Biomolculas: conceptos bsicos Son molculas que solamente se encuentran en la materia viva, se clasifican en glcidos, lpidos, protenas y cidos

nucleicos; el conjunto de todos ellos constituye lo que se llama materia orgnica. De forma general, se utilizan biolgicamente para tres funciones: estructural (forman estructuras biolgicas), energtica (liberan almacenan energa), y dinmica (intervienen en reacciones biolgicas). 1. Glcidos Siempre contienen C, H, y O , y qumicamente se pueden definir como polialcoholes con un grupo carbonilo (aldehdo cetona). Realizan las siguientes funciones: - Proporcionan energa , hasta 4 Klas/gr (glucosa), y la almacenan (almidn, glucgeno). - Forman estructuras (celulosa, ribosa del RNA, etc.) - Constituyen molculas de tipo dinmico (vitamina C, heparina, etc.). Los principales grupos son: a) Monosacridos: son los ms sencillos. A veces se les llama azcares por su sabor dulce, y carbohidratos por contener el H y el O en la misma proporcin que el agua. Su frmula general es CnH2nOn , siendo n un nmero de C entre 3 y 7: triosas, tetrosas, pentosas, etc. Segn que su grupo carbonilo sea un aldehdo una cetona, los monosacridos sern respectivamente Aldosas Cetosas.

Figura 3: El monosacrido Glucosa en su forma abierta (Fisher) y sus anmeros y cerrados (Haworth)

Isomera: Una de sus caractersticas es que presentan estereoisomera debido a que alguno varios de sus carbonos son asimtricos, es decir que sus cuatro enlaces se saturan con radicales distintos. El nmero de estereoismeros de una molcula es 2n , siendo n el nmero de carbonos asimtricos que tenga. De esta manera se forman los epmeros, molculas que se diferencian segn que el radical alcohlico (-OH) del carbono asimtrico ms alejado del grupo carbonilo se site a la derecha (forma D: la mayora en la naturaleza) a la izquierda (forma L), y si estos ismeros forman estructuras especulares constituyen enantiomorfos. Este tipo de isomera no tiene nada que ver con los ismeros pticos que tambin aparecen en las molculas con carbonos asimtricos: en este caso, el ismero ptico llamado dextrgiro ( +), cuando se encuentra disuelto desva hacia la derecha el plano de la luz polarizada que lo atraviesa, y el ismero levgiro ( -), lo desva hacia la izquierda. Podemos encontrar ismeros D(+), como la glucosa (dextrosa), y D(-), como la fructosa (levulosa). Los monosacridos con

ms de cuatro carbonos no se suelen encontrar en forma abierta (representacin de Fisher), sino formando anillos, es decir en forma cclica (representacin de Haworth), de tipo pentagonal (furanos) hexagonal (piranos), y entonces contienen un nuevo tipo de carbono asimtrico que se llama anomrico, y forman, por tanto, dos nuevos ismeros: el anmero , cuando el radical -OH de ese carbono se sita por debajo del plano del anillo (posicin trans), y el anmero , cuando se sita por encima (posicin cis). Estos ismeros tienen distinto poder de rotacin de la luz polarizada, y cuando se encuentran en disolucin se produce la mutarrotacin: cambio gradual del poder rotatorio de la luz polarizada que atraviesa esa disolucin, hasta estabilizarse. Principales monosacridos Gliceraldehido Dihidroxiacetona Eritrosa y eritrulosa Ribosa y desoxirribosa Ribulosa

Tipo Aldotriosa Cetotriosa Tetrosas Aldopentosas Cetopentosa

Funcin Intermediarios en la gluclisis Intermediarios en el ciclo de Calvin Constituyentes de los c. Nuclicos Aceptor del CO2 en la fotosntesis Molcula energtica por excelencia

Glucosa

Aldohexosa

b) Disacridos: Se forman por la unin de dos monosacridos, crendose el enlace O-Glucosdico, , y de tipo monocarbonlico (unin entre el carbono anomrico del primer monosacrido y otro no anomrico del segundo; en este caso se conserva el poder reductor: G + G Maltosa ; Gal + G Lactosa), dicarbonlico (unin de los dos carbonos anomricos de ambos monosacridos, con lo que se pierde el poder reductor: G + F Sacarosa). Los disacridos suelen tener funcin energtica, hidrolizndose para obtener sus monosacridos constituyentes.

Figura 4: Estructura del disacrido sacarosa

c) Polisacridos: Se forman por la unin de miles de unidades de monosacridos (principalmente glucosas), estableciendo enlaces glucosdicos entre ellos, y perdiendo en este proceso el poder reductor, la solubilidad (forman dispersiones coloidales), la cristalizacin, y el sabor dulce. Si los enlaces son del tipo , el polisacrido tendr funcin de reserva energtica: almidn (formado por amilosa, lineal, y amilopectina, ramificada) en las clulas vegetales, y glucgeno (molcula helicoidal y parecida a la amilopectina del almidn, pero ms ramificada) en las animales. Si el enlace es de tipo , el polisacrido tendr funcin estructural: celulosa (estructura lineal y sin ramificar) de la pared celular de los vegetales, quitina (unin de miles de NAGs), formando exosqueletos de artrpodos y la pared celular de los hongos.

Figura 5: El polisacrido celulosa est formado por miles de glucosas unidas por enlaces glucosdicos. Por ello tiene funcin estructural

2. Lpidos Formados por C,H y O, se caracterizan por su insolubilidad en agua y su composicin hidrocarbonada. Actan como materiales de reserva energtica (pueden proporcionar 9 Kcals/gr), como materiales estructurales (membranas celulares), como molculas dinmicas (vitaminas liposolubles, ciertas hormonas, etc). Los ms sencillos son: a) cidos grasos, compuestos por una cadena lineal de un nmero par de carbonos, y una funcin cido terminal: CH3-(CH2)n-COOH. Si slo contiene enlaces sencillo son saturados (c. palmtico, esterico), y si presenta dobles enlaces son insaturados (oleico, linoleico). Su funcin es de reserva energtica, y pueden esterificarse (a travs del enlace ster) con alcoholes formando steres, que se hidrolizan a su vez recomponiendo sus constituyentes. Asimismo pueden saponificarse con lcalis, obtenindose jabones (sales orgnicas). Su principal propiedad es su comportamiento anfiptico, derivado del hecho de poseer una zona lipfila en su molcula (la cadena hidrocarbonada), y otra hidrfila (el radical cido), lo que les hace insolubles en agua, formando micelas mono bicapa.

Figura 6: Bicapa lipdica con extremos hidrfilos y doble capa central hidrfoba: carcter anfiptico

b) Los lpidos que se forman al esterificarse cidos grasos con alcoholes de diverso tipo se llaman saponificables, pues tienen la propiedad de saponificarse. De ellos, los ms sencillos son los glicridos acilglicridos, de funcin de reserva energtica, esterificados con glicerina: oleina, estearina, palmitina, y que normalmente se llaman grasas, aceites y sebos. Cuando el alcohol con que se esterifica el cido graso es de cadena muy larga, se forman los cridos (ceras), que se caracterizan por ser muy lipfilos ( =hidrfobos) y tener funcin protectora. Si los glicridos contienen otros compuestos, forman los fosfolpidos (lecitina, cefalina) y esfingolpidos (esfingomielina, ganglisidos), fundamentales en las clulas pues forman la estructura bicapa de las membranas celulares: lpidos de membrana.

Figura 7: Reaccin de esterificacin para formar un glicrido (ster), y de saponificacin

c) Un tercer tipo de lpidos se caracterizan por no contener cidos grasos en su composicin, y por tanto no poder saponificarse: lpidos insaponificables. Su funcin suele ser metablica, y algunos son muy importantes: terpenos como el fitol (alcohol de la clorofila), las vitaminas A,E y K , el caucho, y esteroides como el colesterol, la vitamina D, las hormonas de la corteza suprarrenal y sexuales.

3. Protenas

Contienen siempre C,H,O y N, y estn constitudas por la unin de unas unidades bsicas llamadas aminocidos ('s), que qumicamente contienen una funcin amina y otra cido.

a) Aminocidos como tienen carbonos asimtricos, tambin tienen estereoisomera (en la naturaleza, la mayor parte son formas L), y actividad ptica dextro (+) levo (-).

Qumicamente tienen carcter anftero por presentar doble ionizacin, y se comportan como cidos bases dependiendo del medio en que se encuentren. Los 's que se unen entre s para formar protenas se llaman proteingenos (unos 20), y lo hacen estableciendo un enlace caracterstico de tipo amida: el enlace peptdico, que puede romperse mediante hidrlisis.

Cuando la cantidad de 's que se unen es pequea, se forma un polipptido, p. ej. la insulina. b) Las protenas, para ser biolgicamente activas necesitan conformarse tridimensionalmente, y pasan sucesivamente por las estructuras 1, 2 y 3. La estructura primaria es la secuencia de 's de la protena, es decir el nmero, tipo y orden de colocacin de sus 's. A continuacin se pliega mediante enlaces no peptdicos, obtenindose la estructura secundaria: enrollamientos espirales (-hlice) lminas plegadas (-lminas). Finalmente se conforma tridimensionalmente mediante nuevos plegamientos, adquiriendo la estructura terciaria: conformacin filamentosa, formndose protenas insolubles de funcin estructural, p.ej. la queratina, conformacin globular, apareciendo protenas solubles con funcin dinmica, p.ej los enzimas. Si la protena est constituda por ms de una subunidad (protmeros), entonces debe adquirir la estructura cuaternaria, unindose tales subunidades (p.ej. la hemoglobina). Las protenas pueden inactivarse mediante calor, cambios de pH, agitacin, perdiendo su estructura 2, 3 4 (no los enlaces peptdicos, que se rompen mediante hidrlisis), lo que se llama desnaturalizacin, que puede ser reversible e irreversible. Quiz su propiedad ms caracterstica es su especificidad, lo que quiere decir que cada especie, incluso los individuos de la misma especie, tienen protenas distintas que realizan la misma funcin. Ello es debido a que se forman a travs del mensaje gentico: DNA RNA Protena.

Figura 8: Conformacin de una protena en sus estructuras 2, 3 y 4

c) Las protenas ms sencillas slo contienen 's en su composicin y se llaman holoprotenas, pudiendo ser globulares, con funcin dinmica (albminas, histonas, globulinas), filamentosas, con funcin estructural (colgeno, queratina, elastina). Si contienen, adems de 's (grupo proteico), otros componentes (grupo prosttico), se llaman heteroprotenas protenas conjugadas, y suelen tener funciones dinmicas: g-globulinas (anticuerpos), lipoprotenas (HDL y LDL), fosfoprotenas (casena), cromoprotenas (Hb, citocromos, clorofila), y nucleoprotenas (fibra de cromatina). Las protenas tienen mltiples funciones biolgicas: estructural, energtica (pueden proporcionar 4 Kclas/gr), transporte, hormonal, regulacin del pH, etc. Una de tales funciones es imprescindible: la funcin biocatalizadora de los enzimas. d) Los enzimas son protenas (excepto los ribozimas) globulares que catalizan todas las reacciones biolgicas. Se caracterizan por su gran especificidad, por no alterarse en el transcurso de la reaccin y por aumentar muchsimo la velocidad de la reaccin que catalizan (a veces hasta 1 milln de veces). Esta reaccin enzimtica se regula mediante variaciones de la temperatura, pH, concentracin del sustrato (molcula sobre la que acta el enzima), cofactores a travs de la propia enzima: enzimas alostricos, en los sistemas multienzimticos, mediante un mecanismo de feed-back. Hay enzimas de tipo heteroprotenas (holoenzimas), cuyo grupo no proteico es una molcula orgnica

que se une a la parte protenica con enlaces no covalentes. Estos grupos no proteicos se llaman coenzimas y pueden actuar separadamente del enzima en procesos biolgicos muy importantes: CoA, NAD, FAD, etc.

Figura 9: La reaccin enzimtica: el enzima permanece inalterable

4. cidos nuclicos Son biomolculas orgnicas que contienen siempre C, H, O, N y P, estructurados en unidades bsicas llamadas nucletidos. a) Un nucletido contiene tres componentes: una pentosa (ribosa desoxirribosa), un fosfato, y una base nitrogenada (Adenina, Citosina, Guanina, Timina Uracilo). Algunos de ellos actan sin formar cidos nucleicos, es decir, sin unirse entre s, y su funcin es imprescindible: ATP, con funcin energtica, coenzimas como el NAD, transportador de e- y H+, etc. Cuando se unen entre s muchos mononucletidos, mediante enlaces fosfodister 5' 3' (esta notacin indica que los nucletidos se unen entre el C5 de la pentosa de uno de ellos y el C3 de la pentosa del siguiente nucletido), se forma un polinucletido cido nuclico. DNA Tamao Estructura Disposicin - Muy grande - Bicatenario (doble cadena)(excepto en ciertos virus) - Abierta (eucariotas) - Circular (procariotas) - Desoxirribosa - A, C, G, T -Duplicacin (reproduccin) - Transcripcin (formacin de RNA) - Almacenamiento de la informacin gentica - Pequeo - Monocatenario (1 cadena)(excepto en ciertos virus) - Abierta (normalmente) RNA

Tipo de pentosa Bases nitrogenadas Funcin

- Ribosa - A, C, G, U - Traduccin (formacin de protenas)

Figura 10: Estructura de un nucletido

b) DNA: cido desoxirribonuclico. Es el material gentico (en algunos virus puede ser RNA) de todos los organismos. Presenta una estructura primaria: la secuencia de bases del polinucletido, que se agrupan funcionalmente formando genes, con grupos de bases que se expresan (exones), y grupo que no lo hacen (intrones). Cuando dos hebras de DNA se emparejan de forma antiparalela, estableciendo puentes de hidrgeno entre sus bases complementarias (A-T y C-G), y se enrollan en una doble hlice en molcula abierta (eucariotas) circular (procariotas), el DNA adquiere su estructura secundaria (modelo de Watson & Crick). Finalmente, el DNA se empaqueta asocindose con protenas (normalmente histonas), en cinco niveles:

1) 2) 3) 4) 5)

Collar de perlas, formando la fibra de cromatina: DNA asociado con histonas. Enrollamiento en solenoide. Bucles de solenoides. Rosetas y rodillos. Cromosoma (sucesin de rodillos).

Figura 11: Empaquetamiento del DNA hasta formar el cromosoma

c) RNA: cido ribonuclico. Es un polinucletido monocatenario (excepto en algunos virus) de ribosa, que se dispone en estructura primaria, aunque a veces forma estructura secundaria de doble hlice formando plegamientos con la misma cadena. Su funcin es traducir la informacin gentica de los genes (DNA) a protenas, a travs del cdigo gentico. Para ello presenta tres tipos bsicos de molcula: RNAt (de transferencia soluble): caracterstico por su forma de hoja de trbol, y que contiene el triplete (grupo de tres bases) que se une con los 's para capturarlos en el citoplasma y transportarlos hasta los ribosomas, y el anticodn, triplete complementario de cada uno de los codones del RNAm , que sirve para leer la secuencia en el orden adecuado e ir disponiendo correctamente los 's de las protenas. RNAm (mensajero): contiene los codones del cdigo gentico: tripletes de bases que expresan cada uno un 's concreto. Se ir leyendo en los ribosomas capturando consecutivamente los 's que ha transportado el RNAt, y disponindolos exactamente al reconocerse el codn del RNAm por el anticodn complementario del RNAt. RNAr (ribosmico): Se asocia con protenas y forma la estructura de los ribosomas.

Figura 12: El RNA