1

LE SPECTRE ELECTROMAGNETIQUE (EM)

La lumire a une double "nature": Vibrationnelle oscillante d'amplitude : y=cos(!t) Quantique - photon d'nergie E= hc/"
c=3 108 m/s

2# c "= $

Propagation des ondes

analogie mcanique
On considre une corde lastique tendue qui est soumis en A un branlement d'amplitude y vers le haut.

Applet

L'longation de A est y=f(t) et l'longation de M est celle qu'avait A l'instant t-#. L'quation du point M est donc y=f(t-#)=f(t-x/v)

Equation de propagation
f t" x posons x'= t " x v v df df dx' df = ="1 v dx' dx dx' dx 2 d2 f 1 d df = " 1 d df # dx' = 1 d f =" 2 v dx dx' v dx' dx' dx v 2 dx'2 dx df df dx' df = = dt dx' dt dx' d2 f d2 f = 2 dt dx'2 2 d2 f 2 d f v = 2 dx 2 dt

( )

!Onde progressive sinusoidale !Double variation spatiale et temporelle !Amplitude de vibration : y

$ x' y = cos"& t # ) % c(
!!=2$f est la pulsation de londe ! Pour la lumire visible f=1014 Hz 1015 Hz ! c=3 108 m/s (dans le vide) est la clrit de la lumire.

d2 f 1 d2 f " 2 2 =0 2 dx v dt
Equation de propagation de d'Alembert
(16 novembre 1717 Paris - 29 octobre 1783)

"2y 1 "2y # 2 2 = 0 Equation de propagation 2 "x c "t

exercice : vrifier que y = cos!(t-x/c) est solution

Toute fonction priodique sinusoidale y = cos!(t-x/v) ou y= sin!(t-x/v) est solution.

! Onde EM : double variation spatiale et temporelle !Amplitude de vibration !Direction de propagation est z

$ z' $ 2* t 2* z ' y = cos"& t # ) = cos& # ) = cos("t # kz) % v( % T + (

!!=2$f est la pulsation de la vibration !"=c/f est la longueur donde de la lumire pour le visible (de 0,4 m 0,8m dans le vide). !k = !/c est le vecteur d'onde !T=1/f priode de la vibration
$ 2" z ' y = cos& ) % # (

z = ", 2 ", 4 " on a le mme tat vibratoire

# 2" t & y = cos% ( $ T '

t = %, 2 %, 4 % on a le mme tat vibratoire

animation

Onde plane
Surface donde sphrique Surface donde plane

"

z
Dphasage (retard optique)

loin de la source la solution est du type onde plane i.e. les surfaces mme tat dbranlement sont des plans

La vibration arrive en M en retard avec un dphasage &

% 2$ y = cos'" t # & c 2# z "= $ !

!

z( * = cos(" t # + ) )

& (dphasage) reprsente le retard entre O et M.

Structure de l'onde

! Le plan donde ' est le plan de mme tat dbranlement. ! Le champ lectrique E est dans le plan donde et

reprsente la polarisation de londe.

Polarisation de londe E.M.

Champ Electrique :
E = Eo cos("t # kz) avec k = " /c

Champ Magntique : B = Bo cos("t # kz) avec k = " /c

! Les champs E et B oscillent en phase. On reprsente londe lectromagntique (E.M.) par le champ E qui

est appele polarisation de londe. ! sur le schma, la ! polarisation de E est rectiligne

x
' plan donde

animation

y B z

! Londe est transverse: E, B, k sont perpendiculaires ! Le plan contenant E et B est le plan de vibration des champs et est appel le plan donde '

L'onde E.M. est polarise

rectiligne
x =0 y = cos(" t )

circulaire
x = cos(" t ) y = sin(" t )

elliptique
x = cos(" t ) y = cos(" t # $ )

x = cos(" t ) y =0

x = cos(" t ) y = #sin(" t )

x = cos(" t ) y = cos(" t )

gauche

Pour l'observateur qui voit la vibration arriver

droite
animation

x = cos(" t ) y = #cos(" t )
x = cos(" t ) y = sin(" t )
x = cos(" t ) y = #sin(" t )

Propagation dans un milieu matriel

Dans le vide

$ z' E = Eo cos"& t # ) % c(

% z( E = Eo cos"' t # * ' v * & $)

Vitesse de propagation de londe ou vitesse de phase: v" = c /n

Dans un milieu matriel

vide n=1 air n=1.0003 eau n=1.33 verre n=1.4-1.7

& 2$ n z ) E = Eo cos("t # + ! ' % *

2# n z "= $ " = nz

est le dphasage est le chemin optique

!
!
file://localhost/Users/rouede/Documents/enseignement/BBM/cdedemo/edemo0.htm

10

Coefficients optiques macroscopiques n , (

R : coefficient de rflexion R = IR Iin T : coefficient de transmission T = I I T in ( : coefficient d'absorption
L

n "1 R= n +1

Verre : n=1.5 , R=4% !

Lumire transmise
I(z + dz) " I(z) # dI = "$ dz I(z) dI = "$ dz I dI % I = "$ % dz Ln I = "$ z + cste I(z) = I(z = 0) e"$ z I(z) T= = e"$ z I(z = 0)
En prsence de rflexion , la transmission T est gale :

Verre ( (silice)=10-5 cm-1

Milieux biologiques (=1 100 cm-1

T = (1" R)e"# L (1" R)

11

Absorption Loi de Beer-Lambert T = e"#

" (cm #1 ) $ 2.303 % & % c A = " # c # L (absorbance)
c concentration (mol/litre) ) coefficient dabsorption molaire (litre mol-1 cm-1)

( coefficient dabsorption cm-1

! !

Fluoresceine ) /litre =92300 M-1 cm -1 (" = 482nm) GFP ) /litre = 44000 M -1 cm -1 (" = 446nm) DAPI ) /litre = 27000 M -1 cm -1 (" = 344nm) Alexa fluor )/litre= 75000 M -1 cm -1 (" = 488nm)

T = e"#

ou T = 10"$

c z

Exercice : calculer le coefficient dabsorption ( de la fluoresceine 1M et en dduire la transmission dune cuve de 1cm (Rponse: ( = 0.21cm-1, T=80%)

!
Absorbance (A) = - log10(T) T=1 T=10-1 T=10-2 A=0 A=1 A=2

12

L'indice de rfraction est complexe

n = n " i# n 2 = n 2 " # 2 " 2in#

Nombre complexe
Nombres de la forme z=x + i y, o x et y sont des nombres rels, et i un "nombre imaginaire"tel que i2 = -1. eix = cosx + isinx cos x = 1/2 ( eix + e-ix) sin x= i/2 (eix + e-ix) (a + i b)(c + i d) = (a c - b d) + (a d + b c)i

n : indice * : coefficient d'extinction

Soit un nombre complexe z = x + i y. On appelle module de z le rel not |z| tel que |z|=(x2+y2).

On nomme conjugu de z le nombre z tq z = x - iy

cos x = "e e ix

!
!

sin x = Im e ix

13

ABSORPTION
Londe EM harmonique et propagative, elle a pour expression

E = Eo e
E = Eo e

i("t# kz )

avec

k=

" n 2# 2# 2# 2# = n= (n % i& ) = n % i & c $ $ $ $

i("t#

2$ 2$ n z +i &z ) % % ! 2$ 2$ n z) # &z % %

k est le vecteur d'onde

E = Eo e

i("t#

intensit " I # E E $ = e
!

4& (z '

IT transmission " T = = e#$ z Iin

T
"=
4# % $

!
!

T
!

14

Birfringence linaire

Lame birfringente place entre polariseurs croiss

15

A P

movie

16

Pourquoi la vitesse de londe dpend de la direction de propagation dans un cristal ? ! La force des liaisons chimiques et la densit atomique sont diffrentes dans diffrentes directions dans un cristal. Un rayon verra un arrangement lectronique diffrent suivant sa direction et suivant la polarisation car la vitesse en dpend .

The above image shows a hypothetical anisotropic mineral in which the atoms of the mineral are: 1. 2. 3. closely packed along the X axis moderately packed along Y axis widely packed along Z axis

The strength of the electric field produced by the electrons around each atom must therefore be a maximum, intermediate and minimum value along X, Y and Z axes respectively, as shown in the following image.

17 ! Lindice du milieu dpend de la direction de propagation de londe

dans ce milieu
! Comme londe est transverse, le champ E est dans le plan donde ! Le milieu va prsenter deux solutions pour le champ E . A chacune

de ces solutions correspond un indice. Pour une direction de propagation donne, il existe deux solutions possibles pour E et pour n: le milieu est birfringent. Il existe donc deux directions rectilignes Ex, Ey du champ E associes ces deux indices qui peuvent traverser le milieu sans dformation. On les appelle les lignes neutres/principales du milieu. Ces directions sont orthogonales.
! Dans le cas dun milieu amorphe (verre, plexi...) cet indice est

unique et le milieu est isotrope

! Ces deux vibrations se dplacent deux vitesses diffrentes c/nx et

c/ny
! Un champ lectrique incident orient dans une autre direction doit

se dcomposer sur ces deux directions principales.

! A la sortie la vibration est elliptique (cf. exercice)

ny z
Quartz, trigonal, 2 indices

vibration incidente

nx lame mince birfringente

onde elliptique

18

EXERCICE
On considre une onde lumineuse rectilignement polarise de longueur d'onde " issue dun polariseur dentre et qui se propage dans la direction z. Cette vibration traverse une lame mince birfringente dpaisseur e dindice nx et ny. 1/ Montrer que la vibration la sortie de la lame est elliptique. 2/ On interpose un polariseur de sortie. Montrer que la transmission T=Intensit incidente/Intensit transmise du systme est donne par 2" 2"% avec ! = (ne $ no )e = # #

! T = sin 2
2

direction de propagation

19

Birfringence circulaire
J.B. BIOT (1838) 1/ Certains corps isot ropes transparents, traverss par un faisceau parallle de lumire monochromatique polaris rectilignement, font tourner d'un certain angle + la direction de la vibration lumineuse autour de celle du rayon. La mme loi est valable pour certains cristaux uniaxes ou biaxes traverss par la lumire suivant la direction d'un axe optique. 2/ La grandeur + de la rotation est proportionnelle l'paisseur traverse. Certaines substances optiquement actives peuvent exister sous la forme dextrogyre et lvogyre. 3/ la rotation produite ne dpend pas de l'azimut de la vibration incidente ni du sens dans lequel la lumire se propage suivant une direction donne. 4/ La rotation dpend de la longueur d'onde: c'est le phnomne de dispersion rotatoire. Pour un corps incolore, la rotation croit gnralement en valeur absolue depuis le rouge jusqu'au violet.

CONVENTION
droite

20

gauche
x = cos(" t ) y = sin(" t )

x = cos(" t ) y = #sin(" t )

y x
SI LE SENS DE ROTATION DE L'HELICE EST CELUI QUI DFINI UN TRIEDRE DIRECTE ALORS L'HELICE EST POSITIVE ET +>0. POUR UN OBSERVATEUR QU REGARDE LA VIBRATION ARRIVER ALORS ELLE TOURNE VERS LA GAUCHE: LE MILIEU EST DIT "LEVOGYRE"

y x
SI LE SENS DE ROTATION DE L'HELICE EST CELUI QUI DFINI UN TRIEDRE INDIRECTE ALORS L'HELICE EST NEGATIVE ET + <0. POUR UN OBSERVATEUR QU REGARDE LA VIBRATION ARRIVER ALORS ELLE TOURNE VERS LA DROITE: LE MILIEU EST DIT "DEXTROGYRE".

Le milieu possde deux indices : birfringence circulaire

ng = no "

#G $

nd = no +

"G #
!

G est la constante de gyration

entre

" cos !t% $ ' 0 & #

! 1 " cos !t% 1 " cos !t% = $ '+ $ ' sin !t & 2 # -sin !t& 2#
gauche(en avance) droite (en retard)

21 La vibration tourne gauche pour un observateur qui regarde la vibration arriver

"

sortie

" cos ( % cos !t % 1 " cos !t ' ( % 1" ( 2) $ + $ = cos (!t ' ) $ 2 # sin ! t & 2 # -sin !t ' ( & 2 $ sin ( ) # 2&
rotation (= ,/2 (le sens de rotation est celui de la vibration rapide) pouvoir rotatoire spcifique: +

2" G " # (ng $ nd ) 2# 2 G ng ! nd = != = = # 2l % %2 Quartz: + ! 20/mm, birfringence circulaire ! 10-4 << birfringence linaire

INTERACTION MATIERE RAYONNEMENT

22

indice de rfraction

indice de rfraction

mission (" diffrent): - fluorescence, - mission spontane (luminescence) - phosphorescence

" identique (lastique) - Rayleigh, Mie " diffrent (inlastique) Brillouin, Raman

INTERACTION MATIERE RAYONNEMENT

A chaque rgion du spectre E.M. correspond des mcanismes spcifiques d'interaction "matire-rayonnement" entre l'onde et le milieu qui sont lis aux valeurs de l'nergie et/ou de la frquence correspondantes .

23

24

Polarisation lectronique (indice de rfraction)

Sous leffet du rayonnement lectromagntique, les lectrons sont dplaces sous leffet du champ lectrique et le noyau reste fixe. Le centre de gravit des charges positives et ngatives ne correspond plus: la molcule devient polaire et il apparat un moment dipolaire induit p=qd.
! A ces frquences ! (1014 - 1015 Hz) seuls les lectrons peuvent interagir avec londe E.M. ! Sous leffet du champ E oscillant, le moment dipolaire oscille galement et rayonne son tour un champ E.M. la mme frquence ! ! Ce rayonnement sajoute au champ incident E , ce qui cre la rponse du milieu. Cette rponse est lorigine de lindice de rfraction n.

25

Modle de Lorentz
Rponse type oscillateur harmonique entretenu

d2 x qE " kx = m dt 2

E " E o cos#t
!

!
2 " (#m$ 2 + m$ o ) x o = qE o !

x " x o cos#t
la rponse est harmonique

m o "x = o #2 $ #2 o

qE

"0 =

k m frquence propre

Indice de rfraction des milieux transparents

Moment dipolaire atomique Polarisation de la matire P
N q2 E o m P = Np = N q x o = "2 # "2 o

26

q2 E o m p =q x o = "2 # "2 o

o N(atomes/m3)

P = ! " # Eo

N q2 m# o n 2 "1 = $2 " $2 o
En posant 2#c 2#c "= , "o = $ $o

1+ " = #r = n 2
10 ev (silice SiO2)

!
spectre visible (.4 .8m)

UV
" (m) =
1, 24 E(ev) # " $ .1 m

%2 %2 Nq 2 o n 2 "1 = m#o 4 $ 2c 2 %2 " %2 o

Nq 2 #2 & #2 ) o o n "1 = 1+ 2 + 2 2( m$ o 4 % c ' # *

2

n2 = A +

B "2

"o < "

!

loi de Cauchy

INTERACTION MATIERE RAYONNEMENT Atome : Modle de Bohr

La matire est constitue d!atomes (lectrons, protons, neutrons)
protons lectrons neutrons

27

Photon: quantification de lnergie

quantum dnergie
h=6.63 10-34 Js

E = h" = hc / #

h est la constante de Planck

!Emission et absorption d!un photon

dans le modle de Bohr. orbite L!nergie du photon mis ou absorb est":

Selon le modle de Bohr, l!atome d!hydrogne peut tre reprsent comme un systme plantaire o l!lectron ne peut emprunter que certaines orbites, toutes les autres tant interdites. Chacune des orbites autorises de l!lectron correspond un niveau d!nergie de l!atome. Ce niveau d!nergie crot avec le rayon de l!orbite. L!lectron passe d!une orbite l!autre soit en mettant un photon (cas o le niveau d!nergie de l!orbite d!origine est suprieur celui de l!orbite de destination) soit en absorbant un photon (cas contraire).

h" = E n # E m

28

Le diagramme de Jablonski
Les tats dnergie dun systme (atomes, molcules) peuvent tre reprsents par un diagramme de Jablonski. Le systme peut se trouver dans diffrents tats excits. Ltat fondamental est appel S0 et reprsente le minimum dnergie du systme. Les premiers tats excits sont nomm respectivement S1, S2Sn .

1 x 10-5 to 10-8 s 1 x 10-4 s

Fluorescence
! Rendement de Fluorescence (probabilit de gnrer un photon de fluorescence par photon
absorb) 0.05 to 1.0

29

! Temps de vie Fluorescence (dure de vie du niveau excit) 1 10 ns

# = 1 10 ns
! Dcalage spectral (Stoke shift)

30

Chromophores

31

Applications la biologie
1. Antibodies, Avidins, Lectins and Related Products 2. Nucleic Acid Detection and Genomics 3.Protein Detection and Proteomics 4. Enzyme Substrates 5. Probes for Cytoskeletal Proteins 6. Probes for Organelles 7. Probes for Lipids and Membranes 8. Assays for Cell Viability, Proliferation and Function 9. Probes for Endocytosis, Receptors and Ion Channels 10. Probes for Signal Transduction 11. Probes for Reactive Oxygen Species, Including Nitric Oxide 13. Indicators for Ca{2+}, Mg{2+}, Zn{2+} and Other Metal Ions 14. pH Indicators 15. Indicators for Na{+}, K{+}, Cl{-} and Miscellaneous Ions 16. Probes for Membrane Potential

32

Diffusion par les tissus biologiques

Scattering coefficient