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Sntesis prebiotica fue un termino utilizado en 1924, por el bioqumico ruso Alexandr Oparin.

Lo utilizo para elaborar una teora para explicar el origen de la vida. Se basaba en el conocimiento de las condiciones fsico-qumicas que reinaban en la Tierra hace 3.000 a 4.000 millones de aos. Oparin postul que, gracias a la energa aportada primordialmente por la radiacin ultravioleta procedente del Sol y a las descargas elctricas de las constantes tormentas, las pequeas molculas de los gases atmosfricos (H2O, CH4, NH3) dieron lugar a unas molculas orgnicas llamadas prebiticas. Estas molculas, cada vez ms complejas, eran aminocidos (elementos constituyentes de las protenas) y cidos nucleicos. Segn Oparin, estas primeras molculas quedaran atrapadas en las charcas de aguas poco profundas formadas en el litoral del ocano primitivo. Al concentrarse, continuaron evolucionando y diversificndose. El proceso de formacion tiene unas fases iniciales: 1-Formacin de molculas orgnicas sencillas. 2-Formacin de molculas orgnicas complejas. 3-Formacin de coacervados. Son un conjunto de molculas coloidales en las que las molculas de agua estn rgidamente orientadas respecto a ellas y rodeadas por una pelcula de agua, que delimitan ntidamente los coacervados del lquido en el cual flotan .

Experimento de Miller Este experimento dio como resultado la formacin de una serie de molculas orgnicas, entre la que destacan cido actico, ADP-Glucosa y los aminocidos glicina, alanina, cido gltamico y cido aspartico usados por las clulas como los pilares bsicos para sintetizar sus protenas. Fue clave para explicar la teoria del caldo primordial

En el aparato se introdujo la mezcla gaseosa, el agua se mantena en ebullicin y posteriormente se realizaba la condensacion; las sustancias se mantenan a travs del aparato mientras dos electrodos producan descargas elctricas continuas en otro recipiente. Despus que la mezcla haba circulado a travs del aparato, por medio de una llave se extraan muestras para analizarlas. En stas se encontraron, como se ha mencionado, varios aminocidos, un carbohidrato y algunos otros compuestos orgnicos. El experimento realizado por Miller y Urey indic que la sntesis de compuestos orgnicos, como los aminocidos, fue fcil en la Tierra primitiva. Otros investigadores siguiendo este procedimiento y variando el tipo y las cantidades de las sustancias que reaccionan- han producido algunos componentes simples de los acidos nucleicos y hasta ATP

Sintesis prebiotica.
Tras las contundentes experiencias de pasteur, el problema del origen de la vida tard ms de setenta aos en ser abordado de nuevo. Segn Oparin y Haldane, la vida sera el resultadi de un proceso gradual que comprenda tres etapas.Las dos primeras denominadas sntesis prebiticas. -Asociacin:progresiva de molculas inorgnicas para originar molculas orgnicas sencillas.La mezcla de gases de la primtiva atmsfera, expuesta a la radiacin solar, reaccionara para dar lugar a molculas orgnicas tales como aminocidos o azcares. -Condensacin: de las molculas orgnicas sencillas para formar molculas orgnicas ms complejas.Estos compuestos acumulados en los ceanos primitivos originaran una "sopa" primordial. -Formacin: en el seno de la "sopa" de agregados moleculares en forma de "coacervados". Estos coacervados seran los precursores de los primeros organismos.

La simulacin experimental de Miller: En 1953, Stanley Miller realiz en una aparato en el laboratorio las supuestas condiciones de la Tierra Primitiva. Sus experimentos sirvieron de apoyo a las hiptesis de Oparin y Haldane. Al final del experimento fue un exit, ya que comenzaron a aparecer varios polmeros, y basandose en las observaciones del mismo , Staley Miller desarroll una teora que explicaba el origen de la vida a partir de componentes que se pudieron formar en la Tierra primigenia a base de reacciones qumicas. Dicha teora recibio el nombre de Teora de la sntesis prebitica. Con dicha teora, se pueden explicar los pasos que se dieron desde el origen de la Tierra, para que finalmente aparecieran los primeros organismos vivos. Los pasos son:

-Formacin de polmeros de ARN capaces de replicarse mediante el anidamiento de bases complementarias. -Incorporacin de los mecanismos necesarios para que las molculas de ARN puedan regir la sntesis de las molculas proteicas. -Formacin de una membrana de lquidos que determine el aislamiento de las molculas de ARN y nuevas proteinas. -Sustitucin de ARN por el ADN como material que codifica la informacin para la sntesis de proteinas. -Aparicin de los primeros organismos procariontes -Evolucin de los organismos procariontes a las formas celulares eucariotas. -Aparicin de los primeros organismos pluricelulares. En la actualidad, esta teora es la ms aceptada de todas, sin embargo, aun hay sectores de la comunidad cientfica que no estan muy conformes con las explicaciones que da esta teora.

Para Oparin, la atmsfera primitiva estaba compuesta por hidrgeno, metano, amonaco y vapor de agua. Esta mezcla gaseosa, debido a la accin de los rayos solares, dara lugar a gran cantidad de molculas orgnicas, que caeran en los ocanos y all se acumularan durante largos perodos de tiempo sin riesgo de descomposicin, formando un "caldo nutritivo". Las molculas se iran asociando entre s, formando agregados moleculares cada vez ms complejos, con una estructura concreta, a los que llam coacervados. Los coacervados con capacidad de autosntesis (productores de su propio alimento), evolucionaran hacia formas cada vez ms estables y complicadas hasta convertirse en verdaderas estructuras vivientes. Estos organismos primordiales daran lugar, por evolucin durante millones de aos, al mundo vegetal y animal de nuestro planeta. Teoras semejantes, aunque con menor difusin mundial, fueron expuestas poco despus por el italiano Giglio-Tos y el ingls J.S. Haldane. Cundo apareci la vida sobre la Tierra? El nacimiento de nuestro planeta tuvo lugar hace 4.600 millones de aos, en que apareci en forma de una masa incandescente, por condensacin de la nube primordial que origin el Sol y los planetas del Sistema Solar. A partir de aquel momento, el enfriamiento progresivo dio lugar a la formacin de una superficie slida, la corteza terrestre; desde ese momento hasta la aparicin de la vida transcurre un perodo llamado era Azoica. Durante la era Azoica, las erupciones volcnicas arrojan al exterior vapor de agua que, al enfriarse, da origen a los primeros mares. Este agua es a su vez el origen del oxgeno y del hidrgeno, que va transformando la atmsfera primitiva, rica en metano, hidrgeno y amonaco, en otra rica en nitrgeno, oxgeno y dixido de carbono. Con estas condiciones, la aparicin de la vida ya es factible, calculndose la existencia de los primeros organismos vivos hace unos 3.700 millones de aos.

EL EXPERIMENTO DE MILLER La teora de Oparin no deja de ser una hiptesis; pese a ello, ha podido, en parte, ser confirmada por el qumico norteamericano Stanley Miller. En los aos cincuenta, Miller trabajaba en la Universidad de Chicago bajo la direccin de H.C. Urey. Simul en un baln de vidrio la atmsfera primitiva con la mezcla de gases propuesta por Oparin y la someti a descargas elctricas que simularan a las radiaciones solares que en esa poca incidan sobre la superficie de nuestro planeta. Cuando al cabo de una semana analiz los productos resultantes de la reaccin, comprob que se haban sintetizado compuestos orgnicos y, en particular, aminocidos, a partir de los cuales se formaran las protenas, componentes fundamentales de la materia viva: Miller haba conseguido formar compuestos orgnicos en condiciones prebiolgicas. Sin embargo, la segunda parte de la teora de Oparin, segn la cual estas molculas se fueron agrupando durante cientos de miles de aos hasta adquirir las caractersticas de un ser vivo, ha de demostrarse por las teoras de la evolucin. El experimento de Miller sirvi de punto de partida a gran nmero de investigadores, como Calvin, Sagan o Ponnamperuma...tal vez dentro de poco tiempo tengamos una idea ms exacta de cmo se produjo el portentoso salto a la vida, ayudados por la enorme labor de estos pioneros de la Qumica prebiolgica.

Replicacin de ADN
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Replicacin de ADN. La doble hlice es desenrollada y cada hebra hace de plantilla para la sntesis de la nueva cadena. La ADN polimerasa aade los nucletidos complementarios a los de la cadena original.

El proceso de replicacin de ADN es el mecanismo que permite al ADN duplicarse (es decir, sintetizar una copia idntica). De esta manera de una molcula de ADN nica, se obtienen dos o ms "clones" de la primera. Esta duplicacin del material gentico se produce de acuerdo con un mecanismo semiconservativo, lo que indica que las dos cadenas complementarias del ADN original, al separarse, sirven de molde cada una para la sntesis de una nueva cadena complementaria de la cadena molde, de forma que cada nueva doble hlice contiene una de las cadenas del ADN original. Gracias a la complementacion entre las bases que forman la secuencia de cada una de las cadenas, el ADN tiene la importante propiedad de reproducirse idnticamente, lo que permite que la informacin gentica se transmita de una clula madre a las clulas hijas y es la base de la herencia del material gentico.

La molcula de ADN se abre como una cremallera por ruptura de los puentes de hidrgeno entre las bases complementarias liberndose dos hebras y la ADN polimerasa sintetiza la mitad complementaria aadiendo nucletidos que se encuentran dispersos en el ncleo. De esta forma, cada nueva molcula es idntica a la molcula de ADN inicial. La replicacin empieza en puntos determinados: los orgenes de replicacin. Las protenas iniciadoras reconocen secuencias de nucletidos especficas en esos puntos y facilitan la fijacin de otras protenas que permitirn la separacin de las dos hebras de ADN formndose una horquilla de replicacin. Un gran nmero de enzimas y protenas intervienen en el mecanismo molecular de la replicacin, formando el llamado complejo de replicacin o replisoma. Estas protenas y enzimas son homlogas en eucariotas y arqueas, pero difieren en bacterias.

REPLICACION DEL DNA

La replicacin del DNA es el proceso por el cual el DNA es perpetuado. Es un proceso semiconservativo, esto quiere decir que las molculas finales contienen una hebra nueva, recin sintetizada, y la complementaria, hebra antigua, que sirvi como templado (molde).

El DNA es replicado por DNA polimerasas, esta utilizan una hebra como templado, sobre la cual realizan la sntesis de la hebra complementaria utilizando los desoxinucletidos trifosfatos adecuados. La cadena de DNA naciente siempre crece en sentido 53, es decir, el nucletido que se agrega une su -fosfato al grupo 3OH libre de la cadena en sntesis, este enlace ocurre entre las pentosas que componen los nucletidos.

Durante el proceso de replicacin se forman diferentes estructuras:

1.

Ojo De Replicacin.

2. Fragmentos De Okazaki. 3. Hebra Lder. 4. Hebra Discontinua.

Este proceso se lleva adelante por una variedad de enzimas:

1.

DNA Polimerasa I.

2. DNA polimerasa II. 3. DNA polimerasa III. 4. Girasa. 5. Primasa. 6. Helicasa.


7. Ligasa.

Estructuras Formadas Para La Replicacin Del DNA

OJO DE REPLICACION:
Es la estructura se forma al separase la doble hebra de DNA durante la replicacin. En ella se pueden distinguir los llamados tenedores de replicacin, esto pueden ocurrir en una o ambas hebras y es donde esta ocurriendo la sntesis de DNA.

FRAGMENTOS DE OKAZAKI:

Estos son los Fragmentos de RNA-DNA que son resultados de la sntesis de DNA en la hebra discontinua. Estos son sintetizados en direccin 53 pero discontinuamente, luego de la remocin de los primers (RNA) son unidos por la DNA Ligasa.

HEBRA LIDER: Es la hebra donde la sntesis de DNA esta ocurriendo en forma continua.

HEBRA DISCONTINUA: Es la hebra donde la sntesis de DNA, en esta podemos encontrar los fragmentos de OKAZAKI.

ENZIMAS DE LA REPLICACION

DNA POLIMERASA I: Esta enzima cuenta con tres actividades. Tiene actividad polimerasa, de sntesis en direccin 53. Una actividad 35 exonucleasa, remocin de nucletidos errneos o conocida como proofreading o revisora. Y finalmente, una actividad 53 exonucleasa, que a partir de un nick (rompimiento del enlace entre dos nucletidos vecinos) resintetiza una porcin de DNA removiendo la ya existente. Esta enzima no lleva a cabo el proceso de replicacin. Estara involucrada en la sntesis de los primers.

DNA POLIMERASA II: Con actividad exonucleasa 35 esta involucrada en procesos de reparacin de DNA.

DNA POLIMERASA III: Esta es la enzima que realiza el proceso replicativo, su funcin es la sntesis de DNA. Tambin cuenta con actividad revisora, 35 exonucleasa.

DNA GIRASA: La DNA Girasa esta encargada de desempaquetar el DNA, en eucariontes se encuentra unido a protenas y sufre procesos de enrollamiento que lo hacen

inaccesibles para la DNA Pol III, por esta razn es necesario su desenrollamiento para que la replicacin se pueda llevar a cabo.

PRIMASA: Enzima en cargada de la sntesis de los primers (partidores) para la sntesis del DNA en E. coli. Esta inicia los fragmentos de Okazaki. En eucariontes este proceso lo llevara acabo la DNA Pol I.

HELICASA: Esta enzima esta encargada de separar la doble hebra de tal forma que se puedan formar los primers y luego se lleve a cabo la replicacin.

LIGASA: La Ligasa va a unir los fragmentos de Okasaki o aquellas zonas del DNA donde se hayan producidos nicks

biologia molecular
Jean-Pierre HERVEG y Maritza BARCIA-MACAY

2b: la replicacin del AD


Cochabamba, Bolivia 2004
plan ejercicio (caja amarillo)

La replicacin del ADN produce una copia de s mismo por medio de enzimas que adems de ser muy exactas poseen un sistema de reparacin de errores. El mecanismo de replicacin es es esencialmente el mismo en todas las clulas. Es un proceso semiconservativo porque cada uno de los dos ADN hijos tiene una cadena del ADN anterior.

a continuacin

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En las clulas procariotas hay 1 lugar de origen de replicacin que se muestra en la horquilla de replicacin (replication fork) y que seala el avance de la copia. La horquilla (fork) indica que se est haciendo la separacin y la replicacin a la vez. El avance es bidireccional, lo que acorta el tiempo. En el sitio en que empieza la replicacin se organizan las protenas en un complejo llamado replisma. La replicacin del ADN en procariotas sucede a una velocidad de 500 nucletidos por segundo.

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En las clulas eucariotas el proceso es esencialmente el mismo pero el ADN es mucho ms grADNe y linear. Hay varios orgens de replicacin y es bidireccional. El avance es ms lento que en procariotas ya que hay ms protenas asociadas al ADN que hay que soltar. La replicacin del ADN, que ocurre una sola vez en cada genracin celular necesita de muchos "ladrillos", enzimas y una gran cantidad de energa en forma de ATP (recuerde que luego de la fase S del ciclo celular , las clulas pasan a una fase G a fin de, entre otras cosas, recuperar energa para la siguiente fase de la divisin celular). La replicacin del ADN en el ser humano se realiza a una velocidad de 50 nucletidos por segundo. Los nucletidos tienen que ser armados y estar disponibles en el ncleo conjuntamente con la energa para unirlos.

a continuacin

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Una vez que se abre la molcula, se forma una rea conocida como "burbuja de replicacin" en ella se encuentran las "horquillas de replicacin" . Por accin de la la ADN polimerasa los nuevos nucletidos entran en la horquilla y se enlazan con el nucletido correspondiente de la cadena de origen (A con T, C con G). Los procariotas abren una sola burbuja de replicacin, mientras que los eucariotas mltiples. El ADN se replica en toda su longitud por confluencia de las "burbujas". Dado que las cadenas del ADN son antiparalelas, y que la replicacin procede solo en la direccin 5' to 3' en ambas cadenas, numerosos experimentos han mostrado que, una cadena formar una copia continua, mientras que en la otra se formarn una serie de fragmentos cortos conocidos como fragmentos de Okazaki . La cadena que se sintetiza de manera continua se conoce como cadena gua, delantera adelantada y, la que se sintetiza en fragmentos, cadena atrasada rezagada.

En la primera , la cadena adelant continuamente en la direccin 5' cadena atrasada, la sntesis de A seccin de una hebra simple de A procede en la direccin opuesta a replicacin (5' to 3'). Es por sto d fragmentos Okazaki son unidos d ligasas formADNo una hebra con fragmentos Okazaki porque fu primeramente los observ y estud . En los eucariotas, los fragmento unos cuantos cientos de nucletid procariotas estos fragmentos pue

Para que la ADN polimerasa trab en el inicio de cada nuevo fragme ARN conocidas como cebadores polimerasa toca el extremo 5' de enzimas, que remueven los fragm nucletidos de ADN en su lugar y Los fragmentos cortos, recin sintetizados de hebras de ADN se la cadena en crecimiento. denominan fragmentos Okazaki. Todas las ADN polimerasas conocidas, pueden slo sintetizar ADN en la direccin 5' a 3' . Sin embargo, cuADNo las hebras se separan, la horquilla de replicacin se desplaza a lo largo de una hebra molde en la posicin 3' a 5' y 5' a 3' en el otro lado del molde.
El cido ribonucleico (ARN) es una estructura molecular polmera, de forma lineal, cuya unidad fundamental es el nucletido, el cual forma una larga cadena. El eje de la cadena lo forman grupos de fosfatos, el azcar ribosa y bases nitrogenadas. La presencia de un oxgeno en la posicin 2 de la ribosa impide que se forme una doble cadena como en el cido desoxirribonucleico (ADN). El filamento nico del ARN es capaz de enrollarse sobre s mismo mediante la formacin de pares de bases en algunas secciones de la molcula. El cido ribonucleico se forma a partir de un proceso de duplicacin (o rplica) de las cadenas de ADN, esto se realiza en el interior del ncleo de las clulas. Es el primer paso del proceso denominado flujo de informacin gentica. Luego tenemos la transcripcin o la copia de la informacin gentica en la nueva cadena de ADN producida, que tambin se lleva a cabo en el ncleo, formndose el ARN. Finalmente el ARN, formado en el ncleo, sale de l y se dirige al citoplasma, donde distinguimos a unos corpsculos denominados ribosomas, que sern los escenarios de la sntesis proteica.

Al parecer, el cido desoxirribonucleico, descubierto por Friedrich Miescher en 1869, es la molcula precursora del cido ribonucleico, es decir ste ltimo es producto del primero. Miescher, destacado mdico suizo, llam a los cidos nucleicos como nuclenas porque fueron encontrados inicialmente en el ncleo de los glbulos blancos. Aos despus se determinaron los dos tipos de cidos nucleicos: El cido ribonucleico (ARN), molcula que sintetiza protenas, y el cido desoxirribonucleico (ADN), molcula de transmisin de la herencia. El ADN fue redescubierto y determinado plenamente, por primera vez, en las estructuras del retculo endoplasmtico, gracias al trabajo de los cientficos George Palade y Siekevitz, en la dcada de 1950. En 1955 James Watson determin la existencia del cido ribonucleico mensajero (como una molcula intermediaria en la transmisin de la informacin del ADN hacia los ribosomas citoplasmticos. En 1957, Watson y Crick formularon el llamado Dogma o Fundamento Central de la Biologa, que explicaba el mecanismo de la replicacin del ADN, a travs del cual se generaba el ARN y luego la sntesis de protenas. En 1970, se determin que exista un proceso de transcripcin inversa de la informacin que provena del ARN y se diriga al ADN. Este proceso modific el llamado Dogma central. En 1998 los cientficos norteamericanos Andrew Fire y Craig C. Mello formularon sus primeros estudios sobre el funcionamiento del ARN de interferencia, por lo cual obtuvieron el Premio Nobel de Medicina el ao 2006. El ARN est compuesto qumicamente por: Un azcar (la ribosa), una cadena de fosfatos y cuatro bases nitrogenadas (purinas: adenina, guanina; y pirimidinas: citosina, uracilo). Debemos saber que existe una variante con respecto a las bases nitrogenadas: en el ARN, el uracilo reemplaza a la timina. El ARN acta como intermediario en la transmisin de las instrucciones genticas del ADN, as como tambin tiene una participacin muy activa en la sntesis de protenas. Las enzimas que sintetizan los ARN se denominan polimerasas.