Génomique Synthétique: Utiliser la modification génétique pour créer un nouvel ADN ou des formes de vie entières
By Fouad Sabry
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About this ebook
Qu'est-ce que la génomique synthétique
Pour fabriquer un nouvel ADN ou des formes de vie complètes, la génomique synthétique, un sous-domaine relativement jeune de la biologie synthétique, utilise des techniques telles que l'altération génétique sur des formes de vie déjà existantes. formes de vie ou la synthèse de gènes artificiels. Ces techniques peuvent être utilisées pour créer un nouvel ADN.
Comment vous en bénéficierez
(I) Insights et validations sur les sujets suivants :
Chapitre 1 : Génomique synthétique
Chapitre 2 : Paires de bases
Chapitre 3 : Chromosome artificiel bactérien
Chapitre 4 : Génétique moléculaire
Chapitre 5 : Chromosome artificiel de levure
Chapitre 6 : Synthèse d'ADN
Chapitre 7 : Mutagenèse dirigée
Chapitre 8 : Xénobiologie
Chapitre 9 : Index des articles de biologie moléculaire
Chapitre 10 : Construction d'ADN
Chapitre 11 : Bibliothèque génomique
Chapitre 12 : Fosmid
Chapitre 13 : Synthèse artificielle de gènes
Chapitre 14 : Clonage fonctionnel
Chapitre 15 : Mycoplasma laboratorium
Chapitre 16 : Analogue d'acide nucléique
Chapitre 17 : Clonage moléculaire
Chapitre 18 : Génome minimal
Chapitre 19 : Clyde A. Hutchison III
Chapitre 20 : Génomes synthétiques
Chapitre 21 : Édition du génome sans cicatrice (recombinaison assistée Cas9 sans cicatrice)
(II) Réponse posant les principales questions du public sur la génomique synthétique.
(III) Exemples concrets d'utilisation de la génomique synthétique dans de nombreux domaines.
(IV) 17 annexes pour expliquer brièvement 266 technologies émergentes dans chaque industrie pour avoir une compréhension complète à 360 degrés des technologies de la génomique synthétique.
À qui s'adresse ce livre
Professionnels, étudiants de premier cycle et des cycles supérieurs , les passionnés, les amateurs et ceux qui veulent aller au-delà des connaissances ou des informations de base pour tout type de génomique synthétique.
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Génomique Synthétique - Fouad Sabry
Copyright
Synthetic Genomics Copyright © 2022 par Fouad Sabry. Tous droits réservés.
Tous droits réservés. Aucune partie de ce livre ne peut être reproduite sous quelque forme que ce soit ou par quelque moyen électronique ou mécanique que ce soit, y compris des systèmes de stockage et de récupération d’informations, sans l’autorisation écrite de l’auteur. La seule exception est celle d’un réviseur, qui peut citer de courts extraits dans une revue.
Couverture conçue par Fouad Sabry.
Ce livre est une œuvre de fiction. Les noms, personnages, lieux et incidents sont soit des produits de l’imagination de l’auteur, soit sont utilisés de manière fictive. Toute ressemblance avec des personnes réelles, vivantes ou mortes, des événements ou des lieux est entièrement fortuite.
Bonus
Vous pouvez envoyer un e-mail à 1BKOfficial.Org+SyntheticGenomics@gmail.com avec la ligne d’objet « Synthetic Genomics: Using genetic modification to create new DNA or entire lifeforms », et vous recevrez un e-mail contenant les premiers chapitres de ce livre.
Fouad Sabry
Visitez le site Web de 1BK à l’adresse
www.1BKOfficial.org
Préface
Pourquoi ai-je écrit ce livre ?
L’histoire de l’écriture de ce livre a commencé en 1989, alors que j’étais étudiant à l’école secondaire des étudiants avancés.
C’est remarquablement comme les écoles STEM (science, technologie, ingénierie et mathématiques), qui sont maintenant disponibles dans de nombreux pays avancés.
STEM est un programme basé sur l’idée d’éduquer les étudiants dans quatre disciplines spécifiques - sciences, technologie, ingénierie et mathématiques - dans une approche interdisciplinaire et appliquée. Ce terme est généralement utilisé pour traiter d’une politique éducative ou d’un choix de programme d’études dans les écoles. Cela a des répercussions sur le développement de la main-d’œuvre, les préoccupations en matière de sécurité nationale et la politique d’immigration.
Il y avait un cours hebdomadaire dans la bibliothèque, où chaque étudiant est libre de choisir n’importe quel livre et de lire pendant 1 heure. L’objectif de la classe est d’encourager les élèves à lire des matières autres que le programme éducatif.
Dans la bibliothèque, alors que je regardais les livres sur les étagères, j’ai remarqué d’énormes livres, totalisant 5 000 pages en 5 parties. Le nom du livre est « L’Encyclopédie de la technologie », qui décrit tout ce qui nous entoure, duzéro absolu aux semi-conducteurs, presque toutes les technologies, à cette époque, étaient expliquées avec des illustrations colorées et des mots simples. J’ai commencé à lire l’encyclopédie, et bien sûr, je n’ai pas pu la terminer dans le cours hebdomadaire de 1 heure.
J’ai donc convaincu mon père d’acheter l’encyclopédie. Mon père a acheté tous les outils technologiques pour moi au début de ma vie, le premier ordinateur et la première encyclopédie technologique, et les deux ont un grand impact sur moi-même et ma carrière.
J’ai terminé toute l’encyclopédie pendant les mêmes vacances d’été de cette année, puis j’ai commencé à voir comment fonctionne l’univers et comment appliquer ces connaissances aux problèmes quotidiens.
Ma passion pour la technologie a commencé il y a plus de 30 ans et le voyage continue.
Ce livre fait partie de « L’Encyclopédie des technologies émergentes » qui est ma tentative de donner aux lecteurs la même expérience incroyable que j’ai eue quand j’étais au lycée, mais au lieu des technologies du²⁰ème siècle, je suis plus intéressé par les technologies émergentes du 21ème siècle, les applications et les solutions industrielles.
« L’Encyclopédie des technologies émergentes » sera composée de 365 livres, chaque livre sera axé sur une seule technologie émergente. Vous pouvez lire la liste des technologies émergentes et leur catégorisation par industrie dans la partie « Coming Soon », à la fin du livre.
365 livres pour donner aux lecteurs la chance d’accroître leurs connaissances sur une seule technologie émergente chaque jour au cours d’une période d’un an.
Introduction
Comment ai-je écrit ce livre ?
Dans chaque livre de « L’Encyclopédie des technologies émergentes », j’essaie d’obtenir des informations de recherche instantanées et brutes, directement de l’esprit des gens, en essayant de répondre à leurs questions sur la technologie émergente.
Il y a 3 milliards de recherches Google chaque jour, et 20% d’entre elles n’ont jamais été vues auparavant. Ils sont comme une ligne directe vers les pensées des gens.
Parfois, c’est « Comment puis-je enlever le bourrage papier ». D’autres fois, ce sont les peurs déchirantes et les désirs secrets qu’ils n’oseraient jamais partager avec Google.
Dans ma quête pour découvrir une mine d’or inexploitée d’idées de contenu sur la « génomique synthétique », j’utilise de nombreux outils pour écouter les données de saisie semi-automatique des moteurs de recherche comme Google, puis je lance rapidement toutes les phrases et questions utiles, les gens demandent autour du mot-clé « Génomique synthétique ».
C’est une mine d’or de connaissances sur les gens, que je peux utiliser pour créer du contenu, des produits et des services frais et ultra-utiles. Les gens gentils, comme vous, veulent vraiment.
Les recherches de personnes sont l’ensemble de données le plus important jamais collecté sur la psyché humaine. Par conséquent, ce livre est un produit en direct, et constamment mis à jour par de plus en plus de réponses pour de nouvelles questions sur la « génomique synthétique », posées par des gens, tout comme vous et moi, s’interrogeant sur cette nouvelle technologie émergente et souhaitant en savoir plus à ce sujet.
L’approche pour écrire ce livre est d’obtenir un niveau plus profond de compréhension de la façon dont les gens recherchent autour de la « génomique synthétique », révélant des questions et des requêtes que je ne penserais pas nécessairement du haut de ma tête, et répondant à ces questions dans des mots super faciles et digestes, et de naviguer dans le livre d’une manière simple.
Donc, quand il s’agit d’écrire ce livre, j’ai veillé à ce qu’il soit aussi optimisé et ciblé que possible. Le but de ce livre est d’aider les gens à mieux comprendre et à développer leurs connaissances sur la « génomique synthétique ». J’essaie de répondre le plus possible aux questions des gens et d’en montrer beaucoup plus.
C’est une façon fantastique et magnifique d’explorer les questions et les problèmes que les gens ont et d’y répondre directement, et d’ajouter de la perspicacité, de la validation et de la créativité au contenu du livre – même des pitchs et des propositions. Le livre révèle des domaines de recherche riches, moins encombrés et parfois surprenants que je n’atteindrais pas autrement. Il ne fait aucun doute qu’il est prévu d’augmenter les connaissances de l’esprit des lecteurs potentiels, après avoir lu le livre en utilisant cette approche.
J’ai appliqué une approche unique pour rendre le contenu de ce livre toujours frais. Cette approche dépend de l’écoute de l’esprit des gens, en utilisant les outils d’écoute de recherche. Cette approche m’a aidé à :
Rencontrez les lecteurs exactement là où ils se trouvent, afin que je puisse créer un contenu pertinent qui touche une corde sensible et conduit à une meilleure compréhension du sujet.
Gardez le doigt fermement sur le pouls, afin que je puisse obtenir des mises à jour lorsque les gens parlent de cette technologie émergente de nouvelles façons, et surveiller les tendances au fil du temps.
Découvrir des trésors cachés de questions nécessite des réponses sur la technologie émergente pour découvrir des informations inattendues et des niches cachées qui renforcent la pertinence du contenu et lui donnent un avantage gagnant.
Les éléments constitutifs de l’écriture de ce livre sont les suivants:
(1) J’ai cessé de perdre du temps sur le contenu voulu par les lecteurs, j’ai rempli le contenu du livre avec ce dont les gens ont besoin et j’ai dit adieu aux idées de contenu sans fin basées sur des spéculations.
(2) J’ai pris des décisions solides et pris moins de risques pour obtenir des sièges aux premières loges de ce que les gens veulent lire et veulent savoir – en temps réel – et utiliser les données de recherche pour prendre des décisions audacieuses, sur les sujets à inclure et les sujets à exclure.
(3) J’ai rationalisé ma production de contenu pour identifier les idées de contenu sans avoir à passer au crible manuellement les opinions individuelles pour gagner des jours, voire des semaines de temps.
C’est merveilleux d’aider les gens à accroître leurs connaissances d’une manière simple en répondant simplement à leurs questions.
Je pense que l’approche de l’écriture de ce livre est unique car elle rassemble et suit les questions importantes posées par les lecteurs sur les moteurs de recherche.
Remerciements
Écrire un livre est plus difficile que je ne le pensais et plus gratifiant que je n’aurais jamais pu l’imaginer. Rien de tout cela n’aurait été possible sans les travaux réalisés par des chercheurs prestigieux, et je tiens à souligner leurs efforts pour accroître les connaissances du public sur cette technologie émergente.
Dédicace
Pour les illuminés, ceux qui voient les choses différemment et veulent que le monde soit meilleur, ils n’aiment pas le statu quo ou l’État existant. Vous pouvez être trop en désaccord avec eux, et vous pouvez discuter avec eux encore plus, mais vous ne pouvez pas les ignorer, et vous ne pouvez pas les sous-estimer, parce qu’ils changent toujours les choses... ils poussent la race humaine vers l’avant, et tandis que certains peuvent les voir comme des fous ou des amateurs, d’autres voient des génies et des innovateurs, parce que ceux qui sont assez éclairés pour penser qu’ils peuvent changer le monde, sont ceux qui le font et conduisent les gens à l’illumination.
Épigraphe
Pour fabriquer de nouveaux ADN ou des formes de vie complètes, la génomique synthétique, un sous-domaine relativement jeune de la biologie synthétique, utilise des techniques telles que l’altération génétique sur des formes de vie déjà existantes ou la synthèse de gènes artificiels. Ces techniques peuvent être utilisées pour créer de nouveaux ADN.
Table des matières
Copyright
Bonus
Préface
Introduction
Remerciements
Dédicace
Épigraphe
Table des matières
Chapitre 1 : Génomique synthétique
Chapitre 2 : Craig Venter
Chapitre 3 : Chromosome artificiel bactérien
Chapitre 4 : Génétique moléculaire
Chapitre 5 : Chromosome artificiel de levure
Chapitre 6 : Génétique moléculaire
Chapitre 7 : Mutagénèse dirigée par site
Chapitre 8 : Xénobiologie
Chapitre 9 : Index des articles de biologie moléculaire
Chapitre 10 : Construction de l’ADN
Chapitre 11 : Bibliothèque génomique
Chapitre 12 : Fosmid
Chapitre 13 : Séquençage du génome entier
Chapitre 14 : Clonage fonctionnel
Chapitre 15 : Laboratoire de mycoplasmes
Chapitre 16 : Analogue de l’acide nucléique
Chapitre 17 : Clonage moléculaire
Chapitre 18 : Génome minimal
Chapitre 19 : Clyde A. Hutchison III
Chapitre 20 : Génomes synthétiques
Chapitre 21: Édition du génome sans SCAR (Scarless Cas9 Assisted Recombineering)
Épilogue
À propos de l’auteur
À venir
Annexes : Technologies émergentes dans chaque industrie
Chapitre 1 : Génomique synthétique
La génomique synthétique est un sous-domaine relativement nouveau de la biologie synthétique qui se concentre sur la création de nouveaux ADN ou de formes de vie complètes en utilisant diverses méthodes, y compris la synthèse de gènes artificiels et des parties d’altération génétique appliquées à des formes de vie déjà existantes.
La génomique synthétique n’est pas la même chose que la modification génétique en ce sens qu’elle n’utilise pas les gènes déjà présents dans les organismes qu’elle crée. Dans un sens plus large et encore non réalisé, la génomique synthétique pourrait utiliser des codes génétiques qui ne sont pas composés des deux paires de bases d’ADN actuellement utilisées par la vie. Cette possibilité existe malgré le fait que la génomique synthétique peut utiliser des séries de paires de bases qui ont été spécialement conçues.
L’essor de la génomique synthétique peut être attribué à l’expansion rapide de capacités et de technologies technologiques spécifiques dans l’étude de la génétique au cours des dernières décennies. Les chercheurs ont pu mener des études sur des génomes qui ne se produisent pas naturellement en raison de la capacité de générer de longues chaînes de paires de bases à grande échelle d’une manière à la fois précise et économique. La discipline de la génomique synthétique commence à entrer dans une période fertile de vitalité, ce qui peut être attribué aux récentes percées dans les modèles de repliement des protéines ainsi qu’à la baisse des coûts associés à l’analyse informatique.
En 2010, les scientifiques ont réussi à construire une créature synthétique pour la toute première fois.
Peu de temps après la découverte des endonucléases et des ligases de restriction, le domaine de la génétique a commencé à utiliser ces outils moléculaires afin d’assembler des séquences artificielles à partir de plus petits fragments d’ADN synthétique ou naturel. Ces séquences artificielles peuvent être transmises à des organismes pour être utilisées dans la reproduction ou à d’autres fins. Le lien inverse qui existe entre la longueur de l’ADN synthétique et le pourcentage de pureté de cette longueur synthétique est la source du bénéfice qui peut être obtenu en utilisant la stratégie de recombinaison par opposition à la synthèse continue du nouvel ADN. En d’autres termes, en raison des taux d’erreur intrinsèques des technologies disponibles aujourd’hui, le nombre de clones qui incluent des erreurs augmente à mesure que la longueur des séquences synthétisées augmente.
Une séquence d’oligonucléotides est utilisée dans le processus connu sous le nom d’assemblage de cycle de la polymérase (PCA) (ou oligos), entre 40 et 60 nucléotides de longueur environ, qui forment ensemble les deux brins de l’ADN qui est maintenant produit.
Ces oligos ont été créés de telle sorte qu’un seul oligo d’un brin comprend une longueur d’environ 20 nucléotides à chaque extrémité, ce qui est complémentaire aux séquences de deux oligos distincts sur le brin opposé, ce qui crée des zones de chevauchement.
L’ensemble est traité par des cycles de: a) hybridation à 60 °C; b) l’allongement par l’utilisation de la Taq polymérase et d’une ligase régulière; et c) la dénaturation à 95 °C, entraînant des brins