Compactao do Material Gentico

ODIR DELLAGOSTIN
Disciplina de Biologia Molecular

Conceitos
Cromatina Carioteca Histonas Metilao

Nucleossomo

Eucromatina

Heterocromatina Nucleide Acetilao

Cromossomo

Por que a necessidade de compactar genomas?

DNA E. coli

O ncleo de uma clula humana tem 6 m de dimetro e a extenso total do DNA dos seus 46 cromossomos soma 1,8 m. Como resolvida a discrepncia entre estas duas grandezas?

1- Espao fsico
Organismo / Compartimento Fago T4 Forma icosaedro Dimenses 0,065x0,10m Tamanho do DNA 55 m Nmero de bases 170.000

E.coli

cilindro

1,7 x 0,65 m

1,3 mm

4,6 x 106

Mitocndria humana

esferide

3 x 0,5 m

50 m

16.000

Ncleo humano

esferide

6 m diametro

1,8 m 46 cromossomos

6 x 109 (diplide)

* Compactao organizada

Nmero de cromossomos em alguns organismos

- Nucleide (1/3 do volume celular)

- 80% DNA + 20% protenas e RNA; em eucariotos, a cromatina tem 50% DNA - A compactao no apresenta caractersticas morfolgicas de cromossomo

Nucleide expelido de um clula bacteriana lisada

Nucleide

Organizao do DNA bacteriano

Domnios ( 100/genoma) Cada ala tem ~ 40 kb

Apresentam alta proporo de aa carregados + (lisina e arginina)

Compactao de Genomas Eucariticos

Protenas nucleares especficas + DNA

Cromatina

Eucromatina menos compactada

Heterocromatina mais compactada

Cromossomos Estado mais condensado na Mitose ou Meiose

Cromatina
Eucromatina (estado de menor compactao) - Interfase Heterocromatina (densamente compactada) - Interfase Cromossomo (estado de maior compactao) - Diviso celular

Eucromatina e Heterocromatina

Nucleossomo unidade estrutural bsica da cromatina

150 a 250 pb associados a um
octmero de histonas (11 a 20 kDa, carter bsico acentuado, ou seja aa carregados +) Histonas Centrais: 2 X (H2A, H2B, H3 e H4) * Alta conservao * Genes Histona de ligao H1

Nucleossomo

Organizao das histonas no nucleossomo

Periodicidade dos nucleossomos

A cada 200 pb

Fibra de 10 nm - primeiro nvel de compactao da cromatina

Posicionamento do DNA

Fibra de 30 nm

segundo nvel de compactao da cromatina (enrolamento da fibra de 10 nm em uma estrutura helicoidal na qual cada volta contm 6 nucleossomos)

Nveis de organizao mais complexos da cromatina

Participao de protenas no-histnicas Processo pouco conhecido

Animao
http://www.biostudio.com/demo_freeman_dna_coiling.htm

Cromossomos desprovidos de histonas: arcabouo de protenas no qual as alas do DNA esto ancoradas

A cromatina na replicao

A cromatina no incio da transcrio

Ativadores DNA de ligao ou superfcie do nucleossomo Remoo H1 Deslocamento ou dissociao do nucleossomo

A cromatina durante a transcrio

Modificao das histonas: - Acetilao: (H2A, H2B, H3 e H4),
altera conformao do DNA de ligao, reduz estabilidade da fibra 30 nm, evita compactao favorecendo a transcrio

- Fosforilao: N-terminal da H1 leva a

descondensao da cromatina; C-terminal leva a condensao

- Ubiquitinao: ubiquitina uma

protena no histnica de carter acdico, e a sua ligao a histonas reduz o carter bsico das mesmas, levando a alteraes estruturais dos nucleossomos

As caudas N-terminais das histonas podem ser modificadas covalentemente de modo reversvel: Fosforilao, acetilao, metilao ou ubiquitinao

Alterao funcional do octmero de histonas levando a mudanas estruturais da cromatina na transcrio e na replicao

Acetilao ou metilao da lisina ou fosforilao da serina reduz a carga lquida das histonas

Mecanismos para ativao da cromatina

Acetilao de Histonas

Desacetilao de histonas

Metilao do DNA

Metilao do DNA

Conceitos
Cromatina Carioteca Histonas

Nucleossomo Heterocromatina Nucleide Acetilao

Eucromatina

Cromossomo Metilao