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Nota
Distribuio de Notas
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apenas as respostas de dois questionrios indicaram uma compreenso maior, visto
que mencionaram tambm os tipos de interferncia que podem ocorrer. As questes
n 6 e 7 envolvem pequenos clculos, mas uma compreenso espacial e terica
razovel. A primeira foi respondida por quatro alunos, sendo que apenas um deles
respondeu todas as figuras de forma correta, demonstrando o total entendimento
das regras para indexao dos ndices de Miller. Os outros trs no indicaram os
ndices corretos para as figuras que apresentavam ndices incorretos. A questo n 7
foi outra pergunta no respondida em nenhum dos questionrios entregues. Destas
observaes, nota-se que o contedo tcnico necessita de uma abordagem mais
lenta e exemplificada.
As duas ltimas perguntas tinham o objetivo de avaliar a receptividade do uso de
rplicas de estruturas ou modelagem atravs do programa Mercury. Segundo as
respostas pergunta n 8, as estruturas em escala ampliadas foram preferidas por
trs alunos, os quais justificaram a escolha afirmando que elas permitiram melhor
compreenso da tridimensionalidade dos cristais e por se tratarem de objetos fsicos
com os quais h uma interao real. O uso do Mercury foi preferido por cinco alunos
os quais justificaram afirmando que o programa permite maior manipulao da
estrutura, tanto em orientao quanto edio (montagem ou remoo de tomos) e
melhor visualizao dos planos cristalinos. A resposta de um questionrio sugere
que o aluno no leu e/ou compreendeu a pergunta corretamente, pois ela no
indicou a sua escolha entre os recursos utilizados.
A ltima pergunta, mesmo sendo de resposta pessoal, foi respondida em oito
questionrios. Os alunos afirmaram que a oficina foi interessante e diversificada
fornecendo-lhes no s informaes novas relacionadas ao tema, mas tambm
reviso de alguns conceitos gerais de Matemtica e Fsica. Todas as respostas
tambm indicaram que os alunos consideram o tema relevante em sua formao
como fsico, devido ao contedo histrico relacionado Fsica e a importncia
cientfica do tema. Alguns, inclusive, mencionaram a importncia da oficina para sua
formao como professor devido abordagem geral de conceitos que ela envolveu
e pelo uso dos recursos didticos.
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6. CONCLUSES
Durante a realizao deste trabalho pode-se concluir que o desenvolvimento das
ideias em torno dos raios X contm significativa importncia no apenas pelo
nmero considervel de prmios Nobel relacionados, mas tambm pela
abrangncia, tendo contribudo para outras reas alm da Fsica. Destaca-se, ainda,
a contribuio para o surgimento de duas reas na Fsica: a Fsica do Estado Slido
e a Fsica Quntica.
Os estudos realizados com o software Mercury 3.0 demonstraram que este
programa tem um grande potencial para o desenvolvimento dos conceitos aqui
abordados. Ele se mostrou habilitado com recursos muito funcionais para
Cristalografia e de fcil manipulao por um usurio. Uma das suas melhores
caractersticas a edio e possibilidade de construo de estruturas cristalinas.
Contudo, a funo de exibio de planos pertencentes a uma mesma famlia
demonstrou problemas com arquivos feitos pelo usurio e tambm com os arquivos
que podem ser baixados nos sites mencionados no captulo 3. Isto, porm, no
algo que prejudica sua utilizao, pois, todas as demais funes podem ser
executadas com estes arquivos. Destaca-se, tambm, a preciso oferecida pelo
software no padro de DRX que ele fornece de uma determinada estrutura.
Conclui-se tambm que o assunto deste trabalho tem grande importncia na
formao do fsico educador, uma vez que ele aborda diversos conceitos da Fsica
Clssica e da Fsica Moderna, ambas, requisitos do currculo mnimo de Fsica na
educao pblica. destacvel que a Fsica Moderna tem sido cada vez mais
solicitada no currculo mnimo e as noes bsicas relacionadas a tomos, a
interao da radiao com a matria e a prpria estrutura da matria esto contidas
no tema em questo.
Os resultados obtidos na oficina, no entanto, indicam que nem todos podem se
interessar pela fundamentao histrica desta Fsica, dependendo da forma como
ela for abordada. Os aspectos prticos se mostram mais atraentes, de forma que, se
faz necessrio unific-los. Isto foi percebido na oficina quando na primeira parte, em
que foram apresentados aos alunos alguns dos prmios Nobel no tema e sua
contribuio, alguns alunos demonstraram pouco estmulo, no interagindo muito.
Na terceira parte, contudo, se percebeu que em cada conceito trabalhado com as
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estruturas ou com o programa e remetido reviso histrica, a maioria dos alunos
estava atenta ao que era falado.
Dos resultados obtidos tambm se conclui que o uso de objetos de
aprendizagem so facilitadores, tanto para a aquisio de contedo pelo aluno
quanto para o desenvolvimento de contedos pelo professor. No caso especfico
deste tema, dois bons recursos verificados so as estruturas em escala ampliada e o
uso de software Mercury. A melhor opo, porm, parece no se tratar da escolha
entre um ou outro, mas dos dois. As respostas dadas pelos alunos indicam que
estes recursos se complementam, visto que para a visualizao tridimensional dos
cristais alguns preferiram as estruturas enquanto outros o programa.
Mediante aos resultados obtidos com os questionrios e as anlises das
interaes dos alunos na oficina, acredita-se que o melhor perodo para
implementao do contedo deste trabalho seja aps o 4 perodo. As principais
dificuldades observadas estavam relacionadas a conceitos vistos em disciplinas
como Ondulatria e Fsica Moderna. Apesar disso, notou-se tambm que estas
dificuldades podem ser superadas, sendo necessrio, contudo, trabalh-las de forma
mais lenta.
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7. REFERNCIAS
Ashcroft, N. W., Mermin, N. D. Fsica do Estado Slido. So Paulo: Cengage
Learning, 2011. Cap(s): 4, 69 89; 6, 103 117 e 7, 120 138.
Ball, D. W. Fsico Qumica. So Paulo: Pioneira Tomson Learning, 2006, vol. 2,
cap. 21, 781 813.
Bertin, E. P., Principles and Practice of X-Ray Spectrometric Analysis. Prenum, 1984,
cap. 1, 3 49.
Chesman, A.; Andr, C.; Macedo, A. Fsica Moderna: experimental e aplicada. So
Paulo: Livraria da Fsica, 2004, cap. 3, 49 61.
Cullity, B. D., Stock, S. R., Elements of X-Ray Diffraction. Prentice Hall: New Jersey,
1978, 2 ed., cap(s). 1, 3 29; 2, 32 63; 3, 81 99 e 10, 324 - 345.
Cunha, C. J., Novo, J. B. M. Uso do programa cristalogrfico Mercury para o ensino
de Qumica Mineral e Mineralogia. Terrae Didtica, v. 2, n. 1, 67 74, 2006.
Jenkins, R., X-Ray Fluorescence Espectrometry. Wiley Interscience: New York,
1932. 2 ed., vol. 152, cap(s). 1, 1 15; 3, 37 50 e 4, 53 73.
Kittel, C. Introduo Fsica do Estado Slido. Rio de Janeiro: Guanabara Dois S.
A., 1978, 5 ed., cap. 1, 5 34.
Martins, R. A. A Descoberta dos Raios X: O Primeiro Comunicado de Rntgen.
Revista Brasileira de Ensino de Fsica, v. 20, n. 4, 373 391, 1998.
Mercury 3.0: User Guide and Tutorials. The Cambridge Crystallographic Data Centre.
Registered N 800579. 2012.
Nobel Prize. 2012. Disponvel em: <http://www.nobelprize.org/>. Acessos:
17/08/2012 e 30/08/2012.
Puri, S. Modern Physics: Concepts and Applications. Alpha Science International:
Pangbourne, 2004, cap. 8, 184 208.
Saitovitch, H. Cem anos da descoberta dos raios X: caracterizao estrutural de
slidos. Revista Brasileira de Ensino de Fsica, v. 17, n. 3, 203 -208, 2009.
Thornton, S. T., Rex, A. Modern Physics. Belmont: Thomson Brooks/Cole, 2006,
cap(s). 3, 85 126, e 5, 161 199.
Tipler, P. A., Liewellyn, R. A. Fsica Moderna. Rio de Janeiro: Livros Tcnicos e
Cientficos. 3 ed, cap(s). 3, 77 95 e 4, 101 121.
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APNDICE A STIOS RELEVANTES
Aqui esto dispostos os stios citados ao longo deste trabalho.
- Download do Mercury 3.0:
<http://www.ccdc.cam.ac.uk/>.
- Obteno de arquivos cif:
<http://sdpd.univ-lemans.fr/cod/>;
<http://icsd.ill.eu/icsd/> (neste caso os arquivos so solicitados via e-mail);
<http://rruff.geo.arizona.edu/AMS/amcsd.php>;
<www.crystallography.net/>.
- Mineralogia/ Cristalografia:
<http://webmineral.com>;
<http://www.mindat.org/>.
- Publicaes da Unio Internacional de Cristalgrafos (IUCR):
<http://it.iucr.org/>.
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APNDICE B QUESTIONRIO DA OFICINA
Semana Acadmica Unificada UENF - Encontro da Licenciatura em Fsica (ELF)
Atividade Relacionada oficina Introduo DRX e Cristalografia para professores
de Fsica
1. O que so os raios X? Qual a principal forma de produzi-los?
2. Observe a figura abaixo, ela um tpico espectro de raios X: apresenta linhas
estreitas sobrepostas a uma curva contnua. Qual a origem destas linhas
estreitas e da curva contnua?
3. Qual a diferena entre um material amorfo e um material cristalino?
4. O que uma cela unitria?
5. O que interferncia (no caso de ondas)?
6. Observe as figuras abaixo e verifique se os ndices de Miller esto corretos para
os planos mostrados, assinale com C as que estiverem certas e, as que
estiverem erradas indique quais so os ndices corretos.
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7. Observe o plano na figura abaixo e calcule a qual ngulo de difrao 2 planos
com estes ndices so responsveis, considere = 1,54056 . A distncia
fornecida tem a unidade de angstrom.
8. Em sua opinio, foi mais fcil visualizar as estruturas dos minerais abordados na
oficina atravs do programa Mercury ou das estruturas montadas? Por que?
9. Voc acha que os aspectos relacionados aos raios X so relevantes para sua
formao como Fsico? Qual a sua opinio sobre a oficina?
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APNDICE C MANUSEANDO O MERCURY 3.0
Quando o Mercury 3.0 inicializado, automaticamente arquivos exemplos que
acompanham o software so carregados. O instalador do software solicitar quais
bibliotecas utilizar. ideal a seleo de todos os formatos de arquivos possveis.
Isso garante, por exemplo, o reconhecimento dos arquivos que acompanham o
Mercury. A interface que aparece aps a inicializao mostrada na figura abaixo.
Figura C1. Interface exibida aps a inicializao do Mercury 3.0.
Os arquivos que acompanham o Mercury so disponibilizados aps a
inicializao e a estrutura marcada na janela Structure Navigator j exibida na tela.
No menu principal da interface existem nove funes que gerenciam todo o
programa, e distribudos por ela, tambm existem botes de acesso direto a
algumas destas funes. As funes no gratuitas aparecem precedidas de um
smbolo do CCDC. A figura C2 mostra o menu principal expandido. Na sequncia h
uma breve descrio das funes que podem ser utilizadas gratuitamente.
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Figura C2. Menu principal com seus submenus abertos.
No menu principal as funes que podem ser utilizados so:
1. File: abre, salva e mostra os arquivos utilizados recentemente;
2. Edit: desfaz uma ao anterior ou permite copiar o que est na worksheet como
imagem;
3. Selection: seleciona elementos presentes na rea de trabalho (do Mercury);
4. Display: configura opes de visualizao tanto das estruturas quanto da
worksheet (estilo de estrutura, cor de tomos, nomes, cor do fundo da
Worksheet, mostra os elementos de simetria) e fornece informaes sobre a
estrutura;
5. View: configura opes de observao da estrutura (eixo e distncia de
observao e movimentao horizontal e/ou vertical da estrutura);
6. Calculate: exibe planos cristalinos (hkl indexados), configura tipos de ligao
qumica, gerencia aspectos de molculas e fornece o padro de difrao de
raios X da estrutura;
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7. Databases: abre os arquivos que acompanham o software;
8. Help: exibe os tpicos de ajuda, um pequeno tutorial, d acesso pgina do
Mercury no site do CCDC.
Algumas funes tambm so oferecidas ao se clicar com o boto direito do
mouse sobre a worksheet ou sobre a estrutura que nela estiver. Tais comandos
esto presentes na interface, mas podem ser encontrados e executados mais
rapidamente deste modo. Para ilustrar melhor as funes bsicas deste software e
seu funcionamento sero abordadas algumas atividades que podem ser realizadas
nele. O arquivo utilizado para estas atividades um arquivo que contm as 14 redes
de Bravais e foi elaborado com o bloco de notas do Windows.
Ao abrir o arquivo, ele estar condicionado s configuraes padres do
programa. A figura C3 mostra a interface e nela uma das estruturas presentes no
arquivo aberto. Repare na janela do lado direito da interface, ela mostra as
estruturas presentes no arquivo aberto (ou outros arquivos separados). Note que a
estrutura est posicionada ao longo do eixo primitivo b e est relativamente afastada
da tela. Alm disso, as ligaes apresentam um tamanho exagerado se comparadas
com o tamanho dos tomos (neste caso Nquel).
Figura C3. Aspecto da estrutura na worksheet aps a abertura de seu respectivo arquivo.
Para melhorar a visualizao pode-se aproximar e girar a estrutura em relao
interface, alterar a sua cor e tamanho da ligao. Para girar a estrutura pode-se
utilizar o mouse simplesmente clicando sobre alguma regio na worksheet e
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moviment-lo na direo desejada. Na parte superior da interface a primeira linha de
funes tem a opo default view a qual seleciona por qual eixo as estruturas sero
visualizadas (quando mudar de estrutura a prxima ser mostrada de acordo com
esta opo). direita dela existem outras funes para orientao da estrutura,
porm so momentneos quando se muda a estrutura, as configuraes
escolhidas so desfeitas. Estes comandos permitem girar uma estrutura em
qualquer ngulo continuamente, mov-la horizontal ou verticalmente e aproximar ou
afast-la. A alterao do tamanho da ligao pode ser feita atravs do submenu em
Display ou clicando com o boto direito do mouse sobre a ligao. Na opo Styles
escolhida a aparncia da ligao e suas caractersticas. Neste caso, as alteraes
so feitas em Ball and Stick settings no submenu em Styles. Neste menu o tamanho
dos tomos pode ser alterado. A cela unitria por padro no identificada na
estrutura, mas isto pode ser feito selecionando o comando show cell axes na parte
inferior da interface. A figura C4 mostra estas alteraes e o aspecto final da mesma
estrutura.
Figura C4. Submenus para alterao do aspecto dos tomos, das ligaes e da aparncia final
da estrutura devido modificao na orientao e na distncia de observao.
O ajuste das variveis de ambiente torna mais apropriada a manipulao das
estruturas, pois, a realizao de algumas medidas podem ser comprometidas
quando a imagem est distante do usurio. A estrutura utilizada na figura C4
apenas representativa de uma rede cbica simples. Com o objetivo de obter
informaes reais de uma estrutura ser utilizada nas prximas imagens a estrutura
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do cloreto de sdio (NaCl), que uma rede cbica de face centrada. As primeiras
informaes a se obter so as medidas dos vetores primitivos que definem a cela
unitria do NaCl. Para isto utiliza-se a funo packing mode localizada na parte
superior esquerda da interface, selecionando o modo measure distance e em
seguida clicando com o mouse sobre os tomos necessrios medida neste caso,
o tomo localizado na origem e o tomo localizado no fim do vetor primitivo. Quando
esta ao for executada o primeiro tomo selecionado ser marcado com listras
amarelas e ao selecionar o segundo tomo, a medida da distncia entre eles
aparecer prximo reta que os uni. relevante mencionar aqui um ponto
desfavorvel do software quanto estas medidas. Os valores so apresentados pelo
programa apenas na cor verde claro, o que dificulta um pouco a visualizao deles.
Mas, pode-se alterar a cor da worksheet e aumentar o tamanho dos nmeros,
melhorando a visualizao.
Figura C5. Cela unitria do NaCl com as medidas dos vetores primitivos e outras distncias
para exemplificao (note o tomo verde selecionado e as letras que indicam a origem e os
vetores primitivos). Cores: Na roxo, Cl verde.
Para realizar a medida de ngulos utiliza-se o mesma funo utilizada para as
medidas, agora, porm, selecionando a opo measure angles. O processo para
obteno dos ngulos tambm similar, mas na medida dos ngulos trs tomos
devem ser selecionados. O ngulo medido em relao ao segundo tomo
selecionado, que o ponto de rotao angular. Para medir o ngulo entre os vetores
primitivos a e b, por exemplo, seleciona-se algum tomo sobre o vetor a, em seguida
o tomo na origem e, por fim, seleciona-se algum tomo sobre o vetor b note que
o processo inverso tambm vlido (fig. C6).
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Figura C6. Algumas medidas de ngulos (note os dois primeiros tomos selecionados).
Outra informao importante em uma estrutura cristalina so os planos
cristalinos que os tomos que a compem formam, uma vez que, tais planos so
fundamentais na difrao de raios X pela estrutura (cap. 2). Mas, para identificar os
planos responsveis pelo padro de difrao do NaCl necessrio obter o padro
de difrao (difratograma) deste mineral. Isto feito por meio da funo Powder
localizado na parte inferior da interface (ou no submenu da funo Calculate no
menu principal). Ela abrir uma janela (fig. C7, esquerda) com o nome da estrutura
analisada, um difratograma e as seguintes opes para sua configurao:
Customize, Reset zoom, Save e Save image. A opo Customize (fig. C7, direita)
a mais relevante, pois, a responsvel pelos parmetros de obteno do
difratograma: radiao utilizada, ngulo inicial e final (varredura), passo (velocidade
da varredura), e resoluo dos picos de difrao. Estes parmetros so muito
importantes, pois, se no forem ajustados corretamente o difratograma poder ser
visualizado de forma errada ou ter parte de suas informaes perdidas.
Figura C7. Janela com o difratograma aberto com o comando Powder, esquerda, e janela de
ajuste dos parmetros de obteno do difratograma, direita. Note na parte inferior direita do
difratograma os ndices de Miller, eles so indicados quando se posiciona o mouse sobre
algum pico de difrao.
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Quando for necessrio (para maior resoluo) pode-se selecionar uma regio do
difratograma com o boto esquerdo do mouse. Isto ampliar esta regio, e a opo
Reset zoom desfaz esta ao. A opo Save permite salvar o difratograma em
alguns formatos de arquivos que podem ser abertos em programas grficos como o
Origin. A opo Save image cria um arquivo imagem, possveis em alguns formatos,
do difratograma que pode ser aberto em qualquer programa visualizador de
imagens.
A partir do difratograma possvel, ento, verificar quais planos cristalinos so
responsveis pela difrao com raios X da estrutura em questo. Como possvel
manter duas janelas diferentes abertas ao mesmo tempo no Mercury, pode-se
verificar os ndices de Miller e indicar os planos cristalinos referentes a eles
concomitantemente. A indicao dos planos tambm feita no menu Calculate
selecionando, agora, a opo Planes. Uma janela abrir com apenas um comando
ativo New plane, o qual deve ser acionado. Com isto outra janela contendo duas
abas abrir na worksheet; para indicar os planos cristalinos pelos ndices de Miller
deve-se escolher a aba identificada com hkl. Nesta aba esto as caixas de entrada
para os respectivos ndices e opes de configurao para a visualizao dos
planos identificao, transparncia e cor (fig. C8).
Figura C8. Janela aberta pela opo Planes, esquerda, e janela aberta pelo comando New
Plane (na figura a aba para entrada dos ndices de Miller j foi selecionada), direita.
Inserindo os ndices de Miller, o programa mostrar na estrutura os respectivos
planos cristalinos (fig. C9). Uma observao importante que o Mercury opera
apenas com o inverso dos ndices inseridos no programa. Desta forma, planos cujos
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ndices no so o inverso direto de suas intersees podem no ser representados
conforme desejado pelo usurio. Por exemplo, suponha a existncia de um plano
cristalino que tenha as seguintes intersees: (2/3, 1/4, 1). Pela regra de Miller, as
intersees devem ser invertidas obtendo (3/2, 4, 1) que no so inteiros.
necessrio, ento, reduzi-los aos menores inteiros mantendo a mesma proporo; o
que significa multiplic-los por 2 obtendo assim (3 8 2) que so os respectivos
ndices de Miller para o plano em questo. Quando inseridos estes ndices no
Mercury, porm, o plano que ser representado ser o plano cujas intersees com
os vetores primitivos so (1/3, 1/8, 1/2), que diferenciam das intersees do plano
original. Contudo, isto no um erro do software; os ndices de Miller encontrados
indexam uma famlia de planos a qual ambos os planos pertencem, mas apenas um
pode ser representado devido a lgica do programa. Note, para maior
esclarecimento, que a proporo entre os ndices de cada um destes planos mantm
a mesma proporo entre si (h/k= 2.67, k/l= 0.25 e h/l= 0.67).
Figura C9. Visualizao dos planos responsveis pelos trs picos de maior intensidade na
difrao de raios X pelo NaCl.
possvel, agora, utilizar as funes observadas apresentadas para verificar a
Lei de Bragg. Utilizando os procedimentos anteriores de medida possvel medir a
distncia interplanar dos planos mostrados na figura C9 e comparar com o valor
calculado pela Lei de Bragg. Entretanto, h um problema no Mercury quanto a
exibio de planos da mesma famlia. A figura C10 a representao de dois outros
planos da famlia (222) obtida no software, porm, a execuo da funo necessria
para isto utiliza muito do processamento do computador. O seu uso acarreta na
maioria das vezes um atraso na execuo, podendo paralisar o software e obrigando
o usurio a encerr-lo. Deste modo, esta funo um ponto negativo no software e,
pode ser substituda. A figura muito relevante para uma melhor compreenso do
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que so planos da mesma famlia (hkl). Para contornar esta funo problemtica do
software, o que se pode fazer mudar a origem da cela unitria dentro dela,
observando quais tomos sero compreendidos pelo mesmo plano (mesmos hkl,
mas em relao nova origem). Exemplificando este procedimento na estrutura do
NaCl (fig. C10), observe que se a origem (tomo roxo marcado com a letra O) for
mudada para o outro tomo roxo acima da origem inicial ou na diagonal dela
(indicado pela seta, fig. C10), haver uma simetria de base. Na direo dos vetores
a e b, esto posicionados tomos amarelos prximos ao tomo roxo, que a nova
origem, os quais so compreendidos por um plano da famlia (222). Desta forma,
possvel notar entre quais tomos deve-se calcular a distncia para obter a distncia
interplanar.
Figura C10. Ilustrao de outros planos da famlia (222). A seta mostra o deslocamento
imaginrio da origem na cela unitria para percepo de outros planos com mesmos ndices
hkl.
Os valores obtidos a partir da medio das distncias interplanares so:
- plano (111): d= 3.256;
- plano (200): d= 2.820;
- plano (222): d= 3.256.
A partir da Lei de Bragg, os valores de distncia interplanar calculados com os
ngulos 2 de difrao fornecidos pelo difratograma so calculados facilmente e,
esto descritos a seguir. Como se observa os valores coincidem regularmente
dentro da margem de erro presente na medio dos ngulos (o que pode ser notado
no fato de que o ponteiro do mouse possui uma largura maior que alguns picos de
difrao).
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= 2d sen, com = 1.54056 (angstrom),
- 2
(111)
= 27.399 .: d
(111)
= 3.252 ;
- 2
(200)
= 31.738 .: d
(200)
= 2.817 ;
- 2
(222)
= 56.570 .: d
(222)
= 3.251 .
erro= 0.06
C.1. Produzindo e/ou Editando Estruturas
A partir de um editor de texto possvel criar ou editar estruturas que podero,
posteriormente, serem utilizadas no programa Mercury. Para isto preciso respeitar
um corpo mnimo de comandos que o arquivo tem de conter para que o software o
reconhea. Existem algumas informaes que podem ser adicionadas a estes
arquivos, mas que no modificam os parmetros fundamentais das estruturas. Tais
informaes so: o nome do arquivo escolhido pelo autor, volume da cela unitria e
informaes extras sobre a estrutura ou sobre a edio da estrutura. A figura C11
mostra um arquivo de uma determinada estrutura pesquisada em um dos bancos de
dados citados anteriormente. Nesta figura possvel notar informaes adicionais
inseridas pelo autor: seu nome, o jornal de publicao com seus respectivos dados
de identificao e o volume da cela unitria.
Figura C11. Informaes contidas no arquivo de uma estrutura disponvel nos bancos de
dados cristalogrficos.
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A ideia bsica na lgica de comandos do Mercury a representao dos tomos
por meio de um sistema dextrogiro, no qual a posio de cada tomo indicada por
um valor que pode ser tanto positivo quanto negativo. Alm disso, a quantidade de
algarismos significativos escolhida durante a edio do arquivo. Os vetores
unitrios deste sistema tero os comprimentos dos vetores primitivos, os quais
tambm sero indicados na edio da estrutura. Os comandos bsicos para que um
arquivo seja reconhecido pelo Mercury esto descritos a seguir.
data_cubica-simples
_cell_length_a 2.874
_cell_length_b 2.874
_cell_length_c 2.874
_cell_angle_alpha 90
_cell_angle_beta 90
_cell_angle_gamma 90
_symmetry_space_group_name_H-M Pm3m
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
Ni 0.00000 0.00000 0.00000
Ni 0.00000 1.00000 0.00000
Ni 0.00000 0.00000 1.00000
Ni 0.00000 1.00000 1.00000
Ni 1.00000 0.00000 0.00000
Ni 1.00000 1.00000 0.00000
Ni 1.00000 1.00000 1.00000
Ni 1.00000 0.00000 1.00000
O primeiro comando data responsvel pelo nome do arquivo, o qual deve ser
escrito sem espao entre as palavras, podendo ser utilizado o _ (underline) ou o -
(hfen) para separ-las. Na sequncia so escritos os comandos responsveis pelas
caractersticas dos vetores primitivos: seu comprimento _cell_lenght, os ngulos
entre eles _cell_angle e o tipo de grupo espacial da estrutura
_symmetry_space_group_name. Este ltimo comando indispensvel caso se
pretenda trabalhar com os elementos de simetria; como o caso de expanses das
celas unitrias. Quando ele no est presente no arquivo o programa exibir na aba
superior da interface o nome do arquivo seguido da palavra (Unknown), isto, porm
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no compromete outras funes que no necessitem dos parmetros de simetria da
estrutura. Os grupos espaciais so nomenclaturas utilizadas para indexar estruturas
cristalinas quanto s operaes de simetria que elas possuem, sendo que existem
230 grupos espaciais. Cada sistema cristalino possui uma quantidade de grupos,
cuja nomenclatura feita de forma que a primeira letra designe qual o tipo de rede
de Bravai (P, I, F, C ou R) de uma determinada estrutura (ASHCROFT e MERMIN,
2011). Na criao de uma estrutura especfica, portanto, preciso pesquisar o grupo
espacial que ela apresenta. Estes grupos espaciais so tabelados e podem ser
encontrados, nas publicaes da Unio Internacional de Cristalgrafos (IUCR) que
so disponibilizadas no stio <http://it.iucr.org/>, ou, ento, em sites de mineralogia/
cristalografia como o Webmineral, disponvel no stio <http://webmineral.com>.
Na sequncia devem ser escritos os comandos responsveis pela representao
dos tomos. O comando loop_ essencial para o reconhecimento das coordenadas
de cada tomo; se ele no estiver presente o programa exibe a mensagem: No
coordinates available. Em seguida so escritos os comandos responsveis pela
identificao dos tomos e dos eixos do sistema dextrogiro. Os tomos a serem
utilizados so indicados pelo seu respectivo smbolo na tabela peridica, seguido
ds suas coordenadas na cela unitria. Inseridos estes comandos no editor de texto
preciso salvar o arquivo com a terminao cif, que um dos formatos
reconhecidos pelo programa (note na figura C11, na aba superior est escrito
Ferro.cif).
relevante destacar que possvel criar um nico arquivo contendo mais de
uma estrutura, ou seja, para a elaborao de mais de uma estrutura no se faz
necessrio criar mais de um arquivo no editor de texto. E uma observao a se fazer
que um dos textos de referncia deste trabalho menciona o uso do comando #end
ao fim do arquivo (Cunha, J. C. e Novo, J. B., 2006), porm durante o manuseio do
Mercury 3.0 no presente trabalho foi verificado no ser necessrio este comando
mesmo no caso de um arquivo nico contendo dados de mais de uma estrutura.