Mendeley : gestion de rfrences bibliographiques et collaboration entre chercheurs

Club photo et Maxime Storn

Alain Marois Bibliothque de l'Ecole Centrale de Lyon alain.marois@ec-lyon.fr / www.twitter.com/amarois

Plan

Les logiciels de gestion de rfrences Installation de Mendeley Grer sa bibliothque de rfrences Citer en utilisant ses rfrences Partager, collaborer, grer son identit numrique
Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010

bibliographiques

Trop de rfrences bibliographiques

sur une ide originale de Valentin Vivier

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Alain Marois - 27/04/2010

Grer sa bibliographie
S'organiser Capitaliser Privilgier le fond sur la forme Partager des rfrences, collaborer Dcouvrir de nouveaux travaux ?

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Des outils ddis

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Besoins classiques...et mergents

sur une ide originale de Martin Fenner

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Mendeley 1/2
Logiciel installer + service en ligne (http://www.mendeley.com) Windows + Mac + Linux Modle de Last.fm (partage de musique) Version beta, gratuit, mais... ...business model en volution, mais... ...what is free now will remain free Socit base Londres

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Mendeley 2/2

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Installation de Mendeley

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Tlchargement : option 1

Par dfaut, tlchargement suite l'initialisation d'un compte

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Tlchargement : option 2

Il est aussi possible d'installer l'outil sans crer de compte priori

Mendeley est disponible sur de nombreuses plateformes

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Installation : les plugins Word et OpenOffice

1 2

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Compatibilit OpenOffice

Compatibilit word 2003 - 2007

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Vue d'ensemble de l'interface Desktop

Barre d'outils Moteur de recherche

Collections, collections partages, corbeille

Liste des rfrences

Filtres (auteurs, journaux, tag, mots cls auteur Dtails, tag et annotations, rfrences cites

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Crer sa bibliothque de rfrences

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Ajouter des rfrences : via Mendeley Desktop

Diffrentes stratgies :

Ajout d'un document ou d'un rpertoire de documents Watch a folder, pour l'import automatique de PDF Ajout de rfrences au format EndNote, BibTeX, RIS, etc.

Ajout par glisser-dposer de fichiers PDF...

...et Mendeley extraira les descriptions du document PDF automatiquement

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Ajouter des rfrences : utiliser l'import web

1

Un simple lien plac dans la barre d'adresse permet d'importer directement des rsultats de recherche partir des sites compatibles

Choisir les rfrences dans la fentre ddie, annoter, ajouter des tag

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Import web : installation et compatibilit

http://www.mendeley.com/import

Compatible avec Firefox, Chrome, Safari, Internet Explorer...

Les principales sources d'information scientifique

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Synchronisation de sa bibliothque de rfrences

Synchronisez votre bibliothque Mendeley Dekstop avec votre compte en ligne

Gestion et dition en ligne de vos rfrences

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Si vous disposez d'un lot de fichiers PDF

1
Indiquez le dossier importer contenant les PDF

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Mendeley va chercher les informations dcrivant les documents dans les bases de donnes d'information scientifique

L'importation se droule automatiquement et les rfrences correspondant aux documents PDF apparaissent

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Si vous venez de EndNote

1
Slectionner les rfrences exporter

Exporter en Xml, ou .txt avec le style RefMan(RIS)

Dans Mendeley, choisir le format d'import RIS ou EndNote Xml suivant le format d'export EndNote

De la mme manire, Mendeley peut importer des listes de rfrences aux formats BibTeX, Zotero.sqlite, OVID,...
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Grer sa bibliothque de rfrences

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Des fonctions de gestion simples et utiles

Collection cres par dfaut : Toutes les rfrences Ajouts rcents Mes favoris Rfrences vrifier Mes publications Publications non classes Triez rapidement vos listes en cliquant sur les en-ttes de colonne

Affichez le PDF attach la rfrence pour lecture Crez vos propres collections

Les rfrences peuvent tre marques comme lire, lues, favorites Filtrez vos listes de rfrences de faon aise

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Recherche incrmentielle et suggestion de recherche

Recherche dans les rfrences et les PDF de toutes les collections

Suggestion de termes au court de la frappe

Mise jour de la liste de rsultat au cour de la frappe

Mise en contexte et surlignage des termes recherchs

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Utilisation avance du moteur de recherche

champs:terme recherche

Exemples : author:harnad keyword:Bacteria publication:nature tag:tools title:open access

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PDF : lecteur intgr + et recherche de mots-cls

Outils d'exploitation avance : notes, surlignage manuel, lecture plein cran, etc.

Ouverture des PDF dans des onglet ddis

Surlignage du terme recherch dans le PDF

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PDF : surlignez et annotez vos documents

Annotation (avec auteur et date)

Notes gnrales

Listes des annotations avec leurs liens pour une navigation aise Passage surlign manuellement

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Classez et renommez automatiquement vos fichiers

Tools > Option > File Organizer L'outil de gestion des fichiers et ses options

Classement et nommage paramtrables

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PDF : surlignez, annotez, ajoutez des notes

PDF (et autres fichiers) joints renomms

Fichiers organiss automatiquement en arborescence

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Prenez soin de vos mtadonnes : homognisation des noms de journaux, auteurs, tag, etc.

Mendeley modifie automatiquement les rfrences en consquence

Les entres d'index peuvent tre glisse-dpose les unes sur les autres pour homogniser leurs valeurs Passage surlign manuellement

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Citer en utilisant ses rfrences

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Citer dans Word et OpenOffice 1/2

Cliquer sur Insert Citation dans la barre d'outil Mendeley de Word

1
Placer son curseur l'emplacement de l'appel de citation dans votre texte

Dans Mendeley, choisir la rfrence citer

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Citer dans Word et OpenOffice 2/2

Cliquer sur Send Citation to Word

5
L'appel de citation est intgr au format choisi l'emplacement du curseur

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diter une bibliographie dans Word ou OpenOffice

Cliquer sur insert Bibliography

Choisir un style bibliographique

Finaliser son texte avec tous les appels de citation

Vous pouvez changer le style : le document se met jour

1
Positionner son curseur l'endroit o doit figurer la bibliographie

3
La bibliographie est gnre automatiquement

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Produire une simple liste de rfrences formates

Slectionnez des rfrences La liste est au format slectionn

Dplacez les dans votre document (drag & drop)

Cela fonctionne aussi par copier-coller

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Un vaste choix de styles bibliographiques

Ooo : Choose Citation Style

Word : Other citations from Mendeley

Recherchez et slectionnez un style

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Utiliser LaTeX / BibTeX : options de synchronisation de la bibliothque de rfrences

Tools > Options > BibTeX Prise en compte de caractres spciaux

Mise jour automatique du fichier .bib

Cls BibTeX ditables si besoin rfrence par rfrence

Un ou plusieurs fichiers. On peut imaginer le mettre sur un dossier partag...

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Partager, collaborer, s'intgrer une communaut en grant son identit numrique

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Rendre une collection publique

Les critres de publication des collections sont paramtrables pour chacune d'entre elles indpendamment des autres

Rendez vos collections publiques via Edit Settings

D'autres usagers pourront s'abonner vos collections publiques. Vos modifications seront rpercutes dans les Mendeley Desktop des autres membres abonnes. Les membres abonnes une collection sont visibles, ainsi que l'auteur d'une collection
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Crer une collection partage pour collaborer

Une collection partage entre membres n'est visible uniquement que par ses membres. Vous pouvez inviter vos contacts partager une collection que vous avez cre. Les rfrences sont alors visibles et modifiables par tous les membres partageant la collection. Les fichiers PDF peuvent tre mis en commun et annots collaborativement.
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Complter son profil et sa liste de publications : l'identit numrique du chercheur

Liste des publications du chercheur, mise jour via une collection Mendeley

CV du chercheur Statistiques sur ce chercheur

Contacts du chercheur Contacter ce chercheur Collections publiques du chercheur

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Mendeley : un rseau social pour les chercheurs ?

We define social network sites as webbased services that allow individuals to (1) construct a public or semi-public profile within a bounded system, (2) articulate a list of other users with whom they share a connection, and (3) view and traverse their list of connections and those made by others within the system.
Boyd, D.M., et N.B. Ellison. Social network sites: Definition, history, and scholarship. Journal of Computer-Mediated Communication 13, 2007, 210-230. Available from world wide web: <http://jcmc.indiana.edu/vol13/issue1/boyd.ellison.html>.

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Paramtrer la confidentialit de son profil

Se tenir inform

Plusieurs niveaux de confidentialit

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Valoriser son travail bibliographique et son expertise

Crer par simple copier-coller une liste de publication mise jour automatiquement

Inclure un bouton vers son profil dans votre signature de courriel ou sur son blog de chercheur

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Trouver de l'aide

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Mendeley : participer, suivre l'volution

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Statistiques et srendipit
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Questions ?
Alain Marois 04.72.18.64.50 alain.marois@ec-lyon.fr

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Ressources

Hull, Duncan, Defrosting the Digital Library: A survey of bibliographic tools for the next generation web. [cit 20 Avril 2010]. Disponible sur

le world wide web : <http://www.slideshare.net/dullhunk/defrosting-the-digital-library-a-survey-of-bibliographic-tools-for-the-next-generation-web>.

Hull, Duncan, Steve R Pettifer, et Douglas B Kell. Defrosting the Digital Library: Bibliographic Tools for the Next Generation Web. PLoS

Comput Biol 4, Octobre 2008, e1000204+. Disponible sur le world wide web : <http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000204>

Mendeley Teaching Presentation [cit 20 Avril 2010]. Disponible sur le world wide web :

<http://www.slideshare.net/luiszz11/mendeley-teaching-presentation>

Reiswig, Jennifer. Mendeley. 98, Avril 2010, 193-194. PubMed Central Link. [cit 31 Mai 2010]. Disponible sur le world wide web :

<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2859264/>

Readwriteweb, Curt Hopkins Of. Mendeley Throws Open the Doors to Academic Data. The New York Times Avril 2010. [cit 31 Mai 2010].

Disponible sur le world wide web : <http://www.nytimes.com/external/readwriteweb/2010/04/29/29readwriteweb-mendeley-throws-open-the-doors-to-academic-43750.html>

Henning, Victor, et Jan Reichelt. Mendeley - A Last.fm For Research? Dans eScience, IEEE International Conference on, Vol. 0 of, 327-

328, [Los Alamitos, CA, USA]: IEEE Computer Society, 2008

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