Bactéries

Cocci Gram positif
y y y y y

Cocci Gram négatif
y y y

Staphylococcus aureus Streptococcus pyogenes Streptococcus agalactiae Streptococcus pneumoniae Enterococcus sp.
Bacilles Gram positif

Neisseria meningitidis Neisseria gonorrhoeae Branhamella catarrhalis
Bacilles Gram négatif

y y y y y

Listeria monocytogenes Corynebacterium sp.

y y y y y

Entérobactéries Pseudomonas aeruginosa Haemophilus influenzae Legionella pneumophila Campylobacter sp. Helicobacter pylori Bordetella pertussis Bartonella henselae
Cocci anaérobies

Actinomycètes aérobies
y y

Nocardia sp. Mycobacterium tuberculosis
Bacilles Gram positif anaérobies Bacilles Gram négatif anaérobies

y

Clostridium sp.
Intracellulaires stricts Mollicutes
y

y y y

Chlamydia trachomatis Chlamydophila pneumoniae Chlamydophila psittaci

Mycoplasma - Ureaplasma

Cocci Gram positif

Cocci Gram négatif

Bacilles Gram positif Bacilles Gram négatif .

Actinomycètes aérobies Cocci anaérobies .

Bacilles Gram positif anaérobies Bacilles Gram négatif anaérobies .

en diplocoques ou en amas . ostéomyélites «) .Détection de la protéine A. Aztréonam «) si prélèvement polymicrobien . amygdalites. du clumping factor « d .Staphylococcus aureus . endocardites «) d .Milieu de Chapman (milieu sélectif hypersalé) : présence de colonies jaunes (utilisation du mannitol) .1-Cocci Gram positif 1.Détection de la DNAse thermostable . panaris.Milieu chromogène d .Milieu de Baird Parker : présence de colonies noires (réduction du tellurite en tellure) .Prélèvements ORL (sinusites. nalidixique.Prélèvements ostéo-articulaires (ostéites. salpingites «) .Hémocultures (septicémies.Prélèvements urinaires (cystites.Anticorps anti-staphylolysine (ASL) : diagnostic d¶infection profonde à S. Colistine.Prélèvements oculaires (infections orbitaires) .Recherche de la leucocidine de Panton-Valentine (PVL) : rôle dans les infections cutanées et les pneumonies nécrosantes (un phénotype de résistance Méti-R.Catalase positive .Prélèvements broncho-pulmonaires (pneumopathies «) .Détection de la coagulase libre .Cocci Gram + isolés. otites «) . Ac. Kanamycine R.Prélèvements vaginaux (cervicites. souvent de couleur jaune orangée .Prélèvements cutanés (lésions suppurées : furoncles. impétigo « ) . fusidique R voire Tétracycline R est souvent associé à la présence d¶une PVL) . prostatites) .Gélose au sang + antibiotiques (Ac.Gélose au sang : présence de colonies -hémolytiques. aureus .

en anaérobie (espèce anaérobie qui tolère l¶aérobiose) .Gélose au sang + antibiotiques (Ac.Gélose au sang sous CO2 +/.Galerie d¶identification d . nalidixique. impétigo «) .2.Prélèvements vaginaux (fièvre puerpérale «) .Cocci Gram + en chaînette . dermo-hypodermite nécrosante.Hémocultures (septicémie.Typage de l¶antigène polysaccharidique de paroi : groupe A de Lancefield . glomérulonéphrite aiguë « .Prélèvements cutanés (érysipèle.Anticorps anti-streptolysine O (ASLO). Colistine. anticorps anti-streptodornase B (ASD) : utilisés pour le diagnostic rétrospectif d¶infection à strepto A lors de rhumatisme articulaire aigu. Aztréonam «) si prélèvement polymicrobien présence de colonies -hémolytiques d .Catalase négative .Streptococcus pyogenes . endocardite «) d . scarlatine.Prélèvements de gorge (diagnostic d¶angine érythémateuse ou érythémato-pultacée) .

LCR : méningite chez le nouveau né . Colistine. agalactiae d . lecture à 48H) : présence de colonies oranges spécifiques de S.Prélèvements cutanés d . Aztréonam «) si prélèvement polymicrobien présence de colonies -hémolytiques (très faible hémolyse) . 10-30% de portage : Amoxicilline lors de l¶accouchement). nalidixique.Cocci Gram + en chaînettes . porcinus (PV ou nouveau né.3.Galerie d¶identification Diagnostic différentiel : S. sorbitol + (contrairement à S.Gélose au sang + antibiotiques (Ac. groupe en B mais esculine +.Catalase négative .ECBU : responsable d¶infection urinaire (attention aux contaminations par les sécrétions vaginales) . agalactiae) d Camp test + Hippurate + .Streptococcus agalactiae .Typage de l¶antigène polysaccharidique de paroi : groupe B de Lancefield . mannitol +.Gélose Granada (en anaérobie.en anaérobie (espèce anaérobie qui tolère l¶aérobiose) .Prélèvements vaginaux (dépistage entre 34-38 SA.Gélose au sang sous CO2 +/. -hémolytique (large zone d¶hémolyse).

Streptococcus pneumoniae .4.Recherche d'antigènes du pneumocoque dans les urines ou le LCR .Catalase négative .LCR : méningite chez l¶adulte .en anaérobie (espèce anaérobie qui tolère l¶aérobiose) : présence de colonies -hémolytiques en atmosphère ordinaire (mais pouvant être -hémolytiques en anaérobie) Colonies +/.Mise en évidence de la capsule avec de l¶encre de chine .Hémocultures : septicémie d .Lyse par la bile d .Prélèvements broncho-pulmonaires : responsable de pneumonie (voir broncho-pneumonie) .Prélèvements ORL : portage au niveau du rhinopharynx. responsable d¶otite et de sinusite .muqueuses en fonction du type de colonies (R ou S) et de la taille de la capsule Phénomène d¶autolyse qui donne un aspect en roue de vélo (présence d¶un ombilic au centre de la colonie) d .Agglutination des antigènes capsulaires .Cocci Gram + en diplocoques .Sensible à l¶optochine (contrairement aux autres streptocoques -hémolytiques) .Gélose au sang sous CO2 +/.

E.Gélose à l¶esculine (enterococcosel) : présence de colonies noires . nalidixique.en anaérobie (espèce anaérobie qui tolère l¶aérobiose) Ajout d¶antibiotique si prélèvement polymicrobien (Ac. faecalis d .Cocci gram + en chaînette. colistine. endocardites « d . E. casseliflavus et E.Milieu au tellurite : résistance au téllurite de potassium pour E. .Recherche de bactéries multi-résistantes : entérocoques résistant à la vancomycine (milieu enterococcosel + vancomycine) : attention certains entérocoques sont naturellement résistants à la vancomycine (E.Typage de l¶antigène polysaccharide de paroi : groupe D de Lancefield (parfois non groupables) .Prélèvements péri-abdominaux : infections abdominales d¶origine intestinale . flavescens) .Enterococcus sp.Esculine + .5.Catalase négative .Prélèvements urinaires . gallinarum. casseliflavus. E.PYRA + (pyrrolidonyl arylamidase) d . flavescens qui sont des espèces mobiles à vérifier la mobilité) . immobile (sauf E. gallinarum.Gélose au sang sous CO2 +/. aztréonam «) .Hémocultures : septicémie.

sous CO2 (aérobie stricte) .LCR : N.Hémocultures : plutôt N.Recherche d¶antigènes solubles du méningocoque dans le sang. arthrite (rares et plutôt N. gonorrhoeae .PCR . meningitidis (si purpura fulminans associé : prélèvements cutanés) . meningitidis d . A.Catalase + . Amphotéricine B.Sérogroupage du polysaccharide capsulaire des souches de méningocoque : B (60%).Milieux enrichis car germes exigeants : gélose au sang ou mieux gélose chocolat.Ostéo-articulaires : ostéomyélite.Prélèvements oculaires : N.Diplocoques Gram négatif aérobies stricte . gonorrhoeae .Maltose + pour le méningocoque.Neisseria sp.Rhinopharynx : 5-15% de portage de N.Prélèvements ano-génitaux : N. les urines ou le LCR . W135 « . négatif pour le gonocoque d . . C (40%).Oxydase + . Triméthoprime) Le gonocoque ne résiste pas à des températures dépassant 37°C d . Y. meningitidis) . meningitidis . Colistine.2-Cocci Gram négatif 1.Milieux sélectifs pour la recherche de gonocoque : gélose chocolat VCAT (Vancomycine.

Saccharose ± (contrairement aux Neisseria) d .Nitrate réductase +. de méningites ou d¶arthrites d . C1G voire C2G) .LCR.LBA : pneumonies .Branhamella catarrhalis Flore commensale du nez et du rhinopharynx .Test chromogénique pour la recherche de béta-lactamase (90%) : BRO-1 et BRO-2 (profil de résistance : Ampicilline.Milieux enrichis : gélose au sang ou gélose chocolat sous 5% de CO2 (aérobie stricte) .Milieux sélectifs : gélose chocolat VCAT (Vancomycine. liquides articulaires.Catalase + . Colistine. Ticarcilline. DNAse +. hémocultures : exceptionnelles cas de septicémies.Oxydase + . test à la Tributyrine + . laryngites. Amphotéricine B.Prélèvements ORL : bronchites. rhinopharyngites . Triméthoprime) d . Piperacilline. otites.Prélèvements oculaires : conjonctivites . sinusites.Diplocoques Gram négatif aérobies stricte .

agalactiae (catalase).Camp test positif . mobiles à 25°C (immobiles à 37°C) .Liquide amniotique.Listeria monocytogenes .LCR : méningite chez l¶enfant de plus de 5 j et chez l¶adulte âgé ou immunodéprimé . Corynébactéries (esculine).Catalase positive . gélose ANC d . pousse de 4 à 42°C (psychrophile). nalidixique. zone étroite de -hémolyse Ajout d¶antibiotiques si prélèvement polymicrobien (Ac. S. membrane placentaire.Petits bacilles Gram +.Agglutination des antigènes flagellaires (H) et somatiques (O) d .Hémocultures : septicémie (chez l¶enfant de moins de2 j et chez l¶adulte âgé ou immunodéprimé) d . Colistine.3-Bacilles Gram positif 1.Esculine + rapide (<2H) . liquide gastrique du nouveau-né « : contamination materno-f tale transplacentaire . Erysipelothrix .Gélose hypersalée (Chapman).Gélose ordinaire ou gélose au sang : microaérophile.Diagnostic différentiel : Entérocoques. Aztréonam «) .

uréase.C. qu¶il y ait des signes cliniques . abcès) .C. qu¶il y ait une réaction leucocytaire et inflammatoire.Gélose ordinaire ou gélose au sang . riegelii.2.C. nitrate réductase « d . endocardite « . C.Turicella otitidis : otite moyenne aiguë d . milieu de Loeffler ou milieux spécifiques (cystine-tellurite.C.Critères d'identification d'espèce : lipophilie.Atmosphère enrichie en CO2 .C. minutissimum.C.C. prostatite . ulcerans (pharyngite diphtériforme.C.Recherche de la toxine diphtérique : ELISA.C. endocardite . abcès pulmonaire. renale : infection urinaire .Arcanobacterium haemolyticum (pharyngite avec rash cutané.Bacilles Gram + en massue. diphtheriae . glucuronolyticum / seminale : urétrite. méningite.Gélose sélective par ajout de Fosfomycine .C. pseudotuberculosis : lymphadénite. milieu de Tinsdale : colonies noires + halo noir) d . macginleyi : infection oculaire . alphabet . urealyticum : infection urinaire. jeikeium : septicémie. Flore normale saprophyte de la peau et des muqueuses 3 espèces pathogènes : .Corynebacterium sp. pseudodiphtericum : trachéite. abcès. détection du gène tox . C. endocardite « . endocardite) Pour les autres espèces : il faut que le germe soit abondant à l¶examen direct et en culture. palissade. esculine.Certaines espèces sont lipophiles (adjonction de Tween 80) . pneumopathie . diphtheriae : gélose au sang.

P. Proteus. Yersinia d . Drigalski.Géloses sélectives (présence de sels biliaires qui inhibent les Gram +) : Hektoën.Entérobactéries .Bacilles Gram négatif généralement mobiles (sauf Klebsiella. coli K1 . SS « d .Prélèvements broncho-pulmonaires : K.. BCP) Escherichia. pneumoniae « .coli (E.Milieu ordinaire ou gélose au sang . « . H et K : . E. Citrobacter.Salmonelles : agglutinines O et H pour le diagnostic de la fièvre typhoïde . Shigella et Yersinia à 37°C) . Mac Conkey.Coprocultures : Salmonella spp. coli (80% des cystites). E. Drigalski. Enterobacter.Typage antigénique O. mirabilis.H2S : réduction du thiosulfate en H2S qui réagit avec le citrate de fer pour donner du sulfure de fer (noir sur Hektoën. « d . Klebsiella .Hémocultures : septicémie. Shigella spp.coli K1 chez les nouveaux nés) . SS) surtout les salmonelles .4-Bacilles Gram négatif 1.Oxydase négative. SS. polyarthrites « .Shigelles .Yersinia (enterocolitica et pseudotuberculosis) : diagnostic des érythèmes noueux. Yersinia spp.LCR : méningite néonatale : E.Fermentation du lactose : fréquemment étudiée sur gélose (Hektoën. Klebsiella spp. Shigelles ..Salmonelles.Prélèvements urinaires : E.Sérologie : .coli O157 H7 (sorbitol négatif sur milieu MacConkey-sorbitol). coli « . nitrate réductase + (bandelettes urinaires) . Mac Conkey.E.Uréase : mise en évidence de l¶alcalinisation d¶un milieu urée tryptophane par libération d¶ammoniac Klebsiella..

aeruginosa (pyocyanine sur le milieu King A et pyoverdine sur le milieu King B) (10% des souches sont non pigmentées et certaines souches produisent un pigment rouge : la pyorubrine ) .Oxydase +. Mac Conkey. endocardite « d .Prélèvements cutanés : surinfection de plaies « . SS «. aeruginosa . catalase + .Prélèvements urinaires : infections urinaires nosocomiales .Milieux King A et King B favorisant la production des pigments du P.Odeur de seringa d .Dénitrification ou respiration de l¶azote » : présence d¶une nitrate réductase et d¶une nitrite réductase d .Pseudomonas aeruginosa Germe opportuniste : infection des sujets immunodéprimés .Prélèvements ORL : otite .Prélèvements broncho-pulmonaires : pneumopathie. aérobies stricts .Géloses sélectives (présence de sels biliaires qui inhibent les gram +) : Hektoën.Hémocultures : septicémie.Sérologie (Ac anti-protéase.Gélose au Cétrimide : gélose sélective qui favorise la pigmentation de P. colonisation des sujets atteints de mucoviscidose .2.Prélèvements ophtalmo .Milieu ordinaire ou gélose au sang . Ac anti-exotoxine A) permettrait de différencier une infection chronique d¶une colonisation occasionnelle chez les patients atteints de mucoviscidose   .Bacilles Gram négatif mobiles. Ac anti-élastase. Drigalski.

aureus apporte le facteur V) .Recherche de l¶antigène capsulaire dans le LCR.LCR : méningites purulentes . influenzae d .Gélose à 4 cadrans (4 cadrans : X+V. aspiration bronchique « : pneumonies.Recherche de la production de pénicillinase (Céfinase®) . V. ostéo-myélites . parfois capsulés . Amphotéricine B d .Oculaires : conjonctivites .Gélose chocolat sélective par ajout d¶antibiotiques : Bacitracine. ou X+V) .ORL : commensal de l¶oropharynx et du nasopharynx mais peut être responsable de laryngites. immobiles.Prélèvements génitaux : peut être responsable de prostatites. V et aucun facteur) ou utilisation de disques contenant X. influenzae à proximité d¶une strie de S. épiglottites . X. aureus sur gélose au sang (S. infections néonatales d . Vancomycine. vaginites.Liquide articulaire « : arthrites.Hémoculture : septicémies .Test au delta-ALA : absence de coloration rouge si H.Exigeant : pousse uniquement sur gélose chocolat (nécessite du facteur X (hémine) et V (NAD)) sous CO2 . exacerbation de bronchites chroniques « .LBA. le sérum ou les urines .Haemophilus influenzae .Catalase + Oxydase + .3. pharyngites. urétrites.Phénomène de satellitisme : développement de colonies d¶H.Petits bacilles Gram négatif. sinusites. otites.

Prélèvement d¶eau : contamination par inhalation de micro-gouttelettes (aérosol) .Typage du sérogroupe par agglutination d .Bacilles Gram négatif.Culture lente : 3-10j .Recherche d¶antigènes urinaires : détection d¶antigène spécifique de L.Sérologie : multiplication du titre par 4 entre 2 sérums prélevés à 3 semaines d¶intervalle (diagnostic rétrospectif) .Aspect de verre fritté à la loupe binoculaire d . liquide articulaire.Milieux spéciaux contenant de la cystéine : BCYE. éventuellement sélectif par l¶ajout d¶antibiotiques (BMPA.4. pneumophila sérogroupe 1 (80% des infections) excrétion précoce (2-3j suivant les signes cliniques) et longue (2-12mois) et non influencée par l¶antibiothérapie . mobiles. LBA « : infection pulmonaire aiguë .5%) .Legionella pneumophila .Catalase faiblement positive . péricardique « d .Exceptionnellement sang. aspiration bronchique.Crachat.Oxydase + . aérobies stricts . GVPC) sous faible concentration de CO2 (2.Enquête épidémiologique .

5.Température de culture : 42°C pour C. Polymyxine B. Skirrow. très mobiles .Campylobacter sp. . en microaérophilie (5% O2) Karmali.Hemocultures : plutôt Campylobacter fetus (bactériémie et localisations secondaires surtout chez l¶immunodéprimé) .Campylobacter coli : environ 10 % des Campylobacter isolés dans le sang ou les selles (contamination surtout par le porc) d . Amphotéricine B). 3 sem après l¶entérite) .Bactéries spiralées (ou incurvées) Gram négatif. Triméthoprime.Sérologie : C. Campylosel « . jejuni . 37°C pour C. fetus d .Hippurate + uniquement pour C.Catalase + . jejuni : CF : R. fetus : CF : S AN : R d . AN : S / C.Sensibilité à la Céfalotine et à l¶Acide nalidixique : C.Coproculture : plutôt Campylobacter jejuni (responsable d¶entérites : contamination par la volaille et le lait cru).Oxydase + . jejuni.Milieux de culture enrichis et sélectifs (ex : Vancomycine. jejuni peut être responsable d'un syndrome de Guillain-Barré (env.

Endoscopie et biopsie gastrique .Détection d¶antigènes dans les selles .Test respiratoire : ingestion d¶urée marquée au carbone 13 (ou 12) et mesure de CO2 marqué expiré .Gélose enrichie et sélective.Catalase + .Bactéries spiralées (ou incurvées) Gram négatif. Western Blot) . microaérophiles .Sérologie (ELISA.6. en microaérophilie (10% CO 2) .Oxydase + .Helicobacter pylori Biopsie gastrique : responsable de gastrite pouvant évoluer vers l¶ulcère gastrique et le carcinome gastrique d .Uréase +++ (test à l¶urée indole directement sur la biopsie ou test respiratoire à l¶urée radiomarquée) d .Pousse lente (examiner les boîtes tous les 4 jours pendant 15 jours) d . mobiles.PCR et séquençage .

Ecouvillonnage rhinopharyngé d Bactérie fragile (ensemencer le prélèvement rapidement) et exigeante (milieux spéciaux) .Petit bacille Gram négatif (coccobacille). capsulé . Ac anti-adénylcyclase .Le diagnostic est principalement réalisé par PCR . immobile.Bordetella pertussis Agent pathogène strictement humain responsable de la coqueluche .Crachat.NFS : hyperlymphocytose .Catalase positive . pousse en 3-6j Petites colonies en gouttelettes de mercure s¶entourant d¶une zone d¶hémolyse d . mouton. aspiration bronchique « .Milieu additionné de sang frais (cheval.7. lapin) : milieu de Bordet et Gengou .Oxydase positive d .Milieu au charbon Atmosphère aérobie stricte.Sérologie : Ac anti-toxine pertussique.

Catalase ± . BCYE . henselae . hémoculture .Diagnostic principalement sérologique d . rétinite.Formes sévères : hépatite.Sérologie Bartonella : on dispose d¶Ag +/.spécifiques de B. 37°C d . syndrome oculo-glandulaire de Parinaud. quintana et de B.Prélèvements : ponction d¶adénopathie.Gélose au sang frais. axillaires) . pousse lente (2-4 semaines) . morsure «) .Autres formes : endocardite infectieuse.Oxydase ± d .8. complications neurologiques .Maladie typique : fièvre. adénopathies satellites (cervicales.Petit bacille gram négatif .Bartonella henselae Transmission principalement par contact avec un chat (griffure.Atmosphère humide enrichie en CO2 (5%). biopsie cutanée. angiomatose ou péliose bacillaire . lésions cutanées.Culture difficile.

5-Actinomycètes aérobies 1. gris. du gène hsp65 . cancer. chimiothérapie.Colonies blanches ou pigmentées (jaune. nausées. vomissements. déficits sensitif ou moteur « (la bactérie est rarement retrouvée dans le LCR) d .Aspect de filaments ramifiés . rose.Prélèvements pulmonaires : crachats.En aérobiose 5 à 10% de CO2 . gélose chocolat. uréase souvent + d .Bacilles Gram + (prend mal le Gram : apparaît en pointillés) ou généralement acido-alcoolo résistants à la coloration de Ziehl-Neelsen modifiée . Lowenstein-Jensen «) . greffé «) . brun.Nocardia sp. BCYE.Non exigeant (gélose ordinaire. évolution subaiguë) . gélose au sang.Pousse généralement en 3-7j .Catalase +. orange. SIDA. dyspnée.Ponction de pus et d¶abcès cérébraux : céphalées.Séquençage de l¶ARN 16S. LBA « (toux.Aspect cérébriforme (parfois duveteux : présence d¶hyphes aériens visibles au microscope) d . Sabouraud.Prélèvements cutanés : mycétome : nodule non douloureux qui devient inflammatoire et purulent . rouge. Germe opportuniste (corticothérapie. -galactosidase +. nitrate-réductase +. pourpre) souvent incrustées dans la gélose .

hémoculture. latente ou traitée récemment) . mais qui sont absents du vaccin BCG (diagnostic de tuberculose active. de décontamination (crachats.Mycobacterium tuberculosis . aspirations bronchiques.2. le matin au réveil (voire tubage gastrique)). atteintes génito-urinaires. urine « pour les autres localisations : miliaire (septicémie tuberculeuse).Prélèvements de crachats (3 jours de suite. LBA pour les formes pulmonaires : caverne tuberculeuse (voire miliaire tuberculeuse) . 7H9 « . liquide articulaire.Antibiogramme en milieu liquide par la méthode des proportions . tuberculosis.IDR à la tuberculine : met en évidence une hypersensibilité retardée . Pyrazinamide «) par méthode génotypique : amplification par PCR puis hybridation ou séquençage . de couleur crème d Bacilles acido-alcoolo résistants (BAAR) à la coloration de Ziehl-Neelsen (prend mal le Gram.Quantiféron® : dosage de l¶interféron après stimulation lymphocytaire par des Ag spécifiques de M. MB-redox. liquide pleural. mais structure de Gram +) Bacilles fluorescents après coloration à l¶auramine (ou à l¶acridine orange) Nitrate réductase + Niacine + (production d¶acide nicotinique) d .Culture lente : 2-4 semaines (les milieux sont gardés environ 3 mois) .Atmosphère aérobie humide sous 10% de CO2 . ostéoarticulaires (Mal de Pott).On utilise des techniques de fluidification (crachats).Milieux spéciaux : .Identification d¶espèce et de certaines résistances (Rifampicine. cutanées « . méningo-encéphalite. urines «) et de concentration par centrifugation d .milieux solides : Lowenstein-Jensen ou Coletsos ( uf coagulé) .milieux liquides : MGIT.LCR.T-SPOT-TB® : test ELISPOT permettant la détection de la production d¶IFN .Colonies rugueuses en chou fleur.

Recherche des toxine A (entérotoxine) et B (cytotoxine) sur les selles (voire sur la culture) : ELISA. Polymyxine. non sporulé. capsulé . en anaérobie stricte colonies à bords irréguliers.Catalase ± d .Moxifloxacine R et Erythromycine R orientent vers les souches O27 hypertoxinogènes ¡ .C. entérocolites. Fructose.Recherche d¶antigène dans les selles (glutamate déshydrogénase) . perfringens : milieu TGY (double hémolyse) ou milieu TSN (Néomycine. PCR « . pneumonies nécrosantes. difficile : .Endoscopie .Typage phénotypique ou génotypique .C. jaune d¶ uf) taurocholate de sodium (favorise la formation de spores). C. Immunochromatographie. cholecystites . déformante) .6-Bacilles Gram positif anaérobies 1. Céfoxitine.C.C. difficile : gros bacille Gram +. difficile : milieux enrichis et sélectifs tels que CCFA (Cyclosérine.C. .C. mobile et sporulé (spore sub-terminale. odeur caractéristique de crottin de cheval . difficile : coproculture colite pseudo-membraneuse ou de diarrhée post-antibiothérapie (attention : portage chez 3% de la population et 50-70% des enfants de moins de 2 ans) .C. anaérobie strict. perfringens : gros bacille Gram + immobile. tetani : laboratoires spécialisés d Gélose au sang en anaérobiose .Clostridium sp. ovale. citrate de fer) d . non hémolytiques. septicémies.C. perfringens : infections des plaies. botulinum.

prélèvement urétral ou 1er jet d¶urine . F. Da.Chlamydophila psittaci : pneumopathie (psittacose.Chlamydia trachomatis. Ba et C : responsables du trachome (kératoconjonctivite chronique contagieuse) .techniques de PCR d . chez l¶homme. I. H.Chlamydia trachomatis : . L2a. Chlamydophila psittaci . psittaci : .sérovars L1.7-Intracellulaires stricts 1. pneumoniae et réactions croisées avec les autres Chlamydia).Chlamydophila pneumoniae : pneumopathie atypique communautaire.sérovars A.la technique de choix est la PCR . L2.techniques d¶immunofluorescence directe . ornithose : transmises par les oiseaux) d .Germes intracellulaires donc culture cellulaire réservée à des centres spécialisés d .Chlamydophila pneumoniae et psittaci : la sérologie peut être utile au diagnostic mais est d¶interprétation difficile (prévalence élevée de C. pharyngite. Chlamydophila pneumoniae. B. G. bronchite .Chlamydophila pneumoniae et C. .Chlamydia trachomatis : la sérologie peut aider au diagnostic des infections génitales hautes.Chlamydia trachomatis : 1er agent bactérien responsable d¶IST. des pneumopathies du nouveau-né ou des lymphogranulomatoses vénériennes . E. Ia.sérovars D. L3 : responsables de la lymphogranulomatose vénérienne ou Maladie de Nicolas et Favre (maladie systémique avec atteinte ganglionnaire et lymphatique) . J et K : responsables d¶IST prélèvement endocervical sous spéculum à l¶écouvillon ou. 70% des stérilités tubaires .

non colorables au Gram Prélèvement M.M.). Triméthoprime. Ureaplasma sp. genitalium M. abcès des glandes de Bartholin (M. Rifampicine.Prélèvements néonataux : infection des grands prématurés (M. Sulfamides.) . hominis et Ureaplasma sp. Acide nalidixique) : on teste les MLS. : (résistance naturelle : -lactamines.) . hominis. pneumoniae . pneumoniae (enfant > 5ans et adulte jeune) : pneumonie atypique. : infections extragénitales chez l¶immunodéprimé (arthrites «) d .M.M. pneumoniae M. les Cyclines et les Fluoroquinolones .8-Mollicutes Mycoplasma .Prélèvements ORL et broncho-pulmonaires : M.Ureaplasma .Germes polymorphes.Sérologies et PCR pour M. hominis. hominis). salpingite. peuvent être cultivés en milieu liquide contenant de l¶urée ou de l¶arginine et un indicateur coloré d . pneumoniae : culture difficile et longue (2-3 semaines) diagnostic par PCR . infections per-partum : chorioamniotite. endométrite (M. hominis et Ureaplasma sp.Antibiogramme pour M. Ureaplasma sp.Prélèvements génitaux : urétrite non gonococcique (Ureaplasma sp. hominis et Ureaplasma sp. urealyticum d Glucose + + - Arginine + - Urée + Respiratoire Génital Génital Génital . hominis U. trachéobronchite .