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ED BIOCHIMIE 2010-2011 Acides AminsPeptides-Protines Mthodes dtude Proprits structurales des AA QCM N1 (Concours 2009-2010) Concernant la polarit des

molcules, indiquer la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A. La molcule deau est trs apolaire. B. La polarit des molcules est influence par la prsence de certains groupements chimiques sur les molcules. C. La prsence dune fonction alcool amliore la solubilit dans les lipides. D. La solubilit dans leau dun peptide sera favorise si les chanes latrales des acides amins de ce peptide sont trs polaires. E. Lisoleucine a une chane latrale plus polaire que celle de la thronine. QCM N2 Concernant la chane latrale des acides amins, indiquer la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A. Elle nest jamais charge pH physiologique. B. Elle ne contient pas dautres atomes que C, H, O et N. C. Elle ne joue aucun rle dans la protine. D. Elle permet de classer les acides amins. E. Elle est toujours de nature aliphatique. QCM N3 Concernant les acides amins, indiquez la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A. La chane latrale de la srine est plus polaire que celle de la valine. B. Larginine et lisoleucine prsentent une chane latrale ionise au pH physiologique. C. La phnylalanine et le tryptophane prsentent une chane latrale avec un noyau aromatique. D. La glycine ne possde pas de caractre amphotre. E. La glycine est le seul acide amin de la srie L ne prsentant pas de carbone asymtrique. QCM N4 (Concours 2009-2010) Concernant la chane latrale des acides amins, indiquer la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A. Quelle que soit lacide amin, elle intervient dans la formation de liaisons covalentes. B. Elle influence la conformation spatiale des protines. C. Elle est similaire pour tous les acides amins. D. Elle influence les proprits acido-basiques de tous les acides amins. E. La chane latrale des acides amins aromatiques participe aux interactions hydrophobes. 1/13

QCM N5 Donner la (ou les) bonne(s) rponse(s) concernant les acides amins : A. Une augmentation de certains acides amins peut tre observe dans certaines maladies. B. Certains acides amins sont des prcurseurs de neurotransmetteurs. C. La leucine est un acide amin aromatique. D. Certains acides amins peuvent subir une raction de dcarboxylation. E. La chane latrale de certains acides amins peut tre modifie chimiquement. QCM N6 Indiquer la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : Parmi les acides amins suivants, quels sont ceux dont la chane latrale est susceptible dtre phosphoryle dans la structure des peptides et protines : A. B. C. D. E. Leucine Srine Phnylalanine Thronine Tyrosine

Proprits acido-basiques des AA QCM N7 Soit le graphique ci-dessous reprsentant la variation des espces chimiques de lalanine (Courbes A, B et C) en fonction du pH. Indiquez la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A. Le trac B reprsente la fraction de forme zwitterion prsente en solution B. Pour lalanine, la seule valeur de pKa est de 2,35. C. Quelle que soit la valeur de pH, on retrouve la forme zwitterion en solution. D. Le point isolectrique est de 9,87 E. le pHi peut tre calcul partir de la (les) valeur(s) de pKa retrouve(s) graphiquement

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O-

pH

QCM N8 Concernant l'acide amin X, on donne pKa1 = 2 pKa2 = 9 et pKa3 chane latrale = 12,5. Indiquez la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A. La forme zwitterion de X est majoritaire un pH = 5,5. B. Le point isolectrique (pHi) calcul pour X est de 7,25. C. Le pHi calcul pour X est de 10,75. D. A pH = 10, X est essentiellement sous forme de cation. E. Le pHi reprsente la valeur de pH pour laquelle X nest pas charg.

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QCM N9 On dispose dun mlange de 4 acides amins appartenant la liste suivante : Glu, His, Val, Arg. Valeurs des diffrents pK Glu pKa1=2,2 pKa2=9,9 pKa3=4,4 Ala pKa1=2,3 pKa2=9,7 Arg pKa1=2,2 pKa2=9,4 pKa3=12,5 Asp pKa1=2 pKa2=10 pKa3=3,9

Indiquez la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A/ Une lectrophorse pH=7 permet de sparer les 4 acides amins B/ Une lectrophorse pH=3 permet de sparer les 4 acides amins C/ On peut identifier les 4 acides amins du mlange au moyen de deux lectrophorses pH=3 et pH=7. D/ La sparation lectrophortique dpend du pHi des acides amins et du pH impos. E/ Aucune rponse bonne. Mthodes dtudes QCM N10 Indiquez la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : Les techniques permettant la sparation des acides amins en solution sont : A/ Llectrophorse B/ Lultracentrifugation C/ La chromatographie liquide D/ Llectrophorse capillaire E/ La chromatographie dchange dions QCM N11 Soit un mlange de 3 oligopeptides 1/ Phe-Gly-Leu-Lys 2/ Val-Ile-Thr-Asp 3/ AlaGly-Trp-Ser Indiquez la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A/ En utilisant un pH appropri, les trois polypeptides pourront tre spars par lectrophorse. B/ Aucune sparation du mlange ne pourra avoir lieu quelle que soit la valeur du pH impos au cours de llectrophorse. C/ A pH trs acide, seuls deux polypeptides migrent vers la cathode. D/ Les trois peptides migrent vers lanode pH trs basique. E/ La chromatographie dexclusion est une technique approprie pour la sparation du mlange.

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QCM N12 Indiquez la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes. Quel(les) est(sont) la (les) mthode(s) pouvant tre utilises pour la dtermination de la squence en acides amins de polypeptides : A/ Une mthode utilisant un ractif permettant la formation de phnylthiohydantones, suivie dune sparation chromatographique B/ Une hydrolyse acide suivie dune sparation chromatographique du mlange C/ Un traitement par la trypsine suivi dune sparation lectrophortique des diffrents fragments obtenus D/ Un traitement par la trypsine suivi dune sparation chromatographique des diffrents fragments obtenus et analyse par spectromtrie de masse E/ La mthode du biuret QCM N13 Le compos peptidique A comporte huit acides amins mais lhydrolyse acide totale ne permet didentifier que six acides amins diffrents. Laction du -mercaptothanol sur le compos A libre un hexapeptide B et un dipeptide C. Laction de courte dure dune carboxypeptidase libre Ile sur le peptide B. Laction du ractif dEdman sur le peptide B libre le PTH-Asp. Une analyse par spectromtrie de masse nous indique quun acide amin basique est situ du ct carboxyterminal du dipeptide C. Lhydrolyse trypsique sur le peptide B libre un ttrapeptide dont la composition suit (Lys, X, Asp, Trp) et un dipeptide. Le dernier acide amin encore inconnu X est dpourvu de pouvoir rotatoire. Indiquez la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A/ La squence du peptide B est : Ile-Gly-Trp-Lys-Cys-Asp B/ La squence du peptide B est : Asp-Cys-Trp-Lys-Gly-Ile C/ La squence du peptide B est : Asp-Gly-Trp-Lys-Cys-Ile D/ La squence du peptide C est : Cys-Cys E/ La squence du peptide C est : Arg-Cys QCM N14 Un pentapeptide peut tre dfini au moyen des quatre critres suivants : 1) 2) 3) 4) Hydrolyse/HCl = 3 spots en chromatographie couche mince Hydrolyse trypsique = 3 spots en chromatographie couche mince Electrophorse pH 6 = migration vers la cathode Absorption UV 280 nm

Lequel (ou lesquels) de ces peptides rpond(ent) tous ces critres ? Indiquez la ou les bonnes rponses parmi les propositions suivantes : A/ Ala-Asp-Arg-Asp-Gly B/ Arg-Ala-Arg-Ala-Phe C/ Asp-Lys-Asp-Ala-Lys D/ Glu-Lys-Trp-Lys-Val E/ Glu-Asp-Ala-Asp-Val

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Proprits biologiques des AA et peptides QCM N15 (Concours 2009-2010) Parmi les molcules biologiques importantes ci-dessous, laquelle ou lesquelles provient(nent) du mtabolisme de certains acides amins : A. B. C. D. E. Srotonine. Dopamine. Cholestrol. Adrnaline. Hormones strodiennes.

QCM N16 Indiquez la ou les bonnes rponses parmi les propositions suivantes : A/ Les polypeptides prsents dans lorganisme nont aucun rle physiologique. B/ Certains polypeptides sont des hormones. C/ Les polypeptides sont des molcules non charges au pH physiologique. D/ Les polypeptides sont liposolubles. E/ Certains polypeptides peuvent se fixer un rcepteur membranaire. QCM N17 Concernant le glutathion, indiquez la ou les bonnes rponses parmi les propositions suivantes : A/ Le glutathion est un tripeptide. B/ Le glutathion joue le rle danti-oxydant. C/ Le rle anti-oxydant fait intervenir une fonction thiol D/ Le glutathion permet de neutraliser les espces chimiques de type peroxyde. E/ Dautres molcules possdent galement des proprits anti-oxydantes QCM N18 Concernant linsuline, indiquez la ou les bonnes rponses parmi les propositions suivantes : A/ Linsuline est une hormone strode. B/ Linsuline est constitue de deux chanes polypeptidiques relies par des ponts disulfure. C/ La formation de linsuline fait intervenir une hydrolyse chimique. D/ Un petit peptide est libr au cours de la synthse de linsuline. E/ Linsuline est initialement synthtise sous la forme dune prohormone.

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Structure des peptides et protines QCM N19 (Concours 2009-2010) Concernant les protines, indiquer la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A. Labsorption par les protines de la lumire dans lultra-violet dpend de la prsence dacides amins aromatiques. B. Les structures primaires des protines sont identiques dune protine une autre. C. Le maintien de la structure primaire dpend de la prsence de nombreuses liaisons hydrogne. D. La structure quaternaire des immunoglobulines est maintenue par des liaisons covalentes. E. Les domaines transmembranaires des rcepteurs coupls aux protines G sont constitus dhlices . QCM N20 Les structures secondaire et tertiaire des protines mettent en jeu diffrents types de liaisons non covalentes : A. Des interactions de type hydrophobe B. Des ponts disulfure C. Des interactions mettant en jeu des groupements chargs D. Des interactions de faible distance inter-atomiques E. Des interactions perturbes par la prsence dure forte concentration F. Des interactions entre des rsidus dacides amins prsentant une chane latrale aliphatique QCM N21 (Concours 2009-2010) Concernant les structures protiques, indiquer la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A. Lhlice est constitue de 3 acides amins par tour. B. Lhlice de collagne est une hlice droite. C. Lhlice est une hlice droite. D. La structure du tropocollagne nest pas maintenue par des liaisons hydrogne. E. La structure secondaire en hlice est maintenue par des liaisons hydrogne intracatnaires.

Q N22 Des mesures de rsonance magntique nuclaire (RMN) ont montr que la poly-L-lysine est sous forme de pelote statistique (random coil) pH 7, mais adopte une conformation en hlice pH > 10. Quelle explication peut-on donner ce phnomne ? Quelle prdiction feriez-vous quant linfluence du pH sur la conformation de lacide poly-Lglutamique ?

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Q N23 Considrons un segment de chane polypeptidique capable de se replier pour former une hlice . Du point de vue thermodynamique, ce segment aura-t-il une probabilit plus leve de se replier en hlice sil est expos entirement au milieu aqueux, ou sil est entirement enfoui dans lintrieur hydrophobe de la protine ? Expliquez.

QCM N24 (Concours 2009-2010) Concernant les modifications post-traductionnelles des protines, indiquer la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A. B. C. D. E. Elles peuvent modifier lactivit des protines enzymatiques. Elles peuvent influencer la localisation intracellulaire des protines. Elles peuvent modifier la structure tridimensionnelle dune protine. La carboxylation est un exemple de modification post-traductionnelle. Ces modifications post-traductionnelles nont aucun rle.

Mthodes dtudes des protines QCM N25 Parmi les propositions suivantes concernant les techniques de sparation des protines, indiquer la(les) bonne(s) rponse(s) : A. La technique par gel filtration permet la sparation des protines sur la base de leurs poids molculaires B. Lisolectrofocalisation permet la sparation des protines sur la base de leurs points isolectriques C. La chromatographie daffinit permet la sparation des protines en fonction de leur capacit fixer un ligand D. La chromatographie changeuse de cations utilise un support charg positivement E. Toutes les techniques de sparation des protines cites dans les propositions A,B, C et D sont dnaturantes

QCM N26 (Concours 2009-2010) Concernant llectrophorse non dnaturante des protines sur gel dagarose pH=8, indiquer la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A. Les protines sont spares en fonction de leur taille. B. La sparation des protines dpend de la charge nette. C. Le remplacement dun acide amin neutre ou basique par un acide amin acide dans une protine peut modifier la migration lectrophortique. D. Les protines sont majoritairement charges positivement pH=8. E. Elle permet la sparation de diffrentes fractions protiques partir du srum.

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QCM N27 On ralise une lectrophorse en gel de polyacrylamide en prsence de dodcyl sulfate de sodium (SDS) et dure 8M aprs traitement par le Beta-mercaptoethanol pour deux chantillons A et B. On utilise un mlange de protines de masses molculaires connues (Etalon) comme rfrence. Le gel est ensuite color avec du bleu de Coomassie. Cela nous donne les rsultats suivants :

A.La protine A peut tre monomrique. B.Ce type de rsultat pour A peut tre obtenu avec lhmoglobine. C.Les sous-units de B sont diffrentes. D.Le poids molculaire estim de B est de 140 KDa. E.Pour B, une autre exprience peut tre ncessaire pour prciser la prsence de ponts disulfure.

QCM N28 (Concours 2009-2010) La glucokinase est un enzyme de masse molculaire de 50 kDa. Certaines mutations peuvent aboutir la synthse de formes tronques moins actives, voire inactives de la glucokinase. Les protines issues dun extrait cellulaire dun sujet sain (T) et dun sujet malade (P) sont tout dabord spares au moyen dune lectrophorse sur un gel de polyacrylamide en prsence de dodcyl-sulfate de sodium. On utilise un mlange de protines de masses molculaires connues (M) comme rfrence. Aprs un transfert sur une membrane, la glucokinase est mise en vidence par immunoblot au moyen de lanticorps 1, qui reconnat la rgion amino-terminale de la protine, et de lanticorps 2, qui reconnat la rgion carboxyterminale de la glucokinase. Les rsultats sont prsents sur la figure ci-dessous.

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Parmi les propositions suivantes, indiquer la (les) bonne(s) rponse(s) : A. Le patient P exprime une forme tronque de la glucokinase. B. La glucokinase est constitue de 2 sous-units. C. Pour le sujet malade (P), aucune protine nest dtecte avec lanticorps 2 car la partie carboxy-terminale de lenzyme est absente. D. Les diffrences de migration observes sont lies des diffrences de charges des protines. E. La technique dimmunoblot permet didentifier spcifiquement une protine donne. QCM N29 (concours 2008-2009) On souhaite purifier la pyruvate carboxylase partir dun extrait mitochondrial. La pyruvate carboxylase est une enzyme constitue de 4 sous-units de 130 kDa chacune. La chromatographie dexclusion en conditions non dnaturantes permet dobtenir diffrentes fractions partir de lchantillon. Le systme chromatographique est talonn par lutilisation dun mlange de 4 protines de masses molculaires connues (25, 50 100 et 200 kDa). Les fractions spares sont dtectes par absorption dans les ultra-violets (rsultats exprims sous forme de densit optique). Quatre pics sont observs pour la gamme dtalonnage avec des volumes dlution de 2, 4, 8 et 16 millilitres ; les rsultats sont prsents sur la figure A ci-dessous. Le rsultat chromatographique obtenu pour lextrait mitochondrial est prsent sur la figure B ci-dessous. Trois fractions X, Y et Z sont rcoltes.

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Parmi les propositions suivantes, indiquer la(les) bonne(s) rponse(s): A. B. C. D. E. Lactivit enzymatique de la pyruvate carboxylase sera retrouve dans la fraction X Lactivit enzymatique de la pyruvate carboxylase sera retrouve dans la fraction Y Lactivit enzymatique de la pyruvate carboxylase sera retrouve dans la fraction Z Aucune fraction ne possde lactivit pyruvate carboxylase Si au pralable lextrait mitochondrial est dnatur par le dodcyl-sulfate de sodium, lure et le -mercapto-thanol, lactivit de la pyruvate carboxylase sera retrouve dans la fraction Y

Aspect physiologiques et physiopathologiques. QCM N30 Concernant les protines : A. Le collagne constitue la protine la plus abondante du corps humain B. Certaines protines sont connues pour jouer un rle de transport dans le sang C. De nombreuses protines sont la cible de mdicaments D. Le collagne est riche en glycine, proline et hydroxyproline E. Certaines protines sont insres dans la membrane plasmique QCM N31 (Concours 2009-2010) Concernant la drpanocytose, indiquer la (ou les) bonne(s) rponse(s) parmi les propositions suivantes : A. Cette maladie est lie lexpression dune hmoglobine anormale. B. Cette maladie est lie une mutation sur la chane de lhmoglobine. C. Cette maladie est lie une mutation sur la chane de lhmoglobine. D. En condition dhypoxie, lhmoglobine anormale se polymrise. E. En condition dhypoxie, les sous-units de lhmoglobine anormale se dissocient.

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QCM N32 Concernant lhmoglobine, quelles sont les propositions vraies ? A Labaissement du pH diminue la libration de loxygne par lhmoglobine. B- Lhmoglobine ftale possde deux sous-units alpha et deux sous-units gamma. C- la myoglobine a moins daffinit pour loxygne que lhmoglobine dans des conditions de pH, pCO2 et pO2 physiologiques. D Une concentration leve de 2,3-bisphosphoglycrate dans les globules rouges diminue la capture de loxygne. E- la diffrence daffinit pour la fixation de lO2 entre hmoglobine et myoglobine est due une fixation diffrente de lhme sur le site actif de chaque protine. F Une augmentation de la pression partielle en monoxyde de carbone entrane une diminution de la capacit de lhmoglobine fixer loxygne. G - la rduction du fer ferrique ltat ferreux empche la fixation de loxygne. QCM N33 Voici 3 courbes prsentant la saturation en oxygne de lhmoglobine.

Parmi les propositions suivantes, indiquer la (les) bonne(s) rponse(s) : A. La courbe (a) peut reprsenter la saturation en oxygne de lhmoglobine A en labsence de 2,3-bisphosphoglycrate B. La courbe (a) peut reprsenter la saturation en oxygne de lhmoglobine A en prsence dure . C. Si la courbe (b) reprsente la saturation en oxygne de lhmoglobine A, alors la courbe (c) peut reprsenter la saturation en oxygne de lhmoglobine F D. Si la courbe (c) reprsente la saturation en oxygne de lhmoglobine A, alors la courbe (b) peut reprsenter la saturation en oxygne de lhmoglobine F E. Si la courbe (b) reprsente la saturation en oxygne de lhmoglobine A, le dplacement de la courbe (b) vers la courbe (c) est observ lors dune augmentation de pH

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QCM N34 Concernant la figure reprsente ci dessous :

Parmi les propositions suivantes, indiquez la(l)es bonne(s) rponse(s) : A. Il peut sagir dun rsultat dune lectrophorse des protines sriques B. La technique utilise permet de sparer lalbumine des autres protines C. Diffrentes fractions protiques peuvent tre spares dont certaines sont augmentes en cas de syndrome inflammatoire D. La fraction la plus importante reprsente les immunoglobulines E. Chaque fraction nest constitue que dun seul type de protine

QCM N35 Parmi les propositions suivantes concernant la structure des immunoglobulines, indiquer la(les) bonne(s) rponse(s) : A. La structure de base dune immunoglobuline est un ttramre compos de quatre chanes polypeptidiques identiques deux deux B. Seules les chanes H prsentent des rgions constantes C. Les chanes L et H sont relies entre elles par des ponts disulfure D. Les chanes H possdent des rsidus glucidiques E. La spcificit de reconnaissance dun antigne par une immunoglobuline est lie la prsence de domaines variables sur les chanes H et L

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