Metabolismo

Artculo principal:

Metabolismo microbiano

Filamento (una colonia) decianobacteria fotosinttica. En contraste con los organismos superiores, las bacterias exhiben una gran variedad de tipos metablicos.[86] La distribucin de estos tipos metablicos dentro de un grupo de bacterias se ha utilizado tradicionalmente para definir su taxonoma, pero estos rasgos no corresponden a menudo con las clasificaciones genticas modernas.[87] El metabolismo bacteriano se clasifica con base en tres criterios importantes: el origen del carbono, la fuente de energa y los donadores de electrones. Un criterio adicional para clasificar a los microorganismos que respiran es el receptor de electrones usado en la respiracin.[88] Segn la fuente de carbono, las bacterias se pueden clasificar como:

Hetertrofas, cuando usan compuestos orgnicos. Auttrofas, cuando el carbono celular se obtiene mediante la fijacin del dixido de carbono.

Las bacterias auttrofas tpicas son las cianobacterias fotosintticas, las bacterias verdes del azufre y algunas bacterias prpura. Pero hay tambin muchas otras especies quimiolitotrofas, por ejemplo, las bacterias nitrificantes y oxidantes del azufre.[89] Segn la fuente de energa, las bacterias pueden ser:

Fototrofas, cuando emplean la luz a travs de la fotosntesis. Quimiotrofas, cuando obtienen energa a partir de sustancias qumicas que son oxidadas principalmente a expensas del oxgeno (respiracin aerobia) o de otros receptores de electrones alternativos (respiracinanaerobia).

Segn los donadores de electrones, las bacterias tambin se pueden clasificar como:

Litotrofas, si utilizan como donadores de electrones compuestos inorgnicos. Organotrofas, si utilizan como donadores de electrones compuestos orgnicos.

Los organismos quimiotrofos usan donadores de electrones para la conservacin de energa (durante la respiracin aerobia, anaerobia y la fermentacin) y para las reacciones biosintticas (por ejemplo, para la fijacin del dixido de carbono), mientras que los organismos fototrofos los utilizan nicamente con propsitos biosintticos. Bacterias del hierro en un regato. Estos microorganismos quimiolitotrofos obtienen laenerga que necesitan poroxidacin del xido ferroso a xido frrico. Los organismos que respiran usan compuestos qumicos como fuente de energa, tomando electrones del sustrato reducido y transfirindolos a un receptor terminal de electrones en una reaccin redox. Esta reaccin desprende energa que se puede utilizar para sintetizar ATP y as mantener activo el metabolismo. En los organismos aerobios, el oxgeno se utiliza como receptor de electrones. En los organismos anaerobios se utilizan como receptores de electrones otros compuestos inorgnicos tales como nitratos, sulfatos o dixido de carbono. Esto conduce a que se lleven a cabo los importantes procesos biogeoqumicos de la desnitrificacin, la reduccin del sulfato y la acetognesis, respectivamente. Otra posibilidad es la fermentacin, un proceso de oxidacin incompleta, totalmente anaerbico, siendo el producto final un compuesto orgnico, que al reducirse ser el receptor final de los electrones. Ejemplos de productos de fermentacin reducidos son el lactato (en la fermentacin lctica), etanol (en la fermentacin alcohlica), hidrgeno, butirato, etc. La fermentacin es posible porque el contenido de energa de los sustratos es mayor que el de los productos, lo que permite que los organismos sinteticen ATP y mantengan activo su metabolismo.[90] [91] Los organismos anaerobios facultativos pueden elegir entre la fermentacin y diversos receptores terminales de electrones dependiendo de las condiciones ambientales en las cuales se encuentren. Las bacterias litotrofas pueden utilizar compuestos inorgnicos como fuente de energa. Los donadores de electrones inorgnicos ms comunes son el hidrgeno, el monxido de carbono, el amonaco (que conduce a la nitrificacin), el hierro ferroso y otros iones de metales reducidos, as como varios compuestos de azufre reducidos. En determinadas ocasiones, las bacterias metanotrofas pueden usar gas metano como fuente de electrones y como sustrato simultneamente, para el anabolismo del carbono.[92] En la fototrofa y quimiolitotrofa aerobias, se utiliza el oxgeno como receptor terminal de electrones, mientras que bajo condiciones anaerbicas se utilizan

compuestos inorgnicos. La mayora de los organismos litotrofos son auttrofos, mientras que los organismos organotrofos son hetertrofos. Adems de la fijacin del dixido de carbono mediante la fotosntesis, algunas bacterias tambin fijan el gas nitrgeno usando la enzima nitrogenasa. Esta caracterstica es muy importante a nivel ambiental y se puede encontrar en bacterias de casi todos los tipos metablicos enumerados anteriormente, aunque no es universal.[93] El metabolismo microbiano puede jugar un papel importante en la biorremediacin pues, por ejemplo, algunas especies pueden realizar el tratamiento de las aguas residuales y otras son capaces de degradar los hidrocarburos, sustancias txicas e incluso radiactivas. En cambio, las bacterias reductoras de sulfato son en gran parte responsables de la produccin de formas altamente txicas de mercurio (metil- y dimetilmercurio) en el ambiente.[94]

MEDIOS DIFERENCIALES
Son empleados para detectar reacciones bioqumicas, con carcter diferencial de grupos,

MEDIOS DIFERENCIALES

Son empleados para detectar reacciones bioqumicas, con carcter diferencial de grupos, gneros o especies microbianas, mediante el viraje de color del indicador presente en el medio, demostrando algunas de sus caractersticas. Estos medios son el TSI, LIA, Citrato de Simmons, SIM, Caldo reagneros o especies microbianas, mediante el viraje de color del indicador presente en el medio, demostrando algunas de sus caractersticas. Estos medios son el TSI, LIA, Citrato de Simmons, SIM, Caldo rea.

TSI ( Triple Sugar Iron)

CARAC

TERSTICAS:

COLOR: rojo ladrillo INHIBIDORES: no tiene INDICADOR: rojo fenol

SUSTRATOS PRINCIPALES: Lactosa, sacarosa y glucosa (la proporcin en el medio de lactosa y sacarosa es de 10:1 con la glucosa)

 SUSTRATOS SECUNDARIOS: tiosulfato sodico, peptona, citrato ferrico amoniacal y extractos. Se siembra por picadura profunda con aguja y luego se siembra por estria en el pico.

FUNDAMENTO: en es te medio se busca determinar la capacidad de la bacteria para degradar los azucares y la formacin de gas y de H2S. la fermentacin aerobica se produce en el pico del tubo y la anaerobica en el fondo del tubo. La degradacin de la lactosa ocurre en la parte superior, la de la sacarosa en la parte intermedia y de la glucosa en la parte profunda producindose un viraje de rojo a amarillo. El tiosulfato es reducido a H2S quien reacciona con el citrato frrico amoniacal para dar formacin a sulfuro de de fierrro que es de color negro. La presencia de gas se debe al CO2 producto de la

fermentacin.

MEDIO DE LIA (Lisina Iron Agar)

CARACTERISTICAS: FUNDAMENTO: En este medio se permite evidenciar la descarboxilacin del aminocido lisina en la diamina cadaverina, como tambin la desaminacin de la lisina en un alfa cetocido. Estas dos reacciones se ponen de manifiesto por el viraje del indicador prpura de bromocresol. La formacin de H2S se pone de manifiesto por la presencia del tiosulfato sdico, que dar formacin al sulfato frrico. Tambin puede verificarse la formacin de gas a partir de la degradacin de la glucosa. COLOR: Lila INHIBIDORES: no tiene INDICADOR: prpura de bromocresol SUSTRATOS PRINCIPALES: Lisina y glucosa SUSTRATOS SECUNDARIOS: peptona, tiosulfato de sodio, extracto de levadura. Se siembra por picadura profunda con aguja y luego por estrias en el pico.

1.- Lisina descarboxilasa positivo

2.- Descarboxilacin

positiva, H2S positivo

3.-Lisina descarboxilasa

negativa

4.- Lisina desaminasa positivo

CITRATO SEGN SIMMONS

CARACTERSTICAS:

COLOR: verde INHIBIDOR: no tiene INDICADOR: azul de bromocresol SUSTRATO PRINCIPAL: citrato de sodio

SUSTRATO SECUNDARIOS:fosfato dipotasico, cloruro de sodio, sulfato de magnesio y fosfato monoamonico. FUNDAMENTO: Nos permite comprobas la capsidad de la basteria de utilisar el citrato como unica fuente carbono. La degradacion del citrato conlleva a la alcalinizacion del medio y el viraje del indicador azul de bromotimol de verde a azul prusia. Con este medio podemos diferenciar entre las coliformes fecales y Citrobacter como algunas especies de Salmonella. Se siembra por estrias.

1.- Citrato positivo

2.-

Citrato negativo

MEDIO SIM (Sulfuro-Indol-Motilidad)

CARACTERSTICAS: COLOR: Crema INDICADOR: No tiene INHIBIDOR: No tiene SUSTRATO PRINCIPAL: Peptona SUSTRATO SECUNDARIO: Tiosulfato sodico, Hierro y amanio

Este medio se utiliza para comprobar la motilidad, formacin de H2S y la produccin de indol por parte de la bacteria Se siembre por picadura

FUNDAMENTO: MOTILIDAD

HIDROGENO SULFURADO: Aqu se estudia el metabolismo de la cisteina que posee dos molculas de asufre(S) que sern liberados como H2S por accin de la cisteinasa y con la presencia de sales ferrosas formaran S2Fe que le dar un precipitado de color negro.

INDOL: para la demostracion de indol de usa el reactivo de Kobacs, que manifiesta la degradacion del triptofano por la enzima triptofanasa en indol, que se combina con el aldehido(paradimetilbenzaldehido) presente en el reactivo de Kobacs, para producir un color rojo

CALDO REA
CARACTERISTICAS: COLOR: Rosado INDICADOR: rojo fenol

INHIBIDOR: no tiene SUSTRATO PRINCIPAL: urea

SUSTRATO SECUNDARIO: extracto de levadura, fosfato monopotasico y fosfato dipotasico. Este medio no se autoclava.

FUNDAMENTO: Se observa la capacidad de la bacteria de degradar la urea por medio de la enzima ureasa formando amoniaco y carbonato de aminio, que alcaliniza el medio por lo cual el rojo de fenol vira a un rojo cereza.

1.- Urea positivo

2.- Urea

Negativa

Prueba de la Movilidad Sirve para determinar si un organismo es mvil o inmvil. Las bacterias tienen movilidad por medio de sus flagelos que se encuentran principalmente entre los bacilos aunque existen algunas formas de cocos mviles. El medio manitol movilidad permite la realizacin de esta prueba gracias a ser semislido ya que presenta solamente 3,5 g/l de agar. En estas condiciones, las bacterias

mviles producirn un enturbiamiento homogneo del medio debido a la distribucin aleatoria de los microorganismos. Por el contrario, las bacterias inmviles permanecern en la misma lnea de la picadura en que se sembraron. Entre las enterobacterias, la movilidad nos permite diferenciar el gnero Klebsiella (-) de las restantes que suelen ser movilidad (+). Dentro del gnero Bacillus, nos permite diferenciar B.anthracis (-) de otras especies generalmente (+).