ESTRUCTURAS PROTEICAS

Esteban Osorio Cadavid, PhD. Curso Biologa Celular y Bioqumica I

ESTRUCTURA PRIMARIA
Es la secuencia de aminocidos y la localizacin de los enlaces disulfuro.

ESTRUCTURA SECUNDARIA
Se refiere a las relaciones estricas de los residuos de aminocidos que estn prximos unos a otros en la secuencia lineal y que forman una estructura peridica. Existen varios tipos: Hlice , Hoja plegada , Hlice de colgeno y Giro

HLICE Y HOJA
Propuesta por Pauling y Corey a principios de los aos 1950

Hlice
Estructura semejante a un cilindro. La cadena polipeptdica principal est estrechamente enrrollada, formando la parte interior del cilindro, y las cadenas laterales se extienden hacia fuera en una disposicin helicoidal.

 La hlice queda estabilizada por enlaces de H entre los grupos NH y CO de la cadena principal. El grupo CO de cada aminocido, est enlazado por un enlace de Hidrgeno, al grupo NH del aminocido situado cuatro residuos ms adelante en la secuencia lineal. De esta manera todos los grupos CO y NH de la cadena principal quedan enlazados por puentes de H.

 Cada residuo queda relacionado con el siguiente por una translacin de 1.5 a lo largo del eje de la hlice; y una rotacin de 100, lo que da 3.6 residuos de a.a. por vuelta de la hlice. El sentido de la hlice puede ser dextrgiro (sentido de las agujas del reloj) o levgiro (sentido opuesto). Las hlices alfa que se encuentran en las protenas, generalmente son dextrgiras.

 Una hlice sencilla es normalmente un cilindro bastante corto, tpicamente de una longitud de 40.

Pero, una variante de la hlice se utiliza para construir cilindros o filamentos mucho ms largos, que pueden extenderse hasta 1000.

 Dos o ms hlices pueden enrollarse una alrededor de la otra para formar un cable. Ejemplos: Queratina (cabellos), miosina y tropomiosina (msculo), epidermina (piel), fibrina (cogulos de sangre).
Los cables helicoidales formados as en estas protenas, aportan un papel mecnico fuerte, en la formacin de fibras muy resistentes.

La Hoja Plegada o lmina

Difiere profundamente de la hlice , en que es una hoja, en vez de un cilindro. La cadena polipeptdica de la hoja plegada est casi completamente extendida, en vez de, estar completamente enrollada como en la hlice .

 La distancia axial entre los aminocidos adyacentes es de 3.5, en contraste con la de 1.5, para la hlice .
Otra diferencia importante. La hoja plegada queda estabilizada, por enlaces de H entre los grupos NH y CO de filamentos polipeptdicos diferentes, mientras que en la hlice , el enlace de H se establece entre los grupos NH y CO de la misma cadena polipeptdica.

 Las cadenas adyacentes en una hoja plegada pueden orientarse: En la misma direccin (hoja paralela)

 En direcciones opuestas (hoja antiparalela)

Ejemplo: fibrona de la seda, (haces de hojas antiparalelas).

La hlice del colgeno

Constituye un tercer ejemplo, de otra estructura peridica de tipo secundaria. Esta estructura secundaria especial y especializada es responsable de la gran fuerza tensil del colgeno (principal componente de la piel, los huesos y los tendones).

 La unidad estructural bsica del colgeno es el tropocolgeno, que consta de 3 fibras, cada una de las cuales tiene unos 1000 residuos de longitud. El tropocolgeno es una fibrilla helicoidal de triple hebra, de 3000 de longitud y 15 de dimetro.

Giro
Las cadenas polippticas pueden invertir su direccin, por medio de los giros beta. Lo esencial de este giro en horquilla es que, el grupo CO de un residuo n de un polipptido, se enlaza por un puente de H, con el grupo NH del residuo situado (n+3); en consecuencia, la cadena polipeptdica puede cambiar bruscamente de direccin.

ESTRUCTURA TERCIARIA
Se refiere a las relaciones estricas de los residuos de aminocidos que estn muy distanciados en la secuencia lineal. Se forma por empaquetamiento de tales elementos estructurales, en una o varias unidades globulares compactas, denominadas dominios.

DOMINIOS COMUNES

ESTRUCTURA CUATERNARIA
La poseen aquellas protenas que contienen ms de una cadena polipeptdica; y se refiere a la forma en la cual las cadenas polipeptdicas diferentes estn empaquetadas entre s. Cada cadena polipeptdica de este tipo de protenas es lo que se denomina subunidad, o un MONMERO. Por lo tanto, existen protenas monomricas y polimricas.

SIMETRAS DE LAS ESTRUCTURAS CUATERNARIAS

Aminocidos formadores e inestabilizadores de hlices

Permiten hlice estable Favorecen Lmina u hoja Valina

Alanina

Cistena

Leucina
Fenilalanina Tirosina

Metionina
Histidina Asparagina

Isoleucina
Tirosina

Triptfano
Valina

Glutamina

Inestabilizan la hlice Serina Isoleucina Treonina Acido glutmico Lisina Arginina Glicocola (Glicina) Acido asprtico

Rompen la hlice Prolina Hidroxiprolina

RIBONUCLEASA
La ribonucleasa es una cadena polipeptdica que contiene 124 residuos de aminocidos. Contiene 4 enlaces disulfuro que pueden ser irreversiblemente oxidados por medio del cido perfrmico para dar residuos de cido cistico.

Alternativamente, estos enlaces disulfuro puede ser escindidos, de modo reversible, reducindolos por medio del mercaptoetanol que forma disulfuros mixtos con las cadenas laterales de las cisteinas. En exceso de mercaptoetanol, los disulfuros mixtos son tambin reducidos; de modo que en el producto final, los disulfuros (cistina) estn completamente transformados. Son sulfhidrilos (cisteina).

Secuencias de aminocidos de la ribonucleasa bovina. Los cuatro enlaces disulfuro se muestran en color.

 mercaptoetanol

 Sin embargo, se encontr que la ribonucleasa, a 37C y pH 7.0, no puede ser fcilmente reducida por el mercaptoetanol, a menos que la protena sea parcialmente desplegada por agentes desnaturalizantes del tipo de la urea o del clorhidrato de guanidina. Cuando se trata la ribonucleasa con mercaptoetanol en urea 8M, el producto fue una cadena polipetdica completamente reducida, enrrollada al azar y sin ninguna actividad enzimtica (actividad biolgica).

 Alfinsen, observ que la ribonucleasa desnaturalizada, liberada de la urea y del mercaptoetanol por dilisis, recuperaba la actividad enzimtica. Logr concluir que: La informacin necesaria para especficar la estructura compleja, tridimensional de la ribonucleasa, est contenida en su secuencia de aminocidos. Por lo tanto: La secuencia de aminocidos especifica la conformacin de la Protena.

 La forma tridimensional NATIVA de la ribonucleasa A parece ser la estructura termodinmicamente ms estable.

La ribonucleasa reducida fue reoxidada mientras estaba todava en urea 8M. Se dializ para eliminar la urea. Se observ la formacin de apareamientos disulfuros equivocados, cuando la forma enrrollada al azar, de la molcula reducida, fue oxidada.

Secuencias de aminocidos de la ribonucleasa bovina. Los cuatro enlaces disulfuro se muestran en color.

Reduccin y desnaturalizacin de la ribonucleasa

Renaturalizacin de la ribonucleasa

Renaturalizacin de la ribonucleasa