Estructura y Funcin de los cidos nucleicos

Estructura de los cidos Nucleicos Componentes Bsicos

Ncleotidos Azcar Fosfato Base Nitrogenada

Bases Nitrogenadas
Purinas Adenina Guanina Pirimidinas Citosina Timina (ADN) Uracilo (ARN)

La doble hlice

Diferencias estructurales del ADN y el ARN

Por qu Timina en el ADN y Uracilo en el ARN?
La Citosina se deamina espontneamente formando Uracilo. Las enzimas reparadoras reconocen estas "mutaciones" y reemplazan Us por Cs. Si no hubiera Timina (5-metil-U): Cmo distinguir las U normales de las resultantes de deaminacin?
NH3 H20

Por qu 2-dideoxi en el ADN ?

Dos grupos OH en el ARN lo hacen ms susceptible a hidrlisis. El ADN sin OH en 2 es ms estable a hidrlisis.

Estructura secundaria del ADN: Caractersticas Principales

Dos cadenas polinucleotdicas enrolladas en una doble hlice dextrgira. Las hebras son antiparalelas. Los esqueletos azcar-fosfato en el exterior de la doble hlice. Pares de base planares a travs de puentes de hidrgeno, en el centro de la estructura: A T (2 H) GC (3H) Pares de base separados 3.4 A. Una vuelta de hebra (3.4 nm) tiene aprox. 10 pares de base. La posicin de los esqueletos azcar-fosfato definen surco mayor y menor.
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Odio ser una molcula de ADN!!

Hay tanta informacin que debo recordar!!

Flujo de informacin
en la clula

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Reglas de Sntesis de Molculas Informativas

cidos nucleicos y protenas

Formados por un nmero limitado de subunidades.

Las unidades son agregadas secuencialmente formando cadenas lineales. Cada cadena tiene un punto de inicio, avanza en una nica direccin y tiene un punto de finalizacin. Los productos de la sntesis primaria son modificados previamente a cumplir su funcin.

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Seales en el ADN
Seales Dnde comienza y termina un gen? Dnde comienza y termina una protena? Como leer estas seales? Legibilidad
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Legibilidad de secuencias de ADN

Accesibilidad a la secuencia (surcos mayor y menor) Variacin con movimientos de pares de base Formas alternativas del ADN

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Propiedades Fsico-qumicas de los cidos Nucleicos

1. Desnaturalizacin de los cidos nucleicos
Desnaturalizacin Parcial del ADN necesaria para procesos de copiado. Experimental
Aumento de Temperatura Regiones ricas en AT se disocian primero

Por temperatura
Se analiza mediante espectroscopa
Aumento de Temperatura Disociacin cooperativa de las hebras

Separacin de hebras y formacin de ovillos Tm : un reflejo de la composicin promedio de un ADN Depende del contenido de GC

Tm
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Temperatura de disociacin
T a la que la mitad del ADN est disociado

Desnaturalizacin de los cidos Nucleicos: Tm

Tm : un reflejo de la composicin promedio de un ADN
Se analiza mediante espectroscopa Depende del contenido de GC Tm Temperatura de disociacin T a la que la mitad del ADN est disociado

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2. Renaturalizacin del ADN

Reaccin Bimolecular Encuentro de hebra complementaria Zipping de complementarias Depende del tiempo y de la concentracin de reactantes Aplicaciones Complejidad del genoma Bsqueda de secuencias especficas

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Reasociacin de ADN: complejidad del genoma

Permite analizar complejidad de un genoma: Secuencias repetidas reasocian rpidamente

Secuencias nicas reasocian lentamente

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3. Hibridacin de cidos nucleicos

Bsqueda de secuencias especficas en mezclas complejas de cidos nucleicos

En solucin En soportes slidos

Southern Blot Northern Blot Dot blot Micro-arrays
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ADN ARN

Hibridacin de cidos Nucleicos

En soportes slidos
Southern Blot Northern Blot Dot blot Micro-arrays ADN ARN

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Estructura Terciaria de los cidos Nucleicos: palndromes, horquillas y cruciformes

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Acidos nucleicos monocatenarios: Estructura secundaria y terciaria

Los ARN suelen adoptar distintas conformaciones, muchas de ellas estables y mantenidas por regiones autocomplementarias.

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Estructuras complejas de ARN

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Topologa y funcin
Superenrollamiento necesario para la compactacin del ADN y su funcin. In vivo la mayora del ADN est superenrollado negativamente. Esto favorece la disociacin local de las hebras, importantes durante la duplicacin y transcripcin. Enzimas topoisomerasas regulan los niveles de superenrollamiento celular. Es posible que se formen estructuras alternativas debido a desenrollamientos locales generados por superollamiento.

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