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DITORIAL 5

1 | PRSENTATION
INTRODUCTION
|
Inra, une science pour limpact 8
Panorama 2011 10
Prix et distinctions 12
Investissements d'avenir 14
Les Mtaprogrammes : une recherche intgre face aux grands enjeux 16
2 | FAITS MARQUANTS SCIENTIFIQUES
Scurit alimentaire mondiale 20
Performances conomiques, sociales et environnementales
de lagriculture et de la foresterie 22
Attnuation de leffet de serre et adaptation de lagriculture
et de la fort au changement climatique 26
Valorisation de la biomasse pour la chimie et lnergie 28
Pour des systmes alimentaires sains et durables 30
Des approches prdictives en biologie 33
Agrocologie 37
3 | MISSIONS ET PARTENARIATS
Consolider le systme franais de recherche et d'enseignement 42
Anticiper, clairer, changer 44
Se mobiliser autour des grands enjeux 46
Structurer et valoriser nos actions dans les territoires 48
Poursuivre louverture linternational 50
Renforcer l'innovation et le partenariat avec les entreprises 53
Dvelopper les partenariats avec le monde agricole 55
Amliorer l'attractivit et moderniser la gestion 57
4 | REPRES 2010
Les hommes et les femmes 62
Les moyens financiers 64
Lorganisation et la structure 65
SOMMAIRE
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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


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pondre aux besoins dalimentation dune population large,
contribuer la bio-conomie qui fournit nergie, matriaux
ou produits partir du carbone vgtal renouvelable, sassurer
de la sant publique et prparer ladaptation des systmes
de production agricole aux changements climatiques, voil
ce qui a guid nos programmes proposs aux investissements
davenir en 2011.
Faire voluer nos comptences, mutualiser chaque fois que possible la gestion
et les rseaux, renforcer les outils collectifs ncessaires aux sciences de la vie, de
lenvironnement et de la socit de demain, voil ce qui a structur nos changements
internes en 2011.
Travailler en interaction avec dautres comptences, nationales au sein dAllEnvi
et internationales, publiques, coopratives et prives, discuter ds lamont avec
les agriculteurs, les collectivits, les associations, voil ce qui a modifi notre
partenariat en 2011.
Avec comme fil directeur le document dorientation 2010-2020, nous avons sign
avec nos ministres de tutelle le contrat dobjectifs 2012-2016. Cest lui qui, au-del
des animations scientifiques conduites par les 14 dpartements de lInra et au sein
des six grands programmes transversaux lancs ce jour, donne le sens des chantiers
dvolution conduire.
Nos travaux de recherche et dexpertise sont sollicits ; ils slargissent lchelle
internationale, mobilisant Agreenium pour rpondre aux demandes externes
de construction de capacit dans les domaines agronomiques et vtrinaires.
Ils contribuent linnovation technique et sociale. Nous sommes attendus pour
proposer des systmes alimentaires durables ; lInra, chercheurs, agriculteurs,
techniciens, administratifs sont plus que jamais mobiliss autour de cette Science
pour limpact.
Marion Guillou
DITORIAL
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


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INTRODUCTION
INRA, UNE SCIENCE POUR LIMPACT 8
PANORAMA 2011 10
PRIX ET DISTINCTIONS 12
INVESTISSEMENTS D'AVENIR 14
LES MTAPROGRAMMES :UNE RECHERCHE INTGRE
FACE AUX GRANDS ENJEUX 16
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PRSENTATION
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

7 W. Beaucardet
8

I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


INTRODUCTION
INRA, UNE SCIENCE POUR LIMPACT
LInra, moteur public de la recherche
agronomique mondiale
L
Institut national de la recherche agronomique (Inra), organisme de recherche finalise, produit des connaissances et accom-
pagne linnovation conomique et sociale. Dployant une science pour limpact, par sa capacit dimpulsion, de coordi-
nation, de diffusion et de transfert, ltablissement fdre une grande diversit dacteurs : acadmiques, socio-professionnels,
associatifs ou territoriaux. Tous participent pleinement la dfinition des activits de recherche et dinnovation de lInstitut. La
recherche agronomique doit tudier de faon intgre des questions complexes des chelles varies : depuis les mcanismes
fondamentaux du vivant jusquau fonctionnement des paysages et de la biosphre en passant par les comportements des indi-
vidus lchelle des territoires, des filires ou des marchs. La recherche agronomique fait galement appel un large socle de
disciplines : principalement les sciences de la vie (68% des comptences scientifiques de lInstitut), mais aussi les sciences des
milieux et des procds (12%), lingnierie cologique, les cotechnologies et les biotechnologies (8%), ainsi que les sciences
conomiques et sociales (8%) et les sciences du numrique (4%).
LInra simpose comme un acteur majeur de la recherche agronomique dans le monde par la qualit de ses productions scienti-
fiques. En nombre de citations, lInstitut maintient sa 2
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position mondiale dans le domaine de lagriculture et se place au 4
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rang
mondial en sciences des plantes et de lanimal. De plus, lInra se positionne dans les premiers organismes mondiaux en microbiolo-
gie, en cologie et en environnement (voir tableau). Par rapport 2009, le nombre de publications Inra a cr de 2,2% et de 40% par
rapport 2001. L'Institut est prsent dans le top 1% des institutions les plus cites dans 15 de ses 22 champs disciplinaires.
POSITION MONDIALE, EUROPENNE ET FRANAISE DE L'INRA DANS LE TOP 1% DES INSTITUTIONS LES PLUS CITES
CHAMP DISCIPLINAIRE
D'APRS LE NOMBRE DE CITATIONS REUES D'APRS LE NOMBRE DE PAPIERS*
Rang mondial Rang franais Rang mondial* Rang franais*
Agronomie 2
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/534 organismes 1
er
3
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1
er
Biologie vgtale et animale 3
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/997 organismes 1
er
5
e
1
er
Microbiologie 18
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/394 organismes 3
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13
e
3
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Environment/cologie 34
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/585 organismes 2
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15
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1
er
ESI
SM
a t mise jour le 1
er
mars 2012 afin de couvrir la priode du 1
er
janvier 2001 au 31 dcembre 2011.
*Les classements par nombre de papiers publis concernent les institutions appartenant au top 1% des organismes les plus cits pour la priode de 2001 2011.
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2011, anne de discussion et dlaboration du contrat dobjectifs
Couvrant la priode 2012/2016, le contrat dobjectifs a t sign le mardi 28 fvrier 2012, loccasion du Salon international de lagriculture, par les
ministres en charge de la recherche et de lagriculture, ainsi que par la prsidente directrice gnrale de lInstitut.
Il est le fruit dune rflexion dune anne entre ltablissement, ses ministres de tutelle (Agriculture, Recherche) et le ministre du Budget dans
un climat de confiance et de comprhension partages sur les dossiers que lInra doit prioritairement traiter dans les cinq prochaines annes.
Ce contrat dobjectifs a t labor pour mettre en place les objectifs scientifiques et institutionnels identifis dans son document dorientation
stratgique 2010/2020. Ce dernier avait fait lobjet dune vaste consultation en ligne des porteurs denjeux, avant dtre adopt par le Conseil
dadministration de lInstitut la fin de lanne 2010.
le-de-France
SEINE-ET-MARNE
VAL DE
MARNE
SEINE-
ST-DENIS
HAUTS-
DE-SEINE
VAL D'OISE
YVELINES
ESSONNE
Angers
Guadeloupe Guyane franaise
Alimentation
Animal
Plante
Implantations du centre Angers-Nantes
Centres Inra
LGENDE
Units exprimentales 2010
Implantations du centre PACA
Paris
Jouy-en-Josas
Versailles-Grignon
Lille
Nancy
Rennes
Tours
Poitou-Charentes
Bordeaux
Toulouse
Montpellier
Corse
Clermont-Ferrand
Theix-Lyon
Antilles-Guyane
Dijon
Avignon
Sophia-Antipolis
Orlans
Nantes
Colmar
KOUROU
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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


PANORAMA 2011
JANVIER
06/01 Publication :
dcouverte des facteurs Myc
Des chercheurs de lInra, du CNRS
et de lUniversit Paul Sabatier de
Toulouse ont dtermin la structure
et lactivit biologique de signaux
molculaires, appels facteurs Myc,
synthtiss par des champignons
mycorhiziens du sol dans le cadre de
symbioses. Les rsultats sont publis
dans la revue Nature du 6 janvier.
31/01 Nouveau conseil scientifique
Constitu pour quatre ans, le conseil
scientifique, instance de rflexion et
de proposition en matire de politique
scientifique et dvaluation des activits de
recherche, a t renouvel. Sa composition
reflte la volont de prendre en compte les
orientations scientifiques que lInstitut vient
de privilgier pour les dix ans venir.
30/01 Publication :
un silence trompeur
Des mutations gntiques, dites
silencieuses car elles nont pas de
consquences visibles directement,
peuvent en fait tre impliques dans
lapparition de maladies graves.
Rsultats publis dans la revue Nature
Genetics date du 30 janvier.
FVRIER
19-27/02 Salon International
de lAgriculture
Le stand de l'Inra explore l'univers de la
sant et illustre les travaux conduits par
lInstitut dans ce domaine sur des espces
stratgiques en culture et en levage.
28/02 - 02/03 Deuxime
confrence plnire de la Global
Research Alliance on agricultural
greenhouse gases (GRA)
Organise par lInra Versailles avec
le soutien des ministres en charge de
lcologie, de la recherche et de lagriculture.
MARS
30/03 Lancement du projet
Toulouse White Biotechnology
Un dmonstrateur prindustriel
pour dvelopper lutilisation du carbone
renouvelable.
AVRIL
05/04 Carrefour de lInnovation
Agronomique Rennes
Les protines laitires : aspects nutritionnels
et fonctionnels, de la prparation l'utilisation.
20/04 Publication :
la flore intestinale permet
de diffrencier les individus
Comme le groupe sanguin, trois
entrotypes, ou signatures
bactriennes intestinales, ont t
identifis par les chercheurs du
consortium europen MetaHIT,
coordonn par lInra et impliquant des
chercheurs de lInra, du CEA, du CNRS
et de luniversit dvry-Val dEssonne,
ainsi que ceux de Danone et de lInstitut
Mrieux. Les rsultats ont t publis
dans Nature du 20 avril.
MAI
04/05 LInra coordonne le projet
europen ANAEE pour comprendre
lvolution des cosystmes
Dsormais intgr la feuille de route
europenne, ANAEE (ANAlysis and
Experimentation on Ecosystem) permettra
la mise en place coordonne de plateformes
dobservation et danalyse des cosystmes
europens, terrestres et aquatiques.
06/05 Trois quipements
scientifiques majeurs pour le
ple de recherche de lInra Paca
La nouvelle serre Msocosme, le nouveau
btiment de quarantaine Entomopolis et un
spectromtre de masse permettront aux
scientifiques dexplorer de manire fine les
dynamiques qui se jouent entre les plantes
et lensemble des autres organismes au
sein des cosystmes afin denvisager une
agriculture durable.
24/05 AllEnvi publie
son premier rapport d'tape
La recherche environnementale franaise,
structure au sein de l'alliance nationale
de recherche pour l'environnement,
AllEnvi, dispose dsormais d'outils
partags pour rpondre aux grands dfis
environnementaux.
JUIN
6/06 Les plantes traire
rcompenses
Le Laboratoire Agronomie et Environnement
(LAE, Nancy) a t distingu par Curie,
rseau de valorisation de la recherche
publique, pour avoir t lorigine de lune
des dix plus belles histoires de transfert
de technologie. Ce trophe distingue une
belle russite, ne dune innovation du LAE :
traire les plantes pour en extraire des
molcules vgtales pour la pharmacie
ou la cosmtique.
29-30/06 LInra au Salon
International du Bio et
de lAgri-Durable
LInra a choisi dtre partenaire du SIAD
pour accompagner le dveloppement dune
agriculture durable capable de rpondre
la fois aux enjeux renouvels de lagriculture
et aux attentes de la socit.
9/06 Inauguration en Picardie
lObservatoire de Recherche
en Environnement
Cet observatoire situ Estre-Mons (80)
est un dispositif dobservation et
dexprimentation en environnement
sur les Agro-cosystmes, les Cycles
Biogochimiques et la Biodiversit (ACBB).
Les chercheurs y tudient sur le long terme
le cycle du carbone, celui de lazote et
lvolution de la biodiversit dans les sols.


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23/06 La recherche sur le bl
soutenue lors du G20 agricole
Une initiative internationale de coordination
des recherches pour lamlioration du
bl (Wheat Initiative), soutenue par des
organismes de recherche et des agences
de financement dune dizaine de pays, a t
adopte par les ministres de lagriculture du
G20. LInra, le Biotechnology and Biological
Sciences Research Council (BBSRC, Grande-
Bretagne) et le Centre International pour
lAmlioration du Mas et du Bl (Mexique),
se sont engags contribuer aux activits de
coordination de la Wheat Initiative durant les
quatre premires annes du projet.
JUILLET-AOT
13/07 Premire action Pilote
de la FACCE-JPI
L'initiative de programmation conjointe
Agriculture, scurit alimentaire et
changement climatique (FACCE-JPI),
co-dirige par la France (Inra) et le Royaume-
Uni (BBSRC), a lanc sa premire action
pilote intitule tude dtaille des risques
lis au changement climatique pour
lagriculture et la scurit alimentaire en
Europe, en collaboration avec des projets
internationaux.
21/07 Lancement du projet WallTraC
Coordonn par lInra, ce projet europen
de formation dexcellence de jeunes
chercheurs porte sur lanalyse de la paroi
des cellules vgtales. Un tel projet permet
de jeunes chercheurs dobtenir lissue
de trois ans une thse avec le prestigieux
label Marie Curie.
25/07 Des carabes contre
les mauvaises herbes
Une tude conjointe entre lInra
et le BBSRC (Royaume-Uni), conclut
que la prsence de carabes dans
les champs cultivs serait un moyen
de lutte biologique efficace contre
les mauvaises herbes. Ces rsultats
sont publis dans le Journal of Applied
Ecology* du mois daot 2011.
SEPTEMBRE
12-13/09 Runion du G20
dveloppement (Montpellier)
sur Promouvoir les partenariats scientifiques
au service de la scurit alimentaire.
14/09 Mtaprogrammes
et internationalisation
LInra a organis un atelier de rflexion
linternational sur ses mtaprogrammes.
Ce sminaire a rassembl 78 scientifiques
de haut niveau et responsables dorganismes
de recherche agronomique et universitaire
pour moiti de pays trangers afin didentifier
des actions conjointes possibles et
d'esquisser des modalits de collaboration.
21/09 Premire pierre du btiment
Xavier Leverve Jouy-en-Josas
La premire pierre du btiment Xavier
Leverve a t pose au centre Inra de
Jouy-en-Josas. Il permettra de rassembler
une large communaut de microbiologistes.
En 2013, les 350 spcialistes de lunit
Micalis (Microbiobiogie de lalimentation au
service de la sant) occuperont un total de
10 000 m dont les 4 000 m du btiment
Xavier Leverve.
OCTOBRE
12/10 Usine pilote du Projet Futurol
La premire usine pilote franaise du Projet
Futurol a t mise en fonction sur le site
de Pomacle-Bazancourt (Champagne-
Ardenne). Ce projet soutenu par lInra
vise mettre au point et commercialiser
un procd complet de production de
biothanol de deuxime gnration.
18/10 Jugement du tribunal
correctionnel de Colmar
Le tribunal correctionnel de Colmar a
condamn les faucheurs de vignes OGM
une peine de 2 mois de prison avec sursis.
Ils avaient entirement dtruit le 15 aot
2010 une parcelle de plusieurs dizaines de
pieds de vignes OGM, plants dans le cadre
d'une exprimentation en plein air.
NOVEMBRE
3-4/11 CIAG de Guadeloupe et
de Martinique sur les systmes
durables de production et
de transformation agricoles
aux Antilles et en Guyane
Organiss conjointement par lInra et
le CIRAD. cette occasion, Marion Guillou
a rencontr les reprsentants de ltat et les
partenaires acadmiques et professionnels
des deux les.
9/11 Lancement dAMAIZING
Le lancement officiel du projet
dInvestissements davenir AMAIZING
a eu lieu Versailles. Coordonn par lInra,
le projet a pour ambition de relever
les dfis dune production de mas durable
et de qualit. Il permettra de dvelopper
les technologies ncessaires la cration
de nouvelles varits pour faire face
des conditions agrocologiques en pleine
volution.
18/11 Premier bilan de ltat
des sols en France
Aprs dix ans de travaux, le Groupement
dIntrt Scientifique sur les sols dresse
le premier bilan scientifiquement quantifi
de ltat des sols de France mtropolitaine
et doutre-mer. Ce rapport fournit
aux citoyens et tous les acteurs de
lenvironnement les cls pour comprendre
les fonctions des sols, les services quils
rendent et les pressions quils subissent.
DCEMBRE
6/12 Rencontres parlementaires
sur lagriculture durable
Lexpertise de lInra a t sollicite pour la
7
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dition de ces Rencontres qui portaient
cette anne sur La relance agricole :
comment concilier comptitivit, dfi
alimentaire et environnement ?. Dans
sa contribution, lInra a prsent le dfi
alimentaire mondial lhorizon 2050.
7/12 Les Lauriers de lInra
Le Laurier de la recherche agronomique
est attribu Antoine Kremer.
13/12 Le monde agricole et lInra :
des partenariats pour linnovation
Adoption du rapport par le Conseil
dAdministration.


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PRIX ET DISTINCTIONS
LAURIER DE
LA RECHERCHE
AGRONOMIQUE
Le Laurier de la recherche
agronomique est dcern
une personnalit qui a contribu
dune manire exceptionnelle
au rayonnement de la recherche
agronomique.
Remis par Frdric Dardel,
prsident du jury international
et du Conseil scientifique de lInra.
Antoine
Kremer,
un gnticien
en chne
et en os
Directeur de recher-
che lunit mixte de
recherches Biogeco
(Biodiversit, Gnes
& Communauts)
lInra de Bordeaux, Antoine Kremer engage ds
les annes 80 des recherches lchelle euro-
penne sur la fort en sappuyant sur la gn-
tique des populations et la biologie volutive.
Associant des approches historiques et gn-
tiques sur plus de 2 600 forts, il reconstitue
le scnario de limplantation des chnes en
Europe et claire les mcanismes dadaptation
et de migration des espces forestires. Ses
travaux ont t consacrs au plan international
par lattribution en 2006 du prix Marcus Wallen-
berg, le Nobel de la filire bois.
LAURIER
JEUNE CHERCHEUR
Le Laurier jeune chercheur
rcompense le travail
remarquable d'un chercheur
recrut rcemment l'Inra.
Remis par Serge Poignant,
dput de Loire-Atlantique
et prsident de la Commission
des affaires conomiques
de l'Assemble nationale.
Anne-Clia
Disdier,
au bonheur
des douanes
Charge de recher-
che en conomie
au sein de lUMR
PSE (Paris-Jourdan
Sciences conomi-
ques), ses travaux
portent sur les effets des mesures tarifaires et
non tarifaires rglementations sanitaires, phy-
tosanitaires et techniques sur les changes
commerciaux et sur le bien-tre. Intervenante
dans de nombreux colloques internationaux en
sciences conomiques, Anne-Clia Disdier sest
aussi implique dans les projets de recherche
europens portant sur les changes agricoles
et alimentaires, TradeAG et AgFoodTrade.
LAURIER INGNIEUR
Le Laurier ingnieur est attribu
une personne ayant apport
une contribution remarquable dans
le dveloppement mthodologique,
la valorisation des rsultats
de recherche, le lien avec les besoins
de certaines professions.
Remis par Claude Birraux Dput
de Haute-Savoie, Prsident de lOffice
parlementaire dvaluation des choix
scientifiques et technologiques
(OPECST).
Andr Faur,
le cratif de
ladministratif
Directeur des ser-
vices dappui la
recherche du centre
de Toulouse, Andr
Faur est un homme
de lombre qui ne
man que pas de
lumi res. Il est le crateur doutils, dapplica-
tions et de solutions pour une administration
plus efficace. Aprs un dbut de carrire dans
la recherche en aquaculture, il devient suc-
cessivement responsable dune unit expri-
mentale en aquaculture, secrtaire gnral du
centre de Tours puis de Toulouse. Andr Faur
excelle par sa capacit dinnovation au service
dune administration moderne, et sa facult
mobiliser pour mettre en place les change-
ments ainsi construits collectivement.


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Les Lauriers de l'Inra 2011


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Andr Moretti,
lhomme des tomates malades
Assistant ingnieur, il a accompagn pendant
quarante ans la recherche sur lamlioration
des plantes lunit de Gntique et amlio-
ration des fruits et lgumes dAvignon. Andr
Moretti a contribu la dcouverte de nou-
velles sources de rsistance plusieurs mala-
dies de la tomate. Ce matriel sert de base
des programmes de recherches sur les rsis-
tances aux maladies chez la tomate. Ses travaux et expertises ont lar-
gement contribu la reconnaissance internationale de lInra dAvignon.
Agns Thomas,
toute en mesures
Assistante ingnieur au sein de lquipe Ani-
mal, Muscle, Viande, dans lunit des Her-
bivores Theix, prs de Clermont-Ferrand,
Agns Thomas est spcialise dans les ana-
lyses fines des nutriments chez le ruminant
en production. Elle orchestre les analyses
dacides gras chane courte du sang et
chane longue des produits carns et de
leurs drivs oxyds laide de diffrentes techniques (chromatogra-
phie liquide ou gazeuse, spectrophotomtrie)
Autres prix
Erwan Guichoux de l'unit mixte Bio-
diversit, gnes et communauts (Inra et
universit de Bordeaux 1) a reu le prix Jean
Lesbats le 14 avril 2011 pour sa thse sur la
prdiction de la qualit des bois de chne
pour l'levage des vins et des alcools.
Le 7 juin 2011, Gabriel Krouk, post-docto-
rant au sein de lunit Biochimie et physiologie
molculaire des plantes lInra de Montpellier
et un des laurats du prix AXA-Acadmie des
sciences a prsent ses rsultats de recherche
l'Acadmie. Ses travaux mettent en lumire
un mcanisme molculaire permettant aux
plantes de localiser le nitrate dans le sol.
Claire Duchet a reu le prix Setac-Europe
2011 (Society of Environmental Toxicology and
Chemistry) de la meilleure publication en valua-
tion du risque pour son travail de thse, ralis au
sein de lUMR ESE (Inra/AgroCampus Ouest) sur
lvaluation des effets des produits de dmousti-
cation sur des populations de puces deau dans
le Morbihan et en Camargue.
Rut Carballido-Lpez, charge de recher-
che lunit Micalis (Jouy-en-Josas), a t slec-
tionne pour le prestigieux Young Investigator
Programme (YIP) 2011 avec vingt et un autres
jeunes chercheurs en Europe. Ce programme a
t mis en place par lEMBO, Organisation euro-
penne pour la Biologie molculaire, qui promeut
lexcellence au plus haut niveau dans la recherche
en Biologie. Ses recherches sintressent la
forme des cellules bactriennes.
Catherine Feuillet, directrice de recherche
Inra, a t distingue par l'Association Amri-
caine pour lAvancement des Sciences (AAAS)
qui publie la revue Science. L'AAAS a annonc le
23 dcembre la nomination de Catherine Feuil-
let en tant que AAAS Fellow pour sa contri-
bution la comprhension des mcanismes
de rsistance aux maladies et lanalyse de la
structure et de lvolution des gnomes du bl
et de lorge.
LAURIERS DE LAPPUI LA RECHERCHE
Deux Lauriers de l'appui la recherche sont attribus deux techniciens de la recherche dont lapport
est trs particulier et significatif dans des activits dexprimentation, de formation et de transfert.
Remis par Jean-Yves Le Daut Dput de Meurthe-et-Moselle, Vice-Prsident de lOPECST.
Les membres du jury international
Prsid par Frdric Dardel, Prsident du conseil scientifique de l'Inra, Universit Paris V Descartes ; Pr. Nigel Brown, Premier vice-pr-
sident dlgu la politique de recherche de lUniversit dEdimbourg, Royaume-Uni ; Pr. Klaus Frohberg, Institut d'conomie de l'aliment
et des ressources, Facult d'agriculture, Universit de Bonn, Allemagne ; Pr. Claude Pichard, Mdecin chef du service de Nutrition, Hpitaux
universitaires de Genve, Suisse ; Dr. Jacques J. Neeteson, Directeur de lunit des systmes agricoles, Plant Research international, Wage-
ningen University and Research Centre, Pays-Bas ; Pr. Guiseppe Scarascia-Mugnozza, Directeur du dpartement Agriculture, sylviculture
et utilisation du territoire, Consiglio per le Ricerche in Agricoltura, Italie.
LInra, second best place to work
dans le monde
Dans le numro de juillet 2011, la revue scientifique amricaine the Scientist publie
les rsultats de son enqute annuelle qui vise valuer quelles sont les meilleures
institutions internationales pour travailler. Seul institut franais distingu, le
Centre Inra de Versailles-Grignon arrive en deuxime position aux cts dinstituts
internationaux de renom.


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Gabriel Krouk
C. Matre / Inra
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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


INVESTISSEMENTS DAVENIR
Les quipes de recherche de lInra
coordonnent ou sont partenaires de plusieurs
dizaines de projets laurats en 2011
LInra coordonne un quipement dexcellence (Xyloforest), un dmonstrateur (TWB), deux pro-
jets de Biotechnologies et Bioressources (AMAIZING et BREEDWHEAT), un institut dexcellence
en nergies dcarbones (IEED GreenStars). Il participe une vingtaine de laboratoires dexcel-
lence, plusieurs quipements dexcellence, infrastructures nationales, projets de recherche ou
IEED. Sont cits ci-dessous les projets dont le positionnement est au cur de la stratgie de
lInra.
CARTE DE FRANCE DES PROJETS COORDONNS PAR LINRA
OU DANS LESQUELS LINRA EST FORTEMENT IMPLIQU
Guadeloupe Guyane franaise
le-de-France
M 60 30 15 5
EQUIPEX - Infrastructures
FR GENOMIQUE
AMAIZING
PHEROTAXIS
COTE
XYLOFOREST
LABEX
Projets de recherche Dmonstrateurs - IEED
SPS
OSE
SITES
CEBA
VOLTAIRE MIHMES
BREEDWHEAT
TWB
GREENSTARS
IAST
AGRO
CEMEB
BIORARE
TULIP
SYNTHACS
BIOBANQUES
L
e programme
Investissements
davenir a ddi
des financements hautement
significatifs pour la recherche
et linnovation en France.
Il a cr des opportunits
pour les laboratoires
de lInstitut de concevoir
ou dtre partenaires de projets
denvergure qui sinscrivent
dans les priorits scientifiques
de lInra. Les succs obtenus
en 2011 permettent
de renforcer certaines
implications territoriales
avec les universits et de
dmarrer des projets innovants
avec les porteurs denjeux
des filires et des industries.
La plupart des projets associent
un panel de comptences dont
la rpartition gographique
dpasse le site principal,
traduisant ainsi les synergies
entre une politique scientifique
nationale et une stratgie
partenariale territoriale.
LABORATOIRES DEXCELLENCE
(LABEX) : BIOTECHNOLOGIES
VERTES, ENVIRONNEMENT,
SCIENCES HUMAINES
ET SOCIALES
Sciences des plantes de Saclay (SPS)
Le Labex SPS vise accrotre les connaissances
fondamentales de la biologie des plantes, notam-
ment en matire de biotechnologies vgtales,
dans le but d'laborer des systmes de culture
plus durables, et de dvelopper des utilisations
de la biomasse vgtale. Port par la Fondation
de coopration scientifique de Saclay et coor-
donn par lInra, le Labex SPS associe lInra,
AgroParisTech, le CNRS et les Universits dvry
et Paris Sud 11.
Agronomie et dveloppement
durable (AGRO)
Le Labex AGRO, centr sur les plantes dintrt
agronomique, a pour objectif de mettre en place
une approche intgre dtude des plantes
en milieu tropical, mditerranen et tempr,
depuis la gntique de la plante jusqu' ses utili-
sations finales. Port par Agropolis Fondation, ce
Labex associe lInra, le Cemagref, le Cirad, lIRD
et les universits de Perpignan et Montpellier 2.
Il est coordonn par Agropolis Fondation, dont
lInra est membre fondateur.
Vers une thorie unifie
des interactions biotiques :
rle des perturbations
environnementales (TULIP)
Le Labex TULIP, centr sur les interactions
entre organismes ou communauts en condi-
tions naturelles ou modifies par l'homme,
dveloppe des approches interdisciplinaires
alliant biologie et cologie. Port par le PRES
Universit de Toulouse, ce Labex associe lInra,
le CNRS, lInstitut national polytechnique de
Toulouse et lUniversit Paul Sabatier.
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volution, adaptation
et gouvernance des cosystmes
continentaux ctiers (COTE)
Le Labex COTE allie sciences physiques, chimiques,
biologiques et les sciences humaines et propose
une approche de modlisation originale destine
amliorer la capacit de prdiction de l'volution
des cosystmes en rponse aux changements
environnementaux (extinction, adaptation ou
transformation) et aux pressions anthropiques.
Port par le PRES Universit de Bordeaux, ce pro-
jet est co-coordonn par lInra et le CNRS-ENSCP
Bordeaux.
Centre dtude de la biodiversit
amazonienne (CEBA)
Le Labex CEBA a pour objectif didentifier des
pistes pour prserver les forts tropicales tout en
rpondant aux besoins des socits humaines
qui y vivent. Port par lUniversit Antilles-Guyane,
ce Labex associe le CNRS (coordinateur), lInra,
lInstitut Pasteur et lIRD.
Centre mditerranen de
lenvironnement et de la biodiversit
(CEMEB)
Afin dapporter des lments de rponse concrets
aux perturbations subies par la biodiversit, le
Labex CEMEB vise la cration d'un centre pour
lamlioration des connaissances, l'expertise,
linformation et lappui aux dcideurs publics
ou privs sur les enjeux dans ce domaine. Port
par lUniversit Montpellier 2, ce projet associe
le CNRS (coordinateur), lInra et lIRD.
Sciences, innovations et techniques
en socit (SITES)
Le Labex SITES cible ltude de la produc-
tion de la connaissance et de ses modes de
gouvernance aux diffrentes chelles territo-
riales. Le domaine de recherche sinscrit dans
un large spectre denjeux qui incluent agri-
culture et biotechnologies, technologies de
l'information et de la communication, nano-
technologies, sant et risques environnemen-
taux. Port par lUniversit Paris Est, ce projet
associe en outre le Cnam, lEHESS, lInra, lIRD
et lUniversit Paris 13.
Ouvrir la science conomique (OSE)
Le Labex OSE vise lanalyse des frontires de
l'conomie moderne, en examinant les liens
entre les sciences sociales (histoire, sociologie,
dmographie et sciences politiques) et en asso-
ciant d'autres disciplines comme les neuros-
ciences et les sciences cognitives. Il est port par
PSE-cole dconomie de Paris.
Institut d'tudes avances
Toulouse (IAST)
Le Labex IAST propose une approche scientifique
originale pour analyser les motifs individuels
de l'action, la mise en rseau des individus, les
politiques publiques, les tats-nations, la gouver-
nance et les marchs. Il est port par lUniversit
Toulouse 1 Capitole.
tude des gofluides et des volatils
Terre, Atmosphre et Interfaces
Ressources et Environnement
(VOLTAIRE)
Le Labex VOLTAIRE tudie la dynamique des
fluides au sein des diffrentes enveloppes (lithos-
phre, hydrosphre, atmosphre), ainsi que les
interactions entre ces dernires, en combinant
observations et approches exprimentales. Ses
domaines dapplication concernent les ressources
nergtiques et minrales et l'environnement
(eau, sol et air). Ce projet est port par lUniversit
dOrlans.
INSTITUTS DEXCELLENCE
DANS LE DOMAINE DES NERGIES
DCARBONES (IEED)
GreenStars
LIEED GreenStars permet la cration dun
ensemble de plateformes collaboratives regrou-
pant des acteurs hexagonaux de la filire de valori-
sation des micro-algues. Son objectif premier est
de dvelopper, lhorizon 2020, des composs
dintrts dont notamment des biocarburants
performants et des molcules haute valeur
ajoute grce des micro-algues utilisant les
missions de CO
2
et les substances issues des
rejets des activits humaines. Port par lInra, cet
institut rassemble 45 partenaires (organismes de
recherche publique, entreprises, collectivits ter-
ritoriales, ples de comptitivit).
INFRASTRUCTURES NATIONALES
DE RECHERCHE EN BIOLOGIE
France Gnomique
Le projet dInfrastructure France Gnomique
regroupe des dispositifs de squenage, de gno-
typage et de bioinformatique lchelle natio-
nale, afin daugmenter les capacits danalyse
des gnomes en France. Porte par le CEA, cette
infrastructure associe lInra, le CNRS et lInserm.
Biobanques
Le projet dInfrastructure distribue Biobanques
runit les acteurs du Rseau franais des bio-
banques, des tumorothques et des centres de
ressources microbiologiques de micro-orga-
nismes (mBRCs). Les quipes Inra responsables
du Centre international de ressources micro-
biennes (levures, bactries dintrt alimen-
taire, bactries pathognes des animaux et de
lHomme, bactries phytopathognes et cham-
pignons filamenteux) collaborent ce projet.
DMONSTRATEURS
PRINDUSTRIELS
EN BIOTECHNOLOGIE
Toulouse White Biotechnologies
(TWB)
TWB est un centre de recherches technolo-
giques au service de lindustrie franaise qui
cible la conception et la mise au point de pro-
cds bass sur lutilisation des enzymes et
des micro-organismes pour les biotechnologies
industrielles. Port par l'Inra, TWB est un consor-
tium qui rassemble des institutions publiques
(Inra, Insa, collectivits locales) et des entre-
prises prives du secteur.
QUIPEMENTS D'EXCELLENCE
EQUIPEX
Xyloforest
Xyloforest est une plateforme de recherche,
d'innovation et de services dans le domaine
Fort-Bois-Fibre-Biomasse. Son champ dap-
plication couvre ladaptation des ressources
forestires aux changements climatiques,
lingnierie du bois-construction, la valorisa-
tion nergtique et chimique des fibres et de
la biomasse forestire. Xyloforest vise doter
les laboratoires de recherche dquipements
de haut niveau afin d'accrotre les connais-
sances des systmes fort-bois et dvelopper
des solutions innovantes et durables capables
dajouter de la valeur aux forts. Ce projet est
coordonn par lInra.
BIOTECHNOLOGIES
ET BIORESSOURCES
AMAIZING et BREEDWHEAT :
deux projets coordonns par lInra
sur les biotechnologies vgtales
(voir faits marquants scientifiques)
AMAIZING : 9 millions deuros sur huit ans et
BREEDWHEAT : 9 millions deuros sur neuf ans.
Synthacs
Le projet Synthacs dveloppe des molcules
chimiques partir de la biomasse, en alterna-
tive aux produits ptroliers et sappuiera sur le
dmonstrateur prindustriel TWB. Port par l'Insa
Toulouse, il associe l'Insa, l'Inra et le CNRS.
Biorare
Le projet Biorare a pour ambition de propo-
ser des solutions innovantes pour acclrer la
valorisation des dchets organiques en nergie
renouvelable. LInra est associ ce projet port
par le Cemagref.
BIO-INFORMATIQUE
Mihmes
Port par l'Inra, ce projet a pour ambition de
modliser la rponse dun animal, dun troupeau
ou dun groupe de troupeaux aux infections et pi-
dmies, afin den rduire et matriser les risques.
Pherotaxis
Port par l'Inra, ce projet a pour objectif de
comprendre la communication par phromone
chez les papillons, afin de crer des nez artifi-
ciels utiles pour dtecter les pollutions environ-
nementales ou industrielles.
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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


LES MTAPROGRAMMES:
UNE RECHERCHE INTGRE
FACE AUX GRANDS ENJEUX
En 2011, trois mtaprogrammes ont t lancs et trois autres valids pour dmar-
rage en 2012. LInra conduira terme un total de huit mtaprogrammes sur une
dure de cinq ans avec reconduction possible, qui mobiliseront un tiers des moyens
de lInstitut. Les moyens allous tmoignent de limportance structurante des
mtaprogrammes dans la nouvelle politique scientifique de lInra.
D
ans son document
d'orientation
2010-2020, l'Inra
a dfini des priorits de
recherche dans un contexte
de changement global :
changement climatique,
demande accrue de produits
agricoles et alimentaires mais
aussi nergie et chimie vertes,
rarfaction des ressources
(sol, eau, biodiversit), enjeux
sur la sant humaine en relation
avec la malnutrition, le surpoids
et l'obsit. Pour traduire
ces enjeux globaux en
recherches, l'Inra a dcid
de mettre en place des
programmes de recherche
systmiques, intgrs et
interdisciplinaires, appels
mtaprogrammes. Ces
mtaprogrammes sont aussi
des leviers pour concevoir
des projets de dimension
internationale ports par lInra.
LES MTAPROGRAMMES LANCS EN 2011
SMACH : gestion intgre de la sant des plantes
La gestion de la sant des plantes de demain devra concilier efficacit et durabilit. Suite au
Grenelle de lEnvironnement, rduire de 50% lusage de produits phytosanitaires, est considr
comme une priorit. Les expertises collectives de lInra pesticides, agriculture et environne-
ment en 2005 et agriculture et biodiversit en 2008 tendent montrer quil est envisageable
de rduire la consommation dintrants phytosanitaires sans diminuer de manire significative
les productions et les revenus. Port par le chef du dpartement Sant des plantes et environ-
nement, le mtaprogramme SMACH engage des recherches pour renouveler les systmes de
culture dans une perspective de rduction des intrants et de prservation des gnes de rsis-
tance aux pathognes. Il fdre des recherches pluridisciplinaires dans le domaine de la sant
des plantes et plus particulirement entre domaines bio-cologique et socio-conomique. LInra
sappuie sur le Rseau dExcellence Endure et le programme Ecophyto 2018.
En 2011, la cellule de coordination du mtaprogramme a retenu deux projets et participe au finance-
ment de trois bourses de thse. Les recherches engages mobilisent 4 dpartements sur 5 centres Inra.
Atelier international sur les mtaprogrammes
de l'Inra Jouy-en -Josas le 13 septembre 2011.
B.Nicolas / Inra
Unit Exprimentale
de Gotheron sur les
productions intgres
en 2009
C. Matre / Inra
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ACCAF : adaptation au changement
climatique de lagriculture et de la fort
Le rapport 2007 du Groupement intergouvernemental dexperts sur le
climat prvoit, si lon rduit dici 2015 les missions mondiales de gaz
effet de serre, un rchauffement climatique modr de lordre de 2 C.
Si la tendance actuelle se
prolonge, le rchauffe-
ment dpasserait 4-5 C.
Quel que soit le scna-
rio, il est ncessaire de
prparer ladaptation de
nos systmes agricoles
et forestiers. De plus, le
changement climatique
interfre avec dautres
modifications environne-
mentales, comme laug-
mentation de la concentration atmosphrique en CO
2
et en ozone, le dpt
atmosphrique dazote, lintroduction despces, le changement dusage
des sols, lensemble de ces modifications ayant des effets conjoints sur
les cosystmes. Pilot par le chef du dpartement cologie des forts,
prairies et milieux aquatiques, le mtaprogramme ACCAF a pour ambition
dengager des recherches pour tudier les effets conjoints de ces diff-
rentes modifications sur les cosystmes, afin de proposer des stratgies
dadaptation pour les espces cultives ou domestiques, les pratiques, les
systmes de production et les filires. Il sappuie notamment sur lAtelier
de rflexion prospective ANR Adage anim par lInra.
En 2011, la cellule de coordination du mtaprogramme a retenu pour
financement huit projets de recherche sur 35 dclarations dintrt,
neuf actions linternational, ainsi que trois bourses de post-doctorants.
Le mtaprogramme participe au financement de 4 doctorants. Les
recherches engages mobilisent 11 dpartements sur 17 centres Inra.
MEM ou M2E : mta-omiques
des cosystmes microbiens
Les micro-organismes constituent 95% de la biosphre et sont gn-
ralement prsents sous forme de communauts mixtes dont la biodi-
versit est plus ou moins importante suivant les environnements. Ces
cosystmes microbiens
ont une utilit dans des
domaines aussi varis
que lagriculture et lle-
vage, la sant humaine
et animale, lalimentation,
la production dnergie
renouvelable et de mol-
cules (biotechnologie) en
lien avec la dpollution et
plus gnralement le trai-
tement de dchets, ainsi
que le changement climatique global. Port par le chef du dpartement
Microbiologie et Chane alimentaire, le mtaprogramme MEM ou M2E a
pour ambition, dengager des recherches pour caractriser les rpertoires
de gnes dans les cosystmes, dvelopper des analyses intgratives de
grands ensembles de donnes telles que gnres par les approches de
mtagnomique notamment et intensifier les interactions entre biologie
exprimentale et thorique.
En 2011, la cellule de coordination du mtaprogramme a retenu pour
financement 8 projets sur 28 dclarations dintrt, ainsi quune action
linternational. Le mtaprogramme participe au financement de quatre
bourses de thse. Les recherches engages mobilisent 7 dpartements sur
8 centres Inra.
SELGEN : Slection
gnomique
Lamlioration gntique, aussi bien dans
le domaine vgtal quanimal, reste un
levier de choix pour innover vers une
agriculture cologique et productive.
La slection gnomique se met en place
grce lessor des connaissances sur
le gnome des espces agronomiques
(squence complte, caractrisation
de polymorphismes rpartis haute
densit sur lensemble du gnome)
et au dveloppement de techniques
permettant la caractrisation haut
dbit des variations nuclotidiques.
Parce quelle donne une estimation ds
le plus jeune ge de la valeur gntique
des individus, la slection gnomique
permet dacclrer significativement
les programmes de slection, daccrotre
le progrs annuel, et denvisager la
slection sur de nouveaux caractres.
Lambition du mtaprogramme SELGEN
est de promouvoir de nouvelles
mthodes de slection, en dployant
des recherches transversales et
pluridisciplinaires, aux fronts de
science en slection, tout en abordant
simultanment les questions souleves
en sciences conomiques et sociales par
ces nouvelles mthodes. Dans la phase
de lancement du programme, les deux
espces phares sont le bl et les bovins.
GISA : Gestion Intgre
de la Sant Animale
La Sant des Animaux de production
constitue un enjeu multisectoriel.
Les maladies animales sont causes
de prjudices conomiques,
environnementaux, sociaux et peuvent
de surcrot affecter la sant publique.
Dans un contexte de globalisation des
changes de denres et danimaux,
daccroissement des dplacements
humains, danthropisation de zones
abritant la faune sauvage et de
dsquilibres dans les cosystmes,
le risque infectieux dans llevage et
ses industries saccrot et acquiert une
dimension plantaire. Le mtaprogramme
GISA vise dvelopper des mthodes
innovantes pour la sant animale, tout
en prservant lquilibre entre lanimal
et son environnement. Il aura une triple
ambition : comprendre lanimal et ses
pathognes, construire la sant dans
lexploitation et dans les filires, et
prserver lHomme et les territoires.
DIDIT : Dterminants
et Impacts de la Dite :
Interactions et Transitions
Lalimentation joue un rle central
en matire de sant publique. Elle est
la fois facteur de risque et facteur
de protection. Les enjeux en termes de
scurit alimentaire sont, dune part de
nourrir la plante en quantit suffisante,
mais galement de promouvoir des
systmes alimentaires sains qui
prservent les individus des risques
dobsit et de maladies mtaboliques
dus des dsquilibres nutritionnels.
Lambition du mtaprogramme DIDIT est
de fournir des lments de connaissance
et de comprhension des comportements
et des effets des pratiques alimentaires
dans la perspective de contribuer
au bien-tre et la sant des
consommateurs tout au long de la vie.
Trois mtaprogrammes valids en 2011 pour lancement en 2012
Unit de recherche sur l'cosystme prairial
Clermont en 2011
S.Toillon / Inra
Laboratoire de mtagnomique Jouy-en-Josas
en 2010
W. Beaucardet
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Laboratoire de physiologie
de l'insecte en 2010
W. Beaucardet
SCURIT ALIMENTAIRE MONDIALE 20
PERFORMANCES CONOMIQUES, SOCIALES
ET ENVIRONNEMENTALES DE LAGRICULTURE
ET DE LA FORESTERIE 22
ATTNUATION DE LEFFET DE SERRE
ET ADAPTATION DE LAGRICULTURE
ET DE LA FORT AU CHANGEMENT CLIMATIQUE 26
VALORISATION DE LA BIOMASSE
POUR LA CHIMIE ET LNERGIE 28
POUR DES SYSTMES ALIMENTAIRES SAINS ET DURABLES 30
DES APPROCHES PRDICTIVES EN BIOLOGIE 33
AGROCOLOGIE 37
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FAITS MARQUANTS
SCIENTIFIQUES
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ans un contexte de
changement climatique
et de rarfaction
des ressources naturelles,
les systmes agricoles
se rvlent vulnrables
face aux alas climatiques
et conomiques, alors que
les dfis globaux lis
laccroissement
dmographique et lvolution
de la demande en termes
dnergie et dalimentation
conduisent produire
davantage. La scurit
alimentaire mondiale est
un enjeu prioritaire. LInra
investit dans la recherche
pour proposer des systmes
efficients et plus rsilients
aux alas.
Utilisation des terres et
impacts sur la durabilit
Les paysages ruraux dlivrent de nombreux services cosystmiques qui contribuent la dura-
bilit environnementale, conomique et sociale des rgions. Les gouvernements et dcideurs
souhaitent pouvoir recourir une valuation ex ante des impacts de scnarios de politiques
publiques. Cette valuation se doit dtre multicritre, associant notamment les aspects co-
nomiques, socitaux et environnementaux de la durabilit. Le projet Europen FP6 SENSOR
a dvelopp une plateforme simulant, dune part leffet de scnarios macro-conomiques sur
lutilisation des terres lchelle europenne et, dautre part, limpact de cette modification
des espaces ruraux sur la durabilit des rgions europennes. Le corpus de modles labors
estime une srie dindicateurs de durabilit, parmi lesquels un indicateur dimpact des effets sur
la biodiversit des niveaux dmission dazote et un indicateur dimpact des changements duti-
lisation des terres sur lavifaune infode aux agro-cosystmes. Cette batterie dindicateurs va
permettre lInra de poursuivre son rle de leader dans lvaluation multicritre des impacts de
changements dutilisation des terres, que ce soit lchelle de pratiques agricoles appliques
la parcelle ou dagencement spatio-temporel des territoires agricoles.
SCURIT ALIMENTAIRE
MONDIALE


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Lutter contre la volatilit
excessive des prix
par la production
Une initiative internationale sur le bl,
soutenue par des organismes de recherche
et des agences de financement dune
dizaine de pays, a t adopte par les
ministres de lagriculture du G20. Cette
initiative, coordonne par lInra, a pour
objectif de renforcer la synergie entre
les programmes de recherche conduits
lchelle internationale, pour contribuer
la scurit alimentaire mondiale, en
augmentant la productivit, la valeur
nutritionnelle et ltat sanitaire des
cultures.
Publication
Marion Guillou, PDG de l'Inra
et Grard Matheron, DG du Cirad
ont publi 9 milliards dhommes
nourrir. Un dfi pour demain
(Franois Bourrin ed.), un ouvrage
de rflexions et de propositions sur
le dfi alimentaire du 21
e
sicle.
Pour nourrir convenablement au moins
neuf milliards dtres humains en 2050,
il conviendra de produire en quantit
croissante une nourriture rpondant
des normes de qualit exigeantes.
Il faudra y parvenir en respectant mieux
lenvironnement et en outre tenir compte
quune partie des terres sera utilise
pour la production dnergie et de biens
industriels, ou le stockage de carbone
et la protection de la biodiversit.
Cela suppose donc dinnover, de rduire
les pertes et les gaspillages, de diminuer
les consommations alimentaires excessives
et dsquilibres et simultanment,
de sortir de la pauvret le milliard dtres
humains qui souffrent aujourdhui
de la faim.
Impact des comportements alimentaires
LInra a particip au rapport dit par la Commission sur lagriculture durable et le changement
climatique en rdigeant une contribution consacre aux comportements alimentaires. Aprs
avoir pos les enjeux lis ces comportements, notamment pour la scurit alimentaire, cette
contribution retrace les dernires volutions en la matire, mettant notamment en lumire
un mouvement de convergence des comportements alimentaires de par le monde, mme sil
convient de nuancer lide dune uniformisation qui sapparenterait une occidentalisation. La
contribution de lInra passe ensuite en revue les facteurs (conomiques, sociologiques, cultu-
rels) susceptibles dexpliquer les volutions des comportements alimentaires. Elle adresse
enfin tous les acteurs (consommateurs, exploitants, industriels) une srie de recommanda-
tions pour amliorer la qualit nutritionnelle des rgimes tout en respectant les impratifs du
dveloppement durable.
De nouvelles varits de bl et de mas
pour une agriculture durable
Pour rpondre au formidable dfi de produire plus en quan-
tit et qualit au sein dun systme durable, de nouvelles
mthodes de slection plus prdictives et cycle plus court
doivent tre mises en place pour le bl et le mas. Deux
projets soutenus par les Investissements dAvenir ont pour
objectifs de soutenir la comptitivit de ces deux filires :
BREEDWHEAT pour le bl et AMAIZING pour le mas. Ces pro-
jets visent la slection de varits amliores pour leur ren-
dement, qualit et tolrance aux stress dans un contexte de
changement climatique, en utilisant des outils molculaires
issus de la connaissance des gnomes et des approches
innovantes de phnotypage. Le projet BREEDWHEAT, prvu
sur 9 ans, rassemble 26 partenaires dont 12 UMR Inra et 11 partenaires industriels de
la recherche et de la slection du bl. Le projet AMAIZING, prvu sur 8 ans, rassemble
24 partenaires dont 13 UMR Inra, 7 partenaires industriels de la recherche et de la slec-
tion du mas, deux socits de biotechnologies et deux instituts techniques.
Circuits courts : innovations et performances
Les circuits courts alimentaires suscitent aujourdhui un fort engouement mais questionnent
les acteurs de leur dveloppement. Forte de son exprience pionnire sur ce thme, lInra sest
engag dans diffrentes recherches en partenariat, au niveau national et rgional, pour appro-
fondir la dimension conomique de ces circuits, analyser les situations dinnovation qu'ils com-
portent et dgager de nouveaux indicateurs de richesse.
humains qui souffrent aujourd hui
de la faim.
pi de mas
J.Weber / Inra
Vente directe la ferme (Drme)
M.Meuret / Inra
22

I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


L
es systmes agricoles
terrestres et aquacoles,
ainsi que les systmes
forestiers, doivent innover
pour la fois produire
davantage, dans des conditions
socialement viables et
prserver lenvironnement
pour les gnrations futures.
Il est essentiel de dvelopper
des filires comptitives
qui adhrent et participent
aux changements, dassurer
la coexistence dune diversit
des exploitations, tout en
limitant les intrants et en
garantissant un dveloppement
des territoires.
Substitution des produits marins dans
l'alimentation des poissons
Lexploitation des stocks de petits poissons
plagiques plafonne, ce qui limite fortement
lapprovisionnement en huiles et farines de
poisson, composants traditionnels des aliments
piscicoles.
Consquences environnementales values
par analyse du cycle de vie
En sappuyant sur un inventaire environnemen-
tal prcis des ingrdients des aliments pour
poisson et des expriences ralises dans des
fermes aquacoles, il a t possible de montrer
les effets sur lenvironnement de la substitution,
dans les aliments pour poisson daquaculture,
des huiles et farines de poisson de pche par des
produits issus de plantes cultives, en utilisant
la mthode Analyse du Cycle de Vie. Cette ana-
lyse montre labsence deffet de ce changement
de rgime sur la consommation nergtique,
et peu deffet sur les autres impacts si ce nest
laugmentation de lutilisation des terres.
Quand la slection accompagne les transi-
tions alimentaires en pisciculture
En tudiant des populations de truites arc-en-ciel et de bars, les chercheurs de lInra et de lIfre-
mer ont rvl lexistence de variabilit gntique de la capacit utiliser des aliments enti-
rement dpourvus de produits marins, remplacs par des produits dorigine vgtale. Cette
aptitude peut tre slectionne, ce qui ouvre de nouvelles perspectives pour la mise en place
dlevages piscicoles performants dans un environnement alimentaire en volution.
PERFORMANCES CONOMIQUES,
SOCIALES ET ENVIRONNEMENTALES
DE LAGRICULTURE ET DE LA FORESTERIE
Stand Inra au Salon International de l'Agriculture 2010
C. Matre / Inra
Salmoniculture exprimentale Rennes en 2001
C. Matre / Inra
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

23
Un vecteur poxviral induit
une rponse protectrice
vis--vis de la fivre
catarrhale ovine
Pour valuer le myxomavirus SG33,
un poxvirus de lapin attnu, comme
plateforme vaccinale chez les ruminants,
nous avons tudi son interaction
avec des cellules dendritiques de mouton.
Le profil dexpression gnique indique
une forte expression des gnes associs
la signalisation par les interfrons
de type I et prdit son efficacit vaccinale.
Les capacits immunognes et protectrices
vis--vis du virus Bluetongue ont t
valides chez lanimal cible.
Index de frquence
des traitements
par les antibiotiques :
un indicateur de durabilit
des ateliers d'levage
Nous proposons un indicateur qui permet
dvaluer les pratiques de traitement
des animaux par les antibiotiques en
levage. Lindex correspond au nombre
de traitements reus par animal et
par jour, sur une priode de rfrence.
Valid en levage cunicole, il reflte
la pression mdicamenteuse exerce
sur les animaux et sur lenvironnement,
ainsi que la dpendance des leveurs
vis--vis de lutilisation dantibiotiques.
Une analyse conomique
de la transition
agrocologique des filires
Dans le contexte d'une transition
agrocologique des filires
agroalimentaires, la contractualisation
entre agriculteurs et coopratives
ou industriels est au cur de
la rflexion stratgique des pouvoirs
publics et des acteurs des filires.
Nous avons montr qu'une intgration
des filires par des contrats de long
terme peut tre efficace pour assurer
le financement dinvestissements
spcifiques et une coordination
des acteurs, et pour grer des adaptations
techniques et organisationnelles.
Origine du franchissement des barrires d'espces
dans les maladies prions
Le prion est un agent infectieux de nature protique, responsable chez les mammifres de la
survenue des encphalopathies spongiformes transmissibles ou maladies prion (maladie
de Creutzfeldt-Jakob chez l'homme, tremblante du mouton et de la chvre, encphalopathie
spongiforme bovine). Si le cerveau constitue le site majeur de multiplication des prions, le tissu
lymphode est galement permissif certaines souches de prions lors de transmissions inter-
individuelles au sein dune mme espce. Nos rsultats montrent cependant que, lors de trans-
missions inter-espces en apparence infructueuses au plan neuropathologique, les prions sont
capables de se rpliquer silencieusement et efficacement dans le tissu lymphode des individus
atteints. Ces rsultats portent un clairage nouveau sur le potentiel zoonotique des prions et sur
les stratgies de dtection dindividus asymptomatiques.
Slectionner des poulets sur l'efficacit
digestive pour amliorer la comptitivit des
filires et rduire les rejets dans l'environnement
Lefficacit digestive des animaux contribue pour une large part leur efficacit alimentaire et
donc la comptitivit de llevage. Ainsi, chez le poulet de chair, 10% damlioration de leffica-
cit digestive se traduit par 10% damlioration de lefficacit alimentaire. Cette observation a
conduit la cration de lignes divergentes de poulets slectionnes sur une forte ou une faible
efficacit digestive. Nos rsultats montrent quil est possible damliorer lefficacit digestive
par slection gntique. Limpact environnemental de la slection divergente sur lefficacit
digestive a t valu, permettant didentifier des critres pertinents de slection pour limiter
les rejets dans lenvironnement. La slection danimaux produisant moins de rejets peut donc
tre envisage, en complment dautres voies, notamment nutritionnelles.
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Coq et poule de type chair
C.Slagmulder / Inra
Prlvement de salive sur une chvre Tours
G.Vasseur Delaitre / Inra
24

I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


Caractrisation et
utilisation dun gne
confrant une rsistance
aux galles chez les
porte-greffes Prunus
Cette recherche mene lInra tudie
les stratgies conomiques des acteurs
sur le march du conseil phytosanitaire.
Une enqute auprs d'acteurs du conseil
montre quils tendent promouvoir
diffrents types de pratiques moins
intensives (l'agriculture raisonne voire
intgre). Une recherche plus thorique
partir de la littrature sur les marchs
d'experts montre que l'aversion au
risque des agriculteurs peut influencer
les stratgies de conseil dans le sens d'un
usage plus important de pesticides.
La reproduction clonale
par graines : une premire
mondiale
Nous avons montr pour la premire
fois qu'il tait possible d'amener une
plante sexue produire des graines
gntiquement identiques leur mre.
Certaines espces de plantes produisent
ces descendants identiques par un
processus asexu nomm apomixie.
Les descendants ainsi produits sont
des clones identiques leur mre.
L'introduction de l'apomixie chez les
plantes cultives reprsenterait une
rvolution car elle permettrait de
multiplier n'importe quelle plante lite.
Nos rsultats montrent que lapomixie
peut tre mime chez une plante sexue.
Ulysse, un piment
pour les tropiques
Le rseau de slection de varits de
piment adaptes aux zones intertropicales
dlivre cette anne un premier hybride
F1 Ulysse pour la culture en Afrique de
lOuest. Ulysse est une co-obtention qui
cumule les rsistances aux 5 principaux
virus des cultures intertropicales, une
adaptation la saison sche et frache,
mais aussi la saison chaude et humide
pendant laquelle la production
de lgumes est dficitaire.
Ulysse est le rsultat dune collaboration
avec nos partenaires Cuba, au Soudan,
au Cameroun, et au Sngal.
La rsistance au mildiou de la vigne :
de nouveaux gnes et des gnes contourns
Une contrainte majeure pse sur la viticulture franaise : rduire l'usage des pesticides. La
cration de nouvelles varits de vigne rsistantes aux maladies constitue une des voies pour
rpondre cet enjeu. Nos recherches visent inventorier et caractriser les facteurs de rsis-
tance au mildiou de la vigne. Pour la premire fois, un isolat de mildiou surmontant un gne de
rsistance a t mis en vidence, ce qui montre que, malgr une utilisation encore restreinte des
varits rsistantes en viticulture europenne, le contournement de rsistances monogniques
peut survenir. Paralllement, une carte gntique de Vitis amurensis, une espce d'origine asia-
tique apparente la vigne cultive et constituant une ressource gntique d'intrt pour la
rsistance au mildiou de la vigne, a t tablie et a permis l'identification d'un nouveau facteur
majeur de rsistance au mildiou, nomm Rpv8.
Di@gnoPlant

: des applications mobiles


en protection des plantes
En France, les pathologistes et les structures de diagnostic font dfaut aux producteurs et aux
techniciens de nombreuses filires qui doivent grer des systmes de production complexes et
diversifis, et qui sont confronts lmergence de nombreux bioagresseurs autochtones ou
introduits. Or, lidentification prcoce et fiable des maladies, une pidmio-surveillance perfor-
mante, la prconisation de mthodes de protection optimises sont des services contribuant
rduire notablement lusage des pesticides. Pour faire face ces dfis, le portail Web e-Phytia en
protection des plantes a t ouvert en 2011, avec prs de 20 000 visites ce jour, et plusieurs
applications mobiles (smartphones-tablettes) de diagnostic/conseil sont maintenant diffuses
sur plateformes Apple et Android, afin de constituer un continuum de services en protection des
plantes, du Web au terrain.
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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

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Mthode optimise
de phnotypage
et reprsentation 3D
des peuplements
LInra, en sappuyant sur des travaux
sur le bl, a mis au point une simulation
informatique dynamique de la structure
3D des peuplements obtenus au cours
dexprimentations au champ.
Des mesures simples (dnombrement
des organes prsents, mesure de
dimensions), ralises entre 3 et
5 fois au cours du cycle, permettent
de simuler quotidiennement lvolution
dun peuplement du semis la rcolte.
Limpact dune
labellisation des produits
sur la concurrence
aux diffrents niveaux
dune filire
Nous avons tudi l'impact d'une
labellisation des produits d'un march
aval sur la concurrence aux diffrents
niveaux d'une filire. Bien qu'elle soit
mise en place uniquement en aval,
la labellisation facilite la diffrenciation
des produits aux diffrents niveaux de
la filire mais conduit aussi inverser
le classement des produits en amont.
Ces deux effets impactent la concurrence
en amont, dterminant, au sein de
la filire, qui gagne et qui perd, suite
la mise en place du label.
valuation ex ante des
impacts dune politique
de rglementation
des marchs de produits
alimentaires
Nous avons tudi la disposition payer
des consommateurs pour diffrentes
caractristiques environnementales,
sociales et/ou sanitaires des produits
agroalimentaires, via la ralisation
dexpriences en laboratoire.
Ces dispositions payer sont mobilises
pour examiner les effets attendus
en termes de bien-tre de diffrents
instruments de politique conomique
(label, taxe, standard de qualit
minimale) visant amliorer
le fonctionnement des marchs.
Le rle des technologies dans
les organisations ; le cas de la gestion
des ressources gntiques animales
En France, la gestion des ressources gntiques animales utilises en agriculture a repos
depuis les annes 1960 sur une coopration forte entre ltat, la recherche publique et la profes-
sion agricole, et un progrs gntique appuy sur des innovations scientifiques et techniques.
Des innovations scientifiques font voluer les modes de production de connaissances sur les
animaux et crent de nouvelles incertitudes sur les rles des acteurs et les organisations
mettre en place. La gestion des ressources gntiques animales domestiques, et notamment
des races locales, est aujourdhui au cur dune actualit renouvele et un enjeu fort pour le
maintien de la biodiversit. partir dune dmarche de recherche-intervention autour de la
slection des races ovines laitires locales des Pyrnes-Atlantiques, nous avons montr que
les technologies ont des effets sur les pratiques des acteurs et la manire dont voluent les
organisations de gestion de ces biens communs territorialiss.
La remonte de floraison
chez les Rosods (fraise et rose)
est contrle par un rpresseur floral
La floraison est une tape cl dans la vie des plantes et ce processus dveloppemental est fine-
ment rgul par des facteurs endognes et environnementaux. Chez les Rosods comme le
rosier et le fraisier, la remonte florale, capacit fleurir plusieurs fois dans l'anne, est un carac-
tre slectionn pour produire des fruits ou des fleurs sur une priode longue et conserver ainsi
l'accs au march. Nos travaux, en partenariat avec un partenaire priv et des collaborateurs
japonais, ont permis de montrer que ce caractre est contrl par un rpresseur floral, homo-
logue TERMINAL FLOWER 1 chez ces deux espces. Ces rsultats reprsentent une avance
importante dans la comprhension des mcanismes de la floraison chez les plantes prennes
et ouvre des voies intressantes pour contrler la saisonnalit de floraison et pour tendre la
phase vgtative et/ou florale.
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Fleurs de rosier R. chinensis
'Old Blush' et de fraisier F. vesca
N.Mansion / Inra
Manex tte noire sur
un march Iraty (Pays basque)
Inra
26

I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


L
e changement climatique
a des effets visibles,
comme la stagnation
des rendements de crales
en Europe depuis quelques
annes, et les mesures
disponibles estiment que
les productions animales
reprsentent jusqu 18%
des missions de gaz effet
de serre. Il est donc ncessaire,
dune part dadapter les
systmes de production
au rchauffement climatique,
et dautre part didentifier
des pistes pour que forts,
cultures et levages puissent
contribuer attnuer
ce changement climatique.
La fort tropicale humide
profite de laugmentation de la concentration
en CO
2
atmosphrique !
Les forts tropicales humides, comme lensemble des cosystmes forestiers, sont soumises aux
changements environnementaux. Une augmentation de la vitesse de croissance de la fort ama-
zonienne a t mise en vidence au cours des dernires dcennies, mais lorigine de cette varia-
tion reste incertaine. Par une analyse rtrospective chez deux espces bien tablies sur lensemble
du plateau Guyanais, nous avons cherch comprendre si et comment laugmentation de CO
2
a
influenc leur fonctionnement foliaire. Lapproche a consist combiner des prlvements, dans
diffrents herbiers, de feuilles de deux espces darbres collectes de la fin du 18
e
sicle au dbut
du 21
e
sicle sur le plateau des Guyanes, des analyses isotopiques
13
C et
18
O de ces chantillons, et
une approche de simulation de scnarios de rponse des arbres aux changements environnemen-
taux prenant en compte les modles de fractionnement isotopique carbone et oxygne au cours
de la photosynthse et transpiration. Laugmentation de la concentration en CO
2
atmosphrique
au cours des deux derniers sicles a stimul la photosynthse des arbres en fort tropicale humide
guyanaise, sans changement de conductance stomatique. Lefficience dutilisation de leau de ces
arbres a alors augment. Ce rsultat est cohrent avec lacclration de la productivit des forts
tropicales humides observe depuis 50 ans.
ATTNUATION DE LEFFET DE SERRE
ET ADAPTATION DE LAGRICULTURE ET
DE LA FORT AU CHANGEMENT CLIMATIQUE
Cloches de mesure de N
2
O
Inra
Fort de Guyane
M.Meuret / Inra
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

27
conomiser 10%
de leau dirrigation
grce aux cailloux
Nous avons dvelopp une mthodologie
permettant une meilleure estimation
de la rserve utile des sols caillouteux
via la dtermination des capacits de
rtention en eau des lments grossiers.
Les rsultats obtenus montrent que les
lments grossiers peuvent fournir un
apport hydrique significatif aux cultures,
et pourraient contribuer une conomie
dirrigation de lordre de 10%.
Impacts des pratiques
agricoles sur le stockage
du carbone dans
une prairie permanente
Il existe une incertitude considrable
quant lvaluation de limpact du
changement climatique et de ses
vnements associs sur les changes
de carbone dans les agro-systmes.
Laugmentation de la squestration
du carbone dans les sols est considre
comme une piste cl pour rduire
les missions de gaz effet de serre.
Les prairies permanentes constituent
des puits de carbone qui attnuent
les missions de gaz effet de serre.
Selon les pratiques culturales, ces prairies
peuvent tre des puits ou des sources
de carbone.
Du rle du climat
sur les rendements
et les prix dun grand vin
Le dpouillement des donnes issues
des archives d'un clbre chteau
Bordeaux et couvrant les deux derniers
sicles permettent d'tudier l'volution
dans le temps de l'impact du climat
sur les rendements et les prix.
Les rsultats montrent comment
le prix et la production dun grand vin
ont t influencs par les conditions
climatiques, et comment cette influence
a pu tre, pour les rendements, tempre
par des innovations techniques et,
pour les prix, dcuple par la spculation
nourrie par des avis dexperts de plus en
plus diffuss.
Utilisation des symbiotes des lgumineuses
pour rduire le puissant gaz effet de serre, N
2
O
Les sols, et ainsi les activits agricoles, sont la principale source de N
2
O, puissant gaz effet de serre.
Les missions de N
2
O par les sols sont la rsultante du fonctionnement de mcanismes microbiens
conduisant la production de ce gaz (nitrification et premires tapes de la chane de dnitrifica-
tion) et du mcanisme microbien de consommation de ce gaz (dernire tape de la chane de dni-
trification). Une possibilit pour rduire les missions de N
2
O par les sols est dy amplifier la fonction
de rduction de N
2
O en N
2
, en crant des puits de N
2
O. Au cours dexprimentations en serre sur
du sol cultiv avec du soja inocul par diffrents micro-organismes naturels symbiotiques du soja,
nous avons transform un systme metteur de N
2
O en un systme consommateur de ce gaz.
Des travaux complmentaires de modlisation ont montr l'intrt environnemental quil y aurait
dvelopper des cultures de lgumineuses inocules avec des Rhizobia d'intrt, puits de N
2
O.
Variation de la production de mthane
par les ruminants
Le mthane est un des principaux gaz effet de
serre et la production de mthane reprsente une
perte denviron 8% de lnergie consomme par
lanimal. Chez les ruminants, le mthane entrique
est produit dans le rumen par les Archaea mthano-
gnes, mais aucun lien na t mis en vidence entre
labondance de cette communaut microbienne et
la quantit de mthane mis. Nos travaux montrent
que plus que labondance des Archaea, cest leur
diversit et leur activit mthanogne qui expli-
queraient les variations de production de mthane.
Lhydrogne tant le substrat principal de la mtha-
nogense, ce travail suggre que la production de
mthane et la structure du microbiote ruminal dpendent de la disponibilit de lhydrogne dans le
milieu. La multitude des interactions microbiennes prsentes dans le rumen indique quil ny a pas
un, mais des mcanismes microbiens lorigine des variations de la mthanogense et par voie
de consquence diffrentes stratgies pour rduire les missions de mthane par les ruminants.
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Un gnrateur climatique stochastique
Le principe gnral dune tude dimpact du climat sur l'agriculture, la fort ou l'environnement
ncessite de disposer de nombreuses rptitions de sries climatiques annuelles. Dans le cadre
du projet CLIMATOR, un gnrateur stochastique de temps, WACS-Gen, a t dvelopp pour
tre utilis dans ltude des incertitudes climatiques. On sintresse ici la simulation de cinq
variables climatiques (tempratures minimales et maximales, rayonnement global, prcipita-
tion et vitesse du vent) avec un pas de temps journalier. Le gnrateur WACS-Gen permet de
simuler de nouvelles chroniques des mmes variables dont les proprits statistiques sont simi-
laires celles de la chronique dorigine. Il est possible de gnrer autant de sries diffrentes que
souhait, ce qui permet, par exemple, dexplorer de faon assez fine la sensibilit au climat dune
culture par une utilisation conjointe d'un modle de culture et de WACS-Gen.
Vache avec appareil pour mesurer
le mthane rejet
O.Bernard / Inra
Nodules fixateur d'azote
Inra
28

I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


L
a plante est
confronte un dfi
dapprovisionnement
en nergie. Dans ce contexte,
la chimie verte du carbone
renouvelable avec, notamment,
la production dnergie partir
de matire organique vgtale
(ou biomasse) ouvre des
perspectives dun intrt majeur.
LInra conduit des recherches
importantes dans ce domaine,
en sattachant proposer des
pistes qui ne concurrencent
pas les usages alimentaires.
Xyloforest :
Plateforme dInnovation
Fort-Bois-Fibre-Biomasse du Futur
XyloForest est une plateforme
mutualise de recherche et
dinnovation pour les syst-
mes forts cultives pro-
duits & matriaux bois. Son
champ dapplication couvre
ladaptation des ressources
forestires aux changements
climatiques, lingnierie du
bois dans la construction, la
valorisation nergtique et
chimique des fibres et de la
biomasse forestire. Ce projet,
coordonn par lInra et laurat
en janvier 2011 du premier appel projets Equipex des Investissements dAvenir, a t lanc le
8 juillet 2011. Il concerne 14 laboratoires sur 6 rgions et associe 6 partenaires de la recherche
et de lenseignement suprieur, ainsi que le ple de comptitivit Xylofutur. Xyloforest dotera
les laboratoires concerns de dispositifs exprimentaux et dquipements de haut niveau dont
la mise en uvre est chelonne jusquen 2013 et le fonctionnement jusquen 2020. Le projet
permet daborder les questions scientifiques du gne au matriau travers une structuration
en 6 plateaux techniques consacrs aux itinraires sylvicoles de demain, aux biotechnologies
forestires, la gnomique et au phnotypage des arbres, lingnierie avance du bois, aux
produits composites base de bois et la xylochimie.
VALORISATION DE LA BIOMASSE
POUR LA CHIMIE ET LNERGIE
Biomasse aprs hydrolyse enzymatique
B.Nicolas / Inra
Lancement de Xyloforest
le 8 juillet 2011
A.Girard / Inra
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

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SOLEIL nous claire sur
la structure des protines
stabilisatrices des rserves
lipidiques de plantes
olagineuses
L'extraction des huiles partir des graines
dolagineux est coteuse en nergie
et polluante. Il est ncessaire de mieux
caractriser les composants des olosomes
qui constituent les lipides de rserves des
graines. l'aide du dichrosme circulaire
utilisant le rayonnement synchrotron
(SOLEIL, Saint-Aubin), nous avons obtenu
la structure secondaire de deux olosines
et de la calosine purifies et maintenues
en solution grce diffrents tensioactifs,
ce qui a permis de proposer un modle
de repliement de ces trois protines.
Nouvelles techniques de
sparation et dlucidation
de la structure
des amylopectines
L'analyse des amylopectines constitutives
des amidons, de dextranes synthtiss
enzymatiquement et de glycognes de
sources animales et vgtales a rvl,
dune part, la conservation et lhomognit
de la structure macromolculaire
globale des amylopectines de diffrentes
origines botaniques et, d'autre part, une
htrognit structurale variable selon
lorigine des dextranes et glycognes.
Des solutions savonneuses issues
de bio-ressources, un potentiel pour le secteur
des dtergents ou de la cosmtique
Des solutions savonneuses qui moussent, cela nest pas
extraordinaire ; une mousse de savon stable pendant plu-
sieurs mois, mme 60C, cela lest davantage. Dautant
plus si cette mousse peut aussi tre rapidement dtruite
en modifiant seulement son environnement thermique,
et ceci de faon rversible. La constitution dune mousse
aussi stable et thermosensible avec une molcule tensioac-
tive issue de bio-ressources est une premire. L'utilisation
d'agro-ressources des fins industrielles est un des grands
dfis du XXI
e
sicle, en contribuant notamment la substi-
tution de carburants d'origine fossile ou la formation des
biosynthons organiques pour l'industrie chimique. Dans
le domaine des dtergents, la part des produits dits verts
sur le march est encore trs faible. Dans ce contexte actuel
de chimie verte et de dveloppement durable, il faut donc
chercher renforcer cette part de produits plus respectueux de lenvironnement tout en tenant
compte galement de la biodgradabilit des molcules utilises.
Toulouse White Biotechnology (TWB) :
un futur centre dexcellence pour dvelopper les
utilisations industrielles du carbone renouvelable
Futur centre dexcellence pour les biotechnologies industrielles dites blanches, TWB favorisera
le dveloppement dune bio-conomie base sur lutilisation du carbone renouvelable. TWB
vise la cration et la conception doutils biologiques (micro-organismes, consortia microbiens
et enzymes) qui seront implants au cur de procds industriels innovants et rentables. Ces
procds ouvrent de nouvelles voies de production durable, notamment la synthse de mol-
cules nergtiques (biocarburant), partir de carbone renouvelable.
Laptitude la dgradation de la biomasse lignocellulosique
Afin doptimiser les procds de transformation de la lignocellulose, il est important de comprendre la structure molculaire de
ses composs, leurs proportions et leurs interactions, responsables de la rigidification de la paroi vgtale. Ladquation dun
vgtal un procd de transformation est en grande partie lie la structure des polymres constitutifs de sa biomasse ligno-
cellulosique, et de la lignine en particulier, polymre phnolique complexe qui doit tre dgrad pour permettre la transformation
des polysaccharides paritaux en biothanol. Pour mieux comprendre la structure de la lignine, en lien avec les mcanismes de
biosynthse, et afin de mieux le dgrader et/ou de le valoriser en tant que source de molcules phnoliques fonctionnelles, nous
avons tabli et valid in vitro, un nouveau modle mcanistique qui permet de mieux comprendre la structure de la lignine, ainsi
que les facteurs physico-chimiques intervenant dans la slectivit de sa formation, au cur de la paroi vgtale.
Mousse toujours stable aprs six mois
Inra
Inauguration TWB le 30 mars 2011
G. Cattiau / Inra
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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


L
es systmes alimentaires
intgrent toute
la chane alimentaire,
de la production des matires
premires leur transformation,
distribution et consommation.
Partout dans le monde,
des transitions alimentaires
brutales sont observes
qui conduisent des allergies
alimentaires et un risque
accru de maladies comme
le diabte. Il est crucial de
concevoir des systmes
qui prennent en compte
la qualit des matires
premires, leur transformation
et distribution, ainsi
que le comportement
du consommateur.
La flore intestinale diffrencie les individus
Lhomme vit en association permanente avec les bactries prsentes sur toutes les surfaces
et dans toutes les cavits de son corps, la majorit tant hberge par son tube digestif. Les
cellules bactriennes qui nous accompagnent sont au moins dix fois plus nombreuses que nos
propres cellules. Ces communauts, dynamiques et complexes, influencent profondment notre
physiologie, notre nutrition, ainsi
que notre immunit. De mme
quil existe des groupes sanguins,
trois entrotypes, ou signatures
bactriennes intestinales, ont t
identifis par les chercheurs du
consortium europen MetaHIT,
coordonn par lInra et impliquant
des chercheurs de lInra, du CEA,
du CNRS et de luniversit dvry-
Val dEssonne, ainsi que ceux de
Danone et de lInstitut Mrieux.
Ces signatures savrent indpen-
dantes de lorigine gographique
dun individu, de son ge ou de son
tat de sant. Elles sont principale-
ment dtermines par l'abondance de certains types de bactries mais aussi par leur potentiel
gntique (cest--dire par les fonctions que leurs gnes codent). Nous avons galement mon-
tr, en utilisant certains gnes bactriens en tant que biomarqueurs, qu'il existe des corrlations
entre ces marqueurs fonctionnels et des caractristiques telles que l'ge, le sexe, l'origine go-
graphique ou la masse corporelle des individus. Ceci apporte la preuve du concept selon lequel
lanalyse de la flore intestinale pourrait aider au diagnostic de maladies telles que lobsit ou la
maladie de Crohn. Lensemble de ces recherches ouvre de nombreuses perspectives d'applica-
tions dans le domaine de la nutrition et de la sant humaine.
POUR DES SYSTMES
ALIMENTAIRES SAINS & DURABLES
March aux lgumes de Rungis en 2010
March International de Rungis
E.Coli
NIAID
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

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Lactivit physique
haute intensit :
un remde contre
l'obsit infantile ?
Lactivit physique modre fait partie
de la stratgie de prise en charge du
sujet obse ou susceptible de le devenir.
Nous avons dmontr que l'exercice
intensif peut favoriser un bilan
nergtique ngatif, en affectant
les dpenses nergtiques, mais
surtout en diminuant la prise
alimentaire spontane dadolescents
obses. Cette modification des apports
nergtiques na pas t accompagne
de variation des sensations de faim,
ce qui suggre que les adolescents
ne sont pas risque de frustration
alimentaire.
Des souris dpourvues
de microbiote intestinal
consomment plus
de graisses
Nos rsultats sur l'effet du microbiote
dans le contrle de la prfrence
et la consommation d'mulsion
des graisses chez les souris montrent
que la prfrence et la consommation
des calories partir des graisses sont
augmentes chez les souris axniques.
Cette augmentation est due un
accroissement de la dtection orale
des graisses associ une diminution
significative de la sensitivit intestinale
et une drgulation des voies de
signalisation pour les graisses.
Le statut nutritionnel en acides gras
polyinsaturs n-3 influence le comportement
Un des enjeux actuels de sant publique vise la dfinition dune nutrition protectrice vis--vis
des altrations des fonctions crbrales, pour maintenir ltat de bien-tre individuel dans
ses composantes cognitives et affectives, et prvenir le dveloppement de pathologies men-
tales (dpression, troubles de la mmoire). Lobjectif gnral des recherches menes dans ce
domaine est de comprendre les rpercussions de diffrents apports alimentaires lipidiques
sur les troubles de lhumeur et les capacits mnsiques de sujets gs et obses. Les rsultats
montrent que, chez des souris, la carence toute la vie en AGP-I n-3 altre la mmoire spatiale et
les comportements motionnels du sujet adulte, sans exacerbation chez le sujet g. La plas-
ticit synaptique dpendante des endocannabinodes, lipides cls du cerveau, est altre dans
les structures majeures des comportements motionnels (cortex prfrontal, noyau accum-
bens). La reconstruction 3D des cellules gliales par microscopie fonctionnelle haute rsolution
met en vidence quune supplmentation nutritionnelle en EPA/DHA de courte dure restaure
le phnotype des cellules gliales des sujets gs et la mmoire spatiale, et rduit lexpression
des cytokines inflammatoires crbrales.
Rponses comportementales et
lectrophysiologiques des rats des odeurs
En utilisant des odeurs biologiquement pertinentes, nous avons observ que le recrutement des
neurones du tubercule olfactif chez les rats dpend de lodeur teste (nourriture, fces de rats
mles et de renarde en strus). En outre, la rponse sexuelle (frquence des rections pniennes)
observe lors de l'exposition des rats mles aux fces de rates en strus peut tre reproduite
par des concentrations particulires d'un mlange odorant simple. C'est la premire fois que des
rections sont provoques chez le rat mle par un mlange odorant synthtique, et la premire fois
quil est montr que le recrutement des neurones du tubercule olfactif dpend de l'odeur source.

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Quand le got fait sens
Le projet SensInMouth analyse la
dynamique de libration des solu-
ts lorigine des stimuli sensoriels
lors de la mastication dun aliment
chez lhomme. Deux paramtres cls
relis la physiologie ont t mis en
vidence in vivo : limprgnation du
produit par la salive et le transfert
des armes de la bouche vers la
cavit nasale. Ces rsultats ouvrent
des perspectives intressantes pour
la formulation de produits rpondant
des critres nutritionnels et pour
une meilleure acceptabilit par le
consommateur.
Rat brun du laboratoire
de neurobiologie de l'olfaction
C.Nicolas / Inra


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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


Dcontamination
par la lumire pulse
en industrie
La dcontamination par la lumire
pulse est un procd innovant bas
sur les proprits anti-microbiennes
de flashes de lumire de haute
nergie et de trs courte dure
(moins dune milliseconde).
Lapplication de ce procd ncessite
une meilleure comprhension de
ses mcanismes daction sur les
micro-organismes, en particulier sur
les spores bactriennes, contaminants
des industries alimentaires frquents
et particulirement rsistants.
Le comportement
au schage de produits
laitiers concentrs
De rcents rsultats permettent
de prdire la sensibilit au collage
de concentrs laitiers lors du schage
par dsorption et les caractristiques
des poudres ainsi obtenues.
La modlisation sappuie sur
lapproche SDP (logiciel
de prdiction des paramtres
de schage Inra) qui sest amliore
pour intgrer, la fois, les interactions
eau-constituants, grce une
mthode de dsorption filament
en verre et le gnie ractionnel,
grce lapproche REA (reaction
engineering approach).
Un logiciel daide au choix demballage
pour la filire Fruits et Lgumes frais
Pour augmenter la trs courte dure de vie des fruits et lgumes frais, une stratgie consiste
maintenir, dans leur environnement trs proche, une atmosphre teneur rduite en O
2
grce
un emballage dont les permabilits aux gaz (O
2
et CO
2
) sajustent parfaitement la respiration du
produit. Ce conditionnement
sous atmosphre modifie
est actuellement une alter-
native lusage intensif du
froid dans la filire Fruits et
Lgumes, trs coteux en
nergie. De manire choisir
lemballage le plus adapt
en termes de proprits de
transfert de matire au pro-
duit cible, lInra a dvelopp
un modle mathmatique
permettant de modliser les
transferts de gaz et ractions
de respiration associs dans
le couple emballage/produit.
Ces rsultats concernent le processus daide la dcision qui, partant du cahier des charges de
lemballage recherch (aliment emballer, dure de vie, temprature de conservation), rsultat
dun consensus entre les acteurs de la filire, restitue la liste des emballages les plus pertinents.
Impact carbone de l'alimentation
et qualit nutritionnelle
De nombreuses tudes suggrent de rduire la consommation de viande pour la
fois protger lenvironnement et la sant. Nous avons estim 4 kg de CO
2
eq par jour
l'impact carbone de l'alimentation des adultes franais, et avons confirm que les pro-
duits carns en sont les principaux contributeurs. Cependant, nos rsultats montrent
que remplacer, nombre de calories gales, de la viande par des fruits et lgumes,
ne permet pas de diminuer l'impact carbone journalier. En effet, une alimentation de
bonne qualit nutritionnelle implique l'ingestion de quantits importantes d'aliments
dans lesquels l'nergie est peu concentre, tels que les fruits et lgumes. Ainsi, mme
si ces aliments ont un faible impact carbone pour 100g, le fait de devoir en consommer
beaucoup pour atteindre un bon quilibre nutritionnel pourrait attnuer le bnfice
que leur consommation reprsente sur le plan environnemental.
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Repas de viande rouge
C. Matre / Inra


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a prdiction est
un lment cl pour
anticiper et orienter
les rponses des systmes.
Elle se nourrit de donnes
et de modlisation.
Les interactions complexes
qui rgissent la vie soprent
lchelle des micro-organismes,
des cellules, des organes ou
des organismes, dans des
environnements plus
ou moins fluctuants.
La biologie prdictive
sattache donc dcrypter
les interrelations qui existent
entre les informations
molculaires (portes par
les gnomes, les ARN, les
protines, les mtabolites),
les donnes de terrain
(phnotypages, observations
environnementales...), afin
de contribuer llaboration
de modles de prdiction.
La fcondation dtermine le phnotype adulte
Dans le cadre des recherches visant mieux connatre les mcanismes la source de l'laboration
du phnotype des animaux, nous avons tudi si la variabilit de l'activit mtabolique pouvait tre
corrle avec celle du phnotype des animaux adultes. La fcondation est le moment de rema-
niements importants dans l'uf : remodelage chromatiniens, initiation de l'activit transcription-
nelle. Les variations spontanes ce stade gnrent une grande varit de transcriptomes, de
protomes et de mtabolomes dont on ne peut pas encore prdire les consquences long terme.
Nous avons dvelopp des approches de micro-ingnierie permettant de faire varier avec prci-
sion le potentiel d'oxydorduction et l'activit mitochondriale de l'uf, afin d'observer les rponses
long terme des variations mtaboliques induites. Nous avons dmontr que la croissance des
souris et leur poids l'ge adulte sont dtermins par un mcanisme mtabolique dpendant,
la fois du niveau nergtique, et du potentiel redox de luf, au moment de la fcondation. La
pntration du spermatozode dans l'uf dclenche la reprise de l'activit mtabolique. Dans les
premires heures de la fcondation, le catabolisme oxydatif et les modifications concomitantes du
potentiel d'oxydorduction de l'uf se conjuguent pour orienter le dveloppement embryonnaire
et induire, aprs la naissance, de manire persistante et indpendamment des apports nutrition-
nels ultrieurs, des animaux de petite ou de grande taille.
DES APPROCHES
PRDICTIVES EN BIOLOGIE


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Thrapie cellulaire de
la dystrophie musculaire
de Duchenne chez le chien
Nos travaux sur les cellules souches
somatiques ont permis disoler et didentifier
chez le chien sain une population rsidente
du muscle squelettique. Leur pertinence
pour la thrapie cellulaire de la dystrophie
musculaire de Duchenne (DMD) a t
dmontre dans le modle canin de la
maladie. Ces rsultats reprsentent une
avance scientifique de 1
er
ordre en recherche
des maladies neuromusculaires rares.
Les strigolactones rgulent
lextension des mousses
Les strigolactones, nouvelle classe
dhormones vgtales qui rprime la
ramification des plantes vasculaires, sont
synthtises par la mousse Physcomitrella
patens. Chez cette plante non vasculaire,
elles ont un rle de communication chimique
entre individus en rprimant leur extension
en fonction de la densit, rle qui rappelle
le quorum-sensing des bactries rgul
notamment par les acyl homosrine lactones.
Maintien de la diversit
gntique dans
une interaction
virus-champignon
laide dun modle pidmiologique
nous avons analys comment la pression
de slection exerce par un mycovirus
sur son hte fongique permettait le
maintien de la diversit de la population
hte, et plus particulirement du
systme d'incompatibilit vgtative
des champignons. Ce systme de
reconnaissance du nonsoi intervient
dans le contrle des fusions somatiques
entre individus conspcifiques, qui ne
sont possibles quentre individus de
mme GCV (Groupe de Compatibilit
Vgtative).
Le modle seuil environnemental
latent : un outil pour valuer le potentiel volutif
partir de donnes d'observations
Le signal environnemental et le seuil qui dterminent pour chaque individu le phno-
type exprim sont des grandeurs conceptuelles inaccessibles l'observation. Nous
levons cette difficult en proposant le modle seuil environnemental latent. Ce der-
nier intgre dans un cadre statistique le modle seuil environnemental comme un
mcanisme latent (inobservable), et le connecte avec une caractristique environne-
mentale observable et des donnes gntiques d'apparentement entre individus. Ce
modle ouvre la porte l'tude de l'volution de la plasticit phnotypique en milieu
naturel et lintgration de donnes gnomiques (pouvant remplacer ou complter la
connaissance des apparentements). Il favorisera la valorisation des donnes de suivi
long terme l'chelle individuelle collectes au sein de dispositifs de type Observa-
toire de Recherche en Environnement.
Le bal des protines bactriennes
mis en lumire
LInra et le Max Planck Institute en Allemagne, ont visualis et caractris in vivo,
pour la premire fois, la construction de la paroi qui entoure les cellules bactriennes.
Cette paroi, barrire protectrice indispensable la survie des bactries est galement
la cible de nombreux antibiotiques comme la pnicilline. Cette tude a conduit une
comprhension fine du mcanisme de formation de la paroi et permettra de propo-
ser de nouveaux moyens de lutte contre des micro-organismes pathognes issus de
l'alimentation ou de l'environnement. Dun point de vue technique, ce travail est indit
et ouvre la voie ltude approfondie des dynamiques subcellulaires chez les cellules
bactriennes, longtemps inaccessibles en raison de leur petitesse et de la difficult
atteindre de tels niveaux de rsolution spatiale et temporelle en microscopie.
Cartographie d'expression des gnes
lors dune infection bactrienne
La rgulation de lexpression des
gnes intervient plusieurs niveaux
et des tudes rcentes ont mis en
vidence le rle capital que joue
lorganisation nuclaire. Nous avons
dmontr que, dans des cellules
immunitaires porcines, suite une
infection bactrienne, la position
des gnes up-rguls varie signifi-
cativement dans lespace nuclaire
alors que les gnes down-rguls
ne bougent pas. Il existe donc une
corrlation entre position nuclaire
et transcription des gnes.


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Physcomitrella patens
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Contrle chromatinien
et transcriptionnel
du dveloppement
de la graine
Le gne LEAFY COTYLEDON 2 code
un facteur de rgulation de la
transcription qui joue un rle cl
dans le dveloppement de la graine
dArabidopsis thaliana. Nous avons pu
caractriser les mcanismes molculaires
responsables de son expression trs
spcifique la graine. Nous avons
en particulier montr limportance
dune rgulation pigntique impliquant
des modifications de la chromatine.
qPFD : un dispositif
pour le criblage de
Stimulateurs de Dfense
Naturelle des plantes
L'outil qPFD (Puce Faible Densit
quantitative) a t cr pour dterminer
rapidement et faible cot le niveau
d'induction de dfense d'une plante.
Les dfenses suivies (28 au total)
sont rparties sur les principales
voies dcrites chez les plantes comme
impliques dans la rsistance induite
et trs conserves. L'outil est destin
cribler une nouvelle gnration
d'intrants des cultures appels
stimulateurs de dfense des plantes (SDP),
et comprendre leur mode d'action
pour amliorer leur efficacit.
Caractrisation
de linteractome :
un schma dorganisation
des processus biologiques
dArabidopsis
Grce une approche systmatique
de recherche dinteractions
protine-protine par la technique
de double hybride chez la levure,
nous avons construit le premier rseau
dinteractions grande chelle
chez Arabidopsis. Nous avons ainsi
rvl lexistence de 6 200 interactions
entre 2 700 protines qui permettent
de proposer un schma global
dorganisation des processus biologiques
chez Arabidopsis thaliana, assorti
de nouveaux liens fonctionnels.
Un nouveau mcanisme
de rponse des plantes au stress
Une nouvelle voie de rgulation implique dans la rponse des plantes au stress oxydatif a t
identifie en utilisant le gne modle AtFer1 chez Arabidopsis. Ce gne code une ferritine et est
induit par le fer. Par des approches pharmacologiques et gntiques, un lment cis, nomm DST
(DownSTream), prsent dans la rgion 3-transcrite non traduite dAtFer1, a t identifi et est
impliqu dans la dgradation du transcrit dclenche par un stress oxydant. Lidentification de
cette nouvelle voie de dgradation des ARN est la premire impliquant une squence cis, identifie
chez les vgtaux, qui ne semble pas faire intervenir de mcanismes pigntiques. Laltration de
ce contrle post-transcriptionnel montre que cette voie de dgradation est un mcanisme essen-
tiel permettant aux plantes de faire face aux conditions dfavorables de lenvironnement.
Une base de connaissances accessible
sur les composs des plantes
Lvolution des techniques analytiques et lintrt grandissant pour le mtabolome
gnrent des nombres croissants de profils mtabolomiques. Diffrentes bases de
donnes ont t cres, dont des bases de connaissances spcifiques dun orga-
nisme, et des bases de donnes spectrales spcifiques dune stratgie analytique.
MeRy-B est la premire plateforme pour les profils mtabolomiques de plantes par
RMN-1H. Elle a t cre pour : (I) fournir une base de connaissances de profils et de
mtabolites dtermins par RMN dans le domaine vgtal, avec les donnes expri-
mentales et autres mtadonnes associes, (II) interroger et visualiser ces donnes,
(III) comparer les profils mtabolomiques en utilisant des outils de visualisation et des
outils statistiques, (IV) faciliter lidentification des composs.
MeRy-B est accessible http://bit.ly/meryb.
Plantules d'Arabidopsis thaliana
C.Slagmulder / Inra
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Lhistoire de la slection
des bovins Crole est trace
dans leur gnome
Lexploitation des puces de gnotypage
haute densit renseigne sur
les polymorphismes lchelle
des gnomes entiers et permet
de retracer lhistoire des populations
par espce. Une tude rcente a permis
de prciser la contribution de diffrents
rameaux au gnome du bovin Crole
de Guadeloupe. Parmi les signatures
de slection observes, certaines sont
associes des caractres dadaptation
lenvironnement tropical (solidit
du squelette, mtabolisme lipidique,
dveloppement embryonnaire,
rsistance aux maladies).
PhyleasProg,
un serveur web ddi
l'analyse volutive
PhyleasProg est une bote outils
ddie aux programmes d'analyse
phylogntique. Sur un ensemble
de squences dintrt, lutilisateur,
dun simple clic, obtient
(I) les reconstructions des arbres
phylogntiques, (II) les calculs de
slection positive avec une visualisation
de ces rsultats sur la squence
de la protine et sur une structure
tridimensionnelle quand cela
est possible, et (III) il peut galement
explorer l'environnement gnomique
des gnes impliqus dans la requte.
Une part gntique significative du contrle
de la rponse immune chez le porc
Introduire des critres de robustesse dans les futurs schmas de slection pour produire des
animaux globalement plus rsistants des pathologies diverses est un des enjeux majeurs de
la prochaine dcennie. Afin dvaluer la faisabilit dintroduire des critres lis la sant chez
le porc, un programme d'analyse fine du contrle gntique de la rponse immunitaire com-
binant des approches gntiques et fonctionnelles a t mis en place. Nous avons mesur une
large gamme de paramtres qui caractrisent les rponses immunitaires innes et adaptatives
pour une mme population danimaux de race Large White, suite une vaccination. Les analyses
gntiques montrent que les paramtres immuns sont peu corrls et quun grand nombre
dentre eux a des variations hritables. Le transcriptome sanguin est informatif pour une partie
des caractres mesurs et pourrait permettre didentifier des biomarqueurs dintrt.
Une modlisation de la propagation
de la fivre catarrhale ovine
Prdire o et quelle vitesse une maladie va se propager partir de son point dintroduction per-
met dadopter des mesures adquates de restriction pour tenter de la contenir. La fivre catar-
rhale ovine (FCO) est une maladie infectieuse vectorielle due au Bluetongue Virus (BTV). Elle
est transmise par un insecte piqueur du genre Culicoides et touche les ruminants domestiques
et sauvages. Jusquen 2006, elle
navait jamais t diagnostique
en Europe centrale. En aot 2006,
lintroduction du srotype 8 du
virus (BTV-8) en Europe occiden-
tale dans la rgion de Maastricht
et son extension rapide aux Pays-
Bas, en Allemagne et en Belgique
cette anne-l, puis lensemble
de lEurope de lOuest les deux
annes suivantes, a constitu une
crise sanitaire majeure en sant
animale. Nous avons estim la
vitesse de progression du front de
cette infection en France, laide
dun modle spatial. Le front a
progress une vitesse moyenne
de 5,6 km/jour avec des vitesses
comprises entre 2,1 et 9,3 km/
jour selon le lieu et la priode. La
transmission de la FCO en France
sest donc faite majoritairement
de faon locale, faible distance
et de proche en proche.
Une mutation induit le phnotype
cornes branlantes en race bovine Charolaise
Face linterdiction probable moyen terme de lcornage des bovins, une approche gntique
apparat comme une solution de choix et plusieurs lignes gntiques sans cornes sont en cours
de slection dans diffrentes races, dont la ligne
Charolaise. Or, lobtention de telles lignes souffre
de lapparition frquente de cornes anormales
dans la descendance danimaux sans cornes. Nous
avons montr quune duplication de 10 bases,
entranant un dcalage du cadre de lecture du gne
TWIST1 sur le chromosome 4 bovin, est l'origine
du phnotype cornes branlantes chez les bovins
Charolais. Cette mutation agit en l'absence du gne
polled d'absence de cornes, crant ainsi un ph-
notype diffrent du phnotype scurred classique.
L'effet du gne est dominant et semble ltal l'tat homozygote. Cette dcouverte ouvre d'impor-
tantes perspectives pour la comprhension du dterminisme du cornage.
0 100 200 km
Septembre 2007
Octobre 2007
Novembre 2007
Dcembre 2007
Avril 2008
Mai 2008
Juin 2008
Juillet 2008
Aot 2008
Septembre 2008
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Bovin crole
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ous avons inscrit
lagrocologie dans
nos priorits, afin
de promouvoir des recherches
qui visent croiser lagronomie
et lcologie. Lobjectif est
de mieux comprendre les
interactions entre lagriculture,
llevage, la sylviculture,
les services des cosystmes
et leur environnement physique.
Une approche multichelle
permet de travailler de la
parcelle jusquau paysage,
ce qui devrait dboucher
sur des propositions de
systmes et pratiques agricoles
nouveaux la fois productifs
et durables.
Structure du paysage agricole et son influence
sur le risque pidmique vgtal
L'intensification de l'agriculture s'est accom-
pagne d'une simplification des paysages
agricoles rendant nos agrocosystmes plus
sensibles au risque pidmique. L'utilisation de
la diversit gntique des cultures est une piste
prometteuse pour rduire ce risque tout en
rduisant l'usage des pesticides. Elle ncessite
cependant une gestion collective des espaces
agricoles et, pour commencer, une meilleure
comprhension du rle de la structure du pay-
sage et de la diversit gntique des plantes
cultives sur le contrle des pidmies. Pour
aborder cette thmatique, il est indispensable
de s'appuyer sur des approches de modli-
sation l'chelle du paysage, intgrant des
connaissances l'interface de l'agronomie, de
l'cologie et des mathmatiques appliques.
Le dveloppement d'un modle de statistique
baysienne appliqu la rouille brune du bl
en France a permis de quantifier les relations
fortes entre la composition varitale du pay-
sage, la structure gntique des populations
de rouille, et le niveau de maladie observ dans
les parcelles. Des approches plus thoriques de modlisation ont t dveloppes l'chelle du
paysage, intgrant de la dynamique de population locale, de la dispersion, et de la dmo-gn-
tique. Ainsi, par une dmarche de statistique et de modlisation l'chelle du paysage, nous
avons dmontr la possibilit de mieux comprendre et exploiter le systme dynamique form
par l'interaction entre varits cultives et populations de pathognes.
AGROCOLOGIE
Suivi des peuplements de carabes
C. Matre / Inra
Vue arienne de champs en Picardie
JP Tissier
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NitroScape : proposer des
stratgies dattnuation
des missions dazote
Le modle NitroScape a t
dvelopp pour simuler les transferts,
transformations et bilans dazote ractif
(NH
3
, NO
3
-NO
x
, N
2
O) lchelle du paysage
agricole. Il intgre simultanment quatre
compartiments du cycle de lazote :
exploitations agricoles, agrocosystmes,
atmosphre et hydrosphre. Ce modle
vise tre utilis en recherche puis
en partenariat avec le dveloppement
agricole pour valuer limpact de scnarios
agroenvironnementaux et proposer
des stratgies dattnuation des missions
dazote et de gaz effet de serre.
Origine de la mineuse du
marronnier et identification
dun candidat en lutte
biologique
Ltude gntique dherbiers anciens
conservs dans les muses europens
a permis de confirmer, partir des feuilles
endommages au sicle dernier par
les chenilles, lorigine balkanique de
la mineuse du marronnier dInde et de
dgager des pistes pour la lutte biologique.
Cela renouvelle lintrt dutiliser les
collections anciennes, herbiers comme
collections entomologiques, en sappuyant
sur les techniques nouvelles dinvestigation,
en particulier molculaires.
Changements technologiques
pour rduire les effluents
La tendance la concentration gographique des levages intensifs, notamment
des productions porcines ou avicoles, observe de par le monde, en particulier
en France et au Danemark, se traduit par une concentration gographique des
effluents issus de ces levages, dont les effets nfastes en matire environnemen-
tale sont bien connus et aujourdhui manifestes. Cette tendance peut tre freine
par des rgulations environnementales, notamment, lorsque celles-ci sappuient
sur des politiques de limitation de lpandage des effluents dlevage, limage
de la Directive europenne Nitrates. Elles peuvent tout autant entraner chez les
producteurs des changements de technologie visant soit rduire leurs effluents,
soit limiter lpandage au bnfice du traitement du lisier. De tels changements
tendent alors renforcer les processus dagglomration de la production.
Impact du btail sur la communaut
microbienne dnitrifiante du sol
et l'mission de N
2
O
Le N
2
O est un puissant gaz effet de serre dont le potentiel de rchauffement global est environ
300 fois suprieur celui du CO
2
. Les missions biologiques de ce gaz sont principalement dues
au processus de dnitrification au cours duquel lazote soluble, nitrate ou nitrite, est transform
en gaz N
2
O ou N
2
. Certaines populations microbiennes possdent le gne nosZ codant la N
2
O
rductase et prsentent le poten-
tiel gntique de rduire N
2
O en
N
2
, vitant ainsi lmission du gaz
effet de serre N
2
O. Des travaux
rcents montrent leffet du btail
sur la proportion des populations
microbiennes telluriques pr-
sentant le gne nosZ et donc sur
limportance des missions de
N
2
O (% N
2
O/N
2
O+N
2
). Ainsi en
prsence dun btail important,
lmission de N
2
O est plus faible
du fait dune plus forte propor-
tion de populations prsentant
le gne nosZ capable de rduire
N
2
O en N
2
. La manipulation de la
composition de la communaut
microbienne dnitrifiante obte-
nue en introduisant dans un sol
des densits croissantes dune
souche bactrienne ne prsen-
tant pas le gne nosZ a permis de
confirmer la forte corrlation entre le niveau dabondance de nosZ et celui de lmission du gaz
effet de serre N
2
O. En conclusion, ces travaux dmontrent lorigine gntique de la rduction du
N
2
O en N
2
des sols et lintrt de prciser linfluence de leurs modes dusage sur la composition
de la communaut dnitrifiante pour llaboration de stratgies de mitigation.
Mesures agroenvironnementales favorables
la biodiversit
La perte et la fragmentation des habitats naturels sont les principales causes de lrosion de la
biodiversit. Les paysages agricoles sont le rsultat des dcisions dynamiques dusage des sols
de nombreux acteurs privs, en fonction des conditions fluctuantes des marchs. Nous avons
examin leffet de mesures agroenvironnementales incitatives visant prserver la biodiversit
dans les paysages agricoles. Nous dfinissons le cot et le bnfice cologique de deux types
de politiques publiques visant prserver une espce dans un paysage agricole affect par des
changements dusage des sols dus lvolution des prix des ressources agricoles. La premire
politique est une subvention pour augmenter la surface dhabitat dune espce. La seconde
politique est une taxe sur lusage de fertilisants. Nous montrons que ces deux instruments sont
substituables et que le cot dune politique de subvention peut tre diminu en compltant cet
instrument dune taxation des productions intensives.
Station de traitement du lisier
de porc dans une porcherie
C. Matre / Inra


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Rles positifs
des bandes enherbes
Les bandes enherbes sont des
lments semi-naturels introduits
en bord de cours deau depuis 2005
pour des raisons environnementales.
Elles reprsentent des linaires visibles
dans les paysages agricoles exempts
de tout produit phytosanitaire
et sont considres comme des
lments contribuant aux trames
vertes. Implantes et gres par
les agriculteurs, ces bandes ont
pour objectif de protger les cours
deau, des risques drosion et
dcoulement des intrants chimiques
(azote, produits phytosanitaires).
Il a t craint que le nouvel habitat
constitu par ces infrastructures
agri-environnementales ne serve
de rservoir des espces agressives
de la flore adventice et contribue
ainsi accrotre les difficults de
leur gestion par les agriculteurs.
Les travaux montrent que les bandes
enherbes naccroissent pas ce risque
mais tendent mme plutt limiter
lentre des espces adventices dans
les parcelles depuis les bordures
adjacentes.
Comment contrler le dveloppement
de la rsistance des bioagresseurs
aux pesticides ou aux varits rsistantes ?
Lutilisation de pesticides et lintroduction de varits rsistantes certains bioagres-
seurs (insectes, champignons, virus, bactries) en agriculture exercent une pression
de slection sur ces populations de bioagresseurs. Au cours du temps, lefficacit
de ces technologies peut diminuer si des rsistances aux pesticides ou aux varits
rsistantes se dveloppent. La durabilit des pesticides et des varits rsistantes est
donc en grande partie tributaire de leur utilisation. Sur la base dun modle spatiale-
ment et temporellement explicite, notre tude compare la performance de deux ins-
truments de politique publique : la zone refuge obligatoire (rgulation de command
and control) et la taxe sur les pesticides ou sur les semences des varits rsistantes
(instrument conomique). Nos rsultats montrent que le choix dinstrument dpend
de la mobilit des bioagresseurs et de lhtrognit des attaques de bioagresseurs
selon les exploitations agricoles.
Inscription au catalogue franais de deux varits
de bl tendre dhiver adaptes lagriculture
biologique : une premire en France
La demande en farines issues de lagriculture bio-
logique est croissante et laugmentation de la pro-
duction franaise ne suffit pas. Les importations
couvrent un quart des utilisations. Par ailleurs, les
rendements en agriculture biologique sont divi-
ss par deux par rapport la moyenne nationale
et lamlioration des rotations arrive un palier.
court terme, il semble donc que seule la culture
de nouvelles varits puisse accrotre le rendement
par hectare, sous contrainte de maintenir la valeur
boulangre en conditions de disponibilits en azote
trs limitantes la montaison. Aprs 10 annes
dessais en agriculture biologique puis 2 annes
dexprimentation spciale VAT du CTPS en agri-
culture biologique, les varits (lignes pures) de
bl tendre Hendrix et Skerzzo vont tre inscrites au
catalogue franais avec une mention AB. Appor-
tant un gain de 10 15% de rendement par rapport
Renan, varit la plus cultive en AB, leurs performances antrieures obtenues dans le rseau
ITAB sont ainsi confirmes. Et, condition indispensable en AB, la bonne qualit boulangre
faible teneur en protines a t valide sur la rcolte 2010.
Tavelure du Pommier
F. Didelot / Inra


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CONSOLIDER LE SYSTME FRANAIS
DE RECHERCHE & D'ENSEIGNEMENT 42
ANTICIPER, CLAIRER, CHANGER 44
SE MOBILISER AUTOUR DES GRANDS ENJEUX 46
STRUCTURER ET VALORISER NOS ACTIONS
DANS LES TERRITOIRES 48
POURSUIVRE LOUVERTURE LINTERNATIONAL 50
RENFORCER L'INNOVATION ET LE PARTENARIAT
AVEC LES ENTREPRISES 53
DVELOPPER LES PARTENARIATS
AVEC LE MONDE AGRICOLE 55
AMLIORER L'ATTRACTIVIT ET MODERNISER LA GESTION 57
3
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MISSIONS
ET PARTENARIATS
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

41 B.Nicolas / Inra
42

I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


Premier rapport dtape
dAllEnvi
Le premier rapport d'tape de l'Alliance nationale
de recherche pour l'environnement AllEnvi a t
prsent le 24 mars 2011. Les douze membres fon-
dateurs (dont lInra) et les quinze membres associs
dAllEnvi, organismes de recherche, universits et
grandes coles, entendent faire jouer la recherche
fondamentale et finalise un rle central, en France
et en Europe, dans la promotion dune socit inno-
vante ouverte lconomie et qui matrise les risques
environnementaux. Les travaux mens depuis sa
cration en fvrier 2010 par les groupes de travail
d'AllEnvi, runissant 250 experts scientifiques, ont
permis de renforcer la synergie entre acteurs de la
recherche en France et de proposer des orientations
programmatiques pour une recherche ambitieuse et performante.
La synthse des priorits issues des travaux des groupes thmatiques d'AllEnvi va contribuer
la programmation 2012 de l'Agence nationale de la recherche via notamment la soumission
de trois propositions concernant les risques environnementaux, le fonctionnement des cosys-
tmes en relation avec leur biodiversit et la prvision du climat aux chelles de temps interm-
diaires. En 2011, l'alliance a coordonn et labellis les infrastructures nationales dobservation
et dexprimentation pour la recherche environnementale (SOERE) qui ont pour objectif de
recueillir et mutualiser les paramtres observables et mesurables sur l'ensemble du territoire,
dans six grands domaines : ocan et atmosphre, surfaces et interfaces continentales, cosys-
tmes, biodiversit, homme et milieux, sciences de la Terre.
U
ne profonde
rnovation
des universits et
des coles a t impulse avec
la loi relative aux liberts et
responsabilits des universits.
Elle a conduit une vritable
refondation du partenariat
entre les tablissements
denseignement suprieur et
les organismes de recherche.
LInra sest fortement investi
dans la construction dalliances
impulse par le ministre charg
de la recherche afin de mieux
coordonner les principaux
oprateurs nationaux de la
recherche et de linnovation.
Ces alliances doivent dvelopper
collectivement des instruments
pour renforcer lattractivit
scientifique de la France et ainsi
attirer les meilleurs talents.
CONSOLIDER LE SYSTME FRANAIS
DE RECHERCHE & DENSEIGNEMENT


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101
Units mixtes
de recherche
57
Units propres
de recherche
49
Units
exprimen-
tales
40
Units
sous contrat
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Agreenium : une cole et un label internationaux
pour les doctorants
Dans le cadre de sa mission de promotion de la mobilit internationale et de renforcement
de lattractivit du dispositif franais denseignement suprieur et de recherche ltranger,
Agreenium a lanc en 2011 son cole internationale de recherche (EIR-A). Cette structure,
ddie la formation pour et par la recherche, place le doctorant au cur des questionne-
ments et des enjeux globaux du champ des agrosciences, l'coute des grandes questions de
socit et de lensemble du monde socio-conomique. Dans cette perspective, l'EIR-A cherche
dvelopper les capacits d'innovation des doctorants et des jeunes chercheurs au contact
des fronts de science. Sur la base de partenariats avec les coles doctorales, l'EIR-A propose un
parcours professionnalisant qui s'appuie sur les rfrentiels europens en considrant le doc-
torant comme un jeune professionnel. Ainsi, les doctorants de la toute premire promotion de
lcole, mise en place en 2011, se verront accompagns dans la construction de leur parcours
linternational. lissue de cette formation complmentaire de celle de leur tablissement dins-
cription, ils se verront attribuer le label Agreenium.
Plus des deux tiers des units de recherche Inra
sont en partenariat avec des universits,
des coles ou des acteurs de la recherche
publique
Le dispositif de recherche de l'Inra est organis au sein de prs de 200 units de
recherche, auxquelles sajoutent 49 units exprimentales. Environ 70% des units de
recherche sont mixtes ou sous contrat avec des partenaires de la recherche publique.
Linstitut compte 101 units mixtes de recherche (UMR) et 40 units sous contrat
(USC) avec un ou plusieurs partenaires. L'Inra n'est pas tutelle des USC mais y met
des moyens financiers et humains (techniciens, ingnieurs et chercheurs titulaires).
La convention-cadre signe entre lInra et la Confrence des Prsidents dUniversit
mentionne spcifiquement ce type dassociation. Parmi les 101 UMR, 58 sont par-
tenaires de plus de quarante tablissements d'enseignement suprieur (1 6 UMR
par tablissement).LInra est partenaire des sept ples de comptence rgionaux en
sciences et technologie du vivant et de l'environnement, qui regroupent lensemble
des grandes coles formant les agronomes et les vtrinaires franais. Ces grandes
coles partagent 54 UMR avec l'Inra. Les partenariats les plus nombreux sont avec
AgroParisTech (17 UMR), Montpellier SupAgro (15 UMR) et AgroCampus Ouest
(7 UMR). Les autres coles d'agronomie (Bordeaux, Clermont-Ferrand, Dijon, Lyon,
Nantes et Nancy) et coles vtrinaires (Alfort, Lyon, Nantes et Toulouse) partagent
de 1 4 UMR avec l'Inra. Pour complter, huit organismes de recherche franais sont
co-tutelles d'un tiers des units mixtes de l'Institut (29 UMR). Cest avec le CNRS et le
Cirad que lInra partage le plus dunits (13 UMR chacun). Mme si lassociation sous
forme dUSC sest renforce depuis 2009, la mixit du dispositif repose essentielle-
ment sur les UMR.
cole d't NFZ.forestnet
Nancy
Cest en Lorraine que ldition 2011 de
lcole d't NFZ.forestnet sest droule.
Elle a t consacre aux sciences du bois
et a rassembl 26 doctorants et jeunes
chercheurs de 13 nationalits diffrentes.
Dune faon gnrale, les coles dt
NFZ.foresnet visent former des jeunes
docteurs hautement qualifis dans
le domaine fort-bois et stimuler
les changes entre quipes des pays
concerns (Suisse, Allemagne et France)
mais aussi avec dautres pays invits.
Des alliances sur tous
les fronts de science
Outre Allenvi, dont lInra est membre
fondateur, lInstitut est prsent dans
les quatre autres alliances couvrant
les champs thmatiques prioritaires
dgags dans le cadre de la Stratgie
nationale de recherche et dinnovation.
Ainsi, en 2011, 3 ans aprs la cration
de lAlliance nationale pour les sciences
de la vie et de la sant, lengagement
de lInra est particulirement remarqu
dans le domaine de la nutrition et de
la sant humaines. Deux ans aprs
la cration de lAlliance nationale de
coordination de la recherche pour
lnergie dont lInra est membre
associ, les groupes de travail ont pos
les bases des premiers programmes de
R&D ncessaires la leve des freins au
dveloppement des filires nergtiques
de demain. De la mme manire, les
contributions de lInra lAlliance des
sciences et technologies du numrique
ont t affines dans le cadre du
renouvellement de laccord-cadre Inra-
Inria intervenu en novembre. LInstitut
a galement prcis sa participation au
sein de lAlliance nationale des sciences
humaines et sociales).


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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


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ans un contexte
de fortes incertitudes
sur lenvironnement
global et dune interrogation
lgard des consquences
du progrs scientifique,
lInra continue damplifier
son investissement en faveur
du dialogue et dune science
ouverte aux questionnements
de la socit, tout en favorisant
le dveloppement dun climat
de confiance fond notamment
sur lobjectivit et lintgrit
de ses pratiques. Paralllement,
les diffrentes instances de
lInstitut ont t fortement
mobilises sur la production
de prospectives et dexpertises
destines clairer la dcision
publique mais aussi renforcer
la capacit danticipation
de lInra.
Quel avenir pour les varits tolrantes
aux herbicides
Commandite par les ministres en charge de l'cologie et de lagriculture, lexpertise collective
Varits tolrantes aux herbicides (VTH), conduite avec le CNRS, a dress un bilan critique des
connaissances scientifiques disponibles sur les plantes cultives prsentant le trait gntique
de la tolrance un herbicide, tous modes dobtention considrs. Ces VTH visent dabord
proposer aux agriculteurs une rponse technique des difficults de dsherbage ; leur culture
est galement prsente comme permettant une rduction des quantits dherbicides utili-
ses. Lanalyse a pour but didentifier les questions spcifiques que posent leur production et
leur utilisation, en termes dimpacts agronomiques, environnementaux et socio-conomiques
dans le cadre des politiques publiques notamment du plan Ecophyto 2018 qui vise rduire
de moiti lusage des produits phytosanitaires en agriculture. Lexpertise runissant un collec-
tif pluridisciplinaire, constitu de chercheurs dorigines institutionnelles diverses (Inra, CNRS,
universits) reprsentant un large ventail de comptences (cologie, agronomie, chimie des
herbicides, gntique, conomie, droit), fait le point des connaissances scientifiques sur les
modalits d'obtention des VTH et sur les conditions de leur adoption. Un des rsultats montre
quune utilisation rpte de VTH, sous certaines conditions, pourrait les rendre inefficaces
moyen terme. Cette expertise conduit aussi souligner la ncessit dune gestion des adven-
tices ne sappuyant pas uniquement sur ces innovations varitales, mais intgrant diffrentes
approches complmentaires en intgrant une large palette de leviers gntiques, agronomiques
et organisationnels. La composition de la rotation est notamment un lment dterminant.
ANTICIPER, CLAIRER, CHANGER
Visite du site de recherche
sur la fort et le bois Pierroton
B.Nicolas / Inra
Restitution des
rsultats de l'expertise
scientifique collective
sur les varits
tolrantes
aux herbicides
C. Matre / Inra
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

45
Publication de la nouvelle charte
de lexpertise scientifique de lInra
LInra publie en mars 2011 sa nouvelle charte de lexpertise scientifique institution-
nelle. Cest la dclinaison de la charte nationale de lexpertise adapte aux spcificits
de lInstitut. Issue des recommandations du Grenelle de lenvironnement, cette charte
nationale constitue une rfrence pour lensemble des tablissements de recherche et
denseignement suprieur, et fournit un socle de principes communs qui doivent gui-
der la mise en oeuvre des expertises conduites en leur sein. Les principes raffirms
dans ce document visent garantir la comptence des experts, lindpendance de
lexpertise base sur la transparence en matire de conflits dintrts, la traabilit des
sources, lexplicitation de la mthode, la clart des conclusions, et le devoir dalerte.
Les oprations dexpertise scientifique collective de lInra sont utilises par les pou-
voirs publics pour clairer leurs politiques, mais galement par les chercheurs, pour
orienter leurs programmes de recherche.
Estimer limpact de la recherche publique
Au niveau international, diffrents lments concourent au renforcement de la demande
d'une mesure objective et robuste des retombes socio-conomiques de la recherche.
Toutefois, si lanalyse des impacts de la recherche publique a fait lobjet de trs nom-
breux travaux, les mthodologies disponibles sont essentiellement conues pour lva-
luation conomique de programmes ou de secteurs spcifiques, et peinent prendre en
compte la diversit des impacts (environnementaux, socitaux, politiques, territoriaux),
et les rles spcifiques dun organisme de recherche tel que lInra. Dans ce contexte,
lInra a lanc en janvier 2011 le projet Asirpa (http://www6.inra.fr/asirpa). Ce projet a
pour ambition de proposer une mthodologie nouvelle de lanalyse socio-conomique
des impacts dun organisme de recherche publique ; de la tester partir dune premire
tude pilote ralise pour lInra ; et dengager la discussion avec des organismes publics
de recherche agronomique dautres pays afin dexplorer les possibilits de se doter dune
approche commune. Les rsultats de la premire phase dtude sont attendus pour
novembre 2012.
Les mots de lagronomie passent en ligne
Ce sont prs de 600 termes dagronomie, concernant des objets matriels, des tech-
niques, des mthodes, des concepts, que cet ouvrage en ligne se propose de dfinir
et surtout de mettre en perspective historique et critique. D'o viennent-ils ? Dans
quels contextes et pour quels usages ont-ils t crs ? quels dbats et controverses
ont-ils donn lieu et donnent-ils encore lieu ? Ce dictionnaire s'adresse tous ceux qui
s'intressent aux dbats actuels sur l'agriculture et le monde rural : agronomes, histo-
riens et gographes, enseignants et tudiants, et toute personne dsireuse de mieux
connatre l'activit agricole et le vocabulaire qui la dcrit. Ce site web a t publi par
le dpartement Sciences pour l'action et le dveloppement de l'Inra, avec l'appui de la
Direction de la valorisation / IST de l'Inra et le Noyau d'innovation et de technologie de
l'Institut national polytechnique de Lorraine.
http://mots-agronomie.inra.fr
Alimentation durable
Lance l'initiative du Cirad et de
l'Inra, la prospective Dualine porte sur
les interactions entre alimentation et
dveloppement durable, afin de mieux
connatre et dagir sur la non-durabilit
des systmes alimentaires. Elle aborde
les rgimes alimentaires, les mthodes
danalyse des impacts, les points critiques
et les besoins de recherche, lvolution
des systmes alimentaires et enfin les
dynamiques urbaines et la localisation des
units de production, de transformation
et de distribution. Les travaux ont runi
pendant 18 mois des acteurs publics,
privs et des chercheurs pour dresser un
tat des lieux des connaissances sur les
points clefs de lalimentation, au regard
de ses impacts sur lenvironnement, la
sant, lconomie et la socit, dans un
contexte de changements globaux.
Ltat des sols en France
Le Groupement dIntrt Scientifique sur
les sols (Gis Sol), anim par l'Inra, a publi
un rapport sur ltat des sols en France
ainsi quune synthse en rsumant les
principaux rsultats. Fruit dun travail
de 10 ans de collecte et danalyse de
donnes, ce rapport dresse le premier
bilan quantifi de ltat des sols en
France. Il met en lumire les points positifs
et les principales inquitudes, ainsi que
les interrogations qui subsistent quant
au devenir de la qualit des sols et de
la durabilit de leur multifonctionnalit.
Le SIA sur la sant des
animaux et des plantes
La sant des animaux et des plantes
a t le thme du stand de lInstitut pour le
Salon international de lagriculture 2011. Les
scientifiques de lInra ont chang avec les
visiteurs, autour danimations sur diffrents
thmes : la nature des agents pathognes ;
leurs modes opratoires pour infecter les
plantes et les animaux ; la gestion du risque
en alimentation animale ; les moyens de
contrle des infections ; lusage raisonn
des traitements dans un souci de meilleure
efficacit et de prservation des cosystmes.
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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


C
oncilier dveloppement
conomique, bien-tre
social et protection
de lenvironnement, agir
pour la scurit sanitaire
de lalimentation, sadapter
au changement climatique...
Les grands enjeux actuels
se portent lchelle mondiale.
Pour rpondre aux dfis
scientifiques autour de ces
grands enjeux, lInra intensifie
ses collaborations scientifiques
nationales et internationales,
simplique dans des initiatives
mondiales, met en place
un nouveau systme de pilotage
sur les objectifs des activits
de recherche, complmentaire
des schmas stratgiques des
dpartements scientifiques.
Wheat Initiative :
un meilleur bl pour la plante
Parmi les cinquante actions dci-
des en juin 2011 par les ministres
de lagriculture du G20 pour lut-
ter contre les crises alimentaires
plantaires et la volatilit des prix
agricoles, lune delles implique tout
particulirement la recherche agro-
nomique : la cration de lInitiative
internationale de recherche pour
l'amlioration du bl (ou Wheat Ini-
tiative). LInra, avec le Biotechnology
and Biological Sciences Research
Council (BBSRC) en Grande-Bre-
tagne et le Centre international pour
lamlioration du mas et du bl bas au Mexique, sest engag coordonner les activits de lIRIWI
durant les quatre premires annes du projet. Cette initiative, acte le 15 septembre Paris, vise
renforcer la scurit alimentaire mondiale, en recherchant laugmentation de la productivit, de la
valeur nutritionnelle et de ltat sanitaire des cultures de bl dur et de bl tendre dans le cadre de
pratiques et systmes de production agricole durables. Elle va renforcer la synergie, les coopra-
tions et les changes entre les programmes de recherche internationaux damlioration du bl. Les
actions coordonnes par la Wheat Initiative dans les domaines de la gntique, de la gnomique
et de lagronomie permettront de crer de nouvelles varits de bl et de mettre en place des pra-
tiques agronomiques innovantes, adaptes des environnements diffrents. Elles seront mises la
disposition des agriculteurs afin dassurer une production mondiale plus importante, de meilleure
qualit et plus stable.
SE MOBILISER AUTOUR
DES GRANDS ENJEUX


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Tour de mesure de CO
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au Brsil
H.Cochard / Inra
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

47
La programmation conjointe sur lagriculture,
la scurit alimentaire et le changement climatique
lance sa premire action pilote
L'initiative de programmation conjointe Agriculture, scurit alimentaire et changement cli-
matique (FACCE-JPI), co-dirige par la France (Inra) et le Royaume-Uni (BBSRC), a lanc sa
premire action pilote le 13 juillet 2011 intitule tude dtaille des risques lis au changement
climatique pour lagriculture et la scurit alimentaire en Europe, en collaboration avec des
projets internationaux. Cette premire action portera sur la modlisation des impacts du chan-
gement climatique et la rduction des incertitudes face aux divers scnarios de changement
climatique. Elle sera mene par le biais du rseau dexcellence, le FACCE Knowledge Hub. Ce
rseau a t mis en place par la FACCE-JPI pour favoriser les cooprations transnationales, la
collaboration et la communication entre les communauts de recherche dans les domaines
de FACCE et contribue optimiser les rsultats de recherche en facilitant la mise en rseau
et le partage dinformation entre les diffrents acteurs. Il est un rseau constitu de groupes
de recherche slectionns parmi les pays membres du JPI dans un domaine de recherche
dfini. Concernant laction pilote sur la scurit alimentaire, le hub rassemblera des groupes
de recherche europens provenant de 17 pays, privilgiant les interactions et la synergie entre
des modlisateurs europens des cultures, des levages et des changes conomiques afin
danalyser comment le changement climatique modifiera lagriculture et la scurit alimentaire
mondiales. La dure du rseau dexcellence sera de trois ans dans la premire phase, suivie par
une valuation avec la perspective dune prolongation de deux ans, aprs examen favorable et
financements suffisants.
Biodiversit : lIPBES se structure
La premire session de la runion
plnire de la Plateforme inter-
gouvernementale scientifique et
politique sur la biodiversit et les
services cosystmiques (IPBES)
sest runie du 3 au 7 octobre
2011 au sige du Programme
des Nations unies pour lenviron-
nement Nairobi (Kenya). Elle a
rassembl 366 dlgus repr-
sentant 112 pays. Au cours de ces
cinq jours de runion, les dl-
gus ont examin les modalits
et dispositifs institutionnels pour une IPBES, notamment : les fonctions et principes de fonctionne-
ment de la plateforme ; les questions juridiques lies la mise en place et loprationnalisation de
la plateforme ; le programme de travail de la plateforme ; et les critres de slection de linstitution
daccueil et du sige du Secrtariat. limage du Giec, le Groupe d'experts intergouvernemental
sur l'volution du climat, lIPBES doit permettre de rapprocher les scientifiques des dcideurs poli-
tiques sur la question de la biodiversit. L'Inra participe en tant quexpert cette plateforme.
LInra lorigine
dun programme europen
sur ltablissement
de bioindicateurs
de la qualit des sols
Fort de son exprience dans le domaine
de la caractrisation de la biodiversit
des sols de grandes chelles spatiales
et du dveloppement de la plateforme
GenoSol (http://www2.dijon.inra.fr/
plateforme_genosol/) reprsentant une
structure unique pour la gestion et la
caractrisation molculaire de larges
chantillons, lInra pilote aujourdhui
le projet europen EcoFINDERS (Ecological
Function and Biodiversity Indicators in
European Soils, http://www.ecofinders.eu/)
qui vise notamment proposer
(I) des bioindicateurs de ltat des sols
et (II) des mthodes pour caractriser
leur biodiversit et leurs fonctions.
Ce programme rpond au souhait
de la Commission europenne de mettre
en uvre une politique de gestion
durable des sols impliquant la mise
en place dune directive cadre sur
les sols. Cette politique ncessite de
disposer de connaissances scientifiques
et oprationnelles sur la biodiversit
des sols et des fonctions associes
contribuant aux services cosystmiques.
Scheresse et agriculture
Pour faire face des situations de crise
comme en 2005, il est apparu ncessaire
que des dcisions publiques ou prives
puissent sappuyer sur un tat de
lart actualis sur les relations entre
agriculture et ressource en eau.
Cest cette fin qua t engage
lexpertise scientifique collective intitule
"Rduire la vulnrabilit de lagriculture
un risque accru de manque d'eau",
commandite par le ministre en charge
de lagriculture et pilote par lInra,
et qui associe des experts dautres
organismes de recherche (Cemagref
et CNRS), de l'Universit, d'coles
agronomiques. L'expertise se situe
au niveau de l'analyse gnrique de
la problmatique nationale et conduira
identifier les besoins de recherche
conduire pour prparer des options
rgionalises.
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Recherche de l'Unit Environnement
et Grandes Cultures
C. Matre / Inra
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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


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vec ses centres,
son rseau unique
dinstallations
exprimentales, son implication
dans les coles doctorales
et ses partenariats diversifis,
lInra, institut de recherche
finalise, est un tablissement
solidement ancr au cur
des territoires. Le programme
des investissements davenir
a cr une dynamique visant
promouvoir lexcellence
dans une logique valorisant
les politiques de site et
la visibilit internationale. LInra
sengage fortement sur cette
trajectoire de renforcement
de la dimension territoriale
de sa stratgie, qui repose
sur la spcialisation scientifique
de ses implantations, pour
favoriser ses partenariats
et amliorer son attractivit.
LInra inaugure en Picardie lObservatoire
de recherche en environnement
Ce nouvel observatoire sur le site Inra dEstres-Mons (80) est un dispositif dobservation et
dexprimentation en environnement sur les Agro-cosystmes, les Cycles Biogochimiques et
la Biodiversit (ACBB). LORE ACBB dEstres-Mons comprend un dispositif exprimental en
champs de 22 ha et un laboratoire de plus de 270 m
2
. Il est financ hauteur de 1 643 000 HT
dont 225 000 par le Fonds Europen de Dveloppement Rgional, 147 000 par lAgence
nationale de la recherche, 822 000 par le Conseil rgional de Picardie, et 449 000 par lInra.
Les chercheurs y tudient sur le long terme le cycle du carbone, celui de lazote et lvolution de
la biodiversit dans les sols, ainsi que les impacts environnementaux des pratiques culturales.
Il permet d'tudier plus spcifiquement les systmes de grande culture, que ce soit pour la pro-
duction de plantes usage alimentaire ou de biomasse pour la chimie verte. Ce dispositif est
insr au cur du bassin cralier du nord de la France.
STRUCTURER
& VALORISER NOS ACTIONS
DANS LES TERRITOIRES
Projet du btiment
Xavier Leverve Jouy-en-Josas
DR
Inauguration le 9 juin 2011 de lObservatoire de
recherche en environnement Estres-Mons (80)
C. Matre / Inra
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

49
Rgion PACA : trois nouveaux quipements
pour la recherche en agriculture durable
Le 6 mai 2011, trois quipements majeurs du Ple sant des plantes de lInra en par-
tenariat avec le CNRS et lUniversit de Nice-Sophia Antipolis ont t inaugurs au
centre Inra PACA. La nouvelle serre Msocosme, le nouveau btiment de quarantaine
Entomopolis et le spectromtre de masse permettront aux scientifiques dexplorer de
manire fine les dynamiques qui se jouent entre les plantes et lensemble des autres
organismes, nuisibles et amis, qui interagissent au sein des cosystmes afin denvisa-
ger une agriculture durable, limitant le recours aux pesticides. Les trois quipements
ont t financs dans le cadre du Contrat de projets tat-rgion 2007-2013, avec le
soutien de lUnion europenne pour un budget total de 2,6 M. Les financeurs sont
le Conseil rgional Provence-Alpes-Cte dAzur (1,2 M), lInra (part-tat : 0,3 M),
lEurope (FEDER : 0,6 M) et le Conseil gnral des Alpes-Maritimes (0,4 M).
La labellisation
des installations exprimentales
Engag en 2010, le processus danalyse des installations exprimentales (IE) sest poursuivi
en 2O11. lissue des runions de validation organises par la Direction Gnrale et la Com-
mission nationale des units exprimentales (CNUE), associant les chefs de dpartement,
les prsidents de centre et la direction
de laction rgionale, de lenseignement
suprieur et de lEurope (Darese), 47 IE
ont t labellises. Ces installations se
rpartissent sur 17 centres de recherche
et 12 dpartements de recherche. Dans
certaines situations, le dispositif expri-
mental est encore considr en volution,
trs gnralement en liaison avec la mise
en uvre dune nouvelle organisation du
dispositif scientifique de tutelle. Un dossier
complet de labellisation regroupant les
informations sur les moyens, les activits
et le management, sera soumis aux IE en
2012 et constituera la dernire phase du
processus. Lanalyse a galement conduit
proposer et accorder le statut dunit
exprimentale (UE) certaines installa-
tions exprimentales. LInra dispose ainsi
de 49 units exprimentales permettant
le dveloppement des programmes de
recherche et des partenariats associs.
Observatoire de lambroisie
Les ministres chargs de la sant,
de lagriculture et de l'cologie ont mis
en place lObservatoire de lambroisie,
hberg par le centre Inra de Dijon.
Il aura pour mission principale
la coordination des moyens de lutte
contre cette plante hautement allergisante
qui envahit le territoire.
levage laitier, territoires
de lOuest et prairies
Soutenu par les rgions Basse-Normandie,
Bretagne, Pays-de-Loire et Poitou-
Charentes, le projet Laitop sappuie
sur les chercheurs de lInra et de lIrstea
pour renforcer la dynamique du secteur
productif laitier dans le Grand Ouest,
en tenant compte de lexigence dun
dveloppement durable des territoires.
Laitop claire le paysage sociologique
de llevage laitier, pointe la diversit
des formes dexercice du mtier,
sa dynamique et ses dterminants.
Il informe de ce fait sur ce que pourrait
tre, moyen et long termes, la diversit
des modles sociaux dexploitations
laitires dans le Grand Ouest.
Laitop montre aussi quune diversit
de solutions techniques (systmes
dlevage et systmes fourragers)
peut tre mobilisable pour que
les systmes de production puissent
sadapter cette nouvelle donne.
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Inra simpose
comme un acteur
de la recherche
agronomique internationale
de plus en plus visible au
plan institutionnel. Il sengage
activement dans la structuration
lchelle mondiale du
rseau des principaux
oprateurs de recherche
agronomique, notamment
en proposant la constitution
de consortiums de recherche
sur les thmatiques de ses
mtaprogrammes. De plus,
avec les membres dAgreenium,
lInra va structurer loffre
linternational et initier des
actions combinant recherche,
formation et dveloppement
dans les champs de lagriculture,
lalimentation, la sant animale
et lenvironnement.
La France et lInra au cur de la recherche contre
les gaz effet de serre dorigine agricole
Du 28 fvrier au 4 mars, la deuxime confrence plnire de lAlliance de recherche globale sur
les gaz effet de serre (GES) d'origine agricole, ou Global Research Alliance (GRA), sest tenue
en France. Lorganisation de cette confrence durant le G8-G20 tait une occasion unique de
rendre visible au niveau international l'action scientifique de la France et de l'Inra en particulier.
Les visites des sites de lInra (Versailles, Clermont-Ferrand, Orlans) ont t loccasion de mon-
trer la communaut scientifique et diplomatique internationale la pertinence et limportance
du dispositif de lInstitut sur la question de lattnuation des GES dorigine agricole. Les changes
scientifiques ont t nourris. La notorit de lInra a t renforce, lInstitut est maintenant for-
tement insr dans toutes les instances de la GRA. Ce consortium international dtats, initi
par plusieurs pays de l'OCDE sous limpulsion de la Nouvelle-Zlande, est la seule organisation
de niveau international traiter globalement de l'attnuation des missions de GES dorigine
agricole et promouvoir des programmes de recherche internationaux, en lien avec les enjeux
environnementaux et de scurit alimentaire. la France y est reprsente par le ministre en
charge de lagriculture o il est assist par lInra sur le plan scientifique et technique. La GRA se
situe la frontire entre diplomatie et science : les membres de l'Alliance sont des tats mais
elle fonde sa lgitimit sur les changes scientifiques un niveau international. En juin 2011, la
Chine, la Core du Sud, le Brsil et la Commission Europenne lont rejointe portant le nombre
de membres trente-deux.
POURSUIVRE LOUVERTURE
LINTERNATIONAL
Colloque Global Research Alliance on Agricultural
Greenhouse gases (GRA) 3 Mars 2011
J.Weber / Inra


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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

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Agreenskills, un programme de mobilit
scientifique mis en place par Agreenium
Lanc en dcembre 2011, le programme Agreenskills vise favoriser la mobilit inter-
nationale des jeunes chercheurs, de 6 12 mois pour les sjours sortants, et de 12
24 mois pour les sjours entrants en France, en soutenant des projets de recherche
dans les domaines de lagriculture, lenvironnement, lalimentation et la sant animale.
Le programme concerne tous les laboratoires de recherche des membres d'Agreenium.
Le site du programme www.agreenskills.eu prsente lensemble des lments dinfor-
mation relatifs au programme, conditions daccueils, critres dligibilit et modalits de
candidature, calendriers, etc. Lappel candidatures sera lanc partir du 15 mars 2012
en continu sur une priode de 3 ans. La slection sera ralise selon un processus inter-
national deux fois par an. Coordonn par lInra et Agreenium, le programme AgreenSkills
(2012-2016), est cofinanc par la Commission europenne dans le cadre du Programme
COFUND Personnes du 7
e
Programme cadre de recherche et dveloppement.
Un rseau social de
chercheur en agronomie
VOA3R est un projet europen du 7
e
PCRD,
d'une dure de 3 ans, qui a pour objectif
de partager les connaissances scientifiques
issues darchives ouvertes dans les domaines
de lagriculture, de lalimentation,
de laquaculture et de lenvironnement.
La plateforme VOA3R offre un rseau social
pour la communaut des chercheurs en
agronomie. Elle permet didentifier des
experts, des projets et vise dvelopper
les futures collaborations scientifiques
internationales. Des interfaces innovantes de
recherche rendront ce portail trs collaboratif
et convivial. Une exprimentation sera
mene avec lintgration dontologies afin
de proposer aux utilisateurs des suggestions
de contenu, dexperts travaillant dans
les mmes thmatiques ou encore de revues
o publier les travaux en cours.
http://voa3r.eu/
Premires recommandations
de la commission Beddington
Marion Guillou sige la Commission
sur lAgriculture durable et le Changement
climatique mise en place en fvrier 2011,
dans le cadre du Consultative Group on
International Agricultural Research (CGIAR).
Avant de rendre public son rapport final
en janvier 2012, la Commission prside
par le professeur Sir John Beddington,
a adress, en novembre, une srie de
recommandations lattention des
dcideurs afin daider lagriculture mondiale
rpondre aux dfis auxquels elle doit faire
face afin de nourrir le monde en 2050.
http://ccafs.cgiar.org/commission
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Mobilits sortantes : TOTAL 6 017

Mobilits entrantes : TOTAL 1 885
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chercheur en agronomie
Un rseau social de
chercheur en agronomie
Mobilits sortantes: TOT T AL 6 L 017 017

Mobilits entrantes: TOTAL 1 L 885 85
AMRIQUE LATINE
& CARABES

265 (4,4%)

181 (9,6%)
ASIE & PACIFIQUE

290 (4,8%)

203 (10,8%)
ESPACE CONOMIQUE
EUROPEN NORD

3 062 (50,9%)

456 (24,2%)
ESPACE CONOMIQUE
EUROPEN SUD

1 327 (22,1%)

293 (15,5%)
MDITERRANE
HORS EUROPE

342 (5,7%)

422 (22,4%)
AMRIQUE DU NORD

576 (9,6%)

113 (6%)
PECO

72 (1,2%)

34 (1,8%)
AFRIQUE SUBSAHARIENNE

83 (1,4%)

183 (9,7%)
Carte des mobilits
Penser les mtaprogrammes
pour linternational
Les 13 et 14 septembre, lInra a organis un atelier de rflexion linternational de ses mtapro-
grammes (MP). Ce sminaire a rassembl 78 scientifiques de haut niveau et responsables dorga-
nismes de recherche agronomique nationaux et internationaux (Australie, Brsil, Chine, Russie,
tats-Unis...) Les enjeux de ces journes taient multiples : explorer les dmarches homologues
aux MP chez les grands acteurs de la recherche agronomique et universitaire, identifier des actions
conjointes possibles, esquisser des modalits de collaboration De ces changes trs fructueux, il
en est ressorti entre autres que la plateforme Agreenskills sera un atout majeur pour faire rayonner
les MP linternational en favorisant la mobilit entrante et sortante des post-doc de haut niveau. Il
a t soulign galement quau moins la moiti des projets de chaque MP devra tre construite et
ralise avec des partenaires internationaux incluant des projets de recherche conjoints sous des
formes varies mais effectives.
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LInra et les programmes cadres europens
Les programmes cadres de recherche et dveloppement (PCRD) sont le principal
instrument de lUnion europenne en matire de financement de la recherche
lchelon europen. Le 7
e
PCRD couvre la priode 2007-2013. Dote dun budget de
53,2 milliards deuros, cest la plus importante allocation de fonds pour ce genre de
programmes. Le 7
e
programme cadre de recherche et dveloppement est un moyen
de : crer les conditions dune conomie comptitive et durable, de faciliter la coh-
sion conomique et sociale de lUnion europenne et de rpondre aux attentes du
citoyen consommateur.
Dans ce cadre, lInra a t retenu en 2011 dans le montage de 39 projets collaboratifs
dont huit pour lesquels il assure la coordination.
Projets coordonns
Rpartition par thmes (pour tout le PCRD)
Mditerrane :
Rsultats de la prospective
Parme...
Parme (Partenariats et recherche en
Mditerrane), programme financ par
l'ANR, vise rpondre une question
majeure : Quelles recherches et quels
partenariats pour la Mditerrane ?
Plus vaste que le seul champ de
l'agriculture, de l'environnement et de
l'alimentation, il couvre aussi les cultures
et civilisations ou la sant. Ce programme
s'est achev mi 2011, par la publication
dun rapport et dune synthse
*
.
* http://www.agropolis.fr/gestion-projets/atelier-
reflexion-prospective-mediterranee.php
... Et coordination
de programmes
Lappel doffres scientifiques lanc en juin
2011 par lERA-Net ARIMNet (Agricultural
Research In the Mediterranean Network ou
recherche agronomique dans les rseaux
mditerranens) a distingu dix projets
(dont deux ports par lInra) impliquant
plusieurs partenaires des pays de l'Union
europenne et des pays mditerranens
associs. Lappel portait sur un budget
de 7 millions deuros. ARIMNet vise
coordonner et optimiser les programmes
nationaux de recherche agronomique
pour renforcer les capacits de ses
membres rpondre de faon coordonne
aux grands dfis auxquels l'agriculture
mditerranenne est confronte.
Il est financ par l'Union europenne
et coordonn par lInra.
Lancement dAnimalChange
LInra, en association avec 25 partenaires
a lanc en mars 2011 le projet europen
AnimalChange. Ce projet a t pens
pour fournir, pour la premire fois,
une vision prospective et intgrative
des futurs du secteur de llevage,
en tenant compte du changement
climatique. Il proposera notamment
des systmes de dveloppement durable
de llevage en Europe, Afrique du Nord
et subsaharienne et en Amrique latine.
Son budget global est de 12,8 millions
deuros dont 9 millions sont financs
par la Commission europenne dans
le cadre du 7
e
PCRD sur une dure de 4 ans
(2011-2015).
INTITUL
DU PROJET
TYPE DE CONTRAT OBJECTIF
Trees4Future Infrastructure
Mise en rseau des
infrastructures de recherche
forestire en Europe
TERIFIQ Petit projet collaboratif
Rduction en sel, sucre et gras
des aliments transforms
SUSCLEAN Petit projet collaboratif
Optimisation des procds
de nettoyage et de dsinfection
dans les industries
agroalimentaires pour
conomiser l'eau
CANTOGETHER Petit projet collaboratif
Nouveaux systmes agricoles
productifs et conomes
ARRAINA Grand projet collaboratif
Nutrition optimise pour
une aquaculture durable
SUSFOOD Eranet Alimentation durable
ANIWHA Eranet Sant et bien-tre animal
FACCE-CSA CSA
Assurer le secrtariat
et la gestion de la JPI-FACCE
p
KBBE
p
Environnement
p
Sant
p
Infrastructures
p
People
p
Autres
47,4%
7,1%
5,3%
3,4%
20,7%
16,1%
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volution rcente
du dispositif
de recherche a
encourag les chercheurs
construire des partenariats
avec leur environnement
socio-conomique et,
lInra, comme ailleurs,
les cooprations se sont
multiplies. Le partenariat
ne doit pas tre une source de
dispersion, mais au contraire un
moyen de mener une recherche
cohrente, en phase avec les
enjeux socio-conomiques.
Le partenariat de lInra recouvre
des collaborations de recherche
selon des modalits de plus en
plus diversifies et des actions
de transfert et de valorisation
gres par Inra Transfert SA,
Agri Obtentions SA et ABA,
les trois filiales de lInstitut.
Trois instituts Carnot naissent en 2011
En mai 2011, le ministre de lEnseignement suprieur et de la Recherche a labellis
34 instituts Carnot, dont 3 ports par lInra : 3BCAR (Bionergies Biomolcules et
Biomatriaux du Carbone Renouvelable), ICSA (Sant Animale) et QUALIMENT (Qua-
lit Nutritionnelle & Sensorielle des Aliments). Ces groupements de laboratoires ont
dmontr leur capacit collaborer efficacement avec des partenaires socio-co-
nomiques. Les structures labellises Carnot reoivent des financements de lANR
destins adapter leurs comptences scientifiques et technologiques aux futurs ques-
tionnements des industriels et dvelopper leur activit de recherche partenariale. Le
rle principal des trois instituts Carnot ports par lInra est de se mettre au service
des chercheurs et des industriels afin de faciliter et dencourager leurs collaborations.
Pour ce faire, chaque institut Carnot a mis en place : un guichet unique dentre pour
lindustriel, seul ou en consortium ; un interlocuteur unique pour laccompagnement
de la construction des projets de recherche, en mobilisant les diffrents acteurs de
chaque institut Carnot, grce un accord de consortium inter-tablissements, une
cohrence thmatique et organisationnelle afin de proposer la meilleure offre en
rponse la question pose et enfin une professionnalisation dans linstruction des
contrats avec des dlais courts et respects et une mise sous assurance qualit. Le
label est dlivr pour une priode de 5 ans.
RENFORCER LINNOVATION
ET LE PARTENARIAT
AVEC LES ENTREPRISES
36
nouveaux
brevets
dposs
270
nouveaux
contrats de
recherche signs
avec le secteur
priv
14
demandes
de protection
par certificat
dobtention
vgtale
50
nouvelles
licences
dexploitation
de varits
L'usine pilote du projet FUTUROL
Pomacle-Bazancourt dans la Marne
B.Nicolas / Inra
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Lancement du GIS Biotechnologies Vertes
Le groupement dintrt scientifique
(GIS) Biotechnologies Vertes a
tenu le 29 juin 2011 sa premire ru-
nion. Faisant suite au rseau Gno-
plante, ce GIS a pour but de crer
les technologies et les comptences,
et de produire les connaissances
ncessaires pour le dveloppement
de varits innovantes. Il se construit
sur un trs large partenariat public-
priv, runissant organismes de
recherche, socits semencires,
reprsentants de filires, instituts
techniques et ples de comptiti vit. Il sappuiera sur des plateformes technologiques denvergure
internationale (squenage, phnotypage, bioinformatique, ingnierie cellulaire, ressources gn-
tiques et gnomiques), existantes ou crer, et mutualisant les moyens technologiques de pointe
ncessaires aux recherches menes. Une des premires actions menes par le GIS est la labellisa-
tion et la mise en uvre des deux projets slectionns dans le cadre des Investissements dAvenir :
BREEDWHEAT et AMAIZING (cf p. 21).
chalote Melkior
Ne dans la station exprimentale Inra de Ploudaniel (Finistre), Melkior est la premire varit
dchalote tolrante au mildiou. Issue dun travail de recherche de plus de dix ans men conjoin-
tement par lInra et Agri-Obtentions, sa culture pourra dsormais saffranchir des nombreux
traitements phytosanitaires dont elle faisait lobjet jusque-l. Trs riche en matire sche, lcha-
lote Melkior se conserve naturellement jusquaux mois davril-mai. La slection de cette varit
a bnfici du projet lgumes typiquement angevin port par la PME Fleuron dAnjou et label-
lis par Vegepolys. Les premiers plants certifis de Melkior rpondent au cahier des charges
de lagriculture biologique. Cette varit a obtenu le prix de linnovation varitale au Salon des
techniques lgumires et fruitires en 2012 Angers.
LInra et NewVectys
annoncent leur partenariat
LInra et la socit de biotechnologies
NewVectys ont sign une convention
de partenariat qui vise renforcer
leurs collaborations scientifiques et
dvelopper des innovations de rupture
dans le domaine des biotechnologies
animales, au service de la recherche
sur la sant.
Des emballages
biodgradables
Le projet europen EcoBioCAP lanc
en mars 2011 a pour objectif de
fournir aux industries alimentaires de
lUnion europenne, des emballages
biodgradables et modulables
faon selon les exigences des
denres alimentaires prissables,
avec des bnfices directs la fois
pour lenvironnement et pour les
consommateurs europens en termes
de qualit et de scurit alimentaire.
Cette nouvelle gnration demballages
sera base sur le dveloppement
multichelle de structures composites
dont les constituants seront tous obtenus
partir de co-produits des industries
alimentaires.
Une start-up spcialise
dans le mtagnome
bactrien
Enterome dveloppe des mdicaments
et des biomarqueurs pour le diagnostic de
maladies chroniques lies des anomalies
de la composition bactrienne de l'intestin
(maladies mtaboliques et inflammatoires
intestinales). La technologie utilise
par la socit a t initialement
dveloppe lInra de Jouy-en-Josas ;
lapplication de cette technologie
lidentification des enterotypes
a t reconnue comme tant l'une
des cinq perces scientifiques majeures
de l'anne 2011 par la revue Science.
La socit bnficie dun accs exclusif
aux dcouvertes ralises sur la
plateforme de mtagnomique de lInra
dans des pathologies spcifiques, incluant
le diabte de type 2 et les maladies du foie
et de lintestin.
Futurol : lavenir des carburants
Le projet Futurol vise mettre au point et commercialiser un procd complet de production
de biothanol de deuxime gnration, c'est--dire issu de rsidus vgtaux qui ne concur-
rencent pas les utilisations alimentaires. Le 11 octobre 2011, ce projet a atteint une nouvelle
tape de son dveloppement : la mise en fonction de la premire usine pilote franaise sur le site
de Pomacle-Bazancourt, prs de Reims. Cette tape dcisive concrtise la production de bio-
thanol de deuxime gnration, et va permettre de valider l'chelle prindustrielle les rsultats
des recherches entreprises depuis 2008. Trois annes dessais seront dsormais ncessaires
pour dterminer les choix technologiques qui permettront le passage lchelle industrielle. Il
sera suivi par la construction en 2015 dun prototype (chelle x 20) avant la phase dindustria-
lisation (chelle x 1 000), le tout en huit ans. terme, on estime quune unit de taille standard
pourra produire 180 millions de litres dthanol/an. Ce projet est men avec onze partenaires
R&D (dont lInra), industriels et financiers. Il est port par une socit ddie SAS Procethol 2G.


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55
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es enjeux agricoles
aujourdhui se portent
lchelle mondiale,
comme le soulignent notamment
les conclusions de la rflexion
prospective Objectif terres
2020 conduite par le ministre
charg de lagriculture et de
lalimentation. Les trajectoires
dinnovations peuvent prendre
des formes varies mais
les agricultures du 21
e
sicle
devront tre simultanment
productives et cologiques.
Productives car il faudra produire
plus pour satisfaire des besoins
alimentaires et non-alimentaires
en augmentation, en utilisant
moins de facteurs de production
rares (nergie, sol, eau) ;
cologiques car les agricultures
du monde devront se penser
comme gestionnaires des
ressources naturelles.
LInra claire la rforme de la PAC
La Politique Agricole Commune (PAC) est la veille dune nouvelle rforme pour
mise en uvre thoriquement au 1
er
janvier 2014. Si les principes gnraux de la PAC
actuelle ne sont pas remis en cause les propositions en dbat sinscrivent dans la
continuit du processus engag en 1992 , les fortes volutions du contexte europen
font merger de nouvelles contraintes et proccupations. la contrainte budgtaire,
qui pse sur toutes les politiques, sajoutent les incertitudes sur les volutions des
marchs des matires premires et leur instabilit, les forts enjeux de comptitivit,
le renforcement des proccupations de limitation des impacts environnementaux des
activits conomiques, la monte en puissance des questions environnementales
ayant une dimension de bien public telle que le changement climatique et la biodiver-
sit, ainsi que des enjeux de cohsion sociale et territoriale de lUnion europenne. Les
chercheurs de lInra travaillent sur ces diffrentes questions, dans le cadre de collabo-
rations troites et fructueuses avec les autorits publiques communautaire et natio-
nale. Au-del des publications scientifiques, une premire synthse de ces travaux a
fait lobjet dun dossier spcifique de la revue de transfert Inra Sciences Sociales,
dossier disponible ladresse suivante :
http://www.inra.fr/sae2/publications/iss/iss11-45.php
DVELOPPER LES PARTENARIATS
AVEC LE MONDE AGRICOLE
22
Units mixtes
technologiques
270
Rseaux mixtes
technologiques
14
Groupements
dintrt
scientifique
4
e
dition des Prairiales de Normandie au domaine
exprimental Inra du Pin-au-Haras(Orne) en 2011
J. Weber / Inra
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I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


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Les actions du GIS Relance agronomique
labore dans le cadre du GIS Relance agronomique
1
, la premire session de formation
Conseiller demain en agronomie sest droule en 2011. Cette formation aborde les
aspects scientifiques et techniques du fonctionnement des agrosystmes mais gale-
ment lvolution du mtier de conseiller agricole. Dans un objectif de valorisation et capi-
talisation de linformation, le
GIS a par ailleurs organis une
premire journe de restitu-
tion des programmes de R&D
laurats de lappel projets
Innovation et partenariat du
Casdar
2
. Cette journe initie un
cycle annuel de restitution des
rsultats de ces programmes
avec une vise trs concrte :
produire des rsultats porteurs
d'innovations, facilement com-
municables aux conseillers et aux agriculteurs, et pouvant contribuer la dfinition des
politiques publiques. La durabilit des filires agricoles est au cur de cet appel pro-
jets. Au-del de la journe dchanges, lintgralit des rsultats est publie dans la revue
en ligne de lInra, Innovations agronomiques
3
. Par ailleurs, le GIS a apport un appui au
programme Dphy Ecophyto par la rdaction du cahier des charges pour la slection des
sites exprimentaux. Enfin, la demande du ministre en charge de lagriculture, le GIS
Relance agronomique est porteur de la contribution franaise au Partenariat europen
pour l'innovation (PEI) Agriculture productive et durable.
1. www.gis-relance-agronomique.fr
2. Compte daffectation spciale dveloppement agricole et rural
3. http://www.inra.fr/ciag/revue
UMT et RMT, un rseau solide et prenne
En 2011, douze Units mixtes technologiques (UMT) arrivant au terme de leur labelli-
sation ont t values ; dix dentre elles ont dpos un nouveau projet accept dans
tous les cas. Deux toutes nouvelles UMT ont galement t labellises : UMT Innoplant
sur la qualit des plants de pomme de terre en lien avec la comptitivit de la filire
associant lInra et la Fdration nationale des plants de pomme de terre ; lUMT Alice
analyse les liens entre nutriments lipidiques et liposolubles et prvention des dficits
cognitifs et motionnels qui apparaissent au cours du vieillissement en partenariat
avec lInstitut des corps gras. LInra se trouve ainsi impliqu dans 22 UMT mobilisant
130 ETP. LInra participe par ailleurs 23 Rseaux mixtes technologiques (RMT). Les
RMT regroupent de nombreux organismes de dveloppement et de formation initiale
ou suprieure. Ils constituent de vritables rseaux dexperts avec une vise trs op-
rationnelle. Ainsi dans le domaine de llevage des ruminants, les 5 UMT en partenariat
avec lInstitut de llevage couvrent les domaines trs complmentaires de la gn-
tique, de la sant et des systmes dlevage. Des liens se sont tablis entre ces diff-
rentes UMT mais aussi avec les RMT concerns.
Un bilan des relations
avec le monde agricole
Pour lInra, lambition du partenariat avec le monde agricole est celle dun renouvel-
lement des trajectoires dinnovation au service de systmes agricoles et alimentaires
durables dans les trois dimensions de lconomie, du social et de lenvironnement,
adaptes aux particularismes locaux et rsilients face aux changements globaux. Le
partenariat de lInra doit contribuer relever ce dfi, tant par les thmatiques traites
que par les types de partenaires mobiliss et les formes partenariales mises en uvre.
la demande de son conseil dadministration, lInra a prsent un bilan actualis de
ses relations avec le monde agricole, assorti de propositions pour rendre ce partena-
riat plus efficace. Ce bilan, intitul lInra et le monde agricole : des partenariats pour
linnovation, a t adopt le 13 dcembre 2011.
L'Inra et lActa
intensifient
leurs relations
Marion Guillou, PDG de lInra
et Eugne Schaeffer, Prsident de
lActa, le rseau des instituts des
filires animales et vgtales ont sign
le 19 octobre 2011 un accord-cadre
de 5 ans pour renforcer leurs
collaborations et intensifier
les relations entre la recherche
agronomique et la recherche
applique agricole. Lobjectif
est dacclrer lchange de
connaissances et de favoriser
linnovation en agriculture face
aux dfis du XXI
e
sicle.
Un rseau pour
lautonomie fourragre
des levages caprins
En partenariat avec des leveurs
caprins et des acteurs du
dveloppement agricole, lInra
a cr le rseau dexprimentation
et de dveloppement caprin (Redcap).
Regroupant 28 levages en Poitou-
Charentes, Redcap vise acqurir
et diffuser des connaissances pour
permettre aux leveurs de dvelopper
la part dherbe dans lalimentation
de leurs chvres et favoriser leur
autonomie fourragre.
Parution dun guide
de conception pour
la filire lgumes
Le GIS Piclg a t charg de rdiger
un guide pratique pour la conception
de systmes lgumiers plus conomes
en produits phytosanitaires
destin au binme agriculteur/
accompagnateur-conseiller,
et pouvant aussi tre utilis lors
de formations pour des agriculteurs,
des conseillers ou des tudiants.
Ce travail sinscrit dans le plan
Ecophyto 2018.
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

57
L
e principal capital
dun tablissement
de recherche est
constitu par les comptences
de ses agents. Accueillir
et entretenir dans la dure
ces comptences en cohrence
avec les priorits
de ltablissement simpose
comme un enjeu essentiel.
La recherche rsulte de
la mobilisation de talents
individuels porteurs de crativit
et du leadership pour animer
des quipes autour de projets
innovants. Dans le domaine
de lappui la recherche,
cest une logique de mtier
qui prvaut pour permettre
llvation collective de la
qualit du service offert aux
scientifiques par lamlioration
des comptences de chacun.
Les recrutements 2011
En 2011, dans le cadre des recrutements de fonctionnaires par voie de concours, 289 profils
de chercheurs, ingnieurs et techniciens ont t proposs. Ils ont gnr 898 candidatures de
chercheurs et 4 668 candidatures dingnieurs et techniciens et ont permis le recrutement de
97 chercheurs et 177 ingnieurs et techniciens.
Lanne 2011 est marque par une attractivit qui a continu se dvelopper notamment sur
les profils de chercheurs de 2
e
classe et sur les profils dingnieurs de recherche. Corps pour
lesquels les taux de pression ont augment respectivement de 3 points (taux de pression de
14.3) et 4 points (taux de pression de 16.4). Il est noter que pour lensemble des autres corps,
les taux de pression sont rests stables.
Pour favoriser cette attractivit, un effort particulier a t ralis vers linternational pour une
meilleure lisibilit et comprhension du site web des concours par la traduction des profils en
langue anglaise, ce qui a contribu dvelopper le nombre de candidatures trangres (30%
des candidatures en CR2, en CR1 sur projets). En parallle, une collaboration troite entre la
DRH de lInra et la Commission europenne a permis de dvelopper la visibilit des profils
lchelle europenne ainsi 56.3% des candidats trangers taient dorigine europenne.
AMLIORER LATTRACTIVIT
ET MODERNISER LA GESTION
Centre de Jouy-en-Josas
W.Beaucardet


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Mise en place dun accompagnement
des mobilits internationales entrantes
Afin de faciliter le recrutement sur la scne acadmique, nationale et internationale,
lInra a renforc les conditions daccueil des chercheurs recruts lInra ayant ralis
jusque-l lensemble de leurs parcours ltranger. LInstitut propose ces derniers
de bnficier dune prestation personnalise et adapte afin de faciliter leur mobilit
entrante. Notre prestataire, Excutive Relocations, les accompagne pour toutes leurs
dmarches lies la recherche dun logement, la ralisation des dmarches admi-
nistratives (inscription la scurit sociale et/ou scolaire pour les enfants) mais
galement la gestion puis la coordination du dmnagement, des formations ou de
loutplacement pour le conjoint. Enfin, pour permettre encore une meilleure lisibilit
et attractivit de lInra lInternational, de nombreux supports de communication ont
t traduits en anglais et ce, pour une information facilite des collaborateurs tran-
gers (traduction du guide et du mmo de politique sociale)
Une dmarche intgre
de la prvention des risques
Lanne 2011 est marque par lvolution de la rglementation en matire de sant et
scurit des agents dans la fonction publique visant en particulier harmoniser les
exigences rglementaires avec les entreprises prives. Les membres reprsentants du
personnel des instances de concertation ont travaill conjointement avec les membres
de ladministration afin de prparer le passage aux comits dhygine, de scurit et de
conditions de travail en 2012. Des premires volutions des rgles de scurit ont gale-
ment t dployes dans les centres en fin danne 2011.
La sensibilisation des directeurs dunit au management de la prvention a t pour-
suivie par lorganisation de nouvelles formations ddies et par la diffusion du guide
prvention des risques pour les personnes, lenvironnement et les biens destination
des directeurs dunit. Les missions en charge de la qualit et de la prvention ont
men des actions conjointes de sensibilisation aux nouveaux directeurs dunit.
Les formations en matire de prvention des risques psychosociaux (RPS) se sont
poursuivies et un groupe de pilotage oprationnel a permis de capitaliser le retour
dexprience des centres dans ce domaine. Prventeurs et mdecins ont galement
apport leur concours cette dmarche de prvention afin de prparer lintgration
de lvaluation des RPS au sein du document unique de ltablissement.
Un nouvel outil pour llaboration du document unique, synthse des valuations des
risques professionnels, dnomm Outil de Pilotage de la prvention lInra a t dve-
lopp en 2011. Ralis avec le soutien de la DSI et du comit daccompagnement OPPI, il
sera accessible sur lintranet et dploy dans les centres ds le printemps 2012.
Des avances importantes dans
la gestion des systmes dinformation
Dans le champ de linformatique de proximit, le premier inventaire national des postes de tra-
vail a t conduit, munissant lensemble des professionnels en charge de leur administration des
cls pour une gestion optimise du parc (plus de 18 000 postes), socle dune offre de services
de proximit assume collectivement, ractive, adapte aux usages, et volutive.
Dans le champ de linformatique dappui, le dveloppement du systme dinformation insti-
tutionnel a t marqu par louverture russie du Systme dinformation de gestion de lInra
deux grandes coles de lenseignement suprieur agronomique, membres dAgreenium, en
accompagnement de la construction de campus intgrs Montpellier, et Rennes-Angers. Les
trois tablissements Agro Campus Ouest, SupAgro Montpellier et lInra se sont accords sur les
principes de gouvernance du systme dinformation partag acts dans une charte qui fonde
durablement le socle communautaire et son volution.
Dans le champ de linformatique scientifique, lInstitut, les dpartements et les centres sont
munis, au terme du programme daudits des infrastructures informatiques achev dbut 2011,
dune description dtaille du capital informatique, dcline par dpartement et par centre, et
dune vue qualifie de ladquation des dispositifs, des comptences et des forces de produc-
tion informatique aux besoins de la production scientifique. La connaissance partage et assu-
re de ce capital et des scnarios dvolution permet dassurer la stratgie de ltablissement
en matire de systmes dinformation scientifiques.
La Mission daudit
interne lInra
Dans les domaines de lappui
la recherche, lobjectif de lInstitut
est de fournir aux units un
environnement de qualit et des
outils de gestion au meilleur niveau
professionnel, contribuant mettre
en uvre la politique scientifique.
Des audits de services (services centraux,
units locales dappui la recherche,
missions nationales) et des audits
de fonctions (16 fonctions sont
aujourdhui identifies dans
ce cadre) sont raliss par une quipe
dauditeurs internes ou appartenant
au CGAAER*. Le premier programme
daudit a t mis en place en 2008.
Celui de lanne 2011 a port sur
laudit des services dappui du Centre
de Bordeaux, de la fonction
communication dans les Centres,
de la fonction achat des units et des
charges dinfrastructure. De plus,
une tude sur les indicateurs dactivit
et de performance de lappui
la recherche a t ralise, dans
la perspective de leur utilisation dans
le dialogue de gestion lchelle
des Centres et pour le suivi des
orientations nationales.
* Conseil gnral de lalimentation,
de lagriculture et des espaces ruraux.


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Une politique handicap
revisite et renforce
La convention triennale conclue avec
le Fonds dinsertion des personnes
handicapes de la Fonction publique
(FIPHFP) est arrive son terme
fin 2011. Ce partenariat a permis
lInra de dvelopper sa
politique daccueil des personnes
handicapes et de proposer des
mesures trs diversifies permettant
le dveloppement de parcours
professionnels adapts et le maintien
dans lemploi. LInra affiche
dsormais un taux lgal demploi
de 5,07% et est reconnu par le FIPHFP
comme un institut socialement
responsable.
Une innovation majeure est
intervenue en matire de Politique
handicap. Constatant un vivier
potentiel restreint sur les mtiers
pointus de lInstitut, lInra a tendu
le recrutement sur projet aux
chargs de recherche en situation de
handicap. Cette nouvelle procdure
a permis dintgrer cinq chargs
de recherche ayant propos un projet
de recherche en cohrence avec
les orientations stratgiques
et scientifiques de lInstitut.
Le rle essentiel de lvaluation
Dans les orientations dfinies sur la priode 2010-2020, le rle essentiel de lvaluation scienti-
fique dans le pilotage stratgique de la recherche est raffirm. Cest dans ce but que les valua-
tions des chercheurs et des ingnieurs sont mises en uvre, dans la mesure du possible, lanne
suivant lvaluation de leurs units.
valuation des ingnieurs
Pour lanne 2011, 431 ingnieurs ont t sollicits, et in fine, 381 dossiers examins par les
diffrentes commissions d'valuation des ingnieurs (CEI).
Le schma ci-dessous donne la rpartition des dossiers selon les diffrentes CEI en 2011

valuation des chercheurs
Le mandat des 13 commissions scientifiques spcialises (CSS) en charge de lvaluation
des chercheurs de lInstitut tant arriv chance le 30 septembre 2011, lInra les a renou-
veles pour quatre ans compter du 1
er
octobre 2011. La grille danalyse utilise pour dcrire
les activits des chercheurs et issue des travaux du groupe Erefin qui permet de tenir compte
des diffrentes missions des organismes de recherche finalise, est galement utilise par de
nombreuses units lInra dans le cadre de la prparation de lauto-valuation attendue dans le
rapport transmis lAERES. Les temps par activit cumuls par grade montrent, qu'en dbut de
carrire, les chercheurs consacrent l'essentiel de leur temps la production de connaissances
gnriques. Puis ils s'investissent aussi dans des recherches objectifs oprationnels. En paral-
lle, les responsabilits collectives augmentent ainsi que l'implication dans l'expertise et l'inte-
raction avec la socit.
valuation des units
Depuis janvier 2011, les units sont values sur un cycle de 5 annes. Ces valuations sont
maintenant rparties en 5 vagues. Pour lanne 2011, les units des centres de Colmar, Nancy,
Orlans, PACA, Poitou-Charentes et Tours ont t values.
Mthode pour la recherche (MPR)
MPR5 : processus conomiques et sociaux
MPR4 : milieux
et systmes physiques
MPR3 : alimentation
et nutrition humaine
MPR2 : biologie animale
MPR1 : biologie vgtale
laboration
des produits
transfrables
Conduite
d'instruments,
dinstallations
ou de ressources
usage partag
Appui la recherche
CR2
CR1
DR2
DR1-DREx
22%
11%
7%
7%
5%
26%
12%
10%
0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
p
Recherches gnriques
p
Recherches objectifs oprationnels
p
Expertises et tudes
p
Responsabilits collectives
p
Enseignement
p
Interaction science-socit


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LES HOMMES ET LES FEMMES 62
LES MOYENS FINANCIERS 64
L'ORGANISATION ET LA STRUCTURE 65
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REPRES 2011
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

61 B.Nicolas / Inra
62

I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


LES HOMMES
ET LES FEMMES
LES EFFECTIFS
Au 31 dcembre 2011, lInra compte 8 478 agents titulaires rmunrs, soit 4 208 femmes et 4 270 hommes. Au cours
de cette mme anne, lInra a accueilli 2 407 stagiaires, et rmunr plus de 3 000 contractuels, dont 526 doctorants,
36 jeunes scientifiques en pr-doc, 37 pr-docs trangers, 96 post-docs trangers et 4 post-docs sur financement du
ministre en charge de la recherche.
Dans le cadre de sa politique dinternationalisation des recrutements chercheurs, lInra grce ses actions de communi-
cation cibles et son effort damlioration du dispositif de recrutement, attire de plus en plus de chercheurs de nationalit
trangre : 171 (30%) au niveau CR2 sur comptences, 25 (39%) au niveau CR1 sur projets et 14% au niveau DR2 sur projets.
RPARTITION DE L'GE DES AGENTS TITULAIRES RMUNRS SELON LE GENRE
ET LA CATGORIE DE LA FONCTION PUBLIQUE AU 31 DCEMBRE 2011
68
67
66
65
64
63
62
60
59
58
57
56
55
54
53
52
50
49
48
47
46
45
44
43
42
40
39
38
37
36
35
34
33
32
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29
28
27
26
25
24
23
22
20
19
18
0 80 40 120 160 200 40 80 120 160 200
FEMMES
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EFFECTIFS
Lgende
p
Catgorie A femmes
p
Catgorie B et C femmes
p
Catgorie A hommes
p
Catgorie B et C hommes
HOMMES


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B
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c
a
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d
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t
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

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M
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Effectifs Scientifiques et direction Ingnieurs Techniciens Total
2007 1 828 2 427 4 249 8 504
2008 1 820 2 462 4 108 8 390
2009 1 839 2 572 4 121 8 532
2010 1 837 2 590 4 061 8 488
2011 1 830 2 640 4 008 8 478
40,6% 47,9% 51,3% 48%
41,6% 48,7% 51,7% 48,6%
42,6% 49,7% 52% 49,2%
43,5%
44% 50,2% 51,8% 49,6%
50% 52,1% 49,6%
% Taux de fminisation* Lgende
* Le taux de fminisation est le rapport du nombre de femmes l'effectif total.
VOLUTION DES EFFECTIFS TITULAIRES RMUNRS AU 31 DCEMBRE (SOURCE: DRH)
LA FORMATION
Le service de la Formation permanente nationale doit pro-
poser un accompagnement de qualit dans une priode de
changements importants pour lInra, qui impactent la politique
scientifique (nouveaux fronts de sciences, dveloppement des
approches trans et inter disciplinaires, innovation, valorisation,
internationalisation), les organisations (dveloppement des
plateformes, redploiement local-national, cration de TGU,
territorialisation), les modes de management (pilotage de
la recherche par projets, animation de rseaux mtiers profes-
sionnels, approche prospective des besoins en comptences),
les ressources (dveloppement de nouvelles comptences,
dploiement doutils et dquipements communs puissants).
Laudit interne de la formation permanente, qui a fait lobjet dun
rapport en 2011 et dune rponse du Directeur gnral dlgu,
confirme ses enjeux : une formation permanente dont la qua-
lit est reconnue par tous, en cohrence avec une politique de
ressources humaines au service des orientations scientifiques
et des volutions de ltablissement, dont les moyens sont glo-
balement bien dimensionns, mise en uvre par des quipes
motives et professionnelles, ouverte lensemble des catgo-
ries de personnel, quels que soient leur statut et leur corps.
En 2011, 59% des agents titulaires se sont forms et 2 300 contrac-
tuels ont eu un accs des actions de formation. Plus de 4,6 mil-
lions deuros ont t consacrs la formation permanente.
LA POLITIQUE SOCIALE
LAssociation pour le dveloppement des activits sociales
(Adas) rgie par la loi de 1901 est, en matire daction sociale,
lun des partenaires de lInstitut. Cette association a pour
objectif de promouvoir et dorganiser divers projets caractre
social, sportif et culturel auprs des personnels et retraits
de lInra. Dote en 2011 dun budget de plus de 3,37 millions
deuros, lAdas compte plus de 10 000 adhrents rpartis dans
48 sections locales. Ce sont plus de 200 bnvoles qui parti-
cipent quotidiennement au dveloppement des actions de
lassociation au bnfice premier des agents de lInra. En 2011,
diverses coupes sportives ont t organises (ski, volley)
ainsi que des week-ends dcouverte (Fries de Nol en
Alsace) ou encore, autre illustration du rle social de lAdas, un
voyage solidaire au Vnzuela.
LA PROMOTION
ET LGALIT HOMMES-FEMMES
LInra veille activement lquilibre entre les femmes et les
hommes, tant en termes de composition des jurys de concours
quen termes de nominations dans les instances collectives ou
aux postes de responsabilit. Ainsi, dans lensemble des com-
missions ou comits nationaux, les femmes reprsentent plus
de 40% des membres nomms ou lus. Entre 2006 et 2011, la
reprsentation des femmes aux postes de responsabilit sest
accrue de prs de 70%. titre dexemple, le taux de fminisa-
tion de la fonction de directeur/directrice dunit est pass de
15% 26% et celui des directeurs/directrices dunit adjoint(e)s
dpasse dsormais 34%. Dans les fonctions de chefs de dpar-
tements, le pourcentage atteint 28%.
TAUX DE FMINISATION DANS LES INSTANCES (EN %)
41%
28%
33%
26%
Chefs de
dpartement
Conseil
scientifique
Prsidents
de centre
Directeurs
d'units
64

I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


LES MOYENS FINANCIERS
LE BUDGET
Le budget primitif de lInra pour 2011 stablit 844 M. Il est en
progression de 3,7% par rapport 2010 en raison principalement de
lvolution des ressources provenant des contrats de recherche qui
augmentent de 18,3%.
LES RESSOURCES
Tel quarrt en fin dexercice aprs divers ajustements, le budget de
lInra ressort 907,3 M, montant comportant 75,9 M au titre des
reports de lexercice prcdent.
Lvolution de la structure de financement du budget demeure en
2011 quasi stable par rapport 2010. Les subventions pour charges
de service public dun montant de 652,5 M reprsentent 78,5% du
budget de lInstitut.
Les ressources propres slvent, quant elles, 178,9 M, soit une
proportion de 21,5% du total des ressources contre 21,1% en 2010.
Elles comprennent :
|e: contrat: de rec|erc|e et :out|en: |na||:e: (revu: a |auteur de
127,2 M, soit 15,3% du budget, intgrant une premire budgtisation
des investissements davenir hauteur de 2M ;
|e: autre: (rodu|t: ((rodu|t: va|or|:e: de |act|v|te de rec|erc|e.
prestations de services, ventes,) qui totalisent un montant de
51,7 M, soit 6,2% du budget.
LA RALISATION DU BUDGET 2011
Le budget 2011 de lInra est ralis pour un montant de recettes nettes
de 841,9 M et un volume de dpenses de 837,6 M. Cette situation
aboutit un solde positif de 4,3 M.
Rapproch des ultimes prvisions de recettes de lexercice (831,3 M),
le taux global de ralisation de celles-ci stablit 101,3% contre 97,6%
en 2010. Ces recettes se composent :
de: :u|vent|on: (our c|are: de :erv|ce (u|||c dont |e montant
(652,5 M) est en lgre progression (+0,5%) : elles reprsentent
77,5% des recettes ralises (80,9% en 2010) et couvrent 77,9% des
dpenses (79,2% en 2010)
de: :u|vent|on: et :out|en: |na||:e: (contrat: et convent|on: de
recherche, financement de programme) dont le montant des titres
mis slve 123,4 M, ce qui reprsente 65,2% du total des res-
sources propres contre 67,8% en 2010
de: autre: re::ource: (ro(re: qu| :eta|||::ent a GG.C |. :o|t
34,8% du total des ressources propres contre 32,2% en 2010.
Sagissant du taux de consommation des crdits ouverts, celui-ci,
apprci au niveau des mandatements, est de 92,3%, soit un taux en
nette progression par rapport celui de lan dernier (89,8%). Toute-
fois, ce taux porte sur un volume de crdits ouverts qui, dun budget
lautre, a diminu de 5,4 M. Cette comparaison fait apparatre une
volution diffrencie selon les natures de dpenses : - 8,7 M au
titre de la dotation globale ; - 5,4 M au titre de linvestissement. En
revanche, les crdits de masse salariale ont progress de 8,5 M.
La dynamique des dpenses par destination, y compris dpenses de per-
sonnel, atteste de la priorit budgtaire rserve aux activits conduites
directement par les units de recherche et exprimentales. Les quipes
de recherche peroivent directement 75,6% des moyens financiers
de ltablissement. Le taux dexcution sur cet agrgat augmente de
1,6 point compar 2010 (93,5% en 2011, contre 91,9% en 2010).
FIGURE 3 RALISATION DES RECETTES CONTRACTUELLES
PAR FINANCEUR
p
ANR
p
ANR - IA
p
Collectivits territoriales
p
Europe
p
OSEO
p
Autres partenaires
publics franais
p
Partenaires conomiques
p
Partenaires internationaux
FIGURE 2 RPARTITION DES DPENSES 2011 PAR FONCTION
p
Personnel des units :
462 M
p
Personnel des units sur
contrats et autres RP : 39 M
p
Fonctionnement et
quipement des units :
141 M
p
Personnel de soutien
et de support : 89 M
p
Frais d'infrastructure et
informatique collective : 76 M
p
Immobilier, entretien
et constructions : 31 M
FIGURE 1 VOLUTION DU BUDGET DE LINRA PAR CATGORIE
DE RESSOURCES (HORS REPORTS DE CRDITS)
p
Subventions pour charges
de service public
p
Contrats de recherche
et soutiens finaliss
p
Autres ressources propres
2008
740 M
2009
790 M
2010
822 M
2011
831 M
603
651
649
652
84
93
121
127
53
46
52
52
10%
26,23%
1,1%
25,22%
20,19%
3,3%
16,15%
16,15%
2,2%
55%
5%
17%
9%
4%
2011
831 M
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

65
LORGANISATION ET LA STRUCTURE
CONSEIL DADMINISTRATION AU 31 DCEMBRE 2011
MEMBRES DE DROIT
Prsidente
Marion Guillou
Prsidente directrice gnrale de l'Inra
Reprsentants de l'tat
Marion Zalay
Directrice gnrale de l'Enseignement
et de la Recherche
Ministre de l'Agriculture, de l'Alimentation,
de la Pche, de la Ruralit et de l'Amnagement
du territoire
ric Allain
Directeur gnral des Politiques agricole,
agroalimentaire et des territoires
Ministre de l'Agriculture, de l'Alimentation,
de la Pche, de la Ruralit et de l'Amnagement
du territoire
Catherine Gaudy
Directrice gnrale adjointe de la Recherche
et de lInnovation
Ministre de l'Enseignement suprieur
et de la Recherche
Didier Hoffschir
Directeur scientifique la direction
gnrale de la Recherche et de lInnovation
Ministre de lducation nationale, de la Jeunesse
et de la Vie associative
Marie-Christine Le Gal
Charge de mission la direction gnrale
de la Comptitivit, de lIndustrie et
des Services
Ministre de l'conomie, des Finances
et de l'Industrie
Grgory Cazalet
Chef du bureau de la recherche et de
l'enseignement suprieur, la direction
du Budget
Ministre du Budget, des Comptes publics,
de la Fonction publique et de la Rforme de l'tat
Arila Pochet
Chef du bureau des aliments,
direction gnrale de la Sant
Ministre du Travail, de l'Emploi et de la Sant
Jean-Louis Grard
Sous-directeur de la Politique
de la Consommation et de la Scurit
Ministre de l'conomie, des Finances
et de l'Industrie
Claire Hubert
Chef du service de la Recherche
Ministre de lcologie, du Dveloppement
durable, des Transports et du Logement
MEMBRES NOMMS
Prsident du Conseil scientifique
de l'Inra
Frdric Dardel
Prsident de l'Universit Paris Descartes
Reprsentants des organisations
professionnelles agricoles
Joseph Giroud
Secrtaire gnral de l'Assemble
permanente des chambres d'agriculture
Christophe Terrain
Prsident de la commission Recherche
et Innovation de la Fdration nationale
des syndicats d'exploitants agricoles
et prsident de lAssociation gnrale
des producteurs de mas
Dominique Lefebvre
Vice-Prsident de la Confdration
nationale de la mutualit, de la coopration
et du crdit agricole
Julien Valentin
Administrateur du Centre national
des jeunes agriculteurs
Reprsentants des industries
lies l'agriculture
Dominique Dutartre
Directeur gnral adjoint de la socit
Champagne Crales
Yves Bayon de Noyer
Prsident de la Commission de recherce
de l'Association nationale des industries
alimentaires (Ania)
Dominique Heriard Dubreuil
Prsidente du conseil d'administration
du groupe Rmy Cointreau
Franois Desprez
Prsident de l'Union franaise
des semenciers
Reprsentante des consommateurs
Reine-Claude Mader
Prsidente de la Confdration
de la consommation, du logement
et du cadre de vie
Reprsentants des salaris
de l'agriculture
Andr Hemmerle
Fdration nationale agroalimentaire
et forestire CGT
Frdric Malterre
Secrtaire national de la Fdration
gnrale CFDT agroalimentaire
MEMBRES LUS
lisabeth Blesbois (CFDT)
Unit Physiologie de la reproduction et
des comportements - Inra Tours
Jamila Anba-Mondoloni (CFDT)
Unit Flore lactique et environnement carn
- Inra Jouy-en-Josas
Pascal Tillard (CGT)
Unit Biochimie et physiologie molculaire
des plantes - Inra Montpellier
Thierry Magallon (CFTC)
Unit Physiologie de la reproduction et
des comportements - Inra Tours
Bernard Rolland (Sud Recherche EPST)
Unit Amlioration des plantes et
biotechnologies vgtales - Inra Rennes
Le Conseil dadministration dlibre notamment sur lorientation
de la politique de recherche de lInstitut, les programmes gnraux
dactivits et dinvestissements, lexploitation des rsultats de
la recherche et sur les mesures gnrales relatives lorganisation
de lInstitut, son budget, ses modifications et son compte financier.
66

I NRA RAPPORT ANNUEL 2011


CONSEIL SCIENTIFIQUE AU 31 DCEMBRE 2011
COMIT CONSULTATIF DTHIQUE POUR LA RECHERCHE AGRONOMIQUE,
COMMUN AU CIRAD ET LINRA
PRSIDENT
Frdric DARDEL
Prsident de lUniversit Paris Descartes
MEMBRES DE DROIT
Marion Guillou
Prsidente directrice gnrale de l'Inra
Franois Houllier
Directeur gnral dlgu l'organisation,
aux moyens et l'valuation scientifiques
de l'Inra
Marion Zalay
Directrice gnrale de l'Enseignement
et de la Recherche
Ministre de l'Agriculture, de l'Alimentation,
de la Pche, de la Ruralit et de l'Amnagement
du territoire
Patrick Hetzel
Directeur gnral de l'Enseignement
suprieur et de l'Insertion professionnelle
Ministre de l'Enseignement suprieur
et de la Recherche
Ronan Stephan
Directeur gnral de la recherche
et de l'innovation
Ministre de l'Enseignement suprieur et
de la Recherche
MEMBRES NOMMS
Maurice Barbezant
Directeur de lUnion nationale
des coopratives agricoles dlevage
et dinsmination animale
Hlne Barbier-Brygoo
Directrice de recherche au Centre national
de la recherche scientifique (CNRS)
Dominique Bureau
Professeur charg de cours
lcole Polytechnique
Patrick Caron
Directeur gnral dlgu la recherche
et la stratgie, Centre de coopration
internationale en recherche agronomique
pour le dveloppement (Cirad)
Sophie Jullian
Directrice scientifique dIFP nergies nouvelles
Marianne Lefort
Directrice scientifique dAgroParisTech
Gilles Pinay
Professeur lUniversit de Birmingham
Dominique Pontier
Professeur l'Universit Claude Bernard,
Lyon I
John Porter
Professeur lUniversit de Copenhague
Andr Pouzet
Directeur du Centre technique
interprofessionnel des olagineux
mtropolitains (Cetiom)
Isabelle Rico-Lattes
Directrice de recherche au Centre national
de la recherche scientifique (CNRS)
MEMBRES LUS DE LINRA
Daniel Auclair
Environnement et Agronomie, cologie
des forts, prairies et milieux aquatiques
Catherine Albertini
Sant des plantes et environnement
Taline Elmayan
Gntique et amlioration des plantes,
Biologie vgtale, Groupe d'tude et
de contrle des varits et des semences
Jean-Michel Salmon
Caractrisation et laboration des produits
issus de l'agriculture
Yves Chilliard
Physiologie animale et systmes d'levage
Harry Archimede
Sant animale, Gntique animale
Monique Lavialle
Alimentation humaine, Microbiologie
et chane alimentaire
Jol Chaduf
Sciences sociales, agriculture et
alimentation, espace et environnement ;
Mathmatiques et informatique appliques ;
Sciences pour l'action et le dveloppement
Nicolas Maurin
Services d'appui la recherche,
Administration centrale, Documentation
et publications, Informatique
PRSIDENT
Louis Schweitzer
Prsident de la Haute autorit de lutte contre
les discriminations et pour l'galit (Halde)
MEMBRES NOMMS
Fifi Benaboud
Centre Nord-Sud du Conseil de l'Europe
Gilles Buf
Prsident du Conseil scientifique
du Museum national d'Histoire naturelle
Marcel Bursztyn
Socio-conomiste, directeur du Centre pour
le dveloppement durable l'Universit
de Brasilia
Claude Chreau
Inspecteur gnral honoraire de l'agriculture
Soraya Duboc
Ingnieur agroalimentaire chez Nestl France
Patrick Du Jardin
Agronome, doyen de lUniversit
de Gembloux (Belgique)
Catherine Larrre
Professeur agrg de philosophie
l'Universit Paris 1
Jeanne-Marie Parly
Anthropologue, professeur agrg
des universits en sciences conomiques
Grard Pascal
Nutritionniste, directeur de recherche
honoraire
Lazare Poam
Docteur en philosophie, professeur
l'Universit de Bouak et prsident
du Comit consultatif national de
Biothique (Cte d'Ivoire)
Grard Toulouse
Agrg de sciences, directeur de recherche,
laboratoire de Physique thorique
de l'cole normale suprieure (ENS)
Dominique Vermersch
Agronome, professeur d'conomie publique
et d'thique Agrocampus Rennes
Heinz Wismann
Philosophe, professeur l'cole des hautes
tudes en sciences sociales (EHESS)
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Le Conseil scientifique est une instance de rflexion et de proposition en
matire de politique scientifique et dvaluation des activits de recherche.
Ce comit consultatif a pour objectif de traiter des questions thiques
que peuvent soulever lactivit et le processus de recherche en France et
hors de France, dans les domaines de lagriculture, de lalimentation, de
lenvironnement et du dveloppement durable. Il est plac auprs du prsident
du Conseil dadministration de lInstitut. Il est commun au Cirad et lInra.
I NRA RAPPORT ANNUEL 2011

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ORGANIGRAMME AU 1
ER
JUIN 2012
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Batrice
Darcy-Vrillon
& Jean Fioramonti
(co-direction
par intrim)
Alimentation humaine
Frdric Gaymard
Biologie vgtale
Monique Axelos
Caractrisation et
laboration des produits
issus de l'agriculture
Jean-Marc Guehl
cologie des forts,
prairies et milieux
aquatiques
Guy Richard
Environnement
et agronomie
Denis Milan
Gntique animale
Carole Caranta
(par intrim)
Gntique et
amlioration des plantes
Frdrick Garcia
Mathmatiques et
informatique appliques
Emmanuelle
Maguin
Microbiologie
et chane alimentaire
Benoit Malpaux
Physiologie animale
et systmes d'levage
Thierry Pineau
Sant animale
Olivier Le Gall
Sant des plantes
et environnement
Benoit Dedieu
Sciences pour l'action
et le dveloppement
Bertrand Schmitt
Sciences sociales,
agriculture
et alimentation, espace
et environnement
CHEFS DE DPARTEMENTS DE RECHERCHE
DIRECTIONS DAPPUI
LA RECHERCHE
Vronique
Debisschop
Directrice de
laction rgionale,
de lenseignement
suprieur et de
lEurope
Franois
Chambelin
Directeur du
financement et
de ladministration
gnrale
Fabrice Marty
Directeur
des ressources
humaines
Sylvie Moreau
Directrice
du systme
dinformation
Grard
Jacquin
Directeur de
la valorisation
AGENCE COMPTABLE
Philippe Martin
Agent comptable principal
Marion Guillou
Prsidente directrice
gnrale
Guy Riba
Vice-prsident
non-excutif
COLLGE DE DIRECTION
Christine Cherbut
Directrice scientifique
Alimentation
Herv Guyomard
Directeur scientifique
Agriculture
Jean-Franois
Soussana
Directeur scientifique
Environnement
DIRECTEURS SCIENTIFIQUES
Philippe
Chemineau
Dlgu lexpertise
scientifique collective,
la prospective
et aux tudes
Robert Habib
Dlgu scientifique
pour linternational
Paul Colonna
Dlgu scientifique au
dveloppement durable
Mission de coordination
des services dconcentrs
d'appui la recherche
Pierre Paris
Mission d'anticipation recherche/
socit et dveloppement durable
Jean-Luc Pujol
Mission daudit interne
et dinspection
Pierre-Henri Due
Jean-Franois
Launay
Directeur de la Mission
communication
(Micom)
Bruno
Goffinet
Directeur
de la Dlgation
l'valuation
Michel Eddi
Directeur gnral
dlgu, charg de
l'appui la recherche
Franois
Houllier
Directeur gnral
dlgu l'organisation,
aux moyens et
l'valuation scientifiques
CONSEIL
D'ADMINISTRATION
Prsidente Marion Guillou
CONSEIL SCIENTIFIQUE
Prsident
Frdric
Dardel
COMIT D'THIQUE
Prsident
Louis
Schweitzer
Henri Seegers
Angers-Nantes
Alice Danielle
Celestine-Myrtil-
Marlin
Antilles-Guyane
Hubert de
Rochambeau
Bordeaux-Aquitaine
Michel Beckert
Clermont-Ferrand - Theix
- Lyon
Frdrique Pelsy
Colmar
Dominique Agostini
Corse
Patrick Etievant
Dijon
Muriel
Mambrini-Doudet
Jouy-en-Josas
Gilles Gandemer
Lille
Laurent Bruckler
Montpellier
Erwin Dreyer
Nancy
Catherine Beaumont
Orlans
Robert Thivet
(administrateur)
Paris (centre-sige)
Jean-Marc
Chabosseau
Poitou-Charentes
Michel Bariteau
Provence-Alpes-
Cte-d'Azur
Patrick Herpin
Rennes
Michle Marin
Toulouse
Catherine Beaumont
Tours
Laurent Hmidy
Versailles-Grignon
PRSIDENTS DES CENTRES DE RECHERCHE
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