UNIVERSIDAD AUTNOMA CHAPINGO DEPARTAMENTO DE FITOTECNIA PROGRAMA DEL CURSO: BIOLOGA MOLECULAR DATOS GENERALES.

Departamento: Programa Educativo: Nivel Educativo: rea de Conocimiento: Asignatura: Carcter: Tipo: Prerrequisitos: Profesor: Semestre: Ao: Horas/Teora/Semana: Horas/Prctica/Semana: Horas Totales Del Curso: INTRODUCCIN Este curso se caracteriza por tener un enfoque bsico y aplicado, lo cual da la oportunidad a los alumnos de los ltimos semestres de la especialidad de Fitotecnia a entrar en contacto con los ltimos avances de la Biologa Molecular. Los alumnos orientados hacia el mejoramiento gentico de plantas o a la investigacin en biotecnologa, podrn tener una visin en perspectiva sobre el potencial que ofrece la Biologa Molecular para contribuir al entendimiento bsico de otras disciplinas tales como la Ingeniera Gentica, Cultivo de Tejidos y el Fitomejoramiento tradicional y clsico. PRESENTACIN Con antecedentes tales como la elucidacin de la estructura tridimensional del ADN, el cdigo gentico y la sntesis de protenas, se desarroll la gentica de procariontes y las tcnicas para manipular al ADN o ingeniera gentica, alcanzando la biologa molecular su carta de naturalizacin como ciencia. En la dcada de los 80's, esta nueva ciencia utilizaba sus conocimientos bsicos para irrumpir explosivamente en el campo de la medicina, la industria y la agronoma. En esta ltima rea, que es la de inters en el presente curso, se han dado avances considerables en el mejoramiento de bacterias y plantas de importancia, por mtodos no convencionales, que tienen su origen en la manipulacin in vitro de molculas qumicas biolgicamente activas. Fitotecnia Ingeniero Agrnomo Especialista en Fitotecnia Licenciatura Agrobiologa. Biologa Molecular Optativo Terico-Practico Gentica, Fisiologa Vegetal, Bioqumica Dra. Ernestina Valadez Moctezuma Primero y Segundo Sexto 3.0 2.0 85.0

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El acceso a esta nueva ciencia aplicada se ha presentado en aquellos grupos, instituciones y pases que se han preocupado por mantener una infraestructura material y recursos humanos altamente calificados para desarrollar investigaciones en este campo. Dadas las caractersticas de nuestra institucin, es necesario empezar a involucrarnos en esta rea, para lo cual se requiere de una motivacin a los estudiantes que podra repercutir en futuros investigadores en el planteamiento y desarrollo de investigaciones en biologa molecular. CONOCIMIENTOS BSICOS El curso est diseado para alumnos de licenciatura que posean conocimientos bsicos de gentica, bioqumica y fisiologa vegetal. Ser adems un apoyo para aquellos estudiantes interesados en la biotecnologa agrcola o en el mejoramiento gentico, que deseen complementar su formacin conociendo los aportes y potencialidades de la biologa molecular. OBJETIVOS GENERALES En este curso, el alumno adquirir los conocimientos bsicos sobre las macromolculas (cidos nucleicos y protenas), gentica bacteriana y tcnicas bsicas del ADN recombinante, lo que le permitir posteriormente, acceder al conocimiento y anlisis, logros y perspectivas de la ingeniera gentica en procariontes y eucariontes, as como sus aplicaciones.

PROGRAMA DE TEORIA UNIDAD 1. ACIDOS NUCLEICOS 6.0 h

Objetivo: Alcanzar el conocimiento fundamental sobre las propiedades fisico-qumicas y estructurales de los cidos nucleicos que le permitan entender sus propiedades biolgicas. 1.1 ESTRUCTURA Y PROPIEDADES QUIMICAS - nucletidos - estructura del ADN - estructura del ARN - propiedades fisicoqumicas de los cidos nucleicos 1.2 DUPLICACIN DEL ADN - modelos - duplicacin en procariotes - duplicacin en eucariotes 1.3 MTODOS FISICO-QUIMICOS DE ANLISIS - espectrofotometra - ultracentrifugacin - electroforesis

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1.4 SNTESIS Y SECUENCIACIN DE ADN - Sntesis qumica de oligonucletidos - Mtodos de secuenciacin (Sanger y Maxam-Gilbert) UNIDAD 2. PROTENAS 9.0 h

Objetivo: Conocer la funcin y codificacin de la informacin gentica a nivel celular, as como las propiedades fisico-qumicas y biolgicas de las protenas. 2.1 BIOSNTESIS DE PROTENAS - transcripcin y traduccin - cdigo gentico y sntesis de protenas - sntesis de protenas en procariontes - sntesis de protenas en eucariontes 2.2 ESTRUCTURA Y PROPIEDADES QUMICAS - clasificacin de protenas 2.3 ENZIMAS - clasificacin de enzimas - factores que regulan la actividad enzimtica 2.4 MTODOS FSICO-QUMICOS DE ANLISIS - espectrofotometra - electroferesis en una y dos dimensiones 2.5 MTODOS BIOLGICOS DE ANLISIS - secuenciacin de polipptidos - traduccin in vitro - mtodos inmunoqumicos. Western blot UNIDAD 3. REGULACIN GENTICA 12 h

Objetivo: Extender la regulacin de la expresin de los genes en clulas procariotes y eucariotes y su importancia en el desarrollo de los organismos. 3.1 ESTRUCTURA DEL GEN PROCARIONTE - elementos que controlan la expresin de los genes 3.2 ESTRATEGIAS DE REGULACIN DE LA EXPRESIN GENTICA - regulacin transcripcional (modelo del opern) - atenuacin 3.3 ESTRUCTURA DEL GEN EUCARIOTE - El nucleosoma y la organizacin de la cromatina - factores que intervienen en la transcripcin - procesamiento del ARN

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- regulacin postraduccional UNIDAD 4. GENTICA BACTERIANA 9.0 h

Objetivo: Adquirir los conocimientos generales sobre gentica bacteriana que le permitan entender posteriormente el uso de estos microorganismos en la ingeniera gentica de procariontes y eucariontes. 4.1 CROMOSOMAS, PLASMIDOS Y EPISOMAS 4.2 CONJUGACIN 4.3 TRANSFORMACIN 4.4 TRANSDUCCIN 4.5 CARACTERISTICAS DE LAS CEPAS BACTERIANAS USADAS EN EL LABORATORIO 4.6 MANTENIMIENTO DE CEPAS UNIDAD 5. INGENIERIA GENETICA DE PROCARIONTES 15 h

Objetivo: Adquirir recibir los conocimientos bsicos de la metodologa del ADN recombinante desarrollada principalmente en procariontes. 5.1 ENZIMAS QUE SE USAN PARA LA MANIPULACION DE CIDOS NUCLEICOS - polimerasas - ligasas - endonucleasas de restriccin - exonucleasas - otras enzimas 5.2 VEHCULOS MOLECULARES - caractersticas de un plsmido vector - vectores de clonacin - vectores de expresin - vectores ms utilizados 5.3 BANCOS GENMICO - en plsmidos - en bacterifagos - en csmicos 5.4 AISLAMIENTO Y CLONACION DE GENES - estrategia general de clonacin - uso de oligonucletidos sintticos - transcripcin reversa de ARN 5.5 ANLISIS DE LOS GENES CLONADOS - reaccin de polimerasa en cadena (PCR) - seleccin biolgica - tcnicas de hibridacin (southern, northern y western)

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- genes reporteros 5.6 MTODOS DE TRANSFORMACIN GENTICA - transformacin - microinyeccin de ADN - electroporacin - biobalstica - agroinfeccin UNIDAD 6. MUTAGENESIS 6.0 h

Objetivo: Analizar el empleo de la mutagnesis clsica y dirigida y su potencial en estudios bsicos y aplicados en microorgansmos (y plantas) 6.1 MUTAGENESIS NO DIRIGIDA - mutaciones puntuales - mutgenos fsicos - mutgenos qumicos - aplicaciones 6.2 MUTAGENESIS DIRIGIDA - uso de transposones - uso de oligonucletidos sintticos - aplicaciones UNIDAD 7. TEMAS SELECTOS 3.0 h

Objetivo: Conocer mediante la revisin de artculos cientficos, la utilidad, ventajas y aplicaciones de la Ingeniera Gentica en procariotes; para lo cual, dependiendo de su inters particular, elaborar un seminario donde utilice los conocimientos adquiridos en alguno de los siguientes temas generales: 7.1 TCNICAS DE BIOLOGA MOLECULAR 7.2 MUTAGENESIS 7.3 EXPRESIN DE GENES EN PROCARIOTES 7.4 CLONACION DE GENES, SECUENCIAS DE ADN, ARN Y ORGANIZACION DEL GENOMA 7.5 GENTICA DE PROCARIOTES 7.6 GENTICA DE LOS VIRUS METODOLOGA En la prctica se desarrollarn actividades en el laboratorio, en el campo experimental universitario y con gua de estudio, esto con el afn de afianzar y clasificar todas las actividades que se tienen contempladas en el presente programa.

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CRITERIOS DE EVALUACION: Exmenes Prcticas de laboratorio Seminario BIBLIOGRAFA BSICA: UNIDAD 1. CIDOS NUCLICOS Davidson, J. M. 1980. Bioqumica de los cidos nucleicos de Davidson. Ed. Revert, S.A. Espaa. 401pp. Erlich, H. A. 1989. PCR Technology: principles and applications for DNA amplification. Stockton Press, N. Y. 246 pp. Kornberg, A. 1980. DNA replication. W.H. Freeman and Company. San Francisco, USA. Sanger, F. S., Nicklen and A. Coulson. 1977. DNA sequencing with chain- terminanting inhibitors. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 74: 5463-67. Subirana -Torrent, J. A. 1985. Estructura de ADN. Ed. alhambra, Espaa. 225 pp. UNIDAD 2. PROTENAS Crick, F. H. C. 1966. The genetic code III. Sci. Am. 215 ( 4 ): 55-62. Darnell, J., H. Lodish and D. Baltimore. 1990. Molecular Cell Biology. 2da. ed. American Books. New York. 1005 pp. Doolitle, R. F. 1985. Proteinas. Investigacin y Ciencia. III: 54-64 Lehninger, A. L. 1977. Bioqumica. Las bases moleculares de la estructura y funcin celular. Ed. Omega, S. A. Espaa. 887 pp. Stryer, L. 1985. Bioqumica. 2a. ed. Ed. Revert. S. A. Espaa. 887 pp. Walker, J. M. 1984. Proteins: Methods in Molecular Biology. Vol 1. Ed. Human Press. Clifton, N. J. 365 p. UNIDAD 3. REGULACIN GENTICA Freinfelder, D. 1983. Molecular Biology. A comprehensive introduction to prokariotes and eukariotes. Jones and Bartlett Publishers Inc. Boston, USA. 979 pp. Hawkins, J. 1985. Gene Estructure and Expression. Cambridge University Press. G. B. 162 pp. Jelinek, W. R. and C. W. Schmid. 1982. Repetitive sequences in eukariotic DNA and their expression. Ann Rev. Biochem. 51: 813-44. Kahl, G. 1988. Architecture of Eukariotic Genes. VCH. FDR. 517 pp. Rubenstein, I., R. L. Phillips, Ch. E. Green and B. G. Gengenbach. 1979. Molecular Biology of Plants. Academic Press. New York. 343 pp. UNIDAD 4. GENTICA BACTERIANA Birge, E. A. 1981. Bacterial and Bacteriophage Genetics. Springer-Verlag. New York. 359 pp. Clark, A. J. and Warren.1979. Conjugal Transmission of Plasmids. Ann. Rev. Genet. 13: 99-125 70% 20% 10%

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Jimnez-Snchez, A. and R. Guerrero. 1982. Gentica Molecular Bacteriana. Ed. Revert, S. A. Espaa. 445pp. Miller, J. H. 1972. Experiments in Molecular Genetics. Cold Spring Harbor Laboratory. CSH, New York. 446 pp. Shapiro, J. A. 1983. Mobile Genetic Elements. Academic Press. New York. 687 pp. UNIDAD 5. INGENIERA GENTICA DE PROCARIOTES Chakrabarty, A. M. 1978. Genetic Engineering. CRC Press Inc. Boca Ratn. 687 pp. Cohen, S. N. 1975. The Manipulation of genes. Sci. Am. 233: 24-33. Goeddel, D. V., D. G. Kleid, F. Bolivar, H. L. Heyneker, D. G. Yansura, R. Crea, T. Hirose, A. Kraszewsky, K. Itakura and A. D. Riggs. 1979. Expression in Escherichia coli of chemically synthetized genes for human insulin. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 76: 106-110. Itakura, K., T. Hirose, R. Crea, A. D. Riggs, H. L. Heyneker, F. Bolivar and H. W. Boyer. 1977. Expression in Escherichia coli of a chemically synthetized gene for the hormone somatostain. Science 198: 1056-63. Old, R. W. and S. B. Primrose. 1985. Principles of gene manipulation. An introduction to genetic engineering. Blackwell Scientific Publications. Oxford. 409 pp. Watson, J. D., J. Tooze and D. T. Kurtz. 1896. ADN recombinante. Introduccin a la Ingeniera Gentica. Ed. Labor, S. A. Espaa. 200 pp. Wu, R., L. Grossman and K. Moldave. 1989. Recombinant DNA Methodology. Academic Press. New York. 760 pp. UNIDAD 6. MUTAGENESIS Dalbadie-McFarland, G., L. W. Cohen, A. D. Riggs, C. Morin, K. Itakura and J. H. Richards. 1982. Oligonucleotide-directed mutagenesis as a general and powerful methods for studies of protein function. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 79: 6409-13. IAEA. 1977. Manual of mutation breeding. Technical report series No. 119. International Atomic Energy Agency. Vienna. Noel, K. D., A. Snchez, L. Fernndez, J. Leemans and M. Cevallos. 1984. Rhizobium phaseoli symbiotic mutants with transposon Tn 5 insertions J. Bacteriol. 158: 148-55. Shortle, D., D. Dimaio and D. Nathans. 1981. Directed mutagenesis. Ann. Rev. Genet. 15: 265-94. Singer, B. and J. T. Kusmierek. 1982. Chemical mutagenesis. Ann. Rev. Biochem. 52: 655-93. UNIDAD 7. REVISTAS PARA TEMAS SELECTOS Annual Review of Biochemistry Annual Review of Genetics Annual Review of Microbiology Annual Review of Plant Physiology and Molecular Biology Biotechnology EMBO Jurnal Journal of Bacteriology Journal of Molecular Biology Molecular and General Genetics Nature

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Nucleic Acids Research Plant Molecular Biology Plant Physiology Proc. Natl. Acad. Sci. USA Science Scientific American Trends in Biotechnology (TIBTECH ) Transgenic Plants Journal of Molecular Biology Molecular and General Genetics

ltima revision Julio del 2007