REPLICACION DEL ADN

Fisin Binaria en Procariotes

Ciclo Celular en Eucarites

Maquinarias Moleculares Asociadas

Experimento de Meselson y Stahl

Experimento de Meselson y Stahl

Caractersticas Generales de la Replicacin 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. Orgen de replicacin Bidireccional Hebra continua Hebra discontinua Semiconservativa Direccin 5 3 DNA polimerasa I / II / II : procariotas DNA polimerasa / / : eucariotas Una batera de molculas accesorias Fases: Iniciacin, Elongacin, Terminacin

Sitio de Iniciacin en Virus y Bacterias

1) Ori (Origen de replicacin): O 2) Term (Sitio de terminacin): T
Ori

Ori

Virus y Bacterias

Ter

Sitio de Iniciacin en Eucarites

Telmero Telmero

T O T Replicn

O T O R

T O R

Eucariotas

Sitio de Iniciacin en Eucarites

Sobrevisin de la Replicacin

Iniciacin de la Replicacin del ADN Bacteriano

A 1. Iniciacin 1) Dna A (Relaja) B C Helicasa (abre )

SSB

DNA B + C

J K

SSB

SSB

B+C

SSB: Protenas de unin a cadena sencilla (Single strand binding)

SSB

Elongacin de la Replicacin del ADN Bacteriano

J K B+C 5 3 5 3 Primasa Dna G (ARN pol)

Ojal de Replicacin

2. Elongacin 5 5 3 5 3 GIRASA

Topoisomerasa I
5 GIRASA 3 3 5 Girasa

Elongacin de la Hebra Continua

DNA pol III + Dna G + Girasa (Primasa) o ARN - pol DNA Dirigido o Iniciador (Primer)
+

Topoisomerasa I Replisoma

3 5

3 5

SSB

Hebra continua

DNA POL - III

3 5

3 5
RNA RNA RNA

5 3

5 3

5 3

3 5

1000-2000 pb

1000-2000 pb

Hebra discontinua

DNA Pol III RNA (Nick translation) Corta y cambia:RNA por DNA

DNA POL - I

Terminacin de la Replicacin del ADN Bacteriano

3. Terminacin

DNA LIGASA Dependiente de ATP

ESTRUCTURA DEL GEN PROCARIOTE

Estructura del Gen Procariote

Un gen Procariote yace en una regin que se llama la UT (Unidad de Transcripcin. La que se transcribe) Tiene 2 regiones Regin codificante: Donde se codifica el gen Regin Promotora: sitio a partir del cual se transcribe y se regula el gen SIT: +1 Sitio de Inicio de la Transcripcin. Punto limitante entre la regin codificante y la regin promotora (Start point = sp)

Estructura del Gen Procariote

3 5 5 3
Convenciones:
UT: Unidad de transcripcin SIT: Sitio de iniciacin de la transcripcin UTR: Regin no traducida ( 5o 3) CI: Codn de iniciacin CT: Codon de terminacin STT: Sitio de terminacin de la transcripcin TTS: Transcription termination site.

Regin Promotora ( RP )

UT
Regin Codificante ( RC )

Regin Terminadora ( RT )

3 5

5 UTR

3 UTR

5
Regin no traducida

3
+1 SIT CI (ATG) CT STT TTS

Estructura del Promotor Procarite

Regin O (operadora): Se pega al 7-8 nucleot. Represor (Impide que se abra el ADN, se una la RNA pol y por ende, que se Transcriba el gen)
Caja Pribnow Control negativo Regin O

3 5
Control positivo Caja CRP

+1 SP
Caja CAT

+ 1SP: Punto de arranque Tambin se llama sitio SIT (Sitio de Inicio de la Transcripcin): Sitio en el cual entra el primer nucleotido en el RNAm. Se abre el ojal de transcripcin para la transcripcin del gen.

-65

-35 Protena Represora del Catabolito

-10

-2 -1 + 1 Secuencia Represora del Catabolito

CRP

CRS

Caja Pribnow: tetranucleotido rico en AT.

Estructura de la Regin 5UTR

5UTR CI (AUG) 20 - 60 pb CI 5 UTR 3UTR Se transcribe pero no se traduce * Espacios conectores ARNr + protena Ribosoma RBS: (Del ingls Ribosomal Binding Protein)

+1

*
+1

10 pb RBS

Sitio de Unin al Ribosoma Poly - Purinas A - G S/D Secuencia Shine/Dalgarne Se une al 3ARNr 16s (subunidad menor)

Estructura de un Policistrn (OPERON)

Promotor CI CT

Tres Genes 1 CI CT CI 2 CT CI 3 CT RNAm 3

5
Regin Intercistrnica larga: diferentes ribosomas traducen

5 > 1 gen: - Policistrnico - Un opern

Regin intergnica corta

ARNm 3 E. Coli: tiende a tener promotores con 3 genes en promedio

Estructura de la Regin Terminal

Regin Terminal CT STT

3 UTR SDR: Seal de degradacin del RNA m = Ribonucleasa o RNasa Se descompone en sus partes

Factor de terminacin de la transcripcin: STT: dependiente STT: independiente Fgura hexamnica de protenas GC: independiente GC: dependiente Terminales intrnsecos

TRANSCRIPCION EN PROCARIOTES

Caractersticas Generales de la Transcripcin en Procarites 1. Unidad de transcripcin: Secuencia promotor y regin codificante. 3. ARN polimerasa core 4. Molculas accesorias: - Subunidad sigma, subunidad rho 4. Hebra codificadora Hebra no codificadora 5. Es simultnea en procarites junto con la Traduccin 6. Sntesis del ARN en la direccin 5 3 7. Fases: Iniciacin, Elongacin, Terminacin

La ARN Polimerasa Bacteriana

Subunida d ' 2

P.M. (kDa) 150 160 2(40) 32-90 6(46)

Funcin Toma la hebra codificante o templado Toma los ribonucletidos Unin al promotor Iniciacin Terminacin dependiente

REGULACION DE LA TRANSCRIPCION EN PROCARIOTE

1) + Glucosa - Lactosa

Opern apagado ARN polimerasa no puede unirse

Promotor Plac

Represor se une al operador Operador o Gen z DNA

Represor activo 2) - Glucosa + Lactosa Uni n de la ARN polimerasa Plac o Transcrip ci n Plac Transcrito de ARNm o z Opern encendid o Inductor se une al represor Represor no puede unirse z Inductor (Lactosa)

ESTRUCTURA DEL GEN EUCARIOTE

Estructura del gen Eucariote: Tres Tipos de Genes

Existen 3 clases de genes transcritos por 3 ARN pol diferentes: ARN pol I, II y II Genes ARN pol I: ARN pol II ARN pol III Nucleolo Nucleoplasma Nucleoplasma ARNr ARNm Clase I ClaseII

ARNr 5S (excepcin)Clase III ARNnp ARNt

Estructura del Gen Eucarite: Clase I

UT RP +1 5 3 5 UFR UCR UCE CI RC CT IRE RT ARE

5 UTR SP +1

3 UTR

CI

3 DFR DCR DCE AAUAAA

SI + 10 cap 7 metil guanosina Asa 5

Secuencia Lder: Protenas que atraviesan la membrana y aa hidrofbico

IRE Elemento rico en hierro

ARE

Depende del hierro Paradegradadar el RNAm

50 pb Rico en AU Elemento rico en AU

Secuencia consenso Desestabiliza el poly A

Estructura Bsica del Promotor - Clase II

5 3 sp 3 5 +1

RP = Regin Promotora RR = Regin Reguladora

-65

-35

Caja TATA Hexapleta rica en AT

Elementos de Caja respuesta CAAT

Caja Caja TATA GC

Se regulan lo genes caseros (House Keeping genes)

Existen: - Elementos de respuesta a estrgenos, corticoides, glucocorticoide - Dependientes del tejido - Se pegan factores inducibles a esta regin promotora o fuera de ella. Puede haber otras cajas dependiendo del tipo de gen y tambin los genes especializados como los morfogenes o como los genes hometicos (desarrollo) o de diferenciacin

Estructura de la Regin Codificante - Clase II

Exn n Intrn Exn n+1

5BD GT GU Regla GU - AG: AG GU AG

3BA AG GU

BD: brazo dador BA: brazo aceptor AG

Empalmar Exones

Secuencia Consenso: al inicio y al fin del intrn

SR: Sitio de ramificacin (Branch site)

SITIO DE RAMIFICACION

TACTA
X: 5 intrones (mamferos) X: 2 intrones (Otros organismos)

C
Se localiza a 2/3 longitud del intron BS: - Consenso - Rica en pirimidina (T y C)

Siempre presente

Amplificadores y Silenciadores (ENHANCERS SILENCERS)

RP SP +1

Amplificador

*
Silenciador
Silencian a los enhancers o amplificadores de expresin Ejemplo: *: Hgado : Glucogenasa Amplificador:

Amplificador

Regulacin temporal y tejido especifica en los Genes Clase I y Clase II - Secuencia consenso - Regin amplificadora del gen - Ubicua: Puede estar hasta dentro de los intrones excepto en los exones

Estructura del Gen Eucarite - Clase I

Core del promotor -110 -170 -70 pb Regin espaciadora entre core promotor y la regin UCE (elementos de codificacin no traducidos) Ribonucleasas -40 -10 GC SP +1 28 S 5.8 S 18 S

Se transcriben en tandem

En procariotas estn organizados los genes para ribosomas de igual manera que los eucariotas con la excepcin de que hay 1000 y 2000 copias en tandem del mismo gen

Estructura del Gen Eucariote - Clase III

SP 5 3 Octmero PSE TATA RP UT Box A Box C RC +1 3 ARNt
met

ARNtala

Se une la RNA pol III 90 pb

Procesamiento del Gen Eucariote - Clase III

ARNt ala

ARNr 5S

ARNt met

Ribonucleasa

Descubrimiento de los Genes Interrumpidos

Caractersticas Generales de la Transcripcin en Eucarites de los Genes Clase II 1. Unidad de transcripcin: Secuencia promotor y regin codificante. 3. ARN polimerasa II 4. Molculas accesorias: - Factores de Transcripcin 4. Hebra codificadora Hebra no codificadora 5. Es sucesiva respecto a la traduccin 6. Sntesis del pre-ARNm en la direccin 5 3 8. Fases: Iniciacin, Elongacin, Terminacin, Proteccin del ext. 5, Poliadenilacin del ext. 3, Eliminacin de Intrones y Empalme de Exones, Transporte del ARNm al Citoplasma.

Procesamiento del pre-ARNm Clase II

Tipos de Procesamientos de pre-ARN

Secuencias Concenso de un Intrn Tpico Clase II

ARN Polimerasa II de Levadura

Formacin del Complejo de Iniciacin de la Transcripcin de los Genes Clase II

Maquinara Molecular del Esplaiceosoma y Procesamiento del pre-ARNm

Uniones Especficas de las RNPs

Reacciones en el Esplaiceosoma de los pre-ARNm Clase II

Estructura de un Gen Interrumpido Eucaritico Clase II

Complejo de Terminacin de la Transcripcin en los Genes Clase II

PROCESAMIENTO ALTERNATIVO DEL ARNhn

El Transcripsoma

Activadores Interactuando con el Complejo de Iniciacin en los Genes Clase II

Flujo de la Informacin Gentica Intracelular en Eucarites

Complejo de Iniciacin de la Transcripcin en los Genes Clase I

Complejo de Iniciacin de la Transcripcin en los Genes Clase III

BIBLIOGRAFIA
Lodish, H; Baltimore, D; Zipursky, L.; Matsudara, P.; Darrell, J. Molecular Cell Biology. Third Edition. Scientific American Books New York, 1997. Lewin, Benjamin. Genes VII. International Student Edition. Oxford University. Press, Inc. Nex York, 1999