La energa total del universo es constante y la entropa esta continuamente incrementndose

Rudolf Clausius (1865)

Leyes Fundamentales de la Termodinmica

Primera Ley: El principio de la conservacin de la energa Para cualquier cambio fsico o qumico, la cantidad total de energa del universo permanece constante. Segunda Ley: El principio del desorden La cantidad de entropa de un sistema aislado termodinmicamente tiende a incrementarse con el tiempo, hasta alcanzar un valor mximo. Tercera: La imposibilidad de llegar al cero absoluto Es imposible alcanzar una temperatura igual al cero absoluto mediante un nmero finito de procesos fsicos. Ley cero: Del equilibrio termodinmico Si dos sistemas A y B estn en equilibrio termodinmico, y B est en equilibrio termodinmico con un tercer sistema C, entonces A y C estn a su vez en equilibrio termodinmico.

Bioenergtica
Entalpa
Entropa Energa Libre de Gibbs

Bioenergtica
Entalpa (H): Es el contenido de calor del sistema. Esto refleja el nmero y las clases de uniones qumicas en los reactantes y productos. Cuando una reaccin qumica libera calor (exotrmica) el contenido de calor de los productos es menos que l de los reactantes y por tanto H tiene un valor negativo. Los sistemas que al reaccionar adquieren calor de su entorno son endotrmicos y tienen valores positivos de H.

Entropa (S): Es una expresin cuantitativa para la aleatoriedad o el desorden en un sistema. Cuando los productos de una reaccin son menos complejos y ms desordenados que los reactantes, se dice que la reaccin a ganado en entropa.
Energa libre de Gibbs (G): Expresa la cantidad de energa capaz de realizar un trabajo durante una reaccin a temperatura y presin constantes. Las reacciones exergnicas producen liberacin de energa libre, por lo que el G es negativo y las reacciones endergnicas, que ganan energa, tienen un G positivo.

Las clulas requieren energa libre

La composicin de un sistema reactivo (mezcla de reactantes y productos) tiende a continuar cambiando hasta que el equilibrio es alcanzado.

Cuando un sistema no esta en equilibrio, la tendencia a moverse hacia el equilibrio representa una fuerza direccional; la magnitud de la misma puede ser expresada como el cambio de la energa libre (G) para la reaccin. Bajo condiciones estandar de temperatura (25 C = 298 K) y concentraciones iniciales de 1 M (o para gases de presin parcial de 1 Atm = 101.3 kPa); la fuerza que dirige el sistema hacia el equilibrio, pude ser definida como la energa libre estandar (G).

Entonces las constantes qumicas basadas en estos estandares bioqumicos son llamadas constantes de transformacin estandar y se escriben con un smbolo primo (G' y K'eq).

El cambio de energa libre estandar de una reaccin qumica es solo

una medida matemtica de

expresar la constante de equilibrio

Cuando el G es
negativo, los productos tienen menor energa libre que los reactantes, por lo que la reaccin puede proceder espontaneamente bajo

condiciones estandar

Ejemplo: Calcular la energa libre estandar

20mM 1 mM 19 mM

Notar: La hidrlisis de esteres simples, amidas

y glicsidos, al igual que

las reacciones de isomera presentan relativamente pequeos G; mientras que la oxidacin completa de componentes orgnicos

resulta en una gran

disminucin en la

energa libre estandar

Enzimas

Importancia de las enzimas para la vida

Las enzimas son catalizadores biolgicos extraordinariamente eficientes. La mayora de las reacciones catalizadas por enzimas dentro de los seres vivos jamas alcanzaran tasas significativas bajo las condiciones fisiologicas normales en ausencia de enzimas.

Casi todas las enzimas son protenas

Ribozimas

30 g de pepsina cristalina
pura son capaces de

digerir casi dos toneladas

mtricas de clara de huevo

en pocas horas.

Incrementos en la Velocidad de Catlisis Producidos por Enzimas

Enzima Reaccin sin Enzima (t1/2) Tasa de Incremento

_______________________________________________________________

Anhidrasa carbnica
Carboxipeptidasa A Adenosina desaminasa AMP nucleosidasa Nucleasa Staphylococcal OMP descarboxilasa

5 aos
24 aos 120 aos 69 000 aos 130 000 aos 78 000 000 aos

107
1011 1012 1012 1014 1017

_______________________________________________________________

Las Enzimas son catalizadores altamente especficos

Caractersticas de Catalizador
La concentracin de la enzima no vara durante la reaccin. La enzimas no alteran el equilibrio qumico de la reaccin. La Velocidad es una funcin de la concentracin de la enzima hasta la concentracin de sustrato limitante. Disminuyen el G (Energa de Activacin). Aceleran la reaccin en varios ordenes de magnitud con respecto a la no catalizada.

Caractersticas Proteicas
Elevado peso molecular (> 12 KD). Presentan estructura tridimensional (3ria o 4ria). Sufren denaturacin.

Otras Caractersticas
Elevada especificidad. Elevado grado de efectividad. Capacidad de regular la velocidad de reaccin.

Especificidad: Sitio Activo

1. De Reaccin: Sirve para varios sustratos que comparten un elemento comn. Ej: Fosfatasas (hidrolizan grupos P en casi cualquier sustrato) 2. Absoluta: Reaccin nica, sustrato nico Ej: Ureasa (cataliza la hidrlisis de urea a dixido de carbono y amoniaco.) 3. Estereo-especificidad: Capacidad de diferenciar entre ismeros. Ej: Aspartasa (cataliza la adicin reversible de amoniaco al cido fumrico, transformndolo en L- aspartato)

Teoras del Sitio Activo

Modelo de Llave y Cerradura

Modelo de Ajuste inducido

Efectividad
Nmero de Recambio: Es el nmero de molculas de sustrato que es capaz de catalizar una molcula de enzima en una unidad de tiempo (minutos). Ejemplos: Citocromo C 1400 / min Catalasa 5,6 millones/min Anhidrasa Carbnica 36 millones / min

Velocidad de Reaccin
La velocidad de reaccin de una enzima se ve afectada por la efectividad de la misma, el grado de afinidad de la enzima por el sustrato, el pH, la temperatura, la presencia de cofactores, las concentraciones del sustrato y de los productos finales, la presencia de inhibidores, etc.
Ejemplo: La pepsina a pH 2 hidroliza 50,000 enlaces /min La pepsina a pH 5 hidroliza 1,2000 enlaces /min

Nomenclatura y Clasificacin de las Enzimas

Nombre Comn: Una forma general de denominar a las enzimas es aadir el sufijo "asa" al nombre del sustrato; sin embargo con el descubrimiento de nuevas enzimas esta nomenclatura resulta a veces confusa. Actualmente se ha adoptado ciertas recomendaciones de la Internacional Enzime Comission, que pretende sistematizar la nomenclatura y clasificacin de las diferentes enzimas conocidas. Este sistema divide a las enzimas por el tipo de reaccin que catalizan en seis clases que a su vez pueden tener diferentes subclases. Nombre Sistemtico: El nmero de clasificacin es una serie de 4 dgitos que designan la clase, subclase,sub-subclase y nmero de orden de la enzima dentro de la clasificacin internacional que va precedido por las siglas EC.

1. Oxido-Reductasas
Son enzimas de xido-reduccin que catalizan la transferencia de tomos de H. (transferencia de electrones). Subclases:

1.1 actan sobre >CH-OH

1.2 actan sobre >C=O

1.3 actan sobre >C=CH1.4 actan sobre >CH-NH2 1.12 actan sobre hidrgeno 1.97 Otras oxidoreductasas

2. Transferasas
Catalizan la transferencia de grupos funcionales distintos del H (transferencia de grupos). Estos grupos funcionales pueden ser

un carbono, grupos aldehdos o cetnicos, fosfatos, aminos etc.

Subclases: 2.1 grupos con un tomo de carbono 2.2 funciones aldehdo o cetona 2.3 grupos acilo (aciltransferasas) 2.4 grupos glucosilo (glucosiltransferasas) 2.8 grupos sulfurados 2.9 grupos que contienen selenio

3. Hidrolasas
Actan hidrolizando determinados enlaces de numerosos compuestos (reacciones de hidrlisis o transferencia de grupos funcionales al agua)

Subclases:
3.1 actan sobre enlaces ster 3.2 actan sobre enlace glicosdicos 3.3 hidrolizan enlaces eter 3.4 actan sobre enlaces peptdicos 3.6 actan sobre anhdridos de cido 3.12 actan sobre enlaces S-S

4. Liasas
Catalizan la separacin de grupos qumicos del sustrato por va no hidroltica (adicin de grupos a dobles enlaces). Remueven o

agregan los elementos del agua, amonio o CO2.

Subclases: 4.1 actan sobre enlaces >C=C< 4.2 actan sobre enlaces >C=O 4.3 actan sobre enlaces >C=NH4.4 actan sobre enlaces C-S 4.6 actan sobre enlaces P-O 4. 99 Otras liasas

5. Isomerasas
Actan catalizando la interconversin de ismeros estructurales,

de posicin u pticos, de una a otra forma (transferencia de

grupos en el interior de la molcula para originar formas isomricas). Subclases: 5.1 racemasas y epimerasas 5.2 isomerasas cis-trans 5.4 mutasas 5.5 liasas intramoleculares 5.99 otras isomerasas

6. Ligasas
Catalizan la unin de dos compuestos, mediante la energa

liberada en la ruptura de una molcula de ATP (forman diversos

enlaces acoplados a la ruptura de ATP). Subclases: 6.1 formacin de enlaces C-O 6.2 formacin de enlaces C-S 6.3 formacin de enlaces C-N 6.4 formacin de enlaces C-C 6.5 formacin de enlaces P-O

Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB) EC 1 EC 1.4 EC 1.4.1 Ejemplos: EC 1.4.1.1 EC 1.4.1.2 EC 1.4.1.3 EC 1.4.1.4 EC 1.4.1.5 EC 1.4.1.6 EC 1.4.1.7 EC 1.4.1.8 EC 1.4.1.9 Alanina deshidrogenasa Glutamato deshidrogenasa Glutamato deshidrogenasa [NAD(P)+] Glutamato deshidrogenasa (NADP+) L-aminocidos deshidrogenasa SUBGRUPO BORRADO, incluido en EC 1.4.4.1 Serina 2- deshidrogenasa Valina deshidrogenasa (NADP+) Leucina deshidrogenasa
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/

OXIDOREDUCTASAS Actan sobre los grupos donadores CH-NH2 Utilizan NAD+ o NADP+ como aceptor

Cmo funcionan las enzimas?

La caracterstica distintiva de una reaccin catalizada por una enzima es que tiene lugar en un bolsillo de la enzima llamado Sitio Activo. La molcula que se une a dicho sitio es llamada sustrato y las otras molculas que participan unindose a la enzima pueden ser cofactores, potenciadores o inhibidores.

El Centro Activo

Multiples interacciones permiten a un sustrato especfico inducir grandes cambios conformacionales en las enzimas.

Enzimas: Trminos relacionados

Apoenzima: Referido solo a la parte proteica de la enzima Holoenzima: Es la protena unido a una coenzima y/o in metlico Grupo Prosttico: Componente orgnico unido fuertemente (covalentemente) a la apoenzima. Es frecuente la confusin entre cofactor y grupo prosttico, pero la diferencia radica en la fuerza de su unin a la enzima. Cofactor (coenzima): Son molculas orgnicas inorgnicas, cuya presencia es necesaria para que la enzima sea activa.

Cofactores: molculas inorgnicas

Coenzimas: Cofactores orgnicos

El Estado de Transicin
Es un complejo temporal formado por la enzima y el sustrato que permite favorecer la reaccin:

Es importante notar que las enzimas no afectan el equilibrio de la reaccin (la diferencia en las concentraciones finales de S y P)
Las enzimas adems no son afectadas por la reaccin (no sufren ningn cambio permanente).

Diagrama de una reaccin qumica

GS P

Final energy change

GP S G'

Diagrama de una reaccin catalizada enzimaticamente

Cintica Enzimtica

Leonor Michaelis (18751949) y Maud Menten (18791960), pioneros de la Cintica Enzimtica.

La concentracin de sustrato [S]

Es uno de los factores claves que afectan la tasa de reaccin catalizada por una enzima. Dada la dificultad del estudio de este parmetro (la [S] cambia durante el curso de la reaccin), una aproximacin es medir la tasa inicial, denominada velocidad inicial (V0) cuando la [S] es mucho mayor que la [E]. A bajas [S], la V0 se incrementa casi linearmente cuando se incrementa [S]; a elevadas [S] el incremento en V0 es cada vez ms pequeo, hasta que finalmente alcanza un punto cercano a la velocidad mxima (Vmax)

Efecto de la [S] en la V0

Cuantificaciones
La relacin entre [S] y Vo, puede ser expresada algebraicamente gracias a la ecuacin de Michaelis-Menten:

donde:
Km es la concentracin de sustrato a la cual se logra la mitad de la velocidad mxima

El plot doble recproco: La ecuacin de Lineweaber-Burk

La V0 depende de la [S]

El Km puede variar grandemente de enzima a enzima; e incluso para diferentes sustratos de una misma enzima

El Km puede servirno de indicador indirecto de la afinidad de una enzima por su sustrato

Aplicacin Clnica: Efecto fisiolgico de las variaciones del Km. Sensibilidad a las bebidas alcohlicas
La inusual sensibilidad a las bebidas alcohlicas que presentan los orientales tiene una base bioqumica.

Los efectos fisiolgicos tpicos del consumo de alcohol son provocados en su mayora por el acetaldehdo liberado por la alcohol deshidrogenasa heptica. El acetaldehdo a su vez es eliminado por la enzima mitocondrial aldehdo deshidrogenasa (que tiene un Km bajo para el aldehdo) siendo convertido en acetato. Algunos asiticos no presentan esta forma enzimtica, solo poseen la enzima citoslica de Km alta, lo que conlleva a un nivel elevado de acetaldehdo en los tejidos.

Inhibicin Enzimtica
Los inhibidores enzimticos son agentes moleculares que interfieren con la catlisis disminuyendo la velocidad de las reacciones o inclusive detenindola completamente.

Existen dos tipos principales de inhibidores enzimticos: Inhibidores Reversibles Competitivos No competitivos Mixtos Inhibidores Irreversibles

Aplicacin Clnica: Diseo de un inhibidor selectivo

Las prostaglandinas son importantes hormonas derivadas de cidos grasos que entre sus variados efectos fisiolgicos se cuentan el dolor y la inflamacin. Tradicionalmente la artritis ha sido tratada con aspirina y otros frmacos que inhiben las enzimas ciclooxigenasas (COX) que participan en la sntesis de estas hormonas. Sin embargo, debido que otro de los efectos de las prostaglandinas es proteger la mucosa gstrica, se ha determinado que el uso prolongado de estos frmacos produce hemorragias gastrointestinales . Recientemente se ha determinado que existen dos clases de COX 1 y 2 que se expresan diferencialmente en los tejidos,; COX-1 fabrica prostaglandinas protectoras de la mucosa estomacal y COX-2 se induce bajo artritis causando dolor e inflamacin. Debido a que la nica diferencia significativa entre ambas enzimas es un aminocido en la posicin 523 (valina por isoleucina) se ha diseado un frmaco que especficamente inhibe a COX-2, permitiendo que COX-1 contine produciendo prostaglandinas protectoras del epitelio.

Inhibicin Reversible

El inhibidor compite con el sustrato por el sitio activo. Usualmente son compuestos anlogos del sustrato.

Anlisis cuantitativo de la inhibicin competitiva

donde:

Ecuacin Lineweaver-Burk:

El inhibidor se une a un sitio distinto del sitio activo. Siempre se unen al complejo E-S.

Anlisis cuantitativo de la inhibicin no competitiva

donde:

Ecuacin Lineweaver-Burk:

El inhibidor se une a un sitio distinto del sitio activo. Tiene la capacidad de unirse tanto a la enzima libre, como al complejo E-S.

Anlisis cuantitativo de la inhibicin mixta:

donde:

Ecuacin Lineweaver-Burk:

Test cintico para determinar el mecanismo de inhibicin

Inhibicin Irreversible
Son aquellos que se unen
covalentemente con la

enzima, o que destruyen un

grupo funcional de la misma

esencial para su actividad

enzimtica, o que forman

asociaciones no covalentes
particularmente estables.

Otros factores que afectan la Actividad Enzimtica

pH

Presin

Temperatura

Aplicacin Clnica: La labilidad trmica de la glucosa 6-fosfato deshidrogenasa (G6PD) produce anemia hemoltica
La G6PD es una importante enzima celular en trminos de mantenimiento de la membrana. Existen individuos con variantes mutadas de esta enzima que presentan sensibilidades mayores al estrs oxidativo o trmico, inactivndose y/o degradndose rpidamente. Esta situacin es especialmente crtica para los hemates puesto que una vez maduros carecen de la capacidad para sintetizar protenas y por los tanto no puede renovar las enzimas a medida que se desnaturalizan. El resultado es un tiempo de vida mas corto para las clulas con G6PD inestable, especialmente bajo otros tipos de estrs que generan fiebre.

Enzimas Isostricas y Alostricas

Una enzima isostrica es aquella cuya

actividad est
regulada por la

unin del sustrato

al sitio activo.

Una enzima alostrica es aquella cuya actividad est regulada mediante un centro alostrico (un sitio distinto del centro activo) al que se une un regulador de manera reversible y no covalente.

La unin de este regulador modifica la estructura de la enzima y afecta la configuracin del sitio activo, por lo que aumenta o disminuye su actividad, segn el caso.

Las enzimas como indicadoras de enfermedades

Exmenes comunes que incluyen anlisis de enzimas en sangre

Su relacin de concentracin plasma/tejidos es < 1:1000.
GPT (Transaminasa glutamico purinica, tambien llamada ALT: Alaninoaminotransferasa): Hgado. GOT (Transaminasa glutamico oxalacetica, tambien llamada AST: Aspartatoaminotransferasa): Hgado, musculo cardiaco y esqueltico, rin, cerebro, pncreas y pulmones. GGT (Gamma-glutamil-tranferasa): hgado (bilis). FAL (Fosfatasa alcalina): hgado, huesos, placenta e intestino FAC (Fosfatasa acida): tejido prosttico, eritroso y plaquetas Troponinas cardacas C (TpTc) e I (TpIc): msculo cardaco. Alfa-amilasa: glndula pancretica y salival. Fosfolipasas: pncreas y bazo. Creatina fosfato (CPK 1, 2 y 3): cerebro, miocardio y musculo respectivamente. Lactato deshidrogenasa (LDH 1 a 5): Miocardio, eritrocito, cerebro, rion, higado y musculo esqueltico respectivamente.

Enzimas como agentes teraputicos

Estreptoquinasa: se usa para disolver cogulos formados en infartos del miocardio y extremidades. Activa la plasmina, serina proteasa que corta la fibrina insoluble del coagulo en componentes solubles Activador tisular del plasmingeno (t-PA): disolver cogulos Asparaginasa: control de leucemias. Las clulas tumorales requieren asparagina, esta enzima disminuye los niveles sricos de este aminocido.

Enzimas en farmacia e industria

-galactosidasa: disminucin de la lactosa en leche para personas intolerantes a este azcar. 11--hidroxilasa y -1,2-deshidrogenasa: produccin de prednisolona, precursor de la prednisdona, hormona de efecto glucocorticoide

1ra. Prueba Parcial !!!!