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Plan du cours

Philippe ROUSSEAU Matre de confrence Laboratoire de Microbiologie et de Gntque Molculaire LMGM (UMR5100, CNRS-UPS) Tel: 05 61 33 59 16 Mail: philippe.rousseau@ibcg.biotoul.fr

Gntique Licence 1 D1

Introduction la Gntique
1) Histoire, dfinitions et notion de gne 2) La fonction et la mutation du gne 3) Sgrgation dun gne au cours de la miose

Cours 1

Gntique Licence 1 D2

Introduction la Gntique
1) Histoire, dfinitions et notion de gne 2) La fonction et la mutation du gne 3) Sgrgation dun gne au cours de la miose

La gntique

Gntique Licence 1 D3

Chaque individu contient un programme gntique (ses gnes).

Ce programme gntique lui vient de ses parents il le transmettra en partie ses enfants: cest la base de lhrdit.
femelle mle

La gntique, cest lanalyse et la comprhension de ce programme gntique et de cette hrdit.

La gntique dans la socit

Gntique Licence 1 D4

Comprhension philosophique Contrle de lhrdit Au niveau des espces germinal Au niveau des individus somatique

Slection animale et vgtale en Agriculture Clonage animal, vgtal ou microbien en agriculture et en mdecine Comprhension des maladies gntiques chez lHomme

Thrapies gniques chez lHomme

Historique

Gntique Licence 1 D5

Mendel (1865), De Vries (1900) Sutton (1902) Morgan (1914) Griffith (1928) Beadle, Ephrussi, Tatum (1941) Avery,McArty, McLeod (1944) Watson, Crick, (1953)
Biologie (1995), Campbell, DeBoeck univ.

Lacide dsoxyribonuclique: lADN


Biologie (1995), Campbell, DeBoeck univ.

Gntique Licence 1 D6

Adnine (A) Thymine (T)

Guanine (G) Cytosine (C) 3 S P S P S P A T G C T A 5 P S P S P S P C G S 3

phosphate S Bases 3 P 5

dsoxyribose

Rplication de lADN
La structure de lADN reflte sa fonction: Assurer la transmission du matriel gntique dune gnration lautre.

Gntique Licence 1 D7

La rplication de lADN: - utilise lappariement spcifique des bases - est semi-conservatrice


5 3 5 3 5 3 5 3

ADN parental ADN nosynthtis

Biologie (1995), Campbell, DeBoeck univ.

Notion de gne
Gne: Unit fonctionnelle et physique lmentaire de lhrdit qui transmet linformation dune gnration la suivante.

Gntique Licence 1 D8

Un fragment dADN, constitu constitu dune rgion transcrite et de squences rgulatrices.


Procaryote Promoteur Stop

Eucaryote

Promoteur

Intron

Stop

Exon1 Codant

Exon2

Notion de gnome
Gnome :

Gntique Licence 1 D9

Ensemble du matriel gntique contenu dans un jeu de chromosomes

Toujours base dADN les gnomes ont des structures et des organisations qui diffrent en fonction des organismes.

Organisme

Taille du gnome (kb)

Nombre de gnes

Nombre moyen dexons

longueur moyenne des gnes (kb) 1 1 1,6 16,6

Longueur moyenne des ARNm (kb) 1 1 1,6 2,2

Escherichia coli Hemophilus influenzae

4700 C 1830 C

4000 1703 6000 100000

1 1 1 7

13500 L Saccharomyces cerevisiae 3000000 L Homo sapiens

Kb = kilo base = 1000 bases

L = linaire

C = circulaire

Plodie: nombre de copie du gnome

Gntique Licence 1 D10

Haplode:

Une seule copie du gnome Une seule copie de chaque gne Si un gne est altr, la fonction quil code est modifie

Diplode:

Deux copies du gnome Deux copies de chaque gne Si un gne est altr, lautre copie garde sa fonction et peut donc compenser la possible perte de fonction Recombinaison (crossing-over) possible entre les deux copies du gnome

Cours 2

Gntique Licence 1 D11

Introduction la Gntique
1) Histoire, dfinitions et notion de gne 2) La fonction et la mutation du gne 3) Sgrgation dun gne au cours de la miose

Fonction du gne

Modle simple bactrien La structure du gne reflte sa fonction: Assurer lexpression du matriel gntique.
+1 -35 -10

Unit fonctionnelle: gne


Promoteur RNAP

Gntique Licence 1 D12

Stop

RNAP

Transcription Traduction Codon initiation Codon Stop

Promoteur: exemple E.coli

maturation

Larchitecture dune protine est la cl de la fonction des gnes.

Un gne code une fonction: importance de larchitecture dune protine

Gntique Licence 1 D13

+ substrat enzyme enzyme

+ produit

La structure tridimensionnelle de la protine (enzyme) dfinit sa fonction biochimique.

Si la structure tridimensionnelle de la protine est modifie, sa fonction biochimique peut elle aussi tre modifie. La mutation du gne peut induire ce type de modification.

Maladie gntique: enzymes dficientes et mutations


Beaucoup de maladies gntiques sont dues la perte de fonction dune enzyme mtabolique.

Gntique Licence 1 D14

La mucoviscidose est lie la perte de fonction dun pore ions chlorure. Il en dcoule un paississement du mucus entranant des difficults respiratoires.

Mutation: au niveau de lADN

Gntique Licence 1 D15

Mutation: processus alatoire par lequel des gnes passent dune forme alllique une autre

Altration dune base. Etape facilite par les agents mutagnes: - rayons UV - rayons X - rayons beta et gamma - acide nitreux - nitrosoguanidine Altration dune base
*

Gnration 2

Gnration 1

ACGTC TGTAG ACATC TGTAG


rplication

ACGTC TGTAG ACGTC TGCAG

ACGTC TGCAG

ACGTC TGCAG

ACGTC TGCAG ACGTC TGCAG

rplication

Deux types de mutations ponctuelles: Transition: Transversion:

changement dune purine par une autre ou dune pyrimidine par une autre changement dune purine par une pyrimidine ou inversement.

Rparation
Rparation:

Gntique Licence 1 D16

- processus par lequel la plupart des lsions ou des mutations de lADN sont rpares - ce processus est enzymatique - la dfaillance dans un des ces processus enzymatique est la base de nombreuses maladies gntiques humaines: cancers de la peau ou du colon

Gnrat 1 Altration dune base

Gnrat 1

ACGTC TGTAG ACGTC TGCAG


*

ACGTC TGCAG ACGTC TGCAG


Rparation du msappariement

ACGTC TGCAG
Rparation de la lsion

ACGTC TGCAG
rplication

Mutation: frquence
Chez un procaryote ou un eucaryote unicellulaire
Mutation dun gne : environ 10-8

Gntique Licence 1 D17

Lobtention dun mutant dpendra du nombre de gne quil faut muter pour observer le phnotype: - mutation dun gne en particulier: - mutation dun gnes parmi plusieurs: 10-8 10-6

- mutation dun codon particulier dun gne en particulier: 10-10

Chez un Eucaryote suprieur


Mutation dun gne

Consquences somatiques: frquentes vu le grand nombre de cellules et donc de divisio Consquences germinales: Rares vu le grand nombre de cellules et donc de divisions

Mutation: consquence au niveau protique


Promoteur

Gntique Licence 1 D18

Dans une mutation ponctuelle, le changement de base peut induire un changement de codon. Stop

Les mutations ponctuelles peuvent tre: - faux-sens: changement de codon et dacide amin - non-sens: changement de codon vers un codon stop - silencieuse: changement de codon sans changement dacide amin

TGT(Cys)

TCT(Ser)

TAC(Tyr)

TAA(Stop)

CCT(Pro)

CCC(Pro)

Rversion
Rversion: cest une mutation qui en annule une autre
Promoteur

Gntique Licence 1 D19

Stop

mutation - rversion vraie AAA(Lys) GAA(Glu)

rversion AAA(lys)

- rversion quivalente

TCC(Ser)

TGC(Cys)

AGC(Ser)

Consquence fonctionnelle des mutations: Perte de fonction chez les haplodes

Gntique Licence 1 D20

+ Enzyme active substrat

Enzyme inactive

Gnotypes

sauvage a+ [normal]

mutant a[dficient]

Phnotypes

Consquence fonctionnelle des mutations: Perte de fonction chez les diplodes


Enzyme active + substrat Enzyme active + substrat

Gntique Licence 1 D21

Enzyme inactive

+ Enzyme active substrat

Enzyme inactive

Enzyme inactive

Gnotypes

Homozygote sauvage a+/a+ [normal]

Htrozygote a+/a[normal] si haplo-suffisance [dficient] si haplo-insuffisance [intermdiaire] si co-dominance

Homozygote mutant a-/a[dficient]

Phnotypes

Consquence fonctionnelle des mutations: gain de fonction chez les haplodes

Gntique Licence 1 D22

+ Enzyme active substrat

Enzyme dactivit diffrente

Gnotypes

sauvage a+ [normal]

mutant am [mutant]

Phnotypes

Consquence fonctionnelle des mutations: gain de fonction chez les diplodes


+ Enzyme active substrat Enzyme active + substrat

Gntique Licence 1 D23

Enzyme dactivit diffrente

Enzyme + Enzyme active substrat dactivit diffrente

Enzyme dactivit diffrente

Gnotypes

Homozygote sauvage a+/a+

Htrozygote a+/am [normal] et/ou [mutant] Suivant les cas

Homozygote mutant am /am

Phnotypes [normal]

[mutant]

Cours 4

Gntique Licence 1 D24

Introduction la Gntique
1) Histoire, dfinitions et notion de gne 2) La fonction et la mutation du gne 3) Sgrgation dun gne au cours de la miose

La reproduction sexue: brassage gntique


n 2n Sordaria macrospora n

Gntique Licence 1 D25

2n

Levure

Humain

fcondation

n n 2n

2n

mose

La miose: lieu du brassage gntique


La miose fcondation rplication mioseI

Gntique Licence 1 D26

miose II

2n

2n (x 2)

n (x 2)

Brassage interchromosomique
mioseI rplication fcondation

Gntique Licence 1 D27

miose II

quiprobable

Pour 1 chromosome, il y a deux arrangements possibles la mtaphase de la miose I Tous les gamtes sont quiprobables

Brassage interchromosomique II
fcondation rplication mioseI

Gntique Licence 1 D28

miose II

quiprobable

Pour 2 chromosomes, il y a deux arrangements possibles la mtaphase de la mioses I, et 22 = 4 gamtes differents Tous les gamtes (parentaux P et recombins R) sont quiprobables

Brassage intrachromosomique

Gntique Licence 1 D29

non quiprobable

crossing-over

Le crossing-over a lieu au niveau dun chiasma lors de lappariement des chromosomes homologues en mtaphase I Les gamtes (parentaux P et recombins R) ne sont pas quiprobables

Consquences du brassage gntique


n 2n n

Gntique Licence 1 D30

1re loi de Mendel Sgrgation monognique: 1/2 Arg+ 1/2 Argchez les gamtes de l hybride

ttrade
Arg+ Arg-

Arg+

Arg+

1/2

Arg-

Arg-

1/2

Les brassages inter et intra ny changent rien

Consquences du brassage gntique

Gntique Licence 1 D31

Graine jaune

Graine verte

J/J

v/v

100%

F1

J/v

F2 = F1 x F1 75% 25% 3/4 1/4 J 1/2 V 1/2

J 1/2 J/J v/J

1/2

J/v v/v

Croisement test
J/J x v/v

Gntique Licence 1 D32

F1: J/v F1 x F1 F2: J 1/2 v


1/2

Test cross F1 x v/v v


1/2

J 1/2 J/J v/J 1/4

J/v v/v

J 1/2 v
1

1/2

J/v

v/v

3/4

1/2

1/2

Phnotype intermdiaire: codominance

Gntique Licence 1 D33

R/R

B/B

F1

R/B

F2 = F1 x F1
25% 25% 50%

R 1/2 R 1/2 B 1/2 R/R B/R

B1/2 R/B B/B