Cromatina

Diferentes niveles de condensacin de ADN. (1) Hebra simple de ADN. (2) Hebra de cromatina (ADN con histonas, "cuenta de collar"). (3) Cromatina durante la interfase concentrmero. (4) Cromatina condensada durante la profase(Dos copias de ADN estn presentes). (5) Cromosomadurante la metafase.

La cromatina es el conjunto de ADN, histonas y protenas no histnicas que se encuentra en el ncleo de las clulas eucariotas y que constituye el cromosoma de dichas clulas. Las unidades bsicas de la cromatina son los nucleosomas. Estos se encuentran formados por aproximadamente 146 pares de basesde longitud (el nmero depende del organismo), asociados a un complejo especfico de 8 histonas nucleosmicas (octmero de histonas). Cada partcula tiene una forma de disco, con un dimetro de 11 nm y contiene dos copias de cada una de las 4 histonas H3, H4, H2A y H2B. Este octmero forma un ncleo proteico alrededor del que se enrolla la hlice de ADN (da aproximadamente 1,8 vueltas). Entre cada una de las asociaciones de ADN e histonas existe un ADN libre llamado ADN "espaciador", de longitud variable entre 0 y 80 pares de nucletidos que garantiza flexibilidad a la fibra de cromatina. Este tipo de organizacin, permite un primer paso de compactacin del material gentico, y da lugar a una estructura parecida a un "collar de cuentas". Posteriormente, un segundo nivel de organizacin de orden superior lo constituye la "fibra de 30nm" compuestas por grupos de nucleosomas empaquetados uno sobre otros adoptando disposiciones regulares gracias a la accin de la histona H1. Finalmente contina el incremento del empaquetamiento del ADN hasta obtener los cromosomas que observamos en la metafase, el cual es el mximo nivel de condensacin del ADN.

Tipos de cromatina
La cromatina se puede encontrar en 2 formas Heterocromatina, es una forma inactiva condensada localizada sobre todo en la periferia del ncleo, que se tie fuertemente con las coloraciones. En 1928 Emil HEITZ, basndose en observaciones histolgicas, defini la heterocromatina (HC) como los segmentos

cromosmicos que aparecan muy condensados y oscuros en el ncleo en interfase. De hecho, la cromatina est formada de una maraa de fibras cuyo dimetro no solo vara durante el ciclo celular sino que tambin depende de la regin del cromosoma observada. La eucromatina activa est formada por una fibra de un dimetro que corresponde al del nucleosoma, que es un segmento de ADN bicatenario enrollado alrededor de homodmeros de las histonas H2A, H2B, H3, y H4. En la eucromatina inactiva, esta fibra se enrolla sobre s misma gracias a las histonas H1 para formar el solenoide. La interaccin con otras protenas no histonas (topoisomerasa II, protenas de andamiaje, lamininas, ) provoca mayores grados de organizacin. En cuanto a la heterocromatina, la fibra que la constituye se encuentra ms condensada y a menudo aparece formada por agregados. Su formacin require numerosas protenas adicionales, que incluyen las protenas HP1 (Heterochromatin Protein 1 o protena de la heterocromatina1). La heterocromatina puede ser de dos tipos diferentes,la riqueza en ADN satlite determina tanto la naturaleza permanente o reversible de la heterocromatina, como su polimorfismo y propiedades de tincin.: la constitutiva, idntica para todas las clulas del organismo y que carece de informacin gentica, incluye a los telmeros y centrmeros del cromosoma que no expresan su ADN. La heterocromatina constitutiva contiene un tipo particular de ADN denominado ADN satlite, formado por gran nmero de secuencias cortas repetidas en tndem. Los tipos principales de este ADN son el ADN satlite alfa, y los ADN satlite I, II y III. Estas secuencias de ADN satlite son capaces de plegarse sobre s mismas y pueden tener un papel importante en la formacin de la estructura altamente compacta de la heterocromatina constitutiva. La heterocromatina constitutiva es estable y conserva sus propiedades heterocromticas durante todas las etapas del desarrollo y en todos los tejidos. La heterocromatina constitutiva es altamente polimrfica, probablemente debido a la inestabilidad del ADN satlite. Este polimorfismos puede afectar, no solamente a su tamao sino tambin a la localizacin de la heterocromatina, y aparentemente no tiene un efecto fenotpico. La heterocromatina constitutiva se encuentra fuertemente teida en la tcnica de bandas C, lo que es el resultado de una renaturalizacin muy rpida del ADN satlite tras la desnaturalizacin. la facultativa, diferente en los distintos tipos celulares, contiene informacin sobre todos aquellos genes que no se expresan o que pueden expresarse en algn momento. Incluye al ADN satlite y al corpsculo de Barr. La heterocromatina facultativa se caracteriza por la presencia de secuencias repetidas tipo LINE. Estas secuencias, dispersas a lo largo del genoma, podran promover la propagacin de una estructura de cromatina condensada. La heterocromatina facultativa es reversible, su

estado heterocromtico depende de la etapa del desarrollo y del tipo celular. Dos ejemplos de este tipo de heterocromatina son el cromosoma X inactivo (cuerpo de Barr) de las clulas somticas femeninas y la vescula sexual inactiva en la etapa del paquiteno de las meiosis masculinas. La heterocromatina facultativa no es particularmente rica en ADN satlite, y por ello, no es polimrfica. La heterocromatina facultativa no se encuentra nunca teida en la tcnica de bandas C. Se ha visto que en la formacin de heterocromatina frecuentemente participa el fenmeno de ARN interferente. Por ejemplo, en Schizosaccharomyces pombe, la heterocromatina se 1 forma en el centrmero, telmeros y en el loci mating-type. La formacin de la heterocromatina en el centrmero depende del mecanismo de ARN interferente (ARNi). ARN doble cadena complementarios son producidos de secuencias repetidas localizadas en el centrmero, que inducen ARNi y seguidamente metilacin de la lisina 9 histona 3 y enlazamiento de Swi6 (protena estructural de la heterocromatina, la cual es homloga 2 a HP1 en mamferos). Propiedades de la heterocromatina A pesar de las diferencias descritas anteriormente, la heterocromatina constitutiva y la heterocromatina facultativa tienen propiedades muy similares. 1. La heterocromatina est condensada. Este es, de hecho, lo que define la heterocromatina, y por ello es aplicable tanto a la heterocromatina constitutiva como a la facultativa. Esta elevada condensacin la hace fuertemente cromoflica e inaccesible a la DNAsa I y, en general, a otras enzimas de restriccin. 2. El ADN de la heterocromatina se replica ms tarde.

La incorporacin de varios anlogos de nucletidos muestra que el ADN de ambos tipos de heterocromatina se replica tarde. Esto es el resultado, por un lado, de su elevado grado de condensacin, que evita que la maquinaria replicativa accede fcilmente al ADN y, por otro lado, de su localizacin en un dominio nuclear perifrico pobre en elementos activos. 3. El ADN de la heterocromatina se encuentra metilado. El ADN de la heterocromatina constitutiva se encuentra altamente metilado en las citosinas. Por ello, un anticuerpo anti-5-metil citosina marca fuertemente todas las regiones de este tipo de heterocromatina. Por lo que se refiere a la heterocromatina facultativa, la metilacin de su ADN es menor, aunque los anlisis mediante enzimas de restriccin sensibles a metilacin revelan una importante metilacin de los islotes CpG, especficamente localizados en las regiones que controlan la expresin de los genes.

4. En la heterocromatina las histonas se encuentran hipoacetiladas. Las histonas puede sufrir una serie de modificaciones post-traduccionales en sus extremos N-terminales que pueden afectar a la propia actividad gentica de la cromatina.

La hipoacetilacin de las colas N-terminales de las histonas, principalmente en las lisinas, estn asociadas con la cromatina inactiva. Por el contrario, las histonas hiperacetiladas son caractersticas de la cromatina activa. La acetilacin/desacetilacin de histonas es un mecanismos absolutamente esencial para el control de la expresin gnica. Existen numerosos factores de transcripcin que presentan una actividad acetiltransferasa de histonas (HAT, Histone Acetyl Transferase) o desacetilasa de histonas (HDAc o Histone De-Acetylase).

5. Las histonas de la heterocromatina se encuentran metiladas en la lisina 9. La metilacin de la lisina 9 de la histona H3 (H3-K9) parece que est muy relacionada con el proceso de heterocromatinizacin del genoma, tanto en la formacin de heterocromatina constitutiva como facultativa. 6. La heterocromatina es transcripcionalmente inactiva. A diferencia de lo que ocurre en Drosophila, la heterocromatina constitutiva humana no contiene genes y la incorporacin de uridina tritiada en los cultivos celulares no producen ningn tipo de marcaje a este nivel. La heterocromatina facultativa es relativamente pobre en genes, y stos generalmente no se transcriben en el estado de heterocromatina.

7. La heterocromatina no participa en la recombinacin gentica. De modo general se acepta que la heterocromatina constitutiva no participa en la recombinacin gentica. La no existencia de un emparejamiento preliminar de las regiones heterocromatnicas homlogas se podra deber al polimorfismo caracterstico de estas regiones que lo dificultaran, aunque no lo haran imposible. La heterocromatina constitutiva tambin acta reprimiendo la recombinacin en la regiones de eucromatina adyacentes.Por lo que respecta a la heterocromatina facultativa, tampoco participa en la recombinacin meitica cuando se encuentra en su forma inactiva.

Funciones de la heterocromatina Durante mucho tiempo el papel concreto de la heterocromatina ha sido un misterio, ya que su polimorfismo no pareca tener ningn efecto funcional o fenotpico. 1. Papel de la heterocromatina en la organizacin de los dominios nucleares. La heterocromatina y la eucromatina ocupan dominios nucleares distintos. La heterocromatina se localiza generalmente en la periferia del ncleo anclada a la membrana nuclear. Por el contrario, la cromatina activa se localiza en una posicin ms central. La localizacin preferencial de la heterocromatina contra la membrana nuclear puede deberse a la interaccin de la protena HP1 con el receptor de la lmina B, componente de la membrana interna del ncleo. La localizacin perifrica de la heterocromatina concentra los elementos activos en la porcin central del ncleo, permitiendo que eucromatina activa se replique y transcriba con una eficiencia mxima.

2. Papel de la heterocromatina en la funcin del centrmero. En la mayor parte de eucariotas, los centrmeros se encuentran rodeados de una considerable masa de heterocromatina. Se ha sugerido que la heterocromatina centromrica sera necesaria para la cohesin de las cromtidas hermanas y que permitira la disyuncin normal de los cromosomas mitticos. En la levadura Schizosaccharomyces pombe, el homlogo Swi6 de la protena HP1 es absolutamente esencial para la cohesin eficiente de las cromtidas hermanas durante la divisin celular. Los experimentos en los cuales se ha realizado la delecin del ADN satellite muestran que una gran regin de repeticiones de este tipo de ADN es indispensable para el funcionamiento correcto del centrmero.

Se supone que la heterocromatina centromrica podra, de facto, crear un compartimento mediante el incremento de la concentracin local de la variante centromrica de las histonas, CENP-A, y mediante la promocin de la incorporacin de la CENP-A en lugar de la histona H3 durante la replicacin. 3. Papel de la heterocromatina en la represin gnica (regulacin epigentica) La expresin gnica puede estar controlada a dos niveles: Primero, a nivel local o control transcripcional, gracias a la formacin de complejos locales de transcripcin. Este nivel involucra secuencias de ADN relativamente pequeas unidas a genes. A nivel ms global, en cuyo caso se dice que hay un control de la transcriptabilidad. Este control involucra a secuencias ms largas que representan un gran dominio de cromatina, que puede estar en estado activo o inactivo. En este caso es la heterocromatina la que parece estar involucrada. Los genes que generalmente se encuentran en la eucromatina pueden, por tanto, ser silenciados cuando se encuentran cercanos a un dominio de heterocromatina.

Mecanismo de inactivacin en cis: Los reordenamientos cromosmicos pueden provocar que una regin eucromtica se yuxtaponga a una regin heterocromtica. En el momento en el que el reordenamiento elimina ciertas barreras que protegen la eucromatina la estructura heterocromtica es capaz de propagarse en cis a la eucromatina adyacente, inactivando los genes que se encuentran en ella. Este es el mecanismo observado en la variegacin por efecto de posicin (PEV) en Drosophila y en la inactivacin de ciertos transgenes en ratn. Mecanismo de inactivacin en trans: Durante la diferenciacin celular, ciertos genes activos pueden transponerse a un dominio nuclear heterocromtico haciendo que se inactiven. Este mecanismo es el que se ha propuesto como explicacin para la co-localizacin en los ncleos de linfocitos de la protena IKAROS con la heterocromatina centromrica y de los genes cuya expresin controla. Eucromatina, est diseminada por el resto del ncleo (menor condensacin), se tie dbilmente con la coloraciones (su mayor tincin ocurre en la mitosis y no es visible con el microscopio de luz). Representa la forma activa de la cromatina en la que se

est transcribiendo el material gentico de las molculas de ADN a molculas de ARNm, por lo que es aqu donde se encuentran la mayora de los genes activos. [editar]Rol

de la cromatina en la expresin genetica

La cromatina es una estructura dinmica que adapta su estado de compactacin y empaquetamiento para optimizar los procesos de replicacin, transcripcin y reparacin del ADN, juega un rol regulatorio fundamental en la expresin gnica. Los distintos estados de compactacin pueden asociarse (aunque no unvocamente) al grado de transcripcin que exhiben los genes que se encuentran en esas zonas. La cromatina es, en principio, fuertemente represiva para la transcripcin, ya que la asociacin del ADN con las distintas protenas dificulta la procesin de las distintas ARN polimerasas. Por lo tanto, existe una variada cantidad de mquinas remodeladoras de la cromatina y modificadoras de histonas. Existe actualmente lo que se conoce como "cdigo de histo s". Las distintas histonas pueden sufrir modificaciones post-traduccionales, como ser la metilacin, acetilacin, fosforilacin, generalmente dada en residuos lisina o arginina. La acetilacin est asociada con activacin de la trascripcin, ya que al acetilarse una lisina, disminuye la carga positiva global de la histona por lo cual tiene una menor afinidad por el ADN (que est cargado negativamente). En consecuencia, el ADN se encuentra unido menos fuertemente lo que permite el acceso de la maquinaria transcripcional. Por el contrario, la metilacin est asociada con la represin transcripcional y una unin ADN-histona ms fuerte (si bien no siempre esto se cumple). Por ejemplo, en la levaduraS. pombe, la metilacin en el residuo de lisina 9 de la histona 3 est asociado con represin de la transcripcin en la heterocromatina, mientras que la metilacin en 2 el residuo de lisina 4 promueve la expresin de genes. Las enzimas que llevan a cabo las funciones de modificaciones de histonas son las acetilasas y desacetilasas de histonas, y las metilasas y desmetilasas de histonas, que forman distintas familias cuyos integrantes se encargan de modificar un residuo en particular de la larga cola de las histonas. Adems de las modificaciones de las histonas, existen tambin maquinarias remodeladoras de la cromatina, como por ejemplo SAGA, que se encargan de reposicionar nucleosomas, ya sea desplazndolos, rotndolos, o incluso desensamblndolos parcialmente, retirando algunas de las histonas constituyentes del nucleosoma y luego volvindolos a colocar. En general las maquinarias remodeladoras de la cromatina son esenciales para el proceso de transcripcin en eucariotas, ya que permiten el acceso y procesividad de las polimerasas. Otra forma de marcacin de la cromatina como "inactiva" puede darse a nivel de la metilacin del ADN, en citosinas que pertenezcan a dinucletidos CpG. En general la metilacin del ADN y de la cromatina son procesos sinrgicos, ya que, por ejemplo, al metilarse el ADN, existen enzimas metiladoras de histonas que pueden reconocer citosinas metiladas, y metilan histonas prximas. Del mismo modo, encimas que metilan el ADN pueden reconocer histonas metiladas, y as seguir con la metilacin a nivel de ADN.

Eucromatina
La eucromatina es una forma de la cromatina ligeramente compactada (menos que la heterocromatina)que no suele estar activa casi nunca, con una gran concentracin de genes, y a menudo (no siempre) se encuentra en transcripcin activa. A diferencia de la heterocromatina, se encuentra tanto en eucariotas como en procariotas.
ndice
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1 Estructura 2 Aspecto 3 Funcin 4 Enlaces externos & referencias

[editar]Estructura
La estructura de la eucromatina recuerda a la de un collar de perlas, representando cada una de ellas un nucleosoma. Los nucleosomas estn compuestos por ocho protenas denominadashistonas, con aproximadamente 146 pares de bases (Pb) de ADN enrolladas a cada una; en la eucromatina este empaquetamiento es menor para poder acceder con mayor facilidad al ADN. Cada histona posee una estructura variante que se cree que interviene en la ordenacin de la cromatina. En concreto, se cree que la lisina metilada 4 en las histonas acta como un marcador genrico para la eucromatina.

[editar]Aspecto
La eucromatina generalmente se observa como bandas de color claro cuando es teido con colorante Giemsa y se observa a travs del microscopio ptico; a diferencia de la heterocromatina, que se tie en bandas oscuras. La tincin ligera se debe a la estructura menos compacta de la eucromatina. Cabe recordar que en procariotas la eucromatina es el nico tipo de cromatina presente, lo que indica que la estructura de la heterocromatina evolucion ms tarde, a la vez que el ncleo, posiblemente como un mecanismo para manejar el genoma cada vez mayor, y obtener as ms seguridad y manejabilidad.

[editar]Funcin
La eucromatina participa en la transcripcin del ADN a ARNm. La estructura menos compacta permite a las protenas reguladoras de genes y a los complejos de ARN polimerasa unirse fcilmente a la secuencia de ADN, permitiendo as el principio de la transcripcin. No toda la cromatina se utiliza para la transcripcin: la que no suele ser utilizada se transfroma en heterocromatina para proteger los genes mientras no se estn utilizando. Hay, por tanto, una relacin entre lo productiva que es una clula y la cantidad de eucromatina que se puede encontrar en su ncleo. Se cree que la clula utiliza la transformacin de eucromatina a heterocromatina como un mtodo de controlar la expresin gentica y la replicacin, ya que los procesos son distintos para la cromatina compactacin (hiptesis de accesibilidad).

Heterocromatina

Esquema del ncleo

de una clula humana.

La heterocromatina son regiones de la cromatina ms compactas, condensadas, empaquetadas que se tien fuertemente con coloraciones para ADN. (P ej. DAPI (heteropicnosis positiva).cromosoma + proteina; histonas estan en estado condensado, por lo tanto no se puede replicar.

[editar]Tipos

de heterocromatina

La heterocromatina se puede dividir en:

constitutiva idntica para todas las clulas del organismo. Incluye los telmeros y centrmeros. Contiene H3 y H4sub-acetiladas y la H3 metilada en la lisina 9 (H3K9)

facultativa diferente en los distintos tipos celulares. Contiene aquellos genes que no se expresan pero que pueden expresarse en algn momento.