Amiloides como elongacin fibrilar siguiendo la cintica de MichaelisMenten

Introduccin El primero depsito como amiloide fue encontrado hace ms de 100 aos. Hoy en da conocemos decenas de diferentes enfermedades que estn relacionadas a la protena formacin de amiloides fibrilares de protenas. Cifras de otras enfermedades no relacionadas a las protenas pueden agregarse dentro amiloides como fibrilares bajo ciertas condiciones. Una de las hiptesis propuestas es la estructura fibrilar para ser genrica para todas las protenas. Esto sugiere que las fibrillas son formadas va mecanismo de crecimiento nucleado (tambin conocido como nucleacin elongacin). La nucleacin es ms bien un proceso estocstico incluso en condiciones idnticas, los tiempos lag de la fibrilacin pueden diferir. Una vez el primer ncleo es formado, el procesos de elongacin empieza. Mientras que solamente varias molculas puedes ser suficientes para formar ncleos, esto puede reclutar miles de molculas sobre fibrillas de elongacin. La elongacin es usualmente un proceso muy rpido que la nucleacin. Por otra parte, las fibrillas pueden elongar bajo condiciones, no favorables para la nucleacin. En conjunto esto sugiere que el principal motor de la formacin del amiloide se establece en la elongacin. Varios enfoques diferentes fueron usados para describir el proceso de formacin de protena amiloide como fibrillas con una funcin matemtica. A partir de una simple ecuacin lgica para describir el crecimiento nucleado y cintica de primer orden para describir la elongacin, del modelo ms complicado de polimerizacin de tres pasos e incluso modelos comprensivos tomando en cuenta una suma de posibles eventos tales como nucleacin primaria, elongacin y nucleacin secundaria (como rompimiento o ramificacin de fibrillas). Sin embargo estos modelos todava tienen algunos problemas. Los ms comunes es un ajuste imperfecto cuando es aplicado a un dato experimental. Esto puede ser un problema de ambos, el modelo el cual puede perder algo del proceso involucrado en la fibrilacin y los datos a los cuales puede ser afectado por procesos no relacionados a la fibrilacin. As para conseguir un ajuste perfecto por algn modelo, los procesos de agregacin deben ser estrictamente controlados para asegurarse que los datos no podrn involucrar algn proceso, no descrito por el modelo. Nuestra idea fue disear el ms simple experimento de formacin de amiloides como fibrillas el cual involucrara al menos cifras de diferentes procesos y as podra ser ajustado por un modelo simple. El nico proceso de agregacin el cual puede ser separado de otros, es la elongacin fibrilar. Esto puede ser iniciado por adicin de fibrillas a una solucin proteica. Las concentraciones de fibrillas y condiciones de la reaccin pueden ser optimizadas para evitar la nucleacin primaria. La nucleacin secundaria puede ser minimizada por evitacin de cualquier tipo de agitacin.

Se observ que la elongacin de fibrillas es muy similar a una reaccin enzimtica e incluso analizndola usando la ecuacin de Michaelis-Menten. El crecimiento final de las fibrillas juega el papel del sitio activo de la enzima mientras los monmeros o oligmeros juegan el papel del sustrato. Incrementando en masa de las fibrillas imita la reaccin enzimtica del producto. Aplicamos el mejor modelo conocido de cintica enzimtica la ecuacin de Michaelis-Menten para describir el proceso de elongacin de amiloides como fibrillas. Tpicamente la reaccin enzimtica involucra unin de sustraro y catlisis pasos que pueden resumirse como: La elongacin de fibrillas puede ser descrita de manera similar

Donde F es fibrilla, M es monmero (De hecho no podemos descartar la posibilidad de elongacin de fibrillas a travs de uniones de oligmeros, pero para mantener el modelo ms simple posible usamos M) y FM es un complejo de corta vida el cual existe a partir del momento cuando la unin de monmeros a las fibrillas est completamente incorporado. La velocidad de elongacin puede ser descrita por la ecuacin de Michaleis-Menten

Donde M es la concentracin del monmero,

es la velocidad mxima de fibrillas

ms largas Fe es la concentracin de fibrillas finales Km es la constante de Michaelis-Menten