Université Saad Dahleb de Blida Faculté de médecine Département de chirurgie dentaire 2eme année chirurgie dentaire Module de microbiologie

Dr S.OUKID

2011/2012

Introduction au monde microbien et anatomie fonctionnelle de la bactérie Plan du cours : I. Introduction au monde microbien 1. Historique 2. Place des micro-organismes dans le monde vivant 3. Généralités sur le monde bactérien Anatomie fonctionnelle de la bactérie A-MORPHOLOGIE DE LA BACTERIE B - STRUCTURE DE LA BACTERIE : 1. Eléments obligatoires : a) Appareil nucléaire ou chromosome bactérien b) Cytoplasme c) Membrane cytoplasmique d) Paroi bactérienne : structure et rôle 2. Eléments facultatifs a) Glycocalyx b) Flagelles ou cils c) Pilis d) Plasmides C-BIOFILM D-SPORE

II.

Bibliographie : Généralité : structure générale des bactéries , anatomie fonctionnelle des bactéries et application au diagnostic, Dr YALA Le monde microbien, Pr NAIM Le monde microbien, les virus et le fonctionnement de l’écosystème, CNRS, 2010

protozoaires. presentent un problème en médecine humaine par leur grande virulence et leur capacité de provoquer des infections graves ( ex : hépatite virale C) même mortelles (ex : tétanos) .1878) L'existence d'un monde microbien fut méconnue jusqu'à l'invention du microscope au début du XVIIème siècle La découverte des micro-organismes est attribuée au hollandais Antonie VAN LEEVENHOEK (1632 . Les bactéries et les virus omniprésents dans l’environnement. 1. ni des végétaux.Place des micro-organismes dans le monde microbien Les microbes ne sont ni des animaux. celui des Protistes.Historique Le mot « MICROBE » signifie « être vivant microscopique » (SEDILLOT . sont regroupés virus. Ils peuvent être bénéfiques et utiles tout autant que néfastes. qui a bénéficié des progrès de l’optique. Ils sont indispensables à l’équilibre de la biosphère en participant aux cycles élémentaires de la nature. Les protistes sont des êtres généralement unicellulaire (parfois pluricellulaires mais différenciation tissulaire) et se subdivisent en deux groupes : Les protistes supérieurs ou EUCARYOTES : sont des cellules identiques aux cellules animales ou végétales avec un vrai noyau et les différentes structures retrouvées dans le cytoplasme. bactéries. Sous ce terme. marchand de la ville de Delft. algues et champignons microscopiques. ils appartiennent à un 3eme règne crée par Haeckel . sont non pathogènes En chirurgie dentaire.8 milliards d’années et leur mise en évidence. un grand nombre de particules invisibles à l‘oeil nu. On considère qu’ils sont apparus il y a environ 3. on doit connaitre l’agent infectieux pour pouvoir le combattre et éviter l’infection. . Ils sont ubiquitaires et représentent la biomasse la plus importante de la Terre. remonte au XVIIe siècle. se sont des bactéries ou virus pathogènes. au moyen d'un microscopie rudimentaire de sa fabrication. il décrivit des formes diverses (sphères.I- Introduction au monde microbien Les microorganismes sont des êtres vivants invisibles à l’œil nu. spirilles) correspondant aux principales variétés morphologiques des bactéries La microbiologie médicale est née dans la 2eme partie du XIXeme siècle avec les travaux de Louis PASTEUR et Robert KOCH qui démontrèrent le rôle des micro-organismes dans la transformation de la matière organique (fermentation) et dans les maladies 2. certaines bactéries vivent à l’état saprophytes dans l’environnement ou à l’état commensal dans les flores de l’homme. où on est constamment confronter au risque infectieux et aux risque de complications infectieuses liées aux soins dentaires. qui-observa.1723). bâtonnets. qu'il appelait « animalcules » Parmi ces micro-organismes extrêmement petits. Toutefois.

Les bactéries se distinguent des cellules eucaryotes. cyanophycées). organite intra cytoplasmiques. se sont des parasite intracellulaires obligatoires des cellules eucaryotes ou procaryotes (bactériophages) . algues bleues . leur physiologie et leur pouvoir pathogène . 3. Elles représentent néanmoins des caractères structuraux et fonctionnels de base communs qui permettent de définir et de délimiter le monde bactérien. Depuis le milieu de XXo siècle . Les virus sont incapables de réplication autonome. . vegetales et animales non seulement par leur petite taille ( 1-10 micromètre). plasmide) sont des facteurs de variabilité qui retentissent sur les caractères phénotypiques. Au cours de l’évolution la bactérie à garder sa petite taille et aurait acquis une paroi alors que la cellule eucaryote aurait augmenté de taille en même temps que des formations particulières sur différenciaient à l’intérieur de la cellule ( la membrane nucléaire.).Généralités sur le monde bactérien Les bactéries sont des micro-organismes le plus souvent unicellulaires.. appareil de Golgi…. Constituant un outil préféré des généticiens (les bactéries constituent un système génétique simple. leur morphologie.- Les protistes inferieurs ou PROCARYOTES : sont des cellules atypiques avec un noyau primitif sans membrane nucléaire et dépourvues de nombreuses organites cytoplasmiques ( bactéries. tant sur le plan structural que sur le plan physiologique. L’étude générale des bactéries va nous montrer les corrélations entre structures et fonctions chez ces micro-organismes. mais aussi par leur structure particulières essentiellement l’absence de membrane nucléaire et leur mode de division ( par scissiparité). l’étude des bactéries a considérablement progresser. Adaptation au milieu ambiant ( spore). d’autre part leur pouvoir de synthétiser des molécules indispensables a leur croissance et leur multiplication. modification génétique (mutation. elles jouent un rôle fondamental dans le cycle de la matière : Interviennent dans l’équilibre biologique des espèces. Largement répandu dans le sol et les eaux. Très diverses dans leur écologie.) En perpétuel compétition avec les autres êtres vivants. Leur « anatomie » permet de comprendre d’une part. leur capacité de résistance dans le milieu extérieur. Mais des changements peuvent survenir. La bactérie se distingue des virus qui sont généralement de taille encore plus petite essentiellement par l’existence en elle à la fois d’ADN et d’ARN alors que les virus n’ont qu’un seul type d’acide nucléique.

II- Anatomie fonctionnelle de la bactérie Au microscope optique : On observe la plupart des bactéries. Les éléments obligatoires sont : appareil nucléaire ou chromosome bactérien. La morphologie ou la configuration externe et les groupements caractéristiques des bactéries ont pu ainsi être minutieusement décrit pratiquement dés leur découverte. Par contre l’étude de la structure « fine » des constituants internes de la cellule bactérienne n’a été entreprise qu’après l’apport de la microscopie électronique . . les pilis et les plasmides Une dernière structure : la spore qui s’individualise par le fait qu’elle représente à elle seule une bactérie entière mais sous un aspect différent Les bactéries ont la capacité d’adhérer sur n’importe qu’elle surface formant des biofilms . Ces caractères ont pendant longtemps tenu une grande place dans l’identification et la classification des bactéries. Parallèlement aux connaissances acquises sur l’aspect structural. MORPHOLOGIE DE LA BACTERIE Les bactéries apparaissent comme des corpuscules sphériques ( coque ou cocci) ou cylindriques ( bacilles) ou incurvées ( ex de bactéries : vibrions cholérique) ou hélicoïdales ( ex : spirochètes et tréponèmes) dans la plus grande dimension n’excède pas généralement 4 micromètre en moyenne . si ils se forment à la surface de la dent. constitué d’une molécule d’ADN bi caténaire en double hélice. cytoplasme.Eléments obligatoires a. les flagelles ou cils .Appareil nucléaire ou chromosome bactérien Représenté par un SEUL chromosome circulaire. Il mesure en général prés de 1000 fois la longueur de la bactérie. L’appareil nucléaire constitue le support de l’information génétique. les biofilms sont à l’origine de la formation de plaque dentaire qui évoluera vers la carie dentaire. L’étude morphologique des bactérie peut être effectué au microscope optique soit à l’était frais soit après coloration ( voir les diaporamas du cours) Pour les différentes formes des bactéries : voir diaporamas du cours. Ainsi est née une véritable « anatomie fonctionnelle » des bactéries. STRUCTURE DE LA BACTERIE La bactérie est une cellule vivante constituée d’éléments obligatoires et d’éléments facultatifs. 1. membrane cytoplasmique et la paroi bactérienne Les éléments facultatifs sont : le glycocalyx . ont été établies des corrélations entre chaque élément de structure et une ou plusieurs fonctions spécifiques.

Excrétion de diverses substances par la bactérie comme les enzymes extracellulaire et les exotoxines libérées par la bactérie. Il reste à l’état de gel permanent. .Membrane cytoplasmique Enveloppe mince composée de bicouche lipidique et de protéines membranaires (intégrées ou périphériques) La membrane cytoplasmique est en contacte soit avec le cytoplasme soit avec l’espace péri plasmique Membrane cytoplasmique des bactéries ne contient pas des stérols sauf celle des mycoplasmes Elle joue un rôle essentiel dans la vie de la bactérie. Nettement délimité par la membrane cytoplasmique. L’excrétion de ces substances peut intervenir dans le pouvoir pathogènes des bactéries. Il n’existe pas de réticulum endoplasmique. la membrane cytoplasmique est le siège des enzymes respiratoires ( la chaine respiratoire) apparaissant ainsi comme l’équivalent fonctionnel des mitochondries des cellules eucaryotes ( à retenir) . les chloroplastes.Régulation métabolique grâce à une perméabilité sélective . ni d’organites tels que les mitochondries. . c.Cytoplasme Le cytoplasme des procaryotes présente une structure simplifiée par rapport au cytoplasme des cellules procaryotes.Régulation osmotique permettant à la bactérie de conserver ses ions essentiels .De la taille du génome dépendent en très grande partie les capacités métaboliques des bactéries.D’autres part. b. l’appareil de Golgi. .Concentration de substance dans le cytoplasme jusqu’à 500 fois par rapport à la concentration du milieu extérieur . Ces dernières assurent l’entrée spécifique et active de substances déterminées utiles au métabolisme bactérien. il est essentiellement constitué de ribosomes et de diverses inclusions.Certaines molécules diffusent passivement à l’intérieur de la bactérie. d’autre nécessitent un transport actif utilisant des enzymes spécifiques appelées Perméases. C’est une membrane semi-perméable qui règle les échanges entre le cytoplasme et le milieu extérieur : . les lysosomes. C’est ainsi que les souches possèdent les génomes les plus petits ont des capacités enzymatiques limités ( germes exigeants) alors que celles qui disposent d’un génome plus grand disposent d’activités enzymatiques multiples ( germes non exigeants pour leur croissance). Il est composé d’une masse amorphe assez dense aux électrons.

Rigidité : protection du choc osmotique et maintien de la forme de la bactérie . . le peptidoglycane et la membrane externe séparé par un espace periplasmique où est libéré les enzymes bactériennes notamment les enzymes qui inactivent les antibiotiques.La paroi bactérienne La paroi bactérienne est une structure rigide retrouvée de manière quasi-constante .Joue un rôle de protection . car elle contient plus de peptidoglycane. On sait également que cette virulence est liée au fait que . le rôle des acides teichoiques pourrait être : récepteur des bactériophages .La capsule représente un facteur de virulence responsable du pouvoir pathogène de la bactérie ( ex pneumocoque).d. la paroi des Gram négatif sont composé d’une couche mince de peptidoglycane au dessus de la quelle se présente une membrane externe composé d’une bicouche lipidique mélangée à des protéines membranaires (porines) et des lipopolysaccharides LPS (support de antigenicité bactérienne et facteur de virulence :endotoxine) . fixation au lugol . La paroi bactérienne joue un rôle important : .Aurait un rôle dans l’adhésion des bactéries sur un certains nombre de cellules . décoloration par l’alcool et contre coloration à la fuchsine . en plus. Deux catégories : la capsule et le slime Rôle du glycocalyx : .Eléments facultatifs Ce sont des éléments qui ne sont pas retrouvés chez toutes les bactéries . la paroi des Gram positif est plus épaisse que celle des Gram négatif . seuls les mycoplasmes (espèce bactérienne naturellement dépourvue de paroi) n’en possèdent pas. et les bactéries qui ne retiennent pas les colorants : bactéries à Gram négatif de couleur rose.Structure de la paroi : L’affinité tinctorial de la bactérie après coloration de Gram permet l’étude de la paroi bactérienne : on distingue les bactéries qui retiennent les colorants : bactéries à Gram positif de couleur violet . La coloration de Gram se fait en 4 temps : coloration au violet de gentiane .Identification de la bactérie par son aspect tinctorial et ses propriétées antigénique . Certaines bactéries à Gram positif possèdent des polysaccharides et des protéines.Cible des antibiotiques 2. leur absence n’entraine pas la mort de la bactérie. Par contre. a.Porteur de facteur de virulence : LPS .Glycocalyx C’est tout composé renfermant des polysaccharides et situé à la surface de la paroi des bactéries à Gram positif ou situé à la surface de la membrane externe des bactéries à Gram négatif.Porteur de site de récepteur de bactériophages . La paroi des Gram positif est épaisse et contient 40 à 95% de peptidoglycane melangés à des acides teichoiques . L’ultra structure de la paroi montre qu’elle est constitué d’un élément structural essentiel et prédominant est : LE PEPTIDOGLYGANE (rigidité de la paroi et le maintien de la forme de la bactérie).

certaines bactéries subissent un phénomène : SPORULATION pour résister à ces conditions donnant ainsi des spores.Biofilm Un biofilm est une communauté de micro-organismes (bactéries. Le nombre : un ou plusieurs mais de spécificité différentes dans une même bactérie.La présence à la surface externe de la bactérie de substance capable de jouer un rôle dans le pouvoir pathogène peut être à l’origine de la production d’anticorps protecteurs on peut utiliser cela pour l’élaboration de vaccins efficace dirigés contre ces composés. b. c. qu’elle soit naturelle (débris cellulaires.La spore La spore n’est pas un élément structural (obligatoire ou facultatifs) : elle constitue à elle seule une bactérie sous un aspect différent Lorsque les conditions deviennent défavorables à la survie et à la multiplication . comme c’est le cas de la spore produite par Clostridium tetani agent du Tétanos. intervient dans le transfert des plasmides par conjugaison. Les biofilms se développent sur les dents et forment une plaque qui conduit à la carie. de nature protéique . 4. algues ou protozoaires).Flagelles ou cils De nature protéique : Flagelline joue un double rôle : mobilité et support de l’antigenicité H Plusieurs disposition possible à la surface bactérienne : peritriche .les cellules phagocytaires ne sont pas capable d’exercer leur rôle par suite de la présence de polysaccharides capsulaires. surfaces des eaux ) ou artificielle (prothèse. La spore peut être l’unité infectieuse de la bactérie . Il est autoréplication indépendamment du chromosome bactérien et autotransférable d’une bactérie donatrice vers une bactérie réceptrice par le phénomène de conjugaison. caractérisée par la sécrétion d’une matrice adhésive et protectrice. La sporulation est sous contrôle génétique. champignons.Plasmide : définition Fragments d’ADN bi caténaire extra chromosomique de taille variable Sous forme circulaire surenroulée.Pilis Filament rigides à la surface de la bactérie. séquestres. 3. d. Les bactéries qui peuvent produire des spores sont les bactéries du genre Bacillus et du genre Clostridium. . monotriche . cathéter). sonde. . Le biofilm peut se développer sur n’importe quel type de surface . bipolaire. adhérant entre eux et à une surface.La capsule est le support de l’antigenicité K pour l’identification bactérienne . Les pilis communs courts : Fimbrae joue un rôle dans l’adhésion et la colonisation des tissus Les pilis communs longs : pili sexuel codé par un plasmide (gène facteur F) .

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