Enzimas: Son protenas especializadas en catalisis

Nomenclatura: sufijo asa al nombre del sustrato EC Reaccin 1. Oxidoreductasas 2. Transferasa 3. Hidrolasas 4. Liasas 5. Isomerasas 6. Ligasas

1. Oxidoreductasas

+ A-red B-Oxi

A-oxi

+ B-red

Dehidrogenasas Oxidasas Peroxidasas Reductasas Monooxigenasas

2. Transferasas

+ A* B

+ B*

C1- transferasas Glicosil-transferasas Amino-transferasas Fosfo-transferasas

3. Hidrolasas:

+ A-B Esterasas Glicosidasas Peptidasas amidasas

H2O

H
A-H

OH
B-OH

4.Liasas(sintasas):

+ A B

A-B

C-C liasas C-O liasas C-N liasas C-S liasas Originan o destruyen dobles enlaces

5. Isomerasas

A Epimerasas Cis-trans isomerasas Intermolecular transferasas Iso-A

6. Ligasas:

+ A B C-C Ligasas C-N Ligasas C-O Ligasas C-S Ligasas

XTP

AB

XDP

X dependientes de energia

Cofactores enzimaticos

Componentes no proteicos, necesarios para la actividad de algunas enzimas. Naturaleza: a. Iones metalicos b. Moleculas organicas (coenzimas). Relacin con la enzima a. Coenzimas solubles b. Grupos prosteticos (fuertemente unidas a la enzima, ni dejan la enzima)

Enzima + cofactor apoenzima

Holoenzima

Coenzima

Abreviacin

Grupe/tipo de reaccin

Derivado de

COENZIMAS DE LAS OXIDOREDUCTASAS

1. Nicotinamidaadeninadinucleotido/fosfato

NAD+/ NADP+

H+

Niacina (B3)

2. Flavinmononucleotido/ Flavin-adeninadinicleotido

FMN/FAD

H+

Riboflavina (B2)

3. Ubiquinona

Co Q

Electrones y protones

Poliprenilquinona

4. Acido lipoico

Lip(S2)

H+

Acido tioctanico

5. Hemo

Electrones

COENZIMAS DE LAS OXIDOREDUCTASAS

1.

Nicotinamida-adeninadinucleotido/fosfato ( NAD/NADP)

NAD Reduccin equivalentes catabolitos a cadena respiratoria (intercambiador E.) NADP medio reductor en biosintesis

COENZIMAS DE LAS OXIDOREDUCTASAS

Deshidrogenasas

Piruvato
COOH C CH3 O
Lactato -Deshidrogenasa

Lactato
COOH H C CH3 OH

NADH+H
(340nm)

NAD+

Transportan iones hibridos (2e + 1H+) Hidruro NADH + H NADH2

COENZIMAS DE LAS OXIDOREDUCTASAS

2. Flavinmononucleotido/Flavin-adeninadinicleotido (FMN/ FAD)

Unidad fuertemente generalmente Flavoproteinas

Flavina

Ribitol

COENZIMAS DE LAS OXIDOREDUCTASAS

Flavoproteina
Fumarato
COOH H C C COOH H
Succinato Deshidrogenasa

Succinato
COOH H H C C COOH H H

FADH2

FAD

Oxidada
450nm

Reducida -

COENZIMAS DE LAS OXIDOREDUCTASAS

3. Ubiquinona (CoQ) En la cadena respiratoria / membrana mitocondrial

Quinon

Ubiquinon/hidroquinon

Transporta los H completos

COENZIMAS DE LAS OXIDOREDUCTASAS

4. Acido lipoico o A. Tiotico

Covalentemente unido con la enzima (decarboxilacin oxidativa)

Disulfuro ciclico oxidado

Dihidrolipoico reducido

CH3 C S H CH2 CH2 S CH R O

COENZIMAS DE LAS OXIDOREDUCTASAS

5. Hemo
Diferentes tipos a no unido covalentemente, b unido Protoporfirina Fe,Co,Ni,Cu Mg

En la cadena respiratoria citocromo C Fotosintesis Peroxidasas Mono-oxigenasa (CytP450)

COENZIMAS DE TRANSFERASAS 1. S-Adenosilmetionina 2. Acido tetrahidrofolico 3. Biotina 4.Tiamina pirofosfato 5. Acido Liponico 6. Coenzima A 7. Uridindifosfato 8. Piridoxalfosfato 9. Adenosin trifosfato 10.Citidinmonofosfato 11. Acido fosfoadenilsulfato TPP Lip(S2) CoA Aldehido Aldehido Acil (acetil) grupos SAM FolH4 CH3 HC=O,CH3,HO-CH2 CO2 Metionina Acido folico (B4) Vitamina H Tiamina (B1) Acido tioctanico A. Pantotenico (B5)

UDP PLP ATP CMP PAPS

Sacaridos Grupos Amino NH2 Pi,PPi, AMP Grupos fosforil Sulfatos Piridoxol (B6)

COENZIMAS DE TRANSFERASAS

1. S-Adenosilmetionina (SAM)
Metiltransferasas Metilaciones Transporte de grupos METILO Sintesis o inactivacion de toxicos

COENZIMAS DE TRANSFERASAS

2. Acido tetrahidrofolico (FolH4)

Pterina (N5 o/y N10 transportan los C1) C1=

Metilo (CH3-) Metilen (CH2-) Formil (CHO)

Sintesis de purinas

COENZIMAS DE TRANSFERASAS

3. Biotina
Unida a la enzima (K) Carboxyl transferasas (Piruvato Carboxilasa) CO2

Avidina

COENZIMAS DE TRANSFERASAS

4.Tiamina pirofosfato (TPP)

Acil-restos (Aldehidos y cetonas) de las Decarboxilasas, transcetolasas, deshidrogenasas

Metabolismo de carbohidratos transfiriendo aldehidos

COENZIMAS DE TRANSFERASAS

Piruvato decarboxilasa

COENZIMAS DE TRANSFERASAS

6. Coenzima A (CoA)
Acil-restos, en aciltransferasas,

Activacion de los grupos acilo, en metabolismo de lipidos y carbohidratos

COENZIMAS DE TRANSFERASAS

7. Uridindifosfato
Transferencia de glucosa, Epimerasas, sintesis de polimeros

COENZIMAS DE TRANSFERASAS

8. Piridoxalfosfato (PLP)
Transferencias de grupos amino NH2, Aminotransferasas. Metabolismo de aa Unido a (K)

H R C NH2 COOH

Aminotransferasas
COOH

H R C NH2 COOH

C O

PLP

C O

COOH

COENZIMAS DE TRANSFERASAS

9. Adenosin trifosfato (ATP)

Fuerte Anion, (4H) Mg [MgATP]- Fosfotransferasas/quinasas, nucleotidiltransferasas, ligasas

Activacin de sustratos, ATP + HO-R ATP + HO-R ADP + P-R (grupos fosfaro) AMP + PP-R (grupos Difosfato) AMP-R + PPi (AMP)

ATP + HO-R

COENZIMAS DE TRANSFERASAS

11. Acido fosfoadenilsulfato

Grupos sulfato son transportados sobre azucares, alcoholes

Mucopolisacaridos, proteoglucanos

COENZIMAS DE LIASAS

COENZIMAS DE LAS LIASAS

1. Tiaminapirofosfato

TPP

Decarboxilacin

Tiamina (B1)

2. Piridoxalfosfato

PLP

Piridoxol (B6)

COENZIMAS DE ISOMERASAS

COENZIMAS DE LAS ISOMERASAS

1. Uridin difosfato

UDP

epimerasas

2. Glucosa-1,6bisfosfato

Grupos fosfato

3. 2,3-Bisfosfoglicerato

Grupos fosfato

4. Desoxiadenosilcobalamina

CoB12

Grupos carboxilo

Cobalamina (B12)

Que se requiere para que ocurra una reaccin?

Acercamiento o colicin. Orientacin adecuada. Barrera energetica. aumentos en la energia cinetica reducen esta (Temperatura Concentracin)

Energia de activacion:

Catalizadores:
Son sustancias que aceleran la velocidad de la reaccin, sin gastarse A nivel bilogico las enzimas Lentitud en reacciones alta energia de activacin (CapaH2O) Estado de transcicin, catalizadores abrir nuevos vias no modifican G energia de activacion (Incorrecto) ofrecen via con baja energia de activacin

Las enzimas pueden incrementar la V reaccion 10x1012 veces

- catalizador

+ catalizador

Por que la energia requerida para alcanzar el Estado de transcicin es mas baja con la E?
Centro Activo o catalitico (El bolsillo magico)

+
(4) (3) (1) (2)

(1) Estabiliza la transcicin (2) Excluye agua (3) Grupos reactivos (4) Acercamiento y orientacion de R

La enzima se une a la molcula de reactivo y la hace adoptar un estado intermediario semejante al de transicin pero de menor energa Esta energa de activacin y la conversin del intermediario en producto son menores que la energa de activacin de la reaccin sin catalizar

Interaccin enzima sustrato Llave - cerradura Inducido

Cinetica en quimica: es la velocidad en que sucede una reaccin Cinetica enzimatica: es la velocidad en que una enzima cataliza una reaccin Utilidad de la cinetica enzimatica:
Ensayos clinicos comprender vias metabolicas y sus patologias comprender mecanismos enzimaticos

Como medimos la velocidad de una reaccion?

De que depende la velocidad de la reaccion? a. Energia de activacin. b. Temperatura c. Concentracion de los reactantes. Velocidad (v) [reactantes] Tipos de reacciones Composicin Base cinetica: De orden cero Monomoleculares De primer orden Bimoleculares De segundo orden Trimoleculares De tercer orden

Velocidad (v) [reactantes]

Primer Orden V= k. [A]

segundo Orden V= k * [A][B]

Constante de velocidad (k)

Unidad de actividad enzimtica (U) es la cantidad de enzima que cataliza la conversin de 1 mol de sustrato en un minuto. katal (kat). la cantidad de enzima que transforma 1 mol de sustrato por segundo La actividad especfica es el nmero de unidades de enzima por miligramo de protena (U/mg prot) o por mililitro de disolucin (U/ml).

Que afecta la actividad enzimatica:

Factores que afectan las reacciones quimicas catalizadas por enzimas: 1. 2. 3. 4. 5. Concentracin de la enzima Concentracion del sustrato Temperatura pH Presencia de inhibidores

Factores que afectan la actividad enzimtica

Las reacciones enzimticas se ajustan a dos tipos de cinticas:

Hiprbolas rectangulares: enzimas que siguen la cintica de MichaelisMenten Sigmoidales: enzimas alostricas que muestran fenmenos de cooperatividad
Las reacciones catalizadas por enzimas, siguen los principios generales de la cintica de las reacciones qumicas, pero adems muestran un rasgo caracterstico: la SATURACIN POR SUSTRATO

Michaelis-Menten (1913):
Describe los cambios Vo vs [S], aclara el comportamiento hiperbolico Caracterizar la enzima

Las constantes de esta ecuacin son: Km and Vmax, definidas: Vmax = velocidad maxima Km = [S] a la cual se obtiene 1/2 Vmax

Definicin de KM y Vmax y su relacin Vmax/KM KM conocida como K de Michaelis Afinidad de la enzima por el S es un valor intrinseco de cada enzima, relacionada a la constante de asociacin del complejo ES y la constante de la catalisis es un equilibrio definido asi: Formacion/descomposicin de ES K1 E + S K-1 V1 = k1 [E]*[S] V-1 = k-1 [ES] V2 = k2 [ES] ES K2 E + P

Formacion/descomposicin de ES k1 [E]*[S] = k1 [E]*[S] k-1 [ES] +k2 [ES] (k-1+ k2) [ES] (k-1+ k2) [E]*[S] = = KM k1 [ES]

Significancia de la Km

(k-1+ k2) k1

[E]*[S] [ES]

= KM

La Km es una medida de la afinidad del enzima por el sustrato. Cuanto ms pequea es la Km, mayor afinidad del enzima por el sustrato Los valores de Km de muchas enzimas estan entre 10-1 y 10-7 M.

Glucosa en la sangre de 4-5mM Hexoquinasa 1 Km = 0,1mM Hexoquinasa 4 Km = 5mM

Vmax (propio de cada Enzima) La Vmax se alcanza cuando todos los

centros activos estn ocupados con sustrato

V= k2 [ES]

Si E esta saturado ET ES Vmax k2 = kcat

Vmax = kcat [Et] [Et] = [E]+[ES] [E]*[S] [ES] = KM

Vmax/KM [E]= [Et]- [ES]

K M [ES] = [E t] [S] - [ES] [S] [ES] {[S] + K M } = [Et][S]

Eficiencia Comparar Enzimas

[E] = [ES] KM [S] V= k2 [E] [S] Km +[S]

v o = k 2 [ES], V= Vmax [S] Km +[S]

Para determinar Km y Vmax la MM se convierte en su forma lineal Colocando los inversos a ambos lados de la ecuacion. V= Vmax [S] Km +[S]

Lineweaver-Burk

Y =

X +

Inhibidores: son sustancias que reducen o suprimen la actividad

enzimatica. Metabolitos o medicamnetos.

Reversibles

irreversibles

Inhibidor competitivo (IC)

IC se une al enzima libre Compite con el sustrato por la unin a la enzima Aumenta la Km sin afectar a Vmax Se puede revertir la inhibicin aadiendo ms sustrato Los inhibidores competitivos se parecen a los sustratos

Inhibidor No-competitivo (NI)

NI puede unirse al enzima libre o al complejo ES Baja la Vmax, pero la Km no se altera NI no se unen al sitio cataltico donde se une el sustrato

Grficas de Michaelis y dobles recprocas en la inhibicincompetitiva y no competitiva

Inhibicin irrevesible de una enzima de sntesis de la pared bacteriana

Enzimas alostericas

Multiples subunidades y sitios activos La representacin Vo vs [S] da como resultado una curva sigmoidea

La unin de inhibidores o activadores alostricos no afecta a la Vmax, pero si altera la Km

Mecanismos de regulacin enzimtica

1. 2. 3. 4. Regulacin de la cantidad de enzima sintetizada por las clulas Inhibicin reversible por productos Interaccin con protenas moduladoras Activacion/inhibicin alostrica - El modulador alostrico se une a un sitio distinto del centro activo - La unin del modulador es reversible e implica cambio conformacional - Suelen ser enzimas multimricas - Tienen cintica sigmoidea Modificacin covalente: - fosforilacin - ADP-ribosilacin - metilacin, acetilacin Activacin proteoltica de pro-enzimas

5.

6.

Activacin de proenzimas por proteolisis

Ki = [E] [I] [EI]

competitivo

No competitivo