Glendaliz Maldonado Moreno Jem M. Morales Vzquez Mara R.

Gonzlez Rivera

Resumen Introduccin Metodologa Resultados y discusin Trabajos futuros Agradecimientos Bibliografia Mi experiencia

Los Puentes de hidrgeno han tenido una influencia decisiva sobre la estructura y funcin del DNA. Ellos han sido ampliamente estudiados. Se le conoce en abundancia que el aumento en el nmero de interacciones de puentes de hidrgeno puede aumentar la estabilidad del complejo formado. Sin embargo, pocos estudios se muestran las diferentes interacciones que pueden surgir entre las especies que tienen mltiples posibilidades de formar puentes de hidrgeno. Con el propsito de adquirir una mejor comprensin de estas interacciones, se ha estudiado los puentes de hidrgeno entre: citosina, adenina, guanina, timina y uracil con las 22 bases de lo que se llama "molculas del futuro".

Los anillos heteroaromticos son comunes en pequeas molculas bioactivas, las que funcionan como buen modelo para explorar trabajos en este campo. (1) Normalmente esto conduce a numerosas aplicaciones: Bioqumica, Farmacologa, Qumica y Biologa Molecular (2), las que tambin dan un buen punto de comienzo para estudios Fsico-Qumico. (3)

Se estudiaron y se calcularon todas las molculas MOL 1 a MOL 22 en conjunto con Adenina (A), Citocina (C), Guanina (G), Timina (T) y Uracil (U) constituyentes de DNA y RNA. EL programado utilizado para efectuar todos esto procedimientos fue HYPERCHEM versin 7.1 con un gradiente de 10-6 y el mtodo semiempirico AM1 y PM3.

La tabla 1 informa el Hf de A, C, G, T y U (en Kcal/mol) en la cual Uracil presenta el valor ms negativo, indicando probablemente su alta estabilidad. La tabla 2 se muestra los Hf de las MOL de 1 al 22. La mayora de los valores son positivos a excepcin de MOL 8 y MOL 19.

DNA Adenina Citocina Guanina Timina ARN Uracil MOL 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

-54.000 +

Hf kcal/mol 86.610
+ 2.585 +48.635 -61.303

Tabla 1
Hf kcal/mol

Hf kcal/mol (AM1) +1.738 +45.896 +21.099 +7.953 +21.575 +29.853 +24.243 -11.398 +55.059 +81.740 +120.005 +45.269 +111.584 +45.269 +13.879 +48.954 +19.026 +23.993 -8.715 +59.861 +46.009 +48.091

Hf kcal/mol (PM3) -16.382 27.799 -15.928 -21.727 4.413 15.495 6.541 -27.688 30.951 84.763 99.731 33.282 81.380 88.639 -12.352 12.725 -0.887 14.624 -18.526 42.615 37.261 38.862

Tabla 2

Todas las geometra resultaron ser planas a excepcin del MOL 9, MOL 13 y MOL 17, las cuales muestran un H unido a N con hibridizacin sp3 con ngulos fluctuando de 113.06 a 116.24 . La molcula que se aleja ms de un plano molecular es MOL 14 mostrando una geometra cncava siendo el ngulo de la concavidad 147.16 . Las tablas 3, 4, 5, 6 y 7 se muestran los Hf de los MOL 1 al MOL 22 con adenina, citosina, guanina, timina y uracil en los distintos puentes de hidrgenos que se pueden formar. La formacin 9 es ms favorecida en dichas tablas son las de timina y uracil.

Bonds OH-N N-H..N

Distance (A0)exp. 2.80 3.00

Distance (A0)theoretical 3.10 3.48

Con la finalidad de revisar nuestros clculos se llevo a cabo el clculo del puente hidrgeno formando entre timina y adenina. Las tablas 8 a la 12 se calcula la formacin del puente de hidrgeno a partir de sus componentes utilizando H f = p es el aducto y H f r son Hf p H f r en que Hf las molculas que forman el aducto. Las tablas 13 a la 17 se muestran las distancias hidrgeno y oxgeno (OH-N) e hidrgeno y nitrgeno (HN-H).

Citosina con la MOL 22

Nuestro trabajo es un paso inicial para entender las interacciones entre bases de ADN y otras bases de inters no estudiadas ni sintetizadas an.

Decanato de Estudiante; el Dr. Juan Varona, Rector de la Universidad de P.R. en Cayey; Instituto de Investigaciones Interdisciplinarias junto con el programa BRIC. Igual queremos agradecer a otras entidades privadas como: Hospital Menonita, Dr. Cadi, Dr. L. Vera, Cooperativa Aibonitea. Tambin queremos agradecer a nuestra compaera Natalia Prez Coln por su colaboracin en nuestro trabajo.

(1) W.R Pitt et al ., J Med Chem 2009. 52, 2952. (2) Stephen C. Case And Edwin M. Southern., Nucleic Acids research, 1994, 22, 131. (3) Mara E. Costo, Rodolfo A. Chavez., J. Phys. Chem. A 1997, 01, 8308. (4) Klaus Weiszatal., J. Phys. Chem. A., 2003, 109, 1703., L. Pauling And Corey, Arch. Biochem. And Biophys. 65, 164-81 (1956).