Escuela de Ingenieria Ambiental Microbiologa Ambiental TAXONOMIA BACTERIANA

Mblgo. Dr Enrique A. Martin Alva

rbol construido a partir de la comparacin de las secuencias de los ARNr 16S y 18S 1977 (Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 74:4537- 5088) 1990 ( Hacia un sistema natural de organismos : Propuesta de los dominios Archaea,Bacteria y EuKarya)

Quimiorganotrofos

Evolucion lenta Antiguedad Hipertermofilia Quimiolitotrofia del H

Fototrofo Oxigenico

Fototrofos,Quimiolitotrofos,Quimiorganotrofos 2 SUBGRUPOS : % GC Mas Numeroso , 5 subgrupos (Arn 16s):

Dominio Bacteria

Clasificacion y Filogenia de las bacterias

Definicin de especie en Microbiologa: grupo de cepas (clones celulares) que mostrando entre si un grado elevado de semejanza fenotpica general, difieren en muchas caractersticas de otros grupos de cepas relacionadas (Stanier). TIPOS Y CRITERIOS DE CLASIFICACIN BACTERIANA

Tipos de Clasificacin artificial numrica o adansoniana filogentica: las relaciones se establecen en base a criterios evolutivos. Que caractersticas se utilizan para clasificar las bacterias? Caracteres fenotpicos. Caracteres bioqumicos. Caracteres genticos - Composicin de bases del DNA (%G+C) - Secuencias de rRNAs, la ms utilizada actualmente.

rRNA: reloj molecular. El grado de semejanza de las secuencias de rRNA es una indicacin de la distancia filogentica entre microorganismos.

El BERGEYS. PRINCIPALES DIVISIONES DE LAS BACTERIAS

El Bergeys es la principal fuente de referencia para los microbilogos. Contiene la descripcin de todos los gneros y especies establecidos. Volumen 1 (2001) The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria Volumen 2 (2005) The Proteobacteria Volumen 3 (2009) The Firmicutes Volumen 4 (previsto 2010) The Bacteroidetes, Planctomycetes, Chlamydiae, Spirochaetes, Fibrobacteres, Fusobacteria, Acidobacteria, Verrucomicrobia, Dictyoglomi and Gemmatimonadetes Volumen 5 (previsto 2010?) The Actinobacteria

Bacterias Fotosinteticas
Existen tres grupos de bacterias Gram- fotosintticas:
CIANOBACTERIAS BACT. ROJAS anoxignica especficos BACT. VERDES anoxignica especficos bacilar y filamentosa bac.: inmviles fil.: deslizamiento ciclo reductor ATC Si cond. anaer. nula/amplia

Fotosntesis Pigmentos Morfologa Motilidad

oxignica sim. plantas

filamentosa y unicel. unicelular inmviles o por deslizamiento por flagelos

Fijacin CO2 Fijac. del N2 Heterotrofa

ciclo de Calvin Si con heterocistes escasa

ciclo de Calvin Si cond. anaer. escasa/amplia

Desde un punto de vista filogentico se dividen en:

Nombre comn Cianobacterias Phylum Cyanobacteria Del azufre No del azufre Del azufre No del azufre Proteobacteria Proteobacteria Chlorobi Chloroflexi

Bacterias rojas

Bacterias verdes

Fotoquimica de las Bacterias Fototrofas

CIANOBACTERIAS Muy diversas morfolgica y genticamente. Algunas formas filamentosas fijan nitrgeno por medio de heterocistes, que se desarrollan a partir de una clula vegetativa que pierde la capacidad fotosinttica y de fijar CO2. Gneros: - Sin heterocistes: Oscillatoria y Spirulina - Con heterocistes: Anabaena y Nostoc. BACTERIAS ROJAS Incluidas en el phylum Proteobacteria. Unicelulares, mviles por flagelos. Metablicamente muy verstiles: - condiciones anaerobias y luz: fijan N2 y crecen fotoautotrficamente o fotoheterotrficamente - sin luz: quimiohetertrofas. Se dividen en dos subgrupos: del azufre y no del azufre.

1.- BACTERIAS FOTOSINTETICAS NO PROTEOBACTERIAS

En este grupo se incluyen las bacterias fotosnteticas que no pertenecen a las Proteobacterias. Se trata de bacterias que realizan Fotosntesis oxignica, Cianobacterias y Phrochlorales (Oxifotobacterias) y otras que llevan a cabo Fotosntesis anoxgenica : Bacterias verdes del Azufre y Bacterias verdes no del Azufre (Anoxifotobacterias) La relacin filogentica entre estos grupos es distante como indica la posicin que ocupan en el rbol filogentico.Diapositiva 3 De ellos, el grupo de bacterias verdes no del Azufre es el mas antiguo desde el punto de vista evolutivoDiapositiva 3

OXIFOTOBACTERIAS y ANOXIFOTOBACTERIAS
OXIFOTOBACTERIAS: CIANOBACTERIAS : Anabaena, Spirulina, Oscillatoria, Nostoc, Synechococcus. PROCHLORALES: Prochloron, Prochlorococcus ANOXIFOTOBACTERIAS: BACTERIAS VERDES DEL AZUFRE: Chlorobium, Pelochromatium BACTERIAS VERDES NO DEL AZUFRE: Chloroflexus,Chloronema

2.- OXIFOTOBACTERIAS
CIANOBACTERIAS. CARACTERISTICAS GENERALES Morfologa variada: unicelulares y filamentosas mviles por deslizamiento Presentan diferenciaciones celulares: Heteroquistes y Acinetos Realizan Fotosntesis Oxignica. Presentan Ficobilisomas Fijan Nitrgeno, producen Geosmina y Toxinas Se dividen por fisin binaria, gemacin o fisin mltiple Estn presentes en numerosos hbitat: Superficie e interior de rocas, suelos desrticos, estanques y lagos, en simbiosis con Hongos, Protozoos y plantas... Son componentes bsicos de los Estromatolitos. Hay restos fsiles de mas de 3000 millones de aos de antigedad. Probablemente fueron los primeros organismos productores de Oxgeno Actualmente 24 gneros: Chroococcus, Synechococcus, Anabaena, Spirulina, Nostoc, Oscillatoria...

Tipos Morfologicos
UNICELULARES FILAMENTOSAS (Tricomas)

Chroococcus

Nostoc

Oscillatoria

Colonias de 2 - 4 clulas

Cianobacteria ramificada

Anabaena

Se deslizan sobre superficies Fototaxia y Quimiotaxia positivas

Formas de Reproduccion
FISIN BINARIA FORMACIN Y SEPARACIN DE HORMOGONIOS : una forma de reproduccin de los filamentos

Ecologia
Muy tolerantes a condiciones ambientales extremas
Piedras volcnicas Suelos desrticos (costras) Superficie e interior de rocas (C. endolticas)

Ambientes acuticos
En estanques y lagos ricos en nutrientes (Afloramientos)
- Eutrofizacin - Produccin de Toxinas

Manantiales termales y geseres Simbiosis con

- Hongos - Protozoos - Plantas

Prochlorales: Caracteres generales

Son fottrofos oxignicos con clorofila a , b o d pero carecen de ficobilinas. Muy emparentados filogenticamente con Cianobacterias El grupo contiene especies de vida libre, Prochlorothrix, Prochlorococcus y Acaryochloris que son componentes mayoritarios del plancton y simbiontes, Prochloron, en la cavidad cloacal de Ascidias Prochlorococcus, contiene clorofila a divinlica y alfa caroteno Acaryochloris contiene clorofila d

Prochlorothrix

Acaryochloris

Prochloron

3.- ANOXIFOTOBACTERIAS Bacterias Verdes del azufre :Caractersticas Generales

Son Anoxifotobacterias que utilizan como donadores de electrones SH2 y a veces SO4 2La mayora auttrofos Morfologa muy variada: cadenas de cocobacilos, formando entramados Mas antiguas que las Cianobacterias Muy alejadas filogenticamente de los otros dos grupos de anoxifotobacterias, Bacterias Prpura y Heliobacterias Poseen Bacterioclorofila a junto a c, d, o e y Carotenoides de color verde El aparato fotosinttico est localizado en Clorosomas y membrana plasmtica Viven a grandes profundidades Algunas forman Consorcios con bacterias quimiorganotrofas Gneros representativos: Chlorobium, Pelochromatium, Pelodictyon

Morfologia

Chlorobium : Grnulos de Azufre

Pelodictyon : Entramado tridimensional

Consorcios

Pelochromatium roseum

Chlorobium aggregatum

Bacterias Verdes No del Azufre. Caracteres Generales

Lnea filogentica propia, muy distante de las bacterias verdes del Azufre. Es una lnea evolutiva muy antigua Poseen bacterioclorofila a o c Utilizan sustancias orgnicas como donadores de electrones Poseen Clorosomas Viven en aguas termales donde forman biopelculas Gneros representativos: Chloroflexus, Chloronema

Chloroflexus

Filamentos de Chloronema creciendo en un lago estratificado

GENEROS DESCRITOS
Anabaena Acaryochloris Chlorobium Chloroflexus Chloronema Chroococcus Nostoc Oscillatoria Pelochromatium Pelodictyon Prochloron Prochlorothrix

Proteobacterias
Las Proteobacterias son un grupo de bacterias extenso y complejo, 1300 especies en 384 gneros. Todas relacionadas filogenticamente pero muy variables en morfologa, fisiologa y modo de vida. Son Gram negativos. Estn representados todos los tipos nutricionales principales: Fottrofos, Hetertrofos y Quimiolitotrofos. Incluye muchas especies importantes para la industria, medicina e investigacin biolgica: Escherichia, Neisseria, Rhizobium, Salmonella.. El filum se divide en cinco grupos en funcin de las secuencias del RNAr, y preferencias nutricionales , son:

1. 2.
3.

4.
5.

Alfa Proteobacterias, incluye la mayora de formas oligotrficas. Beta Proteobacterias, especies que suelen utilizar sustancias procedentes de la descomposicin orgnica anaerobia. Gamma Proteobacterias, grupo amplio y complejo quimiorganotrofos, anaerobios facultativos y fermentadores; tambin especies aerobias, fotosintticas y oxidadoras del Azufre. Delta Proteobacterias, contiene especies depredadoras, formadoras de cuerpos fructificantes, anaerobias, etc. Epsilon Proteobacterias, son las menos numerosas, a l pertenecen Campylobacter y Helicobacter

Divergencia Evolutiva

Grupos de Proteobacterias
BACTERIAS FOTOSINTTICAS PRPURA BACTERIAS QUIMIOSINTTICAS BACTERIAS METANOTROFAS Y METILOTROFAS GRUPO DE Pseudomonas BACTERIAS DEL CIDO ACTICO BACTERIAS DEL GRUPO DE Rhizobium (FIJADORAS DE NITRGENO) BACTERIAS ENTRICAS (ENTEROBACTERIAS) Vibrio y Photobacterium (VIBRIONACEAS) Pasteurella y Haemophilus ( PASTEURELLACEAS) Neisseria y relacionados Legionella Bordetella Brucella RIQUETTSIAS BACTERIAS CON VANA BACTERIAS ESPIRILADAS Y CURVADAS BACTERIAS GEMANTES y/o CON APNDICES BACTERIAS REDUCTORAS DEL SULFATO y DEL AZUFRE Bdellovibrio MIXOBACTERIAS Campylobacter y Helicobacter

BACTERIAS FOTOSINTETICAS PURPURA: CARACTERSTICAS GENERALES

Realizan fotosntesis anoxignica Poseen bacterioclorofilas a/b y carotenoides que proporcionan color marrn, prpura, rojo Su aparato fotosinttico se localiza en Cromatforos Obtienen energa por fotofosforilacin Se dividen en dos grupos dependiendo del donador de electrones: del Azufre no del Azufre Gneros representativos: Ectothiorhodospira, Thiospirillum, Chromatium, Rhodospirillum, Rhodobacter

Bacterias prpura del azufre

UTILIZAN SULFURO de HIDRGENO , AZUFRE ELEMENTAL Y OTROS COMPUESTOS REDUCIDOS DEL AZUFRE , TIOSULFATOS, COMO DONADORES DE ELECTRONES. ANAEROBIOS ESTRICTAS Y FOTOLITOTROFAS. TODAS DEL GRUPO GAMMA. VIVEN EN ZONAS ILUMINADA Y ANXICAS DE AMBIENTES ACUTICOS RICOS EN SULFUROS. (Lagos, manantiales ) LAS ESPECIES HALFILAS EXTREMAS (Halorhodospira) EN AMBIENTES SALINOS PAPEL IMPORTANTE EN FASES ANXICAS DE LOS CICLOS DEL AZUFRE Y DEL CARBONO

Chromatium

Thiospirillum

Bacterias prpuras no del azufre

UTILIZAN SUSTANCIAS ORGNICAS COMO DONADORES DE ELECTRONES . TAMBIN H2 Y A VECES SULFUROS, A BAJA CONCENTRACIN, PERO NUNCA AZUFRE ELEMENTAL. LA MAYORIA SON ANAEROBIOS Y FOTOORGANOTROFOS. VIVEN EN AMBIENTES ACUTICOS RICOS EN MATERIA ORGNICA Y CON BAJOS NIVELES DE SULFUROS

Rhodomicrobium

Rhodospirillum

Bacterias Quimiolitotrofas : CARACTERSTICAS GENERALES

Obtienen energa mediante la oxidacin de compuestos inorgnicos Son auttrofos, utilizan CO2 como fuente de Carbono Dependiendo de la sustancia oxidada se dividen en varios grupos:
Oxidadoras del Nitrgeno Oxidadoras del Azufre Oxidadoras del Hierro Oxidadoras del Hidrgeno

Muy importantes desde el punto de vista ecolgico por la actividades que realizan : intervienen en los ciclos biogeoqumicos del Nitrgeno, Azufre, Hierro y Carbono; Lixiviacin; drenaje cido; EDAR Gneros representativos: Nitrosomonas, Nitrobacter, Thiobacillus, Beggiatoa, Ralstonia

Grupos de Bacterias Quimiolitotrofas

Reacciones de oxidacin BACTERIAS OXIDADORAS DEL NITROGENO: NTRICAS ......................NO2 + O2 ---------->NO3BACTERIAS OXIDADORAS DEL AZUFRE S0 + H2O + O2 -------->SO4 2-+ 2 H+ BACTERIAS OXIDADORAS DEL HIERRO Fe 2++ H+ + O2--------> Fe 3+ + H2O BACTERIAS OXIDADORAS DEL HIDRGENO H2 + O2 ------------------>H2O
NITROSAS .....................NH4 + + O2 ------->NO2- + 2H+ + H2O

BACTERIAS OXIDADORAS DEL NITROGENO

REALIZAN EL PROCESO DE NITRIFICACIN. UTILIZAN EL AMONIO DE LODOS ACTIVADOS (EDAR) SE ENCUENTRAN EN SUELOS Y AMBIENTES ACUTICOS DE AGUA SALADA, DULCE O RESIDUALES CON ELEVADA CONCENTRACIN DE AMONIO. PUEDEN PROVOCAR EUTROFIZACIN

BACTERIAS OXIDADORAS DEL AZUFRE

OXIDAN EL SH2 PROVENIENTE DE LA DESCOMPOSICIN DE LA MATERIA ORGNICA Y EL PRODUCIDO POR LAS BACTERIAS SULFATORREDUCTORAS (Ciclo del Azufre)

BACT. OXID. DEL AZUFRE FILAMENTOSAS

FILAMENTOSAS Maraas formadas por bacterias filamentosas oxidadoras del azufre en un arroyo (Beggiatoa y otras)

Viven en aguas sulfurosas, lodos de fondos de lagos, aguas contaminadas con aguas residuales y fuentes hidrotermales submarinas.Rizosfera de plantas de suelos inundados Causan ENGROSAMIENTO en alcantarillado, lagunas de desechos industriales y EDAR (lodos engrosados) Thiothrix forma tapetes en ambientes acuticos azufrados

BACTERIAS OXIDADORAS DEL HIERRO

LIXIVIACIN DRENAJE CIDO

Gallionella _____pH Neutro

Acidithiobacillus ferrooxidans_____pHcido

BACTERIAS OXIDADORAS DEL HIDRGENO

QUIMIOLITOTROFOS FACULTATIVOS MICROAERFILOS POSEEN HIDROGENASAS, UNA O MAS, EN LA MEMBRANA PLASMTICA O EN CITOPLASMA MUCHAS ESPECIES SON CARBOXIDOTRFICAS Ralstonia , Alcalgenes , Pseudomonas, Paracoccus