Bactries

Cocci Gram positif

y y y y y

Cocci Gram ngatif

y y y

Staphylococcus aureus Streptococcus pyogenes Streptococcus agalactiae Streptococcus pneumoniae Enterococcus sp.
Bacilles Gram positif

Neisseria meningitidis Neisseria gonorrhoeae Branhamella catarrhalis

Bacilles Gram ngatif

y y y y y

Listeria monocytogenes Corynebacterium sp.

y y y y y

Entrobactries Pseudomonas aeruginosa Haemophilus influenzae Legionella pneumophila Campylobacter sp. Helicobacter pylori Bordetella pertussis Bartonella henselae
Cocci anarobies

Actinomyctes arobies
y y

Nocardia sp. Mycobacterium tuberculosis

Bacilles Gram positif anarobies Bacilles Gram ngatif anarobies

Clostridium sp.
Intracellulaires stricts Mollicutes
y

y y y

Chlamydia trachomatis Chlamydophila pneumoniae Chlamydophila psittaci

Mycoplasma - Ureaplasma

Cocci Gram positif

Cocci Gram ngatif

Bacilles Gram positif

Bacilles Gram ngatif

Actinomyctes arobies

Cocci anarobies

Bacilles Gram positif anarobies

Bacilles Gram ngatif anarobies

1-Cocci Gram positif

1- Staphylococcus aureus
- Prlvements cutans (lsions suppures : furoncles, panaris, imptigo ) - Prlvements urinaires (cystites, prostatites) - Prlvements vaginaux (cervicites, salpingites ) - Prlvements oculaires (infections orbitaires) - Prlvements ORL (sinusites, amygdalites, otites ) - Prlvements broncho-pulmonaires (pneumopathies ) - Prlvements osto-articulaires (ostites, ostomylites ) - Hmocultures (septicmies, endocardites )
d

- Glose au sang : prsence de colonies -hmolytiques, souvent de couleur jaune orange - Glose au sang + antibiotiques (Ac. nalidixique, Colistine, Aztronam ) si prlvement polymicrobien - Milieu de Chapman (milieu slectif hypersal) : prsence de colonies jaunes (utilisation du mannitol) - Milieu de Baird Parker : prsence de colonies noires (rduction du tellurite en tellure) - Milieu chromogne
d

- Cocci Gram + isols, en diplocoques ou en amas - Catalase positive - Dtection de la coagulase libre - Dtection de la DNAse thermostable - Dtection de la protine A, du clumping factor
d

- Anticorps anti-staphylolysine (ASL) : diagnostic dinfection profonde S. aureus - Recherche de la leucocidine de Panton-Valentine (PVL) : rle dans les infections cutanes et les pneumonies ncrosantes (un phnotype de rsistance Mti-R, Kanamycine R, Ac. fusidique R voire Ttracycline R est souvent associ la prsence dune PVL)

2- Streptococcus pyogenes
- Prlvements de gorge (diagnostic dangine rythmateuse ou rythmato-pultace) - Prlvements cutans (rysiple, dermo-hypodermite ncrosante, scarlatine, imptigo ) - Prlvements vaginaux (fivre puerprale ) - Hmocultures (septicmie, endocardite )
d

- Glose au sang sous CO2 +/- en anarobie (espce anarobie qui tolre larobiose) - Glose au sang + antibiotiques (Ac. nalidixique, Colistine, Aztronam ) si prlvement polymicrobien prsence de colonies -hmolytiques
d

- Cocci Gram + en chanette - Catalase ngative - Typage de lantigne polysaccharidique de paroi : groupe A de Lancefield - Galerie didentification
d

- Anticorps anti-streptolysine O (ASLO), anticorps anti-streptodornase B (ASD) : utiliss pour le diagnostic rtrospectif dinfection strepto A lors de rhumatisme articulaire aigu, glomrulonphrite aigu

3- Streptococcus agalactiae
- Prlvements vaginaux (dpistage entre 34-38 SA, 10-30% de portage : Amoxicilline lors de laccouchement)- LCR : mningite chez le nouveau n - ECBU : responsable dinfection urinaire (attention aux contaminations par les scrtions vaginales) - Prlvements cutans
d

- Glose au sang sous CO2 +/- en anarobie (espce anarobie qui tolre larobiose) - Glose au sang + antibiotiques (Ac. nalidixique, Colistine, Aztronam ) si prlvement polymicrobien prsence de colonies -hmolytiques (trs faible hmolyse) - Glose Granada (en anarobie, lecture 48H) : prsence de colonies oranges spcifiques de S. agalactiae
d

- Cocci Gram + en chanettes - Catalase ngative - Typage de lantigne polysaccharidique de paroi : groupe B de Lancefield - Galerie didentification Diagnostic diffrentiel : S. porcinus (PV ou nouveau n, -hmolytique (large zone dhmolyse), groupe en B mais esculine +, mannitol +, sorbitol + (contrairement S. agalactiae)
d

Camp test + Hippurate +

4- Streptococcus pneumoniae
- Prlvements ORL : portage au niveau du rhinopharynx, responsable dotite et de sinusite - Prlvements broncho-pulmonaires : responsable de pneumonie (voir broncho-pneumonie) - LCR : mningite chez ladulte - Hmocultures : septicmie
d

- Glose au sang sous CO2 +/- en anarobie (espce anarobie qui tolre larobiose) : prsence de colonies -hmolytiques en atmosphre ordinaire (mais pouvant tre -hmolytiques en anarobie) Colonies +/- muqueuses en fonction du type de colonies (R ou S) et de la taille de la capsule Phnomne dautolyse qui donne un aspect en roue de vlo (prsence dun ombilic au centre de la colonie)
d

- Cocci Gram + en diplocoques - Catalase ngative - Agglutination des antignes capsulaires - Sensible loptochine (contrairement aux autres streptocoques -hmolytiques) - Lyse par la bile
d

- Mise en vidence de la capsule avec de lencre de chine - Recherche d'antignes du pneumocoque dans les urines ou le LCR

5- Enterococcus sp.
- Prlvements urinaires - Prlvements pri-abdominaux : infections abdominales dorigine intestinale - Hmocultures : septicmie, endocardites
d

- Glose au sang sous CO2 +/- en anarobie (espce anarobie qui tolre larobiose) Ajout dantibiotique si prlvement polymicrobien (Ac. nalidixique, colistine, aztronam ) - Glose lesculine (enterococcosel) : prsence de colonies noires - Milieu au tellurite : rsistance au tllurite de potassium pour E. faecalis
d

- Cocci gram + en chanette, immobile (sauf E. casseliflavus, E. gallinarum, E. flavescens) - Catalase ngative - Typage de lantigne polysaccharide de paroi : groupe D de Lancefield (parfois non groupables) - Esculine + - PYRA + (pyrrolidonyl arylamidase)
d

- Recherche de bactries multi-rsistantes : entrocoques rsistant la vancomycine (milieu enterococcosel + vancomycine) : attention certains entrocoques sont naturellement rsistants la vancomycine (E. gallinarum, E. casseliflavus et E. flavescens qui sont des espces mobiles vrifier la mobilit)

2-Cocci Gram ngatif

1- Neisseria sp.
- Prlvements ano-gnitaux : N. gonorrhoeae - Prlvements oculaires : N. gonorrhoeae - LCR : N. meningitidis - Hmocultures : plutt N. meningitidis (si purpura fulminans associ : prlvements cutans) - Osto-articulaires : ostomylite, arthrite (rares et plutt N. meningitidis) - Rhinopharynx : 5-15% de portage de N. meningitidis
d

- Milieux enrichis car germes exigeants : glose au sang ou mieux glose chocolat, sous CO2 (arobie stricte) - Milieux slectifs pour la recherche de gonocoque : glose chocolat VCAT (Vancomycine, Colistine, Amphotricine B, Trimthoprime) Le gonocoque ne rsiste pas des tempratures dpassant 37C
d

- Diplocoques Gram ngatif arobies stricte - Catalase + - Oxydase + - Maltose + pour le mningocoque, ngatif pour le gonocoque
d

- Srogroupage du polysaccharide capsulaire des souches de mningocoque : B (60%), C (40%), A, Y, W135 - Recherche dantignes solubles du mningocoque dans le sang, les urines ou le LCR - PCR

Branhamella catarrhalis
Flore commensale du nez et du rhinopharynx - Prlvements ORL : bronchites, laryngites, otites, sinusites, rhinopharyngites - Prlvements oculaires : conjonctivites - LBA : pneumonies - LCR, liquides articulaires, hmocultures : exceptionnelles cas de septicmies, de mningites ou darthrites
d

- Milieux enrichis : glose au sang ou glose chocolat sous 5% de CO2 (arobie stricte) - Milieux slectifs : glose chocolat VCAT (Vancomycine, Colistine, Amphotricine B, Trimthoprime)
d

- Diplocoques Gram ngatif arobies stricte - Catalase + - Oxydase + - Nitrate rductase +, DNAse +, test la Tributyrine + - Saccharose (contrairement aux Neisseria)
d

- Test chromognique pour la recherche de bta-lactamase (90%) : BRO-1 et BRO-2 (profil de rsistance : Ampicilline, Ticarcilline, Piperacilline, C1G voire C2G)

3-Bacilles Gram positif

1- Listeria monocytogenes
- Liquide amniotique, membrane placentaire, liquide gastrique du nouveau-n : contamination materno-f tale transplacentaire - LCR : mningite chez lenfant de plus de 5 j et chez ladulte g ou immunodprim - Hmocultures : septicmie (chez lenfant de moins de2 j et chez ladulte g ou immunodprim)
d

- Glose ordinaire ou glose au sang : microarophile, pousse de 4 42C (psychrophile), zone troite de -hmolyse Ajout dantibiotiques si prlvement polymicrobien (Ac. nalidixique, Colistine, Aztronam ) - Glose hypersale (Chapman), glose ANC
d

- Petits bacilles Gram +, mobiles 25C (immobiles 37C) - Catalase positive - Esculine + rapide (<2H) - Agglutination des antignes flagellaires (H) et somatiques (O)
d

- Camp test positif - Diagnostic diffrentiel : Entrocoques, S. agalactiae (catalase), Corynbactries (esculine), Erysipelothrix

2- Corynebacterium sp.
Flore normale saprophyte de la peau et des muqueuses 3 espces pathognes : - C. diphtheriae - C. ulcerans (pharyngite diphtriforme, abcs) - Arcanobacterium haemolyticum (pharyngite avec rash cutan, abcs, endocardite) Pour les autres espces : il faut que le germe soit abondant lexamen direct et en culture, quil y ait une raction leucocytaire et inflammatoire, quil y ait des signes cliniques - C. jeikeium : septicmie, mningite, endocardite - C. urealyticum : infection urinaire, endocardite - C. pseudodiphtericum : trachite, abcs pulmonaire, endocardite - C. pseudotuberculosis : lymphadnite, pneumopathie - C. macginleyi : infection oculaire - C. glucuronolyticum / seminale : urtrite, prostatite - C. minutissimum, C. riegelii, C. renale : infection urinaire - Turicella otitidis : otite moyenne aigu
d

- Glose ordinaire ou glose au sang - Certaines espces sont lipophiles (adjonction de Tween 80) - Glose slective par ajout de Fosfomycine - Atmosphre enrichie en CO2 - C. diphtheriae : glose au sang, milieu de Loeffler ou milieux spcifiques (cystine-tellurite, milieu de Tinsdale : colonies noires + halo noir)
d

- Bacilles Gram + en massue, palissade, alphabet - Critres d'identification d'espce : lipophilie, esculine, urase, nitrate rductase
d

- Recherche de la toxine diphtrique : ELISA, dtection du gne tox

4-Bacilles Gram ngatif

1- Entrobactries
- Prlvements urinaires : E. coli (80% des cystites), P. mirabilis, Klebsiella spp. - Coprocultures : Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia spp., E. coli - Prlvements broncho-pulmonaires : K. pneumoniae - LCR : mningite nonatale : E. coli K1 - Hmocultures : septicmie,
d

- Milieu ordinaire ou glose au sang - Gloses slectives (prsence de sels biliaires qui inhibent les Gram +) : Hekton, Mac Conkey, Drigalski, SS
d

- Bacilles Gram ngatif gnralement mobiles (sauf Klebsiella, Shigella et Yersinia 37C) - Oxydase ngative, nitrate rductase + (bandelettes urinaires) - Fermentation du lactose : frquemment tudie sur glose (Hekton, Drigalski, Mac Conkey, SS, BCP) Escherichia, Citrobacter, Enterobacter, Klebsiella - H2S : rduction du thiosulfate en H2S qui ragit avec le citrate de fer pour donner du sulfure de fer (noir sur Hekton, SS) surtout les salmonelles - Urase : mise en vidence de lalcalinisation dun milieu ure tryptophane par libration dammoniac Klebsiella, Proteus, Yersinia
d

- Typage antignique O, H et K : - E.coli (E.coli O157 H7 (sorbitol ngatif sur milieu MacConkey-sorbitol), E.coli K1 chez les nouveaux ns) - Salmonelles, Shigelles - Srologie : - Salmonelles : agglutinines O et H pour le diagnostic de la fivre typhode - Yersinia (enterocolitica et pseudotuberculosis) : diagnostic des rythmes noueux, polyarthrites - Shigelles

2- Pseudomonas aeruginosa
Germe opportuniste : infection des sujets immunodprims - Prlvements ORL : otite - Prlvements ophtalmo - Prlvements broncho-pulmonaires : pneumopathie, colonisation des sujets atteints de mucoviscidose - Prlvements urinaires : infections urinaires nosocomiales - Prlvements cutans : surinfection de plaies - Hmocultures : septicmie, endocardite
d

- Milieu ordinaire ou glose au sang - Gloses slectives (prsence de sels biliaires qui inhibent les gram +) : Hekton, Mac Conkey, Drigalski, SS - Glose au Ctrimide : glose slective qui favorise la pigmentation de P. aeruginosa - Milieux King A et King B favorisant la production des pigments du P. aeruginosa (pyocyanine sur le milieu King A et pyoverdine sur le milieu King B) (10% des souches sont non pigmentes et certaines souches produisent un pigment rouge : la pyorubrine ) - Odeur de seringa
d

- Bacilles Gram ngatif mobiles, arobies stricts - Oxydase +, catalase + - Dnitrification ou respiration de lazote : prsence dune nitrate rductase et dune nitrite rductase
d

- Srologie (Ac anti-protase, Ac anti-lastase, Ac anti-exotoxine A) permettrait de diffrencier une infection chronique dune colonisation occasionnelle chez les patients atteints de mucoviscidose

3- Haemophilus influenzae
- ORL : commensal de loropharynx et du nasopharynx mais peut tre responsable de laryngites, pharyngites, sinusites, otites, piglottites - Oculaires : conjonctivites - Hmoculture : septicmies - LCR : mningites purulentes - Liquide articulaire : arthrites, osto-mylites - LBA, aspiration bronchique : pneumonies, exacerbation de bronchites chroniques - Prlvements gnitaux : peut tre responsable de prostatites, urtrites, vaginites, infections nonatales
d

- Exigeant : pousse uniquement sur glose chocolat (ncessite du facteur X (hmine) et V (NAD)) sous CO2 - Glose 4 cadrans (4 cadrans : X+V, X, V et aucun facteur) ou utilisation de disques contenant X, V, ou X+V) - Glose chocolat slective par ajout dantibiotiques : Bacitracine, Vancomycine, Amphotricine B
d

- Petits bacilles Gram ngatif, immobiles, parfois capsuls - Catalase + Oxydase + - Test au delta-ALA : absence de coloration rouge si H. influenzae
d

- Phnomne de satellitisme : dveloppement de colonies dH. influenzae proximit dune strie de S. aureus sur glose au sang (S. aureus apporte le facteur V) - Recherche de lantigne capsulaire dans le LCR, le srum ou les urines - Recherche de la production de pnicillinase (Cfinase)

4- Legionella pneumophila
- Crachat, aspiration bronchique, LBA : infection pulmonaire aigu - Prlvement deau : contamination par inhalation de micro-gouttelettes (arosol) - Exceptionnellement sang, liquide articulaire, pricardique
d

- Milieux spciaux contenant de la cystine : BCYE, ventuellement slectif par lajout dantibiotiques (BMPA, GVPC) sous faible concentration de CO2 (2.5%) - Culture lente : 3-10j - Aspect de verre fritt la loupe binoculaire
d

- Bacilles Gram ngatif, mobiles, arobies stricts - Catalase faiblement positive - Oxydase + - Typage du srogroupe par agglutination
d

- Recherche dantignes urinaires : dtection dantigne spcifique de L. pneumophila srogroupe 1 (80% des infections) excrtion prcoce (2-3j suivant les signes cliniques) et longue (2-12mois) et non influence par lantibiothrapie - Srologie : multiplication du titre par 4 entre 2 srums prlevs 3 semaines dintervalle (diagnostic rtrospectif) - Enqute pidmiologique

5- Campylobacter sp.
- Coproculture : plutt Campylobacter jejuni (responsable dentrites : contamination par la volaille et le lait cru)- Hemocultures : plutt Campylobacter fetus (bactrimie et localisations secondaires surtout chez limmunodprim) - Campylobacter coli : environ 10 % des Campylobacter isols dans le sang ou les selles (contamination surtout par le porc)
d

- Milieux de culture enrichis et slectifs (ex : Vancomycine, Polymyxine B, Trimthoprime, Amphotricine B), en microarophilie (5% O2) Karmali, Skirrow, Campylosel - Temprature de culture : 42C pour C. jejuni, 37C pour C. fetus
d

- Bactries spirales (ou incurves) Gram ngatif, trs mobiles - Oxydase + - Catalase + - Hippurate + uniquement pour C. jejuni - Sensibilit la Cfalotine et lAcide nalidixique : C. jejuni : CF : R, AN : S / C. fetus : CF : S AN : R
d

- Srologie : C. jejuni peut tre responsable d'un syndrome de Guillain-Barr (env. 3 sem aprs lentrite)

6- Helicobacter pylori
Biopsie gastrique : responsable de gastrite pouvant voluer vers lulcre gastrique et le carcinome gastrique
d

- Glose enrichie et slective, en microarophilie (10% CO 2) - Pousse lente (examiner les botes tous les 4 jours pendant 15 jours)
d

- Bactries spirales (ou incurves) Gram ngatif, mobiles, microarophiles - Catalase + - Oxydase + - Urase +++ (test lure indole directement sur la biopsie ou test respiratoire lure radiomarque)
d

- Srologie (ELISA, Western Blot) - Dtection dantignes dans les selles - Test respiratoire : ingestion dure marque au carbone 13 (ou 12) et mesure de CO2 marqu expir - Endoscopie et biopsie gastrique - PCR et squenage

7- Bordetella pertussis
Agent pathogne strictement humain responsable de la coqueluche - Crachat, aspiration bronchique - Ecouvillonnage rhinopharyng
d

Bactrie fragile (ensemencer le prlvement rapidement) et exigeante (milieux spciaux) - Milieu additionn de sang frais (cheval, mouton, lapin) : milieu de Bordet et Gengou - Milieu au charbon Atmosphre arobie stricte, pousse en 3-6j Petites colonies en gouttelettes de mercure sentourant dune zone dhmolyse
d

- Petit bacille Gram ngatif (coccobacille), immobile, capsul - Catalase positive - Oxydase positive
d

- Le diagnostic est principalement ralis par PCR - Srologie : Ac anti-toxine pertussique, Ac anti-adnylcyclase - NFS : hyperlymphocytose

8- Bartonella henselae
Transmission principalement par contact avec un chat (griffure, morsure ) - Maladie typique : fivre, lsions cutanes, adnopathies satellites (cervicales, axillaires) - Formes svres : hpatite, syndrome oculo-glandulaire de Parinaud, rtinite, complications neurologiques - Autres formes : endocardite infectieuse, angiomatose ou pliose bacillaire - Prlvements : ponction dadnopathie, biopsie cutane, hmoculture - Diagnostic principalement srologique
d

- Glose au sang frais, BCYE - Culture difficile, pousse lente (2-4 semaines) - Atmosphre humide enrichie en CO2 (5%), 37C
d

- Petit bacille gram ngatif - Catalase - Oxydase

d

- Srologie Bartonella : on dispose dAg +/- spcifiques de B. quintana et de B. henselae

5-Actinomyctes arobies

1- Nocardia sp.
Germe opportuniste (corticothrapie, chimiothrapie, cancer, SIDA, greff ) - Prlvements pulmonaires : crachats, LBA (toux, dyspne, volution subaigu) - Prlvements cutans : myctome : nodule non douloureux qui devient inflammatoire et purulent - Ponction de pus et dabcs crbraux : cphales, nauses, vomissements, dficits sensitif ou moteur (la bactrie est rarement retrouve dans le LCR)
d

- Non exigeant (glose ordinaire, glose au sang, glose chocolat, BCYE, Sabouraud, Lowenstein-Jensen ) - En arobiose 5 10% de CO2 - Pousse gnralement en 3-7j - Colonies blanches ou pigmentes (jaune, rose, orange, rouge, gris, brun, pourpre) souvent incrustes dans la glose - Aspect crbriforme (parfois duveteux : prsence dhyphes ariens visibles au microscope)
d

- Bacilles Gram + (prend mal le Gram : apparat en pointills) ou gnralement acido-alcoolo rsistants la coloration de Ziehl-Neelsen modifie - Aspect de filaments ramifis - Catalase +, nitrate-rductase +, -galactosidase +, urase souvent +
d

- Squenage de lARN 16S, du gne hsp65

2- Mycobacterium tuberculosis
- Prlvements de crachats (3 jours de suite, le matin au rveil (voire tubage gastrique)), aspirations bronchiques, LBA pour les formes pulmonaires : caverne tuberculeuse (voire miliaire tuberculeuse) - LCR, liquide pleural, hmoculture, liquide articulaire, urine pour les autres localisations : miliaire (septicmie tuberculeuse), mningo-encphalite, atteintes gnito-urinaires, ostoarticulaires (Mal de Pott), cutanes - On utilise des techniques de fluidification (crachats), de dcontamination (crachats, urines ) et de concentration par centrifugation
d

- Milieux spciaux : - milieux solides : Lowenstein-Jensen ou Coletsos ( uf coagul) - milieux liquides : MGIT, MB-redox, 7H9 - Atmosphre arobie humide sous 10% de CO2 - Culture lente : 2-4 semaines (les milieux sont gards environ 3 mois) - Colonies rugueuses en chou fleur, de couleur crme
d

Bacilles acido-alcoolo rsistants (BAAR) la coloration de Ziehl-Neelsen (prend mal le Gram, mais structure de Gram +) Bacilles fluorescents aprs coloration lauramine (ou lacridine orange) Nitrate rductase + Niacine + (production dacide nicotinique)
d

- Antibiogramme en milieu liquide par la mthode des proportions - Identification despce et de certaines rsistances (Rifampicine, Pyrazinamide ) par mthode gnotypique : amplification par PCR puis hybridation ou squenage - IDR la tuberculine : met en vidence une hypersensibilit retarde - Quantifron : dosage de linterfron aprs stimulation lymphocytaire par des Ag spcifiques de M. tuberculosis, mais qui sont absents du vaccin BCG (diagnostic de tuberculose active, latente ou traite rcemment) - T-SPOT-TB : test ELISPOT permettant la dtection de la production dIFN

6-Bacilles Gram positif anarobies

1- Clostridium sp.
- C. difficile : coproculture colite pseudo-membraneuse ou de diarrhe post-antibiothrapie (attention : portage chez 3% de la population et 50-70% des enfants de moins de 2 ans) - C. perfringens : infections des plaies, septicmies, pneumonies ncrosantes, entrocolites, cholecystites - C. botulinum, C. tetani : laboratoires spcialiss
d

Glose au sang en anarobiose - C. difficile : milieux enrichis et slectifs tels que CCFA (Cyclosrine, Cfoxitine, Fructose, jaune d uf) taurocholate de sodium (favorise la formation de spores), en anarobie stricte colonies bords irrguliers, non hmolytiques, odeur caractristique de crottin de cheval - C. perfringens : milieu TGY (double hmolyse) ou milieu TSN (Nomycine, Polymyxine, citrate de fer)
d

- C. difficile : gros bacille Gram +, anarobie strict, mobile et sporul (spore sub-terminale, ovale, dformante) - C. perfringens : gros bacille Gram + immobile, non sporul, capsul - Catalase
d

- C. difficile : - Recherche des toxine A (entrotoxine) et B (cytotoxine) sur les selles (voire sur la culture) : ELISA, Immunochromatographie, PCR - Recherche dantigne dans les selles (glutamate dshydrognase) - Endoscopie - Typage phnotypique ou gnotypique - Moxifloxacine R et Erythromycine R orientent vers les souches O27 hypertoxinognes

7-Intracellulaires stricts

1- Chlamydia trachomatis, Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila psittaci

- Chlamydia trachomatis : 1er agent bactrien responsable dIST, 70% des strilits tubaires - srovars A, B, Ba et C : responsables du trachome (kratoconjonctivite chronique contagieuse) - srovars D, Da, E, F, G, H, I, Ia, J et K : responsables dIST prlvement endocervical sous spculum lcouvillon ou, chez lhomme, prlvement urtral ou 1er jet durine - srovars L1, L2, L2a, L3 : responsables de la lymphogranulomatose vnrienne ou Maladie de Nicolas et Favre (maladie systmique avec atteinte ganglionnaire et lymphatique) - Chlamydophila pneumoniae : pneumopathie atypique communautaire, pharyngite, bronchite - Chlamydophila psittaci : pneumopathie (psittacose, ornithose : transmises par les oiseaux)
d

- Germes intracellulaires donc culture cellulaire rserve des centres spcialiss

d

- Chlamydia trachomatis : - la technique de choix est la PCR - techniques dimmunofluorescence directe - Chlamydophila pneumoniae et C. psittaci : - techniques de PCR
d

- Chlamydia trachomatis : la srologie peut aider au diagnostic des infections gnitales hautes, des pneumopathies du nouveau-n ou des lymphogranulomatoses vnriennes - Chlamydophila pneumoniae et psittaci : la srologie peut tre utile au diagnostic mais est dinterprtation difficile (prvalence leve de C. pneumoniae et ractions croises avec les autres Chlamydia).

8-Mollicutes

Mycoplasma - Ureaplasma
- Prlvements ORL et broncho-pulmonaires : M. pneumoniae (enfant > 5ans et adulte jeune) : pneumonie atypique, trachobronchite - Prlvements gnitaux : urtrite non gonococcique (Ureaplasma sp.), salpingite, abcs des glandes de Bartholin (M. hominis), infections per-partum : chorioamniotite, endomtrite (M. hominis, Ureaplasma sp.) - Prlvements nonataux : infection des grands prmaturs (M. hominis, Ureaplasma sp.) - M. hominis et Ureaplasma sp. : infections extragnitales chez limmunodprim (arthrites )
d

- M. pneumoniae : culture difficile et longue (2-3 semaines) diagnostic par PCR - M. hominis et Ureaplasma sp. peuvent tre cultivs en milieu liquide contenant de lure ou de larginine et un indicateur color
d

- Germes polymorphes, non colorables au Gram

Prlvement M. pneumoniae M. genitalium M. hominis U. urealyticum
d

Glucose + + -

Arginine + -

Ure +

Respiratoire
Gnital Gnital Gnital

- Srologies et PCR pour M. pneumoniae - Antibiogramme pour M. hominis et Ureaplasma sp. : (rsistance naturelle : -lactamines, Rifampicine, Sulfamides, Trimthoprime, Acide nalidixique) : on teste les MLS, les Cyclines et les Fluoroquinolones