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com/doc/5203044/Medios-de-Cultivo-y-Pruebas-Bioquimicas
http://www.danival.org/100%20biolomar/3600micromar/_madre_micromar.html
0802_Pruebas bioqumicas
Apartados de este ejercicio A. Introduccin B. Test de la catalasa C. Test de utilizacin de citrato D. Test de la coagulasa E. Test de la urea F. Test de fermentacin de carbohidratos G. Test de produccin de indol H. Test de la oxidasa
A. Introduccin
Los ensayos bioqumicos tradicionalmente utilizados( las llamadas pruebas bioqumicas convencionales), generalmente determinan la actividad de una va metablica de la bacteria (conjunto de reacciones qumicas) a partir de un sustrato que se incorpora en un medio de cultivo y que la bacteria al crecer transforma o no. Obviamente, en la identificacin bacteriana hay que partir de un cultivo puro obtenido en el aislamiento, subcultivando de una colonia bien aislada. Es aconsejable realizar un comprobacin efectuando una siembra en placa en la que crezcan nicamente colonias del mismo tipo.
B. Test de la catalasa
Se utiliza este test para identificar microorganismos que producen la enzima catalasa. El perxido de hidrgeno es una molcula altamente reactiva que provoca daos en los componentes celulares, puede producirse en los microorganismos por diferentes vas. Los organismos que producen la enzima catalasa son capaces de romper el perxido de hidrgeno en agua y oxgeno gas.
Reaccin:
2H2O2
Catalasa
2H2O + O2 (gas)
El test de la catalasa se lleva a cabo de la siguiente forma: Se siembra en una placa el microorganismo que queremos analizar. Se aade una gota de agua oxigenada (perxido de hidrgeno) al 3% y se observa el resultado de la reaccin.
Citrasa
El test del citrato se lleva a cabo utilizando el "agar citrato de Simmons": El test del citrato se lleva a cabo de la siguiente forma: Se siembra con asa en un tubo con "agar citrato de Simmons". Se incuban los tubos durante 24 horas y se hace la lectura del test. Este agar contiene citrato sdico como nica fuente de carbono y in amonio como nica fuente de nitrgeno. Adems contiene azul de bromotimol como indicador de pH. El agar citrato de Simmons es inicialmente de color verde, si el microorganismo es capaz de crecer en este medio y utilizar el citrato se producirn productos alcalinos. El azul de bromotimol por encima de pH 7,6 produce un viraje del medio a azul.
La reaccin es citrato positiva cuando se producen un cambio de color del medio a azul La ausencia de cambio de color se considera como resultado negativo.
D. Test de la coagulasa
Se utiliza para detectar la capacidad de un microorganismo para coagular el plasma. El test de la coagulasa en tubo utiliza como sustrato plasma tratado con anticoagulantes para evitar la coagulacin espontanea. Los organismos coagulasa positivos activan los mecanismos de coagulacin con la enzima coagulasa y esto produce una coagulacin del plasma. Procedimiento del test de la coagulasa: El test de la coagulasa se lleva a cabo de la siguiente forma: Se aade una suspensin densa de bacterias a un tubo con plasma tratado. Se incuban los tubos a 37C, se observa la coagulacin entre las 4 y las 24 horas.
E. Test de la urea
Se utiliza para diferenciar organismos capaces de hidrolizar la urea. La enzima responsable de esta hidrlisis es la ureasa. Este enzima hidroliza la urea (H2N-CO-NH2) y origina amonio, lo que producir un incremento del pH que puede detectarse con un indicador (rojo fenol). 2NH 3+ CO2
Urea
Ureasa
El test de la urea se lleva a cabo de la siguiente forma: Las bacterias se inoculan en un medio con glucosa-peptona y urea al 2%. e incuban los tubos a 37C, se observa el viraje de color del medio a las 24 horas. Como indicador de pH se utiliza rojo fenol el cual por encima de pH 8,4 vira de amarillo a rosa.
Cuando no se produce la hidrlisis de urea en el medio no se observa cambio de color. El resultado es negativo.
La reaccin es positiva cuando los tubos se vuelven de color amarillo (lo que indica una disminucin de pH por la produccin de cido) y se observa gas retenido en la campana Durham.
La reaccin es negativa cuando no se produce cambio de color del medio, ni se observa gas en la campana.
Triptfano
La presencia del indol se visualiza con reactivo de Kovacs, que provoca la formacin de un anillo rojo en el tubo: El test del indol se lleva a cabo de la siguiente forma: La bacteria se inocula en un medio lquido que contiene triptfano (caldo de triptona). Este se incuba durante 24 horas. Transcurrido el tiempo de incubacin, la presencia de indol se detecta aadiendo el reactivo de Kovacs (pdimetilaminobenzaldehdo). Al aadir unas gotas de reactivo de Kovacs (que es de color amarillo) este queda sobre la superficie del caldo de triptona (al ser menos denso el primero que el segundo) formando una especie de anillo. Si este anillo es de color rojo-morado la reaccin es positiva. Si este anillo es del color amarillo que inicialmente tiene el reactivo de Kovacs, es decir amarillo, quiere decir que la reaccin es negativa.
La reaccin es positiva cuando aparece en la superficie del medio lquido un anillo rojo-morado tras aadir el reactivo de Kovacs
H. Test de la oxidasa
Se usa para identificar bacterias que tienen la enzima citocromo oxidasa. La presencia de citocromo C oxidasa en la cadena de transporte de electrones puede detectarse utilizando un aceptor de electrones artificial (pfenilendiamina).
El test de la oxidasa se lleva a cabo de la siguiente forma: Se utiliza como reactivo p-fenilendiamina al 1% en agua. Con este reactivo se impregna un papel de filtro , posteriormente, con un asa que no sea de hierro (dara lugar a falsos positivos), se coge una colonia de un cultivo de 24 horas y se extiende sobre el papel de filtro. La lectura se hace inmediatamente.
A. Introduccin
El agar hierro de Kligler (KIA: Kligler Iron Agar) y el agar hierro triple azcar (TSI: Triple Sugar Iron) son dos medios slidos diferenciales que se preparan en tubo inclinado y que se utilizan principalmente para la diferenciacin de enterobacterias. En el mismo tubo se determinan simultneamente: a) la fermentacin y utilizacin de los hidratos de carbono, b) la produccin de cido sulfhdrico (sulfuro de hidrgeno), y c) la produccin de gas. KIA contiene 2 carbohidratos: 1,0% de lactosa y 0,1% de glucosa. El TSI es similar al KIA, la nica diferencia es la adiccin de un tercer carbohidrato, la sacarosa al 1,0 %. Ambos medios llevan un indicador del cambio de pH: el rojo fenol. Cuando el pH es neutro, como en el medio sin inocular, el indicador da un color rojo al medio de cultivo. Cuando el pH es cido vira al amarillo y a pH alcalino toma un color rojo mas intenso (rojo cereza). Como tienen una funcin bastante similar, en el resto del ejercicio nos referiremos nicamente al Kligler o KIA.
Glucosa + Galactosa C02 + H2O + energa cidos orgnicos aldehidos alcoholes CO2 + H2 energa
Glucosa
Embden-MeyerhofParnas
Algunos microorganismos pueden fermentar ambos hidratos de carbono (glucosa y lactosa). Otros fermentan solo la glucosa (lactosa negativos) y otros no fermentan ni la glucosa ni la lactosa. Fermentacin nicamente de la glucosa Estos microorganismos despus de 18-24 hora de incubacin muestran un Kligler con reaccin alcalina en la superficie inclinada y reaccin cida en el fondo del tubo (alcalino / cido). La superficie inclinada es alcalina, indicando una degradacin aerbica de la glucosa. Despus de 18-24 horas de incubacin, la baja concentracin de glucosa (0.1 %) se agota y el microorganismo inicia la utilizacin de las peptonas (presentes en el medio) para sus necesidades nutritivas. El catabolismo de las peptonas libera amonio que produce un pH alcalino y el rojo fenol toma una coloracin roja ms intensa (rojo cereza) en la superficie inclinada del tubo. Por el contrario, el fondo del tubo tiene un color amarillo (pH cido) a causa de la degradacin anaerbica de la glucosa. La glucosa en el fondo del tubo es tambien degradada en las 18-24 horas de incubacin. Los productos finales cidos producidos en la fermentacin anaerbica producen un pH cido y el indicador vira a amarillo. Este pH cido (color amarillo) se mantiene en el fondo del tubo por la estabilidad de los productos finales y por la baja tensin de oxgeno. Fermentacin de lactosa y glucosa Algunos microorganismos pueden fermentar ambos hidratos de carbono, produciendo un Kligler con reaccin
cida en la superficie del tubo y reaccin tambin cida en el fondo del tubo (cido / cido). La concentracin de lactosa (1.0 %) es diez veces mayor que la concentracin de la glucosa, por lo que no se agota al cabo de 18-24 horas y se mantiene el pH cido tanto en le fondo del tubo como en la superficie inclinada. Sin fermentacin de glucosa ni lactosa Ciertas bacterias, principalmente bacilos gram negativos no pertenecientes a la familia Enterobacteriaceae, no son capaces de fermentar ni la glucosa ni la lactosa. Dado que estas bacterias no pueden utilizar como nutrientes a estos carbohidratos, aprovechan las peptonas en el medio como nutrientes. Estos microorganismos pueden utilizar las peptonas tanto en condiciones aerbicas como anaerbicas. Una reaccin alcalina en la superficie inclinada y no cambio en el fondo del tubo indica un microorganismo capaz de metabolizar las peptonas nicamente en condiciones aerbicas, y por ello solamente se se produce un cambio de color (rojo cereza) en la superficie inclinada del tubo. Por el contrario, cuando el microorganismo es capaz de utilizar las peptonas tanto en condiciones aerbicas como anaerbicas se produce la alcalinidad tanto en la superficie inclinada como en el fondo del tubo. Cuando las peptonas son degradadas se produce un pH alcalino debido a la liberacin de amonio y el color del medio cambia a un rojo ms intenso (rojo cereza). aerobiosis Peptonas anaerobiosis amonio (NH3)
Por lo tanto, la reaccin de Kligler permite identificar cuatro patrones metablicos en las bacterias
1. 2. 3. 4.
alcalino / cido : nicamente utilizacin de la glucosa cido /cido : glucosa y lactosa utilizadas alcalino / alcalino : ni glucosa ni lactosa atacadas; peptonas utilizadas aerbica y anaerbicamente alcalino / no cambio : ni glucosa ni lactosa usadas; peptonas utilizadas nicamente en condiciones aerobias Glucosa y Lactosa cido / cido
Fermentacin Patrn de la reaccin Superficie inclinada / Fondo tubo Color Superficie inclinada / Fondo tubo
Glucosa slo
Alcalino / cido
Alcalino /Alcalino
Rojo / Amarillo
Amarillo / Amarillo
Rojo / Rojo
Rojo / Rojo Glucosa no fermentada Lactosa no fermentada Peptonas utilizadas en : aerobiosis nicamente
Glucosa no fermentada Lactosa no Glucosa fermentada fermentada Peptonas Lactosa fermentada utilizadas en : aerobiosis y anaerobiosis
Posibles resultados Sin inocular Fermentacin de glucosa slo Fermentacin de Lactosa y Glucosa Ni lactosa ni glucosa fermentada
No cambio/No cambio
Alcalino/cido
Alcalino/No cambio Pseudomonas aeruginosa Varias especies de: Acinetobacter Alcaligenes Ver listado completo
Algunas especies que pueden dar ese resultado. Ver listado completo
Escherichia coli Enterobacter aerogenes Citrobacter spp. Enterobacter cloacae Klebsiella oxytoca Enterobacter Ver listado completo
C. Produccin de gas
En los tubos de Kligler no slo se observa la fermentacin de la lactosa y la glucosa, sino tambin la produccin de gas (CO2 y O2) como producto final del metabolismo de los carbohidratos. Las bacterias productoras de gas se denominan aerognicas y se evidencian por la aparicin de burbujas, grietas en el medio, desplazamiento del fondo del tubo, etc Algunas imgenes con evidencia de la produccin de gas Fondo del tubo desplazando el medio hacia arriba Grietas o roturas del medio Burbujas en el medio Una simple burbuja de gas
D. Produccin de sulfhdrico
Otra caracterstica que se determina en el medio de Kligler es la produccin de cido sulfhdrico (sulfuro de hierro). El sulfuro de hierro generado reacciona con el hierro que contiene el medio (en forma de sales de hierro) formado sulfuro de hierro, insoluble y de color negro. El sulfuro de hierro se puede presentar como un precipitado negro en el fondo del tubo, como un ennegrecimiento de todo el fondo del tubo enmascarando la acidez, o como un anillo cerca de la superficie. Algunas imgenes con evidencia de produccin de sulfhdrico Precipitado negro en el fondo del tubo Ennegrecimiento de todo el fondo enmascarando acidez Anillo negro en parte superior del fondo
E. Tcnica de siembra
Toma de muestra de colonia aislada
Con el asa flameada y dejada enfriar, se toma la muestra de una colonia aislada
Sembrar la muestra de la colonia primero en el fondo del tubo, introduciendo el asa, por picadura, en el centro del tubo y hasta el fondo del mismo
Realizar adems, una estra recta, al salir sobre la superficie inclinada del medio
Incubacin a 37 C
cido / cido, gas cido / cido, H2S Alcalino / cido Alcalino / cido, gas Alcalino / cido, gas, H2S Alcalino / cido, H2S Alcalino / alcalino Alcalino / no cambio No ca
A / A, gas - A / A, G A / A, H2S Alc / A - K / A Alc / A, gas - K / A, G Alc / A, gas, H2S - K / A, G, H2S Alc / A, H2S - K / A, H2S Alc / Alc - K / K Alc / no cambio - K / NC
Utilizacin de lactosa y glucosa, produccin de gas Utilizacin de lactosa y glucosa, produccin de sulfhdrico Utilizacin de glucosa Utilizacin de glucosa, produccin de gas Utilizacin de glucosa, produccin de gas, produccin de sulfhdrico Utilizacin de glucosa, produccin de sulfhdrico Ni lactosa ni glucosa fermentada; utilizacin de peptonas Ni lactosa ni glucosa fermentada; utilizacin de peptonas en aerobiosis
fermentacin/oxidacin de sorbitol fermentacin/oxidacin de ramnosa fermentacin/oxidacin de sacarosa fermentacin/oxidacin de melobiosa fermentacin/oxidacin de amigdalina fermentacin/oxidacin de arabinosa citocromo oxidasa
azul o verde azul o verde azul o verde azul o verde azul o verde azul o verde
Tomar una colonia bien aislada de cada microorganismo y resuspenderla homogneamente en 5 mL de solucin salina (1% de NaCl) o 5 mL de agua estril.
Siembra de la galera API Cada pocillo tiene un tubo y una cpula (parte aerobia).
Llenar con la suspensin de bacterias los tubos, no la cpula, de todos los pocillos.
Llenar la cpula de los pocillos CIT , VP, GEL con la suspensin de bacterias.
Llenar con parafina las cpulas de los pocillos ADH, LDC, ODC, URE, H2S para obtener anaerobiosis.
Poner la tira en su propia cmara hmeda de incubacin. Previamente poner agua en los alvolos de la cmara para proporcionar una atmsfera hmeda durante la incubacin.
Incubacin en estufa
La lectura de los resultados se lleva a cabo por comparacin de los colores de cada pocillo con los de las tablas de lectura. Ver tabla de lectura (colores en imagen) en otra pantalla Ver tabla de lectura (colores en texto) en otra pantalla Y anotando el resultado como positivo o negativo
Revelado de pruebas que requieren reactivos (Ver vdeo revelado y lectura API20E) Para la lectura se tienen en cuenta los siguientes criterios:
Si la glucosa da negativo y los tests positivos son 2 o menos de 2, no hay que aadir reactivos. Cuando sto ocurre se hacen otros tipos de API como el API 20NE, API OF, el API M o el API 10S para ver determinados metabolismos especiales. Si la glucosa es positiva y/o 3 o ms tests son positivos se revelan los test que requieren reactivos:
TDA
Aadir una gota de FeCl3 10 %. Positivo = color marrn oscuro.
VP
Aadir una gota del reactivo 1 (KOH al 40%) y una gota del reactivo 2 (C2 H5 OH). Positivo = color rosa fuerte o rojo en 5-10 minutos.
IND
Aadir una gota de reactivo de Kovacs (1) o de Dimetilamino-cinamaldehido (2). Dependiendo del reactivo utilizado pueden darse las posibilidades siguientes: (1)Positivo = aparece un anillo rosarojo (2)Positivo =color de rosa a morado en todo el pocillo
Oxidasa Aadir una gota del reactivo (tetrafenilendiamina) recin preparado. Positivo = color azul que aparece inmediatamente
La lectura de los resultados se lleva a cabo por comparacin de los colores de cada pocillo con los de las tablas de lectura. Ver tabla de lectura (colores en imagen) en otra pantalla Ver tabla de lectura (colores en texto) en otra pantalla Y anotando el resultado como positivo o negativo
Perfil numrico e identificacin Del conjunto de reacciones y resultados se obtiene un perfil numrico de 7 cifras. Los pocillos estn separados en grupos de tres: en total tenemos 7 grupos de tres tubos o tripletes (el test nmero 21 corresponde al test de la oxidasa). A cada pocillo se le da el valor 0, 1, 2 o 4. o Si la reaccin es negativa se pone 0. o Si la reaccin es positiva se pone: 1 si es el primer pocillo de un triplete, 2 si es el segundo, 4 si es el tercero. o Se suman los valores de cada triplete y se obtiene un cdigo de 7 cifras. o Con este cdigo se busca en la tabla de identificacin la especie de que se trata.