Vous êtes sur la page 1sur 160

ISSN 1302-6763

Journal
of
Qafqaz
University

Journal of Qafqaz University


Структурно-функциональная взаимосвязь
кардиоактивных пептидов, миелопептидов и
гликопептидов
Л. И. Исмаилова

Nano-porous silicon for gas sensor and fuel cell applications


Tayyar Dzhafarov, Sureyya Aydın Yuksel

İkiölçülü dalğa tənliyinin qrup nəzəriyyəsi


metodu ilə tədqiqi
Ə.Q. Ağamalıyev

Kompleks konsantrelerdeki bakır ve çinkonun selektif


çözeltme imkânları üzerine bir araştırma
Mustafa Akdağ

Toz metalürjisi ile üretilmiş iki metal parçanın difüzyon


kaynağıyla birleştirilmesinde sıcaklığın kaynak bölgesine
etkisinin irdelenmesi
Yadullah Babayev

Депонирование и транспорт оксида азота в


биологических системах
И.С. Курбанов
Number 25, 2009

“Journal of Qafqaz University” can be searched in


such international indexes as Russian Periodicals New inequalities on triangle areas
Catalog, Directory of Open Access Journals, Middle Y.N. Aliyev
East Virtual Library, The International Consortium for
the Advancement of Academic Publication,
JournalSeek, Genamics, RefSeek, Dspace, Eprints, Number 25
Indexcopernicus.

Qafqaz University Publications 2009 http://journal.qafqaz.edu.az


Publisher
Ahmet Sanich

Editor-in-Chief
Niftali Qodjayev

Managing Editor
Elchin Suleymanov

Editorial Board
Member Irada Aliyeva
Member Muharrem Kaplan
Member Murat Erguvan
Member Islam Huseynov
Secretary Ramil Haciyev

Editorial Advisory Board


Ahmet Oksuz Khalil Ismayilov
Ayhan Erdal Mamedali Babashli
Ali Bora Mustafa Akdag
Jihan Bulut Mehmet Rihtim
Fahreddin Isayev Reha Yilmaz
Hamzaga Orujov Omer Okumush

Advisory Board
Abdul Aziz Abdul Hafis El Khouli (Egupt, Cairo University) Latif Huseynov (Azerbaijan, National Assembly)
Ali Fuat Bilkan (Turkey, University of Economics and Tekhnology) Oktay Gasimov (USA, California University)
Ajdar Agaev (Azerbaijan Institute of Education Problems) Muhammed Tebrizi (USA, East Carolina University)
Akif Huseynli (Azerbaijan, National Academy of Science) Muhittin Shimshek (Turkey, Sakarya University)
Ali Çelik (Turkey, Karadeniz Technical University) Nadir Alishov (Ukraine, Academy of Science)
Bakhram Asgerov (Azerbaijan, Baku State University) Nazan Bekiroglu (Turkey, Karadeniz Technical University)
Don C. Hines (USA, Troy University) Nadir Seyidov (Azerbaijan, National Academy of Science)
Erhan Birgili (Turkey, Sakarya University) Rasim Alikuliyev (Azerbaijan, National Academy of Science)
Erol Oral (Kyrgyzstan, International Ataturk-Alatoo University) Saim Selvi (Turkey, Ege University)
Farkhad Guseynov (Turkey, Bilkent University) Salih Shimshek (Turkey, Sakarya University)
Firuddin Semenderov (Azerbaijan, Baku State University) Sami Karahan (Turkey, Konya Selchuk University)
Gholam Riza Sabri Tabrizi (London, Edinburg Uni. King College) Shamil Samedzade (Azerbaijan, Technical University)
Gültekin Yildiz (Turkey, Sakarya University) Surkhay Akberov (Turkey, Yildiz Technical University)
Halit Pastaci (Turkey, Yildiz Technical University) Tabriz Aliev (Azerbaijan, Oil Academy)
Halil Gasimov (Azerbaijan, National Academy of Science) Tarlan Afandiyev (Belarus, National Academy of Science)
Hakan Acar (Turkey, Fatih University) Telman Aliyev (Azerbaijan, National Academy of Science)
Hilmi Kirlioglu (Turkey, Sakarya University) Tofiq Hajiyev (Azerbaijan, Baku State University)
James F. Rinehart (USA, Troy University) Tatyana Birshteyn (Russia, National Academy of Science)
Ibrahim El-Rabi (USA) Vasim Mammedaliev (Azerbaijan, Baku State University)
Irada Aliyeva (Azerbaijan, Baku State University) Vladimir Pashenko (Russia, Moskow State University)
Ismail Ozsoy (Turkey, Fatih University) Yaqub Mahmudov (Azerbaijan, National Academy of Science)
Kev Salihov (Tataristan, Kazan University) Yusuf Tuna (Turkey, Istanbul University)
Konstantin Voldemarovich Shaitan (Russia, Moskow State Unıversıty) Zafer Ayvaz (Turkey, Ege University)

Design
Sahìb Kazimov

Corresponding Address
Journal of Qafqaz University
Baku - Sumqayit Road, 16 km., Khirdalan, Baku, AZ0101, Azerbaijan
Tel: 00 994 12 - 448 28 62/66 Fax: 00 994 12 448 28 61/67
e-mail: journal@qafqaz.edu.az
web: http://journal.qafqaz.edu.az
The “Journal of Qafqaz University” is a publication of
Qafqaz University and issue twice a year since 1997
Copyright © Qafqaz University
ISSN 1302-6763
Reyestr No: 670, 09.11.2003
Abonet
The Journal of Qafqaz University is available by subscription for 30 USD a year abroad and
9.2 AZN in Azerbaijan. Bankship and corresponding address must be faxed to Qafqaz University.
Bank Account: T.C. Ziraat Bankasí / Üsküdar-Ìstanbul, Hesap Sahibi: Ömer Okumuå, Hesap Türü/Para Birimi: Vadesiz Hesap/TL
Hesap No: 2426261-5001403, IBAN: TR890001000403024262615001 (Türkiye);
Qafqaz Universiteti: VÖEN: 1300325511, Hesab No: 38090000900001 AZN, 38190066220001 USD, Kod: 506452 Müx. Hes. 0137010031944
“Texnikabank ASC” Abåeron Filialí - VÖEN: 9900000681 SWIFT BIC: TECIAZ22 (Azerbaijan)
ISSN 1302-6763

Qafqaz
Universiteti
Jurnalı
“Journal of Qafqaz University” beynəlxalq jurnalı Russian
Periodicals Catalog, Directory of Open Access Journals,
Middle East Virtual Library, The International Consortium for
the Advancement of Academic Publication, JournalSeek,
Genamics, RefSeek, Dspace, Eprınts, Indexcopernicus
beynəlxalq elmi indekslərinə daxildir.

T bi t Elml ri Seriyas

No 25, 2009
Täsisçi
Ahmet Saniç

Baå Redaktor
Niftalí Qocayev

Näår Redaktoru
Elçin Süleymanov

Näår Redaksìyasí
Üzv Ìradä Äliyeva
Üzv Muharrem Kaplan
Üzv Murat Erguvan
Üzv Ìslam Hüseynov
Katib Ramil Hacíyev

Redaksìya Heyäti
Ahmet Öksüz Mämmädälì Babaålí
Ayhan Erdal Mehmet Ríhtím
Ali Bora Mustafa Akdað
Cihan Bulut Reha Yílmaz
Fäxräddìn Ìsayev Ömer Okumuå
Hämzaða Orucov Xälil Ìsmayílov

Mäslähät Heyäti
Əbdül Əziz Əbdül Hafis Əl Xouli (Misir, Qahirə Universiteti) Oqtay Qasımov (ABŞ, Kaliforniya Universiteti)
Əli Fuat Bilkan (Türkiyə, Ekonomi və Teknoloji Universiteti) Məhəmməd Təbrizi (ABŞ, East Carolina University)
Əjdər Ağayev (Azərbaycan, Təhsil Problemləri İnstitutu) Muhittin Şimşek (Türkiyə, Sakarya Universiteti)
Akif Hüseynli (Azərbaycan, Qafqaz Universiteti) Nadir Əlişov (Ukrayna, Elmlər Akademiyası)
Əli Çelik (Türkiyə, Karadeniz Teknik Universiteti) Nazan Bekiroğlu (Türkiyə, Karadeniz Teknik Universiteti)
Bəhram Əsgərov (Azərbaycan, Bakı Dövlət Universiteti) Nadir Seyidov (Azərbaycan, Milli Elmlər Akademiyası)
Don C. Hines (ABŞ, Troy Universiteti) Rasim Əliquliyev (Azərbaycan, Milli Elmlər Akademiyası)
Erol Oral (Qırğızıstan, Beynəlxalq Atatürk Alatoo Universiteti) Saim Selvi (Türkiyə, Ege Universiteti)
Erhan Birgili (Türkiyə, Sakarya Universiteti) Salih Şimşek (Türkiyə, Sakarya Universiteti)
Fərhad Hüseynov (Türkiyə, Bilkənt Universiteti) Sami Karahan (Türkiyə, Konya Selcuk Universiteti)
Firuddin Səməndərov (Azərbaycan, Bakı Dövlət Universiteti) Şamil Səmədzadə (Azərbaycan, Texniki Universitet)
Gholam Rıza Sabri Təbrizi (London, Edinburg Univ., King College) Surxay Əkbərov (Türkiyə, Yıldız Teknik Universiteti)
Gültəkin Yıldız (Türkiyə, Sakarya Universiteti) Təbriz Əliyev (Azərbaycan, Neft Akademiyası)
Halit Pastacı (Türkiyə, Yıldız Teknik Universiteti) Tofiq Hacıyev (Azərbaycan, Bakı Dövlət Universiteti)
Hakan Acar (Türkiyə, Fatih Universiteti) Tərlan Əfəndiyev (Belarusiya, Elmlər Akademiyası)
Hilmi Kırlıoğlu (Türkiyə, Sakarya Universiteti) Telman Əliyev (Azərbaycan, Milli Elmlər Akademiyası)
James F. Rinehart (ABŞ, Troy Universiteti) Tatyana Birshteyn (Rusiya, Rusiya Elmlər Akademiyası)
İbrahim Əl-Rabi (ABŞ) Vasim Məmmədəliyev (Azərbaycan, Bakı Dövlət Universiteti)
İradə Əliyeva (Azərbaycan, Bakı Dövlət Universiteti) Vladimir Paşenko (Rusiya, Moskva Dövlət Universiteti)
İsmail Özsoy (Türkiyə, Fatih Universiteti) Xəlil Qasımov (Azərbaycan, Milli Elmlər Akademiyası)
Kev Salihov (Tatarıstan, Kazan Universiteti) Yaqub Mahmudov (Azərbaycan, Milli Elmlər Akademiyası)
Konstantin Voldemaroviç Şaitan (Rusiya, Moskva Dövlət Universiteti) Yusuf Tuna (Türkiyə, İstanbul Universitesi)
Lətif Hüsynov (Azərbaycan, Milli Məclis) Zafer Ayvaz (Türkiyə, Ege Universiteti)

Tärtibat
Sahìb Kazímov

Ünvan
“Journal of Qafqaz University”
AZ101, Baký -Sumgayýt yolu, 16-cý km., Xýrdalan - Baký / Azärbaycan
Tel: 00 994 12 - 448 28 62/66 Fax: 00 994 12 448 28 61/67
e-mail: journal@qafqaz.edu.az
web: http://journal.qafqaz.edu.az
“Journal of Qafqaz University” jurnalí Qafqaz Unìversìtetìnìn näårìdìr;
1997-ci il tarixindän etibarän ìldä ìkì däfä därc edìlìr.
Copyright © Qafqaz University
ISSN 1302 - 6763
Reyest: No: 670, 09.11.2003

Abunä
Jurnalín illik abunä qiymäti 9 manat 20 qäpik olub, Azärbaycan xaricindä 30 ABÅ Dollarídír. Abunä olmaq istäyänlärin abunä
qiymätini aåagídakí hesaba köçürüb, qäbzin bir nüsxäsini älaqä ünvaní ilä birlikdä Qafqaz Universitetinä fakslamalarí lazímdír.
Bank Hesabí: T.C. Ziraat Bankasí / Üsküdar-Ìstanbul, Hesap Sahibi: Ömer Okumuå, Hesap Türü/Para Birimi: Vadesiz Hesap/TL
Hesap No: 2426261-5001403, IBAN: TR890001000403024262615001 (Türkiye);
Qafqaz Universiteti: VÖEN: 1300325511, Hesab No: 38090000900001 AZN, 38190066220001 USD, Kod: 506452 Müx. Hes. 0137010031944
“Texnikabank ASC” Abåeron Filialí - VÖEN: 9900000681 SWIFT BIC: TECIAZ22 (Azärbaycan)
ISSN 1302-6763

Qafqaz
Üniversitesi
Dergisi
“Journal of Qafqaz University” Uluslararası Dergisi Russian
Periodicals Catalog, Directory of Open Access Journals,
Middle East Virtual Library , The International Consortium
for the Advancement of Academic Publication, JournalSeek,
Genamics, RefSeek, Dspace, Eprınts, Indexcopernicus
uluslararası bilimsel endeksler tarafından taranmaktadır.

Fen Bilimleri Serisi

Sayı 25, 2009


Sahibi
Ahmet Saniç

Baå Editör
Niftalí Gocayev

Yayín Editörü
Elçin Süleymanov

Yayín Editörlüðü
Üye Ìrade Aliyeva
Üye Muharrem Kaplan
Üye Murat Erguvan
Üye Ìslam Hüseynov
Sekreter Ramil Hacíyev

Yayín Kurulu
Ahmet Öksüz Halil Ìsmayílov
Ayhan Erdal Memmedalì Babaålí
Ali Bora Mehmet Ríhtím
Cihan Bulut Mustafa Akdað
Fahrettìn Ìsayev Reha Yílmaz
Hämzaða Orucov Ömer Okumuå

Daníåma Kurulu
Abdul Aziz Abdul Hafis El Houli (Mısır, Kahire Üniversitesi) Latif Hüseynov (Azerbaycan, Milli Meclis)
Ali Fuat Bilkan (Türkiye, Ekonomi ve Teknoloji Üniversitesi) Muhammed Tebrizi (ABD, East Carolina University)
Ejder Ağayev (Azerbaycan, Eğitim Problemleri Enstitüsü) Muhittin Şimşek (Türkiye, Sakarya Üniversitesi)
Akif Hüseynli (Azerbaycan, Milli İlmler Akademisi) Nadir Alişov (Ukrayna, İlmler Akademisi)
Ali Çelik (Türkiye, Karadeniz Teknik Üniversitesi) Nazan Bekiroğlu (Türkiye, Karadeniz Teknik Üniversitesi)
Behrem Askerov (Azerbaycan, Bakü Devlet Üniversitesi) Nadir Seyidov (Azerbaycan, Milli İlimler Akademisi)
Don C. Hines (ABD, Troy Üniversitesi) Rasim Alikuliyev (Azerbaycan, Milli İlimler Akademisi)
Erol Oral (Kırgızistan, Uluslararası Atatürk Alatoo Üniversitesi) Saim Selvi (Türkiye, Ege Üniversitesi)
Erhan Birgili (Türkiye, Sakarya Universitesi) Salih Şimşek (Türkiye, Sakarya Üniversitesi)
Ferhat Hüseynov (Türkiye, Bilkent Üniversitesi) Sami Karahan (Türkiye, Konya Selçuk Üniversitesi)
Firuddin Semenderov (Azerbaycan, Bakü Devlet Üniversitesi) Şamil Samedzade (Azerbaycan, Teknik Üniversite)
Gholam Rıza Sabri Tebrizi (London, Edinburg Uni. King College) Surhay Ekberov (Türkiye, Yıldız Teknik Üniversitesi)
Gültekin Yıldız (Türkiye, Sakarya Üniversitesi) Tebriz Aliyev (Azerbaycan, Neft Akademisi)
Oktay Kasımov (ABD, Kaliforniya Üniversitesi) Tofiq Hacıyev (Azerbaycan, Bakü Devlet Üniversitesi)
Halit Pastacı (Türkiye, Yıldız Teknik Üniversitesi) Terlan Efendiyev (Belarusya, İlimler Akademisi)
Hakan Acar (Türkiye, Fatih Üniversitesi) Telman Aliyev (Azerbaycan, Milli İlimler Akademisi)
Hilmi Kırlıoğlu (Türkiye, Sakarya Üniversitesi) Tatyana Birshteyn (Rusiya, Rusiya İlimler Akademisi)
James F. Rinehart (ABD, Troy Üniversitesi) Vasim Memmedaliyev (Azerbaycan, Bakü Devlet Üniversitesi)
İbrahim El-Rabi (ABD) Halil Kasımov (Azerbaycan, Milli İlimler Akademisi)
İrade Aliyeva (Azərbaycan, Bakı Dövlət Universiteti) Vladimir Paşenko (Rusya, Moskova Üniversitesi)
İsmail Özsoy (Türkiye, Fatih Üniversitesi) Yaqub Mahmudov (Azerbaycan, Milli İlimler Akademisi)
Kev Salihov (Tataristan, Kazan Üniversitesi) Yusuf Tuna (Türkiye, İstanbul Üniversitesi)
Konstantin Voldemaroviç Şaitan (Rusya, Moskova Devlet Üniversitesi) Zafer Ayvaz (Türkiye, Ege Üniversitesi)

Dizgi
Sahìb Kazímov

Yazíåma Adresi
“Journal of Qafqaz University”
AZ101, Baký -Sumgayýt yolu, 16. km., Xýrdalan - Baký / Azerbaycan
Tel: 00 994 12 - 448 28 62/66 Fax: 00 994 12 448 28 61/67
e-mail: journal@qafqaz.edu.az
web: http://journal.qafqaz.edu.az
“Journal of Qafqaz University” dergisi Qafqaz Üniversitesi Yayímídír;
1997 senesinden itibaren yílda iki defa yayímlanír.
Copyright © Qafqaz University
ISSN 1302 — 6763
Reyest: No 670, 09.11.2003
Abone
Derginin yıllık bedeli 9.2 Yeni Azerbaycan manatı olup Azerbaycan dışı için 30 ABD Dolarıdır. Abone olacakların abone bedelini
aşağıdaki hesaba yatırıp dekont fotokopisini haberleşme adresi ile beraber Qafqaz Üniversitesi'ne fakslamaları gerekmektedir.
Banka Hesabí: T.C. Ziraat Bankasí / Üsküdar-Ìstanbul, Hesap Sahibi: Ömer Okumuå, Hesap Türü/Para Birimi: Vadesiz Hesap/TL
Hesap No: 2426261-5001403, IBAN: TR890001000403024262615001 (Türkiye);
Qafqaz Üniversitesi: VÖEN: 1300325511, Hesab No: 38090000900001 AZN, 38190066220001 USD, Kod: 506452 Müx. Hes. 0137010031944
“Texnikabank ASC” Abåeron Filialí - VÖEN: 9900000681 SWIFT BIC: TECIAZ22 (Azärbaycan)
ISSN 1302-6763

Журнал
Университета
Кавказ
Журнал “Journal of Qafqaz University” входит в Российский
периодический каталог, Directory of Open Access Journals,
Middle East Virtual Library, The International Consortium for the
Advancement of Academic Publication, JournalSeek, Genamics,
RefSeek, Dspace, Eprints, Indexcopernicus.

Серия Естествознания
и Техники

No 25, 2009
Учредитель
Ахмед Санич

Редактор
Нифтали Годжаев

Председатель издательского совета


Эльчин Сулейманов

Издательский Совет
Члены Ирада Алиева
Члены Мугaррам Кaплан
Члены Мурат Эргуван
Члены Иcлам Гусейнов
Секретарь Рамиль Гаджиев

Редакционная Коллегия
Ахмет Оксуз Мамедали Бабашлы
Айхан Ердал Мехмeт Рыхтым
Али Бора Муcтaфa Aкдaг
Джихан Булут Рехa Йылмaз
Фахреддин Исаев Омaр Окумуш
Гамзага Oруджов Xалил Исмаилов

Международный Консультативный Совет


Абдул Азиз Абдул Хафиз Эль Хоули (Египeт, Каирский Университет) Латиф Гусейнов (Азербайджан, Милли Меджлис)
Али Фуaд Билкaн (Турция, Екoнoмический Технoлoгический Университет) Мухаммед Табризи (США, Восточный Университет Королина)
Аждар Агаев (Азербайджан, Институт Проблем Образования) Мухиддин Шимшек (Турция, Университет Сакаря)
Аkиф Гусейнли (Азербайджан, Национальная Академия Наук) Надир Алишов (Украина, Академия Наук)
Али Челик (Турция, Технический Университет Карадениз) Назан Бекироглы (Турция, Технический Университет Карадениз)
Бахрам Acкеров (Азербайджан, Бакинский Госуд. Университет) Надир Сейидов (Азербайджан, Национальная Академия Наук)
Дон C. Хинец (США, Университет Tрoй) Рacим Aликuлиев (Азербайджан, Национальная Академия Наук)
Эрхан Биргили (Турция, Университет Сакаря) Саим Селви (Турция, Университет Еге)
Эрoл Oрaл (Киргизстан, Международный Университет Ататюрк Алатоо) Салих Шимшек (Турция, Университет Сакаря)
Фархад Гусейнов (Турция, Университет Билкент) Сами Карахан (Турция, Университет Коня Селчук)
Фируддин Самандаров (Азербайджан, Бакинский Госуд. Университет) Шамиль Самедзаде (Азербайджан, Технический Университет)
Гхолам Рыза Сабри Табризи (Королевский Колледж Лoндoнского Ун. Единбург) Сурхай Aкберов (Турция, Технический Университет Йылдыз)
Гюльтекин Йылдыз (Турция, Университет Сакаря) Табриз Алиев (Азербайджан, Госуд. Нефтяная Академия)
Oктaй Kacымов (США, Университет Кaлифoрния) Тофиг Гаджиев (Азербайджан, Бакинский Госуд. Университет)
Халид Пастаджи (Турция, Технический Университет Йылдыз) Тарлан Aфaндиев (Белaруссия, Академия Наук)
Хакан Аджар (Турция, Университет Фатиx) Тeлмaн Алиев (Азербайджан, Национальная Академия Наук)
Хилми Kырлыкоглу (Турция, Университет Сакарйа) Васим Мамедалиев (Азербайджан, Бакинский Госуд. Университет)
Джeймc Ф.Ринехард (США, Университет Tрoй) Халил Kacымов (Азербайджан, Национальная Академия Наук)
Ибрагим Эль-Раби (США) Владимир Пашенко (Россия, Moскoвкий Госуд. Университет )
Ирада Алиева (Азербайджан, Бакинский Государственный Университет) Якуб Махмудов (Азербайджан, Национальная Академия Наук)
Исмаиль Озсой (Турция, Университет Фатиx) Юсуф Туна (Турция, Станбульский Университет)
Kэв Caлихoв (Taтaрыcтaн, Университет Kaзaн) Зафер Aйвaз (Турция, Университет Еге)
Константин Вальдемарович Шаитан (Россия, Московский Гос. Унив.) Taтьянa Бирштeйн (Россия, Академия Наук)

Дизайн
Сахиб Казымов

Адрес
«Journal of Qafqaz University»
AZ0101, Шоссе Баку–Сумгаит, 16 км, Хырдалан - Баку / Азербайджан
Teл: 00 994 12 - 448 28 62/66 Faкс: 00 994 12 448 28 61/67
e-mail: journal@qafqaz.edu.az
web: http://journal.qafqaz.edu.az
Журнал «Journal of Qafqaz University» издание
Университета Кавказ, публикуется два раза в год с 1997 года
Copyright © Qafqaz University
ISSN 1302 - 6763
Reyest: No: 670, 09.11.2003
Абонент
Годовая абонентская плата 9.2 AZN, за рубежом 30 $ (USD). Абоненты должны перечислить
деньги на нижеследующие счета и выслать нам по факсу обратный адресс и счет фактуру.
Банковские Счета: T.C. Ziraat Bankasí / Üsküdar-Ìstanbul, Hesap Sahibi: Ömer Okumuå, Hesap Türü/Para Birimi: Vadesiz Hesap/TL
Hesap No: 2426261-5001403, IBAN: TR890001000403024262615001 (Türkiye);
Qafqaz Üniversitesi: VÖEN: 1300325511, Hesab No: 38090000900001 AZN, 38190066220001 USD, Kod: 506452 Müx. Hes. 0137010031944
“Texnikabank ASC” Abåeron Filialí - VÖEN: 9900000681 SWIFT BIC: TECIAZ22 (Azärbaycan)
Journal of Qafqaz University
An International Journal

Number 25, 2009


Science

Contents

Physics and technics  1 
 
Структурно‐функциональная взаимосвязь кардиоактивных пептидов,         
миелопептидов и гликопептидов 
Л. И. Исмаилова  3 

Nano‐porous silicon for gas sensor and fuel cell applications 
Tayyar Dzhafarov, Sureyya Aydın Yuksel  20 

İkiölçülü dalğa tənliyinin qrup nəzəriyyəsi metodu ilə tədqiqi  
Ə.Q. Ağamalıyev  36 

Kompleks konsantrelerdeki bakır ve çinkonun selektif çözeltme  
imkânları üzerine bir araştırma 
Mustafa Akdağ  40 

About structural changes in polyethylene glycol ‐ C4O6H4Na2 ‐ water two‐phase system 
E.A. Masimov, H.F. Abbasov, T.O. Bagirov  46 

Heptapeptid molekulunun nəzəri konformasiya analizi 
N.A. Əhmədov, R.M. Abbaslı, E.M.Həsənov  49 

Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐Nh2 molekulunun fəza quruluşu 
N.A.Əhmədov, R.M.Abbaslı, İ.T.Məmmədova, Ş.N.Hacıyeva  54 

Определение сечения когерентного рассеяния нейтронов на  
кристаллах изотопов лития, углерода и никеля кодом MCNP4C 
Масти. Д  58 

Эффект заполнения зон в кристаллах Gase при  
высоких уровнях оптического возбуждения 
А.А. Салманова  64 
Электронно‐конформационные свойства молекулы вилон 
Л.С. Гаджиева, Л.И. Исмаилова  69 

Депонирование и транспорт оксида азота в биологических системах 
И.С. Курбанов  76 

Toz metalürjisi ile üretilmiş iki metal parçanın difüzyon kaynağıyla  
birleştirilmesinde sıcaklığın kaynak bölgesine etkisinin irdelenmesi 
Yadullah Babayev  92 

Конформационные свойства молекулы антимикробного пептида тритрптицина 
Г.А. Агаева, Р.Э. Алиев  101 

Обобщение экспериментальных данных по изобарной объемной теплоемкости 
бинарных растворов метанола и изоспиртов 
Махир Баширов, Яшар Назиев, Акиф Бахшиев  111 

Электронное строение мономерных и димерных  
комплексов молекулы карнозина с цинком 
С.Д. Демухамедова, И.Н. Алиева, Н.М. Годжаев, Н.С. Набиев  114 

Mathematics  127 

New inequalities on triangle areas 
Y.N. Aliyev  129 
 
Лифты векторных полей в полутензорное расслоение типа (2,0) 
Габил Фаттаев  136 

Об отображении двумерных евклидовых пространств 
Наджаф Ягуб оглы Алиев  141 
Journal of Qafqaz University
An International Journal

№: 25, 2009
Texniki Elmlər

İçindəkilər

Fizika və Texnika  1  
 

Структурно‐функциональная взаимосвязь кардиоактивных пептидов,         
миелопептидов и гликопептидов 
Л. И. Исмаилова  3 

Nano‐porous silicon for gas sensor and fuel cell applications 
Tayyar Dzhafarov, Sureyya Aydın Yuksel  20 

İkiölçülü dalğa tənliyinin qrup nəzəriyyəsi metodu ilə tədqiqi  
Ə.Q. Ağamalıyev  36 

Kompleks konsantrelerdeki bakır ve çinkonun selektif çözeltme  
imkânları üzerine bir araştırma 
Mustafa Akdağ  40 

About structural changes in polyethylene glycol ‐ C4O6H4Na2 ‐ water two‐phase system 
E.A. Masimov, H.F. Abbasov, T.O. Bagirov  46 

Heptapeptid molekulunun nəzəri konformasiya analizi 
N.A. Əhmədov, R.M. Abbaslı, E.M.Həsənov  49 

Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐Nh2 molekulunun fəza quruluşu 
N.A.Əhmədov, R.M.Abbaslı, İ.T.Məmmədova, Ş.N.Hacıyeva  54 

Определение сечения когерентного рассеяния нейтронов на  
кристаллах изотопов лития, углерода и никеля кодом MCNP4C 
Масти. Д  58 

Эффект заполнения зон в кристаллах Gase при  
высоких уровнях оптического возбуждения 
А.А. Салманова  64 
Электронно‐конформационные свойства молекулы вилон 
Л.С. Гаджиева, Л.И. Исмаилова  69 

Депонирование и транспорт оксида азота в биологических системах 
И.С. Курбанов  76 

Toz metalürjisi ile üretilmiş iki metal parçanın difüzyon kaynağıyla  
birleştirilmesinde sıcaklığın kaynak bölgesine etkisinin irdelenmesi 
Yadullah Babayev  92 

Конформационные свойства молекулы антимикробного пептида тритрптицина 
Г.А. Агаева, Р.Э. Алиев  101 

Обобщение экспериментальных данных по изобарной объемной теплоемкости 
бинарных растворов метанола и изоспиртов 
Махир Баширов, Яшар Назиев, Акиф Бахшиев  111 

Электронное строение мономерных и димерных  
комплексов молекулы карнозина с цинком 
С.Д. Демухамедова, И.Н. Алиева, Н.М. Годжаев, Н.С. Набиев  114 

Riyaziyyat  127 

New inequalities on triangle areas 
Y.N. Aliyev  129 
 
Лифты векторных полей в полутензорное расслоение типа (2,0) 
Габил Фаттаев  136 

Об отображении двумерных евклидовых пространств 
Наджаф Ягуб оглы Алиев  141 
    
Journal  
  of  
Qafqaz  
University 

  PHYSICS AND TECHNICS
 
  FİZİKA VƏ TEXNİKA 
 
  FİZİK VE TEKNİK 
 
    ФИЗИКА И TEXHИКА 
 
 
 
 
СТРУКТУРНО‐ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ВЗАИМОСВЯЗЬ 
КАРДИОАКТИВНЫХ ПЕПТИДОВ, МИЕЛОПЕПТИДОВ И 
ГЛИКОПЕПТИДОВ 

Л. И.  ИСМАИЛОВА 
Институт Физических Проблем,  
Бакинский Государственный Университет  
Баку / АЗЕРБАЙДЖАН 
Larisa_Ismailova@yahoo.com

РЕЗЮМЕ 

Методом  молекулярной  механики  была  изучена  пространственная  структура  кардиоактивных  пепти‐


дов, миелопептидов и гликопептидов. С помощью теоретического   конформационного анализа найдены 
низкоэнергетические конформации пептидных молекул, их энергетические и геометрические параметры. 
Ключевые слова: пептид, конформация, структура, молекула 

STRUCTURE‐FUNCTIONAL RELATIONSHIP OF THE CARDIO ACTIVE PEPTIDES,                
MYELOPEPTIDES AND GLYCOPEPTIDES 

ABSTRACT 

The spatial structure of the cardioactive peptides, myelopeptides and glycopeptides were investigated using 
method  of  molecular  mechanics.  By  theoretical  conformational  analysis  method  has  been  investigated  the  low‐
energy conformations, geometric and energetic parameters of these molecules. 
Key words: peptide, conformation, structure, molecule 

действии  биологически  активного  пеп‐


I. Ввдение 
тида  с  рецептором  могут  происходить  
Функционирование  живых  организмов  конформационные  изменения  пептид‐
обеспечивается  пептидными  молекула‐ ной цепи, которые обеспечивают эффек‐
ми,  которые  осуществляют  все  регуля‐ тивные взаимодействия активного центра 
торные процессы в клетке. Понять меха‐ молекулы с лиганд ‐ связывающим цент‐
низмы  действия  этих  биомолекул  мож‐ ром  рецептора.  Биологически  активная 
но,  если  решить  задачу  их  структурной  конформация  пептидной  молекулы,  ко‐
и  структурно‐функциональной  органи‐ торая реализуется при взаимодействии с 
зации. Короткие линейные пептиды, как  рецептором, обычно входит в набор низ‐
правило, не имеют в растворах фиксиро‐ коэнергетических  структур,  существую‐
ванной  пространственной  структуры.  щих  в  водном  растворе.  Поэтому  пред‐
Они  существуют  в  виде  набора  низко‐ ставляет самостоятельный интерес иссле‐
энергетических  конформаций,  который  дование  пространственного  строения  и 
определяется их аминокислотной после‐ конформационных  возможностей  пеп‐
довательностью  и  физико‐химическими  тидных молекул. Нужно не только опре‐
свойствами  растворителя.  При  взаимо‐ делить  пространственную  организацию 

Number 25, 2009    3
Л. И.  Исмаилова 

молекулы  на  атомном  уровне,  но  и  диоактивных пептидных молекул, шести  


исследовать  ее  динамические  характе‐ молекул  миелопептидов,  трех  пептидов 
ристики, определить подвижность ее от‐ с  ингибирующими  свойствами  и  шести 
дельных структурных единиц.   гликопептидных  молекул.  Были  изуче‐
ны точечные замены при теоретическом 
Широко используемые в настоящее время 
конструировании аналогов этих природ‐
экспериментальные  методы  исследова‐
ных  молекул,  а  также  исследована  кон‐
ния (рентгеноструктурный анализ, мето‐
формационная подвижность боковых це‐
ды ЯМР, ИК, КД, ДОВ) для определения 
пей  аминокислот,  входящих  в  пептид‐
пространственной структуры пептидных 
ные молекулы. 
молекул  не  дают  полный  набор  геомет‐
рических  и  энергетических  параметров.   Для  нахождения  пространственного  ст‐
Кроме  того,  все  эти  экспериментальные  роения  биомолекул  (пептидов,  олигоса‐
методы  исследования,  давая  ценную  ин‐ харидов,  гликопептидов)  использовался 
формацию  о  конечной  структуре,  не  теоретический  подход,  позволяющий 
позволяют  количественно  определить  рассчитывать трехмерную структуру био‐
силы,  приводящие  к  этой  пространст‐ молекул  исходя  из  известной  аминокис‐
венной  структуре.  Ответить  на  многие  лотной  последовательности  [2‐10].  Слож‐
вопросы,  касающиеся  количественной  ную  задачу  нахождения  пространствен‐
оценки  геометрических  и  энергетичес‐ ной  структуры  пептидной  молекулы 
ких  характеристик  пептидных  молекул,  сводят  к  фрагментарному  расчету,  то 
могут  теоретические  методы  исследова‐ есть  пептидную  молекулу  разбивают  на 
ния структуры, а именно метод теорети‐ участки  меньшей  длины  и  находят  их 
ческого конформационного анализа.  пространственную структуру. Специаль‐
Чтобы  определить  пространственное  но  введенная  классификация  (конфор‐
строение  пептидных  и  гликопептидных  мация,  форма  основной  цепи,  шейп) 
молекул  и    исследовать  их  структурно‐ позволяет  ориентироваться  в  огромном 
функциональную взаимосвязь была необ‐ числе  рассматриваемых  структур,  пред‐
ходима  программа,  которая  позволила  полагая, что низкоэнергетическая струк‐
бы находить с помощью метода теорети‐ тура  биомолекулы  формируется  из  от‐
ческого конформационного анализа трех‐ дельных  структурных  блоков  меньшей 
мерную  структуру  этих  биомолекул  и  длины,  которые  потом  укладываются  в 
структуру их комплексов с помощью вы‐ пространственную  структуру  всей  моле‐
числительной  техники.  Такая  програм‐ кулы  [2‐4].  Формы  остатков  определ‐
ма  была  нами  разработана  [1].  Она  поз‐ ялись  низкоэнергетическими  областями 
волила изучать пространственную струк‐ B, R, L  двугранных углов основной цепи 
туру  и  конформационные  возможности  φ‐ψ. При расчете  рассматривались  раз‐
пептидных молекул.   вернутые  формы  дипептидной  молеку‐
лы  (BB,  BR,  LB,  LR)  и  свернутые  формы 
Основная  цель  данной  статьи  состоит  в 
основной цепи (RB, RR, BL).  
определении  структурно‐функциональ‐
ной связи  пептидных и гликопептидных  Конформационное  состояние  каждого 
молекул,  в  изучении  внутримолекуляр‐ аминокислотного  остатка  обозначалось 
ных и межмолекулярных взаимодействий  символом Xіј , где X означает одну из воз‐
в  этих  молекулах.  Нами  было  найдено  можных форм основной цепи  B, R, L, P, 
пространственное строение и конформа‐ а  индексы  іј    =  11…,  12…,13…,  21…и  т.д. 
ционные возможности одиннадцати кар‐ обозначают  положения  углов  боковой 

4  Journal of Qafqaz University   
Структурно‐Функциональная Взаимосвязь Кардиоактивных Пептидов, Миелопептидов и Гликопептидов 

цепи    χ1,  χ2,  χ3...  При  этом  индекс  1  ется  метод  теоретического  конформа‐
соответствует значению угла χ в области  ционного  анализа,  который  позволяет  с 
0 −120º, 2 − 120 − ‐120º, 3 − ‐120 − 0º. Отсчет  достаточной  точностью  количественно 
двугранных  углов  вращения  проводился  описать геометрию молекулы и энергию 
согласно  стандартной  номенклатуре  взаимодействия атомов в этой молекуле 
IUPAC‐IUB [11].  или  между  молекулами.  Он  исходит  из 
Известно,  что  пептидные  молекулы    по‐ механической  модели,  рассматриваю‐
лифункциональны. Это обусловлено тем,  щей  молекулу  как  систему  взаимодейс‐
что пространственное строение этих мо‐ твующих  атомов,  при  этом  полностью 
лекул  может  принимать  в  физиологи‐ абстрагируясь  от  электронов  и  ядер. 
ческих условиях ограниченный набор ст‐ Поэтому  метод  теоретического  конфор‐
руктур.  В  данной  работе  для  нахожде‐ мационного  анализа  еще  называют  ме‐
ния  пространственного  строения  пеп‐ тодом молекулярной механики. 
тидных  молекул  использован  теорети‐ Расчет  выполнялся  в  рамках  механичес‐
ческий подход, предложенный Поповым  кой  модели  молекул  с  учетом  невалент‐
Е.М.[2,  6,  10].  Этот  подход  позволяет  ных,  электростатических,  торсионных 
решить структурно‐функциональную за‐ взаимодействий  и  энергии  водородных 
дачу, разделив ее  на несколько этапов:  связей.  Невалентные  взаимодействия 
1. Структурный  этап–нахождение  прос‐ оценивались  по  потенциалу  Леннарда‐
транственной  структуры  и  конформа‐ Джонса с параметрами Скотта и Шераги 
ционной  динамики  пептидной  молеку‐ [12]. Электростатические взаимодействия 
лы  на  основании  известной  аминокис‐ рассчитывались в монопольном прибли‐
лотной  последовательности.  Использо‐ жении по закону Кулона c с использова‐
вание метода теоретического конформа‐ нием  зарядов,  предложенных  в  работе 
ционного  анализа  позволяет  по  извест‐ [13].  Конформационные  возможности 
ной  химической  структуре  найти  пол‐ пептидов  рассчитывались  применитель‐
ный  набор  низкоэнергетических,  биоло‐ но  к  условиям  водного  окружения,  по‐
гически активных конформаций.  этому  величина  диэлектрической  про‐
2. Структурно‐функциональный  этап– ницаемости  принята  равной  10.  Водо‐
конструирование  искусственных  анало‐ родные  связи,  которые  оценивались  по 
гов, пространственное строение которых  потенциалам  типа  Морзе,  предполага‐
отвечает  набору  низкоэнергетических  лись ослабленными (максимальная энер‐
конформаций  природных  пептидных  гия  образования  водородной  связи  при 
молекул. Этот этап позволяет связать ст‐ ro=1,8Å  составляла  1,5  ккал/моль).  Тор‐
руктуру молекулы с выполняемой функ‐ сионные потенциалы и величины барье‐
цией.  ров  вращения  аналогичны  величинам,  
3. Этап  количественной  оценки  биоло‐ предложенным в работах [12, 14].  
гической  активности  пептидных  моле‐
кул,  оценки  участков  связывания  с  ре‐ II. Кардиоактивные пептиды.  
цептором  и  сопоставления  теоретичес‐ Был  проведен  расчет  пространственной 
ких результатов расчетов пространствен‐ структуры молекул кардиоактивных пеп‐
ной структуры пептидных молекул с из‐ тидов,  относящихся  к  классу  нейропеп‐
вестными экспериментальными данными.   тидов [15‐21]. Выбор объектов исследова‐
Для  определения  пространственной  ст‐ ния был продиктован их актуальностью, 
руктуры  пептидных  молекул  использу‐ так как по данным Всемирной организа‐

Number 25, 2009    5
Л. И.  Исмаилова 

ции здоровья сердечно‐сосудистые забо‐ На  первом  этапе  на  основе  низкоэнер‐


левания  занимают  по  своей  распрос‐ гетических конформаций монопептидов 
траненности  первое  место  среди  наибо‐ были  изучены  конформационные  воз‐
лее часто встречающихся заболеваний на  можности  трех  тетрапептидных  участ‐
нашей  планете.  Интерес  к  структуре  и  ков  молекулы  Met1‐Asn2‐Tyr3‐Leu4,  Leu4‐
функциям  кардиоактивных пептидов не  Ala5‐Phe6‐Pro7 и Phe6‐Pro7‐Arg8‐Met9. Этот 
утихает и по сегодняшний день [22‐25]. В  расчет  позволил  найти  все  возможные 
качестве  объектов  исследования  нами  для  тетрапептидов  конформационные 
выбраны  11  кардиоактивных  пептидов,  состояния,  выявить  из  них  наиболее 
имеющих  следующие  аминокислотные  предпочтительные  по  энергии,  оценить 
последовательности:  тетрапептиды  Phe‐ роль  взаимодействий  между  соседними 
Met‐Arg‐Phe‐NH2  и  Phe‐Ile‐Arg‐Phe‐NH2,  остатками  в  дифференциации  форм  по 
пентапептиды  Leu‐Pro‐Leu‐Arg‐Phe‐NH2,  энергии. В энергетический интервал  0÷4 
Glu‐Phe‐Leu‐Arg‐Ile‐NH2,  Pro‐Phe‐Tyr‐Arg‐ ккал/моль  попадают  представители всех 
Ile‐NH2  и  Glu‐Phe‐Phe‐Pro‐Leu‐NH2,  гепта‐ возможных форм основной цепи и шей‐
пептид  Lys‐Ser‐Ala‐Phe‐Val‐Arg‐Phe‐NH2,  пов,  поэтому  говорить  об  энергетичес‐
октапептид  Pro‐Gln‐Asp‐Pro‐Phe‐Leu‐Arg‐ кой  дифференциации  конформаций 
Ile‐NH2,  нонапептид  Met‐Asn‐Tyr‐Leu‐Ala‐ этих тетрапептидов не приходится. Луч‐
Phe‐Pro‐Arg‐Met‐NH2, декапептиды Pro‐Asp‐ шие  представители  всех  форм  основной 
Val‐Asp‐His‐Val‐Phe‐Leu‐Arg‐Phe‐NH2  и  Ala‐ цепи  и  шейпов  были  учтены  при  рас‐
Pro‐Asn‐Phe‐Leu‐Ala‐Tyr‐Pro‐Arg‐Leu‐NH2.   чете  гептапептида  Met1‐Pro7  и  нонапеп‐
тида Met1‐Met9‐NH2. 
Остановимся  подробно  на  определении 
пространственного  строения    некоторых  Начальные  нулевые  приближения  для 
из  рассчитанных  пептидных  молекул.  минимизации энергии гептапептидного 
Нонапептид  Met1‐Asn2‐Tyr3‐Leu4‐Ala5‐ фрагмента Met1‐Asn2‐Tyr3‐Leu4‐Ala5‐Phe6‐
Phe6‐Pro7‐Arg8‐Met9‐NH2    принадлежит к  Pro7  формировались  из  низкоэнергети‐
семейству кардиоактивного нейропепти‐ ческих конформаций восьми возможных 
да  FMRF‐амида.  Специфика  аминокис‐ шейпов  тетрапептида  Met1‐Asn2‐Tyr3‐
лотной последовательности продиктова‐ Leu4  и  четырех  шейпов  тетрапептида 
ла  следующую  схему  конформационно‐ Leu4‐Ala5‐Phe6‐Pro7.  Составленные  таким 
го  анализа  нонапептидной  молекулы.  образом  исходные  нулевые  приближе‐
Сначала  исследовались  конформацион‐ ния минимизировались по энергии при 
ные  свойства  трех  перекрывающихся   вариации  всех  переменных  двугранных 
тетрапептидных фрагментов   Met1‐Asn2‐ углов основной и боковых цепей амино‐
Tyr3‐Leu4, Leu4‐Ala5‐Phe6‐Pro7 и Phe6‐Pro7‐ кислот,  входящих  в  данный  фрагмент 
Arg8‐Met9,  затем  на  основе  результатов  молекулы. Проведенный расчет показал, 
расчета двух первых тетрапептидов  был  что  рассмотренные  170  конформаций, 
проведен  теоретический  конформаци‐ которые  принадлежат  32  различным 
онный  анализ  гептапептидного  участка   шейпам  гептапептидного  фрагмента, 
Met1‐Asn2‐Tyr3‐Leu4‐Ala5‐Phe6‐Pro7  и,  на‐ попадают  в  энергетический  интервал 
конец, на последнем этапе расчет  гепта‐ 0÷14,3 ккал/моль. Из них в интервал  0÷7 
пептида  и  тетрапептида  Phe6‐Pro7‐Arg8‐ ккал/моль  попадают  представители  9 
Met9,  перекрывающихся  по  двум  остат‐ шейпов,  в  интервал  0÷8  ккал/моль–кон‐
кам,  позволил  оценить  конформацион‐ формации  17  шейпов.  Все  они  были 
ные  возможности  всей  нонапептидной  включены  в  расчет  структуры    нонапеп‐
молекулы.  тидной молекулы. 

6  Journal of Qafqaz University   
Структурно‐Функциональная Взаимосвязь Кардиоактивных Пептидов, Миелопептидов и Гликопептидов 

Представители  17  шейпов  гептапептид‐ ческих взаимодействий  13,4 ккал/моль и 


ной молекулы и 4 шейпов тетрапептида  торсионных  взаимодействий  4,2  ккал/ 
составили свыше 110 начальных нулевых  моль (табл.1). 
вариантов,  принадлежащих  80  различ‐
Обращает  на  себя  внимание  тот  факт, 
ным  шейпам  природной  нонапептид‐ что  в  глобальной  конформации  присут‐
ной  молекулы.  Относительная  энергия  ствуют  все  возможные  для  нонапептид‐
конформаций  нонапептида    изменяется  ной  молекулы  виды  внутримолекуляр‐
в  пределах  0÷24.5  ккал/моль.  Таким  об‐ ных взаимодействий: от монопептидных 
разом,  из  80  рассмотренных  шейпов  и дипептидных до нонапептидных взаи‐
интерес  представляют  лишь  17  (табл.1),  модействий. Пространственное располо‐
причем  из  них  можно  выделить  четыре  жение  аминокислотных  остатков  друг 
группы  низкоэнергетических  шейпов:   относительно  друга  в  низкоэнергетичес‐
1–eeeffeee,  eeeffeff;    2–eefefeee,  eefefeef,  eefefeff;   ких  конформациях  нонапептидной  мо‐
3–ffffeeee, ffffeeef, ffffeeff;  4–fffffeee, fffffeef, fffffeff,  лекулы  Met1‐Met9‐NH2  представлено  на 
в  которых  конформации  отличаются  рис.1.  Из  этого  рисунка  видно,  что  ход 
лишь  положением  концевого  трипептид‐ основной  цепи    конформациий  шейпа 
ного  фрагмента.  Самой  низкоэнергети‐ eeeffeff  (Uотн=0  ккал/моль)  обеспечивает 
ческой  из  всех  рассчитанных  конформа‐ сближенность боковых цепей  аминокис‐
ций  является  B3222B21B11R3222RB11RR3322R2222,  лотных остатков Met1, Asn2, Tyr3 c участ‐
ками основной цепи и боковых цепей ос‐
принадлежащая  шейпу    eeeffeff.  Вклад 
татков  Phe6,  Pro7,  Arg8,  Met9  и  способст‐
невалентных  взаимодействий  в  ней  сос‐
вует их эффективным взаимодействиям. 
тавляет  (‐45,1ккал/моль),  электростати‐

Таблица 1.  Шейпы, оптимальные конформации, энергетические вклады невалентных, электростатических, 
торсионных взаимодействий нонапептидной молекулы Мet1‐Met9‐NH2 

N  Шейп  Конформация  Uнев  Uэл  Uтор  Uотн 


1  eeefeeee  B3222 B21 B31 R3222 B B11 B B2222 B3122  ‐36,5  9,7  4,8  5,5 
2  eeefeeef  B3222 B21 B31 R3222 B B21 B R2222 R3222  ‐35,8  10,0  4,0  5,7 
3  eeeefeff  B3222 B21 B31 B3222 R B11 R R3322 R3322  ‐36,2  10,3  3,7  5,3 
4  eeefeeff  B3222 B21 B31 R3222  B B11 R R3322 R3322  ‐44,0  12,5  4,5  0,5 
5  eeeffeff  B3222 B21 B11 R3222 R B11 R R3322 R2222  ‐45,1  13,4  4,2  0,0 
6  efeffeff  B2122 R21 B31 R2122 R B11 R R3322 R2222  ‐36,7  10,9  3,4  5,1 
7  eefeeeff  B3222 B21 R31 B2122 B B11 R R3322 R3322  ‐37,7  10,6  3,8  4,0 
8  eefefeee  B3222 B21 R31 B2122 R B21 B B3322 B3322  ‐41,4  9,8  4,8  0,7 
9  eefefeef  B3222 B21 R31 B2122 R B21 B R3322 R3322  ‐37,7  10,2  4,3  4,3 
10  eefefeff  B3222 B21 R31 B2122 R B11 R R3322 R2222  ‐39,0  10,2  4,6  1,3 
11  fffefeff  R2222 R21 R31 B2122 R B11 R R3322 R3322  ‐36,8  10,1  5,6  6,6 
12  ffffeeee  R2222 R21 R31 R2122 B B11 B B3322 R3122  ‐40,8  11,2  4,8  2,5 
13  ffffeeef  R2222 R21 R31 R2122 B B11 B R3322 R3122  ‐38,0  11,5  3,7  4,7 
14  fffefeff  R2222 R21 R31 B2122 R B11 R R3322 R3322  ‐40,8  11,5  3,6  1,8 
15  fffffeee  R2122 R21 R31 R2122 R B11 B B3322 B3122  ‐36,3  11,6  5,2  8,0 
16  fffffeef  R2222 R21 R31 R2122 R B11 B R2222 R3222  ‐36,9  12,7  4,2  7,5 
17  ffffeeff  R2222 R21 R31 R2122 B B11 R R3322 R3322  ‐39,5  12,3  4,1  4,4 

Number 25, 2009    7
Л. И.  Исмаилова 

Рис.1. Пространственная структура шейпов eeeffeff, eefefeee, fffefeff молекулы нонапептида Мet1‐Met9‐NH2  

Энергия  глобальной  конформации  ста‐ ких конформаций нонапептидной моле‐


билизируется  следующими  основными  кулы  Met1‐Met9‐NH2 представлены в таб‐
вкладами  межостаточных  внутримоле‐ лице 2. Эта таблица является наглядным 
кулярных  взаимодействий:  монопеп‐ примером  количественной  оценки  гео‐
тидные  взаимодействия  составлют  3,6  метрии  молекулы,  то  есть  значений 
ккал/моль, дипептидные (‐2,4 ккал/моль),  двугранных  углов  основной  цепи  (φ,ψ  и 
трипептидные  (‐2,5  ккал/моль),  тетра‐ ω) и углов боковых цепей  (χ1,χ2,  …) ами‐
пептидные  (‐7,2  ккал/моль),  пентапеп‐ нокислот,  входящих  в  нонапептидную 
тидные  (‐3,4  ккал/моль),  гексапептидные  молекулу. 
(‐2,8  ккал/моль),  гептапептидные  (‐1,1 
В  таблице  2  указаны  относительная 
ккал/моль),  октапептидные  (‐0,7  ккал/ 
моль) и нонапептидные взаимодействия  энергия  низкоэнергетической  конфор‐
(‐1,3 ккал/моль).   мации  и  соответствующий  ей  шейп,  к 
которому она принадлежит. Такая коли‐
Конформации  шейпа  eefefeee  имеют  чественная  информация  геометрии  мо‐
развернутые начальный и концевой фраг‐
лекулы  является  особенно  ценной,  так 
менты  молекулы  и  изогнутую  среднюю 
как  приводятся  двугранные  углы  не 
часть.  Низкая  энергия  лучшей  конфор‐
только  основной  цепи  молекулы,  но  и  
мации  этого  шейпа  (Uотн=0,7ккал/моль) 
боковых цепей аминокислот, входящих в 
определяется  дипептидными,  трипеп‐
эту молекулу. Используемая нами прог‐
тидными и тетрапептидными вкладами. 
рамма  позволяет  определять  также  и 
В  другой  конформации  шейпа  fffefeff  
(Uотн=1,8ккал/моль) форма основной  цепи  координаты  атомов  молекулы  в  любой 
сначала  сворачивается,  потом  отходит,  представляющей интерес конформации. 
изгибаясь,  а  конец  молекулы  опять  ока‐ Низкоэнергетические  конформации  при‐
зывается  свернутым  (рис.1).  Такой  ход  родного  кардиоактивного  нонапептида   
основной  цепи  обеспечивает  эффектив‐ Met1‐Met9‐NH2  были  использованы  в 
ные  взаимодействия  концевых  участков  качестве  исходных  структурных  вариан‐
нонапептидной  молекулы.  Здесь  основ‐ тов  для  исследования  конформацион‐
ной  вклад  вносят  трипептидные,  тетра‐ ных возможностей искусственных анало‐
пептидные, пентапептидные и гексапеп‐ гов природной молекулы (табл.3). Выбор 
тидные взаимодействия.                                                                                                          
структур  определялся  исключительно 
Значения  двугранных  углов  основной  и  стерическими соображеними. В природ‐
боковых  цепей  трех  низкоэнергетичес‐ ной  аминокислотной  последовательнос‐

8  Journal of Qafqaz University   
Структурно‐Функциональная Взаимосвязь Кардиоактивных Пептидов, Миелопептидов и Гликопептидов 

ти кардиоактивного нонапептида после‐ раничению  конформационной  свободы 


довательно  заменялись  остатки    Ala5  и  молекулы при сохранении всех функци‐
Leu4, Phe6   на их N‐ метилпроизводные.  ональных  групп  и  даже  запрещению 
Такие  замены  приводят  к  заметному  ог‐ ряда конформаций природной молеку лы,

Таблица 2.  Геометрические  параметры  (град)  низкоэнергетических  конформаций  нонапептидной  молекулы 


Met1‐Met9‐NH2 

Остаток  Шейп 
       eeeffeff  eefefeee  ffffeeff 
Met1   ‐169  138  179   ‐171  136  178    ‐47  ‐55  178 
  ‐67  ‐177 180 180  ‐67  ‐178  180 180   ‐178  177  179 180 
Asn2   ‐96  113  ‐177    ‐97  114  ‐177    ‐69  ‐57  ‐178 
  ‐176   83    ‐175   91    180  91    
Tyr3  ‐153  153  179    ‐98  ‐54  178    ‐79  ‐53  178 
 58     89   180    ‐60   92  180    ‐59   99  180 
Leu4   ‐96   ‐63   176      ‐115  124  ‐176   ‐128  119  ‐177 
 ‐60  171 ‐175  180   177  64  180  175   177  64  180  175 
Ala5    ‐86   ‐56  180    ‐87  ‐52  ‐175    ‐86  ‐53  ‐177 
          180                180             180 
Phe6   ‐162   151  177    ‐86  128  176   ‐150  142  ‐179 
         49      89    ‐177  84      48     89  
Pro7      ‐64     ‐174     114   174     ‐61   ‐177 
Arg8   ‐118   ‐59  180   ‐115   98  176   ‐117   ‐61  ‐179        
‐62  ‐66  ‐174  ‐179  ‐66  ‐67  ‐173  ‐178   ‐63  ‐66  ‐174 ‐179 
Met9   ‐131  ‐36   180  ‐121  142  180   ‐133  ‐35  180 
 ‐179 179 179  180   ‐68  ‐69 ‐177  180   ‐58  ‐60  179 180 
Uотн, ккал/моль  0  0,7  1,8 

Таблица  3. Относительная энергия (ккал/моль) конформаций молекулы Мet1‐Met9‐NH2  и ее аналогов 

N  Конформация  Нона  Аналог  Аналог 


пептид  MeAla5  MeLeu4, MePhe6 
 1  B3222 B21 B31 R3222 B B11 B B2222 B3122  5,5  17,7  2,0 
 2  B3222 B21 B31 R3222 B B21 B R2222 R3222  5,7  20,1  ‐ 
 3  B3222 B21 B31 B3222 R B11 R R3322 R3322  5,3  14,7  ‐ 
 4  B3222 B21 B31 R3222  B B11 R R3322 R3322  0,5  16,8  3,5 
 5  B3222 B21 B11 R3222 R B11 R R3322 R2222  0,0  10,5  0,0 
 6  B2122 R21 B31 R2122 R B11 R R3322 R2222  5,1  17,5  16,7 
 7  B3222 B21 R31 B2122 B B11 R R3322 R3322  4,0  8,8  11,3 
 8  B3222 B21 R31 B2122 R B21 B B3322 B3322  0,7  6,5  7,8 
 9  B3222 B21 R31 B2122 R B21 B R3322 R3322  4,3  8,9  11,8 
10  B3222 B21 R31 B2122 R B11 R R3322 R2222  1,3  3,4  9,2 
11  R2222 R21 R31 B2122 R B11 R R3322 R3322  6,6  0,0  12,5 
12  R2222 R21 R31 R2122 B B11 B B3322 R3122  2,5  9,9  8,2 
13  R2222 R21 R31 R2122 B B11 B R3322 R3122  4,7  5,7  16,7 
14  R2222 R21 R31 B2122 R B11 R R3322 R3322  1,8  7,9  6,0 
15  R2122 R21 R31 R2122 R B11 B B3322 B3122  8,0  ‐  ‐ 
16  R2222 R21 R31 R2122 R B11 B R2222 R3222  7,5  ‐  ‐ 
17  R2222 R21 R31 R2122 B B11 R R3322 R3322  4,4  ‐  ‐ 

Number 25, 2009    9
Л. И.  Исмаилова 

но не вызывают образования новых низ‐ осуществляется  методом  проб  и  оши‐


коэнергетических  состояний.  Относитель‐ бок. 
ная  энергия  пространственных  структур 
Расчет  декапептидной  молекулы  Ala1‐
аналогов  кардиоактивного  нонапептида 
Pro2‐Asn3‐Phe4‐Leu5‐Ala6‐Tyr7‐Pro8‐Arg9‐
показана  в  таблице  3.  Из  этой  таблицы  
Leu10‐NH2,  которая  увеличивает  перенос 
следует,  что  для    ряда  пространственных 
ионов  Na+  и    Ca2+через  мембрану,    вы‐
структур,  предпочтительных  для  при‐
полняет  сократительную  функцию.  Экс‐
родной  нонапептидной  молекулы, рез‐
периментальные  данные  по  изучению 
ко  уменьшается  число  реальных  кон‐
биологической  активности  декапептид‐
формаций  для  искусственных  аналогов. 
ной молекулы отмечают, что С‐концевой 
Глобальная  конформация  в  аналоге 
тетрапептидный  участок  Tyr4‐Pro8‐Arg9‐
MeLeu4,  MePhe6  сохраняется,  низкоэнер‐
Leu10‐NH2 не проявляет активности даже  
гетической  остается  и  конформация 
в  случае  очень  высоких  концентраций. 
шейпа  eeefeeff,  зато  энергия    всех  осталь‐
ных  шейпов  резко  возрастает.  Значит,  Зато,  гексапептидный  участок  Leu5‐Ala6‐
такая  точечная  замена  не  приводит  к  Tyr7‐Pro8‐Arg9‐Leu10‐NH2  молекулы  яв‐
потере функциональной активности  мо‐ ляется  той  минимальной    структурной 
лекулы    и  может  представлять  интерес  единицей, которая необходима для про‐
при синтезе искусственных аналогов, ко‐ явления активности и связи с молекулой 
торые  выполняют  функции  природной  рецептора.  Расчет  пространственного 
пептидной  молекулы.  Такие  точечные  строения  молекулы  Ala1‐Leu10‐NH2  про‐
замены  в  аминокислотной  последова‐ водился  по  следующей  схеме:  N‐конце‐
тельности  природной  пептидной  моле‐ вой  пентапептид  Ala1‐Pro2‐Asn3‐Phe4‐
кулы  позволяют  не  только  выявить  ее  Leu5,  С  –  концевой    тетрапептид  Tyr7‐
искусственные аналоги, но и рекомендо‐ Pro8‐Arg9‐Leu10‐NH2,  гексапептид  Leu5‐
вать их для биохимического синтеза, что  Ala6‐Tyr7‐Pro8‐Arg9‐Leu10‐NH2  и,  наконец, 
очень  важно,  так  как  синтез  в  основном  декапептид Ala1‐Leu10‐NH2 .  
Таблица 4.  Энергетические вклады низкоэнергетических конформаций декапептидной молекулы        
Ala1‐Leu10‐NH2 

N  Конформация  Uнв  Uэл  Uторс  Uоб  Uотн 


1  B2 RR11B21B2222R2B11BB1222B2122  ‐49.3  3.0  4.7  ‐41.6  0 
2  B2RR21B11R3222R2B11BB1222B3122  ‐48.4  3.0  4.7  ‐40.7  0.9 
 3  B2RR21B11B2222R2B11BB1222B2122  ‐47.5  4.8  4.6  ‐38.1  3.5 
4  B2RB21R11B2222R2B11BB1222B2122  ‐44.4  3.6  4.4  ‐36.4  5.2 
5  B2RB11B21B2122R2B21RR2222R3222  ‐47.8  4.1  7.6  ‐36.2  5.4 
6  B2RR11R21B2222R2B11BB1222B2122  ‐45.0  4.9  4.2  ‐36.0  5.6 
7  B2BR11R11R2122B2B21RR1222R3222  ‐46.8  4.4  6.9  ‐35.5  6.1 
8  B2RR21B11R2122B3B21RR1222R3222  ‐45.3  3.5  6.7  ‐35.2  6.4 
9  B2RR21B11B2122R3B21RR1222R3222  ‐45.9  4.4  6.7  ‐34.9  6.7 
10  B2RB21R11B2122R2B21RR1222R3222  ‐44.9  3.7  6.5  ‐34.7  6.9 
             
Молекула кардиоактивного декапептида  конформаций, которые затем были про‐
содержит  170  атомов  и  49  переменных  минимизированы  по  энергии.  Расчет 
двугранных  углов  основной  и  боковых  показал,  что  полученные  пространст‐
цепей  аминокислотных  остатков,  входя‐ венные  структуры  декапептида  попада‐
щих  в  нее.  На  последнем  этапе  для  нее  ли  в  широкий  энергетический  интервал 
было  составлено  свыше  100  начальных  0÷16.1  ккал/моль.  Самые  низкоэнергети‐

10  Journal of Qafqaz University   
Структурно‐Функциональная Взаимосвязь Кардиоактивных Пептидов, Миелопептидов и Гликопептидов 

ческие  конформации  из  них,  энергия  ных  взаимодействий.  В  случае  гексапеп‐


которых попадала в интервал  0÷10 ккал/  тидного  фрагмента  и  всей  декапептид‐
моль,  представлены  в  табл.  4.  Здесь  же  ной молекулы, которые являются актив‐
для  полученных  пространственных  ст‐ ными,  самой  низкой  энергеей  обладают  
руктур  представлены  энергетические  структуры с вытянутым концевым участ‐
вклады невалентных, электростатических,  ком молекулы. Это наталкивает на мысль, 
торсионных  взаимодействий  и  относи‐ что одинаковая пространственная струк‐
тельная  энергия  для  десяти  пространст‐ тура  концевой  части  гексапептидного 
венных структур.  участка  и  декапептидной  молекулы  и 
является  ответственной  за  обеспечение 
Глобальной  структурой  декапептидной 
их функциональной активности. Сравне‐
молекулы  (Uотн=0.0ккал/моль)  является 
ние  всех  низкоэнергетических  структур 
конформация  B2RR11B2B22B2B1BB1222B21. 
изолейциновых кардиопептидов позвол‐
Энергетический вклад невалентных взаи‐
яет  сделать  вывод,  что  свернутый  конец 
модействий в ней составляет  (‐49.3 ккал/ 
пространственного  строения  этих  моле‐
моль), электростатических  (3.0 ккал/моль) 
кул  обеспечивает  их  связь  с  рецептором 
и  и  торсионных  (4.7  ккал/моль).  В  этой 
и  выполнение  сократительной  функции 
конформации  энергетическое  распреде‐
кардиоактивных пептидов. Такой ход ос‐
ление  межостаточных  взаимодействий  в 
новной цепи  освобождает боковую цепь 
молекуле декапептида таково: дипептид‐
аминокислоты  Arg  от  сильных  взаимо‐
ные  вклады    (‐17.1  ккал/моль),  трипеп‐
действий  с  другими  боковыми  цепями 
тидные    (‐14.8  ккал/моль),  тетрапептид‐
молекул,  тем  самым  освобождая    этот 
ные  (‐4.5  ккал/моль),  пентапептидные    
аминокислотный  остаток  для  взаимо‐
(‐5.5  ккал/моль),  гексапептидные  (‐1.9 
действий с молекулой рецептора.  
ккал/моль),  гептапептидные  взаимодей‐
ствия    (‐2.3  ккал/моль),  октапептидные     Сравнение  аминокислотных  последова‐
(‐2.6  ккал/моль)  и  нонапептидные  (3.1  тельностей  пептидных молекул Phe‐Met‐
ккал/моль).  Пространственное  располо‐ Arg‐Phe‐NH2,  Leu‐Pro‐Leu‐Arg‐Phe‐NH2, 
жение  аминокислот,  представленное  на  Met1‐Asn2‐Tyr3‐Leu4‐Ala5‐Phe6‐Pro7‐Arg8‐
рис.2,  показывает,  что  боковые  цепи  Met9‐NH2  и  Pro‐Asp‐Val‐Asp‐His‐Val‐Phe‐
аминокислотных  остатков    Arg9  и  Tyr7,   Leu‐Arg‐Phe‐NH2 и сравнение полученных 
хотя  и  осуществляют  взаимодействия  с  результатов  расчетов  пространственного 
соседними  по  цепи  остатками,  однако  строения  этих  молекул  позволяет  сде‐
они  полностью  не  исчерпывают  свои  лать  следующие  заключения.  Все  кар‐
конформационные  возможности,  о  чем  диоактивные  пептидные  молекулы  за‐
свидетельствуют  построенные  коформа‐ канчиваются одинаковыми дипептидны‐
ционные карты.   ми  концевыми  фрагментами,  включаю‐
щими аминокислотные остатками  арги‐
Сопоставление результатов расчета прос‐ нина и фенилаланина. Замена этих ами‐
транственной  структуры  декапептида  и  нокислот  на    D‐Ala  в  случае  каждой  из  
ее  фрагментов,  показал,  что  для  тетра‐ перечисленных молекул приводила к пол‐
пептидного  участка  низкоэнергетичес‐ ному  перераспределению  низкоэнерге‐
кими  являются  структуры  со  свернутым  тических  конформационных  структур, 
концом молекулы. Именно такой ход ос‐ что позволяет сделать вывод о важности 
новной  цепи  молекулы  сближает  боко‐ именно этих остатков для функциональ‐
вые  цепи  остатков  и  способствуют  воз‐ ных  особенностей  кардиоактивных  мо‐
никновению  сильных внутримолекуляр‐ лекул.  Обращает  на  себя  внимание    тот 

Number 25, 2009    11
Л. И.  Исмаилова 

факт,  что  независимо  от  длины  амино‐ Asp‐Pro‐Phe‐Leu‐Arg‐IleNH2,  которые    об‐


кислотных  последовательностей  в  этих  ладают высоким уровнем сократительной 
пептидных  молекулах  (тетра‐,  пента‐,  активности.  Сравнительный  анализ  изо‐
нона‐  или  декапептид)  в  низкоэнерге‐ лейциновых  кардиоактивных  пептидов 
тических структурах концевой тетрапеп‐ обнаружил  сходство  в  структуре  низко‐
тид  имеет  одинаковые  конформации  –  энергетических  конформаций  этих  мо‐
шейп  eff,  то  есть  свернутый  С‐конеце‐ лекул. Все глобальные пространственные 
вой участок молекулы.  структуры имеют свернутый С‐концевой 
пентапептидный  участок  молекулы  в 
случае  октапептидной  молекулы  и  пол‐
ностью  свернутую  структуру  в  случае 
пентапептьидных  молекул.  Такой  ход 
основной  цепи  молекул  обеспечивает 
сближенность боковых цепей аминокис‐
лот,  входящих  в  эти  молекулы  и  их  те‐
денцию к  взаимодействию между собой 
и с участками основой цепи молекул. 
Исследование  конформационной  дина‐
мики  боковых  цепей  аминокислот  с  по‐
мощью  построения  конформационных 
карт  двугранных  углов  боковых  цепей 
для  всех  трех  молекул  обнаружило  кон‐
формационную  подвижность  боковых 
цепей  аргинина  и  фенилаланина.  В  са‐
мых  низкоэнергетических  конформаци‐
ях этих кардиопептидных молекул свер‐
нутый  ход  основной  цепи  освобождает 
боковую цепь аргинина от сильных внут‐
римолекулярных взаимодействий, остав‐
ляя  ей  тем  самым  возможность  взаи‐
модействия с молекулой рецептора. 

Рис.2.  Конформации B2RR11B2B22B2B1BB1222B21  Нейропептидные  молекулы  являются 


(Uотн=0.0 ккал/моль) и 2RR21B1R32R2B1BB1222B31  повсеместно  распространненным  клас‐
(Uотн=0.9 ккал/моль) молекулы Ala‐Leu10‐NH2  сом выдающихся сигнальных пептидных 
молекул.  Сами  нейропептиды,  их  прос‐
Такой ход основной цепи конца молекул 
транственное  строение  и  функциональ‐
направляет  боковые  цепи  аргинина  и 
ные  особенности  приковывают  к  себе 
фенилаланина  в  окружающую  среду  и 
внимание многих ученых в мире. Поэто‐
делает боковые цепи  Arg и  Phe  конфор‐
му  мы  выбрали  объектом  исследования 
мационно  свободными  для  взаимодей‐
нейропептидные  гексапептидные  моле‐
ствия с рецептором. 
кулы  с  аминокислотными  последова‐
Такой  подробный  конформационный  тельностями  Gly‐Ala‐Pro‐Arg‐Phe‐Val‐NH2, 
анализ  проводился  и  для  изолейцино‐ Gly‐Ala‐Pro‐Arg‐Phe‐Leu‐NH2  и  Gly‐Ala‐
вых  кардиопептидов  Glu‐Phe‐Leu‐Arg‐Ile‐ Pro‐Arg‐Phe‐Ile‐NH2,  которые  обладают 
NH2,  Pro‐Phe‐Tyr‐Arg‐Ile‐NH2  и  Pro‐Gln‐ ингибирующим  свойством.  Аминокис‐

12  Journal of Qafqaz University   
Структурно‐Функциональная Взаимосвязь Кардиоактивных Пептидов, Миелопептидов и Гликопептидов 

лотная  последовательность  исследуемых  пролина все конформации предшествую‐


гексапептидных молекул включает шесть  щего  остатка  становятся  высокоэнерге‐
аминокислот,  причем  их  N‐  концевой  тичными, поэтому из рассмотрения иск‐
участок идентичен, они отличаются кон‐ лючаются.  В  достаточно  широкий  энер‐
цевым  остатком.  Оказалось,  что  молеку‐ гетический интервал  0‐5,0 ккал/моль по‐
лы имеют похожие структурные и функ‐ падают  представители  всех  возможных 
циональные  характеристики,  подобные  для  пентапептидного  участка  форм  ос‐
опиоидным  пептидам,  которые  были  новной цепи. Низкоэнергетическими яв‐
выделены  из  позвоночных  животных.  ляются  конформации  BBRBB,  BBRRB, 
Физиологические  исследования  показа‐ RBRBB  и  RBRRB  форм  основной  цепи. 
ли, что их ингибиторная активность  раз‐ Расчёт  пентапептида  Gly‐Ala‐Pro‐Arg‐Phe  
лична.   выявил  широкий  спектр  конформаций, 
принадлежащих  всем  восьми  возмож‐
Нами  была  исследована  пространствен‐
ным  шейпам. Все они  рассматривались 
ная структура и конформационные свой‐
при  конформационным  анализе  трех 
ства  гексапептидных  молекул  Gly‐Pro‐
гексапептидных   молекул.  
Pro‐Arg‐Phe‐Val‐NH2,  Gly‐Pro‐Pro‐Arg‐Phe‐
Leu‐NH2  и  Gly‐Pro‐Pro‐Arg‐Phe‐Ile‐NH2.      Найденные  низкоэнергетические  кон‐
Гексапептидные молекулы с ингибирую‐ формации  пентапептидного  фрагмента 
щим свойством имеют общий пентапеп‐ и  низкоэнергетические  конформации 
тидный  участок,  поэтому  сначала  были  аминокислотного остатка Val послужили 
изучены  конформационные  свойства   начальными  приближениями  для  на‐
фрагмента  Gly‐Ala‐Pro‐Arg‐Phe,  затем  был  хождения  пространственной  структуры 
проведен    конформационный  анализ  всей  гексапептидной    молекулы.  Нами 
гексапептидных  молекул.  Все  три  моле‐ было  составлено  свыше  300  различных 
кулы  включают  конформационно  жест‐ начальных  приближений,  принадлежа‐
кие  (Pro,  Phe)  и  конформационно  ла‐ щих  16‐ти  возможным  шейпам  гекса‐
бильные  аминокислотные  остатки  (Arg,  пептида  (с  учетом  наличия  в  аминокис‐
Val,  Leu,  Ile),  которые  и  продиктовали  лотной  последовательности  молекулы 
данную  схему  расчета.    Пространствен‐ остатка пролина). Проведенный теорети‐
ная  структура  пентапептидного  участка  ческий  конформационный  анализ  прос‐
молекулы  Gly‐Ala‐Pro‐Arg‐Phe  исследова‐ транственной структуры гексапептидной 
на  на  основе  низкоэнергетических  кон‐ молекулы  обнаружил  резкую  энергети‐
формаций  монопептидов  глицина,  ала‐ ческую дифференциацию конформаций 
нина,  пролина,  аргинина  и  фенилала‐
и  по  шейпам,  и  по  формам  основной 
нина.  Результаты  теоретического  кон‐
цепи. Так, в энергетический интервал 0‐6 
формационного  анализа  данной  моле‐
ккал/моль попадают конформации толь‐
кулы показали, что возникает  энергети‐
ко  четырех  из  шестнадцати  шейпов  гек‐
ческая  дифференциация  между  шейпа‐
сапептида,  а  именно  шейпов  eefff,  fefff, 
ми,  формами  основной  цепи  и  конфор‐
eefее и  fefee.    
мациями. Наличие аминокислотного ос‐
татка  Pro  уменьшает  число  возможных  Расчет  показал,  что  самой  низкой  энер‐
рассматриваемых шейпов до 8. Известно,  гией  обладает  конформация  BBRR3222 
что аминокислота, стоящая перед остат‐ R31R222  (Uотн  =  0ккал/моль),  принадлежа‐
ком пролина может находиться только в  щая  шейпу  eefff,  имеющему  свёрнутый 
B  или  L  конформационном  состоянии,  конец  основной  цепи  молекулы.  Вклад 
так  как  из–за  жесткой  боковой  цепи  невалентных взаимодействий в этой гло‐

Number 25, 2009    13
Л. И.  Исмаилова 

бальной структуре  составляет (‐21,3 ккал  обладает  ограниченным  набором  ста‐


/моль),  электростатических  (4,7  ккал/  бильных пространственных структур, поз‐
моль) и торсионных 1,4 ккал/моль. Видно,  волил  количественно  оценить  энергети‐
что основной вклад в энергию этой кон‐ ческие  и  геометрические  параметры 
формации  вносят  невалентные    взаимо‐ низкоэнергетических конформаций  мо‐
действия.  Всего  0,9  ккал/моль  уступает  лекулы. 
ей  конформация  RBRR3222R31R3222  (Uотн 
=0,5ккал/моль)  шейпа  fefff.  Здесь  распре‐ III. Миелопептиды.  
деление  энергетических  вкладов  в  этой  Иммунная  система  защищает  организм 
конформации  следующее:  невалентные  от многих заболеваний, в том числе и от 
взаимодействия  (‐21,3  ккал/моль),  элек‐ такого  грозного  заболевания,  как  рак. 
тростатические  (5,9ккал/моль),  торсион‐ Для  этого  костный  мозг,  являясь  цент‐
ные (1,1ккал/моль). Низкая энергия этих  ральным  органом    иммунной  системы, 
конформаций  обусловлена  сближен‐ продуцирует    группу  биорегуляторных 
ностью  бковых  цепей  Arg,    Phe  и  Val  с  пептидных  молекул,  названных  миело‐
участками основной цепи и между собой   пептидами  (МП).  Исследования  показа‐
и наличием  эффективных взаимодейст‐ ли,  что  миелопептиды  не  обладают  ви‐
вий  не  только  моно‐,  ди‐  и  трипептид‐ довой специфичностью, то есть получен‐
ных,  но  и  тетра‐,    пента‐  и  гексапептид‐ ные  от  любого  вида  животного,  они  с 
ных  взаимодействий.  Обе  эти  простран‐ успехом  работают  на  клетках  других 
ственные  структуры  имеют  свернутый   видов  животных  и  человека.  Учитывая 
концевой  трипептидный  участок  моле‐ этот  факт,  были  разработаны  лекарст‐
кулы.  В  стабилизации  глобальной  кон‐ венные  препараты  миелопид,  который  
формации  ВBRR3222R31R3222    важную  роль  представляет  собой  смесь  миелопепти‐
играют следующие энергетические вкла‐ дов,  полученную  из  культуры  клеток 
ды: монопептидные взаимодействия сос‐ костного  мозга  свиньи,  серамил  и  бива‐
тавляют  1,5  ккал/моль,  дипептидные        лен.  
(‐10,7ккал/моль), трипептидные (‐2,9ккал 
/моль),  тетрапептидные  (‐1,3ккал/моль),  Для    молекул  миелопептидов  сравни‐
пентапептидные  (‐2,0ккал/моль)  и  гекса‐ тельно  недавно  были  определены  ами‐
пептидные (‐0,3ккал/моль). В низкоэнер‐ нокислотные последовательности: 
гетической  конформации  BBRR3222R31R222  Phe1–Leu2–Gly3–Phe4–Pro5–Thr6     МП‐1 
шейпа  eefff  N‐концевой  начальный  учас‐ Leu1–Val2–Val3–Tyr4–Pro5–Trp6                 МП‐2 
ток Gly‐Ala‐Pro имеет развернутую струк‐ Leu1–Val2–Cys3–Tyr4–Pro5–Gln6                МП‐3 
туру,  а  С‐концевой    участок    Arg‐Phe‐Ile  Phe1–Arg2–Pro3–Arg4–Ile5–Met6–Thr7–Pro8 МП-4
имеет  свернутую  структуру.  Такой  ход 
Val1–Val2–Tyr3–Pro4–Asp5 МП-5
основной  цепи  гексапептидной  молеку‐
Val1–Asp2–Pro3–Pro4                                     МП‐6 
лы    приводит  к  сближенности  участков 
основной и боковых цепей аминокислот  Оказалось, что каждый миелопептид вос‐
и  возникновению  эффективных  межос‐ производит одну из активностей  миело‐
таточных  взаимодействий.  Подробный  пида,  причем  строго  определенную, 
конформационный  анализ  был  выпол‐ имеет собственную клетку‐мишень и нап‐
нен для каждой из низкоэнергетических  равленно  действует  на  конкретное  звено 
структур исследуемой молекулы. Прове‐ иммунитета.  Выполняя  в  целом  имму‐
денный расчет показал, что гексапептид‐ норегуляторные  функции,  миелопепти‐
ная молекула Gly‐Ala‐Pro‐Arg‐Phe‐Val‐NH2  ды  различаются  по  конечному  эффекту 

14  Journal of Qafqaz University   
Структурно‐Функциональная Взаимосвязь Кардиоактивных Пептидов, Миелопептидов и Гликопептидов 

и  механизму  действия.  Первый  миело‐ лопептиды  МП–5,  МП–6  в  настоящее 


пептид  (МП–1)  обладает  ярко  выражен‐ время находятся на стадии разработки.  
ным иммунокорригирующим действием. 
Целью  нашей  работы  было  нахождение 
Миелопептид  МП‐2  создает  серьезные  пространственной  структуры  и  конфор‐
помехи  в  росте  злокачественных  опу‐ мационных  возможностей  всех  шести  
холей.  Действие  миелопептидной  моле‐ молекул  миелопептидов.  Для  каждой 
кулы МП‐3 способствует захвату и унич‐ молекулы был определен  полный набор 
тожению  микробов,  стимулирует  им‐ низкоэнергетических конформационных 
мунный ответ на их антигены. На основе  состояний,  значения  двугранных  углов 
МП‐3  разрабатывается  препарат  Сера‐ основной и боковых цепей аминокислот, 
мил    (иммуномодулятор  с  противобак‐ входящих в эти молекулы, оценена энер‐
териальным  эффектом).  МП‐4,  как  и  гия  внутри‐  и  межостаточных  взаимо‐
МП‐2,  имеет  отношение  к  онкологии,  действий  [26,27].  Найденные  низкоэнер‐
обладает противоопухолевым действием.  гетические конформации всех шести мо‐
Этот  пептид  оказался  основным  факто‐ лекул  миелопептидов    представлены  в 
ром клеточной дифференцировки. Мие‐ таблице 5. 

Таблица 5. Низкоэнергетические конформации  миелопептидов 
Молекула  Uотн  Аминокислотная последовательность  Конформация 
МП‐1  0,0  Phe‐Leu‐Gly‐Phe‐Pro‐Thr‐NH2  R2B21PB2RR11 (fffef) 
2,3  R2R21RB3RR11 (fffef) 
6,9  B1B21PB3RR11 (effef) 
4,5  B1B21PB3 BB31 (effee) 
МП‐2  0,0  Leu‐Val‐Val‐Tyr‐Pro‐Trp‐NH2 
4,1   R21R2R2B1RR11 (fffef) 
 R21B2B2B3RR13 (feeef) 
МП‐3  0,0  Leu‐Val‐Cys‐Tyr‐Pro‐Gln‐NH2   R21R2R2B1RR313 (fffef) 
5,4   R21R2R2B3BB211 (fffee) 

МП‐4  0,0  Phe‐Arg‐Pro‐Arg‐Ile‐Met‐Thr‐Pro‐NH2  B11B2222RB2122B3322R2222B32B 


3,0  (eefeefe) 
4,2  B21B2122BR3322R3122B2122B32B 
(eeeffee) 
B21B2122BB3122R3322R3322B32B 
(eeeeffe) 
МП‐5  0,0  Val‐Val‐Tyr‐Pro‐Asp‐NH2  R2R2B3RR3 (ffef) 
2,8  R2R2B2BR2 (ffee) 
5,1  R2B2L2RR1 (ffef) 
МП‐6  0,0  Val‐Asp‐Pro‐Pro‐NH2  R2B3BB (fee) 
1,8  B1L3BB (eee) 
2,4  B2B3BB (eee) 
3,1  R2L3BB (fee) 
       
С  помощью  построенных  конформаци‐ вижные  боковые  цепи  миелопептидов, 
онных  карт  для  боковых  цепей  амино‐ способные  принимать  участие  во  взаи‐
кислот, входящих в молекулы миелопеп‐ модействиях  с  рецепторами.  Расчет  об‐
тидов,  была  определена  их  конформа‐ наружил,  что    у  молекулы  МП‐1  низ‐
ционная  подвижность.  Исследование  коэнергетическими являются конформа‐
конформационной  динамики  пептидов  ции форм RRRBRR и RBPBRR, у МП‐2 и 
позволило  определить  наиболее  под‐ МП‐3  RRRBRR,  которые  являются  лиде‐

Number 25, 2009    15
Л. И.  Исмаилова 

рами  среди  других  структур.  Можно  онные  возможности  этих  боковых  при‐
предположить,  что  связь  миелопепти‐ весков,  мы  построили  ряд  конформа‐
дов  с  Т‐лимфоцитами  осуществляется  ционных карт при варьировании одного 
именно  посредством  этих  структур.  В  или  двух  строго  определенных  углов 
пользу этого говорит тот факт, что боко‐ молекулы моносахарида. 
вые  цепи  Phe4  и  Tyr4  в  низкоэнергети‐
Следует  отметить,  что  N‐ацетильная 
ческих структурах обращены в раствори‐
группа  и  СН2ОН  группа  находятся  по 
тель и конформационно свободны.  разные  стороны  от  сахарного  кольца, 
Следует  подчеркнуть,  что  в  настоящее  поэтому  они  влиять  на  конформацион‐
время  молекулы  миелопептидов  пред‐ ные  состояния  друг  друга  не  могут. 
ставляют  большой  интерес  для  широ‐ Отсюда  следует,  что    из–за  удаленности 
кого  исследования [28‐33].  эти боковые привески не влияют на кон‐
формационные  карты  друг  друга.  При 
IV. Гликопептиды.   построении  конформационных  карт  од‐
ной  группы,  положение  другой  группы 
Известно,  что  биологическая  активность 
фиксировалось  в  оптимальных  конфор‐
гликанов  и  гликопептидов  существенно 
мациях.  Конформационный  анализ  сво‐
зависит  от  числа и способа  присоедине‐
бодного N‐ацетил глюкозамина, постро‐
ния остатков  глюкозы, от типа и стерео‐
ение  конформационных  карт  позволил 
химии  аминокислот,  образующих  пеп‐
найти  два  значения  угла  Q2g  (‐30˚,  20˚) 
тидные  части  молекул.  Исследования 
для  N‐ацетильной  группы.  Для  СН2ОН 
функциональной  активности  этих  моле‐
группы значения углов Q5,6g= 60, 180, ‐60˚ 
кул  обнаружили  их  высокую  иммуно‐
оказались равновероятными. 
стимулирующую  и  противоопухолевую   
активность.  Поэтому  нами  сначала  был  Низкоэнергетические  положения  остат‐
выполнен    конформационный  анализ  ка  D‐молочной  кислоты  в  молекуле  N‐
олигосахаридных    молекул,  так  как  они  ацетил‐мурамовой кислоты были найде‐
являются  ингибиторами  и  субстратами  ны  из  конформационных  карт    Qm  3‐  φm  
фермента  лизоцима  и  входят  в  состав  и  φm  ‐  ψm.  Для    молекулы  MurNAc  из 
гликопептидных  молекул,  представляю‐ карты  φm  ‐  ψm  были  определены  пять 
щих  большой  научный  интерес.  Были  низкоэнергетических  конформаций,  от‐
изучены  пространственные  структуры  личающиеся значениями двугранных уг‐
моно‐,  ди‐,  тетрасахаридных  молекул,  лов  лактильной  группы.  Первые  две 
содержащих  N‐ацетил‐глюкозамин  отвечают  состоянию  угла  Qm  3=‐30º,  а 
(GlcNAc)  и  N‐ацетил‐мурамовую  кисло‐ остальные  три  конформации  –  состоя‐
ту (MurNAc).   нию с Qm3= 0º.  
Сначала  были  изучены  конформацион‐ Биологическая  активность  гликанов  и 
ные свойства свободной молекулы моно‐ гликопептидных  молекул    зависит  от 
сахарида.    У  молеклы  (GlcNAc)  имеется  числа  и  способа  присоединения  остат‐
два  боковых  привеска,  положения  кото‐ ков    глюкозы,  от    стереохимии  амино‐
рых  в  пространстве  определяются  сле‐ кислот в пептидных частях молекул. Экс‐
дующими  двугранными  углами:  поло‐ периментальные  исследования  функци‐
жение  N‐ацетильной  группы  определя‐ ональной  активности  гликопептидных 
ется двугранным углом Q2g и положение  молекул обнаружили их высокую имму‐
группы СН2ОН определяется углами Q5g   ностимулирующую  и  противоопухоле‐
и  Q6g..  Чтобы  определить  конформаци‐ вую активность  (табл.6). Важно было со‐

16  Journal of Qafqaz University   
Структурно‐Функциональная Взаимосвязь Кардиоактивных Пептидов, Миелопептидов и Гликопептидов 

поставить  эти  данные    с  полученными  ки. Например, для молекулы М‐L‐Ala‐D‐


расчетами  пространственной  структуры  GluNH2  глобальной  структурой  является 
этих молекул.  конформация  PBP12.  В  этой  конформа‐
Мы  рассчитали  пространственную  ст‐ ции  реализуются  все  возможные  взаи‐
руктуру    гликопептидных  молекул,  ко‐ модействия.  Кроме  того,  N‐ацетильная 
торые  образуются  путем  присоедине‐ группа  остатка  MurNAc  на  расстоянии 
ния  фрагментов  L(D)‐Ala‐L(D)‐GluNH2  к  О…Н,  равном  2.2Ǻ,  образует  слабую 
карбонильному  углероду  О‐β‐N‐ацетил‐ водородную  связь  с  карбонильным  кис‐
D‐мурамовой  кислоты  (MurNAc)  или  О‐ лородом  лактильной  группы  (при  Q2m~‐
β‐N‐ацетил‐D‐глюкозаминил‐(1‐4)‐N‐ 30º) или аминокислотного остатка  D‐Glu 
ацетил‐D‐мурамовой кислоты (GlcNAc –  (при  Q2m~ 30º). А в конформации  PRP12 
MurNAc) [34]. Сначала были определены  (шейп  fe)  вторую  водородную  связь  N‐
конформационные возможности дипеп‐ ацетильная  группа  образует  с  боковой 
тидного участка молекул. Начальные ва‐ цепью D‐Glu. 
рианты  для  минимизации  энергии  мо‐ Из  табл.  6  видно,  что  активность  моле‐
лекул  гликопептидов  составлялись  на  кул  MurNAc‐L‐Ala‐D‐GluNH2  и  GlcNAc–
основе  проведенных  расчетов  MurNAc,  MurNAc‐L‐Ala‐D‐GluNH2 резко падает при 
GlcNAc–MurNAc,  и  L  (D)‐Ala–L  (D)‐  Glu‐ замене  D‐Glu  на D‐Asp. Наш расчет по‐
NH2.  казал,  что  такая  замена  не  влияет  су‐
Расчет пространственной структуры шес‐ щественным  образом  на  распределение 
ти  гликопептидных  молекул  позволил  конформаций  по  энергетическим  уров‐
определить  количественные  геометри‐ ням. 
ческие  и  энергетические  характеристи‐

Таблица 6. Адьювантная и противоопухолевая активность гликопептидов 
№  Гликопептидная                  Противо  Адьювантная 
Молекула  опухолевая  активность 
активность 
1  GlcNAc‐MurNAc‐LAla‐DGluNH2  +  +  +  +++ 
2  GlcNAc‐MurNAc‐DAla‐DGluNH2  +  +  + 
3  GlcNAc‐MurNAc‐LAla‐LGluNH2  ―  ― 
4  GlcNAc‐MurNAc‐LAla‐DAspNH2  +  ― 
5  MurNAc‐LAla‐DGluNH2  +  +  ++ 
6  MurNAc‐LAla‐LGluNH2  ―  ― 
7  MurNAc‐DAla‐DGluNH2  +  ― 
8  MurNAc‐LAla‐DAspNH2  ―  ― 
9  GlcNAc‐MurNAc‐Lala  +  ― 
10  GlcNAc‐MurNAc  ―  ― 
11  MurNAc  ―  ― 
12  LAla‐DGluNH2  ―  ― 

По‐видимому, причина снижения актив‐ сутствует. Из этого можно сделать вывод, 
ности  соединений  с  D‐Asp  кроется  в  са‐ что  аминокислота  D‐Glu  в  наиболее  ак‐
мой  природе  их  взаимодействия  с  ре‐ тивной  молекуле  GlcNAc–MurNAc‐L‐Ala‐
цептором. Слабо выраженным противо‐ D‐GluNH2,  вероятно,  не  принимает  не‐
опухолевым  действием  обладает  и  гли‐ посредственное  участие  в  реакции,  а 
копептид  GlcNAc–MurNAc‐L‐Ala,  в  кото‐ служит  для  понижения  активационного 
ром  остаток  глутаминовой  кислоты  от‐ барьера.  То  же  можно  сказать  относи‐

Number 25, 2009    17
Л. И.  Исмаилова 

тельно остатка GlcNAc, поскольку глико‐ 8. Ахмедов  Н.А.,  Аббаслы  Р.М.,  Попов  Е.М. 


Структурно‐функциональная  организация 
пептид MurNAc‐L‐Ala‐D‐GluNH2    обладает 
пептида, индуцирующего дельта‐сон //  Моле‐
как  адьювантной,  так  и  противоопухо‐ кулярная биология, 1989, т.23, вып.3, с.676‐682 
левой активностью.   9. Годжаев  Н.М.,  Агаева  Г.А.  Конформационные 
Проведенные  теоретические  количест‐ особенности  пентапептида,  как  элемента  ак‐
тивного  центра  иммуноглобулина  Е  человека 
венные  расчеты  пространственных  ст‐
// Биофизика, 2000, т.45, вып.4, с.581‐585 
руктур различных по природе биомоле‐ 10. Попов Е.М. Белки и пептиды, М.: Наука, 1995, 
кул и сравнение полученных теоретичес‐ с.10‐73 
ких  данных  с  экспериментально  полу‐ 11. IUPAC‐IUB,  Quantity,  Units  and  Symbols  in 
ченными результатами доказали верность  Physical  Chemistry.  V.39.  Blackwell  Scientific 
выбранной  физической  модели,  теоре‐ Publications, Oxford, 1988 
12. Popov  E.M.  //  Int.J.Quantum  Chem.,  1979,  V.16, 
тического  подхода  и  используемого  в 
p.707‐737 
расчетах метода теоретического конфор‐
13. Momany  F.A.,  McGuire  R.F.,  Burgess  A.W., 
мационного анализа.  Scheraga  H.A.  //    J.Phys.Chem.,  1975,  V.  29, 
p.2361‐2381 
ЛИТЕРАТУРА  14. Попов  Е.М.  Структурная  организация  белков, 
М., Наука, 1989, 352 С.   
1. Максумов И.С, Исмаилова Л.И., Годжаев Н.М. 
15. Исмаилова Л.И., Ахмедов Н.А., Ахмедова С.Р. 
Программа  полуэмпирического  расчета  кон‐
Теоретический  конформационный  анализ 
формаций молекулярных комплексов на ЭВМ 
кардиоактивных  пептидов.I.Тетрапептид 
//  Журнал структурной химии, 1983, т.24,  №4, 
Phe1‐Met2‐Arg3‐Phe4‐NH2  и  пентапептид 
с.147‐148 
Leu1‐Pro2‐Leu3‐Arg4‐Phe5‐NH2  //  Биофизика, 
2. Попов Е.М. Подход к априорному расчету ста‐ 1997, т.42, вып.4, с.796‐799 
бильных  конформаций  белковых  молекул  //  
16. Исмаилова Л.И., Ахмедов Н.А., Ахмедова С.Р. 
Молекулярная биология, 1975, т.9, с.578‐593 
Теоретический  конформационный  анализ 
3. Попов  Е.М.,  Касумова  Л.И.,  Ахмедов  Н.А.,  кардиоактивных  пептидов.II.  Нонапептид 
Максумов  И.С.  и  др.  Теоретический  конфор‐ Met1‐Asn2‐Tyr3‐Leu4‐Ala5‐Phe6‐Pro7‐Arg8‐
мационный  анализ  фрагмента  Arg1‐Pro2‐ Met9‐NH2 // Биофизика, 1997, т.42, вып.4, с.800‐
Asp3‐Phe4‐Cys5‐Leu6‐Glu7‐Pr[8‐Pro9  молекулы  805 
панкреатического трипсинового ингибитора //   17. Исмаилова Л.И. Структурная организация кар‐
Препринт  Института  Теоретической  Физики  диоактивного  декапептида  //  Bakı  Universite‐
АН УССР, ИТФ‐79‐43Р, 1979,  Киев, с.3‐59   tinin  Xəbərləri,  Fizika‐riyaziyyat  elmləri  seriyası,  
4. Гoджаев Н.М., Касумова Л.И., Попов Е.М. Тео‐ 1999, №2, s.67‐73 
ретический  конформационный  анализ  фраг‐ 18. İsmailova  L.  Three‐dimensional  structure  and 
мента Arg1‐Cys14 молекулы панкреатического  conformational properties of the small carioactive 
трипсинового ингибитора // Препринт Инсти‐ peptie  //  Journal  of  Qafqaz  University,  2006,  
тута  Теоретической  Физики  АН  УССР,  ИТФ‐ №17, p.42‐50 
79‐45Р, 1979,  Киев, с.  3‐58  19. Исмаилова  Л.И.  Сравнительный  анализ  прос‐
5. Попов  Е.М.,  Годжаев  Н.М.,  Исмаилова  Л.И.,  транственной структуры кардиоактивных изо‐
Мусаев  Ш.М.  и  др.  Априорный  расчет  трех‐ лейциновых  пептидов  //    Bakı  Universitetinin 
мерной  структуры  молекулы  бычьего  панк‐ Xəbərləri, Fizika‐riyaziyyat elmləri seriyası, 2007,  
реатического  трипсинового  ингибитора  //  №3, с.106‐111 
Биоорган. химия, 1982, том 8, № 6, с.776‐816  20. Исмаилова Л.И., Аббаслы Р.М.,  Ахмедов Н.А. 
6. Попов  Е.М.  Подход  к  решению  проблемы  Пространственная  структура  изолейцинового 
структурно‐функциональной  организации  октапептида  //  Биофизика,  2007,  т.52,  вып.6, 
природных  пептидов  //    Молекулярная  био‐ с.1141‐1147 
логия, 1985, т.19, вып.4, с.1107‐1138   21. Исмаилова  Л.И.,  Ахмедов  Н.А.,  Аббаслы  Р.М. 
7. Ахмедов  Н.А.,  Аббаслы  Р.М.  Пространствен‐ Пространственная  структура  изолейциновых 
ная  структура  молекулы  Ser1‐Arg2‐Val3‐Lys4‐ пентапептидов Glu‐Phe‐Leu‐Arg‐Ile‐NH2 и Pro‐
Gln5‐Val6‐Gly7‐Ser8‐Ser9‐Pro10‐Gln11 // Биофи‐ Phe‐Tyr‐Arg‐Ile‐NH2    //    Биофизика,  2008,  т.53, 
зика, 1989, т.34, вып.1, с.167‐173  вып.1, с.14‐21 

18  Journal of Qafqaz University   
Структурно‐Функциональная Взаимосвязь Кардиоактивных Пептидов, Миелопептидов и Гликопептидов 

22. Wasielewski O., Skoneeszna M. Pleotropic effects  28. Mikhailova  A.,  Fonina  L.,  Kirilina  E.,Gur’yanjv 


of  the  neuropeptides  CCAP  and  miyosuppressin   S.,Efremov  M.,  Petrov  R.  Peculiarities  of 
in the beetl // J.Comp.Physiol. , 2008, V.178, N 7,  immunocorrective  effects  of  the  bone  marrow 
p. 877‐885  regulatory  peptides  (myelopeptides)  // 
23. Nakayama  T.,  Nishijima  Y.,  Miyamoto  M.,  Requl.Pept., 2003, V.114, N 2,p.183‐187 
Hamlin  R.  Effects  of  uclasses  of  cardiovascular  29. Mikhailova A. A., Belevskaya R.G., Kalyuzhnaya 
drugs on ventricular function in dogs with mitral  M.V.,  Fonina  L.A.,Liashenko  V.A.,Petrov  R.V. 
regurgitation  //  J.Intern.Med.,  2007,  V.23,  N  3,  Myelopeptide  ‐2  recovers  interleukin‐2  synthesis 
p.445‐450  and interleukin‐2 receptor expression in human T 
24. Fort  T.J.,Garcia‐Crescioni  K.,  Agricola  H.J.,  lymphocytes  depressed  by  tumor  products  or 
Brerina  V.,  Miller  M.W.  Requlation  of  the  crab  measles virus // J. Immunother., 2006, V. 29, N 3, 
heatbeat  by  crustacean  cardioactive  peptide  p.306‐312 
(CCAP):  central  and  peripheral  actions  //  J.  30. Fonina  L.A.,  Az’muko  A.A.,  Kalikhewich  V.N., 
Neurophysiol, 2007,V.97, N 5, p.3407‐3420  Levit M. et all Myelopeptide MP‐5 and fluorescent 
25. Fort  T.J.,  Brerina  V.,  Miller  M.W.  Requlation  of  derivaties:  synthesis  and  biological  activity  // 
the  crab  heatbeat  by  FMRF  amide  like  peptides:  Bioorg. Khim., 2008, V.34, N4, p.451‐456 
multiple  interacting  effects  on  center  and  31. Kirilina  E.A.,  Mikhailova  A.A.,  Efremov  M.A., 
periphery    //    J.  Neurophysiol,  2007,V.98,  N  5,  Petrov R.V. Myelopeptide 6, a novel endogenous 
p.2887‐2902  bone  marrow‐derived  differentiation  factor  // 
26. Ахмедов Н.А., Исмаилова Л.И., Аббаслы Р.М.,   Dokl.Biol.Sci., 2008, V.421, p.282‐285 
Годжаев  Н.М.  Пространственная  структура  32. Fonina  L.A.,  Ovchinnikov  M.V.,  Gur’yanjv  S.V., 
миелопептидов  I.  Конформационный  анализ  Svchev  S.V.,  Belevskaya  R.G.,  Treshchalina  E.M. 
молекул Phe‐Leu‐Gly‐Phe‐Pro‐Thr, Leu‐Val‐Val‐ Synthesis and properties of the retro‐analogue of 
Tyr‐Thr‐Trp,  Leu‐Val‐Cys‐Tyr‐Pro‐Gln  //  myelopeptide MP‐2 //  Bioorg. Khim., 2005, V.31, 
Биоорганическая химия, 2005, т.31, №1, с.31‐38  N3, p.239‐244 
27. Исмаилова Л.И., Ахмедов Н.А., Аббаслы Р.М.,  33. Максумов  И.С.,  Исмаилова  Л..И.,  Годжаев 
Годжаев  Н.М.  Пространственная  структура  Н.М.  Конформации  гликопептидов  с  L‐  и    D‐
миелопептидов  II.  Конформационный  анализ  стереоизомерами  аминокислот  Ala    и  Glu    //  
молекул  Phe‐Arg‐Pro‐Arg‐Ile‐Met‐Thr‐Pro,  Val‐ Молекулярная биология, 1985, т.19, №3, с. 730‐
Val‐Tyr‐Pro‐Asp, Val‐Asp‐Pro‐Pro // Биооргани‐ 741. 
ческая химия, 2005, т.31, №2, с.140‐146 

Number 25, 2009    19
 
 
 
NANO‐POROUS SILICON FOR GAS SENSOR AND                              
FUEL CELL APPLICATIONS 

Tayyar DZHAFAROV 
Institute of Physics,  
Azerbaijan National Academy of Sciences,  
Baku / AZERBAIJAN 
caferov@physics.ab.az

Sureyya Aydın YUKSEL 
Department of Physics,  
Yildiz Technical University,  
Esenler – Istanbul / TURKEY 

ABSTRACT 
The hydrogen fuel cell has recently attracted attention as a clear source for the future. For this reason, there is 
a  big  demand  for  reliable  and  inexpensive  hydrogen  gas  sensors.  The  nanoporous  silicon  with  a  sponge‐like 
structure  and  very  large  surface‐to‐  volume  ration  (about  to  103  m2/cm3)  is  attractive  for  gas  sensor  and 
hydrogen fuel cell applications. In the paper the review of works on fabrication, structure, electrical and optical 
properties of porous silicon (PS) is given. The operating principles of different types of gas sensors and hydrogen 
fuel cells, specifically Proton Exchange Membrane type cell, were presented. New type sensor, based on metal/PS 
Schottky‐type  structures  and  working  at  room  temperature  without  any  power  source  was  considered.  Such 
structures  in  the  hydrogen‐containing  atmosphere  produce  electricity  by  themselves,  i.e.  they  exhibit  the 
properties of both a gas sensor and a hydrogen fuel cell. 
Key words: porous silicon, gas sensor, hydrogen fuel cell, metal/porous silicon structure 

НАНО‐ПОРИСТЫЙ КРЕМНИЙ ДЛЯ ГАЗОВЫХ СЕНСОРОВ И 
ВОДОРОДНЫХ ТОПЛИВНЫХ ЭЛЕМЕНТОВ 

РЕЗЮМЕ 

Водородные  топливные  элементы  привлекают  внимание  как  источники  чистой  энергии  будущего. 
Поэтому  имеется  большая  потребность  в  разработке  надежных  и  недорогих  газовых  сенсоров,  чувстви‐
тельных  к  водороду.  Нано‐пористый  кремний  с  ʺгубчатойʺ  структурой  и  очень  большим  соотношением 
площади поверхности пор к объему образца (около 103м2/см3) очень подходит для изготовления газовых 
сенсоров  и  водородных  элементов.  В  статье  дан  обзор  данных  по  изготовлению,  структуре  и  свойствам 
пористого кремния. Рассмотрены принципы работы существующих типов газовых сенсоров и водородных 
элементов, особенно PEM‐типа элемента. Представлен новый тип газового сенсора, основанного на метал/ 
пористый кремний барьерной структуре, который работает при комнатной температуре и без внешнего 
источника энергии. Такой прибор сам генерирует электричество в водородной атмосфере, т.е. проявляет 
свойства и газового сенсора, и водородного элемента. 
Ключевые слова: пористый кремний, газовый сенсор, водородный элемент, метал/пористый кремний 
структуры 

 
mical  etching  have  been  know  for  many 
I. Introduction 
years [34,35] in 1958. However, it has been 
Porous silicon (PS) layers formed on mono‐ extensively studied in last twenty years. In 
crystalline  silicon  substrates  by  electroche‐ 1990 Canham reported the discovery signi‐

20  Journal of Qafqaz University   
Nano‐Porous Silicon for Gas Sensor and Fuel Cell Applications 

ficant visible photoluminscence from porous  (defects and impurities) in the surrounding 
silicon  under  UV  illumination  [7].  Fig.  1  SiOx layers [29]. 
illustrates the typical red luminescence of a 
Quantum wires, quantum dots and quantum 
porous  silicon  layer  which  was  prepared 
wells  are  basis  of  many  modern  devices 
by  a  remarkable  simple  electrochemical 
and they are the key to the development of 
etching  process  on  silicon  wafer.  The  pho‐
the nanoelectronics. Electrochemical etching 
toluminescence  characteristics  of  porous 
of  Si  results  in  the  formation  of  nano‐
silicon  in  comparison  to  bulk  mono‐
crystalline  Si.  The  crystalline  structure  of 
crystalline  silicon  and  other  silicon‐based 
porous silicon presents a network of silicon 
compounds  is  also  given  in  Fig.  1.  Typical 
in  nano‐sized  regions  surrounded  by  void 
photoluminescence  intensity  of  porous 
space  with  a  very  large  surface‐to‐volume 
silicon  in  the  visible  region  (1.5‐2.0  eV)  is 
ration (up to 103 m2cm‐3) [21]. The structure 
larger  by  several  order  of  magnitude  as 
of  porous  silicon  is  like  a  sponge  where 
compared  to  the  monocrystalline  silicon, 
quantum  effects  plays  fundamental  role  (a 
which  locates  in  near  infrared,  correspon‐
quantum sponge) [5]. The pore surfaces are 
ding  to  the  1.1  eV  energy  of  mono‐
covered  by  silicon  hydrides  and  silicon 
crystalline Si [33]. Si, being a indirect semi‐
oxides and therefore they are very chemical 
conductor,  is  the  dominant  material  of 
active.  These  features  of  porous  silicon  (a 
microelectronics.  However,  it  a  poor  light 
quantum  system,  a  sponge  structure  and 
emitter  and  therefore  can  not  be  used  in 
an  extremely  large  pore  surfaces)  ensure 
optoelectronics. Porous silicon prepared on 
many  possible  applications,  such  as  light 
Si  substrate,  shows  the  high  external 
emitting  diode,  sensor,  hydrogen  fuel  cell 
efficiencies  of  photo‐and  electrolumine‐
and other applications.  
scence and  suits for photonic applications. 
However,  the  origin  of  photoluminescence  Bellow  the  review  of  the  crystalline  struc‐
in  PS  is  still  controversial.      A  few  models  ture and properties of nano‐porous silicon, 
are  suggested  for  explanation  mechanism  and  characterization  of  the  porous  silicon 
of  photoluminescence.  According  model  based  gas  sensors  and  hydrogen  fuel  cells 
proposed  by  Canham  [7]  radiative  recom‐ have been presented. 
bination of electron‐hole pairs occurs within 
2.  Preparation and Properties of Porous 
nanometer  silicon  wires  and  their  energy 
Silicon 
gaps  become  larger  than  that  of  bulk  Si 
(quantum  confinement  effect).  This  model  Porous  silicon  layer  on  monocrystalline  Si 
modified  by  Koch  et  al.  [24]  suggests  that  substrate  is  usually  formed  by  electro‐
electron‐hole  pairs  are  photo‐excided  in  chemical  etching  of  Si  in  HF:  ethanol  or 
nanometer  silicon  particles  and  radiatively  HF:H2O  solution.  Electrochemical  etching 
recombined  via  Si  intrinsic  surface  states.  of  siliconis  attractive  because  of  the 
Another  model  [6]  suggests  that  lumine‐ possibility to tune the pore size from a few 
scence from PS was caused by some special  nanometers  to  a  few  tens  of  micrometers, 
luminescence  materials,  such  as  SiHx  com‐ just  by  choosing  wafer  doping  level  and 
plexes,  polysilanes,  or  SiO2  rather  than  an  etching  conditions.  The  simplest  electro‐
intrinsic property of nanometer Si. A third  chemical cell is shown in Fig. 2. The Si wafer 
model  believes  that  excitation  of  charge  acts  as  the  anode  and  the  the  platinum  is 
carriers  occurs  in  nanometer  silicon  par‐ the cathode. The thickness of porous silicon 
ticles  and  the  photoexcitated  carriers  layer  on  Si  substrate  is  determined  by 
transfer  into  the  luminescence  centers  duration  of  etching.  The  porosity,  i.e.  the 

Number 25, 2009    21
Tayyar Dzhafarov, Sureyya Aydın Yuksel 

voig  fraction  in  the  porous  layer  is  deter‐ Si + 6HF →H2SiF6 + 4H+ +4e‐                   (2) 
mined by the current density (about 10‐100 
Pores,  depending  on  the  its  diameter, 
mA/cm2), composition electrolyte, resistivity 
denoted as micropores (R<2nm), mesopores 
and the doping density of Si substrate. 
(2 nm < R < 50 nm) and macropores (R > 50 
The anodic reaction on the Si substrate can  nm).  Under  illumination  the  pore  size 
be written during pore formation as [4]   dependent  on  doping  density  and  anodi‐
zation  conditions,  with  diameters  in  the 
Si + 6HF →H2SiF6 + H2 + 2H+ +2e‐                (1) 
range 100 nm – 20 μm (macropores).  
Silicon atoms are dissolved as SiF62‐  requires 
PS layers with a thickness of 10‐20 μm and 
the  presence  of  F‐  ions  (from  HF  solution) 
an  average  porosity  of  40  to  80%  were 
and  positively  charges  holes  (from  the 
silicon  wafer)  at  the  silicon  interface.  Con‐ prepared  on  n‐type  (111)  Si  substrates  (ρ= 
centration  of  holes  in  p‐Si  is  sufficiently  =1×10‐2 Ω cm) by anodic etching in HF:H2O 
high  (about  1014  –  1018  cm‐3)  and  this  case  =  1:3  solution  at  a  dc  current  of  about  15 
the  nano‐size  pores  were  formed.  Concen‐ mA cm‐2 under white‐light illumination [8]. 
tration of holes in n‐Si is very small (about  For some measurements, the PS films were 
102  –  106  cm‐3)  and  therefore  generation  of  then  detached  from  the  Si  substrate  by 
holes is possible due to illumination of n‐Si  electro polishing in the same solution with 
substrate.  a current density of 0.8‐1.0 A cm‐2. The free 
standing  PS  films  were  characterized  by 
The  structure  and  size  of  pores  in  porous 
porosity, thickness and resistivity measure‐
silicon layer formed on n‐Si substrate differ 
ments. The average porosity was measured 
from  those  for  layer  on  p‐Si.  If  electroche‐
by  a  gravimetry  technique.  Resistivity  and 
mical  etching  was  carried  out  at  relatively 
charge carrier concentration measurements  
low  current  density  (10‐80  mA/cm2),  then 
were  carried  out  on  the  free  standing  PS 
the local dissolution of silicon surface takes 
layers  attached  to  a  dielectric  substrate 
place.  Herewith,  pore  formation  begins  on 
(glass)  by  using  the  Van  der  Pauw 
surface defects of Si and further growth of 
technique. In or In‐Ga alloy was used as an 
pores into silicon substrate proceeds due to 
ohmic  contact  to  the  PS  layer.  Morpholo‐
the holes diffusion to Si‐electrolyte interface. 
gical  characterizations  of  the  PS  surface 
In  the  case  of  large  current  density  (0.5  – 
were  performed  by  scanning  electron 
0.8  A/cm2)  when  the  amount  of  holes 
microscopy. 
moving  to  Si‐electrolyte  interface  is  very 
high,  the  etching  of  top  regions    of  Si  The average porosity, i.e. the avoid fraction 
substrate is preferred. It ensures the unoform  in  the  porous  layer,  can  be  obtained  by 
etching  of  silicon  surface  and  formation  a  gravimetry using the equation 
smooth  surface  of  substrate  (the  so‐called  P(%) ={ (m1 – m2)/(m1 – m3)}100          (3) 
the  electropolishing  process).  Raising  the 
current  density  above  the  critical  value  at  Here  m1  is  Si  sample  mass  before  the 
the  end  of  anodization process  results  in  a  etching,  m2  just  after  etching  and  m3  after 
detachment of the porous silicon film from  the  removal  of  the  porous  layer  by 
Si  substrates.  The  behavior  at  high  current  electropolishing or after a rapid dissolution 
densities turns out to be useful to produce  of  the  whole  porous  layer  in  a  3%  KOH 
porous  silicon  free‐standing  layers.  The  solution. 
anodic  reaction  during  the  electropolising  One  can  also  get  the  porous  silicon  layer 
can be written as   thickness d using the equation 

22  Journal of Qafqaz University   
Nano‐Porous Silicon for Gas Sensor and Fuel Cell Applications 

d = (m1 – m3)/ρS              (4) 
eV with rising of porosity of PS films in the 
range of 30‐90 % is observed. Data on Fig. 5  
where ρ is the Si density ( 2.33 g/cm3) and S 
concerning  a  increase  of  the  energy  gap  in 
is the etched surface. 
dependency on porosity of PS films, can be 
Fig.  3  shows  the  SEM  micrographs  of  explained  by  a  model  including  the 
porous silicon/Si structure.   quantum  confinement  of  carriers  in  the  PS 
The  electrical  measurements  of  the  free  microcrystallites,  causing  the  widening  of 
the Si band gap. 
standing  PS  layers  with  65%  porosity                                     
(300 K, 45% RH) gave values of ρ = 1.8×106 
Ω  cm  for  resistivity,  p  =  9.6×1012  cm‐3  for  3.  Gas Sensors 
hole  concentration,  and  μ  =  0.36  cm2/(V  s)  A  chemical  sensor  is  defined  as  “a  small 
for hole mobility [9].  device  that  as  the  result  of  a  chemical 
Fig.  4  illustrate  FTIR  spectrum  of  free‐ interaction  or  process  between  the  analyte 
standing  PS  film  of  thickness  12  μm  gas  and  the  sensor  device,  transforms 
measured  at  room  temperature  [10].  The  chemical  or  biochemical  information  of  a 
peaks related with absorption on vibration  quantitative  or  qualitative  type  into  an 
of  Si‐H  (2100  cm‐1)  and  Si‐O  bonds  (1100  analytically useful signal” [31]. Sensors have 
cm‐1)  located  on  pore  surfaces  were  obser‐ been widely used for environmental moni‐
ved  from  Fig.  3.  These  bonds  play  an  toring, industrial safety, homeland security, 
important  role  in  regulating  optical,  clinical diagnostics, automotive etc.  
electrical  and  gas  sensing  properties  of  Gas  sensors  were  divided  on  next  main 
porous  silicon.  The  effect  of  isothermal  categories: resistive, solid electrolyte, capa‐
annealing  of  free‐standing  PS  films  on  citive, infrared and other. The resistive sen‐
changes  of  absorption  coefficient  of  Si‐H  sors  were  based  on  Tin  Oxide  (SnO2)  or 
(2100  cm‐1)  and  Si‐O  (1100  cm‐1)  peaks  is  similar  metal  oxide  semiconductors  (CuO, 
used  for  estimation  of  diffusion  coefficient  WO,TiO2,  ZnO,  MgO).  The  working 
from equation [1]  principle  of  this  type  sensor  is  that  the 
Q = 2 π‐0.5 SNo (Dt)0.5                                                               (5)  resistance  of  the  metal  oxide  semicon‐
ductor  changes  when  it  is  exposed  to  the 
Here Q is the total quantity of hydrogen (or 
ambient gas because the gas reacts with the 
oxygen)  penetrating  from  air  into  PS  film 
heated  metal  oxide  surface  and  change  its 
(or out‐diffusing from PS film), No = N(0,t) 
electronic  properties.  The  sensor  usually 
is  the  surface  concentration  on  an  external 
can  be  produced  by  coating  a  metal  oxide 
surface  of  PS  film  and  S  is  the  area  of 
layer  on  a  substrate  with  two  electrodes 
sample.  In  the  range  of  65  –  185oC  the 
pre‐embedded  on  it.  Metal  oxide  sensors 
temperature  dependence  of  hydrogen  and 
are  commonly  used  for  the  detection  of 
oxygen  diffusion  coefficient  along  the 
hazardous  gases,  such  as  NH3,  CO,  NO, 
porous surfaces are described as [10] 
etc.  One  limitation  of  metal  oxide  gas 
D(H) = 5x10‐10 exp (‐0.37 eV/kT)                  (6)  sensors,  however,  is  their  high  operating 
D(O) = 1.3x10‐8 exp (‐0.50 eV/kT)                (7)  temperature  (350  –  500oC)  which  leads  to 
high power consumption.  
Fig. 5 shows energy gap in dependency on 
porosity  of  the  free  standing  PS  films,  The solid electrolyte gas sensor is similar to 
calculated  from  extrapolation  of  the  high  semiconductor  gas  sensor  but  has  voltage 
energy  part  of  (α2 ‐  hν)  spectra  [11].  Near  output.  Solid  electrolyte  sensor  is  typically 
linear increase of band gap from 1.4  to 1.9  designed  to  operate  at  high  temperature. 

Number 25, 2009    23
Tayyar Dzhafarov, Sureyya Aydın Yuksel 

An  example  of  solid  electrolyte  sensor  is  smallest atom and thus the H2 gas can leak 


the  well‐known  yttria‐stabilized  zirconia  easily.  In  addition,  it  can  catch  fire,  for 
(YSZ) based oxygen sensors that have been  example from a spark. For this reason, there 
widely  used  for  air/fuel  ratio  control  in  is  a  big  demand  for  reliable  and  inexpen‐
internal  combustion  engines.  This  type  sive  H2  gas  sensors.  At  present,  there  are 
sensor  has  construction  of  solid  electrolyte  several  types  of  hydrogen  gas  sensors 
which  arranged  between  two  metal  which  are  partly  on  the  market.  Among 
electrodes  (for  example  Pt/YSZ/Au).  In  these,  above  considered  oxide  semicon‐
such  type  sensor  more  than  one  ductors (SnO/Pd, ZnO/Pt, TiO2/Pd, WO3/Pd 
electrochemical  reaction  takes  place  at  the  etc)  have  been  extensively  investigated. 
electrodes  so  that  a  mixed  potential  is  These  sensors  are  normally  heated  up  to 
established  by  competing  reactions.  The  400oC. As hydrogen diffuses easily through 
Pt/YSZ/Au  sensor  can  measure  CO  and  most materials, containment of hydrogen is 
hydrocarbons  due  to  the  differece  in  difficult.  Not  only  leak  detection,  but  also 
catalytic  activities  between  the  Pt  and  Au  the  concentration  monitoring  is  important 
electrodes.   application  of  hydrogen  sensor.  For  the 
standpoint  of  the  safety  with  the  global 
The  working  principle  of  capacitive  type 
environment,  it  is  necessary  today  to 
sensor  is  that  the  dielectric  constant  of 
develop new hydrogen gas sensors working 
polymer  increase  with  absorbed  gas  such 
at  room  temperature  without  any  power 
as  water  vapor  (ε  is  80  for  water,  2‐3  for 
source.  In  addition,  they  should  be  small, 
polymer)  [23].  Typically  capacitance 
cheap  and  easy  to  be  implanted  into 
increase  by  10‐30%  as  relatively  humidity  microelectronic integrated circuits.   
(RH)  varies  from  0  to  100%  for  this  type 
sensor. Infra‐red type sensor uses principle  Nanostructured  porous  silicon  with  the 
based  on  the  ability  of  some  gases  absorb  high  specific  surface  area  was  intensively 
light at particular IR wavelength according  investigated  in  the  early  nintiesin  view  of 
to relation I =Io exp (‐αx), where I/Io is light  its  apllication    in  silicon  based  integrated 
absorbed  during  transmission,  x  is  path  optoelectronics.  In  parallel,  the  material 
properties  were  also  studied  and  other 
length  and  α  is  absorption  coefficient  at 
applications  were  derived  from  these 
specific wavelength. The dependence of the 
investigations.  An  interesning  example  is 
absorption coefficient on gas concentration 
the  field  of  Si  sensors  and  other  silicon‐
was  used  in  infra‐red  sensors  for  measure 
based  microelectro‐mechanical  (MEMs) 
the  gas  concentration.  Transmission  filtres 
devices.  The  compatility  of  porous  silicon 
select specific wavelength bands. IR sensors 
with  conventional  silicon  microelectronics 
are  reproducible  but  not  high  sensitive. 
fabrication  technologies  make  it  very 
Thus,  most  gas  sensors  available  today 
attractive for gas sensor applications. Series 
operate  under  external  voltage  and  (or)  its 
applications  of  porous  silicon  in  sensor 
work  proceeds  at  high  temperature.  Micro 
technology  have  been  based  on  change  of 
Electronic  Mechanical  Systems  (MEMS)  conductivity [2] or capacity [23] of material 
type  sensors  promise  much  smaller  size,  upon adsorption of gas molecules. The gas‐
lower  power  and  lower  cost  than  conven‐ stimulated sensing mechanisms of working 
tional gas sensors.  for conductance or capacitance type porous 
The  hydrogen  fuel  cells  have  recently  silicon‐based  sensors  are  generally 
attracted attention as a clear energy source  associated  with  a  change  in  the  carrier 
for  the  future.  However,  hydrogen  is  the  concentration  in  the  porous    layer  due  to 

24  Journal of Qafqaz University   
Nano‐Porous Silicon for Gas Sensor and Fuel Cell Applications 

the  adsorbed  molecules  or  change  in  ties  of  the  Au/PS  structures  were  analysed 
dielectric  constent,  as  a  result  of  gas  con‐ by  measuring  the  I‐V  characteristics  in  the 
densation inside the pores.  dark,  in  daylight,  and  under  tungsten‐
The large surface to volume ratio (about 103  halogen  lamp  illumination    150  mW  cm‐2). 
m2/cm3),  high  chemical  reactivity  at  room  All  the  investigated  structures  exhibited 
temperature  and  potential  compatibility  very  weak  photosensitivity.  The  value  of 
with  silicon  integration  technologies  allow  the  open‐circuit  photo  voltage  in  daylight 
to fabricate porous silicon based gas sensors.  and  under  tungsten‐halogen  lamp  illumi‐
Below  considered  metal/porous  silicon  nation was 1‐3 mV. Therefore, gas‐sensitive 
Schottky type structures operating at room  measurements  were  performed  under 
temperature  as  humidity‐sensitive  sensor  daylight illumination. 
or sensors sensitive to hydrogen‐containing  The current‐voltage characteristics of Au/PS 
gases, do not need to operate under external  structure at the normal room conditions (45 
voltage bias [8,9,10,11,12,13].  Instead, such  %RH,  T=300K)  showed  rectifying  proper‐
structures  in  hydrogen‐containing  atmos‐ ties.  Here  the  values  of  current  under 
phere  produce  electricity  by  themselve.  In  ‘forward’ voltages (the positive polarity on 
other  words,  metal/PS  structures  exhibit  Au film) are larger than those for ‘reverse’ 
the  properties  of  both  a  gas  sensor  and  a  voltages.  It  is  worth  noting  that  the  recti‐
hydrogen fuel cell.   fying characteristics of Au‐PS structures as 
Sensor fabrication.   The Au/PS/Si structures  well as Ag/PS [12] and Cu/PS structures [8] 
were  fabricated  by  the  evaporation  of  a  were  depended  on  ambient  humidity. 
thin  Au  film  onto  the  PS  surface  with  a  Herewith  the  reverse  I‐V  characteristics 
porosity  of  65%  at  room  temperature  by  have  more  considerable  humidity‐stimu‐
using  the  electron‐beam  technique.  The  lated  dependencies  than  the  forward    I‐V 
thickness of the deposited Au film was 150  characteristics. 
nm,  as  obtained  by  measurements  during  The  typical  reverse  I‐V  characteristics  of 
the  evaporation  using  a  deposition  Au/PS structure in air ambient at 45 %RH, 
controller  (Inficon,  Leybold).  Current‐ 70 %RH,  83 %RH,  90 %RH and  99 %RH 
voltage  (I‐V)  characteristics,  open‐circuit  at  room  temperature  are  presented  in 
voltage  (Voc),  and  short‐circuit  current  (Fig.7).  It  is  seen  that  the  reverse  currents 
density  (Jsc)  of  the  (Au)/PS/Si  and  PS/Si  considerably  increase  with  the  rising  of 
structures  were  measured  at  room  tempe‐ relative  humidity.  The  value  of  current  at 
rature in air (300 K, 45% relative humidity  99  %RH  (for  2V)  increases  in  comparison 
(RH))  as  well  as  for  different  gas  atmos‐ with that at 45 %RH (for 2V) by factor 12. It 
pheres (humid, CO, and H2S) in the measu‐ will be noted that PS/Si structures (without 
ring cell. The concentrations of CO and H2S  Au film) showed a weak rectifying charac‐
were  measured  using  a  BW  Defender  teristics  and  the  weak  humidity‐sensitive 
Multi‐Gas  Detector.  The  gas‐stimulated  properties. 
open  circuit  voltage  (Voc)  and  short‐circuit  The  humidity‐voltaic  effect  i.e.  generation 
current  density  (Jsc)  for  the  contacts  to  the  of  a  voltage  between  the  contacts  to  Au 
Au film and PS layer (or Si substrate) were  film  and  PS  layer  under  humidity  expo‐
measured directly by a Thurlby‐1503 digital  sition is observed for Au‐PS structures. The 
multimeter.  (Fig.  6).  RH  in  the  cell  was  similar  effect  is  earlier  discovered  for 
measured  with  an  Extech‐44470  hygro  Ag/PS  and  Cu/PS  structures  [8,  12].  Fig.  8 
thermometer.  The  photosensitive  proper‐ illustrates  the  open‐circuit  voltage  in 

Number 25, 2009    25
Tayyar Dzhafarov, Sureyya Aydın Yuksel 

dependency  on  the  relative  humidity  for  tration  of  water  molecules  in  air.  The 
one of such Au/PS structures. It is seen that  voltage generated   (about 30 mV), at a zero 
the  Voc  approximately  linearly  increases  concentration  of  CO  gas  is  related  to  the 
from  15  mV  to  400  mV  with  rise  of  the  humidity  of  air.    The  relation  between 
relative humidity from 51 %RH to 95 %RH.  open‐circuit  voltage  and  H2S  gas  concen‐
The  humidity‐sensitivity  of  Au/PS  struc‐ tration is similar (Fig. 11) [9].   
ture estimated from curve of Fig. 8 is about 
The generation of Voc and Jsc was observed 
10 mV/(%RH). The PS‐Si structures without 
between the contacts to the Au film and PS 
Au  film  on  PS  surface  displayed  the  low 
layer (or Si substrate), but not between the 
value of Voc  in humid atmosphere (about of 
contacts to the PS layer and Si substrate. In 
10 mV at 95%RH). 
other words, the presence of the Au film on 
The  I‐V  characteristics  of  the  Au/PS/Si  the  porous  Si  is  a  necessary  condition  for 
structure  (thickness  of  PS  film,  10  μm;  the generation of electricity in the Au/PS/Si 
surface area of Au film, 0.04 cm2) in normal  cell  in  humid,  CO,  and  H2S  atmospheres. 
air (300 K, 45% RH) and in the presence of  The sensitivities of the Au/PS sensors to the 
H2S  gas  are  indicate  good  rectifying  pro‐ humidity  level  and  the  concentrations  of 
perties  (Fig.9).  Also,  the  current  under  CO  gas  and  H2S  gas  were  about  8.9 
reverse  voltage  (the  negative  polarity  on  mV/RH,  3.6  mV/ppm,  and  1.8  mV/ppm, 
the  Au  film)  in  the  H2S  atmosphere  is  a  respectively. 
factor  of  103  larger  than  that  in  air,  while 
the current under the forward voltage bias  Fig.  12  shows  the  response‐recovery  beha‐
in  H2S  is  only  1.4  times  that  in  air.  The  vior of the open‐circuit voltage of the Au/PS 
increased  fragment  of  I‐V  curve  (2)  in  H2S  sensor after successive cycles of placing the 
is  also  shown  in  Fig.  9.  The  open‐circuit  sensor in a H2S atmosphere (45 ppm). It can 
voltage  and  short‐circuit  current  are  300  be seen that the response time is about 60 s. 
mV  and  0.075  mA,  respectively.  The  small  Sensitivity  of  Au/PS  sensor  to  H2S  gas  (45 
value  of  Isc  may  be  caused  by  the  high  ppm) defined from the relation  
internal  electrical  resistance  of  the  Au/PS  S={Voc(gas) – Voc(0)}/Voc (0)             (8) 
cell (about 4×105 Ω). 
is  equal  16.5.  Here  Voc(gas)  and  Voc(0)  are 
The  humidity/hydrogen‐containing  gas  ‐ 
the  open‐circuit  voltage  for    concentration 
voltaic  effect,  i.e.,  the  generation  of  the 
of H2S gas 45 ppm and 0, respectively. 
open‐circuit  voltage  between  the  contacts 
to  the  Au  film  and  PS  (or  Si)  after  an  To  summarize,  the  following  experimental 
increase in humidity (Fig. 8) or by adding a  facts  related  to  the  change  of  the  electrical 
hydrogen‐containing gas [8, 9, 12, 13], was  characteristics  after  placing  the  Au/PS 
also  observed  for  the  Au/PS  structure  in  Schottky‐type  structures  in  a  humid,  CO, 
CO  and  H2S  atmospheres  (Fig.  10  and  Fig.  or  H2S  gas  atmosphere  were  solidly 
11) [9]. Fig. 10 illustrates the dependence of  established: 
the open‐circuit voltage generated in Au/PS 
(1) Placing the Au/PS structures in a humid, 
structures  on  the  CO  concentration  at  45 
CO,  or  H2S  gas  atmosphere  results  in 
and  58%  RH.  An  almost  linear  increase  of 
the  increase  of  both  the  forward  and 
Voc  is  observed  with  increasing  CO 
reverse  currents,  but  the  latter  increase 
concentration. Voc also increases with rising 
is much greater.    
RH.  The  increase  of  voltage  at  higher 
humidity observed in Fig.10 can be related  (2) Simultaneously,  the  formation  of  an 
to  the  influence  of  the  increased  concen‐ open‐circuit voltage (up to 480 mV) and 

26  Journal of Qafqaz University   
Nano‐Porous Silicon for Gas Sensor and Fuel Cell Applications 

a  short‐circuit  current  (up  to  0.08  mA)  the  cathode  (PS/Si  interface)  region.  Water 
was observed for these structures.   molecules  and  oxygen  from  air  can  easily 
penetrate into the PS/Si interface due to the 
(3) However,  when  the  PS/Si  structures 
imperfections  in  this  area.  Here  the 
(without  Au  film)  were  placed  in  a 
hydrogen  is  recombined  and  reacts  with 
humid, CO, or H2S atmosphere, electri‐
oxygen to produce water molecules. 
city generation was not observed. 
Concerning  the  the  operating  principle  of 
(4) Voc  is  dependent  on  the  relative  humi‐
the Au/PS/Si sensor to detect the  CO mole‐
dity  and  the  concentration  of  CO  and 
cules,  one  can  suppose  that  at  the  first 
H2S gases.  
stage, the water molecules from the humid 
(5) This  phenomenon  is  reversible,  i.e.,  for  air  in  the  presence  of  the  Au  catalyst 
Au/PS  structures,  inserting  and  remo‐ interact  with  the  CO,  resulting  in  the 
ving  the  structure  from  the  gas  is  formation  of  hydrogen,  according  to  the 
accompanied  by  the  response  and  electrode reaction [25]  
recovery of Voc, respectively. 
CO + H2O → CO2 + H2                                  (9) 
Thus,  the  above  results,  i.e.,  the  voltage 
H2 → 2H+ + 2e‐.                                            (10) 
generation  in  the  Au/PS/Si  Schottky‐type 
structures  in  a  humid,  CO,  or  H2S  atmos‐ After  the  reaction  described  by  eq.  (9),  the 
phere indicate, both the gas sensor and fuel  formation  of  electricity  proceeds  in 
cell  functionalities  of  these  structures.  The  accordance with eq. (10). Note that in spite 
similar effect of the voltage generation was  of  the  absence  of  hydrogen  in  the  CO  gas, 
discovered  upon  dipping  the  Au(Ag,Cu)/  this  gas  is,  nevertheless,  hydrogen‐
PS/Si  structures  into  different  hydrogen‐ producing, as shown by eqs. (9) and (10).  
containing  solutions  (KOH  (potassium  In the case of Au/PS/Si cell at H2S gas + air 
hydroxide),  CH3CH2OH  (ethanol),  CH3OH  atmosphere  the  following  reactions  take 
(methanol), C6H12O6  (glucose), H3BO3 (boric  place in the presence of Au catalyst [22]  
acid),  C5H12  –  C16H34  (benzine),  NaBH4 
(sodium borohydride), Black sea‐water etc)  At the anode:   
[13].   H2S + 2H2O → SO2 +6H+ + 6e‐                   (11) 
The  mechanism  of  the  generation  of  the  At the cathode:                   
electricity  in  the  metal/PS/Si  cells  under  6H+ + 6e‐ +3/2O2 → 3H2O                          (12) 
humid  conditions  has  already  been 
To  overall,  the  voltage  generation  mecha‐
proposed  [8,  12,  13].  We  suggest  that  in 
nism  in  Au/PS/Si  structure  at  H2S  atmos‐
Au/PS/Si  cell,  similar  to  Proton  Exchange 
phere  is  similar  with  the  above‐described 
Membrane  (PEM)  fuel  cell  [3],  the  Au  film 
mechanism for humid and CO ambient.   
and  PS  layer  play  the  role  of  the  catalytic 
anode  and  electrolyte,  respectively.    The  The  Ag/PS  structure  discovered  humidity‐
interface  region  between  the  porous  and  sensitive  properties  due  to  change  of  the 
crystalline  silicon  (PS/Si),  which  is  very  capacitance  under  water  vapor  exposition. 
imperfect and stressed, plays the role of the  Fig.  13  shows  the  humidity‐sensitive 
cathode.  Electrons  and  protons  formed  in  properties  of  Au/PS  sensor  [19].The  strong 
Au  catalyst  film  after  hydrogen  splitting  dependence  the  capacitance  on  relative 
(H2 → 2H+ + 2e‐), pass through the external  humidity  was  observed  because  of  the 
circuit  and  along  the  pore  surfaces  of  PS  dielectric constant of pure water (about 80), 
layer  (electrolyte),  respectively  and  reach  that  condensed  on  pores,  is  significantly 

Number 25, 2009    27
Tayyar Dzhafarov, Sureyya Aydın Yuksel 

larger  than  that  of  the  silicon  (about  12).  producing light and heat, electrical current 


The  measurement  of  capacitance  was  also  is produced. 
performed at high frequencies (100 Hz, 200 
Several  different  types  of  fuel  cells  are 
Hz,  500  Hz,  1  kHz)  and  the  decrease  of 
being explored for commercial development. 
capacitance  with  frequency  was  observed. 
They  are  typically  classified  according  to 
The  porous  silicon  in    humid  ambient  can 
electrolyte type. (Table 1). Polymer electro‐
be considered as a complex material where 
lyte  membrane  (PEM)  cells,  also  known  as 
the dielectric properties are depend on the 
proton  exchange  membrane  cells  are  now 
various  polarizations  of  silicon,  water 
considered  the  leading  for  automotive 
vapor  and  air.  The  dielectric  constant  of 
applications.    PEM  fuel  cell  is  a  thin,  flat, 
such  material  varies  with  the  frequency  of 
multi‐latered “sandwich”. It is made up of 
the  applied  ac  signal  by  the  dielectric 
two  electrodes  (anode  and  cathode) 
dispersion.  Especially  at  low  frequency,  it 
surrounding  the  polymer  electrolyte.  The 
is  much  influenced  by  the  orientational 
polarization  which  usually  occurs  in  electrodes of the fuel cell are thin layers of 
liquids  and  gases  composed  of  molecules  material,  with  the  platinum  catalyst 
with  a  permanent  or  an  induced  dipole  dispersed  in  carbon,  which  are  applied  to 
moment [23].      each  side  of  the  membrane,  yielding  what 
is  known  as  a  Membrane  Electrode 
4.  Hydrogen Fuel Cells  Assembly (MEA) (Fig.14).  
Hydrogen  is  the  most  attractive  and  In past years, the rise in portable electronics 
ultimate candidate for a future fuel and an  requires the development of miniature fuel 
energy  carrier.  Hydrogen  is  recognized  as  cells  compatible  with  standard  silicon 
the environmentally desirably clean fuel of  micro  fabrication  technology.  Most  silicon 
the  futute  since  it  can  be  used  directly  in  micro‐fuel cells have used the polyperfluo‐
different  types  of  hydrogen  fuel  cells.  In  rosulfonic  acid  membranes  (Nafion®)  as  a 
hydrogen  fuel  cells  the  electrical  energy  proton  exchange  membrane  (PEM)  that  is 
will be derived from the reaction of hydro‐ not  really  integrated  with  standard  micro 
gen and oxygen gases within the fuel cell to  fabrication  techniques  [30].The  composite 
make water. 
materials  such  as  inorganic‐organic  hybrid 
In  the  water  electrilizer,  electric  current  materials,  often  including  Nafion®  as  one 
passed througth water splits  it into hydro‐ of  components  (Nafion‐silica,  Nafion‐
gen and oxygen  borosiloxane  etc)  are  next  generation  of 
2H2O → 2H2 + O2        (‐285 kJ/mol)           (13)  proton conducting membrane [28, 32]. The 
porous  silicon  wafer  filled  with  acid  or 
As opposity to reaction (13), production of  Nafion®  was  developed  as  a  proton  con‐
water,  heat,  light  and  sometimes  sound 
duction  membrane  [20].  Most  previous 
takes  place  when  normally    hydrogen 
works on fuel cells using the porous silicon 
burns reacting with oxygen from air 
has  been  focused  on  Direct  Methanol  Fuel 
2H2 + O2 → 2H2O       (+285 kJ/mol)           (14)  Cell (DMFC). Bellow presented study have 
Most fuel cells directly generates electricity  demonstrated  that  direct  hydrogen 
using the chemical reaction between a fuel  sulphide  or  sodium  borohydride  fuel  cells 
(hydrogen)  and  an  oxidant  (oxygen).    İn  with porous silicon layer as proton conduc‐
the hydrogen fuel cell the chemical reaction  ting  membrane  and  the  gold  catalyst  film 
is  exactly  same  to  (14),  but  instead  of  are interesting for micro power generation. 

28  Journal of Qafqaz University   
Nano‐Porous Silicon for Gas Sensor and Fuel Cell Applications 

Hydrogen  or  a  fuel  like  methanol  applications  for  PEM  cells  are  stationary 
containing hydrogen is fed into the anode,  power  stations,  engines  of  automobiles, 
where the hydrogen atoms, encouraged by  power sources for portable electronics etc. 
a  catalyst,  split  into  protons  and  electrons 
Table 1. Types of fuel cells 
according to oxidation reaction  
_______________________________________________ 
H2 →2H+ + 2e‐              (15)  Fuel Cell types          Fuel         Efficiency   Operating 
                          (%)                              temp. (oC)                
The  protons  pass  through  a  selective  _______________________________________________ 
electrolyte  membrane,  while  the  electrons 
PEM                           H2               40‐50               ~80 
are  shunted  off  to  another  path,  creating  a 
Direct Methanol     Methanol          35                 ~80 
usable  electric  current.  The  protons  and 
(DMFC)                   Ethanol 
electrons  rejoin  at  the  cathode,  where  the 
Solid Oxide              H2, CO,         45‐55               700 
hydrogen  reacts  with  oxygen  from  the  air 
(SOFC)                      CH4 
to  form  water.  Oxygen  reduction  reaction 
Molten Carbonate  H2, CO,         50‐60               650 
on the cathode can be described as 
(MCFC)                   CH4   
2H+ + 2e‐  + 1/2O2 → H2O           (16)  Phosphoric Acid      H2                 40‐50               190 
Fuel cells run on pure hydrogen gas, which  (PAFC) 

can  be  produced  cleanly  from  solar  power  Alkaline                    H2                                           50 


as  well  asother  renewble  energy  sources.  (AFC) 
_______________________________________________ 
Fuel cells running on hydrogen produce no 
pollution,  the  only  byproduct  is  pure  Major parameters of different types of Fuel 
water.  Hydrogen  fuel  cells  are  about  50%  Cells  were  presented  in  Table  1.  Polymer 
efficient,  while  the  internal  combustion  electrolyte  membranes  are  also  used  to 
engines  are  only  12  –  15%.  PEM  fuel  cells  construct  Direct  Methanol  Fuel  Cells 
are  no  moving  parts,  can  be  very  reliable  (DMFC),  another  actice  area  of  fuel  cell 
and  make  almost  no  noise.  The  first  research.  DMFC  operates  on  dilute 
practical  fuel  cells  were  built  for  the  aqueous solutions, with reported workable 
APOLLO  space  program  in  the  1960  and  devices  allowing  no  more  than  3% 
fuel  cells  are  still  used  in  space  today.  methanol  in  water.  Working  principle  of  a 
However,  PEM  cell  is  expensive  and    so  DMFC, using the methanol as fuel, consists 
current  cell    cost  somewhere  around  $20  in  the  follow  chemical  reactions  on  the 
per  Watt  of  power.  Fuel  cells  require  anode and cathode 
precious metals for catalysts and expensive 
Anode:  
polymer membranes. While the cost of fuel 
CH3OH + H2O → CO2 + 6H+ +6e‐         (17) 
cell  stacks  decreased  tenfold  in  just  three 
Cathode:     
years.  Each fuel  cell  generates  an  electrical 
6H+ + 3/2O2 + 6e‐→ 3H2O           (18) 
potential  of  up  1‐3  V  depending  on  how 
______________________________________ 
much  electrical  current  it  is  asked  to 
produce. Higher voltages can be created by  CH3OH + 3/2O2 → CO2 + 2H2O          (19) 
arranging  of  multiple  cells  together  (Fuel 
cell stack). The amount of electrical current  The values of DMFC single cell performance 
produced by cell is proportional to its total  are 0.5 V/cell at 0.2 A/cm2 at 30‐60oC. 
area. Currently, demonstration stacks of 50  Hydrogen as a source of clean energy has a 
kW capacity are operating and stacks up to  number  of  attractive  advantages,  such  as 
250  kW  under  development.  Possibly  high  energy  density,  nontoxic  reaction 

Number 25, 2009    29
Tayyar Dzhafarov, Sureyya Aydın Yuksel 

products  and  abundant  natural  resources.  structure  is  very  sensitive  to  NaBH4 
However,  the  application  of  hydrogen  for  concentration.  The  Au/PS/Si  structure  on 
power sources has been  greatly restrained  dipping into NaBH4 solution also exhibited 
due  to  the  lack  of  safe  and  convenient  the  short‐circuit  current  (about  of  2.5 
generation and storage methods. Hydrogen  mA/cm2). pH measuring of NaBH4 solution 
can  be  stored  in  high  pressure  tanks  or  showed that with increase of concentration 
liquefied H2, or by adsorption on activated  of  NaBH4  from  10  to  30  mg/ml,  pH  of  the 
carbon,  carbon  nanotubes  or  in  hydrogen‐ solution  increases  from  9.3  to  9.5,  i.e. 
storing alloy [26]. Among hydrogen‐storing  increase of pH of NaBH4 solution results in 
materials,  sodium  borohydride  (NaBH4)  increase  of  voltage  generated  in  the  cell 
due to the high hydrogen content (about of  (Fig. 15). It should be noted that, as opposed 
10%  wt  or  100  kg/m3)  is  suggested  as  new  to  Au/PS/Si  structure,  in  PS/Si  structure 
fuel  media  supplying  hydrogen  at  normal  (without  the  Au  film)  the  marked  gene‐
temperatures.  The  catalyc  hydrolysis  of  ration of electricity on dipping its in NaBH4 
sodium borohydride proceeds as   solution was not observed. 

NaBH4 + 2H2O → NaBO2 + 4H2         (20)  The  Voc‐N  dependence  observed  in  Fig.  15 
can be explained by two concurrent pheno‐
As result of this reaction, each mole NaBH4  mena.  The  increase  of  NaBH4  concentra‐
can generate 4 moles of hydrogen gas. This  tion, for the relative low contents of NaBH4 
is  a  very  effective  system,  since  we  are  (N<30 mg/ml), is accompanied by increasing 
getting  hydrogen  out  of  the  water  as  well.  of  proton  concentration  (up  to  2x1011  cm‐3) 
We  get  eight  hydrogen  atoms  (four  mole‐ and this results in rising of voltage. On  the 
cules) from just four atoms of hydrogen in  other  hand,  at  large  contents  of  NaBH4 
the  NaBH4..  The  hydrogen  is  formed  right  (N>30  mg/ml),  products  of  reaction  (17) 
there  on  the  anode,  and  is  thus  precipitate  in  pores  of  Au  and  porous 
immediately  used  by  the  fuel  cells.  NaBH4  silicon  and  thereby  hindering  penetration 
is a nonreversible chemical hydride for the 
of protons to interface. Thus, Schottky‐type 
one‐time  hydrolysis  generation  of  H2.  It  is 
Au/PS/Si  structures  sunk  in  NaBH4  and 
shown  that  NaBO2  byproduct  of  reaction 
other  hydrogen‐containing  solutions  gene‐
(12)  can  be  recycle  back  to  NaBH4  using 
rate  a  voltage  up  to  550  mV.  These  data 
coke or membrane [27]              
indicate on perspectivity of using Au/PS/Si 
The effect, similar to humidity‐voltaic effect  structures as hydrogen cells.                             
[8  ],  i.e.  the  generation  a  voltage  between 
Fig.  16  shows  the  open‐circuit  voltage  ge‐
the  contacts  to  Au  film  and  Si  under 
neration for the Au/PS/Si cell in H2S+dH2O 
humidity  exposition,  was  also  discovered 
solution  at  different  concentration  of  H2S. 
on  dipping  of  Au/PS/Si  structure  into 
Almost linear increase of voltage (from 230 
NaBH4  solution.  Fig.  15  illustrates  the 
open‐circuit  voltage  arising  in  Au/PS/PS  to 400 mV) is observed with increasing the 
structure  dependent  on  the  concentration  H2S concentration from 17 to 75 mM.  Value 
of  NaBH4  solution  (N)  [16,17].    It  is  seen  of  Voc  in  pure  water  (120  mV)  is  markedly 
that the Voc – N dependence seems to be a  lower  than  that  in  hydrogen  sulphide‐
curve with a maximum (Voc =550 mV) at N  containing solution [18].   Fig. 17 shows the 
= 30 mg/ml. In the range of concentration of  current‐voltage‐power  output  of  Au/PS/Si 
NaBH4 solution up to 30 mg/ml gradient of  cell  in  H2S+dH2O  solution.  Results  were 
curve  (dVoc/dN)  is  large  (about  13  mV.ml/  gained  at  room  temperature  with  0.08M 
mg),  i.e.  voltage  generated  in  Au/PS/Si  hydrogen  sulphide.  From  the  polarization 

30  Journal of Qafqaz University   
Nano‐Porous Silicon for Gas Sensor and Fuel Cell Applications 

curve and current‐voltage characteristic we  These  results  allow  supposing  that  the 


found  that  the  power  density  of  the  single  Metal  (Au,  Ag)/PS  structures  can  be  used 
direct  hydrogen  sulphide  cell  reached  0.3  as  miniature hydrogen cells. In addition to 
mWcm‐2.  It  is  be  noted  that  successive  this, the nearly linear dependence the open 
placing in and removal of the Au/PS/Si cell  circuit voltage generated in Au/PS/Si cell in 
from  H2S‐containing  solution  is  accompa‐ dependence  on  concentration  of  H2S    in 
nied  by  the  response  and  recovery  of  the  hydrogen  sulphide  containing  solution 
value of Voc with response time about 40‐60 s.   (Fig. 11) permits of using such structures as 
hydrogen sulphide sensors with sensitivity 
The similar effect of voltage generation was 
about  2.5  mV(mM)‐1.  The  low  current 
also  observed  during  dipping  of  Ag/PS 
generated in such cell is its lack so far. 
structures  in  other  hydrogen‐containing 
solutions  (the  distilled  water,  fresh  water,  This  work  was  supported  by  STCU  Grant 
Black  sea‐water,  ethanol  and  methanol)  no. 3819. 
(Table 2) [14]. 
REFERENCES 
Table 2.  Data on Voc and Jsc generated in Ag/PS struc‐
[1]  G.B.Abdullaev,  T.D.  Dzhafarov,  Atomic  Diffu‐
tures  in  humid  and  in  the  hydrogen‐
sion  in  Semiconductor  Structures,  New  York, 
containing solutions 
Harwood, 1987.  
                Conductivity           [2]   G.  Barillaro,  A.  Diligenti,  G.  Marola,  L.M. 
Ambient        of solution        V (mV)   (μA/cm2)  Strambini,  Sensors  and  Actuators  B  105  (2005) 
                         (mS/cm)  278. 
_______________________________________________ 
[3]   S.  Basu,  Fuel  Cell  Science  and  Technology, 
Humid (95% RH)            430                 6  Springer, New York, 2007, p.40. 
Distilled water            0.08                  505                44  [4]   M.I.J. Beate, J.D. Benjamin, M.J. Uren, N.G. Chew, 
A.G. Cullis, J. Crystal Growth, 73 (1985) 622. 
Fresh‐water                 0.47                  514                131 
[5]   O.  Bisi,  S.  Ossicini,  L.  Pavesi,  Surface  Science 
Sea‐water                    48.4                   559                256 
Reports, 38 (2000), 1‐126. 
Ethanol                        0.0095               254                3 
[6]   M.S. Brant, H. D. Fuchs, m. Stutzman, J. Weber, 
Methanol                    0.047                  380                10  M. Cardona, Solid State Commun. 81 (1992) 307. 
_______________________________________________  [7]   L. T. Canham, Appl. Phys. Lett., 57 (1990) 1946. 
[8]   T.D.  Dzhafarov,  B.  Can  Omur,  C.  Oruc,  Z.A. 
Largest value of voltage, generated in Black  Allahverdiev,  J.  Phys.  D:  Appl.  Phys.  35  (2002) 
sea‐water  for  the  cell  can  be  caused    by  3122. 
contribution  of  the  hydrogen  sulphide  [9]   T.D.  Dzhafarov,  S.  Aydin  Yuksel,  C.  Oruc  Lus, 
molecules in sea‐water. It is known that the  Japan J. Appl. Phys. 47 (2008) 8204‐8207. 

Black  sea‐water  contains  significant  con‐ [10]   T.D.  Dzhafarov,  B.  Can,  J.  Materials  Science 
Letters, 19 (2000) 287‐289. 
centration  of  hydrogen  sulphide  (about 
[11]   T.D.  Dzhafarov,  S.  Aydin,  C.  Oruc  Lus,  Fizika, 
0.05‐1.50 mg/ml depending on deep water).  13 (2007) 17‐20. 
As can be seen from Table 2, the correlation  [12]   T. D. Dzhafarov and B. Can: J. Mater. Sci. Lett. 
between  changes  of  the  Voc  and  Jsc  19 (2000) 2193‐2195. 
parameters  of  Ag/PS/Si  cells  and  the  [13]   T. D. Dzhafarov, C. Oruc, and S. Aydin: J. Phys. 
conductivity  of  hydrogen‐containing  solu‐ D: 37 (2004) 404‐408. 
[14]   T.D.  Dzhafarov,  S.  Aydin,  D.  Oren,  Solid  State 
tion  is  observed.  Such  correlation  can  be 
Phenomena, 131‐133 (2008) 189‐194. 
tentatively  explained  by  an  increase  of 
[15]   T.D.  Dzhafarov,  S.  Aydin,  J.  Porous  Media,  13, 
concentration of the charge particles, depo‐ issue 1 (2009). 
sited  on  the  pore  surfaces  with  increase  of  [16]  T.D.  Dzhafarov,  C.  Oruc  Lus,  S.Aydin,  Metal/ 
conductivity of solutions.   Porous  Silicon  Schottky‐type  Hydrogen  Fuel   

Number 25, 2009    31
Tayyar Dzhafarov, Sureyya Aydın Yuksel 

Cells,    Ninth  Grove  Fuel  Cell  Symposium,  4‐6  Fig. 3.  Scanning electron microscopy of porous silicon 


October 2005, London, UK.  layer (a is top and b is the cross‐section). 
 [17] T.D. Dzhafarov, C. Oruc Lus, S. Aydin, E. Cingi,  Fig. 4.  FTIR spectrum of porous silicon film (300 K). 
Metal/Porous silicon Schottky diode structure as  Fig. 5.  Energy band gap in depending on porosity of 
sensors, MRS 2006 Spring Meeting, Sympo‐sium  PS film (40 %RH, 300K). 
R, April 17‐21, San Francisco, CA USA.  Fig. 6.  Schematic sketch of  Metal/PS/Si structure. 
[18]  T.D.  Dzhafarov,  S.  Aydin,  Development  of  Fig. 7.  Reverse I‐V characteristics of Au/PS structure 
porous  silicon‐based  direct  hydrogen  sulphide   in humid ambient ( (1) 45, (2) 70, (3) 83, (4) 90 
fuel  cells,  EMRS  2008  Spring  Meeting,    Simpo‐ and (5) 99 %RH). 
sium  K  –  Advanced  Silicon  Materials    Research  Fig. 8.  The open‐circuit votage – RH dependence for 
for  Electronic  and  Photovoltaic  Applications,  Au/PS structure (300 K). 
May 26‐28, 2008, Strasbourg,   France. 
Fig. 9.  I‐V characteristics of Au/PS structure in (1) air 
[19]  T.D.  Dzhafarov,  C.Oruc,  G.Guven,  Humidity‐ (45 %RH, 300 K) and (2) H2S (45 ppm). 
Voltaic  Properties  of  Metal‐Porous  Silicon 
Fig. 10.  Voltage  generated  by  Au/PS/Si  sensor  as  a 
Contacts,  9‐th  International  Conference  on  the 
function of the CO gas concentration in (1) 45 
Formation  of      Semiconductor  Interfaces,    
% RH and (2) 58 % RH. 
ICFSI‐9,   Madrid, September 15‐19, 2003 
Fig. 11.  Voltage  generated  by  Au/PS/Si  sensor  as  a 
[20]  N. Gyoko, I. Naohiro, Y. Jingrong, T. Koji, Elec‐ function of the H2S gas concentration. 
trochemistry, 73 (2005) 939. 
Fig. 12.  Voltage  response  of  the  Au/PS/Si  sensor 
[21]  R.  Herino,  Properties  of  Porous  Silicon,  ed.  L.  exposed to H2S gas (45 ppm). 
Canham (London: INSPEC, 1998). 
Fig. 13.  Capacitance  change  with  humid  ambient  for 
[22]  G.  Hoogers,  Fuel  Cell  Technology  Handbook,  Ag/PS/Si structure (50 Hz, 300 K). 
CRC Press, Boca Raton, FL (2003) p.307.  Fig. 14.  Proton  Exchange  Membrane  type  hydrogen 
[23]  S.  Kim,  J.  Park,  S.  Lee,  S.  Yi,  J.  Phys.  D:  Appl.  fuel cell. 
Phys. 33 (2000) 1781.  Fig. 15.  The  voltage  generation  in  Au/PS/Si  cell  as  a 
[24]  F. Koch,V. Petrova, T. Muschik, A. Nikolaev, V.  function  of  NaBH4  contains  in  NaBH4:H2O 
Gavrilenko.  Mater.  Res.  Soc.  Symp.  Proc.  283  solution. 
(1993) 197.  Fig. 16.  The  voltage  generation  in  Au/PS/Si  cell  as  a 
[25]  D.Kohl, J. Phys. D 34 (2001) R125.  function  of  H2S  concentration  in  distilled 
[26]  M.  Mamirlan,  T.N.  Veziroglu,  Renewable  and  water. 
Substainable Energy Reviews, 6 (2002) 141‐179.  Fig. 17.  (1)  The  I‐V  characteristic  and  corresponding 
(2)  power  density  curve  of  Au/PS/Si  cell  in 
[27] Y. Kojima, T. Haga, Intern. J. Hydrogen Energy, 
H2S+dH2O solution (0.08 M). 
28 (2003) 989. 
 
[28]  M.  Miyare,  J.S.  Wainright,  R.F.  Savinell,  J. 
Electrochem. Soc., 148 (2001) A898.    
[29]  G.G.  Qin,  Y.  Q.  Jie,  Solid  State  Commun.  85   
(1993) 559. 
[30]  R.F. Service, Science, 296 (2002) 1222. 
[31] J.P. Stetter, W.R. Penrose, S. Yao, J. Electrochem. 
Soc. 150 (20 (2003) S11‐S16. 
[32]  H. Suzuki, Y. Yoshida, M.A. Mehta, M. Watanabe, 
T. Fujinami, Fuel Cells, 2 (2002) 46. 
[33]  W. Theib, Surface Science Reports, 29 (1997) 91‐192. 
[34]  D.R. Turner, J. Electrochem. Soc., 105 (1958) 405. 
[35]  A. Uhler, Bell System Tech. J. v.35 (1956) 333‐338. 
 
FIGURE CAPTIONS 

Fig. 1.  Photoluminescence spectra of the PS film and 
bulk Si (300 K). 
Fig. 1. Photoluminescence spectra of the PS film and 
Fig. 2.  Cross‐sectional view of lateral anodization cell.  bulk Si (300 K). 

32  Journal of Qafqaz University   
Nano‐Porous Silicon for Gas Sensor and Fuel Cell Applications 

1.8

Eg (eV)
1.6

1.4

1.2
Fig. 2. Cross‐sectional view of lateral anodization cell.  20 40 60 80 100
Gözeneklilik (%)
 
Fig. 5. Energy band gap in depending on porosity of 
PS film (40 %RH, 300K). 

 
Fig. 6. Schematic sketch of Metal/PS/Si structure. 
 
a) 

 
 
(b) 
Fig. 7. Reverse I‐V characteristics of Au/PS structure 
Fig. 3. Scanning electron microscopy of porous 
in humid ambient ( (1) 45, (2) 70, (3) 83, (4) 90 and (5) 
silicon layer (a is top and b is the cross‐section). 
99 %RH). 
500

400 I
I
300 I
V0C (mV)

200 II
I
II
100
I
0 II
50 60 70 80 90 100
Relative Humidity (%)
 
 
Fig. 4. FTIR spectrum of porous silicon film (300 K).  Fig. 8. The open‐circuit voltage – RH dependence for 
Au/PS structure (300 K). 

Number 25, 2009    33
Tayyar Dzhafarov, Sureyya Aydın Yuksel 

400
H2S air H 2S air H 2S air H 2S air

Voc(mV)
350
300
250
200
150

100
50
0
0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26
t (min)
 
Fig. 12. Voltage response of the Au/PS/Si sensor 
  exposed to H2S gas (45 ppm). 
Fig. 9. I‐V characteristics of Au/PS structure in (1) air 
(45 %RH, 300 K) and (2) H2S (45 ppm).   

   
 

   
Fig. 10. Voltage generated by Au/PS/Si sensor as a  Fig. 13. Capacitance change with humid ambient for 
function of the CO gas concentration in (1) 45 % RH  Ag/PS/Si structure (50 Hz, 300 K). 
and (2) 58 % RH. 
 
600
Voc(mV)

 
500  

400

300

200

100

0
0 50 100 150
H2 S Concentration (ppm)  
 
Fig. 11. Voltage generated by Au/PS/Si sensor as a  Fig. 14. Proton Exchange Membrane type hydrogen 
function of the H2S gas concentration.  fuel cell. 

34  Journal of Qafqaz University   
Nano‐Porous Silicon for Gas Sensor and Fuel Cell Applications 

600

400
V (mV)

200

0
0 20 40 60 80
N (mg/ml)
   
Fig. 15. The voltage generation in Au/PS/Si cell as a  Fig. 17. (1) The current‐voltage (I‐V) characteristic 
function of NaBH4 contains in NaBH4:H2O solution.  and corresponding (2) power density curve of 
Au/PS/Si cell in H2S+dH2O solution (0.08 M). 
 

 
Fig. 16. The voltage generation in Au/PS/Si cell as a 
function of H2S concentration in distilled water. 

 
 
 
 
 

Number 25, 2009    35
 
 
 
İKİÖLÇÜLÜ DALĞA TƏNLİYİNİN QRUP NƏZƏRİYYƏSİ   
METODU İLƏ TƏDQİQİ 

Ə.Q. AĞAMALIYEV 
 Bakı Dövlət Universiteti 
Bakı / AZƏRBAYCAN 

XÜLASƏ 

Məqalədə  ikiölçülü  dalğa  tənliyinin  maksimal  invariantlıq qrupu  tapılmışdır.  Göstərilmişdir  ki,  həmin  qrup 
11 parametrli kəsilməz Li qrupundan ibarətdir. Alınmış qrupun elementləri ikiölçülü Lorents qrupu və konform 
çevirmələrin elementlərindən ibarətdir.  
Açar sözlər: dalğa tənliyi, invariant, Li qrupu 

INVESTIGATION OF THE TWEDIMENSIONAL WAVE EQUATION  
FROM THE GROUP POINT OF  VIEW 

SUMMARY 

The  two  dimensional  wave  equation  from  the  group  point  of    view  has  been  investigated.    The  maximal 
invariable group of the equation founded in this group is 11‐parameters Li group.  
Key words: wave equation, invarianse, Li group 

 
 
Bildiyimiz  kimi,  hər  bir  fiziki  məsələnin  İbraqimov [5] tərəfindən verilmişdir. Həmin 
həlli  diferensial,  inteqral  və  ya  inteqro‐  metod  invariantlıq  operatorlarının  davamı 
diferensial tənliklərin qurulması və onların  metodu  adlanır.  Bu  metodda  göstərilir  ki, 
həllinə  gətirir.  Həmin  tənliklərin  analitik  s  tərtibli 
F ( x, u , u1 , u 2 , K , u s ) = 0
şəkildə həlli isə həmişə mümkün olmur. Bu 
səbəbdən də fiziki sistemin hərəkətinin xa‐
şəklində verilmiş tənliyin invariantlıq şərti 
(X F )
rakteri  haqqında  hərəkət  tənliklərini  həll 
etmədən müəyyən  informasiya əldə  etmək  = 0        (1) 
s F =0
lazım  gəlir.  Bunun  üçün  sistemin  hərəkət 
inteqrallarını  və  ya  saxlanan  kəmiyyətləri  tənliyi vasitəsilə ifadə olunur. Buradakı  X  
s
bilmək  kifayət  edir.  Saxlanan  kəmiyyətləri 
operatoru tənliyi invariant saxlayan 
bilmək  üçün  isə  sistemin  simmetriyasını 
∂ ∂
bilmək kifayətdir.  X = ςi +ηα α  
∂x1 ∂u
Sistemin  simmetriyası  ilə  saxlanan  kəmiy‐
yətlər arasında əlaqə Nyoter teoremi [1,2,3]  operatorun  s ‐ci  tərtibdən  davam  operato‐
vasitəsilə ifadə edilir. Bu səbəbdən də siste‐ rudur.  s ‐  indeksinin  qiyməti  verilmiş  tən‐
min  simmetriyasını,  başqa  sözlə,  sistemin  liyin tərtibinə,  i  ‐ indeksinin qiyməti tənli‐
invariantlıq qrupunu tapmaq mühüm əmə‐ yə  daxil  olan  asılı  olmayan  dəyişənlərin 
liyyat kəsb edir. Belə məsələlərin qoyuluşu  sayına,  α ‐  indeksinin  qiyməti  tənlikdəki 
və  həlli  metodu  S.Li,  Ovsyannikov  [4]  və  funksiyaların sayına bərabərdir.  

36  Journal of Qafqaz University
İkiölçülü Dalğa Tənliyinin Qrup Nəzəriyyəsi Metodu ilə Tədqiqi 

Bizim  tədqiq etdiyimiz dalğa tənliyi   (X F )
2
1
F =0
{
= η tt + u tt (η u − 2ξ t1 ) +
u tt − (u xx + u yy ) = 0      (2)  + u t (2η ut − ξ tt1 ) − 2u tx ξ t2 − u x ξ tt2 − 2u ty ξ t3 −
şəklində  olduğundan  s = 2 ;  α = 1 ;  i = 3  
qiymətlər  almalıdırlar.  Deməli,  bizə  ikinci 
[
u y ξ tt3 + (u t ) 2 η uu − η xz _ u xx (η u − 2ξ x2 ) +
tərtibdən  davam  operatorunu  bilmək  la‐ + u x (2η ux − 2ξ xx2 ) − 2u tx ξ x1 − u t ξ xx1 − 2u xy ξ x3 −
zımdır. Həmin operator   − u y ξ xx3 + (u x ) 2 η uu + η uu + u yy (η u − 2ξ y3 ) +
∂ ∂ + u y (2η uu − ξ yy3 ) − 2u ty ξ 1y −
X = X + ς iα α
+ ς ijα α     (3) 
∂u i ∂u ij
]}
2

α
− u t ξ 1yy − 2u xy ξ y2 − u x ξ yy2 + (u y ) 2 η uu =0
kimi təyin olunur. Buraya daxil olan  ς i , və  F =0
                       (5) 
ς ijα  kəmiyyətləri 
Alınmış  (5)  tənliyində,  t , x, y, u , u x , u y , u xx ,  
ς i = Di (η
α
) − u D (ξ )
α α
j i
j
u xy , u xt və s. ifadələrinin hər biri asılı olma‐
α
ς ij = D (ς ) − u D (ξ )
j
α
i
α
ik j
k
  yan kəmiyyətlər sayılır. Ona görə də həmin 
∂ ∂ ∂ tənlik  eyniyyətlə  ödənilməlidir.  Bunun 
Di = + uiα α + uijα α üçün  isə  həmin  kəmiyyətlərin  əmsalları 
∂xi ∂u ∂u j
eyniyyətlə sıfıra bərabər olmalıdırlar. 
düsturları vasitəsilə təyin olunurlar. 
Əvvəlcə,  ən  yüksək  tərtibli  törəmə  daxil 
Hesablamalardan  alınır  ki,  ikiölçülü  dalğa  olan hədlərin əmsallarından başlayaq:  
tənliyinin  invariantlıq  şərti  aşağıdakı  for‐
mada olur:  u xt ‐nin əmsalı  − 2ξ t2 + 2ξ x1 = 0 ;  
( )
    X F
2 F =0
= [ς 11 − (ς 22 + ς 33 )]F =0 = 0    (4)  buradan  ξ t2 = ξ x1  
u yt ‐nin əmsalı  − 2ξ t3 + 2ξ 1y = 0 ;  
Deməli ikiölçülü dalğa tənliyinin invariant‐
lıq  qrupunu  tapmaq  üçün  (4)  tənliyini  həll  buradan  ξ t3 = ξ 1y    (6) 
etmək  lazımdır.  Bunun  üçün  ς 11 , ς 22   və  u xy ‐nin əmsalı  2ξ x3 + 2ξ y2 = 0 ;  
ς 33  kəmiyyətlərini tapmaq lazımdır. Həmin  buradan  ξ x3 = −ξ y2  
ifadələri  tapmaq  üçün  yuxarıda  verilmiş 
ümumi  düsturlardan  istifadə  etməliyik.  (5)  tənliyindəki  u xx , u yy   ifadələrinin  əmsal‐
Hesablamalardan alınır ki,   ları  qruplaşdırıb  sıfıra  bərabər  etmək  üçün 
ς 11 = η tt + 2u tη ut + u ttη u + (u t ) η uu 2 əvvəlcə  utt ‐nin  əvəzinə  dalğa  tənliyindən 
istifadə edərək 
− 2u tx ξ t2 − u x ξ tt2 − 2u tt ξ t1 − u t ξ tt1 −  
utt = u xx + u yy  
− 2u ty ξ t3 − u y ξ tt3 ;
ς 22 = η xx + 2u xη ux + u xxη u + (u x ) 2 η uu − yazaq  və  alınan  ifadədə  u xx   və  u yy   əmsal‐
larını sıfıra bərabər qılaq: 
− 2u tx ξ x1 − u t ξ xx1 − 2u xx ξ x2 − u x ξ xx2 − 2u xy ξ x3 ;
ς 33 = η yy + u yy (η u − 2ξ y3 ) + u y (2η uy − ξ yy3 ) − u xx ‐nin əmsalı η u − 2ξ t1 − η u + 2ξ x2 = 0 ;  
buradan  ξ t1 = ξ x2  
− 2u ty ξ 1y − u t ξ 1yy − 2u xy ξ y2 − u xξ yy2 + (u y ) 2 η uu ;
ς 11 , ς 22   və  ς 33   kəmiyyətlərinin  bu  ifadə‐ u yy ‐nin əmsalı η u − 2ξ t1 − η u + 2ξ y3 = 0 ;  
lərini  tənliyin  invariantlıq  şərtində  yerinə  buradan  ξ t1 = ξ y3   (7) 
yazdıqdan sonra invariantlıq şərti aşağıda‐
kı şəkil alır:  və ya alarıq ki,  ξ t1 = ξ x2 = ξ y3 . 

Number 25, 2009    37
Ə.Q. Ağamalıyev 

Bundan  sonra  ut , u x , u y ‐in  əmsallarına  η = A( x, y, t )u + B( x, y, t )  


baxaq:  buradan η tu ,η xu və  η yu ‐nu tapaq. 
ut ‐in əmsalı  2η ut − 2ξ + ξ + ξ 1 1 1
= 0 
tt xx yy η tu = At ,η ux = Ax , η uy = Ay ilə  işarə  edək 
u x ‐in əmsalı  2η ux + ξ − ξ − ξ 2
tt
2
xx
2
yy = 0      (8)  və (8) düsturu ilə müqayisə etsək alırıq ki, 
u y ‐in əmsalı  2η uy + ξ − ξ − ξ 3 3 3
= 0 . 
tt xx yy
2 At = ξ tt1 − ξ xx1 − ξ yy
1

(u x ) 2 , (u y ) 2   və  (ut ) 2   əmsallarından  alınır  2 Ax = ξ xx2 − ξ yy2 − ξ tt2                  (9) 


ki, η uu = 0 .  2 Ay = ξ yy3 + ξ xx3 − ξ tt3
Sərbəst hədlərin əmsallarından isə 
Yuxarıda  aldığımız  ξ 1 , ξ 2   və  ξ 3   funksiya‐
η tt − η xx − η yy = 0  
larından  uyğun  törəmələri  alıb  (9)  düstu‐
tənliyini alırıq. 
runda yerinə yazsaq, 
Aldığımız (6), (7) və (8) tənliklərini birlikdə 
A = −c10 t + c11 ; A = −c8 x + c12   
həll  etsək  ξ i   və  η α   kəmiyyətlərini  tapa 
bilərik.  və  A = −c9 y + c13 . Buradan isə  
Alınan ifadələr göstərir ki,  ξ i  kəmiyyətləri  A = −(c8 x + c9 y + c10 t ) + c11   
x,  y,  t  dəyişənlərinin  kvadratik  funksiyala‐
rıdır.  Doğrudan  da,  aldığımız  ifadələrdən  və   η = −(c8 x + c9 y + c10t − c11u ) + B  
görünür ki,  
yaza  bilərik.  Bu    ifadələrə  daxil  olan 
ξ 2
xxx =ξ 3
xxy = −ξ 2
xyy = −ξ 1
yyt = ci (i = 1,2,...,11)  ifadələri ixtiyari sabitlər,  B  
= −ξ ytt
3
= −ξ xtt2 = −ξ xxt
1
= −ξ xxx
2 isə dalğa tənliyinin ixtiyari həllidir. 

yəni,  ξ 2   funksiyası  x  dəyişəninin  kvadra‐ ci   sabitlərinin  birini  vahidə,  qalanlarını  sı‐


tik funksiyasıdır. Analoji olaraq göstərir ki,  fıra  bərabər  götürməklə  ikiölçülü  dalğa 
ξ 2  funksiyası y və t‐nin də kvadratik funk‐ tənliyinin invariantlıq operatorlarının aşkar 
siyalarıdır.  şəklini aşağıdakı kimi yaza bilərik: 
∂ ∂ ∂ ; 
Hesablamalardan  alınır  ki,  (6),  (7)  və  (8)  X1 = , X2 = , X3 =
∂t ∂x ∂y
şərtlərini  ödəyən  kvadratik  ξ 1 , ξ 2   və  ξ 3  
funksiyaları   ∂ ∂ ∂ ∂ ∂
X4 = t +x +y ; X5 = x −y ;
∂t ∂x ∂y ∂y ∂x
ξ 1 = c3 + c6 x + c7 y + c 4 t + 2c8 xt +
∂ ∂ ∂ ∂
+ 2c9 yt + c10 ( x 2 + y 2 + t 2 ) X6 = x + t ; X7 = y + t ;
∂t ∂x ∂t ∂y
ξ 2 = c1 + c 4 x − c5 y + c6 t + c8 ( x 2 − y 2 + t 2 ) + ∂ ∂
X 8 = 2 xt + (x2 − y 2 + t 2 ) +
+ 2c9 xy + 2c10 xt ∂t ∂x
ξ 3 = c 2 + c5 x + c 4 y + c7 t + 2c8 xy + ∂ ∂
+ 2 xy − xu ;
+ c9 (− x 2 + y 2 + t 2 ) + 2c10 yt   ∂y ∂u  
şəklindədir.  ∂ ∂ ∂ ∂
X 9 = 2 yt + 2 xy + (− x 2 + y 2 + t 2 ) − yu ;
∂t ∂x ∂y ∂u
Bundan sonra  η  funksiyasının x, y, t dəyi‐
∂ ∂ ∂ ∂  
şənlərindən asılılığını tapaq:  η uu = 0  ifadə‐ X 10 = ( x 2 + y 2 + t 2 ) + 2 xt + 2 yt − tu ;
∂t ∂x ∂y ∂u
si  göstərir  ki,  η   funksiyası  u  dəyişəninin  ∂
X 11 =u .
xətti funksiyasıdır. Yəni  ∂u

38  Journal of Qafqaz University   
İkiölçülü Dalğa Tənliyinin Qrup Nəzəriyyəsi Metodu ilə Tədqiqi 

Bu  ifadələr  göstərir  ki,  ikiölçülü  dalğa  ƏDƏBİYYAT  


tənliyinin  invariantlıq  qrupu  11  parametrli  1.   Бoгoлюбoв  Н.Н.  и    Ширкoв  Д.В.  «Ввeдeниe  в 
kəsilməz  Li  qrupudur.  Bu  operatorlardan  тeoрию квaнтoвыx пoлeй». Мoсквa 1957, стр. 20.  
X 1   zamana  görə,  X 2   və  X 3   isə  x  və  y  2.   Aлфaрo В.Д., Фибини С. и др. «Тoки в физикe 
aдрoнoв», Мoсквa 1976, стр.90 
dəyişənlərinə  görə  sürüşmə  operatorları, 
3.   Нeтeр  Э.  «Инвaриaнтныe  вaриaциoнныe 
X 5 , X 6 , X 7   operatorları  üç  ölçülü  Lorents  зaдaчи»  –  В  сб.,  «Вaриaциoнныe  принципы 
qrupunun operatorları,  X 4  və  X 11  oxşarlıq  мexaники», Мoсквa 1959, стр.611‐630 

çevirməsi,  X 8 , X 9 , X 10   isə  konform  çevir‐ 4.   Oвсянникoв  Л.В.  «Группoвoй  aнaлиз  диффe‐
рeнциaльныx урaвнeний» Мoсквa 1978 
mənin operatorlarıdır.  5.   Ибрaгимoв  Н.X.  «Группы  прeoбрaзoвaний  в 
Qeyd etməliyəm ki, analoji məsələ «Elastik‐ мaтeмaтичeскoй физикe», Мoсквa 1983 

lik nəzəriyyəsi tənliyi» üçün mənim əvvəl‐ 6.   Ağamalıyev Ə.Q., Baxşıyeva M.R., «BDU‐nun xə‐


bərləri,  fizika‐riyaziyyat    elmləri  seriyası»,  2006, 
ki işimdə [6] həll edilmişdir.   №2, səh. 148 

Number 25, 2009    39
 
 
 
KOMPLEKS KONSANTRELERDEKİ BAKIR VE ÇİNKONUN 
SELEKTİF ÇÖZELTME İMKÂNLARI ÜZERİNE BİR ARAŞTIRMA 

Mustafa AKDAĞ 
Qafqaz Üniversitesi, Prof. Dr., Rektör Yrd. 
Bakü /AZERBAYCAN 
m_akdag@hotmail.com 

ÖZET 

Bakır,  çinko  ve  kurşun  metal  minerallerini  birlikte  içeren  konsantrelerin  üretimi  daha  pratik  ve  yaygındır. 
Ancak, bu tür konsantrelerde bulunan bu değerlerin metalürjik kazanımlarında zayiatlara ve çevre kirlenmesine 
sebep olan pirometalurjik proseslerden çok hidrometalürjik prosesler tercih edilmektedir. Bu nedenle bu araştır‐
mada  sülfürik  asitli  sulu  ortamda  selektif  çözeltme  tekniği  uygulanmış  ve  optimal şartlarda  bakırın %6.5  kada‐
rının çözünmesine karşılık çinkonun %98’e yakınının çözelti bünyesine alınması başarılmıştır. 
Anahtar kelimeler: Kompleks cevher, hidrometalürji, bakır‐çinko‐kurşun 

AN INVESTIGATION INTO THE SELECTIVE SOLUBILIZATION POSSIBILITIES OF  
COPPER AND ZINC BEARING BULK CONCENTRATES 

ABSTRACT 

A  bulk  concentrate  sample  had  been  dissolved  in  sulphate  solutions  with  function  of  time,  temperature, 
agitation  speed,  acid  concentration,  oxygen  pressure  and  pulp  density.  In  the  paper,  only  dissolution  result  is 
explained from the leaching programme. After three hours, dissolution of sample under the optimum conditions 
6.5% of copper and 98% of zinc recoveries are achieved. 
Key words: Complex ores, hydrometallurgy, copper‐zinc‐lead 

 
 
1. Giriş  söz  konusudur  [2,6].  Bu  tür  konsantreler‐
deki  metalik  değerlerin  kazanılması  yö‐
Cevher tenörlerinin günümüzde düşmeleri 
nünde  yapılan  ve  yapılmakta  olan  araştır‐
karşısında mevcut tesislerin konsantre üre‐
maların  yanı  sıra,  bunların  bir  kısmı  pilot 
tim kapasitelerini muhafaza etme bakımın‐
çapta uygulamaya sokulmuştur [7‐9]. 
dan yeni zenginleştirme alternatiflerinin ve 
buna  uygun  metalürjik  proseslerin  gelişti‐ Bu  araştırmada  Doğu  Karadeniz  Bölgesin‐
rilmesi  zorunlu  hale  gelmiştir.  Bunun  en  den  çıkarılan  cevherlerden  konsantre  ha‐
açık örneği, artık selektif konsantrelerin üre‐ line  getirilmiş  olan  bakır‐çinko‐kurşun  nu‐
tilmesi  ve  bunlardaki  metalik  değerlerin  muneleri  üzerinde  sulu  sülfürik  asitli  or‐
zayi edilmeden kazanılabilmesini esas alan  tamda çinkonun bakıra nispetle selektif ola‐
araştırmaların  yoğunluğudur[1‐5].  Türki‐ rak çözeltiye alınması üzerinde çalışılmıştır. 
ye’nin  özellikle  Doğu  Karadeniz  Bölgesin‐
de  yoğunlaşan  kompleks  cevherlerden  bir‐ 2. Deneysel Çalışma 
kaç  metali  birlikte  içeren  bulk  konsantre‐
2.1. Deneysel Çalışmaya Esas Olan Ön Bilgi: 
lerin  üretilmesinde,  selektif  konsantrelerin 
üretilmesine  nispeten  büyük  kolaylıklar,  Sulandırılmış sülfüric asitli ortamda  önem‐
verim  üstünlüğü  ve  ekonomik  avantajlar  li  bir  çinko  minerali  olan  sphalerite’in  çö‐

40  Journal of Qafqaz University
Kompleks Konsantrelerdeki Bakır ve Çinkonun Selektif Çözeltme İmkânları Üzerine Bir Araştırma 

zeltiye geçme mekanizması aşağıdaki şekil‐ Metal  içeriği  ve  tane  iriliği  dağılımı  Tablo 


de cereyan etmektedir[10,12,15,16] :  2.1 de verilen kompleks konsantreye ait X‐
ışınları  difraksiyonu  sonuçları  bu  konsan‐
ZnS+H2SO4 +½ O2 =ZnSO4 +H2O+S0,          (1) 
trenin temel olarak sphalerite, tedrahedrite, 
Ancak,  bu  esnada  (2)  nolu  reaksiyonla  galenite, pyrite ve quartz mineralleri ihtiva 
meydana  gelen  H2S  gazının  kısmi  basıncı  ettiğini ortaya koymuştur. 
sebebiyle 
Tablo 2.1. Deneylerde Kullanılan Kompleks Konsan‐
ZnS + H2SO4 = ZnSO4 + H2S                         (2) 
treye Aıt Analiz Sonuçları 
arzu edilen çözünme reaksiyonları yavaşla‐
Element 
yacağından dolayı, bu gazın (3) ve (4) reak‐ Analizi 
Zn      Cu      Pb       Fe       Cd         Ag      
siyonları yardımı ile ortamdan uzaklaştırıl‐ 29,.3    5,5     25,0     3,3       0,3      0,0025 
(%) 
ması gerekmektedir: 
Tane İriliği  Elek               Ağırlıkça               Ağır.  
  Açıklığı            Oranı              Kümülatif  
H2S + Fe2(SO4)3 = 2FeSO4 + H2SO4 + S ,      (3) 
0
                                                         Oranı 
FeSO4 + H2SO4 +1/2O2 = Fe2(SO4)3 + H2O,  (4)  (mm)                    (%)                      (%) 
Konsantrede mevcut olan tedrahedrite (Cu,  +0,300                   10,0                     10,0 
‐0,300+0,180           5,0                     15,0 
Fe,  Zn,  Ag)  12  Sb4S13)  in  sülfat  çözelti‐ ‐0,180+0,106           8,7                     23,7 
lerinde çözünme mekanizması ile ilgili bil‐ ‐0,106+0,045         19,8                     43,5 
giler  sınırlıdır.Bazı  bilgilere  göre  bu  mine‐ ‐0,045+0,000         56,5                   100,0   
ralin  çözünmesi  oldukça  zor,  bazı  bilgilere 
Deney  malzemesi  sıcaklığı  ayarlanabilen, 
göre ise pirit, sfalerit, galen ve kalkopiritin 
basınca  ve  kimyasal  korozyona  dayanıklı 
çözünmesinden daha kolaydır[4] . 
olan  ve  çalışırken  istenildiği  anda  analiz 
Sülfürlü  cevherlerin  temel  minerallerinden  numunelerinin  alınmasına  imkan  veren  ve 
olan pyrite sülfat çözeltilerinde çözünmeye  şekil  2.1’de  görülen  laboratuvar  ölçekli 
büyük bir direnç gösterir; bunun meydana  otoklav  içerisinde  çözeltme  deneylerine 
gelen  element  kükürdün  bir  tabaka  oluş‐ tabi tutulmuştur. 
turmasından  ve  piritin  elektrokimyasal 
özelliklerinden  kaynaklandığı  iddia  edil‐
mektedir.         İç basınç 
manometresi
FeS2+3/2O2+H2SO4 =Fe2(SO4)3 +3 H2O+S0,  (5) 
FeS2+7Fe2(SO4)3+8H2O=15FeSO4 +8H2O,    (6)          Nümune 
alma   
Kurşunun yaygın minerali olan  galenite’in  Yoğunlaştırıcı   
sülfürik asitli sulu ortamdaki davranışı ise,  Termokupl
katı artıkta yerini alacak olan PbSO4 bileşiği    
oluşumu şeklindedir:  Isıtıcı

PbS+H2SO4=PbSO4 +H2S,                              (7) 
Bazen  de  galenin  ferric  sülfat  ile  aşağıdaki 
reaksiyonu yaptığı bilinmektedir:  
Şekil 2.1. Çözeltme deneylerinin gerçekleştirildiği
PbS + Fe2(SO4)3 =PbSO4 +FeSO4  + S0,          (8)  otoklav düzeneği
2.2.Malzeme ve Metot:  Çözeltme ve numune alma hassasiyetleri göz 
Deneysel  çalışmalarda  Harşit‐Köprübaşı  önünde  bulundurularak  yapılan  deneyler‐
cevherlerinden flotasyon  yoluyla üretilmiş  de  kullanılan  parametreler  ve  kullanılma 
olan  kompleks  konsantre  kullanılmıştır.  aralıkları ayrıca Tablo 2.2’de verilmiştir. 

Number 25, 2009    41
Mustafa Akdağ 

Tablo 2.2.  Deneylerde Kullanılan Parametreler ve Kullanılma Aralıkları 

  Sıcaklık(0C)  Poksijen(atm.)  Asit(Stok.)  Karıştırma(d/d)  Katı(%)  


  60  110 130  150  5  10  15  20  1  1,5 3  4  400‐650‐ 900‐ 1200  5  15  30  60
Sıcaklık  x  x  x  x  x        x        x  x         
Poksijen  x        x  x  x  x  x        x  x                
Asit        x        x        x  x  x  x  x  x                 
Karıştırma     x        x        x        x     x     x     x  x                 
Katı         x        x        (1‐ 3‐6 ‐12) Stok  x  x    x    x    x

                       
Her  deney  için  öngörülen  malzeme  ve  çö‐ sıcaklığın  biraz  üzerinde  olduğu  söylene‐
zücü  hazırlandıktan  sonra  otoklava  yerleş‐ bilir. 
tirilmiş  ve  otoklav  içerisindeki  hava  saf 
oksijenle  dışarıya  süpürüldükten  sonra, 
yine o deney için öngörülen şartlara ulaşıl‐
dığı  an  deney  başlangıcı  kabul  edilmiştir. 
Deney  esnasında  30‐60‐90‐120‐150  ve  180. 
dakikalarda analiz numuneleri alınmıştır. 

3. Sonuçlar ve İrdelemeler 
3.1. Sıcaklığın Tesiri: 
Oksijen basıncının 5 atm., karıştırma hızının 
400 d/d,katı oranının %5 ve sülfürik asidin 
konsantredeki  bakır  ve  çinkonun  tamamı‐
nın  çözeltiye  geçmesine  yetecek  (stokio‐
metrik miktar) kadar kullanıldığı deneyler‐
de,  şekil  3.1’den  de  açıkça  görüldüğü  üze‐
re,  çözeltme  süresine  bağlı  olarak  bakır  ve 
çinkonun çözeltiye geçme miktarı (%si) art‐
makla birlikte, (1) çinkonun  bakıra nispetle 
daha açık bir farkla, daha yüksek oranlarda 
Şekil 3.1. Sıcaklığın bakır ve çinko çözünürlüğü
çözündüğü  (2)  yüksek  sıcaklıklara  doğru 
üzerinde etkisi 
çıkıldıkça bakırın çözünme veriminde düş‐
me,  çinkonun  çözünme veriminde  ise,  tam  3.2.Basıncın Tesiri: 
aksine,  artma  söz  konusudur.  Bu  iki  sebe‐
Sıcaklığın 600C, karıştırma hızının 400 d/d, 
bin,  iki  farklı  mineralin  farklı  çözünme 
katı  oranının  %5  ve  sülfürik  asitin  kon‐
mekanizmasından  ve  meydana  gelen  ele‐
santredeki  bakır  ve  çinkonun  tamamının 
ment  kükürt  tarafından  her  iki  mineralin 
çözeltiye  geçmesine  yetecek  (stokiometrik 
yüzeyinde  oluşturduğu  koruyucu  tabaka‐
miktar)kadar  kullanıldığı  deneylerde,  şekil 
nın  çözücü  difüzyonuna  gösterdiği  farklı 
3.2’de görüldüğü üzere, her iki metalin çö‐
direnç  özelliğinden  kaynaklandığı  sanıl‐
zünme  verimleri  oksijen  basıncı  ile  doğru 
maktadır [14] . 
orantılıdır.  Ancak,  şekil  3.2  ‘de  görüldüğü 
Araştırmada  hedeflenen  selektif  çözünme  üzere,  yine  çinko  minerali  olan  sphalerite 
amacını  sağlayan  optimal  sıcaklığın  1100C  ile  bakırı  bünyesinde  barındıran  tedrahed‐

42  Journal of Qafqaz University
Kompleks Konsantrelerdeki Bakır ve Çinkonun Selektif Çözeltme İmkânları Üzerine Bir Araştırma 

rite  minerali  arasında  oldukça  bariz  çö‐


zünme  farklılığı  göze  çarpmaktadır.  180 
dakikalık  çözeltme  süresi  esas  alındığında, 
5 atm. oksijen basıncında %10,8 olan bakır  

Şekil  3.3.  Sülfürik  asit  konsantrasyonunun  bakır  ve 


çinko çözünürlüğü üzerinde etkisi 

3.4. Karıştırma Hızının Tesiri: 
Sıcaklığın  600C,  oksijen  basıncının  5  atm., 
sülfürik asitin stokiometrik, katı oranının  
Şekil 3.2.  Oksijen basıncının bakır ve çinko çözünür‐
lüğü üzerinde etkisi 

çözünme verimi, basınç bu değerin 4 katına 
çıkarılmasına  rağmen  ancak  %22,9  olmuş‐
tur. Buna karşılık gelen çinko değerleri ise, 
aynı  sıraya göre %45,4 ve %85,3 tür. 

3.3.  Sülfürik Asit Konsantrasyonunun 
Tesiri: 
Oksijen  basıncının  5  atm,  sıcaklığın  600C, 
karıştırma hızının 400 d/d, katı oranının %5 
olarak kullanıldığı bu deney serisinde, şekil 
3.3’te  görüldüğü  üzere,  bakır  ve  çinkoya 
yetecek miktarın (stokiometrik miktar) çok 
üzerinde  asit  kullanmanın  faydası  yoktur. 
Hatta  fazla  asit  kullanmanın  bakır  çözü‐
nürlüğünü menfi yönde etkilediği de söyle‐
nebilir. Optimal sülfürik asit ihtiyacı olarak 
stokiometrik  miktarın  1,5‐2  katının  yeterli 
olduğu açıkça görülmektedir. Bu durumda 
bakır  çözünürlüğü  %11‐12,  çinko  çözünür‐ Şekil 3.4.  Karıştırma  hızının  bakır  ve  çinko  çö‐
lüğü ise % 54‐65 arasında olmaktadır.  zünürlüğü üzerinde etkisi 

Number 25, 2009    43
Mustafa Akdağ 

ise  %5  miktarında    kullanılarak  karıştırma  yetecek (stokiometrik) miktarlarda sülfürik 


hızının incelendiği deneylerden elde edilen  asit  kullanılmıştır.  Şekil  3.5’ten  de  açıkça 
sonuçlar  şekil  3.4  te  verilmiştir.  Bakır  ve  görülebildiği gibi, katı oranı arttıkça her iki 
çinko çözünürlüklerinin belli bir karıştırma  metalin çözünme verimleri belirgin şekilde 
hızına  kadar  (900  d/d)  karıştırma  hızı  artı‐ düşmektedir.  Sebebin,  buna  benzer  çalış‐
şına paralel olarak arttığı, 900 d/d’dan daha  maların  çoğunda,  tamamen  difüzyon  ve 
yüksek  karıştırma  hızlarının  çözünme  ve‐ kimyasal  karakter  taşıdığı  ihtimali  üzerin‐
rimleri üzerinde tesirli olmadığı tespit edil‐ de durulmuştur. Söz konusu şartlarda, tabiî 
miştir.  Optimal  olarak  kabul  edilen  bu  de‐ ki, en yüksek verimler bakır için %10,8, çin‐
ğerde, üç saatlik bir çözeltme sonunda, ba‐ ko  için  ise  %45,4  katı  oranının  en  düşük 
kır  ve  çinko  çözünürlükleri,  aynı  sıra  ile,  olduğu (%5) değerde elde edilmiştir. 
%18,5 ve %64,4 seviyesinde olmuştur. 
4.  Genel Değerlendirme ve Prensip 
3.5. Katı Oranının Tesiri:  Akım Şeması 
Oksijen  basıncının  5  atm,  sıcaklığın  600C,  Kompleks  konsantreleri  temsil  edebilecek 
karıştırma  hızının  400  d/d,  karıştırma  karakterde,  sanayiden  alınmış  olan  numu‐
hızının  400  d/d  seviyesinde  kullanılarak,  neler  üzerinde  laboratuvar  çapta  yapılan 
katı oranının bakır ve çinko çözünürlükleri  bu  hidrometalurjik  çalışma  sonuçları  bakır 
üzerindeki  etkilerinin  incelendiği  bu  ve çinkonun selektif şekilde çözeltiye alına‐
gruptaki  deneylerde,  katı  miktarına  yani  bileceğini göstermektedir. Elbette ki, bu ça‐
bakır ve çinkonun tam olarak çözünmesine   lışmaların  pilot  ölçekte  ve  tesis  paramet‐
relerine yakın şartlarda çalışılması ve buna 
uygun  fizibilite  değerlerinin  üzerinde  du‐
rulması gerekir. 
Laboratuvar  şartlarında,  ortaya  konmuş 
olan bütün değerler göz önüne alındığında 
en  yüksek  çözünürlük  değerleri  olan  %6‐7 
bakır  ve  %91‐98  çinko  rakamlarını  elde 
etmek  için otoklav ortamında 5 atm. Oksi‐
jen  basıncı,%5  katı,  stokiometrik  miktarda 
sülfürik asit ve 130‐1500C sıcaklık ortamın‐
da, %5 katı ile çözücünün 400d/d hızla ka‐
rıştırılması gerektiği ortaya konmuştur. 
Bu  durumda,  pilot  ölçekte  yapılacak  çalış‐
malar için aşağıdaki kademeler tavsiye edi‐
lebilir: 
• Bakır‐çinko‐kurşun  kompleks  konsan‐
tresi  önce  çinkonun  azami  şartlarda  çözel‐
tiye geçmesini sağlayacak şartlarda liç işle‐
mine tabi tutulur. Çözeltiye bir miktar geç‐
miş  olan  bakır  çökeltilir.  Çözeltideki  çinko 
elektroliz yöntemi ile kazanılır. 
• Katı  artıktaki  bakır  ikinci  bir  liç  kade‐
Şekil 3.5.  Katı  oranının  bakır  ve  çinko  çözünürlüğü  mesinde çözeltiye alınır ve klasik metotlar‐
üzerinde etkisi  dan herhangi birisi ile çözeltiden kazanılır. 

44  Journal of Qafqaz University   
Kompleks Konsantrelerdeki Bakır ve Çinkonun Selektif Çözeltme İmkânları Üzerine Bir Araştırma 

Geride kalan artık ise kurşun ve diğer eko‐ 7.  Jean, B.; Imperial Smelting Furnace of Penarroya 


Extractive  Metallurgy  of  Lead  and  Zinc,  Chapt. 
nomik  metal  değerleri  açısından  üçüncü 
22, S. 619‐48.  
kademede metalürjik işleme tabi tutulur. 
8.  Krusei,  P.R.;  Cymet  Process;  CIM  Bulletin,  66. 
734, 1973, 5.81‐87.  
KAYNAKLAR  9.  Kuhn,  M.C.;  Anacondaʹs  Arbiter  Process  for 
1.  Akdağ,  M.;  Kompleks  Bakır‐Kurşun‐Çinko  Kon‐ Copper,  Trans,  Can.  Inst.  Min.  Metall.,  1974,  5, 
santrelerinin  Oksijenli  Ortamda  Sülfürik  Asit‐ 745.  
Ferriksülfat  Çözücülerinde  Çözeltme  Olanakla‐ 10. Naboichenko,  5.;  Autoclave  Sülfürik  Acid 
rının Araştırılması. E.Ü.Mak. Fak. Doktora Çalış‐ Leaching  Of  Zn‐Cu,  İntermediate  Products, 
ması, 1979, İzmir.   Obtained  from  Flotation  of  Cu‐Zn  Ores;  Tsvetny 
2.   Aytekin, Y.; Doğu Karadeniz Bölgesindeki Bakır‐ Metally, S. 39‐43.  
Kurşun‐Çinko  Kompleks  Yataklarının  Cevher  11. Sapmaz,  S.;  Yavuzel,  I.  ve  Cingöz,  N.;  Türkiye 
Hazırlama  Yönünden  İncelenmesi,  TÜBİTAK‐ Madencilik  ve  Bilimsel  Teknik  Kongresi,  1973 
MAG‐284, 1979 Ankara.   Ankara, 5.607  
3.  Copper  Hydrometallurgy;  The  Third  Generation  12. Scott,  T.R.;  The  Catalyzed  Oxidation  of  Zinc 
Plants. Eng. Min. J., 176,6,1975, S. 104‐105.   Sulfide  under  Acid  Pressure  Leaching  Condi‐
4.   Çakır,  A.F.,‐Harşit‐Köprübaşı  Kompleks  Cu‐Pb‐ tions. Trams. of The Metall. Soc. Of AIME, V.242, 
Zn‐Sb‐Ag‐Cd  Cevher  Konsantresinin  Ferrik  Klo‐ Sept. 1968, S. 1815‐21.  
rür  Çözeltisinde  Liçi.  TMMOB,  3.  Ulusal  Meta‐ 13. The  KIVCET  Cylone  Smelting  Process  for  İmpure 
lurji Kongresi, 1979 Ankara, 5.103   Copper Concentrates. J.Of. Metals, July, 1976, S. 4‐5.  
5.  Dutrizac,  J.E.;  Ferric  İon  As  A  Leaching  Of  14.  Vizsolyi, A.; Copper and Elemental Sulphur from 
Sulphide Ores, Min. Sci., And End., Vol. 6, No.2,  Chalcopyrite by Pressure Leaching. J.Of. Metals, 
1974, 5.59‐101   Nov. 1967, S.52.  
6.   Haver, F.P. Ve M.H.Wong.; Recovering Elemental 
15.  Yoroslavtsev,  A.S.;  ‐A  Study  of  The  Autoclve 
Sulfur From Nonferrous Minerals. Ferric Chloride 
Leaching  of  Cu‐Zn  Concentrates  and  Interma‐
Leaching  of  Chalcopyrite  Concentrates.  U.S. 
diate  Concentration  Products.  The  Soviet  J.  of 
Bureau of Mines RI 7474, 1971, 5.20.  
Non‐Ferrous Metals, S. 43‐47. 
 
 

Number 25, 2009    45
 
 
 
ABOUT STRUCTURAL CHANGES IN POLYETHYLENE               
GLYCOL ‐ C4O6H4Na2 ‐ WATER TWO‐PHASE SYSTEM 

E.A. MASIMOV, H.F. ABBASOV, T.O. BAGIROV 
Baku State University,  
Institute for Physics Problems 
Baku / AZERBAIJAN 
hakimabbasov@yahoo.com 

ÖZET 
The  structural  changes  in  the  homogeneous  and  heterogeneous  regions  of  the  polyethylene  glycol  ‐ 
C4O6H4Na2‐ Н2O two‐phase system have been investigated by low frequency dielectric spectroscopy method. The 
influence  of  molecule  mass  and  concentrations  of  the  polymer  and  of  the  salt  on  the  dimension  of  water 
associates, occurring in the considered water solutions has been studied.  
Key words: polyethylene glycol, dispersion, relaxator. 

POLİETİLENQLİKOL ‐ C4O6H4Na2 ‐ Н2O İKİFAZALI SİSTEMİNDƏ  
STRUCTUR DƏYİŞİKLİKLƏRİ BARƏDƏ 

XÜLASƏ 
Polietilenqlikol  ‐  C4O6H4Na2  ‐  Н2O  ikifazalı  sistemin  homogen  və  heterogen  oblastlarında  struktur  dəyişik‐
likləri  aşağı  tezlikli  dielektrik  spektroskopiya  metodu  ilə  tədqiq  edilmişdir.  Polimerin  molekulyar  kütləsinin  və 
konsentrasiyasının, həmçinin, duzun konsentrasiyasının baxılan su məhlullarında mövcud olan su assosiatlarının 
ölçülərinə təsiri öyrənilmişdir. 
Açar sözlər: polietilenqlikol, dispersiya, relaksator. 
 

 
It is well known that the functional activity,  Cole‐Cole diagram for every water solution 
the  conformation  and  the  structure  of  and  it  was  determined  the  relaxation  time 
biological  objects  are  strongly  depend  on  corresponding to the relaxator, which reply 
the  thermodynamic  state  of  containing  for the dielectric losses. For estimate of the 
inside  them  water  [1].  Recently  in  our  radius  of  these  relaxators  it  was  used  the 
laboratory  it  was  obtained  the  two‐phase  following  formula,  on  the  assumption  of 
system  having  great  segregation  ability  in  spherical form of the associates [3]: 
comparison  with  the  polymer‐polymer 
two‐phase  systems:  water  solution  of  τ 0 kT
a=3  
polyethylene  glycol  (PEG)  with  the  salt  4πη
C4O6H4Na2.  1
Where  τ 0 = a relaxation time, k is the 
In this work dielectric behavior of both the  2πν 0
bottom  and  upper  phases  of  the  hetero‐ Boltzman  constant,  T  is  the  absolute 
geneous  and  homogeneous  regions  have 
temperature,   η  is the dynamic viscosity of 
been investigated by low frequency dielectric 
spectroscopy  [2].  It  was  constructed  the  solution and ν 0  is the relaxation frequency. 

46  Journal of Qafqaz University
About Structural Changes in Polyethylene Glycol ‐ C4O6H4Na2 ‐ Water Two‐Phase System 

The  investigated  water  solutions  were  water solutions decrease with increasing of 


placed  between  gold  electrodes  of  the  flat  the  electrolyte  concentrations  in  the  case 
capacitor  and  the  conductivity  and  the  when  the  other  parameters  are  constant 
capacity  of  these  solutions  were  measured  (fig. 4,5,6).  
at  room  temperature  (20о  С)  in  the 
To  explain  the  obtained  experimental 
frequency region 20‐200000 Hz [4].  
results  the  Schwartz  theory  of  α   disper‐
Fig.1  shows  the  dependences  of  the  sion  was  involved  [5].  Schwartz  uses 
relaxators radius on the polymer molecular  theories of electric double layers to describe 
mass  in  the  bottom  (1)  and  upper  (2)  the  measured  α   dispersion  of  suspension 
phases of the heterogeneous regions of the  particles. When an external field is applied, 
considered  water‐polymer  system.  As  the  system  will  be  polarized  since  the 
shown in this figure the relaxator radius no 
counter  ions  will  be  slightly  displaced 
depends  on  the  polymer  molecular  mass 
laterally  on  the  particle  surface.  This  will 
for the bottom phase (fig.1 c.1). This result 
lead  to  permittivity  dispersion  in  low 
can  be  explain  to  taking  into  account  that 
frequency. In this case the colloid  particles 
the bottom phase was richen with constant 
are  the  relaxators.  In  our  experiments  the 
concentration  of  the  salt  ( Csalt ≈ 8% ),  but 
observed dispersion is analogous with this 
for  any  molecular  mass  the  polymer 
α   dispersion  and  we  are  suggested  that 
concentration is negligible (CPEG~1%) in this 
the  relaxators  in  considered  case  are  the 
phase.  In  upper  phase  of  heterogeneous 
region  the  relaxator  radius  increases  with  water medium associates.  
increasing the polymer molecular mass, but  So  many  of  water  molecules  are  discon‐
it  is  necessary  to  note  that  in  this  case  the  nected  from  water  clusters  and  take  place 
increasing  of  the  molecular  mass  was  in  hydration  of  ions  by  increasing  the 
accompanied  by  decreasing  the  salt  electrolyte  concentration  (salts,  acids  etc.). 
concentration  and  this  factor  plays  an  Because  the  dimensions  of  water  clusters 
important  role  in  changes  of  the  relaxator 
decrease  with  increasing  the  concentration 
radius.  This  has  been  proved  by  special 
of KOH, NaOH and salt C4O6H4Na2    in the 
carried  out  experiments.  The  relaxator 
homogeny  region  of  the  two‐phase system 
dimension  not  depends  on  the  molecular 
also. The increasing of clusters dimensions 
mass  when  the  concentration  of  polymer 
(СPEG=12%)  and  salt  (0.1  mole/l  KOH)  are  with  increasing  of  the  polymer  concen‐
constant  (fig.2).  To  elucidate  the  influence  tration  of  the  other  unchanged  conditions 
of  polymer  concentration  on  the  structure  can be explained by the following way. The 
of polymer‐water solution the concentration  polymer  molecules  connect  with  water 
dependence  of  relaxator  radius  was  inves‐ clusters by hydrogen bounds and form the 
tigated  for  homogeny  region  of  PEG  with  complicated  water‐polymer  complex.  The 
NaOH  at  the  constant  polymer  molecular  number of the hydrogen bound centers (the 
mass  (M=3000)  and  at  the  constant  ending  oxygen  atoms)  no  changes  with 
electrolyte  concentration  (0.1  mole/l  increasing  of  the  polymer  molecular  mass. 
NaOH)  (fig.3)  As  shown  in  this  figure  the  The number of the ending oxygen atoms in 
increasing  of  polymer  concentration  leads  every molecule PEG is two and not depends 
to the increasing of relaxator dimension.   of the polymer molecular mass and increase 
It  was  established  that  the  dimension  of  proportionally  with  increasing  of  the 
relaxators  existing  in  different  considered  polymer concentration. 

Number 25, 2009    47
E.A. Masimov, H.F. Abbasov, T.O. Bagirov 

REFERENCES:  4. Masimov  E.A.,  Hasanov  Sh.Sh.,  Abbasov  H.F., 


Pashaev  B.A.,  Institute  of  Phisics  of  Azerbaijan 
1. Wolkanstain  M.V.  ʺBiofizikaʺ,  М.,  Nauka,  1988,  National Academy  of  Science,  «Fizika»,  2006,  12, 
p.591   № 3, p. 11‐14 
2. Krupka J. and Geyer G., Loss‐angle measurement,  5. Schwartr  G.  “A  theory  of  the  low  frequency 
Wiley Encyclopedia of  Electrical and Electronics  dispersion  of  colloid  particles  in  electrolyte 
Engineering Online, Wiley, New York, 1999  solution”, J.Phys. Chem., 1962, 66, 2636‐2642 
3. Skanavi  G.I.  Fizika  dielektrikov.  part  1.  1949. 
Moskow‐Leningrad.  
 
Relaxator radius, nm

2 45

Relaxator radius, nm
50

30 1 35

10
0 10000 20000 30000 40000 25
8 10 12 14 16
Molecular mass of PEG
  Concentration , %
Fig. 1.  The  dependences  of  the  relaxator  radius  on  Fig. 4.   The  dependence  of  the  relaxator 
the  molecular  mass  of  PEG  in  the  hetero‐ radius  on  the  concentration  of  the  salt 
geneous region of the two‐phase system PEG‐  C4O6H4Na2.  in  the  case  of  constant  relative 
C4O6H4Na2.– H2O; 1 ‐ bottom phase, 2 ‐ upper  molecular  mass  of  the  PEG  (M=3000)  in  the 
phase  homogeny  region  of  the  two‐phase  system 
  PEG‐ C4O6H4Na2.– H2O 
Relaxator radius, nm

60 60
Relaxator radius, nm

40 40
20
20
0
0 10000 20000 30000 40000 0
0 0.2 0.4 0.6
Molecular mass of PEG
  Concentration of KOH, mol/l
Fig. 2.  The dependence of the relaxator radius on the   
relative  molecular  mass  of  PEG  for  the  Fig. 5.  The dependence of the relaxator radius on the 
system 12% PEG – Н2О ‐ 0.1mol/l KOH   concentration  of  KOH  for  the  system  Н2О  – 
  KOH 
Relaxator radius, nm

250.46
Relaxator radius, nm

60 187.85
125.23
62.62
0.00
40
0 0.2 0.4 0.6
0 2 4
Concetration of NaOH, mol/l
Concentration of PEG, %  
Fig. 3.  The dependence of the relaxator radius on the  Fig. 6.   The  dependence  of  the  relaxator 
concentration  of  PEG  for  the  system  PEG  radius  on  the  concentration of  NaOH  for  the 
3000 – Н2О ‐ 0.1mol/l NaOH   system Н2О ‐ NaOH 

48  Journal of Qafqaz University   
 
 
 
HEPTAPEPTİD MOLEKULUNUN NƏZƏRİ                      
KONFORMASİYA ANALİZİ 

N.A. ƏHMƏDOV, R.M. ABBASLI, E.M.HƏSƏNOV 
Bakı Dövlət Universiteti,  
Fizika Problemləri İnstitutu 
Bakı / AZƏRBAYCAN 
namig.49@bk.ru 

XÜLASƏ 
Nəzəri  konformasiya  analizi  üsulu  ilə  kardiofəal  peptidlər  fəsiləsinə  daxil  olan  Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐
Arg6‐Phe7‐NH2 heptapeptid molekulunun fəza quruluşu tədqiq edilmişdir. Hesablamalar nəticəsində müəyyən 
edilmişdir ki, heptapeptid molekulun fəza quruluşu əsas zəncirin 12 formasının stabil konformasiyaları ilə tərən‐
nüm olunur. 
Açar sözlər: konformasiya, struktur, peptid, kardiofəal, molekul. 

SPATIAL STRUCTURE OF THE HEPTAPEPTIDE MOLECULE 

ABSTRACT 
The  spatial  structure  of  the  cardioactive  heptapeptide  molecule  Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2 
has  been  investigated  using  theoretical  conformational  analysis.  Conformational  fragmental  analysis  indicates 
that the spatial structure of this molecule can be described by set of 12 stable backbone forms. 
Key words: conformational analysis, spatial structure, peptide, cardioactive, molecule. 
 
 
Peptid  molekullarının  yerinə  yetirdikləri  gen rabitəsi enerjisinin cəmi şəklində seçil‐
funksiyalar onların fəza quruluşları ilə əla‐ mişdir.  Qeyri‐valent  qarşılıqlı  təsir  enerjisi 
qədardır.  Onların  yerinə  yetirdikləri  funk‐ Lennard‐Cons  potensialı  ilə  Skott  və  Şera‐
siyaları  başa  düşmək  üçün,  quruluş‐funk‐ qanin  təklif  etdiyi  parametrlərlə  hesablan‐
siya əlaqələrinin öyrənilməsi üçün fəza qu‐ mişdır  [9].  Molekulun  konformasiya  im‐
ruluşlarının öyrənilməsi zəruridir. Bir necə  kanları  su  mühitində  öyrənilmişdir  [10]. 
müddətdir  ki,  kardiofəal  peptidləri  quru‐ Hidrogen  rabitəsinin enerjisi Morze poten‐
luş‐funksiya  əlaqələri  tədqiq  edilir  [1‐8].  sialı  ilə  hesablanmışdır  [11].  Torsion  qarşı‐
Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2  lıqlı  təsir  enerjilərini  hesablamaq  üçün  po‐
heptapeptid  molekulu  kardiofəal  peptidlər  tensial funksiyalar, atomlardakı parsial yük‐
fəsiləsinə  daxildir  və  aparılan  elmi  işlərin  lərin  qiymətləri,  valent  bucaqlarının  qiy‐
davamıdır.  mətləri  və  valent  rabitələrinin  uzunluqları 
Momani  və  Şeraqanın  məqaləsindən  götü‐
Heptapeptid  Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐
rülmüşdür  [12].  İkiüzlü  fırlanma  bucaqla‐
Arg6‐Phe7‐NH2  molekulunun  fəza  quru‐
rının işarələri və  qiymətləri beynəlxalq no‐
luşu  nəzəri  konformasiya  analizi  metodu 
menklaturaya uyğundur [13]. 
ilə  tədqiq  edilmişdir.  Molekulun  fəza  qu‐
ruluşunu  öyrənmək  üçün  sistemin  poten‐ Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2 
sial  enerjisi  qeyri‐valent,  elektrostatik,  tor‐ heptapeptid  molekulunun  fəza  quruluşu 
sion  qarşılıqlı  təsir  enerjilərinin  və  hidro‐ onu  fragmentlərə  ayırmaqla  öyrənilmişdir. 

Number 25, 2009    49
N.A. Əhmədov, R.M. Abbaslı, E.M.Həsənov 

İlkin  mərhələdə  molekulun  N‐tərəf  Ala1‐ cədvəl 3‐də, onlarda aminturşu qalıqlarının 


Gln2‐Thr3‐Phe4 tetrapeptid və C‐tərəf Phe4‐ fəzada  yerləşməsi  isə  şəkil  1‐də  göstəril‐
Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2 tetrapeptid fragment‐ mişdir. 
lərinin fəza quruluşları onları əmələ gətirən 
Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2 
aminturşu  qalıqlarının  stabil  konforma‐
molekulun  RB211B22B3B1B3322B3  və 
siyaları  əsasında  hesablanmışdır.  Hesabla‐
RB211R12B1B1B3322R3 konformasiyalarının nis‐
maların nəticələri göstərir ki, yalnız konfor‐
bi  enerjiləri  0  kkal/mol‐dur.  Göründüyü 
masiyaların enerjilərinə görə diferensiasiya 
kimi bu konformasiyalar bir‐birindən üçün‐
gedir.  Ona  görə  də  tetrapeptid  fraqment 
cü  amin  turşusu  Thr3‐ün  əsas  zəncirinin 
ücün  mümkün  ola  bilən  bütün  səkkiz  şey‐
formasına, üçüncü və dördüncü aminturşu 
pin  konformasiyaları  heptapeptid  Ala1‐
qalıqlarının  yan  zəncirlərinin  vəziyətlərinə 
Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2  mo‐
görə fərqlənirlər. Cədvəl 2‐dən göründüyü 
lekulunun  fəza  quruluşunu  hesablamaq 
kimi bu konformasiyalarda dördüncü feni‐
ücün  seçilmişdir.  Başlangıç  konformasiya‐
lalanin Thr2 və Arg6 ilə qarşılıqlı təsiri bir‐
lar  qeyd  olunduğu  kimi  seçildikdə  ilkin 
birindən fərqlənir. 
mərhələdə  200‐dən  çox  konformasiya  he‐
sablanmışlır.  Heptapeptid  molekulun  fəza  RB211B22B3B1B3322B3  konformasiyasının  sta‐
quruluşunun  tədqiqi  göstərir  ki,  şeyplərin,  billəşməsinə Ala1 digər aminturşu qalıqları 
əsas  zəncirin  formalarının  və  konformasi‐ ilə  qarşılıqlı  təsir  enerjisi  (‐1.8  kkal/mol), 
yaların  enerjilərinə  görə  kəskin  diferensia‐ Gln2 digər aminturşu qalıqları ilə qarşılıqlı 
siya  gedir.  Hesablamalar  göstərir  ki,  0‐7,0  təsir  enerjisi  (‐7.3)  kkal/mol,  Thr3  ‐  (‐3.4) 
kkal/mol enerji intervalına əsas zəncirin 12  kkal/mol,  Phe4  ‐  (‐5.5)  kkal/mol,  Val5  ‐  (‐
formasının konformasiyaları düşür. Həmin  5.1) kkal/mol qədər pay verir (cədvəl 2). 
konformasiyaların  şeypləri,  əsas  zəncirin  RB211B12R3B1R2122R3  konformasiyasının  nisbi 
formaları,  ümumi  enerjiyə  qeyri‐valent,  enerjisi  1.3  kkal/mol‐dur.  Bu  konformasi‐
elektrostatik, torsion qarşılıqlı təsir enerjilə‐ yaya  Thr3‐Val5  arasındakı  qarşılıqlı  təsir   
rinin  verdikləri  pay,  ümumi  və  nisbi  ener‐ (‐2.7) kkal/mol, Thr3‐Arg6 ‐ (‐1.2) kkal/mol, 
jiləri  cədvəl  1‐də  göstərilmişdir.  Cədvəl  1‐ Arg6‐Phe7  –  (‐5.6)  kkal/mol  qədər  ümumi 
dən  göründüyü  kimi  stabil  konformasiya‐ enerjiyə pay verərək onu stabil etmişdir. 
lara  qeyri‐valent  qarşılıqlı  təsir  enerjisinin 
Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2 
verdiyi  pay  (‐31.1)  –  (‐24.6)  kkal/mol,  elek‐
molekulunun  cədvəl  1‐də  göstərilən  stabil 
trostatik  qarşılıqlı  təsir  enerjisinin  verdiyi 
konformasiyalarının  əksəriyyətində  amin‐
pay 9.2‐7.5 kkal/mol, torsion qarşılıqlı təsir 
turşu  qalıqları  əsas  zəncirin  B  formasında‐
enerjisinin  verdiyi  pay  isə  7.5‐3.0  kkal/mol 
dır.  Buna  səbəb  molekulu  əmələ  gətirən 
enerji intervalında dəyişir. 
yeddi aminturşu qalığından ikisinin Thr və 
Cədvəl 2‐də   Val  olmasıdır.  Məlum  olduğu  kimi  bu 
Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2   aminturşu qalıqlarının R və B formalarının 
molekulun   alçaqenerjili oblastları alanin tip amin turşu 
RB211B22B3B1B3322B3 (Unis=0 kkal/mol),  qalıqlarının  alçaqenerjili  oblastlarından 
RB211 R22B1B1B3322B3 (Unis=0 kkal/mol),  xeyli  azdır.  Buna  görə  də  Thr  və  Val  çox 
BB211B12R3B1R2122R3 (Unis=1.3 kkal/mol)   vaxt  sterik  cəhətdən  spiralvari  quruluşları 
əmələ qətirə bilmirlər. 
konformasiyalarında  aminturşu  qalıqları 
daxilində  və  arasında  qarşılıqlı  təsir  ener‐ Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2 
jiləri cədvəl 2‐də, həmin konformasiyalarda  molekulunun  cədvəl  1‐də  göstərilən  stabil 
ikiüzlü  fırlanma  bucaqlarının  qiymətləri  konformasiyalarından yalnız birində ‐ nisbi 

50  Journal of Qafqaz University   
Heptapeptid Molekulunun Nəzəri Konformasiya Analizi 

enerjisi  2.1  kkal/mol  olan  RR211  R12  B1  R1  və  mütəhərrikliyinə  malik  olduğunu  söy‐
R3222R2 konformasiyasında dördüncu amin‐ ləmək olmaz. 
turşu  qalığı  fenilalanində  başqa  digərləri  Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2 
əsas zəncirin R formasındadırlar. 
molekulunun  fəza  quruluşunun  öyrənil‐
Heptapeptid  molekulun  N‐  və  C‐tərəf  tri‐ məsi  göstərir  ki,  molekul  elə  fəza  quruluş‐
peptid fraqmentləri yeddi şeyplə tərənnüm  ları yığımına malik olur ki, o müxtəlif bio‐
olunmuşdur. Ona görə də molekulun hansı  loji funksiyaları yerinə yetirə bilər. 
hissəsinin daha çox konformasiya şərtliyinə 
 
 
Cədvəl 1. Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2 molekulunun stabil konformasiyaları (enerjilər kkal/mol‐la) 

N  Şeyp  Konformasiya  Uqv  Uel  Utor  Uüm  Unis 


1  f f e e f f  RR211B32B1R1R3222R3  ‐26.6  8.0  4.9  ‐13.8  3.9 
2  e e e e e e  BB211B12B3B1B3322B3  ‐26.0  7.9  4.9  ‐13.2  4.5 
3  e e e e e f  BB211B12B3B1R2122R3  ‐26.7  7.5  3.0  ‐16.3  1.4 
4  e e e f e f  BB211B12B3B1R2122R3  ‐27.7  7.8  3.5  ‐16.4  1.3 
5  f e e e f f  RB211B12B3R1R3222R2  ‐28.6  8.5  3.8  ‐16.2  1.5 
6  f e e e e e  RB211B22B3B1B3322B3  ‐29.5  7.9  3.9  ‐17.7  0 
7  f e e f f f  RB211B32R3R1R2122R3  ‐26.8  9.2  5.9  ‐11.8  5.9 
8  e f e e e e  BR231B32B1B1B3322B3  ‐27.2  8.1  6.5  ‐12.6  5.1 
9  f f f e f f  RR211R12B1R1R3222R2  ‐31.1  8.1  7.5  ‐15.6  2.1 
10  f e f e e e  RB211R12B1B1B3322B3  ‐29.4  7.5  4.2  ‐17.7  0 
11  f e f e e e  RB211R12B1B1R2122R2  ‐24.6  7.7  5.6  ‐11.4  6.3 
12  e e f e e e  BB311R32B3B1B3322B3  ‐27.7  7.7  5.4  ‐14.7  3.0 

 
Cədvəl  2.  Ala2‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2  molekulunun  RB211B22B3B1B3322B3  (Unis=0  kkal/mol,  1  sətr), 
RB211R12B1B1B3322B3 (Unis=0 kkal/mol, 2sətr), RB211B12R3B1R2122R3 (Unis=1,3 kkal/mol, 3 sətr) konformasiya‐
larında aminturşu qalıqları arasında və daxilində qarşılıqlı təsir enerjiləri 

Ala1  Gln2  Thr3  Phe4  Val5  Arg6  Phe7   


2.7  ‐1.2  ‐0.4  ‐0.2  0  1.3  0  Ala1 
2.8  ‐1.1  ‐0.6  ‐0.1  0  1.0  ‐0.1 
2.6  ‐1.4  ‐0.4  ‐0.1  0  1.2  0 
  ‐0.4  ‐3.4  ‐3.9  0  0  0  Gln2 
‐0.2  ‐3.3  ‐3.1  ‐1.8  0  0 
‐0.4  ‐3.7  ‐0.5  ‐0.1  0.1  0 
      0.8  ‐2.9  ‐0.5  0  0  Thr3 
 0  ‐2.8  ‐0.4  0  0 
  0.6  ‐1.5  ‐2.7  ‐1.2  ‐0.1 
       0  ‐1.6  ‐3.9  0  Phe4 
  0.1  ‐1.7  ‐3.0  0 
  0.2  ‐1.6  ‐0.3  0 
        1.6  ‐2.1  ‐3.0  Val5 
2.6  ‐2.1  ‐3.3 
0.8  ‐1.5  ‐2.0 
            0.2  ‐1.9  Arg6 
 0  ‐2.0 
  0.6  ‐5.6 
            ‐2.7  Phe7 
‐2.7 
‐2.7 

Number 25, 2009    51
N.A. Əhmədov, R.M. Abbaslı, E.M.Həsənov 

Cədvəl 3.  Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2 molekulunun stabil konformasiyalarının həndəsi parametr‐
ləri (ikiüzlü fırlanma bucaqlarının qiymətləri φ,ψ,ώ,χ11, χ12, ardıcıllığı ilə dərəcələrlə verilmişdir). 

Amin  RB211 B22B3B1B3322B3  RB211R12B1B1B3322B3  BB211B12R3B1R2122R3 


turşusu 
Ala1  ‐60        ‐68     179    ‐64     ‐69     ‐179    ‐57     151      179 
 173   173   180 

Gln2  ‐142     139     180    ‐99    140      180  ‐141     139     ‐178 


 180       60       78    179     59        76   180       59        76 
Thr3    ‐92     142     179    ‐87     ‐62      179    ‐97     147      178 
 177     176     55    180      176     60    ‐179       171 

Phe4  ‐137     157    174  ‐117    144     ‐176    ‐62      ‐44       179 


  ‐58       97     55      85    ‐62     103 

Val5  ‐128    127   ‐175  ‐117    130    ‐177  ‐132     149      179 


 105    174   ‐178     96    173    ‐176   114     175     ‐179 

Arg6  ‐120    118     180  ‐120    118     ‐174    ‐75      ‐52     ‐179 


  ‐49     ‐65    179    ‐54     ‐68     ‐171   176        61      174 
‐178  ‐179   179 

Phe7  ‐108    140     180  ‐107    140      180  ‐115      ‐53      179 


  ‐55      93    ‐55      92    ‐54     105 

E nisbi  0  0  1,3 
 
 
 

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

   
Şəkil 1.  Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2  Şəkil 2.  Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2 
molekulunun stabil konformasiası   molekulunun stabil konformasiası  
RB211 B22B3B1B3322B3  (Unis=0 kkal/mol)  RB211 R22B1B1B3322B3 (Unis=0 kkal/mol) 

52  Journal of Qafqaz University   
Heptapeptid Molekulunun Nəzəri Konformasiya Analizi 

11. Попов  Е.М.,  Дашевский  В.Г.,  Липкинд  Г.М., 


Архипова  С.Ф.  //  Молекулярная  биология 
1968, т.2, с.612‐620. 
12. Momany  F.A.,  Mc  Guire  R.F.,  Burgess  A.W., 
Scheraga  H.A.  //  J.  Phys.Chem.,  1975,  v.79, 
p.2361‐2381. 
13. IUPAC‐IUB  Commission  on  Biochemical 
Nomenclature // Biochem. et Biophys. Acta, 1971, 
v.229, p. 1‐17. 
 

 
Şəkil 3.  Ala1‐Gln2‐Thr3‐Phe4‐Val5‐Arg6‐Phe7‐NH2 
molekulunun stabil konformasiası 
BB211B12R3B1R2122R3 (Unis=1.3 kkal/mol) 
 
 
 
ƏDƏBİYYAT 

1. Исмаилова Л.И., Ахмедов Н.А., Ахмедова С.Р. 
// Биофизика, 1997, т.42, Вып.4, с.796‐805. 
2. Исмаилова Л.И., Ахмедов Н.А., Ахмедова С.Р. 
// Биофизика, 2007, т.52, Вып.6, с.1141‐1147. 
3. Исмаилова Л.И., Ахмедов Н.А., Ахмедова С.Р. 
// Биофизика, 2008, т.53, Вып.1, с.14‐21. 
4. Akhmedov  N.A.,  Tagiyev  Z.H.,  Hasanov  E.M., 
Akverdieva  G.A.    J.  Molecular  Structure,  2003, 
v.646, p.75‐80. 
5. Ахмедов Н.А., Исмаилова А.И., Аббаслы Р.М., 
Ахмедов Н.Ф., Годжаев Н.М. Биоорган. химия, 
2005, т.31, №1, с.31‐38. 
6. Исмаилова Л.И., Ахмедов Н.А., Аббаслы Р.М., 
Годжаев  Н.М.  Биоорган.химия,  2005,  т.31,  №2, 
с.140‐146. 
7. Hacıyeva  Ş.,  Əhmədov  N.,  Abbaslı  R.  Qafqaz 
Universiteti Jurnalı, 2007, №9, s.95‐99. 
8. Исмаилова  Л.И.,  Ахмедов  Н.А.,  Аббаслы  Р.М. 
//Биофизика, 2008,т.53,вып.1,с.14‐21. 
9. Skott  R.A.,  Sheraga  H.A.  //  Chem.  Phys.,  1966, 
v.45, p.2091. 
10. Липкинд  Г.М.,  Архипова  С.Ф.,  Попов  Е.М. 
//Журнал структурной химии, 1970, т.11, с.121‐
126. 

Number 25, 2009    53
 
 
 
SER‐PRO‐LEU‐GLY‐THR‐MET‐ARG‐PHE‐NH2                        
MOLEKULUNUN FƏZA QURULUŞU 

N.A.ƏHMƏDOV, R.M.ABBASLI, İ.T.MƏMMƏDOVA, Ş.N.HACIYEVA 
Bakı Dövlət Universiteti,  
Fizika Problemləri İnstitutu 
Bakı / AZƏRBAYCAN 
namig.49@bk.ru 

XÜLASƏ 
Kardiofəal Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2  oktapeptid molekulunun fəza quruluşu nəzəri  konforma‐
siya  analizi  üsulu  ilə  tədqiq  edilmişdir.  Molekulun  fəza  quruluşu  onu  fraqmentlərə  ayırmaqla  öyrənilmiş  və 
hesablamalar nəticəsində müəyyən edilmişdir ki, oktapeptid molekulun fəza quruluşu əsas zəncirin 12 forması‐
nın stabil konformasiyaları ilə tərənnüm olunur. 
Açar sözlər: molekul, peptid, kardiofəal, quruluş, konformasiya analizi. 

SPATIAL STRUCTURE OF THE MOLECULE  
SER‐PRO‐LEU‐GLY‐THR‐MET‐ARG‐PHE‐NH2 

ABSTRACT 
The  spatial  structure  of  the  octapeptide  molecule  Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2  were  investigated 
using  theoretical  conformational  analysis.  It  is  revealed  that  spatial  structure  of  each  molecule  can  exist  in  12 
stable backbone forms. 
Key words: molecule, peptide, cardioactive, structure, conformational analysis. 

 
 
Peptid  hormonları  canlı  orqanizmlərdə  sistemin potensial enerjisi qeyri‐valent, elek‐
müxtəlif  bioloji  funksiyaları  yerinə  yetirir‐ trostatik, torsion qarşılıqlı təsir enerjilərinin 
lər. Onların  yerinə  yetirdikləri funksiyaları  və  hidrogen  rabitəsi  enerjisinin  cəmi  şək‐
başa  düşmək  üçün  molekulların  üçölçülü  lində seçilmişdir. Potensial funksiyalar, isti‐
fəza  quruluşlarını  atom  səviyyəsində  təyin  fadədilən  işarələr  əvvəlki  məqalələrdə  ol‐
etmək lazımdır.  duğu kimi seçilmişdir. İkiüzlü fırlanma bu‐
caqlarının  qiymətləri  Beynəlxalq  nomenk‐
Kardiofəal  peptidlər  əsasən  orqanizmlərin 
laturaya uyğundur [9]. 
ürək fəaliyyətinin düzgün rejimini  tənzim‐
ləyir.  Bir  çox  orqanizmlərdən  kardiofəal  Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2 mo‐
peptidlər ayrılmış, onların analoqları sintez  lekulunun fəza quruluşu onu fraqmentlərə 
edilmiş, yerinə yetirdikləri funksiyaları öy‐ ayırmaqla  öyrənilmişdir.  İlkin  mərhələdə 
rənilmişdir [1‐3].  N‐tərəf    Ser1‐Thr5  pentapeptid  və  C‐tərəf 
tetrapeptid  fraqmentlərinin  fəza  quruluş‐
Kardiofəal  peptidlərin  quruluş‐funksiya 
ları  onları  əmələ  gətirən  uyğun  aminturşu 
əlaqələri  çoxdandır  ki,tədqiq  olunur  və  bu 
qalıqlarının  stabil  konformasiyaları  əsasın‐
iş də həmin tədqiqatların davamıdır [4‐8]. 
da  hesablanmışdır.  İkinci  mərhələdə  okta‐
Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2 mo‐ peptid  Ser1‐Phe8‐NH2  molekulun  fəza  qu‐
lekulunun fəza quruluşunu öyrənmək üçün  ruluşu  N‐tərəf  pentapeptid  və  C‐tərəf  tet‐

54  Journal of Qafqaz University
Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐Nh2 Molekulunun Fəza Quruluşu 

rapeptid  molekulların  stabil  konformasi‐ həm  də  elektrostatik  qarşılıqlı  təsir  ener‐
yaları  əsasında  öyrənilmişdir.  İlk  mərhələ‐ jilərinə  görə  əlverişlidir.  Cədvəl  1‐dən  gö‐
də oktapeptid molekulun yüzdən çox kon‐ ründüyü  kimi  qeyri‐valent  qarşılıqlı  təsir 
formasiyası  hesablanmışdır.  Hesablanmış  enerjisi  ümumi  enerjiyə  (‐42.7)  kkal/mol, 
konformasiyaların  bir  hissəsi  yüksəkener‐ elektrostatik  qarşılıqlı  təsir  enerjisi  (5.7) 
jili, bir hissəsi isə sterik cəhətdən mümkün  kkal/mol  qədər  pay  verir.  Bu  konformasi‐
olmamışdır.İkinci mərhələdə nisbi enrjisi 0‐ yada  Ser1‐in  yan  zəncirindəki  O  atomu  ilə 
20.0  kkal/mol  intervalına  düşən  konforma‐ Gly4‐ün əsas zəncirindəki H atomu arasın‐
siyalar  seçilmiş  və  yenidən  daha  kiçik  ad‐ dakı  məsafə  0.2nm,  Ser1‐in  əsas  zəncirin‐
dımlarla  enerjinin  qiyməti  minumumlaş‐ dəki O atomu ilə Thr5‐in əsas zəncirindəki 
dırılmışdır.  H  atomu  arasındakı  məsafə  0.19nm,  Pro2‐
nin əsas zəncirindəki O atomu ilə Met6‐nın 
Hesablamaların nəticələri göstərir ki, 0‐10.0  əsas  zəncirindəki  H  atomu  arasındakı  mə‐
kkal/mol enerji intervalına Ser‐Pro‐Leu‐Gly  safə  0.18nm‐dir.Ona  görə  bu  atomlar  ara‐
‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2  molekulunun  12  sında  hidrogen  rabitəsi  yaranmışdır  və 
konformasiyası  düşür.  Həmin  stabil  kon‐ molekulun quruluşunu stabilləşdirmişdir. 
formasiyalar,  onlara  qeyri‐valent,  elektro‐
statik,  torsion  qarşılıqlı  təsir  enerjilərinin  Qlobal  konformasiyanın  stabilləşməsinə 
verdikləri  pay,  ümumi  və  nisbi  enerjiləri  Ser1‐in  digər  aminturşu  qalıqları  ilə  qarşı‐
cədvəl  1‐də  göstərilmişdir.  Cədvəl  2‐də  lıqlı  təsir  enerjisi  (‐10.7)  kkal/mol,  Pro2           
Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2  (‐9.0)  kkal/mol,  Leu3  (‐7.9)  kkal/mol,  Met6 
molekulunun  üç  ən  stabil  konformasiya‐ (‐7.1) kkal/mol qədər pay verir (cədvəl 2). 
sında  aminturşu  qalıqları  arasında  və  da‐ Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2  mo‐
xilində  qarşılıqlı  təsir  enerjiləri,  cədvəl3‐də  lekulunun  ikinci  stabil  konformasiyası  2.5 
isə həmin konformasiyaların həndəsi para‐ kkal/mol  nisbi  enerjili  B1BB32RR3B222B3322B3. 
metrləri  göstərilmişdir.  Şəkil1‐də  moleku‐ Bu  konformasiyada  N‐tərəf  tripeptid  fraq‐
lun iki stabil konformasiyasında aminturşu  mentin əsas zəncirinin forması  qlobal  kon‐
qalıqlarının  fəzada  yerləşməsi  göstərilmiş‐ formasiyanın  əsas  zəncirinin  formasından 
dir.  Cədvəl  1‐dən  göründüyü  kimi  okta‐ fərqlənir, C‐tərəf pentapeptid fraqmentin ‐ 
peptid  molekulun  stabilləşməsinə  qeyri‐
valent qarşılıqlı təsir enerjisinin verdiyi pay  Cədvəl 1.  Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2 
molekulunun stabil konformasiyaları 
(‐42.7) – (‐32.0) kkal/mol enerji intervalında, 
elektrostatik  qarşılıqlı  təsir  enerjisinin  ver‐ № Konformasiya  Uqv  Uel  Utors  Uum Unis
diyi pay (5.6) – (11.0) kkal/mol enerji inter‐ 1 B1RR31RR3B222B3322B3 ‐42.7  5.7  4.9  ‐32.1 0 
valında,  torsion  qarşılıqlı  təsir  enerjisinin  2 B1RR11RR1R122R3222R2 ‐42.3  7.3  7.7  ‐27.4 4.7
verdiyi  pay  (3.3)  –  (7.7)  kkal/mol  enerji  3 B1RR11RR1B222R2222R3 ‐38.7  6.5  4.8  ‐27.4 4.7
intervalında dəyişir. 
4 B1RR31RR3R122B2222B1 ‐36.9  6.5  5.5  ‐24.8 7.3
Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2  mo‐ 5 B1BB32RR3B222B3322B3 ‐40.1  6.1  4.6  ‐29.6 2.5
lekulun  stabil  konformasiyalarında  N‐tərəf  6 B1RB31RR3B222B3322B3 ‐36.4  5.8  5.4  ‐25.2 6.9
pentapeptid fraqment əsas zəncirin altı for‐ 7 B3BB32BB1R122R3222R2 ‐37.0  7.5  4.7  ‐25.0 7.1
masının, S‐tərəf tripeptid fraqment isə əsas 
8 B1RR31BB3B222B3322B3 ‐34.4  6.5  3.9  ‐24.1 8.0
zəncirin  dörd  formasının  konformasiyaları 
9 B1RR31BB3R122R3322R2 ‐36.8  7.9  5.5  ‐23.4 8.7
ilə tərənnüm olunmuşdur. 
10 B1RR31BB3B222B2222R3 ‐32.0  6.5  3.4  ‐22.1 10.0
Oktapeptid molekulun ən stabil konforma‐
11 B2RR21LR1B222B3322B3 ‐33.0  6.9  3.3  ‐22.9 9.2
siyası  B1RR31RR3B222B3222B3‐dür.  Bu  konfor‐
12 B2RR21LR1R122B3222R2 ‐38.3  11.0  4.4  ‐22.9 9.2
masiya  eyni  zamanda  həm  qeyri‐valent, 

Number 25, 2009    55
N.A.Əhmədov, R.M.Abbaslı, İ.T.Məmmədova, Ş.N.Hacıyeva 

əsas zəncirinin forması isə eynidir. Konfor‐
masiyaya qeyri‐valent qaşılıqlı təsir enerjisi 
(‐40.1) kkal/mol, elektrostatik qarşılıqlı təsir 
enerjisi  (6.1)  kkal/mol,  torsion  qarşılıqlı 
təsir enerjisi (4.6) kkal/mol qədər pay verir. 
Konformasiyanın    stabilləşməsinə  Ser1‐in 
digər  aminturşu  qalıqları  ilə  qarşılıqlı  təsir 
enerjisi  (‐6.7)  kkal/mol,  Pro2‐ninki  (‐6.2) 
kkal/mol, Leu3‐ünkü isə (‐9.7) kkal/mol qə‐
dər pay verir (cədvəl 2). 
Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2  mo‐
lekulunun  N‐tərəf  pentapeptid  fraqmentin 
əsas  zəncirinin  formalarına  görə  fərqlənən 
stabil  konformasiyalarının  üçüncüsü 
B1RB31RR3B222B3322B3‐dür.  Onun  nisbi  ener‐
jisi  6.9  kkal/moldur.  Cədvəl  1‐də  göstəril‐
Şək.1b.  Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2  mole‐
miş  sonrakı  stabil  konformasiyaların  nisbi 
kulunun  B1BB32RR3B222B3322B3  (Unis=2,5kkal/ 
enerjiləri 7.0 kkal/moldan çoxdur.  mol) stabil konformasiyası 

Arg7 və Phe8‐in yan zəncirləri molekuldan 
mühitə  doğru  yönəlmişdir  və  digər  mole‐
kullarla  müxtəlif  qarşılıqlı  təsirlərdə  asan‐
lıqla iştirak edə bilərlər və molekulun müx‐
təlif  bioloji  funksiyaları  yerinə  yetirdikdə 
iştirak edə bilərlər. 

ƏDƏBİYYAT 

1. Wasielevvski O., Skoneeszno M.//J.Comp. Physiol. 
2008, v .178, №7,p.877‐885. 
2. Hatami  L.,Valojerdi  M.R.,  Movvla  S.J.//Int.J. 
Cardiol. 2007,v.117,№1,p.80‐89. 
3. Fort  I.J.,Brerina  V.,  Miller  M.W.//J.Neurophysiol/ 
2007, v.98, №5,p.2887‐2902. 
4. Исмаилова  Л.И.,  Ахмедов  Н.А.,  Ахмедова 
С.Р.// Биофизика,1997,т.42,вып.4,с.796‐805. 
5. Akhmedov  N.A.,  Tagıyev  Z.H..  Hasanov  E.M., 
Akverdieva  G.A.//J.Molecular  Structure,  2003, 
v.646, p.75‐80 
Şək.1a.  Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2  mole‐
kulunun B1RR31RR3B222B3322B3   (Unis=0kkal/mol)  6. Ахмедов Н.А., Исмаилова Л.И., Аббаслы Р.М., 
stabil konformasiyası  Ахмедов  Н.Ф.,  Годжаев  Н.М.//  Биоорган.  Хи‐
мия, т.31,№1,с.31‐38. 
Oktapeptid molekulun ən stabil konforma‐ 7. Исмаилова  Л.И.,  Аббаслы  Р.М.,  Ахмедов  Н.А. 
// Биофизика,2007,т.52,вып.6,с.1141‐1147. 
siyasında  aminturşu  qalıqlarının  yan  zən‐
8. Исмаилова  Л.И.,  Ахмедов  Н.А.,  Аббаслы 
cirlərin ikiüzlü fırlanma bucaqları ətrafında 
Р.М.// Биофизика,т.53,вып.1,с.14‐21. 
konformasiya xəritələri qurulmaqla onların 
9. 9.IUPAC‐IUB  Commission  on  Biochemical 
konformasiya  mütəhərrikliyi  öyrənilmişdir.  Nomenclature//  Biochem.et  Biophys.Acta,  1971, 
Stabil konformasiyalarda Ser1‐in,Thr5‐in, v.229,p.1‐17. 

56  Journal of Qafqaz University   
Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐Nh2 Molekulunun Fəza Quruluşu 

Cədvəl 2.  Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2  molekulunun  B1RR31RR3B22B33B3  (Unis=0kkal/mol,1sətr), 


B1BB32RR3B22B33B3  (Unis=2,5  kkal/mol,  2  sətr),  B1RB31RR3B22B33B3  (Unis=6.9kkal/mol3  sətr),  konformasiya‐
larında amin turşu qalıqları arasında və daxilində qarşılıqlı təsir enerjiləri. 
SER  PRO  LEU  GLY  THR  MET  ARG  PHE   
3.3  ‐3.2  ‐2.1  ‐3.1  ‐2.3  ‐0.1  1.4  ‐0.1 
1.9  ‐3.9  ‐2.0  0.0  0.0  ‐0.2  1.6  ‐0.6  SER 
3.7  ‐3.0  ‐2.5  ‐0.3  0.0  ‐0.2  ‐2.8  ‐0.6 
0.2  ‐2.4  ‐0.9  ‐1.9  ‐2.2  ‐0.2  ‐1.4 
  0.3  ‐1.3  ‐0.3  0.0  ‐0.4  ‐3.3  ‐0.9  PRO 
0.2  ‐2.5  ‐0.7  0.0  0.0  ‐0.4  0.0 
‐0.4  0.2  ‐2.2  ‐1.3  ‐2.2  ‐2.2 
    ‐0.4  0.6  ‐1.3  ‐2.7  ‐3.4  ‐2.3  LEU 
‐0.2  ‐0.2  ‐1.0  ‐1.8  ‐2.2  ‐1.6 
1.2  ‐0.8  ‐0.8  ‐2.8  0.0 
      1.3  ‐0.9  ‐0.7  ‐2.9  0.0  GLY 
1.2  ‐0.7  ‐0.8  ‐2.6  0.0 
0.5  ‐1.0  ‐1.1  ‐0.1 
        0.5  ‐1.2  ‐1.0  ‐0.1  THR 
0.5  ‐1.0  ‐0.9  0.0 
0.3  ‐2.5  ‐4.6 
          0.3  ‐2.4  ‐4.7  MET 
0.3  ‐2.4  ‐4.4 
0.5  ‐2.1 
            0.5  ‐1.9  ARG 
0.4  ‐1.9 
‐1.9 
              ‐2.0  PHE 
‐2.0 

Cədvəl3.   Ser‐Pro‐Leu‐Gly‐Thr‐Met‐Arg‐Phe‐NH2 molekulunun stabil konformasiyalarının həndəsi parametrləri. 
(ikiüzlü bucaqların qiymətləri φ,ψ,ω,χ11,χ21 ardıcıllığı ilə dərəcələrlə verilmişdir) 
Amin turşusu  B1RR31RR3B222B3322B3  B1BB32RR3B222B3322B3  B1RB31RR3B222B3322B3 
 ‐89        151        175    ‐60        151        173    ‐94        148       ‐179 
Ser 
  57       ‐178     56        179     57        179 
Pro   ‐60         ‐38        180    ‐60        131       ‐177    ‐60        ‐37       ‐177 
 ‐74         ‐43        178  ‐107        148       ‐174    ‐73        113       ‐177 
Leu   ‐75          65         180    ‐51        179       ‐175    ‐75         67        179 
 172   180    172 
Gly    ‐59         ‐40       ‐177   ‐49        ‐45        ‐176    ‐73        ‐40       ‐166 
 ‐77          ‐52       ‐173   ‐71        ‐60        ‐177    ‐73        ‐52       ‐176      
Thr 
 ‐59         179         178   ‐57        178         175    ‐59        179        179 
‐122         139       ‐178  ‐128        143       ‐175  ‐126        144       ‐178 
Met    178        174        177   180        173         178  ‐177        172        180 
‐179  ‐179  ‐179 
‐103        123        ‐172  ‐101        117       ‐177  ‐107        119        180 
Arg    ‐50        ‐62          176   ‐50        ‐66         176    ‐51        ‐64        176 
 180   180   178 
‐104        154        180  ‐109        154        180  ‐107        154        180 
Phe 
 ‐52          95    ‐59          91    ‐60         90 
Unisbi  0  2.5  6.9 

Number 25, 2009 57
 
 
 
ОПРЕДЕЛЕНИЕ СЕЧЕНИЯ КОГЕРЕНТНОГО РАССЕЯНИЯ 
НЕЙТРОНОВ НА КРИСТАЛЛАХ ИЗОТОПОВ ЛИТИЯ, 
УГЛЕРОДА И НИКЕЛЯ КОДОМ MCNP4C 

МАСТИ. Д 
Бакинский Государственный Университет 
Баку / АЗЕРБАЙДЖАН 
mastidarush@yahoo.com 

РЕЗЮМЕ 
Представлен разработанный  метод  расчета  эффективных  сечений   когерентного  рассеяния  нейтронов 
на  кристаллах  лития,  углерода  и  никеля  с  помощью  кода  MCNP4C.  Создана  точная  трехмерная  геомет‐
рическая  модель  гетерогенной  активной  зоны  реактора,  и  cмоделированы  геометрические  конструкции 
внутри  и  вне  активной  зоны.  Подобраны  необходимые  параметры  для  задания  области  регистрации, 
послужившие входными данными для расчета числа нейтронов при расчете по коду  MCNP4С. Получен‐
ные результаты и сравнение с экспериментальными данными, представленные в настоящей статье, свиде‐
тельствуют  о  возможности  применения  методики  кода  MCNP4С  для  практических  расчетов  характерис‐
тик рассеянных нейтронов на кристаллах  для  лабораторных реакторов. 
Ключевые  слова:  Метод  Монте‐Карло;  водо‐водяной  энергетический  реактор;  тепловыделяющая 
сборка  реактора; когерентное рассеяние; кристалл; дифракция нейтронов. 

DEFINITION OF COHERENT NEUTRON SCATTERING CROSS SECTION IN ISOTOPES OF              
ELEMENTS:  LITHIUM, CARBON AND NICKEL BY MCNP4C CODE 

ABSTRACT 
This paper presents design method of calculation coherent neutron scattering cross section in crystals: lithium, 
carbon and nickel, by MCNP4C code. Three‐dimensional geometric model of heterogeneous reactor core is made, 
and modeled geometric constructions inside and outside reactor core. Necessary parameters for the computation 
of  number  of  neutrons  in  calculations  of  MCNP4С  code,  are  selected.  Received  results  and  comparison  with 
experimental  data  presented  in  this  paper,  introduced  the  possibility  of  applying  of  MCNP4C  code  for  the 
practical calculations of neutron scattering in crystals for laboratory reactors. 
Key words: Monte‐ Carlo method; water‐water energetic reactor; fuel assembly; coherent scattering; crystal; 
neutrons diffraction. 
 
 
Absorber  rods),  интенсивности  потока 
1. Введение 
нейтронов,  Keff  (эффективный  коэффи‐
Для  ядерных  реакторов    одним  из  силь‐ циент  размножения)  и  т.д.  в  активной 
нейших  вычислительных  методов  явля‐ зоне  реактора.  Кроме  того,  код  MCNP 
ется код MCNP4С (Monte Carlo N‐Particle,  позволяет      решать      широкий      спектр   
version  4C).  Он  развит  на  базе  метода  задач  по  взаимодействию  частиц  с  ве‐
Монте‐Карло  и  широко  используется  ществом,  охватывая  практически  все  об‐
для вычисления и определения физичес‐ ласти  применения.  Однако,  для  расчет‐
ких  параметров  нейтронов:  таких  как  ных  обоснований  потока  нейтронов  в 
реактивность  поглощающих  стержней  реакторах,  необходима  разработка  соот‐
(CPS‐AR:Control  and  protection  system‐ ветствующей  методики  с  созданием 

58  Journal of Qafqaz University
Определение Сечения Когерентного Рассеяния Нейтронов на Кристаллах  
Изотопов Лития, Углерода и Никеля Кодом MCNP4C  

адаптированной  геометрической  модели,  рии  и  соответствующих  краевых  усло‐


модели  источника  нейтронов,  проведе‐ вий также облегчает моделирование гео‐
ние  сравнения  с  результатами,  получен‐ метрии. 
ными  другими  проверенными  методи‐
Все  границы  геометрических  зон  моде‐
ками [1‐5].    лируются из кусков плоскостей или квад‐
В данной статье для моделирования выб‐ ратичных  поверхностей,  поэтому  при 
ран реактор ВВЭР(Водо‐Водяной Энерге‐ наличии деталей с более сложными гра‐
тический  Реактор)  [7‐10],  где  были  про‐ ничными поверхностями их необходимо 
ведены  нейтронно‐активационные  изме‐ аппроксимировать большим числом зон. 
рения на кристаллах изотопов углерода,  Каждой  геометрической  зоне  приписы‐
лития и никеля [12‐14].   вается  ряд  атрибутов:  номер  материала, 
номер  регистрационной  зоны  (произ‐
2. Описание Кода MCNPС  вольное объединение геометрических зон 
из  одинаковых  материалов),  номер  ре‐
Код MCNP4С предназначен для совмест‐
гистрационного  объекта  (например, 
ного  моделирования  переноса  различ‐
ячейка или кассета). 
ного  вида  частиц:  нейтронов,  фотонов, 
электронов  (нейтронный  режим  энер‐ Для  проверки  входных  данных,  описы‐
гии ‐ от 10‐11 MeV до 20 MeV, фотонный,  вающих  геометрию  моделируемой  ком‐
и  электронный  режимы  энергии‐  от  1  позиции,  можно  просмотреть  изобра‐
keV  до  1000  MeV).  Неоднородные  (а  для  жение модели в  виде  плоских сечений с 
нейтронов,  однородные)  уравнения  пе‐ последовательным  изображением  мате‐
реноса  излучений  решаются  аналоговы‐ риальных,  регистрационных  зон  и  объ‐
ми  и  неаналоговыми  методами  Монте‐ ектов.  
Карло  с  использованием  констант,  со‐
Регистрировать  частицы  можно  различ‐
держащихся  в  библиотеках  оцененных 
ными способами: в объеме, при прохож‐
ядерных  данных  или  полученных  на  их 
основе.  Геометрический  модуль  позвол‐ дении  через  поверхность,  в  детекторе  и 
яет описывать, практически без упроще‐ т.д. Вычисляются различные функциона‐
ний,  любые  системы  в  трехмерной  гео‐ лы  потока,  определяемые  как    интегра‐
метрии. Это неоспоримое преимущество  лы    потока    с    заданными    весовыми 
данного  кода.  Код  MCNP4С  имеет  приб‐ функциями  в  регистрационных  зонах, 
лизительно  48000  линий  программы  регистрационных  объектах  и  в  компо‐
ФОРТРАНА и 1000 линий программы C  зиции  в  целом.  Источники  нейтронов 
[1‐5].  могут  иметь  практически  произвольное 
пространственное,  энергетическое  и 
Композиция  (реактор)  представляется 
угловое распределение. 
как  объединение  однородных  геометри‐
ческих зон, каждая из которых описыва‐
3.  Подготовка модели для расчета 
ется  как  комбинация  набора  простых 
по коду MCNP4C 
тел  (например,  цилиндр,  конус,  сфера). 
Описание  геометрии  композиций,  со‐ Процедура  расчета  необходимых  харак‐
держащих  регулярно  повторяющиеся  теристик поля нейтронов (и далее числа 
элементы,  облегчается  благодаря  ис‐ нейтронов)  включает  в  себя  подготовку 
пользованию методов размножения, поз‐ исходных  данных,  проведение  расчета 
воляющих  задавать  повторяющийся  переноса  нейтронов  в  околокорпусном 
элемент  только  один  раз.  Учет  симмет‐ пространстве  реактора  (точнее  в  крис‐

Number 25, 2009    59
 
Масти. Д 

таллическом образце и в металлической  шестигранную  трубу  из  сплава  Zr  +  1% 


сфере  (рис.1))  и  обработку  результатов.  Nb,  заполненную  водой  и  располагаю‐
Именно  это  является  отличительной  щимися в ней моделями твэлов. Модель 
особенностью расчетов по коду MCNP4С,  твэла  –  трехзонный  (топливо,  зазор, 
который  позволяет  точно  описать  всю  оболочка) цилиндр, одинаковый по всей 
геометрию  без  каких‐либо  приближе‐ высоте.  Высота  активной  зоны  принята 
ний и упрощений.   равной  высоте  топливного  столба  в 
горячем  состоянии  и  составляет  384  см. 
Кассеты‐экраны  представлены  в  виде 
гомогенизированных  (смесь  вода‐сталь) 
моделей.  Источник  нейтронов  в  актив‐
ной  зоне  задается  по  твэльно  по  всем 
кассетам. 

 
Рис.1.  Горизонтальное  сечение  расчетной  модели: 
реактор,  кристалл  и  металлическая  сфера: 
1–активная зона; 2–кассеты‐экраны; 3–выго‐
родка; 4–вода; 5–корзина; 6–шахта; 7–экран; 
8–корпус;  9–воздушный  зазор;  10–наплав‐
ка;  11–теплоизоляция;  12–стенка  бака;  13–
биологическая защита (вода);     14– монок‐
ристалл;  15–  типовой  кристалл;  16‐метал‐
 
лическая сфера.  Рис. 2.  Визуальный  фрагмент  гетерогенной  моде‐
ли  активной  зоны:  1–кассета‐экран;  2–вы‐
4.  Моделирование активной зоны и  городка;  3–чехол  ТВС;  4–вода  в  активной 
зоне; 5–твэл. 
дифракции нейтронов на 
кристаллах Поток нейтронов из активной зоны реак‐
Модель  активной  зоны  набирается  из  тора,  с  помощью  алюминиевой  трубки 
шестигранников,  имеющих  вид  попе‐ (диаметр 15 см, толщина 3 мм, длина 300 
речного  сечения  по  центру  реальной  см) проходит через  корпус реактора (за‐
тепловыделяющей  сборки  (ТВС)  реак‐ медлителя).  Далее  через  коллимирую‐
тора  ВВЭР  (рис.2).  ТВС  –  это  пучок  щую  систему,  формирующую  узконап‐
тепловыделяющих  элементов  (твэл),  равленный  пучок,  они  попадают  на 
собранных  по  треугольной  решетке  и  монокристалл,  в  котором  и  происходит 
зафиксированных  в  несущей  конструк‐ дифракция.  После  прохождения  через 
ции,  обеспечивающей  возможность  монокристалл  монохроматический  по‐
транспортных операций с ТВС и сборки  ток  нейтронов  попадает  на  нейтронную  
активной  зоны.  При  создании  модели  кристаллографию [7‐11,14‐17]. 
активной  зоны  учитываются  все  харак‐
5. Выбор области регистрации 
терные  геометрические  размеры  реаль‐
ной  конструкции  реакторов  ВВЭР.  Мо‐ Оценка  числа  нейтронов  проводится  с 
дель  ТВС  представляет  собой  чехловую  помощью  металлической  сферы.  Для 

60  Journal of Qafqaz University   
Определение Сечения Когерентного Рассеяния Нейтронов на Кристаллах  
Изотопов Лития, Углерода и Никеля Кодом MCNP4C  

этого необходимо выбрать соответствую‐ расположение‐должно быть точно опре‐
щий  объем,  в  котором  будут  регистри‐ делено  и  задано,  так  как  изменение  рас‐
роваться  частицы,  и  по  которому  будет  положения  требует  нового  расчета  с 
усредняться конечный   результат.  подготовкой новых весовых окон; 
Задаваемый  для  регистрации  частиц  размер‐не  должен  быть  слишком  ма‐
объем  представляет  собой  точно  задан‐ леньким для набора достаточной статис‐
ную ячейку, которую можно назвать об‐ тики  и  не  должен  быть  слишком  боль‐
ластью  регистрации  (металлическая  шим  для  получения  конкретного  рас‐
сфера).  В  расчетах  по  коду  MCNP4С,  пределения. 
особое  место  стоит  уделять  выбору  и  В данной задаче выбраны область регис‐
заданию  области  регистрации  частиц.  трации  нейтронов  на  типовом  кристал‐
Это  связано  с  необходимостью  подго‐ ле  и  на  металлической  сфере  за  корпу‐
товки  отдельного  весового  окна  для  об‐ сом реактора.  
ласти  регистрации  (металлическая  сфе‐
Исходными  данными  для  MCNP4C,  в 
ра, часть 12, 13 рис.3 А, Б) и проведения 
том  числе  по  источнику  нейтронов,  по 
соответствующего  расчета  с  набором 
составу  материалов  реактора  служили 
достаточной  статистики.  В  связи  с  этим 
подготовленные  данные  и  были  исполь‐
область  регистрации  должна  быть  оп‐
зованы  мировой  опыт  –ротация  крис‐
тимизирована  по  следующим  показа‐
талла [6,18,19,21] и расчеты по MCNP4C. 
телям: 
 

           A                           B 
Рис. 3.  Реактор, металлическая сфера и кристалл, подготовленные для расчета по коду MCNP4C: 1–тепло‐
изоляция; 2– нижний отражатель; 3–выгородка; 4–активная зона; 5–верхний отражатель; 6–корпус 
реактора;  7–защита;  8–кольцо  опорное;  9–бак  с  водой;  10–ребра  бака;  11–зоны  регистрации;  12–
монокристалл; 13–металлическая сфера; 14–типовой кристалл. 
 

но  100000,  энергия  монохроматического 


6. Результаты расчетов и их анализ  потока  нейтронов  Е=0.06  eV  (λ=1.16  Å), 
Были  рассмотрены  изотопы  углерода  угол  дифракции  =20о.  На  рис.  4,5,6  и  7 
(графит‐алмаз),  лития  (Li,7Li)  и  никеля  показаны зависимость числа рассеянных 
(Ni,58Ni,60Ni). Интенсивность нейтронов в  нейтронов  на соответствующих кристал‐
монохроматическом  луче‐приблизитель‐ лах от угла. 

Number 25, 2009    61
 
Масти. Д 

Графит Fhkl=Rhkl.f0 .                            (2) 


90000
когерентное рассеяние
Число нейтронов

80000
70000 В  этом  выражении  Fhkl  структурная 
60000
50000 некогерентное рассеяние
амплитуда,  а  Rhkl    геометрическая  часть 
40000
30000
20000
структурной  амплитуды.  Эти  величины 
10000
0
определяются    экспериментально  по 
9 14 19 24 29 34
формуле: 
θ(градус )
 
V λ3 2
Рис. 4.  Зависимость числа рассеянных на графите  Phkl = ⋅ P0 ⋅ Fhkl ,           (3) 
ν 02 sin θ
нейтронов от угла. 
 Р0‐ интенсивность нейтронов во входном  
Алмаз типовом    кристалле;Phkl‐  интенсивность 
100000
луча  в  дифракционном  пике;  λ‐  ней‐
Число нейтронов

90000
80000
70000
60000
когерентное рассеяние тронная длина волны; V‐ объем типовой 
50000 некогерентное рассеяние
40000 кристапл  θ‐  угол  между  гранью  крис‐
30000
20000
10000
талла  и  лучом;  ν0‐  объем  единичной 
0
8 13 18 23 28 33 38 43 48 53 58
ячейки.  
θ(градус)
  На таблице 1 представлены сечения  ко‐
Рис. 5.  Зависимость  числа  рассеянных  на  алмазе  герентного рассеяния нейтронов (σког)mcnp 
нейтронов от угла.  на  рассмотренных  изотопах  по  методу 
Литий
кода    MCNP4С  и  экспериментальные 
70000
(σког)лаб  [6,11,12,13,18].  Как  видно  из  таб‐
Числo нейтронов

60000
50000 Li7
когерентное рассеяние
лицы,  экспериментальные  данные  подт‐
40000
30000 Li
верждает  правильность  проведенных 
20000
10000
расчетов и созданных моделей.  
0
15 17 19 21 23 25 27 29
θ(градус) 7. Основные выводы 
 
Применение  кода  MCNP4С  дает  воз‐
Рис. 6.  Зависимость  числа  рассеянных  на  литии 
нейтронов от угла. 
можность  точного  трехмерного  модели‐
рования  всех  геометрических  особен‐
Никель
ностей  конструкции  реактора  и  часть 
60000

50000 NI58
кристаллографии  для  получения  диф‐
Число нейтронов

40000
когерентное рассеяние NI ракции нейтронов.  Эта возможность ко‐
30000

20000 да  успешно  реализована  в  настоящей 


10000

0
NI60 работе,  и  полученная  геометрическая 
20 22 24 26 28 30 32 34
модель  может  применяться  для  даль‐
θ(градус)
  нейших  расчетов  дифракции  нейтронов 
Рис. 7.  Зависимость  числа  рассеянных  на  никеле  и  для  моделирования  когерентного  рас‐
нейтронов от угла.  сеяния нейтронов [20]. 
Сечение когерентного рассеяния связано  Таблица 1. 
с  амплитудой  когерентного  рассеяни 
Элемент Графит Алмаз 60
Ni  58
Ni  Ni  7
Li Li 
следующим образом: 
(σког)mcnp
σког=4π.f0 .                             (1)  (Барн) 
5.60  4.98  1.04  26.76  13.68  0.69 0.52

В  случае  моноатомного  образца  ампли‐ (σког)лаб


5.55  4.81  0.99  26.10  13.30  0.61 0.45
туда f0  определяется выражением:  (Барн) 

62  Journal of Qafqaz University   
Определение Сечения Когерентного Рассеяния Нейтронов на Кристаллах  
Изотопов Лития, Углерода и Никеля Кодом MCNP4C  

ЛИТЕРАТУРА  11.  Wollan.E.O,  Shull.C.G.The diffraction of neutrons 


by  crystalline  powders.Tennessee  AEC,  Oak 
1.  Briesmeister,  J.F.,  2000.  MCNP‐A  General  Monte    Ridge, Tenn, 4‐11‐49‐850‐Al462. 
Carlo  N‐Particle  Transport  code,  Version  4C,  Los 
12.  Wollan.E.O.  Shull.C.G.  Marney.M.C.  Neutron 
Alamos National Laboratory Report LA‐13709‐M. 
diffraction  studies.  Tennessee  AEC,  Oak  Ridge, 
2.  Members  of  Cross‐Section  Evaluating  Working  Clinton Laboratories, AECD – 2359. 
Group,      Mclane,  2001.  ENDF‐102,  Data  Formats 
and  Procedures  for  the  Evaluated  Nuclear  Data  13.  Wollan.E.O,  Shull.C.G,  Morton.G.A,  Davidson. 
File,  ENDF‐6,  National  Nuclear  Data  Center,  W.L.  Neutron  diffraction  analysis  of  NaH  and 
Brookhaven National Laboratory.  NaD.  Technical  Information  Branch,  Oak  Ridge, 
Tennessee AEC, MDDC 842 . 
3.  Reactor    Physics    Constants,  Second      Edition, 
ANL‐5800, chap 7, section 7.2.  14.  Masti.D.  Definition  of  differential  and  integral 
reactivity worth of control  rods for WWER‐1000 
4.   RSICC  COMPUTER  CODE  COLLECTION 
by  MCNP  Code,  Amrikabir  Technical 
MCNP4C Monte Carlo N‐Particle Transport Code 
University, Teheran, Iran, Thesis (M.S.), 2001. 
System  Contributed  by:  Los  Alamos  National 
Laboratory,  OAK  RIDGE  NATIONAL  15.  Masti.D. MCNP a general Monte Carlo N‐particle 
LABORATORY,  managed  by:  UT‐BATTELLE,  transport code, Baku State University. 2008.№ 4. 
LLC  for  the  U.S.  DEPARTMENT  OF  ENERGY  ‐  16.  T.Margulova.  Nuclear  power  stations.  Mir 
April 2000.  Publishers, Moscow  1978. 
5.  П.Г.Бородкин  Расчетные  исследования  пере‐ 17.  Дж. Бэйкон.    Дифракция нейтронов. 1963 г. 
носа  нейтронов  в  околокорпусном  простран‐ Октябрь,Т. LXXXI, вып. 2, Успехи физических 
стве  реактора  ВВЭР‐440  по  коду  MCNP‐5  и  наук.
сравнение  их  результатов  с  эксперименталь‐
18.  Р.П.Озеров.Структурная  нейтронография, 
ными  данными,  ядерная  и  радиационная  без‐
Успехи  физических  наук  1951  г.  Декабрь    ,       
опасность , № 1, 2008 г. 
Т. XLV, вып. 4. 
6.  G.L.Squters, Introduction to the theory of thermal 
19.  Ю.Л.Изюмов.  Теория    рассеяния  медленных 
neutron  scattering,  Cambridge  University  press 
нейтронов  в  магнитных  кристаллах.  1963 
1978. 
г.,Т.ЪХХХ, вып.1.Успехи физических наук. 
7.  Lamarsh.  John,  Introduction  to  Nuclear  Engi‐
20.  П.А.Андросенко,  М.Р.Малков  Прецизионное 
neering, Addison‐Wesley Company, 1977.                                                 
моделирование  рассеяния  тепловых  нейтро‐
8.  Zarkesh.M.  Principles  of  design,  equipment 
нов  в  ПК  brand.  ISBN 5‐7262‐0559‐6.  IV  Кон‐
assembly and operating of NPP. Tehran‐Iran 2004. 
ференция «Научно‐инновационное сотрудни‐
ISBN:  964‐8171‐13‐0. 
чество».    Физико‐энергетический  институт, 
9.  Davarzani.A.  Nuclear  reactors  applied  physics.  Обнинск. 
Tehran‐Iran 2004. ISBN: 964‐8171‐50‐5. 
21.  Noorbehesht.I. A introduction to crystallography 
10.  Mahmoodi.R.  Reactor  VVER‐1000  (V‐  320).  (geometry),  third  Edition,  Esfahan  University 
Tehran ‐ Iran 2004. ISBN: 964‐8171‐25‐4.  2004. ISBN: 964‐6478‐38‐7. 

 
 

Number 25, 2009    63
 
 
 
ЭФФЕКТ ЗАПОЛНЕНИЯ ЗОН В КРИСТАЛЛАХ  GASE  ПРИ 
ВЫСОКИХ УРОВНЯХ ОПТИЧЕСКОГО ВОЗБУЖДЕНИЯ 

А.А. САЛМАНОВА 
Бакинский Государственный Университет 
Баку / АЗЕРБАЙДЖАН 

РЕЗЮМЕ 
Экспериментально исследовано нелинейное поглощение света в кристаллах GaSe в области фундамен‐
тального поглощения при высоких уровнях оптического возбуждения. Просветление края полосы погло‐
щения,  с  одновременным  его  сдвигом  в  высокоэнергетическую  область  спектра,  может  быть  объяснено 
заполнением  энергетических  зон  при  высоких  уровнях  оптического  возбуждения.  Экспериментальное  
значение  изменения  коэффициента  поглощения  находится  в  хорошем  согласии  с  теоретически  вычис‐
ленными значениями. На основании соотношения Крамерса‐Кронига по изменению коэффициента пог‐
лощения  определено  изменение  показателя  преломления  GaSe.  Показано,  что  наблюдаемый  эффект 
заполнения зон позволяет на основе кристаллов GaSe создать полупроводниковый лазер. 
Ключевые слова: поглощение, фундаментальное поглощение, коэффициент поглощения 

BANDFILLING EFFECT IN GASE CRYSTALS UNDER HIGH OPTICAL EXCITATION 

ABSTRACT 
The  nonlinear  light  absorption  in  GaSe  crystals  at  the  fundamental  absorption  edge  for  high  excitation 
intensities has been investigated experimentally. The bleaching of band‐edge absorption which manifests itself as 
an  apparent  blue  shift  of  the  absorption  edge  can  be  interpreted  on  the  base  of  bandfilling  nonlinearities.  The 
obtained  experimentally  change  in  the  absorption  coefficient  (Δα)  is  in  good  agreement  which  is  calculated 
theoretically. In the base of  Kramers‐Kronig relation the change in refractive index (Δn) is defined by (Δα). It is 
shown that the observed negative absorption change in GaSe crystal is the basis of optical amplification and the 
semiconductor laser. 
Key words: absorption, band‐edge absorption, absorption coefficient 
 
 
1. Введение  няют  зоны,  начиная  от  дна,  поэтому 
сперва  заполняются  наинизшие  энерге‐
Известно,  что  в  полупроводниках  при 
тические  состояния.  В  результате  этого 
высоких  уровнях  оптического  возбужде‐
окрестности  зоны  проводимости  запол‐
ния  генерируется  большое    количество 
няются  электронами,  а  потолок  валент‐
электронно‐дырочных пар. Так как элек‐
ной  зоны  дырками.  Заполнение  зон,  в 
троны  и  дырки  являются  фермионами, 
конечном  итоге  приводит  к  нелинейно‐
то согласно принципу  Паули на каждом 
му  поглощению  в  области  края  полосы 
квантовом  состоянии  может  быть  не  бо‐
поглощения. 
лее двух электронов с разными спинами 
(±1/2).  Занятые  носителями  состояния  В  данной  работе  экспериментально  ис‐
являются, как бы конечными состояния‐ следуется  нелинейное поглощение света 
ми в процессе оптического поглощения.  в  области  фундаментального  поглоще‐
Согласно принципу минимизации энер‐ ния.  Показано,  что  наблюдаемый    сдвиг 
гии,  носители  в  квазиравновесии  запол‐ края  полосы  поглощения  в  коротковол‐

64  Journal of Qafqaz University
Эффект Заполнения Зон в Кристаллах GASE при Высоких Уровнях Оптического Возбуждения 

новую  область  спектра  при  высоких  2. МЕТОДИКА ЭКСПЕРИМЕНТА 


уровнях оптического возбуждения имеет 
Исследованные  кристаллы  GaSe  были 
важное  значение  для  лазерной  техники, 
выращены  методом  Бриджмена.  Образ‐
ибо  на  основе  этого  явления  могут  быть 
цы относились к ε‐модификации, имели 
созданы  полупроводниковые  лазеры  на 
гексагональную структуру и обладали р‐
основе кристаллов GaSe. 
типом проводимости. Образцы с толщи‐
Слоистые  кристаллы  GaSe  благодаря  нами  10÷50мкм  и  геометрическими  раз‐
особенностям  структуры  и  химических  мерами  3х3мм  были  изготовлены  путем 
связей обладают уникальными физичес‐ скалывания  из  крупных  слитков  (пер‐
кими  свойствами.  Структура  этих  крис‐ пендикулярно  к  оптической  оси‐с).  Сог‐
таллов  состоит  из  последовательно  упа‐ ласно  холловским  измерениям  концен‐
кованных  слоев,  каждый  из  которых  трация и подвижность носителей тока в 
содержит  четыре  плотно  связанных  направлении, параллельном оптической 
атомных  плоскостей  Se‐Ga‐Ga‐Se.  Связь  оси‐с  при  комнатной  температуре  сос‐
между  слоями  является  слабой  Ван‐дер‐ тавляли  р=1х1014см‐3,  μр  =(20÷30)см2В‐1с‐1, 
Ваальсовой, тогда как вдоль  слоев  доми‐ соответственно.  
нирует  ковалентная  связь.  Cлабая  Ван‐
дер‐Ваальсовая связь между слоями поз‐ В качестве источника излучения был ис‐
воляет  осуществить  скол  вдоль  плос‐ пользован  импульсный  лазер  на  краси‐
кости  спайности  и  получить  образцы  с  теле Родамин  6G (PRA, LN‐107), накачка 
толщинами  вплоть  до  доли  микрона  с  которого  осуществлялась  азотным  лазе‐
естественными  зеркальными  поверхност‐ ром  (PRA,  LN‐1000).  Область  перес‐
ями.  Сравнительно  небольшое  значение  тройки  длины  волны  излучения  λ=594‐
коэффициента  поглощения  (α∼103см‐1)  643нм, ширина линии генерации во всем 
позволяет работать с резонаторами дли‐ диапазоне  ∼  0,4А°.  Мощность  импульса 
ной  ∼  10мкм.  Край  полосы  поглощения  составляла 12МВт/см2 при  длительности 
этих  кристаллов  обусловлен  экситон‐ импульса  3нс    с  частотой  повторения 
ными переходами. Большая энергия свя‐ ∼20Гц.  Интенсивность  лазерного  излуче‐
зи  экситонов  (Еэкс  ∼  20мэВ)  позволяет  ния  изменялась  при  помощи  калибро‐
вести оптические и люминесцентные ис‐ ванных нейтральных фильтров. Спектры 
следования  даже  при  комнатной  темпе‐ пропускания были получены перемеще‐
ратуре. Ширина запрещенной зоны GaSe  нием  светофильтров  из  передней  части 
(Eg∼2,02эВ)  находится  в  области  диапа‐ образца  к  задней  части  и  одновремен‐
зона  частот  генерации  большинства  ла‐ ной  проверкой  воспроизводимости  ре‐
зеров,  работающих  в  видимой    и  ближ‐ зультатов  в  области  прозрачности.  Им‐
ней  инфракрасной  диапазонах  спектра  пульсы лазерного света, прошедшего че‐
(YАG:Nd+3,  Ar,  He‐Ne,  Rb  лазеры,  жид‐ рез  плоско‐параллельные  образцы  ре‐
костные  лазеры  на  красителях  и  т.д.).  гистрировались  с  помощью  силиконо‐
Благодаря большой нелинейной воспри‐ вого фотодиода (пригодного для исполь‐
имчивости  и  большим  разнообразием  зования  такого  сорта  лазерных  изме‐
механизмов  нелинейности  показателя  рений).  Выход  сигнала  подавался  в  нес‐
преломления и коэффициента поглоще‐ тационарную  цифровую  систему,  кото‐
ния  в  кристаллах  GaSe  удалось  обнару‐ рая  включала  в  себя  запоминающий 
жить  и  исследовать  ряд  нелинейных  осциллограф  (Le  Croy  9400)  и  компью‐
оптических явлений [1‐6].  терную систему (board Master 800 ABI 8). 

Number 25, 2009    65
А.А. Салманова 

3.  Экспериментальные Результаты  По нашему мнению, наблюдаемое нели‐
и их Обсуждение  нейное поглощение около запрещенной 
зоны может быть обусловлено эффектом 
На рис.1,а приведены спектры поглоще‐ оптического  заполнения  в  GaSe,  т.е. 
ния  кристаллов  GaSe  при  низких  (кри‐ электроны и дырки, генерированные ла‐
вая  1)  и  высоких  (кривая  2)  уровнях  зерным  светом,  в  результате  быстрой 
оптического  возбуждения.  Как  видно  из  релаксации  до  термического  распреде‐
рисунка,  при  высоких  уровнях  возбуж‐ ления, блокируют дальнейшее поглоще‐
дения  происходит  уменьшение  погло‐ ние  на  краю  полосы  поглощения.  Это 
щения  около  запрещенной  зоны  и  од‐ приводит  к  просветлению  края  погло‐
новременно сдвиг края полосы поглоще‐ щения  и  его  сдвигу  в  сторону  высоких 
ния в сторону высоких энергий. Измене‐ энергий.  
ние  коэффициента  поглощения  (Δα)  
было найдено прямым вычитанием кри‐ Заполнение  состояний  электронами  и 
вых  1  и  2,  результаты  которого  предс‐ дырками  определяется  так  называемым 
тавлены  на  рис.1,б.  Видно,  что  макси‐ фактором заполнения [7]:  
мальное  изменение  поглощения  имеет  A(ε)= 1 ‐ fe(ε) ‐ fh(ε)      (1) 
место  в  непосредственной  близости  от 
запрещенной зоны.   здесь fe и fh являются функциями Ферми 
для электронов и дырок, соответственно. 
Фактор заполнения означает, что между 
валентной  зоной  и  зоной  проводимости 
имеет  место  переход  (v→c),  валентная 
зона  заполнена  электронами  (∼fv),  зона 
проводимости  пустая    (∼1‐fc).  Интенсив‐
ность  перехода  пропорциональна  их 
произведению 
Av→c = fv (1‐ fc )     (2) 
Интенсивность  обратного  перехода  (т.е. 
переход  зона  проводимости  ‐  валентная 
  
зона  (c  →  v),  описывающая  рекомбина‐
цию носителей) 
Ac→v = fc (1‐ fv )     (3) 
Вычитав уравнение (3) из (2) и используя 
fv=1‐ fh  получим (1). 
Как известно, Ферми функция может из‐
меняться  только  между  0  и  1,  где  0 
означает,  что  вероятность  заполнения 
равна нулю и 1 указывает, что состояние 
  заполнено  полностью.  Когда  оба  fe  и  fh 
Рис.1.  (а)  спектры  поглощения  кристаллов  GaSe  равны  нулю  (т.е.  для  невозбужденного 
при низких  (3,5 МВт/см2, кривая 1) и высо‐ полупроводника),  А  становится  равным 
ких  (12МВт/см2,  кривая  2)  интенсивностях  единице  и  все  состояния  способны  для 
возбуждения; (б) изменение коэффициента 
оптического  поглощения.  Для  высоких 
поглощения (Δα); (с) изменение показателя 
преломления (Δn).  плотностей носителей, fe и fh  отличны от 

66  Journal of Qafqaz University   
Эффект Заполнения Зон в Кристаллах GASE при Высоких Уровнях Оптического Возбуждения 

нуля,  и  при  достаточно  высокой  плот‐ усилению  света  прошедшего  через  об‐
ности  существует  энергия,  для  которой  разец  
сумма  обоих  Ферми  функции  равна 
I(x) = I0 exp(‐αx)    (5) 
единице,  т.е.  А=0;  это  имеет  место  для 
энергии равной   Для  α<0,  интенсивность  прошедшего 
света больше, чем интенсивность падаю‐
ε = μe + μh = μxп.     (4) 
щего. Это оптическое приращение явля‐
т.е. сумме квази ‐ химических потенциа‐ ется  предпосылкой  создания    полупро‐
лов электронов и дырок (рис.2.).   водникового  лазера  на  основе  крис‐
таллов GaSe. 
Экспериментально  найденные  значения 
(Δα)  были  сопоставлены  с  теоретичес‐
кими.  Согласно  [8  ]  изменение  коэффи‐
циента  поглощения  можно  вычислить 
по формуле 
πh
Δα (hω ' ) = −α 0 (hω ' )21 / 2 ( )3/ 2 ⋅
            k BT
[
⋅ ne me
−3 / 2
exp(− ΔE c / k B T ) +   (6) 
+ nh mh
−3 / 2
exp(− ΔE v / k B T ) ]
где 

        ΔEc = (hω ' − E g' ) /(1 + me / mh )          (7) 

        ΔEv = (hω ' − E g' ) /(1 + mh / me )          (8) 


                     
Рис.2.  Схематическое  представление  оптической  α 0 (hω ' ) ‐ коэффициент поглощения при 
нелинейности,  обусловленное  эффектом  низких  уровнях  возбуждения  для  фото‐
заполнения зон в полупроводнике:  
(а)  зонная  диаграмма  полупроводника  в 
на  с  энергией  (hω ' ) ,  me‐  эффективная 
отсутствии электронно‐дырочных пар,   масса электрона,  mh‐ эффективная масса 
(б) зонная диаграмма полупроводника при  дырки, ne и nh‐ концентрация свободных 
большой  плотности  электроннодырочных 
электронов и свободных дырок, соответ‐
пар. 
ственно.  E g' ‐перенормированная  запре‐
Исчезновение  фактора  заполнения  ука‐ щенная  зона,  которая  следует  от  обмен‐
зывает, что полупроводник является про‐ ного  и  корреляционного  эффекта  при 
зрачным  для  этой  частоты,  оптическое  высоких  плотностях  [9].  Зная  величины 
поглощение «просветляется» до нуля. Для  me=0,3m0,  mh  =  0,2m0  [10]  и  вычислив 
высокой  плотности  носителей,  fe  +  fh  >  1  значении  ne,  nh,  E g' ,  ΔEc,  ΔEv  из  формул 
для  ε<  μxп..  В  этом  случае  A(ε)<0  и  опти‐
(4)‐(11)  работы  [11],  на  основании  фор‐
ческое  поглощение  становится  отрица‐
мулы  (6)  найдем,  что  относительное  из‐
тельным. Действительно, из рис.1,б, вид‐
но, что изменение поглощения  (Δα) при 
Δα ⋅ 100%
менение    для  GaSe  составляет 
этом  становится  отрицательным.  Как  α0
видно  из  формулы  Бугер‐Ламберта,  от‐ ∼12%.  Это  значение  близко  к  экспери‐
рицательное  поглощение  приводит  к  ментально  найденному  значению,  кото‐

Number 25, 2009    67
А.А. Салманова 

рое составляет 15%. Незначительная раз‐ 4. Заключение   
ница между теоретическими и экспери‐
Показано,  что  наблюдаемое  в  слоистых 
ментальными  результатами  может  быть 
кристаллах  GaSe  нелинейное  поглоще‐
обусловлена тем фактом, что в формуле 
ние  в  области  фундаментального  погло‐
(6)  не  учитывается  экситонное  взаимо‐
щения обусловлено  эффектом заполне‐
действие,  хотя  в  широкозонных  полуп‐
ния  зон.  Изменение  коэффициента  пог‐
роводниках,  таких  как  GaSe,  кулонов‐
лощения  и  связанное  с  ним  изменение 
ский  электронно‐дырочный  корреляци‐ показателя  преломления  в  GaSe  дает 
онный  эффект  должен  быть  учтен.  Учет  возможность    создание  на  их  основе  по‐
экситонного взаимодействия в конечном  лупроводниковых лазеров.  
итоге приведет к более точному опреде‐
лению нелинейного поглощения.   ЛИТЕРАТУРА 

Эффект  заполнения  зон  наряду  с  нели‐ 1. E.Bringuier,  A.  Bourdon,  N. Piccioli, A.  Chevy  // 
нейным  поглощением  ведет  также  к  Phys. Rev.B 49, 16971  (1994). 
сильной  зависимости  показателя  пре‐ 2. М.Мау,  S.Debrus,  K.Zakrzewska,  H.Benisty, 
A.Chevy // J.Opt. Soc. Amer.B 14,1048(1997). 
ломления   GaSe от интенсивности света. 
3. В.Ю.Рудь,  Ю.В.Рудь  //  Письма  в  ЖЭТФ  23,  13 
На  основе  соотношения  Крамерса– (1997).  
Кронига, зная изменение коэффициента  4. L.E.Rumanev,  A.M.Olmstead,  F.S.Ohuchi  //  J.  of 
поглощения  (Δα),  можно  определить  Vacuum  Science  and  Technology  B: 
изменение показателя преломления (Δn)  Microelectronics  and  Nanometer  structures  16, 
977 (1998). 
для энергии фотонов  hω [12] 
5. M.Caraman,  E.Cuculescu,  I.  Evtodiev  //  J. 

hc Δα ( h ω )
' Optoelect.Advanced Materials 7, 805 (2005). 
   Δn(hω ) =
π ∫ ( hω )
0
' 2
− ( hω ) 2
d (hω ' )   (9)  6. W.Shi, Y.J.Ding // Opt. Lett., 30, 1861 (2005).  
7. М.К.Керимов,  А.Ш.Мехтиев,  В.М.Салманов 
«Современная оптика полупроводников» Изд. 
Вставив  экспериментально  найденные 
Элм, Баку, 2006, 298 c. 
значении  Δα  (см.  рис.1б)  в  формулу  (9) 
8. A.Мiller,  G.Parry,  R.Daley  //  J.  Quantum 
определим  Δn,  результаты  которого  Electron. QE‐20, 710 (1984). 
приведены  на  рис.1,в.  Kак  видно  из  9. P.Vashista,  R.K.Kalia  //  Phys.  Rev.  B  25,  6492 
рисунка  изменение  показателя  прелом‐ (1982). 
ления  ведет  к  нелинейным  эффектам:  10. R.Minder, G.Ottaviani, C.Canali // J. Phys. Chem. 
Solids 37, 417 (1976). 
Δn(ω)  отрицательно  при  частотах  мень‐
11. F.E.Hilinski,  P.A.Lucas,  Ying  Wang  //  J.  Chem. 
ших,  чем  край  полосы  поглощения  и  Phys. 89, 3435 (1988). 
положительно  в  высокоэнергетической  12. N.Peyghambarian,  S.W.Koch,  A.Mysyrovicz 
области.  Отрицательное  изменение  по‐ «Introduction to Semiconductor optics», Series in 
казателя  преломления  под  действием  Solid State physical Electronics, New Jersey,1993, 
p. 325. 
лазерного  света  относится  к  самодефо‐  
кусирующим  оптическим  нелинейност‐  
ям,  тогда  как  положительные  значения   
Δn(ω)  в  высокоэнергетической  области 
запрещенной  зоны  соответствует  само‐
фокусирующим  оптическим  нелиней‐
ностям. 
 

68  Journal of Qafqaz University   
Электронно‐Конформационные Свойства Молекулы Вилон  

 
 
 
ЭЛЕКТРОННО‐КОНФОРМАЦИОННЫЕ СВОЙСТВА 
МОЛЕКУЛЫ ВИЛОН 

Л.С. ГАДЖИЕВА, Л.И. ИСМАИЛОВА 
Бакинский Государственный Университет 
Институт Физических Проблем, 
Баку / АЗЕРБАЙДЖАН 
Larisa_Ismailova@yahoo.com 

РЕЗЮМЕ 
Полуэмпирическими расчетными методами была изучена пространственная и электронная структура 
молекулы  Вилон (Lys‐Glu). С помощью метода  конформационного анализа найдены низкоэнергетические 
конформации молекулы, ее энергетические и геометрические параметры. С помощью квантово‐химичес‐
кого  метода  AM1  определены  распределения  электронной  плотности  и  величины  дипольных  моментов 
молекулы в ее стабильных конформационных состояниях. 
Ключевые слова: конформация, пептид, электронная структура, молекула 

ELECTRON‐CONFORMATIONAL PROPERTIES OF THE VILON MOLECULE 

ABSTRACT 
The  spatial  and  electron  structures  of  the  Vilon  molecule  (Lys‐Glu)    were  investigated  using  semiempirical 
methods.  By  theoretical  conformational  analysis  method  has  been  investigated  the  low‐energy  conformations, 
geometric and energetic parameters of this molecule. By quantum‐chemical method of AM1 has been determined 
sharing electronic density and value of dipole moments of Vilon molecule in stable conformational states.  
Key words:  conformation, peptide, electron structure, molecule 
 
 
работки  сигнальных  пептидных  моле‐
Введение 
кул,  которые  регулируют  созревание  Т‐
Иммунная  система  играет  основную  лимфоцитов.  Поэтому  актуальным  ста‐
роль  в  защите  организма  от  любых  чу‐ новится исследование пространственной 
жеродных  агентов.  В  настоящее  время  структуры пептидов  с высокой биологи‐
известны  3  класса  пептидов,  участвую‐ ческой  активностью.  Известно,  что  био‐
щих  в  процессах    иммунорегуляции  –  логические свойства пептидных молекул 
нейропептиды,  пептиды  тимуса  и  пеп‐ определяются их химическим, простран‐
тиды костного мозга.  ственным  и  электронным  строением. 
Конформационные изменения, флуктуа‐
Тимус,  являясь  ключевым  органом  им‐
ции  заряда  отдельных  полярных  групп 
мунной  системы,  играет  важную  роль  в 
молекулы  играют  важную  роль  в  струк‐
ослаблении  системы  клеточного  и  гумо‐
туре и связывании пептидных молекул. 
рального  иммунитета  в  процессе  старе‐
ния  организма.  Возрастная  инволюция  Синтетические пептиды Вилон (Lys‐Glu) 
тимуса сопровождается сильными функ‐ и  Эпиталон  (Ala‐Glu‐Asp‐Gly)  обладают 
циональными  изменениями  клеток  ти‐ выраженными  иммуногеропротектор‐
муса. Это влечет за собой ослабление вы‐ ными свойствами. Они относятся к клас‐

Number 25, 2009    69
Л.С. Гаджиева, Л.И. Исмаилова 

су пептидных тимомиметиков, обладаю‐ механические  методы  расчета  электрон‐


щих иммуномодулирующим действием.  ной  структуры  пептидов  позволяют  оп‐
Обе  молекулы  идентифицированы  в  ка‐ ределить  эффективные  заряды  на  ато‐
честве  фрагментов  в  различных  белко‐ мах, дипольные моменты молекулы. 
вых  молекулах.  Установлено,  что  эти 
синтетические  пептиды  стимулируют  Результаты и их обсуждение 
процессы регенерации, ускоряют зажив‐ С  помощью  метода  теоретического  кон‐
ление  ран,  способствуют  восстановле‐ формационного  анализа  для  дипептид‐
нию  клеточного  метаболизма  в  лимфо‐ ной  молекулы  Вилон  был  проведен 
цитах,  тормозят  развитие  спонтанных  и  расчет  пространственной  структуры  в 
индуцированных  опухолей  у  животных  рамках  механической  модели  молекул  с 
[1,2].  Клинические  испытания  показали,  учетом  невалентных,  электростатических 
что  инъекции  вилона  ускоряют  процесс  и  торсионных  взаимодействий  и  энер‐
регенерации  тканей  и  восстанавливают  гии  водородных  связей.  Были  найдены 
функции организма [3].  низкоэнергетические  конформации,  зна‐
Целью  данного  исследования  является  чения  двугранных  углов  основной  и  бо‐
определение  электронно‐конформацион‐  ковых  цепей  аминокислот,  входящих  в 
ных  свойств  молекулы  Вилон,  которая  молекулу.  При  этом  оценивалась  энер‐
гия  внутри  ‐  и  межостаточных  взаимо‐
включает  два  аминокислотных  остатка 
действий  в  каждой  пространственной 
Lys  и  Glu.  Конформационные  измене‐
структуре. 
ния  могут  приводить  к  различной  вза‐
имной  ориентации  отдельных  участков  В  молекуле  Вилон  обе  аминокислоты 
молекулы,  к  различиям  энергетических  являются  полярными  остатками  с  объ‐
характеристик  функциональных  групп  емными  и  конформационно  лабильны‐
молекулы.  Существует  необходимость  ми  боковыми цепями. Боковая цепь ли‐
проверки утверждения, что при конфор‐ зина  несет  положительный  заряд,  а  бо‐
мационных  превращениях  вариации  ковая  цепь  глутаминовой  кислоты  яв‐
зарядов на некоторых атомах пептидной  ляется  ионизированной  с  отрицатель‐
молекулы  могут  быть  значительными,  ным  зарядом  на  атомах  кислорода  кар‐
что  идет  в  разрез  с  существующими  в  боксила. Присутствие заряженных боко‐
настоящее время методами молекулярно‐ вых цепей должно сказаться на   величи‐
динамического  моделирования  свойств  нах  вкладов  электростатических  взаимо‐
биоорганических систем. В этих методах   действий в молекуле. 
анализ  пространственной  структуры  и 
динамики макромолекул основан на эм‐ Конформационные  возможности  ами‐
пирических  моделях,  в  которых  заряды  нокислоты  лизин  определяются  тремя 
на  атомах  являются  величинами    посто‐ двугранными  углами  основной  цепи  φ, 
ψ,  ω    и  пятью  углами  χ1,  χ2,  χ3,  χ4  и  χ5 
янными  и  не  зависят  от  конформаций 
боковой  цепи,  а  конформационные 
молекул.  Поэтому  выяснение  взаимо‐
свойства глутаминовой кислоты   углами 
связи конформационных и электронных 
основной  цепи  φ,  ψ,  ω    и  тремя  углами 
аспектов  пептидных  молекул  на  сегод‐
χ1,  χ2  и  χ3  боковой  цепи.  Молекула 
няшний  день  представляет  особый  ин‐
Вилон  включает  в  себя    40  атомов  и  13 
терес.  Полуэмпирический  метод  моле‐
переменных двугранных углов вращения.  
кулярной  механики  позволяет  оценить 
конформационные  возможности  пеп‐ Формы  остатков  определялись  низко‐
тидной молекулы, а надежные квантово‐ энергетическими  областями  B,  R  и  L  

70  Journal of Qafqaz University   
Электронно‐Конформационные Свойства Молекулы Вилон  

двугранных  углов  основной  цепи  φ‐ψ.  ранных  углов  боковой  цепи  χ1,  χ2,  χ3  
При  расчете  были  рассмотрены  все  раз‐ задавались  три  возможных  значения  60, 
вернутые  формы  дипептидной  молеку‐ 180  и  ‐60º, а  для  углов  χ4  и  χ5‐180º.  Угол 
лы  (BB,  BR,  LB,  LR)  и  свернутые  формы  χ1  боковой цепи глутаминовой кислоты 
основной  цепи  (RB,  RR,  BL).  В  развер‐ задавался    60,  180  и  ‐60º,    для  угла    χ2 
нутых  формах  основной  цепи  боковые  задавалось  значение  180º,  а  для  угла    χ3 
цепи  остатков  Lys  и  Glu  находятся  по  значение  90º.  Расчет  всех  семи  возмож‐
разные  стороны,  поэтому  эффективны‐ ных  форм  основной  цепи  дипептидной 
ми  оказываются  взаимодействия  боко‐ молекулы  позволил  определить  низко‐
вых  цепей  аминокислотных  остатков  с  энергетические  структуры  молекулы. 
участками  основной  цепи  молекулы.  В  Все  конформации  попадают  в  энергети‐
случае же свернутых структур, сближен‐ ческий  интервал  от  ‐11ккал/моль  до  4 
ными оказываются боковые цепи амино‐ ккал/моль. 
кислотных  остатков,  входящих  в  эту  мо‐
Энергетические  параметры,  вклады  не‐
лекулу,  поэтому  здесь  эффективными 
валентных,  электростатических,  торсион‐
являются  взаимодействия  между  боко‐
ных  взаимодействий,  а  также  вклады 
выми цепями и взаимодействия боковых 
внутри  и  межостаточных  взаимодейст‐
цепей между собой.  
вий для некоторых низкоэнергетических 
Конформационное  состояние  каждого  конформаций    молекулы  Вилон  пред‐
аминокислотного  остатка  обозначалось  ставлены  в  таблице  2,  а  значения  гео‐
символом  Xіј  ,  где  X  означает  одну  из  метрических параметров (значения двуг‐
возможных форм основной цепи  B, R, L,  ранных углов основной и боковых цепей 
P,  а  индексы  іј    =  11…,  12…,13…,  21…и  молекулы) приведены в таблице 3.  
т.д.  обозначают  положение  углов  боко‐
Таблица 1.  Начальные  приближения  аминокис‐
вой цепи  χ1, χ2, χ3... При этом индекс 1 
лотных остатков  Lys и Glu молекулы 
соответствует значению угла χ в области  Вилон 
0  −120º,  2  −  120  −  ‐120º,  3  −  ‐120  ‐  0º.  В 
                   LYS  φ  ψ  χ1 
качестве  начальных  приближений  при 
R  ‐110   ‐50     60 
расчете  конформационных  возможнос‐
  ‐110   ‐60   180 
тей  молекулы  рассматривались  извест‐
  ‐115   ‐60    ‐60 
ные  значения  двугранных  углов  основ‐ B  ‐120  150     60 
ной  цепи  и  боковых  цепей  молекулы,    ‐120  115   180 
соответствующих  низкоэнергетическим    ‐120  100    ‐60 
состояниям  монопептидов  Lys  и  Glu  L     40    60     60 
(табл.1). Отсчет двугранных углов прово‐      60    70   180 
дился  согласно  общепринятой  номен‐      60    70    ‐60 
клатуре [4]. В проведенном расчете была  GLU  φ  ψ  χ1 
использована  сервисная  программа  для  R    ‐90   ‐40     60 
  ‐100   ‐60   180 
изучения  пространственного  строения 
  ‐100   ‐60   ‐60 
биомолекул [5]. 
B  ‐150  150    60 
Исходные приближения для расчета кон‐   ‐100  140  180 
формационных  состояний  молекулы    ‐100  140   ‐60 
Вилон  составили  свыше  500  различных  L     50    50    60 
вариантов.  При  расчете  конформацион‐      60    60  180 
     60    60   ‐60 
ных  возможностей  остатка  Lys  для  двуг‐

Number 25, 2009    71
Л.С. Гаджиева, Л.И. Исмаилова 

Определенные  нами  геометрические  и  что  основной  вклад  принадлежит  дис‐


энергетические  параметры  низкоэнер‐ персионным  и  электростатическим  
гетических  конформаций  молекулы  Ви‐ взаимодействиям.   В данной конформа‐
лон  дают  полную  информацию  о  прос‐ ции  образуются  две  водородные  связи 
транственной  структуре  дипептидной  между  атомами  водорода  боковой  цепи 
молекулы.  Самой  низкоэнергетической  Lys  и  карбоксильной  группой    С‐конца 
конформацией  молекулы  является   молекулы   (расстояние водородной свя‐
L21222  R321 (общая энергия составляет ‐ зи  1,9  Å,  энергия    составляет  ‐1,0  ккал/ 
10,9 ккал/моль). Вклад невалентных взаи‐ моль).  Расстояния  между  начальным 
модействий  в  данной  пространственной  атомом  азота  основной  цепи  Lys  и  ато‐
структуре  составляет  ‐8,1  ккал/моль,  мом  кислорода  С‐конца  Glu  составляет 
электростатических взаимодействий сос‐ 5,7 Å, а между азотом боковой цепи  Lys 
тавляет  ‐4,9  ккал/моль,  а  торсионных  и  углеродом  боковой  цепи  Glu  состав‐
взаимодействий  2,1  ккал/моль.  Видно,  ляет 7,1Å. 

Таблица 2. Энергетические характеристики низкоэнергетических конформаций молекулы Вилон 

№  Шейп  Конформация  Енев  Еэл  Еторс  Е1  Е2  Е1‐2  Еотн 


1  e  B21222 B321  ‐8,2  ‐5,0  2,5  3,4  8,2  ‐24,9  0,3 
2    B23222 B321  ‐7,5  ‐5,1  2,1  3,0  8,2  ‐23,8  0,5 
3    B21222 R321  ‐8,3  ‐4,8  2,3  3,0  8,0  ‐24,9  0,1 
4    B23222 R321  ‐7,5  ‐4,8  2,4  2,9  8,9  ‐24,1  1,1 
5    L21222 R321  ‐8,1  ‐4,9  2,0  3,0  8,9  ‐24,9  0,0 
6    L23222 B221  ‐6,9  ‐4,3  2,0  2,9  8,4  ‐33,5  1,7 
7  f  R22222 B321  ‐8,3  ‐3,9  2,5  2,8  8,3  ‐23,2  1,3 
8    R22222 R321  ‐7,8  ‐3,2  2,1  2,5  8,7  ‐22,4  1,9 
9    B22222 L321  ‐6,9  ‐1,5  1,4  1,3  8,5  ‐18,3  3,9 

Таблица 3. Геометрические параметры низкоэнергетических конформаций молекулы Вилон 

Углы  B21222B321  B21222R321  L21222R321  L23222B221  R23222B121  R22222R321  B22222L321 


ϕ1  ‐58  ‐59  61  64  ‐48  ‐50  ‐68 
χ   11 166  165  167  ‐164  ‐171  179  176 
χ12  54  58  54  ‐68  ‐80  ‐159  177 
χ   13 178  ‐178  180  ‐169  ‐163  169  178 
χ14  162  165  168  ‐176  180  ‐171  179 
χ15  177  178  179  175  181  ‐179  180 
ψ1  104  112  110  110  ‐65  ‐70  117 
ω1  170  171  172  176  179  ‐175  179 
ϕ2  ‐125  ‐99  ‐100  ‐119  ‐133  ‐107  53 
χ21  ‐59  ‐60  ‐60  ‐176  62  ‐57  ‐58 
χ22  179  179  179  179  ‐176  ‐179  178 
χ   23 90  90  89  90  85  83  91 
ψ2  68  ‐50  ‐44  81  146  ‐46  54 
Еотн  0,3  0,1  0,0  1,7  1,3  1,9  3,9 
 

Как следует из табл.1 и 2, конформации  формации  со  свернутой  формой  основ‐


с полностью развернутой основной цепью  ной  цепи.  Основной  стабилизирующий 
дипептидной  молекулы  являются  энер‐ вклад  вносят  невалентные  и  электроста‐
гетически  предпочтительнее,  чем  кон‐ тические взаимодействия, а также вклад 

72  Journal of Qafqaz University   
Электронно‐Конформационные Свойства Молекулы Вилон  

от межостаточных взаимодействий меж‐ тронов  при  фиксированных  координа‐


ду  участками  основной  цепи  и  боковы‐ тах ядер атомов. Общий заряд молекулы 
ми  цепями  остатков  лизина  и  глутами‐ Вилон  при  расчетах  в  основном  сос‐
новой кислоты.  тоянии  брался  равным  нулю.  Рассчиты‐
вались  полная  энергия,  энергия  связы‐
Представляет  особый  интерес  изучение 
вания,  электронная  энергии  молекулы, 
того,  как  меняются  заряды  на  атомах  в 
дипольные  моменты  и  распределение 
молекуле  при  конформационных  изме‐
зарядов  на  атомах  аминокислот  пеп‐
нениях пространственной структуры пеп‐
тидной  молекулы  в  разли  чных  низко‐
тидной  молекулы  Вилон.  Семь  стабиль‐
энергетических конформациях. При рас‐
ных пространственных структур этой мо‐
чете электронной структуры пептида са‐
лекулы  послужили  основой  для  опреде‐
мосоглование  в  различных  низкоэнерге‐
ления  электронной  структурыы.  Расчет 
тических  конформациях  было  достиг‐
был проведен с использованием полуэм‐
нуто  на    43,  41,  42  ,  43  ,  41,  43  и  39  ите‐
пирического  квантово‐химического  ме‐
рациях  для  семи  низкоэнергетических 
тода АМ1, в расчетах использовалась де‐
структур,  соответственно.  Дипептидная 
монстрационная версия комплекса кван‐
молекула  включала  110  электронов,  97  
тово‐химических  программ  HyperChem 
орбиталей.  Энергетические  вклады  пол‐
(сайт http://www.hyper.com [6]). 
ной  энергии,  энергии  связывания,  элек‐
Современные  полуэмпирические  мето‐ тронной энергии, энергии ядерных взаи‐
ды  нулевого  дифференциального  перек‐ модействий  и  энергии  теплообразова‐
рывания  основаны  на  валентном  приб‐ ния  при  переходе  от  одной  конформа‐
лижении,  когда  при  расчете  валентных  ции к другой представлены в таблице 4. 
электронов  электроны  внутренних  обо‐
Как  видно  из  данной  таблицы,  конфор‐
лочек  включаются  в  остов  молекулы. 
мация  (Еотн=0.0ккал/моль)  характеризу‐
Среди них выделяют метод АМ1 (Austin 
Model),  наиболее  точный  метод  для  вы‐ ется  низкими  значениями  энергетичес‐
числения  электронной  структуры  и  ких  параметров  молекулы.  Изменение 
оптимизации  геометрии.  Электронная  этих параметров при переходе от одной 
структура  пептидной  молекулы  нами  конформации к другой дает общую кон‐
находилась  в  процессе  оптимизации  формационно‐электронную  картину  ст‐
электронной  энергии  валентных  элек‐ руктуры дипептидной молекулы Вилон. 

Таблица 4. Энергетические характеристики (ккал/моль) конформаций молекулы Вилон 

Конформация  Еотн  Епол  Есв  Еэлек  Еядер  Етеп 


B21222 B321  0,3  ‐138652  ‐10099  ‐658273  519620  ‐6498 
B21222 R321  0,1  ‐138045  ‐9492  ‐662383  524338  ‐6506 
L21222 R321  0,0  ‐138737  ‐10116  ‐662813  517089  ‐6502 
L23222 B221  1,7  ‐138649  ‐10096  ‐657056  518406  ‐6496 
R22222 B321  1,3  ‐138671  ‐10118  ‐670163  531492  ‐6501 
R22222 R321  1,9  ‐137650  ‐9098  ‐671038  533387  ‐6509 
B22222 L321  3,9  ‐138493  ‐10108  ‐666723  533592  ‐6498 
    

Значения  дипольных  моментов  в  раз‐ ние  электронного  облака  в  семи  струк‐


личн‐ых  низкоэнергетических  конфор‐ турах  приводит  к  различным  диполь‐
мациях  дипептидной  молекулы    пред‐ ным  моментам  дипептида,  причем  в 
ставлены  в  таблице  5.  Перераспределе‐ данной таблице прослеживается некото‐

Number 25, 2009    73
Л.С. Гаджиева, Л.И. Исмаилова 

рая  закономерность:  с  увеличением  от‐ Таблица 5. Значения дипольных моментов низко‐


энергетических конформаций молекулы Вилон 
носительной  конформационной  энер‐
гии  молекулы  Вилон  значения  ее  ди‐ Конформация  Дипольный момент, Дб 
польных моментов также увеличиваются.  X  Y  Z  Полный 
B21222 B321  40,7  50,6  ‐7,4  52,9 
В семи отобранных низкоэнергетических  B21222 R321  41,3  45,5  ‐14,0  51,7 
структурах  были  рассчитаны  значения  L21222 R321  ‐17,4  ‐8,5  ‐21,4  28,0 
эффективных  зарядов  на  атомах  амино‐ L23222 B221  ‐50,1  ‐9,1  ‐35,8  53,6 
кислотных  остатков  молекулы  Вилон  R22222 B321  44,3  24,5  15,4  62,3 
R22222 R321  43,4  23,0  16,4  62,9 
(таблица 6). 
B22222 L321  49,0  19,6  8,8  65,4 
   

Таблица 6.  Эффективные  заряды  на  атомах  молекулы  Вилон  в  различных  низкоэнергетических  конфор‐


мациях 
Остаток  Атомы  Конформации 
B21222 B321  B21222 R321  L21222 R321  L23222 B221  R22222 B321  R22222 R321  B22222 L321
Lys1  N  ‐0,035  ‐0,039  ‐0,038  ‐0,037  ‐0,035  ‐0,025  ‐0,036 
  CA  ‐0,150  ‐0,150  ‐0,161  ‐0,150  ‐0,157  ‐0,169  ‐0,149 
  HA  0,129  0,137  0,125  0,124  0,141  0,118  0,130 
  C  0,213  0,230  0,247  0,212  0,216  0,229  0,222 
  O  ‐0,397  ‐0,383  ‐0,401  ‐0,401  ‐0,365  ‐0,314  ‐0,385 
  CB  ‐0,156  ‐0,162  ‐0,163  ‐0,157  ‐0,167  ‐0,159  ‐0,160 
  HB  0,071  0,072  0,071  0,071  0,074  0,065  0,071 
  HB  0,118  0118  0,070  0,117  0,105  0,121  0,100 
  CG  ‐0,153  ‐0,156  ‐0,159  ‐0,156  ‐0,152  ‐0,153  ‐0,150 
  HG  0,151  0,163  0,147  0,148  0,148  0,160  0,149 
  HG  0,120  0,103  0,097  0,096  0,097  0,091  0,111 
  CD  ‐0,183  ‐0,180  ‐0,177  ‐0,181  ‐0,190  ‐0,186  ‐0,180 
  HD  0,084  0,104  0,079  0,084  0,086  0,083  0,080 
  HD  0,103  0,100  0,094  0,101  0,111  0,114  0,101 
  CQ  ‐0,157  ‐0,162  ‐0,191  ‐0,165  ‐0,147  ‐0,149  ‐0,158 
  HQ  0,159  0,164  0,139  0,154  0,178  0,184  0,158 
  HQ  0,143  0,141  0,126  0,137  0,142  0,146  0,141 
  NE  ‐0,046  ‐0,046  ‐0,071  ‐0,051  ‐0,046  ‐0,045  ‐0,045 
  HE1  0,222  0,213  0,164  0,207  0,251  0,251  0,215 
  HE2  0,215  0,203  0,163  0,203  0,238  0,235  0,220 
  HE3  0,222  0,210  0,168  0,209  0,258  0,251  0,222 
Glu2  N  ‐0,254  ‐0,240  ‐0,270  ‐0,267  ‐0,284  ‐0,286  ‐0,220 
  H  0,214  0,219  0,210  0,213  0,159  0,192  0,160 
  CA  ‐0,035  ‐0,014  ‐0,029  ‐0,042  ‐0,035  ‐0,014  ‐0,017 
  HA  0,121  0,093  0,084  0,121  0,129  0,086  0,095 
  C  ‐0,260  ‐0,297  ‐0,192  ‐0,260  ‐0,233  ‐0,297  ‐0,201 
  O  ‐0,121  ‐0,088  ‐0,178  ‐0,121  ‐0,135  ‐0,177  ‐0,101 
  CB  ‐0,136  ‐0,127  ‐0,137  ‐0,136  ‐0,138  ‐0,128  ‐0,135 
  HB  0,070  0,057  0,069  0,070  0,038  0,029  0,071 
  HB  0,085  0,089  0,094  0,085  0,079  0,064  0,069 
  CG  ‐0,241  ‐0,234  ‐0,231  ‐0,241  ‐0,243  ‐0,233  ‐0,240 
  HG  0,114  0,016  0,056  0,114  0,123  0,121  0,096 
  HG  0,063  0,014  0,054  0,063  0,066  0,091  0,076 
  CD  0,332  0,369  0,334  0,332  0,331  0,329  0,329 
  OD1  ‐0,570  ‐0,577  ‐0,572  ‐0,570  ‐0,571  ‐0,571  ‐0,573 
  OD2  ‐0,586  ‐0,586  ‐0,578  ‐0,586  ‐0,608  ‐0,609  ‐0,607 

74  Journal of Qafqaz University   
Электронно‐Конформационные Свойства Молекулы Вилон  

Квантово‐химические  расчеты  низко‐ реляционных эффектов в динамике пеп‐


энергетических конформаций молекулы  тидной молекулы. 
Вилон  показали,  что  конформационные   
изменения  в  различных  пространствен‐ ЛИТЕРАТУРА 
ных  структурах  молекулы  сопровожда‐ 1. Щербак  В.А.,  Кузник  Б.И.,  Витковский  Ю.А. 
ются  изменениями  величины  диполь‐ Цитокинины и воспаление, 2005, №2, с.46‐49 
ного  момента  молекулы.  При  этом  при  2. Рыжак  Г.А.,  Алехова  Т.М.,  Бахидзе  Е.В.  II 
переходе  между  низкоэнергетическими  Российский симпозиум по химии и биологии 
пептидов, 2005,Санкт‐Петербург, с.106 
конформациями молекулы имеют место 
3. Колодин  В.И.,  Кузнецов  О.Н.  Вопросы 
флуктуации  плотности  зарядов  на  стро‐
онкологии, 1995, т.21, №9, с.65‐71 
го определенных группах атомов, в част‐
4. IUPAC‐IUB  Quantity,  Unit  and  Symbols  in 
ности, в боковой цепи аргинина и глута‐ Physical  Chemistry,  Blackwell  Scientific  Publi‐
миновой  кислоты.  Такие  дифференци‐ cations, Oxford, 39 
рованные электронно‐конформационные  5. Maksumov  I.S.,  L.I.  Ismailova,  N.M.  Godjaev    J. 
взаимодействия  могут  оказаться  важны‐ Struc. Chem., 1983, т.24, №4, с.147 ‐148   
ми  источниками  дополнительных  кор‐ 6. http://www.hyper.com 
 
  

Number 25, 2009    75
 
 
 
ДЕПОНИРОВАНИЕ И ТРАНСПОРТ ОКСИДА АЗОТА В 
БИОЛОГИЧЕСКИХ СИСТЕМАХ  

И.С. КУРБАНОВ 
Губинский Региональный Центр Аграрной науки, 
Баку / АЗЕРБАЙДЖАН 
qubatimiryazev@mail.ru 

РЕЗЮМЕ 
На основе обзора работ, посвященных биологической роли оксида азота проанализированы биохими‐
ческие  механизмы  его  образования,  депонирования  и  транспорта  в  биосистемах.  Приведены  данные  по 
исследованию  пространственной  и  электронной  структуры  динитрозильных  комплексов  негемового 
железа (комплексов 2,03), фрагмента внеклеточного каталитического домена фермента гуанилатциклазы и 
описаны квантово‐химические аспекты взаимодействия оксида азота с гемовым компонентом белков. 
Ключевые  слова:  оксид  азота;  комплексы  2,03;  гуанилатциклаза;  каталитический  домен;  структура; 
молекулярная динамика; квантово‐химические расчеты 

NITROGEN OXIDE DEPOSITION AND TRANSPORT IN BIOLOGICAL SYSTEMS  

ABSTRACT 
Investigations  dedicated  to  biological  role  and  description  of  the  physiological  effects  of  the  action  of  the 
nitrogen oxide are briefly reviewed. The biochemical mechanisms of formation and the methods of the nitrogen 
oxide  deposition  in  the  cell  are  examined.  Data  on  a  study  of  the  three‐dimensional  and  electron  structure  of 
complexes  2,03,  the  extracellular  catalytic  domain  of  the  guanylate  cyclase  ferment  are  cited  and  the  quantum‐
chemical aspects of interaction of the nitrogen oxide with the heme components of proteins are described. 
Key words: nitrogen oxide; complexes 2,03; guanylate cyclase; catalytic domain; structure; molecular  dynamics 
simulations; quantum‐chemical calculations 

 
 
Оксид  азота  (NO)‐небольшое  газообраз‐ клеточные  мембраны.  Время  жизни  ок‐
ное соединение, которое является внутри‐  сида  азота  составляет  ~6‐10  сек,  после 
и межклеточным мессенджером и участ‐ чего  он  превращается  в  нитраты  и  нит‐
вует  в  регуляции  разнообразных  мета‐ риты  при  участии  кислорода  и  воды.  
болических  реакций,  обеспечивающих  Радиус  действия  NO  в  тканях  не  превы‐
жизнеспособность  и  функциональную  шает  500  мкм.  Однако  при  определен‐
активность  клеток  и  всего  организма  в  ных  условиях  оксид  азота  способствует 
целом  [1‐15].  Благодаря  наличию  неспа‐ формированию  патологических  процес‐
ренного  электрона  на  2ρ‐π  орбитали,  сов  и  возникновению  ряда  серьезных 
оксид  азота  проявляет  высокую  реак‐ заболеваний.  Двоякое  действие  оксида 
ционную способность. NO хорошо раст‐ азота    реализуется  в  зависимости  от  его 
ворим в воде и липидах, имеет наиболее  концентрации,  времени  воздействия  и 
высокий  по  сравнению  с  другими  моле‐ условий  обмена  в  различных  типах  кле‐
кулами  коэффициент  диффузии,  легко  ток  и  тканей  организма  (рис.1).  Чрез‐
и  беспрепятственно  проникает  через  мерное  накопление  NO  в  организме  иг‐

76  Journal of Qafqaz University
Депонирование и Транспорт Оксида Азота в Биологических Системах 

рает ведущую роль в развитии таких па‐ Каролины  (США)  синтезировали  нано‐


тологий,  как  нарушение  тонуса  и  пов‐ частицы  диоксида  кремния    размером 
реждение  сосудов,  шока,  диабет,  воспа‐ 136 нм, содержащие NO в [16] и исполь‐
лительные,  аутоиммунные  и  вызванные  зовали  такой  нанокомплекс  в  качестве 
тканевой несовместимостью заболевания.  антибактериального препарата для борь‐
Оно  приводит  к  угнетению  пролифера‐ бы  с  синегнойной  палочкой  Pseudomonas 
ции  и  увеличению  частоты  апоптоза  aeruginosa  in  vitro.  Эксперименты  пока‐
лимфоцитов  и  макрофагов,  а  следова‐ зали, что при этом, ни сами по себе час‐
тельно,  развитию  вторичных  иммуноде‐ тицы,  ни  выделяемый  ими  оксид  азота 
фицитов. Одним из нежелательных пос‐ не наносят вреда фибробластам мыши.  
ледствий  накопления  NO  в  организме 
Оксид азота образуется в организме жи‐
является  усиление  эндогеного  синтеза 
вотных  и  человека  из  L‐аргинина  в  ре‐
канцерогенных  N‐нитрозосоединений. 
зультате  окисления  кислородом  при 
Поэтому  снижение  содержания  NO  в 
участии фермента нитрооксидсинтетазы 
организме  может  быть  эффективным 
[2,3].  На  сегодняшний  день  охарактери‐
при  лечении  указанных  патологий.  Для 
зованы  на  молекулярном  уровне  три 
достижения  такого  результата  обычно 
изоформы  нитрооксидсинтетазы  (NOS): 
пробуют  использовать  препараты,  ко‐
нейрональная  (nNOS,  NOS1),  индуци‐
торые  ингибируют  индукцию  и  актив‐
бельная  (iNOS,  NOS2),  она  же  макро‐
ность  NO‐синтаз,  а  также  эндогенные 
фагальная,  и  эндотелиальная  (eNOS, 
«ловушки»  NO,  например,  оксигемогло‐
NOS3).  
бин. Но эти препараты зачастую токсич‐
ны, вызывают побочные эффекты или не  Нейрональная  и  эндотелиальная  изо‐
приводят к ожидаемым результатам.   формы  являются  конститутивными  и 
поддерживают  низкий  стационарный 
уровень NO, который не превышает нес‐
кольких  микромолей  и  необходим  для 
нейротрансмиссии,  поддержания  элек‐
трической  активности  нервных  клеток. 
Благодаря стационарному уровню оксид 
азота  участвует  в  сохранении  долговре‐
менной памяти, вазорелаксации, агрега‐
  ции  тромбоцитов,  секреции  гормонов, 
регуляции  почечной  гемодинамики, 
Рис. 1.  Схема, иллюстрирующая функциональную 
электролитного  баланса  и  других  фи‐
активность оксида азота 
зиологических  процессах.  Индуцибель‐
Учитывая  изложенное,  представляется  ная  форма  экспрессируется  во  многих 
особенно перспективным создание лечеб‐ клетках, в том числе в макрофагах, эози‐
ных препаратов, которые могли бы кон‐ нофилах,  лимфоцитах  и  гладкомышеч‐
курировать  в  организме  за  связывание  ных  клетках  после  иммунологических 
NO  с  гемоглобином,  белками,  содержа‐ стимулов  и  при  воспалении,  под  дей‐
щими негемовое железо, а также парные  ствием  медиаторов  этого  процесса  – 
SH‐группы и низкомолекулярные железо‐ цитокинов  и  под  действием  эндотокси‐
тиоловые комплексы. Для предотвраще‐ нов.  При  участии  этой  формы  образу‐
ния  реакционной  способности  оксида  ется  большое  количество  NO,  которое 
азота  ученые  из  университета  Северной  составляет сотни микромолей и поддер‐

Number 25, 2009    77
И.С. Курбанов 

живается  в  течение  от  нескольких  часов  действие  NO  реализуется  через  S‐,  N‐  и 
до  нескольких  дней,  что  зависит  от  дли‐ O‐нитрозирование,  при  котором  катион 
тельности  стимула.  Синтез  NO  значи‐ нитрозония  (NO+)  присоединяется  к 
тельно  усиливается  под  влиянием  гор‐ аминам,  тиолам  или  гидроксильным 
монов, нейромедиаторов, в ответ на дей‐ группам ароматических соединений, че‐
ствие микроорганизмов, вирусов и   дру‐ рез  нитрование,  осуществляемое  путем 
гих чужеродных агентов.  присоединения  нитро  группы  (NO2)  к 
биомолекулам  (наиболее  чувствительны 
Условно  характер  влияния  NO  на  раз‐
к  нитрованию  ароматические  кольца,  в 
личные биохимические и физиологичес‐
частности,  тирозина),  а  также  через 
кие  процессы  разделяют  на  прямое  и 
окисление  или  гидроксилирование  био‐
непрямое.  Прямое  влияние  осуществл‐
молекул.  Соотношение  между  перечис‐
яется при непосредственном взаимодей‐
ленными типами модификаций  биосуб‐
ствии  NO  с  биомолекулами.  Основной 
стратов  и  их  выраженность  зависит  от 
мишенью  при  этом  служит  гемовое  же‐
условий  метаболизма,  прежде  всего 
лезо  гемопротеинов  (гемоглобина,  мио‐
окислительно‐восстановительного  потен‐
глобина,  гуанилатциклазы,  цитохрома 
циала,  рН  и  баланса  между  образова‐
Р‐450,  NO‐синтаз  (NOS)  и  др.).  NO  взаи‐
нием  NO  и  ROS  в  клеточных  компарт‐
модействует  также  с  негемовым  желе‐
ментах.  
зом,  входящим  в  состав  железосерных 
белков  и  нуклеиновых  кислот  и  свобод‐ Прямое  и  непрямое  действие  NO  в  кле‐
ным железом (Fe3+). Мишенями прямого  точных  компартментах  происходит  од‐
действия  NO  являются  Cu  и  Zn,  входя‐ новременно,  но  выражено  неодинаково 
щие  в  состав  ферментов,  и  высокоэнер‐ из‐за  различий  в  синтезе  NO  и  О2‐,  а 
гетические  свободные  радикалы  (ради‐ также  потому,  что  О2‐  в  силу  различия 
калы  с  углеродным  центром,  липидные,  заряда плохо диффундирует сквозь мем‐
диоксида  азота).  Прямые  эффекты  NO  браны. 
доминируют  в  организме  при  физиоло‐ Молекула NO может существовать в раз‐
гических  условиях,  когда  эта  молекула  ных  электронных  состояниях:  1)  относи‐
синтезируется,  преимущественно  конс‐ тельно стабильный нейтрально заряжен‐
титутивными  формами  NOS  в  низких  ный радикал  (NO•); 2) при присоедине‐
количествах.  Благодаря  прямому  дейст‐ нии  одного  электрона  он  восстанавли‐
вию  NO,  осуществляются  главным  об‐
вается  до  (NO–)  нитроксил‐аниона;  3) 
разом  его  регуляторные  и  сигнальные 
при  потере  одного  электрона  он  может 
функции. 
трансформироваться  в  ион  нитрозония 
Непрямое действие оксида азота опосре‐ (NO+)  [17].  Каждая  из  описанных  форм 
дуется  через  его  реактивные  формы  NO  имеет  свои  клеточные  мишени  и, 
(RNOS),  являющиеся  продуктом  реак‐ соответственно, играет различные роли в 
ции  NO  с  О2,  О2‐  или  Н2О2.  В  образова‐ клеточных процессах.  
нии RNOS могут принимать также учас‐
В настоящее время считается установлен‐
тие  переходные  металлы.  Непрямое 
ным, что существуют три типа химичес‐
влияние  NO  проявляется  при  увеличе‐
ких  мишеней  оксида  азота  в  клетках  и 
нии его синтеза, связанного с индукцией 
тканях [17]: 
NOS2,  которая  наблюдается  при  воспа‐
лительных процессах различной этиоло‐ 1. Гемовые  группы  белков,  связываю‐
гии  и  сочетается  с  образованием  реак‐ щие NO с образованием гем‐нитрозиль‐
тивных  форм  кислорода.  Непрямое  ных комплексов; 

78  Journal of Qafqaz University   
Депонирование и Транспорт Оксида Азота в Биологических Системах 

2. Негемовое  железо,  образующее  с  NO 


динитрозильные  комплексы  железа 
(ДНКЖ): (RS−)2Fe2+(NO+)2; 
3. Тиоловые группы, способные присое‐
динять  ион  нитрозония  (NO+)  с  образо‐
ванием S−нитрозотиолов: RS−NO. 
Способность  NO  непосредственно  взаи‐
модействовать  с  железом  обусловливает 
его  многие  физиологические  и  токси‐
ческие  эффекты.  NO  обратимо  связы‐
вается  с  гемовым  железом  гуанилатцик‐
лазы,  циклооксигеназы,  каталазы,  ли‐
поксигеназ, NO‐синтаз, цитохрома Р‐450 
и  пероксидаз,  цитохромов  электрон‐
транспортной  цепи  митохондрий,  а 
также  с  гемовым  железом  оксигемог‐
лобина.  В  этом  ряду  ферменов  исклю‐
чительно  важная  роль  принадлежит 
гуанилатциклазе.  Гуанилатциклаза  (ГЦ, 
КФ  4.6.1.2)  принадлежит  семейству 
ферментов, катализирующих превраще‐
ние гуанизинтрифосфата (ГТФ) в цикли‐
ческий  гуанозинмонофосфат  (цГМФ) 
[18‐23].  Стимуляция  гуанилатциклазы  и 
аккумуляция  цГМФ  регулирует  целый 
комплекс  сигнальных  превращений  с 
Рис.2   (а)  Структура  мономера  доменной  струк‐
участием  промежуточных  сопутствую‐ туры  ГЦ;  (б)  Структура  каталитического 
щих эффекторов−цГМФ‐зависимой про‐ домена ГЦ [24] 
теинкиназы,  цГМФ‐регулирующих  фос‐
фодиэстераз  и  ионных  каналов.  Гуани‐ Согласно современным представлениям, 
латциклазы  играют  ключевую  роль  в  активация  гуанилатциклазы  оксидом 
регуляции  разнообразных  патофизио‐ азота обусловлена взаимодействием  NO 
с  железом  гема,    входящего  в  молекулу 
логических  процессов;  они  участвуют  в 
фермента.  Известно,  что  непосредствен‐
синтезе  цГМФ  в  ответ  на  различные 
ным  предшественником  гема  в  организ‐
сигналы,  такие  как  оксид  азота,  пеп‐
ме  является  протопорфирин  IX,  кото‐
тидные  гормоны,  бактериальные  токси‐
рый  и  является  активатором  фермента 
ны,  свободные  радикалы  и  потоки  внут‐
[25,26]. Введение железа в порфириновое 
риклеточных  ионов  кальция.    В  работе  кольцо приводит к образованию ферро‐
[24]  была  установлена  кристаллическая  протопорфирина  IX  или  гема,  являю‐
структура каталитического домена ГЦ из  щегося  ингибитором  фермента.  Этой 
зеленой  водоросли  Chlamydomonas  реакции  придается  важное  значение  в 
reinhardtii с  разрешением   2.55 Å и пока‐ эндогенной регуляции растворимой гуа‐
зано, что ГЦ является димером (рис.2).  нилатциклазы. При взаимодействии NO 

Number 25, 2009    79
И.С. Курбанов 

с  железом  гема  железо  выступает  из 


плоскости  порфиринового  кольца  и 
структура  образовавшегося  комплекса 
нитрозил‐гем приближается к структуре 
протопорфирина  IX‐одного  из  сильных 
активаторов  фермента.  Следовательно, 
истинным  активатором  гуанилатцик‐
лазы  является  нитрозил‐гемовый  комп‐
лекс. Лечебный эффект наиболее извест‐
ных нитровазодилататоров (нитроглице‐
рина  и  др.)  связан  с  взаимодействием 
оксида азота, образующегося в процессе 
их  биотрансформации  с  гемом  гуани‐
латциклазы  по  указанному  выше  меха‐
низму,  активацией  фермента  и  накоп‐
лением цГМФ [27].  
Среди известных доноров оксида азота в   
последнее время значительное внимание  Рис. 3.  Форма сигнала ЭПР комплексов 2,03, обра‐
зованных in vivo в печени мышей:  (а)‐нахо‐
привлекают  низкомолекулярные  или  дившихся  на  питьевом  растворе  с  нитри‐
связанные с белками комплексы железа.  том  и  железом;  (б)‐через  1 час  после  внут‐
Динитрозильные  комплексы  железа  рибрюшинного введения животным ДНКЖ 
с  глютатионом;  (в)‐через  1  час  после  внут‐
(ДНКЖ, общая формула (RS−)2Fe2+(NO+)2) 
рибрюшинного  введения  ДНКЖ  с  фосфа‐
являются  одной  из  форм  депонирова‐ том. Запись при 77 К 
ния  NO  [28‐32].  Впервые  ДНКЖ  были 
обнаружены  методом  ЭПР  в  тканях  жи‐ Предполагают, что ДНКЖ разрушаются 
вотных,  а  в  последствии  в  различных  под действием супероксида и других ак‐
клеточных  культурах,  продуцирующих  тивных  окислителей  аналогично  моно‐
количество  NO  под  действием  бакте‐ нитрозильным комплексам железа с ди‐
риальных  липополисахаридов  и  γ‐ин‐ тиокарбаматом.  Следует  отметить,  что 
терферона,  которые  стимулируют  син‐ обнаружение  ДНКЖ–первое  свидетель‐
тез  индуцибельной  NOS  [29].  У  живот‐ ство  эндогенного  синтеза  оксида  азота  в 
ных,  получавших  в  течение  длительного  организме  животных.  Эндогенное  обра‐
зование  ДНКЖ  становится  возможным 
времени  пищу  или  питьевую  воду  с  по‐
благодаря  наличию  в  цитозоле  клеток 
вышенным  содержанием  нитритов,  в 
так  называемого  свободного  пула  желе‐
тканях  также  обнаруживаются  ДНКЖ. 
за. Это железо из‐за высоких концентра‐
Однако  в  крови  они  распадаются  в  пре‐
ций  аскорбиновой  кислоты,  глютатиона 
делах  1ч  с  выделением  нитроксида,  ока‐
и  других  восстановителей,  находится  в 
зывающего  длительное  гипотензивное  виде  ферро‐иона,  слабо  связанного  с 
действие.  ДНКЖ  является  парамагнит‐ различными  низкомолекулярными  ор‐
ным  и  в  замороженном  состоянии  на  ганическими  хелаторами  (цитратом, 
спектре  ЭПР  дает  сигнал  с  характерной  изоцитратом,  пируватом,  фосфатом, 
триплетной  структурой  (gср=2,03),  вели‐ АТР, ADP), а также SH‐группами белков, 
чина  которого  прямо  зависит  от  уровня  липидами  мембран  и  свободным  геми‐
NO в тканях (рис.3).   ном.  Свободный  пул  железа  восполня‐

80  Journal of Qafqaz University   
Депонирование и Транспорт Оксида Азота в Биологических Системах 

ется  за  счет  эндоцитоза  Fe3+‐трансфер‐ лов  снижается  количество  как  ДНКЖ, 
рина  в  эндосомы  клеток  с  помощью  ре‐ так и  RS‐NO. 
цептора  трансферрина  [33].  Рецептор 
ДНКЖ  и  S‐нитрозотиолы  могут  быть 
трансферрина–трансмембранный  белок, 
низкомолекулярными  или  высокомоле‐
состоящий  из  двух  молекул,  соединен‐
кулярными,  т.е.  связанными  с  белками. 
ных  дисульфидной  связью.  Ацильная 
Обычно  белковые  комплексы  более  ста‐
группа,  присоединенная  к  цитоплазма‐ бильны, чем низкомолекулярные. К низ‐
тической части белка, заякоривает комп‐ комолекулярным  нитрозотиолам  относ‐
лекс к плазматической мембране (рис.4).  ятся  S‐нитрозоцистеин  и  S‐нитрозоглю‐
татион. Последний был предложен в ка‐
честве  промежуточного  соединения 
между активацией NOS и образованием 
свободного  NO.  По‐видимому,  NOS  по 
неизвестному  пока  механизму  нитрози‐
лирует  глютатион,  а  образовавшийся  S‐
нитрозоглютатион  в  присутствии  ионов 
Cu+ высвобождает NO. Низкомолекуляр‐
ные RS‐NO не только высвобождают NO, 
но  и  могут  передавать  его  на  цистеино‐
вые  остатки  белков.  S‐нитрозилирова‐
нию  может  подвергаться  практически 
любое  тиол‐содержащее  соединение  в 
организме. 
Низкомолекулярные  ДНКЖ  являются 
более стабильными образованиями, чем 
NO,  так  как  устойчивы  в  течение  минут 
[29]. Биологическая активность низкомо‐
лекулярных ДНКЖ: 1) Высокая гипотен‐
зивная  и  вазодилататорная  активности; 
2)  Способность  подавлять  агрегацию 
тромбоцитов;  3)  Антиапоптотическая 
активность  на  клеточных  культурах;  4) 
Защита  миокарда  от  губительного  дей‐
ствия вируса C; 5) Cтимуляция усвоения 
железа  растениями  при  хлорозе;  6)  Экс‐
прессия  генов  антиоксидантной  защиты 
Рис. 4.  Схематическое  изображение  рецептора  у бактерий. Таким образом, образование 
трансферрина 
динитрозильных комплексов железа спо‐
собствует  депонированию,  транспорти‐
Другой  формой  депонирования  оксида 
ровке  на  значительные  расстояния  ок‐
азота являются S‐нитрозотиолы (RS‐NO) 
сида азота, что снижает возможность его 
[28,31,34‐39].  Известно,  что  ДНКЖ  и  S‐
локального  токсического  воздействия  на 
нитрозотиолы  способны  к  взаимопрев‐
функцию и жизнеспособность клеток.  
ращению  в  зависимости  от  уровня  в 
клетке  Fe2+,  низкомолекулярных  тиолов  В  данной  работе  методами  теоретичес‐
и  NO.  При  снижении  содержания  тио‐ кого  моделирования  исследованы  элек‐

Number 25, 2009    81
И.С. Курбанов 

тронная  и  пространственная  структура  луэмпирическим  квантово‐химическим 


динитрозильных  комплексов  железа  с  методом  РМ3  с  учетом  всех  валентных 
цистеином,  моделирующих  комплексы  электронов. Метод РМ3 параметризован 
2,03  в  биологических  системах,  изучена  для  соединений,  содержащих  атомы 
конформационная  динамика  фрагмента  переходных металлов.  
каталитического  домена  гуанилатцик‐
Для  проведения  расчетов  была  исполь‐
лазы,  ответственного  за  связывание  ок‐
зована  демонстрационная  версия  прог‐
сида  азота  из  состава  комплексов  2,03,  а 
раммы  HyperChem,  доступная  на  сайте 
также  изучены  квантово‐химические  ас‐
(http://www.hyper.com/).  корпорации 
пекты образования комплексов гем‐NO.  
Hypercube  Несомненным  преимущест‐
Электронная  структура  комплексов  2,03  вом  программы  HyperChem  является 
была  рассчитана  на  основе  координат  возможность  наглядного  изображения 
равновесных  конфигураций  ядер,  полу‐ графической  структуры  молекулы  и  из‐
ченных  в  результате  оптимизации  гео‐ менение геометрических параметров при 
метрии  комплекса  в  потенциалах  полу‐ оптимизации  химической  системы,  а 
эмпирического  метода  молекулярной  также  визуализация  полученных  в  ре‐
механики  ММ+.  В  методах  молекуляр‐ зультате расчетов молекулярных орбита‐
ной  механики  атомы  рассматриваются  лей, относительной интенсивности элек‐
как ньютоновские частицы, находящиеся  тронных  переходов,  потенциалов  в  дву‐
в  силовом  поле,  и  взаимодействие  меж‐ мерном  и  трехмерном  изображении  и 
ду  этими  частицами  описывается  полу‐ анимация колебательных мод.  
эмпирическими  потенциалами.  Потен‐
Модель  комплекса  2,03  приведена  на 
циальная  энергия  является  функцией 
рис.5,  а  в  табл.1  и  2  обобщены  резуль‐
длин  связей,  валентных  углов,  двугран‐
таты  расчетов  его  электронной  и  прос‐
ных  углов  вращения  вокруг  одинарных 
связей. Взаимодействие несвязанных мо‐ транственной структуры. Расчеты прово‐
лекулярных  фрагментов  описывается  с  дились  для  различных  расположений 
помощью полуэмпирических атом‐атом‐ NO групп с целью установления зависи‐
ных  потенциалов,  учитывающих  ван‐ мости геометрических параметров связи 
дер‐ваальсовые,  электростатические  вза‐ Fe‐N‐O  от  электронных  и  стерических 
имодействия,  также  образование  водо‐ характеристик  других  лигандов  в  комп‐
родных  связей.  В  зависимости  от  приб‐ лексе. 
лижений,  используемых  при  расчете  Согласно  результатам  расчета,  получен‐
силового поля и от вида потенциальных  ным  после  оптимизации  геометрии 
функций  и  эмпирических  параметров,  комплекса  методом  ММ+,  валентный 
описывающих  это  поле,  встречаются  угол Fe‐N‐O принимает значение, равное 
различные  модификации  расчетных  120.60.  Лигандное  окружение  в  коорди‐
программ  (MM+,  AMBER,  BIO  и  т.д.).  В  национной полости формирует структу‐
данной  работе  расчеты  пространствен‐ ру,  близкую  к  тетраэдрическому.  Цис‐
ной  структуры  были  проведены  с  по‐ теиновые  лиганды  располагаются  в 
мощью  метода  ММ+.  Оптимизация  гео‐ транс‐положении,  являющимся  наибо‐
метрии  молекулы  проводилась  с  пара‐ лее оптимальным в структуре комплекса 
метром  сходимости  0.01.Полученные  (торсионный  угол  Fe‐S‐C‐C  принимает 
данные были положены в основу расчета   значение, равное 171.90). На основе коор‐
электронной  структуры  комплексов  по‐ динат равновесных конфигурций атомов 

82  Journal of Qafqaz University   
Депонирование и Транспорт Оксида Азота в Биологических Системах 

проведены  расчеты  электронной  струк‐


туры  комплекса  методом  РМ3.  В  табл.2 
приведены значения полной и электрон‐
ной    энергии,  оценены  вклады  энергии 
отталкивания  атомных  ядер  при  комп‐
лексобразовании.  В  работе  исследовано 
также  влияние  тиолсодержащих  лиган‐
дов  на  электронную  структуру  комп‐
лексов  2,03  и  изучено  перераспределе‐
ние  электронной  плотности  и  измене‐
ние  электростатического  поля  всей  сис‐
темы  в  результате  диссоциации  групп 
NO. 
Одним  из  важных  характеристик  моле‐
кул, определяющим их поведение в раз‐
личных силовых полях является диполь‐
ный  момент,  обладающий  свойством 
аддитивности. Величина дипольного мо‐
мента для комплекса 2,03 составляет 4.45 
D (по сравнению с величиной 2.89 D для 
комплекса в отсутствии цистеиновых ли‐
гандов).  Очевидно,  что  при  комплексо‐
образовании  характер  межмолекуляр‐
ного  взаимодействия  комплекса  2,03  с 
окружающей средой  будет в значитель‐ Рис. 5.  Расчетная  модель  (а)  и  (б)  оптимизиро‐
ванная  пространственная  структура  ди‐
ной  степени  различаться  в  зависимости 
нитрозильного  комплекса  железа  с  цис‐
от природы лиганда.  теином 

Таблица 1. Геометрические параметры комплекса 2,03 поданным метода ММ+ 

Связь  Длина (Å)  Валентный угол  Значение (град)  Торсионный угол  Значение (град) 


Fe‐N  1.51  N‐Fe‐N  108.22  N‐Fe‐S‐C  ‐65.5 
N‐O  1.18  S‐Fe‐S  110.9  S‐Fe‐N‐O  ‐59.7 
Fe‐S  2.19  N‐Fe‐S  110.7  Fe‐S‐C‐C  171.9 
S‐C  1.81  Fe‐N‐O  120.6  S‐Fe‐S‐C  ‐98.3 
C‐C  1.53         

C‐N  1.44         

Таблица 2. Результаты расчета по данным метода PM3 

  Энергетические параметры, ккал/моль  Дипольный 
Комплекс   Полная  Электронная  Энергия  Энергия  момент,  
  энергия  энергия  отталкивания ядер связывания  Дебай 
Комплекс  ‐42429.01  ‐142803.52  100374.51  ‐750.08  2.89 
2,03 (в 
отсутствии 
лиганда) 
Комплекс  ‐96138.41  ‐567008.42  470869.99  ‐2697.69  4.45 
2,03 (с 
цистеином) 

Number 25, 2009    83
И.С. Курбанов 

Для  изучения  влияния  двух  SH  ‐  содер‐ вывод  был  сделан  на  основе  результатов 
жащих  лигандов  рассматривались  вели‐ оптимизации геометрии координацион‐
чины  параметров,  характеризующих  ного  центра  комплекса.  Изменение  ме‐
электронную структуру как в отсутствии  жатомного расстояния позволяет судить 
двух  остатков  цистеина,  так  и  в  комп‐ об  изменении  силы  химической  связи 
лексе  с  ними.  Мерой  изменения  элек‐ между  атомами  комплекса.  Наблюдае‐
тронного распределения служит обычно  мое в комплексах увеличение длины свя‐
изменение  заряда  на  атомах,  коорди‐ зи  Fe‐N (0,1 Å) и уменьшение связи  Fe‐S 
нирующихся с металлом. Кроме того, по  (0,2  Å)  свидетельствует  об  ослаблении 
изменению  электронного  распределения  взаимодействия  между  железом  и  окси‐
в области атома металла при замещении  дом  азота.  В  результате  увеличивается 
лигандов  можно  судить  о  прочности  как  суммарный  положительный  заряд 
связи  металл‐лиганд.  Такое  замещение  на  NO  группах,  так  и  уменьшается  ве‐
может  менять  характер  взаимодействия  личина энергии диссоциации NO групп.  
и  функциональные  свойства  комплекс‐
ных  соединений.  При  этом  следует  от‐
метить,  что  рассматривается  та  часть 
электронной  плотности,  которая  расхо‐
дуется  на  образование  координацион‐
ных связей, играющих важную роль при 
участии  комплексов  железа  в  биохими‐
ческих  процессах.  Согласно  результатам 
расчетов  существенное  изменение  элек‐
тронной  плотности  при  введении  цис‐
теиновых  лигандов  наблюдается  на  ато‐
ме железа и атомах азотов NO групп. Об 
этом  свидетельствуют  также  и  рельеф‐
ные  карты  перераспределения  валент‐
ной  плотности  при  замещении.  Распре‐
деления  плотности  построены  в  сече‐
ниях, проходящих через плоскость комп‐
лекса  и  на  расстоянии  0,5Å  от  нее,  где 
изменения плотности  максимальны. Раз‐
ность электронных плотностей в коорди‐
национном  центре  максимальна,  в  то 
время  как  уже  на  расстоянии  более 
одной  химической  связи  от  места  вве‐
дения лиганда не превышает нескольких 
процентов  (рис.6).  Несмотря  на  неболь‐
шую величину подобных эффектов было 
бы  ошибочным  игнорировать  их  вооб‐
ще.  Как  следует  из  результатов  расчета 
суммарный  заряд,  локализованный  на 
NO  группах  комплекса  положителен  и 
Рис. 6.  Распределение  электростатического  потен‐
свидетельствует  об  ионизации  этих  циала  и  спиновой  плотности  комплекса 
групп  при  связывании  лигандов.  Этот  2,03 на плоскости XY 

84  Journal of Qafqaz University
Депонирование и Транспорт Оксида Азота в Биологических Системах 

Таким  образом  связывание  комплекса‐ комплекса  он  был  помещен  в  гипотети‐


ми  цистеиновых  лигандов  приводит  к  ческий объем с размерами: х=12 Å; у=8 Å; 
упрочению  связи  между  Fe  и  атомом  z=12  Å,  заполненный  молекулами  воды. 
серы  лиганда,  и  ослаблению  связи  Fe‐ Максимальное  число  молекул  воды  в 
NO,  что  создает  благоприятные  условия  таком  объеме  равно  39,  а  минимальное 
для  перехода  NO  из  состава  комплекса  расстояние между атомами комплекса и 
2,03  на  гемовую  группу  гуанилатцикла‐ раствора  взято  равным  2,3Å.  Результаты 
зы.  Таким  образом,  включение  NO  в  расчета  свидетельствуют,  что  средне‐
комплексы  2,03  с  одной  стороны  пре‐ квадратичные  амплитуды  флуктуации 
дохраняет  его  от  возможных  превраще‐ атомов  остова  комплекса  на  60%  опре‐
ний,  а  с  другой  стороны  способствует  деляются  осцилляциями  в  пределах  од‐
участию оксида азота в активации гуани‐ ной энергетической ямы и на 40%‐ пере‐
латциклазы.  Анализ  карт  электростати‐ ходом  из  одной  ямы  в  другую.  Любое 
ческого  потенциала,  создаваемого  ядра‐ конформационное  состояние  достигает 
ми атомов и электронным зарядом в об‐ глобального минимума уже в течении 10 
ласти  реакционной  сферы  комплекса  пс.  Как  следует  из  результатов  расчета 
показал,  что  в  отсутствии  лиганда  он  под  действием  температуры  меняются 
близок  к  нулю.  Хотя  следует  отметить,  относительные  вклады  р‐орбиталей  ато‐
мов азота и d‐орбиталей железа. Резуль‐
что при добавлении цистеиновых лиган‐
таты  вычислений  подтверждают  выска‐
дов  вокруг  комплекса  создается  боль‐
зывающееся  ранее  предположение  о 
шой  по  величине  положительный  по‐
локализации неспаренного электрона на 
тенциал  и  изменение  внешнего  элек‐
dZ2‐орбитали  железа.  Поскольку  моле‐
тростатического поля сильнее зависит от 
кула оксида азота в основном состоянии 
дальних  заместителей,  чем  изменение 
парамагнитна  и  содержит  на  π*‐орби‐
электрической плотности (рис.6). 
тали один неспаренный электрон, то эта 
Важным  аспектом  теоретических  иссле‐ орбиталь  оказывается  вытянутой  в  нап‐
дований  является  также  изучение  влия‐ равлении иона железа. 
ния температуры на динамику атомного 
Таким  образом,  на  основе  использова‐
остова комплексных соединений. Поэто‐
ния  полуэмпирических  методов  расчета 
му было рассмотрено влияние тепловых 
электронной  и  пространственной  струк‐
колебаний  на  геометрию  комплексов 
туры  комплексов  2,03  получены  резуль‐
2,03  при  физиологической  температуре 
таты, которые позволяют предположить, 
(310  К).  Расчеты  проводили  методом 
что  образующиеся  в  биологических  сис‐
неэмпирической  молекулярной  дина‐
темах  соединения  типа  Fe‐NO‐RS  спо‐
мики,  который  не  требует  введения  эм‐
собны  эффективно  связывать  NO,  созда‐
пирических  межмолекулярных  потен‐
вая  тем  самым  его  высокие  стабильные 
циалов  для  расчетов.  Такие  исследова‐
концентрации у так называемых «мише‐
ния  позволяют  установить  не  только 
равновесное  состояние  комплекса,  но  и  ней действия» и обеспечивая тем самым 
выявить  кинетику  поведения  в  окрест‐ реализацию  физиологической  роли  ок‐
ностях установленного минимума. Дина‐ сида азота. 
мика отбора продолжалась в течении 30  В  работе  изучена  динамика  непрерыв‐
пс при 310 К (∼ 15.000 значений энергии  ных конформационных состояний функ‐
и  ее  производных  с  шагом  1х10‐15  сек).  ционально  активного  фрагмента  Met1‐
Для  моделирования  водного  окружения  Gly21 каталитического домена гуанилат‐

Number 25, 2009    85
И.С. Курбанов 

циклазы‐А  и  осуществлен  поиск  его 


наиболее  вероятного  конформационно‐
го состояния с минимумом энергии при 
физиологической  температуре.  Сущест‐
вование  таких  локальных  изменений  не 
противоречит  нахождению  всего  фраг‐
мента  в  равновесном  состоянии,  пос‐
кольку такие изменения могут быть ком‐
пенсированы  локальными  изменениями 
в  других  его  частях,  или  же  эти  изме‐
нения  могут  быть  обратимы  для  задан‐
ного  фрагмента.  Результаты  моделиро‐
вания  могут  быть  полезными  в  после‐
дующих  исследованиях  свойств  ГЦ,  в 
частности,  для  более  полного  описания 
внутримолекулярных  процессов  в  ката‐
литическом  домене,  необходимых  для 
проявления  функциональной  активнос‐
ти белка.  
Исследуемый фрагмент каталитического 
домена  ГЦ  содержит  328  атомов  и  115 
углов внутреннего вращения вокруг оди‐
нарных  связей  основной  и  боковых  це‐
пей  аминокислотных  остатков.  Началь‐
ные  варианты  были  составлены  на  ос‐
нове  сочетания  низкоэнергетических 
конформаций  фрагментов  Met1‐Val11  и 
Val11‐Gly21,  которые  перекрываются  по 
остатку  валина.  Как  следует  из  резуль‐
татов  расчета,  низкоэнергетические  кон‐
формационные  состояния  (рис.7)  содер‐
жат  характерные  элементы  вторичной 
структуры,  к    которым  можно  отнести 
три  реверсивных  поворота  пептидной 
цепи  на  участках  Met1‐Tyr4,  Leu6‐Thr10 
и Thr10‐Thr14 (β‐повороты). 

Рис. 7.  Устойчивые  конформационные  состояния 


фрагмента  Met1‐Gly21  каталитического 
домена  ГЦ‐А  по  данным  теоретического 
моделирования:  (а)  Еотн=0.0  ккал/моль;  (б) 
Еотн=8.2  ккал/моль;  (в)  Еотн=8.9  ккал/моль; 
(г)  Еотн=9.6  ккал/моль;  (д)  Еотн=10.8  ккал/ 
моль; (е) Еотн= 11.9 ккал/моль 

86  Journal of Qafqaz University   
Депонирование и Транспорт Оксида Азота в Биологических Системах 

Формирование  таких  β‐поворотов  подт‐ а  для  участков  Met1‐Tyr4  и  Thr10‐Thr14, 


верждается  расстоянием  между  Сα‐ато‐ содержащих  β‐повороты,  структура 
мами,  которое  меньше  7Å  и  водород‐ фрагмента к 300пс моделирования прак‐
ными  связями  между  СО  и  NH  группа‐ тически  не  отличается  от  начального 
ми  остатков  Met1  и  Cys5,  Leu6  и  Thr10,  этапа  моделирования.  Не  исключено, 
Thr10  и  Thr14.  Однако  наличие  пол‐ что  устойчивость  таких  участков  с  оди‐
ностью  вытянутого  участка  цепи,  вклю‐ наковыми  формами  основной  цепи  мо‐
чающего остатки  Arg16‐Thr17‐Glu18 при‐ жет  играть  определенную  роль  в  функ‐
водит к реализации большого числа кон‐ циональной активности ГЦ. Полученные 
формационных  состояний,  разделенных  результаты  могут  быть  использованы 
невысокоми  энергетическими  барьера‐ для  описания  сложных  внутримолекул‐
ми.  Наибольший  вклад  в  стабилизацию  ярных механизмов, которые представля‐
устойчивых  конформациронных  состоя‐ ют большой интерес в связи с развитием 
ний  вносят  взаимодействия  остатков  молекулярных  технологий,  но  в  то  же 
Arg16  и  Glu18,  суммарный  вклад  от  ко‐ время  достаточно  сложны  для  экспери‐
торых составляет –12.8 ккал/моль. Устой‐ ментальных методов. 
чивые состояния стабилизированы водо‐ Таблица 3.  Водородные  связи  в  глобальной  кон‐
родными  связями,  в  образовании  кото‐ формации  фрагмента  Met1‐Gly21  ка‐
рых  участвуют  боковые  цепи  остатков  талитического домена молекулы ГЦ‐А 
Arg3,  Asn9,  Thr10,  Ser15,  Arg16  и  Thr19  Водородные связи  Длина  Энергия, 
(табл.3).   водород‐  ккал/моль
ной связи, 
Обобщая результаты исследования мож‐ Å 
но  утверждать,  что,  несмотря  на  отно‐ (Met1) CO…HN (Cys5)  1.8    ‐1.5 
сительно  ограниченные  конформацион‐ (Leu6) CO…HN (Thr10)  1.7    ‐1.3 
ные  возможности  отдельных  участков  (Thr10) CO…HN (Thr14)  2.1    ‐0.9 
исследуемого  фрагмента,  он  лабилен  и  (Met1) NH…Oγ Н (Asn9)  2.7    ‐0.2 
(Met1) NH…Oγ Н (Thr10)  2.5    ‐0.3 
представлен 30 конформационными сос‐ γ 
(Arg3) N H…O Н (Tyr4) 
z 2.6    ‐0.2 
тояниями,  разделенными  энергетичес‐
(Phe7) CO…HN (Asn9)  2.5    ‐0.3 
ким  барьером  10  ккал/моль.  С  целью  (Asn12) CO…HNz (Arg16) 2.2    ‐0.8 
изучения  устойчивости  этих  конформа‐ (Ser15) NH...Oγ Н (Ser15)  2.8    ‐0.1 
ционных  состояний  в  условиях,  модели‐ (Thr19) OH...NH (Thr20)  2.1    ‐0.9 
рующих  реальное  водное  окружение, 
была  проведена  молекулярная  динами‐ В  последние  годы  активно  введутся 
ка  фрагмента  в  гипотетическом  объеме,  экспериментальные  исследования  атом‐
содержащем  380  молекул  воды.  Моле‐ ной  и  электронной  структуры  комплек‐
кулярная  динамика  выполнялась  при  сов  гема  из  состава  гемопротеинов,  в 
постоянном  числе  частиц,  давлении  частности,  гуанилатциклазы,  с  оксидом 
(300К)  с  использованием  силового  поля  азота,  проводятся  количественные  рас‐
AMBER  [41].  Ниже  описаны  результаты  четы энергии диссоциации и ряд других 
исследования  динамических  свойств  термодинамических  характеристик  [42‐
фрагмента Met1‐Gly21 С‐концевого ката‐ 44].  Однако  эти  исследования  не  дают 
литического  домена  ГЦ‐А.  Согласно  ре‐ объяснений  столь  высокому  сродству 
зультатам  исследования  для  С‐концево‐ оксида  азота  с  протеинами  и  не  могут 
го  участка  исследуемого  фрагмента  ха‐ объяснить  механизмы  регуляции  ряда 
рактерен высокий уровень подвижности  биохимических  процессов,  протекаю‐
в  любом  конформационном  состоянии,  щих  при  участии  данного  соединения. 

Number 25, 2009    87
И.С. Курбанов 

Остаются  не  до  конца  выясненными  цию  данной  белковой  молекулы,  кото‐
природа  химической  связи  и  характер  рая  находится  либо  в  цитоплазме  клет‐
изменений  электронной  структуры  ге‐ ки,  либо  встроена  в  клеточную  мембра‐
мопротеинов  при  образовании  комп‐ ну.  С  трех  сторон  порфириновый  цикл 
лексов  с  NO.  Для  решения  подобных  гема  содержит  гидрофобные  замести‐
задач  в  теоретической  молекулярной  тели–метильные  и  винильные  группы,  а 
биологии  все  большее  распространение  с  четвертой  стороны–две  гидрофильные 
получают  квантово‐химические  методы  карбоксильные  группы,  которые  в  нейт‐
расчета, поскольку именно электронные  ральной  среде  находятся  в  анионной 
аспекты процессов, протекающих в био‐ форме  СОО−.  В  работе  [45]  были  иссле‐
логических  системах,  привлекают  вни‐ дованы  структурные  изменения  в  струк‐
мание  исследователей.  К  сожалению,  туре гема из состава гемопротеинов при 
расчеты  электронной  структуры  комп‐ связывании  оксида  азота.  Несмотря  на 
лексов  гема  с  лигандами  встречаются  в  то,  что  природа  лиганд‐индуцированных 
литературе достаточно редко и авторы, в  изменений  остается  неясной  и  по  сей 
большинстве  случаев,  не  делают  попы‐ день,  было  установлено,  что  отклонение 
ток  связать  полученные  результаты  с  от  планарной  структуры  при  связыва‐
биологическими  свойствами  изучаемых  нии  лиганда  варьирует  в  пределах  от  10  
объектов. Целью настоящей работы яви‐ до 100 в окси‐миоглобине и от 120 до 200 в 
лось  сравнительное  теоретическое  кван‐ цитохроме  С3.  В  работе  [25]  было  оха‐
тово‐химическое  и  молекулярно‐дина‐ рактеризовано окружение гема в составе 
мическое  исследование  электронной  и  каталитического домена ГЦ (рис.8). 
атомной  структур  комплексов  гема  из 
состава  гуанилатциклазы  с  оксидом  азо‐
та  и  динамики  их  атомного  остова  при 
физиологической  температуре.  Геомет‐
рию  построенных  молекулярных  струк‐
тур  оптимизировали  методом  молекул‐
ярной  механики  (на  основе  алгоритма 
Polak‐Ribiere в методе ММ+) с точностью 
0,001  ккал/моль.  Квантово‐химические 
расчеты  проводили  полуэмпирическим 
методом  РМ3,  параметризированным 
для  атомов  переходных  металлов.  Из‐
вестно,  что  гем  состоит  из  36  атомов  и 
лишь  несколько  аминокислот,  ковалент‐
но  связанных  с  углеродами,  находящи‐
Рис. 8.  Структурные изменения, связанные с раз‐
мися  на  периферии  порфиринового 
личными конформационными состояния‐
кольца,  а  также  аминокислоты,  связан‐ ми каталитического домена ГЦ [25]. 
ные  непосредственно  с  железом  гема, 
имеют определенное влияние на степень  Нами были рассчитаны комплексы гема 
функциональной  активности  гемопро‐ с His в 5‐ом  и с молекулой NO в шестом 
теина.  Остальная  же  аминокислотная  координационном  положении.  Полуэм‐
цепь  благодаря  водородным  связям  и  пирические  квантово‐химические  расче‐
силам  гидрофобного  взаимодействия  ты  методом  РМ3  проводились  без  огра‐
поддерживает  уникальную  конформа‐ ничения  по  симметрии  соединений, 

88  Journal of Qafqaz University   
Депонирование и Транспорт Оксида Азота в Биологических Системах 

участвующих  в  образовании  комплекса  зывавшиеся  предположения    о  том,  что 


гем‐NO.  Согласно  результатам  расчетов  благодаря  наличию  одного  из  электро‐
при  образовании  комплекса  гем‐NO  нов на dx2‐y2‐орбитали железа происходит 
расстояние  между  Fe  и  азотом  имида‐ увеличение  эффективного  радиуса  ато‐
зольного  кольца  His  практически  не  от‐ ма  железа  в  направлении  атомов  азота 
личалось  по  сравнению  со  свободным  порфиринового  кольца,  что  приводит  к 
гемом. Однако межатомное расстояние в  росту  отталкивания  с  неподеленными 
самой  молекуле  лиганда  значимо  меня‐ электронными  парами  атомов  азота.  В 
лось.  Так,  расстояние  между  атомами  результате чего, атом железа, чтобы уме‐
азота  и  кислорода  в  молекуле  NO  воз‐ ньшить  это  отталкивание,  выходит  из 
растало  на  0,056  Å  и  наблюдалось  пере‐ плоскости,  образуемой  атомами  азота, 
распределение  заряда  с  NO  на  пор‐ на 0,7‐0,8 Å.  
фириновую  плоскость.  Анализ  элек‐
Однако  атом  железа  связан  координа‐
тронной структуры позволяет предполо‐
ционной  связью  и  с  атомом  гистидина, 
жить,  что  изменения  касаются,  в  снов‐
поэтому  появление шестого лиганда из‐
ном,  заселенности  р‐орбиталей  атомов 
меняет  силу  поля  лигандов,  железо  пе‐
углерода  и  азота  порфиринового  коль‐
реходит  в  низкоспиновое  состояние,  в 
ца. Анализ заселенностей по Малликену 
котором  шесть  d‐электронов  занимают 
включает  в  себя  процедуру  разделения 
орбитали dxy, dzx  и dyz. Орбиталь dx2‐y2  ста‐
электронной  плотности  между  атомами 
новится  вакантной,  и  описанный  выше 
и  атомными  орбиталями,  основанную 
эффект  отталкивания  между  порфири‐
на  значениях  коэффициентов  АО  в  мо‐
новыми  атомами  азота  и  электроном, 
лекулярных  орбиталях  и  приближении 
занимавшим  эту  орбиталь  пропадает.  В 
равномерного распределения плотности 
перекрывания  (приближение  Маллике‐ результате  атом  железа  может  вновь 
на).  Изменения  в  коэффициентах  засе‐ вернуться  в  центр  почти  плоского  пор‐
ленностей  свидетельствует  о  том,  что  фиринового кольца и образовать октаэд‐
происходит  перераспределение  элек‐ рический  комплекс.  Таким  образом, 
тронной плотности атомов не только по  движение  атома  железа  гем‐группы  в 
перемещениям, но и  по   направлениям,  одной субъединице гемопротеина дейст‐
так  как  в  валентном  приближении  учи‐ вует как «спусковой механизм», который 
тывается  ограниченное  число  атомных  запускает  в  движение  существенные  ст‐
орбиталей  атомов,  входящих  в  коорди‐ руктурные  изменения  в  других  субъеди‐
национную полость. При этом основное  ницах.  
перераспределение  электронной  плот‐
ности  происходит  за  счет  изменения  ЛИТЕРАТУРА 
коэффициентов  заселенностей,  которые  1. Bryan  N.S.,  Bian  K.,  Murad  F.  Discovery  of  the 
занимают  неспаренные  электроны,  т.е.  nitric oxide signaling pathway and targets for drug 
р‐орбитали атомов.  Нами был  проведен  development // Front Biosci., 2009, v.14, p.1‐18 
подробный  анализ  заселенностей  атом‐ 2. Calabrese V., Mancuso C., Calvani M. et al. Nitric 
ных  орбиталей  комплекса  гем‐NO  и  oxide  in  the  central  nervous  system:  neuro‐
protection  versus  neurotoxicity  //  Nature  Rev. 
установлено,  что  при  комплексообразо‐
Neurosci., 2007, v.8, iss.10, p.766‐775 
вании  существенные  изменения  проис‐
3. Cary  S.P.,  Winger  J.A.,  Derbyshire  E.R.,  Marletta 
ходят,  в  основном,  на  р‐орбиталях  ато‐ M.A. Nitric oxide signaling: no longer simply on 
мов имидазольного кольца. Полученные  or off // Trends in Biochem. Sci., 2006, v. 31, iss. 4, 
результаты  подтверждают  ранее  выска‐ p. 231‐239 

Number 25, 2009    89
И.С. Курбанов 

4. Elrod J.W., Calvert J.W., Gundewar S. et al. Nitric  19. Hoenicka M., Schmid C. Cardiovascular effects of 


oxide  promotes  distant  organ  protection:  Evi‐ modulators  of  soluble  guanylyl  cyclase  activity 
dence for an endocrine role of nitric oxide // Proc.  (review)  //  Cardiovasc.Hematol.Agents  Med. 
Natl.Acad.Sci.USA, 2008, v. 105, p. 11430‐11435  Chem., 2008, v.6(4), p.287‐301 
5. Гоженко  А.И.,  Николаевская  И.В.,  Котюжин‐ 20. Kristianto  J.,  Muchunku  M.,  Gerber  N.  Soluble 
ская С.Т., Бабий В.П. Оксид азота и иммунная  guanylate  cyclase  conformational  regulation  // 
система организма // Мед. Химия, 2001, с.5‐9  Biophys. Journ., 2009, v. 96 (3), suppl. 1, p. 401a 
6. Ивашкин  В.Т.,  Драпкина  О.М.  Оксид  азота  в  21. Megson  I.L.,  Miller  M.R.  NO  and  sGC‐
регуляции  функциональной  активности  фи‐ stimulating  NO  donors  (review)  //  Handb.Exp. 
зиологических  систем  //  Росс.  журн.  Гастро‐ Pharmacol., 2009, v.191, p.247‐276 
энтерологии,  гепатологии  и  колопроктоло‐ 22. Poulos  T.L.  Soluble  guanylate  cyclase  // 
гии, 2000, № 4, с. 16‐21  Curr.Opin.Struc.Biol., 2006, v.16, iss.6, p. 736‐743 
7. Каменский А.А., Савельева К.В. Оксид азота и  23. Royand  B.,  Garthwaite  J.  Nitric  oxide  activation 
поведение.  М.:  Изд‐во  НЦССХ  им.  А.Н.  Баку‐ of guanylyl cyclase in cells revisited // Proc. Natl. 
лева РАМН, 2002, 156 с.  Acad. Sci. USA, 2006, v.103(32), p.12185‐12190 
8. Bian  K.,  Murad  F.  Nitric  oxide‐biogeneration, 
24. Winger  J.A.,  Derbyshire  E.R.,  Lamers  M.H.  et  al. 
regulation  and  relevance  to  human  diseases  // 
The crystal structure of the catalytic domain of a 
Bioscience, 2003, v.8, p.264‐278 
eukaryotic guanylate cyclase //  BMC Struct.Biol., 
9. Brennan  P.A., Moncada  S.  From  pollutant  gas  to  2008, v. 8, p. 42 
biological messenger: the diverse actions of nitric 
25. Karow  D.S.,  Pan  D.,  Davis  J.H.,  Behrends  S., 
oxide  in  cancer  //  Ann.R.Coll.Surg.Engl.,  2002, 
Mathies  R.A.,  Marletta  M.A.  Characterization  of 
v.84, No.2, p.75‐78 
functional heme domains from soluble guanylate 
10. Hemish J., Nakaya N., Mittal V. et al. Nitric oxide  cyclase  //  Biochemistry,  2005,  v.44(49),  p.16266‐
activates  diverse  signaling  pathways  to  regulate  16274  
gene expression // J.Biol.Chem., 2003, v. 278, No. 
26. Martin  E.,  Berka  V.,  Bogatenkova  E.,  Murad  F., 
43, p. 42321‐42329 
Tsai  A.L.  Ligand  selectivity  of  soluble  guanylyl 
11. Lundberg J.O., Weitzberg E. NO generation from  cyclase:  effect  of  the  hydrogen‐bonding  tyrosine 
nitrite  and  its  role  in  vascular  control  //  in  the  distal  heme  pocket  on  binding  of  oxygen, 
Arterioscler.  Thromb.  Vasc.  Biol.,  2005,  v.25(5),  nitric  oxide,  and  carbon  monoxide  //  J.Biol. 
p.915‐922  Chem., 2006, v.281(38), p.27836‐27845 
12. Moncada  S.,  Higgs  E.A.  Nitric  oxide  and  the  27. Ignarro  L.J.  After  130  years,  the  molecular 
vascular  endothelium  //  Handb.Exp.Pharmacol.,  mechanism  of  action  of  nitroglycerin  is  revealed 
2006, v.176, p.213–254  //  Proc.Natl.Acad.Sci.USA,  2002,  v.    99,  p.  7816‐
13. Mujoo  K.,  Sharin  V.G.,  Bryan  N.S.  et  al.  Role  of  7817 
nitric  oxide  signaling  components  in  differen‐ 28. Ванин А.Ф. Динитрозильные комплексы желе‐
tiation  of  embryonic  stem  cells  into  myocardial  за  и  S‐нитрозотиолы–две  возможные  формы 
cells  //  Proc.Natl.Acad.Sci.USA,  2008,  v.  105,  стабилизации  и  транспорта  оксида  азота  в 
p.18924‐18929  биосистемах // Биохимия, 1998, т. 63, вып. 7, с. 
14. Murad  F.  Discovery  of  some  of  the  biological  924‐930  
effects of nitric oxide and its role in cell signaling 
29. Ванин  А.Ф.  «Нитрозильные  комплексы  неге‐
// Biosci. Rep., 2004, v.24(4‐5), p.452‐474 
мового  железа  в  тканях  животных  и  микро‐
15. Murad  F.  Nitric  oxide  and  cyclic  guanosine  организмах».  Дисс.  д‐ра  биол.  наук,  М.,  ИХФ  
monophosphate  signaling  in  the  eye  (review)//  АН СССР, 1980 
Can.J.Ophthalmol., 2008, v.43(3), p.291‐294 
30. Ванин  А.Ф.,  Кубрина  Л.Н.,  Лисовская  И.Л.  и 
16. Hetrick  E.M.,  Shin  J.H.,  Stasko  N.A.  et  al.  др.  Эндогенные  нитрозильные  комплексы  ге‐
Bactericidal efficacy of nitric oxide‐releasing silica  мового  и  негемового  железа  в  микроорга‐
nanoparticles // ACS Nano, 2008, v.2 (2), p. 235–246  низмах и животных тканях // Биофизика, 1971, 
17. Ванин  А.Ф.  Оксид  азота  в  биологии:  история,  т. 16, с. 650‐656  
состояние  и  перспективы  исследований  //  31. Ванин  А.Ф.,  Маленкова  И.В.,  Мордивинцев 
Биохимия, 1998, т. 63, вып. 7, с. 867–869   П.И.,  Мюльш  А.  Динитрозильные  комплексы 
18. Derbyshire  E.R.,  Marletta  M.A.  Biochemistry  of  железа  с  тиолсодержащими  лигандами  и  их 
soluble guanylate cyclase (review) // Handb. Exp.  обратимое  превращение  в  нитрозотиолы    // 
Pharmacol., 2009, v.191, p.17‐31  Биохимия, 1993, т. 58, вып.7, с. 1094‐1103  

90  Journal of Qafqaz University   
Депонирование и Транспорт Оксида Азота в Биологических Системах 

32. Васильева C.В., Мошковская Е.Ю., Санина Н.А.  Properties  of  These  Complexes  //  J.  Am.  Chem. 
и  др.  Формирование  динитрозильных  комп‐ Soc., 2008, v.130 (46), p.15288–15303 
лексов  железа–необходимый  этап  в  реализа‐ 44. Winger  J.A.,  Derbyshire  E.R.,  Marletta  M.A. 
ции генетической активности тетранитрозиль‐ Dissociation  of  nitric  oxide  from  soluble 
ного комплекса с тиосульфатом // Докл. РАН.,  guanylate  and  h‐nox  domain  constructs  //  JBC 
2005, т.402, № 5, с. 1–4  papers in press, www.jbc.org by on april 19, 2009 
33. Thakurta  P.G.,  Choudhury  D.,  Dasgupta  R.,  45. Pellicena  P.,  Karow  D.S.,  Boon  E.M.,  Marletta 
Dattagupta  J.K.  Tertiary  structural  changes  M.A.,  Kuriyan  J.  Crystal  structure  of  an  oxygen‐
associated  with  iron  binding  and  release  in  hen  binding  heme  domain  related  to  soluble 
serum  transferrin:  a  crystallographic  and  guanylate  cyclases  //  PNAS,  2004,  v.  101,  No.35, 
spectroscopic  study  //  Biochem.  Biophys.  Res.  p.12854‐12859. 
Commun.. 2004, v. 316, p.1124‐1131 
34. Zhang  Y.,  Hogg  N.  S‐nitrosothiols:Cellular 
formation and transport //Free Radical Biol.Med.,  
2005,  v.38, p.831‐838 
35. Foster  M.W.,  Pawloski  J.R.,  Singel  D.J.,  Stamler 
J.S. Role of circulating S‐nitrosothiols in control of 
blood pressure // Hypertension, 2005, v. 45, p. 15‐
17 
36. Foster  M.W.,  Stamler  J.S.  New  insights  into 
protein  S‐nitrosylation.  Mitochondria  as  a  model 
system    //  J.Biol.Chem.,  2004,  v.  279,  p.  25891–
25897 
37. Jourdʹheuil  D.,  Jourdʹheuil  F.L.,  Feelisch  M. 
Oxidation  and  nitrosation  of  thiols  at  low 
micromolar exposure to nitric oxide. Evidence for 
a free radical mechanism // J.Biol.Chem.,  2003, v. 
278, p. 15720–15726  
38. Liu L. Essential roles of S‐nitrosothiols in vascular 
homeostasis and endotoxic shock // Cell, 2004, v. 
116, p. 617–628 
39. Severina  I.S.,  Bussygina  O.G.,  Pyatakova  N.V., 
Malenkova I.V., Vanin A.F. Activation of soluble 
guanylate  cyclase  by  NO  donors‐S‐nitrosothiols, 
and  dinitrosyl‐iron  complexes  with  thiol‐
containing  ligands  //  Nitric  oxide.  Biology  and 
Chemistry, Academic Press, 2003, v.8, p.155‐163 
40. Алиев  Д.И.,  Алиева  И.Н.,  Годжаев  Н.М. Элек‐
тронное  и  пространственное  строение  динит‐
розильного  комплекса  закисного  железа  с 
цистеином // Ж.физ.химии, 1989, т.LXIII, № 10, 
c.2656‐2660 
41. Allinger  N.L.,Yuh  Y.  QCPE  395,  Quantum 
chemistry  program  exchange,  Indiana  Univ., 
Indiana, 1982 
42. Russwurm  M.,  Koesling  D.  NO  activation  of 
guanylyl cyclase // The EMBO Journal, 2004, v.23, 
p.4443–4450 
43. Praneeth  V.K.K.,  Paulat  F.,  Berto  T.C.,  S.  DeBeer 
George,  Nther  C.,  Sulok  C.D.,  Lehnert  N.L. 
Electronic  Structure  of  Six‐Coordinate  Iron(III)  − 
Porphyrin  NO  Adducts:  The  Elusive  Iron(III)  − 
NO  (radical)  State  and  Its  Influence  on  the 

Number 25, 2009    91
 
 
 
TOZ METALÜRJİSİ İLE ÜRETİLMİŞ İKİ METAL PARÇANIN 
DİFÜZYON KAYNAĞIYLA BİRLEŞTİRİLMESİNDE SICAKLIĞIN 
KAYNAK BÖLGESİNE ETKİSİNİN İRDELENMESİ 

Yadullah BABAYEV 
Qafqaz Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi 
Endüstri Mühendisliği Bölümü 
Bakü / AZERBAYCAN 
ybabayev@qafqaz.edu.az 

ÖZET 
Bu çalışmada Fe‐Cu‐C ve Fe‐Zn‐C toz metal karışımlarından soğuk şekillendirme uygulanarak toz metalden 
üretilmiş numunelere ham mukavemet kazandırılmıştır. Daha sonra silindirik şekilli bu parçalara vakumlu fırın 
içerisinde  değişik  sıcaklıklarda  difüzyon  kaynağı  yapılmıştır.  Kaynak  edilen  bu  numuneler  üzerinde  sıcaklığın 
kaynaklı  birleştirmenin  mekanik  özelliklerine  etkisi  incelenmiştir.  Çalışmada  yapılan  difüzyon  kaynağının  en 
önemli özelliği birleştirilecek parçalara dış basıncın uygulanmaması ve tozlara gerekli olan sinterleme işleminin 
de kaynak işlemi ile birlikte gerçekleştirilmiş olmasıdır. Yapılan incelemeler sonucunda sıcaklığın yükselmesiyle 
kaynak dikişinin kesme dayanımının yükseldiği ve sertlik değerlerinin yükseldiği tespit edilmiştir. 
Anahtar sözler: Toz metalürjisi, difüzyon kaynağı, kesme mukavemeti 

ANALYSIS OF THE HEAT IMPACT ON WELD AREA DURING CONNECTING WITH DIFFUSION 
WELDING OF TWO METAL POWDER PIECES 

SUMMARY 
In  this  study,  pure  resistance  for  metal  powder  samples  were  gained  from  Fe‐Cu‐C  and  Fe‐Zn‐C  metal 
powder  composites  with  applying  cold  forming.  Later,  on  these  cylindric  formed  pieces  was  applied  diffusion 
welding in a different temprature in the vacuum oven. The welded samples were analyzed in the aspect of the 
heat  impact  on  mechanical  features  of  welded  connection.  The  main  feature  of  diffusion  welding  in  this  study 
was non‐use of outside pressure on connecting pieces and realizing of welding process with sintering process. As 
a  result  of  analysis,  it  was  defined  that  the  weld  cutting  resistanse  and  solidity  values  are  increased  with  the 
increasing of the heat.  
Key words: Powder metallurgy, diffusion welding, cutting resistance 
 
 
kompakt  olmak  üzere  iki  çeşittir.  Son  iş‐
1.  Giriş 
lemden  sonra  malzemede  %10‐30  arasında 
Parçanın şekil ve boyutlarına uygun olarak  gözenek  mevcutsa,  buna  gözenekli,  %1‐3 
metal  esaslı  tozları  presleyip,  (0.75‐0.86)Tm  arasında gözenek varsa bu ürüne kompakt 
sıcaklığında  vakum  veya  koruyucu  gaz  at‐ malzeme denilir (Avci, 1993; Bishop, 1998). 
mosferinde sinterlenmesine toz metalürjisi  Sıkıştırılmış  toz  parçalar  arasındaki  bağ, 
adı  verilir  (Şükürov,  2002).  Toz  metalürjisi  yapışma, mekanik kilitleme ve benzeri tür‐
metal, seramik tozlarının üretimi ve bu toz‐ den zayıf bağlar olup kristal kafes içerisin‐
ların  mekanik  ve  termik  etkilerle  birleştiri‐ deki  bağ  dayanımına  göre  çok  zayıftır.  Sı‐
lerek  parça  üretimi  yöntemidir.  Toz  meta‐ kıştırılmış tozlar bir birleriyle temas etseler 
lürjisi  ile  elde  edilen  parçalar  gözenekli  ve  bile  bir  birlerinden  bağımsıdırlar.  Sinterle‐

92  Journal of Qafqaz University
Toz Metalürjisi ile Üretilmiş İki Metal Parçanın Difüzyon Kaynağıyla Birleştirilmesinde  
Sıcaklığın Kaynak Bölgesine Etkisinin İrdelenmesi 

mede  sıcaklığın  etkisi  ile  bu  tozlar  arasın‐ için  çeşitli  yöntemler  vardır.  Bu  yöntem‐
daki  temas  noktaları  artırılmakta,  atom  ve  lerden  en  önemlisi  çeşitli  alaşım  element‐
iyonlar arasında bir bağ oluşturulmaktadır.  lerinin  ilavesi  ile  malzemelerin  alaşımlan‐
Tek  bileşenli  sistemlerde  sinterleme  tama‐ dırılmasıdır  (Skoroxod,  1995;  Zavolotnıy, 
men  katı  fazda  gerçekleşir.  Çok  bileşenli  Şevçuk,  Begun,  Koliniçenko,  ve  Varçenko, 
sistemlerde  sinterleme  işlemi  sıkıştırılmış  1994).  Daha  karmaşık  şekillere  ve  özellik‐
parçanın  katı  formunu  (iskeletini)  koruya‐ lere  sahip  olan  parçaların  üretimi,  toz  me‐
cak  şekilde katı  veya  sıvı  fazda  gerçekleşir  talürjisinin  presleme,  pişirme  (sinterleme) 
(Kurt,  2005).  Gerçekte  sinterleme  işlemi  de  ve  ısıl  işlem  operasyonlarından  başka  ek 
bir  sıcak  basınç  kaynağı  işlemi  olup,  toz‐ işlemlerin  yapılmasını  zorunlu  kılar.  Bu 
ların  birbirleriyle  birleşmesi  difüzyon  me‐ parçaların  malzemelerinin  fiziksel,  meka‐
kanizmasıyla olmaktadır.  nik ve diğer özelliklerinin iyileştirilmesi için 
malzeme  yoğunluğunun  uygun  şekilde 
Toz metalürjisi, ana imalat yöntemleri olan  ayarlanması,  yeterli  alaşımlamanın  ve  ısıl 
döküm,  plastik  şekil  verme,  talaşlı  imalat  işlemin  yapılması  gereklidir.  Bununla  bir‐
ve kaynaklı imalata (ergitme kaynağı) göre  likte,  ergime  sıcaklığı  düşük  olan  metaller 
daha  farklı  bir  imalat  yöntemidir  ve  bu  sayesinde  üretilecek  parçaların  gözenekle‐
yöntemin  kendine  has  özellikleri  vardır.  rinin yeterli derecede doldurulması da sağ‐
Bunlar,  üretimi  zor  olan  alaşımların  daha  lanmalıdır. 
kolay üretilebilmesi, karmaşık şekilli parça‐
ların imalatının kolaylığı, yoğunluk kontro‐ Karmaşık şekle sahip bir ürünün elde edil‐
lünün  yapılabilmesi  ve  ekonomiklik  gibi  mesi,  bazen  büyük  boyutlardaki  hammad‐
özelliklerdir. Toz metalürjisi genelde kalite  deden diğer imalat yöntemleri kullanılarak, 
ve maliyet açısından diğer yöntemlerle üre‐ bazen  de  toz  metalürjisi  yöntemi  kullanı‐
tilemeyen parçaların imalatında yaygın ola‐ larak  yapılır.  Toz  metalürjisi  yönteminde 
rak  kullanılır  (Babayev,  Karadeniz,  ve  presleme, pişirme (sinterleme) ve az sayıda 
Memmedov,  2005).  Toz  metalürjisi  ile  elde  talaşlı  imalat  gerekebilir.  Karmaşık  şekilli 
edilmesi  düşünülen  bir  parçanın  malze‐ elemanlar  iki  veya  daha  fazla  parçalı  üre‐
mesi ve elde edilecek parça, kalite ve mali‐ tilerek daha sonra birleştirilebilirler. Parça‐
yet açısından diğer yöntemlerdekilerle kar‐ nın  bütün  olarak  hazırlanması  gerekli  za‐
şılaştırılmalı ve elde edilen sonuca göre toz  manı  arttırmakta,  daha  büyük  boyutlu 
metalürjisinin  uygulanıp,  uygulanmama‐ preslere  ve  pres  kalıplarına  ihtiyaç  gerek‐
sına karar verilmelidir. Toz metalürjisi tek‐ tirmekte ve bunların yanında bir çok teknik 
nolojisi, makine ve elemanlarının yapımın‐ ve  ekonomik  zorluklara  neden  olmaktadır 
da  istifade  edilen  önceki  teknolojilerden  (Ordenko, 1987). Bu nedenle de, bu tip ele‐
farklıdır.    En  önemli  farklılığı,  istenilen  manların, bir kaç basit parçaya ayrılarak bu 
özellik  ve  şekle  sahip  ürünlerin  elde  edil‐ parçaların soğuk presleme yöntemiyle elde 
mesine  imkan  vermesidir.  Kaliteli  ve  kar‐ edildikten  sonra  birleştirilerek,  son  şekle 
maşık  parçaların  ekonomik  olarak  üretile‐ getirilmesi  yalnızca  fırın  içerisinde  difüz‐
bilmesi toz metalurjisini daha da cazip kıl‐ yon  kaynağı  (sıcak  basınç  kaynağı)  ile 
maktadır  (Federçenko  ve  Pugına,  1980;  mümkün olmaktadır. 
Radomıselskiy, 1985). 
Toz  metalürjisi  ile  elde  edilen  malzemele‐
Toz  metalurjisi  malzemeleri  içerisinde  de‐ rin  kaynağı  veya  birleştirilmeleri,  haddele‐
mir esaslı toz metal malzemeler önemli bir  me  veya  diğer  üretim  yöntemleri  ile  üre‐
yere  sahiptirler.  Bu  malzemelerin  çeşidini  tilmiş  malzemelerin kaynağından farklıdır. 
arttırmak ve uygulama alanını genişletmek  Preslenmiş  toz  malzemeler  pişirilerek  kay‐

Number 25, 2009    93
 
Yadullah Babayev 

nak  edildiğinde  ergiyen  malzemenin  ha‐ Ergitme  ve  nokta  kaynağı  ile  toz  metal 
cimsel  büzülme  ve  ısıl  genleşme  miktar‐ malzemeler  kaynak  edildiğinde  toz  parça‐
larının kaynaktan önce tam olarak belirlen‐ cıklarının  iyi  özellikleri  (örneğin  mekanik 
mesi  gerekmektedir.  Bunun  dışında  parça‐ mukavemet  değerleri)  değişerek,  yok  ol‐
ların  montajında  parçaların  arasındaki  ara  maktadır.  Bu  nedenle  toz  metal  malzeme‐
boşlukların  dikkate  alınması  gerekmekte‐ lerin  kaynağında  bu  yöntemlerin  kullanıl‐
dir.  Bu  ara  boşlukların  optimal  değerleri  ması  uygun  değildir.  Ayrıca  ergitme  kay‐
ana malzemeye ve bu malzeme içerisindeki  nağı yöntemlerinin kullanılması durumun‐
ergiyen metallere bağlıdır.  da   gözenekli  yapı  çeşitli  kaynak  problem‐
leri oluşturmaktadır. Kaynak işlemi sırasın‐
2.  Toz Metalürjisi ile Üretilmiş  da  sinterlenmiş metalin ergime bölgesinde 
Parçaların Kaynağı  gözeneklerin  tamamen  ortadan  kalkması, 
kaynak  dikişinde  büyük  boşlukların  oluş‐
Farklı  kimyasal  bileşime  sahip  malzeme‐
ma  riskini  artırmaktadır.  Özellikle  iki  toz 
lerin  difüzyon  kaynağında  ve  gözenekli 
metal  parçanın  kaynaklanmasında  bu  risk 
malzemelerin  kaynağında  kaynak  işlemin‐
daha   önemli  duruma  gelmektedir.  Bu  du‐
de çeşitli zorluklar ile karşılaşılmaktadır.  
rumda,  ortadan  kalkan  gözeneklerin  oluş‐
Toz metalürjisi yöntemiyle elde edilen par‐ turduğu  hacimsel  boşluk  oluşumunu  en‐
çaların kaynak işlemi fırında gerçekleştiril‐ gellemek  için  özel  dolgu  malzemelerinin 
diğinde  kaliteli  bir  kaynak  dikişinin  elde  kullanılması  gerekmektedir  (Varol,  Tunay, 
edilebilmesi  için  malzeme  bileşiminin  ve  Tüfekçi,  2002).  Yapılan  deneyler  bu  tip 
sinterleme  süresinin  uygun  seçilmesi  gere‐ malzemelerin difüzyon kaynağı vasıtasıyla 
kir.  Ayrıca  bu  birleştirme  işleminde  kons‐ birleştirilmesinin  daha  uygun  bir  yöntem 
trüktif  faktörlerin  de  dikkate  alınması  ge‐ olduğunu göstermektedir. Pratikte, toz me‐
rekir (Demyanenko ve Polikov, 1998).   talürjisi ile üretilen parçaların kaynağı hak‐
Toz  metal  malzemeler  haddeleme,  döküm  kında  pek  fazla  bilimsel  çalışma  yapılma‐
gibi  geleneksel  imalat  yöntemleri  ile  üre‐ mıştır.  Kaynaklı  bir  toz  metalürjisi  ile 
tilen  malzemelere  göre  bazı  değişik  ve  üretilen  parçanın  yapısı  ve  özelliklerinin 
avantajlı  özelliklere  sahiptir.  Bu  avantajlar,  bilinmesi bu malzemelerin kaynağında bü‐
üretimi zor olan alaşımları daha kolay üre‐ yük  önem  arz  eder.  Toz  metalürjisi  yönte‐
tme,  karmaşık  şekilli  parçaların  imalat  ko‐ miyle  üretilmiş  malzemelerin  difüzyon 
laylığı, yoğunluk kontrolü (uygulanan pres‐ kaynağı yöntemiyle birleştirilmesi, hem toz 
leme  basıncı  değiştirilerek  arzu  edilen  yo‐ metalürjisi  ile  üretilen  malzemelerin  oriji‐
ğunluk  değeri  elde  edilebilir)  ve  ekono‐ nal yapısının korunması ve hem de oluştu‐
rulacak malzeme çiftinin difüzyon kaynağı 
miklik  gibi  olanaklardır.  Bununla  birlikte 
davranışlarının  anlaşılması  açısından  çok 
toz  metal  malzemelerin  kaynağı  veya  bir‐
önemlidir (Ozan ve diğerleri, 2006).  
leştirilmeleri hadde veya diğer üretim yön‐
temleri  ile  üretilmiş  malzemelerin  kayna‐ 3. Deneysel Çalışma 
ğından  biraz  farklı  olmaktadır.  Preslenmiş 
3.1.  Malzeme ve Deney Numunelerinin 
toz  parçaların  pişirilme  ile  kaynaklanma‐
Hazırlanması 
sında  ergiyen  malzemenin  büzülme  ve  ısıl 
genleşme  ölçülerinin  tam  olarak  tayin  edil‐ Kaynatılacak parçaların üretiminde Fe, Cu, 
mesi gerekmektedir. Bunun dışında parçala‐ Zn  ve  C  olmak  üzere  4  farlı  toz  malzeme 
rın montajında ara boşlukların dikkate alın‐ kullanılmıştır.  Bu  toz  malzemelere  sıkıştır‐
ması  gerekir.  Bu  ara  boşlukların  optimal  ma  sırasında  toz  taneleri  arasında  ve  toz 
değeri ana ve ergiyen metallere bağlıdır.  taneleri  ile  kalıp  duvarı  arasında  sürtün‐

94  Journal of Qafqaz University   
Toz Metalürjisi ile Üretilmiş İki Metal Parçanın Difüzyon Kaynağıyla Birleştirilmesinde  
Sıcaklığın Kaynak Bölgesine Etkisinin İrdelenmesi 

meyi kolaylaştırmak için Zn sterat yağlayı‐ toz  metal  numuneler  iç  ve  dış  silindirik 


cı ilave edilmiştir. Deneylerde kullanılan Fe  parçalar olarak hazırlanmışlardır ve boyut‐
tozunun görünür yoğunluğu 2.7‐2,9 gr/cm3  ları Şekil 1’de gösterilmiştir. 
olup,  7  ton  yükle  preslemede  yoğunluğu 
6.6 gr/cm3  değerini almaktadır. Fe tozunun 
kimyasal  bileşimi  ağırlık  yüzdesi  olarak 
Tablo  1’de  ve  karışımdaki  tane  çapları  da‐
ğılımı ağırlık yüzdesi olarak Tablo 2’de elek 
analizine bağlı olarak aşağıda verilmiştir.  Şekil 1.  (a) İç silindirik (Fe‐Cu‐C) ve (b) dış silindirik 
(Fe‐Zn‐C) T/M parçaların kesit görünüşü, (c) 
Tablo 1.  Fe tozu kimyasal bileşimi   her iki parçanın montaj edilmiş hali 
Kimyasal  C  Si  Mn  S  P  O2 
Bileşim  Kaynağı yapılan numunelerin kimyasal 
0.08  0.1  0.3  0.02  0.03  0.5 
(%w)  kompozisyonu ağırlık yüzdesi (%w) ola‐
Tablo 2. Fe tozunun tane çapı dağılımı 
rak Tablo 5’de verilmiştir. 
Tane Çapı  Tablo 5. T/M numunelere ait kimyasal kompozisyon (%w) 
<56  56‐160  160‐200  200‐250 
(μm) 
İç Silindirik 
Ağrılık  %3 Cu %0,8 C  Kalanı Fe  %0,5 
Parça 
Yüzdesi  10‐30  Kalanı  5‐15  0.3  Zn 
Dış Silindirk 
(%w)  %2 Zn %0,8 C  Kalanı Fe  Sterat 
Parça 

Karışımda  kullanılan  Cu  tozu  elektroliz 


Değişik  bileşimdeki  tozların  karıştırılması 
yöntemiyle  elde  edilmiş  olup,  normalizas‐
işlemi  kapasitesi  0.1  m3  olan  Smesitel  mar‐
yon işlemi uygulanmıştır. Görünür yoğun‐ ka  karıştırma  makinesinde  gerçekleştiril‐
luğu  1.25‐1,9  gr/cm3  arasında  değişmek‐ miştir.  Seçilen  malzemeler  Makine  hazne‐
tedir ve tane çapı büyüklüğü 100 μm’dir.   sine  yerleştirildikten  sonra,  makine  45  da‐
Karışımda kullanılan Zn tozunun kimyasal  kika süreyle çalıştırılmıştır. Tozların homo‐
bileşimi ağırlık yüzdesi olarak ve elek ana‐ jen  olarak  karışabilmelerini  gerçekleştire‐
lizi sırasıyla Tablo 3 ve 4’de verilmektedir.  bilmek için makine haznesine çapları 10‐30 
mm olan çelik bilyeler yerleştirilmiştir. 
Tablo 3.  Zn tozu kimyasal bileşimi 
Numunelerin  soğuk  presleme  işleminde 
Kimyasal  Pb  Cd  Fe  Zn 
Bileşim (%w)  <0.1  <0.1  <0.2  Kalanı 
KAO 81‐30 marka ve 100 ton kapasitesi olan 
mekanik pres kullanılmıştır. Pres çift tesirli 
Tablo 4. Zn tozunun tane çapı dağılımı  olup, alttan ve üstten sıkıştırmalıdır. Bu pres 
Tane Çapı  ile  1000  MPa  soğuk  presleme  basıncında 
+45  30‐45  20‐30  10‐20 ‐10 
(μm)  soğuk  presleme  ile  iç  ve  dış  silindirik  par‐
Ağırlık  çalar  üretilmiştir  (Şekil  1).  Soğuk  presleme 
0.1  40  30  23.9  6 
yüzdesi (%w) 
sonucunda  iç  silindirik  parçanın  ham  yo‐
ğunluğu 7.23 gr/cm3 ve dış silindirik parça‐
Malzeme  mukavemetinin  artırılması  için 
nın  ham  yoğunluğu  ise  7.09  gr/cm3  olarak 
içerisine ayrıca %0.8 grafit katılmıştır. Karı‐
elde  edilmiştir.  Burada  ham  yoğunluk  toz 
şımda  kullanılan  grafit  tozu  2.253  gr/cm3’‐
metal  parçanın  sinterlemeden  önceki  yo‐
lük yoğunluğa sahip olup tane çapı ortala‐
ğunluğudur  ve  ham  yoğunluk  hesabı  so‐
ma 20 mikrondur. 
ğuk  presleme  sonrası  toz  metal  numune‐
Deneylerde  iki  farklı  toz  metal  malzeme  lerin  boyutlarına  ve  kütlesine  bağlı  olarak 
gurubu  kullanılmıştır.  Kaynağı  yapılacak  hesaplanmıştır.  

Number 25, 2009    95
 
Yadullah Babayev 

Soğuk preslemeyle üretilmiş  olan parçalar,  kıldıkça  ergimiş  Cu’dan  dolayı  sıvı  hal 


normal  geçme  olarak  montaj  (Şekil  1.  c)  sinterlenmesi  meydana  gelmektedir.  Sıvı 
edildikten  sonra  60  dakikalık  sabit  sinter‐ haldeki Cu gözeneklerin içine ve tane sınır‐
leme süresinde ve 1050, 1100, 1150 ve 1200OC  larına  yerleşmektedir.  Sıvı  haldeki  Cu  iyi 
sinterleme  sıcaklıklarında,  2000OC  kapasi‐ bir bağ kuvveti oluşturur. 
teli  SEV‐2.5,5/20‐E  marka  vakumlu  fırında 
Dış  silindirik  parça  bileşiminde  bulunan 
sinterleme  ve  difüzyon  kaynağı  işlemine 
çinko ise, 900OC civarında buharlaşarak bi‐
tabi tutulmuştur. Vakum ortamı 1.3×10‐3 Pa 
leşimi terk etmektedir. Yapıyı terk eden Zn 
değerinde  sağlanmıştır.  Arzu  edilen  sıcak‐
elementinin  yerini  Fe  ve  C  elementleri  al‐
lığa  yaklaşık  olarak  20  OC/dak  ısıtma  hı‐
maktadır.  Bu  sayede  dış  silindirik  parça‐
zında  ulaşılmıştır.  Fırın  sıcaklığı  600OC’ye 
daki  büzülme  oranında  artma  olmaktadır. 
ulaştığında 30 dakika bu sıcaklıkta durula‐
İç  silindirik  parçanın  genleşmesi,  dış  silin‐
rak  toz  metal  karışımı  içerisinde  yer  alan 
dirik parçanın da büzülmesiyle kaynak böl‐
Zn  sterat  yağlayıcısı  ve  diğer  katışkıların 
gesinde  temas  eden  yüzeyler  arasında  bir 
yanarak  malzemeyi  terk  etmesi  sağlanmış‐
basınç oluşmaktadır. Bu basınç ta difüzyon 
tır. Sinterleme işlemi bittikten sonra numu‐
kaynağının  gerçekleşmesinde  gerekli  para‐
nelerin  soğuma  işlemi,  fırın  içerisinde  ko‐
metrelerden birini oluşturmaktadır. 
ruyucu  atmosfer  olan  vakum  ortamında 
serbest soğumayla sağlanmıştır.  Kesme Mukavemetinin Saptanması 
Kaynak  edilmiş  numuneler  basma  deneyi‐
3.2. Deney Bulguları ve Değerlendirme 
ne  tabi  tutularak  kaynaklı  birleştirmenin 
Sırasıyla  Fe‐Cu‐C  ve  Fe‐Zn‐C  malzeme  kesmeye karşı dayanımı tespit edilmiştir. 
kombinasyonlarından  hazırlanmış  iki  adet 
iç ve dış silindirik toz metal parçaların bir‐ 50
leştirilmesinde  60  dakika  süreyle  ve  1050, 
Kesme Mukavemeti, MPa

45
1100,  1150  ve  1200OC  sıcaklık  değerlerinde 
40
bir  vakumlu  fırın  içerisinde  difüzyon  kay‐
35
nağı  işlemi  uygulanmıştır.  Buradaki  kay‐
nak  işleminde  dıştan  her  hangi  bir  basınç  30

uygulanmamıştır. Kaynak edilecek parçala‐ 25
rın  kimyasal  içeriği,  kaynak  dikişinin  ka‐ 20
liteli  olmasını  sağlayabilecek  şekilde  seçil‐ 1050 1100 1150 1200

miştir.   Sıcaklık, C

İç  silindirik  parçanın  boyutlarında,  bileşi‐ Şekil  2.  Kesme  mukavemetinin  sinterleme  sıcaklığı‐
minde  bulunan  Cu  yüzdesine  bağlı  olarak  na göre değişimi 
sinterleme  sonrası  bir  artış  meydana  gel‐
mektedir.  Yapılan  literatür  araştırmasına  Şekil 2’den de görülüğü gibi kaynak sıcak‐
göre karışıma katılan %0.8 karbonun 900OC  lığı  artışına  bağlı  olarak  kaynaklı  birleştir‐
civarındaki  sıcaklıklarda  Fe  içerisinde  çö‐ menin kesmeye karşı dayanımı da artmak‐
zünmeye  başlayarak  perlit  oluşturduğu  tadır.  1050OC’de  mukavemetin  düşük  ol‐
tespit edilmiştir. 1083OC sıcaklığa kadar Fe‐ masının  sebebinin,  bu  sıcaklıkta  meydana 
Cu‐C  karışımında  olan  toz  metal  parçada  gelen katı hal difüzyonu sonucu, Cu atom‐
katı  hal  sinterlenmesi  meydana  gelmekte‐ larının  katı  halde  Fe  ve  C’la  tane  sınırla‐
dir.  Bakırın  ergime  sıcaklığının  üzerine  çı‐ rında daha düşük kuvvette bağ oluşturma‐

96  Journal of Qafqaz University   
Toz Metalürjisi ile Üretilmiş İki Metal Parçanın Difüzyon Kaynağıyla Birleştirilmesinde  
Sıcaklığın Kaynak Bölgesine Etkisinin İrdelenmesi 

larını olarak tahmin edilmektedir. 1083OC’‐ mesine  bağlı  olarak  bir  artışın  olduğu  gö‐


nin üzerinde Cu sıvı halde olduğundan do‐ rülmektedir.  Sertlik  değerlerinde  olan  ani 
layı 1100OC’nin üzerinde sıvı hal difüzyonu  düşüşlerin  sebebi  ölçüm  aldığımız  bölge‐
meydana  gelmektedir.  Sıvı  halde  olan  Cu  nin altında veya yanında gözeneklerin var‐
tane  sınırlarına  nüfuz  ederek  tane  sınırla‐ lığına bağlanmaktadır. Ayrıca yapıdaki fer‐
rını  ıslatır  ve  daha  kuvvetli  bir  bağ  oluş‐ ritin ve bazı bölgelere Cu’ın birikmesi (ana 
masına neden olur (Yılmaz, 2005).   malzeme  içinde  çözünemeyen  Cu’ın  tane 
sınırlarında çökelmesinden dolayı) de sert‐
Sıcaklık değeri 1050OC’den 1100OC’ye yük‐
lik değerinin düşmesine neden olmaktadır. 
seldiğinde  kesme  mukavemeti  değerinde 
Fe‐Cu‐C toz karışımından olan iç silindirik 
kayda  değer  bir  artış  görülmektedir.  Yani 
parçanın  sertlik  değeri  bileşimde  olan  Cu 
kati  hal  difüzyonundan  sıvı  hal  difüzyo‐
sebebiyle daha yüksek olmaktadır. Kaynak 
nuna  geçişte  kaynak  birleşmesinin  kesme  bölgesine  doğru  sertlik  değerinde  genel 
mukavemetinde  çok  belirgin  bir  yükselme  olarak  düşüş  gözlenmektedir.  Buna,  Cu’ın 
olmuştur.  Sıcaklığın  1100,  1150  ve  1200OC  difüzyonla  dış  silindirik  parçaya  geçmesi 
değerleri  arasında  kesme  mukavemeti  de‐ ve iç silindirik parçada Cu oranının kısmen 
ğerindeki  yükselme  öncekine  oranla  daha  azalması  sebep  olmaktadır.  1050OC’de  katı 
az  olmaktadır.  Kesme  mukavemetinin  en  hal  difüzyonu  sebebiyle  Cu’ın  karşı  parça‐
yüksek  değeri  1200OC  sıcaklık  değerinde  ya  difüzyonu  çok  az  olduğundan  Fe‐Cu‐C 
elde edilmiştir.  toz karışımı parçanın sertlik değeri yüksek 
Sertlik Değerlerinin Saptanması  olmaktadır. 

Şekil 3’te difüzyon kaynağıyla birleştirilmiş  En  yüksek  sertlik  değeri  1200OC’de  elde 


numunelerin  sertlik  değerleri  verilmiştir.  edilmiştir.  Cu’ın  dış  silindirik  parçaya  di‐
Yapılan deneyde Fe‐Cu‐C toz karışım mal‐ füzyonu  ile,  bu  parçanın  da  kaynak  bölge‐
zemesinden olan iç silindirik parçadan baş‐ sine  yakın  kısımlarında  sertlik  değerleri 
layarak  kaynak  bölgesine  kadar  ve  sonra  yükselmiştir. Kaynak bölgesinden uzaklaş‐
takiben  Fe‐Zn‐C  toz  karışım  malzemesin‐ tıkça  sertlik  değerlerinde  düşme  meydana 
den  olan  dış  silindirik  parçanın  kesiti  bo‐ gelmiştir. 
yunca  1’er  mm  aralıklarla  sertlik  değerleri  Metalografik Muayene 
ölçülmüştür. 
Metalografik incelemelerde kaynak sıcaklı‐
1050oC 1100oC 1150oC 1200oC
ğının  yükselmesiyle  difüzyon  kaynağının 
Fe-Cu-C Fe-Zn-C metalografik  olarak  ta  daha  iyi  gerçekleş‐
450
400 tiği  saptanmıştır.  Şekil  4’de  1050OC  sıcak‐
350
Sertlik değeri, HV

300 lıkta yapılan difüzyon kaynağında, kaynak 
250
200
bölgesinin  çeşitli  bölgelerinden  alınan  fo‐
150 toğraflar  görülmektedir.  Fotoğraflardan  da 
100
50 anlaşılacağı  üzere  1050OC’de  yapılmış  di‐
0
-5 -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 5 füzyon kaynağında, difüzyonun yeterli dü‐
Mesafe, mm zeyde  olmadığı  ara  kesitlerde  (şekil  4  a,  b 
  ve  c’de)  belirgin  olarak  gözükmektedir. 
Şekil 3.  Kaynaklı  birleşmenin  sertlik  değerinin  kay‐
Şekil 4 d’de ise bir miktar difüzyonun ger‐
nak sıcaklığına göre değişimi 
çekleştiği  görülmektedir.  Burada  difüzyo‐
Şekil  3’te,  kesme  mukavemetinde  olduğu  nun  yeterli  derecede  olmamasının  sebebi 
gibi sertlik değerlerinde de sıcaklık yüksel‐ sıcaklığın yeterli olmamasıdır. 

Number 25, 2009    97
 
Yadullah Babayev 

Ara kesit Ara kesit

Fe-Zn-C Fe-Cu-C
Fe-Zn-C Fe-Cu-C

(a) (b) 

Ara kesit
Ara kesit

Fe-Zn-C Fe-Cu-C Fe-Zn-C Fe-Cu-C

  (c)                                                                    (d)  

Şekil 4. 1050OC sıcaklık 60 dakika sinterleme süresinde yapılmış difüzyon kaynak bölgesi (x400); birleşme 
yüzeyinden (a) 2 mm, (b) 6 mm, (c) 10 mm, (d) 14 mm 

1100  ve  1150OC  sıcaklıklarda  difüzyonun  görülmüştür. Cu’ın büyük bölümü ise Fe‐C 


yeterli olduğu saptanmıştır. Fakat en iyi di‐ alaşımının  tane  sınırlarına  çökelmiştir.  Bu 
füzyonun  ise  1200OC  meydana  geldiği  gö‐ olay SEM incelemesinde de açık bir şekilde 
rülmüştür.  Şekil  5’ten  de  görüleceği  üzere  gözükmektedir. Bu malzemenin bazı bölge‐
birleşme  yerindeki  arakesitler  1200OC’de  lerinde  ise  Cu  yığılmasının  olduğu  da  tes‐
tamamen ortadan kalkmıştır.  pit edilmiştir.  
Metalografik incelemeler sonucu malzeme‐
nin  yapısının  perlit  ve  ferritten  oluştuğu 

98  Journal of Qafqaz University
Toz Metalürjisi ile Üretilmiş İki Metal Parçanın Difüzyon Kaynağıyla Birleştirilmesinde  
Sıcaklığın Kaynak Bölgesine Etkisinin İrdelenmesi 

Ara kesit
Ara kesit

Fe-Zn-C Fe-Cu-C Fe-Zn-C Fe-Cu-C

(c) (b) 

Ara kesit
Ara kesit

Fe-Zn-C Fe-Cu-C Fe-Zn-C Fe-Cu-C

(c) (d) 
Şekil 5. 1200 C sıcaklık 60 dakika sinterleme süresinde yapılmış difüzyon kaynak bölgesi (x400);  birleşme 
O

yüzeyinden (a) 2 mm, (b) 6 mm, (c) 10 mm, (d) 14 mm 
 

Şekil 7.  1200OC’de  kaynak  edilmiş  numunenin  SEM 


Şekil 6.  1050 C’de  kaynak  edilmiş  numunenin  SEM 
O analizi 
analizi  Buradan  da  anlaşılacağı  üzere  bu  sıcaklık 
Numuneler  SEM  (Scanning  Electron  değerlerinde  difüzyon  işleminin  yeterli  ol‐
Microscopy)  analizine  tabi  tutulmuştur.  madığı ve dolayısıyla kaynakta yetersiz bir 
1050OC’de  kaynak  edilmiş  numunenin  hat  nifuziyet olmuştur. 1200OC’de kaynak edil‐
analizi  (line  analyse)  sonuçları  incelendi‐ miş  numunelerin  hat  analizi  sonuçlarında 
ğinde Cu’ın Fe‐Zn‐C toz metal parçaya da‐ ise  Cu’ın  Fe‐Zn‐C  toz  metal  parçaya  daha 
ha az difüz ettiği görülmektedir (Şekil 6).   iyi difüz ettiği görülmektedir (Şekil 7).  

Number 25, 2009    99
 
Yadullah Babayev 

4. Sonuçlar  − Skoroxod  V.V.  (1995).  Sostoyanıe  i  perispektivı 


razvitiya  nauçnıx  osnav  poroşkovoy  metallurgii. 
Sıcaklık  1050OC’den  1200OC’te  yükseldikçe  Poroşkovaya Metallurgiya, (10), s. 20‐24. 
difüzyon kaynağının daha iyi olduğu tespit  − Zavolotnıy  L.V.,  Şevçuk  Y.F.,  Begun  K.İ.,  Kolini‐
edilmiştir.  Aynı  zamanda  sıcaklığın  artışı‐ çenko  A.F.  ve  Varçenko  V.T.  (1994).  Poroşkovıe 
antifrukçionnıe  materialı  na  osnove  matallokon‐
na  bağlı  olarak  kaynak  dikişinin  kesme 
çentrata  iz  şlifovalnıx  şlamov.  Poroşkovaya 
kuvvetine karşı dayanımının da yükseldiği  Metallurgiya, (7/8), s. 89‐92. 
görülmüştür.  − Ordenko  V.B.  (1987).  Proizvodstvo  i  primeneni‐
Bileşikte olan bakırın yüksek yoğunluğa ve  ya izdeliy iz metalliçeskix poroikov. Kiev. 

yayınma  katsayısına sahip  olmasından  do‐ − Ozan  S.,  Çaligülü  U.,  Taşkin  M.,  Gür  A.  K., 
Dikbaş  H.  ve  Çay  V.V.  (2006).  Sicak  Presleme 
layı  Cu  yüzdesi  birleşmenin  sertliğine  ve 
Yöntemiyle İmal Edilmiş SiCp Takviyeli Alümin‐
difüzyon  kaynağının  iyi  düzeyde  gerçek‐ yum  Esasli  Kompozitlerin  Difüzyon  Kaynağinda 
leşmesine olumlu yönde etki etmiştir. Bakı‐ Sicakliğin  Birleşme  Üzerindeki  Etkisinin  İncelen‐
rın  tane  sınırlarına  ve  gözeneklere  yerleş‐ mesi.  11.  Denizli  Malzeme  Sempozyumu,  19‐21 
Nisan, s.233‐236.  
mesi  sonucu  iyi  bir  bağ  kuvveti  oluştur‐
− Demyanenko  V.L.  ve  Polikov  V.N.  (1998).  Sosto‐
duğu bilinmektedir (Zavoltnıy, 1994). Kay‐
yanie  i  perispektivı  razvitiya  poroşkovoy  metal‐
nak sıcaklığının artmasına bağlı olarak sert‐ lurgii v otrasli priborostroyaniya. Priborı i şstvmı 
lik değerlerinde artış elde edilmiştir.   upravleniya, (4), s. 27‐28. 

Bileşiğe  eklenmiş  %0.8  oranındaki  grafit  − Varol  R.,  Tunay  R.F.  ve  Tüfekçi  K.  (2002)  Toz 
metal  (T/M)  parçaların  elektron  ışın  kaynağı  ile 
yapıda perlit oluşturmuştur. Oluşan perlit‐
birleştirilmesi.  Mühendis  ve  Ma‐kine,  45(513), 
ten dolayı bileşimin mekanik özelliklerinde  s.32‐55. 
iyileşme olmuştur.  − Yılmaz  R.  (2005).  Fe‐Cu‐C  kompaktlarda  presle‐
me  basıncı  ve  toz  karışım  oranlarının  sertliğe  ve 
çekme  mukavemetine  etkisi.  4.  Uluslararası  Toz 
KAYNAKLAR  Metalürjisi Konferansı, 18‐22 Mayıs, s.795‐806. 

− Şükürov R.İ. (2002). Metalşünaslıq. Bakü: Çaşıoğlu   
Yayınevi. 
− Avcı  A.U.  (1993).  Toz  metalürjisi  ders  notları. 
Yıldız Teknik Üniversitesi, İstanbul. 
− Bishop D.P. (1998). Diffusion‐based micro‐alloying 
via  reaction  sintering.  Ph.D.  Thesis,  Dalhousie 
University. 
− Kurt  A.O.  (2005).  Toz  üretim  yöntemleri  ve  sin‐
terleme.  Sakarya  Üniversitesi,  Mühendislik  Fa‐
kültesi,  Metalürji  ve  Malzeme  Mühendisliği  Bö‐
lümü Ders Notları, s. 19‐20. Sakarya. 
− Babayev  Y.,  Karadeniz  S.  ve  Memmedov  A. 
(2005).  Fe‐Cu  karışımı  toz  malzemenin  tribolojik 
özelliklerinin  incelenmesi.  3.  Makina  Tasarım  ve 
İmalat Teknolojileri Kongresi, 16‐17 Eylül, s. 127‐
130. 
− Federçenko  İ.M.  ve  Pugina  L.İ.  (1980).  Kompozi‐
çionnıe  speçennıe  antifrikçionnıe  materialı.  Kiev: 
Nauk 
− Radomıselskiy  İ.D.  (1985).  Poroşkovıe  konstruk‐
çionnıe  detali.  Sovremennoe  sostoyanıe,  peres‐
pektnıe  razvitiya.  Poroşkovaya  Metallurgiya, 
(10), s. 37‐41.  

100  Journal of Qafqaz University   
 
 
 
КОНФОРМАЦИОННЫЕ СВОЙСТВА МОЛЕКУЛЫ 
АНТИМИКРОБНОГО ПЕПТИДА ТРИТРПТИЦИНА 

Г.А. АГАЕВА, Р.Э. АЛИЕВ 
Бакинский государственный университет 
Баку / АЗЕРБАЙДЖАН 
gulshen@mail.ru 

РЕЗЮМЕ 
Методом молекулярной механики исследовано пространственное строение антимикробного пептида 
тритрптицина  в  условиях  полярной  среды  и  среды,  имитирующей  окружение  мембраны.  Исследование 
пространственного строения пептида на основе его фрагментарного конформационного анализа показало, 
что  он  обладает  способностью  формировать  целый  ряд  низкоэнергетических  конформаций,  которые 
можно  сгруппировать  в  четыре  семейства  конформаций,  обладающих  идентичной  конформацией  цент‐
рального фрагмента Phe4‐Phe10. 
Ключевые слова: Конформация, пептид, тритрптицин 

CONFORMATIONAL PROPERTIES OF THE ANTIMICROBIAL PEPTIDE TRITRPTICIN 

ABSTRACT 

The  spatial  structure  of  the  antimicrobial  peptide  tritrpticin  has  been  investigated  by  molecular  mechanics 
method  at  the  polar  and  membrane  simulated  conditions.  It  is  showed  that  tritrpticin  has  possibility  to  form  a 
series  of  low‐energy  conformation,  which  may  be  presented  by  four  structure  families  with  identical  backbone 
forms of the central fragment Phe4‐Phe10. 
Key words:  Conformation, peptide, tritrpticin 
 
 
шинство  природных  пептидов  наряду  с 
Введение 
антимикробным  обладают  некоторым 
Антимикробные  пептиды  в  живых  су‐ гемолитическим  действием,  то  есть  раз‐
ществах,  включая  человека,  эффективно  рушают  человеческие  эритроциты  [1‐5]. 
борются  с  бактериями  и  грибками,  что  Поэтому становится актуальной пробле‐
создает  перспективы  для  их  практичес‐ ма создания таких искусственных анало‐
кого  применения  в  качестве  лекарствен‐ гов  природных  антимикробных  пепти‐
ного препарата. Антимикробные пепти‐ дов,  которые  бы  обладали  антибакте‐
ды, хотя несколько уступают антибиоти‐ риальной, но не имели  гемолитической 
кам  по  эффективности,  но  действуют  активности.  Однако  механизм  действия 
намного  быстрее  и,  что  самое  главное,  этих  пептидов  до  сих  пор  детально  не 
уничтожают бактерии, устойчивые к из‐ изучен,  а  потому  направленный  моле‐
вестным антибиотикам. Однако примен‐ кулярный дизайн весьма затруднителен. 
ять в клинике в качестве антибиотиков и  К  таким  антимикробным  пептидам 
антигрибковых средств можно только те  относится  тритрптицин  молекула,  ко‐
пептиды, которые не  разрушают клетки  торого  состоит  из  13  аминокислотных 
млекопитающих.  Как  оказалось,  боль‐ остатков  с  последовательностью 

Number 25, 2009    101
Г.А. Агаева, Р.Э. Алиев 

VRRFPWWWPFLRR  [1‐3].  Этот  пептид  менительно  к  полярной  среде    и  как  к 


относится к классу  Arg/Pro богатых пеп‐ среде,  имитирующей  мембранное  окру‐
тидов  семейства  кателицидинов,  выде‐ жение.  Параметризация потенциальных  
ленных из нейтрофильных гранул свиньи.  функций  в  первом  случае  была  аппрок‐
Уникальность    тритрптицина  состоит  в  симирована  к  условиям  полярной  сре‐
наличие  в  его  последовательности  трех  ды:  величина  диэлектрической  постоян‐
последовательно  связанных  остатков  ной принята равной 10 [6] и водородные 
триптофана.  Как  и  другие  антимикроб‐ связи  предполагались  ослабленными 
ные  пептиды  тритрптицин  является  (максимальная энергия при r0=1,8 Å сос‐
мембрано‐активным  пептидом,  т.е.  он  тавляла –1.3 ккал/моль), а во втором слу‐
связывается  с  микробной  мембраной,  чае  диэлектрическая  постоянная  бралась 
что  приводит  к  лизису  мембраны.  По  равной  4  (максимальная  энергия  при 
всей  видимости,  своеобразие  аминокис‐ r0=1,8 Å составляла –1.5 ккал/моль).  Рас‐
лотной  последовательности  тритрпти‐ чет стабильных конформаций  пептидов 
цина достаточно для формирования оп‐ проводился  с  помощью  программы    и 
ределенной  пространственной  мембрано‐ системы потенциальных функций,  ранее 
активной структуры, т.е. важной для свя‐ описанных и примененных в работах  [7‐
зывания пептида с мембраной. Поэтому 
11].   
помимо  знания  механизма  биологичес‐
кого  действия  полифункционального  При  обсуждении  результатов  расчета 
пептида, необходимо знание и его прос‐ была  использована  принятая  классифи‐
транственной  организации  для  опреде‐ кация    пептидных  структур  [7].  Выбор 
ления  конформационно‐функциональ‐ структурных  вариантов    при  расчете 
ных взаимосвязей и создания его эффек‐ конформаций  отдельных пептидов осу‐
тивных  селективно‐действующих  анало‐ ществлялся  на  основе  известных  значе‐
гов без вредных воздействий [4,5].  В нас‐ ний  двугранных  углов  (ϕ  и  ψ)  соответ‐
тоящей  статье  представлены  результаты  ствующих    низкоэнергетическим    об‐
исследования  конформационных  осо‐ ластям    конформационной  карты  R,B,L 
бенностей  молекулы  тритрптицина  ме‐ и  P  для  каждого  монопептида.  Для  всех  
тодом  молекулярной  механики  в  усло‐ неглициновых  монопептидов  варианты  
виях полярной среды и и среды, имити‐ составлялись  из R, B и L областей, а для  
рующей окружение мембраны.                                             
остатка пролина, благодаря жестко фик‐
сированной  связи  N‐Cα, только из  R и B 
Метод Расчета  областей. Отсчет двугранных  углов  про‐
водился согласно общепринятой номенк‐
Исследование  конформационных    воз‐
латуре  [12].  Как  известно,  для    остатка 
можностей  тритрптицина  и  его  отдель‐
предшествующего  пролину,  стерически  
ных  фрагментов    проводилось  методом 
разрешена лишь B форма основной цепи 
теоретического  конформационного  ана‐
[13],  что  значительно  ограничивает  его 
лиза с использованием  стандартной гео‐
конформационные возможности. 
метрии. При расчете конформационной 
энергии    учитывались  невалентные  и 
Результаты и Обсуждение 
электростатические  взаимодействия,  во‐
дородные  связи  и  торсионные  потенци‐ Конформационное  исследование  моле‐
алы.  Следует  отметить,  что  расчеты  ст‐ кулы  тритрптицина  проводилось  на  ос‐
руктурных  вариантов  каждого  исследу‐ нове    фрагментарного  анализа  согласно 
емого  фрагмента  проводилось  как  при‐ схеме  расчета,  представленной  на  рис.1. 

102  Journal of Qafqaz University   
Конформационные Свойства Молекулы Антимикробного Пептида Тритрптицина 

Начальные  структурные  варианты  для  При  выборе  вариантов  боковые  цепи 


расчета  стабильных  конформаций  от‐ остатков  пептида  варьировались  таким 
дельных фрагментов  составлялись с уче‐ образом,  чтобы  создать  максимальное 
том  оптимальных  конформаций  состав‐ количество,  стабилизирующих  структу‐
ляющих  их  свободных  монопептидов.  ру, межостаточных взаимодействий. 

H-Val1-Arg2-Arg3-Phe4-Pro5-Trp6-Trp7-Trp8-Pro9-Phe10-Leu11-Arg12-Arg13-COOH
1-4 5-8 10-13

3-6

6-9

8-11

1-9

1-11

1-13

Рис. 1. Схема расчета молекулы тритрптицина 

На рисунке 2 приведена атомная модель  формационным  своеобразием,  благодаря 


и  переменные  углы  пептида  тритрпти‐ циклическому строению основной цепи. 
цина.  Как  видно  из  рисунка  2  этот  пеп‐ Согласно  атомной  модели,  при  расчете 
тид  состоит  из  13  остатков,  два  из  кото‐ конформаций  исследуемого  пептида 
рых остатки пролина (Pro). Остатки про‐ учитывались  274  атомов  и  69  перемен‐
лина,  как  известно  [13],  обладают  кон‐ ных угла, составляющих его остатков. 
N N
C
N N N
C
C
N
C C
Cγ C C
C
C C Cβ O Cβ
O O O Cβ O O

||C' Сβ
||C' ||C' ||C' ||C' Cα N
||
C' Cα O
Cα N Cα N Cα N Cα N Cα N N
N C' Cα C'
Cα Cα Cα Cα
N C'
||O
N C'
||O
Cα N C'
||O Cβ
N C'
||O Cβ
N C'
||O ||O |O
C Cβ Cβ Cβ
C
C
C C
N N

C C
N N N N

H-Val1-Arg2-Arg3-Phe4-Pro5-Trp6-Trp7-Trp8-Pro9-Phe10-Leu11-Arg12-Arg13-COOH

Рис. 2. Атомная модель молекулы тритрптицина 

Для сокращения числа рассматриваемых  вательно  рассмотрены  конформацион‐


конформационных  состояний  нами  был  ные возможности трех перекрывающхся 
применен  поэтапный  подход  конфор‐ по  двум  остаткам  тетрапептидов  N‐кон‐
мационного  анализа.  По  схеме  расчета,  цевого  тетрапептида  Val1–Arg2–Arg3–
представленной на рис.1, были последо‐ Phe4,    Arg3–Phe4–Pro5–Trp6    и    Pro5–Trp6–

Number 25, 2009    103
Г.А. Агаева, Р.Э. Алиев 

Trp7–Trp8,    затем  на  основе  стабильных  дят уже 45 конформаций всех 8 допусти‐


конформаций  указаных  тетрапептидов  мых  шейпов  тетрапептида.  Наиболее 
и  конформаций  пролина  были  рассчи‐ низкоэнергетическими  конформациями 
таны  низкоэнергетические  конформации  оказались  структуры  с  вытянутой  фор‐
N‐концевого  нонапептида.  Для каждого  мой  основной  цепи,  хотя  лучшая  по 
исследуемого  фрагмента  в  качестве  на‐ энергии конформация с полностью свер‐
чальных  приближений  использовались  нутой  формой  основной  цепи  уступает 
величины  двугранных  углов  (ϕ,  φ,  χ1,  ей  по  стабильности  лишь  2  ккал/моль. 
χ2…χn)  низкоэнергетических  конформа‐ Для  последующего  расчета  больших 
ционных  состояний,  составляющих  его  фрагментов  были  отобраны  конформа‐
монопептидов.  Величины  двугранных  ции,  величины  относительной  энергии 
углов  (ϕ,  ψ  и  ω)  оптимальных  конфор‐ которых  входят  в  интервал  0‐5  ккал/ 
маций монопептидов выбирались из всех  моль. 
областей  стерической  карты  для  остат‐
В  отличии  от  предыдущего  тетрапепти‐
ков аналинового типа  из  B, R и  L облас‐
да,  в  следующем  рассматриваемом  тет‐
тей.  Рассмотрим  теперь  в  отдельности 
рапептиде  Arg3–Phe4–Pro5–Trp6  располо‐
результаты конформац`ионного анализа 
жен  остаток  пролина  (Pro),  который 
фрагментов пептида. Следует отметить 
ограничивает  конформационные  воз‐
Как известно, для пептидного фрагмента  можности  предыдущего  остатка,  поэто‐
число рассматриваемых структурных ти‐ му  были  рассмотрены  конформации 
пов,  т.е.  шейпов,  определяется  форму‐ только  четырех  структурных  типов.  В 
лой  2n‐1,  где  n‐число  остатков  в  после‐ последовательности тетрапептида также 
довательности  фрагмента.  В  случае  тет‐ расположен  остаток  триптофана  (Trp)  с 
рапептида число шейпов должно быть 8.  гетероциклической  боковой  цепью.  Все 
Аминокислотные остатки, составляющие  это  вносит  своеобразие  при  образова‐
первый тетрапептид, имеют громоздкие  нии межостаточных взаимодействий. Ре‐
разветвления  боковой  цепи.  Остаток  ва‐ зультаты расчета структурных вариантов 
лина  (Val)    также  имеет    разветвленную  с  варьированием  боковых  цепей  остат‐
боковую  цепь,  которая  однако  в  силу  ков  Arg,  Phe  и  Trp  показали,  что  наи‐
своей  геометрии,  находится  относитель‐ более  низкоэнергетичными  оказались 
но  в  фиксированном  положении.  Затем  конформации с развернутой формой ос‐
следуют  два  остатка  аргинина  (Arg)  с  новной  цепи.  Для  этого  тетрапептида 
положительно  заряженными  боковыми  выявлена  некоторая  дифференциация 
цепями  и  остаток  фенилаланина  (Phe)  с  по  конформациям  и  в  интервал  относи‐
ароматическим кольцом в боковой цепи.  тельной  энергии  0‐4  ккал/моль  попада‐
При  составлении  начальных  структур‐ ют 12 наиболее оптимальные конформа‐
ных  вариантов  тетрапептида  варьирова‐ ции всех форм основной цепи. Для пос‐
лись  боковые  цепи  всех  остатков.  Как  ледующего  конформационного  анализа 
показал  проведенный  расчет  составлен‐ отбирались  все  формы  основной  цепи  в 
ных  структурных  вариантов  тетрапепти‐ интервале  0‐4  ккал/моль.  Следующий 
да существенной дифференциации ни по  рассматриваемый тетрапептид  Pro5–Trp6 
шейпам,  ни  по  формам  основной  цепи  –Trp7–Trp8    содержит  остаток  пролина  в 
не  наблюдается.  Так  в  интервал  относи‐ начале  последовательности  и  три  ос‐
тельной  энергии  0‐3  ккал/моль  попали  татка  триптофана  подряд.  В  составлен‐
26  конформаций,  принадлежащие  6  ных начальных структурных вариантах 8 
шейпам, а в интервал 0‐5 ккал/моль вхо‐ допустимых  шейпов  данного  тетрапеп‐

104  Journal of Qafqaz University   
Конформационные Свойства Молекулы Антимикробного Пептида Тритрптицина 

тида  варьировались  боковые  цепи  всех  варианты  форм  и  ориентаций  близле‐


трех  триптофанов.  Расчет  начальных  ва‐ жащих  остатков.  Результаты  расчета 
риантов    показал,  что    для  этого  тетра‐ конформаций  нонапептида  представле‐
пептида  наиболее  стабильными  оказа‐ ны в таблице 1. В этой таблице показаны 
лись конформации с полусвернутыми  и  наиболее  оптимальные  конформации 
свернутыми  формами  основной  цепи.  В  нонапептида, входящие в интервал отно‐
интервал  относительной  энергии  0‐4  сительной  энергии  0‐10  ккал/моль.  Как 
ккал/моль входят 10 конформаций  шес‐ видно  из  табл.1,  в  интервал  0‐2  ккал/ 
ти  шейпов,  а  в  интервал  0‐5  ккал/моль  моль  попадают  только  две  конформа‐
уже  входят  15  конформаций  всех    вось‐ ции  двух  похожих  шейпов  eefeeeee  и 
ми  шейпов.  Стабильные  конформации  fefeeeee,  которые  различаются  только 
данного  тетрапептида,  входящие  в  ин‐ формой основной цепи Val. В таблице 2 
тервал  относительной  энергии  0‐5  ккал/  приведны  величины  двугранных  углов 
моль  были  отобраны  для  расчета  боль‐ основной  и  боковых  цепей  энергетичес‐
шого фрагмента.  ки  предпочтительных  конформаций  но‐
Конформационные возможности N‐кон‐ напептида. Таким образом, расчет опти‐
цевого  нонапептида  Val1–Arg2–Arg3–Phe4  мальных  конформаций  N‐концевого  но‐
–Pro5–Trp6–Trp7–Trp8–Pro9  были  исследо‐ напептида  выявил  существенную  кон‐
ваны  на  основе  выбранных  стабильных  формационную  консервативность  дан‐
конформаций  трех  тетрапептидов  Val1– ного  участка  тритрптицина.  В  итоге  для 
Arg2–Arg3–Phe4,    Arg3–Phe4–Pro5–Trp6    и   последующего анализа молекулы тритр‐
Pro5–Trp6–Trp7–Trp8,  а  также  остатка  Pro.  птицина были оставлены все низкоэнер‐
Было  составлено  около  300  структурных  гетические  конформации  N‐концевого 
вариантов  нонапептида.  На  перекрыва‐ нонапептида,  входящие  в  интервал  0‐5 
ющихся участках  были рассмотрены все  ккал/моль. 
 

Таблица 1. Величины энергетических параметров (ккал/моль) оптимальных конформаций                    
фрагмента молекулы тритрптицина Val1‐Pro9 

          Конформация  Шейп  ЕНЕВ.  ЕЭЛС.  ЕТОР.  ЕОБЩ.  ЕОТН. 


 1.  B2 B3 R2 B3 R B1 R2 B2 B  eefefefe  ‐46.6  9.1  4.9  ‐32.6  0.0 
 2.  B2 R3 R3 B3 R B1 R2 B2 B  effefefe  ‐45.1  10.8  4.7  ‐29.6  3.0 
             
 3.  B2 R3 R2 B3 R B2 B3 B2 B  effefeee  ‐44.7  10.2  3.3  ‐31.2  1.4 
 4.  B2 B2 R2 B3 R B2 B3 B2 B   eefefeee  ‐42.8  9.0  3.8  ‐30.0  2.6 
 5.  B2 B2 B2 B3 R B2 B3 B2 B  eeeefeee  ‐42.2  9.0  4.0  ‐29.2  3.4 
 6.  B2 R3 B2 B3 R B2 B3 B2 B  efeefeee  ‐42.1  10.0  3.8  ‐28.3  4.3 
             
 7.  B2 R3 R2 B3 R R2 B2 B2 B  effeffee  ‐44.7  9.8  4.0  ‐30.9  1.7 
 8.  B2 R3 B2 B3 R R2 B2 B2 B  efeeffee  ‐43.0  10.1  3.9  ‐29.0  3.6 
 9.  B2 B3 R2 B3 R R2 B2 B2 B  eefeffee  ‐42.4  9.3  4.8  ‐28.3  4.3 
10. B2 B3 B2 B3 R R2 B2 B2 B  eeeeffee  ‐43.1  10.4  4.5  ‐28.2  4.4 
             
11.  B2 B2 B2 B1R R2 R2 B2 B  eeeefffe  ‐40.7  8.9  2.8  ‐28.9  3.7 
12.  B2 B2 R3 B1R R2 R2 B2 B  eefefffe  ‐41.6  8.8  4.2  ‐28.6  4.0 

Number 25, 2009    105
Г.А. Агаева, Р.Э. Алиев 

Таблица 2. Величины двугранных углов стабильных конформационных состояний    фрагмента молекулы 
тритрптицина Val1‐Pro9 : I ‐ B2B3R2B3RB1R2B2B (Eотн. =0ккал/моль), II ‐ B2R3R2B3  RB2B3B2B (Eотн=  1.4 
ккал/моль) и III ‐ B2R3R2B3RR2B2B2B (Eотн. =1.7ккал/моль)  

Аминокислотная  Конформация Величины двугранных углов (ϕ, ψ, ω, χ1, χ2, χ3, χ4) 
последовательность 
Остаток, №      I  II  III 
Val1  ‐103,140,180,170,183,180  ‐103,141,180,171,183,180  ‐104,141,179,165,184,178 
Arg2  ‐100,141,180, 181,179,180,180  ‐100,141,180, 183,178,182,179  ‐100,137,175,178,180,178,180 
Arg3  ‐99,140,180,180,180,180,180  ‐97, ‐60,189,‐60,180,180,180  ‐102,135,179,181,179,179,180 
Phe4  ‐100,136,180,57,88  ‐100,134,182,55,91  ‐106,143,176, ‐61,90 
Pro5     64,184  ‐56,185  ‐57,177 
Trp6  ‐116, ‐67,176,182,72  ‐121, ‐64,175,184,73  ‐100,140,185,180,79  
Trp7  ‐125, ‐65,183,180,70  ‐129, ‐62,179,181,71  ‐98,137,181,177,81  
Trp8  ‐100,134,176,171,82  ‐100,134,178,171,83  ‐101,126,175,175,80 
Pro9  117,180  117,180     115,180    
ЕОТН.  0.0 ккал/моль  1.4 ккал/моль  1.7 ккал/моль 
 

 
На  завершающей  стадии  исследования  цепями и  остаток лейцина (Leu) с боль‐
на  основе  стабильных  структур  N‐ шой  разветвленной  боковой  цепью. 
концевого  нонапептида и  тетрапептида  Поэтому  в  оптимальных  конформациях 
Trp8‐Pro9‐Phe10‐Leu11  были  определены  фрагмента  межостаточные  взаимодей‐
энергетически  предпочтительные  кон‐ ствия могут вносить существенный вклад 
формационные  состояния  для  N‐конце‐ в  стабильность  этих  структур.  При  вы‐
вого  ундекапептида.  И,  наконец,  на  ос‐ боре  начальных  приближений  учитыва‐
нове  стабильных  структур  N‐концевого  лись различные ориентации боковых це‐
ундекапептида  и  перекрывающегося  с  пей остатков. Энергетически предпочти‐
ним  по  двум  остаткам  С‐концевого  тет‐ тельными конформациями оказались ст‐
рапептида  Phe10‐Leu11‐Arg12‐Arg13  было  руктуры только одного шейпа  еее , в ко‐
исследовано  пространственное  строение  тором  благодаря  развернутой  (ВВВB) 
целой молекулы. Для этого сначала был  форме  образуются  эффективные  взаи‐
проведен конформационный анализ двух  модействия  между    боковыми  цепями 
перекрывающихся по двум остаткам тет‐ остатков  Trp  и  Phe.  В  интервал  относи‐
рапептидов  Trp8‐Pro9‐Phe10‐Leu11  и  Phe10‐ тельной  энергии  0‐5  ккал/моль  попада‐
Leu11‐Arg12‐Arg13.  Рассматриваемый  тет‐ ют  оптимальные  конформации  четырех 
рапептид Trp8‐Pro9‐Phe10‐Leu11, как видно  шейпов.  Для  последующего  расчета  бы‐
из  последовательности  пептида,  содер‐ ли  отобраны  конформации  всех  форм 
жит  один  остаток  пролина,  который  ог‐ тетрапептида  Trp8‐Pro9‐Phe10‐Leu11,  вход‐
раничивает  конформационные  особен‐ ящие в интервал относительной энергии 
ности предстоящего ему остатка. Поэто‐ 0‐5  ккал/моль.  На  следующей  стадии 
му  для  данного  фрамента  из  8  возмож‐ конформационного  анализа  были  сос‐
ных  для  тетрапептида  структурных  ти‐ тавлены структурные варианты N‐конце‐
пов  стерически  допустимыми  являются   вого  ундекапептида  на  основе  стабиль‐
только  четыре:  eee,  eef,  fee  и  fef.  В  данном  ных  конформаций  N‐концевого  нона‐
фрагменте  расположены  остатки  трип‐ пептида  и  тетрапептида  Trp8‐Pro9‐Phe10‐
тофана  (Trp)  и  фенилаланина  (Phe)  с  Leu11.  Всего  было  рассчитано  около  200 
громоздкими  циклическими  боковыми  структурных  вариантов  ундекапептида 

106  Journal of Qafqaz University   
Конформационные Свойства Молекулы Антимикробного Пептида Тритрптицина 

тритрптицина Val1‐Leu11. Наиболее ста‐ и  Trp8  (‐5,4  ккал/моль),  Trp6  и  Trp7  (‐3,7 


бильным  является семейство конформа‐ ккал/моль), Trp7 и Trp8 (‐4,0 ккал/моль) и 
ций  с  формой  основной  цепи  середин‐ т.д.  Наличие  же  остатка  пролина  при‐
ной  последовательности  В4  –R5  –В6  –В7  – водит к формированию β‐изгибов. В гло‐
В8–R9  –В10.  Затем    на  основе  стабильных  бальной конформации, которая входит в 
структур  N‐концевого  ундекапептида  и  первое  семейство,  реализируется  три  β‐
перекрывающегося  с  ним  по  двум  ос‐ изгиба:  на  участках  2‐5,  4‐7  и  8‐11,  о  чем 
таткам  С‐концевого  тетрапептида  Phe10‐ свидетельствуют  расстояния  между  Сα 
Leu11‐Arg12‐Arg13  было  исследовано прос‐ атомами  остатков  <  7  ангстрем.  В  опти‐
транственное строение целой молекулы.   мальной  конформации  второго  семей‐
По  результатам  расчета  низкоэнергети‐ ства  β‐изгибы  образуются  на  участках  1‐
ческие  конформации  всей  молекулы  4,  4‐7  и  8‐11.  В  предпочтительной  кон‐
можно  подразделить  на  четыре  семей‐ формации  третьего  семейства  β‐изгибы 
ства  структур,  характеризующихся  оди‐ локализованы на участках 2‐5, 6‐9 и 8‐11. 
наковой  формой  серединного  гептапеп‐ В  конформациях  четвертого  семейства 
тида.  Следует  отметить,  что  благодаря  формируются  только  два  β‐изгиба  4‐7  и 
взаимодействию  трех  остатков  трипто‐ 8‐11. В глобальной конформации наибо‐
фана, расположенных в середине  после‐ лее  существенным  является  суммарный 
довательности  тритрптицина,  во  всех  вклад  дипептидных  взаимодействий  (‐6,4 
стабильных конформациях на централь‐ ккал/моль).  Благодаря  β‐изгибам  в  гло‐
ном участке этого пептида формируется  бальной  конформации  реализуются  
нуклеативная  энергетически  предпочти‐ также  отдельные  межостаточные  взаи‐
тельная структура с β‐изгибами, форми‐ модействия между удаленными по цепи 
рующая семейство конформаций. В таб‐ остатками    Arg3  и  Arg13  (‐1,9  кал/моль),  
лице  3  представлены  энергетические  Trp7  и  Leu11  (‐1,8  ккал/моль)  и  др.  В  
вклады  внутри‐  и  межостаточных  взаи‐ оптимальной  конформации  второго  се‐
модействий наиболее оптимальных кон‐ мейства эффективны суммарные вклады 
формаций  тритрптицина.  Анализ  вкла‐ только  ди‐  и  трипептидных  взаимодей‐
дов  позволил  определить  основные  ме‐ ствий,  которые  соответственно  состав‐
жостаточные  взаимодействия,  стабили‐ ляют –23,5 и –23,2 ккал/моль.  Здесь реа‐
зирующие  указанные  пространственные  лизуются    межостаточные  взаимодейт‐
структуры.  Как  видно  из  таблицы  3  ос‐ вия  между    остатками:  Trp8  и  Pro9  (‐3,4 
татки  триптофана  очень  эффективно  ккал/моль),  Trp8  и  Phe10  (‐1,6  ккал/моль), 
взаимодействуют  между  собой  в  ста‐ Trp8 и Leu11 (‐3,7 ккал/моль), Phe10 и Leu11 
бильных  конформациях  молекулы:  Trp6  (‐2,7 ккал/моль). 

Number 25, 2009    107
Г.А. Агаева, Р.Э. Алиев 

Таблица 3.  Энергетические вклады внутри‐ и межостаточных взаимодействий в двух наиболее низкоэнер‐
гетических  конформациях  тритрптицина  B2B2R2B3RB2B2B3RB3B3B3B  (ЕОТН.=0  ккал/моль)  и 
B2R3B2B3RB2B2B3RR2B3R3R3(ЕОТН.=0.5 ккал/моль) 

Val  Arg  Arg  Phe  Pro  Trp  Trp  Trp  Pro  Phe  Leu  Arg  Arg  № 
5.5  0.7  1.6  0.2  0.1  ‐0.1  ‐0.0  ‐0.1  0.0  ‐0.1  0.1  1.3  0.5  Val 
5.4  1.1  0.2  ‐2.6  ‐0.1  ‐0.2  ‐0.1  ‐0.1  0.0  0.0  0.1  1.4  ‐0.1 
  0.1  1.2  2.3  2.2  0.4  ‐0.2  ‐0.2  0.0  ‐0.1  0.1  1.7  0.4  Arg 
‐0.5  1.4  ‐1.5  ‐1.5  ‐0.1  0.0  ‐0.1  0.0  0.0  0.0  1.5  0.1 
    0.0  ‐6.4  0.6  0.3  0.0  ‐0.1  0.0  ‐0.1  0.2  1.0  ‐1.9  Arg 
0.0  ‐2.8  ‐1.0  ‐0.3  ‐0.1  ‐0.2  0.0  0.0  0.0  1.7  ‐0.5 
      ‐0.1  3.0  1.9  0.5  2.5  0.0  0.0  ‐0.3  ‐0.5  0.0  Phe 
‐0.1  ‐3.1  ‐2.1  ‐0.3  ‐2.6  0.0  0.0  ‐1.8  ‐0.1  0.1 
        0.3  1.5  0.3  0.1  0.0  0.0  0.0  0.0  0.0  Pro 
0.3  ‐1.6  ‐0.3  ‐0.1  0.0  0.0  0.0  0.0  0.0 
          ‐0.5  ‐3.8  ‐3.8  0.9  0.0  0.0  ‐0.2  0.0  Trp 
‐0.5  ‐3.7  ‐5.4  ‐1.2  0.0  ‐0.1  0.1  0.1 
            ‐0.7  ‐4.0  2.7  0.2  ‐1.8  ‐0.1  0.0  Trp 
‐0.6  ‐4.0  ‐2.6  ‐0.2  ‐1.8  ‐1.6  ‐0.2 
              ‐0.4  3.4  2.0  2.0  ‐0.4  ‐0.1  Trp 
‐0.3  ‐3.4  ‐1.6  ‐3.7  ‐0.2  0.1 
                0.3  ‐1.5  0.7  1.1  ‐0.1  Pro 
0.2  ‐0.9  ‐1.2  ‐0.4  0.0 
                  ‐0.1  3.5  3.0  0.1  Phe 
‐0.3  ‐2.6  ‐1.4  ‐0.1 
                    ‐0.8  1.4  0.8  Leu 
‐0.4  ‐1.0  ‐0.9 
                      ‐0.5  1.6  Arg 
‐0.5  ‐0.3 
                        ‐2.3  Arg 
‐2.4 

 
Рис.3. Проекции четырех энергетически предпочтительных конформаций  
тритрптицина из каждого семейства 

108  Journal of Qafqaz University   
Конформационные Свойства Молекулы Антимикробного Пептида Тритрптицина 

В  оптимальных  конформациях  третьего  ных    взаимодействий.  В  таблице  4  при‐


и четвертого семейств существенны лишь  ведены  величины  двугранных  углов  (в 
суммарные  вклады  ди‐  и  трипептидных  град)  двух  наиболее  оптимальных  кон‐
взаимодействий,  а  все  другие  взаимо‐ формаций  молекулы  тритрптицина.  На 
действия  малоэффективны.  Можно  зак‐ рисунке  3  показаны  стереоизображения 
лючить, что конформации всех семейств  четырех  оптимальных  конформаций  из 
тритрптицина  стабилизируются,  глав‐ каждого семейства тритрптицина. 
ным  образом,  за  счет  ди‐  и  трипептид‐

Таблица 4.  Величины двугранных углов двух наиболее стабильных конформационных состояний молеку‐
лы тритрптицина. 

Аминокислотная  Конформация  
Последовательность  Величины двугранных углов (ϕ, ψ, ω, χ1, χ2, χ3, χ4) 
Остаток, №       B2B2R2B3RB2B2B3RB3B3B3B  B2R3B2B3RB2B2B3RR2B3R3R3 
Val1  ‐103,142,179,164,83,178  ‐102,144,180,164,183,178 
Arg2  ‐100,136,180,182,179,‐69,179  ‐95,‐60,181,‐62,180,180,180 
Arg3  ‐102,‐60,177,176,174,174,182  ‐100,134,182,181,179,180,180 
Phe4  ‐100,142,177,‐62,99  ‐96,146,185,182,79  
Pro5     ‐57,172  ‐53,178 
Trp6  ‐100,146,190,185,77  ‐96,146,185,182,79 
Trp7  ‐90,135,183,180,87  ‐89,134,184,176,89  
Trp8  ‐98,145,174,‐65,83  ‐100,147,176,‐65,79 
Pro9  ‐54,173  ‐37,187 
Phe10  ‐100,138,179,180,90  ‐78,‐38,179,187,85 
Leu11  ‐104,134,183,‐52,176,186,180  ‐82,132,180,‐55,174,185,180  
Arg12  ‐101,140,180,‐60,180,180,180  ‐105,‐56,179,‐61,180,180,180 
Arg13  ‐102,140,‐61,180,180,180    ‐105,‐55,‐63,182,179,180   
ЕОТН.  0.0 ккал/моль  0.5 ккал/моль 

Таким  образом  исследование  простран‐ центрального  участка  (4‐10)  обусловлена 


ственного строения тритрптицина  пока‐ формированием    стабильных  межоста‐
зало,  что  все  его  низкоэнергетические  точных  взаимодействий,  образующихся 
конформации    можно  сгруппировать  в  в  результате  изгибов  цепи  вокруг  двух 
четыре  семейства,  которые  содержат  остатков пролина. Были определены  ве‐
идентичное  конформационное  состоя‐ личины  двугранных  углов  основной  и 
ние  центрального  гептапептида  (4‐10)  и  боковых  цепей,  а  также  оценены  энер‐
относительно  более подвижные  конце‐ гетические  вклады  внутри  и  межоста‐
вые  трипептидные  участки.  Исследова‐ точных  взаимодействий  во  всех  опти‐
ние  конформационных  возможностей  мальных  конформациях  молекулы.  Ис‐
отдельных  фрагментов  и  всей  молекулы  пользуя  величины  двугранных  углов 
тритрптицина  применительно  к  двум  энергетически  предпочтительных  кон‐
разным  средам  не  выявило  существен‐ формаций  тритрптицина  были  получе‐
ной  разницы  в  энергетическом  распре‐ ны  координаты  атомов  молекулы  и 
делении  предпочтительных  пространст‐ построены  визуальные  пространствен‐
венныхъ  структур  молекулы.  Расчет  по‐ ные  модели  этих  конформаций.  На 
казал,  что  конформационная  жесткость  рис.3  приведены  проекции  четырех 

Number 25, 2009    109
Г.А. Агаева, Р.Э. Алиев 

энергетически  предпочтительных  кон‐


формаций  из  каждого  семейства.  Полу‐
ченные результаты согласуются с данны‐
ми ЯМР‐спектроскопии [2,3], предсказы‐
вающими  конформационную  консерва‐
тивность  центрального  участка    молеку‐
лы тритрптицина. 

ЛИТЕРАТУРА 

1.   D.J. Shibli, P.M. Hwang, H.J. Vogel,   Biochemistry, 
1999, 38, p.16749‐16755. 
2.   S.Nagpal  ,  V.Gupta,  K.J.Kaur,  J.Biol.Chem,  1999, 
274, p.23296‐23304. 
3.   S.T.Yang,  S.Y.Shin.,  Y.C.Kim,  Y.Kim,  K.S.Hahm, 
J.I.Kim.,  Biochem.  Biophys.  Res.  Commun.,  2002, 
296, p.1044‐1050. 
4.  P.M.  Hwang,  H.J.    Vogel  ,  Biochem.Cell.Biol., 
1998, 76, p.235‐246. 
5.  D.J.  Shibli,  L.T.  Nguen,  S.D.  Kernaghan,  O. 
Rekdal  ,  H.J.Vogel,  Biophys.  J.,  2006,  91,  p. 
4413‐4426. 
6. Г.М.  Липкинд,  С.Ф.  Архипова,  Е.М.  Попов. 
Молек. биол., 1970, т.4, с.331‐334. 
7. E.V. Popov, Int. J. Quant. Chem., 1979, v.16, p.707‐
710. 
8. Н.М. Годжаев, И.С. Максумов, Л.И. Исмаилова, 
Ж. Структ. Химии, 1983, т.24, с.147‐150. 
9. Г.А. Агаева, Н.А. Ахмедов, Е.М. Попов, Молек. 
биол. т.21, 1987, №1, с.164‐173. 
10. Е.М.  Попов,  В.Г.  Дашевский,  Г.М.  Липкинд, 
С.Ф.  Архипова.  Молек.  биол.  1968,  т.2,  с.  612‐
620. 
11. Н.М.  Годжаев,  И.С.  Максумов.  Уч.  записки 
АГУ, серия физ.‐мат., 1979, №5, с.157‐162. 
12. IUPAC‐IUB Commision on Biochemical Nomen‐
clature  Abbreviations  and  symbols  for  descrip‐
tion  of  conformation  of  polypeptide  chainsʺ, 
Pure Appl. Chem., 1974, v. 40, p.291‐308. 
13. P.R. Schimmel, P.J. Flory. J. Mol. Biol., 1968, v.34, 
p. 105‐111. 
 

110  Journal of Qafqaz University   
 
 
 
ОБОБЩЕНИЕ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ ДАННЫХ ПО 
ИЗОБАРНОЙ ОБЪЕМНОЙ ТЕПЛОЕМКОСТИ БИНАРНЫХ 
РАСТВОРОВ МЕТАНОЛА И ИЗОСПИРТОВ 

Махир БАШИРОВ, Яшар НАЗИЕВ, Акиф БАХШИЕВ 
Азербайджанский Технический Университет 
Баку / АЗЕРБАЙДЖАН 
mahirbashirov@yahoo.com 

РЕЗЮМЕ 
Проведено экспериментальное исследование изобарной объемной теплоемкости смесей метанола‐изо‐
спиртов  при  концентрациях  25,    50  и  75  масс.%  при  высоких  параметрах  состояния.  Предложено  обоб‐
щенное  уравнение  по  изобарной  объемной  теплоемкости  смесей  метанола‐изоспиртов  при  различных 
температурах и давлениях.  
Ключевые слова: аддитивности, бинарных растворов. 

GENERALIZATION OF EXPERIMENTAL ISOBARIC HEAT CAPACITY VALUES OF BINARY  
SOLUTIONS OF METHYL AND IZOALCOHOLS 

ABSTRACT 

In  the  presented  paper  the  empirical  equation  describing  of  concentration,  temperature  and  pressure 
dependences of  experimental  isobaric  heat capacity    (ж′ )   values  of  binary  solutions  of  methyl  and  izoalcohols 
п
with 2,2% is offered. On the base this equation the general equation for the    methyl and izoalcohols solutions is 
offered. 
Key words: additivity, binary solutions. 
 
 
  
В  связи  с  широким  применением  одно‐ С3Н7ОН  до  С5Н11ОН).  Для  исследования 
атомных  спиртов  и  их  смесей  в  различ‐ были  использованы  образцы  спиртов 
ных  отраслях  народного  хозяйства,  изу‐ квалификации ″ХЧ″ производства России 
чение  их  тепловых  свойств,  в  частности  со  степенью  чистоты  98,3‐99,9  %.  Изме‐
изобарной  теплоемкости,  приобретает  рение изобарной объемной теплоемкос‐
особый  интерес.  Единственным  путем  ти  проводилось  на  установке,  осуществ‐
получения  достоверной  информации  о  ленной  по  методу  импульсно‐регуляр‐
изобарной  объемной  теплоемкости  ж′п   ( ) ного режима, подробно описанной в [4]. 
Максимальная  относительная  погреш‐
одноатомных спиртов и их смесей в нас‐
ность определения изобарной объемной 
тоящее время является эксперимент.  
теплоемкости  исследованных  растворов 
В  предыдущих  работах  [1‐3]  были  вы‐ находилась в пределах 2,2% (при довери‐
полнены  экспериментальные  исследова‐ тельной  вероятности  α=0,95).  Экспери‐
ния  изобарной  объемной  теплоемкос‐  менты  проведены  в  интервале  темпера‐
ти  растворов  метанол‐изоспиртов  (от  тур  295‐525  К,  давлений  0,101‐50МПа  и 

Number 25, 2009    111
 
Махир Баширов, Яшар Назиев, Акиф Бахшиев 

при  концентрациях  0,25;  0,50  и  0,75  ное  по  форме  эмпирическое  уравнения, 
массовых  долях  метанола.  Настоящая  отражающие зависимость  ж′п  от Р, Т  и  х.    
работа  является  продолжением  указан‐
ных исследований и посвящена обобще‐ ж′п = ж′п1 х1 + ж′п2 х2 + х1 х2(αΔТ − βП + γ ) ,  (1) 
нию  результатов  исследования  экспери‐
где  ж′п ‐  изобарная  объемная  теплоем‐
ментальных  данных  по  изобарной  объ‐
емной  теплоемкости  бинарных  смесей  кость раствора, кДж/(м3К),  ж′п1 ,  ж′п2 – изо‐
метанола с изоспиртами при различных  барные объемные теплоемкости первого 
температурах и давлениях.  и  второго  компонентов,  кДж/(м3К);  х1,  х2 
Полученный нами богатый эксперимен‐ –  концентрации  первого  и  второго  ком‐
тальный  материал  позволяет  составлять  понентов, в массовых долях; α,  β,  γ  ‐ пос‐
более  точные  уравнения  для  расчета  ж′п   тоянние  для  каждой  системы  веществ; 
ΔТ=Т–Т0;  Т0  –  базовая  температура, 
Т 0 = (Т кун ′′ ) 2 ,  Т кун
исследованных  бинарных  смесей    мети‐
′ + Т кун ′′  – темпера‐
′ ,  Т кун
лового и изоспиртов. Как следует из это‐
туры  кипения  первого  и  второго  ком‐
го  материала  ж′п   исследованных  бинар‐
понентов, К; Р – давления раствора, МПа; 
ных  смесей  зависит  не  только  от  давле‐ Т – абсолютная температура, К.  
ния  (Р)  и  температуры  (Т),  но  и  от  кон‐
центрации (х). Таким образом, перед на‐ Значения постоянных α, β  и γ  входящих 
ми  ставилась  задача  составления  новых  в  уравнение  (1)  найдены  на  компьютере 
уравнений  для  описания  зависимости  на основе экспериментальных данных по 
ж п′ = ф( П , Т , х)   бинарных  смесей  конк‐ ж′п  [1‐3] и приведены в табл.1.    
ретной  системы,  а  также  по  возможнос‐ Уравнение  (1)  описывает  эксперимен‐
ти обобщить их.  тальные  данные  по  ж′п   исследованных 
Как  показали  результаты  и  анализ  экс‐ систем в пределах погрешности опытов.  
периментов  по  качественному  измене‐
Большой  интерес  представляет  исполь‐
нию и по ходу, концентрационные зави‐
зование  коэффициентов  α,  β  и  γ    урав‐
симости  изобарной  объемной  теплоем‐
нения  (1)  в  обобщении  эксперименталь‐
кости  исследованных  систем  метанола  с 
ных  данных  по  ж′п   смесей  метанола  с 
изоспиртами, одинаковы.  
изоспиртами при различных температу‐
При  обработке  и  аналитическом  обоб‐
рах  и  давлениях.  Подобное  обобщение 
щении  экспериментальных  данных  по 
нами  выполнено  по  изобарной  тепло‐
ж′п  для исследованных систем метанола +  емкости  бинарных  растворов  одноатом‐
изоспиртов  можно  рекомендовать  еди‐ ных спиртов в работе [5]. 

Таблица 1.  Значения коэффициентов уравнения (1) 

Постоянные коэффициенты  Базовая температура, 
Наименование  системы 
α  β  γ  Т0, К 
Метиловый + изопропиловый  3,186  0,160  86,467  346,545 
Метиловый + изобутиловый  2,96706  0,180  59,1995  355,20 
Метиловый + изоамиловый  2,754  0,200  51,9421  371,025 

Для  обобщения  опытных  данных  по  ж′п   ноатомными  изоспиртами  при  высоких 
жидких бинарных смесей метанола с од‐ давлениях предложено уравнение в виде 

112  Journal of Qafqaz University   
Обобщение Экспериментальных Данных по Изобарной Объемной  
Теплоемкости Бинарных Растворов Метанола и Изоспиртов  

 
ж′п = ж′п1 х1 + ж′п2 х2 + ЛИТЕРАТУРА  

1. Назиев  Я.М.,  Баширов  М.М.  Изобарная  теп‐


⎛ 2 1 2 ⎞
+ х1 х2 ⎜⎜ ΔТ ∑ Аи ни − П ∑ Б ъ н ъ + ∑ Дε нε ⎟⎟      (2)  лоемкость  взаимных растворов  метилового и 
⎝ и =0 ъ =0 ε =0 ⎠ изопропилового  спиртов  при  различных  тем‐
где  п  –  число  атомов  углерода  в  моле‐ пературах и давлениях. //Инженерно‐физичес‐
кий журнал. БНАН, 2004. т. 77, №1, с.155‐157. 
куле  изоспирта:  Аi,  Bj  и  Dε  ‐  коэффи‐
циенты уравнения. Значения их найдены  2. Баширов М.М. Изобарная теплоемкость взаим‐
ных  растворов  метилового  и  изобутилового 
методом  наименьших  квадратов  на  спиртов  при  высоких  давлениях.  //Изв.НАНА, 
компьютере и приведены в табл.2.    Серия физ.‐мат.тех. наук, 2007, 27, №2, с.168‐171. 
3. Баширов М.М., Бахшиев А.Б. Изобарная тепло‐
Таблица 2. Значения коэффициентов уравнения (2) 
емкость  растворов  метилового  и  изоамилового 
спиртов  при  различных  температурах  и  давле‐
Аi   Bj  Dε   
ниях.  //Журнал  Университета  Кавказ,  Серия 
А0=3,879  В1= 0,10  D 0=288,3301  естествознания и техники, №23, 2008, с. 30‐33.   
А1= –0,240  В2= 0,02  D 1= –97,30285  4. Баширов  М.М.  Тепловые  свойства  одноатом‐
А2=0,003    D 2=10,00505  ных  спиртов  и  их  бинарных  смесей,  методы 
измерения. Баку: ″Элм″, 2008. 368 с. 
Уравнение  (2)  с  учетом  значений  коэф‐ 5. Баширов  М.М.  Обобщение    эксперименталь‐
фициентов  Аi,  Bj  и  Dε  описывает  экс‐ ных  данных  по изобарной  объемной  тепло‐
периментальное  данные  по  ж′п   исследо‐ емкости  бинарных  растворов  одноатомных 
спиртов.  Проблемы  энергетики.  АНАН.  2004, 
ванных  смесей  метанола  с  изоспиртами  №3, с. 94‐97. 
с  максимальной  погрешностью  2,7%,  а   
также,  самое  главное,  дает  возможность   

для  предвычисления  ж′п   любой  смеси 


 

метанола‐изоспиртов  при  различных 


температурах и давлениях.  
     

Number 25, 2009    113
 
 
 
ЭЛЕКТРОННОЕ СТРОЕНИЕ МОНОМЕРНЫХ И ДИМЕРНЫХ 
КОМПЛЕКСОВ МОЛЕКУЛЫ КАРНОЗИНА С ЦИНКОМ 
1С.Д. ДЕМУХАМЕДОВА, 1И.Н. АЛИЕВА, 1,2Н.М. ГОДЖАЕВ, 3Н.С. НАБИЕВ 
1
Институт Проблем физики и 3Кафедра химической физики наноматериалов,  
Бакинский Государственный Университет  
Баку / АЗЕРБАЙДЖАН 
2
Университет Qafqaz,  
Баку / АЗЕРБАЙДЖАН 
svetlanabest@mail.ru;  iradanur@mail.ru; nifbiophys@yahoo.com 

РЕЗЮМЕ 
Методом молекулярной механики в потенциалах полуэмпирического поля ММ+ и методом квантовой 
химии в приближении РМ3 рассчитаны энергетические параметры молекулы карнозина в двух таутомер‐
ных формах имидазольного кольца, изучены электронные структуры мономерных и димерных комплек‐
сов обоих форм карнозина с цинком и  проведен анализ заселенностей атомных орбиталей. 
Ключевые слова: карнозин, комплекс карнозина с цинком, метод молекулярной механики, квантово‐
химические расчеты, заселенности атомных орбиталей 

ELECTRONIC STRUCTURE OF THE MONOMERIC AND DIMERIC COMPLEXES OF THE          
CARNOSINE MOLECULE WITH ZINC 

ABSTRACT 

The geometrical and energy parameters of the carnosine molecule with two forms of imidazole ring and their 
monomeric  and  dimeric  complexes  with  zinc  were  calculated  by  the  semiempirical  methods  of  molecular 
mechanics ММ+ and РМ3 method of quantum chemistry. The electronic structures and atomic orbital populations 
of monomeric and dimeric complexes of the both carnosine two forms with zinc were analyzed. 
Key  words:  biocarnosine,  zinc  complex  of  carnosine;  molecular  mechanics  method;  quantum‐chemistry 
calculations, atomic orbitals populations 
 
 
выживают и пролиферируют, повышает 
Введение  устойчивость  животных  к  воздействию 
Карнозин  (L‐CA,β–аланил–L–гистидин)– ионизирующего  облучения,  гипобари‐
природный  антиоксидант,  который  мо‐ ческой  гипоксии  и  переохлаждения, 
жет  служить  ловушкой  пероксильных  и  снижая гибель животных и улучшая реа‐
гидроксильных  радикалов,  синглетного  билитационный  процесс.  Терапевтичес‐
и  супероксид–аниона  кислорода,  а  так‐ кое  применение  карнозина  в  экспери‐
же  может  нейтрализовать  гипохлорит– менте  и  в  клинике  позволило  охаракте‐
анион, образуя с ним стабильные хлора‐ ризовать  его,  как  эффективный  имму‐
миновые  комплексы  [1‐4].  Карнозин  об‐ номодулятор  и  противовоспалительный 
ладает  мембранопротекторным  дейст‐ агент  .  Карнозин  оказался  селективным 
вием, оказывает цитотоксический эффект  ингибитором  NО–зависимой  активации 
на опухолевые клетки в культуре в усло‐ гуанилатциклазы [5]. В связи с этим воз‐
виях,  при  которых  эти  клетки  обычно  никает возможность использования кар‐

114  Journal of Qafqaz University
Электронное Строение Мономерных и Димерных Комплексов Молекулы Карнозина с Цинком 

нозина в качестве лечебного средства при  личных  образцов  было  установлено,  что 


таких  патологических  состояниях,  как  L‐CAZ  имеет  форму  N1H,  отличную  от 
злокачественные  новообразования,  сеп‐ формы  N3H  свободного  кристалличес‐
сис,  септический  шок,  астма,  мигрень,  кого  карнозина  [12,13].  Такая  валентная 
связанные с усилением активности внут‐ таутомеризация,  по‐видимому,  благо‐
риклеточной  сигнальной  системы:  NO– приятна  для  формирования  энергети‐
растворимая  гуанилатциклаза–цГМФ.  В  чески устойчивых пяти‐ и шестичленных 
настоящее  время  известна  способность  хелатных колец. Цинк обладает высоким 
карнозина образовывать хелатные комп‐ сродством  к  координационным  атомам, 
лексы с ионами двухвалентных металлов  таким  как  сера,  азот,  и  кислород,  что 
Сu,  Co,  Zn,  Mn,  в  том  числе  и  с  двух‐ определяет  высокую  гибкость  структу‐
валентным  железом  [6‐10].  Комплекс  с  ры,  способ  координации  и  координа‐
Zn  (L‐CAZ),  известный  под  названием  ционное  число  образованных  комплек‐
«Полапрецинк», обладает мощным про‐ сов.  Атомный  радиус  цинка  1,37Å,  ион‐
тивоязвенным  действием  и  эффективен  ный  (Zn2+)  0,83Å.  Внешняя  электронная 
против Helicobacter pylori, смягчает тяжесть  конфигурация  атома  Zn  3d104s2. Степень 
повреждений  слизистой  желудка  [10].  окисления  в  соединениях  +2.  Нормаль‐
Данный препарат оказывает действие на  ный  окислительно‐восстановительный 
метаболизм костной ткани, улучшает за‐ потенциал, равный 0,76 В, характеризует 
живление  ран,  а  также  эффективен  при  цинк  как  активный  металл  и  энергич‐
гепатите  и  гепатопатии.  Несмотря  на  ный восстановитель. Так как 3d орбиталь 
наличие  большого  экспериментального  цинка  полностью  занята,  двухвалентное 
материала,  молекулярный  механизм  состояние цинка стабильно и поддержи‐
действия карнозина и его биологическое  вается даже в условиях высокого окисли‐
значение до сих пор окончательно не вы‐ тельного  или  восстановительного  потен‐
яснены.  Структура  L‐CAZ  была  охарак‐ циала.  
теризована  при  помощи  элементного 
Данная работа посвящена исследованию 
анализа,  инфракрасной  спектроскопии, 
электронной  структуры  мономерных  и 
твердофазного  ЯМР  (13С‐  и  15N1‐H‐Cross‐
димерных  комплексов  молекулы  карно‐
Polarization  (CP)/Magic  Angle  Spinning, 
зина с цинком в двух ее известных тауто‐
MAS)  [11].  Полученные  данные  свиде‐
мерных формах N1H и N3H. 
тельствуют  о  том,  что  L‐карнозин  обра‐
зует  тетрадентатный  координационный 
Методы Расчета 
комплекс с ионом цинка в соотношении 
1:1.  Однако  одновременное  связывание  Расчеты  электронной  структуры  моно‐
четырех координационных участков кар‐ мерных  и  димерных  комплексов  были 
нозина  с  одним  ионом  цинка  в  качестве  проведены  на  основе  координат  равно‐
координационного  центра  невозможно  весных конфигураций ядер, полученных 
из‐за высокохелатного напряжения коль‐ в  результате  оптимизации  геометрии 
ца,  что  предполагает,  что  L‐карнозин  комплексов  в  потенциалах  полуэмпи‐
находится  в  полимерном  состоянии.  По  рического  метода  молекулярной  меха‐
данным твердофазного  13С‐СР/MAS ЯМР  ники  ММ+.  Полученные  данные  были 
при  комплексообразовании  происходит  положены  в  основу  расчета    электрон‐
валентная изомеризация имидазольного  ной  структуры  координационных  комп‐
кольца. При сопоставлении поглощения  лексов  карнозина  с  цинком  полуэмпи‐
имидазольных  атомов  углерода  у  раз‐ рическим  квантово‐химическим  мето‐

Number 25, 2009    115
С.Д. Демухамедова, И.Н. Алиева, Н.М. Годжаев, Н.С. Набиев 

дом  РМ3,  параметризованным  для  сое‐ таутомерных  форм  карнозина.  Сущест‐


динений,  содержащих  атомы  переход‐ венное  изменение  парциального  заряда 
ных  металлов  с  учетом  всех  валентных  с изменением знака  происходит на ато‐
электронов.  Для  проведения  расчетов  мах  N13  (заряд    свободного  карнозина    ‐
была  использована  демонстрационная  0.041  меняется    в    мономерном    комп‐
версия программы  HyperChem.8.03, дос‐ лексе на  →   0.468  для   N1H формы и  ‐
тупная  на  сайте  корпорации  Hypercube  0.046  →  0.483  для  N3H  формы)  и    N9  (‐
(http://www.hyper.com/).   0.026  →  0.099  для  N1H  формы  и  ‐0.027→ 
0.241 для N3H формы), а также на атоме 
Результаты и их Обсуждение  О15    (‐0.269→  ‐0.297  для  N1H  формы  и  ‐
Ранее  нами  методом  молекулярной  0.274→  ‐0.306  для  N3H  формы).  Измене‐
механики  ММ+  при  помощи  алгоритма  ния    выявлены    также    для    зарядов    на 
Polak‐Ribiere с точностью 0,001 ккал/моль  атоме  С7  пятичленного  хелатного  кольца 
были  исследованы  пространственная  ст‐ (‐0.06 → ‐0.14) и на атоме С12 шестичлен‐
руктура  и получены  геометрические  па‐ ного  хелатного  кольца  (‐0.08→ ‐0.18), 
раметры двух таутомерных форм карно‐ непосредственно  не  связанных  коорди‐
зина  и  его  мономерных  и  димерных  национными  связями  с  Zn,  что  свиде‐
комплексов с цинком [15‐18] и получено   тельствует  о  распространении  влияния 
хорошее  согласие  теоретически  рассчи‐ цинка  не  только  на  атомы,  непосред‐
танных  параметров  с  экспериментом.  ственно связанные с ним координацион‐
При  построении  теоретической  модели  ной  связью,  но  и  на  всю  координацион‐
комплекса  карнозина  с  цинком  был  ную  полость.  Следует  отметить  также, 
использован  нейтральный  атом  цинка,  что электронная плотность с атомов азо‐
образующий  координационные  связи  с  та (в основном с атома N13), образующих 
атомами  O15,  N9  и  N13  молекулы  кар‐ координационные связи с цинком, пере‐
нозина. Координационная  полость, сос‐ мещается  на  вакантные  р‐орбитали  ато‐
тоящая из двух хелатных колец –пяти‐ и  ма цинка. При этом атомы азота станов‐
шестичленного, имеет общую координа‐ ятся  положительными,  а  атом  цинка 
ционную  связь  Zn‐N9,  относительно  ко‐ приобретает  формальный  отрицатель‐
торой  хелатные  кольца  согнуты  под  уг‐ ный  заряд.  Отрицательными  становятся 
лом  ∼115º.  Пространственное  строение  заряды  на  атомах  С12  и  С7,  связанных 
координационной  полости  имеет  вид  химическими  связями  соответственно  с 
«кресла».  Валентные  углы  N9‐Zn‐O15  и  атомами азота N13 и N9. 
N9‐Zn‐N13  принимают  значения,  близ‐ Все эти изменения также отражаются на 
кие к прямому углу.  В димерном комп‐ коэффициентах заселенности орбиталей 
лексе  четвертая  координационная  связь  атомов,  входящих  в  координационную 
цинка  соединена  с  атомом  азота  имида‐ полость мономерных и димерных комп‐
зольного  кольца  второго  мономера:  с  лексов карнозина с цинком. Анализ засе‐
атомом  N3  в  димере  N1H  и  атомом  N1   ленностей  представляет  собой  процеду‐
димере  N3H.  Расчеты  электронной  ст‐ ру  разделения  электронной  плотности 
руктуры, проведенные методом РМ3 по‐ между  атомными  орбиталями  (АО),  ос‐
казали,  что  образование  координацион‐ нованную  на  значениях  коэффициентов 
ного  комплекса  карнозина  с  цинком  АО  в  молекулярных  орбиталях  и  приб‐
приводит  к  сильному  перераспределе‐ лижении  равномерного  распределения 
нию  электронной  плотности  для  обоих  плотности перекрывания (приближение 

116  Journal of Qafqaz University   
Электронное Строение Мономерных и Димерных Комплексов Молекулы Карнозина с Цинком 

Малликена). Анализ коэффициентов за‐ ном  благодаря  присутствию  неподелен‐


селенностей  позволяет  исследовать  из‐ ных  электронов  у  атомов  N  и  О,  су‐
менения  в  распределении  электронной  щественное  изменение  электронной  ст‐
плотности  не  только  по  перемещениям,  руктуры  должно  происходить  именно 
т.е. по  численному значению зарядового  на атомах N и O, имеющих неспаренные 
распределения,  но  и  изучить  перерас‐ электроны  и  образующих  координа‐
пределение  по  направлениям,  т.е.  прос‐ ционные  связи  с  цинком.  В  табл.1  и  2 
транственное  распределение  электрон‐ приведены  заселенности  атомных  орби‐
ной плотности, которое отражается в зна‐ талей для карнозина в двух таутомерных 
чениях  коэффициентов  заселенностей,  формах,  а  также  его  мономерных  и  ди‐
разложенным по координатным осям.  мерных комплексов с цинком. Как видно 
Изменения  в  коэффициентах  заселен‐ из  табл.1  и  2,  основное  перераспреде‐
ностей свидетельствует о том, что проис‐ ление  электронной  плотности  проис‐
ходит  перераспределение  электронной  ходит за счет изменения коэффициентов 
плотности  атомов  не  только  по  переме‐ заселенностей  АО,  которые  содержат 
щениям, но и по  направлениям, так как  неспаренные электроны, т.е. р‐орбитали 
в  валентном  приближении  учитывается  атомов.  При  этом  происходит  сущест‐
ограниченное число атомных орбиталей  венное  изменение  электронной  плот‐
атомов  азота  (2s2px2py2pz),  кислорода  ности  как  по  перемещению  электрон‐
(2s2px2py2pz),  углерода  (2s2pxpy2pz).  При  ного облака к связям, описываемому из‐
образовании  комплексов  карнозина  с  менениями  зарядов  на  атомах  так  и  по 
цинком,  поскольку  координационная  направлениям, характеризующимися за‐
связь с атомом цинка образуется в основ‐ селенностями орбиталей  рх   рy   pz.  

Таблица 1. Заселенности атомных орбиталей для карнозина N3H и его комплексов с  Zn 

Атом  Карнозин N3H  Карнозин N3H +Zn Димер карнозина с Zn 


s  Pх  Py  Pz  s  Pх  Py  Pz  s  Pх  Py  Pz  Атом  s  Pх  Py  Pz 
Zn          0.77  0.44  0.50  0.74 0.75  0.50  0.51  0.52  Zn2  0.72  0.47  0.46  0.73 
N9  1.32  1.32  1.41  0.98 1.40  1.20  1.02  1.14 1.46  1.35  1.16  1.08  N38  1.49  1.29  1.06  1.10 
N13  1.47  1.29  1.07  1.22 1.23  0.98  1.30  1.00 1.25     1.04     1.01     1.29  N42  1.24  1.17  1.14  0.99 
O15  1.80  1.44  1.40  1.64 1.81  1.45  1.41  1.64 1.81  1.36  1.44  1.77  O44  1.81  1.18  1.64  1.69 
C7  1.18  0.89  0.94  1.05 1.21  1.02  0.91  0.99 1.20  0.97  0.94  1.00  C36  1.21  0.95  0.93  1.03 
C12  1.17  0.97  0.99  0.96 1.19  0.96  1.03  1.00 1.19  0.97  0.98  1.01  C41  1.13  0.97  1.03  0.98 
C10  1.20  0.85  0.83  0.88 1.21  0.87  0.90  0.82 1.20  0.81  0.86  0.89  С39  1.21  0.82  0.86  0.88 
C11  1.17  0.98  0.99  1.00 1.17  0.96  0.96  1.04 1.17  0.92  1.01  1.04  С40  1.17  0.94  0.99  1.04 
C8  1.19  0.88  0.80  0.77 1.19  0.82  0.84  0.73 1.19  0.83  0.84  0.74  С37  1.19  0.83  0.82  0.74 
O14  1.86  1.45  1.69  1.38 1.86  1.71  1.31  1.48 1.86  1.84  1.25  1.44  О43  1.86  1.70  1.31  1.42 
O16  1.86  1.62  1.57  1.33 1.86  1.28  1.84  1.33 1.86  1.39  1.53  1.60  О45  1.86  1.51  1.62  1.37 
C6  1.15  0.96  0.96  0.96 1.15  1.00  1.00  0.86 1.15  0.96  0.98  0.92  С35  1.15  0.90  0.97  1.01 
N1  1.65  1.13  1.12  1.16 1.65  1.18  1.11  1.15 1.65  1.21  1.10  1.13  N30  1.34  1.09  1.09  1.11 
C2  1.24  0.97  1.02  1.08 1.24  1.00  1.10  0.99 1.24  1.09  1.00  1.02  С31  1.26  1.10  1.01  1.02 
N3  1.21  0.96  1.10  1.30 1.21  1.06  1.28  1.02 1.21  1.29  1.01  1.06  N32  1.20  1.23  1.06  1.04 
C4  1.21  0.97  1.05  1.15 1.20  1.04  0.11  0.99 1.21  1.12  1.00  1.01  С33  1.21  1.08  1.01  1.04 
C5  1.19  0.94  0.98  1.02 1.19  0.95  1.02  0.96 1.19  1.00  0.95  0.97  С34  1.21  1.03  0.99  0.96 
 

Number 25, 2009    117
С.Д. Демухамедова, И.Н. Алиева, Н.М. Годжаев, Н.С. Набиев 

Таблица 2. Заселенности атомных орбиталей для карнозина N1H и его комплексов с  Zn 

Атом  Карнозин N1H  Карнозин N1H +Zn  Димер карнозина N1H с Zn 


s  Pх  Py  Pz  s  Pх  Py  Pz  s  Pх  Py  Pz  Атом  s  Pх  Py  Pz 
Zn          0.76  0.49  0.56  0.62  0.75  0.51  0.51  0.52  Zn2  0.76  0.47  0.68  0.48 
N9  1.32  1.31  1.41  0.99  1.46  1.28  1.09  1.07  1.48  1.15  1.05  1.50  N38  1.46  1.06  1.17  1.24 
N13  1.46  1.30  1.08  1.20  1.23  0.96  1.06  1.28  1.25  0.99  1.06  1.29  N42  1.23  1.10  0.98  1.22 
O15  1.80  1.43  1.37  1.67  1.81  1.33  1.44  1.72  1.81  1.50  1.34  1.73  O44  1.81  1.66  1.42  1.40 
C7  1.18  0.90  0.95  1.03  1.22  1.02  0.92  0.98  1.20  1.00  0.92  0.97  C36  1.21  0.98  0.99  0.96 
C12  1.17  0.97  0.99  0.95  1.19  0.94  0.98  1.05  1.19  0.95  0.99  1.02  C41  1.19  0.94  1.03  1.01 
C10  1.20  0.84  0.83  0.87  1.21  0.83  0.88  0.85  1.20  0.88  0.87  0.79  С39  1.21  0.88  0.87  0.82 
C11  1.17  0.98  0.99  1.00  1.17  0.96  0.97  1.04  1.17  0.99  1.00  0.97  С40  1.17  0.99  0.99  0.99 
C8  1.19  0.88  0.80  0.76  1.19  0.82  0.85  0.73  1.19  0.83  0.85  0.74  С37  1.19  0.82  0.79  0.80 
O14  1.86  1.44  1.70  1.39  1.86  1.78  1.22  1.48  1.86  1.77  1.26  1.49  О43  1.86  1.46  1.39  1.62 
O16  1.86  1.60  1.58  1.34  1.86  1.31  1.52  1.63  1.86  1.39  1.66  1.66  О45  1.86  1.68  1.25  1.59 
C6  1.14  0.92  0.96  0.98  1.14  0.94  1.01  0.88  1.14  0.94  1.01  0.90  С35  1.15  0.91  1.05  0.90 
N1  1.21  0.97  1.08  1.31  1.21  1.13  0.98  1.26  1.22  1.22  1.02  1.13  N30  1.21  0.99  1.16  1.18 
C2  1.24  0.92  1.05  1.09  1.24  0.97  1.03  1.02  1.25  1.05  1.03  1.00  С31  1.26  1.04  1.06  1.07 
N3  1.66  1.29  1.01  1.11  1.66  1.24  0.97  1.21  1.66  1.16  1.00  1.26  N32  1.36  1.01  1.10  1.19 
C4  1.19  0.91  1.01  1.04  1.19  0.93  1.01  0.96  1.19  0.99  1.00  0.96  С33  1.21  0.99  1.03  1.01 
C5  1.21  1.00  1.01  1.14  1.21  1.06  0.95  1.09  1.15  0.91  1.05  0.90  С34  1.22  0.98  1.02  1.06 

При  образовании  мономерного  комп‐ щих  координационные  связи  с  цинком. 


лекса  карнозина  N3H  с  цинком  элек‐ Суммарная  заселенность  атомных  орби‐
тронная  плотность  на  р‐орбиталях  цин‐ талей  на  атомах  азота  значительно 
ка  распределена  неравномерно,  наибо‐ уменьшилась:  на  атоме  N13  в  мономер‐
лее  густо  заселена  рz‐орбиталь  (0.74),  ном  комплексе  N1H  на  0.5  и  на  0.54  в 
хотя  и    не  с  таким  сильным  различием,  комплексе  N3H,  а  на  атоме  N9‐на  0.14  в 
но и у мономерного комплекса N1H так‐ комплексе  N1H  и  на  0.28  в  комплексе 
же гуще заселена рz‐орбиталь (0.62). При  N3H.  При  этом  на  атомах  С7  и  С10,  ва‐
образовании  димерного  комплекса  у  лентно  связанных  с  атомом  N9  суммар‐
срединного  комплекса  все  три  р‐орби‐ ная заселенность атомных орбиталей по‐
тали становятся равноправными в обоих  вышается соответственно на  0.16 и 0.04 в 
комплексах  (N1H  и  N3H),  электронная  комплексе  N3H  и  на  0.08  и  0.03  в  комп‐
плотность на них становится одинаковой  лексе  N1H,  а  на  атоме  С12,  валентно  свя‐
по  0.5,  а  электронная  плотность  с  рz  ор‐ занном с атомом  N13 заселенность атом‐
битали  цинка  переходит  в  основном  на  ных  орбиталей    повышается  соответ‐
рx  и  рy  орбитали  атома  N9  и    px  и  pz  ственно на 0.09 в комплексе N3H и 0.08  в 
орбитали атома N13. Нами был проведен  комплексе  N1H.  На  атоме  О15,  также  об‐
подробный  анализ  заселенностей  атом‐ разующем  координационную  связь  с 
ных  орбиталей  исследуемых  комплек‐ цинком  никаких  особых  изменений  в 
сов.  Анализ  заселенностей  атомных  ор‐ атомных  популяциях  при  образовании 
биталей  показал,  что  при  образовании  мономерного  комплекса  с  цинком  в 
мономерного  комплекса  с  цинком  сво‐ форме  N3H  не  происходит  ни  на  одной 
бодного карнозина в обоих таутомерных  атомной орбитали, в то время как у фор‐
формах N1H и N3H основные изменения  мы N1Н происходит обмен электронами 
происходят на атомах N9 и N13, образую‐ между  р‐орбиталями  атома  кислорода 

118  Journal of Qafqaz University   
Электронное Строение Мономерных и Димерных Комплексов Молекулы Карнозина с Цинком 

при  котором    электроны  с  рх  орби‐ ти  орбиталей,  либо  электронная  плот‐
тали(0.1↓)  переходят  на  рy(0.07↑)  и  ность перераспределяется только между 
рz(0.05↑)  орбитали.  Но  в  обоих  формах  орбиталями  самого  атома.  Небольшое 
суммарная  заселенность  на  атоме  О15  перетекание  электронной  плотности  на 
увеличивается на  0.03. При образовании  атом  С7  происходит  с  атома  С8(0.05),  а 
мономерного  комплекса  N3H  на  атоме  также  с  атома    N9(0.11),  с  атома  О16(0.07) 
С6,  валентно  связанном  с  атомом  С7  ни‐ на атом С10    и дальше с атома С10(0.03) на 
каких  изменений  в  суммарной  атомной  атом N9, а также на атом С12 с атома N13 
популяции не наблюдается, также прак‐ (0.08). 
тически  нет  изменений  и  на  атоме  С11, 
Рассмотрим  заселенность  имидазольно‐
валентно  связанном  с  атомами  С10  и  С12, 
го  кольца  при  образовании  мономерно‐
суммарная  атомная  популяция  умень‐
го  комплекса  карнозина  N3H  с  цинком. 
шается  на  этом  атоме  всего  на  0.01.  Аб‐
На  атоме  N1,  пространственно  сближен‐
солютно  никаких  изменений  не  наблю‐
ном  с  атомом  кислорода  О16,  незначи‐
дается  и в суммарной популяции атома 
тельно  повышается  суммарная  заселен‐
С11  мономерного  комплекса  N1H,  но  на 
ность р‐орбиталей (0.03↑), в основном, за  
атоме  С6  этого  комплекса  заселенность 
счет  повышения  популяций  на  рх‐орби‐
незначительно  уменьшается  на  0.03.  В 
тали  (0.05↑).  На  атоме  N3  суммарная 
обоих случаях все изменения на атоме С6 
заселенность  не  меняется,  хотя  проис‐
происходят  перетеканием  электронной 
ходит  перераспределение  между  р‐ор‐
плотности  с  орбитали  рх  на  рy  и  рz  ор‐
биталями  –  электронная  плотность 
битали  атома,  а  на  атоме  С11–с  орби‐
переходит  с  рz‐орбитали  (0.28↓)  на  рy 
талей  рх  и  рy–на  рz  орбитали.  На  атоме 
кислорода  О14  заселенность  немного  (0.18↑) и рх (0.1↑) орбитали. На атоме С5 
уменьшается  на  0.02  в  комплексе  N3H  и  хотя  и  происходит  обмен  электронной 
на  0.05  в  комплексе  N1H,  причем  все  плотностью  между  рy  и  рz  орбиталями 
электроны  перетекают  с  рy(0.38↓  в  N3H   на  0.04,  но  суммарная  популяция  прак‐
и  0.48↓  в  N1H)  орбитали  в  основном  на  тически  не  меняется.  На  атоме  С2  сум‐
свои же рх и pz орбитали.   марная  заселенность  р‐орбиталей  нез‐
начительно  повышается  на  0.02,  а  на 
Таким  образом,  мы  можем  предполо‐ атоме  С4  понижается  на  0.04.  Предпола‐
жить,  что  при  образовании  мономер‐ гаемое  перераспределение  электронной 
ного комплекса карнозина N3H с цинком 
плотности  имидазольного  кольца  пред‐
в  образовавшихся  хелатных  кольцах 
ставлено на рис.1,б. 
происходит  перераспределение  элек‐
тронной плотности согласно схеме, пред‐ При  образовании  мономерного  комп‐
ставленной  на  рис.1,а.  Основная  элек‐ лекса  N1H  имидазольное  кольцо  прос‐
тронная  плотность  на  атом  цинка  Zn  транственно  сближено  с  атомом  кисло‐
переходит  с  атомов  азота  N13  (0.45)  и  N9  рода О14 и происходит понижение элек‐
(0.20). Причем участвуют в этом перерас‐ тронной заселенности на всех атомах уг‐
пределении  электронной  плотности  лерода  имидазольного  кольца.  Поэтому 
атомные    орбитали  рx  (0.31)  и  рz  (0.22), а  можно предположить перетекание элек‐
также  s‐орбиталь    (0.24)  атома  N13  и  рy‐ тронной плотности  с кольца по цепочке 
орбиталь атома N9. На остальных атомах  через  атомы  С6,  С7  и  N9  на  атом  цинка 
при  образовании  мономерного  комп‐ происходит  согласно  рис.1,а.  Согласно 
лекса  происходит  незначительное  пере‐ представленной  схеме  на  атом  цинка  с 
распределение  электронной  заселеннос‐ атома  N9  может  перейти  электронная 

Number 25, 2009    119
С.Д. Демухамедова, И.Н. Алиева, Н.М. Годжаев, Н.С. Набиев 

плотность  пропорционально  коэффи‐ но  уменьшается  (c  ‐0.432  в  мономерном 


циенту 0.35, в то время как соответствую‐ комплексе  N1H  →  на  ‐0.283  в  димерном  
щий  переход  в  комплексе  N3H  состав‐ и  c  ‐0.442  в  мономерном  комплексе 
ляет  0.20.  В  остальном  картина  пере‐ N3H→  на  ‐0.282  в  димерном).  Одновре‐
текания  электронной  плотности  в  шес‐ менно  наибольшее  перераспределение 
тичленном  хелатном  кольце,  представ‐ электронной  плотности  происходит  на 
ленная на рис.1,а, схожа с таким  же про‐ атоме азота N9(∼0.29), который в димер‐
цессом в мономерном комплексе N3H.  ном  комплексе  N1H  опять  становится 
отрицательным  и  на  атоме  кислорода 
О15 (‐0.297 в мономерном комплексе N1H 
меняется → на ‐0.375 в димерном и ‐0.306 
в мономерном комплексе N3H→на ‐0.282 
в  димерном).  Также  незначительно  по‐
нижается  положительный  заряд  на  ато‐
ме  N13  (∼0.042  для  димера  N1H  и  0.060 
для димера N3H).  
При  образовании  димерного  комплекса 
электронная  плотность  на  атоме  цинка 
Zn,  образующим  срединный  комплекс, 
уменьшается  по  сравнению  с  мономер‐
ными  комплексами  на  0.16    в  димерном 
комплексе N3H и 0.14 в димерном комп‐
лексе N1H (рис.2) Причем для комплекса 
N3H  уменьшение  происходит  за  счет 
понижения заселенности на рz орбитали 
(0.22)  цинка, в то время как заселенность 
ру  орбитали  практически  не  меняется,  а 
на  рх  орбитали  даже  немного  увеличи‐
вается  (0.07).  В  комплексе  N1H  тоже  в 
основном  понижается  заселенность  рz 
орбитали  (0.1↓),  но  также  понижается 
заселенность  рy  орбитали  (0.05↓)  и  наб‐
людается  небольшое  повышение  засе‐
ленности рх орбитали(0.02↑). Также наб‐
Рис. 1.  Схема, иллюстрирующая перераспределе‐ людается значительное понижение засе‐
ние  заселенности  атомных  орбиталей  мо‐
ленности  атомов  азота  имидазольных 
номерного  комплекса  карнозина  с  цин‐
ком:  (а)  для  таутомерной  формы  карно‐
колец,  присоединенных  к  мономерным 
зина  N1H;  (б)  для  таутомерной  форма  комплексам,  и  соединенных  координа‐
карнозина N3H  ционной  связью  с  атомом  Zn  в  димер‐
ный  комплекс.  Причем  это  понижение 
В димерном комплексе карнозина с цин‐ происходит  в  основнмм  на  s  орбиталях 
ком  в  образовании  координационной  атомов азота. Так в димерном комплексе 
полости  участвуют  все  четыре  коорди‐ N3H  происходит  суммарное  понижение 
национные связи цинка. При этом отри‐ заселенности  на  атоме  N30  на  0.46  отно‐
цательный заряд на атоме цинка, наход‐ сительно мономерного комплекса и  0.43 
ящегося в срединной полости значитель‐ по сравнению со свободным карнозином, 

120  Journal of Qafqaz University   
Электронное Строение Мономерных и Димерных Комплексов Молекулы Карнозина с Цинком 

и  при  этом  на  s  орбитали  заселенность  зольном кольце в сторону большего уве‐


понижается  на  0.31  относительно  атома  личения  заселенности  атомов  углерода 
N1  имидазольного кольца и в мономер‐ кольца  на  атом  цинка  может,  по‐види‐
ном  комплексе  и  в  свободном  карнози‐ мому,  перейти  значительно  меньше 
не.  А  в  димерном  комплексе  N1H  сум‐ электронной  плотности  (0.1)  по  сравне‐
марное  понижение  заселенности  на  нию с 0.37 в димерном комплексе N3H, в  
атоме  N32  составляет  0.41  и  0.42  относи‐ то  время  как    в  нем  сильно  повышается 
тельно  атома  N3  в  свободном  карнозине  заселенность  не  только  атома  азота  N9, 
и  в  мономерном  комплексе,  происход‐ но  и  заселенность  атома  кислорода  О16. 
ящая  в  основном  за  счет  понижения  в  Для  правильного  описания  такого  пере‐
обоих  случаях  заселенности  на  s‐  орби‐ распределения  необходимо,  чтобы  и  в 
тали атома азота также  на 0.3.  димерном комплексе N1H при образова‐
нии  его  из  мономерного  практически 
Если  сравнивать  заселенность  атомных 
вся электронная плотность, которая уме‐
орбиталей  образованных  димерных 
ньшается  на  атоме  N32    имиазольного 
комплексов  карнозина  N3H  и  N1H  с  за‐
кольца  также  переходила  бы  на  атом 
селенностями  соответствующих  орбита‐
цинка.  
лей  молекул  свободного  карнозина,  то 
следует  отметить,  что  происходит  очень  В табл.3 приведены параметры, характе‐
сильное  уменьшение  суммарной  засе‐ ризующие  электронную  структуру 
ленности  на  атоме  N13  хелатного  кольца  исследуемых  соединений.  Различие  в 
и,  следовательно,  в  этих  случаях  основ‐ структуре  двух  таутомерных  форм  сво‐
ное перетекание электронной плотности  бодного карнозина  отражается на вели‐
при  образовании  димеров  из  молекул  чинах полной энергии (∼0.09  ккал/моль) 
свободного карнозина происходит с ато‐ в  пользу  формы  N3H  и  дипольного  мо‐
ма  N13  (соответственно  0.42  и  0.39)    и  N30  мента (∼3.2 D). Таким образом, обе фор‐
(0.37) и N32(0.31)  на атом Zn и через него  мы  свободного  карнозина  почти  равно‐
дальше  на  атом  N9.  Причем    в  случае  правны по полной энергии, а выигрыш в 
N1H – увеличив заселенность атома N9 на  298.7  ккал/моль  дает  электронная  энер‐
0.15  электронная  плотность  перетекает  гия.  При  образовании  мономерного 
еще дальше через атом С10 на атом О16,, а  комплекса  карнозина  (N1H)  с  цинком 
в  случае  N3H–через  атом  N9  на  атом  C7.  полная и электронная энергия уменьша‐
Интересно,  что  суммарная  заселенность  ются  на  192.3  и  18402.2  ккал/моль  соот‐
атома  азота  N9  в  димерном  комплексе  ветственно,  в  то  время  как  вследствие 
N3H  остается  такой  же,  как  в  свободном  сильного  отталкивания  ядер  атома  цин‐
карнозине.  ка  и  атомов  координационной  полости, 
При  сравнении  димерных  комплексов  с  энергия  связывания  увеличивается  на 
мономерными  следует  отметить,  что  за‐ 137.8  ккал/моль.  Как  видно  из  табл.3 
селенность  на  атоме  Zn  уже  уменьша‐ величина  полного  дипольного  момента 
ется, и именно с него часть электронной  у  мономерного  комплекса  карнозина 
плотности,  которую  он  получает  от  (N1H)    равна  10.6  D,  т.е.  на  8.0  D  выше 
атомов азота имидазольного кольца  пе‐ величины  дипольного  момента  свобод‐
реходит  в  основном  на  атом  азота  N9,  а  ного карнозина. При образовании моно‐
также  атомы  N13  и  О15    хелатных  колец  мерного  комплекса  карнозина  (N3H)  с 
(рис.2,с и д). Интересно, что в димерном  цинком  полная  и  электронная  энергии 
комплексе N1H из‐за перераспределения  уменьшаются  соответственно  на  217.7  и 
электронной  плотности  в  самом  имида‐ 28122.7  ккал/моль,  в  то  время  как  энер‐

Number 25, 2009    121
С.Д. Демухамедова, И.Н. Алиева, Н.М. Годжаев, Н.С. Набиев 

гия  связывания  увеличивается  на  112.4  лости,  находящейся  в  середине  образо‐


ккал/моль,  а  величина  полного  диполь‐ ванного  комплекса,  все  четыре  коорди‐
ного  момента  на  5.6  D  выше  величины  национные связи цинка заняты. И такой 
дипольного  момента  свободного  карно‐ комплекс  уже  становится  возможным, 
зина  с  формой  (N3H)  имидазольного  так  как  уменьшается  напряжение,  осо‐
кольца.  Таким  образом,  для  мономер‐ бенно у шестичленного хелатного цикла 
ного комплекса энергетически более вы‐ вследствие  увеличения  значений  валент‐
годна  опять  структура  N3H,  в  то  время  ных  углов    С12‐N13‐Zn  и  C11‐C12‐N13. 
как  очевидно,  что  из‐за  сильного  напря‐ Интересно  сравнить  величины  диполь‐
жения  хелатных  колец  такая  структура  ных моментов и их компонентов при об‐
не  может  быть  реализована.  Далее,  при  разовании димерных комплексов карно‐
образовании димерных комплексов обоих  зина. 
форм карнозина у координационной по‐
 

 
(а)  Димерный  комплекс  карнозина  N1H  по  срав‐ (с)  Димерный  комплекс  карнозина  N1H  по  срав‐
нению со свободным карнозином  нению с мономерным комплексом 

   
(б) Димерный  комплекс  карнозина  N3H  по  срав‐ (д)  Димерный  комплекс  карнозина  N3H  по  срав‐
нению со свободным карнозином  нению с мономерным комплексом 

Рис. 2.  Схема,  иллюстрирующая  перераспределение  заселенности  атомных  орбиталей  димерных  комп‐


лексов  карнозина  с  цинком:  (а,с)  для  таутомерной  формы  карнозина  N1H;  (б,д)  для  таутомерной 
форма карнозина N3H 

122  Journal of Qafqaz University   
Электронное Строение Мономерных и Димерных Комплексов Молекулы Карнозина с Цинком 

Как  следует  из  результатов  расчета  формой  имидазольного  кольца  в  значи‐


(табл.3)    для  димера  карнозина  N1H+Zn  тельной степени различаются. Выигрыш 
величина дипольного момента составля‐ в  полной  и  электронной  энергии  при 
ет 13.6 D,  в то время  как для комплекса  образовании  димерных  комплексов  по 
карнозин    N3H+Zn  эта  величина  равна  сравнению  с  мономерными  составляет 
19.5 D. Разница в 5.9 D свидетельствует о  соответственно  64751.4  и  804041.5  ккал/ 
том,  что  второй  димерный  комплекс  моль для комплекса карнозин N1H+Zn и 
N3H+Zn  более  полярен,  а  поэтому    ха‐ 64207.7  и  816515.9  ккал/моль  для  комп‐
рактер межмолекулярного взаимодейст‐ лекса  карнозин  N3H+Zn.  Это  может 
вия с окружающей средой и способность  объяснить  предрасположенность  су‐
к  полимеризации  в  димерных  комплек‐ ществования  комплексов  карнозина  с 
сах  карнозина  с  цинком  с  различной  цинком в димерной форме. 

Таблица 3.  Энергетические характеристики 2‐х таутомерных форм карнозина и его мономерных и димер‐
ных комплексов с цинком 

Энергетические параметры, ккал/моль  μ, D 
Карнозин и его комплексы с Zn 
Е полн.*  Еэл.  Еот.  Есв. 
Карнозин N1H   ‐64839.5  ‐402729.6  337890.1  ‐2976.7  2.6 
Карнозин N3H  ‐64839.6  ‐403028.3  338188.7  ‐2976.8  5.8 
Карнозин N H с Zn 
1 ‐65031.8  ‐421131.8  356099.9  ‐2838.9  10.6 
Карнозин N3H с Zn  ‐65057.3  ‐431151.0  366093.6  ‐2864.4  11.3 
Димер карнозина N H с Zn 
1 ‐129783.1  ‐1225173.3  1095390.1  ‐5698.8  13.6 
Димер карнозина N H с Zn 
3 ‐129765.0  ‐1247666.9  1117901.8  ‐5680.6  19.5 

*   Примечание: Еполн.–полная энергия; Еэл.– электронная энергия; Еот.–энергия отталкивания атомных осто‐
вов; Есв.–энергия связывания; μ –дипольный момент 

Как  видно,  энергетически  более  выгод‐ Приходим  к  выводу,  что    даже  если  в 
ной  (на  18.18 ккал/моль) становится реа‐ свободной  форме  могут  реализоваться 
лизация  димерного  комплекса  карнози‐ оба  таутомера  карнозина,    димерный 
на с цинком с таутомерной формой N1H.   комплекс с цинком энергетически более 
Энергетическое  преимущество  первого  предпочтителен  для  одной  из  форм,  а 
димерного  комплекса  N1H  с  цинком  именно  N1H.  Дипольный  момент  этого 
обеспечивается эффективным экраниро‐ комплекса  на  5.9  ккал/моль  меньше  ди‐
ванием  атомных  остовов  электронным  польного момента димерного комплекса 
облаком.  За  счет  такого  благоприятного  N3H.  Следовательно,  вполне  возможно, 
экранирования  отталкивание  атомных 
что  при  создании  полимерного  цинко‐
остовов  ослабляется  на  22511.7  ккал/ 
вого  комплекса  карнозина  происходит 
моль.  
валентная  переизомеризация  имида‐
Несмотря  на  то,  что  такое  перераспре‐ зольных  колец  формы  N3H    свободного 
деление  электронной  плотности  умень‐ карнозина  в  форму  N1H  твердофазного 
шает  и  электронную  энергию,  в  итоге  и  комплекса карнозина с цинком. Энергия 
полная  энергия  и  энергия  связывания  ионизации,  которая  соответствует  отри‐
дает выигрыш в полной энергии 18 ккал/  цательным  значениям  энергии  ВЗМО 
моль.  Это  может  объяснить  предраспо‐ комплекса карнозина N1H+Zn равна 9.17 
ложенность  существования  комплекса  эв (по теореме Купманса энергия ВЗМО 
карнозина с цинком в димерной форме.  молекулы приближенно равна потенци‐

Number 25, 2009 123
С.Д. Демухамедова, И.Н. Алиева, Н.М. Годжаев, Н.С. Набиев 

алу ионизации, взятому с обратным зна‐ лексов  с  точки  зрения  орбитальной 


ком).  Разность  энергий  первой  вакант‐ энергии, но все‐таки энергия ионизации 
ной  орбитали  и  энергии  ВЗМО  интер‐ этих комплексов и сродство к электрону 
претируется  как  первая  энергия  возму‐ незначительно  отличаются  на  0.16  эв  и 
щения  и  равна  8.26  эв  для  мономерного  0.77  эв,  что  говорит  о  большей  реакци‐
комплекса  N1H+Zn  (рис.3).  Чем  ближе  онной  способности  мономерного  комп‐
значения  энергий  этих  орбиталей,  тем  лекса  карнозина  N1H+Zn.  При  сравне‐
больше  система  имеет  сродство  к  элек‐ нии  орбитальных  энергий  димерных 
трону.  В  мономерном  комплексе  карно‐ комплексов  карнозина  с  цинком  видно, 
зина  N3H+Zn  энергия  ионизации  равна  что  энергия  ионизации  димерного 
9.33  эв,  а  разность  энергий  ВЗМО  и  комплекса карнозина N1H+Zn равна 7.78 
НВМО имеет значение 9.03 эв. Чем мень‐ эв,  а  димерного  комплекса  карнозина 
ше  по  абсолютному  значению  энергия  N3H+Zn  равна  7.04  эв  (рис.4).  Разность 
ионизации,  тем  более  реакционноспо‐ энергий  первой  вакантной  орбитали  и 
собен  комплекс  и  больше  вероятность  энергии  высшей  занятой  молекулярных 
того,  что  он  сможет  отдать  электрон.  орбиталей, т.е. энергия возмущения рав‐
Анализ  орбитальных  энергий  мономер‐ на  6.81  эв  для  димерного  комплекса 
ных комплексов карнозина с цинком по‐ карнозина  N1H+Zn  и  6.40  эв  для  димер‐
казывает  большое  сходство  этих  комп‐ ного комплекса карнозина N3H+Zn. 

Рис. 3.  Энергетические диаграммы и графическое изображение ВЗМО и НВМО  в мономерных комплек‐


сах карнозина N1H (а)   и N3H (б)  с цинком по данным метода РМ3. 

124  Journal of Qafqaz University   
Электронное Строение Мономерных и Димерных Комплексов Молекулы Карнозина с Цинком 

Следовательно,  энергия  ионизации  и  шестичленного хелатного кольца, и поэ‐


сродство к электрону у димерного комп‐ тому димерные комплексы более реали‐
лекса  карнозина  N3H+Zn  соответственно  зуемы,  чем  мономерные.  Кроме  того,  за 
на  0.74  эв  и  0.64  эв  меньше,  чем  у  ди‐ преимущественную  реализацию  димер‐
мерного комплекса карнозина N1Н+Zn и  ного  комплекса  также  свидетельствуют 
он  оказывается  незначительно  более  энергия  ионизации  комплексов  и  раз‐
реакционноспособен. Это, по‐видимому,  ность энергий ВЗМО и НВМО. Величина 
связано  с  общим  распределением  элек‐ этого  энергетического  расщепления 
тронного  облака,  более  ярко  проявляю‐ между  верхней  заполненной  и  нижней 
щимся  при  сравнении  энергетических  вакантной орбиталями определяет реак‐
параметров.  ционную  способность  комплексов.  Чем 
меньше  эта  величина,  тем  больше  реак‐
Таким образом, в результате наших рас‐
ционная  способность  комплекса,  что 
четов  мы  получили,  что  мономерные 
связано  с  уменьшением  энергии  для  пе‐
комплексы  карнозина  с  цинком  имеют 
рехода  в  первое  возбужденное  состоя‐
большое напряжение шестичленного хе‐
ние. Энергия возбуждения меньше в ди‐
латного  кольца  (два  угла  в  нем  ~  1040  и 
мерных  комплексах,  следовательно,  ди‐
1090). При образовании димерных комп‐
мерные  комплексы  имеют  большую  ве‐
лексов  у  срединной  координационной 
роятность  присоединения    следующего 
плоскости,  где  заняты  все  четыре  коор‐
мономера  и  образования  в  результате  
динационные  связи  цинка,  соответству‐
полимерной цепочки.  
ющие углы увеличиваются (~1140 и 1190), 
что  значительно  снижает  напряжение 

   a) 

   b) 
Рис. 4.   Энергетические  диаграммы  и  графическое  изображение  ВЗМО  и  НВМО  в  димерных  комплексах 
карнозина N1H (а) и N3H (б)  с цинком по данным метода РМ3 

Number 25, 2009 125
С.Д. Демухамедова, И.Н. Алиева, Н.М. Годжаев, Н.С. Набиев 

По  результатам  детального  анализа  экс‐ 3. Boldyrev A. Carnosine as natural antioxidant and 


neuroprotector:  biological  functions  and  possible 
периментальных  ЯМР  спектров  карно‐
clinical  use.  In:  Free  Radicals,  Nitric  Oxide  and 
зина  в  растворе  при  образовании  комп‐ Inflammation:  Molecular,  Biochemical,  and 
лексов  карнозина  с  цинком  изменяется  Clinical  Aspects  (A.  Tomasi  et  al.,  Eds.)  IOS 
таутомерное  предпочтение  между  про‐ Press, 2002, pp. 206‐221. 
тонированием  N‐атомов  имидазольного  4. Boldyrev  A.A.  Na/K‐ATPase  as  a  sensor  of 
oxidative stress, In: Molec. Therapeut. Aspects of 
кольца  по  сравнению  со  свободными  RedOx Bioch. , T. Bahorun and A. Gurib‐Fakim, 
лигандами,  где  преобладает  таутомер  Eds., OICA, 2003, pp. 59‐68. 
N1H  [13].  По  результатам  наших  расче‐ 5. Северина И.С., Бусыгина О.Г., Пятакова Н.В. // 
тов, исходя из полученных значений для   Биохимия, 2000, т.65, вып.7, с.921‐927  
энергетических  параметров,  вполне  воз‐ 6. Матсукура  Т.,  Танака  Х.  Применение  комп‐
лекса    L‐карнозина  с  цинком  в  медицине.  // 
можно,  что  форма  N3H  мономерного  Биохимия, 2000, т.65, с.961‐968 
комплекса  карнозина  с  цинком  будет  7. Viola  R.E.,  Hartzell  C.R.,  Villafranca  J.J.  //  J. 
переходить  в  форму  N1H  димерного  Inorg.Biochem., 1979, v.10, p.281‐292 
комплекса. У димерных комплексов зна‐ 8. Viola  R.E.,  Hartzell  C.R.,  Villafranca  J.J.  // 
чительно  меньше  энергия,  следователь‐ J.Inorg.Biochem., 1979, v.10, p.293‐307 
9. Vladimirov  Y.A.  Proc.Intern.Symp.Naural  Anti‐
но,  они  более  устойчивы,  комплексооб‐
oxidants  Molecular  Mechanisms  and  Health 
разование  димерных  комплексов    энер‐ Effects  (Parcker  L.,  Traber  M.G.,  Xin  W.,  eds), 
гетически  выгоднее  комплексообразова‐ AOCS Press, Champaign, Illinois, 1996, pp.125‐144 
ния  мономерных  комплексов,  и  димер‐ 10. Boldyrev  A.A.,  Stvolinsky  S.L.,  Tyulina  O.V., 
ные  комплексы  быстрее  полимеризуют‐ Okoshelev  V.B.,  Hori  N.,  Carpenter  D.  //  Cell 
Mol.Neurobiol., 1997, v.17, p.259‐271 
ся, так как имеют более близкий уровень 
11. Miller D.J. // J.Physiol., 1974, v.242, p.615‐634 
НВМО. У мономерных комплексов энер‐ 12. Miller  D.J.  Lamont  C.,  O’Dowd  J.J.  In  Calcium 
гия    меньше  у  комплекса  карнозин  Sensitising:  a  Noel  Inotropic  Mechanism,  ch.5 
N3H+Zn,  т.е.  именно  у  комплекса  N3H  (Allen,D.G.,  and    Lee,  J.,eds),  Publ.  Oxford 
большая  вероятность  пойти  на  дальней‐ Univ.Press, 1993, hh. 117‐139 
13. Gajda T., Henry B., Delpuech J.J.  // J.Chem. Soc. 
шую полимеризацию. У димерных комп‐
Perkin Transact., 1994, p.1545‐1551 
лексов  энергия  на  18.2  ккал/моль  мень‐ 14. Itoh  H.,  Yamane  T.,  Ashida  T.,  Kakudo  M.  // 
ше у комплекса карнозин N1H+Zn. Мож‐ Acta Crystallogr. B33, 1977, p.2959 
но  также  отметить,  что  по  результатам  15. Годжаев  Н.М.,  Демухамедова  C.Д.,  Алиева 
наших  расчетов  при  образовании  всех  И.Н. Исследование молекулы карнозина и его 
производных  методами    квантовой  химии  // 
изученных комплексов карнозина с цин‐
Journal of Qafqaz University, 2007, v.21, p.614‐618  
ком атом цинка ведет себя как акцептор, 
16. Демухамедова  C.Д.,  Алиева  И.Н.,  Годжаев 
а  атомы  азота,  образующие  координа‐ Н.М.,  Набиев  Н.С.  Сравнительный  анализ 
ционные  связи  с  цинком  –  как  доноры  пространственного  и  электронного  строения 
электронной  плотности.  Полученные  таутомерных форм карнозина и его комплек‐
сов  с  цинком  //  Journal  of  Qafqaz  University, 
результаты  будут  использованы  для  мо‐
2008, v.23, p.62‐71  
делирования  структуры  полимерного  17. Демухамедова  C.Д.,  Алиева  И.Н.,  Годжаев 
комплекса карнозина с цинком.  Н.М., Набиев Н.С. Построение теоретической 
модели  димерного  комплекса  карнозина  с 
ЛИТЕРАТУРА  цинком  //  Материалы  III  Международной 
1. Болдырев  А.А.  В  кн.:  Карнозин.  Биологичес‐ Конференции  «Химия,  структура  и  функция 
кое  значение  и  возможности  применения  в  биомолекул», 2008, с.90  
медицине. Из‐во МГУ. Москва, 1998, c.252‐260  18. Демухамедова  C.Д.,  Алиева  И.Н.,  Годжаев  Н. 
2. Boldyrev  A.A.  Significance  of  reactive  oxygen  М. Моделирование пространственной структу‐
species  for  neuronal  function.  In:  Free  Radicals,  ры  таутомерных  форм  карнозина,  анзерина  и 
Nitric  Oxide  and  Inflammation:  Molecular,  гомокарнозина  и  их  комплексов  с  цинком  // 
Biochemical,  and  Clinical  Aspects  (A.  Tomasi  et  Материалы  Международной  Конференции 
al., Eds.) IOS Press, 2002, pp.157‐173.  «Молекулярное моделирование», 2009, с.42 

126  Journal of Qafqaz University
 
 

Journal  
     of  
Qafqaz  
University 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

  MATHEMATICS 
 
  RİYAZİYYAT 
 
  MATEMATİK 
 
   
МАТЕМАТИКА  
 
 
 
 
NEW INEQUALITIES ON TRIANGLE AREAS 

Y.N. ALIYEV 
Department of Mathematics, 
Faculty of Pedagogy, Qafqaz University, 
Khyrdalan –Baku / AZERBAIJAN 
yaliyev@qafqaz.edu.az 

ABSTRACT 
In this paper we prove a new inequality with the best constant for the areas of triangles formed by the lines 
through a point M in a triangle ABC, parallel to the sides of Cevian triangle of ΔABC with respect to the point M. 
Unexpectedly,  this  result  lead  us  to  a  new  refinement  of  Euler’s  inequality  on  the  ratio  of  circumradius  and 
inradius  of  a  triangle.  Using  a  generalization  of  the  familiar  fact  in  plane  geometry,  we  prove  also  a  new 
inequality  for  reciprocals  of  triangle  areas  formed  by  the  sides  of  polygon  A0A1…An‐1  and  by  the  sides  and 
diagonals  of  inscribed  polygon  B0B1…Bn‐1.  We  note  that  even  in  special  cases  when  n=3  and  n=4  the  obtained 
results are new and interesting. At the end of the paper we prove a new inequality for quadrilaterals. 
Key  words:  inequality,  best  constant,  Cevian  triangle,  refinement,  Euler’s  triangle  inequality,  circumradius, 
inradius, plane geometry, triangle areas, reciprocal, polygon, quadrilateral. 

ÜÇBUCAQ SAHƏLƏRINƏ AID YENI BƏRABƏRSIZLIKLƏR 

XÜLASƏ 

Məqalədə  ABC  üçbucağının  daxilində  götürülmüş  M  nöqtəsindən  bu  nöqtənin  ΔABC‐yə  nəzərən  Çevian 
üçbucağının  tərəflərinə  çəkilmiş  paralel  düz  xəttlərin  əmələ  gətirdiyi  üçbucaqların  sahələri  haqqında  dəqiq 
bərabərsizlik  isbat  olunur.  Gözlənilmədən,  bu  nəticə  bizi,  üçbucağın  xaricinə  və  daxilinə  çəkilmiş  çevrələrin 
radiusları  nisbəti  haqqında  olan  Eyler  bərabərsizliyinin  yeni  ümumiləşməsinə  gətirir.  Müstəvi  həndəsəsindən 
məlum faktın ümumiləşməsini istifadə edərək, A0A1…An‐1 çoxbucaqlısının tərəfləri və bu çoxbucaqlının daxilinə 
çəkilmiş  B0B1…Bn‐1  çoxbucaqlısının  tərəfləri  və  diaqonallarının  əmələ  gətirdiyi  üçbucaqların  sahələrinin  tərs 
qiymətləri haqqında yeni bərabərsizlik isbat olunur. Hətta n=3 və n=4 xüsusi hallarında da bu bərabərsizlik yeni 
və maraqlı nəticələrə gətirir. Məqalənin sonunda dördbucaqlılar üçün yeni bərabərsizlik isbat olunur. 
Açar sözlər: dəqiq bərabərsizlik, Çevian üçbucağı, ümumiləşmə, Eyler bərabərsizliyi, xaricə və daxilə çəkilmiş 
çevrələr, müstəvi həndəsəsi, üçbucağın sahəsi, tərs qiymət, çoxbucaqlı, dördbucaqlı. 
 
 
Introduction  angle  measures,  areas,  and  all  other  com‐
Every  geometric  figure  in  plane  or  space  parisons of parts of the figure in the context 
can be studied in two different ways. In the  of Geometric Inequalities. Usually, studies in 
first approach one find formulas, equalities  these  two  directions  complete  each  other. 
involving  the  elements  of  the  geometric  Let  us  demonstrate  our  words  by  the 
figure, establish collinearity or concurrency  following. 
theorems, and determine all other relation‐ Example  1.  Given  two  concentric  circles 
ships  in  the  context  of  Classic  Euclidean  with  center  O  and  let  A  be  a  fixed  point 
Geometry.  The  second  somewhat  modern  different  from  O  in  the  interior  of  the 
approach  is  about  finding  inequalities  circles.    A  ray  through  A  intersects  the 
between  the  elements  of  geometric  figure,  circles at the points  B  and  C . Let tangents 
estimating  the  length  of  line  segments,  to  corresponding  circles  at  the  points  B  

Number 25, 2009    129
Y.N. Aliyev 

and  C   intersect  at  the  point  D.  Let  E  be  a  intersects  BA  and  BC  at  C1  and  A2, 
point  on  the  line  BC  such  that  DE  is  respectively.  Analogously,  draw  the  paral‐
perpendicular to BC. Then  lel through  M to B0A0 (and to B0C0) to find 
A1  and  B2  (and  B1  and  C2).  It  was  proved    
1)  the  equality AB = EC   holds  if  and  only 
in  [1]  that  A1B2||A2B1,  B1C2||B2C1  and  
if  the  line  OA  is  perpendicular  to  the  line 
C1A2||C2A1. 
BC, 
Areas  in  this  and  subsequent  section  will 
2)  the  length  of  line  segment  BC   is 
be  denoted  by  square  brackets.  Denote 
maximal  if  and  only  if  the  line  OA  is 
T1=[MC1B2],  T2=[MA1C2],  T3=[MB1A2], 
perpendicular to the line BC. 
S1=[MA1A2],  S2=[MB1B2],  S3=[MC1C2], 
Although  these  two  results  look  as  inde‐ P1=[AB2C1],  P2=[BC2A1],  P3=[CA2B1], 
pendent,  they  are  closely  related  to  each  U1=[MBC],  U2=[MAC],  U3=[MAB]  (Figure 
other.  However,  they  can  be  proved  sepa‐ 1.2). 
rately.  As  in  Example  1  interplay  between 
2U iU jU k
the  two  approaches  is  very  fruitful  for  Lemma 1.1.  S i = , 
finding  new  geometric  facts.  Similar  (U j + U k )(U i + U j + U k )
situation appear in many places and one of  for  {i, j , k} = {1,2,3} . 
such problems was discussed in [1]. Section 
Proof.  Note  that  |BA0|/|A0C|=U3/U2, 
1  of  the  present  paper  continues  and  in  a 
|CB0|/|B0A|=U1/U3,  |AC0|/|C0B|=U2/U1. 
certain sense completes the study of triangle 
Then  [BMA0]=U1|A0B|/|BC|=U1U3/(U3+U2). 
areas  developed  in  [1].  Section  2  and 
Similarly, [CMA0]=U1U2/(U3+U2). We have 
Section  3  contain  new  inequalities  for 
convex  polygons,  with  many  interesting  [MB0A0]=[CMA0]|AB0|/|AC|= 
corollaries.  =U1U2U3/((U3+U2)(U1+U3)). 
Then 
1. Geometric  inequality  with  the  best 
constant  and  a  refinement  of  Euler’s  [BB0A0]=[BMA0]+[MB0A0]=  
triangle inequality.  =U1U3(U1+U2+U3)/((U3+U2)(U1+U3)). 

Let M be a given point in the triangle ABC.  Since  |BM|/|BB0|=(U1+U3)/(U1+U2+U3),  then 


Extend  the  lines  AM,  BM,  and  CM  to  from similarity of triangles BMA1 and BB0A0 
intersect the sides of triangle ABC at A0, B0,  we obtain 
and C0, respectively (Figure 1.1). Next cons‐ [BMA1]=[BB0A0](|BM|/|BB0|)2=  
truct the parallel to A0C0 through M, which  =U1U3(U1+U3)/((U2+U3)(U1+U2+U3)). 
A Similarly,  
[CMA2]=U1U2(U1+U2)/((U2+U3)(U1+U2+U3)). 
Finally,  [MA1A2]=[BMC]‐[BMA1]‐[CMA2], 
B2 and therefore 
C1
B0 2U 1U 2U 3
S1 = . 
C0 (U 2 + U 3 )(U 1 + U 2 + U 3 )
M B1
C2 The  equalities  for  S2  and  S3  can  be  proved 
in a similar manner. 
B C 2UiU jU k (U j + U k )
A1 A0 A2 Lemma  1.2.  Ti = , 
(Ui + U j + U k )(Ui + U j )(Ui + U k )
Figure 1.1.  for {i,j,k}={1,2,3}. 

130  Journal of Qafqaz University   
New Inequalities on Triangle Areas 

Proof.  By  [1,  Lemma  1],  we  have  Si2=TjTk.  without loss of generality, that U1+U2+U3=1. 


Using this equalities it is easy to check that  Noting this in the inequality (1.2) we obtain 
Ti=SjSk/Si. Using the equalities for Si (i=1, 2,  1 1 1 ⎛1 1 1⎞
3) in Lemma 1.1 we find that the equality in  + + −1 ≥ 24− 48U1U2U3 ⎜⎜ + + ⎟⎟ , 
U1 U2 U3 ⎝ U1 U2 U3 ⎠
Lemma 1.2 is true. 
which follows from Lemma 1.3. The equality 
Lemma  1.3.  ([2,3,4])  Let  x,  y,  z  be  positive 
cases  of  inequality  in  Lemma  1.3  corres‐
real  numbers  such  that  x+y+z=1,  then 
pond  to  the  cases  when  the  point  M 
1 1 1 25
+ + ≥ ,  and  equality  holds  coincides  with  centroid  or  midpoints  of 
x y x 1 + 48 xyz medians of triangle ABC. 
⎛1 1 1⎞ ⎛1 1 1⎞
only for numbers  ⎜ , , ⎟  and  ⎜ , , ⎟ .  Remark  1.1.  The  inequality  (1.1)  is  in  a 
⎝ 3 3 3 ⎠ ⎝2 4 4⎠
certain sense the best possible. 
A Indeed, consider the following inequality 
P1+P2+P3+k(S1+S2+S3)  ≥ (k+1)(T1+T2+T3),  (1.3) 
P1
where  k  is  a  real  parameter.  Let  M  be  a 
midpoint  of  the  median  from  A.  Denote 
T1 S2 S=[ABC], then U1=S/2, U2=U3=S/4. By Lemma 
S3
1.1  and  Lemma  1.2,    S1=S/8,  S2=S3=S/12, 
T3
T2 S1 P3 T1=S/18,  T2=T3=S/8.  Noting  these  in  the 
P2 inequality  (1.3)  we  obtain  k ≤ 7 .  On  the 
B C other  hand  from  (1.1)  and  [1,  Inequality  1] 
 
Figure 1.2. 
it follows that the inequality (1.3) is true for 
all  k < 7 .  Thus  we  find  that  k=7  is  the  best 
constant for the inequality (1.3). 
Theorem 1.1. The inequality  
Corollary  1.1.  ([4,5,15])  If  a,  b,  c  are  sides 
P1+P2+P3+7(S1+S2+S3) ≥ 8(T1+T2+T3),     (1.1) 
and R, r are circumradius and inradius of a 
holds  true  and  equality  in  (1.1)  occurs  if  triangle then 
and only if  M is a midpoint of medians or 
R (a − b) 2 + (b − c) 2 + (c − a ) 2
centroid of triangle ABC.  ≥ 2+8 ,     (1.4) 
r ( a + b + c) 2
Proof. By adding the sum T1+T2+T3 to both  and  equality  holds  only  for  equilateral 
sides of the inequality (1.1) we obtain  triangles  and  for  triangles  similar  to  the 
[ABC]+ 6(S1+S2+S3) ≥ 9(T1+T2+T3).  triangle with sides 3, 3, 2. 

Noting  that  [ABC]=U1+U2+U3  and  using  Proof.  Let  inscribed  circle  of  the  triangle 
Lemma 1.1 and Lemma 1.2 we obtain, after  with  sides  a,  b,  c  divide  these  sides  into 
simplifications,  parts  u1,  u2,  u3,  that  is  a=u2+u3,  b=u1+u3, 
c=u1+u2.  The  inequality  (1.2),  which  is  true 
(U 1 + U 2 )(U 2 + U 3 )(U 3 + U 1 )
≥ for all real numbers U1=u1, U2=u2, U3=u3, can 
8U 1U 2U 3 be written in terms of a, b, c as follows 


( 2 2
3 U1 + U 2 + U 3
2
) (1.2)
abc

(U 1 + U 2 + U 3 ) 2
 
(a + b − c)(b + c − a )(c + a − b)  

Since  the  inequality  (1.2)  is  homogeneous  3((a + b − c) 2 + (b + c − a) 2 + (c + a − b) 2 )



in  its  variables  U 1 ,U 2 ,U 3 ,  we  can  suppose  (a + b + c) 2

Number 25, 2009    131
Y.N. Aliyev 

Using  formulas  S=abc/(4R),  S=pr,  S2=p(p‐ A


K
a)(p‐b)(p‐c) (Heron), where S and p are area  1
K
and  semiperimeter  of  the  triangle,  we  can  D
write the last inequality in this form 


( )
R 9 a 2 + b 2 + c 2 − 6(ab + bc + ca )
,  O
2r (a + b + c) 2

which  can  be  transformed  easily  to  the  C


inequality (1.4).  L L1
B  
Remark  1.1.  The  inequality  (1.4)  is  a  new  Figure 2.1. 
refinement  of  Euler’s  triangle  inequality 
Without loss of generality we may suppose 
R/r ≥ 2  and  equivalent  to  the  following 
that  K1  is  closer  to  A  than  K,  then  we  can 
inequality for the sides a, b, c of a triangle 
write the last inequality as 
a3 b3 c3
+ + + [OLL1 ] [OKK 1 ]
b+c−a c+a−b a+b−c   ≥ , 
[ BOL][ BOL1 ] [ AOK ][ AOK 1 ]
( )
+ 7(ab + bc + ca ) ≥ 8 a 2 + b 2 + c 2 . 
| OL || OL1 ] sin ∠LOL1 | OK || OK1 | sin ∠KOK1
≥  
Note that in the proof of inequality (1.4) we  2[ BOL][BOL1 ] 2[ AOK ][ AOK1 ]
have  used  a  new  type  transformation, 
Since  K1L1||AB  then  |OL1|/[BOL1]=  |OK1|/ 
which  associates  to  each  interior  point  of 
[AOK1],  hence  |OL|/[BOL] ≥ |OK|/[AOK], 
triangle ABC a new triangle with sides a, b, 
which  is  obvious,  because  the  point  L  is 
c. It is interesting to study properties of this 
closer  to  line  AB  than  K.  Proof  of  Lemma 
new  transformation  for  example  in  the 
2.1 is complete. 
context of [14]. 
All  the  indexes  of  points  in  the  following 
2. Inequality on reciprocals of triangle  theorem and in its proof are taken modulo 
areas in polygons.  n, that is Ai=Aj, Bi=Bj, if i=j (mod n). 
Firstly, we prove auxiliary result which is a  Theorem  2.1.  [16]  Let  A0 , A1 ,..., An −1   be  a 
generalization  of  the  fact  given  in  [6],  but  convex  polygon  and  let  Bi   be  an  arbitrary 
the proof is essentially the same.  point  on  Ai Ai +1 ,  for  i = 0,1,..., n − 1 .  Let  the 
Lemma  2.1.  Let  ABCD  be  a  convex  quad‐ diagonals  Bi − 2 Bi   and  Bi −1 Bi +1   meet  at  the 
rilateral and a line through the intersection  point  C i ( i = 0,1,..., n − 1 ). Then 
point  O  of  diagonals  AC  and  BD  intersect  n −1 n −1
the sides AD and BC at the points K and L.  ∑ i =0
[ Ai Bi Bi −1 ] −1 ≥ ∑ [C B B
i =0
i i i −1 ]
−1
.     (2.1) 
Then the sum 1/[AOK]+1/[BOL] is  minimal 
if and only if KL||AB.  Proof.  Let  a  line  through  the  point  Bi  
Proof. Let KL is not parallel to AB and let a  parallel to the line  Bi −1 Bi +1  intersect the line 
line through O, and parallel to AB intersect  Ai −1 Ai  at the point  Ai′  and the line  Ai +1 Ai + 2  
AD  and  BC  at  the  point  K1  and  L1,  at  the  point  Ai′′+1 ,  and  let  the  lines  Ai′−1 Ai′′  
respectively  (Figure  2.1).  We  must  prove  and  Ai′ Ai′′+1   meet  at  C i′ ,  for  i = 0,1,..., n − 1  
that  (see Figure 2.2 where n=5). 
1 1 1 1
+ ≥ + .   
[ AOK ] [ BOL] [ AOK 1 ] [ BOL1 ]

132  Journal of Qafqaz University   
New Inequalities on Triangle Areas 

A''4 A4 C'0 the  triangle  KLM  (see  [8,  Problem  19]  and 
B4 A''0
C'4 [12, Problem 10.61]). 
A'4 A0
A'0
Corollary  2.2.  Let  K,  L,  M,  N  be  arbitrary 
C0 B0
C4 points on corresponding sides AB, BC, CD, 
B3
A''1 and  DA  of  a  convex  quadrilateral  ABCD. 
C1 Let the lines KM and LN meet at the point 
A3 C3 A1 C'1
A'3 O. Then 
A''3 C2
C'3
A'1 1/[AKN]+1/[BLK]+1/[CML]+1/[DNM] ≥  
B1 ≥ 1/[OKN]+1/[OLK]+1/[OML]+1/[ONM]. 
B2
C'2
Corollaries 2.1‐2.2 are special cases n=3 and 
A'2 n=4 of Theorem 2.1. 
A''2
A2
  3. Inequality on reciprocals of triangle 
Figure 2.2.  areas in quadrilaterals. 

From Lemma 2.1 it follows that  Theorem  3.1.  Let  ABCD  be  a  convex 


polygon.  A  line  through  intersection  point 
[ Bn −1 A0′ B0 ] −1 + [ B0 A1′′B1 ] −1 ≤ [ Bn −1 A0 B0 ] −1 + O  of  diagonals  AC  and  BD  intersect  the 
+ [ B0 A1 B1 ] −1 , sides  AB  and  CD  at  the  points  K  and  M. 
[ B0C1′B1 ]−1 + [ B1 A2′′B2 ]−1 ≤ [ B0 A1′′B1 ]−1 + [ B1 A2 B2 ]−1 Another  line  through  the  point  O  intersect 
the sides BC and AD at the points L and N. 

Then  arithmetic  mean  of  reciprocals  of 
[ B1C 2′ B2 ] −1 + [ B2 A3′′B3 ] −1 ≤ [ B1 A2′′B2 ] −1 + [ B2 A3 B3 ] −1 areas  of  triangles  AKO,  BKO,  BLO,  CLO, 
………………………………………  CMO,  DMO,  DNO,  and  ANO  is  greater 
than or equal to the sum of arithmetic and 
[ Bn−3Cn′−2 Bn−2 ]−1 + [ Bn−2 An′′−1Bn−1 ]−1 ≤ [ Bn−3 An′′−2 Bn−2 ]−1 +
quadratic  means  of  reciprocals  of  areas  of 
+ [ Bn−2 An−1Bn−1 ]−1, triangles ABO, BCO, CDO, and DAO. 
[Bn−2Cn′−1Bn−1 ]−1 + [Bn−1C0′ B0 ]−1 ≤ [Bn−2 An′′−1Bn−1 ]−1 +
B
+ [Bn−1 A0′ B0 ]−1. L
  C
S S
By summing these n inequalities, canceling  S 3 4
common terms from both sides and noting  2 S
K 5 M
[ Bi C i′Bi −1 ] = [ Bi C i Bi −1 ]   (because  the 
O S
quadrilateral  Bi C i′Bi −1C i   is  parallelogram,  S 6
1
for  i = 0,1,..., n − 1 )  we  obtain,  the  required 
S S
inequality (2.1).  8 7
Corollary  2.1.  Let  K,  L,  M  be  arbitrary  D
N
points  on  corresponding  sides  BC,  CA,  AB  A  
of triangle ABC. Then  Figure 3.1. 

1/[ALM]+1/[BMK]+1/[CKL] ≥ 3/[KLM]. 
Proof:  Denote  the  areas  of  triangles  AKO, 
In  particular,  it  follows  from  Corollary  2.1  BKO,  BLO,  CLO,  CMO,  DMO,  DNO,  and 
that at least one of the triangles ALM, BMK,  ANO  by  S1,  S2,  S3,  S4,  S5,  S6,  S7,  and  S8 
CKL has an area not greater than the area of  (Figure 3.1). We must prove that 

Number 25, 2009    133
Y.N. Aliyev 

1 1 1 1 1 1 1 1 C
+ + + + + + + ≥  B c
S1 S 2 S 3 S 4 S 5 S 6 S 7 S8 b G
F
⎛ 1 1 1 1 ⎞ z
≥ 2⎜⎜ + + + ⎟⎟ +   y
⎝ S1 + S 2 S 3 + S 4 S 5 + S 6 S 7 + S 8 ⎠ K M
O t
1 x
⎛ 1 1 1 1 ⎞2
+ 4⎜⎜ + + + ⎟  
2⎟
⎝ (S1 + S2 ) (S3 + S4 ) (S5 + S6 ) (S7 + S8 ) ⎠ E a H
2 2 2
A d D  
    (3.1) 
Figure 3.2. 
Let  OA=a,  OB=b,  OC=c,  OD=d  (Figure  3.2). 
Denote  the  angles  ∠AOB = ∠COD = α ,  Using (3.2) and (3.3) we obtain that, 
∠AOK = ∠COM = β ,  then 
⎛ 1
1 1 1 1 1 1 1⎞
∠KOB = ∠MOD = α − β .  Drop  perpen‐ + + + = 2⎜⎜ + + + ⎟⎟ =
S1 S 2 S 5 S 6 ⎝ xa yb zc td ⎠
diculars  KE=x,  KF=y,  MG=z,  MH=t  to  the 
⎛ xa + yb zc + td ⎞ ⎛ 1 1⎞
corresponding  lines  OA,  OB,  OC,  OD.  By  = 2⎜⎜ + ⎟⎟ = 2 sin α ⎜⎜ + ⎟⎟
the formula for the area of triangles  ⎝ xyab ztcd ⎠ ⎝ xy zt ⎠  
ax by ab sin α Using (3.4), (3.5), (3.6), (3.7) we obtain that 
+ = S1 + S 2 = . 
2 2 2 1 1 1 1 2 sin α ⎛ 1 1 ⎞
+ + + = ⎜ 2 + 2⎟=
Then  S1 S 2 S 5 S 6 f ⎝x z ⎠
 
ax + by = ab sin α .    (3.2)  2 sin α ⎛⎜ ⎛ a + bf ⎞ ⎛ c + df ⎞ ⎞⎟
2 2

= ⎜ ⎟ +⎜ ⎟ =
Similarly,  f ⎜⎝ ⎝ ab sin α ⎠ ⎝ cd sin α ⎠ ⎟⎠
cz + dt = cd sin α .    (3.3)  2 ⎛ 1 ⎛ 1 1 ⎞ ⎛ 1 1 ⎞ ⎛ 1 1 ⎞⎞
= ⎜ ⎜ + ⎟ + f ⎜ + ⎟ + 2⎜ + ⎟⎟  
sinα ⎜⎝ f ⎝ b2 d 2 ⎠ ⎝ a2 c2 ⎠ ⎝ ab cd ⎠⎟⎠
On the other hand  OK sin β = x  and 
OK sin(α − β ) = y  then  By AM‐GM inequality and noting that f>0, 

x y 1 1 1 1
= .     (3.4)  + + + ≥
sin β sin(α − β ) S1 S2 S5 S6
 
Similarly,  2 ⎛⎜ ⎛ 1 1 ⎞⎛ 1 1 ⎞ ⎛ 1 1 ⎞⎞⎟
≥ 2 ⎜ 2 + 2 ⎟⎜ 2 + 2 ⎟ + 2⎜ + ⎟⎟ =
z t sinα ⎜⎝ ⎝ b d ⎠⎝ a c ⎠ ⎝ ab cd ⎠⎠
= .    (3.5) 
sin β sin(α − β ) 4 4 4 4
=2 + 22 + 2 2 + 22 +
From (3.2) and (3.3) it follows that  b a sinα b c sinα d a sinα d c sinα  
2 2

ab sin α ⎛ 2 2 ⎞
+ 2⎜ + ⎟
x= .      (3.6)  ⎝ absinα cdsinα ⎠
a + bf
Since 
where  f = sin(α − β ) / sin β . 
1 1
Similarly,  S1 + S 2 = ab sin α ,  S 3 + S 4 = bc sin α , 
2 2
cd sin α 1 1
z= .      (3.7)  S 5 + S 6 = cd sin α ,  S 7 + S 8 = da sin α , 
c + df 2 2
then we can write 

134  Journal of Qafqaz University   
New Inequalities on Triangle Areas 

⎛ 1 7. D.O.  Shklyarshky,  N.N.  Chensov,  I.M.  Yaglom, 


1 1 1 1 1 ⎞
+ + + ≥ 2⎜⎜ + ⎟⎟ + Geometric  Inequalities  and  Problems  in  Maxima 
S1 S2 S5 S6 ⎝ S1 + S2 S5 + S6 ⎠ and Minima (in Russian), Nauka, Moscow, 1970, 
1 336 p. 
⎛ 1 1 1 1 ⎞⎟2 8. D.O.  Shklyarshky,  N.N.  Chensov,  I.  M.  Yaglom, 
+ 2⎜⎜ + + + 2⎟
⎝ (S1 + S2 ) (S3 + S4 ) (S5 + S6 ) (S7 + S8 ) ⎠
2 2 2 Selected  Problems  and  Theorems  in  Elementary 
Mathematics  (in  Russian),  Part  2:  Geometry 
      (3.8)  (Planimetry), Gittl, Moscow, 1952, 380 p. 
Similarly,  9. H.S.M Coxeter, S.L. Greitzer, Geometry Revisited, 
Random House, 1967. (Also published in Russian 
1 1 1 1 ⎛ 1 1 ⎞
+ + + ≥ 2⎜⎜ + ⎟⎟ +   by Nauka, 1978, 224 p.). 
S3 S 4 S 7 S8 ⎝ S3 + S 4 S 7 + S8 ⎠ 10. S.I.  Zetel,  Problems  about  Maxima  and  Minima 
1 (in  Russian),  OGIZ‐Gostekhizdat,  Moscow,  1948, 
⎛ 1 1 1 1 ⎞2 224 p. 
+ 2⎜⎜ + + + ⎟
2⎟
(S
⎝ 1 2+ S )2
(S3 + S 4 ) 2
(S5 + S6 ) 2
(S7 + S8 ) ⎠  
11. S.I. Zetel, New Geometry of Triangle (in Russian), 
Uchpedgiz, Moscow, 1962, 152. 
By  summing  these  two  inequalities  we  12. V.V.  Prasolov,  Problems  in  Planimetry  (in 
obtain the required inequality (3.1).  Russian), Mccme, Mosc. Uchebnik, Moscow, 2006, 
640 p. 
Remark  3.1:  Note  that  equality  occurs  in  13. I.F.  Sharygin,  Problems  in  Geometry:  Planimetry 
(3.8) if and only if  (in Russian), Nauka, Moscow, 1986, 224 p. 
14. D.N. Mackenzie, What is the shape of a triangle? 
⎛ 1 1 ⎞
⎜ 2 + 2⎟ Note di Matematica, 13(2), (1993), 237‐250. 

f = ⎝
b d ⎠ 15. Y.N. Aliyev, Problem 127, La Gaceta de la RSME, 
    (3.9) 
⎛ 1 1 ⎞ 12(2), (2009), 315. 
⎜ 2 + 2⎟
⎝a c ⎠ 16. Y.N. Aliyev, Problem 11441, Amer. Math. Month., 
116(6), (2009), 547 . 
But  f = sin(α − β ) / sin β   as  a  positive   
function of  β ∈ (0, α )  is strictly decreasing 
and  attains  all  values  in  the  interval 
(0,+∞ ) .  Thus  equality  holds  in  (3.1)  for 
some  concrete  positions  of  the  lines  KM 
and  LN.  It  is  therefore  interesting  to  find 
explicit  geometric  meaning for the equality
condition (3.9) of the inequality (3.8).

REFERENCES 

1. Y.N.  Aliyev,  Hexagons  and  Inequalities,  Crux 


Math. with Math. Mayhem, 32(7), 2006, 456‐461. 
2. Y.N.  Aliyev, Problem  M2002,  Kvant  (in  Russian), 
3 (2006), 17; Solution: 6 (2006), 19. 
3. Y.N. Aliyev, Problem 11199, Amer. Math. Month., 
113(1), (2006), 80; Solution: 114(7), (2007), 649. 
4. Y.N. Aliyev, The Best Constant For An Algebraic 
Inequality,  J.  Inequal.  Pure  and  Appl.  Math.,  8(2) 
(2007), Art. 79, 6 pp. 
5. Y.N.  Aliyev,  Problem  4861,  Mathematics  in  School 
(in Russian), 9 (2005), 68; Solution: 4 (2006), 70–71. 
6. Problem 3393, Mathematics in School (in Russian), 
6, 1989, 130; Solution: 4, 1990, 70. 

Number 25, 2009    135
 
 
 
ЛИФТЫ ВЕКТОРНЫХ ПОЛЕЙ В ПОЛУТЕНЗОРНОЕ 
РАССЛОЕНИЕ ТИПА (2,0) 

Габил ФАТТАЕВ 
Университет Кавказ, 
Бакинский Государственный Университет, 
 Механико‐математический факультет  
Баку ‐ АЗЕРБАЙДЖАН 
gabil_dovlatoglu@yahoo.com 

РЕЗЮМЕ  
В работе определяется полутензорное расслоение типа (2,0) дифференцируемого многообразия. Стро‐
ятся  полный  и  горизонтальный  лифты  проектируемых  векторных  полей  в  это  расслоение.  Исследуется 
соотношение  между  полным  и  горизонтальным  лифтами.  Вычисляются  компоненты  коммутатора  двух 
проектируемых векторных полей в полутензорное расслоение типа (2,0).   
Ключевые слова: полутензорное расслоение, полный лифт, аффинная связность, коммутатор. 

THE LIFTS OF  VECTOR FIELDS TO THE SEMITENSOR BUNDLE  OF THE TYPE (2, 0) 

ABSTRACT 

In this article the semitensor bundle of the type (2,0) of differentiable  manifold is determined. Complete and 
horizontal lifts of the projectiable vector fields to this bundle are constructed. The relation between complete and 
horizontal  lifts  is  investigated.  The  components  of  complete  lifts  of  the  commutator  of  two  projectiable  vector 
fields to semitensor bundle  of the type (2,0) are calculated. 
Key words: semitensor bundle, complete lift, affine connection, commutator. 

 
 
1. Понятие полукасательного расслоения  слоение типа  ( p, q ) . В настоящей работе 
введено  В.В.Вишневским  в  начале  вось‐ будут  рассмотрены  некоторые  вопросы 
мидесятых годов XX столетия [1,2]. Осно‐ теории лифтов векторных полей в полу‐
вываясь на естественную интегрируемую  тензорное расслоение  типа  (2,0 ).  
аффинорную  структуру,  имеющуюся  на 
данном  расслоении,  В.В.Вишневским  и  2. На дифференцируемом многообразии 
его  учениками  построена  и  развита  тео‐ M n   класса  C ∞   рассмотрим  дифферен‐
цируемое расслоение  L (n − m ) − мерных 
рия  лифтов  дифференциально‐геомет‐
рических  структур  в  полукасательном 
расслоении.  Тензорные  расслоения,  так‐ подмногообразий.  На  M n   введем  адап‐
же  полутензорные  расслоения,  являю‐ тированные  к  расслоению  L   локальные 
щиеся  обобщениями  полукасательного  ( )
координаты  x i = x a , xα , где  xα − коорди‐
наты на базе расслоения  L (α = 1, K m ), x a  
расслоения, рассмотрены в работах А.А. 
Салимова  и  Г.Д.Фаттаева  [3‐5].  В  работе 
[3]  А.А.Салимовым  построен  полный  ‐  слоевые  координаты  (a = 1,K n − m ) . 
лифт  так  называемого  проектируемого  Адаптированные локальные координаты 
тензорного  поля  в  полутензорное  рас‐ определяются  с  точностью  до  преобра‐

136  Journal of Qafqaz University
Лифты Векторных Полей в Полутензорное Расслоение Типа (2,0) 

зований,  которые  мы  будем  считать  до‐ ~


( ) ( ) (
det A = det Abb′ det Aββ ′   det Aββ11 Aββ22 ≠ 0 , 
′ ′
)
пустимыми: 
~
т.е.  M − дифференцируемое  многообра‐
a′
⎧⎪ x = x x , x ,a′
( )
a α
зие  размерности  n + m 2 .  Дифференци‐
⎨ α′
( )
                      (1) 
⎪⎩ x = xα ′ xα . ~
руемое  многообразие  M   назовем  по‐
⎛ ∂x i ′ ⎞ лутензорным    расслоением  типа  (2,0) 
Якобиева матрица  A = ⎜⎜ i ⎟
⎟, i′ = (a′, α ′) ,  многообразия  M n   и  обозначим  через 
⎝ ∂x ⎠
преобразований (1) имеет вид:  τ 02 (M n ) .  Очевидно,  что  если  m = n ,  то 
получим  тензорное  расслоение 
⎛ ∂x a ′ ∂x a ′ ⎞
⎜ a ⎟ a′
Aαa ′ ⎞
τ 02 ( )
M n ≡ T02 (M n )   [3].  Для  локальных 
∂x ∂xα ⎟ ⎛⎜ Aa
A = ⎜⎜ = ⎟ ,  (2)  
координат  расслоения    τ 02 (M n )   примем 
⎜⎜ ∂x
α′
∂xα ′ ⎟⎟ ⎜⎝ 0 α′ ⎟
Aα ⎠
⎝ ∂x a ∂xα ⎠
⎟ обозначение  (x ) = (x , xα , xα ),  
A a
где 
2
где   det A ≠ 0.  Отсюда следует, что   A = 1,2, K , n + m .   

( )
det Aaa ′ ≠ 0, det Aαα ′ ≠ 0.    ( )     (3)   3.  Пусть  на  многообразии  M n   задано 
проектируемое  относительно 
Введем  в  рассмотрение  многообразие 
троек  (x , x
b β
)
, x β ,  где  x β = t β1β 2 ,  а 
расслоения 
( (

) ( ))
V = v a x a , xα , vα xα .  Полный  лифт 
векторное  поле  

β1β 2
t −   координаты  контравариантного 
векторного  поля  V   в  полутензорное 
тензора  t   на  базе  расслоения  L .  При 
расслоение  τ 0 (M n )   опреде‐лим  как 
2
допус‐тимом  преобразовании  (1)  эти 
величины  преобразуются  векторное поле: 
дифференцируемым об‐разом:  c
( ) (
V = c v A = c v a , c vα , c vα =    )
⎧x = x x , x ,
b′
⎪⎪ ′
b′
( )
b β
(
= v a , v α , t σα 2 ∂ σ v α1 + t α1σ ∂ σ v α 2 .           (5)  )
β β′ β
⎨x = x x , ( )        (4) 
⎪ β′ β ′β ′ β1′ β 2′ β β Покажем,  что  полный  лифт  в  виде  (5) 
⎪⎩ x = t 1 2 = Aβ1 Aβ 2 t 1 2 . определяется  инвариантно,  т.е. 
Якобиева  матрица  преобразования  (4)  необходимо  установить,  что  при 
имеет следующее строение: 
⎛ Abb′ Aβb′ 0 ⎞
переходе  (x , x b β
) (
, x β → x b′ , x β ′ , x β ′   )
⎜ ⎟ объект  (5)  пре‐образуется  по  закону 
~ ⎜ β′ ⎟ .  
A= 0 Aβ 0 c B′
v = ABB ′ c v B .  
⎜ ⎟
⎜0
⎝ t β1β 2 β1′ β 2′
∂ β Aβ1 Aβ 2 (
β1′ β 2′ ⎟
Aβ1 Aβ 2 ⎠ ) Возможны следующие случаи: 
Имея  в  виду,  что  матрица  (A β1′ β 2′
β1 Aβ 2 )  1)   B′ = b′,  так  как   
является  матрицей  перехода  от  одного  ( ) (
V ′ = v b′ , v β ′ = Abb ′v b + Aβb ′v β , Aββ ′v β ,  )
векторного  базиса  к  другому  в  вектор‐ то  в данном случае  
ном  пространстве  T02 (Q )   размерностью  c b′
2 v = Abb ′v b + Aβb′v β ,  
m ,  приходим  к  следующему  выводу: 

( ′
)
det Aββ11 Aββ22 ≠ 0 .  Учитывая  этот  факт,  а           ABb c v B = Abb c v b + Aβb c v β + Aβb c v β =     
′ ′ ′ ′

′ ′ ′
также соотношения (3), заключаем:             = Abb v b + Aβb v β = c v b .   

Number 25, 2009    137
Габил Фаттаев 

2)   B′ = β ′,  при этом  заданных на многообразии  M n , 

[v, w] = [c v,c w].  


′ ′
       c v β = Aββ v β ,                      c

′ ′ ′
      ABβ c v B = Abβ c v b + Aββ c v β +   Доказательство.  Возможны  следующие 
    + Aββ ′ c v β = Aββ ′ v β c β′
= v .  случаи: 
1)   B = b,  при этом 
3)  B′ = β ′,  в данном случае  
c
[v, w]b = v a ∂ a wb + vα ∂α wb −
c B′
v = v c β′
=t σ ′α 2′
(∂ σ ′v
α1
) ′
Aαα11 +
− w a ∂ a v b − wα ∂α v b = [v, w]b ,
(
+ t σ ′α 2′ ∂σ ′ Aαα11 vα1 + t α1′σ ′

) (∂ σ ′v
α2
)A α 2′

α2
[ v , w] = v ∂
c c b c a c
wb + c v α ∂ α c wb +
(∂ )v
a
α1′σ ′
4  
α 2′ α2
+t σ ′ Aα 2 = ∑ cp, + c vα ∂ α c wb − c w a ∂ a c v b − c wα ∂α c v b −
p =1
где            − c wα ∂ α c v b = vα ∂ α wb + vα ∂ α wb −
′ ′
( )
c1 = t σ α 2 ∂σ ′ vα1 Aαα11 ,  c3 = t α1σ ∂σ ′ vα 2 Aαα22 , 
′ ′ ′
( ) ′ − w a ∂ a v b − wα ∂α v b = c [v, w]b .

c2 = t σ α 2

(∂ α1′
σ ′ Aα1 )v α1
,  c4 = t
α1′σ ′
(∂ α 2′
σ ′ Aα 2 )v α2

2)   B = β ,  при этом 

       [v, w] = [v, w] = vα ∂α w β − wα ∂α v β ,  


c β β
С другой стороны, 
с другой стороны 
ABβ ′ c v B = Abβ ′ c v b + Aββ ′ c v β + Aββ ′ c v β =

( )
= v β t β1β 2 ∂ β Aββ11 Aββ22 + v β t β1β 2 Aββ11 ∂ β Aββ22 +
′ ′ ′ ′ [ v , w] = v ∂
c c β c a
a
c
w β + c vα ∂ α c w β +
′ ′ ′ ′ + c vα ∂ α c w β − c w a ∂ a c v β − c wα ∂ α c v β −
+ Aββ11 Aββ22 t σβ 2 ∂ σ v β1 + Aββ11 Aββ22 t β1σ ∂ σ v β 2 =
− c wα ∂ α c v β = vα ∂ α w β − wα ∂ α v β = [v, w] .
c β
4
= ∑ dq ,   3)  B = β ,  при этом пользуясь  (5), нахо‐
q =1
дим: 
где  
8
d1 = v β t β1β2
′ ′
(
∂ β Aββ11 Aββ22 ,    )
c
[v, w]β = ∑ bs ,   где 
s =1
′ ′
d2 = v β t β1β2 Aββ11 ∂ β Aββ22  ,   b1 = t σβ 2 ∂ σ v α ∂ α w β1 , b5 = t β1σ ∂ σ v α ∂ α w β 2 ,
d 3 = Aββ11 Aββ22 t σβ2 ∂ σ v β1   
′ ′
b2 = t σβ 2 v α ∂ σ ∂ α w β1 , b6 = t β1σ v α ∂ σ ∂ α w β 2 ,
′ ′
d 4 = Aββ11 Aββ22 t β1σ ∂σ v β 2   b3 = −t σβ 2 ∂ σ wα ∂ α v β1 , b7 = −t β1σ ∂ σ wα ∂ α v β 2 ,
Легко проверяется, что  b4 = −t σβ 2 wα ∂ σ ∂ α v β1 , b8 = −t β1σ wα ∂ σ ∂ α v β 2 ,
c1 = d3 , c2 = d1 , c3 = d 2 , c4 = d 4 ,  [ v , w]
c c β 12
= ∑ al ,   
l =1
т.е. полный лифт векторного поля опре‐
делен инвариантно.  Имеет место  где 
a1 = t σβ2 vα ∂ α ∂ σ w β1 , a7 = − wα t σβ 2 ∂ α ∂ σ v β1 ,
Теорема  1.  Для  произвольных  проектиру‐
емых векторных полей   a2 = t β1σ vα ∂ α ∂ σ w β 2 , a8 = − wα t β1σ ∂ α ∂ σ v β 2 ,
( ( ) ( ))  
v = v a x a , xα , vα x α , a3 = t γβ 2 ∂ γ vσ ∂ σ w β1 , a9 = −t γβ 2 ∂ γ wσ ∂ σ v β1 ,
w = (w (x , x β ), w β (x β )),
b b

138  Journal of Qafqaz University   
Лифты Векторных Полей в Полутензорное Расслоение Типа (2,0) 

a4 = t γσ ∂ γ v β1 ∂ σ w β 2 , a10 = −t γσ ∂ γ w β1 ∂ σ v β1 , 3)   B′ = β ′,   в этом случае 

a5 = t σγ ∂ γ v β 2 ∂ σ w β1 , a11 = −t σγ ∂ γ w β 2 ∂ σ v β1 , H
v B′ = H v β ′ = −Γμβ′1σ ′ t σ β 2 v μ ′ − Γμβ′σ2 ′ t β1α v μ ′ =
′ ′ ′ ′ ′ ′

a6 = t β1γ ∂ γ vσ ∂ σ w β 2 , a12 = −t β1γ ∂ γ wσ ∂ σ v β 2 . (


β1 β1 μ σ
= −v μ ′ t σ ′β1′ Γμσ Aβ1 Aμ ′ Aσ ′ + Aββ11 Aμβ1′σ ′ −
′ ′
)
 Нетрудно проверить, что  ( β2 σ ′ μ β2
− v μ ′ t β1′σ ′ Γμσ Aσ Aμ ′ Aβ 2 + Aββ22 Aμβ′2σ ′
′ ′
)=
b1 = a3 , b2 = a1 , b3 = a9 , b4 = a7 , β1 β1 β 2 σβ 2 ′ ′
= −v μ Γμσ Aβ1 Aβ 2 t −
b5 = a12 , b6 = a2 , b7 = a6 , b8 = a8 ,  
− v μ Aββ11 Aμβσ1 ′ Aσσ ′ Aββ22 t σβ 2 −
′ ′
a4 + a11 = 0, a5 + a10 = 0,
β 2 β1 β 2 β1σ ′ ′
т.е.                                    − v μ Γμσ Aβ1 Aβ 2 t −

[ v, w] = ( [v, w]) ,  
c c β c β
− Aμβσ2 ′ v μ t β1σ Aββ11 Aββ22 Aσσ ′ ,
′ ′

тем  самым  доказательство  теоремы  за‐ здесь  Aμβσ ′ = ∂ μ Aσβ′ .   


вершено. 
Вводим следующие обозначения: 
4.  Пусть  база  расслоения  L   наделена 
α
аффинной  связностью  ∇ = Γβγ .  Гори‐ ( )                l1 = −v μ Γμσ1 Aβ 1 Aβ 2 t
β β′
1
β ′ σβ2
2

l2 = −v μ Aββ11 Aμβσ1 ′ Aσσ ′ Aββ22 t σβ2 ,


зонтальный  лифт  проектируемого  век‐ ′

торного  поля  v = v a x a , xα , vα xα   в  ( ( ) ( )) β 2 β1 β 2 β1σ ′ ′


l3 = v μ Γμσ Aβ1 Aβ 2 t ,
расслоение  τ 02 (M n )   определяем  следу‐  

l4 = Aμβσ2 ′ v μ t β1σ Aββ11 Aββ22 Aσσ ′ .


′ ′
ющим образом: 
H
v= ( H
) (
vB = H b H
v , vβ ,H vβ = ) С другой стороны, 
 
( β1 σβ 2 μ
= v b , v β ,−Γμσ β 2 β1σ μ
t v − Γμσ t v . )          (6) 
ABB′ H v B = ABβ ′ H v B = Abβ ′ H v b + Aββ ′ H v β +
( )
                
+ Aββ ′ H v β = v β t β1β 2 ∂ β Aββ11 Aββ22 +
′ ′
Инвариантность  горизонтального  лифта  
(6)  устанавливаем  по  аналогии  с  инва‐
′ ′ ′ ′
риантностью  полного  лифта.  Докажем,  + v β t β1β2 Aββ11 ∂ β Aββ22 − Γμσ
β1 σβ 2 μ β1 β 2
t v Aβ1 Aβ 2 −
что  v B ′ = ABB ′ H v B .   По  отношению  ин‐
H
4                               
β 2 β1σ μ β1 β 2 ′ ′
декса  B′  возможны следующие случаи:  − Γμσ t v Aβ1 Aβ 2 = ∑ k r ,
r =1

1)  B′ = b′,  при этом   v = H b′


Abb ′v b b′ β
+ Aβ v ,      где                  k1 = v β t
β1β 2
(∂ β Aββ11 Aββ22 ,   

) ′

     с  другой стороны  ′ ′
k 2 = v β t β1β2 Aββ11 ∂ β Aββ22 ,
ABb′ c v B = Abb′ H v b + Aβb′ H v β + Aβb′ H v β = ′ ′
                                  k3 = −Γμσ1 t
β σβ 2 μ
v Aββ11 Aββ22 ,        
= Abb′ v b + Aβb′ v β = H v b′ . β 2 β1σ μ β1 β 2 ′ ′
k 4 = −Γμσ t v Aβ1 Aβ2 .
2)  B′ = β ′,  при этом       
Очевидно, что 
B′ H β′ β′
H
     v = v =v = Aββ ′v β ,   l1 = k 3 , l 2 = k1 , l3 = k 4 , l4 = k 2 ,  
β′
ABB′ H v B = ABβ ′ H v B = A b H v b + Aββ ′ H v β + ′
т.е.      H v β = ABβ
′H
v B ,       тем самым инва‐
      
+ Aββ ′ H v β = Aββ ′ v β = H v B′ . риантность объекта  (6) установлена. 
Справедлива 

Number 25, 2009    139
Габил Фаттаев 

Теорема  2.  Для  проектируемого  вектор‐ ЛИТЕРАТУРА 

ного  поля  v = v x , x , v( (
a a α
) (x )),   заданного 
α α
1. Вишневский В.В.  Многообразия  над  плюраль‐
на многообразии   M n ,  ными  числами  //  Итоги  науки  и  техники. 
Проблемы  геометрии.  ВИНИТИ  АН  СССР, 
c
v −H v = v,   1988, т.20, с.35‐74. 
2. Вишневский  В.В.,  Пантелеева  Т.А.  Голоморф‐
⎛ ⎞ ное  продолжение  объектов  в  полукасательное 
здесь  v = ⎜ 0,...,0,v β ⎟ ‐вертикальное вектор‐ расслоение  второго  порядка.  Изв.вузов,  Мате‐
⎜ 123 ⎟
⎝ n ⎠ матика, 1988, N 9, с. 3‐10. 

ное поле на расслоении  τ 02 (M n )  такое, что  
3. Салимов А.А. Полиаффинорные структуры на  
дифференцируемом  многообразии  и  его  тен‐
v β = t σβ2 ∇ σ (
ˆ v β1 + t β1σ ∇
σ)
ˆ v β2 ,   ( ) а  ˆ −   
∇ зорном расслоении. Дисс. докт. физ.‐мат. наук, 
1998, Казань, 260 с.  
аффинная  связность  с  коэффициентами    4. Фаттаев  Г.Д.  Горизонтальный  лифт  тензорных 
α α
Γˆσμ = Γμσ .    полей  в  чистое  аффинорное  расслоение.  М., 
1992,  19  с,  Деп.  В  ВИНИТИ  25.09.92,  N  2852‐В 
Доказательство.    Вводим    обозначение   92. 

v B = c v B − H v B .  Относительно   индекса  B   5. Фаттаев  Г.Д.  Лифты  аффинорных  полей  на 


сечениях  в  тензорном  расслоении  типа  (2,0). 
возможны следующие случаи:  Журнал  Унив‐та  Кавказ,  сер.естест.  и  техн., 
1)  B = b,  при этом  пользуясь соотноше‐ 2008, № 21, с. 109‐115. 

ниями  (5) и (6), получим:   

v B = v b = c v b − H v b = v b − v b = 0, b = 1, n − m
2)  Пусть  B = β .   Тогда  согласно  (5)  и  (6) 
имеем: 

v B = v β = c v β − H v β = v β − v β = 0,
  
β = n − m + 1, n.
3)  B = β .  В этом случае  векторное поле  
v   имеет  следующую  серию  компонен‐
тов:  

v B = v β =cv β − H v β =
= t σβ 2 ∂ σ v β1 +t β1σ ∂ σ v β 2 +
β1 σβ 2 μ β 2 β1σ μ
+ Γμσ t v + Γμσ t v =
(
= t σβ 2 ∂ σ v β1 + Γμσ
α μ
v + )   

+ t β1σ (∂ v
σ
β2 β2
+ Γμσ v )=μ

= t σβ 2 (∂ v
σ
β1 β1
+ Γˆ σμ v )+ μ

+ t β1σ (∂ v
σ
β2 β2
+ Γˆσμ v )= t
μ σβ2 ˆ v β1 +
∇ σ
   
β1σ ˆ v β2 , β = n + 1, n + m 2 .
+t ∇ σ

Этим  доказательство  теоремы  2  завер‐


шается. 

140  Journal of Qafqaz University   
 
 
 
ОБ ОТОБРАЖЕНИИ ДВУМЕРНЫХ ЕВКЛИДОВЫХ 
ПРОСТРАНСТВ 

Наджаф Ягуб оглы АЛИЕВ 
Кафедра Алгебры и Геометрии, Механико математический факультет, 
Бакинский Государственный Университет, 
Баку / АЗЕРБАЙДЖАН 

АННОТАЦИЯ  
В  работе  исследуется  две  случаи  взаимного  однозначного  отображения  двумерных  поверхностей  в 
четырехмерном евклидовом пространтве. В первом случае отображение изучаеться как функция действи‐
тельного  переменного,  во  втором  случае  отображение  изучаеться  как  аналитическая  функция  комплекс‐
ного переменного. Используется методы подвижного репера и внешних форм. 
Ключевые слова: Отображение двумерных поверхностей, четырехмерное евклидово пространтво. 

ON MAPPING OF TWO DIMENSIONAL EUCLIDEAN SPACES 

ABSTRACT 

In paper we study two cases of one‐to‐one mapping of two dimensional planes in four dimensional euclidean 
space. In the first case we replace the mapping by  real valued functions, but in the second case we use analitic 
functions of complex variable. In the paper we used the method of moving reper and exterior forms. 
Keywords: Mapping of two dimensional planes, Four dimensional euclidean space. 

 
 
Пусть  в  евклидовом  пространстве  E 4   разующие базис ортогонального дополь‐
даны  две  вполне  ортогональные  плос‐ нения  N 2 ( x)   касателной  плоскости 
r r
кости  E 2   и  E 2   с  общей  точкой  O   и  T ‐ T2 ( x) = [ x, ε 1 , ε 2 ]   к  поверхности  V2   в 
r r r r
дифференцируемое отображение облас‐ точке  x . Через  η ij = ei ⋅ e j ,  η ij = e2+i ⋅ e2+ j , 
ти  Ω ⊂ E 2   на  область  Ω ⊂ E 2 .  Если 
r r
g ij = ε i ⋅ ε j  обозначены компоненты мет‐
точка  x1   описывает  область  Ω ,  а  рических  тензоров  плоскостей  E 2   и  E 2  
x 2 = T ( x1 ) ∈ Ω   то  точка  x   с  радиус  век‐ и поверхности  V2 , соответсвенно. Учиты‐
тором  Ox = Ox1 + Ox 2   опишет  некото‐ вая,  что  плоскости  E 2   и  E 2   вполне 
рую  двумерную  поверхность  V2 ,  назы‐ ортогональны, находим 
ваемую  графиком  отображения  T   [1]. 
g ij = η ij + η ij .              (1) 
Присоединим  к  плоскостям  E 2   и  E 2   и 
поверхности  V2  подвижные репери  Деривационные формулы этих реперов 
r r имеют вид: 
R x1 = {x1 , ei } ,  R x2 = {x 2 , e2+i } ,  r r
r r dx1 = ω i ei ,              (2) 
R x1 = {x1 , ε i , ε 2+i } , 
r r
r r r dei = ω i j e j ,              (3) 
где  i, j , k , e, s, t = 1,2 ,  ε i = ei + e2 +i ∈ T2 ( x) , 
r r r r r r
а  ε 2 +i = ei − η ikη kt e2 +t .  ε 2+i ‐  векторы,  об‐ dx 2 = ω i e2+i ,              (4) 

Number 25, 2009 141
Наджаф Ягуб оглы Алиев 

r r
de2+i = ω i j e2+ j ,            (5)  ортогональному  реперу.  Тогда  уравне‐
r r ния (11), (12), (13) примут вид: 
dx = θ i ε i ,              (6) 
ω ii = 0 ,  ω i j + ω ij = 0   (i ≠ j ) ,    (15) 
r r r
dε i = θ i j ε j + θ i2+ j ε 2+ j ,          (7)  ω i = θ i − η θ , 
j j jj 2+ j
(16) 
i
r r r θ ii + θ i2+ j = 0,     
d ε 2 + i = θ 2j+ i ε j + θ 2+ j
2+i ε 2+ j ,        (8)  (17) 
θ i2+ j g jj + θ 2i + j g ii = 0       (18) 
где  формы  ω i ,  ω i ,  θ i ,  θ i j ,  θ i2+ j , θ 22++i j , 
ω i j ,  ω i j ,  θ 2j+i   удовлетворяют  соотноше‐ (по  i, j  не суммировать). 
ниям  В  плоскости  N 2 ( x)   рассмотрим  систему 
r
ω i = ω i = θ i ,             (9)  трех  векторов  bij = bij2 + k ⋅ ε 2+ k ,  bii ‐вектор 
вынужденной  кривизны  линии,  проход‐
θ i2+ k = bij2+ k θ j ,  bij2+ k = b 2ji+ k ,         (10) 
ящей  через  точку  x   в  направлении 
r
ω i j = θ i j + θ i2+ j ,            (11)  ветора  ε i .  bij (i ≠ j ) ‐вектор  вынужден‐
r r
ной  кривизны  направлений  ε i ,  ε j   по 
ω i = θ i +η tkη θ
j j kj
i
2+t
,           (12) 
отношению друг к другу. 
r r
θ i2+ k g kj + θ 2k+i g kj = 0 ,  g kj = ε 2+ k ⋅ ε 2+ j ,   (13) 
Будем предполагать, что в каждой точке 
θ i j + θ i2+ j = θ 2j+i + θ 22++i j ,          (14)  x1 ∈ Ω   главные  полуоси  эллипсоида 
деформации  различны:  η 11 ≠ η 22 .  В.Т. 
В  каждой  точке  x ∈ V2   можно  инва‐
Базылев  называет  отображение  указан‐
риантным  образом  определить  вектор 
ного типа простым [1]. Направление  e  и 
1 ij 2+ k r
M = g bij ε 2+ k .  Его  называют  векто‐ прямая  [ x, e]  в плоскости  E 2  называется 
2
характеристическими  если  для  каждой 
ром средней кривизны поверхности  V2  в 
кривой  η , проходящей через точку  x1  и 
точке  x . 
касающейся  в  этой  точке  прямой  [ x1 , e]  
Если  отбражение  T : Ω → Ω   переводит  ее  прообразы  при  отображении  T   и 
ортогональную сеть  σ 2  в ортогональную  любой  из  гомографий,  касательных  к  T  
сеть  σ 2 = T (σ 2 ) ,  то  сеть  σ 2   (как  и  σ 2 )  в  паре  точек  x1 ,  x 2 = T ( x1 )   имеют  гео‐
называется  основанием  отображения  T   метрическое  касание  второго  (по  край‐
[1].  ней мере) порядка. 
r r
Направим  векторы  e1 ,  e2   по  касатель‐ Характеристические  направленияопре‐
ным  в  точке  x1   к  линиям  основания  σ 2   деляются уравнениями 
отбражения  T . Тогда  η12 = η12 = 0 , а зна‐ (1 + η kk )bij2+ k ω i ω j = λω k .        (19) 
чит,  и  g12 = 0 ,  т.е.  сеть  σ ∗
2 ,  соответству‐
Если  η ii = αη ii ,  то  отображение 
ющая на графике  V2  основанию  σ 2 , ор‐
тогональная. 
T : E 2 → E 2   называется  конформным, 
r r т.к. η ij = η ij = 0 (i ≠ j ) . 
Векторы  e1 ,  e2   выберем  единичными. 
Тогда  η11 = 1 ,  g ii = 1 + η ii ,  ηij = ηij = gij = 0   Зафиксируем  сеть  σ 2 ⊂ E 2   (а  значит  и 
r r r
(i ≠ j) . Нетрудно проверить, что  ε 3 ⋅ ε 4 = 0 ,  сеть  σ 2 = T (σ 2 ) ⊂ E 2 ). Векторы  ε i  будут 
т.е. график  V2  отображения  T  отнесем к  касательными  к  линиям  соответствую‐

142  Journal of Qafqaz University   
Об Отображении Двумерных Евклидовых Пространств  

щей сети  σ 2∗ ⊂ V2  (как и векторы  ei и  e2 +i   Дифференцируя  тождества  (24)  и  ис‐


пользуя  формулы (5), получим: 
для сетей  σ 2  и  σ 2 ). 
∂x t ∂ f
2 i
t
Тогда  формы  ω ,  ω i ,  θ   (i ≠ k )   и 
i
k k
i
k
ω = i k h dx h ,  i, j , k , t , h = 1,2 ,   (26) 
k
∂f ∂x ∂x
имеем разложения: 
k ∂f i ∂x t
ω ik = aijk ω j ,  ω i = bijk ω j , θ ik = cijk ω j .      (20)  где  j = δ tj . 
∂x ∂f i

Отнесем  пространство  E 4   к  прямоу‐


Вторые  тензоры  поверхности  V2 ,  гра‐
гольной  декартовой  системе  координат 
r r r r фика  отображения  T ,  в  этом  случае 
{O, J 1 , J 2 , J 3 , J 4 } ,  где  O = E 2 ∩ E 2 , 
r r r r имеют разложение 
J 1 , J 2 ∈ E 2 ,  J 3 , J 4 ∈ E 2 .  Пусть  в  этой  α ∂x j ∂ f
2 i
2+ j
b =− .        (26) 
α + 1 ∂f i ∂x k ∂x h
системе  координат  отображение  kh

T : x1 ( x , x ) → x 2 ( x , x )   определяется 
1 2 3 4

уравнениями  Из (1, 25) и  η ij = 0 ( i ≠ j ),  η ii = α  следует 


g ij = 0   ( i ≠ j ), g ii = 1 + α .  Также  g ij = 0  
x 2+i = f i ( x1 , x 2 )   (i = 1,2) .         (21) 
1
Тогда из (21), (2), (3), (4), (5) находим:  ( i ≠ j ), g ii = . 
1+α
r r
dx1 = J k dx k ,             (22)  Находим  вектор  средней  нормали  гра‐
r r ∂f i фика  V2  отображения  T , 
dx 2 = J i k dx k ,           (23) 
∂x 1 2+ t kh 1
r ∂f i r
Mt =
2
bkh g =
2(α + 1)
∑b 2+t
kk ,      (30) 
e2+ k = k J i ,            (24)  k
∂x Или в силу (29), 
∂f k ∂f k
η ij = δ ij = 0 , η ij = ∑ i .       (24)  α ∂x t
k ∂x ∂x
j
Mt =− Δf i ,        (31) 
2(α + 1) 2 ∂f i
Условия  конформности  отображения  T  
можно  выразить  так:  в  любой  точке  где  Δ ‐оператор Лапласа. Из (26), (27) и 
x 2 ∈ Ω   должны  выполняться  соотноше‐ (31) следует 
ния:  Δf i = 0 .            (32) 
η ij = 0 , η ii = α ,  i = 1,2 ,  i ≠ j . 
Итак,  графиком  конформного  отобра‐
Отсюда прямо следует, что отображение  жения  всегда  служит  некоторая  мини‐
T   будет  конфомное,  если  функции  f i   мальная поверхность  V2 ⊂ E 4 . 
определяющие  отображение  удовлет‐
Пусть  отображение  T : Ω → E 2 ,  Ω ⊂ E 2  
воряют следующие условие: 
определено  функции  w = f (z ) ,  где 
∂f 1 ∂f 1 ∂f 2 ∂f 2 z = x + iy .  Положим  w = u + iv .  Обозна‐
+ = 0 ,        (26) 
∂x1 ∂x 2 ∂x 2 ∂x1 чим такое отображение через  Ts . 
2 2 2 2
⎛ ∂f 1 ⎞ ⎛ ∂f 2 ⎞ ⎛ ∂f 1 ⎞ ⎛ ∂f 2 ⎞ В  пространстве  E 4   возьмем  ортонорми‐
⎜⎜ 1 ⎟⎟ + ⎜⎜ 1 ⎟⎟ = ⎜⎜ 2 ⎟⎟ + ⎜⎜ 2 ⎟⎟ . (27)  r r r r
⎝ ∂x ⎠ ⎝ ∂x ⎠ ⎝ ∂x ⎠ ⎝ ∂x ⎠ рованный  репер  R0 = {O, J 1 , J 2 , J 3 , J 4 } , 
Пусть  отображение  T   конфомное,  т.е.  где  по  прежнему  O = E 2 ∩ E 2 .  Имеем 
η ij = 0 ,  η ii = α ,  i = 1,2 ,  i ≠ j .  r r r r
x = oz + ow ,  dx = a1 dx + a 2 dy , где 

Number 25, 2009    143
Наджаф Ягуб оглы Алиев 

r r r ∂u r ∂v где 
a1 = J 1 + J 3 + J4 ,  −1
∂x ∂x ⎡ ⎛ ∂u ⎞ 2 ⎛ ∂u ⎞ 2 ⎤
r r r ∂u r ∂v A = − ⎢1 + ⎜ ⎟ + ⎜⎜ ⎟⎟ ⎥ , 
a2 = J 2 + J 3 + J4 .        (33)  ⎢⎣ ⎝ ∂x ⎠ ⎝ ∂y ⎠ ⎥⎦
∂y ∂y
−1
Нормальная плоскость  N 2 ( x)  к графику 
⎡ ⎛ ∂v ⎞ 2 ⎛ ∂v ⎞ 2 ⎤
B = − ⎢1 + ⎜ ⎟ + ⎜⎜ ⎟⎟ ⎥ . 
V2  отображения  Ts  в точке  x  есть плос‐ ⎢⎣ ⎝ ∂x ⎠ ⎝ ∂y ⎠ ⎥⎦
r r
кость  N 2 ( x) = [ x, b1 , b2 ] , где 
Так  как  формы  θ i2+ k   главные,  то 
r ∂u r ∂u r r
b1 = J1 + J 2 − J 3 ,  θ i2+ k = bi21+ k dx + bi22+ k dy .  Следовательно, 
∂x ∂y второй  основной  тензор  графика  имеет 
r ∂v r ∂v r r
b2 = J1 + J 2 − J 4 .       (34)  координаты: 
∂x ∂y
∂ 2u 3 ∂ 2u ∂ 2v
Отнесем  поверхность  V2   к  подвижному  b113 = A ,  b12 = A ,  b 4
12 = B , 
r r ∂x 2 ∂x∂y ∂x∂y
реперу  R x = {x, ai , bi } .  Обозначим  ∂ 2v 3 ∂ 2u ∂ 2v
r r
g ij = ai ⋅ a j . Мы с помощью формул (33)  b114 = B 2 ,  b22 = A 2 ,  b224 = B 2 . (37) 
∂x ∂y ∂y
находим 
2 2 Для  вектора  средной  кривизны  поверх‐
⎛ ∂u ⎞ ⎛ ∂v ⎞ ности  V2  получим координаты 
g11 = 1 + ⎜ ⎟ + ⎜ ⎟ , 
⎝ ∂x ⎠ ⎝ ∂x ⎠
1 3 ij 1 11 3
2
⎛ ∂u ⎞ ⎛ ∂v ⎞
2
M3 = bij g = g (b11 + b22 3
) , 
g 22 = 1 + ⎜⎜ ⎟⎟ + ⎜⎜ ⎟⎟ ,       (35)  2 2
⎝ ∂y ⎠ ⎝ ∂y ⎠ 1 1
∂u ∂u ∂v ∂v M 4 = bij4 g ij = g 11 (b114 + b224 ) , 
g12 = + .  2 2
∂x ∂y ∂x ∂y
1 11 1 11
или  M3 = g AΔu ,  M4 = g BΔv . 
Как известно, условия аналитичности  2 2
функции  T  имеют вид:  Учитывая  условия  аналитичности  функ‐
∂u ∂v ∂v ∂u ции  T   имеем  Δu = 0 ,  Δv = 0 .  Следова‐
= , = − .         (36) 
тельно,  M = 0 .  Таким  образом  графи‐
∂x ∂y ∂x ∂y
ком  любой  аналитической  функции 
Из (35) и (36) находим:  g12 = 0 ,  g11 = g 22 . 
w = T (z ) ,  где  T : E 2 → E 2   является  ми‐
r r r
Пусть  dai = θ i j a j + θ i2 + j b j .  Используя  нимальная поверхность  V2 ⊂ E 4 . 
формулы (33), (34), получим:  Имеем  
r r r r
⎛ ∂ 2u ∂ 2u ⎞ d oz = J1dx + J 2 dy ,  d ow = J 3 du + J 4 dv .  (38) 
θ13 = A ⎜⎜ 2 dx + dy ⎟⎟ , 
⎝ ∂x ∂x∂y ⎠ Используя  формулы  (2),  (38),  получим 
r
⎛ ∂ 2v ∂ 2v ⎞ ei = J i . Из формул (4), (29), получим 
θ14 = B ⎜⎜ 2 dx + dy ⎟⎟ , 
⎝ ∂x ∂x∂y ⎠ ∂u r ∂v r ∂u r ∂v r
e3 = J 3 + J 4 ,   e4 = J 3 + J 4 .  (39) 
⎛ ∂ 2u ∂ 2u ⎞ ∂x ∂x ∂y ∂y
θ 23 = A ⎜⎜ dx + 2 dy ⎟⎟ , 
⎝ ∂x∂y ∂y ⎠ Используя  формулы  (39),  находим 
⎛ ∂ 2v ∂ 2v ⎞ η11 = η 22 .  Следовательно,  отображение 
θ 24 = B ⎜⎜ dx + 2 dy ⎟⎟ , 
⎝ ∂x∂y ∂y ⎠ T : E2 → E2   является  конформным. 

144  Journal of Qafqaz University   
Об Отображении Двумерных Евклидовых Пространств  

r r r r
Итак,  любая  аналитическая  функция  b11 = −b22 ,  b11 ⋅ b12 = 0 . 
комплексного переменного  w = T (z )  по‐
Поверхность  V2   в  E4   отнесем  к  реперу 
рождает  конформное  отображение 
r r r
T : Ω ⊂ E 2 → Ω ⊂ E 2   с  минимальным  R x = {x, a i , bi } ,  где  ai   векторы  касатель‐
графиком  V2 ⊂ E 4 .  ных к линиям ортогональной сети  σ 2 . 

Пусть  Система уравнений 
j
η11 = η 22 = α .           (40)  bijα ω i ω = 0 ,            (49) 

Из (40) находим  определяет в точке  x  на поверхности  V2  


пару  сопряженных  направлений 
i1
ω i = d ln α ,           (41)  1 2
(ω , ω ) ,  (ω , ω ) .  Так  как  ω   не  равны 
1 2 i
2
1 нулью  одновременно,  то  определитель 
θ ii = d ln(1 + α ) .          (42) 
2 системы (49) должен равняться нулью: 
Из (11), (12) и (41), (42) находим  (ω 1 ) 2 ( b113 b124 − b123 b114 ) + ω 1ω 2 ( b113 b242 − b143 b123 ) +
 
1 + (ω 2 ) 2 ( b132 b242 − b124 b22
3
)=0
θ i
2+i
= − d ln(1 + α ) .         (43) 
2
Отсюда, используя разложения (10),  Учитывая (47), из последнего равенства 
имеем  находим 
r
b = b ,  b = b . 
3 4 3 4
        (44)  [(ω 1 ) 2 + (ω 2 ) 2 ] ⋅ b122 = 0 .         (50) 
11 12 12 22
r
Если  α = const , то из (44), (43) и (10)  Если  b12 = 0 , то  b123 = 0 ,  b124 = 0 . Тогда из 
получим 
равенства  (47)  следует,  что  bijα = 0 ,  т.е. 
b113 = b124 = b123 = b224 = 0 .        (45) 
поверхность  V2   является  плоскостью. 
r
Если  (45)  выполняется  то  либо  V2 ⊂ E 3 ,  Итак,  b12 ≠ 0 ,  следовательно,  условия 
либо  поверхность  V2   развертывающая‐ (50) не выполняются. Таким образом мы 
ся, что исключаем из рассмотрения.  приходим к следующему выводу. 
Итак  в  общем  случае,  не  существует  Если  поверхность  V2 ⊂ E 4   является  гра‐
отображения  Ts , для которого  α = const.  фиком  отображения  Ts   то  эта  поверх‐
Из (36), (37). Находим  ность не несет сопряженной сети. 
r r
b11 = −b22 .             (46)  Из (40) и (19) получим  
Из (44), (46) получим  (1 + α )bij2+ k ω i ω j = λω k .         (51) 
b = b = −b ,  b = b = −b
3 4 3 3 4 4
11 .       (47) 
11 12 22 12 22
Пусть  направление  линии  ω 2   является 
Из (47) и (37) имеем 
характеристическим,  но  не  является 
A = B .              (48)  Kaf ‐главным  в  отображении  Ts .  Тогда 
r r
Используя (47), находим:  b12 ⋅ b11 = 0 .  из (51) находим  

Итак одним из интересных свойств отоб‐
3
b22 = 0 .             (52) 
ражений  Ts   является  то,  что  векторы  Из (52), (26), (27), (37) получим 
вынужденной  кривизны  линии  сети  ∂ 2u ∂ 2u ∂ 2v
= 0 ,  2 = 0 ,  = 0 .      (53) 
σ 2 ⊂ V2  удовлетворют условиям  ∂x 2 ∂y ∂x∂y

Number 25, 2009    145
Наджаф Ягуб оглы Алиев 

Функция  T ( z )   удовлетворяющая  усло‐ Система (51) задает  Kaf ‐главное направ‐


виям  (53),  (37)  имеет  следующий  вид  ление  отображения  T   соответствует 
T ( z ) = icz 2 + az + b ,  c ∈ R ;  a, b ∈ C .  асимптотическое  направление    поверх‐
ности  V2 . Учитывая (37) в уравнении при 
Пусть  направление  линии  ω 1   является 
λ = 0 ,  приходим  к  следующему  выводу: 
характеристическим,  но  не  является  для отображения  Ts  не существует  Kaf ‐
Kaf ‐главным  в  отображении  T .  Тогда 
главных  направлений  (для  которых 
из (51), (26) и (37) получим  λ = 0 ),  следовательно,  поверхность  V2  
∂ 2v ∂ 2v ∂ 2u не имеет асимптотических направлений. 
= 0 ,  = 0 ,  = 0 .       (54) 
∂x 2 ∂y 2 ∂x∂y
ЛИТЕРАТУРА 
Функция  w = T (z )   удовлетворяющая  ус‐
1. Базылев В.Т. К геометрии дифференцируемых 
ловию  (54)  имеет  следующий  вид 
отображений  евклидовых  пространств.  Уч. 
T ( z ) = cz 2 + az + b ,  c ∈ R ;  a, b ∈ C . Итак,  записки МГПИ, 1970,  №374, т. 1, стр. 28‐40. 
доказано  2. Алиев  Н.Я.  Об  отображении  поверхностей 
коразмерности  два  евклидовых  пространств, 
Теорема:  Линия  ω 2 ⊂ σ 2   ( ω 1 ⊂ σ 2 )  бу‐ Геометрия  погруженных  многообразий, 
дет  характеристической,  но  не  является  Моква, 1981, 3‐5. 
Kaf ‐главной линией тогда и только тог‐ 3. Алиев  Н.Я.  Об  одном  случае  отображения 
поверхностей  евклидовых  пространств, 
да,  когда  отображение  Ts   определено 
Дифференциальная  геометрия  многообразий 
функцией  w = icz2 + az + b  ( w = cz2 + az + b ).  фигур, Калининград, 1981, №12, 5‐7. 

 
   

146  Journal of Qafqaz University   
YAZI QAYDALARI
1. “Qafqaz Universiteti” jurnalí ictimai, elmi vä texniki (Kompüter vä Ìstehsalín ìdarä edìlmäsì) sahädä ävvällär heç bir
yerdä näår olunmamíå orijinal tädqiqat äsärläri vä materiallarí qäbul edir.
2. Mäqalälär Azärbaycan, türk, ingilis vä rus dilindä yazíla bilär.
3. Mäqalälär A4 kaõízínín bir üzündä, üç nüsxädä kompüter yazí sähifäsindä, müällifin imzaladíõí ärizäsi ilä birlikdä
göndärilmälidir.
4. Yazílar IBM uyumlu kompüterin Microsoft Word yazí programínda, CD-dä göndärilmälidir.
5. Göndärilän äsärlär bu bölümlärdän ibarät olmalídír: baålíq, müällifìn adí vä soyadí, ünvaní, xülasä, açar sözlär, mätn
vä qaynaqlar.
6. Baålíq ortada, qara vä böyük härflä yazílmalídír. Baålíq häm türk, rus vä ya Azärbaycan dilindä, häm dä ingilis
dilindä olmalídír.
7. Müällifin adí baålíõín altínda (ortada olmaqla) yazílmalí, ünvaní vä varsa e-mail bildirilmälidir.
8. Xülasä yüz sözü keçmämäk åärtilä, 9 punto yazí tipi böyüklüyündä häm türk, rus vä ya Azärbaycan dilindä, häm dä
ingilis dilindä olmalídír. Här iki dildä dä än azí üç açar söz yazílmalídír.
9. Åäkil, räsm, grafik vä cädvällär çapda düzõün, aydín çíxacaq väziyyätdä olmalídír. Åäkil, räsm vä grafiklärin yazí-
larí onlarín altínda yazílmalídír. Cädvällärdä isä baålíq cädvälin üstündä yazílmalídír.
10. Qaynaqlar mätn içärisindä (vä ya sähifänin altínda) verilmäli vä än sonda älifba sírasí ilä düzülmälidir. Qaynaqlar 9
punto yazí tipi böyüklüyündä olmalídír.
11. Sähifä ölçüläri: üstdän 2.8 sm, altdan 2.8 sm, soldan 2.5 sm vä saõdan 2.5 sm olmalídír. Mätn 11 punto yazí tipi
böyüklüyündä, Times New Roman yazí tipi ilä vä täk simvol aralíõínda yazílmalídír. Paraqraflar arasínda 6 punto
yazí tipi aralíõínda mäsafä olmalídír.
12. Mäqalänin tam mätni 10 sähifädän artíq olmamalídír.
13. Mäqalälär elmi redaktorlarín vä jurnalín redaksiya hey’ätinin qärarí ilä çap olunur. Elmi redaktorlar lazím bilsälär
düzäliålär etmäk üçün mäqaläni müällifä qaytara bilärlär. Yazíya görä bütün cavabdehlik müällifin üzärinä düåür.
14. Jurnalda därc olunmayan mäqalälär geri qaytarílmír.

YAZIM KURALLARI
1. Qafqaz Üniversitesi Dergisi, Sosyal Bilimlerde ve Mühendislik sahasínda (Bilgisayar ve Endüstri Mühendisliõi) daha
önce yayímlanmamíå orijinal çalíåmalarí ve derlemeleri kabul etmek-tedir.
2. Makaleler; Azerbaycan, Türk, Ìngiliz ve Rus dillerinde yazílabilir.
3. Çalíåmalar A4 kaõídínín tek yüzüne, üç nüsha bilgisayar çíktísí alínarak, yazarlarín imzasíní taåíyan bir ön dilekçe ile
birlikte gönderilmelidir.
4. Yazílar IBM uyumlu bilgisayarda Microsoft Word yazím programínda dizilip CD’de gönderilmelidir.
5. Gönderilen makaleler åu åekilde düzenlenmelidir: Makalenin Adí, Yazarín Adí, Adresi, Çalíåmanín Özeti, Anah-tar
Kelimeler, Metin ve Kaynaklar.
6. Makalenin adí ortada, siyah ve büyük harfle yazílmalídír. Baålík hem Ìngiliz hem de Türk/Azerbaycan/Rus dilinde
olmalídír.
7. Yazarín adí baålíõín altína bir boåluk bírakílmíå åekilde, ortaya, adres ve e-postayla birlikte, yazílmalídír.
8. Özet yüz kelimeyi geçmeyecek åekilde, 9 font büyüklüõünde hem Türkiye Türkçesinde (veya Azerbaycan Türkçesinde)
hem de Ìngilizce olarak yazílmalí, her iki dilde de en az üç anahtar kelime belirtilmelidir.
9. Åekil, Resim, Grafik ve Tablolar baskída düzgün çíkacak nitelikte olmalídír. Åekil, Resim ve Grafiklerin yazílarí alt
kísímda yer almalídír. Tablolar’da ise baålík, tablonun üst kísmínda bulunmalídír.
10. Kaynaklar, metin içinde veya sayfanín altínda dipnot åeklinde verilmeli ve en sonda alfabetik olarak síralanmalídír.
Kaynaklarín büyüklüõü 9 font olmalídír.
11. Sayfa ölçüleri; üst: 2.8 cm, alt: 2.8 cm, sol: 2.5 cm, saõ: 2.5 cm åeklinde olmalídír. Metin 11 punto büyüklükte Times New
Roman fontu ile ve tek aralíkta yazílmalídír. Paragraflar arasínda 6 puntoluk mesafe olmalídír.
12. Makalenin tamamí 10 sayfayí geçmemelidir.
13. Makalenin yayímlanmasína, Hakemlerin görüåleri doõrultusunda Dergi Daníåma Kurulu karar verir. Hakemlerden
gelen rapora baõlí olarak gerek görüldüõü takdirde makale düzeltme için yazara geri gönderilebilir. Çalíåmanín her
türlü ilmi ve yasal sorumluluõu yazarína aittir.
14. Yayíma kabul edilmeyen yazílar iade edilmez.
15. Azerbaycan díåíndan gönderilen ve yayímlanacak olan makaleler için, 30 ABD Dolarí veya karåílíõí TL, T.C. Ziraat
Bankasí / Üsküdar-Ìstanbul 0403 0050 5917 No’lu hesaba yatírílmalí ve makbuzu üniversitemize fakslanmalídír.
INSTRUCTIONS FOR AUTHORS
1. The Qafqaz University Journal accepts original unpublished articles and book reviews in the following fields: - social sciences,
engineering, which includes computer engineering and industrial engineering.
2. Articles can be written in any of the following languages: - Azerbaijani, English, Turkish or Russian.
3. Articles should be submitted in triplicate, typed on one side of A4 white paper. A submission letter, signed by the author of the
article, should accompany the submission.
4. The submission should also be accom-panied by a CD file compatible with IBM PC formats. File format should be compatible
with Microsoft Word.
5. The submitted article should follow the following format: - Article title, author's name, address, article abstract, list of key
words, article main text and references.
6. The article title should be centred on the page and in bold capitals. The title should be one or the other of these, English and
Azeri, English and Russian or English and Turkish.
7. The writer's name should be centred on the page under the article title with one space between the two, followed by the author's
address and email.
8. The abstract should be written in 9 point type size and not exceed 100 words. The abstract and key words should be written in
either of the following: - English and Azeri, English and Russian or English and Turkish.
9. Figures, pictures, graphics and tables must be of publishing quality. Figures, pictures and graphics should be captioned
underneath, tables should be captioned above.
10. References must be numbered in the in article to refer to a footnote. The reference list at the end of the article must be in
alphabetic order. These should be in 9-point type size.
11. The following margin sizes should be used: - Top 2.8 cm. bottom 2.8 cm. left 2.5 cm, right 2.5 cm. The article main text should be
written in Times New Roman 11 point type size single-spaced. Paragraph spacing should be 6 point.
12. The maximum number of pages for an article should not exceed 10 pages.
13. The decision to publish a given article is made by the Journal advisory board through recommendations taken from referees.
The referees may ask the author of the article to make amendments to the article prior to publication. Publication of the article
will be dependant upon the relevant amendments being made by the author. The scientific and legal integrity of the article is
the responsibility of the author.
14. Unpublished articles will not be returned to the authors.
15. Articles submitted from outside Azer-baijan, which are published, carry a pub-lishing charge of 30 American dollars. This
payment can be to one or other of following bank accounts: - T.C. Ziraat Bankasi / Üsküdar-Istanbul 0403 0050 5917 Proof of
payment should be faxed to the university.

ПРАВИЛА ДЛЯ АВТОРОВ


1. Журнал «Journal of Qafqaz University» публикует оригинальные, ранее нигде не опубликованные статьи и работы
авторов, посвященные актуальным проблемам в общественной, научной и технической (компьютеры и управление
производством) областях.
2. Статьи могут быть представлены на азербайджанском, турецком, английском и русском языках.
3. Рукописи, напечатанные на одной стороне листа стандартного формата А4, представляются в трех экземплярах и
сопровождаются заявлением, подписанным автором.
4. Рукописи должны быть набраны на компьютере типа IBM в текстовом файле Microsoft Word. Копия статьи должна
быть представлена также в электронной форме на CD.
5. Представленные статьи должны содержать следующие разделы: заглавие, инициалы и фамилию автора, адрес,
аннотацию, ключевые слова, текст и список цитированной литературы.
6. Заглавие статьи пишется заглавными буквами, жирным шрифтом и располагается по центру. Заглавие должно быть
на турецком или азербайджанском, а также английском языках.
7. Инициалы и фамилия автора размещаются под названием статьи (по центру) с указанием почтового адреса и
электронной почты.
8. Аннотация статьи должна содержать не более ста слов, набранных шрифтом 9Pt на турецком, русском или aзер-
бaйджанском, а также английском языках. Ключевые слова не менее трех слов должны быть представлены на
каждом из двух языков.
9. Рисунки, картинки, графики и таблицы должны быть тщательно и четко выполнены. Подписи к рисункам разме-
щаются под рисунком, картинкой или графиком. Название таблицы пишется над таблицей.
10. Ссылка на использованную литературу дается в тексте (или внизу страницы) цифрой в квадратных скобках. Список
цитированной литературы, набранный шрифтом 9pt, располагается в конце статьи в алфавитном порядке.
11. Размеры страницы: сверху 2.8 см, снизу 2.8 см, слева 2.5 см и справа 2.5 см. Текст печатается шрифтом Times New
Roman, размер шрифта 11Pt, интервал-одинарный. Параграфы должны быть разделены расстоянием, соответ-
ствующим интервалу 6 Pt.
12. Полный обьем статьи не должен превышать 10 страниц.
13. Статьи публикуются по решению научных редакторов и редакционной коллегии журнала. При необходимости
статья может быть возвращена автору научными редакторами для исправлений. Автор несет ответственность за
материалы, содержащиеся в статье.
14. В случае отклонения статьи рукописи не возвращаются.

Vous aimerez peut-être aussi