a comprensión de la relevancia y de la compleja no-
L
menclatura de los centenares de bacterias «importante»
puede constituir un considerable desafío. Sin embargo,
la clave de esta tarea depende de la organización sistemática del
desconcertante conjunto de diferentes microorganismos en
unas relaciones lógicas (es decir, de una clasificación taxonó-
mica de los microorganismos).
Clasificación fenotípica
Las morfologías microscópica y macroscópica de las
bacterias fueron las primeras características utilizadas para
identificarlas y aún constituyen unos elementos fundamen-
tales en la mayoría de los algoritmos de identificación utiliza-
dos actualmente (cuadro 2-1). Por ejemplo, las bacterias se
pueden clasificar según su capacidad de retención de la tin-
ción de Gram (microorganismos grampositivos y gramnega-
tivos) y por la forma de cada célula (cocos, bacilos, espirilos).
Además, el aspecto macroscópico de las colonias bacteria-
nas (p. ej., las propiedades hemolíticas en un medio de agar
sangre, la pigmentación, el tamaño y la forma de las colo-
nias y el olor de las colonias) también se emplea en la identifi-
cación de las bacterias. Streptococcus pyogenes es una bacteria
grampositiva que forma largas cadenas de cocos y aparece
en forma de pequeñas colonias hemolíticas de color blanco en
las placas de agar sangre. Las características morfológicas se
utilizan para realizar una identificación provisional del mi-
croorganismo y poder seleccionar otros métodos de clasifica-
ción con un mayor poder de discriminación, ya que muchos
microorganismos pueden presentar un aspecto muy similar
en el examen macro y microscópico.
Los métodos más frecuentes y que todavía se utilizan en la
identificación de las bacterias consisten en determinar la pre-
sencia o la ausencia de unos marcadores bioquímicos especí-
ficos (p. ej., capacidad de fermentación de hidratos de carbono
específicos o la utilización de diferentes compuestos como
fuente de carbono para poder proliferar; presencia de protea-
sas, lipasas o nucleasas específicas; o presencia de enzimas
hidrolíticas específicas como lipasas y nucleasas). El empleo
de ciertas pruebas bioquímicas permite identificar con un
alto grado de precisión la mayoría de las cepas clínicamente
significativas. Además, estos métodos se han empleado para
subdividir los grupos de microorganismos más allá del nivel
de especie, principalmente con fines epidemiológicos (p. ej.,
para determinar si un grupo de microorganismos pertene-
cientes al mismo género y especie comparten un origen co-
mún o bien proceden de fuentes distintas). Estas técnicas son
conocidas como determinación del biotipo o biotipado.
Dado que numerosas bacterias poseen antígenos caracte-
rísticos, los anticuerpos utilizados para su detección consti-
tuyen una potente herramienta diagnóstica (serotipado).
Estas pruebas serológicas se realizan con el fin de identificar
microorganismos que son inertes frente a las pruebas bio-
químicas (p. ej., Francisella, el microorganismo causante de
la tularemia), cuyo cultivo es difícil o imposible (p. ej., Trepo-
nema pallidum, el microorganismo responsable de la sífilis),
asociados a síndromes específicos (p. ej., el serotipo 0157
de Escherichia coli, responsable de la colitis hemorrágica) o
deben identificarse de forma rápida (p. ej., S. pyogenes, res-
ponsable de la faringitis estreptocócica). Por otra parte, la
determinación de los serotipos se emplea también con fines
epidemiológicos.
Otros ejemplos de los métodos fenotípicos utilizados en la
clasificación de las bacterias son el estudio de los patrones de
sensibilidad del microorganismo frente a distintos antibióti-
cos (antibiograma) y el lisotipado (susceptibilidad a deter-
minados virus que infectan a las bacterias). Las técnicas
de susceptibilidad a los antibióticos tienen un menor poder de
discriminación. El lisotipado es una técnica engorrosa, por lo
que actualmente ha sido sustituida por técnicas genéticas
con mayor sensibilidad.
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 CUADRO 2-1. Clasificación fenotípica de las bacterias
Morfología microscópica Serotipo
Morfología macroscópica Patrones de antibiograma
Biotipo Fagotipo
CUADRO 2-2. Clasificación analítica de las bacterias
Análisis de los ácidos grasos de la pared celular
Análisis de los lípidos celulares totales
Análisis de las proteínas celulares totales
Electroforesis enzimática tipo multifocus locus
Clasificación analítica
Las características analíticas de las bacterias se han utili-
zado también para clasificarlas en géneros, especies y subes-
pecies (cuadro 2-2). El patrón cromatográfico de los ácidos
micólicos de la pared celular es característico de un gran
número de especies de micobacterias, por lo que durante
muchos años se ha utilizado en la identificación de las espe-
cies aisladas con mayor frecuencia. El análisis de los lípidos
presentes en la totalidad de la célula también es un método
útil para la descripción de numerosas especies bacterianas y
de levaduras. Otras técnicas empleadas para la caracteriza-
ción, fundamentalmente a nivel de subespecie y con fines epi-
demiológicos, son el análisis de las proteínas celulares (aná-
lisis proteómico mediante espectroscopia de masas) y las
enzimas celulares (electroforesis enzimática tipo multi-
loci). Sin embargo, y pese a que estos métodos analíticos son
precisos y reproducibles, requieren un gran trabajo y una
instrumentación muy cara. Por tal motivo, estos análisis se
emplean principalmente en los laboratorios de referencia.
Clasificación genotípica
El método más preciso de clasificación de las bacterias es el
análisis de su material genético (cuadro 2-3). Aunque inicial-
mente los microorganismos se clasificaron según la relación
guanina/citosina, este procedimiento se ha abandonado
en gran medida a favor de otros métodos con mayor poder
de discriminación. Aunque la hibridación del ADN (ácido
desoxirribonucleico) se utilizó en un principio para esta-
blecer la relación existente entre las cepas bacterianas (es de-
cir, para determinar si dos cepas pertenecían al mismo género
o especie), más recientemente esta técnica se ha empleado
para conseguir una rápida identificación de los microorga-
nismos mediante el uso de sondas moleculares. Se extrae
el ADN del microorganismo a identificar y se expone a unas
sondas moleculares específicas de unas especies concretas. La
fijación de la sonda al ADN permite confirmar la identidad del
microorganismo. Esta técnica también se ha utilizado para la
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CUADRO 2-3. Clasificación genotípica de las bacterias
Relación guanina citosina
Análisis de la secuencia del ácido nucleico
Análisis de plásmidos
Ribotipifícación
Fragmento de ADN cromosómico
identificación directa de microorganismos en muestras clínicas,
lo cual evita la necesidad de cultivarlos. La hibridización del
ADN también constituye una valiosa herramienta diagnósti-
ca para la rápida detección e identificación de microorganismos
de crecimiento lento, como micobacterias y hongos.
Una ampliación del método de hibridación es el llamado
análisis de secuencias de ácidos nucleicos. Se utilizan
sondas para localizar unas secuencias específicas en los ácidos
nucleicos que son características de un género, especie o
subespecie determinado. Estas secuencias se amplifican hasta
producir millones de copias, tras lo cual se secuencia el ma-
terial genético amplificado con el propósito de definir la identi-
dad exacta de la cepa. La aplicación más frecuente de este
método es el análisis de secuencias de ADN ribosómico, pues-
to que existen tanto secuencias de ADN muy conservadas (es-
pecíficas de familia o de género) como secuencias muy variables
(específicas de especie o de subespecie). Esta técnica también
se ha empleado para definir la relación evolutiva existente en-
tre distintos microorganismos, así como para identificar mi-
croorganismos de crecimiento difícil o imposible. La mayor
parte de los cambios recientes introducidos en la nomencla-
tura taxonómica se han relacionado con la aplicación del
análisis de secuencias de ácidos nucleicos. Una ampliación de
este método es la secuenciación del genoma completo de una
bacteria, la cual es ya posible desde el punto de vista técnico,
aunque aún no se haya utilizado con fines diagnósticos.
Otros métodos utilizados fundamentalmente para clasifi-
car los microorganismos a nivel de subespecie y con fines epi-
demiológicos son el análisis de plásmidos, el ribotipado y
el análisis de fragmentos del ADN cromosómico. A lo
largo de los últimos años se han simplificado los aspectos téc-
nicos de todos estos métodos hasta lograr que la mayor parte
de los laboratorios clínicos utilicen diferentes variaciones en
su práctica habitual.
En los cuadros 2-4 a 2-8 se ofrece un esquema de clasifica-
ción de gran utilidad para organizar las numerosas bacterias
que se describirán en los capítulos posteriores del texto. Sin
embargo, es preciso destacar que la lista de microorganismos
no es exhaustiva. De este modo, se han omitido muchos gé-
neros que suelen aislarse en las muestras clínicas con el fin de
simplificar la presentación. Los microorganismos incluidos
en estos cuadros de resumen son aquellos que se estudiarán en
los capítulos posteriores. Asimismo, debe tenerse en cuenta
que la organización exacta de las bacterias en familias, gé-
neros y especies continúa cambiando.
 CLASIFICACIÓN DE LAS BACTERIAS CAPÍTULO 2

CUADRO 2-4. Cocos grampositivos aerobios CUADRO 2-6. Cocos, cocobacilos y bacilos gramnegativos aerobios

Cocos catalasa-positivos Cocos catalasa-negativos Cocos y cocobacilos Helicobacteriaceae

Micrococcus Aerococcus Branhamella Helicobacter
Staphylococcus Alloiococcus Moraxella Pseudomonadaceae
Enterococcus Neisseria Pseudomonas
Lactococcus Pasteurellaceae
Leuconostoc Bacilos Actinobacillus
Pediococcus Enterobacteriaceae Haemophilus
Streptococcus Citrobacter Pasteurella
Enterobacter
Escheríchia Otros géneros
Ktebsiella Acinetobacter
Morganella Bartonella
Plesiomonas Bordetella
Proteus Brucella
Salmonella Burkholdería
CUADRO 2-5. Bacilos grampositivos aerobios
Serratia Capnocytophaga
Actinomicetos con ácidos micólicos en la pared celular Shigella Cardiobacteríum
Corynebacterium Yersinia Eikenella
Gordonia Vibrionaceae Francisella
Nocardia Vibrio Kingella
Rhodococcus Aeromonadaceae Legionella
Tsukamurella Aeromonas Stenotrophomonas
Mycobacteríum Campylobacteriaceae Streptobacillus
Arcobacter
Campylobacter
Actinomicetos sin ácidos micólicos en la pared celular
Actinomadura
Dermatophüus
Nocardiopsis
Oerskovia
Rothia
Streptomyces CUADRO 2-7. Bacterias grampositivas y gramnegativas anaerobias
Actinomicetos termofílicos
Saccharomonospora Cocos grampositivos Bacilos grampositivos
Saccharopolyspora Anaerococcus Actinomyces
Thermoactinomyces Finegoldia Bifidobacteríum
Tropheryma Micromonas Clostrídium
Peptostreptococcus Eubacterium
Otros bacilos grampositivos Schleiferella Lactobacillus
Arcanobacteríum Mobiluncus
Bacillus Cocos gramnegativos Propionibacterium
Brevibacterium Veillonella
Erysipetothrix Bacilos gramnegativos
Gardnerella Bacte mides
Listeria Fusobacterium
Turícelía Porphyromonas
Prevotella

CUADRO 2-8. Bacterias diversas con importancia médica

Mycoplasmataceae Chlamydiaceae
Mycoplasma Chlamydia
Urea plasma Chlamydophila
Spirochaetaceae Otras bacterias
Borrelia Coxiella
Treponema Ehrlichia
Leptospiraceae Oríentia
Leptospira Rickettsia

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 CAPÍTULO 2 CLASIFICACIÓN DE LAS BACTERIAS

PREGUNTAS Bibliografía
1. Cite tres ejemplos de las características fenotípicas, Balows A et al, editors: The prokaryotes, ed 2, New York, 1992,
analíticas y genotípicas utilizadas en la clasificación de Springer-Verlag.
las bacterias.
Murray PR et al, editors: Manual of clinícal micwbiology, ed 8,
2. Describa la morfología microscópica (p. ej., característi-
Washington, 2003, American Society for Microbiology.
cas de la tinción de Gram, forma del microorganismo) de las
siguientes bacterias: Staphylococcus, Escherichia, Neis- Murray PR, Shea Y: Pocket guide to clinícal microbiology, ed 3,
sería, Clostrídium, Enterococcus y Pseudomonas. Washington, 2004, American Society for Microbiology.
3. ¿Cuál de los siguientes microorganismos posee ácidos
micólicos en su pared celular: Staphylococcus, Nocardia,
Mycobacteríum o Klebsiella?