NUCLEOTIDOS Y ACIDOS NUCLEICOS Estructura y Funcin del ADN

Los cidos nucleicos son macromolculas celulares, llamadas as originalmente por su tamao, por su reaccin acida y por su localizacin nuclear. El cido desoxirribonucleico (ADN) reside principalmente en el ncleo, en las mitocondrias y cloroplastos de organismo eucariotas, mientras que el otro tipo de cido nucleico, el cido ribonucleico (ARN), se le encuentra en el citoplasma y asociado al retculo endoplasma tico. El ADN el portador permanente de la informacin genotpica celular, puede determinar el fenotipo celular desde el interior del ncleo gracias a la transcripcin de su informacin en ARN, molculas efmeras que viajan a otros compartimientos celulares para ejecutar las instrucciones genotpicas transcritas en ellas.

Los cidos nucleicos son polmeros construidos por monmeros llamados nucletidos. A su vez, un nucletido est compuesto por una pentosa, una base nitrogenada y un fosfato. En los nucletidos que constituyen al ARN, la pentosa es la ribosa y en el caso del ADN, es la 2desoxirribosa, es decir, una ribosa que carece del grupo OH en la posicin 2. De esta distincin a nivel del carbono 2 surgen las diferencias qumicas fundamentales entre el ADN y el ARN. Las pentosas de los cidos nucleicos existen en sus ismeros cclicos, es decir son furanosas. La reunin de una base nitrogenada con una pentosa se denomina nucleosido. La base nitrogenada se une al carbono 1 de la pentosa. Existen 5 distintas bases nitrogenadas en los cidos nucleicos: adenina, guanina y citosina, presentes tanto en el ADN como en el ARN, la timina, presente solo en el ADN, y el uracilo, presente solo en el ARN. Qumicamente, estas bases nitrogenadas son compuestos heterocclicos (anillos con dos o ms tipos de tomos), del tipo de las purinas (guanina y adenina) o las pirimidinas (citosina, uracilo, y timina) Los no9mbres de los nucleosidos derivan de sus correspondientes bases nitrogenadas.

Nomenclatura de los Nucleosidos y nucletidos ms abundantes Adenina + ribosa de adenosina Adenosina (+1 fosfato en 5 ) AMP 5 monofosfato

Adenosina (+2 fosfato en 5) Adenosina (+3fosfato en 5)

ADP 5 difosfato de adenosina ATP 5 trifosfato de adenosina

Adenina + desoxirribosa desoxiadenosina (+1 fosfato en 5) dAMP 5 monofosfato de desoxiadenosina Citosina + ribosa Citidina (+1 fosfato en 5) CMP 5monofosfato de citidina Citosina + desoxirribosa desoxicitidina(+1 fosfato en 5) Dcmp 5 monofosfato de desoxicitidina Guanina + Ribosa Guanosina (+1 fosfato en 5) GMP 5 monofosfato de guanosina Guanina desoxirribosa desoxiguanosina(+1 fosfato en 5) Dgmp 5 monofosfato de desoxiguanosina Timina + desoxirribosa Timina(+1 fosfato en 5) TMP 5 monofosfato de timina Uracilo + Ribosa Uridina (+ 1 fosfato en 5) UMP 5 monofosfato de uridina Hipoxantina + Ribosa Inosina(+ 1 fosfato en 5 ) IMP 5 monofosfato de inosina

Al incorporar un fosfato, el nucleosido se convierte en un nucletido y adquiere con ello su carcter acidico. El grupo fosfato se une a la pentosa del nucleosido mediante un enlace fosfoester. En los cidos nucleicos solo los hidroxilos de las posiciones 3 y 5 participan de estos en laces. En la naturaleza es ms frecuente encontrar 5 nucletidos que 3 nucletidos esto se debe a razones enzimticas durante la biosntesis de los nucletidos. Se debe recordar que las transacciones bioenergticas del ATP ocurren con los fosfatos en posicin 5

Debido a la posibilidad del fosfato de formar mltiples enlaces Ester, dos o hasta tres fosfatos, unidos por enlaces fosfodiester, pueden estar presentes en un nucletido Ejemplo la adenina y sus tres posibles nucletidos 5.

Descubrimiento del material Gentico

A principios del siglo XX, se consideraba que solo molculas tan llenas de plasticidad como las protenas, podran proporcionar la diversidad qumica que los genes necesitaban, se pensaba que estos eran las protenas. No fue sino hasta 1944, con los experimentos de Avery, Macleod y McCarthy, cuando el ADN se empez a considerar como el sustrato qumico de los genes demostraron que no obstante su monotona bioqumica, el ADN era el sustrato fsico de la herencia. La determinacin de la estructura tridimensional del ADN, fue descubierta por Watson y Crick en 1953. No importa que solo cuatro bloques de construccin constituyan esta macromolcula polimrica, la clave reside en dos propiedades del polmero. La primera, es la consecuencia en que estn dispuestos los bloques. La segunda es que en tal secuencia existe en dos copias complementarias que juntas forman una doble cadena
Hlice doble del ADN. El ADN est formado por dos cadenas o hebras polinucleotidicas que se aparean entre s. Los polinucleotidicas del ADN tienden a enrollarse en una estructura helicoidal cuando se aparean. En la doble hlice, los armazones de fosfatodesoxirribosa de cada cadena, con sus cargas anionicas, quedan situadas al exterior y las bases nitrogenadas en medio de las dos cadenas, los apareamientos que se observan en la doble hlice del ADN son casi siempre entre adenina y timina, y entre citosina y guanina. Se nota que entre el par de guanina y citosina se establece 3 puentes (G = C) mientras que en el par de adenina y timina solo se forman 2 puentes (A = T). Esto se traduce en una mayor cohesin o estabilidad para el par G = C que para el par A = T. debido a ello los armazones de las cadenas se mantienen equidistantes entre s a lo largo de la hlice, dndole un aspecto cilndrico con un dimetro de 2 nm. Si las bases apareadas en el interior de la hlice son diferentes de los pares A = T o C = G, el grosor de la hlice puede sufrir una distorsin. Por eje el apareamiento entre dos purinas ocasionara que las distancias entre los armazones aumentase, causando un abultamiento en le hlice. Estas distorsiones permiten que ciertas protenas reconozcan un apareamiento anmalo y procedan a repararlo.

Estructura tridimensional del ADN. Los estudios cristalogrficos de Franklin y Wilkins, as como su anlisis de Watson y Crick, sirvieron para proponer un modelo tridimensional para la estructura de la hlice doble del ADN. El tipo principal de hlice que el ADN forma en la naturaleza se denomina conformacin B. Otras conformaciones, tambin helicoidales, que pueden adoptar el ADN in vitro son la conformacin A y la Z. Hay regiones regulatorias de la expresin gentica podran adoptar, para su funcin la conformacin Z, una hlice alargada de giro zurdo. En la conformacin B, la hlice del ADN tiene la forma de un largo cilindro con un dimetro de 2nm Cada par de bases contribuye a la longitud de la hlice en 0.34 nm y la hace girar 36 con respecto al par vecino y que cada 10 pares de bases haya una revolucin completa (360) del enrolamiento de la hlice. El armazn constituido de las pentosas y los fosfatos, con sus cargas negativas, quedan por fuera de la hlice y van rotando a lo largo del eje de esta en forma diestra. Los anillos purinicos y pirimidicos de cada par de bases se sitan en el interior de la hlice, alinendose en un solo plano. Este plano que incluye al par de bases y sus puentes de hidrogeno, se sitan en forma casi perpendicular al eje de rotacin de la hlice. El apilamiento de los pares de bases permite una interaccin electrnica del tipo de las fuerzas de vart der Waals entre los anillos la cual contribuye a la estabilidad de la hlice El cilindro imaginario que es la doble hlice del ADN es flexible y tiene relieves en su superficie.

Desnaturalizacin del ADN Se usa para analizar su estructura. La estructura bicatenaria del ADN puede separarse en dos cadenas de componentes en solucin al aumentar la temperatura o disminuir las cifras de sales. Las dos pilas de bases no solo se separan, sino que las bases mismas se desapilan mientras que an estn conectadas en el polmero por el esqueleto fosfodiester. Concomitante con esta desnaturalizacin de la molcula de ADN hay un incremento de la absorbancia ptica de las bases purina y pirimidina, fenmeno llamado hipercromicidad de la desnaturalizacin. Debido al apilamiento de las bases y a la formacin de en laces de hidrogeno entre las pilas, la molcula de ADN bicatenario muestra propiedades de una varilla rgida, y en solucin es un material viscoso que pierde su viscosidad en el momento de la desnaturalizacin Las cadenas de una molcula de ADN dada se separan en un rango de temperatura. El punto medio se denomina Temperatura de fusin, o Tm. Est influida por la composicin de bases del ADN y por la concentracin de sales de la solucin. El ADN rico en pares G-C, que tiene tres enlaces de hidrogeno, se fusiona a una temperatura ms alta que el que abunda en pares A-T, que tienen dos enlaces de hidrogeno. El disolvente orgnico formamida, que a menudo se usa en experimentos de ADN recombinante, desestabiliza los enlaces de hidrogeno entre las bases, y por eso aminora la Tm. Esto permite que las cadenas de ADN o los hbridos de ADN-ARN se separen a temperaturas mucho ms bajas, y minimiza la rotura de enlaces fosfodiester que puede ocurrir a temperaturas ms altas.

NATURALIZACION DEL ADN. Esta se da al bajar la temperatura, las cadenas sencillas desnaturalizadas pueden asociarse con sus complementarias reconstituyendo el ADN original. A este proceso de reunin de las cadenas se le llama renaturalizacin. Debido a la complementariedad de secuencias en las cadenas de ADN, el proceso de renaturalizacin. Debido es altamente especfico. Puede darse una reabsorcin parcial y darse entre ADN diferentes, siempre y cuando sus cadenas contengan un cierto grado de complementariedad de secuencia. La capacidad del ADN de desnaturalizarse y renaturalizarse permiti el desarrollo de metodologas, como el anlisis tipo southern y la reaccin en cadena de la polimerasa (PCR), tiles en el anlisis especifico de genes.

EL RNA

El cido ribonucleico es un polmero de purina y pirimidina unidos entre s por enlaces 35-fosfodiester anlogos a los presentes en el DNA ya que es producto de la sntesis de este. Caractersticas de RNA: Parte azcar a la cual fosfatos y bases se fijan es la ribosa Sus componentes pirimidicos son adenina, guanina, citosina y uracilo. El RNA existe como una cadena nica pero esta tiene la capacidad de plegarse sobre si misma a manera de horquilla y de este modo adquiere caractersticas bicatenarias Su contenido de guanina n es igual a su contenido de citosina y su contenido de adenina no es igual al de uracilo El RNA puede hibridarse con otra cadena codificadora para la formacin de pares de bases. Funciones del RNA:

El RNA desempea funciones vitales para la clula entre ellas sirve como moldes para la sntesis de protenas ya que transfieren informacin gentica desde DNA hacia la maquinaria sintetizadora de protena Funciones estructurales en donde contribuyen a la formacin y funcin de ribosomas Sirven como molculas adaptadoras para la traduccin de informacin del RNA hacia secuencias especficas de aminocidos polimerizados Tienen actividad catablica intrnseca: estas ribozimas contienen dos enzimas peptidil transferasa cataliza formacin de enlaces peptdicos en ribosomas y ribozimas involucradas en el empalme del RNA. Clases de RNA En todos los organismos existen cuatro tipos principales de molculas de RNA: mensajero (mRNA), de transferencia (tRNA), ribosmico (rRNA) y RNA pequeos. RNA mensajero (mRNA): Es el menos abundante de los RNA es el molde para la traduccin o sntesis de protenas. El mRNA eucariotico posee caractersticas qumicas singulares. Adems consta de dos partes la cubierta que participa en el reconocimiento del RNA por la maquinaria de traduccin y ayuda tambin a estabilizar el mRNA. La cola poli mantiene la estabilidad intracelular del mRNA especfico. Tanto la cubierta como la cola poli s agregan luego de la transcripcin por enzimas no dirigidas por el molde a molculas precursoras de mRNA. RNA de transferencia (tRNA): la longitud vara desde 74 hasta 95 nucletidos y se generan por procesamiento nuclear de una molcula precursora. Una de sus funciones es el transporte de aminocidos en forma activada al ribosoma para la formacin de enlaces peptdicos y adems puentes de hidrogeno intracatenarios A-U G-C. Este es el que permite el plegamiento y genera una estructura secundaria. Consta de 4 brazos: aceptor: es el que se une a un aminocido especifico, brazo del anti codn: contiene el anti codn, brazos D TC definen un tRNA especifico. El tRNA y mRNA garantizan el orden correcto de aminocidos de cadena polipeptdica sintetizada. RNA ribosmico (rRNA): Es el cido ribonucleico ms abundante; est localizado en los ribosomas y participa en la sntesis de protenas. Contiene dos subunidades una grande que est conformada por 2 molculas ARN y 35 protenas en procariotas y 3 molculas de RNA y 50 protenas en eucariotas y una pequea conformada por una molcula grande de RNA y 20 protenas. Funciones: unin de mRNA y ribosomas y ayudan a su traduccin adems el rRNA grande es el peptidil transferasa que es una ribozima.

RNA pequeo: su tamao vara de 20 a 300 nucletidos y estn presentes en copias 100000 a 1000000 molculas por clula. RNA nucleares pequeos (snRNA): Participan en el procesamiento de rRNA y mRNA y en la regulacin del gen. Hay varias especies entre ellas tenemos: U1U2U4U5U6 participan en eliminacin de intron y procesamiento de precursores de mRNA a mRNA maduro. Se asocian con protenas y forman partculas nucleares pequeas de ribo nucleoprotenas que contribuyen al procesamiento del mRNA inicial que se traduce del DNA. Micro RNA miRNA RNA que interfieren pequeos siRNA: estos se originan inhibicin de la expresin gentica aminorando la produccin de protena especfica mediante distintos mecanismos. Los miRNA tienen una longitud de 21-25 nucletidos se forman a partir de procesamiento nucleolitico sus precursores son monocatearios y a su vez forma una estructura secundaria los miRNA maduros hibridan mediante formacin de dplex RNARNA imperfectos. Los siRNA derivan de la divisin nucleolitica especifica de ARN bicatenario que son de menor tamao los cuales forman los siRNA21-25 nucletidos estos adems forman hbridos RNA-RNA perfectos. Los miRNA y los siRNA estn siendo estudiados para la creacin de frmacos teraputicos.

Bibliografa: Bioqumica de Laguna/ ed. Jos Laguna, Enrique Pia Garza. 6 ed. Mxico: Editorial El Manual Moderno: UNAM, Facultad de Medicina, 2007.xviii, 636 p, il.; 28cm. Translated from the twenty-eight English edition of: Harpers Illustrated Biochemistry Copyright 2009 by McGraw-Hill Companies, Inc.