TEMA 2: AMINOCIDOS Y PROTENAS. ESTRUCTURA, CLASIFICACIN Y FUNCIN.

Las protenas son largas cadenas de aminocidos unidos por enlaces peptdicos. En la naturaleza se conocen alrededor de 300 aminocidos. Muchos de ellos slo se observan en determinadas formas de vida, es decir, slo se encuentran en algunas especies o en una nica especie. Todos los organismos utilizan slo 20 aminocidos para formar las protenas. Los aminocidos pueden clasificarse como: Proticos: forman parte de las protenas y pueden ser: o Codificables o universales: Son 20 aminocidos que se incorporan como tales a las protenas cuando son los llamados cdigo gentico. o Modificado o particulares: Son productos de una modificacin qumica una vez que se ha sintetizado la protena que sufre alguno de los 20 esenciales. No proticos: Son aquellos que no forman parte de las protenas, se encuentran libres o combinados con otras sustancias.

Todos estos aminocidos tienen en comn un grupo carboxilo y un grupo amino unido al mismo tomo de carbono llamado C y las dos valencia restantes estn unidas a un tomo de H y a un radical R. R es una cadena lateral, y que es lo que diferencia un aminocidos de otro. Todos los aminocidos excepto uno, la glicina, tiene el C asimtrico, que est unido a 4 sustituyentes diferentes, lo cual le confiere la propiedad de presentar ismeros pticos o estereoismeros. Todos los aminocidos que forman parte de las protenas pertenecen a la serie L, no se conoce ningn aminocido que pertenezca a la serie D que forme parte de las protenas. Todos los aminocidos codificables o universales son -aminocidos: el C, prximo al grupo carboxilo tiene un enlace con el grupo NH2, otro con el COOH, tiene un H y una cadena lateral, residuo o cadena R de distinta naturaleza dependiendo del aminocido. El C es asimtrico y es un centro quiral. Debido a ello tenemos la configuracin D y la L, que son enantimeros (imgenes especulares). Cuando el radical R se dirige a la izquierda y el h a la derecha es la forma L. Cuando se encuentra al revs es la forma D (con el COOH hacia abajo). Esto de actividad ptica a los aminocidos: la forma D y la forma L gran el plano de la luz polarizada hacia la izquierda (- levgira) o a la derecha (+ dextrgira) una misma magnitud.

Formando parte de las protenas en la naturaleza, solo intervienen aminocidos L. Otros aminocidos pueden estar con otra conformacin. 1. CLASIFICACIN DE LOS AMINOCIDOS: Segn la naturaleza del grupo R, los aminocidos se pueden clasificar en 4 grupos: Aminocidos con R no polar (hidrofbicos): Glicina, es el nico aminocido sin quiralidad. Otros tienen cadenas alifticas cortas. Tambin los hay con grupos aromticos. La Prolina es un aminocido raro: el grupo R se engancha al grupo amino formando un ciclo (este aminocido da lugar a codos en las protenas). Son los menos solubles. Aminocidos con R polar neutro: La polaridad puede venir por grupos OH, amidas, un aminocido con un resto fenol y uno con azufre, fuera de la cadena dando polaridad ya que es un poco cido, dando puentes disulfuro por oxidacin. Aminocidos con carcter cido: Adems de un grupo COOH comn a todos los aminocidos, presentan un carboxilo extra en la cadena lateral. Presentan 3 grupos ionizables: el carboxilo y el amino propios y el carboxilo extra. A pH 7 tiene carga negativa. Aminocidos bsicos: Adems del grupo amino en C, presenta en su cadena R un grupo amino extra ionizable, posiblemente modificado. Tambin tiene 3 grupos ionizables. Tiene carga positiva.

2. PROPIEDADES CIDO-BASE DE LOS AMINOCIDOS Los aminocidos tienen propiedades cido base, es decir, independientemente de sus grupos R, los aminocidos debido a la presencia de los grupos carboxilos y grupos amino tienen propiedades cido base. Los aminocidos a pH =7 poseen un grupo carboxilo y un grupo amino que actan como cidos en disolucin acuosa, es decir, que van perdiendo H+ a medida que se aaden equivalentes de base, el primer grupo en perder el H + es el grupo carboxilo pasando de COOH a COO- y despus el grupo amino que pasa de NH3+ a NH2. Dentro de la misma molcula hay dos grupos ionizables (monoamino monocarboxilo). El primer grupo ionizable es el carboxilo. Al aadir OH- (bases) va perdiendo H+ hasta quedar COO-. Queda en equilibrio cuando el pH =pKa, llamado pKa1. El grupo COOH- se desprotonan antes porque el pKa1 es ms bajo que el pKa2 (pKa del grupo NH3+). Una vez desprotonado el COO-, se siguen aadiendo bases y se desprotonan el amino, pero esto ocurre muy por encima de 7.

Por tanto, los aminocidos se pueden presentar en forma catnica, en forma neutra (forma zwiteron) en forma annica. La mayora de los aminocidos tienen pk a1=2 y pK a2 = 9-10. Curva de titulacin de un aminocido monoamino-monocarboxlico: Los aminocidos con carga positiva o negativa tienen un tercer grupo ionizable. Los aminocidos cidos presentan un COOH adicional cuyo pK se llama pKaR y tiene valor pequeo (cido). Los aminocidos catnicos o bsicos tienen pKaR altos a excepcin de la histidina, con un pKR = 6, lo que le da carcter anftero.

Se representa el pH frente a la adicin de OH. Con pH bajo, tanto el COOH como el amino estn protonados, con carga neta +1. Cuando el pH = pk a1, el 50% se encuentra protonado (+1) y el 50% se encuentra con 0 (queda +1/2). Seguimos aumentando el pH y tenemos todo el COO- desprotonado, quedando carga neta 0, pues el NH3+ est protonado y pH = pI. Continuamos aadiendo base y tenemos pH = pKa2, donde el 50% est con carga 0 y el otro 50% est en 1 (carga neta -1/2). Despus tenemos una carga neta de -1 cuando todo el amino se ha disociado. El punto Isoelctrico se alcanza cuando se aade un equivalente de base. (Denominamos punto isoelctrico de un aminocido, al pH en el que la concentracin de Zwiteron es mxima (el aminocido no presenta carga neta).

Los aminocidos son anfolitos pues tienen un pKa y un pKb tiene dos grupos ionizables y estudiamos el del COOH hasta llegar al punto isoelctrico y a partir de l estudiamos el del - NH3+. Tenemos:

Existen tres zonas de amortiguamiento del pH: o Zonas tampn que se encuentran cerca de los valores de pKa1 y pKa2. Hay poca pendiente en la curva de valoracin al aadir base el pH cambia poco. o El punto isoelctrico representa el punto de inflexin de la curva donde la carga neta del aminocido es 0. En ese punto la curva tiene alta pendiente en pequeas adiciones de base suponen grandes cambios de pH (poca capacidad tampn). o En cualquier punto distinto al punto isoelctrico, la carga neta del aminocido depende de las concentraciones relativas de las especies en equilibrio. En los pH = pKa1 y pH = pKa2 son +1/2 y -1/2 porque las concentraciones son 50%-50%. La carga neta de un aminocido por tanto depende del valor del pH al que se encuentra, como no hay dos aminocidos con los mismos pK, tampoco hay dos aminocidos que tengan la misma carga neta al mismo pH. A pH fisiolgico, la mayor parte de los aminocidos estn en forma neutra (monoamino monocarboxilo). Las curvas de valoracin de los aminocidos con grupos ionizables se comportan de forma distinta, La lisina y arginina son aminocidos bsicos y a pH = 7 tienen carga +1. El glutmico y el asprtico (aminocidos cidos) a pH =7 tienen carga -1. Hay aminocidos con un grupo ionizable de ms en la cadena R. Los aminocidos cidos presentan un carboxilo adicional. Las curvas de valoracin tendrn tres puntos de inflexin: los aminocidos cidos tienen un pK a1 (del carboxilo), un pKa2 (del amino) y un pKR (del carboxilo extra). El que tiene el pKa ms bajo perder el H+ del carboxilo . El segundo protn que se pierde es el del carboxilo en R (pH = pKR). Cuando se aaden dos equilibrios de base se neutraliza el segundo H+. Cuando todo el aminocido est totalmente desprotonado, llegamos a neutralizar el H+ del NH3. Los aminocidos cidos pasan por carga +1,-1 y -2.

Los aminocidos bsicos tambin presentan tres puntos de inflexin. Tienen un carboxilo (pKa1), un amino (pKa2) y un amino R (pKaR). El primer H+ que se pierde es el del carboxilo. Al aadir un equivalente de base, se neutraliza el primer protn. El segundo H+ que se neutraliza es el del amino R y al aadir el tercer equivalente se neutraliza el amino . El punto isoelctrico de los aminocidos con tres grupos ionizables se calcula como la media de los pKa que dirigen el equilibrio hacia -1 y +1. o Aminocidos bsicos (los dos pKa bsicos):

o Aminocidos cidos (los dos pKa cidos):

Los aminocidos no proticos son intermediarios metablicos que no forman parte de las protenas. Algunos no son de tipo o son de quiralidad opuesta ( alanina, D-alanina). 3. FORMACIN DE UN PPTIDO La principal misin de los aminocidos es unirse entre s mediante enlace peptdico y formar las protenas. Cuando se unen dos aminocidos se forma un enlace peptdico. Los enlaces peptdicos poseen tres caractersticas: Son polares. Son planos. Estn estabilizados por resonancia.

Este enlace de forma entre el grupo carboxilo de un aminocido y el grupo amino del siguiente aminocido, de tal manera que siempre el primer aminocido participa con su grupo COOH y el segundo con su grupo NH 3+. Se enlazan dos aminocidos mediante el carbono de un carboxilo y el nitrgeno del amino. El enlace es de tipo amida y se pierde agua.

El aminocido de la izquierda se une por el carboxilo y el siguiente con el amino. El cdigo gentico indica que la sntesis de protena se dirige en este sentido. Las cadenas polipeptdicas estn formadas por planos peptdicos que giran por sus C. Los ngulos de torsin se definen de 180 cuando la cadena polipeptdica es plana y en su conformacin totalmente extendida. Se encuentra estabilizada por resonancia y el enlace peptdico es plano (no puede rotar). Pptidos con actividad biolgica: Hay pequeos pptidos que no forman protenas y tienen actividad biolgica. Son pptidos naturales, hormonas peptdicas, factores de crecimientos, neuropptidos, antibiticos peptdicos y pptidos inmuno represores. 4. CONFORMACIN TRIDIMENSIONAL DE LAS PROTENAS: La conformacin es el estado estructural que puede interconvertir con otros estados estructurales sin romperse con enlaces covalentes. De entre las conformaciones posibles de las protenas, es mayoritaria la termodinmicamente ms estable, se conoce como conformacin nativa y es la nica funcional. La estructura tridimensional viene determinada por el orden en el que estn colocados los aminocidos, que constituyen la estructura primaria. Las protenas deben ser muy extensas. La organizacin proteica tiene distintos niveles: Estructura primaria de las protenas: son aminocidos que se colocan uno detrs de otro unidos por enlaces peptdicos mediante la unin del grupo carboxilo con el grupo amino del siguiente con prdida de una molcula de agua. Estructura secundaria de las protenas: la secuencia de aminocidos se organiza dando hlices o lminas (estructuras regulares estables ocasionadas por pequeos giros entorno a los planos del enlace). Suelen ser alargadas. Algunas protenas se quedan aqu (fibrosas). o Rotacin alrededor de los enlaces en una cadena polipeptdica : Se puede definir tambin los ngulos de torsin, y , como ngulos que se forman entre el C-N y el C-C respectivamente. Los planos peptdicos no puede tomar los valores de los ngulos desde 180 a hasta 180, porque los grupos R se molestaran entre s en el espacio.

o Diagramas de Ramachandrn:

Da valores para el ngulo desde -180 hasta +180 y de desde los mismos valores. Con pptidos sintticos del mismo aminocido hizo medidas. En el primer cuadrante tena muchas medidas. Las zonas en blanco son las zonas no permitidas (no todas las combinaciones estn permitidas). En el segundo cuadrante se distribuy los ngulos de 1000 restos de aminocidos pertenecientes a 8 protenas naturales y distintas de la glicina y salieron zonas permitidas que coincidan en el primer cuadrante, aunque algunas pequeas zonas no coincidan. En el tercer cuadrante si la protena est formada nicamente por glicina permite una mayor rotacin, dado que los hidrgenos se sitan en los vrtices, y se pueden dar muchos valores de los ngulos de torsin. El plegamiento de una cadena polipeptdica, en principio tiene dos problemas: o Evitar que las unidades giren libremente en torno a y a (como adjudicar a cada protena una estructura correcta). o Cuando se estudiaron las primeras estructuras globulares, se observ que en el interior slo haban cadenas hidrofbicas y que en el exterior, los aminocidos con cadenas polares o con carga. Por tanto el problema es llevar las cadenas hidrofbicas hacia adentro sin arrastrar a los enlaces peptdicos, que son polares.

De este modo aparecen las siguientes estructuras secundarias regulares: o Hlices: los puentes de hidrgeno se establecen entre los oxgenos y los hidrgenos de una misma cadena formndose la hlice. Cuando una cadena polipeptdica experimenta un giro de igual magnitud alrededor de sus C se forma una hlice. Existen algunos tipos de hlices mediante el modelo de enlaces por puentes de hidrgeno entre el CO del aminocido y el NH del: Aminocido n+3: Se denomina hlice 310 ya que posee 3 aminocidos por vuelta y la unin se realiza en el C1 y el C10. Es un tipo de enlace que existe en la naturaleza pero est un poco forzado (es ms estrecho y alargado que la hlice). Una sola cadena polipeptdica. Aminocido n+4: El puente de hidrgeno se establece entre el grupo CO del aminocido n con el grupo NH del cuarto aminocido que le sigue. Es la hlice ms frecuente y la ms estable. Se le denomina Hlice . Aminocido n+5: Se denomina hlice , y posee 4 aminocidos por vuelta. Es ms ancha y corta que la hlice .

La hlice es la ms idnea ya que no es tan delgada como la hlice 310 ni tan gruesa como la hlice . La hlice posee 3,6 aminocidos por vuelta y los grupos R estn proyectados hacia fuera. Existen aminocidos como el acido glutmico que favorece la formacin de hlice, hay otros que la soportan como la glicina y otros que la desestabiliza como es la Prolina (ya que es el nico con el grupo amino unido a su propio R). o Lminas : Los puentes de hidrgeno se establecen entre cadenas o trozos de cadenas diferentes. Podemos tener una cadena N C y otra CN y formar lminas antiparalelas, o dos cadenas paralelas. Puede ser una misma molcula en lo que se unen fragmentos laminares, o molculas distintas. En las lminas antiparalelas, los puentes de hidrgeno son muy perpendiculares y con distintas distancias entre s. En las paralelas, los puentes de hidrgeno son equidistantes y no perpendiculares entre s. Las cadenas laterales se presentan alternativamente hacia arriba y hacia debajo de la lmina plegada.

Estos dos tipos de estructuras secundarias son regulares ya que los ngulos de torsin van girando lo mismo uno en relacin con el otro. En las protenas, zonas de estructura secundaria regular se encuentran unidas entre s por fragmentos polipeptdicos, llamados lazos o regiones enlazantes que no son las regiones que unen unas estructuras secundarias entre s. No son estructuras regulares sino que son plegamientos al azar, y suelen estar localizados en los centros activos de las protenas. Estructura terciaria de las protenas: Las protenas globulares adoptan esta estructura. Se representan mediante diagramas de topologa donde los hlice se dibujan como cilindros o muelles, y las lminas se representan como flechas, donde la punta es el Carboxilo terminal y la base representa el amino inicial. Los lazos se representan como regiones enlazantes en verde. A veces hay dominios, donde cada regin de la protena, con una estructura adecuada a una funcin, est basada en -lmina o -hlice. Normalmente en las protenas al nivel de la estructura terciaria se suele hablar de dominios. Se define dominio como una cadena polipeptdica o una parte de ella que se puede plegar independientemente. A los distintos dominios de una protena se le suele adjudicar una funcin. Los dominios suelen estar formados por la asociacin de varios motivos. Las protenas suelen estar formadas por unos patrones comunes que son pequeos elementos de estructura secundaria que se repiten con bastante frecuencia de unas protenas a otras. Estos patrones que se repiten se conocen como motivos. Hay cuatro tipos de motivos: o Motivo -: Formado por dos hlices unidas por un lazo. Su funcin general suele unirse a sustancias como Ca2+ o al DNA.

o Motivo horquilla , o motivo -: Dos cadenas antiparalelas unidas por un lazo.

o Motivo greca: lminas unidas por lazos entre s y un lazo mayor que une a la primera y ltima.

o Motivo - - : se intercala una -hlice en medio de dos lminas paralelas entre s, mediante lazos que se unen.

Las protenas se clasifican en tres grandes grupos basndonos en consideraciones estructurales entre dominios y motivos: o Estructuras con dominios : en su estructura slo contienen hlices unidas por lazos. Se distinguen la tetrahlice (4 hlices unidas por lazos paralelas a un eje comn, con los residuos hidrofbicos hacia adentro y los hidrofficos hacia afuera), a los que pertenece protenas rdox y transportadoras de elementos. El sitio activo se encuentra en medio de las 4 hlices.

Tambin estn las globinas, como las hemoglobinas y las mioglobinas, que presentan 8 hlices nombradas de A a la H, pero no se encuentran paralelas sino formando ngulos de 45. Tambin presentan los residuos apolares hacia dentro y los polares hacia afuera. El centro activo de estas protenas se encuentra en una hendidura hidrofbica donde aparece un grupo no protico (prosttico).

o Estructuras con dominios /: se repite el motivo -- , con paralelas. Es frecuente que sean 8 -lminas, intercaladas con hlices . En el espacio, esta sucesin se coloca de forma cerrada, formando barriles cerrados, los mirando hacia arriba y las hlices un poco ms afuera del barril, las lminas se giran un poco para cerrar el barril. Estas estructuras estn estabilizadas por fuerzas en tres capas: hacia afuera se encuentra los aminocidos polares, entre las y los tenemos residuos hidrofbicos de los y de los , y en el centro tendremos residuos hidrofbicos de los . Los centros activos se encuentran en los lazos, que se encuentran hacia arriba y hacia abajo. Esta estructura est presente en enzimas.

o Estructuras con dominios antiparalelas: se repite el motivo horquilla , de modo que quedan todos antiparalelas. Tenemos por ejemplo los barriles arriba/abajo, formando un barril aplastado. Los centros activos se encuentran en los lazos.

La conformacin o estructura terciaria de protenas est estabilizada por varios tipos de enlaces que podemos dividir en dos grupos: o Enlaces covalentes: son los puentes de disulfuro (S-S), se forma cuando dos cadenas laterales de cistena, aunque alejadas en la secuencia se encuentran en el espacio, pueden oxidarse dando un puente de disulfuro. HS + HS (oxidacin) (reduccin) S-So Enlaces no covalentes: como es el caso de: Puentes de hidrgeno. Interacciones inicas. Interacciones hidrofbicas. Fuerzas de Van der Walls.

Estas fuerzas son las que hacen funcionales a las biomolculas. Estas fuerzas se hacen entre las cadenas laterales de los aminocidos, ya que los carbonos y los hidrgenos de los enlaces amida (pptidos), ya que estn formando puentes de hidrgeno para mantener la estructura secundaria. 5. CONCEPTOS GENERALES DE LA ESTRUCTURA PROTICA: El esqueleto contiene miles de tomos. Si pudieran girar libremente entorno a los enlaces , tendramos varias estructuras terciarias posibles. Pero las protenas tienen una estructura tridimensional propia, debido a que la secuencia de aminocidos es la adecuada y se mantienen entre ellos la fuerza adecuada. La conformacin de una protena est estabilizada principalmente por interacciones dbiles, ya que favorecen termodinmicamente el sistema (mayor entropa en el agua). Todo esto se debe a las propiedades del agua (y a su capacidad de formar puentes de hidrgeno). La secuencia de aminocidos determina la estructura terciaria, es decir, la estructura primaria es la que va a plegarse de una determinada forma para cumplir una determinada funcin. Las protenas difieren en su estructura terciaria. La estructura de una protena determina su funcin.

Las protenas pierden su estructura y su funcin al desnaturalizarse, se denomina desnaturalizacin de una protena a la prdida de su estructura terciaria, su conformacin y por tanto su funcin, la protena puede volver a renaturalizarse si el agente utilizado no ha sido muy fuerte. Las estructuras terciarias no son rgidas. Los polipptidos se pliegan rpidamente segn un proceso en varias etapas, existen unos enzimas llamados chaperones que ayudan a las protenas a adquirir su conformacin espacial en las ltimas fases de su plegamiento. Existe un pequeo nmero de modelos estructurales terciarios comunes llamados dominios

6. DESNATURALIZACIN DE LAS PROTENAS: Si en una protena se rompen sus enlaces dbiles o sus puentes de disulfuro, la protena pierde su conformacin espacial y por tanto su funcin por lo que la protena se despliega, pero no implica ruptura de enlaces peptdicos. Existen una serie de factores que desnaturalizan las protenas: Variacin del pH: implica la alteracin de los estados de ionizacin de los aminocidos y se rompen fuerzas inicas. Temperaturas altas: las interacciones dbiles se rompen por aumento de la movilidad de los tomos o molculas. Detergentes: interfieren en las fuerzas hidrofbicas, es decir, las partes apolares de los detergentes interfieren con las partes apolares de los aminocidos y rompen as las fuerzas o puentes hidrofbicos. Un detergente muy utilizado es el SDS (dodecil sulfato de sodio). Concentraciones elevadas de sustancias orgnicas: son polares y compiten en la formacin de los puentes de hidrgeno. Como por ejemplo: el etanol y la acetona. Agentes desnaturalizantes: actan sobre todos los tipos de enlaces (urea 8M). Agentes reductores: rompen los puentes disulfuro de las protenas (nicas fuerzas covalentes). Por ejemplo el -mercaptoetanol.

Un ejemplo de desnaturalizacin de protenas es la desnaturalizacin y renaturalizacin de la ribonucleasa.

Si las condiciones de desnaturalizacin no son muy drsticas, se pueden renaturalizar. Una seal de la desnaturalizacin es la precipitacin de la protena. 7. CLASIFICACIN Y CARACTERSTICAS DE LAS PROTENAS Las protenas se pueden clasificar: Segn su funcin: o Enzimas. o Protenas de transporte: Hemoglobina (O2). Lipoprotenas (transporte de lpidos en el plasma). Protenas de transporte a travs de membranas.

o Protenas nutrientes y de reserva: En la semilla del trigo, maz y arroz. Ovoalbmina. Casena. Ferritina (almacena hierro).

o Protenas contrctiles: Actina y miosina (clulas musculares y otras). Tubulina y dinena (cilios y flagelos).

o Protenas estructurales: Colgeno, Queratina, Fibrona.

o Protenas de defensa: Anticuerpos (sistema inmunolgico). Fibringeno y trombina. Toxinas y Venenos.

o Protenas reguladoras: Hormonas. Protenas G. Protenas reguladoras de la expresin del DNA.

Segn su composicin: o Homoprotenas o no conjugadas: slo con la cadena polipeptdica pueden cumplir su funcin. o Heteroprotenas o conjugadas: Es necesaria la presencia de una parte no proteica para cumplir su funcin, se denomina grupo prosttico y puede ser un grupo metlico, una estructura orgnica, una coenzima (grupo prosttico de una enzima que no se une de forma permanente a la cadena proteica), ms complejo que se une a enzimas.

Segn su estructura: o Protenas fibrosas: son alargadas y slo llegan al nivel de la estructura secundaria por lo que no se pliegan. Sus funciones suelen ser estructurales, de soporte. Distinguimos varios tipos: -queratina: es una protena formada por -hlices. Un cabello est formado por muchas clulas muertas en cuyo citoplasma slo hay macrofibrillas a modo de haces y estas macrofibrillas estn formadas por la asociacin de numerosas microfibrillas que estn formadas por la unin de 9 filamentos alrededor de 2 centrales (tpica estructura 9+2). Se les llama protofibrillas que estn formados por la asociacin de 4 -hlice, las cuales se enrollan entre ellas por parejas (2 -hlices dextrgiras) en sentido levgiro.

En la -queratina hay un elevado contenido en cistena, por lo que la protena es rica en puentes de disulfuro a diferencia del colgeno. Una fibra de -queratina puede estirarse una dos veces su longitud si aplicamos calor hmedo ya que algunos puentes de disulfuro y puentes de hidrogeno se habrn roto y la protena adopta conformacin . Reacciona poco qumicamente y por tanto es muy abundante. Se encuentra en la piel y en rganos anejos. Se forma por 2 -hlices (tienen un pequeo dominio globular en uno de sus extremos) se unen dando un dmero que se enrollan entre ella. En un segundo paso se enrollan dos dmeros dando un tetrmero llamado protofilamento. Dos protofilamentos se sitan prximos dando una protofibrilla. stas se disponen 2 en el centro y 9 alrededor de un cilindro, formando varias microfibrillas. stas se unen en un mismo haz dando macrofibrillas. Un pelo est formado por clulas muertas atravesados por multitud de macrofibrillas. Los -hlices son ricas en cistenas y se forman muchos puentes de disulfuro para dar cada estructura. La matriz que queda est cementada con alto contenido en azufre. -queratina: es una protena formada por lminas que aparece como consecuencia de aplicar calor hmedo a una -queratina pero al enfriarse revierte espontneamente a la conformacin -hlice. Ello es debido a que los grupos R de los -queratinas son por trmino medio mayores que los de las -queratinas y no son por tanto compatibles con una conformacin . Es poco frecuente por su menor estabilidad. Colgeno: es la protena ms abundante en los animales vertebrados y unicelulares. Es una protena extracelular que se sintetiza en el interior de las clulas del tejido conjuntivo. El colgeno se organiza en fibras insolubles y su principal caracterstica es que soportan con fuerza tensiones.

El colgeno est formado por hlices levgiras y tres de estas hlices se enrollan entre ellos en sentido dextrgiro formando una molcula de tropocolgeno (el que estn formados por hlices levgiras no significan que sean hlices). La estructura secundaria del colgeno es de una triple hlice de cadenas polipeptdicas, cada una es una hlice levgira, en la que de cada 3 aminocidos, uno de ellos es una glicina, 0y cada 4 es una Prolina. La glicina permite que estas tres cadenas estn muy compactadas, y se enrosquen entre s y la Prolina forma los codos y permite que haya muy pocos aminocidos por paso de rosca. Estas triples hlices de tropocolgeno se van asociando unas con otras en forma de hlice y constituyen las fibras de colgeno. Los enlaces son los puentes de hidrogeno entre cadenas y un tipo especial de enlace covalente tpico del colgeno. Entre varias triples hlices existen tambin estos enlaces covalentes. Este enlace covalente slo aparece en el colgeno cuando se encuentran dos cadenas de lisinas (aminocidos con un grupo amino extra) acta sobre ellos la enzima lisoxidasa, que oxida el grupo amino a grupo aldehdo, obtenindose unos derivados de la lisina denominados aldisina, que sufren una condensacin aldlica, y forman un enlace cruzado covalente. Las molculas de colgeno son muy ricas en hidratos de carbono, por tanto el colgeno es una glucoprotena. El colgeno es una protena extracelular aunque su sntesis tiene lugar dentro de la clula y, en concreto, se sintetiza en los ribosomas del Retculo Endoplasmtico Rugoso. En primer lugar la sntesis de las cadenas pro-. Luego se hidroxilan si las prolinas y las lisinas dentro del Retculo Endoplasmtico Rugoso. La protena se glicosila en las conexiones entre el Retculo Endoplasmtico Rugoso y el Retculo Endoplasmtico Liso.

A continuacin, estas cadenas pasan al aparato de Golgi donde termina la glicosilacin y se forma la triple hlice del procolgeno. Una vez trenzado lo suficiente y gracias a la Exocitosis, se forman evaginaciones y salen las triples hlices que no estn enroscadas del todo y tienen unas secciones de carboxilo y amino terminales, de cada una de las cadenas, que constituyen los pptidos seal y que poseen una doble funcin: Evitan que las triples hlices de procolgeno (no maduro) crezcan demasiado y hagan reventar las vesculas. Son muy ricos en aminocidos hidrofbicos lo que permite atravesar la membrana plasmtica y salir fuera. Cualquier molcula polares no pueden pasar la membrana pero esos pptidos de seal permiten entrar y abrirse camino entre las cosas hidrofbicas.

Los pptidos seal se rompen mediante peptidasas, estos se asocian formando microfibrillas, que a su vez se unen para formar las fibras de colgeno. Elastina: la elastina no presenta estructura regular secundaria sino cadenas polipeptdicas que tienen conformacin al azar debido a que estas cadenas son extremadamente flexibles y mviles dado que las cadenas polipeptdicas se unen por algunos enlaces covalentes. Est formada por pequeas cadenas peptdicas y entre ellas se ven puentes, que al estar plegadas pueden estirarse y volver a su posicin inicial (es elstico y por ello est en tejidos elsticos como paredes de arterias). Los puentes de entrecruzamiento son puentes covalentes, que al colocarse cerca, 4 cadenas laterales de 4 lisinas, de las cuales 3 de ellas han pasado su amino a aldehdo L-altisinas, se forma una estructura que une 3 cadenas de 3 lisinas de distintas cadenas polipeptdicas. Esta estructura covalente se llama desmosinas (formado por el entrecruzamiento de diferentes monmero con tres molculas de lisina).

o Protenas globulares: poseen cadenas polipeptdicas muy plegadas en estructuras tridimensionales compactas. La mioglobina y la hemoglobina, son miembros de la familia de las globinas y encargadas del transporte y almacenamiento de O2 en la sangre. La hemoglobina y la mioglobina se diferencian en que la mioglobina est formada por una cadena polipeptdica, es decir, monomricas, mientras que la hemoglobina est formada por 4 subunidades semejantes, pero no idnticas a la mioglobina, por todo es un tetrmero. Mioglobina: es una protena conjugada o heteroprotena, es decir, adems de la cadena polipeptdica posee un grupo prosttico no proteico. La cadena polipeptdica tiene 8- hlices ms o menos largas unidas por lazos y formando entre ellas ngulos de 45. Adems de la cadena polipeptdica hay un grupo llamado grupo hemo, que tiene una parte orgnica a la cual se le une un tomo de Fe. La parte orgnica se denomina protofibrina 9 y est formada por 4 ncleos o anillos pirrlicos a los que se les une 4 metilos, 2 vinil y 2 cidos propanoicos (estos dos ltimos son la nica parte polar de la protofibrina 9 ya que todo lo dems es apolar e hidrofbico). El sexto enlace puede estar libre cuando la mioglobina no transporta nada. Puede estar unido al O2 en el momento en el que est almacenndolo, o unido a agua, cosa que no debe ocurrir ya que el agua oxida al tomo de Fe a in frrico y lo incapacita para transportar O2. Con esto se pueden distinguir tres estados de la mioglobina: Cuando no est unido al O2: desoximioglobina. Cuando est unido al O2: oximioglobina. Cuando est unido al agua: ferrimioglobina.

El 80% de la protena es - hlice con su plegamiento. Estas hlices se disponen de tal forma que dejan una cavidad hidrofbica donde se instala el grupo hemo.

El plegamiento de las globinas no surge de la repeticin de motivos, sino que las -hlice giran aproximadamente 45 unos respectos a otros y se mantienen unidas mediante interacciones no covalentes entre ellas. La mioglobina cumple con el tener todos los residuos hidrofbicos hacia dentro y las cadenas polares hacia fuera ya que es una protena soluble. La configuracin espacial de la mioglobina est condicionada por la unin del grupo hemo, de tal manera que la cadena unida al grupo hemo tiene un 80% en -hlice, si le quitamos el grupo hemo a la protena a pH cido (as rompemos los enlaces de coordinacin) nos queda la cadena polipeptdica llamada apomioglobina en la que slo un 60% de los aminocidos estn formando -hlices, es decir, el grupo hemo ayuda a formar las -hlices. Si desnaturalizamos la apomioglobina, sta presenta un 0% de -hlice. Podemos decir que la presencia del grupo hemo ayuda a la cadena polipeptdica a plegarse correctamente. La cadena polipeptdica tambin ayuda al grupo hemo a instalarse en la mioglobina, si solubilizamos el grupo hemo en agua, el tomo de Fe se encuentra en forma frrica (siendo inactivo). La cadena polipeptdica ayuda al grupo hemo a mantenerse en estado ferroso, y por tanto ayuda a que cumpla su funcin. El plegamiento crea una especie de bolsillo hidrofbico, donde entre en grupo hemo, y mantiene el Fe en estado ferroso. El CO es muy peligroso porque tiene mayor afinidad por el tomo de Fe del grupo hemo que el O2, aunque esta afinidad disminuye cuando el grupo hemo est en la cadena polipeptdica. Se debe a razones estricas. En las cercanas del grupo hemo, existe otra histidina, denominada histidina distal en posicin E7 que no establece enlaces con el grupo, pero se sita muy cerca. El CO va entorpeciendo su entrada en el grupo hemo por esta histidina distal, mientras que el O2 entra ms fcilmente. Cuando la mioglobina se une a la molcula de O2, cambia su configuracin espacial. Este efecto se llama alosterismo.

Tiene 6 enlaces de coordinacin: 4 enlaces del Fe se unen al nitrgeno de la protoporfirina y, dos que salen del plano se unen a una histidina F8 (cadena polipeptdica) y el otro est disponible para el O2. El CO tiene mucha afinidad por el Fe de la mioglobina (Toxicidad). Esto se debe a su facilidad en disolucin acuosa, de formar un ngulo de 90. En la molcula de mioglobina aparece otra histidina distal (E7), que se aproxima al Fe (aparte de la histidina proximal F8), impidiendo la formacin del enlace CO con el Fe perpendicular y limitando la afinidad del grupo (se reduce la toxicidad). El Fe tiene coordinacin Oh en el plano: 4 con la protoporfinina 9 y 2 perpendiculares. El grupo hemo queda en estado ferroso por estar en una hendidura (bolsillo) hidrofbico evitando el contacto con el agua, que da la oxidacin. P50 Presin parcial de O2 a la que el 50% de los tomos de Fe estn ocupados. La P50 de la mioglobina es muy baja, tiene mucha afinidad por el O2 y le cuesta mucho soltarlo. Por ello la mioglobina es mejor como almacn y slo suelta poco a poco a la hemoglobina que lo transporta. Hemoglobina: es una protena transportadora de O2, que se encuentra en los eritrocitos o glbulos rojos de la sangre de los vertebrados. La hemoglobina es una protena tetramrica, es decir, formado por 4 subunidades semejantes aunque no idnticas. Dos de ellas se denominan cadenas (1 Y 2) y las otras dos son (1 y 2). Cada una de las cadenas tiene un grupo hemo unido mediante enlaces no covalentes, por lo que la hemoglobina es capaz de transportar hasta 4 molculas de O2.

Ambas molculas, mioglobina y hemoglobina, son molculas transportadoras de O2, pero la hemoglobina transporta el O2 a travs de la sangre, y la mioglobina en cambio, es transportadora y almacenadora de O2 en los msculos. La mioglobina funciona al ir aumentando la presin de O2: los tomos de Fe se van ocupando de O2. Al aumentar mucho la presin de O2 los Fe de la mioglobina se saturan: curva de saturacin.

La representacin grfica del porcentaje de saturacin de la hemoglobina frente a la presin parcial de O2, es signoidal, mientras que una representacin anloga para la mioglobina del msculo muestra una curva hiperblica. Se observa que la mioglobina, a bajas presiones de O2 se encuentra muy saturado, es decir, hay muchos grupos hemos unidos al O2, mientras que en la hemoglobina a bajas presiones de O2 no hay grupos hemo unidos al O2, y estos aumentan al aumentar la presin (concentracin) de O2. P50 es aquel valor de presin de oxgeno para el que la mitad de los grupos hemo estn unidos al O2. Para la mioglobina P50=1, y para la hemoglobina P50=26. Cuanto mayor sea la presin de O2, mayor ser la capacidad de saturacin de O2 por la protena, es decir, mientras que la afinidad de la hemoglobina por la primera molcula de O2 es respectivamente baja, la segunda, tercera y cuarta molculas de O2 se unen con una afinidad mayor. Este fenmeno recibe el nombre de fenmeno de cooperatividad, es decir, la unin de un ligando a la cadena polipeptdica le facilita la unin de otros ligando a esa misma cadena.

Al entrar la primera molcula de O2 cambia de conformacin la primera cadena, es decir, se da el alosterismo. Este cambio de conformacin se pone de manifiesto cuando va a entrar la segunda molcula de O2 y este cambio a la tercera y a la cuarta. Debido al fenmeno de cooperatividad, la hemoglobina es mucho ms que la simple suma de 4 mioglobinas. La primera cadena que se oxigena es la 1. Lo que sucede en la primera oxigenacin es que el tomo de Fe al unirse al O2 disminuye su dimetro y entra en el hueco de la protofibrina IX y se lleva consigo la histidina proximal con lo que hay un movimiento en la hlice F, el cual se transmite a las dems hlices. La diferencia de comportamiento entre la mioglobina y la hemoglobina es muy importante debido al alosterismo. Cuando una molcula de O2 tiene que entrar en la primera subunidad de la hemoglobina, tiene que romper una serie de puentes salinos o uniones inicas por lo que el primer O2 tiene muchas dificultades para entrar ya que tiene que romper algunos enlaces que estabilizan a la forma desoxigenada, al segundo O2 tiene ya algunos puentes salinos rotos, y le cuesta menos trabajo entrar, y as hasta el cuarto O2. La afinidad de la hemoglobina por el O2, a diferencia de la mioglobina, se ve afectada por una serie de factores externos: Efecto de Bohr: cambios pequeos tienen influencia en la funcin de la hemoglobina. El efecto de Bohr es una disminucin de pH da lugar a una liberacin de O2 que disminuye la afinidad. Al bajar el pH (aumenta el CO2 en el medio por el metabolismo y ste acidifica) disminuye la afinidad por el O2 y la hemoglobina toma el CO2 del medio regulando el pH y transportndolo. La hemoglobina a pH ms bajo va aumentando su P50 (la curva se desplaza a la derecha). La hemoglobina no transporta el CO2 y los H+ con el grupo hemo.

Cuando la hemoglobina llega a los tejidos encuentra mucho CO2 (medio cido), bajo el pH. Esta bajada de pH hace que la hemoglobina pierda afinidad por el O2, y lo suelta (efecto Bohr). En los alveolos llega con el CO2 y al haber un pH mayor suelta el CO2 y coge el O2. El mecanismo del efecto Bohr consiste en que para entrar el O2, debe romper puentes salinos entre cadenas de la hemoglobina. Los puentes salinos se dan entre cadenas laterales de asprticos y argeninas, entre coo- terminales y lisinas, y entre coo- y NH3+ terminales. Cuando baje el pH, la histidina se protona y establece sus puentes con el asprtico ms fcilmente. Al aumentar el pH, la histidina pierde H+ y se limitan los puentes de hidrgeno. El O2 tiene ms dificultad para entrar cuando el pH es bajo pues se estabilizan los puentes de hidrgeno (desoxihemoglobina). Cuando hay pocos puentes salinos (pH alto) el O2 entra mejor (oxihemoglobina). El CO2 se transporta disuelto en el plasma o como carbonatos unidos a los aminos terminales. Los protones que acompaan al CO2, se transportan con la histidina 146. BPG (2,3-bisfosfoglicerato): se encuentra en los glbulos rojos en alta concentracin a pH=7 tiene 4E. se coloca un BPG en el medio de una hemoglobina estableciendo enlaces con NH3+ terminales. Establece puentes salinos adicionales con la hemoglobina disminuyendo la afinidad de la hemoglobina por el O2 (ms puentes salinos, ms dificultad para entrar). Por ello, la presencia de BGP en la sangre permite que la hemoglobina suelta el O2 para que lo utilicen las clulas. La hemoglobina fetal (Hb F) es diferente a la adulta, ya que tiene ms afinidad por el O2 que la hemoglobina materna. Esto es una ventaja para que el O2 pase de la madre al hijo (la sangre no se comunica). El BGP y al hemoglobina b F se unen con menos fuerza y esto determina este hecho.

Esto es porque una histidina de la hemoglobina b F ha sido sustituida por una serina (menos carga, menos puentes salinos, ms afinidad por el O2). Los organismos adultos tenemos hemoglobina A (adulta), en cambio, el feto no sintetiza hemoglobina A, sino que sintetiza cadenas de hemoglobina F (fetal). La hemoglobina F en lugar de tener dos cadenas y dos cadenas tiene dos cadenas y dos cadenas , que se parecen a las pero no son idnticas. La hemoglobina F tiene una afinidad por el O2 mayor que la hemoglobina A. las cadenas se unen al BPG con menos fuerza que las de los adultos, y por tanto los glbulos rojos fetales actan como si tuvieran muy poco BGP ya que hay menos puentes salinos. 8. ENFERMEDADES GENTICAS DE LA HEMOGLOBINA: Anemia falciforme: la causa de esto es que el gen que codifica la sntesis de la cadena de la hemoglobina est afectado de modo que en vez de aparecer aminocido glutmico aparece una valina, que es hidrofbica, y en vez de aparecer aminocido cargado aparece un aminocido hidrofbico de la parte externa de la cadena y surgen as una serie de parches hidrofbicos, de tal manera que la molcula de hemoglobina fo rma fibras y deforma el glbulo rojo. Los glbulos rojos estn deformados. Es transmitida de padres a hijos. Se produce porque la hemoglobina tiene un glutmico cambiado por una valina. El glutamico (polar cargado) est afuera y la valina (apolar) se intenta esconder de ambientes acuosos, unindose con otra valina de otra cadena , deformndose la molcula y deja de transportar O2. Los homocigticos mueren, los heterocigticos tienen 50% de hemoglobina sana. Resisten a la malaria.

9. MODELO RECIENTE DE LA COOPERATIVIDAD:

Cuando hay poco O2 se oxigenan slo una unidad o como mucho dos de la molcula de hemoglobina, en lugares prximos (estado T). Cuando hay varios O2, se oxigena una unidad de cada dmero o ms (estado R). Por tanto no todas las hemoglobinas estn igual oxigenadas.