CONSTITUCIN GENTICA DE UNA POBLACIN FRECUENCIAS GNICAS Y GENOTPICAS

La existencia de variacin gentica es una condicin necesaria para que haya evolucin. Si asumimos que, para un determinado locus, todos los individuos de una poblacin son homocigticos para una misma variante allica, no podr haber evolucin en dicho locus, puesto que las frecuencias gnicas no pueden cambiar de generacin en generacin. Por el contrario, si otra poblacin presenta dos alelos para este locus, podr experimentar un cambio evolutivo: un alelo podra aumentar de frecuencia a expensas del otro alelo. Los cambios hereditarios a travs de las generaciones son subyacentes al proceso evolutivo. La gentica de poblaciones estudia la constitucin gentica de las poblaciones y cmo esta constitucin gentica cambia a travs del tiempo. A la hora de describir una poblacin desde el punto de vista gentico ser necesario especificar los genotipos posibles, indicando cuntos individuos de cada genotipo integran esa poblacin. Supongamos, para simplificar, que estamos interesados en un determinado locus autosmico, A, y que hubiera dos alelos diferentes para ese locus, A1 y A2, entre los individuos de la poblacin. Entonces habra tres genotipos posibles, A 1A1, A1A2 y A2A2 (nos centraremos, a lo largo del curso, en organismos diploides). La constitucin gentica de la poblacin, o del grupo de individuos, quedara perfectamente descrita por la proporcin, o porcentaje, de individuos pertenecientes a cada genotipo o, en otras palabras, por las frecuencias de los tres genotipos en la poblacin. Estas proporciones o frecuencias se denominan frecuencias genotpicas. Si, por ejemplo, encontramos que una cuarta parte de los individuos de la poblacin son A1A1, la frecuencia de este genotipo sera 0.25, o 25%. Obviamente, la suma de las frecuencias genotpicas debe ser 1, o 100%. Supongamos que analizamos un total de N individuos de una poblacin y encontramos los siguientes nmeros: Genotipos N individuos Frecuencias genotpicas A1A1 N11 N11/N A1A2 N12 N12/N A2A2 N22 N22/N TOTAL N 1

Denominaremos P a la frecuencia de homocigotos A1A1, H a la frecuencia de heterocigotos A 1A2, y Q a la frecuencia de homocigotos A2A2.

P+H+Q=1 Ejemplo. Para ilustrar la determinacin de las frecuencias genotpicas de una poblacin para un determinado locus autosmico, consideremos el sistema M-N de grupos sanguneos. Existen tres grupos sanguneos, M, N y MN, que estn determinados por dos alelos, L y L , de un mismo locus, de acuerdo con la siguiente relacin: Grupo sanguneo M MN N
M N

Genotipo L L L L L L
N M M M N

Se analiz una muestra de 730 individuos de la poblacin aborigen australiana y se encontr que 22 individuos eran de grupo M, 216 de grupo MN y 492 de grupo N. Las frecuencias de los grupos sanguneos y de los correspondientes genotipos se obtienen dividiendo el nmero de individuos de cada genotipo por el total de individuos analizados. Por ejemplo, la frecuencia del grupo sanguneo M (y, por tanto, del genotipo L L ) es 22/730=0.030. Una forma de describir la variacin gentica para el locus M-N en este grupo de individuos sera indicando las frecuencias de los tres genotipos (frecuencias genotpicas): Genotipo N de individuos Frecuencias genotpicas L L 22 0.030
M M M M

L L 216

L L 492

TOTAL 730 1

0.296

0.674

Como podemos comprobar, P + H + Q = 0.030 + 0.296 + 0.674 = 1 Si asumimos que los 730 individuos constituyen una muestra aleatoria de aborgenes australianos, podemos considerar las frecuencias genotpicas observadas en la muestra como caractersticas de la poblacin australiana. Una muestra aleatoria es una muestra representativa, no sesgada, de una poblacin. Una poblacin, en el sentido gentico, no es slo un grupo de individuos, sino un grupo reproductivo; y as, el anlisis gentico de una poblacin no slo se centra en determinar la constitucin gentica de los individuos que la integran sino tambin en analizar la transmisin de

genes de una generacin a la siguiente. En el proceso de transmisin hereditaria, los genotipos de los padres se rompen, constituyndose un nuevo conjunto de genotipos en la progenie a partir de los genes transmitidos en los gametos. As pues, los genes contenidos en una poblacin tienen continuidad de generacin en generacin; no as las combinaciones genotpicas en que stos genes aparecen. En este sentido, resulta conveniente describir la constitucin gentica de una poblacin refirindonos al conjunto de genes que contiene y a la frecuencia con que aparecen en la poblacin frecuencias gnicas o allicas. Indicaremos, por tanto, los alelos presentes en cada locus y el nmero, o proporcin, de los diferentes alelos de cada locus en la poblacin. Si, por ejemplo, A 1 es un alelo del locus A, la frecuencia de alelos A1, o la frecuencia gnica de A1, es la proporcin o porcentaje del total de genes de ese locus que pertenecen a la variante A1. La suma de las frecuencias gnicas o allicas para cualquier locus tiene que ser 1, o el 100%. Las frecuencias gnicas se pueden estimar conociendo el nmero de individuos de cada genotipo presentes en un grupo de individuos, o a partir de las frecuencias genotpicas de esa poblacin Para calcular las frecuencias gnicas directamente a partir del nmero de individuos de los distintos genotipos, contamos simplemente el nmero de veces que encontramos un alelo y dividimos por el nmero total de genes presentes en la muestra. Como anteriormente, consideremos que analizamos un total de N individuos de una poblacin y encontramos los siguientes nmeros: . Genotipos N individuos A1A1 N11 A1A2 N12 A2A2 N22 TOTAL N

El nmero total de genes presentes en la muestra con respecto al locus considerado es 2N. El nmero de alelos A1 presentes en esta muestra de 2N genes es: 2N11 + N12. El nmero de alelos A2 presentes en esta muestra de 2N genes es: 2N22 + N12.

Si denominamos p a la frecuencia del alelo A1 y q a la frecuencia del alelo A2: p = (2N11 + N12) / 2N = (N11 / N) + (N12 / N) = P + H q = (2N22 + N12) / 2N = (N22 / N) + (N12 / N) = Q + H

p+q=1 Por tanto, las frecuencias gnicas se pueden calcular directamente a partir de las frecuencias genotpicas, considerando que todos los alelos presentes en homocigotos son de un determinado tipo, mientras que slo la mitad de los alelos de los heterocigotos son de un determinado tipo. Por tanto, la frecuencia de un alelo es la frecuencia de individuos homocigticos para ese alelo ms la mitad de la frecuencia de heterocigotos para este alelo. Consideremos ahora un ejemplo numrico. Supongamos que hay dos alelos, A 1 y A2, y que clasificamos un total de 100 individuos, determinando cuntos de ellos pertenecen a cada uno de los tres genotipos posibles, y que encontramos los siguientes resultados: Genotipos N de individuos N de genes A1 A2 A1A1 30 60 0 A1A2 60 60 60 A2A2 10 0 20 TOTAL 100 120 80 200

Puesto que cada individuo, al ser diploide, lleva dos genes en un determinado locus autosmico, en realidad, hemos analizado una muestra de 200 genes para este locus. Cada individuo A1A1 contiene dos genes A1 y cada individuo A1A2 contiene un gen A1. Por tanto, hay 120 genes A1 en la muestra y 80 genes A2. La frecuencia de A1 es del 60% o 0.6 (120/200), y la frecuencia de A2 es del 40% o 0.4 (80/200). Para calcular las frecuencias gnicas directamente a partir de las frecuencias genotpicas procederamos de la siguiente manera: Genotipos N de individuos Frecuencias genotpicas A1A1 30 0.30 A1A2 60 0.60 A2A2 10 0.10 TOTAL 100 1

La frecuencia del alelo A1 es: p = P + H = 0.30 + 0.60 = 0.60 La frecuencia del alelo A2 es: q = Q + H = 0.10 + 0.60 = 0.40

Como podemos comprobar p + q = 0.60 + 0.40 = 1.

EJEMPLO 2
Para ilustrar con otro ejemplo el clculo de las frecuencias gnicas a partir de las frecuencias genotpicas, podemos partir de los resultados obtenidos en el EJEMPLO 1 para el caso del sistema de grupos sanguneos M-N analizado en la poblacin aborigen australiana. Como hemos dicho, los grupos sanguneos M y N representan los dos genotipos homocigticos y el grupo MN el heterocigoto. La frecuencia del alelo L en la poblacin australiana ser p = 0.030 + 0.296 = 0.178, y la frecuencia del alelo L ser q = 0.674 + 0.296 = 0.822. Como podemos comprobar p + q = 0.178 + 0.822 = 1, LGICO!.
N M

En la siguiente tabla, se muestran las frecuencias gnicas y genotpicas para el locus M-N en tres poblaciones humanas.
N de individuos de grupo sanguneo Poblacin M aborigen 22 australiana indios Navaho 305 MN 216 52 3039 N 492 4 1303 Total 730 361 6129 Frecuencias genotpicas L L
M M

Frecuencias gnicas
N

L L

L L

0.030 0.845 0.292

0.296 0.144 0.496

0.674 0.011 0.213

0.178 0.917 0.539

0.822 0.083 0.461

caucsica 1787 U.S.

Como se desprende de la tabla, las poblaciones humanas son bastante diferentes entre s con respecto a este locus. Como vemos, este tipo de anlisis permite poner de manifiesto la existencia de variabilidad gentica intra-poblacional y de diferencias genticas inter-poblacionales. Para determinar las frecuencias gnicas cuando el nmero de alelos posibles para un determinado locus es mayor de dos, se siguen las mismas reglas que se aplican para un locus con dos alelos: los homocigotos llevan dos copias de un alelo, los heterocigotos llevan una copia de cada uno de los dos alelos presentes.

EJEMPLO 3
En la especie Drosophila willistoni se encontraron seis genotipos distintos para el locus Lap-5 en los siguientes nmeros:

Genotipo N de individuos

98/98 2

100/100 54 0.344

103/103 172 0.108

98/100 38 0.076

98/103 20 0.040

100/103 214 0.428

TOTAL 500 1

Frec 0.004 genotpicas

Las frecuencias genotpicas se obtienen dividiendo el nmero de veces que se observa un determinado genotipo por el nmero total de individuos (genotipos) analizados. As, por ejemplo, la frecuencia del genotipo 98/98 es 2/500 = 0.004. La frecuencia de un determinado alelo (frecuencia gnica) se puede obtener a partir de las frecuencias genotpicas, sumando la frecuencia de homocigotos para ese alelo y la mitad de la frecuencia de cada uno de los genotipos heterocigotos portadores de dicho alelo. As, si denominamos p a la frecuencia del alelo 98, q a la frecuencia del alelo 100 y r a la frecuencia del alelo 103, podemos calcular estas frecuencias como sigue: Frecuencia del alelo 98: p = 0.004 + (0.076 + 0.040) = 0.062

homocigotos 98/98 heterocigotos 98/100 heterocigotos 98/103 Frecuencia del alelo 100: q = 0.344 + (0.076 + 0.428) = 0.596 Frecuencia del alelo 103: r = 0.108 + (0.040 + 0.428) = 0.342

Como podemos comprobar, p + q + r = 0.062 + 0.596 + 0.342 = 1.

POLIMORFISMO Y HETEROCIGOSIDAD
Una medida de variacin gentica intrapoblacional es la proporcin de loci polimrficos, o simplemente el polimorfismo (P), en una poblacin. Consideremos que, utilizando tcnicas de electroforesis, analizamos 30 loci enPhoronopsis viridis, un tipo de gusano marino que vive en las costas de California, y que no encontramos variacin en 12 de esos loci, pero s alguna en los 18 loci restantes. Podemos decir que 18/30 = 0.60 de los loci son polimficos en esa poblacin, o que el nivel de polimorfismo en la poblacin es 0.60. Supongamos que analizamos otras tres poblaciones de P. viridis y que el nmero de loci polimrficos, de los 30 analizados, es 15, 16 y 14,

respectivamente. El nivel de polimorfismo en estas tres poblaciones es 0.50, 0.53 y 0.47, respectivamente. La cantidad de polimorfismo es una medida til de la variacin gentica intrapoblacional, pero presenta dos defectos principales: su arbitrariedad y su imprecisin. El nmero de loci variables observados depende de cuantos individuos se examinen. Consideremos, por ejemplo, que hemos analizado 100 individuos en la primera poblacin de Phoronopsis. Si hubiramos analizado ms individuos, podramos haber encontrado variacin en alguno de los 12 loci que aparecen invariables; si hubiramos analizado menos individuos, alguno de los 18 loci polimrficos podra haberse mostrado invariable. Para evitar este efecto del tamao de la muestra, es necesario adoptar un criterio de polimorfismo. Uno de los criterios ms utilizado es considerar que un locus es polimrfico slo si su alelo ms comn no supera la frecuencia de 0.95, o del 95%. De esta forma, al analizar ms individuos podrn encontrarse nuevas variantes, pero como media la proporcin de loci polimrficos no cambiar. Sin embargo, resulta en cierto modo arbitrario el decidir que criterio de polimorfismo aplicar y, dependiendo del criterio elegido, obtendremos diferentes niveles de polimorfismo. Por ejemplo, si el criterio de polimorfismo elegido fuera que la frecuencia del alelo ms comn no superara el 98%, es posible que otros loci se consideraran polimrficos, que no lo son atendiendo al criterio del 95% (por ejemplo, un locus con dos alelos con frecuencias 0.97 y 0.03). Adems, el polimorfismo de una poblacin es una medida imprecisa de variacin gentica, ya que un locus ligeramente polimrfico contribuye igual a la medida que un locus altamente polimrfico. Supongamos, por ejemplo, que para un determinado locus hay dos alelos con frecuencias 0.95 y 0.05, mientras que para otro locus hay 20 alelos, cada uno de ellos con una frecuencia de 0.05. Resulta obvio que hay ms variacin gentica en el segundo locus que en el primero, pero ambos contribuiran lo mismo al nivel de polimorfismo bajo el criterio del 95%. Una mejor medida de variacin gentica (porque no es arbitraria y es precisa) es la frecuencia media de individuos heterocigotos por locus o, lo que es lo mismo, la heterocigosidad de la poblacin. Se calcula obteniendo primero la frecuencia de individuos heterocigotos en cada locus y determinando, posteriormente, la media de estas frecuencias para todos los loci. Consideremos que estudiamos cuatro loci en una poblacin, y encontramos que la frecuencia de heterocigotos para estos loci es 0.25, 0.42, 0.09 y 0, respectivamente. Basndonos en la informacin de estos cuatro loci, la heterocigosidad sera (0.25 + 0.42 + 0.09 + 0) / 4 = 0.19. Concluiramos que la heterocigosidad de la poblacin es del 19%. Evidentemente, para obtener una buena estima de la

heterocigosidad de una poblacin sera necesario analizar bastantes ms de cuatro loci, pero el procedimiento de clculo sera el mismo.

GENTICA DE POBLACIONES
1.Concepto de poblacin y Gentica de Poblaciones:

Una poblacin es un conjunto de individuos de la misma especie que viven en un lugar geogrfico determinado (nicho ecolgico) y que real o potencialmente son capaces de cruzarse entre s, compartiendo un acervo comn de genes. (poza de genes o pool gnico).

La Gentica de Poblaciones estudia:

la constitucin gentica de los individuos que componen las poblaciones (frecuencias gnicas y genotpicas). la transmisin de los genes de una generacin a la siguiente (gametos=nexos de unin entre una generacin y la siguiente). utilizando modelos matemticos sencillos, cuando se considera 1 slo locus y una sola fuerza actuando sobre la poblacin, diseados para individuos diploides con reproduccin sexual.

2. .

Locus A:

alelos A1 y A2 Genotipos: A1A1 A1A2

A2A2

En codominancia existen 3 genotipos = 3 fenotipos

En dominancia completa existen 3 genotipos = 2 fenotipos

+ Constitucin gentica frecuencias genotpicas

Frecuencias fenotpicas de una poblacin son las proporciones o porcentajes de individuos de cada fenotipo que estn presentes en la poblacin.

Nmero de individuos de un fenotipo Nmero total de individuos

Frecuencias genotpicas de una poblacin son la proporciones o porcentajes de individuos de cada genotipo que estn presentes en la poblacin

Nmero de individuos de un genotipo Nmero total de individuos

La suma de las frecuencias genotpicas ser 1

En Codominancia: frecuencias fenotpicas = frecuencias genotpicas. En dominancia: frecuencias fenotpicas =/= frecuencias genotpicas. Ejemplo:

Genotipos A1A1 A1A2 A2A2 Total

N de individuos 15 30 5 50

Frecuencias genotpicas 15/50 = 0,3 => 30% 30/50 = 0,6 => 60 % 5/50 = 0,1 => 10 % 1 100%

+ Transmisin de los genes de una generacin a la siguiente

Generacin 0 ============> Generacin 1 Frec, genot. 0 genes Gametes Frec. genot. 1

Frecuencias gnicas son las proporciones de los diferentes alelos en cada locus, presentes en la poblacin.

La suma de las frecuencias gnicas ser 1.

Genotipos

N de individuos

N de genes A1 A2

A1A1 A1A2 A2A2 Total

30 60 10 100

60 60 0 120

0 60 10 80

Frecuencias del alelo A1 => 120/200 = 0,6 Frecuencias del alelo A2 => 80 / 200 = 0,4

De forma ms general:

Genotipos A1A1 A1A2 A2A2 Total

N de individuos n1 n2 n3 N

Frecuencias genotpicas n1/N = D n2/N = H n3/N =R 1 => 100%

D+H+R=1

Relacin entre frecuencias gnicas y frecuencias genotpicas:

Genes A1 Frecuencias 2n1 + n2 2D + H

---------- = ---------------- = D + 1/2H = p 2N 2D+2H+2R

A2

2n3 + n4

2R + H

---------- = ---------------- = R + 1/2H = q 2N 2D+2H+2R

La relacin entre la frecuencia gnica y la genotpica es por tanto: p = D + 1/H y q = R + 1/2H

Dos poblaciones pueden tener las mismas frecuencias gnicas p y q, pero distintas frecuencias genotpicas. Ejemplo:

N de individuos
A1A1 A1A2 20 68 A2A2 32 8 Total 100 100

Poblacin 1
Poblacin 2

48 24

Poblacin 1 : D = 0,48

H = 0,20

R = 0,32

p = 0,48 + (1/2) 0,20 = 0,58 (frecuencia gnica) q = 0,32 + (1/2) 0,20 = 0,42 (frecuencia gnica)

Poblacin 1 : D = 0,24

H = 0,68

R = 0,08

p = 0,24 + (1/2) 0,68 = 0,58 (frecuencia gnica) q = 0,08 + (1/2) 0,68 = 0,42 (frecuencia gnica)

Conclusin: Las frecuencias gnicas o allicas pueden calcularse a partir de las frecuencias genotpicas, pero no se pueden calcular las frecuencias genotpicas a partir de las frecuencias gnicas o allicas.