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La contaminacin del agua proviene de diversas fuentes que la afectan de manera diferente, como son: aguas residuales urbanas, aguas de origen industrial, aguas de origen agrcola, contaminacin trmica, derrame de barcos petroleros y por el proceso de eutrofizacin.
CONTAMINACIN TRMICA
Esta contaminacin se da por el aumento de la temperatura del agua producida en las centrales trmicas y nucleares, que vierten el agua utilizada a una temperatura mucho mayor que la que se da en la naturaleza, causando varios efectos fsicos, qumicos y biolgicos. Uno de los ms graves es la descomposicin del agua, agotando el oxgeno disuelto y que por lo tanto, puede provocar la muerte de muchos organismos.
petroleros que limpian sus depsitos en altamar, o cerca de los puertos, as mismo, los derrames producidos en accidentes a barcos petroleros como el que acaeci frente a las costas de Michoacn, en Mxico en el ao de 1994.
PROCESO DE EUTROFIZACIN
A causa del vertido de residuos, qumicos, aguas negras y otros materiales, aumentan los nutrientes en las aguas y provocan un gran crecimiento de algas que ni siquiera la fauna es capaz de consumir, por lo que al morir, estas algas aumentan las poblaciones de bacterias que las degradan y que consumen el oxgeno en los cuerpos de agua, hasta un punto en que la hacen inservible para otros tipos de vida, (por ejemplo, esto es lo que suceda en los canales de Xochimilco, D.F.)