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UNIDAD 2, CLASE 2: VIRUS, TEORA CELULAR, CLULAS Y BACTERIAS

17/04/2012

A modo de repaso, en el ciclo ltico la clula hospedera termina reventndose, pues los virus terminan ocupando todo el espacio citoplasmtico, destruyndola, y en consecuencia todas esas partculas vricas quedan nuevamente en el medio extracelular y son libres de atacar otras clulas. Este sistema es el que se utiliza normalmente en laboratorio cuando se quiere colocar, por ejemplo, un fragmento de un genoma o un genoma completo dividido en trocitos, se clona y se coloca dentro de estos virus y luego se infectan bacterias para producir grandes cantidades de virias que tengan guardado el genoma, de un individuo de un organismo, como una planta, una misma bacteria o un organismo eucaritico animal. Lo que interesa despus es poder aislar y caracterizar genes especficos a partir de trozos ms pequeos y no utilizar el genoma completo. Despus, es posible rescatar el DNA que esta al interior del virus y empezar a trabajarlo pero con trozos ms manipulables y no un genoma completo. El genoma humano tiene un tamao de 3,7x10^9, es bastante grande y no se puede trabajar con todo para buscar un gen; se puede ahora con algunas tcnicas, pero es mucho ms fcil trabajar con un trozo ms pequeo. Entonces se corta en trocitos de aproximadamente 20.000 pares de bases, y estos se colocan dentro del genoma de un virus al cual previamente se le ha eliminado un trozo de aproximadamente 20 kilobases (20.000 bases) para remplazarlo por el trozo que interesa del genoma humano en este caso, de 20.000 pares de bases apenas que es bastante ms manipulable. De sta forma se puede guardar genoma, y a esta tcnica se le llama genoteca. La genoteca permite aprovechar estas caractersticas del virus, su capacidad de hacer ciclo ltico, y tener copias del fragmento de DNA equivalentes a todas las veces que sea capaz de copiarse esta partcula vrica dentro de una bacteria. Pero los virus no solamente hacen ciclo ltico, sino que tambin hacen un ciclo lisognico y depende exclusivamente de la expresin de una cierta protena si se hace ciclo ltico o si se hace ciclo lisognico.

El ciclo lisognico consiste en que cuando ingresa el DNA al interior de la clula, ste es capaz de recombinar con el DNA genmico de la clula, de tal forma que se inserta dentro del ambiente celular y por lo tanto convive con l, forma parte del genoma de la clula, prcticamente no se expresa, sino que simplemente aprovecha las instancias de replicacin de la clula, para replicarse a s mismo, pero no expresa ninguno de sus genes y esta camuflado dentro del genoma de la bacteria. As pueden pasar varias generaciones, y en ese momento se dice que se habla de un profago o provirus. En este caso lo llamaremos profago porque todos los fagos infectan a las clulas bacterianas, en cambio, en un sistema de planta o en un sistema animal hablamos de provirus. Entonces, as el virus puede vivir un tiempo, salvo que se produzca una situacin que Brbara McClintock llam estrs genmico, donde por un shock tan fuerte pueden producirse daos en el genoma. Los nazis, por ejemplo, sometieron a poblaciones polacas a largos perdos de hambruna, dejndolas raquticas y sus generaciones posteriores siguieron raquticas, les provocaron un shock genmico; o como el resultado de una mutacin por luz ultravioleta o rayos X, un agente qumico que pudieron haber aspirado en su momento y que provoc un cambio sobre su genoma. Hay muchas formas de provocar daos en el DNA, y ste puede traducirse simplemente en una rotura simple o un nick. Como sabemos el DNA es de doble hebra y cuando hablamos de nick, se produjo una rotura en una de las hebras, no en las dos, lo que es suficiente para decir que hubo dao genmico. Pues bien, estos virus tienen un sistema que llaman S.O.S., pero no es un llamado de auxilio, sino ms bien un slvese quien pueda!. El virus, al ser capaz de detectar que hubo un nick sobre el genoma, una seal de que existe la posibilidad de muerte celular, inmediatamente se separa, se escinde del genoma, se vuelve a recircularizar e inicia todo el proceso de un ciclo ltico. Por esto el ciclo lisognico puede pasar inadvertido durante mucho tiempo. El virus herpes, por ejemplo, puede pasar aos inadvertido, pero al someterse el portador a un estrs genmico se expresa. Una persona expuesta a los rayos ultravioleta del sol de la playa, por poner un caso, Pgina 1

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puede sufrir de herpes ya que esta radiacin llega al DNA y produce un nick en distintas partes de la doble hebra que es detectado por el virus y por lo tanto lo hace volver a su ciclo ltico.

los virus animales no provocan lisis (salvo el caso del virus herpes), se van eliminando de a poco ya que no les interesa destruir a la clula, por lo que permite la recuperacin de la membrana citoplasmtica.

En esta imagen se muestra como ocurre la infeccin de un virus animal: en el cual existe una envoltura, que es casi una membrana citoplasmtica. Al ingresar se lleva parte de la membrana de la clula, lo cual significa que el virus en definitiva, tiene los mismos receptores a nivel de membrana y los mismos elementos de reconocimiento, por lo tanto se produce fcilmente la fusin de membranas y el virus puede quedar en el interior de la clula. Una vez en el interior, lo nico que falta por hacer es simplemente que se produzca el desacoplamiento entre las protenas de la cpside y el DNA o RNA del virus y que el material gentico quede disponible en el citoplasma de la clula. Tambin pasa por las mismas etapas de un ciclo normal, la nica diferencia es que aqu hay una endocitosis y al mismo tiempo, el virus entra con su cpside; en el caso contrario la cpside queda fuera. Replicacin de un virus DNA: el virus ingresa a la clula y se desacopla de las protenas de la cpside. Un virus DNA dar origen a un RNAm, y ste podr traducir las protenas necesarias para la cpside. La maquinaria de replicacin ya esta en el interior de la clula, las DNA polimerasas estn disponibles de tal manera que este virus no necesita replicar para una polimerasa, por lo tanto de lo nico que se hace cargo es de su material para favorecer la replicacin, y lo nico que necesita bsicamente es traducir las protenas de la cpside. Una vez que se ha replicado el virus se vuelve a reconformar la partcula vrica, eliminndose por exocitosis o por un sistema de crenacin, donde no se produce la ruptura de la clula. La mayor parte de las veces

Replicacin de un virus RNA doble hebra: inicialmente se separan las dos hebras, donde una de las hebras es positiva y suficiente para ser traducida y dar origen a la replicasa y a las protenas de la cpside. Luego se utiliza la hebra negativa para dar origen a la hebra positiva y la hebra positiva para dar origen a la hebra negativa. Finalmente se encapsidan y son liberados nuevamente fuera de la clula.

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Aqu se muestra el caso de un virus RNA+, en el cual el RNA+ puede ser utilizado para poder generar la replicasa y las protenas de la cpside e inmediatamente salir, y otro caso, donde un virus RNA- el cual hay debe transformarse a RNA+ y poseer la replicasa previamente para poder producir las hebras de RNA+ y a partir de esta volver a generar todas las hebras RNA-, encapsidarla y enviarla fuera de la clula. * Los virus RNA no pueden hacer ciclo lisognico, pues para hacerlo hay que integrarse en el genoma. La excepcin la conforman los retrovirus. Replicacin de un retrovirus: en el caso del retrovirus, ste viene con una envoltura, ingresa al interior de la clula y la transcriptasa inversa que trae consigo transforma al RNA viral en DNA viral, que recombina con el DNA genmico de la clula, se inserta dentro del genoma celular, y queda inserto como si fuera parte del mismo y pasa inadvertido tericamente, pero desde aqu comienza a generar RNAm para que expresen las protenas del virus, transcriptasa inversa nuevamente, las protenas de la cpside y tambin toda la progenie (RNA genmico) de las nuevas partculas vricas. ste virus tampoco destruye a la clula inmediatamente, porque est en el interior, por lo tanto pueden pasar aos hospedndolo y el dao se producir de a poco.

dentro del genoma del virus. Cuando el virus esta sintetizando estas protenas no lo transcribe todo, sino una parte: puede transcribir un RNAm solo para transcriptasa inversa por ejemplo, otro para otra protena y as sucesivamente, por tanto cada uno de esos RNAm va a dar origen a una protena correspondiente. Pero estos adems tienen un sistema de promotor que estn en los extremos, que regulan la expresin total de los genes, y tambin regulan el origen de un RNAm para la progenie. Esa regulacin la hace el propio virus, dividiendo su produccin en fragmentos o cadenas de RNA completo, y este, al igual que los RNAs de la propia clula no se degrada, pues posee un conjunto de elementos para que las RNAsas no lo degraden. Por ejemplo, a todos los RNA mensajeros se le coloca una cabeza que se llama cap y una cola de adeninas en el extremo para que las RNAsas degraden las adeninas y no la informacin, lo que es hecho normalmente por las clulas, y con estos RNa virales sucede lo mismo, por lo que no terminan degradados en el citoplasma de la clula y la proteccin de los fragmentos tambin se hace de la misma forma para que no sean degradados. De esa manera tenemos la molcula completa del genoma y tenemos tambin fracciones del genoma cuando nos interesa que se produzca una protena determinada.

* Liberacin de virus con envoltura.

Dentro del provirus hay varios genes: una transcriptasa inversa, una helicasa, protenas de unin a RNA y las protenas de la cpside, etc. Todo Fundamentos Biolgicos de la Medicina Prof. Simn Ruiz Pgina 3

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Dentro del genoma del virus hay unas protenas de la envoltura, las cuales se sintetizan de tal forma que van a ser instaladas en la membrana citoplasmtica de la clula hospedera. El virus sale de la clula por exocitosis; en este proceso, las protenas de la envoltura se agrupan, se produce un cierre y se forma una vescula que queda al exterior del espacio intracelular, es decir, el virus con su cpside y su material gentico esta rodeado en parte por la membrana citoplasmtica, y por protenas de la envoltura que ella misma codific. Por lo tanto, la membrana citoplasmtica que forma parte de la vescula, adems de llevar la informacin contenida en las protenas de la envoltura, trae consigo todas las caractersticas propias de la clula (Protenas integrales, fosfolpidos, carbohidratos, etc.); la clula no se muere instantnea ni completamente, es por eso que cuando contraemos hepatitis C, por ejemplo, a los 20 aos, recin a los 50 nos damos cuenta que padecemos la enfermedad, cuando el hgado ya esta daado casi en su totalidad. No obstante, hay que tener en cuenta que slo las clulas del mismo tejido pueden volver a reconocer al virus, en el caso de la hepatitis, cuando el virus sale de un hepatocito, infecta inmediatamente al hepatocito adyacente, hasta lograr una invasin completa al tejido heptico, lo que conlleva a que toda la maquinaria celular este trabajando a disposicin de las necesidades del virus.

cantidad de partculas vricas producidas es casi insignificante, y su tiempo de multiplicacin para infectar el rgano por completo es relativamente largo. Comparacin entre la infeccin de un bacterifago y un virus animal En ambos casos debe existir una interaccin entre la membrana citoplasmtica de la clula hospedera y el virus, independiente de que la morfologa de cada especie vrica sea distinta. No obstante, esto revela procesos de unin algo distintos (adhesin de las fibras e inyeccin del material gentico de manera directa al espacio intracelular en el caso del bacterifago; fusin y fisin del plasmalema, para atravesar por completo hacia el interior de la clula, incluyendo el desacoplamiento enzimtico de la cpside en el caso del virus animal) Pueden existir, posterior a su insercin, procesos lisognicos (o de latencia, principalmente destinados a la multiplicacin del virus), o lticos (en donde se destruye por completo la clula y se liberan las partculas vricas ya reproducidas).

*Infeccin por virus bacterifago * Recin a principios de la dcada de los 90 se ide la manera de detectar el virus de la hepatitis C en las transfusiones sanguneas. * El gran tiempo que demora en manifestarse la enfermedad se debe a que, en un comienzo, la Fundamentos Biolgicos de la Medicina Prof. Simn Ruiz Pgina 4

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Infeccin por virus animal Ningn proceso metablico, gentico o fisiolgico que realice la clula es azaroso. Si tomamos como ejemplo la codificacin del ADN para formar una protena, no puede pensarse que el ARN mensajero transcrito esta flotando dentro del ncleo hasta que por casualidad encuentra un complejo de poro para salir al citoplasma, en donde continua movindose sin destino fijo, en un tiempo quizs indeterminado, hasta que se adhiera, tambin por casualidad, a un ribosoma para producirse su traduccin. Si los procesos celulares fuesen as, las posibilidades de supervivencia seran mnimas, y el desarrollo evolutivo ser excesivamente largo, es decir, desde que comenz la vida en la tierra, hace miles de millones de aos, recin ahora se estara produciendo la primera divisin celular de esa clula primitiva. Podemos concluir, entonces, que existen mecanismos y estructuras celulares que aseguren la rapidez y eficacia de estos procesos. Si un virus quiere salir de la clula, necesita en una primera instancia, marcar el lugar por donde har exocitosis. Por ejemplo, si tenemos una clula cbica del epitelio estratificado del intestino, el virus no puede salir por las zonas laterales, ya que existe una adhesin muy fuerte con la clula vecina, el espacio intercelular es casi inexistente. Por donde puede salir entonces? Si sale por la zona apical, llegar al lumen del intestino y seguir la va digestiva hasta excretarse a travs de las heces. Entonces, la zona ms favorable para salir es por el dominio basal de la clula, para migrar hacia los vasos sanguneos y distribuirse por el organismo. Para ello, necesita

mandar un mecanismo que sealice la zona por donde se producir la exocitosis, y esas precisamente son las protenas de la envoltura. No obstante, es posible que dichas protenas se equivoquen, hayan pillado otra seal o exista una mutacin en el genoma que le impida su correcto funcionamiento. Por esta razn, el virus se multiplica muchsimas veces, para que, cuando existan errores en su destino y se dirija hacia la parte apical en vez de la parte basal, no afecte el proceso infeccioso que esta llevando a cabo. Todo esto esta determinado por la codificacin de la protenas y las siguientes modificaciones post traduccionales. * La vida solo se concibe con la existencia de una clula. Los complejos supramoleculares no son vida por si solos, a menos que estn incluidos en la maquinaria celular.

Desde hace cientos de miles de aos, los primeros seres con raciocinio se cuestionaron el origen de la vida. Al principio se avalaron ciertas hiptesis como que, para que nazca un organismo X, este debiese provenir necesariamente de otro (u otros) organismos X (de la misma especie). Pero esto difcilmente explicaba el origen del primer ser vivo. La explicacin, en ese entonces, ms fcil y convincente fue la de la generacin espontanea, la que tuvo vigencia hasta fines del siglo XIX. Dentro de otras cosas, esta teora propona que con ciertas condiciones ambientales, sumadas a desechos inorgnicos, podan producir seres vivos de la nada (el caso ms conocido fue la receta de como crear ratones; una prenda sudada, trigo y humedad, todo eso en un recipiente abierto por 21 das; el olor cambia, se produce una fermentacin, lo que da origen a cras de ratones). Hubo poco inters en tratar de refutar dichas proposiciones, ya que cualquier idea contraria a la generacin espontanea, poda ser considerada como hereja por el tribunal de la inquisicin, y costaba la vida con la guillotina.

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Dentro de los primeros cientficos en oponerse a la generacin espontanea encontramos a: Francisco Redi (1668): Coloc cuatro vasos en los que puso respectivamente un trozo de carne de buey. Prepar luego otros cuatro vasos con los mismos materiales y los dej abiertos, mientras que los primeros permanecan cerrados hermticamente. Al poco tiempo algunas moscas fueron atradas por los alimentos dejados en los vasos abiertos y entraron a comer y a poner huevos; transcurrido un lapso de tiempo, en esta serie de vasos comenzaron a aparecer algunas larvas. Esto no se verific, en cambio, en los vasos cerrados, ni siquiera despus de varios meses. Por tal motivo, Redi lleg a la conclusin que las larvas (gusanos) se originaban de las moscas y no por generacin espontnea de la carne en descomposicin.

en su estado inicial. Pasteur demostr as que los microorganismos no provenan de la generacin espontnea, sino que de esporas que se encuentran en el aire, y al encontrar un lugar propicio para su reproduccin, proliferan. Gracias a Pasteur, la idea de la generacin espontnea fue desterrada del pensamiento cientfico y a partir de entonces se acept de forma general el principio que deca que todo ser vivo procede de otro ser vivo.

Los dos experimentos anteriores, a pesar de refutar una de las ideas ms permanentes y errneas en el tiempo, no ofrecieron una explicacin respecto al origen de la vida en la tierra. Louis Pasteur (1872): Utiliz dos frascos de cuello de cisne (similares a un baln de destilacin con boca larga y encorvada). Estos matraces tienen los cuellos muy alargados que se van haciendo cada vez ms finos, terminando en una apertura pequea, y tienen forma de "S". En cada uno de ellos meti cantidades iguales de caldo de carne (o caldo nutritivo) y los hizo hervir para poder eliminar los posibles microorganismos presentes en el caldo. La forma de "S" era para que el aire pudiera entrar y que los microorganismos se quedasen en la parte ms baja del tubo. Pasado un tiempo observ que ninguno de los caldos presentaba seal alguna de la presencia de algn microorganismo y cort el tubo de uno de los matraces. El matraz abierto tard poco en descomponerse, mientras que el cerrado permaneci Teora de Oparin-Haldane El bioqumico ruso, Alexander Oparin y el bioqumico y genetista ingls John Haldane, por separado y en diferentes aos propusieron la teora que nos explica el origen y evolucin de las primeras clulas a partir de la materia orgnica del medio acutico, producto de la sntesis abitica de los compuestos presentes en la atmsfera secundaria de la Tierra y por accin de diversas fuentes de energa. La accin de los diferentes tipos de energa provoc que, a partir de la materia de la atmsfera secundaria (principalmente molculas inorgnicas como metano, acido sulfhdrico, amonaco, etc), se sintetizaran abiticamente en el medio acutico molculas orgnicas simples. Estas a su vez daban origen a molculas orgnicas ms complejas o monmeros de Pgina 6

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compuestos orgnicos (aminocidos, monosacridos, cidos grasos y bases nitrogenadas) cuya concentracin en los mares form la "sopa primitiva". Dichas subunidades estructuraron por polimerizacin las macromolculas orgnicas: los monosacridos crearon los carbohidratos, stos junto con las bases nitrogenadas hicieron los nucletidos; los cidos grasos formaron los lpidos, finalmente los aminocidos crearon los polipptidos y protenas. Al incrementarse su produccin los compuestos orgnicos se acumularon en forma acelerada en esta sopa; la concentracin que hubo en zonas poco profundas tuvo como consecuencia la formacin de molculas coloidales de un mayor tamao y a su vez de una estructura compleja, compuestas de mezclas de protenas, carbohidratos y alguna molcula precursora de los cidos nucleicos. La unin supramolecular de estos compuestos gener la aparicin de las primeras expresiones de vida, denominadas coacervadas, los cuales fueron la base de todas las especies encontradas en la actualidad. La comprobacin de esta hiptesis fue realizada experimentalmente por Stanley Miller y Harold Urey. El experimento consisti, bsicamente, en someter una mezcla de metano, amonaco, hidrgeno, dixido de carbono, nitrgeno y agua en un recipiente a altas temperaturas, en donde herva y se le aplicaban descargas elctricas de 60.000 voltios (simulando la atmosfera primitiva). Como resultado, se observ la formacin de una serie de molculas orgnicas, entre la que destacan cido actico, urea, y los aminocidos glicina, alanina, cido glutmico y cido asprtico, usados por las clulas como los pilares bsicos para sintetizar sus protenas. En el aparato se introdujo la mezcla gaseosa, el agua se mantena en ebullicin y posteriormente se realizaba la condensacin; las sustancias se mantenan a travs del aparato mientras dos electrodos producan descargas elctricas continuas en otro recipiente. Despus que la mezcla haba circulado a travs del aparato, por medio de una llave se extraan muestras para analizarlas.

Inicialmente, los coacervados eran uniones relativamente estables de dichas molculas orgnicas, que carecan de membrana plasmtica. Cuando pudieron sintetizar por primera vez una bicapa fosfolipdica, adquirieron independencia, quedando consolidadas como una nica partcula.

Origen de la vida: Un conjunto de disciplinas se ha dedicado a estudiar cmo se inici la vida en la tierra, como por ejemplo los paleontlogos y paleobotnicos. Actualmente existe un consenso dentro de los especialistas:

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Con la aparicin de la cianobacteria, la cual era capaz de generar oxgeno, comenz la diversificacin de especies. El microscopio Todas las investigaciones acerca del origen de la vida en la tierra se han hecho gracias al microscopio. Fue a partir de la invencin de ste que empez el estudio de la clula.

Con lo anterior se genera la Teora celular: La clula: Es la unidad estructural de los seres vivos (todos formados por clulas). Es la unidad funcional (realiza todos los procesos que le permiten vivir). Es la unidad de reproduccin (procede de otra ya existente). Es la unidad gentica (contienen el material hereditario que pasa de clulas madres a hijas). Existen dos grandes tipos de clulas: procariontes y eucariontes. Principal diferencia: la presencia de envoltura nuclear que se encuentra presente slo en eucariontes. En las Procariontes en cambio, no hay compartimentarizacin celular (no hay membranas), y en algunos casos hay presencia de una invaginacin de la membrana citoplasmtica para crear ambientes distintos dentro de la clula. Compartimentacin celular Clula Procarionte: no posee, ya que no cuenta con membranas en su interior. Clula Eucarionte: se organiza en base a compartimentos creados por membranas internas, similares a las que delimitan la clula. Ncleo, retculo endoplsmico, complejo de Golgi, mitocondrias, son compartimentos con funcionalidad especfica en estas clulas. Caractersticas generales de las bacterias: Poseen membrana y pared celular. Dicha pared si bien es similar a la de las clulas vegetales, pero con un componente fundamental distinto, peptidoglicano. Las bacterias son haploides en su forma natural, un solo alelo para cada gen. La nica excepcin es la conjugacin de bacterias, donde hay una transferencia de parte del material gentico, y puede darse una bacteria diploide parcial. Pgina 8

Los primeros microscopios se hicieron alrededor del ao 1600. En 1590, los artesanos holandeses Hans y Zacharias Jansen, improvisaron el primer microscopio compuesto (el microscopio compuesto estaba formado por dos lentes montadas en cada extremo de un tubo hueco. Actualmente stos permiten un aumento mil veces mayor sobre la imagen real). En 1639 Robert Hooke mejor este aparato y observ finos cortes de corcho y lo que vio le record a las celdillas de un panal de abejas, de all el nombre de clulas. A pesar que Hooke no observ clulas vivas, se le considera la primera persona que observ e identific las clulas. Aos ms tarde de las observaciones de Hooke, Anton Van Leeuwenhoek, comerciante holands, construy el microscopio simple, con una sola lente. El mismo ampliaba 200 veces el objetivo, a diferencia del de Hooke que solo aumentaba 30 veces los objetos. Leeuwenhoek a partir de 1676 empez a observar organismos simples, bacterias.

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Poseen flagelos constituidos a base de una sola protena, flagelina. El movimiento se da por un gradiente de protones que ocurre en la membrana, a diferencia de la clula eucaritica donde se obtiene energa del rompimiento de ATP. El movimiento se realiza en un solo sentido. Poseen pilis o fimbrias, constituidas por una sola protena, pilina. Su funcin va en anclaje y comunicacin para la transferencia de material gentico en la conjugacin. Pueden presentar cpsulas formadas por hidratos de carbono. Suelen ser txicas, por lo que estn presentes en la mayora de las bacterias que producen enfermedades. Nota: algunas cianobacterias son capaces de realizar fotosntesis, otras de producir oxgeno. Ambas, capacidades muy importantes para los inicios de la vida en la Tierra. Bacterias segn forma:

*Espirilos Bacterias segn tincin de Gram Bacterias Gram positivas: poseen una sola membrana plasmtica con gran cantidad de peptidoglicanos. Toman un color azul con la tincin, que no se decolora al agregarle etanol.

*Bacilos

Bacterias Gram negativas: poseen dos membranas, una citoplasmtica con peptidoglicano pequeo, y otra ms externa formada por lpidos. La tincin gran alcanza la membrana ms externa, que es fcilmente decolorada por el etanol gracias a su composicin.

*Cocos

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NOTA: Las bacterias realizan biparticin o fisin, no utilizan la mitosis, pero aun as, el material se reparte equitativamente. Existe un escaso nmero de bacterias que posee un carcter asociativo, lo cual permite: Formacin de colonias bacterianas. Reparticin funcional dentro de la colonia. Esto supone un gran avance, ya que el resto de las bacterias que no poseen sta capacidad, al ser organismos unicelulares, deben realizar todos los procesos que en organismos pluricelurares se reparten entre numerosas clulas; defensa, percepcin, regulacin reconocimiento, etc.

*Colonia bacteriana

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