SIMPLOT

Nama Kelompok :
Ade Ayu G (111810401009)
Eriani Eleganty (111810401007)
Kiki Ikromatus Z. (1118104010
Nidaul Hikmah (111810401039)
Suci Ummi (111810401027)

Software Simplot
Suatu software yang digunakan untuk mendeteksi
rekombinasi virus.

Pada proses analisis diperlukan sequen dari virus
yang akan dianalisa dan virus yang diduga
menjadi lawan rekombinasi.

Analisa dapat dilakukan pada sequen DNA
maupun asam aminonya. Akan tetapi, dengan
SimPlot ini hanya bisa dianalisa sekuen yang
panjangnya sama.
Pada prinsipnya SimPlot membandingkan
kesamaan (kemiripan) sekuen gen dari
masing-masing virus.
Melalui software SimPlot dapat diprediksi
titik/kawasan/bagian yang ada kemungkinan
terjadinya rekombinasi.
Klik file pilih open untuk memiliki sequen DNA yang akan
dipakai


Klik new Group hingga menampilkan kotak sequen baru, klik
Select All kemudian klik use character prior

Pada kotak Query diisi dengan sequen yang akan dianalisis

Kemungkinan rekombinasi dapat teridentifikasi dengan gambar yaitu berupa grafik
yang menunjukkan sequens yang saling crossing over atau menyilang pada menu
SimPlot