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Pr. Y. Touitou
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Sommaire
Sommaire
3 5 5 5 6 6 6 7 7 7 8 8 8 9 11 12 13 14 14 14 15 15 16 16 17 18 19 19 20 20 21 22 22 22 23 24 26 27 28
Sommaire Chapitre 1 :
1.1 1.2 1.3 1.3.1 1.3.2 1.4 1.4.1 1.4.1.1 1.4.1.2 1.4.1.3 1.4.2 1.4.3 1.4.4 1.4.5 1.4.6 1.4.7 1.4.8 1.4.8.1 1.4.8.2 1.4.8.3 1.4.8.4 1.4.8.5 1.4.9 1.4.10 1.4.11 1.4.11.1 1.4.11.2 1.4.11.3 1.4.11.4 1.5 1.5.1 1.5.2 1.5.3 1.5.4 1.5.5 1.5.6 1.5.7
Les glucides
Dfinition Importance en Biologie Classification des glucides Les critres de classification des oses Les osides Les oses Structure linaire des oses Nomenclature Structure du Glycraldhyde Rappels sur le Carbone asymtrique Filiation chimique des oses selon Fischer Srie D et L des oses Principaux oses naturels selon Fischer Objections la structure linaire des oses Structure cyclique des oses : structure de Haworth Intrt de la structure cyclique Structure cyclique des oses selon Haworth D Glucopyranose D-Galactopyranose D-Mannopyranose D-Fructofuranose D Ribofuranose Principales proprits des oses Drivs amines doses biologiques Drivs acides doses biologiques Acides aldoniques Acides uroniques Acide sialique = Acide N-actylneuraminique (NANA) Acide ascorbique = vitamine C Les osides Dfinition Mode de liaison des oses Les principaux diholosides Les polyosides Hydrolyse enzymatique des osides et polyosides Glycosaminoglycanes Les glycoprotines
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Sommaire 28 28 28 29 29 31 31 31 31 32 32 33 33 35 35 35 36 37 38 38 38 39 40 40 41 41 43 43 44 44 47 47 48
Dfinition La fraction glucidique Liaison des fractions glucidiques et protiques Rle biologique des fractions glucidiques Les principales glycoprotines
Chapitre 2 :
2.1 2.2 2.3 2.3.1 2.3.2 2.3.3 2.3.4 2.3.5 2.4 2.4.1 2.4.2 2.4.3 2.5 2.5.1 2.5.2 2.5.3 2.5.4 2.5.5 2.5.6 2.5.7 2.6 2.6.1 2.6.2 2.6.3
Les lipides
Dfinition Rle biologique Les acides gras Les acides gras saturs [CH3 -(CH2)n - COOH] Les acides gras monoinsaturs Les acides gras polyinsaturs Proprits des acides gras Classification des lipides Les lipides simples : glycrides et strides Les glycrides Les strides La vitamine D3 ou Cholcalcifrol Glycerophospholipides Lacide phosphatidique Les glycrophospholipides Les Phosphatidylthanolamines et Phosphatidylsrines Les Phosphatidylcholines ou LcithinesLes Phosphatidylcholines ou Lcithines Les Phosphatidylinositols Proprits des Glycrophospholipides Hydrolyse des phospholipides par les phospholipases Sphingolipides Acylsphingosine ou Cramide Les Sphingomylines Les Glycolipides
Chapitre 3 :
3.1 3.2
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Les glucides
Rle structural Les glucides interviennent comme : Elments de soutien (cellulose), de protection et de reconnaissance dans la cellule. Elments de rserve des vgtaux et animaux (glycogne, amidon). Constituants de molcules fondamentales : acides nucliques, coenzymes, vitamines, Ils reprsentent un fort pourcentage de la biomasse car la plus grande partie de la matire organique sur la Terre est glucidique. Cellulose : milliards de tonnes / an Amidon, saccharose : millions de tonnes / an.
3.
Rle conomique
4.
La place du glucose
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Les glucides
Principal carburant des tissus Seul carburant du ftus Rle fondamental car tous les glucides alimentaires sont absorbs sons forme de glucose ou convertis en glucose dans le foie. Tous les glucides sont synthtiss partir du glucose dans lorganisme.
Holosides Liaison de n molcules doses par des liaisons glycosidiques. Selon le nombre doses constitutifs : Di-, Tri, Ttra holosides. Oligosides : jusqu quelques dizaines doses. Polyosides : quelques centaines doses (cellulose, amidon).
3.
Htrosides Ils donnent par hydrolyse : oses + aglycone (partie non sucre). Liaison des Protines (glycoprotines), des Lipides (glycolipides), des bases.
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Les glucides
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Les glucides
4.
Configuration strochimique et pouvoir rotatoire dun ose En dehors du glycraldhyde, il ny a aucune relation entre configuration strochimique de lose et son pouvoir rotatoire.
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Les glucides
2.
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Les glucides
Filiation des oses selon Fischer (srie D) Par addition successive dun carbone, on obtient chaque tape la formation de 2 isomres (1 triose 2 ttroses 4 pentoses 8 hexoses).
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Epimres Lpimrisation se fait par voie chimique ou enzymatique (pimrase). Le Galactose est pimre en 4 du Glucose. Labsence dpimrase empche la transformation du Galactose en Glucose et entrane une des formes de la galactosmie congnitale du nouveau-n. Le Mannose est pimre en 2 du Glucose (cest un pimre chimique = pimre vrai).
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Les glucides
Un aldose ou un ctose ne fixent quune seule molcule dalcool Aldose ou Ctose + ROH Hmiactal uniquement
2.
Mutarotation (anomres) La valeur du pouvoir rotatoire dun ose (mesure au polarimtre) nest pas fixe immdiatement ; elle le devient au bout dun certain temps. Ce phnomne est li lexistence de 2 formes isomriques, lanomre ou lorigine de la mutarotation. Ces 2 anomres diffrent par la position dans lespace du OH hmiactalique.
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Ces objections permettent de montrer quen solution les oses existent non pas sous forme linaire mais sous forme cyclique.
La structure est convexe vers lobservateur. Par cette convexit les C1 et C6 sont proches dans lespace. La rotation des valences autour du C5 permet de mettre sur un mme plan les atomes participant la cyclisation, soit : le C1, le C5 et lOxygne du C5. Le cycle 6 sommets qui en rsulte est appel pyranique car il est issu du pyrane.
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1.4.8.1 D Glucopyranose
Le Glucose naturel (D (+) Glucose) est trs rpandu dans la nature. Cest le principal carburant de lorganisme et le carburant universel du ftus. La polymrisation du Glucose conduit au Glycogne (foie, muscles). La glycmie est la concentration de Glucose ltat libre dans le sang (0,80g/L soit 4,4 mM/ L). Le Glucose est rducteur. La Glucose oxydase loxyde en acide aldonique : Glucose oxydase Glucose Coenzyme Acide gluconique + H2O
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Les glucides
1.4.8.2 D-Galactopyranose
Il intervient dans la composition de : Lactose = D Gal + D Glc Crbrogalactosides du cerveau Certains glycolipides et glycoprotines Son pouvoir rotatoire est dextrogyre.
1.4.8.3 D-Mannopyranose
Il est prsent surtout dans les vgtaux. Cest un constituant des glycoprotines chez lhomme. Son pouvoir rotatoire est dextrogyre.
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Les glucides
1.4.8.4 D-Fructofuranose
On le trouve surtout dans les fruits do son nom. Son pouvoir rotatoire est lvogyre do son nom de Lvulose. Il est prsent dans le liquide spermatique chez lhomme o il participe au mouvement des spermatozodes. Il est prsent sous forme furanique dans le saccharose. La cyclisation se fait entre le C2 (ctone) et le C5.
1.4.8.5 D Ribofuranose
La forme furanique est la forme habituelle des pentoses combins dans les acides nucliques (ARN). Le D Ribofuranose est li aux bases puriques et pyrimidiques par une liaison N-osidique (nuclosides, nuclotides). Il intervient dans la structure des coenzymes : NAD, NADP, ATP.
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Les glucides
4. 5.
La Glucose oxydase oxyde spcifiquement le Glucose en acide gluconique. Les oses se rduisent en polyols par voie chimique ou enzymatique La fonction aldhydique ou ctonique est rduite en alcool Glucose Galactose Mannose Ribose Glucitol (ou Sorbitol) Galactitol (ou Dulcitol) Mannitol Ribitol
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Les glucides
6.
Comme nous lavons vu prcdemment, une pimrisation en 4 peut se faire par voie enzymatique grce une pimrase :
Glc Galactose
7.
Les oses sont estrifiables : exemples du Glucose - 6 - Phosphate, du Fructose 1, 6 - bis Phosphate, molcules importantes du mtabolisme nergtique.
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Les glucides
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Ce sont des constituants des Glycosaminoglycanes Leur rle biologique est essentiel dans la dtoxification hpatique.
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Rle biologique : cest le coenzyme de la prolylhydroxylase qui intervient dans la synthse dhydroxyproline. Elle intervient aussi dans la synthse des strodes. Sa carence entrane des anomalies de la synthse du collagne, la fragilit des parois vasculaires.
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2.
Diholoside rducteur : liaison osido-ose Il y a condensation dune fonction hmiactalique dun ose avec une fonction alcoolique dun second ose par une liaison osido-ose. Il reste donc dans le diholoside un -OH hmiactalique libre responsable du pouvoir rducteur de la molcule.
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Cest un produit dhydrolyse obtenu lors de la digestion des polyosides (amidon et glycogne) par les amylases. Il est form par lunion de 2 molcules de glucose unies en 1-4. Cest un oside rducteur. Il est hydrolys en 2 molcules de glucose par une enzyme spcifique, la maltase.
B.
Le Lactose
Il est prsent dans le lait de tous les mammifres. Cest un diholoside rducteur constitu dune molcule de Gal et dune molcule de Glc unies par une liaison 1-4 osidique.
C.
Le Saccharose
Cest un diholoside non rducteur, trs rpandu dans les vgtaux. Cest le sucre de table.
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Le saccharose a un pouvoir rotatoire dextrogyre. Par hydrolyse il donne naissance un mlange lvogyre. Ceci sexplique car, dans le mlange, le pouvoir rotatoire lvogyre du fructose (- 92) est suprieur au pouvoir rotatoire dextrogyre du glucose (+ 52). Cette proprit a valu au mlange le nom de sucre interverti. Le saccharose est hydrolysable par voie enzymatique avec une glucosidase ou une fructosidase.
Cest le polyoside vgtal le plus abondant (rserve glucidique), qui a un rle nutritionnel important chez lhomme et lanimal. Il est synthtis dans les grains damyloplastes des cellules vgtales. Son poids molculaire est variable selon lespce vgtale et peut atteindre plusieurs mil-
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Les glucides
lions. Il est constitu dune chane principale faite de glucoses unis en 1-4 et de ramifications (ou branchements) faites de glucoses unis en 1-6.
B.
Le Glycogne
C.
Cest la forme de stockage du glucose dans le foie et les muscles Cest un polyhoside plus ramifi que lamidon car ses branchements sont plus nombreux (liaisons 1-6) et plus rapprochs. Cest un polyoside linaire qui reprsente 50 % du carbone vgtal. Il est form de lunion de 2 Glucoses unis en 1-4 (cellobiose). Il est hydrolys par une glucosidase (cellulase) non prsente dans le tube digestif chez lhomme. La cellulose nest donc pas hydrolyse lors de la digestion chez lhomme.
La Cellulose
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Les amylases (1-4 glucosidases). Elles agissent en nimporte quel point de la chane sur les liaisons 1-4 pour donner des molcules de maltose et des dextrines limites car leur action sarrte au voisinage des liaisons 1-6. Il existe une amylase salivaire, peu active car elle est inactive par le pH acide de lestomac et, surtout, une amylase pancratique trs active. Lenzyme dbranchant ou 1-6 glucosidase Il scinde la liaison 1-6 glucosidique cest--dire les points de branchement. Il est prsent dans la bordure en brosse de lintestin. La maltase Tous les maltoses obtenus prcdemment sont hydrolyss en 2 molcules de glucose par la maltase (1-4 glucosidase).
B.
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La fructosidase (saccharase ou invertine) hydrolyse le saccharose : Saccharose Glucose + Fructose La galactosidase (lactase intestinale du nourrisson) hydrolyse le lactose :
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Lactose Glucose + Galactose La glucosidase, absente chez lhomme, hydrolyse la cellulose. La maltase est une 1-4 glucosidase spcifique qui hydrolyse le maltose en 2 molcules de glucose.
1.5.6 Glycosaminoglycanes
Ce sont des polyosides htrognes qui rsultent de la polycondensation dosamines et dacides glucuroniques. 1.
Lacide hyaluronique
Il reprsente une barrire pour les substances trangres. Il est prsent dans lhumeur vitre et dans les articulations o il a un rle de lubrifiant. Cest le plus simple des glycosaminoglycanes. Il est constitu de motifs disaccharidiques rpts n fois : [Acide D glucuronique + N-actyl D glucosamine]n Les liaisons sont : 1-3 dans le motif 1-4 entre les motifs
Lacide hyaluronique a un poids molculaire trs lev et de trs nombreuses charges ngatives. Il ny a pas de sulfates. Il est hydrolys par une enzyme de dpolymrisation, la hyaluronidase qui agit entre les chanons, sur les liaisons 1-4. Cette enzyme se retrouve dans les bactries, le venin de serpent, le sperme o elle facilite la pntration du spermatozode dans lovule lors de la fcondation en hydrolysant lenveloppe de lovule.
2.
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Elles sont constitues de la polycondensation de motifs disaccharidiques : [Acide D glucuronique + N-actyl galactosamine]n Les liaisons sont galement 1-3 dans les motifs et 1-4 entre les motifs. Elles sont trs riches en charges ngatives en raison des groupements sulfates et uronates. Elles fixent donc fortement les cations. Les sulfates sont fixs en C4 ou C6 de la galactosamine. Cest un anticoagulant physiologique qui est prsent dans de nombreux tissus (foie, poumon, reins, cur). Elle est constitue de la polycondensation de : [Acide D glucuronique + D Glucosamine N-Sulfate]n Les liaisons sont 1-4 dans le motif et entre les motifs. Les sulfates sont indispensables lactivit biologique, ils sont fixs sur lazote et lalcool primaire en 6 de la glucosamine mais certaines hparines peuvent en contenir beaucoup plus.
3.
Lhparine
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dune fonction amide de la glutamine ou de lasparagine : liaison N-glycosidique la liaison se fait sur un motif spcifique, dans un environnement appropri de la protine.
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Les lipides
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Les lipides
Cest un acide gras trs abondant dans les graisses vgtales et animales. La prsence dune double liaison dans un acide gras entrane une isomrie cis-trans. Les acides gras naturels sont cis :
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Les lipides
Acide linolique C18 : 2 6 Lacide linolique est un acide gras indispensable (besoins quotidiens : 3-4 g). Cest un acide gras en C18 avec 2 doubles liaisons (6, 9)
Il conduit par voie enzymatique lacide arachidonique dans lorganisme. Acide arachidonique C20 : 4 6 Il possde 4 doubles liaisons en 6, 9, 12, 15 Lacide linolique donne naissance dans lorganisme lacide arachidonique 20 C et 4 doubles liaisons. En labsence dacide linolique dans lalimentation, lacide arachidonique devient indispensable.
2.
1.
Solubilit Lacide butyrique 4C est soluble dans leau, puis la solubilit des acides gras
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Les lipides
2.
baisse progressivement et ils sont insolubles partir de 10C. Ils sont solubles dans les solvants organiques apolaires : benzne, chloroforme, augmente avec le nombre de C. diminue quand le nombre de doubles liaisons augmente.
Le point de fusion
1.
Loxydation par loxygne de lair conduit au rancissement des graisses Loxydation enzymatique intracellulaire de lacide arachidonique par la cyclooxygnase (cyclisation + oxydation) conduit aux prostaglandines qui sont des mdiateurs trs actifs, trs rapidement dgrads. Cyclooxygnase Acide arachidonique Prostaglandine E2 (Eicosanode)
Action biologique des prostaglandines. Elles interviennent : dans la contraction des muscles lisses (intestin, utrus, vaisseaux) ; dans la rgulation des mtabolismes ; dans lagrgation plaquettaire. Linhibition de la cyclooxygnase des plaquettes par laspirine est utile en thrapeutique (antiagrgant plaquettaire).
2.
Formation de sels de sodium ou potassium Ce sont des savons proprits moussantes, mouillantes et mulsionnantes. Dans leau les savons se dissocient en Na+ + R-COOLanion a 2 ples :
COO-
Hydrophobe
Hydrophile
3.
Ces molcules appeles amphiphiles ou amphipathiques, sont tensioactives : elles abaissent la tension superficielle de leau do leurs proprits. Formation dester (avec Glycrol et Cholestrol) et de thioester (avec le Coenzyme A) (voir le mtabolisme).
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Les lipides
Si les 3 AG sont identiques, le triglycride est homogne ; sils sont diffrents, il est htrogne. Ce sont les lipides naturels les plus nombreux, prsents dans le tissu adipeux (graisses de rserve) et dans de nombreuses huiles vgtales. Ils reprsentent une rserve nergtique importante chez lhomme. Ils sont solubles dans lactone ce qui les diffrencie des phospholipides (ils sont trs apolaires). Hydrolyse des triglycrides La lipase, enzyme du suc pancratique, hydrolyse les triglycrides alimentaires en monoglycride + 2 acides gras :
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Dans le tissu adipeux, lhydrolyse est complte car elle fait intervenir la lipase hormonosensible, puis une monoglycride lipase pour donner : Glycrol + 3 AG
Le stride est form par estrification dun AG sur la fonction alcool en 3 du cholestrol. Le cholestrol est apport dans lalimentation et synthtis par le foie ; il est transport dans le sang dans les lipoprotines.
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Cest un constituant des membranes (rle dans la fluidit). Le cholestrol sert dans lorganisme la synthse de 3 groupes de molcules : Les hormones strodes (cortisol, testostrone) La vitamine D3 Les acides biliaires
Formule de la Vitamine D3
Elle est synthtise partir dun prcurseur le 7-dhydrocholestrol, prsent dans la peau, qui se transforme en vitamine D3 (qui est une prohormone), sous leffet des UV. Elle est mtabolise dans le foie o une 25-hydroxylase la transforme en 25-OH-vitamine D3 puis cette dernire est hydroxyle dans le rein par une 1-hydroxylase pour donner la 1,25-dihydroxyvitamine D3 ou calcitriol qui est une hormone. Le calcitriol est responsable de toutes les proprits de la vitamine D3. La vitamine D3 est une vitamine liposoluble qui prvient le rachitisme en favorisant la fixation du calcium sur los.
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2.5 Glycerophospholipides
2.5.1 Lacide phosphatidique
Cest llment de base des glycrophospholipides. Acide phosphatidique = Glycrol + 2 Acides Gras + H3PO4
Les deux acides gras ont une chane longue ( 14C), lacide gras en position 2 est souvent insatur. Lacidit de la molcule provient des 2 H mobiles libres de lacide phosphorique. Au pH sanguin (7,35 - 7,45) les 2 fonctions acides sont ionises. Lacide phosphatidique est un second messager intracellulaire.
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B.
Les diffrentes classes de glycrophospholipides Le lipide se forme par fixation dun alcool sur lacide phosphatidique. Selon lalcool, on obtient des classes diffrentes de lipides.
Phosphatidylsrines = Acides Phosphatidiques + Srine Phosphatidylthanolamines = Acides Phosphatidiques + Ethanolamine Phosphatidylcholines = Acides Phosphatidiques + Choline Phosphatidylinositols = Acides Phosphatidiques + Inositol
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2. 3.
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Si hydrolyse par la phospholipase A1 : AG satur + Lyso1 phospholipide Si hydrolyse par la phospholipase A2 : AG insatur + Lyso 2 phospholipide Si hydrolyse du phosphatidylinositol 4, 5 diphosphate par une phospholipase C :
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Acide phosphatidique + alcool (choline par exemple). 2. Rle des phospholipases Lhydrolyse des phospholipides alimentaires lors de la digestion est ralise par la phospholipase A2 pancratique. Lhydrolyse des phospholipides membranaires permet la synthse de mdiateurs lipidiques : une phospholipase A2 conduit aux prostaglandines, leucotrines, lysophospholipides une phospholipase C conduit aux DAG (Diacylglycrol), IP3 (inositol 1, 4, 5 triphosphate) une phospholipase D conduit lAcide phosphatidique.
2.6 Sphingolipides
Ce sont des amides de la sphingosine qui se forment par liaison du carboxyle de lAG sur le -NH2 de la sphingosine :
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Lacide gras le plus frquent est lacide lignocrique (C24:O). Au pH du sang, la molcule est ionise. On les trouve dans le tissu nerveux (graines de myline) et dans les membranes. La dficience en sphingomylinase entrane leur accumulation dans le cerveau, la rate et le foie.
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Les lipides
B.
Le galactose est uni lalcool primaire de la sphingosine par une liaison osidique
C.
Les Crbroglucides ou Glucosylcramides Ils sont constitus de : Sphingosine + AG + D Glucose La liaison est osidique. Les Gangliosides ou Oligosylcramides Ils sont constitus de : Sphingosine + AG + chane de plusieurs oses et drivs doses (NANA) (= oligoside) Ils sont abondants dans les ganglions do leur nom. Ces oligosides sont prsents sur la face externe de la membrane plasmique. Ils sont spcifiques, donc reconnus par des protines (toxines bactriennes, lectines). Exemple : antignes des groupes sanguins.
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Ils sont tous amphiphiles et organiss en bicouche lipidique. La partie hydrophile (polaire) de la molcule est la tte , la partie hydrophobe (apolaire) est la queue . Les acides gras prsents sont saturs et insaturs. Les lipides prsents dans les diffrentes classes de lipides membranaires sont faits de : Phospholipides (glycrophospholipides et sphingomylines), Cholestrol : lensemble de la structure est apolaire lexception du OH alcoolique qui est polaire. Il participe la fluidit membranaire Glycolipides : les crbroglucosides, crbrogalactosides et gangliosides sont localiss sur la face externe de la membrane plasmique
Partie Apolaire = Queue 2 AG + Glycrol (DAG) Cramide (AG + Sph.) Cramide (AG + Sph.) Totalit molcule (Sauf OH)
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Bicouche lipidique
Acides Gras : Saturs Insaturs (cis) responsables Fluidit Membranaires Cholestrol : Fluidit Membrane Phospholipides : Constituants majeurs Sphingomylines : Abondants
B.
C.
Les protines Elles sont en nombre trs variables (25 75 % de la masse membranaire) et ont des fonctions spcifiques : protines structurales, enzymes, protines de transport, rcepteurs Les glucides sont associs aux protines sous forme de glycoprotines ou aux lipides sous forme de glycolipides.
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