En la cromatografa gaseosa capilar los compuestos se resuelven por presin de vapor.

Los compuestos eluyen de mayor presin de vapor a menor presin de vapor. O sea que los compuestos como en este caso, los lpidos, van a eluir de menor nmero de tomos de carbono a mayor nmero de tomos de carbono. La resolucin vara dependiendo tambin, de si la columna contiene una fase estacionaria de caractersticas polares o apolares, como es el caso de los cromatogramas 1 y 4 respectivamente. Se puede observar que en el cromatograma 1 (fase estacionaria polar) los lpidos se resuelven por nmero de tomos de carbono y por grado de insaturacin, esto se debe a que las insaturaciones le proporcionan a los lpidos una cierta diferencia de polaridad que implica una mayor interaccin con la fase estacionaria de la columna capilar pudiendo as eluir a diferentes tiempos de retencin, a mayor nmero de insaturaciones mayor polaridad. Primero eluye el lpido saturado y luego, los de menor grado de insaturacin a mayor grado de insaturacin. En el cromatograma 4 (fase estacionaria apolar) los lpidos con distintas insaturaciones no se resuelven entre si ya que estos no pueden interaccionar con la fase estacionaria por lo que su elucin depende solo de su presin de vapor, por lo tanto de su nmero de tomos de carbono. Si se diferencian de los saturados que eluyen despus que los insaturados debido a que los saturados si interaccionan con la fase estacionaria.