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Expertise nationale sur les mortalits de poisson dans la Haute Loue et les liens ventuels avec les prolifrations

de cyanobactries

1- Contexte
La Loue, rsurgence du Doubs, est une rivire emblmatique de la Rgion FrancheComt. Elle est caractrise, au sens de la DCE, par un bon tat biologique et une bonne qualit chimique de leau. Les donnes issues de lanalyse des peuplements de macroinvertbrs, macrophytes et de diatomes rvlent la prsence dun peuplement stable et quilibr, caractristique dune bonne qualit physico-chimique et dune grande qualit dhabitat. Les analyses physico-chimiques confirment cette conclusion et ne rvlent pas deutrophisation du cours deau (PO4 < 0,1mg.L-1 ; NH4 > 0,1 mg.L-1 ; NO3 < 8 mg.L-1) ou de pollution lies la prsence de phytosanitaires et/ou mtaux lourds (donnes DREAL et Agence de leau Rhne Mditerrane et Corse). Cependant, de janvier mai 2010, une forte mortalit de poissons ainsi quun dveloppement important de cyanobactries benthiques (Oscillatoria princeps) ont t observs sur un tronon allant de la source Quingey. Cette mortalit a touch aussi bien les Salmonids (truite commune Salmo trutta et ombre commun Thymallus thymallus) que les petites espces benthiques (chabot Cottus sp et loche franche Barbatula barbatula). Ce type de mortalit est rcurrent sur ce bassin au printemps depuis quelques annes (certaines observations datent des annes 80), mais lvnement de 2010 prsente la particularit dtre plus important quhabituellement, davoir touch de

nombreuses espces et davoir dbut plus tt dans lanne. La mort de deux chevreuils est galement survenue sur cette mme priode. Les premires investigations suggrent que ces mortalits seraient potentiellement lies au dveloppement des cyanobactries benthiques et au mauvais tat sanitaire des poissons. Les cyanobactries sont des organismes procaryotes photosynthtiques capables de coloniser tous les types dcosystmes. Elles peuvent tre unicellulaires ou multi-cellulaires organises alors en colonies ou en filaments (Mur et al, 1999). Dans les milieux aquatiques, elles se dveloppent dans la colonne deau (sous forme planctonique) ou fixe un support (benthique). Elles possdent des caractristiques physiologiques qui les rendent trs comptitifs et qui leur permettent, quand les conditions leur sont favorables, de coloniser rapidement le milieu au dtriment des autres espces phytoplanctoniques ou benthiques. Les facteurs environnementaux qui favorisent lapparition des efflorescences cyanobactries sont relativement bien connus mais limportance de chaque facteur peut varier en fonction des espces et du site tudi. Dans les cours deau, le dveloppement de cyanobactries est gnralement associ un enrichissement en nutriments, une alcalinit leve, un ralentissement des dbits, un ensoleillement et des tempratures levs. Les prolifrations de cyanobactries induisent des dsquilibres sur les cosystmes aquatiques. Les niveaux de biomasse associs aux efflorescences entranent une rduction de la transparence de leau et conduisent labsence de dveloppement de la vgtation aquatique, impliquant la disparition dhabitats pour les invertbrs et les poissons (Paerl et Huisman, 2008). Outre les effets sur les cosystmes induits par les fortes biomasses, la production de mtabolites toxiques est galement suspecte davoir un impact sur les communauts biotiques aquatiques (Smith et al., 2008) et terrestres (Briand et al., 2003 ; Wood et al., 2007). Actuellement, il reste trs difficile de prvoir lapparition et limpact des efflorescences de cyanobactries sur les milieux aquatiques, et notamment les cours deau. Cependant, la communaut scientifique saccorde pour indiquer que la frquence de ce type dvnements va augmenter en lien avec les changements climatiques (Wiedner et al., 2007, Paerl et

Huisman, 2008). Il est donc important de comprendre le dterminisme de ces efflorescences, didentifier leurs impacts sur le fonctionnement des cours deau et de dfinir des actions permettant de minimiser leurs impacts. Suite ce constat, le prfet du Doubs a mandat lONEMA pour conduire une expertise afin didentifier les causes de ces mortalits et les leviers dactions permettant de prvenir ces vnements dans les prochaines annes.

2- Objectif de lexpertise

Cette expertise doit permettre : 1- de mieux comprendre partir des donnes et des documents disponibles les modalits de dveloppement des efflorescences de cyanobactries benthiques, et les liens directs ou indirects avec la mortalit des poissons 2- de dfinir des leviers dactions cibles et concrtes (amnagement des berges, des bassins versants, changement de certaines pratiques agricoles, amlioration de certains traitements, etc.) permettant dviter ce type de mortalits. En terme de gestion, un enjeu important est de comprendre les raisons pour lesquelles la Loue et d'autres rivires de la rgion (Doubs franco-suisse ; Ain) ont t atteintes par des mortalits anormales en 2010 toujours associes la prsence de cyanobactries, alors que d'autres comme le Dessoubre et /ou le Cusancin ont t pargnes 3- de dfinir des stratgies de gestion oprationnelle des efflorescences cyanobactrie 4- de prciser les questions de recherche qui devront tre traites pour une meilleure comprhension et gestion de ces vnements.

3- Composition du groupe national dexperts


Les rponses aux diffrentes questions ncessitent de dvelopper une vision systmique du fonctionnement des cours deau permettant dintgrer les interactions entre

les pressions que subissent les cours deau et leur bassin versant (pollutions diffuses, ponctuelles, amnagement des bassins versants et des cours deau, prlvements etc) et le fonctionnement des cours deau, du point de vu de la biologie (pathologie, chaine alimentaire, cologie des organismes etc..), de la chimie (toxicit, impact, cycles gochimiques, temprature etc) et hydrologie (hydrogologie, hydrologie) Dans cette optique pluridisciplinaire, le groupe national dexperts vise regrouper les principales comptences scientifiques ncessaires et notamment :

- Icthyo-pathologie : Christian Michel (INRA) - Ecologie des cyanobactries : Jean-Franois Humbert (INRA, UMR Bioemco) - Toxine de cyanobactries, gestion et valuation des risques : Sophie KRYS (ANSES) - Pollutions diffuses et Impact sur fonctionnement des cours deau : Bernard Montuelle (INRA, UMR CARRTEL) - Impact des pressions sur la chaine trophique : Grard Lacroix (CNRS, UMR Bioemco) - Dveloppement des biofilms : Frdric Garabtian (Universit de Bordeaux, UMR EPOC) - Ecologie des Macrophytes : Gundrun Bornette (Universit Claude Bernard-Lyon, UMR 5023) - Hydrologie de surface : Eric Sauquet (Cemagref Lyon) - Transfert de pollution en milieu karstique : Nathalie Drfliger (BRGM) - Amnagement du bassin versant et pollution diffuse : Dominique Trevisan (INRA, UMR CARRTEL) - Ecologie des invertbrs : Valrie Vernaux (Universit de Franche-Comt, UMR 6249) - Impact des polluants sur la vie des poissons/cologie des poissons : Philippe

Gaudin (INRA Saint-Pee)

4- Fonctionnement de lexpertise
1- Organisation Lors de sa premire runion, le groupe national dexperts, prsid par Jean-Franois Humbert, organisera : le droulement de lexpertise dans le respect de la norme NF X 50-110 Qualit en expertise Prescriptions gnrales de comptence pour une expertise , et notamment les aspects de comptences, dindpendance, de traabilit et de transparence. le lien avec le commanditaire de lexpertise, le Prfet du dpartement du Doubs, reprsent par la Directrice de la DDT du Doubs les interactions avec le groupe dexperts locaux.

Pour conduire ces tches, le prsident est assist dun animateur scientifique et technique accueilli par lUMR Bioemco sur le site de lENS (Aurlie Villeneuve) qui sappuie sur : - le responsable de lexpertise lOnema (Romuald Berrebi) pour assurer le secrtariat - une quipe projet constitu de chargs de mission de lONEMA pour les aspects scientifiques et techniques (analyses de donnes, notes bibliographiques etc) - le groupe dexperts locaux, pilot par lAgence de lEau Rhne-Mditerrane et Corse (Dlgation de Besanon) qui a comme objectifs : o dorganiser et de mettre disposition les lments de connaissance (rapports techniques notamment) et les donnes disponibles sur les bassins versants tudis o dapporter au groupe national dexperts des connaissances fines du terrain, de lhistorique du fonctionnement de la Loue et des activits humaines, sous forme de notes ou daudit. o dlaborer des propositions dactions, notamment pour le suivi prventif.

2- Moyens Pour raliser lexpertise, le groupe national dexperts se base sur : - les connaissances issues de la littrature scientifique et des rapports et de notes techniques mis disposition par le groupe dexperts locaux - lanalyse et linterprtation des donnes mises disposition par le groupe dexperts locaux, en compatibilit avec les dlais imposs - laudit de personnalits de son choix et notamment des membres du groupe dexperts locaux. Pour mener bien cette expertise, le groupe national dexperts pourra : - se runir en tant que de besoin, physiquement ou par visio-confrence - se dplacer sur le terrain - organiser des audits de personnalits de son choix - et compte-tenu des dlais de rponses attendus organiser un sminaire de travail avec le groupe dexperts locaux. Ce sminaire aura comme objectif de favoriser les changes entre les deux groupes et ainsi de consolider loprationnalit des rsultats du travail. Les frais de dplacements et dhbergements des experts seront pris en charge par lONEMA.

3- Calendrier Premire runion pour constitution du groupe de travail : dbut mai Sminaire de travail avec les experts locaux et visite du site : dbut juin (2 jours) Deuxime runion : mi-juillet (possibilit de visio confrence) Troisime runion : mi-septembre (possibilit de visio confrence) Dbut de rdaction du rapport : partir de novembre 2011

Le rsultat final de lexpertise sera rendu au commanditaire en dbut danne 2012. Afin de faciliter leur intgration dans les processus locaux de gestion (document du SAGE

notamment), le commanditaire de lexpertise pourra : - Interroger au cours de lexpertise, le groupe national dexpert sur certains points prcis, comme notamment la mise en place dune stratgie de recueil de donnes. - Organiser une runion dchange entre le groupe national dexperts et les acteurs locaux de la gestion, dans le cadre notamment des runions de Mise largie