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STROISOMRIE DE CONFORMATION

Deux stroisomres de conformation (conformres) ne diffrent que par rotation(s) autour de liaison(s) . Exemple : le butane

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CH3 H H

H3C

H H

CH3 H H

H H

CH3 H H CH3

H3C H

CH3 H H H

H3C

En reprsentation de Cram, l'interconversion entre conformres s'effectue par rotation autour des liaisons !
CH3 H H CH3 H H

En reprsentation de Newman, l'interconversion entre conformres s'effectue par permutation circulaire sur 3 substituants
H H3C H CH3 H H

En reprsentation de Fischer, l'interconversion entre conformres s'effectue par permutation circulaire sur 3 substituants lis un atome central

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STROISOMRIE DE CONFIGURATION
Des stroisomres qui ne sont pas des conformres sont stroisomres de configuration. De faon gnrale, le passage de lun lautre ncessite des ruptures de liaisons. Exemple : lalanine
H H COOH H NH2 H H COOH H NH2 COOH H H H COOH H H NH2

H H2N

H H

En reprsentation de Cram, l'interconversion entre stroisomres de configuration s'effectue par rupture et formation de liaisons !
COOH H2N CH3 H

En reprsentation de Newman, l'interconversion entre stroisomres de configuration implique une permutation circulaire sur 2 substituants
COOH H CH3 NH2

En reprsentation de Fischer, l'interconversion entre stroisomres de configuration implique une permutation circulaire sur 2 substituants lis un atome central

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LMENTS DE NOMENCLATURE
Le squelette et les fonctions
Une relation entre un nom et une structure plane. Trois rgles : 1- Chercher la chane hydrocarbone la plus longue contenant le groupe fonctionnel de nombre doxydation le plus lev. 2- Numroter les atomes de carbone de la chane de faon ce que lindice du groupe fonctionnel de nombre doxydation le plus lev soit le plus petit. 3- Les substituants et leurs positions sur la chane sont ajouts sous forme de prfixes.

Exemple : 5-thyl-6-hydroxy-2-mthyl-octan-3-one

O
1 7 8 6 5 4 3 2

HO

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FONCTIONS ET RADICAUX
Les prfixes des groupes fonctionnels les plus importants sont : halogno- (drivs halogns ; fluoro, chloro, bromo et iodo), hydroxy- (alcools), amino- (amines), al- (aldhydes), one- (ctones), carboxy- (acides carboxyliques). Les prfixes des radicaux hydrognocarbons les plus importants sont : mthyle (Me- : -CH3), thyle (Et- :-CH2CH3), propyle (Pr- : -CH2CH2CH3), phnyle (Ph : C6H5). Il existe de nombreux noms dusage courant : actone au lieu de propan-2-one, acide actique au lieu dthanoque,
O O OH

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NOMMER LES STROISOMRES

Une relation entre un nom et une structure tridimensionnelle. Un seul nom pour la famille des conformres, en gnral insparables temprature ambiante. Le problme se pose pour les stroisomres de configuration qui ne sinterconvertissent gnralement pas dans les conditions opratoires utilises.

Les rgles de Cahn, Ingold et Prelog


Lutilisation de priorits entre groupes lis llment donnant lieu la stroisomrie de configuration rend possible lattribution dune configuration absolue.

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PREMIER EXEMPLE : DOUBLE LIAISON


Existence dune stroisomrie de configuration si A B et A B. Dfinition dune priorit 1/2 et 1/2 parmi {A,B} et {A,B} deux catgories :

1'

2' 1' 1' 2'

A B

A' B'

A>B et A'>B'
2 2 2' 2'

A>B et A'<B'
2 2

A<B et A'<B'
1 1'

A<B et A'>B'
1

Groupes prioritaires du mme ct de la double liaison: configuration absolue Z (zusammen = ensemble)

Groupes prioritaires de part et d'autre de la double liaison: configuration absolue E (entgegen = oppos)

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SECOND EXEMPLE : CARBONE ASYMTRIQUE


Existence dune stroisomrie de configuration si les quatre substituants A, B, C et D sont diffrents.
Observation

A * B D C

Remarque : Les centres asymtriques sont souvent figurs laide dune astrisque *.

Dfinition dune priorit 1/2/3/4 parmi {A,B,C,D} et positionnement du groupe le moins prioritaire (D par exemple) vers larrire six situations se rpartissant en deux catgories :
A>B>C>D B>C>A>D C>A>B>D 1 2 3 2 3 1 2 3 1 A>C>B>D B>A>C>D C>B>A>D 1 3 2 3 2 1 3 2 1

Trois conformres partageant la priorit 1/2/3 dans le sens trigonomtrique Configuration absolue S (sinister = gauche)

Trois conformres partageant la priorit 1/2/3 dans le sens des aiguilles d'une montre Configuration absolue R (rectus = droite)

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LES RGLES DE PRIORIT


Deux rgles principales :
Rgle n1 : la priorit des atomes diminue avec leur numro atomique Z Rgle n2 : pour deux atomes isotopes, la priorit diminue avec la masse Exemples : Br>F>C>H, D>H

Mise en uvre pour la dtermination de configurations absolues


Le classement par priorit dcroissante sapplique par explorations concentriques partir de latome central (attribution des configurations R,S) ou des atomes lis par une double liaison (attribution des configurations Z,E).

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EXEMPLES DE DTERMINATION DE CONFIGURATION ABSOLUE


1- La dtermination est possible au rang 1 :

H H3C 3

4 Observation * Br 1 F2 H3C 3

2 H Br 1 4 3

! Configuration absolue S
1

4 H 2 H3C * 3 D OH 1

1 Cl

2' CH3

! Configuration absolue S
2H Cl 1'

! Configuration absolue E

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2- Il arrive parfois que la dtermination ne soit pas possible au rang 1, par exemple parce que deux atomes identiques apparaissent au rang 1. Il est alors ncessaire de passer au rang 2, voire aux rangs suprieurs. Il s agit toujours de conclure au rang minimal.
Rangs
0 1 2
O C H H

3
H

H C H H

OH *
b d 3 2 1

OH
b
C

Par convention, la branche issue de latome central passe par les atomes de Z les plus levs: - indtermination au rang 1, - au rang 2, a>(c,d)>b, - au rang 3, d>c
H

c
c

H C H C H C H H C H C H H H H H

D o: a>d>c>b Configuration absolue (R)

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* HO * Cl * * * *
2 1 4

Cl
2

* MeO * 1 *
3

N* H4 OH

CH3 H
N H

* OH

(R)

(S)

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3- Dans le cas des liaisons multiples, le graphe de la molcule fait intervenir des atomes rpliques (Z) (numro atomique Z) et des atomes fantmes nots 0 ( numro atomique gal 0 par convention) de faon complter toutes les valences quatre ( lexception de latome dhydrogne).
0 (C)
0 (C) O 0 0

0 0 0

(C)

0 0

O C H (O)

0 0 0

0 N C (N) 0 0 0

(N)

0 0

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O HO

2'

! Configuration absolue E
2 1'

2'

N
2

1'

! Configuration absolue E

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AUTRES SYSTMES DE NOMENCLATURE


Nomenclature cis-trans
Elle est gnralement remplace par la nomenclature Z/E dans le cas des drivs thylniques. Elle est encore utilise dans les composs cycliques qui portent deux substituants R identiques. Elle repose sur la position relative des deux substituants : - situs dans le mme demi-espace dlimit par le plan moyen du cycle stroisomres cis, - situs de part et dautre du plan moyen du cycle stroisomres trans.

Cl

Cl

Cis dimthyl-1,2-cyclopropane

Trans dichloro-1,3-cyclobutane

Nomenclature D, L des oses et des aminoacides


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