1. SUBRAYA LA RESPUESTA CORRECTA, Y JUSTIFICA CON TEXTO EXPLICATIVO TU RESPUESTA. 1.Que flecha seala un enlace peptdico? A.i B.

2 C.2y3 D..3

E.4y5

Los aminocidos estn unidos por un enlace peptdico entre el grupo amino de un aminocido y el grupo carboxilo del siguiente. Los polipptidos son cadenas lineales de aminocidos, habitualmente de ciento o miles de aminocidos de longitud. Cada cadena polipeptdica tiene dos extremos distintivos, uno terminando en un grupo amino (el extremo amino, o N terminal) y el otro en un grupo carboxilo (el extremo carboxi-, o C, terminal). Los polippti-dos se sintetizan desde el extremo amino al carboxilo terminal, y la secuencia de aminocidos en un polipptido se escribe (por convencin) en el mismo orden. La caracterstica definitoria de las protenas es que son polipptidos con secuencias de aminocidos especficas. 2. La estructura de la izquierda corresponde a un carbohidrato y la estructura de la derecha es un aminocido. A. lpido, polipptido B. carbohidrato , Lpido C. carbohidrato, aminocido D. nucletido, aminocido E. nucletido, carbohidrato

Los monosacridos pueden unirse entre s mediante reacciones de deshidratacin, donde se extrae H2O y se unen los azcares mediante un enlace glicosdico o glucosdico entre dos de sus tomos de carbono. Si solo se extraen unos pocos azucares, el polmeros resultantes se denomina oglisacrido. Los aminocidos son molculas con un grupo carboxilo, amino y un radical (un gripo funcional) el cual le dar las propiedades fsicas y qumicas del respectivo aminocido. 3. La estructura terciaria de una protena se refiere a: A. Secuencia de aminocidos

A. B. C. D.

Presencia de hlices o lminas Plegamiento tridimensional caracterstico de la molcula Interacciones de una protena con otras subunidades de las enzimas Interaccin de una protena con un cido nucleico

La estructura terciaria es el plegamiento de la cadena polipeptdica como resultado de las infracciones entre las cadenas laterales de aminocidos que se encuentran en diferentes regiones de la secuencia primaria. En la mayora de las protenas, combinaciones de hlices y hojas , conectadas por regiones lazo de la cadena polipeptdica, se pliegan en estructuras globulares compactas denominadas dominios, que son las unidades bsicas de la estructura terciaria. 4. La estructura que se muestra en diagrama es un ejemplo de A. B. C. D. E. RNA Una protena Un polisacrido DNA Un lpido

Los lpidos son biomolculas orgnicas formadas bsicamente por carbono e hidrgeno y generalmente tambin oxgeno; pero en porcentajes mucho ms bajos. Adems pueden contener tambin fsforo, nitrgeno y azufre . Los cidos grasos poseen una zona hidrfila, el grupo carboxilo (-COOH) y una zona lipfila, la cadena hidrocarbonada que presenta grupos metileno (-CH2-) y grupos metilo (-CH3) terminales. Por eso las molculas de los cidos grasos son anfipticas, pues por una parte, la cadena aliftica es apolar y por tanto, soluble en disolventes orgnicos (lipfila), y por otra, el grupo carboxilo es polar y soluble en agua (hidrfilo). 5.Que enunciado es correcto, en relacin con la estructura de las protenas? A. La estructura primaria es la secuencia de los aminocidos B. Las hlices alfa y las lamina beta son ejemplos de estructuras secundarias C. Las cadenas laterales de los aminocidos (grupos R) pueden ser hidrofobicas o hidrofilicas. D. Las protenas formadas por dos o mas cadena polipeptidicas se dice que presentan estructura cuaternaria E. Todas la afirmaciones anteriores son ciertas. JUSTIFICACION: Las protenas se pueden degradar (hidrolizar) hasta su aminocido constituyentes mediante diversos mtodos y los estudios inciales sobre las protenas se centraron, naturalmente, en los aminocidos procedentes de las mismas. Los aminocidos de pueden clasificar segn su grupo R .

El conocimiento de las propiedades qumicas de los aminocidos estndar es de vital importancia para la comprensin de la bioqumica. El tema se puede simplificar agrupando los aminocidos en cinco clases principales basadas en las propiedades de sus grupos R, en especial su polaridad, o tendencia a interaccionar con el agua a Ph biolgico (cerca de Ph 7). La polaridad de los grupos R varia enormemente desde totalmente apolar o hidrofobico (insoluble en agua) hasta altamente polar o hidrofilico (soluble en agua). Existen varios niveles de estructura de la protenas. Para macromolculas grandes tales como las protenas, la tarea de describir y comprender la estructura se aborda a varios niveles de complejidad, ordenado en una especie de jerarqua conceptual. Se definen normalmente cuatro niveles de estructura de las protenas: la estructura primaria, estructura secundaria (se refiere a disposiciones particularmente estable de los aminocidos que dan lugar a patrones estructurales repetitivos), estructura terciaria y estructura cuaternaria. Algunas protenas estn constituidas por dos o mas cadenas polipeptidicas o subunidades, las cuales pueden ser idnticas o diferentes. La disposicin de estas subunidades proteicas en complejos tridimensionales constituyen la estructura cuaternaria.

6. Dos macromolculas, como por ejemplo dos protenas, pueden unirse entre ellas con gran fuerza y especificidad. Cmo es posible que interacciones dbiles, como las fuerzas electrostticas atractivas, las interacciones de Van de Waals, los enlaces de hidrogeno y las interacciones hidrofobias originen una adherencia tan fuerte? A. La adherencia puede llegar a ser fuete cuando existen muchas interacciones dbiles, todas ellas contribuyendo a la estabilidad de la estructura. JUSTIFICACION: La estabilidad de una protena no es nicamente el resultado de la suma de las energas libres de formacin de las muchas interacciones dbiles de su interior. Cada uno de los grupos que forman los enlaces de hidrogeno una cadena polipeptidica plegada se encontraba unido por puentes de hidrogeno por el agua antes del plegamiento y para cada enlace de hidrogeno formado en una protena a debido romperse otro enlace de hidrogeno (de fuerza similar) entre el mismo grupo y el agua. La contribucin en estabilidad neta de una interaccin dbil, o la diferencia en energa libre entre el estado plegado y desplegado, puede ser cercano a cero. La contribucin de los enlaces dbiles a la estabilidad de las protenas puede entenderse a partir de la consideracin de la propiedades de la gua. El agua pura contiene una red de molculas de H2O unidas por puente de hidrogeno. La estructura proteica esta estabilizada por mltiples interacciones dbiles. Las interacciones hidrofobias son las que mas contribuyen a la estabilizacin de la forma globular de la mayora de las protena solubles; los enlaces de hidrgenos y

las interacciones inicas se encuentran optimizados en las estructuras especificas mas estables termodinmicamente. II. Contesta extensivamente las siguientes preguntas 1. EXPLICA POR QU EL ENLACE PEPTDICO ES UN ENLACE RGIDO El enlace peptdico es plano y por tanto no existe rotacin alrededor del enlace. El enlace peptdico posee un carcter de doble enlace, lo que significa que es mas corto que un enlace sencillo y, por tanto, es rgido y plano Esta caracterstica previene la libre rotacin alrededor del enlace entre el carbono carbonlico y el Nitrgeno del enlace peptdico. Aun as, los enlaces entre los carbonos y los aminos y carboxilo, pueden rotar libremente; su nica limitacin est dada por el tamao del grupo R. Es precisamente esta capacidad de rotacin la que le permite a las protenas adoptar una inmensa gama de configuraciones. 2. ELABORA UN PROTOCOLO BREVE PARA PURIFICAR UNA PROTEINA, EN DONDE SE INCLUYANAL MENOS CINCO TCNICAS DIFERENTES. EXPLICA LA RAZN POR LA QUE SELECCIONASTE CADA TCNICA La extraccin purificacin parcial de las toxinas hl1, hl2 y hl3 del veneno del escorpin. Extraccin: Disolucin en un buffer (cido actico) para separar las protenas de los dems compuesto que tenga la muestra por polaridad. Centrifugacin para eliminar los restos insolubles. Columna de intercambio catinico usando el buffer para poder retener las protenas en la columna estas fueron eluidas con una solucin (NaCl) B. Cuantificacin de protena El contenido proteico del veneno crudo y de las protenas obtenidas durante la separacin cromatogrfica se determin por el mtodo de Lowry: Reduccin de biuret interaccin de las protenas en la solucin de cobr. Reduccin del reactivo de folin, reduccin de los complejos de biuret Espectrmetro para obtener la concentracin de protenas C. Evaluacin de la pureza y determinacin del peso molecular electroforesis en gel de poliacrilamida en condiciones denaturantes. 3. Explica cul es la diferencia que existe entre el almidn, el glucgeno y la celulosa.

El almidn es una mezcla de de molculas de poliglucosa, algunas lineales y otras ramificadas. Uno de estos tipos, la amilosa, es un polmero largo y no ramificado de -glucosa. El otro, la amilopectina, es el polmero ramificado de la -glucosa. Los almidones naturales tienen aproximadamente de 10 a 20 por ciento de amilosa y entre 80 y 90% de amilopectina, el glicgeno difiere del almidn por la ausencia aparente de cualquier molcula del tipo de amilosa, no ramificada. Es tan ramificado como la amilopectina y quizs un poco mas. El almidn y el glucogeno son polmeros de forma de la glucosa. La celulosa es un polmero de forma . Sus molculas no son ramificadas y se parecen a las de la amilosa. 4. Escribe 3 ejemplos biolgicos donde participen las biomolculas aminocidos, protenas, lpidos, carbohidratos. Ejemplos donde indiquen en que proceso biolgico o enfermedad estn participando las molculas, su descripcin completa. 1. Durante la fotosntesis se obtiene la energa de la luz solar y se utiliza para dirigir la sntesis de glucosa a partir de CO2 y H2O. Al convertir la energa de la luz solar en una forma utilizable de energa potencial qumica, la fotosntesis es la fuente fundamental de energa metablica para todos los sistemas biolgicos. La fotosntesis se realiza en dos fases distintas. En las reacciones de la fase lumnica, la energa de la luz solar dirige la sntesis de ATP y NADPH, acoplada a la formacin de O2 a partir del H2O. En las reacciones de la fase oscura, denominada asi porque no requieren luz solar, el ATP y el NADPH producido en la fase luminica dirigen la sntesis de glucosa. En las clulas eucariotas, tanto la fase luminica como la fase oscura de la fotosntesis tienen lugar en los cloroplastos las reacciones de la fase lumnica en la membrana tilacoidal y las reacciones de la fase oscura en el estroma. Flujo de electrones a travs de los fotosistemas I y II '[ La luz solar es absorbida por los pigmentos fotosintticos, siendo las clorofilas los pigmentos ms abundantes en las plantas. La absorcin de la luz excita un electrn a un estado energtico ms elevado, convirtiendo as la energia de la luz solar en energa qumica potencial. Los pigmentos fotosintticos estan orgaizados en fotocentros en la membrana del tilacoide, cada uno de los ru contiene cientos de molculas de pigmento. Las numerosas molculas de pigmento en cada fotocentro actan como antenas, absorbiendo la luz riendo la energa de sus electrones excitados a una molcula de clorofila como centro de reaccin. La clorofila del centro de reaccin transfiere a continuacin su electrn de alta energa a una molcula aceptara de una de transporte de electrones. Los electrones de alta energa se transfieren a travs de una serie de transportadores de membrana, acoplados a la sntesis de ATP y de NADPH. El centro de reaccin est constituido por tres polipptidos transmembrana unidos a un citocromo de tipo c que se localiza en el lado externo de la membrana. La energa procedente de la luz solar es capturada por un par de moleculas conocida. A continuacin los electrones, transfieren desde el par especial a otro par de clorofilas y desde all a otros grupos prostticos (feofitinas y quinonas). Desde all los electrones se acoplan un complejo citocromo bc, donde

el transporte de electrones se acopla a la generacin de un gradiente de protones. A continuacin los electrones transferidos al citocromo del centro de reaccin y finalmente retornan al par especial de clorofilas. Por lo tanto, el centro de reaccin convierte la energa solar en electrones de alta energa, cuya energa potencial se convierte gradientes de protones por el complejo del citocromo bc. los vegetales, las protenas que intervienen en la fase lumnica de la fotosntesis se organizan en cinco complejos en la membrana del tilacoide. Dos de estos complejos son fotosistemas (fotosistemas I y II), en los que la luz absorbe y transfiere que la luz se absorbe y se transfiere a las clorofilas del centro de reaccin. Los electrones de alta energa se transfieren a travs de una serie de transportadores tanto en los fotosistemas como en un tercer complejo de protenas, el complejo citocromo bf. Al igual que sucede en las mitocondrias, la transferencia de electrones est acoplada a la transferencia de protones a la luz del tilacoide, establecindose as un gradiente de protones a travs de la membrana del tilacoide. La energa almacenada en este gradiente de protones se obtiene posteriormente por un cuarto complejo de protenas de la membrana del tilacoide, la ATP sintetasa, que (al igual que la enzima mitocondrial) acopla un flujo retrgrado de protones, a travs de la membrana, a la sntesis de ATP. o Una diferencia importante entre el transporte de electrones en los cloroplastos y en las mitocondrias es que la energa derivada de la luz solar durante la fotosntesis no slo es convertida en ATP sino que tambin se utiliza para generar el NADPH requerido para convertir el CO2 en carbohidratos. Esto se consigue utilizando dos fotosistemas diferentes en la fase lumnica de la fotosntesis, uno para generar ATP y el otro para generar NADPH. Los electrones se transfieren de forma secuencial entre los dos fotosistemas, interviniendo el fotosistema I para generar NADPH y el fotosistema II para generar ATP. El flujo de electrones se inicia en el fotosistema II, que es homlogo al centro de reaccin fotosinttico de R.viridis ya descrito. Sin embargo, en el fotosistema II la energa derivada de la absorcin de los fotones se utiliza para romper molculas de agua en oxgeno molecular y protones. Esta reaccin tiene lugar en la luz del tilacoide, por lo que la liberacin de protones a partir del H 2O determina un gradiente de protones a travs de la membrana del tilacoide. Los electrones de alta energa derivados de este proceso se transfieren a travs de una serie de transportadores a la plastoquinona, un transportador liposoluble similar a la coenzima Q (ubiquinona) de las mitocondrias. La plastoquinona transporta los electrones desde el fotosistema II al complejo citocromo bf, en el que los electrones son transferidos a la plastocianina y se bombean ms protones al interior de la luz del tilacoide. De esta manera, el transporte de electrones a travs del fotosistema II est acoplado a la generacin de un gradiente de protones, que dirige la sntesis quimiosmtica de ATP. Desde el fotosistema II, los electrones son transportados por la plastocianina (una protena perifrica de membrana) hasta el fotosistema I, donde la absorcin de otros fotones vuelve a generar electrones de alta energa. El fotosistema I, sin embargo, no acta como una bomba de protones, sino que utiliza estos electrones de alta energa para reducir el NADP1 a NADPH. La clorofila del centro de reaccin del fotosistema I transfiere sus electrones excitados a travs de una serie

de transportadores hasta la ferredoxina, una pequea protena de la membrana del tilacoide que da al estroma. La enzima NADP recluc-tasa transfiere despus los electrones desde la ferredoxina hasta el NADP+, generando NADPH. Por lo tanto, el paso de los electrones a travs de los foto-sistemas I y II genera ATP y NADPH, que son utilizados por las enzimas del ciclo de Calvin en el estroma del cloroplasto para convertir CO2 en carbohidratos 2. Metabolismo de lpidos y polisacridos en el golgi Ademas de procesar y distribuir las glicoprotenas, el aparato de Golgi participa en el metabolismo lipdico concretamente, en la sntesis de glicolpidos y esfingomielina. Como ya se ha visto, los glicerofosfolpidos, colesterol, y la ceramida se sintetizan en el RE. La esfingomielina y los glicolpidos se sintetizan a de la ceramida en el aparato de Golgi. La esfingomielina (el fosfolpido no glicrico en las membranas celulares) es sintetizada por la transferencia de un grupo fosforilcolina desde la fosfatidilcolina a la ceramida. lativamente, la adicin de carbohidratos a la ceramida puede dar lugar antes glicolpidos. La esfingomielina se sintetiza en la superficie luminal del Golgi, pero la glucosa se aade a la ceramida en la cara citoslica. Sin embargo, parece ser que cosilceramida se da la vuelta y los carbohidratos adicionales se aaden en a luminal de la membrana. Ni la esfingomielina ni los glicolpidos pueden translocarse a travs de la membrana del Golgi, por lo que slo se localizan en la mitad luminal de la bicapa del Golgi. Tras el transporte vesicular, se localizan cara externa de la membrana citoplasmtica, con sus grupos de cabeza os expuestos en la superficie celular. Los residuos de oligosacridos de los glicolpidos son marcadores de superficie importantes en el reconocimiento clula-clula.

5. cual es la formula general de los aminocidos y carbohidratos7.describe la clasificacin de los aminocidos, de los lpidos, de los carbohidratos. Estructura qumica de los aminocidos. La formula general de los aminocidos hallados en la protenas. La porcin marcada es comn para todos los aminocidos

Excepto la prolina todos ellos tienen como denominadores comunes un grupo carboxilo libre y un grupo amino libre y insustituido el tomo de carbono alfa

diferentes entre si en la estructura de sus cadenas laterales distintivos, llamados grupo R. Existen cuatro clases principales para clasificar los aminocidos sobre su base de sus grupos R. 1.- AMINOACIDOS DE GRUPO R NO POLARES E HIDROFOBICOS. Estas familia contienen cinco aminocidos o grupos R que son hidrocarburos alifticos (la alanina, la leucina, la isoleucina, la valina y la piridina), dos con anillos aromaticos (la felialnina y el triptfano) y uno que contiene azufre (la metionina). Como grupo estos aminocidos son menos solubles en el agua que los aminocidos con grupo R polares. El miembro menos hidrfobo de esta clase es la alanina la cual se haya casi en la line a fronteriza entre los aminocidos no polares y los que poseen grupos R polares. 2.- AMINOCIDOS CON GRUPOS R POLARES SIN CARGA. estos aminocidos son relativamente mas solubles en el agua que los aminocidos con grupo R no polares. Sus grupos R contienen grupos funcionales polares neutros(sin carga) que pueden establecerse en laces de hidrogeno con el agua la polaridad de la serina, la treonina y la tirisina se debe ea los grupos hidroxilo; la de la asprangina y la glutamina a sus grupos amdicos, y la de la cistena a la presencia de l grupo sulfhidrilo (menos SH). La glicocola, se clasifica, a veces como un a aminocido no polar, pero su grupo R, que es una tomo de hidrogeno es demasiado pequeo para que pueda influir en la elevada polaridad de los grupos alfa amino y alfa carboxilo. La asparina y la glutamina son las amidas de los cidos asparticos y glutamico, a los que libera fcilmente por hidrlisis acida y bsica. Los smbolos de tres las letras Asx y Glx, a los de uan letra B y Z, se emplean para designar la suma de acido aspartico y asparagina y acido glutanico, cuando el contenido amidico no se conoce. 3.-AMINOACIDOS CON GRUPOS R CARGADOS POSITIVAMENTE. Los aminocidos bsicos, en los nque en los grupos R poseen carga positiva neta a Ph 7, poseen todos seis atomos de carbono. Estas constituidos por la glisina que contiene un segundo grupo amino en la posicin E de la cadena aliftica, la arginina, que tiene un grupo guanidino cargado positivamente y la histirina que contiene la funcin imida solio, dbilmente bsico. 4.- AMINOACIDOS CON GRUPOS R CARGADOS NEGATIVAMENTE. Los dos miembros de esta clase son los acido aspartico y glutamico, cada uno de los cuales poseen un segundo grupo carboxilo que se haya completamente ionizado, y por tanto, cargado negativamente de Ph 6 a 7. AMINOACIDOS NO PROTEICOS. Se conocen unos 150 aminocidos mas que se encuentran en diferentes clulas y tejidos en forma libre o combina. pero nunca en las protenas la mayor parte de ellos son derivados de las alfa aminocidos hallados en las protenas, pero tambin se conocen beta negativo, gama negatico aminocidos. Algunos aminocidos no proteicos actan como precursores importantes o intermediarios en el metabolismo; asi, la beta alanina es el precursor de la viatmina acido pantotenico, la homosisteina y la homoserina son intermediarios en el metabolismos de los aminocidos; la citrulina y la hornitina, son intermediarios en la sinteis de la orginina. Algunos aminocidos no proteicos poseen la configuracin de, por ejemplo el acido D-glutamico, hallado en cantidades sustanciales en las

paredes celulares de muchas bacteria, la D-analina, halladas en las larvas de algunos insectos y la D- serina, que se encuentra en gusanos CLASIFICACIN DE LOS CARBOHIDRATOS FORMULA DE LOS CARBOHIDRATOS Cn (H2O)n Clasificacin Los carbohidratos se clasifican en monosacridos, oligosacridos y polisacridos. Un monosacrido, es una unidad, ya no se subdivide ms por hidrlisis cida o enzimtica, por ejemplo glucosa, fructosa o galactosa. Los oligosacridos estn constituidos por dos a diez unidades de monosacridos. La palabra viene del griego, oligo = pocos. Digamos el azcar que utilizamos es un disacrido y por tanto un oligosacrido.

Los polisacridos son macromolculas, por monosacridos, entre 100 y 90 000 unidades.

hidrlisis

producen

muchos

Como primera aproximacin, desde el punto de vista qumico, los carbohidratos son polihidroxialdehdos o polihidroxicetonas o compuestos que los producen por hidrlisis cida o enzimtica. Esto es solo parcialmente cierto, pues en solucin acuosa, las estructuras de polihidroxialdehdos o de polihidroxicetonas, permanecen en pequea proporcin en equilibrio con sus formas cclicas, que son las ms abundantes CLASIFICACIN DE LOS LPIDOS Se clasifican como simples o complejos, la siguiente clasificacin de los lpidos ha sido modificado de la Bloor. 1 LPIDOS SIMPLES. Steres de cidos grasos con diversos alcoholes.
a) Grasas: steres de cidos grasos como glicerol. Una grasa en estado lquido se conoce como aceite.

b) CERAS. steres de cidos grasos con alcoholes monohidricos depeso molecular mas elevado.

2.- LPIDOS COMPLEJOS. steres de cidos grasos que contienen otro grupos qumicos adems de un alcohol y cido graso:
a) Fosfolipidos. Lpidos que contienen adems de cidos grasos y un alcohol un reciduo de cido fosfrico con frecuencia tiene bases nitrogenadas y otros sustituyentes. Glicerofosfolpidos. El alcohol es el glicerol Esfingofosfolpidos. El alcohol es la esfingosina

b) Glucolpidos (glucoesfingolpidos). esfingosina y carbohidratos

Lpidos

que

contiene

un

cido

graso,

c) Otros lpidos complejos: Lpidos como sulfolpidos y aminolpidos. Tambin las lipoprotenas pueden colocarse en esta categora.

3.- PRECURSORES Y DERIVADOS DE LOS LPIDOS. Incluyen cidos grasos, glicerol, esteroides, alcoholes, diferentes al glicerol y los esteroides, aldehdos de la grasas y cuerpos cetnicos, hidrocarburos, vitaminas liposolubles y hormonas. Devido a que no poseen carga elctrica los acilgliceroles (acilgliceridos) el colesterol y los steres de colesterilo son llamados lpidos neutros. 6 CULES SON LOS MONMEROS QUE CONFORMAN LAS PROTENAS Y LOS LPIDOS COMPLEJOS CON LA ESFINGOSINA? Los esfingolipidos contienen esfingosina, que es un amino -alcohol aliftico de cadena larga , pero no glicerol. La esfingo mielina tiene, adems del acido fosfrico y la colina, dos cadenas hidrocarbonadas largas, una de ellas apotada por una acido graso y la otra por la esfingisina las otras tres clases de esfingolipidos son los cerebrosidos, los globosidos y los gagliosidos que contienen diversos componentes glusidicos. 8. Da 4 ejemplos de diferentes procesos donde el pH tenga un papel principal para su regulacin.