BASES THEORIQUES DE LANOVA

Le but de ce document est de permettre une manipu ation du test Ano!a de Statistica en connaissant es principes du test et donc en uti isant de "a#on appropri$ es r$su tats% &e document ne porte 'ue sur Ano!a ( mesures r$p$t$es% 1. Le principe de lAnalyse de la Variance (ANalysis Of VAriance ANOVA) Un m$decin peut conna)tre e""et de * m$dicaments distincts sur une ma adie% I suit e protoco e sui!ant + , , , -. + m$dicaments n/. ( .0 ma ades -* + m$dicaments n/* ( .0 ma ades -1 + rien ( .0 autres ma ades 23roupe contr4 e5

I mesure une !ariab e ui donnant une in"ormation sur $tat des patients% 6our conna)tre e""et des 1 traitements i obser!e + a5 es !a eurs abso ues de c7a'ue 3roupe 2e8 + -. a une !a eur mo9enne de .0: -* une !a eur mo9enne de .* et -1 une !a eur mo9enne de ;5% b5 6our sa!oir si ces r$su tats sont dus au 7asard ou au traitement: i re3arde si a !ariabi it$ 2!ariance5 des !a eurs entre es 3roupes est sup$rieure ( ce e au sein de c7a'ue 3roupe% &ette comparaison des !ariances 2inter,3roupe et intra,3roupe5 est "aite par e ca cu du <= + = > Variance entre es 3roupes ? Variance dans es 3roupes 2.5

6 us a !ariance entre es 3roupes est sup$rieure ( ce e dans es 3roupes: p us e""et du "acteur test$ 2ici e m$dicament5 ( des c7ances de na pas @tre du au 7asard% En bre": p us e = est $ e!$: p us i 9 a de c7ance 'ue e "acteur test$ ait un e""et statisti'uement si3ni"icati"% AA On peut conc ure sur a si3ni"icati!it$ du r$su tat seu ement en comparant e = ca cu $ ( un = t7$ori'ue% En e""et: i ne su""it pas de !oir si e = ca cu $ est important ou non: sa !a eur ne peut @tre interpr$t$e 'uen $tant compar$e ( un = t7$ori'ue% &e = t7$ori'ue d$pend de a con"i3uration e8p$rimenta e de $tude 2nombre de participants: dessai: de conditions5% Le = t7$ori'ue d$pend p us pr$cis$ment: du nombre de de3r$ de ibert$ 2dd 5 de a source du nominateur de E'% 2.5 2i%e% B a !ariance entre es 3roupes5 et du nombre de dd de a source du d$nominateur de E'% 2.5 2i%e% B a !ariance dans es 3roupes5%

&e = t7$ori'ue se it dans a tab e de =is7er 2=i3ure .5 +

Figure 1: Table de Fisher

Le = t7$ori'ue: pour un nombre de dd du nominateur donn$ et pour un nombre de dd du d$nominateur donn$: a * !a eurs possib es se on e ni!eau derreur a p7a c7oisi + a p7a>0:0C 2si e""et est si3ni"icati": i 9 aura ;CD de c7ance 'ui ne soit pas du au 7asard5 B a p7a>0:0. 2si e""et est si3ni"icati": i 9 aura ;;D de c7ance 'ui ne soit pas du au 7asard5% AA Dans Statistica ce = t7$ori'ue nest pas ( ire dans cette tab e% Le o3icie compare de ui,m@me es !a eurs du = ca cu $ et du = t7$ori'ue% Le = ca cu $ 2ce ui 'ui appara)t dans es tab eau8 de r$su tats de Statistica est en rou3e si e""et est statisti'uement si3ni"icati"5% Statistica nous rensei3ne sur e = ca cu $ ( partir des donn$es e8p$rimenta es% De p us: i nous indi'ue a probabi it$ 2p5 associ$ ( ce = ca cu $ en consid$rant e = t7$ori'ue% Statistica e""ectue a comparaison entre e = ca cu $ et t7$ori'ue% Si e = est en rou3e: ce a si3ni"ie 'ue p est in"$rieur au seui criti'ue 20%0. ou 0%0C e p us sou!ent5% Nous pou!ons en conc ure un e""et si3ni"icati" de a !ariab e%

2. Lecture des rsultats a5 Intensit$ de e""et du "acteur test$ LAno!a mesure en <!ariance% Ainsi: e "acteur test$ est dautant p us si3ni"icati" 'ui est responsab e dune 'uantit$ importante de !ariance des r$su tats% &ette Intensit$ de e""et se mesure par e RE 2IE + <Intensit9 o" E""ect5% b5 E""ets dinteraction et e""ets simp es Le m$decin aurait $3a ement pu donner * m$dicaments di""$rents sur 1 dur$es de cure di""$rentes 2dans c7acun des * 3roupes de ma ades prenant un m$dicament: un tiers du 3roupe subit une cure de F Gours: un autre un tiers une cure de .H Gours et e dernier un tiers une cure de *. Gours5% Le m$decin !eut sa!oir si a dur$e de a cure est un "acteur pou!ant causer une di""$rence dans es r$su tats de 3u$rison% Le nou!eau protoco e de traitement peut se sc7$matiser ainsi + , , m$dicaments 2"acteur A: nombre + *5 B dur$e de a cure 2"acteur B: nombre + 15%

DaprIs ce protoco e: e m$decin posera 1 'uestions + , , , e""et dinteraction 2AJB5 B e""et simp e de A B e""et simp e de B%

Lors'uon teste p us dun "acteur: a ecture des r$su tats se "ait dans cet ordre 2on obser!e es e""ets dinteraction a!ant es e""ets simp es5% Si i 9 a une interaction: es e""ets de di""$rents "acteurs ne sont pas additi"s 2 e""et dun "acteur d$pend de e""et dun autre "acteur5%

3. Con entions dcriture Dans e corps dun artic e: e""et dun test Ano!a se note de a "a#on sui!ante + a5 Si e""et du "acteur test$ est statisti'uement si3ni"icati" + Le m$dicament n/. in" uence a !ariab e du traitement 2=2.:.05>.H:01: p<:0C: IE>CFD5% , , , , =2.:.05 + . K .0 correspondent au8 dd du nominateur et du d$nominateur B .H:01 + r$su tat du = ca cu $ B p<:0C + erreur a p7a B IE>CFD + Intensit$ de E""et

b5 Si e""et du "acteur test$ est statisti'uement non si3ni"icati" + Le m$dicament n/* nin" uence pas a !ariab e du traitement 2=s L .:M.5% , .:M. + !a eur du = ca cu $%

AA es con!entions d$criture peu!ent !arier dune discip ine ( autre% c5 Les $toi es indi'uant e ni!eau de si3ni"icati!it$ 2pour es 3rap7i'ues5 + , , , J + si3ni"icati!it$ a!ec p L 0:0C JJ + si3ni"icati!it$ a!ec p L 0:0. JJJ + si3ni"icati!it$ a!ec p L 0:00.

!. "appels a5 Nesures r$p$t$es ? Nesures ind$pendantes Nesures r$p$t$es + Les m@mes suGets sont test$s sur p usieurs conditions% Nesures ind$pendantes + 6 usieurs 3roupes dindi!idus sont $tudi$s% &est surtout une notion de 3roupes distincts 'ui sont compar$s%

b5 &a cu de a !ariance La !ariance 2&N ou <&arr$ No9en5 est a somme des $carts ( a mo9enne norma is$e par es e""ecti"s% &N > 2On P N5E ? N P . On + !a eur 2i 9 a n !a eurs: par e8 C si un participant ( "ait C essais5 B N + mo9enne des n !a eurs5 N + nombre de participants

c5 Tab eau de Ano!a E8emp e de tab eau de !a eurs dun protoco e a!ec * "acteurs 2A K B5 +
facteur A facteur B S1 S2 S3 S4 S5 a1 b1 Cond 1 0,67 0,4 0,37 0,49 0,48 b2 Cond 2 0,88 0,96 0,66 0,8 0,86 b1 Cond 3 0,73 0,61 0,64 0,43 0,5 a2 b2 Cond 4 0,64 0,58 0,94 0,74 1,04 b1 Cond 5 0,38 0,86 0,42 0,61 0,73 a3 b2 Cond 6 0,68 1,21 0,51 0,76 1 M oy 0,663 0,770 0,590 0,638 0,768

E8emp e de tab eau Ano!a correspondant +

Source A AS B BS AB ABS S $ot SC 0,01742 0,43258 0,48936667 0,05372 0,03025333 0,14349333 0,12918333 1,29601666 dll CM 2 8 1 4 2 8 4 29 F 0,00871 0,0540725 0,48936667 0,01343 0,01512667 0,01793667 0,03229583 0,04469023 0,16 36,44 0,84 ns # 0,05 ns !" 0,01 0,38 0,02

, , , , , ,

S& + Somme &arr$es 2des $carts ( a mo9enne5 B D + de3r$s de ibert$ B &N + !ariance 2&arr$ No9en5 B = + = de =is7er ca cu $ B 6 + erreur a p7a B RE + Intensit$ de e""et

Dans Statistica: e tab eau Ano!a se pr$sente de "a#on un peu di""$rente +

A%&'A SC ddl CM F p 12957,00 1 12957,00 229,7912 0,000000 563,86 10 56,39 12,96 3 4,32 1,3419 0,279392 96,58 30 3,22 710,71 1 710,71 121,3127 0,000001 58,58 10 5,86 0,81 3 0,27 0,2277 0,876401 35,60 30 1,19

Source &rd &r() *rreur Facteur A *rreur Facteur B *rreur A+B *rreur

Le RE nest pas donn$%

d5 &a cu de intensit$ de""et 2IE ou RE5 RE > S& entre es 3roupes ? S& tota e% Dans e8emp e ci,dessous: e ca cu de intensit$ de e""et du "acteur B + S& entre > F.0:F. S& tota e > ;.C:*H 2 AA ne pas prendre en compte <Ord Ori3 et <Erreur de Ord Ori35 IE 2B5 > 0:FF Le "acteur B e8p i'ue FFD de a !ariance tota e% AA N@me ors'ue e""et dun "acteur test$ nest pas statisti'uement si3ni"icati": i peut @tre int$ressant de ca cu er son intensit$% Ici: par e8emp e: e "acteur A nest pas statisti'uement si3ni"icati" et i e8p i'ue .D 2.*:;M?;.C:*H5 de a !ariance tota e% Nais dans dautres cas: un e""et peut @tre statisti'uement non si3ni"icati" et e8p i'uer pourtant une part non n$3 i3eab e de a !ariance tota e% I "aut donc !oir e RE comme une in"ormation comp $mentaire du =%

e5 &a cu des dd Le protoco e + , , "acteur A + H moda it$s B "acteur B + * moda it$s B

nombre de participants S + .. 2N5

=ormu es des ca cu s des dd pour c7a'ue SOUR&E + A > A,.> H,.>1 B > B,.>*,.>. AB > 2A,.5J2BJ.5>H,.J*,.>1 AS > 2A,.5J2S,.5>H,.J..,.>10 BS > 2B,.5J2S,.5>*,.J..,.>.0 ABS > 2A,.5J2B,.5J2S,.5>H,.J*,.J..,.>10 S > N,.>..,.>.0 Tota e > somme de ttes es pr$c$dentes