Tema 2.

Organizacin de la variacin gentica

La poblacin ideal Equilbrio de Hardy y Weinberg Corolarios de la ley de equilibrio Extensin de la ley de H-W a:
dominancia loci con varios alelos genes ligados al sexo

Equilibrio para dos loci-Desequilbrio gamtico

La poblacin ideal
No hay solape generacional Apareamientos al azar (diploides) Tamao infinito No migracin No seleccin No mutacin

Demostracin de la ley de H-W

G0
D0=NAA/N, H0, R0 descripcin (p+q)^2 p0 y q0

G1

Equilibrio de Hardy-Weinberg (1908)

Si una poblacin no est inicialmente en equilibrio este se alcanza en una generacin en que se cumplan los presupuestos de la poblacin ideal. Las frecuencias gnicas sern las mismas que las que hubiere en el momento en que se den las condiciones de equilibrio y las frecuencias genotpicas sern

En una poblacin mendeliana ideal las frecuencias gnicas y genotpicas se mantienen estables generacin tras generacin

Hardy y Weinberg

Dr. Godfrey Harold Hardy (1877-1947) Matemtico. Trinity College, Cambridge

Dr Wilhelm Weinberg (1862 - 1937) Mdico alemn

Otra demostracin de la ley de H-W

Tipos posibles de apareamientos, frecuencias y descendencias bajo los supuestos de azar
Tipo de apareamiento AA x AA AA X Aa AA x aa Aa x Aa Aa x aa aa x aa Frecuencia DXD=D2 D x H + D x H= 2DH D x R + D x R = 2DR HxH=H2 H x R + H x R = 2HR RxR=R2 AA 1 1/2 1/4 Aa 1/2 1 1/2 1/2 aa 1/4 1/2 1

 D = D2 + DH + H2/4 = (D + H/2)2 = p2 H = 2 DH/2 + 2 DR + H2/2 + 2 HR/2 = 2 (DH/2 + DR + H2/4 + HR/2) = 2(D + H/2)(R + H/2) = 2 pq R = R2 + HR + H2/4 = (R + H/2)2 = q2

Test del equilibrio de H-W

Chi2 frecuencias genotpicas absolutas observadas y esperadas Constancia de las frecuencias gnicas a lo largo de las generaciones

Ejemplo Test HW
Al estudiar los grupos sanguneos MN en una poblacin de 1000 britnicos, se encontraron los siguientes genotipos:" 298 MM 489 MN 213 NN" Est la poblacin en equilbrio?

Tema 2. Organizacin de la variacin gentica

La poblacin ideal Equilbrio de Hardy y Weinberg Corolarios de la ley de equilibrio Extensin de la ley de H-W a:
dominancia loci con varios alelos genes ligados al sexo

Equilibrio para dos loci-Desequilbrio gamtico

Corolarios de la ley de equilibrio

En diploides, la diversidad gentica es igual a la proporcin de heterocigotos esperada en el equilibrio

Corolarios de la ley de equilibrio

El valor mximo de heterocigotos, 2pq, es del 50% lo que ocurre cuando p=q=0.5. As pues, en una poblacin en equilibrio se cumple que D+RH

Corolarios de la ley de equilibrio

Se cumple que D=H cuando p2=2pq , o lo que es lo mismo, q=1/3. De la misma forma, se cumple que R=H cuando q2=2pq (q=2/3). Por lo tanto, para valores de q entre 1/3 y 2/3, los heterocigotos sern el genotipo ms frecuente

Corolarios de la ley de equilibrio

Cuando un alelo tiene una frecuencia muy pequea (raro) est representado mayoritariamente en los heterocigotos. Si examinamos el valor del cociente H/R = 2pq/q2 = 2p/q est claro que si q tiende a cero la frecuencia relativa de H respecto a R aumenta rpidamente. Cuando p 1 entonces los heterocigotos, H=2pq2q, son aproximadamente el doble de la frecuencia del alelo raro.

Frecuencia enfermedades humanas

Tema 2. Organizacin de la variacin gentica

La poblacin ideal Equilbrio de Hardy y Weinberg Corolarios de la ley de equilibrio Extensin de la ley de H-W a:
dominancia loci con varios alelos genes ligados al sexo

Equilibrio para dos loci-Desequilbrio gamtico

Dominancia entre alelos

Se pueden calcular las frecuencias gnicas asumiendo equilibrio de H-W

Tres o ms alelos
Tres alelos: n alelos:

Tres o ms alelos
Test del equilbrio

En una poblacin de Daphnia magna se encontraron 3 alelos de la enzima mli deshidrogenasa denominados S, M y F en base a su menor o mayor movilidad electrofortica. Los genotipos fueron:" SS = 3, SM = 8, SF = 19, MM = 15, MF = 37 y FF = 32" Est la poblacin en equilbrio de H-W? " 2.4 10.9 17.5 12.3 39.5 31.5"

Tres o ms alelos
Test del equilbrio
S p=.145 M q=.329 F r=.526 Los valores esperados de cada genotipo bajo apareamiento al azar son, respectivamente:.021025, .09541, .15254, .108241, .346108 , .276676. ss 3 2.4 sm 8 10.9 sf 19 17.5 mm 15 12.3 P=0.61 mf 37 39.5 ff 32 31.5 total 114

obs esp

chi2=1.8090 gl=6-3=3

Puede notarse el buen ajuste entre los esperado y lo observado.

Genes ligados al sexo

Las frecuencias gnicas medias en la poblacin deben calcularse de forma ponderada

Genes ligados al sexo

Genes ligados al sexo

El equilibrio se alcanza al cabo de muchas generaciones El tiempo hasta el equilibrio es mayor cuanto mayor es la diferencia inicial entre las frecuencias gnicas entre sexos, disminuyendo esa diferencia a la mitad cada generacin La frecuencia media en la poblacin no vara y es la frecuencia gnica que alcanzan los dos sexos en el equilibrio Las frecuencias fenotpicas en el equilibrio son distintas entre los sexos. Por ejemplo el daltonismo afecta a un 8% de los hombres y un 0.5 % de las
mujeres en la poblacin caucsica.

Color gatos
Muestra
Machos hembras 211 negros 42 naranja 277 negras 54 mosaico 7 naranja

Tema 2. Organizacin de la variacin gentica

La poblacin ideal Equilbrio de Hardy y Weinberg Corolarios de la ley de equilibrio Extensin de la ley de H-W a:
dominancia loci con varios alelos genes ligados al sexo

Equilibrio para dos loci-Desequilbrio gamtico

DESEQUILIBRIO GAMETICO
El equilibrio para un locus no implica equilibrio entre loci Desequilibrio de ligamiento, o desequilibrio gamtico es la asociacin no al azar de los alelos de los distintos loci en los gametos

FRECUENCIAS GAMETICAS ESPERADAS

DESEQUILIBRIO GAMETICO

Equilibrio
AB Ab

Desequilibrio
AB Ab aB

aB

ab

ab

DESEQUILIBRIO GAMETICO

FRECUENCIAS GAMTICAS OBSERVADAS

En la prctica es dificil estimar el desequilibrio porque al estudiar las frecuencias genotpicas, se desconoce la fase en que estan los heterocigotos

DESEQUILIBRIO GAMETICO
FRECUENCIAS GAMTICAS OBSERVADAS

El valor mximo de D depende de las frecuencias allicas.

El valor maximo de D es igual al menor entre ps y qr si D>0 o al menor pr o qs si D<0

Resulta til el valor relativo de desequilibrio D` D`=D/Dmax

EVOLUCIN DEL DESEQUILIBRIO GAMTICO

Para saber cmo evoluciona el desequilbrio en una poblacin ideal, necesitamos deducir las frecuencias gemticas en la siguiente generacin:

Frec. AB(1)== pr + D1

D1=D0(1-f)

EVOLUCIN DEL DESEQUILIBRIO GAMTICO

Dt=D0(1-f)t
La reproduccin sexual reduce el desequilbrio gamtico en una poblacin al crear nuevas combinaciones de alelos. La recombinacin tiende a randomizar las frecuencias gamticas (y por tanto tambin las genotpicas) entre distintos loci.

EVOLUCIN DEL DESEQUILIBRIO GAMTICO

f f f f

Dt=D0(1-f)t

El nmero de generaciones hasta el equilibrio depende del desequilibrio inicial y el ligamiento

DESEQUILIBRIO GAMTICO
En sistemas multilocus con un desequilibrio inicial, el equilibrio se alcanza despus de muchas generaciones Cuando el desequilibrio de ligamiento entre genes muy ligados, o entre stios polimrficos dentro de gen, es muy alto se habla de haplotipos

Desequilibrio entre pares de SNPs en humanos

De Hedrick 2005 En humanos una frecuencia de recombinacin de 0.01 corresponde aproximadamente a una distancia fsica de 10 Kb

DESEQUILIBRIO GAMETICO Causas:

Mezcla de poblaciones Deriva: Efecto fundador Cuello de botella

Seleccin: Genes coadaptados Efecto autostop: arrastre por ligamiento con otros genes