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1. 2. 3. 4. 5. DOMINIO ARCHAEA: ARCHAEOBACTERIAS DOMINIO BACTERIA ESTRATEGIAS METABLICAS DE ORGANISMOS PROCARIOTAS TRANSFERENCIA DE GENES EN ORGANISMOS PROCARIOTAS IMPACTO DE LOS ORGANISMOS PROCARIOTAS EN LA SOCIEDAD
Estructura
Estructuralmente carecen de ncleo y comparten con las bacterias algunas caractersticas y algunos genes; tambin presentan genes que poseen los Eukarya, pero, adems, muchos de sus genes son exclusivos. Los lpidos de sus membranas difieren de los que poseen las clulas eucariotas y las eubacterias. No presentan fosfolpidos, sino ciertos compuestos lipdicos que se unen al glicerol por enlaces de tipo ter, ms fuertes que los enlaces tipo ster. En algunas especies la unidad de membrana est constituida por una monocapa lipdica. La composicin de sus paredes celulares tambin es diferente; nunca existe murena, sino protenas o un peptidoglucano modificado (pseudomurena) que no se encuentra en ningn otro ser vivo. Muchos Archaea se encuentran adaptados a unas condiciones de vida extrema, letales para cualquier otro ser vivo. Por dicho motivo a este grupo de microorganismos tambin se les denomina extremfilos.
Estas especies de Archaea viven en el calor extremo en las profundidades del mar. Son especies termfilas
Las acidfilas viven en entornos cidos, como fuentes hidrotermales, donde se originan gases sulfurosos o en las montaas de residuos que se producen en las minas de carbn. Las alcalfilas viven en suelos alcalinos ricos en carbonatos y en lagunas krsticas, como las del valle de Rift en frica. Las halfilas habitan ambientes salinos, preferentemente lagos salobres y los tanques de evaporacin de las salineras.
Extremfilos y extremoenzimas
Cmo pueden desenvolverse en estos ambientes tan duros si los enzimas de todos los seres vivos dejan de funcionar en condiciones extremas? Los enzimas de las arqueobacterias, denominados extremoenzimas, son funcionales cuando otros no lo son y alcanzan su rendimiento ptimo a temperaturas elevadas o en amplios intervalos de acidez o salinidad. Estas caractersticas han despertado gran inters comercial en distintos sectores de la industria: en biomedicina, en la produccin de edulcorantes y en el diagnstico de enfermedades.
2. DOMINIO BACTERIA
La unidad mnima de vida en la Tierra es la clula bacteriana, una diminuta estructura rodeada por una membrana, que fue la primera pobladora del planeta. Posiblemente sean las formas ms pequeas de vida pero han dado pasos de gigante en la evolucin, ya que algunos linajes bacterianos evolucionaron y originaron muchas clases distintas de organismos, incluida la clula eucariota. El dominio Bacteria (eubacterias o bacterias verdaderas) incluye un conjunto extraordinariamente variado de microorganismos unicelulares procariotas, cuyo tamao vara entre 0,3 y 10 m. Estn adaptados a vivir en cualquier ambiente, terrestre o acutico, y presentan todas las formas de nutricin conocidas. Esta diversidad de funciones convierte a las bacterias en organismos indispensables para el mantenimiento del equilibrio ecolgico, ya que contribuyen al reciclaje de la materia en la biosfera.
Morfologa
Las bacterias adoptan formas caractersticas que, en muchas ocasiones, pueden verse influidas por las condiciones del medio de cultivo. Generalmente son unicelulares, aunque en ocasiones se mantienen unidas despus de la divisin celular. Algunas bacterias forman colonias que se agrupan en pelculas bacterianas, verdaderas pelculas vivientes formadas por bacterias inmersas en una especie de baba pegajosa que ellas mismas segregan, que las protege de las agresiones externas y las fija al sustrato en el que viven (la placa bacteriana dental es una pelcula). Los modelos morfolgicos ms comunes que presentan las bacterias son: Cocos. Bacterias de forma casi esfrica. Pueden aparecer aislados o en grupos de dos (diplococos), formando cadenas arrosariadas (estreptococos), grupos arracimados (estafilococos) o masas tridimensionales en forma de cubo (sarcinas). Bacilos. Bacterias de forma cilndrica y alargada, como un bastoncillo. A veces, se presentan en cadenas lineales o ramificadas. Espirilos. Bacterias con forma semejante a bacilos largos y curvados.
tallo.
Vibrios. Bacterias cortas y curvadas, con forma de coma. Espiroquetas. Bacterias con forma de sacacorchos. Bacterias con apndices. Poseen protuberancias celulares con forma de tubo largo o
Existen otros mecanismos que permiten clasificar a las bacterias, como es el de la coloracin de Gram. Este tipo de tincin es la ms usada en bacteriologa y debe su nombre a quin la describi en 1884. Es una coloracin diferencial, dado que las bacterias pueden clasificarse segn su respuesta en Gram positivas o Gram negativas. Las primeras se tien de color azul violeta y las segundas adquieren un color rosado o rojo. La diferente reaccin de las bacterias a la coloracin de Gram se relaciona con diferencias fundamentales de la envoltura celular de estas dos clases de clulas, como se ver ms adelante.
Ultraestructura
La ultraestructura de las bacterias es ms simple que la eucariota. Para su estudio se utiliza el microscopio electrnico y las tcnicas bioqumicas y citolgicas adecuadas, ultracentrifugacin, los medios de cultivo diferenciales, las tcnicas de marcaje, etc como la
Los principales componentes estructurales de las bacterias son: la pared bacteriana, la membrana celular, el citoplasma y los componentes externos a la pared celular: cpsula bacteriana, fimbrias, pili sexuales y flagelos.
Pared bacteriana
La pared bacteriana es la envoltura responsable de la forma y rigidez de la clula que, adems, la protege de una rotura osmtica en medios acuosos. Los componentes fundamentales de la pared son los peptidoglucanos o murenas, que forman alrededor de la bacteria un retculo delgado y rgido encargado de protegerla de los cambios de la presin osmtica.
Adems, segn pertenezcan al grupo de las Gram negativas o al de las Gram positivas, contienen otros elementos diferentes: En las bacterias Gram negativas el peptidoglucano, que constituye tan solo el 10% de la pared, forma una red que se dispone en una nica capa delgada, comprendida entre dos membranas, una interna y otra externa, a la que se une covalentemente mediante un conjunto de protenas del espacio periplasmtico o periplasma. En las bacterias Gram positivas el peptidoglucano representa hasta el 90% de la pared y forma una red compleja que origina varias capas superpuestas, y que por la parte externa enlaza con protenas, polisacridos y molculas derivadas de los cidos teicoicos.
Diagrama simplificado de la envoltura celular de bacterias Gram positivas (arriba) y Gram negativas (abajo)
Los componentes estructurales de las envolturas celulares de las bacterias Gram negativas.
Los componentes estructurales de las envolturas celulares de las bacterias Gram positivas.
Sin embargo, estas clulas contienen tambin una gran cantidad de cido teicoico: poli- sacridos que se unen al cido N-acetilmurmico o a los lpidos de la membrana plasmtica. En este ltimo caso se denomina cido lipoteicoico. Tanto los cidos teicoicos como los lipoteicoicos, tienen la funcin de estabilizar la pared celular. Adems los cidos teicoicos tienen un rol en la virulencia de estos microorganismos, porque actan como antgenos de superficie que se unen a receptores especficos en las clulas del husped. La superficie externa del peptidoglicano de las bacterias Gram positivas est generalmente cubierta de protenas. Los diferentes grupos de bacterias Gram positivas y las diferentes es- pecies difieren en la composicin de sus protenas y de cidos teicoicos; sto es til para la clasificacin serolgica y la identificacin bacteriana.
Membrana
Es una estructura vital para la bacteria, ya que representa una barrera que separa el interior del exterior celular. La membrana de las bacterias es una fina estructura de 8nm de espesor que rodea la clula, separndola del entorno y actuando como una barrera selectiva que permite la concentracin de ciertos metabolitos en el interior de la clula y la excrecin de sustancias de desecho. Consiste en una bicapa lipdica similar a otras membranas biolgicas, compuesta por fosfolpidos anfipticos; no posee esteroles a diferencia de las eucariotas (con la excepcin de los micoplasmas). La membrana se encuentra estabilizada por puentes de hidrgeno, interacciones hidrofbicas y cationes como el calcio y el magnesio, que se combinan con los fosfolpidos car- gados negativamente. Insertas en ella se encuentran mltiples protenas transmembrana, que facilitan el transporte de sustancias hidroflicas a travs de sta. Como las bacterias no poseen membranas internas, todos los sistemas de fosforilacin, oxidacin y transporte de electrones (citocromos) para la produccin de energa se encuentran a nivel de la membrana celular. La membrana celular cumple la funcin de barrera osmtica, tiene permeabilidad selectiva y permite el paso de nutrientes y la salida de desechos por mecanismos de transporte activo y pasivo. En ella se encuentran los sistemas de fosforilacin oxidativa y el transporte de electrones para la produccin de energa; adems tiene las enzimas necesarias para la sntesis de lpidos, de la pared celular (por ejemplo, el bactoprenol), de la cpsula, etc. Finalmente la membrana contiene molculas receptoras especiales que ayudan a las bacterias a detectar y responder a sustancias qumicas del medio externo.
Citoplasma
El citoplasma o matriz citoplasmtica es la sustancia englobada por la membrana plasmtica, compuesta fundamentalmente de agua (70%), protenas y cidos nucleicos, en la que tienen lugar la mayor parte de las reacciones vitales de la clula. Carece de citoesqueleto pero contiene ribosomas, regin nuclear o nucleoide e inclusiones. Los ribosomas son pequeos corpsculos semejantes a los de los eucariotas, aunque de menor tamao (ribosomas 70S), compuestos por una subunidad pequea de 30S y otra mayor de 50S. Se encuentran dispersos en el citoplasma bacteriano, aislados o asociados a cadenas de ARNm formando polirribosomas. Son los encargados de la sntesis de protenas. Las inclusiones son una gran variedad de granulaciones que, generalmente, constituyen un depsito de sustancias de reserva, como por ejemplo, granos de volutina (acmulos de polifosfato), gotas lipdicas (triglicridos) y polisacridos (almidn y glucgeno). Inusualmente, algunas bacterias acuticas producen magnetosomas que contiene de 5 a 40 partculas cristalinas de magnetita (Fe3O4), lo que les permite orientarse en los campos magnticos. Estos organismos presentan un movimiento dirigido segn las lneas del campo magntico que se denomina magnetotaxis. La regin nuclear o nucleoide es una regin concreta de la matriz citoplasmtica, de forma irregular y menos densa que el citoplasma circundante, que contiene el cromosoma bacteriano, y frecuentemente, unidades de replicacin autnomas denominadas plsmidos. Los plsmidos constituyen el material gentico extracromosmico. Estn constituidos por secuencias cortas de ADN circular bicatenario, que pueden replicarse independientemente del ADN cromosmico y transmitirse de generacin en generacin tras la divisin celular. Aunque no son esenciales para la vida de la bacteria, generalmente proveen a sta una ventaja selectiva, como
resistencia a los antibiticos, nuevas capacidades metablicas, patognicas (cuando codifican para factores de virulencia como toxinas, etc.) u otras numerosas propiedades. Pueden transferirse de bacteria a bacteria mediante un proceso denominado conjugacin. Los plsmidos se clasifican en diferentes tipos en funcin de su forma de existencia y diseminacin: Episomas. Son plsmidos capaces de integrarse reversiblemente en el cromosoma bacteriano y, en esta situacin, replicarse junto a l. Plsmidos conjugativos. Son plsmidos que tienen genes que codifican pili sexuales que les permiten transferir copias de s mismos a otras bacterias durante la conjugacin. Algunos son capaces de transferirse entre especies y gneros muy diversos por lo que tambin reciben el nombre de plsmidos promiscuos. Hay muchos tipos de plsmidos conjugativos, si bien los ms conocidos son el factor R y el factor F. El factor R es un plsmido conjugativo que confiere a las bacterias que lo contiene resistencia a los antibiticos. Lleva genes que codifican enzimas capaces de destruir antibiticos como la sulfamida, la ampicilina, la estreptomicina y el cloranfenicol. Algunos plsmidos conjugativos son tambin episomas, como el factor F o factor de fertilidad, que es un episoma que desempea un importante papel en la conjugacin de E. coli, pues contiene los genes responsables de la unin celular y de la transferencia de plsmidos entre las bacterias durante el proceso de conjugacin. Plsmidos no conjugativos. No pueden ser transferidos por conjugacin.
capsuladas. Una respuesta efectiva para defenderse de este tipo de bacterias implica la produccin de anticuerpos que se unan especficamente a la cpsula facilitando la opsonizacin y la fagocitosis.
Los pili comunes cumplen funciones de adherencia a receptores especficos y superficiales, lo cual es importante en las especies de relevancia clnica porque son los responsables de la adherencia de muchas bacterias a determinados epitelios, jugando un papel fundamental en la colonizacin. Los pili sexuales son semejantes a las fimbrias, pero generalmente ms largos y anchos. Participan en el intercambio de fragmentos de ADN durante la conjugacin. De forma resumida, en este proceso se transfiere material gentico de una clula donadora (que posee un plsmido F que codifica el pili sexual) a una receptora. En general el material transferido es un plsmido o una porcin de cromosoma movilizada por un plsmido. Una vez unidas las bacterias los pilis sexuales se retraen, permitiendo que las clulas se unan y pase el ADN de la donadora a la receptora, formndose una verdadera unin (puente) entre las membranas de las clulas para el paso del ADN. La clula receptora est estrechamente emparentada con la donadora y posee un receptor especfico para los pilis sexuales. Los flagelos son apndices largos y finos de mayor longitud que la bacteria, que se encuentran unidos a la clula por uno de sus extremos y libres por el otro. Se trata de estructuras especiales que permiten a las bacterias desplazarse libremente en el medio y alcanzar distintas zonas de su reducido entorno. Sin embargo, los flagelos no son necesarios para la vida bacteriana. Su sntesis est regulada por las necesidades nutricionales o el estado energtico. Estn formados por fibrillas proteicas compuestas por subunidades de una protena llamada flagelina; cada flagelo posee entre 3 y 11 fibrillas trenzadas helicoidalmente, como en una cuerda, que forman la parte denominada filamento. En la base del flagelo existe una regin ms ancha, el codo o gancho, que se une a su vez al corpsculo basal, que es la parte motora y la que ensambla al flagelo en el citoplasma por debajo de la membrana plasmtica.
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Los flagelos pueden variar en nmero, desde uno a cientos. Las especies bacterianas difieren por sus modelos de distribucin de flagelos. Las montricas (trichous: pelo) tienen un solo flagelo que si se sita en un extremo de la bacteria y se denomina polar. Las bacterias anftricas (amphi: en ambos lados) tienen un flagelo en cada polo bacteriano. En cambio, las loftricas (lopho: mechn) poseen un grupo o penacho de flagelos en uno o ambos extremos. Por ltimo, en las bacterias pertricas (peri: alrededor), los flagelos se distribuyen uniformemente en toda la superficie bacteriana. Los modelos de distribucin de los flagelos son tiles para identificar a las bacterias.
Estructura
Presentan una membrana externa y una fina pared compuesta por peptidoglucanos, como las bacterias Gram negativas. Muchas cianobacterias producen envueltas mucilaginosas o vainas que permiten la formacin de colonias. Internamente poseen un sistema complejo y multilaminar de membranas que contiene los pigmentos y los enzimas necesarios para la fotosntesis. Llevan a cabo la fotosntesis oxignica por medio de un aparato fotosinttico similar al de las eucariotas. Todas las cianobacterias poseen el fotosistema I, el fotosistema II, clorofila a y ficobilinas, como las ficocianinas de color azul. Algunas tambin contienen ficoeritrina, una ficobilina de color rojo que confiere a las cianobacterias una coloracin rojiza. Otras son capaces de fijar el nitrgeno atmosfrico en unas clulas especializadas incoloras y redondeadas, denominadas heterocistes.
Biologa
La nutricin de las cianobacterias es muy sencilla. Por ser fotosintticas, utilizan para su nutricin materia inorgnica y la energa de la luz solar. Utilizan nitrato o amoniaco como fuente de nitrgeno. Muchas especies son fijadoras de nitrgeno atmosfrico. Las cianobacterias no presentan movimiento, ya que no poseen flagelos, pero algunas especies se deslizan lentamente cuando estn en contacto con una superficie slida o flotan en el agua gracias a la
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presencia de vesculas de gas en su citoplasma, los que les permite permanecer en las zonas de mxima iluminacin. Se reproducen por fisin binaria, gemacin, fragmentacin y por fisin mltiple.
Ecologa
Viven aisladas o formando colonias globulares o filamentosas y se encuentran en casi todos los ambientes: en los suelos, flotando en el agua de los lagos, los arroyos y los ocanos; debido a su gran resistencia a la desecacin y a las elevadas temperaturas, tambin se pueden encontrar en la superficie de las rocas, en las aguas contaminadas, en las aguas termales y en ambientes muy salinos. Algunas viven en simbiosis con las plantas, de modo que la cianobacteria fija el nitrgeno y la planta le proporciona un ambiente protegido. Este hecho tiene una gran importancia para la agricultura: en los campos de arroz, cuando las plantas son an pequeas, se aade el helecho flotante Azolla con su cianobacteria simbitica Anabaena azolla que fija el nitrgeno y permite el desarrollo de la cosecha. Ciertas especies pueden producir toxinas que causan cncer de hgado en las personas. Otras, como el gnero Spirulina, se utilizan como fuente de alimento.
Bacterias auttrofas
Fottrofas o fotosintticas. Incluye las bacterias rojas y verdes, capaces de realizar la fotosntesis. Para ello disponen de unos corpsculos, los cromatforos, que contienen un pigmento especial, la bacterioclorofila, asociada a unos pigmentos presentes en el fotosistema I, el nico que presentan este tipo de bacterias. En este tipo de fotosntesis los electrones no proceden de la fotolisis del agua, por lo que no se desprende O2. Quimiolittrofas o quimiosintticas. Obtienen la energa de la oxidacin de compuestos inorgnicos que se comportan como donadores de electrones. En este grupo se incluyen las bacterias del cuelo, que desempean un importante papel en la biosfera, reciclando la materia orgnica de los ecosistemas dentro de los ciclos biogeoqumicos. Destacan las bacterias del hidrgeno y del metano, las del azufre y las bacterias nitrificantes (oxidan el amoniaco procedente de cadveres). La oxidacin de los sustratos inorgnicos produce energa que las bacterias utilizan para la sntesis de ATP y NADPH, que luego emplearn para reducir el carbono o el nitrgeno, inorgnicos.
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Bacterias hetertrofas
Este tipo de bacterias se alimenta a base de compuestos orgnicos, previamente elaborados por otros organismos, que descomponen mediante la accin de enzimas hidrolticas. Este tipo de bacterias se alimenta del sustrato sobre el que vive, pudiendo optar por uno de las siguientes estrategias: Saprofitismo. Descomponen la materia orgnica mediante fermentaciones y putrefacciones, en ocasiones de gran inters ecolgico o industrial. Parasitismo. Si se desarrollan en el medio interno de los organismos hospedadores, a los que causan prejuicio. Se trata de bacterias patgenas, responsables de muchas enfermedades. Simbiosis. Las simbiosis mutualistas, es decir, en las que ambos individuos implicados obtienen beneficios, son frecuentes entre las bacterias y algunos animales y plantas. Los rumiantes, por ejemplo, no son capaces de digerir la celulosa presente en los vegetales de los que se alimentan. Para poder hacerlo se ayudan de bacterias y otros microorganismos presentes en el estmago. Las bacterias pertenecen a diversos gneros como Fibrobacter, Clostridium, Streptococcus y Metanobrevibacter. En la especie humana tambin existen bacterias en el tracto digestivo, que realizan procesos fermentativos para completar la digestin y sintetizan algunas vitaminas necesarias. Por ejemplo, E. coli produce vitamina K y vitaminas del grupo B y habita en nuestro intestino grueso. Esta flora bacteriana actua adems como barrera defensiva contra infecciones externas. Respecto a la relacin simbitica con vegetales, existen algunas de gran importancia en la agricultura. Es el caso de las asociaciones de las bacterias del gnero Rhizobium y las raices de las leguminosas. Estas asociaciones se manifiestan en forma de ndulos radicales donde se produce la fijacin del nitrgeno de la atmsfera. Por otro lado, son muchas las especies de plantas que establecen relaciones simbiticas con cianobacterias del gnero Nostoc y Anabaena. Estas bacterias fijan el nitrgeno necesario para el desarrollo de las plantas, que proporcionan un ambiente de proteccin a las bacterias.
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Transformacin
Es el intercambio gentico producido cuando una bacteria (receptora) adquiere e incorpora a su informacin gentica un fragmento de ADN que se encuentra en el medio donde habita. La nueva molcula de ADN es incorporada dentro del cromosoma de forma que la informacin que contiene se transmmite a la siguiente generacin pero tambin se manifiesta en la propia bacteria receptora. Los fragmentos de ADN desnudo suelen proceden de otras bacterias lisadas, y permanecen cierto tiempo en el medio que les rodea, por lo que pueden ser transformados e incorporados por otras bacterias.
Transduccin
Consiste en la transferencia de material gentico entre dos bacetrias por medio de un virus bacterifago, que actua como un vector intermediario entra ambas. Esto se produce porque durante el ciclo ltico de un virus, las enzimas que empaquetan el ADN vrico en el bacterifago incorporan en ocasiones, de forma accidental, ADN baceriano. Si esto ocurre el virus recibe el nombre de fago transductor, y es liberado junto con otros virus normales cuando la bacteria infectada lisa. Si este virus transductor infecta otra bacteria, puede integrar el ADN bacteriano que porta en la bacteria hospedadora, pudindose integrar en su cromosoma bacteriano complatndose de este modo la transferencia.
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Fases de la transduccin: 1) fijacin del fago a la bacteria; 2) respuesta ltica; 3) transduccin del fragmento de ADN a otra bacteria; 4) integracin del ADN en el genoma.
Conjugacin
Es un mecanismo de intercambio gentico en el que una clula donadora transmite, a travs de unas estructuras especiales (pili), un fragmento de su ADN a una bacteria receptora. Las bacterias donadoras deben poseer, ademas del cromosoma bacteriano, un plsmido conjugativo, como el factor F de fertilidad o el factor R.
E. coli (bacilo procariote) cepas llevandoa cabo la conjugacin. Una cepa tiene fimbrias
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exotoxinas destacan las producidas por la Salmonella, enterotoxinas que provocan infecciones alimentarias. Dentro de las endotoxinas se encuentran por ejemplo, los polisacridos producidos por el gnero Brucella, causante de la brucelosis.
Biorremediacin
Las bacterias (y otros microrganismos) juegan un papel fundamental en el reciclado de la materia, dentro de los ciclos biogeoqumicos. Las bacterias son capaces de llevar a cabo lo que se conoce como biodegradacin. Este proceso se basa en las transformaciones destructivas que los microrganismos producen sobre la materia, e incluye procesos como la deshalogenacin (pequeas transformaciones en las molculas), fragmentacin de las molculas o mineralizacin. La importancia de la biodegradacin que las bacterias pueden producir en el agua y el suelo, radica principalmente en que son capaces de degradar sustancias contaminantes y txicas tanto para los ecosistemas como para la salud pblica. Hidrocarburos, disolventes, pesticidas, derivados de plsticos y resinas ampliamente utlizadas en la industria, pueden ser parcial o totalmente degradadas por algunas especies de bacteraias, que estn siendo utilizadas para combatir la contaminacin en un contexto conocido como biorremediacin. La biorremediacin puede ser de dos tipos: intrnseca o dirigida. Intrnseca, cuando en la degradacin de los contaminantes estn involucradas colonias de bacterias presentes de forma natural en la zona afectada. Dirigida, cuando es necesaria la utilizacin de microorganismos externos a la zona afectada para solucionar el problema de contaminacin ambiental. En este caso pueden ser introducidas por el ser humano, estar adems genticamente modificadas, etc. Adems se ueden aadir nutrientes, oxgeno o cualuier sustancia que facilite la labor de estos microrganismos. Por ltimo, las aplicaciones de la biorremediacin son muy numerosas, destacando las siguientes: Eliminacin de hidrocarburos tanto del suelo como del agua. As se eliminan grandes manchas de petrleo procedentes de vertidos accidentales en el mar.
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Tratamiento de residuos industriales muy contaminantes. Degradacin de pesticidas, de origen xenobitico,, que pueden ingresar en las cadenas trficas a travs de animales y plantas expuestos suponiendo un peligro para los ecosistemas y los organismos que habitan en ellos. Eliminacin de metales pesados, como el cadmio, el cobre, el mercurio, etc, procedentes fundamentalmente de la minera y la industria. Tratamiento de aguas residuales en distintas etapas de la depuracin.
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