cido desoxirribonucleico Saltar a: navegacin, bsqueda Artculo destacado ADN redirige aqu.

Para otras acepciones, vase ADN (desambiguacin). DNA redirige aqu. Para otras acepciones, vase DNA (desambiguacin). Situacin del ADN dentro de una clula eucariota. El cido desoxirribonucleico, frecuentemente abreviado como ADN, es un cido nucleic o que contiene instrucciones genticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos los organismos vivos conocidos y algunos virus, y es responsable de su tr ansmisin hereditaria. El papel principal de la molcula de ADN es el almacenamiento a largo plazo de informacin. Muchas veces, el ADN es comparado con un plano o un a receta, o un cdigo, ya que contiene las instrucciones necesarias para construir otros componentes de las clulas, como las protenas y las molculas de ARN. Los segm entos de ADN que llevan esta informacin gentica son llamados genes, pero las otras secuencias de ADN tienen propsitos estructurales o toman parte en la regulacin de l uso de esta informacin gentica. Desde el punto de vista qumico, el ADN es un polmero de nucletidos, es decir, un po linucletido. Un polmero es un compuesto formado por muchas unidades simples conect adas entre s, como si fuera un largo tren formado por vagones. En el ADN, cada va gn es un nucletido, y cada nucletido, a su vez, est formado por un azcar (la desoxirr ibosa), una base nitrogenada (que puede ser adenina?A, timina?T, citosina?C o gu anina?G) y un grupo fosfato que acta como enganche de cada vagn con el siguiente. Lo que distingue a un vagn (nucletido) de otro es, entonces, la base nitrogenada, y por ello la secuencia del ADN se especifica nombrando slo la secuencia de sus b ases. La disposicin secuencial de estas cuatro bases a lo largo de la cadena (el ordenamiento de los cuatro tipos de vagones a lo largo de todo el tren) es la qu e codifica la informacin gentica: por ejemplo, una secuencia de ADN puede ser ATGC TAGATCGC... En los organismos vivos, el ADN se presenta como una doble cadena de nucletidos, en la que las dos hebras estn unidas entre s por unas conexiones denom inadas puentes de hidrgeno.1 Para que la informacin que contiene el ADN pueda ser utilizada por la maquinaria celular, debe copiarse en primer lugar en unos trenes de nucletidos, ms cortos y c on unas unidades diferentes, llamados ARN. Las molculas de ARN se copian exactame nte del ADN mediante un proceso denominado transcripcin. Una vez procesadas en el ncleo celular, las molculas de ARN pueden salir al citoplasma para su utilizacin p osterior. La informacin contenida en el ARN se interpreta usando el cdigo gentico, que especifica la secuencia de los aminocidos de las protenas, segn una corresponde ncia de un triplete de nucletidos (codn) para cada aminocido. Esto es, la informacin gentica (esencialmente: qu protenas se van a producir en cada momento del ciclo de vida de una clula) se halla codificada en las secuencias de nucletidos del ADN y debe traducirse para poder funcionar. Tal traduccin se realiza usando el cdigo gent ico a modo de diccionario. El diccionario "secuencia de nucletido-secuencia de am inocidos" permite el ensamblado de largas cadenas de aminocidos (las protenas) en e l citoplasma de la clula. Por ejemplo, en el caso de la secuencia de ADN indicada antes (ATGCTAGATCGC...), la ARN polimerasa utilizara como molde la cadena comple mentaria de dicha secuencia de ADN (que sera TAC-GAT-CTA-GCG-...) para transcribi r una molcula de ARNm que se leera AUG-CUA-GAU-CGC-... ; el ARNm resultante, utili zando el cdigo gentico, se traducira como la secuencia de aminocidos metionina-leuci na-cido asprtico-arginina-... Las secuencias de ADN que constituyen la unidad fundamental, fsica y funcional de la herencia se denominan genes. Cada gen contiene una parte que se transcribe a ARN y otra que se encarga de definir cundo y dnde deben expresarse. La informacin contenida en los genes (gentica) se emplea para generar ARN y protenas, que son lo s componentes bsicos de las clulas, los "ladrillos" que se utilizan para la constr uccin de los orgnulos u organelos celulares, entre otras funciones.

Dentro de las clulas, el ADN est organizado en estructuras llamadas cromosomas que , durante el ciclo celular, se duplican antes de que la clula se divida. Los orga nismos eucariotas (por ejemplo, animales, plantas, y hongos) almacenan la mayor parte de su ADN dentro del ncleo celular y una mnima parte en elementos celulares llamados mitocondrias, y en los plastos y los centros organizadores de microtbulo s o centrolos, en caso de tenerlos; los organismos procariotas (bacterias y arque as) lo almacenan en el citoplasma de la clula, y, por ltimo, los virus ADN lo hace n en el interior de la cpsida de naturaleza proteica. Existen multitud de protenas , como por ejemplo las histonas y los factores de transcripcin, que se unen al AD N dotndolo de una estructura tridimensional determinada y regulando su expresin. L os factores de transcripcin reconocen secuencias reguladoras del ADN y especifica n la pauta de transcripcin de los genes. El material gentico completo de una dotac in cromosmica se denomina genoma y, con pequeas variaciones, es caracterstico de cad a especie. ndice 1 Historia de la gentica 2 Propiedades fsicas y qumicas 2.1 Componentes 2.2 Apareamiento de bases 2.2.1 Otros tipos de pares de bases 2.3 Estructura 2.3.1 Estructuras en doble hlice 2.3.2 Estructuras en cudruplex 2.4 Hendiduras mayor y menor 2.5 Sentido y antisentido 2.6 Superenrollamiento 3 Modificaciones qumicas 3.1 Modificaciones de bases del ADN 3.2 Dao del ADN 4 Funciones biolgicas 4.1 Genes y genoma 4.1.1 El ADN codificante 4.1.2 El ADN no codificante 4.2 Transcripcin y traduccin 4.3 Replicacin del ADN 4.3.1 Hiptesis sobre la duplicacin del ADN 5 Interacciones ADN-protena 5.1 Protenas que unen ADN 5.1.1 Interacciones inespecficas 5.1.2 Interacciones especficas 5.2 Enzimas que modifican el ADN 5.2.1 Nucleasas y ligasas 5.2.2 Topoisomerasas y helicasas 5.2.3 Polimerasas 6 Recombinacin gentica 7 Evolucin del metabolismo de ADN 8 Tcnicas comunes 8.1 Tecnologa del ADN recombinante 8.2 Secuenciacin 8.3 Reaccin en cadena de la polimerasa (PCR) 8.4 Southern blot 8.5 Chips de ADN 9 Aplicaciones 9.1 Ingeniera gentica 9.2 Medicina forense 9.3 Bioinformtica 9.4 Nanotecnologa de ADN 9.5 Historia, antropologa y paleontologa 10 Vase tambin

11 Referencias 11.1 Notas 11.2 Bibliografa 12 Enlaces externos Historia de la gentica Artculo principal: Historia de la gentica. Friedrich Miescher, bilogo y mdico suizo (1844-1895). El ADN lo aisl por primera vez, durante el invierno de 1869, el mdico suizo Friedr ich Miescher mientras trabajaba en la Universidad de Tubinga. Miescher realizaba experimentos acerca de la composicin qumica del pus de vendas quirrgicas desechada s cuando not un precipitado de una sustancia desconocida que caracteriz qumicamente ms tarde.2 3 Lo llam nuclena, debido a que lo haba extrado a partir de ncleos celular es.4 Se necesitaron casi 70 aos de investigacin para poder identificar los compone ntes y la estructura de los cidos nucleicos. En 1919 Phoebus Levene identific que un nucletido est formado por una base nitrogen ada, un azcar y un fosfato.5 Levene sugiri que el ADN generaba una estructura con forma de solenoide (muelle) con unidades de nucletidos unidos a travs de los grupo s fosfato. En 1930 Levene y su maestro Albrecht Kossel probaron que la nuclena de Miescher es un cido desoxirribonucleico (ADN) formado por cuatro bases nitrogena das (citosina (C), timina (T), adenina (A) y guanina (G)), el azcar desoxirribosa y un grupo fosfato, y que, en su estructura bsica, el nucletido est compuesto por un azcar unido a la base y al fosfato.6 Sin embargo, Levene pensaba que la cadena era corta y que las bases se repetan en un orden fijo. En 1937 William Astbury p rodujo el primer patrn de difraccin de rayos X que mostraba que el ADN tena una est ructura regular.7 Maclyn McCarty con Francis Crick y James D Watson. La funcin biolgica del ADN comenz a dilucidarse en 1928, con una serie bsica de expe rimentos de la gentica moderna realizados por Frederick Griffith, quien estaba tr abajando con cepas "lisas" (S) o "rugosas" (R) de la bacteria Pneumococcus (caus ante de la neumona), segn la presencia (S) o no (R) de una cpsula azucarada, que es la que confiere virulencia (vase tambin experimento de Griffith). La inyeccin de n eumococos S vivos en ratones produce la muerte de stos, y Griffith observ que, si inyectaba ratones con neumococos R vivos o con neumococos S muertos por calor, l os ratones no moran. Sin embargo, si inyectaba a la vez neumococos R vivos y neum ococos S muertos, los ratones moran, y en su sangre se podan aislar neumococos S v ivos. Como las bacterias muertas no pudieron haberse multiplicado dentro del ratn , Griffith razon que deba producirse algn tipo de cambio o transformacin de un tipo bacteriano a otro por medio de una transferencia de alguna sustancia activa, que denomin principio transformante. Esta sustancia proporcionaba la capacidad a los neumococos R de producir una cpsula azucarada y transformarse as en virulentas. E n los siguientes 15 aos, estos experimentos iniciales se replicaron mezclando dis tintos tipos de cepas bacterianas muertas por el calor con otras vivas, tanto en ratones (in vivo) como en tubos de ensayo (in vitro).8 La bsqueda del factor tran sformante que era capaz de hacer virulentas a cepas que inicialmente no lo eran c ontinu hasta 1944, ao en el cual Oswald Avery, Colin MacLeod y Maclyn McCarty real izaron un experimento hoy clsico. Estos investigadores extrajeron la fraccin activ a (el factor transformante) y, mediante anlisis qumicos, enzimticos y serolgicos, ob servaron que no contena protenas, ni lpidos no ligados, ni polisacridos activos, sin o que estaba constituido principalmente por "una forma viscosa de cido desoxirrib onucleico altamente polimerizado", es decir, ADN. El ADN extrado de las cepas bac terianas S muertas por el calor lo mezclaron "in vitro" con cepas R vivas: el re sultado fue que se formaron colonias bacterianas S, por lo que se concluy inequvoc amente que el factor o principio transformante era el ADN.9 A pesar de que la identificacin del ADN como principio transformante an tard varios aos en ser universalmente aceptada, este descubrimiento fue decisivo en el conoc

imiento de la base molecular de la herencia, y constituye el nacimiento de la ge ntica molecular. Finalmente, el papel exclusivo del ADN en la heredabilidad fue c onfirmado en 1952 mediante los experimentos de Alfred Hershey y Martha Chase, en los cuales comprobaron que el fago T2 transmita su informacin gentica en su ADN, p ero no en su protena10 (vase tambin experimento de Hershey y Chase). En cuanto a la caracterizacin qumica de la molcula, en 1940 Chargaff realiz algunos experimentos que le sirvieron para establecer las proporciones de las bases nitr ogenadas en el ADN. Descubri que las proporciones de purinas eran idnticas a las d e pirimidinas, la "equimolecularidad" de las bases ([A]=[T], [G]=[C]) y el hecho de que la cantidad de G+C en una determinada molcula de ADN no siempre es igual a la cantidad de A+T y puede variar desde el 36 hasta el 70 por ciento del conte nido total.6 Con toda esta informacin y junto con los datos de difraccin de rayos X proporcionados por Rosalind Franklin, James Watson y Francis Crick propusieron en 1953 el modelo de la doble hlice de ADN para representar la estructura tridim ensional del polmero.11 En una serie de cinco artculos en el mismo nmero de Nature se public la evidencia experimental que apoyaba el modelo de Watson y Crick.12 De stos, el artculo de Franklin y Raymond Gosling fue la primera publicacin con datos de difraccin de rayos X que apoyaba el modelo de Watson y Crick,13 14 y en ese m ismo nmero de Nature tambin apareca un artculo sobre la estructura del ADN de Mauric e Wilkins y sus colaboradores.15 Watson, Crick y Wilkins recibieron conjuntamente, en 1962, despus de la muerte de Rosalind Franklin, el Premio Nobel en Fisiologa o Medicina.16 Sin embargo, el de bate contina sobre quin debera recibir crdito por el descubrimiento.17 Propiedades fsicas y qumicas Estructura qumica del ADN: dos cadenas de nucletidos conectadas mediante puentes d e hidrgeno, que aparecen como lneas punteadas. El ADN es un largo polmero formado por unidades repetitivas, los nucletidos.18 19 Una doble cadena de ADN mide de 22 a 26 angstroms (2,2 a 2,6 nanmetros) de ancho, y una unidad (un nucletido) mide 3,3 (0,33 nm) de largo.20 Aunque cada unidad in dividual que se repite es muy pequea, los polmeros de ADN pueden ser molculas enorm es que contienen millones de nucletidos. Por ejemplo, el cromosoma humano ms largo , el cromosoma nmero 1, tiene aproximadamente 220 millones de pares de bases.21 En los organismos vivos, el ADN no suele existir como una molcula individual, sin o como una pareja de molculas estrechamente asociadas. Las dos cadenas de ADN se enroscan sobre s mismas formando una especie de escalera de caracol, denominada d oble hlice. El modelo de estructura en doble hlice fue propuesto en 1953 por James Watson y Francis Crick (el artculo Molecular Structure of Nucleic Acids: A Struc ture for Deoxyribose Nucleic Acid fue publicado el 25 de abril de 1953 en Nature ), despus de obtener una imagen de la estructura de doble hlice gracias a la refra ccin por rayos X hecha por Rosalind Franklin.22 El xito de este modelo radicaba en su consistencia con las propiedades fsicas y qumicas del ADN. El estudio mostraba adems que la complementariedad de bases poda ser relevante en su replicacin, y tam bin la importancia de la secuencia de bases como portadora de informacin gentica.23 24 25 Cada unidad que se repite, el nucletido, contiene un segmento de la estruc tura de soporte (azcar + fosfato), que mantiene la cadena unida, y una base, que interacciona con la otra cadena de ADN en la hlice. En general, una base ligada a un azcar se denomina nuclesido y una base ligada a un azcar y a uno o ms grupos fos fatos recibe el nombre de nucletido. Cuando muchos nucletidos se encuentran unidos, como ocurre en el ADN, el polmero r esultante se denomina polinucletido.26 Componentes Estructura de soporte: La estructura de soporte de una hebra de ADN est formada p or unidades alternas de grupos fosfato y azcar.27 El azcar en el ADN es una pentos a, concretamente, la desoxirribosa.

cido fosfrico: Enlace fosfodister. El grupo fosfato (PO43-) une el carbono 5' del azcar de un nuc lesido con el carbono 3' del siguiente. Su frmula qumica es H3PO4. Cada nucletido puede contener uno (monofosfato: AMP) , dos (difosfato: ADP) o tres (trifosfato: ATP) grupos de cido fosfrico, aunque co mo monmeros constituyentes de los cidos nucleicos slo aparecen en forma de nuclesido s monofosfato. Desoxirribosa: Es un monosacrido de 5 tomos de carbono (una pentosa) derivado de la ribosa, q ue forma parte de la estructura de nucletidos del ADN. Su frmula es C5H10O4. Una d e las principales diferencias entre el ADN y el ARN es el azcar, pues en el ARN l a 2-desoxirribosa del ADN es reemplazada por una pentosa alternativa, la ribosa. 25 Las molculas de azcar se unen entre s a travs de grupos fosfato, que forman enla ces fosfodister entre los tomos de carbono tercero (3', tres prima) y quinto (5', cin co prima) de dos anillos adyacentes de azcar. La formacin de enlaces asimtricos impl ica que cada hebra de ADN tiene una direccin. En una doble hlice, la direccin de lo s nucletidos en una hebra (3' ? 5') es opuesta a la direccin en la otra hebra (5' ? 3'). Esta organizacin de las hebras de ADN se denomina antiparalela; son cadena s paralelas, pero con direcciones opuestas. De la misma manera, los extremos asi mtricos de las hebras de ADN se denominan extremo 5' (cinco prima) y extremo 3' (tre s prima), respectivamente. Bases nitrogenadas: Las cuatro bases nitrogenadas mayoritarias que se encuentran en el ADN son l a adenina (A), la citosina (C), la guanina (G) y la timina (T). Cada una de esta s cuatro bases est unida al armazn de azcar-fosfato a travs del azcar para formar el nucletido completo (base-azcar-fosfato). Las bases son compuestos heterocclicos y a romticos con dos o ms tomos de nitrgeno, y, dentro de las bases mayoritarias, se cla sifican en dos grupos: las bases pricas o purinas (adenina y guanina), derivadas de la purina y formadas por dos anillos unidos entre s, y las bases pirimidnicas o bases pirimdicas o pirimidinas (citosina y timina), derivadas de la pirimidina y con un solo anillo.25 En los cidos nucleicos existe una quinta base pirimidnica, denominada uracilo (U), que normalmente ocupa el lugar de la timina en el ARN y difiere de sta en que carece de un grupo metilo en su anillo. El uracilo no se en cuentra habitualmente en el ADN, slo aparece raramente como un producto residual de la degradacin de la citosina por procesos de desaminacin oxidativa. Timina: 2, 4-dioxo, 5-metilpirimidina. Timina: En el cdigo gentico se representa con la letra T. Es un derivado pirimidnic o con un grupo oxo en las posiciones 2 y 4, y un grupo metil en la posicin 5. For ma el nuclesido timidina (siempre desoxitimidina, ya que slo aparece en el ADN) y el nucletido timidilato o timidina monofosfato (dTMP). En el ADN, la timina siemp re se empareja con la adenina de la cadena complementaria mediante 2 puentes de hidrgeno, T=A. Su frmula qumica es C5H6N2O2 y su nomenclatura 2, 4-dioxo, 5-metilpi rimidina. Citosina: 2-oxo, 4-aminopirimidina. Citosina:

En el cdigo gentico se representa con la letra C. Es un derivado pirimidnic o, con un grupo amino en posicin 4 y un grupo oxo en posicin 2. Forma el nuclesido citidina (desoxicitidina en el ADN) y el nucletido citidilato o (desoxi)citidina monofosfato (dCMP en el ADN, CMP en el ARN). La citosina siempre se empareja en el ADN con la guanina de la cadena complementaria mediante un triple enlace, C=G . Su frmula qumica es C4H5N3O y su nomenclatura 2-oxo, 4 aminopirimidina. Su masa molecular es de 111,10 unidades de masa atmica. La citosina se descubri en 1894, a l aislarla del tejido del timo de carnero. Adenina: 6-aminopurina. Adenina: En el cdigo gentico se representa con la letra A. Es un derivado de la pur ina con un grupo amino en la posicin 6. Forma el nuclesido adenosina (desoxiadenos ina en el ADN) y el nucletido adenilato o (desoxi)adenosina monofosfato (dAMP, AM P). En el ADN siempre se empareja con la timina de la cadena complementaria medi ante 2 puentes de hidrgeno, A=T. Su frmula qumica es C5H5N5 y su nomenclatura 6-ami nopurina. La adenina, junto con la timina, fue descubierta en 1885 por el mdico a lemn Albrecht Kossel. Guanina: 6-oxo, 2-aminopurina. Guanina: En el cdigo gentico se representa con la letra G. Es un derivado prico con un grupo oxo en la posicin 6 y un grupo amino en la posicin 2. Forma el nuclesido ( desoxi)guanosina y el nucletido guanilato o (desoxi)guanosina monofosfato (dGMP, GMP). La guanina siempre se empareja en el ADN con la citosina de la cadena comp lementaria mediante tres enlaces de hidrgeno, G=C. Su frmula qumica es C5H5N5O y su nomenclatura 6-oxo, 2-aminopurina. Tambin existen otras bases nitrogenadas (las llamadas bases nitrogenadas minorita rias), derivadas de forma natural o sinttica de alguna otra base mayoritaria. Lo son por ejemplo la hipoxantina, relativamente abundante en el tRNA, o la cafena, ambas derivadas de la adenina; otras, como el aciclovir, derivadas de la guanina , son anlogos sintticos usados en terapia antiviral; otras, como una de las deriva das del uracilo, son antitumorales. Las bases nitrogenadas tienen una serie de caractersticas que les confieren unas propiedades determinadas. Una caracterstica importante es su carcter aromtico, cons ecuencia de la presencia en el anillo de dobles enlaces en posicin conjugada. Ell o les confiere la capacidad de absorber luz en la zona ultravioleta del espectro en torno a los 260 nm, lo cual puede aprovecharse para determinar el coeficient e de extincin del ADN y hallar la concentracin existente de los cidos nucleicos. Ot ra de sus caractersticas es que presentan tautomera o isomera de grupos funcionales , debido a que un tomo de hidrgeno unido a otro tomo puede migrar a una posicin veci na; en las bases nitrogenadas se dan dos tipos de tautomeras: tautomera lactama-la ctima, donde el hidrgeno migra del nitrgeno al oxgeno del grupo oxo (forma lactama) y viceversa (forma lactima), y tautomera imina-amina primaria, donde el hidrgeno puede estar formando el grupo amina (forma amina primaria) o migrar al nitrgeno a dyacente (forma imina). La adenina slo puede presentar tautomera amina-imina, la t imina y el uracilo muestran tautomera doble lactama-lactima, y la guanina y citos ina pueden presentar ambas. Por otro lado, y aunque se trate de molculas apolares , las bases nitrogenadas presentan suficiente carcter polar como para establecer puentes de hidrgeno, ya que tienen tomos muy electronegativos (nitrgeno y oxgeno) qu e presentan carga parcial negativa, y tomos de hidrgeno con carga parcial positiva , de manera que se forman dipolos que permiten que se formen estos enlaces dbiles .

Se estima que el genoma humano haploide tiene alrededor de 3.000 millones de par es de bases. Para indicar el tamao de las molculas de ADN se indica el nmero de par es de bases, y como derivados hay dos unidades de medida muy utilizadas, la kilo base (kb), que equivale a 1.000 pares de bases, y la megabase (Mb), que equivale a un milln de pares de bases. Apareamiento de bases Vase tambin: Par de bases. Un par de bases C=G con tres puentes de hidrgeno. Un par A=T con dos puentes de hidrgeno. Los puentes de hidrgeno se muestran como ln eas discontinuas. La dble hlice de ADN se mantiene estable mediante la formacin de puentes de hidrgeno entre las bases asociadas a cada una de las dos hebras. Para la formacin de un e nlace de hidrgeno una de las bases debe presentar un "donador" de hidrgenos con un tomo de hidrgeno con carga parcial positiva (-NH2 o -NH) y la otra base debe pres entar un grupo "aceptor" de hidrgenos con un tomo cargado electronegativamente (C= O o N). Los puentes de hidrgeno son uniones ms dbiles que los tpicos enlaces qumicos covalentes, como los que conectan los tomos en cada hebra de ADN, pero ms fuertes que interacciones hidrfobas individuales, enlaces de Van der Waals, etc. Como los puentes de hidrgeno no son enlaces covalentes, pueden romperse y formarse de nue vo de forma relativamente sencilla. Por esta razn, las dos hebras de la doble hlic e pueden separarse como una cremallera, bien por fuerza mecnica o por alta temper atura.28 La doble hlice se estabiliza adems por el efecto hidrofbico y el apilamien to, que no se ven influidos por la secuencia de bases del ADN.29 Cada tipo de base en una hebra forma un enlace nicamente con un tipo de base en l a otra hebra, lo que se denomina complementariedad de las bases. As, las purinas forman enlaces con las pirimidinas, de forma que A se enlaza slo con T, y C slo co n G. La organizacin de dos nucletidos apareados a lo largo de la doble hlice se den omina apareamiento de bases. Este emparejamiento corresponde a la observacin ya r ealizada por Erwin Chargaff (1905-2002),30 que mostr que la cantidad de adenina e ra muy similar a la cantidad de timina, y que la cantidad de citosina era igual a la cantidad de guanina en el ADN. Como resultado de esta complementariedad, to da la informacin contenida en la secuencia de doble hebra de la hlice de ADN est du plicada en cada hebra, lo cual es fundamental durante el proceso de replicacin de l ADN. En efecto, esta interaccin reversible y especfica entre pares de bases comp lementarias es crtica para todas las funciones del ADN en los organismos vivos.18 Como se ha indicado anteriormente, los dos tipos de pares de bases forman un nmer o diferente de enlaces de hidrgeno: A=T forman dos puentes de hidrgeno, y C=G form an tres puentes de hidrgeno (ver imgenes). El par de bases GC es por tanto ms fuert e que el par de bases AT. Como consecuencia, tanto el porcentaje de pares de bas es GC como la longitud total de la doble hlice de ADN determinan la fuerza de la asociacin entre las dos hebras de ADN. Las dobles hlices largas de ADN con alto co ntenido en GC tienen hebras que interaccionan ms fuertemente que las dobles hlices cortas con alto contenido en AT.31 Por esta razn, las zonas de la doble hlice de ADN que necesitan separarse fcilmente tienden a tener un alto contenido en AT, co mo por ejemplo la secuencia TATAAT de la caja de Pribnow de algunos promotores.3 2 En el laboratorio, la fuerza de esta interaccin puede medirse buscando la tempe ratura requerida para romper los puentes de hidrgeno, la temperatura de fusin (tam bin denominado valor Tm, del ingls melting temperature). Cuando todas las pares de bases en una doble hlice se funden, las hebras se separan en solucin en dos hebra s completamente independientes. Estas molculas de ADN de hebra simple no tienen u na nica forma comn, sino que algunas conformaciones son ms estables que otras.33 Otros tipos de pares de bases Par de bases A=T de tipo Watson-Crick. En azul el donador de hidrgenos y en rojo el aceptor. Par de bases A=T de tipo Watson-Crick reverso. En azul el donador de hidrgenos y en rojo el aceptor. Ntese que la pirimidina ha sufrido un giro de 180 sobre el eje del carbono 6.

Existen diferentes tipos de pares de bases que se pueden formar segn el modo como se forman los puentes de hidrgeno. Los que se observan en la doble hlice de ADN s on los llamados pares de bases Watson-Crick, pero tambin existen otros posibles p ares de bases, como los denominados Hoogsteen y Wobble u oscilante, que pueden a parecer en circunstancias particulares. Adems, para cada tipo existe a su vez el mismo par reverso, es decir, el que se da si se gira la base pirimidnica 180 sobre su eje. Watson-Crick (pares de bases de la doble hlice): los grupos de la base prica q ue intervienen en el enlace de hidrgeno son los que corresponden a las posiciones 1 y 6 (N aceptor y -NH2 donador si la purina es una A) y los grupos de la base pirimidnica, los que se encuentran en las posiciones 3 y 4 (-NH donador y C=O ace ptor si la pirimidina es una T). En el par de bases Watson-Crick reverso partici paran los grupos de las posiciones 2 y 3 de la base pirimidnica (ver imgenes). Hoogsteen: en este caso cambian los grupos de la base prica, que ofrece una c ara diferente (posiciones 6 y 7) y que forman enlaces con los grupos de las piri midinas de las posiciones 3 y 4 (como en Watson-Crick). Tambin puede haber Hoogst een reversos. Con este tipo de enlace pueden unirse A=U (Hoogsteen y Hoogsteen r everso) y A=C (Hoogsteen reverso). Wobble u oscilante: este tipo de enlace permite que se unan guanina y citosi na con un doble enlace (G=T). La base prica (G) forma enlace con los grupos de la s posiciones 1 y 6 (como en Watson-Crick) y la pirimidina (T) con los grupos de las posiciones 2 y 3. Este tipo de enlace no funcionara con A=C, ya que quedaran e nfrentados los 2 aceptores y los 2 donadores, y slo se podra dar en el caso invers o. Encontramos pares de bases de tipo oscilante en el ARN, durante el apareamien to de codn y anticodn. Con este tipo de enlace pueden unirse G=U (oscilante y osci lante reverso) y A=C (oscilante reverso). En total, en su forma tautomrica mayoritaria, existen 28 posibles pares de bases nitrogenadas: 10 posibles pares de bases purina-pirimidina (2 pares Watson-Crick y 2 Watson Crick reverso, 1 par Hoogsteen y 2 pares Hoogsteen reverso, 1 par os cilante y 2 pares oscilante reverso), 7 pares homo purina-purina (A=A, G=G), 4 p ares A=G y 7 pares pirimidina-pirimidina. Esto sin contar con los pares de bases que pueden formarse si tambin tenemos en cuenta las otras formas tautomricas mino ritarias de las bases nitrogenadas; stos, adems, pueden ser responsables de mutaci ones puntuales por sustitucin de tipo transicin. Estructura El ADN es una molcula bicatenaria, es decir, est formada por dos cadenas dispuesta s de forma antiparalela y con las bases nitrogenadas enfrentadas. En su estructu ra tridimensional, se distinguen distintos niveles:34 35 Estructura primaria: Secuencia de nucletidos encadenados. Es en estas cadenas donde se encuent ra la informacin gentica, y dado que el esqueleto es el mismo para todos, la difer encia de la informacin radica en la distinta secuencia de bases nitrogenadas. Est a secuencia presenta un cdigo, que determina una informacin u otra, segn el orden d e las bases. Estructura secundaria: Es una estructura en doble hlice. Permite explicar el almacenamiento de l a informacin gentica y el mecanismo de duplicacin del ADN. Fue postulada por Watson y Crick, basndose en la difraccin de rayos X que haban realizado Franklin y Wilkin s, y en la equivalencia de bases de Chargaff, segn la cual la suma de adeninas ms guaninas es igual a la suma de timinas ms citosinas. Es una cadena doble, dextrgira o levgira, segn el tipo de ADN. Ambas cadena s son complementarias, pues la adenina y la guanina de una cadena se unen, respe ctivamente, a la timina y la citosina de la otra. Ambas cadenas son antiparalela

s, pues el extremo 3 de una se enfrenta al extremo 5 de la homloga. Existen tres modelos de ADN. El ADN de tipo B es el ms abundante y es el que tiene la estructura descrita por Watson y Crick. Estructura terciaria: Se refiere a cmo se almacena el ADN en un espacio reducido, para formar l os cromosomas. Vara segn se trate de organismos procariotas o eucariotas: En procariotas el ADN se pliega como una sper-hlice, generalmente en forma circular y asociada a una pequea cantidad de protenas. Lo mismo ocurre en orgnulos celulares como las mitocondrias y en los cloroplastos. En eucariotas, dado que la cantidad de ADN de cada cromosoma es muy gran de, el empaquetamiento ha de ser ms complejo y compacto; para ello se necesita la presencia de protenas, como las histonas y otras protenas de naturaleza no histnic a (en los espermatozoides estas protenas son las protaminas).34 Estructura cuaternaria: La cromatina presente en el ncleo tiene un grosor de 300 , pues la fib ra de cromatina de 100 se enrolla formando una fibra de cromatina de 300 . El enr ollamiento de los nucleosomas recibe el nombre de solenoide. Dichos solenoides s e enrollan formando la cromatina del ncleo interfsico de la clula eucariota. Cuando la clula entra en divisin, el ADN se compacta ms, formando as los cromosomas. Estructuras en doble hlice De izquierda a derecha, las estructuras de ADN A, B y Z. El ADN existe en muchas conformaciones.27 Sin embargo, en organismos vivos slo se han observado las conformaciones ADN-A, ADN-B y ADN-Z. La conformacin que adopta el ADN depende de su secuencia, la cantidad y direccin de superenrollamiento que presenta, la presencia de modificaciones qumicas en las bases y las condiciones de la solucin, tales como la concentracin de iones de metales y poliaminas.36 De l as tres conformaciones, la forma "B" es la ms comn en las condiciones existentes e n las clulas.37 Las dos dobles hlices alternativas del ADN difieren en su geometra y dimensiones. La forma "A" es una espiral que gira hacia la derecha, ms amplia que la "B", con una hendidura menor superficial y ms amplia, y una hendidura mayor ms estrecha y p rofunda. La forma "A" ocurre en condiciones no fisiolgicas en formas deshidratada s de ADN, mientras que en la clula puede producirse en apareamientos hbridos de he bras ADN-ARN, adems de en complejos enzima-ADN.38 39 Los segmentos de ADN en los que las bases han sido modificadas por metilacin pued en sufrir cambios conformacionales mayores y adoptar la forma "Z". En este caso, las hebras giran alrededor del eje de la hlice en una espiral que gira a mano iz quierda, lo opuesto a la forma "B" ms frecuente.40 Estas estructuras poco frecuen tes pueden ser reconocidas por protenas especficas que se unen a ADN-Z y posibleme nte estn implicadas en la regulacin de la transcripcin.41 Estructuras en cudruplex Estructura de un ADN en cudruplex formada por repeticiones en los telmeros. La con formacin de la estructura de soporte del ADN difiere significativamente de la tpic a estructura en hlice.42 En los extremos de los cromosomas lineales existen regiones especializadas de AD N denominadas telmeros. La funcin principal de estas regiones es permitir a la clul a replicar los extremos cromosmicos utilizando la enzima telomerasa, puesto que l as enzimas que replican el resto del ADN no pueden copiar los extremos 3' de los cromosomas.43 Estas terminaciones cromosmicas especializadas tambin protegen los extremos del ADN, y evitan que los sistemas de reparacin del ADN en la clula los p rocesen como ADN daado que debe ser corregido.44 En las clulas humanas, los telmero s son largas zonas de ADN de hebra sencilla que contienen algunos miles de repet iciones de una nica secuencia TTAGGG.45

Estas secuencias ricas en guanina pueden estabilizar los extremos cromosmicos med iante la formacin de estructuras de juegos apilados de unidades de cuatro bases, en lugar de los pares de bases encontrados normalmente en otras estructuras de A DN. En este caso, cuatro bases guanina forman unidades con superficie plana que se apilan una sobre otra, para formar una estructura cudruple-G estable.46 Estas estructuras se estabilizan formando puentes de hidrgeno entre los extremos de las bases y la quelatacin de un metal inico en el centro de cada unidad de cuatro bas es.47 Tambin se pueden formar otras estructuras, con el juego central de cuatro b ases procedente, o bien de una hebra sencilla plegada alrededor de las bases, o bien de varias hebras paralelas diferentes, de forma que cada una contribuye con una base a la estructura central. Adems de estas estructuras apiladas, los telmeros tambin forman largas estructuras en lazo, denominadas lazos telomricos o lazos-T (T-loops en ingls). En este caso, las hebras simples de ADN se enroscan sobre s mismas en un amplio crculo estabiliz ado por protenas que se unen a telmeros.48 En el extremo del lazo T, el ADN telomri co de hebra sencilla se sujeta a una regin de ADN de doble hebra porque la hebra de ADN telomrico altera la doble hlice y se aparea a una de las dos hebras. Esta e structura de triple hebra se denomina lazo de desplazamiento o lazo D (D-loop).4 6 Hendiduras mayor y menor Animacin de la estructura de una seccin de ADN. Las bases se encuentran horizontal mente entre las dos hebras en espiral. Versin ampliada49 Doble hlice: a) Dextrgira, b) Levgira. La doble hlice es una espiral dextrgira, esto es, cada una de las cadenas de nuclet idos gira a derechas; esto puede verificarse si nos fijamos, yendo de abajo a ar riba, en la direccin que siguen los segmentos de las hebras que quedan en primer plano. Si las dos hebras giran a derechas se dice que la doble hlice es dextrgira, y si giran a izquierdas, levgira (esta forma puede aparecer en hlices alternativa s debido a cambios conformacionales en el ADN). Pero en la conformacin ms comn que adopta el ADN, la doble hlice es dextrgira, girando cada par de bases respecto al anterior unos 36.50 Cuando las dos hebras de ADN se enrollan una sobre la otra (sea a derechas o a i zquierdas), se forman huecos o hendiduras entre una hebra y la otra, dejando exp uestos los laterales de las bases nitrogenadas del interior (ver la animacin). En la conformacin ms comn que adopta el ADN aparecen, como consecuencia de los ngulos formados entre los azcares de ambas cadenas de cada par de bases nitrogenadas, do s tipos de hendiduras alrededor de la superficie de la doble hlice: una de ellas, la hendidura o surco mayor, que mide 22 (2,2 nm) de ancho, y la otra, la hendid ura o surco menor, que mide 12 (1,2 nm) de ancho.51 Cada vuelta de hlice, que es cuando sta ha realizado un giro de 360 o lo que es lo mismo, de principio de hendi dura mayor a final de hendidura menor, medir por tanto 34 , y en cada una de esas vueltas hay unos 10,5 pb. Hendiduras mayor y menor de la doble hlice. La anchura de la hendidura mayor implica que los extremos de las bases son ms acc esibles en sta, de forma que la cantidad de grupos qumicos expuestos tambin es mayo r lo cual facilita la diferenciacin entre los pares de bases A-T, T-A, C-G, G-C. Como consecuencia de ello, tambin se ver facilitado el reconocimiento de secuencia s de ADN por parte de diferentes protenas sin la necesidad de abrir la doble hlice . As, protenas como los factores de transcripcin que pueden unirse a secuencias esp ecficas, frecuentemente contactan con los laterales de las bases expuestos en la hendidura mayor.52 Por el contrario, los grupos qumicos que quedan expuestos en l a hendidura menor son similares, de forma que el reconocimiento de los pares de bases es ms difcil; por ello se dice que la hendidura mayor contiene ms informacin q ue la hendidura menor.50 Sentido y antisentido Artculo principal: Antisentido.

Una secuencia de ADN se denomina "sentido" (en ingls, sense) si su secuencia es l a misma que la secuencia de un ARN mensajero que se traduce en una protena. La se cuencia de la hebra de ADN complementaria se denomina "antisentido" (antisense). En ambas hebras de ADN de la doble hlice pueden existir tanto secuencias sentido , que codifican ARNm, como antisentido, que no lo codifican. Es decir, las secue ncias que codifican ARNm no estn todas presentes en una sola de las hebras, sino repartidas entre las dos hebras. Tanto en procariotas como en eucariotas se prod ucen ARNs con secuencias antisentido, pero la funcin de esos ARNs no est completam ente clara.53 Se ha propuesto que los ARNs antisentido estn implicados en la regu lacin de la expresin gnica mediante apareamiento ARN-ARN: los ARNs antisentido se a parearan con los ARNm complementarios, bloqueando de esta forma su traduccin.54 En unas pocas secuencias de ADN en procariotas y eucariotas (este hecho es ms fre cuente en plsmidos y virus), la distincin entre hebras sentido y antisentido es ms difusa, debido a que presentan genes superpuestos.55 En estos casos, algunas sec uencias de ADN tienen una funcin doble, codificando una protena cuando se lee a lo largo de una hebra, y una segunda protena cuando se lee en la direccin contraria a lo largo de la otra hebra. En bacterias, esta superposicin puede estar involucr ada en la regulacin de la transcripcin del gen,56 mientras que en virus los genes superpuestos aumentan la cantidad de informacin que puede codificarse en sus dimi nutos genomas.57 Superenrollamiento Estructura de molculas de ADN lineales con los extremos fijos y superenrolladas. Por claridad, se ha omitido la estructura en hlice del ADN. El ADN puede retorcerse como una cuerda en un proceso que se denomina superenrol lamiento del ADN (supercoiling, en ingls). Cuando el ADN est en un estado "relajado" , una hebra normalmente gira alrededor del eje de la doble hlice una vez cada 10, 4 pares de bases, pero si el ADN est retorcido las hebras pueden estar unidas ms e strechamente o ms relajadamente.58 Si el ADN est retorcido en la direccin de la hlic e, se dice que el superenrollamiento es positivo, y las bases se mantienen junta s de forma ms estrecha. Si el ADN se retuerce en la direccin opuesta, el superenro llamiento se llama negativo, y las bases se alejan. En la naturaleza, la mayor p arte del ADN tiene un ligero superenrollamiento negativo que es producido por en zimas denominadas topoisomerasas.59 Estas enzimas tambin son necesarias para libe rar las fuerzas de torsin introducidas en las hebras de ADN durante procesos como la transcripcin y la replicacin.60 Modificaciones qumicas Cytosin.svg 5-Methylcytosine.svg Thymin.svg citosina 5-metil-citosina timina Estructura de la citosina con y sin el grupo metilo. Tras la desaminacin, la 5-me til-citosina tiene la misma estructura que la timina. Modificaciones de bases del ADN Vase tambin: Metilacin. La expresin de los genes est influenciada por la forma en la que el ADN est empaque tado en cromosomas, en una estructura denominada cromatina. Las modificaciones d e bases pueden estar implicadas en el empaquetamiento del ADN: las regiones que presentan una expresin gnica baja o nula normalmente contienen niveles altos de me tilacin de las bases citosina. Por ejemplo, la metilacin de citosina produce 5-met il-citosina, que es importante para la inactivacin del cromosoma X.61 El nivel me dio de metilacin vara entre organismos: el gusano Caenorhabditis elegans carece de metilacin de citosina, mientras que los vertebrados presentan un nivel alto - ha sta 1% de su ADN contiene 5-metil-citosina.62 A pesar de la importancia de la 5metil-citosina, sta puede desaminarse para generar una base timina. Las citosinas metiladas son por tanto particularmente sensibles a mutaciones.63 Otras modific aciones de bases incluyen la metilacin de adenina en bacterias y la glicosilacin d e uracilo para producir la "base-J" en kinetoplastos.64 65 Dao del ADN

Vase tambin: Mutacin. Benzopireno, el mayor mutgeno del tabaco, unido al ADN.66 El ADN puede resultar daado por muchos tipos de mutgenos, que cambian la secuencia del ADN: agentes alquilantes, adems de radiacin electromagntica de alta energa, com o luz ultravioleta y rayos X. El tipo de dao producido en el ADN depende del tipo de mutgeno. Por ejemplo, la luz UV puede daar al ADN produciendo dmeros de timina, que se forman por ligamiento cruzado entre bases pirimidnicas.67 Por otro lado, oxidantes tales como radicales libres o el perxido de hidrgeno producen mltiples dao s, incluyendo modificaciones de bases, sobre todo guanina, y roturas de doble he bra (double-strand breaks).68 En una clula humana cualquiera, alrededor de 500 ba ses sufren dao oxidativo cada da.69 70 De estas lesiones oxidativas, las ms peligro sas son las roturas de doble hebra, ya que son difciles de reparar y pueden produ cir mutaciones puntuales, inserciones y deleciones de la secuencia de ADN, as com o translocaciones cromosmicas.71 Muchos mutgenos se posicionan entre dos pares de bases adyacentes, por lo que se denominan agentes intercalantes. La mayora de los agentes intercalantes son molcul as aromticas y planas, como el bromuro de etidio, la daunomicina, la doxorubicina y la talidomida. Para que un agente intercalante pueda integrarse entre dos par es de bases, stas deben separarse, distorsionando las hebras de ADN y abriendo la doble hlice. Esto inhibe la transcripcin y la replicacin del ADN, causando toxicid ad y mutaciones. Por ello, los agentes intercalantes del ADN son a menudo carcing enos: el benzopireno, las acridinas, la aflatoxina y el bromuro de etidio son ej emplos bien conocidos.72 73 74 Sin embargo, debido a su capacidad para inhibir l a replicacin y la transcripcin del ADN, estas toxinas tambin se utilizan en quimiot erapia para inhibir el rpido crecimiento de las clulas cancerosas.75 El dao en el ADN inicia una respuesta que activa diferentes mecanismos de reparac in que reconocen lesiones especficas en el ADN, que son reparadas en el momento pa ra recuperar la secuencia original del ADN. Asimismo, el dao en el ADN provoca un a parada en el ciclo celular, que conlleva la alteracin de numerosos procesos fis iolgicos, que a su vez implica sntesis, transporte y degradacin de protenas (vase tam bin Checkpoint de daos en el ADN). Alternativamente, si el dao genmico es demasiado grande para que pueda ser reparado, los mecanismos de control inducirn la activac in de una serie de rutas celulares que culminarn en la muerte celular. Funciones biolgicas Las funciones biolgicas del ADN incluyen el almacenamiento de informacin (genes y genoma), la codificacin de protenas (transcripcin y traduccin) y su autoduplicacin (r eplicacin del ADN) para asegurar la transmisin de la informacin a las clulas hijas d urante la divisin celular. Genes y genoma Vanse tambin: Ncleo celular, Cromatina, Cromosoma y Genoma. El ADN se puede considerar como un almacn cuyo contenido es la informacin (mensaje ) necesaria para construir y sostener el organismo en el que reside, la cual se transmite de generacin en generacin. El conjunto de informacin que cumple esta func in en un organismo dado se denomina genoma, y el ADN que lo constituye, ADN genmic o. El ADN genmico (que se organiza en molculas de cromatina que a su vez se ensamblan en cromosomas) se encuentra en el ncleo celular de los eucariotas, adems de pequea s cantidades en las mitocondrias y cloroplastos. En procariotas, el ADN se encue ntra en un cuerpo de forma irregular denominado nucleoide.76