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III.

La stroisomrie configurationnelle (ou isomrie configurationnelle)

La stroisomrie configurationnelle intresse lisomrie optique et lisomrie gomtrique. Elle concerne, spcifiquement, les drivs chiraux (les drivs dissymtriques) et les drivs thylniques et cyclaniques. 1. La stroisomrie optique (ou stroisomrie strique) Notion de chiralit Celui qui nclate pas de rire, lorsquil se penche pour regarder ses pieds nus, celui-l na soit aucun sens de lhumour, soit aucun sens de la symtrie (cit dans la rfrence bibliographique : C. Gros, G. Bonni, Lactualit chimique , mars 1995, pp. 9-15.), ainsi Descartes (1596-1650) exprima, le premier, la notion de chiralit mais sans la nommer. De fait, la chiralit est donc une proprit qui est lie lasymtrie. Elle sapplique aussi bien aux objets qui nous entourent quaux molcules. La plupart des objets de la vie quotidienne : le pas de vis, la paire de ciseaux, le tire-bouchon, les casseroles avec un bec verseur, les chaussures, les gants, lescalier enroul en spirale, etc., sont asymtriques et, par consquent, non superposables leur image dans un miroir. En 1898, Lord Kelvin appela cette proprit chiralit , du grec Kheir qui veut dire la main. Les objets dous de cette proprit sont ainsi qualifis de chiraux et ceux ne la prsentant pas sont dits achiraux. La chiralit nest pas, cependant, une proprit exclusive des seuls objets artificiels. Elle est aussi omniprsente dans la nature, dans le rgne tant animal que vgtal, ce qui poussa dailleurs Louis Pasteur (1893), car layant constat, dclarer : lunivers est dissymtrique . Ainsi, les mains, les pieds, les oreilles, les rotations des anticyclones, certaines plantes grimpantes (comme le chvrefeuille, le haricot rame, le houblon, etc.), la coquille descargot (figure 28a), les coquillages marins (tel le chank de lInde), etc., sont des exemples dobjets naturels chiraux. La chiralit sexprime aussi dans la nature lchelle molculaire. Ainsi, la molcule dADN, laquelle senroule de faon hlicodale, les enzymes des organismes vivants, les molcules participant aux processus de reconnaissance et de relais dinformation (telles les hormones), les glucides naturels, les acides amins naturels, constituants principaux des protines (figure 28b), etc., sont galement chiraux. Mais lon a remarqu que de nombreux objets chiraux et leurs images spculaires peuvent exister naturellement de faon panache dans des proportions trs diffrentes. Par exemple, il est observ quun seul escargot sur 57.000 prsente en moyenne une spirale gauche. Aussi, linstar des glucides et des acides amins naturels qui possdent, pour la plupart, le mme arrangement asymtrique, un objet chiral peut parfois exister dans la nature sous une seule forme chirale (rfrence
bibliographique : C. Gros, G. Bonni, Lactualit chimique, mars 1995, pp. 9-15.).

Figure 28. a) La coquille descargot, un exemple dobjet naturel chiral ;

b) Un couple dnantiomres dun acide amin chiral (R H COOH NH2)

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NH2 NH2
retournement de 180

NH2 HOOC H H

a) acide 2-aminothanoque
HOOC H H H H COOH

NH2

NH2
retournement de 180

NH2 HOOC CH3 H

b) acide 2-aminopropanoque
HOOC H CH3 H H3C COOH

apparis

2ccc NH 22 NH HOOC HOOC H CH3 CH H3 mal apparis HOOC

NH2 ar H H

a) acide 2-aminopropanoque (chiral)

b) acide 2-aminothanoque (achiral)

Figure 29 . Deux exemples d'acides amins chiral et achiral

an cn

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groupements -CH3 et -CH(Et)NMe2 prsente la fois une chiralit centrale et une chiralit plane), les configurations sont nonces dans lordre de priorit suivant : chiralit centrale > chiralit axiale > chiralit plane.
D C C D C C B D B C spiranes (chiralit axiale) A B et C D B Fe B D A C A A C C B A

Allnes nombre pair de doubles liaisons (chiralit axiale)

Biphnyles (chiralit axiale)

alkylidnes cycloalcanes (chiralit axiale)

A Fe B

A B Fe A B Fe

B A

A Ferrocne disubstitu en 1,2- (chiralit plane ou chiralit mtallocnique) Ferrocne disubstitu en 1,3- sur un cycle (chiralit plane ou chiralit mtallocnique) H3C A A B Fe B A B Fe A B A A B Ferrocne disubstitu en 1,2- (chiralit plane ou chiralit mtallocnique + chiralit centrale) B Fe B A NMe2 Fe NMe2 Fe H Et Cyclophane monsubstitu (chiralit plane) Et H CH3

Ferrocne disubstitu en 1,2- sur les deux cycles (chiralit plane ou chiralit mtallocnique)

Figure 30. Quelques exemples de molcules prsentant une chiralit axiale ou une chiralit plane.

Il est important nanmoins de noter que dans le cas particulier de la chiralit centrale, la dissymtrie molculaire nest pas toujours matrialise par lexistence dun carbone asymtrique. Un centre asymtrique ttradrique peut aussi tre symbolis par un lment du groupe 14 de la classification priodique : Si, Ge, Sn, Pb, etc,. De plus, des centres strogniques de types htroatomes : N, P ou Ar sont aussi observs dans les cas de structures ttradriques, de type ammonium ou phosphonium, ou darchitectures pyramidales trois substituants diffrents (figure 31).
Ph Si H H3C Ph Ge

Ph H Ph

O N R R = Me ; tBu

Ph Ph

O N

Et

N PhCH2O Base de Trger OCH3 C(CH3)2 CH2COOH Me Et P

nPr nPr

O P
Me

Ar Me Et
nPr

Ar HO Et
nPr

Et

Figure 31. Quelques exemples de divs du silicium, du germanium et d'amines, de ph osphines et d'arsines chiraux
(Rfrences biblographiques : a) A. Collet, J. Crassous, J.-P. Dutasta, L. Guy, "Molcules chirales : Strochimie et Proprits", Eds EDP Sciences, 2006 ; b) M. Madsclaire, "Stroisomrie. Gnralits et Incidence en Chimie Thrapeutique", Eds Ellipses)

Mais, dans les structures pyramidales asymtriques o latome dazote sert de centre chiral, la prsence du doublet liant est lorigine dun phnomne dinterconversion entre les deux images spculaires. Linversion du doublet non liant de lazote, qui est quelques fois appele flip-flop, est souvent trs rapide temprature ambiante au point quil est difficile disoler individuellement les deux images spculaires de la mme paire. On peut cependant ralentir linversion du doublet en augmentant la barrire dnergie par refroidissement trs basse temprature ou en incorporant lazote dans un petit cycle. Dans les petits cycles asymtriques qui portent lazote sur un sommet, linversion est, en effet, ralentie par les contraintes angulaires cycliques. Mais le flip-flop peut tre compltement

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annihil en prsence de substituants trs volumineux, tels ceux de la base de Trger figure 31, ou de substituants trs lectrongatifs. Les doublets non liants des phosphines et des arsines sinversent aussi, mais beaucoup plus lentement que celui des amines (figure 31).
NH2 NH 2 H HOOC H H 3 plans de symtrie (C-N et C-H) 4 plans de symtrie (C-H et C-H) OH OH HO H H Cis (achirale) 1 plan de symtrie Cis-cyclobutan-1,2-diol mais H H OH Trans (chirale) Trans-cyclobutan-1,2-diol H Cis (achirale) 1 plan de symtrie Cis-cyclobutan-1,3-diol OH Trans (achirale) 1 plan de symtrie Trans-cyclobutan-1,3-diol HO Cis (achirale) 1 plan de symtrie mais HO Trans (chirale) OH HO H H OH H 1 centre de symtrie (le mileu de C-C) H H H H H H O HOOC H H2N H NH2 COOH H O 1 centre de symtrie (le mileu de cycle) HO H3C N CH3 H N

1 plan de symtrie (C-N et C-C)

HO

Cis-cyclopropan-1,2-diol

Trans-cyclopropan-1,2-diol

Figure 32. Identification d'lments de symtrie dans quelques molcules achirales.

Mais, en y regardant de trs prs, nous nous rendons lvidence que lachiralit de lacide 2aminothanoque est cause par lexistence dun plan de symtrie dans la molcule. Celui-ci est dfini par les liaisons C-NH2 et C-COOH. Il est ainsi coplanaire au plan de la feuille. De la mme manire, lachiralit de la mthylamine ou celle du mthane (figure 32) sont provoques par lexistence de trois ou quatre plans de symtrie au sein des deux molcules. Ceux-ci sont dtermins, respectivement, par les couples de liaisons (C-N ; C-H) et (C-H ; C-H). Dans lexemple de lacide 2,3-diaminobutane-1,4-dioque, la prsence de deux strocentres na pas suffit pas pour confrer une chiralit la molcule. La raison est que celle-ci est, en ralit, symtrique. Mais la symtrie, pour ne pas dire lachiralit du diaminodiacide, dans sa conformation dcale de la figure 32, est due cette fois-ci la prsence non pas dun plan mais plutt dun centre de symtrie, savoir le milieu de la liaison centrale carbonecarbone. Cest dire que la condition ncessaire et suffisante pour quune molcule soit chirale est quelle ne prsente ni plan, ni centre de symtrie, encore moins un axe alternant Cn. Les deux premiers lments de symtrie sont, cependant, des cas particuliers du dernier, pour lesquels n est gal 1 ou 2, respectivement.
CH3 H3C CH3 N CH3 CH3 symtrie par rapport au plan P H3C CH3 N CH3 molcule achirale de dpart CH3

axe altern C2

rotation de 90 autour de l'axe C2

CH3 CH3

N H3C

molcule achirale

Figure 33.Un exemple de molcule achirale prsentant un axe de rotation-inversion. (Rfrence bibliographique : P. Caubre, "Comprendre et Apprendre la Chimie Organique", Eds PUN, 1987.)

Laxe alternant Cn permet de raliser deux oprations conscutives de rotation et dinversion, raison pour laquelle il est aussi appel axe de rotation-inversion. Ainsi, une molcule est chirale si lissue dune rotation dun angle de

Plan qui coupe un objet ou une molcule en deux moitis images lune de lautre dans un miroir. Point partir duquel deux substituants identiques sont joignables par une droite et par rapport auquel ceux-ci sont gale distance.

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2/n autour de laxe Cn puis dune symtrie par rapport un plan perpendiculaire celui-ci elle nest pas identique (ou nest pas superposable) elle-mme (figure 33). Et elle est achirale dans le cas contraire. Ds lors, pour estimer si une molcule (ou un objet) est chirale ou non, il ya lieu, dfaut de modles molculaires, de la dessiner avec son image spculaire et, ensuite, dessayer de superposer les deux. Mais, la faon la plus simple de savoir si elle est chirale ou non est de chercher la prsence de carbones asymtriques dans sa structure molculaire fondamentale et de marquer ceux-ci par un astrisque. Si un seul carbone asymtrique est prsent, la molcule tudie est chirale sans aucun doute. Cependant, comme dans lexemple du diaminodiacide et de certains des drivs cycliques de la figure 32, si plus dun carbone asymtrique (cest--dire deux ou plusieurs carbones asymtriques) est prsent, la molcule peut tre chirale comme elle peut ne pas ltre. Aprs le reprage de plusieurs carbones asymtriques au sein dune molcule, il convient donc de chercher la prsence ou non dun lment de symtrie, entre un plan, un centre et un axe alternant Cn. Mais ce dernier est plus difficile identifier. Notions dnantiomrie, dnantioslectivit et dexcs nantiomrique Les molcules chirales (de mme que les objets chiraux) sont lis leur image spculaire par une relation dnantiomrie. On dit, en consquence, que la molcule (ou lobjet) chirale et son image dans un miroir sont des nantiomres, des nantiomorphes, des isomres configurationnels, des isomres optiques, des antipodes optiques ou des inverses optiques. Dans le cas des molcules, en particulier, deux nantiomres ont la mme formule semidveloppe et la mme connectivit. Ils diffrent par leur configuration, cest--dire larrangement spatial ou la disposition des substituants autour du carbone ou des carbones asymtriques, ce qui correspond la dfinition donne la conformation. Chaque nantiomre est donc dans une configuration donne. Pareillement aux conformres, les nantiomres sont aussi des stroisomres. La diffrence entre ces deux types disomres rsulte du fait quun changement conformationnel se fait par rotation autour dune liaison (sans rupture de liaisons), tandis que le changement configurationnel exige la rupture dune ou plusieurs liaisons. Mlange racmique et mlange non racmique (ou mlange enrichi) Dans les cas de substances chimiques macroscopiques formes dun seul des deux nantiomres dune paire, on parle dhomochiralit et dit que la substance est homochirale, nantiopure, optiquement pure, nantiomriquement pure ou nantiomriquement rsolue ( raison de 100%). Et Louis Pasteur est souvent cit en exemple dans ce domaine : il fut, en effet, le premier avoir russi, en 1848, rsoudre (ou ddoubler) un mlange racmique de tartrate dammonium et de sodium. Il en isola les deux nantiomres par tri manuel des deux types de cristaux nantiomorphes. Mais, il est possible quun nantiomre, ltat pur, puisse entrer dans une transformation progressive qui mne un quilibre avec son image optique. On dit alors quil se racmise ou quil ya racmisation. Une substance chimique peut ainsi contenir les deux formes nantiomorphes dune molcule chirale. Si les proportions des deux nantiomres sont quimolaires ou sont dans le rapport 50/50 ou 1:1, cest--dire une

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reprsentation moiti-moiti ou 50% de chaque, le mlange est appel mlange racmique, racmique ou racmate. Un mlange racmique a des proprits physiques diffrentes de celles des nantiomres le composant, lorsque ces derniers sont considrs isolment. En revanche, si le mlange est non racmique ou enrichi, cest--dire si lun des nantiomres de la mme paire est prdominant, on parle dans ce cas de mlange partiellement ddoubl ou partiellement rsolu et dnantioslectivit. Un tel mlange est compos dun racmate, qui est appel reste racmique, et dune part excdentaire qui est compose uniquement de lnantiomre majoritaire, cest--dire ne rentre pas dans la composition du reste racmique. Par exemple, considrons un chantillon dun produit chimique qui contient 70% dun nantiomre A et 30% de son image optique A. Celui-ci est alors form de deux parts dont lune est un reste racmique, dune composition 30% de A et 30% de A. La deuxime part est constitue uniquement de A. Elle reprsente 40% du mlange initial de la part de A qui excde le reste racmique. Il est important toutefois de signaler que la notion dnantioslectivit se rapporte le plus souvent la raction qui a donn lieu la substance chimique enrichie elle-mme. Une telle raction est dite nantioslective pour la simple raison que la formation de lun des nantiomres est favorise sur celle de lautre. Et son nantioslectivit est mesure par lexcs nantiomrique (ou ee en abrg). Ce dernier permet de quantifier, dans un milieu ractionnel ou dans une substance chimique, la quantit de lnantiomre majoritaire A qui excde celle de l'nantiomre minoritaire A ou dpasse le reste racmique du mlange (Rfrence bibliographique : Strochimie des
Composs Organiques (Eliel & Wilen), Eds. TecDoc, 1996, p. 216). Il est donn par la formule

ee = 100 (XA XA) o X dsigne

les fractions molaires de A et A dans le mlange. Ds lors, XA + XA = 1, cette expression devient : ee = 100 (2XA 1), avec XA, la fraction molaire de A dans le mme mlange. En passant aux pourcentages, nous crivons ee = %

nantiomre A - % nantiomre A. Dans lexemple du paragraphe prcdent, lexcs nantiomrique du

mlange en question est : ee = 40%. Activit optique et puret optique Les nantiomres dune paire ont les mmes proprits chimiques lgard dun ractif achiral. Celles-ci sont, cependant, diffrentes en prsence dun ractif chiral, cest--dire lorsque le strocentre est impliqu dans la raction. De plus, toutes les proprits physiques sont identiques sauf une, qui est la facult de faire tourner le plan de la lumire polarise avec le mme angle , mais lun vers la droite [dextrogyre : d ou (+)] et lautre vers la gauche [lvogyre : l ou (-)]. Cette proprit est appele activit optique. Cest lasymtrie des molcules chirales qui en est la cause. Les molcules achirales, lesquelles sont assujetties une certaine symtrie, ne prsentent donc pas cette proprit. Les mlanges racmiques ne la possdent pas aussi. Mais, la diffrence des molcules achirales, cest parce que ces derniers sont forms de quantits quimolaires des deux nantiomres membres de la mme paire, que les deux actions de dviation sannihilent mutuellement : + + (-) = 0. Cest pourquoi, ils sont toujours dsigns par dl ou (), par exemple : dl-butan-2-ol ou ()-butan-2-ol. En revanche, les mlanges non racmiques dnantiomres dune paire dvient le plan de la lumire polarise proportionnellement leur composition en

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lnantiomre majoritaire. Cette dernire est dans ce cas dfinie par la puret optique (p.o.), laquelle est sous forme de pourcentage. Elle est numriquement quivalente lexcs nantiomrique (ee) et donne par la relation : p.o. (%) = ([]mlange dnantiomres/[]nantiomre pur) x 100. Par exemple, titre dexercice dapplication, dterminons la composition dun panach dnantiomres dune paire dont le pouvoir rotatoire observ est gal la moiti de celui de lnantiomre d ou (+) majoritaire considr individuellement. Le calcul de la puret optique donne une p.o. gale x 100 = 50%, soit donc un quivalent en excs nantiomrique (ee) de 50%. Cela signifie que la part excdentaire de lnantiomre majoritaire (+) est reprsente 50% de la composition totale du mlange. Le reste est par consquent un racmique qui forme le deuxime 50%. Ds lors quun racmique est form de deux parts gales de deux nantiomres dune paire, la composition centsimale du mlange est constitue de 50% + 25% = 75% de lnantiomre majoritaire (+) et de 25% de son image optique (-). Cest vers 1815 que Jean-Baptiste Biot (1774-1862), un physicien franais, dcouvrit lactivit optique, alors que lon ne parlait pas encore, cette poque, de chiralit et de molcules chirales. Son exprience intervint la suite de la dcouverte de la polarisation de la lumire par Etienne-Louis Malus (1715-1812). En effet, il observa, pour la premire fois, que des cristaux de quartz, des liquides naturels tels que le gemme ou des solutions aqueuses de sucre de canne ou de camphre avaient la facult de dvier le plan de la lumire polarise qui les traverse dun angle appel rotation optique ou pouvoir rotatoire. Mais cest Louis Pasteur que reviendra le mrite des premires expriences ralises sur lactivit optique. Il utilisa des solutions prpares partir des cristaux dacide tartrique nantiomres quil spara un peu plus tt. Celles-ci lui permirent, en effet, de dcouvrir que lactivit optique est une proprit des seules molcules asymtriques, doues donc de chiralit. La rotation optique peut tre dtecte et mesure par un polarimtre (figure 34). Celui est compos dune lampe au sodium, lequel met une lumire jaune uniforme correspondant la raie D (celle du sodium mme) de longueur donde = 589 nm, dun polariseur sous forme prisme de Nicol, dune cellule contenant la solution de lchantillon et dun deuxime polariseur appel analyseur, qui nest autre quun deuxime prisme de Nicol plac dans loculaire du polarimtre.

Figure 34. Reprsentation schmatique dun polarimtre ( Chimie Organique. Les Grands Principes. (John Mc Murry), Eds Dunod, p. 191.).

La rotation optique est toutefois dpendante des conditions opratoires : la temprature, la longueur donde de la lumire utilise, la concentration de la solution et la nature du solvant qui a dissous lchantillon. Cest pourquoi, lactivit optique dune molcule chirale est quantitativement dfinie, de faon standard, par son pouvoir rotatoire spcifique. Gnralement dsign par DT (en dm-1g-1cm3), le pouvoir rotatoire spcifique est donn par la

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loi de Biot : []DT = /C.l, o dsigne la rotation optique ; C, la concentration en g/cm3 ; l, lpaisseur (exprime en dm) de la cuve contenant la solution de lchantillon, et T, la temprature en C. Pour viter toute ambigit, la valeur de l est conventionnellement retenue gale 1 dm (ou 10 cm) et T numriquement gale 20C. Toujours de faon conventionnelle, la lettre D en indice indique la raie D du sodium. Il remplace cet effet la longueur donde = 589 nm de la raie D en soi. A linverse, il est aussi courant de voir le pouvoir rotatoire spcifique dsign sous la forme []T. Pareillement pour qui est quelques fois remplac par 0. Ainsi, le pouvoir rotatoire spcifique est une grandeur physique qui caractrise les molcules chirales au mme titre que les points dbullition et de fusion, lindice de rfraction, la solubilit, etc. Il est donn par les tables des constantes physiques, du moins pour la plupart des produits organiques chiraux commerciaux (Rfrence bibliographique : Trait de Chimie organique (Vollhardt & Schore), Eds
DeBoeck, 1995, pp.141-143.).

Configuration relative et configuration absolue des molcules chirales

En prsentant, en introduction gnrale, les diffrentes branches de la strochimie, nous avons prsent la cristallographie aux RX (rayons X) comme une sous-branche de la strochimie statique. Elle est de nos jours la meilleure technique qui permet de dterminer la configuration absolue, cest--dire larchitecture ou la structure exacte des molcules. Elle renseigne donc sur la configuration ou larrangement spatial des atomes et groupements datomes des molcules. Elle ne fut toutefois dcouverte quen 1951 par Bivojet, un chimiste hollandais.

Les descripteurs D et L de Fischer (ou des configurations relatives)

CHO H OH CH 2OH D-(+)-glycraldhye
HNO3

COOH H OH CH 2OH
HNO2 H2O

COOH H OH CH 2NH 2
HNO2 HBr

COOH
Zn/H+

COOH H CH 3 Acide D -(-)-lactique OH

H CH 2Br

OH

D -(+)-Isosrine

Figure 35. Dtermination de la configuration relative de molcules chirales par corrlation avec le D-(+)-glycraldhyde (Rfrence Bibliographique : "Initiation la chimie organique" (Jonhson), Eds DeBoeck, p. 626.)

Avant la dcouverte de la mthode cristallographique, il tait impratif de mettre au point une mthode trs simpliste, certes, mais indispensable pour dterminer les configurations des acides amins et des glucides, relativement celle du d ou (+)-glycraldhyde. Et cest Emil Fischer qui fut lorigine de la mthode utilise. Il commena, en effet, par attribuer au d ou (+)-glycraldhyde la configuration arbitraire D. Pour cela, il utilisa la reprsentation qui porte aujourdhui son nom mais en sarrangeant placer, et ce de faon arbitraire, le groupe OH droite. Ainsi, lon attribua par la suite la configuration D tous les produits organiques optiquement actifs qui furent obtenus partir du glycraldhyde (ou de son driv) ou qui gnrrent celui-ci (ou lun de ses drivs) partir de ractions nimpliquant pas directement le carbone asymtrique (figure 35). La configuration relative L fut attribue par la suite aux antipodes optiques des drivs de configuration relative D. La structure aux RX de lacide

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(+)-lactique fut entretemps dcouverte par Bivojet. Lequel acide lactique fut au pralable corrl au glycraldhyde et prsenta la configuration relative L. La prdiction de la configuration relative D du glycraldhyde se rvla, et ce fort heureusement, conformes sa configuration absolue. Ainsi, les configurations relatives des autres molcules, lesquels furent aussi corrles au glycraldhyde, se rvlrent, concomitamment, exactes. La mthode de Fischer est aujourdhui couramment utilise, et mme tendue aux autres types de molcules chirales. Mais il est bon de noter que les lettres D et L qui dsignent les configurations relatives ont plus une signification structurale que physique, linverse des lettres d et l. Il nya aucun lien entre les deux notations. Une faon de dire quune molcule qui prsente la configuration relative D nimplique pas forcment quelle doit tre dsigne par d. Elle peut aussi tre dsigne par l. Cela est aussi inversement valable pour toute molcule qui prsente la configuration relative L. Les proprits indiques par d ou par l sont, pour ainsi dire, dtermines exprimentalement et non structuralement. Aussi, il est intressant de noter que pour dterminer la configuration relative de nimporte quelle molcule chirale, il convient, dans un premier temps, de reprsenter celle-ci selon Fischer. Le substituant de plus haute priorit (il est choisi daprs les rgles squentielles qui sont nonces plus loin) du carbone asymtrique le plus bas de la chane verticale (figure 36) est ensuite identifi. Sil se situe droite, la configuration relative est D. Celle-ci est ds lors L lorsque le substituant est situ gauche.
CHO H HO H H OH H OH OH CHO HO HO H H H H OH OH CH 2 OH D -mannose

CH 2 OH D -glucose

Figure 36. Dtermination de la configuration relative du glucose et du manose

Les descripteurs R et S de Cahn, Ingold et Prelog (CIP)

La configuration absolue des molcules chirales est dtermine par la mthode cristallographique, avonsnous crit plus haut. Mais tout le monde na pas accs cette technique, laquelle savre, en plus, laborieuse laborer. Ainsi, Cahn, Ingold et Prelog (CIP) mirent au point un procd, quoique thorique, pour dterminer avec exactitude la configuration absolue autour de chaque carbone (mais pas seulement pour le carbone comme centre chiral) asymtrique dune molcule chirale. Le procd CIP consiste classer dabord les substituants par ordre de priorit, daprs des rgles appeles rgles squentielles, et ensuite regarder la molcule par le ct du carbone asymtrique et dans la direction du substituant de plus basse priorit. Si les trois autres substituants dfilent de la priorit la plus haute celle la plus basse dans le sens des aiguilles dune montre, la configuration absolue autour du carbone asymtrique tudi sera dite R ou rectus. Si, en revanche, les mmes substituants dfilent linverse du sens horaire, et toujours de la priorit

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la plus haute celle la plus basse, la configuration absolue autour du mme carbone asymtrique sera appele S ou sinister (figure 37).
a d c b a a d b c a

A1 ordre de priorit : a > b > c > d configuration R

b

B1

configuration S

a) La confiuration absolue est R ( rectus) : les substituants dfilent par priorit croissante dans le sens des aiguilles d'une montre.

b) La confiuration absolue est S ( sinister) : les substituants dfilent par priorit croissante dans le sens contraire des aiguilles d'une montre.

Figure 37. Mthode de dtermination des configurations absolues R et S.

Le substituant le moins prioritaire est situ larrire du carbone asymtrique par rapport lobservateur, donc larrire dun plan perpendiculaire sa liaison avec le centre chiral. Dans lexemple de la figure 37, le plan en question est perpendiculaire la surface de la feuille. Ainsi, il peut se poser un problme didentification de ce plan mme. Cest pourquoi, il est plus confortable de prendre le plan de reprsentation de la molcule test comme plan de rfrence.
a d c b d et c sont interchangs a d

A1

configuration R

b c

B1

configuration S

b et d sont interchangs

a c configuration S

ordre de priorit : a > b > c > d d

a b c

B2

configuration R

A2

d b

a). La confiuration absolue du carbone asymtrique du driv A2 de A1 est S . Comme A2 est obtenu de A1 en interchangeant c et d, la configuration du carbone asymtrique dans A1 est par consquaent R.

b). La confiuration absolue du carbone asymtrique du driv B2 de B1 est R. Comme B2 est obtenu de B1 en interchangeant b et d, la configuration du carbone asymtrique dans B1 est par consquaent S.

Figure 38. Mthode de dtermination des configurations absolues en interchangeant un nombre impair de fois deux substituants.

Dans la molcule A1 de la figure 37 que nous avons reproduite la figure 38a, le substituant le moins prioritaire d est port par le plan de la feuille. Il peut tre interchang avec le substituant c situ larrire. Le schma de la molcule A2 rsultante est symbolis la figure 38a. Et faisant de mme avec la molcule B1, mais en permutant cette fois-ci d et b, nous obtenons la molcule B2 figure 38b. Ainsi, en appliquant la mthode CIP aux drivs A2 et B2, nous obtenons les configurations absolues S et R autour de leur strocentre respectif. Celles-ci sont donc, respectivement, les rflchis des configurations absolues permirement dtermines pour les molcules A1 et B1, lesquels ont gnr A2 et B2. Si les configurations autour des strocentres de A1 et B1 ntaient pas au dpart connues, nous aurions dit que celles-ci sont, respectivement, R et S. Ds lors, nous pouvons riger cela en une rgle gnrale qui sapplique nimporte quelle molcule. Elle consiste dire quen permutant un nombre impair de fois conscutives deux substituants dun centre chiral dune molcule mre (mais pas toujours les mmes

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substituants) pour obtenir une deuxime molcule fille, la configuration absolue autour du centre chiral (celui qui lie les substituants interchangs) de cette dernire est linverse de celle du centre chiral de la premire. Comme corollaire au premier postulat, il est bon aussi de retenir quen interchangeant un nombre pair de fois conscutives deux substituants qui sont lis un mme centre chiral, on obtient une molcule fille dont le centre chiral prsente une configuration absolue identique celle du centre chiral de la molcule mre (figure 39).
a d c b A1 configuration R d et c sont interchangs priorit croissante : a > b > c > d b c d a A3 configuration R a et b sont interchangs d b a c A2 configuration S a a et c sont interchangs b B2 configuration R d c configuration S d a B3 c b B1 configuration S b c b et d sont interchangs a d

a). La confiuration absolue du carbone asymtrique du driv A3 de A2 est R . Comme A3 est obtenu de A1 en interchangeant c et d puis a et b la configuration du carbone asymtrique dans A1 est par consquaent R.

b). La confiuration absolue du carbone asymtrique du driv B3 de B1 est S. Comme B3 est obtenu de B1 en interchangeant b et d puis a et c, la configuration du carbone asymtrique dans B1 est par consquaent S.

Figure 39. Mthode de dtermination des configurations absolues en interchangeant un nombre pair de fois deux substituants.

Ces deux rgles sont particulirement utilises si la liaison entre le carbone asymtrique et le substituant d de plus basse priorit est place dans le plan de reprsentation. En revanche, si celui-ci est dirig vers lavant, on na pas besoin de permuter deux substituants (on les permute quand mme mais seulement dans son imagination), encore moins si elle est lorigine dirige vers larrire du plan indiqu. Dans le dernier cas de figure, on a directement la bonne configuration absolue. Dans le premier cas, en revanche (cest--dire en laissant le substituant de priorit moindre lavant), il suffit de prendre linverse de la configuration absolue obtenue. Le premier cas de figure est particulirement rencontr lorsque la molcule est symbolise par une reprsentation de Fischer (figure 40), mais condition que le substituant de plus basse priorit soit port par un segment horizontal. Si, dans la reprsentation de Fischer, il est port par lune des extrmits du trait vertical, on a directement la bonne configuration. Et la raison de cela est quil est dans ce cas situ larrire du plan de reprsentation.
a a

c b

c b

ordre de priorit : a > b > c > d

a b c d c configuration R configuration R d a b

a) Les substituants dfilent dans le sens S mais, d tant situ l'avant du plan, la configuration est R, l'inverse de S.

b) Les substituants dfilent dans le sens R mais, d tant situ l'arrire du plan, la configuration n'est pas invers. Il reste R.

Figure 40. Dtermination de la configuration absolue d'une molcule reprsente par une reprsentation de Fischer.

Partant de la reprsentation de Cram dune molcule chiralit centrale pour laquelle le ou les substituants de plus basse priorit ne sont pas situs larrire du plan de reprsentation, on peut ne pas oprer des

29

permutations de substituants dun mme carbone asymtrique pour en dterminer la configuration absolue. Face une telle situation, on prend en considration le fait que la configuration absolue autour des strocentres ne change pas par rotation autour dune ou de plusieurs liaisons simples. La rotation autour dune ou de plusieurs liaisons au sein dune molcule donne nentrane pas de changement configurationnel mais uniquement un changement conformationnel (figure 41).
a c b conformre 1 rotation autour de la liaison C-a b c conformre 2 a d

priorit croissante : a > b > c > d configuration S configuration S

Figure 41. Dtermination de la configuration absolue aprs un changement conformationnel.

Les rgles de R. S. Cahn, C. Ingold, V. Prelog Elles sont encore appeles rgles de squence (ou rgles squentielles), cest--dire rgles de priorit. Rgle 1. Lordre de priorit est dtermin en comparant dabord les numros atomiques des atomes directement lis au strocentre. La priorit est donne aux atomes qui ont les numros atomiques les plus levs. Les doublets non liants des htroatomes strogniques sont en consquence considrs comme possdant un numro atomique nul. Exemple :
I > Br > Cl > F > H >

Dans les cas de composs arniques chiraux (composs ou complexes demi-sandwiches dans lesquels les atomes de carbone du noyau aromatique, qui est dans ce cas appel arne, sont tous lis au mtal par des liaisons simple ; de pareils composs sont appels composs organomtalliques), le cycle est considr comme un pseudoatome de carbone dont le numro atomique est gal la somme des numros atomiques des atomes de carbone directement lis au mtal. Le symbole atomique du mtal est dans ce cas port en indice des lettres R et S qui dsignent les configurations absolues autour des centres de chiralit mtallique (figure 42).

Z (cyclopentadinyle, Cp) = 6 x 5 = 30
Mn I CO PPh3

Z (benzne, Bz) = 6 x 6 = 36
Cr ON CO

I > Cp > PPh3 > CO

Bz > PPh3 > NO > CO

PPh 3

configuration RMn

configuration SCr

Figure 42. Ordre de priorit dans le cas de mtallocnes semi-sandwich chiraux. Le cyclopentadinyle et le benzne sont, respectivement, penta- et hexacoordins au manganse et au c hrome par le biais des atomes de carbone (A. Collet, J. Crassous, J.-P. Dutasta, L. Guy, "Molcules chirales : Strochimie et Proprits", Eds EDP Sciences, 2006.)

30

Rgle 2. Le marquage isotopique peut rendre un atome de carbone asymtrique. On parle alors dnantiomrie isotopique (figure 43). Ainsi, pour ce qui concerne les composs radiomarqus, la priorit est donne aux isotopes qui prsentent un nombre de masse plus lev (figure 43). Exemple : 37Cl > 35Cl ; 18O > 17O > 16O ; T (3H) > D (=
2

H) > 1H ; etc.
2H 2H NaNO 2/KBr 1H LiAl3H 4 3H 2H

H2N
1H

CO2H

Br
1H

C CO2H

C C3H2OH

2 Cr2O 7 -

3H 2H

1H C

CO2H sens S

sens S mais configuration R

sens S mais configuration R

sens S mais configuration R

mais configuration R

Figure 43. L'acide R-[1H, 2H, 3H] actique obtenu partir de la R-[2H] glycine, un exemple d'nantiomre isotopique. (A. Collet, J. Crassous, J.-P. Dutasta, L. Guy, "Molcules chirales : Strochimie et Proprits", Eds EDP Sciences, 2006.)

Rgle 3. Lorsque deux atomes (lesquels atomes sont dits de premier rang) directement lis au centre chiral ont mme priorit, on compare les ensembles forms par les trois atomes qui leurs sont lis (atomes dits de second rang) et ainsi de suite jusqu' ce que l'on puisse trancher. Un ensemble sera prioritaire sur lautre et, par consquent, un atome de second rang sur son voisin, lorsque, aprs avoir class les substituants membres de chaque triplet dans lordre de priorit dcroissante, on observe une diffrence en comparant les membres des deux ensembles terme terme (figure 44a). Rgle 4. Les liaisons multiples sont clates en liaisons simples. On attache chaque atome une rplique de l'atome qui lui est li jusqu saturer sa valence (figure 44b).
Rang 0 1 2 3 4 Rang 0 1 2 3 (C)

C*

Me

C*

H H H C H H C H H N H H H H H C H H H H H

H C C* H C C* CH2 O

C*

O (O) H C (C) H

C*

Et

C*

C*

(C) H H

C*

nPr

C*

C*

C*

(C) C (C) (C) H (C) (C) N (N)

(N)

H C* CH2NH2 C* C H C* C N C* C

(C)

priorit dcroissante : CH2NH2 > nPr > Et > Me a) arboresence et ordre de priorit de groupes alkyles et d'un groupe amin

priorit dcroissante : -CHO > -CN > -CCH > -C=CH2 b) Arboresence et ordre de priorit aprs eclatement de groupes portant des liaisons multiples. Les carbones entre parenthses sont appels carbones fantmes ou carbones fictifs

Figure 44. Arborescence et classement par ordre de priorit dcroissante de quelques groupes.
(A. Collet, J. Crassous, J.-P. Dutasta, L. Guy, "Molcules chirales : Strochimie et Proprits", Eds EDP Sciences, 2006.)

Rgle 5. Dans le cas des groupes cycliques, latome de carbone directement li au strocentre est considr comme prsentant deux groupes aliphatiques linaires. Ceux-ci sont obtenus en ouvrant le cycle de la faon indique sur la figure 45. Si le cycle porte des doubles liaisons, il ya lieu de procder dabord lclatement de celles-ci sur la base de la rgle 3. Exemple : cas du phnyle et de lortho-fluorophnyle (figure 45).

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F C* C C (C) H 0 1 2 3 4 5 6 7 0 1 2 3 4 5 6 7 C*

(C) (C)

(C) C (C) H (C)

(C) H C F C (C) H C C C (C) H (C)

C (C) H

C (C) (C) H (C) H (C) H H F C* (C) C* (C) C C F (C) C C C (C) H (C)

(C) H H (C) C C (C) H H C (C) (C) H H

(C) H (C) C (C) (C) C (C) H C (C) H H H H (C) (C) H (C) H (C) H H H C* (C) (C)

C*

ortho-fulorophnyle

a priorit sur

phnyle

Les branches sont identiques jusqu'au rang 2 inclus. Elles diffrent au rang 3. La comparaison au rang 3 met en comptition les sries (C, F, (C)) et (C, (C), H). Cela conduit choisir la branche A.

Figure 45. Arborescence, aprs clatement, ouverture et classement par ordre de priorit des groupes phnyle et ortho-fluoroohnyle.
(A. Collet, J. Crassous, J.-P. Dutasta, L. Guy, "Molcules chirales : Strochimie et Proprits", Eds EDP Sciences, 2006.)

Rgle 6. Un carbone asymtrique peut tre li des groupements possdant des chanes ou des ramifications diffremment structures. Ainsi, si, jusqu un certain niveau de la comparaison des chanes on ne peut pas conclure, on choisit dans ce cas la branche prioritaire qui correspond l'atome prioritaire des deux rangs identiques. Dans lexemple de la figure 46, chaque branche porte trois ramifications, dont lune est forme uniquement de H. Il convient, ds lors, de commencer par comparer les ramifications portes par chaque branche (cest ce qui est fait avec lexemple figure 45). Que ce soit pour la branche A que pour celle B, une diffrence est observe au rang 3 en comparant les triplets (Br, C, H) et (F, C, H) des deux premires ramifications. Pour pouvoir distinguer les branches A et B, il importe donc de choisir la premire ramification et de comparer en consquence les membres des triplets (O, H, H) et (H, H, H) des rangs 4. Cest donc le triplet (O, H, H) de la branche A qui a la priorit. Nous en dduisons ainsi que la branche A est prioritaire sur la branche B. Mais, il est vident que si, dans le triplet (Br, C, H) des rangs 3 nous avions, par exemple, H la place de Br, ce sont les deuximes ramifications qui allaient tre prises en considration et compares. Et, de ce fait, la branche B allait lemporter sur la branche A en comparant les membres des triplets (I, H, H) et (H, H, H) des rangs 4.
4 3

O Br H C C H H F C H H C H H H

C*

Br H C C F C C H H

H H H H H I

branche A

a priorit sur

branche B

Les branches A et B sont identiques jusqu'au rang 3 inclus. Elles diffrent au rang 4. La comparaison au rang 4 met en comptition les sries (O, H, H) et (H, H, H). Cela conduit choisir la branche A.

Figure 46. Arborescence, hirarchisation et classement par priorit de groupes portant des ramifications de structures diffrentes.
(A. Collet, J. Crassous, J.-P. Dutasta, L. Guy, "Molcules chirales : Strochimie et Proprits", Eds EDP Sciences, 2006.)

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Dtermination de la configuration absolue des allnes, des spiranes, des biphnyles,des alkylidnescycloalcanes et des cycloalcanone-oximes chiraux Le procd est le mme pour tous ces drivs. Il sagit dabord de reprsenter la molcule par une reprsentation de Newman comme indiqu la figure 47. Les lments de chaque couple de substituants sont ensuite classs sur la base du systme CIP. La rgle complmentaire le proche prcde lloign est ensuite applique au systme quatre substituants, lequel a tout lair dun ttradre irrgulier. Sur la base des rgles de priorit, les deux substituants directement lis au carbone frontal sont alors dsigns par les lettres a et b (avec a > b) non indexes et ceux lis au carbone arrire par les lettres indexes a et b(avec a > b). On regarde ensuite dans la direction de laxe carbone frontal-carbone arrire (ou laxe point-cercle) de la projection de Newman. Si en appliquant la rgle le plus proche prcde lloign le sens aba de dfilement des substituants correspond au sens horaire, alors la configuration absolue est aR (axial rectus). Et elle est aS (axial sinster) dans le cas contraire. Ici, on fait prcder les lettres R et S de la lettre a en minuscule pour dire quon est en prsence dune chiralit axiale. Mais, il est intressant de noter que les configurations absolues aR et aS qui sont obtenues dans le cadre dune chiralit axiale se rapporte lensemble de la molcule tudie et non un lment de celle-ci, tel quand il est sagi de la chiralit centrale.
H C Br C C H H C Br CH 3 alkylidnec ycloalcane H

allne

CH 3

a H3C

.
ou
H b' b H

H N CH 3 a>b

a' Br

ou OH

HO

a' > b' configuration aR

Br

CH 3

cycloalcanone-oxime

spiranne

Figure 47 . Illustration de la mthode de dtermination de la configuration absolue dans le cadre d'une chiralit axiale.

Dtermination de la configuration des mtallocnes chiraux On applique les mmes principes que ceux prtablis pour la chiralit centrale comme indiqu la figure 48. Pour cela, on fait rfrence lun des carbones substitus du cycle qui a priorit sur ses voisins (ceux du mme cycle). Pour cela, on compare les substituants ports par les carbones substitus du cycle sur la base des rgles squentielles nonces plus haut. Et lon choisit comme pilote le carbone du cycle qui est li au substituant de plus haute priorit. On met ensuite en vidence les cinq liaisons Fe-C du cycle mais sans ouvrir celui-ci et sans faire clater les doubles liaisons quil porte en son sein. Le carbone pilote passe ainsi ltat de carbone pseudottradrique et pseudo-asymtrique et la chiralit de plane pseudo-centrale. Et pour dterminer la configuration absolue autour du carbone pseudo-ttradrique, on classe ses substituants daprs le systme CIP. On regarde

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ensuite dans la direction du substituant le moins prioritaire par le ct du pseudo-strocentre. Si les trois autres substituants dfilent de la priorit de la haute la plus basse dans le sens des aiguilles dune montre, alors la configuration sera R. Et celle-ci sera S, dans le cas contraire. La configuration qui est dtermine de la faon se rapporte au carbone substitu de plus haute priorit qui forme lun des sommets du cycle. Sa position dans le cycle est ensuite indique en faisant prcder lindice 1 aux lettres R ou S.
H 3C
2 1

H C O

H C O

CH 3

Fe

Fe

Figure 48. Mthode de dtermination des configurations absolues dans les mltallocnes chiraux.

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optiques. Mais les choses deviennent plus corses lorsque nous sommes en prsence de deux ou plusieurs centres strrogniques. Prenons comme exemple trs simple une molcule deux centres chiraux, en loccurrence celle de la thronine (lacide 2-amino-3-hydroxybutanoque). Elle est dcrite dans sa conformation dcale par les reprsentations de Cram figure 50. Les configurations absolues autour des carbones asymtriques sont obtenues sur la base du systme CIP comme prcdemment dcrit pour les molcules un strocentre.
1 HO OC S 2 H 2N H 1 HOOC S H 2N H 2

1 HOOC

R 2 3 S H CH 3 NH 2 4

OH H

HO H R 3 H 3C 4

1 COOH 2 S H NH 2

retournement en dehors du plan de 180

H OH 3 R CH 3 4

HO OC 1

H HO S 3 H 3C 4 2

1 COOH S H NH 2

OH R 2 R 3 H CH 3 NH 2 4

retournement en dehors du plan de 180

OH H 3 S CH 3 4

Figure 50. Reprsentation de Cram des stroisomres de la thronine.

La figure 50 met en vidence lexistence de quatre stroisomres pour la thronine, lesquels sont tous chiraux. Nous avons deux paires de stroisomres dont les membres sont images lun de lautre dans un miroir. Les stroisomres de type (2R, 3S) et (2S, 3R) sont nantiomres, pareillement ceux de nature (2R, 3R) et (2S, 3S). Ainsi, il existe pour chaque paire une relation de rciprocit entre les configurations sur les deux carbones asymtriques. Les lments (2R, 3S) et (2S, 3R) de la premire paire sont appels nantiomres unlike (qui signifie dissemblable), pour la simple raison que les configurations R et S des centres chiraux dun mme isomre sont des opposs. Et les composs strotyps (2R, 3R) et (2S, 3S) sont dits nantiomres like (qui signifie semblable) eu gard aux configurations qui sapparentent deux par deux. La relation qui lie lun ou lautre des composs (2R, 3S) et (2S, 3R) lun dentre ceux de la deuxime paire (2S, 3S) et (2R, 3R) ne peut tre une relation dnantiomrie : ils ne sont pas images spculaires. Il importe, ds lors, dintroduire la terminologie de diastroisomrie pour dsigner le lien entre les stroisomres de deux paires diffrentes de la mme molcule. Parce que ntant pas images lun de lautre dans un miroir, les membres (2R, 3S) et (2S, 3S) ; (2R, 3S) et (2R, 3R) ; (2S, 3R) et (2S, 3S) ; (2S, 3R) et (2R, 3R) de chaque paire de composs sont des diastroiomres. Lesquels diastroisomres sont similaires mais non identiques, encore moins superposables. Mais lexamen minutieux de la srie prcdente rvle quau sein dun couple de diastroisomres, si les configurations sont identiques sur deux atomes strogniques indexs de la mme faon, elles sont, en revanche, inverses sur les deux autres carbones indexs pareillement. Les diastroiomres se comportent presque de la mme manire que les isomres de constitution. Ils diffrent, en effet, par leurs proprits physiques (temprature dbullition, temprature de fusion, solubilit, masse volumique, indice de rfraction, etc.) et spectroscopiques, ainsi que par leur ractivit chimique. De ce fait, ils

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peuvent tre spars par distillation fractionne ou par recristallisation. Deux diastroisomres dune mme molcule nont pas parfois la mme facult de dvier le plan de la lumire polarise, ce qui fait quils prsentent des angles de rotation optique diffrents tant en signe quen intensit. En outre, loppos des nantiomres, la barrire dnergie dinterconversion entre deux diastroisomres est trs grande. Cela fait quils sadsorbent diffremment sur les substances chirales et peuvent, en consquence, tre facilement spars lun de lautre par une simple colonne chromatographique. Nombre de stroisomres possibles et dfinition dun compos mso Deux atomes asymtriques produisent quatre stroisomres pour deux paires dnantiomres, soit donc le carr de 2 ou 22 vs 22-1. Chaque centre de chiralit pouvant tre dans une configuration R ou dans une configuration S, trois atomes asymtriques produiraient les huit stroisomres ci-dessous, soit le triple de 2 ou 23 vs 23-1 = 4 paires dnantiomres.
Molcule objet 3 centres de chiralit Image spculaire (R, R, R) (S, S, S) (R, R, S) (S, S, R) (R, S, R) (S, R, S) (S, R, R) (R, S, S)

Cest dire que pour un nombre n de centres de chiralit prsents dans une molcule, le nombre de stroisomres possibles est gal 2n vs 2n-1 paires dnantiomres. Mais le nombre 2n est le maximum que lon peut avoir. Il nest pas, cependant, atteint dans les cas de molcules centrosymtriques, lesquelles prsentent un lment de symtrie. Et cela nous amne considrer un autre exemple de molcule chirale : celle du 2-,3-dichlorobutane dans sa conformation dcale (figure 51). Pour seulement deux centres de chiralit, le nombre de stroisomres attendus pour le 2-,3-dichlorobutane est 4 = 22. Mais, larrive, nous nen avons obtenus que 3. La raison de cet impair est que les lments attendus de la paire dnantiomres B(2R, 3S) et B(2S, 3R) sont, en ralit, superposables. Comme indiqu la figure 51, B et B sont ainsi identiques de fait, tout loppos des membres de la paire dnantiomres like A(2S, 3S) et A(2R, 3R). Lidentit observe dans les composs B(2R, 3S) et B(2S, 3R) se traduit par lexistence en leur sein dun lment de symtrie sous forme de plan. Celui-ci est perpendiculaire au plan de reprsentation des molcules et passe par le milieu de la liaison centrale carbone-carbone. Les groupes qui sapparentent sont ainsi deux par deux rflchis par rapport au plan indiqu. Le compos B, de mme que B, est de ce fait dit compos mso (du grec mesos qui veut dire mme) ou, parfois, compos centrosymtrique. Les composs B et B sont achiraux et, pour cela, optiquement inactifs. Mais cela ne voudrait nullement dire que B ou B, ou les deux la fois, sont un mlange racmique, par rfrence linactivit optique de ce dernier. Le compos mso est un stroisomre unique dans son genre qui a des proprits physico-chimiques qui lui sont propres. Tandis que le mlange racmique est constitu de deux stroisomres qui sont nantiomres lun de lautre et dans les mmes proportions : molculaires ou centsimales.

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H 3C 1 H Cl 4 CH 3 2 3 S S Cl H A rotation du C 3 de 180 autour de C-C H 3C 1 S 2 H Cl A 3 Cl H S 4 CH 3 H R 3 H 3C 4 A' Cl 1 CH 3 2 R H Cl retournement de la molcule de 180 en dehors du plan H 3C 1 R Cl H A' 2 3 H Cl R CH 3 4 rotation du C 3 de 180 H C 1 3 autour de C-C R 2 Cl H 4 CH 3 3 R H Cl A'

A et A' sont non superposables : ils sont nantiomres. H 3C 1 R 2 Cl H B 3 4 CH 3 S Cl H S H 3C 1 R Cl H B H B = B' 2 4 CH 3 3 S Cl rotation du C 3 de 180 autour de C-C H 3C 1 R 2 Cl H B R H 3C 1 S Cl H B' H B' 2 3 4 CH 3 R Cl retournement de la molcule de 180 en dehors du plan H 3C 4 R H Cl 3 2 1 CH 3 S H Cl 3 Cl H S CH 3 4 Cl 1 CH 3 H R 3 2 S Cl H 3C 4 H B' rotation du C 2 de 180 autour de C-C retournement de la molcule H C 4 1 CH 3 Cl 3 Cl de 180 en dehors du plan 3 2 S H H R H H R 3 2 S Cl Cl H 3C 4 1 CH 3 B' B'

B et B' prsentent un plan de symtrie. Ils sont superposables et donc identiques. Ils sont tous les deux des composs mso. B et B' sont achiraux.

Fuigure 52. Exemple de molcule deux atomes strogniques qui ne donne lieu qu' 3 stroisomres sur les 4 attendus.

Dtermination des configurations relatives Erytro et thro

En dfinissant les relations nantiomriques, nous avons prcdemment utilis les lettres D et L pour attribuer les configurations relatives des strocentres sur la base de la reprsentation de Fischer des composs pris en exemple. Mais celles-ci, mme dans les exemples du glucose et du mannose, ne se rapportaient qu un seul strocentre.
1 COH 2 H 2 H 2 3 OH 1 OH 1 1 HO 1 HO 1 CHO 2 3 H 2 H 2 1 HO 2 H 1 COH 2 3 H2 OH 1 2 H 1 HO 1 CHO 2 3 OH H2

4 CHOH D-rythrose

4 CH 2O H L-rythrose

4 CHOH D-rythrose

4 CH 2OH L-throse

Figure53. a) R eprsentation de Fisch er de l'rythrose et d u t hrose 1 COOH 2 H 2 H 2 3 4 CH3 thronine rythro-D NH 2 1 OH 1 1 H2N 1 HO 1 COOH 2 3 4 CH 3 thronine rythro-L H 2 H 2 1 H 2N 2 H 1 COOH 2 3 4 CH 3 thronine thro-D H2 OH 1 2 H 1 COOH 2 NH 2 1 H 2

1 OH 3 4 CH 3

thronine thro-L

(2R, 3R)

like

(2S, 3S)

(2S, 3R)

unlike

(2R, 3S)

1 > 2 dsigne l'ordre de priorit des deux substituants de chaque C* d'aprs les rgles CIP
Figure 53. b) Attribution des configurations rythro et thro de la thronine.

Pour attribuer les configurations relatives de deux atomes chiraux attenants, il convient dutiliser une autre nomenclature fonde sur les appellations rythro et thro. Mais celles-ci ne sappliquaient lorigine quaux drivs des monosaccharides, tels lrythrose et le throse (projections de Fischer dpeintes figure 53) qui ont fini par donner leur nom ce systme de nomenclature. Ainsi, sur la base de la projection de Ficher de lisomre tudier, on attribue la configuration relative rythro aux deux centres strogniques contigus pour lesquels les substituants de plus haute priorit dans la hirarchie tablie par les rgles CIP sont situs du mme ct. De la mme manire,

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les strocentres sont dclars thro si leur deux substituants de plus haute priorit sont situs de part et dautre de la verticale de la projection de Fischer. En consquence, on dit que les nantiomres dune paire sont rythro ou thro lorsque les deux strocentres adjacents prsentent une configuration relative du mme nom. Pour diffrencier ensuite les deux membres de chaque paire dnantiomres, on fait prcder lune des lettres D ou L rythro ou thro, suivant que le substituant de plus haute priorit du centre chiral le plus bas est situ droite (D) ou gauche (L). Sur la base de lattribution des configurations absolues, il est important de noter que les membres de la paire dnantiomres like ont tous les deux une configuration relative rythro et ceux de la deuxime paire dnantiomres unlike prsentent la configuration thro. Aussi, il est intressant de souligner que les configurations relatives rythro et thro peuvent tre dtermines partir de la reprsentation de Cram ou partir de la reprsentation de Newman. Dans le premier cas de figure, il convient de baser ltude sur les conformations clipses de la molcule test. Ainsi, si la conformation de dpart est une dcale, il est plus appropri de la transformer en une clipse par une suite doprations de rotation-retournement (retournement dans ou en dehors du plan). Dans les nantiomres A et A du 2,3-dichlorobutanal figure 54, les atomes de chlore, lesquels sont plus haute en priorit que leur voisin atome dhydrogne, des carbones C2 et C3 sont situs loppos lun de lautre. A et A prsentent chacun une configuration relative thro. Les deux atomes de chlore tant situ du mme ct ( lavant du plan de reprsentation) dans B et B, ces derniers sont chacun dans une configuration de type rythro. Toutefois, pour connatre les configurations relatives D ou L qui vont avec, il faut imprativement partir de la reprsentation de Fischer qui correspond celle de Cram tudie.
HOC 3 H Cl CH 3 2 H Cl HOC 1 S 2 H Cl 4 CH 3 3 S Cl H A 1 CHO R 3 2 R H Cl Cl H H 3C 4 A' OHC 3 Cl H CH 3 2 Cl H

thro

thro

Les deux Cl sont situs de part et d'autre du plan de la reprsentation de Cram. Les deux flches incurves de la reprsentation de Newman vont dans des sens opposs. OHC 3 H H CH 3 2 Cl Cl

HOC 3 Cl Cl

CH 3 2 H H

HOC 1

4 CH 3 S 2 3 S H H Cl Cl B

H3C 4 H

1 CHO

R 3 2 R H Cl Cl B'

rythro

rythro

Les deux Cl sont situs du mme ct de la reprsentation deCram. Les deux flches incurves de la reprsentation de Newman vont dans le mme sens. Figure 54. Dtermination des configurations rythro et thro partir d'une "Cram" ou d'une "Newman".

La reprsentation de Newman de chaque stroisomre du 2,3-dichlorobutanal est galement donne la figure 54. Pour en dterminer les configurations relatives rythro et thro, il importe de classer dabord les trois substituants du point et ceux du cercle daprs le systme CIP. Les deux flches incurves sont ensuite obtenue en regardant dans la direction point-cercle et en faisant ensuite dfiler les substituants du mme strocentre de la priorit la plus haute celle la plus basse par la moyenne. Ainsi, si les deux flches incurves vont dans le mme

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sens, lisomre est rythro. Mais si elles sont dans des sens opposs, alors lisomre est thro. Il est important, cependant, de souligner que, bien quelle permette la connaissance de la configuration relative rythro ou thro des stroisomres, la reprsentation de Newman ne renseigne pas sur les configurations absolues R et S, encore moins sur celles relatives D et L. Relations de prochiralit (ou de prostrosimrie) La prochiralit est un concept dun grand intrt pour la synthse nantioslective (ou synthse asymtrique)
(Rfrence bibliographique : Strochimie des Composs Organiques (Eliel & Wilen), Eds. TecDoc, 1996.). Elle permet de prvoir les

proprits spectroscopiques et chimiques ainsi que les arrangements spatiaux des atomes ou groupements datomes des molcules achirales, ou lorigine chirales mais qui prsente un nombre limit de strocentres, pouvant donner lieu une autre molcule chirale par lintroduction dune dissymtrie. La notion de prochiralit repose sur le fait que la plupart des molcules organiques biologiquement actifs, tant naturels que synthtiques, et de catalyseurs enzymatiques sont chirales. Une molcule achirale peut tre rendue chirale en remplaant lun ou lautre des coordinats identiques dun atome cible par un autre coordinat diffrent, et des remplacs et des autres coordinats de latome cible. La molcule dorigine est alors dite molcule prochirale. Cest ce que lon devrait normalement dire mais, dans la pratique, on parle plutt datome prochiral. On fait donc rfrence llment de la molcule qui est responsable de lasymtrie de celle-ci. Cest pourquoi, on parle aussi daxe, de plan ou de faces prochiraux (ou de prochiralit). Mais la prochiralit ne se rapporte pas seulement aux seuls drivs en mesure de gnrer des molcules chirales aprs lopration de remplacement indiqu ci-dessus. Il concerne aussi les alcnes et les cycloalcanes achiraux. Cest pourquoi, vu sous cet angle, le terme prostroisomrie (et ceux de ses corollaires) est souvent prfr au terme prochiralit (vs ceux de ses corollaires). Dans lexemple de la figure 55, les coordinats sont des atomes dhydrogne. Ils sont semblables et dits en consquence homomorphes. Ils peuvent nanmoins tre diffrencis topologiquement en introduisant, et ce de manire hypothtique, une diffrence de priorit entre les deux. Pour cela, on utilise communment un radiomarquage isotopique en substituant, titre formel, lun ou lautre des deux atomes dhydrogne par le deutrium. Mais rien nempche de remplacer lun ou lautre des coordinats, dune manire gnrale, par une fonction, un halogne ou un groupe alkyl, par exemple. Nous obtenons lissue de cette opration de substitution les molcules A et B.
a b D H1 A aa bb
1

a a b b H2 H1 b b B

a H2 D

carbone prochiral si a

DH2 HD

A et B sont non superposables. Ils sont donc nantiomres si a

Figure 55. Illustration d'un cas de prochiralit

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Les deux produits de substitution A et B de la figure 55 sont strochimiquement diffrents. Ils sont images lun de lautre dans un miroir et non superposables, en supposant, bien entendu, que a est diffrent de b. Ainsi, les deux coordinats de la molcule de dpart sont lorigine topologiquement diffrents. Ds lors que les produits A et B sont diffrents, dun point de vue strochimique bien entendu, les deux coordinats ou protons sont dits htrotopiques. Ils seraient appels homotopiques, dans le cas contraire, si les substituants a et b taient au dpart identiques de la mme faon que lauraient t A et B. Dans le prsent cas particulier o a et b sont diffrents et, par ricochet, les nantiomres A et B, les protons mthylniques sont dits protons htrotopiques ou, plus prcisment, protons nantiotopiques. Deux coordinats sont donc nantiotopiques lorsque le remplacement de lun ou lautre par un coordinat achiral diffrent donne lieu deux nantiomres. Toujours pour illustrer la notion de prochiralit, supposons maintenant que lun des substituants a ou b est chiral. Mais pour traiter ce cas, il est plus commode dutiliser un exemple plus parlant comme celui de la molcule de 3R-chloroheptane (figure 56). La mme opration de radiomarquage isotopique au deutrium conduirait thoriquement aux molcules C et D. La configuration reste ainsi inchange R autour du carbone 3. Mais, ds lors que le carbone index 6 passe ltat de carbone asymtrique, la combinaison des configurations absolues autour des strocentres donne lieu aux lments des couples (3R, 6R) pour C et (3R, 6S) pour D. Les produits C et D issus de la substitution isotopique sont cette fois-ci des diastroimres. Les deux coordinats htrotopiques du carbone 6 de la molcule de dpart sont dits protons diastrotopiques, en rfrence la dfinition qui est donne plus haut aux protons nantiotopiques. Ainsi, les cas de diastrotopie sont observs lorsque le carbone prochiral est directement li un centre chiral.
7 CH 3 H 3R C 4 3 2 H 3C 1 Cl 6S 5 H 6 D Cl H C 3 2 H 3C 1 4 5

carbone prochiral
7 CH 3 6 H H Cl H 3R C 4 3 2 H 3C 1

7 CH 3 6R 5 6 H D C

protons diastrotopiques

C (3R, 6S) et D (3R, 6R) sont non superposables mais pas images spculaires. Ils sont diatrosiomres.
Figure 56. Illustration d'un cas de diastrotopie.

Les coordinats diastrotopiques ragissent diffremment lgard dun ractif chiral. De mme, ils se comportent diffremment lgard de phnomne asymtrique comme la spectromtrie RMN (rsonance magntique nuclaire) et prsentent en consquence des proprits spectrocopiques diffrentes. Ils sont donc anisochrones en RMN 1H et/ou 13C, ce qui fait que leurs deux signaux apparaissent diffremment sur le spectre. Mais il peut arriver des situations o la mauvaise rsolution de ceux-ci ncessite lutilisation de champs trs levs. Et aussi des cas o la diffrence nest pas observe. Pareillement au centre prostrogne, on a aussi les faces prostrognes. Celles-ci sont observes lorsque laddition et non la substituation hypothtique dun agent auxiliaire achiral sur lune ou lautre face dun aldhyde ou dune ctone, par exemple, donne naissance la formation de deux molcules strochimiquement inquivalentes.

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On parle alors de faces htrotopiques. Mais, plus prcisment, si les deux produits daddition sont nantiomres les deux faces sont dites nantiotopiques, tels A et B (figure 57). Elles sont dites diastrotopiques lorsque les produits daddition sont diastroisomres, comme C et D (figure 57).
CH 3 H A CH 3 S NC H 3C OH H S C 6H 5 D HCN H 3C S C 6H 5 C CH 3 CH 3 C O HCN H HO H 3C R CN H S C 6H 5 OH CN R H 3C C H O + HCN S H CH 3 CN OH B

Figure 57. Illustration d'un exemple de molcule qui prsente des faces prochirales.

De la mme manire que les coordinats diastrotopiques, les faces homologues sont aussi spectroscopiquement et chimiquement (cest--dire ont des ractivits diffrentes) diffrents.

Dtermination des configurations absolues dans les cas de prochiralit

carbone prochiral
7 CH3 H 3R Cl C 4 3 2 H3C 1 6R 6 5 C D H3C H2 Cl H C 4 3 2 1 5 7 CH3 6 7CH3 H 3R 6S 6 Cl C D H2 4 3 5 H1 H1 2 H3C 1 pro-S D protons diastrotopiques pro-R

C (3R, 6S) et D (3R, 6R) sont non superposables mais pas images spculaires. Ils sont diatrosiomres.
protons diastrotopiques pro-R pro-S c d H1 a S NMe2

H3C H3C d H2 b Fe R Dc a NMe2 Fe H3C H2 H1 NMe2

D b

Fe

sens R mais on inverse pour avoir S

La chiralit plane amne la configuration R. On a ainsi deux drivs frrocniques deutrs diastroisomres de configuration (R, R) et (R, S) Les protons sont donc des protons diastrotopiques.

Figure 58. Mthode de dtermination de la configuration absolue des protons diastrotopiques.

Pour dterminer la configuration absolue des coordinats et des faces prochiraux, on procde dabord comme dcrit plus haut (Rfrence bibliographique : Chimie Organique avance (Carey & Sundberg), Eds. De Boeck, p. 98 ;
( Strochimie des Composs Organiques (Eliel & Wilen), Eds. TecDoc, 1996.)). On effectue ou bien un remplacement de lun ou

lautre des coordinats htrotopiques de la molcule test par un autre coordinat diffrent ou une addition de ractif auxiliaire sur lune ou lautre face htrotopique, dans loptique de crer un centre strogne. Ainsi, le coordinat prochiral remplac ou la face par laquelle lauxiliaire sest additionn auront la mme configuration absolue que celle du centre strognique gnr. Mais, pour marquer la prochiralit des coordinats et des faces htrotopiques, les

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lettres R et S des configurations absolues des stroisomres correspondantes sont respectivement remplaces par pro-R et pro-S, sagissant des coordinat htrotopiques (figure 58), ou par re (de rectus) et si (de sinister), pour ce qui concerne les faces prochirales (figure 59).
face Si H Me Et NaBH4 OH configuration S Me C Et O retournement de 180 O C Et configuration R les deux faces sont des faces nantiotopiques face Re H Me NaBH4 HO Me Et

Me Me H Et OH sens S sens R HO H Et

Figure 59. Dtermination de la configuration absolue de faces prochirales d'un compos achiral

En examinant minutieusement la figure 59, il apparat que les configurations re et si des deux faces de la butan-2-one peuvent tre obtenues directement partir de la reprsentation plane de la molcule. Ainsi, comme laccoutume, on commence par classer les trois substituants du carbone trigonal daprs les rgles de priorit. Si, en regardant par-dessus la face concerne, les substituants dfilent de la priorit la plus haute celle la plus basse dans le sens des aiguilles dune montre, la configuration absolue est re, et si loppos (figure 60).
face re Me C Et O retournement de 180 O C Et

face si Me

faces nantiotopiques

Figure 60. Dtermination des configuration absolues des faces prochirales.

Le concept de prochiralit se rapporte aussi aux doubles liaisons et aux allnes qui sont substitus diffremment sur lun des atomes de carbone sp2 et identiquement sur lautre. Ds lors, il parat vident que, comme les alcnes ne sont pas dous de chiralit, lappellation prostroisomrie est plus approprie ici que la terminologie prochiralit.
H C Cl C CH 3 Cl Cl H C C CH 3 pro Z Cl groupes diastrotopiques CH 3 pro E H C C Cl CH3

configuration E

configuration Z
aR

pro aR axe de prochiralit H C Br C C Br pro aS Br atomes nantiotopiques H b

Br

b' a Br a>b a' > b'

a' Br aS

Figure 61. Prochiralit des alcnes et des allnes : exemple de coordinats autre que H. ("Strochimie des Composs Organiques" (Eliel & Willen), Eds. TecDoc, 1996.)

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En outre, dans les deux exemples dalcnes et dallnes prochiraux de la figure 61, il est mis en vidence que lhtrotopie peut galement sappliquer dautres atomes ou des groupements datomes et pas seulement aux atomes dhydrogne. Dailleurs, cest pourquoi, ds le dbut de ce paragraphe, nous avons choisi dutiliser le terme coordinat la place de atome dhydrogne ou proton . 2. Stroisomrie (ou isomrie) gomtrique