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Virginie Npoux

L'volution du vivant explique ma boulangre

- Collection Sciences / techniques -

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Table des matires


L'volution du vivant explique ma boulangre...................................1 Prface en forme de cerise sur le gteau ..............................................2 Introduction.........................................................................................4 1 Comment diable une espce peut-elle se modifier avec le temps? ...7 1.1 Un exemple : le chien ................................................................7 1.2 Quels sont les mcanismes en jeu dans l'exemple du chien?.......................................................................................13 1.3 Et dans la nature?....................................................................14 2 Comment le polymorphisme gntique apparat-il?.......................30 3 L'arbre du vivant.............................................................................35 3.1 Comment d'une espce passer deux espces et qu'estce qui les diffrencie? ...................................................................35 3.2 Pourquoi certaines espces semblent n'avoir pas chang depuis des millions d'annes?..................................................38 3.3 Comment dater les anctres? ...................................................39 3.4 quoi ressembletil, cet arbre?............................................44 3.5 L'volution dans le temps ........................................................51 4 Les questions qui restent en suspens..............................................53 5 L'volution, la religion et la philo ...................................................55 5.1 Dterminisme et libre arbitre..................................................55 5.2 Et notre responsabilit, alors?.................................................56 5.3 Nous sommes fabriqus par nos gnes pour les reproduire? Merci bien!...........................................................57 Postface ..............................................................................................59 Annexe...............................................................................................64 Concepts basiques :.......................................................................64 Pour aller plus loin........................................................................73 Pourquoi l'intelligent design n'est pas une thorie scientifique .....81 Bibliographie.....................................................................................84 Des livres pour aller plus loin.......................................................84 Articles scientifiques de rfrence :..............................................84 Remerciements et crdits images......................................................87
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Table des matires


L'volution du vivant explique ma boulangre Je remercie :..................................................................................87 Crdits images...............................................................................87 glossaire/lexique................................................................................88

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L'volution du vivant explique ma boulangre


Auteur : Virginie Npoux Catgorie : Sciences / techniques

Ce texte s'adresse en priorit aux gens qui n'ont pas de connaissances particulires en biologie, et ceux qui "ne croient pas en l'volution", car il est important de comprendre avant de porter un jugement. La science n'est pas affaire de croyance, mais de raison.

Pour un meilleur confort de lecture : http://www.lescomplexes.com/poo/collections/col_ilv/liv_evolution/chapitre-20-fr.p

Existe galement en version "papier" : http://www.inlibroveritas.net/catalogue/fiche-livre/levolution_du_vivant_expliquee_

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Prface en forme de cerise sur le gteau

Ma boulangre est une personne fort importante pour moi. D'elle dpend une partie de mon confort, de mon alimentation. Elle est aussi ma concitoyenne. Nous participons diverses lections : maire, dput, prsident, et nous pouvons en parler. Mais l'ide de parler avec elle de l'volution biologique semble incongrue. Non seulement nos rapports ne sont, a priori, pas fonds sur ce type d'change. Mais surtout, UNE boulangre n'est pas suppose vouloir comprendre des choses compliques dans nos socits o se maintient un fond de machisme et o on voudrait encore mener les femmes la baguette. Il est clair que Virginie Npoux n'a pas ces a priori. Le petit ouvrage qu'elle publie ici prsente un panorama complet de la thorie de l'volution; sans viter les difficults thoriques, sans concession, sans simplification, sans nous rouler dans la farine. Il m'est difficile de mesurer l'effort que demandera la lecture de ce livre une lectrice ou un lecteur sans connaissances particulire en biologie. Mais s'il contribue aider des non spcialistes comprendre la faon dont la science aborde la question de nos origines, il aura dj rempli un rle important. En effet, l'ide d'volution n'est pas facile admettre; surtout sous l'influence de la slection, du hasard et de la contingence. C'est comme confesser un meurtre a dit Darwin dans une lettre. De ce point de vue, aider celles et ceux qui voudraient, sans absorber un norme pav, comprendre l'ensemble de la question est une oeuvre mritoire et Virginie Npoux mrite qu'on lui tresse une couronne. Alors, dans une socit o l'effort intellectuel est peu valoris, o on accepte peuttre plus facilement de faire des efforts pour devenir bon en foot qu'en maths (avec derrire la tte l'ide que a rapporte plus de galette), une socit o de plus en plus, la communication remplace l'information et l'ducation, o il est plus valorisant de rpter des slogans que de construire une pense; donner penser, aider comprendre est une ncessit, une urgence. Ceci est particulirement vrai aujourd'hui, o les
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mouvements religieux intgristes se dveloppent. Il est remarquable que la thorie de l'volution soit rejete par les intgristes de toutes les religions monothistes : elles ne mangent pas de ce pain l. Alors, voil. Si vous voulez rflchir, lisez ce livre. Il est court mais ne vous mprenez pas. Il ne peut pas se lire en quelques heures. Il faut du temps pour comprendre chaque page. Il doit se savourer bouche par bouche. Il vous faudra y revenir afin de vrifier que vous avez bien compris. L'volution est un domaine de recherche actif o on fait des dcouvertes tous les jours. Elle nous fournit des explications sur des questions fondamentales qui nous touchent. Elle ne peut tre comprise sans aucun effort : la science, c'est pas du gteau. Mais si vous entrez dans les explications qui vous sont donnes ici, avec simplicit, avec humour aussi, vous dcouvrirez que le monde qui vous entoure est comprhensible. Vous dcouvrirez que votre existence mme peut tre comprise, qu'elle dcoule d'un processus qui nous est intelligible. Vous pourrez alors vous rgaler de ce que la science a de meilleur : le plaisir intellectuel qu'apporte le fait d'avoir compris. Alors, commencez, dgustez! PierreHenri Gouyon, professeur au Musum national d'histoire naturelle de Paris.

Prface en forme de cerise sur le gteau

Introduction

Il est tonnant de voir combien de gens, notre poque, affirment ne pas croire en l'volution . Osons l'avouer, la lumire des connaissances actuelles, une telle phrase est aussi troublante qu'un je ne crois pas en la gravit , ou un je crois que la Terre est plate . Elle dfie simplement le bon sens et la logique. Pourtant... ce n'est pas inexplicable. Un tel comportement peut avoir plusieurs origines : une simple incomprhension, ou un refus de principe li une vue anthropocentrique du monde, parfois d'origine religieuse. Le premier cas est trs frquent. D'ailleurs, mme ceux qui ne remettent pas en doute la thorie l'ont rarement bien comprise, ou se reposent sur quelques ides reues. La deuxime catgorie, s'appuie par contre sur des croyances qui ne ncessitent par dfinition aucune base logique, et par consquent se base sur des ides souvent incompatibles avec les connaissance scientifiques. Pourtant, la religion et la science sont deux domaines diffrents, qui ne se croisent ni ne s'opposent ncessairement. De grands volutionnistes, parmi les fondateurs de la thorie, taient croyants, et beaucoup le sont aujourd'hui, de diverses confessions, mais ils ne prennent pas les textes religieux au pied de la lettre. Il n'y a pas ncessairement de contradiction de fond, tant que la croyance n'est pas utilise pour construire une thorie, ni considre comme un fait avr et explicatif. L'volution, il n'est pas question d'y croire , ou de ne pas y croire , car la science n'est pas une affaire de croyance , mais de pense rationnelle et de logique, soutenue par l'exprience, voue la comprhension du monde tel qu'il est. Vous pouvez croire tant que vous voudrez qu'en vous jetant du septime tage, vous allez vous envoler, mais malheureusement pour vous, cela n'empchera pas la gravit d'exister. Mettons les choses au clair : la thorie de l'volution est simple. Un enfant de quinze ans peut la comprendre sans problme (d'ailleurs, elle est au
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programme de lyce). Elle est aussi robuste : trouvez un contreexemple et vous serez probablement prix Nobel... Cependant, pour la comprendre, quelques bases de biologie et de mathmatiques sont ncessaires, car elle a beau tre simple, ses implications sont souvent contreintuitives, et c'est l que le bt blesse. Dans le prsent ouvrage, je vais donc tcher de vous l'expliquer, le plus simplement et clairement possible. Ce texte s'adresse en priorit ceux qui n'ont pas de connaissances particulires en biologie. Nous ne nous pencherons pas sur l'histoire de la thorie de l'volution, qui est pourtant passionnante. Nous verrons simplement l'volution la lumire de la science actuelle, telle qu'elle est synthtise par le nodarwinisme , ou thorie synthtique de l'volution , qui joint les apports des ides de Darwin et ceux de la gntique et de la biologie moderne. Considrez ce texte comme une introduction, qui vous donnera quelques bases pour pouvoir lire, et surtout comprendre, des ouvrages plus pointus, comme ceux proposs en bibliographie. Installez vous confortablement, prenez votre temps, lisez doucement, mme en plusieurs fois si vous voulez (je vous le conseille d'ailleurs), n'hsitez pas faire des pauses pour rflchir (manger un petit gteau)... et surtout laissez vos ides reues derrire vous et oubliez tout ce que vous avez appris la tl!

Introduction

1 Comment diable une espce peut-elle...

1 Comment diable une espce peut-elle se modifier avec le temps?

1.1 Un exemple : le chien


Pour comprendre les mcanismes de l'volution, rien n'est plus simple que de regarder les animaux domestiques. Darwin avait d'ailleurs tudi les pigeons domestiques. Le chien est aussi un bon exemple. L'archologie permet de trouver des traces de domestication il y a au moins 17 000 ans(source : wikipedia). Lorsque les premiers chiens furent domestiqus, ils ressemblaient vraisemblablement beaucoup au loup, dont ils sont issus, ainsi que nous l'indiquent les dernires recherches effectues ce sujet (bien qu'il existe galement des hypothses suggrant que l'origine du chien soit aussi lie une domestication du coyote et/ou du chacal). Si l'on regarde l'ensemble des races actuelles, par contre, il faut parfois beaucoup d'imagination pour y voir encore un semblant de loup.

Pensez au berger allemand... l, a va encore. Mais le SaintBernard, le lvrier, le chihuahua, le basset et le caniche nain? Comment toutes ces races sontelles apparues?

1 Comment diable une espce peut-elle...

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Reprenons notre premier chien domestique, ou plutt, notre premire population de chiens domestiques. Imaginez les premiers leveurs, avec leurs premiers levages, en famille. Les premiers levages de chiens ont d tre relativement consanguins (la consanguinit s'obtient par croisement d'individus apparents, comme les frres et les surs, les cousins etc). Lorsque de nouveaux caractres ont t rvls chez certains chiots (nouvelles couleurs, modification de la longueur des poils etc...), les premiers leveurs ont russi rendre leurs caractres prfrs plus frquents, en croisant entre eux des chiens choisis pour ces particularits.
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Avec le temps, ils ont russi les fixer, c'est dire avoir des chiens portant chacun les caractres dsirs.

Encore des chiens... Malamute, Boxer, Mastiff, Caniche nain.

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Regardons maintenant ce qui s'est pass au niveau gntique. Vous n'tes pas tout fait sr de savoir ce qu'est, concrtement, un gne?Allez donc jeter un il en annexe concepts basiques ... Chaque chien possde des gnes particuliers, qui vont dterminer la couleur de son poil, sa longueur, mais aussi la forme de son corps, de sa mchoire, sa taille ou la longueur de ses pattes (et bien d'autres choses encore). On dit qu'un gne code pour un caractre donn. Gnralement, un mme caractre peut tre sous l'influence de plusieurs gnes, et il arrive aussi qu'un gne joue un rle dans plusieurs caractres, par exemple en provoquant la fabrication d'une molcule qui sera utilise dans plusieurs organes. Bien sr certains caractres ne sont pas dtermins uniquement par les gnes, les facteurs environnementaux ont aussi leur mot dire (on retrouve l'ide de plasticit phnotypique vue dans l'encadr sur les gnes). Par exemple, un chien mal nourri ne sera jamais aussi grand que s'il tait bien nourri. Mais c'est une autre histoire, car de telles caractristiques dues l'environnement ne seront pas transmises la descendance (mis part dans les cas particuliers des facteurs pigntiques voir encadr refepigenet) : un chien de petite taille car mal nourri pendant sa croissance pourra avoir des chiots de grande taille s'ils disposent d'une alimentation correcte. Dans notre population ancestrale de chiens, tous avaient peu prs le mme aspect (en tous cas, il y avait beaucoup moins de diffrences entre eux qu'entre le SaintBernard et le chihuahua, tout le monde ressemblait au loup). Mais avaientils les mmes gnes? Non. Ce n'est pas obligatoire, loin de l. Les chiens, comme tous les mammifres, sont diplodes. C'est dire que tous leurs chromosomes vont par paire un chromosome est un long filament d'ADN, enroul sur luimme et empaquet dans des protines quand la cellule se divise, droul quand elle l'utilise pour fabriquer d'autres protines. Dans notre population ancestrale de chiens, tous avaient peu prs le mme aspect (en tous cas, il y avait beaucoup moins de diffrences entre eux qu'entre le SaintBernard et le chihuahua, tout le monde ressemblait au loup). Mais avaientils les mmes gnes? Non. Ce n'est pas obligatoire, loin de l. Les chiens, comme tous les mammifres, sont diplodes. C'est dire que tous leurs chromosomes vont par paire un chromosome est un
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long filament d'ADN, enroul sur luimme et empaquet dans des protines quand la cellule se divise, droul quand elle l'utilise pour fabriquer d'autres protines. Pour chaque paire, un des chromosomes vient de la mre (via l'ovule), et un autre vient du pre (via le spermatozode). Ces deux chromosomes sont ditshomologues car ils contiennent la mme suite de gnes. Les chiens, comme nous et beaucoup d'autres organismes, ont ainsi chaque gne en double exemplaire.

La fcondation Vous pouvez donc imaginer la situation : l'individu peut porter deux fois le mme exemplaire de chaque gne, ou bien alors deux exemplaires diffrents (on parle d'allles). Dans le premier cas, on dit que l'individu est homozygote pour le gne considr, dans deuxime cas, on dit qu'il est htrozygote . Ainsi, chez les humains, un bb ayant un parent peau claire et un parent peau sombre hritera, pour chaque gne impliqu dans la couleur de la peau (attention, il y en a plusieurs!), d'un allle de son pre et d'un autre de sa mre, et aura le plus souvent une peau de couleur intermdiaire.

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Un phnotype (trait ou ensemble de traits, observables, physiques, d'un organisme) peut aussi tre dominant sur l'autre (qui est alors dit rcessif ) c'est dire qu'il en masque l'expression. Pour la couleur des yeux, par exemple : si le phnotype couleur marron est dominant sur le phnotype couleur bleue , alors l'individu qui possde un allle de chaque aura les yeux... marron. C'est bien, je vois que vous suivez.

Couleur des yeux : version trs simple avec un gne deux allles Mais attention, la couleur des yeux n'est en ralit pas soumise un seul, mais plusieurs gnes, chacun possdant potentiellement plusieurs allles... Donc, si vous dsirez en savoir un peu plus sur la gntique, et la prvision des rsultats des croisements, toujours sur l'exemple de la couleur des yeux, l'annexe sur les croisements est l pour vous. Revenons nos chiens. Si nous avons des chiens portant des allles codant pour des phnotypes rcessifs rares, cela ne se voit pas, parce que ces allles se trouvent toujours associs d'autres, codant pour un phnotype dominant. Par contre, quand, par hasard, sont croiss deux individus portant le mme allle responsable de ce phnotype, il est possible que naisse un chiot homozygote pour cet allle particulier (portant donc deux exemplaires identiques du gne considr, comme la personne aux yeux bleus de notre exemple). Ce chiot exprime le phnotype rare, dont l'existence est ainsi rvle. En croisant les homozygotes pour cet allle, avec les htrozygotes (souvent les parents ou les frres et surs, dont on pense qu'ils peuvent porter une copie de cet allle rcessif), on finit par obtenir de plus en plus
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d'individus homozygotes pour l'allle rcessif. Et le tour est jou. Quelques milliers d'annes plus tard, nous avons notre caniche nain, alors que les gnes donnant au loup des poils friss, une petite taille, une robe blanche, un front bomb avec des grands yeux, sont extrmement rares dans la nature! Vous voyez galement en quoi la consanguinit (rsultant de croisement entre apparents), recherche volontairement ou non par les leveurs, peut acclrer le processus.

1.2 Quels sont les mcanismes en jeu dans l'exemple du chien?


Nous sommes partis d'une population apparemment assez homogne (de loups), pour arriver une multitude de petites populations trs diffrentes les unes des autres (les caniches, les bergers allemands, les rottweilers, les show show...). La population de base possdait un certain polymorphisme gntique (c'est dire, plusieurs allles pour chaque gne codant pour les caractres qui nous intressent, comme la couleur ou la longueur des poils). En divisant la population initiale en petites souspopulations avec chacune ses caractres particuliers, ce polymorphisme s'est trouv fortement rduit dans chacune d'elle. Mais si l'on dcidait de mlanger toutes les races de chiens, et que l'on comptait les allles prsents, qu'observeraiton? Ces allles sont globalement les mmes que dans la population ancestrale, mais dans des proportions diffrentes ( quelques mutations prs, voir chapitre 2). Ceux qui taient rares dans la population ancestrale sont devenus frquents dans certaines populations actuelles (et on peut ajouter que des allles peuvent mme avoir disparu dans quelques populations). C'est la consquence de la slection effectue par les leveurs. C'est une slection artificielle. Nous pouvons noter que la slection peut faire perdre des allles une population. Pour les rintroduire, les leveurs font parfois des croisements entre races, ce qui leur permet de rinjecter les allles perdus dans leur population.

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Mais laissons l nos chien un moment, et penchons nous sur ce qui se passe dans la nature.

1.3 Et dans la nature?


Dans la nature, trois phnomnes agissent de concert sur la diversit gntique : La slection naturelle, La drive gntique, Les flux de gnes. 1.3.1 La slection naturelle L'environnement exerce ce que l'on apppelle une pression de slection . Dans un environnement donn, certains caractres reprsentent un avantage en facilitant la vie des individus qui les portent, d'autres non. Si ces caractres sont associs des allles*, et donc transmissibles la descendance, les allles dsavantageux vont devenir moins frquents, jusqu' ventuellement disparatre de la population, alors que d'autres vont mieux se transmettre d'une gnration l'autre, et devenir plus frquents. Revenons un instant sur la notion d'allle, ou de caractre, avantageux : cette question est trs importante. Un caractre n'est jamais avantageux dans l'absolu. Par exemple, estil avantageux ou pas d'avoir des poils longs? En fait, a dpend. Si vous vivez au froid, oui, si vous vivez au chaud... pas toujours.

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Voyons maintenant les facteurs ce qui se cachent derrire le terme environnement. Non seulement les espces subissent des pressions de slection de la part de facteurs comme le climat, mais aussi de la part des autres espces avec lesquelles elles interagissent (pathognes, parasites, prdateurs, comptiteurs, proies...). De vritables courses aux armements peuvent s'enclencher. Par exemple, la proie possdant un caractre lui permettant d'chapper au prdateur, comme un camouflage, contribuera la slection des prdateurs les plus mme de la dtecter malgr son camouflage. Le prdateur, de son ct, en liminant les mauvais camouflages, slectionnera les plus efficaces. Ainsi, si un prdateur se nourrit de plusieurs espcesproies, et que l'une d'elles dispose d'un nouveau caractre pour chapper au prdateur, la prdation sur ellemme diminuera, mais sur les autres espces elle augmentera potentiellement en consquence. Les proies, comme les prdateurs, sont en comptition les uns avec les autres. Plusieurs points de vue sont donc possibles : relations prdateurs/proies, comptition prdateur/prdateur ou proie/proie. On parle alors de slection interspcifique. Tout ceci s'ajoute la comptition qui a lieu entre individus de la mme espce (slection intraspcifique), pour chapper aux prdateurs, aux pathognes, ou trouver les meilleures proies. Pire, un allle peut trs bien tre favorable un individu par rapport aux autres de son espce, mais uniquement en prsence d'un autre allle (d'un autre gne, ou du mme gne), et dfavorable dans le cas contraire. Par exemple, un allle codant pour des crocs pointus ne sera favorable qu'en prsence d'allles permettant la digestion de la viande, et d'allles favorisant un comportement de chasse. L'environnement d'un gne est donc prendre dans sa globalit : il s'agit de l'environnement extrieur l'individu, mais aussi des autres gnes ports par l'individu! Pour comprendre si un allle est avantageux, il faut donc l'examiner la fois dans le contexte environnemental de l'espce, par rapport aux autres allles du mme gne, ports par les autres individus et dans le contexte gntique de l'individu qui le porte. Il est par consquent trs difficile de savoir si un caractre est plus favorable que d'autres. D'une part, cette notion est relative et variable en fonction des facteurs environnementaux, et d'autre part, de nombreux caractres sont, mme dans un environnement
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donn, la fois favorables et dfavorables. Un exemple connu chez l'homme est celui de la mutation du facteur de coagulation V dite Leiden , du nom de l'universit o elle a t dcouverte. Elle provoque une augmentation de la vitesse de coagulation du sang. Il a t montr que cette mutation pouvait augmenter la rsistance certaines infections, mais d'un autre ct, elle provoque un risque accru de phlbites. Ce genre de caractre est dit soumis un compromis. Il n'y a pas de solution parfaite . Pour mieux comprendre encore, un autre exemple, chez la mouche du vinaigre : il a t montr que la bonne mmoire avait un cot en terme de dure de vie. Plus les mouches ont une bonne mmoire, ce qui est utile pour elles, pour trouver leur nourriture par exemple, moins elles vivent longtemps. Et il faut aussi faire attention un point important : en ralit, peu importe qu'un caractre soit dfavorable l'individu (ou l'espce ). Un caractre est slectionn simplement s'il est favorable la reproduction de l'individu qui le porte (et s'il est hritable, bien entendu). Il est facile de comprendre que si un caractre confre un individu une vie fertile plus longue que celle de ses congnres, et donc plus de descendants sur l'ensemble de sa vie, il sera slectionn si les conditions environnementales le permettent pas trop de prdation sur les adultes par exemple. Mais inversement, si un allle permet un individu d'avoir une descendance fertile plus nombreuse que ses congnres dpourvus de l'allle en question, et l'amne mourir jeune, mais aprs sa reproduction, il sera slectionn galement! Pourquoi? Au court de sa courte vie, il aura eu davantage de descendants que les autres individus, mme si la vie des autres a t plus longue. Cet tat de fait permet d'expliquer en partie le phnomne du vieillissement, d une accumulation, au cours des gnrations, d'allles ayant un effet favorable ou neutre sur la reproduction, la bonne sant, dans la jeunesse, mais un effet plus ou moins dltre, quelque temps aprs l'ge de la premire reproduction. Nous y reviendrons un peu plus tard. Pourquoi de tels allles sontils slectionns? C'est mathmatique : si un allle permet d'avoir une descendance fertile plus nombreuse que les autres, tant transmis cette mme descendance, il lui permettra son tour d'avoir une descendance plus nombreuse que les enfants de ceux qui
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possdaient un autre allle. Comme aucune population ne peut crotre indfiniment, il y a une comptition entre les descendants de chaque gnration, mais de part leur facult bien se reproduire, les individus portant l'allle avantageux la reproduction seront toujours plus nombreux, jusqu' envahir la population. Pourquoi de tels allles sontils slectionns? C'est mathmatique : si un allle permet d'avoir une descendance fertile plus nombreuse que les autres, tant transmis cette mme descendance, il lui permettra son tour d'avoir une descendance plus nombreuse que les enfants de ceux qui possdaient un autre allle. Comme aucune population ne peut crotre indfiniment, il y a une comptition entre les descendants de chaque gnration, mais de part leur facult bien se reproduire, les individus portant l'allle avantageux la reproduction seront toujours plus nombreux, jusqu' envahir la population. Cette notion est trs importante. Vous pouvez faire une pause pour y rflchir... prenez un caf, par exemple;). Vous l'avez bien mrit.

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La slection naturelle est donc une force qui modifie, et souvent rduit la diversit gntique dans une population. Ds que les conditions environnementales changent, les pressions de slection qui jouent sur la population se modifient. Cela entrane des changements de frquences dans les allles, car les caractres qui taient avantageux auparavant ne le sont plus forcment par la suite. Le nombre d'allles a tendance se rduire. Attention toutefois. La slection naturelle a de multiples facettes, et il est facile de faire des interprtations errones. Par exemple, prenons le fameux exemple des girafes. Dans une population ancestrale de girafes, l'poque o leur cou tait court (si vous vous demandez comment on sait que les anctres des girafes avaient le cou court, ce sera expliqu plus loin), il existait un certain polymorphisme des gnes qui codaient pour la longueur du cou. En gros, certaines avaient des cous un peu plus longs que d'autres. D'ailleurs, si vous regardez autour de vous, vous constaterez la mme chose chez vos voisins : certains topmodels ont des cous trs longs, alors que d'autres personnes donnent l'impression de n'avoir pas de cou (et pourtant, tout le monde a le mme nombre de vertbres cervicales, mme les girafes : sept. C'est le nombre de vertbres cervicales des mammifres, qui est fixe, l'exception des cas du lamantin et du paresseux). Revenons nos girafes : les girafes qui naissaient avec un cou un peu plus long que les autres avaient une descendance plus nombreuse que celles cou court, et de nos jours, toutes les girafes ont un long cou (ceci n'est valable que parce que l'effectif total des girafes ne peut pas crotre, d'une gnration l'autre, jusqu' l'infini). La question est : Pourquoi le long cou atil favoris la reproduction des girafes? Peuttre parce qu'il leur permettait de brouter les feuilles plus haut dans les arbres, et qu'elles taient donc mieux nourries, vitant la comptition avec les espces cou court mangeant la vgtation basse (slection naturelle stricte). Peuttre parce que quand les girafes mles se battent pour accder aux femelles, elles utilisent leur cou... ce qui fait que les plus longs cous
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auraient gagn plus de combats, et donc obtenu la faveur de ces dames (slection sexuelle pour plus de dtails sur cette forme de slection, direction l'encadr sur la slection sexuelle, cidessous!). Peuttre que seul le hasard de la drive gntique est en cause.

Il y a galement des cas o la slection va aider maintenir la diversit, et pas trop la rduire. C'est le cas par exemple de la slection dite frquencedpendante. Dans ce cas, un caractre est slectionn quand il est rare. Cela peut par exemple expliquer pourquoi le systme majeur d'histocompatibilit, le systme qui permet l'identification du soi par le systme immunitaire (et pose donc des soucis lors des greffes d'organes, car le systme immunitaire du receveur reconnat les nouvelles cellules comme trangres), est compos de molcules si varies. En effet, les pathognes (bactries, virus etc...) auraient plus de difficult infecter un hte au MHC rare, favorisant la survie et donc la reproduction de ce dernier.

rsum! Quels caractres sont susceptibles d'tre slectionns? Tous ceux qui sont hritables et qui jouent un rle dans la capacit des individus se reproduire pour laisser une descendance fconde. Pour qu'une slection soit possible, il faut bien sr que ces caractres soient variables, c'estdire que les gnes qui codent pour eux existent en
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plusieurs allles, certains laissant davantage de descendants que d'autres. Ces caractres peuvent tre physiques, physiologiques, morphologiques, mtaboliques, aussi bien que comportementaux. 1.3.2 La drive gntique La drive gntique a le mme type d'effet que la slection naturelle. Elle modifie la frquence des allles dans la population, voire rduit la diversit alllique, pour la simple raison que certains ne contribuent pas, ou peu la gnration suivante, mais cette fois par pur hasard. En outre, dans le cas de la reproduction sexue, les parents ne transmettent pas l'ensemble de leurs caractristiques leurs descendants, mais seulement quelquesunes (un allle sur deux par descendant, nous y reviendrons plus bas). La principale diffrence entre la slection et la drive est donc que cette dernire s'effectue entirement au hasard. Elle joue aussi un rle dans l'volution des espces domestiques, comme le chien, notamment sur tous les caractres auxquels ne font pas attention les leveurs, mais il est difficile de quantifier son rle. Quand on observe un phnomne, il peut appartenir diffrentes catgories. Il peut se drouler selon une loi ordonne. On peut donc prvoir ce qui va se passer. Par exemple, un systme ordonn est un jeu de cartes ranges dans l'ordre. Aprs chaque carte, on peut prvoir quelle sera la suivante. Il y a aussi le systme chaotique, dont une illustration est l'effet papillon . Dans le systme du chaos dterministe, on pourrait prvoir ce qui se passera si on avait une connaissance infiniment prcise de tous les paramtres initiaux, mais comme obtenir cette connaissance est impossible par dfinition ( cause de la notion d'infini), on se retrouve avec quelque chose d'en apparence imprdictible. On ne peut pas prvoir quel vnement, parmi tous ceux qui sont possibles, va se produire. Enfin, si on peut dgager une loi de probabilit d'apparition d'un vnement, sans que cet vnement soit prdictible, on se retrouve avec un systme alatoire. C'est le hasard, un vnement d des causes indpendantes (par exemple la rencontre entre une tuile qui se dtache d'un toit cause du vent et la tte d'un passant : la tuile ne se dtache pas parce que le passant passe, mais parce qu'il y a du vent : les vnements la tuile
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se dtache et le passant est l ont des causes indpendantes). L aussi, on pourrait sans doute prdire ce qui se passerait si l'on connaissait absolument tous les paramtres qui rgissent le systme, mais chaque vnement a une certaine probabilit de se produire, ce qui n'est pas le cas du systme chaotique. Pour la drive gntique, on peut calculer le pourcentage de chances qu'un allle a d'tre transmis la gnration suivante, ou de disparatre, sur l'ensemble de la population, sachant sa frquence initiale. Par exemple, un allle port par un seul individu, et ne confrant cet individu aucun avantage, ni dsavantage, c'est dire neutre dans ses effets sur la reproduction, a une chance sur deux de disparatre immdiatement la gnration suivante si cet individu n'a qu'un seul descendant mais on ne peut pas prdire ce qui va se passer en ralit, on ne peut parler que de probabilits... Et oui, puisque nous possdons deux allles pour chaque gne, nous avons une chance sur deux de transmettre chacun des allles en question chaque descendant... Sachant que l'effectif thorique ncessaire au renouvellement d'une population est de deux descendants par femelle, vous pouvez compter les chances qu'a chaque allle d'tre transmis en moyenne... D'ailleurs, attardonsnous un instant sur cet effectif thorique ncessaire au renouvellement d'une population. Imaginez une population de deux cents individus (des moutons par exemple), avec cent mles et cent femelles. Pour que l'effectif de cette population reste fixe, sans diminuer, ni augmenter, il suffit que chaque femelle ait deux petits. Si l'on considre que les petits ont une chance sur deux d'tre de chaque sexe, cela nous donnera, la gnration suivante, grosso modo 100 mles et 100 femelles. Or, vous connaissez tous des espces qui ont beaucoup plus de deux petits au cours de leur vie. Certains poissons en ont des centaines (et ne parlons pas des mouches). Si tous ces petits arrivaient maturit, ils envahiraient purement et simplement la plante! Comme cela n'est pas le cas, cela signifie que, sur la grande quantit de descendants produits, la plupart meurt avant d'tre mature. Ils sont mangs par les prdateurs... ou n'arrivent pas trouver assez de nourriture euxmmes, par exemple. Donc, chaque femelle produit en moyenne et en thorie, deux petits matures par gnration...
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Naturellement, certains individus arrivent produire une descendance mature plus nombreuse que la moyenne des autres, que ce soit par chance, indpendamment des aptitudes que leurs confrent leurs gnes, ou parce qu'ils possdent un avantage gntique quelconque leur donnant un avantage slectif. Les caractres qu'ils portent, s'ils sont hritables, ont donc de grandes chances de se rpandre dans la population au fil des gnrations, comme nous l'avons vu plus haut, dans le chapitre sur la slection. Dans une population de petite taille, quand un allle est rare, il peut n'tre port que par quelques individus. Que se passetil alors si, pour une raison fortuite, ces individus ne peuvent se reproduire? L'allle disparat, et ce mme s'il tait avantageux. Car tre avantageux ne signifie pas garantir la reproduction. On peut porter un super allle, et se prendre une branche sur la tte... Ou bien, dans le cas de la reproduction sexue, on peut possder cet allle en un seul exemplaire (htrozygotie*), et, par hasard, transmettre l'autre allle ses descendants. Pourtant, de trs nombreux allles ne sont ni avantageux ni dsavantageux par rapport aux autres. On les appelle les allles neutres. La slection naturelle n'a pas de prise sur eux. Leur frquence dans la population ne se modifie que grce la drive gntique. Regardez la figure suivante : elle reprsente une petite simulation (ralise avec le logiciel R). Imaginons dix gnes, chacun reprsent par une couleur diffrente, qui ont chacun deux exemplaires (allles). Chaque allle est prsent dans la moiti de la population, ils sont une frquence de 0,5. Ils ont chaque gnration une chance sur deux d'tre transmis chaque descendant. Il y a 100 individus dans la population, et chacun a un seul descendant. Que vatil se passer au bout de plusieurs gnrations?

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Simulation de drive gntique simple : on part de dix gnes deux allles, chaque allle tant la frquence initiale de 0,5 puis on les laisse voluer pendant 700 gnrations Comme vous pouvez le voir, au bout de 700 gnrations, quelques allles sont fixs (c'est dire qu'ils ont atteint une frquence de 1 ou de 0, donc ils sont seuls ou ont disparu). Mais beaucoup ne sont pas fixs.

Refaisons l'exprience, mais cette foisci, pour chaque gne, un allle est davantage reprsent que l'autre (la frquence initiale n'est plus 0,5). Le rsultat est prsent la figure suivante. Simulation de drive gntique simple : on part de dix gnes deux allles, chaque allle tant la frquence initiale de 0,1 puis on les laisse voluer pendant 700 gnrations.

Cette fois, beaucoup d'allles ont disparu, mais certains ont quand mme vu leur frquence augmenter. En fait, la probabilit de fixation d'un allle,
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c'est dire la probabilit que tous les individus de la population finissent par porter cet allle, est strictement gale sa frquence de dpart. C'est dire qu'en ralit, la probabilit de fixation d'un nouvel allle est gale la probabilit d'apparition de cet allle (mutation, voir chapitre suivant). On pourrait s'amuser faire comme a des milliers de simulations, et mme si on partait chaque fois de la mme situation initiale, on n'obtiendrait jamais deux fois le mme rsultat. C'est pour cela que les rsultats sont imprdictibles . Vous avez pu voir nanmoins que la drive gntique ncessite pas mal de temps (700 gnrations, prennent par exemple environ 700 ans au minimum chez le chien, qui peut avoir des petits au bout d'un an). Et le temps ncessaire est plus long dans les populations de grande taille. Mais l'volution se droule sur des millions d'annes... La drive gntique est une force volutive trs importante, car son rle peuttre plus fort encore que celui de la slection naturelle dans l'volution d'une population. 1.3.3 En fin de compte, quel niveau s'effectuent la slection naturelle et la drive gntique? Prenons un exemple, celui des lions. Vous savez peuttre que les lions mles s'approprient une bande de lionnes, avec lesquelles ils vivent jusqu' tre vincs par un autre lion, plus jeune, plus fort. Or, quand un lion prend possession d'une nouvelle troupe, la premire chose qu'il fait est de tuer les lionceaux. Pourquoi?

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Cela semble tout fait idiot pour la survie de l'espce . Tous ces lionceaux avaient dj un certain ge, il avait t coteux de les produire, de les allaiter, et voil tout rduit nant par un lion stupide. Mais en fait... que se passetil une fois les lionceaux tus? Les lionnes, qui n'ont plus personne allaiter, retombent bientt en chaleurs. Et le lion peut les fconder. Imaginez deux lions. Le lion Marcel possde un allle qui dtermine un comportement tueur de lionceaux (et oui, ce comportement est instinctif, c'est dire gntiquement dtermin). Le lion Jean ne le possde pas. Chacun prend possession d'une troupe de lionnes pendant quelques annes, avant d'tre vinc son tour. son arrive, Marcel tue les lionceaux et les lionnes sont en chaleurs. Quelques mois plus tard, nat une nouvelle troupe de lionceaux, portant leur tour l'allle tueur de lionceaux . Jean, lui, doit attendre un an avant d'avoir ses premiers lionceaux, le temps que les lionnes aient lev les prcdents. Qui au final aura eu le plus de lionceaux? Le tueur de lionceaux. Ce comportement est observ chez un certain nombre d'espces, dont des primates. Nous avons vu prcdemment que, du point de vue de la slection, peu importe qu'un comportement ou un caractre physique soit dfavorable l'espce, s'il est favorable la transmission des gnes qui codent pour lui. Il peut mme entraner la mort prcoce de l'individu; si cette mort ne nuit pas la production d'une descendance mature au moins aussi nombreuse que celles des autres membres de l'espce, le caractre ne sera pas contreslectionn... Cela explique pourquoi, mme si les grandsparents peuvent parfois aider substantiellement lever les enfants, tant de maladies nous atteignent plus particulirement pendant notre vieillesse : cancer, alzheimer etc... C'est simplement qu'elles n'ont jamais t contreslectionnes et pour cause, de toutes manire nos anctres ne vivaient pas un ge assez avanc pour en tre victimes... Peuttre que si nous pouvions vivre 200 ans, des maladies de vieillesse encore plus graves, dont nous n'avons pas ide, s'abattraient sur nous...
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Rflchissons maintenant la reproduction. Nous avons coutume de dire que les individus se reproduisent . Estce exact? Non, car nos descendants sont diffrents de nousmme. Mme si ils portaient le mme gnome que nous, s'ils taient nos clones, comme dans le cas de la reproduction asexue que pratiquent certaines espces, ils ne seraient pas nous . Que leur avons nous transmis? Nos gnes. La moiti de notre information gntique, transmise par un ovule ou un spermatozode, dans le cas des espces sexues. La seule chose qui passe d'une gnration l'autre, c'est donc de l'information gntique (et pigntique, voir encadr). C'est donc cette information qui est la cible de la slection et de la drive (ni l'espce, ni l'individu... qui est si phmre). Selon ce concept, les individus se retrouvent assimils des avatars que leurs gnes ont crs pour assurer leur reproduction. Les individus ne sont pas la cible directe de la slection, notamment car, d'une gnration l'autre, les combinaisons d'allles changent au fur et mesure des croisements successifs. Il y a aussi une possibilit d'apparition de nouveaux allles par mutation (voir chapitre suivant). Par consquent, chaque allle peut tre considr individuellement. Nanmoins, le rle de l'individu est important, en tant que prsenteur de gnes : la slection ne peut toucher les allles qu'au travers des combinaisons allliques des individus. Ainsi, un individu peut porter un allle trs favorable dans ses conditions environnementales propres, il ne sera pas transmis s'il porte en mme temps un autre allle, qui entrane, par exemple, la strilit. Cette ide de la slection des gnes au dtriment des individus est nomme thorie du gne goste et a t dveloppe, entre autres, par Richard Dawkins. Selon cette ide, n'existent l'heure actuelle que les gnes ou allles qui se sont le mieux reproduits, au dtriment des autres gnes. Les gnes qui se reproduisent le mieux sont ceux qui produisent les organismes les plus aptes les reproduire. Cette thorie, que certains trouvent choquante , a permis de rsoudre beaucoup de questions qui semblaient insolubles, notamment au niveau de l'tude des comportements des animaux, comme l'infanticide chez les lions. Elle permet aussi d'expliquer les bases de la coopration chez les
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fourmis. Comme les abeilles et les gupes, les fourmis peuvent former, selon les espces, des colonies de quelques dizaines (parfois moins) plusieurs centaines d'individus. Dans une colonie, on trouve une reine, et les ouvrires, ses filles. Les ouvrires sont toujours des femelles, nous allons voir pourquoi. Enfin, la colonie compte potentiellement quelques mles et quelques futures reines. Les fourmis partagent avec leurs cousines gupes et abeilles une particularit trs spciale. Seules les femelles portent deux exemplaires de chaque chromosome, et donc sont diplodes* (voir figure sur la fcondation pour la diffrence entre haplode et diplode). Les mles sont haplodes, c'est dire qu'ils n'ont qu'un seul lot de chromosomes. Lorsque la reine pond un uf, elle a le choix : fcond d'un spermatozode, cet oeuf donnera une femelle, et non fcond, il donnera un mle. La plupart des femelles sont striles : ce sont les ouvrires. La question est : pourquoi les gnes des fourmis peuventils les autoriser renoncer la reproduction? C'est William Hamilton qui, se basant notamment sur les travaux de Fisher et Haldane, a eu une ide de gnie : il a calcul le degr d'apparentement des ouvrires (toutes surs) entre elles, avec la reine, et avec leur potentielle descendance. Et l, surprise! Si les ouvrires ont le mme pre, elles sont davantage apparentes leurs surs qu' une hypothtique descendance : elles ont plus de gnes en commun. Par consquent, quand une ouvrire prend soin de sa sur, ou de la reine, elle favorise davantage la transmission de ses propres gnes que si elle avait ellemme des petits. D'autres mcanismes peuvent encore renforcer l'altruisme des ouvrires, en particulier si elles sont demisoeurs, mais une base fondamentale est pose. Autre exemple : un gne vraiment trs goste chez certaines espces de gupes parasitodes. Le terme parasitode indique que l'hte est tu au cours du dveloppement du parasite. Il s'agit par exemple des gupes qui pondent leurs oeufs dans des chenilles, les larves se nourrissant des tissus de la chenille, ce qui a pour consquence de la tuer. Les gupes ont un mode de reproduction semblable celui de leurs cousines les fourmis. La femelle, aprs s'tre accouple, peut fconder un ovule avant de le pondre,
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ce qui donnera une femelle, ou ne pas le fconder, ce qui donnera un mle. Or, certains mles portent un chromosome trs spcial, surnumraire. Celuici a la proprit tonnante, d'entraner la perte de tous les autres chromosomes d'origine paternelle prsents dans l'oeuf, au dbut de son dveloppement. Si une reine est fconde avec des spermatozodes portant un tel chromosome, imaginez ce qui arrive quand elle les utilise.... La celluleuf, au lieu de contenir deux lots de chromosomes, n'en contient qu'un, issu de la mre, plus le chromosome surnumraire, issu du pre. Comme il n'y a qu'un lot de chromosomes, la celluleuf donne une gupe mle, comme si l'ovule n'avait jamais t fcond. Mle qui va, son tour, rpandre ce fameux chromosome surnumraire! Cela nous amne donc la question : une espce peutelle s'teindre cause de quelques gnes gostes ? C'est facile imaginer avec l'exemple prcdent, mais on peut aussi imaginer un autre exemple : il suffirait d'un allle favorisant la monopolisation des ressources (nourriture, espace...) par son porteur, mais ne lui permettant pas de produire beaucoup de descendants. Privant les autres individus de ressources, il les priverait de reproduction, et donc se rpandrait dans la population, diminuant le nombre de descendants fertiles d'une gnration l'autre... et donc rendant l'espce sensible l'extinction. On est loin de l'ide de la slection pour la survie du plus apte ou la survie de l'espce. Cette ide du gne goste , peut sembler troublante, et pose pas mal de questions philosophiques, sur lesquelles nous reviendrons. Mais en fin de compte, savoir que nos gnes nous ont dvelopps pour les reproduire ne nous oblige pas le faire... 1.3.4 Les flux de gnes De la mme faon que les leveurs peuvent croiser diffrentes races de chiens pour obtenir des phnotypes* encore plus conformes leurs souhaits, dans la nature les flux migratoires entre des populations d'une mme espce peuvent maintenir la diversit gntique et s'opposer la rduction du nombre d'allles par la slection et la drive. Le brassage gntique (voir annexe) qui rsulte de la prsence de nombreux allles pour chaque gne permet ainsi de multiplier les combinaisons allliques
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dans la population. Ainsi, les possibilits d'adaptation de la population augmentent.

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2 Comment le polymorphisme gntique apparat-il?

Jusqu' prsent nous avons vu comment la slection naturelle (ou sexuelle), la drive gntique et les flux de gnes permettent de modifier les frquences des allles dans une population, et donc comment ils modifient les caractristiques des individus de cette population au cours des gnrations. Les caractristiques modifies peuvent concerner la morphologie, la physiologie, le comportement, tous les traits pour lesquels la gntique peut jouer un rle, mme partiel. Mais nous sommes toujours partis d'une population gntiquement polymorphe, c'est dire possdant plusieurs allles* pour chaque gne. Comment apparaissent donc ces nouveaux allles, ce polymorphisme? C'est le phnomne de mutation. Quand une cellule se divise, elle doit rpliquer toute l'information gntique qu'elle contient, afin que chaque cellulefille puisse fonctionner. Le systme de rplication de l'ADN, bien que trs bien fait, n'est pas infaillible. Il s'y produit rgulirement de petites erreurs, alatoirement, c'est dire au hasard. La notion de hasard est trs importante. Cela signifie qu'une mutation se produit indpendamment du fait qu'elle apporte un avantage ou pas. Nous avons vu que, quand on observe un phnomne, il peut appartenir trois catgories. L'une de ces catgories est le systme alatoire. C'est le cas d'une pice que l'on jette en l'air. Chaque face a une chance sur deux d'apparatre (c'est sa loi de probabilit), mais la face qui tombe est indpendante de la volont de la personne qui regarde. Rappellonsnous la structure de l'ADN. L'information de l'ADN est porte par une sorte d'alphabet quatre lettres (les bases azotes sont les molculeslettres : adnine, cytosine, guanine et thymine). La suite des molcules qui forment ce fragment est comme une phrase d'information. C'est une squence. Exemple de squence : ATTGCCATAATCGCTATTTATATATCGA...
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Pour les mutations, on sait que chaque base, lorsqu'elle est recopie par cellule, a une probabilit (infime) d'tre modifie par erreur. Un A la place d'un T, par exemple, ou carrment l'insertion ou le retrait d'une squence de plusieurs dizaines de paires de bases au mauvais endroit. cause de la chimie de la rplication, certaines erreurs sont plus probables que d'autres... Mais toutes sont imprdictibles. Les erreurs peuvent tre dues des erreurs de copie par la machinerie de la cellule aucune enzyme n'est 100 efficace, dans aucune espce, mais aussi des agents chimiques ou physiques, nomms mutagnes , c'est dire augmentant le risque d'erreur de copie. Il existe un systme pour rparer ces erreurs, mais ce systme non plus n'est pas infaillible. Certaines cellulesfilles sont donc diffrentes de la cellulemre cause d'une de ces mutations alatoires. Un nouvel allle est apparu! Bon, c'est le moment de consacrer un passage spcial aux fans des Xmen, et de Spiderman... Moi aussi, j'aime bien les Xmen et Spidey. Mais leurs scnaristes n'avaient rien compris au phnomne de la mutation et les cinastes actuels pas davantage. Les mutations se produisent lors de la division d'une cellule, ou alors si elle entre en contact avec un agent mutagne qui va abmer l'ADN directement. Dans notre corps par exemple, comme les cellules se renouvellent, et donc se divisent, sans arrt, les mutations peuvent se produire n'importe o, dans le bras ou dans les poumons. En gnral, si elles sont trop modifies, elles ne sont plus reconnues comme faisant partie du soi , et le systme immunitaire limine les cellules mutantes. En irradiant un humain, ou en lui faisant subir n'importe quoi de mutagne... eh bien, si des mutations se produisent, elle ne toucheront que quelques cellules de son organisme. Et ce sera chaque fois une mutation DIFFRENTE! Vous imaginez la catastrophe? Il est statistiquement impossible d'avoir deux fois la mme mutation dans deux cellules diffrentes. Et si un tre humain se retrouve dans ce cas, ce n'est pas des pouvoirs magiques qu'il dveloppe... mais des cancers. D'une manire gnrale, on distingue deux types de mutations : les mutations qui touchent les cellules sexuelles et les mutations somatiques qui touchent les cellules non impliques dans la
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reproduction. Pour qu'une mutation soit prsente dans toutes les cellules du corps, il faut donc qu'elle ait t prsente dans la celluleuf, c'est dire dans une cellule sexuelle d'un des deux parents, sinon, elle ne touche qu'une partie de l'organisme! Bref, des fois, il vaut mieux laisser son cerveau l'entre des cinmas. Revenons nos mutations. Comme nous l'avons vu plus haut, tout l'ADN d'une cellule n'est pas utilis par la cellule. Certaines parties ne servent rien , on les appelle des squences neutres : si elles sont modifies par des mutations cela ne change rien la chimie interne de la cellule, qui fonctionne comme si rien ne s'tait pass. D'ailleurs, mme dans les gnes, toutes les portions d'ADN n'ont pas forcment la mme importance. En effet, dans les enzymes par exemple, seule une petite partie de la molcule a une relle fonction, c'est le site actif . Une mutation touchant le site actif aura donc un effet important (souvent en supprimant sa fonction, ce qui est gnralement dfavorable, mais pas toujours). D'autres squences importantes sont les ventuelles squences de rgulation des gnes: elles ne sont pas codantes mais elles modulent l'expression des gnes. Les mutations qui ont lieu en dehors de ces rgions particulirement importantes seront le plus souvent sans aucun effet : ce sont des mutations neutres. Il est important de noter que les mutations se produisent indiffremment dans les squences neutres et nonneutres de l'ADN. Par contre, les squences d'ADN neutres donnent souvent l'impression d'voluer beaucoup plus rapidement que les autres, comme si les mutations y taient plus frquentes. Ces squences sont potentiellement trs variables entre les individus, tellement variables que l'on s'en sert par exemple pour les tests de paternit. C'est trs pratique, car l o il n'y a par exemple que trois allles pour le principal gne des groupes sanguins, on en trouve des centaines pour certaines squences neutres! Estce que les mutations sont vraiment plus nombreuses dans ces squences? Non, cette illusion vient de la slection naturelle. Il est important de noter que les mutations se produisent indiffremment dans les squences neutres et nonneutres de l'ADN. Par contre, les squences d'ADN neutres donnent souvent l'impression d'voluer
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beaucoup plus rapidement que les autres, comme si les mutations y taient plus frquentes. Ces squences sont potentiellement trs variables entre les individus, tellement variables que l'on s'en sert par exemple pour les tests de paternit. C'est trs pratique, car l o il n'y a par exemple que trois allles pour le principal gne des groupes sanguins, on en trouve des centaines pour certaines squences neutres! Estce que les mutations sont vraiment plus nombreuses dans ces squences? Non, cette illusion vient de la slection naturelle. En effet, elle n'agit pas sur les portions d'ADN qui ne servent pas produire des protines, ou rguler cette production, donc les mutations dans les squences neutres donnent des allles qui voluent par drive uniquement. La perte de variation est donc moins importante que pour une squence nonneutre, un vrai gne par exemple, ou une squence de rgulation, dont les mutations altrant la fonction risquent d'tre contreslectionnes. tudier ces squences neutres a donc un grand avantage : cela permet de mesurer la frquence d'apparition des mutations et ensuite de dater certains vnements volutifs, grce au principe de l' horloge molculaire , dvelopp par Kimura dans sa thorie neutraliste de l'volution. En effet, selon ce principe, bien affin depuis, l'accumulation des mutations dans une squence s'effectue une vitesse proportionnelle au passage du temps, l'chelle gologique. Nous y reviendrons plus en dtails dans le chapitre suivant. Revenons maintenant nos chiens : pendant quelques millions d'annes, avant l'intervention de l'homme, le polymorphisme gntique s'est accumul dans les populations sauvages. Comme certains allles sont dsavantageux dans la nature, ils restent rares. Si en plus ils codent pour des phnotypes rcessifs* par rapport aux autres, leurs effets peuvent demeurer presque invisibles. Par la suite, durant la domestication, la slection artificielle a modifi les frquences allliques, entranant la cration d'une multitude de petites populations domestiques chez lesquelles des allles diffrents ont t slectionns. En outre, d'autres mutations ont pu apparatre depuis les dbuts de la domestication, ce qui amplifie encore le phnomne. Pour terminer avec les mutations, il faut savoir que leurs effets, mme dans les squences codantes ou rgulatrices, sont trs variables. Elles peuvent
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n'avoir aucun effet. Mais une seule et unique mutation peut aussi avoir un effet trs lger, comme une subtile modification de la couleur de quelques poils, ou trs lourds, comme la mutation antennapedia , qui entrane chez la mouche du vinaigre une transformation des antennes en pattes! Ce genre de grosse modification peut arriver lorsqu'un gne qui code pour plusieurs caractres dans un mme organisme est mut. Les plus spectaculaires sont sans doute, chez les pluricellulaires, les mutations qui touchent les gnes de dveloppement, c'est dire les gnes qui donnent la structure de l'organisme, la place des organes. Ainsi peuvent apparatre de nouvelles structures, partir d'organes prexistants. Il suffit parfois de quelques minimes diffrences gntiques pour expliquer d'normes diffrences morphologiques entre deux espces.

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3 L'arbre du vivant

3.1 Comment d'une espce passer deux espces et qu'estce qui les diffrencie?
Comment d'une espce passer deux espces et qu'estce qui les diffrencie? Forts de ces nouvelles connaissances, nous pouvons rflchir au vivant dans son ensemble. Comment relier les tres vivants entre eux? Qui est apparent? Qui est l'anctre de qui? Comment faire pour rpondre ces question? Si vous avez suivi ce qui prcde, vous pouvez dj rpondre la question du titre. Tout d'abord, toutefois, dfinissons la notion d'espce : d'aprs Ernst Mayr, une espce est une communaut reproductive de populations, reproductivement isole d'autres communauts et qui occupe une niche particulire dans la nature . Le pilier de cette dfinition est l'ide d'interfcondit entre les populations. Donc, pour que deux populations, d'une espce sexue, appartiennent la mme espce, il faut que les individus qui les composent puissent se croiser entre eux, et que leurs descendants le puissent galement. Ainsi, l'ne et le cheval produisent des mulets ou des bardots, selon le sens du croisement, qui sont des animaux striles. L'ne et le cheval n'appartiennent donc pas la mme espce. Par contre, le SaintBernard et le berger allemand peuvent avoir une descendance fertile sans problme : ils appartiennent la mme espce. Cependant, des hybrides fertiles sont parfois obtenus, en captivit, entre deux espces sauvages diffrentes (notamment chez les plantes). Cela ne signifie pas qu'il faille les regrouper dans une seule et mme espce, car pour cela il faudrait que ces hybrides soient aussi produits dans le milieu naturel, ce qui n'est gnralement pas le cas, pour des raisons diverses. Par exemple, elles ne fleurissent pas tout fait la mme priode, ne vivent pas au mme endroit, ou n'occupent pas les mmes niches cologiques ,
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c'estdire qu'elles n'occupent pas tout fait le mme milieu, o n'y partagent pas les mmes conditions de vie, ce qui entrave leur mise en contact. Nanmoins, l'obtention d'hybrides en conditions contrles permet de suspecter un anctre commun rcent. Pour les chiens, qui se croisent en captivit... eh bien, leurs conditions de vie naturelles ne sontelles pas la symbiose avec l'homme? Par consquent, les croisements tant toujours possibles entre diffrentes races, nous n'avons vraiment affaire qu' une seule et mme espce. Donc, imaginez une population d'une espce donne, qui se retrouve gographiquement isole du reste de l'espce. Par exemple, elle peut se trouver sur une le qui vient de se former, ou tre isole cause d'une rivire, d'une ruption volcanique, ou d'une migration comme chez les criquets. Ces deux populations, sans contact, vont voir leurs frquencesallliques se modifier de faon diffrente, par le hasard de la drive gntique. En outre, elles peuvent ventuellement tre soumises des pressions de slection diffrentes. Au bout d'un certain nombre de gnrations, les diffrences accumules entre ces deux populations, simplement par drive et slection, voire ventuellement avec quelques mutations, seront tellement importantes que les individus ne pourront plus se croiser, mme si on les mlangeait de nouveau. Elles sont isoles gntiquement : plus aucun allle* ne peut passer d'une population l'autre, il n'y a plus aucun flux de gnes*. Comment se reprsenter un flux de gnes ? Lorsque l'on s'amuse faire de la gntique au niveau d'une population, on se reprsente chaque population sous forme d'un grand sac, contenant les allles de chaque individu pour un gne donn. Pour chaque population, on a donc un sac avec une certaine proportion de chaque allle, proportion qui se modifie au cours des gnrations en fonction de la slection naturelle, de la drive, et des mutations ventuelles. Quand des individus migrent d'une population l'autre (et se croisent elle), ils vhiculent des allles d'un sac l'autre : c'est un flux d'allles. Quand deux populations sont physiologiquement incapables de se croiser, le flux d'allles est nul, mme si les individus vivent au mme endroit. On dit que les populations sont isoles reproductivement. On distingue deux sortes d'isolement reproducteur :
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l'isolement prreproducteur : la fcondation ne peut avoir lieu, parce que les partenaires ne peuvent se rencontrer dans la nature, pour cause d'occupation de diffrentes niches cologique, ou bien ne s'identifient pas comme partenaires (par exemple, essayez de croiser un chien et un chat...), ou alors leur croisement est rendu impossible par un obstacle mcanique (la taille par exemple, ou la forme des organes reproducteurs), cologique (modification de la priode de reproduction par exemple), ou physiologique (par exemple, le spermatozode n'arrive pas trouver son chemin dans les voies gnitales de la femelle, ou pntrer dans l'ovule). l'isolement postreproducteur : la fcondation a lieu, mais l'embryon ne peut se dvelopper, ou bien il se dveloppe, mais il est strile, comme le mulet. Souvent, la mise en place de cet isolement reproducteur se fait graduellement. L'hybridation est possible, mais difficile, puis devient impossible. Mais parfois, une diffrence sur quelques gnes suffit la rendre impossible immdiatement. Le phnomne d'apparition des espces se nomme spciation. Depuis l'apparition de la vie, les populations se sparent et se diversifient, les espces s'loignent les unes des autres, formant un arbre partant d'une origine unique. Nous avons vu la spciation conscutive une isolement gographique de deux populations. Parfois, le phnomne ne ncessite pas d'isolement gographique. Les deux espces continuent peupler la mme rgion, mais deux populations s'isolent dans des niches cologiques diffrentes. Par exemple, elles peuvent se mettre utiliser des ressources alimentaires diffrentes. Il existe plusieurs formes de spciation, que l'on distingue et nomme selon la nature du phnomne qui prcde l'isolement reproducteur. Comme vous l'avez srement compris, la notion d'espce est prendre avec des pincettes, elle n'est pas absolue. D'une part, elle ne s'applique avec cette dfinition qu'aux sexus. D'autre part, de nombreuses espces sont actuellement en cours de spciation... Ce qui les rend difficile sparer et nommer, et entrane d'interminables querelles de spcialistes. Cela ne remet pas l'volution en cause, bien au contraire. Il faut juste savoir de quoi on parle quand aborde la notion d'espce, et ne pas
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l'appliquer tort et travers.

3.2 Pourquoi certaines espces semblent n'avoir pas chang depuis des millions d'annes?
Si vous avez suivi, vous savez que des mutations se produisent tout le temps. Vous savez aussi que les conditions environnementales la surface du globe sont changeantes et donc que les pressions de slection se modifient avec le temps. Comment expliquer alors la prsence des fossiles vivants comme le clacanthe? La rponse est simple : les fossiles vivants n'existent pas. Les organismes ont chang, mais cela ne se voit pas morphologiquement. Pourtant, il y a eu des mutations dans leur gnome (l'ensemble de leur information gntique), et des modifications des frquences allliques entre la population ancestrale et la population moderne. Si vous avez suivi, vous savez que des mutations se produisent tout le temps. Vous savez aussi que les conditions environnementales la surface du globe sont changeantes et donc que les pressions de slection se modifient avec le temps. Comment expliquer alors la prsence des fossiles vivants comme le clacanthe? La rponse est simple : les fossiles vivants n'existent pas. Les organismes ont chang, mais cela ne se voit pas morphologiquement. Pourtant, il y a eu des mutations dans leur gnome (l'ensemble de leur information gntique), et des modifications des frquences allliques entre la population ancestrale et la population moderne. Leur physiologie ou leur mtabolisme peuvent s'tre modifis, ils ne sont pas rests figs dans le temps. Si cela vous semble clair, vous pouvez maintenant comprendre qu'il est faux de dire que l'homme descend du singe! Eh oui, le chimpanz, que l'on utilise couramment pour illustrer cette ide, est un animal actuel! La phrase juste est donc : l'homme est un singe (ou pour tre plus prcis, un primate) , ou encore l'homme a un anctre commun avec le chimpanz . Et notre anctre commun avec le chimpanz est trs rcent, alors que celui que nous avons avec des espces qui sont encore plus diffrentes de nous est plus loign dans le temps. Par exemple, notre
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anctre commun avec le poisson rouge est vieux de plusieurs centaines de millions d'annes. Et notre anctre avec le brin d'herbe est plus vieux encore. Et notre anctre avec les bactries, il remonte aux origines de la vie! Nous sommes tous cousins.

Il est d'ailleurs intressant de constater que tous les tres vivants ont un mme anctre commun. Comment le saiton? Parce que nous partageons tous un certain nombre de molcules, prcises, trs conserves. Les bactries, les arches et les eucaryotes, qui reprsentent, ainsi que nous le verrons par la suite, les trois grands domaines du vivant, ont ainsi une base physiologique commune, notamment parce que nous utilisons tous de l'ADN et que nous partageons les mcanismes qui y sont lis. Il est beaucoup plus probable que ces mcanismes ne soient apparus qu'une fois, plutt qu'ils soient apparus plusieurs fois indpendamment. Histoire de probabilits.

3.3 Comment dater les anctres?


On peut dater les fossiles, c'est une mthode efficace, fiable et qui a fait ses preuves. Mais ce n'est pas cette mthode qui nous intresse aujourd'hui. Comme vous avez pu le voir plus haut, la spciation se droule toujours de la mme manire : une population ancestrale, qui produit deux populations filles (ou plus). Comment les diffrencieton? En analysant leur ADN. Comme les mutations se produisent ponctuellement au cours du temps, et ont tendance plus ou moins s'accumuler, en fonction de la faon dont elles sont soumises la slection naturelle, on peut dater le moment de la divergence entre les deux populations! Concrtement comment faiton? Pour cela, il faut trouver des squences homologues, pour pouvoir les
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comparer. Rappelonsnous que des squences sont des fragments d'ADN, crits dans l'alphabet quatre lettres correspondant aux bases azotes A,T, G, C. Ainsi que nous l'avons vu plus haut, les squences homologues sont donc des gnes ou des fragments d'ADN qui ont la mme origine, c'est dire qu'ils sont tous les deux drivs de la mme squence ancestrale. Comme vous avez pu le voir plus haut, la spciation se droule toujours de la mme manire : une population ancestrale, qui produit deux populations filles (ou plus). Comment les diffrencieton? En analysant leur ADN. Comme les mutations se produisent ponctuellement au cours du temps, et ont tendance plus ou moins s'accumuler, en fonction de la faon dont elles sont soumises la slection naturelle, on peut dater le moment de la divergence entre les deux populations! Concrtement comment faiton? Pour cela, il faut trouver des squences homologues, pour pouvoir les comparer. Rappelonsnous que des squences sont des fragments d'ADN, crits dans l'alphabet quatre lettres correspondant aux bases azotes A,T, G, C. Ainsi que nous l'avons vu plus haut, les squences homologues sont donc des gnes ou des fragments d'ADN qui ont la mme origine, c'est dire qu'ils sont tous les deux drivs de la mme squence ancestrale. Par exemple, notre hmoglobine et celle du chimpanz sont homologues, car elles sont drives de celle de notre anctre commun. En effet, c'est une molcule trs complexe, partage par tous les vertbrs : il est invraisemblable qu'elle soit apparue indpendamment chez toutes ces espces. Donc, quand nous avons nos deux squences, nous comptons le nombre de diffrences entre elles. Et enfin, sachant la frquence des mutations (par gnration), cela nous donne une ide du temps qu'il a fallu pour que toutes ces diffrences s'accumulent. C'est le principe gnral, celui de l' horloge molculaire de Kimura, vu plus haut. Bon, la ralit est un peu plus complexe... et ncessite pas mal de calculs. Entrons un peu dans les dtails, sans aborder les calculs. Bien entendu, on ne prendra pas le mme type de squences si on veut analyser des espces proches que si on veut analyser des espces loignes. Dans le premier cas, on prendra des squences neutres, c'est dire noncodantes, non rgulatrices, qui accumulent en peu de temps beaucoup de mutations car elles ne sont pas soumises la
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slection naturelle. Cependant, si ces squences ont diverg depuis longtemps, plusieurs mutations peuvent avoir eu lieu au mme endroit (fig suivante).

Voici l'exemple de l'volution d'une squence au fil de plusieurs gnrations. On commence par observer 5 mutations (en rouge), entre la squence ancestrale et la premire squencefille. Puis, plus tard, on constate que la deuxime squencefille possde 4 diffrences avec la premire, mais 8 avec l'anctre, car une des mutations (en vert) a restaur une base ancestrale.

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Ainsi, le calcul risque d'tre faux si les organismes ont diverg depuis trop longtemps. Dans ce cas (par exemple des espces qui ont diverg il y a plusieurs centaines de millions d'annes), on prendra donc des squences plus ou moins soumises la slection, car mme dans ce cas, elles auront accumul des diffrences avec le temps, mais beaucoup moins que les squences neutres. Il y a notamment des molcules (comme les ribosomes) que l'on retrouve chez
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tous les tres vivants (ce qui est un des arguments pour expliquer que TOUS les tres vivants, les animaux, les plantes, les champignons, les bactries, ont le MME anctre commun). Elles ont servi laborer l'Arbre du Vivant, car elles ne sont pas trs diffrentes entre tous les tres vivants : on peut donc les utiliser pour comparer des groupes d'espces trs loignes. Avec cette mthode, on peut aussi parfois (pas toujours) avoir une ide de l'aspect ou de la physiologie de l'anctre. Ainsi, si plusieurs espces issues d'un anctre commun partagent toutes un certain caractre, sauf une, il est trs probable que ce caractre ait t aussi port par l'anctre, sinon, cela signifierait qu'une mutation identique a eu lieu plusieurs fois, ce qui est trs improbable. L'autre possibilit est que l'espce en question soit le groupe frre de l'ensemble des autres, et que la mutation ait t introduite aprs les divergence. La figure suivante illustre ces deux cas. On choisit toujours l'hypothse qui ncessite le moins de mutations, qui est dite la plus parcimonieuse. Exemple d'arbres phylogntiques construits sur la base d'un groupe d'espces imaginaires, des points noirs et des points bleus. Le but du jeu est de trouver la couleur de l'anctre commun.

Prenons un exemple concret : l'anctre des mammifres avaitil un long cou? Les girafes ont un long cou, mais les autres mammifres ont gnralement un cou assez court. Si l'anctre commun des mammifres avait eu un cou long, alors cela voudrait dire que tous les mammifres part les girafes ont perdu cette caractristique. L'inverse est infiniment plus probable! Sans compter que les fossiles des premiers mammifres n'ont pas un cou trs long.... ce qui confirme l'hypothse du cou ancestral court. Nous avons vu que les mutations taient alatoires. Il est aussi trs rare d'en trouver deux qui aient le mme effet. Pourtant, on observe souvent dans la nature des espces loignes qui se ressemblent plus ou moins. Ainsi, les baleines, qui sont des mammifres, ont une forme hydrodynamique comme les poissons. On parle alors de convergence : des causes diffrentes (mutations diffrentes sur des gnes diffrents) conduisent des similarits morphologiques.
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Cela peut conduire une erreur d'interprtation si on se limite la morphologie, mais l'analyse gntique permettra de rectifier le tir, en constatant que les espces que l'on croyait proches (baleine et requin par exemple) sont en ralit trs diffrentes.

3.4 quoi ressembletil, cet arbre?


Dans un premier temps, il est important de comprendre qu'au fur et mesure des dcouvertes, les scientifiques modifient en consquence la structure de l'arbre du vivant, qui n'est pas parfait. Il change donc un peu d'anne en anne, et est probablement amen se modifier encore dans le futur. Toutefois, chaque tape nous rapproche un peu plus d'une reprsentation correcte de la ralit. Maintenant, voyons quoi ressemble l'arbre tel qu'il est reprsent d'aprs les donnes actuelle (pour avoir une explication dtaille de l'arbre et de ses volutions, je vous suggre de lire la Classification phylogntique du vivant de Guillaume Lecointre et Herv Le Guyader, aux ditions Belin). Examinons la figure suivante (Source : Wikipedia, http://commons.wikimedia.org/wiki/Image:Phylogenetictree.svg, licence : Domaine Public).

Arbre du vivant simplifi, ralis par Eric Gaba d'aprs Carl Woese. Cet arbre n'est dj plus tout fait exact d'aprs les donnes actuelles. Nous
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savons par exemple que les champignons sont plus proches des animaux que des vgtaux. L'arbre du vivant se compose de trois domaines : les tres vivants dont l'ADN est enferm dans un noyau, ou eucaryotes , les bactries, et les arches. Les arches sont des unicellulaires qui ressemblent des bactries. C'est Carl Woese qui les a, le premier, dfinies comme un groupe part. La plupart d'entre elles vivent dans des milieux extrmes : chauds, acides, ou sals (pour en savoir davantage sur la dcouverte et le mode de vie de ces trs passionnants organismes, je vous conseille la lecture de l'ouvrage suivant : Les microbes de l'enfer , Patrick Forterre, ed Belin/Pour la Science). Il y en a dans les sources d'eau chaude, ou dans... notre systme digestif. Ceci nous amne notre premire observation : il n'y a pas de direction de l'volution vers la pluricellularit, contrairement l'ide reue qui voudrait que l'volution se fasse du simple au complexe , avec en prime l'ide que le complexe correspond ce qui nous ressemble le plus, nous autres les humains , pluricellulaire avec des cellules spcialises en organes. D'une part, les neufs diximes de l'arbre sont des unicellulaires et d'autre part, ils sont loin d'tre simples ! Mme si aux yeux du profane, une bactrie ne ressemble rien de plus qu'une autre bactrie, leur biochimie regorge d'inventions ingnieuses, diverses, originales et complexes, et n'a finalement rien envier celle des animaux ou des plantes. Reprenons notre arbre. Il faut noter que, mme si cela ne se voit pas au premier abord, l'arbre du vivant en gnral est un peu compliqu par quelques particularits lies aux bactries. En effet, certaines de cellesci se sont lies fortement avec les eucaryotes, en vivant en symbiose avec eux, l'intrieur des cellules. Ces bactries ont donn des organites aux rles essentiels : mitochondries pour la respiration, chloroplastes pour la photosynthse des vgtaux... Il faut donc considrer l'volution de ces organites sparment de celle de leurs htes eucaryotes. En outre, les bactries ont l'habitude de s'changer du matriel gntique entre individus (l'art de pratiquer le sexe en dehors de la reproduction). Ces transferts horizontaux (voir annexe)font parfois ressembler leurs branches de l'arbre un rseau davantage qu' un buisson.
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Nous allons maintenant regarder plus attentivement la branche des eucaryotes. Les eucaryotes, ou organismes dont les cellules comportent un noyau , se sont, comme les bactries et les arches de leur ct, largement diversifis. Dans les grands groupes ainsi apparus, on peut citer les animaux, les champignons, les vgtaux (les verts et les algues rouges), mais il en existe beaucoup d'autres, incluant notamment des organismes unicellulaires. Et il faut savoir que les champignons sont classs plus prs des animaux que des vgtaux, justement suite aux analyses gntiques. La science qui consiste explorer les liens exacts entre toutes les branches de l'arbre du vivant, une sorte de gnalogie du vivant, s'appelle la phylognie. Les dcouvertes rcentes dans cette science nouvelle qu'est la phylognie ont beaucoup boulevers la conception traditionnelle du vivant, en seulement une trentaine d'annes, mme si certains des anciens grands biologistes avaient remarquablement bien dduit certains liens de parent entre les organismes. Nous savons maintenant que des termes comme reptile , poisson ou algue , n'ont pas de sens en phylognie. En effet, si l'on prend les reptiles, il faut y inclure les dinosaures... Mais comme les analyses gntiques et palontologiques ont galement montr que les oiseaux taient les descendants actuels d'une famille de dinosaures, cela signifie qu'il faut en toute logique inclure les oiseaux dans les reptiles! Un nouveau groupe a donc t cr, celui des archosauriens , pour dsigner l'ensemble reptiles+oiseaux . Pour les poissons , le mieux est de regarder l'arbre suivant pour comprendre le problme :

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Arbre reprsentatif de la phylognie des vertbrs, reprsentant les apparentements entre les groupes. Les distances entre les branches et la longueur des branches ne reprsentent pas la distance gntique relle. Les ttrapodes sont les animaux quatre pattes munies de doigts , dont font partie les oiseaux, les crocodiles, les tortues, les lzards, les serpents (eh oui), les batraciens, les mammifres (dont l'homme)... Avec cet arbre, les ttrapodes sont inclus dans les poissons ... Et l'homme? L'homme est un animal, il vient donc se placer dans la branche des eucaryotes, au niveau des mammifres, juste ct des chimpanzs et bonobos, dans la branche des primates.

Arbre phylognique des hominids, reprsentant les apparentements entre les groupes. Les distances entre les branches et la longueur des branches ne reprsentent pas la distance gntique relle. Le groupe des humains + bonobos + chimpanzs constitue le groupe des hominins. Le groupesfrre des hominids (= hominins+ gorilles) est celui des
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pongids, les orangoutangs. Arbre phylognique des hominids, reprsentant les apparentements entre les groupes. Les distances entre les branches et la longueur des branches ne reprsentent pas la distance gntique relle. Le groupe des humains + bonobos + chimpanzs constitue le groupe des hominins. Le groupesfrre des hominids (= hominins+ gorilles) est celui des pongids, les orangoutangs. Nous avons commenc ce chapitre en parlant des races de chiens. Peuton parler de races d'hommes? Tout le monde peut voir que nous sommes trs diffrents les uns des autres. Il y a des noirs, des blancs... En fait, tout serait simple s'il n'y avait que des noirs et des blancs, mais il y a des caf au lait, des bronzs, des plus ou moins jaunes, des rougetres, bref, tout un continuum d'intermdiaires que personne ne sera jamais d'accord pour classer noir ou blanc . Rien que sur la couleur de la peau, on pourrait faire quatre, cinq, cent, mille races , et encore, il y en aurait toujours qu'on ne saurait pas classer. Et il n'y a pas que la couleur de la peau, il y a la forme du nez, des yeux, des cheveux... et surtout tout un tas de caractres invisibles, comme les groupes sanguins. Alors en admettant que l'on arrive dfinir un certain nombre de groupes, en se basant sur la couleur de la peau, que se passeratil si on en fait d'autres en se basant sur les groupes sanguins? Il seront diffrents, et ne se superposeront pas. On peut toujours choisir un ou deux (ou dix, ou mille) critres arbitraires, pour essayer de classifier les populations humaines, mais si l'on en change, on se rend compte que, peu ou prou, la classification a chang aussi. Donc, que choisir? Qu'est ce qui est le plus valable? Les groupes sanguins, ou la couleur de la peau? Pour les chiens, c'est facile, ce sont les leveurs qui dcident ce qui est important, en fonction de leurs envies. Mais a ne veut pas dire qu'un caractre ait biologiquement plus d'importance qu'un autre. En plus, ces critres ne refltent pas toujours les vritables filiations. Par exemple, plusieurs populations noires de peau pourraient tre plus diffrentes entre elles (si on utilise une mesure sur d'autres gnes que ceux de la couleur de la peau) qu'une trs fonce et une trs claire. La coloration fonce de la peau est due la slection par l'exposition au soleil, qui fait
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que toutes les personnes habitant dans des rgions ensoleilles vont avoir tendance mourir tt de problmes de peau si elles n'ont pas assez de protection mlanique (le pigment noir de la peau, qui protge des UV solaires). Ainsi, deux populations fonces pourraient habiter cte cte parce qu'elles sont issues toutes les deux de la mme populationmre fonce, ou bien l'une est immigrante, mais que seuls ses membres les plus foncs aient t slectionns (c'est dire qu'ils aient eu plus d'enfants que les autres, mourant moins jeunes). Plus fort encore : la variation l'intrieur d'un groupe est toujours plus leve que la variation entre les groupes. C'est dire que pour un gne donn, vous n'avez gnralement pas davantage de chances de trouver une personne ayant les mmes allles que vous l'intrieur de votre groupe ethnique qu' l'extrieur de celuici. L'illustration flagrante de cet tat de faits est la recherche de donneurs dans le cas d'une greffe d'organe : si l'on ne trouve personne de compatible dans la famille proche du receveur, alors peut chercher directement dans l'ensemble de la population humaine, car les probabilits de trouver un donneur deviennent identiques quelle que soit la rgion du monde o l'on cherche. Ainsi, pour dfinir de faon absolue des populations humaines que personne ne puisse contester, il faudrait compiler tous les caractres possibles. 30 000 gnes, certains trs polymorphes, plus les squences d'ADN noncodantes qui servent mesurer le polymorphisme... On se retrouve alors avec un seul individu par race! Nous sommes tous parents, mais tous diffrents. Pourtant, l'homme est une espce qui, compare d'autres (notamment au chimpanz), n'a pas beaucoup de diversit gntique... Il est donc impossible de biologiquement catgoriser des races humaines. Cela ne signifie pas que nous soyons tous identiques, au contraire, mais qu'il n'y a pas de limite nette quand on dfinit des populations. Alors, on peut trs bien le faire pour les besoins d'une tude, mais en ralit, chaque tude ne fait qu'user une classification arbitraire qui arrange ses concepteurs, et elles sont toutes potentiellement diffrentes. Comme chacun l'accepte, cela ne pose pas de problme. Les mdecins s'en servent d'ailleurs parfois pour faciliter certains diagnostics par exemple (certaines maladies gntiques sont plus prsentes dans certaines rgions
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du monde, ce qui ne signifie pas qu'on ne puisse les trouver ailleurs), ou affiner le dosage de certains mdicaments afin de l'adapter chacun selon son ascendance, en gardant l'esprit les svres limites de cette mthode. Au final, ce que nous apprend la gntique des populations sur l'humain, c'est que nous sommes beaucoup plus proches parents les uns des autres que ce que l'on croit habituellement. Ds que l'on remonte de quelques gnrations dans le pass, nos arbres gnalogiques ne ressemblent plus vraiment des buissons, mais davantage des filets, car nous partageons finalement tous le mme nombre limit d'anctres. Revenons l'arbre du vivant. Il a donc une chelle de temps : on part de l'anctre, et on arrive aux espces actuelles, qui sont toutes places galit sur la ligne du prsent. Vous aurez compris que contrairement ce que beaucoup d'entre nous ont appris l'cole, le vivant ne se reprsente pas sous forme d'une chelle, avec les primitifs en bas et les volus en haut (et l'homme au sommet), car l'ide de progrs ne fait pas partie du concept d'volution biologique. On doit examiner les caractres un par un. Il y a les ancestraux , qui taient dj ports par les anctres, dans le pass, et les drivs , qui ne l'taient pas, et sont nouveaux. Un mme organisme peut donc porter des caractres ancestraux et des caractres drivs. Par exemple nous portons le caractre ancestral de la main cinq doigts (on peut opposer le cheval, qui a un caractre driv d'une main un seul doigt central, mais dont les anctres avaient aussi cinq doigts), et le caractre driv du pouce opposable. Quoi qu'il en soit, vitons d'employer le terme primitif , que ce soit pour parler d'un caractre ou d'un organisme entier, qui est pjoratif : ce n'est pas parce qu'un systme est vieux qu'il est inefficace (au contraire, si il est encore l de nos jours, c'est bien qu'il est efficace), ou qu'il ne l'a pas t dans un contexte environnemental donn, mme si celuici est pass et n'existe plus. Chaque organisme est ou a t adapt son milieu un temps donn. De la mme manire, la complexit n'est pas un gage d'efficacit. De nombreux organismes sont rests simples au cours de leur volution, d'autres se sont complexifis. D'autres encore ont mme connu des phases de complexification/simplification, comme les parasites qui peuvent se
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simplifier en perdant des fonction biologiques, effectues par leur hte leur place. Chacun est adapt son environnement propre. En conclusion, nous pouvons dire que vu sous cet angle, il n'existe pas d'organisme plus volu qu'un autre, car tout le monde a dispos du mme temps d'volution, l'homme, comme le poisson rouge, le brin d'herbe ou les bactries.

3.5 L'volution dans le temps


Nous avons pu voir quels taient les quatre moteurs de l'volution. Mais combien de temps cela prendtil, la spciation, la diffrentiation des espces? C'est variable, car plusieurs facteurs sont en cause, tels que le temps de gnration ou la nature des mutations, mais c'est en moyenne de l'ordre du million d'anne, sachant que c'est parfois bien plus rapide... ou plus lent. Chez les chiens, plusieurs milliers d'annes de slection n'ont pas permis de provoquer de spciation, quoique l'on puisse se poser la question de la possibilit de croisement entre un mastiff et un chihuahua... C'est parce que cette slection est un processus lent, qui ne touche que quelques caractres la fois. Pour prendre un exemple chez une autre espce, le chat, la photo cidessous vous montre l'volution morphologique du profil du visage chez le siamois, en vingt ans de slection.

Voici deux chats siamois pedigree, enregistrs vingt ans d'cart. L'volution du standard de la race est bien visible. L'individu de droite, plus rcent, montre un profil beaucoup plus long et plus droit, ses oreilles sont plus larges par rapport au crne, et plus hautes que celles de celui de gauche, qui est plus proche du siamois tel qu'il tait lorsqu'il ft import de Thalande par Auguste Pavie. En vingt ans, la race s'est considrablement
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modifie. Il est par consquent impossible d'observer de son vivant de grosses modifications volutives chez une espce. Par contre, on peut voir se mettre en place des dbuts de spciation (sous forme par exemple d'isolement reproducteur partiel) chez des espces qui ont des temps de gnration rapides. rsum! Nous avons donc vu que l'volution des espces est explicable grce quatre phnomnes : les mutations, qui crent de la diversit gntique la drive gntique, qui rduit alatoirement cette diversit la slection naturelle, qui rduit aussi la diversit, mais cette fois en fonction de l'environnement la migration : les flux de gnes entre populations permettent d'augmenter une diversit perdue par drive ou slection. Il n'y a pas besoin d'autre chose pour expliquer l'volution du vivant dans le sens o ces mcanismes conjugus sont capables d'entraner les phnomnes macrovolutifs comme la spciation ou les extinctions, pour peu qu'on leur laisse suffisamment de temps. Grce l'tude de ces mcanismes, on peut construire des arbres pour reprsenter les degrs d'apparentement entre espces. En connaissant le rythme des mutations, on peut mme avoir une ide de l'ge de l'anctre de deux espces.

3 L'arbre du vivant

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4 Les questions qui restent en suspens

Il reste un certain nombre de questions en suspens. La plupart sont des questions de dtail : quel tait l'aspect de l'anctre commun de telle et telle espce? Ce caractre estil ancestral ou driv? Quel rle a jou la slection dans l'volution de ce caractre? Quel sont les liens d'apparentement de ce groupe d'espces? etc. Cependant il reste encore quelques grandes questions de fond, qui sont largement dbattues. La question de savoir si l'volution est graduelle, progressive ou bien si les organismes voluent par de brusques changements (morphologiques, physiologiques...), a t longtemps un sujet de discussion, mais au final, on se rend compte que les deux sont possibles, et que cela dpend surtout de l'chelle laquelle on observe l'volution. En effet, sur de grandes chelles de temps, les changements morphologiques sont plus impressionnants. Le type de gnes touchs est galement important puisque des mutations de gnes de dveloppement produisent potentiellement des changements morphologiques brutaux. De la mme manire, les dbats sur les modalits de l'volution des protines font parfois encore rage. La duplication d'un gne estelle ncessaire pour permettre l'apparition d'une nouvelle fonction enzymatique? Une nouvelle enzyme peutelle tre la consquence de la modification progressive d'une ancienne? a dpend probablement des cas, chacun des diffrents partis exprime trs certainement une part de vrit, qu'il faudrait synthtiser. Une des vraies grandes questions encore sans rponse satisfaisante aujourd'hui est celle de l'volution de la reproduction sexue, surtout dans le cas o deux sexes ont volu (certaines espces en comptent davantage), l'un produisant de petits gamtes (mles) et l'autre de gros gamtes (femelles). Comment expliquer le cot de production des mles? Eh oui, si l'on imagine deux femelles d'une espce, l'une se reproduisant par clonage, et l'autre pratiquant la reproduction sexue, on peut voir que pour transmettre tous ses gnes, il faudra deux fois plus de descendants la deuxime qu' la premire, puisque celleci doit partager chaque
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descendant avec son partenaire. long terme, la reproduction sexue, grce au brassage gntique (voir annexe), permet l'apparition de nouvelles combinaisons trs rapidement. Pour que deux mutations favorables soient prsentes chez le mme individu, l'individu issu d'une population clonale doit attendre que la deuxime mutation se produise chez un de ses descendants possdant dj la premire. L'individu qui pratique la reproduction sexue n'a pas ce souci : deux individus portants des mutations diffrentes peuvent provoquer la naissance d'un descendant portant les deux, en une seule gnration. Les capacits d'adaptation devraient donc tre meilleures pour les descendants de tels individus, puisqu'ils auront davantage de variabilit gntique en moins de gnrations. En outre, la reproduction sexue permet aussi l'limination des allles dltres, toujours par brassage gntique d'une gnration l'autre, ce qui est impossible dans une population clonale. La reproduction sexue a donc un certain nombre d'avantages long terme. Pourtant, il existe des petits organismes, nomms rotifres bdellodes, qui pratiquent sembletil depuis des millions d'annes une reproduction clonale, dans des conditions environnementales similaires et sans avoir plus de soucis que leurs congnres rotifres sexus, preuve que mme long terme, la reproduction asexue a probablement aussi ses atouts... Mais court terme? Il semble n'y avoir, court terme, aucun avantage visible pratiquer la reproduction sexue. Pourtant celleci se maintient, sans disparatre, malgr l'apparition rgulire de populations clonales dans diverses espces (lzards, insectes, poissons...), ce qui pourrait provoquer sa disparition. Pourquoi et comment la reproduction sexue se maintientelle? reste donc une des questions clef de la biologie volutive, laquelle de nombreux chercheurs travaillent. Il reste donc encore des mystres lucider pour les volutionnistes d'aujourd'hui, c'est ce qui fait l'un des attraits de cette discipline passionnante.

4 Les questions qui restent en suspens

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5 L'volution, la religion et la philo

5.1 Dterminisme et libre arbitre


Les dcouvertes scientifiques ont, au cours des derniers sicles, boulevers notre conception du monde. La Terre, de centre de l'univers, est devenue une plante parmi d'autres. L'homme, de matre naturel de la Terre , est devenu un animal parmi d'autres. Il est maintenant impossible, si l'on admet les apports des sciences, de considrer le monde comme une cration notre intention, un grand jardin d'enfant. Nous sommes obligs de voir la ralit : le monde ne nous appartient pas plus qu'aux autres tres vivants. Pire : non seulement nous sommes des animaux parmi d'autres, mais en plus nous ne sommes que des avatars , des sacs destins la seule reproduction de nos gnes! Qu'en estil de notre responsabilit dans ce monde, du sens de notre vie? Eh bien, plus que jamais, c'est nous de le dcider. Nous autres, tre vivants, sommes dtermins par deux ensembles de facteurs. L'histoire de l'espce , ou les gnes, models par des millions d'annes d'volution, et notre histoire individuelle , c'est dire notre environnement. O se situe notre libert dans tout cela? Beaucoup de personnes sont rvulses l'ide que leurs comportements puissent avoir une origine gntique. Pourtant, il faut regarder les choses en face : nos comportements, nos penses, trouvent leur origine dans notre cerveau. Il suffit de constater l'impact de certaines maladies (ou substances!) sur notre raison pour en avoir la preuve. La structure du cerveau est dtermine, la base, par nos gnes. Mais... le cerveau est aussi trs plastique. Il est capable de se rparer, dans une certaine mesure... Et surtout, il est capable d'apprendre, c'est dire de s'adapter, de rpondre l'environnement, non pas d'une gnration l'autre, mais au cours d'une seule vie!

5 L'volution, la religion et la philo

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Oh ce n'est pas unique chez les animaux. Pratiquement tout le monde dans ce groupe est capable d'apprendre, mme les mouches ou les petits vers. Cette capacit d'apprentissage, d'o vientelle? De nos gnes. Ce sont eux qui codent pour la plasticit de notre cerveau, sa flexibilit, et qui nous donnent ainsi nos capacits d'innovation et d'adaptation. Vu sous cet angles, nos gnes codent pour un certain libre arbitre. Nous ne sommes donc pas uniquement tributaires de notre environnement... C'est plutt rassurant, non? Cependant... Attention, certains de nos comportements sont peuttre moins plastiques que d'autres... L'important serait alors de connatre les limites de notre plasticit, non seulement en tant qu'individus, mais aussi en tant qu'espce. Comment le savoir? En les tudiant, ce que font notamment les spcialistes d'cologie comportementale. Prendre conscience de ses limites, c'est le seul espoir de pouvoir, si besoin, les repousser.

5.2 Et notre responsabilit, alors?


Vous sentez vous moins responsables maintenant qu'avant d'avoir lu ce texte? Aimez vous moins vos proches et vos enfants? J'espre bien que non! Savoir que la sensation sucre du gteau dans ma bouche n'est qu'un interprtation de mon cerveau n'a jamais diminu mon plaisir de savourer un dessert... Notre responsabilit... Eh bien, elle n'a pas chang, c'est toujours nous d'en dcider! 5.2.3 Et la morale? Ah la morale... Tout le monde en a une, mais c'est rarement la mme que celle du voisin. Cette faon que nous avons, nous les humains, de vouloir tout prix former des groupes unis par une mme morale a sans doute mme une certaine origine gntique. Il est possible mme que cette morale soit un des piliers de notre capacit former des groupes qui ne soient pas uniquement familiaux... Et si l'on considre que les individus appartenant aux groupes sociaux les mieux unis sont les plus aptes survivre quand les conditions deviennent difficiles (famines, par exemple, car l'entraide peut favoriser la survie)... on peut comprendre comment la capacit laborer
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une morale pourrait avoir t slectionne. Disons que nous avons tendance laborer une morale... Mais que son contenu demeure libre, du moment qu'elle permet aux individus de former des groupes sociaux. De la mme manire, nous avons des capacits d'apprentissage, mais ce que nous apprenons dpend de notre culture et de notre histoire personnelle. 5.2.4 Et la religion? Personne ne pourra jamais dmontrer l'existence ou l'absence de Dieu. D'ailleurs, la science n'a pas pour objet de s'occuper de cette question. Par contre, il n'y a pas eu besoin d'attendre Darwin pour comprendre qu'interprter la Bible ou n'importe quelle histoire du Monde religieuse au pied de la lettre n'tait peuttre pas trs pertinent si l'on voulait comprendre le monde tel qu'il est... Ce qui ne retire rien la porte philosophique de ces textes, bien entendu. Cela n'empche aucunement bon nombre de spcialistes de la biologie volutive d'tre croyants. Ils ne mlangent simplement pas leur science avec leurs croyances. Mais l'tude de l'volution apporte bien d'autres choses, dans le domaine des religions. Elle permet d'tudier les comportements religieux d'un il nouveau... Et si la tendance naturelle des humains former des groupes religieux, unis par des rituels plus ou moins coteux pour les individus, mais les rendant solidaires dans l'adversit (cette solidarit pouvant justement tre mise l'preuve par le cot des rituels), avait une base gntique?

5.3 Nous sommes fabriqus par nos gnes pour les reproduire? Merci bien!
Nous pouvons fermer les yeux, et faire comme si nous n'avions rien vu, et continuer nous considrer de purs esprits dans une prison de chair. Nous pouvons aussi apprendre nous connatre, nous comprendre, et nous accepter. Cet angle de vue ne rend pas nos posies moins belles, nos jeux de mots moins drles, ni nos fuses moins puissantes. Par contre, il peut nous aider bien des gards.
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Si nos gnes contribuent la dtermination de certains de nos comportements, models par des millions d'annes d'volution, nous pouvons en prendre conscience pour, enfin, essayer d'agir en connaissance de cause, et non plus simplement subir nos propres petits travers, nos colres instinctives et nos mfiances irraisonnes. Nous pouvons analyser nos comportements, et ceux de nos contemporains, avec un il nouveau. Nous pouvons aussi les relativiser, et peuttre, en intgrant les apports cumuls de l'volution, la psychologie et la neurobiologie, enfin les comprendre, afin de nous approcher de l'adage de Socrate : Connaistoi toimme .

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L'volution, dirige par la slection, a produit toute la diversit de la vie, y compris notre propre espce. Ainsi, sachant comment l'volution fonctionne, nous pouvons expliquer la beaut d'une fleur comme un outil pour attirer les pollinisateurs, ou les taches jaunes d'une salamandre comme des avertissements l'intention des prdateurs qui pourraient tre tents de manger cet animal toxique. Le fait que la puanteur d'une carcasse en dcomposition nous donne la nause (car elle peut tre une source de dangereuses toxines), mais est un parfum suave pour une mouche viande, dont les larves se nourrissent de chair dcompose. Le travail dsintress d'une abeille ouvrire strile pour la colonie comme un moyen d'aider ses frres et soeurs reproducteurs, et le fait que les jeunes reines abeilles nes dans la mme ruche se battent sans merci jusqu' ce qu'une seule reste en vie pour hriter du trne. Le fait que des mles araignes s'offrent euxmme comme nourriture aux femelles en change d'un accouplement, tandis que les femelles de certaines mouches et coloptres permettent leur progniture de les dvorer vivantes. Et, ce qui est particulirement important pour le boulanger, le brasseur de bire et le viticulteur, le fait que la levure a volu de faon pratiquer la fermentation du sucre, et produire de l'alcool, comme un moyen d'empoisonner et lutter contre les microbes. Les explications dtailles de tous ces phnomnes sont drives de la thorie de l'volution et vrifies par des donnes exprimentales. Mais estce que la curiosit intellectuelle est la seule raison pour laquelle une boulangre devrait s'intresser l'volution? L'volution n'est pas simplement quelque chose qui s'est produit dans le pass et a pris des millions d'annes. Au contraire, l'volution se produit ici et maintenant. De patientes tudes aux Galapagos montrent que la slection naturelle favorise les pinsons de Darwin bec large les annes sches, et ceux bec troit les annes humides, ce qui cause la fluctuation de la taille moyenne du bec des oiseaux d'anne en anne, en synchronie avec les variations du climat (El Nio). Les guppies (petits
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poissons vivant Trynidad, populaires chez les aquariophiles), dplacs des endroits dpourvus de prdateurs, deviennent en quelques gnrations plus colors et moins prudents; ces deux changements sont dtermins gntiquement et sont donc soumis l'volution. Des portions de sdiments au fond des lacs prservent des oeufs vivants de puces d'eau et les spores de leurs parasites pendant des douzaines d'annes. L'tude de ces capsules temporelles dmontrent la course aux armements volutive entre les parasites et leurs htes : les htes voluent de faon rsister un parasite, tandis que le parasite volue de faon passer outre cette rsistance, puis l'hte invente une nouvelle dfense, et ainsi de suite. Tous ces changements se droulent sur une chelle de temps de quelques dizaines d'annes, et peuvent donc tre observs durant une vie humaine. De nombreux cas de changements volutifs se droulant de nos jours sont provoqus par des changements d'origine humaine dans l'environnement, et ont d'importantes consquences sur notre bientre. Parmi les organismes voluant le plus rapidement, on trouve le virus de la grippe au niveau de quelques gnes responsables de la virulence, 1 de toutes les bases change tous les 5 ans. Ceci explique pourquoi avoir la grippe (ou avoir t vaccin) l'anne dernire ne vous protge gnralement pas contre le virus de cette anne ce n'est plus exactement le mme virus. Ces nouvelles formes de virus voluent dans les fermes volailles et cochons des pays en voie de dveloppement, o un grand nombre de ces animaux sont maintenus en forte densit, ce qui cre des conditions environnementales parfaites pour qu'un virus circule et volue. Un autre point chaud de l'volution des pathogne humains sont les hpitaux. Aux tats Unis uniquement, environ 90 000 personnes meurent chaque anne d'une infection bactrienne contracte alors qu'elles se trouvaient l'hpital pour une autre raison. C'est un chiffre plus lev que celui du nombre de personnes dcdant du SIDA (17000) ou du cancer du sein (40000). cause d'une frquente exposition aux antibiotiques, beaucoup de bactries circulant en hpital sont devenues rsistantes plusieurs antibiotiques, et sont souvent plus virulentes que les populations des mmes espces vivant en dehors des hpitaux. ll est prvu que les souches des bactries communes rsistantes de multiples antibiotiques (les multirsistantes ) seront un problme mdical srieux dans le futur.
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Depuis la dcouverte de la pnicilline, chaque fois qu'un nouvel antibiotique est dcouvert, des bactries rsistantes apparaissent en quelques annes, parfois en deux ans. Jusqu' prsent, nous nous sommes dbrouills pour rester en tte de cette course aux armements en inventant de nouveaux antibiotiques, mais l'cart se resserre. La menace des pathognes rsistants aux antibiotiques est exacerbe par l'usage de certains antibiotiques comme stimulateurs de croissance en agriculture, une pratique maintenant illgale en Europe, mais courante dans de nombreux autres pays. L'volution frustre galement nos attentes dans le contrle des ravageurs. L'application massive de pesticides en agriculture aboutit une forte slection de la rsistance chez les espces ravageuses, et nombre d'entre elles ont effectivement volu vers une rsistance aux pesticides communs. Les pesticides nuisent souvent d'autres espces que les espcescibles, et reprsentent ainsi une menace contre la biodiversit. Paradoxalement, il est souvent plus difficile pour les autres espces de dvelopper une rsistance car la taille de leurs populations tend tre moins importante (et ainsi la chance de voir apparatre une mutation provoquant une rsistance est moindre), et leur temps de gnration est souvent plus long. Ainsi, les dommages collatraux causs par les pesticides sont susceptibles de se prolonger plus longtemps que leur efficacit contre les espcescibles. Par exemple, le DDT a t introduit pour contrler les moustiques et les insectes ravageurs agricoles la fin des annes 40, et pendant dix ans, de nombreuses espces de moustiques et d'insectes nfastes aux cultures sont devenues fortement rsistantes. Parmi les nombreux effets secondaires de cet insecticide, le DDT a empoisonn les oiseaux de proie, causant la production d'oeufs la coquille trop fragile, ce qui conduisit une diminution de la reproduction et une drastique chute d'effectifs. la diffrence des moustiques, les oiseaux de proie n'ont jamais montr aucun signe de rsistance au DDT, et ont continu souffrir de l'insecticide longtemps aprs son interdiction en usage en plein air par la plupart des pays dans les annes 70. L'volution peut galement frustrer nos attentes au niveau de la lutte biologique Quand le virus de la myxomatose fut introduit pour contrler les lapins en Australie en 1950, il a commenc par tuer pratiquement tous
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les lapins infects en quelques jours, ce qui a caus la chute de l'effectif de lapins de 600 millions seulement 100 millions. Mais en consquence l'efficacit de ce contrle dclina et la population de lapins se reconstitua ( environ 300 millions en 1991). Ceci est d en partie la rsistance dveloppe par les lapins contre le virus, mais des tudes attentives ont montr que le virus a chang galement, il a volu vers moins de virulence. Le virus initial tuait ses htes rapidement, souvent avant qu'ils aient la chance de transmettre le virus au lapin suivant. Ainsi, la slection naturelle sur le virus favorisatelle les formes les moins virulentes, qui permettent au lapin de survivre plus longtemps, et au virus de se transmettre davantage de lapins. Mais les connaissances des mcanismes volutifs peuvent aussi tre utilises pour mettre au point de nouvelles stratgies pour le contrle des ravageurs ou des maladies. Des essais sont en cours pour introduire dans les populations de moustiques un gne qui les rend moins aptes transmettre la malaria. Pour tre srs que ce gne se diffuse dans toute la population de moustiques, les chercheurs projettent de tirer parti d'un phnomne nomm incompatibilit cytoplasmique (dont la description dpasse l'objectif de ce livre). L'exploitation des espces sauvages par l'homme joue aussi sur la slection naturelle, dont les implications pratiques sont particulirement visibles au niveau de la pche. Beaucoup d'espces de poissons exploites commercialement voluent de faon avoir une vitesse de dveloppement plus lente les petits poissons ont davantage de chances de s'chapper des filets. Mais les petits poissons ne sont pas seulement moins intressants d'un point de vue commercial, ils sont aussi moins fertiles, donc ce changement volutif contribue la chute des effectifs des populations. Finalement, les capacits des espces s'adapter aux changements environnementaux affectent la faon dont les plantes et les animaux rpondent aux modifications environnementales causes par l'espce humaine. Le corail peutil s'adapter une hausse des tempratures? Les herbivores locaux vontils voluer de faon pouvoir consommer, et ainsi contrler, les plantes invasives introduites? Comment peuton maximiser la capacit des espces menaces, rduites de petites populations dans des zoos ou des rserves, dvelopper des dfenses contre la courses aux armements avec leurs parasites?
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Ainsi, l'volution a de nombreuses et importantes consquences sur nos vies. Comprendre comment l'volution fonctionne peut aider imaginer des politiques qui la prennent en compte, comme la prudence dans l'usage des antibiotiques, des programmes de vaccination qui slectionnent pour une virulence rduite des pathognes, des schmas de gestion intgre qui rduisent les chances d'volution vers la rsistance aux pesticides, des politiques de gestion de la pche des espces sauvages qui maintiennent la diversit gntique et minimisent les changement volutifs non souhaits. Le bannissement de l'usage systmatique des antibiotiques dans la nourriture animale en agriculture en Europe est un exemple d'une telle politique. Toutes ces politiques sont associes des cots, dont certains sont mesurables en terme d'argent, alors que d'autres ncessitent des changements dans notre style de vie et nos habitudes. Bien que ces politiques soient imagines par des scientifiques, le fait que leurs conseils soient suivis dpend des politiciens et autres dcisionnaires. Cependant, dans les dmocraties ces dcisionnaires sont lus par, et rpondent aux votants, vous inclus. Et mme pour les gouvernements hautement clairs, il va tre difficile d'introduire ces mesures coteuses, si elles ne sont pas comprises, et donc pas soutenues, par la population. C'est pourquoi la socit toute entire peut profiter de ces connaissances si ses membres, qu'ils soient boulangers ou professeurs, politiciens ou conducteurs de bus, ont une certaine comprhension et apprciation de l'volution, et de la science en gnral. Tadeusz Kawecki, professeur l'Universit de Lausanne.

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Concepts basiques :
Les gnes Les tres vivants sont constitus de cellules. Ils peuvent en compter plusieurs, voire plusieurs dizaines, centaines, milliers, ou milliards comme nous autres les animaux ou une seule, comme les levures, ou les bactries. Chaque cellule vivante est diffrente des autres, et a des particularits mtaboliques ou physiologiques. Comment une cellule sait elle comment elle doit tre, et comment elle doit se comporter? Pourquoi une bactrie ne peutelle pas se transformer subitement en autre chose? Dans chaque cellule, il y a son mode d'emploi , ou son plan . C'est de l'information que chaque cellule porte en elle et qui dtermine son aspect, son fonctionnement, ses ractions son environnement. Cette information est porte par de longues molcules d'ADN. Une molcule d'ADN forme ce que l'on appelle un chromosome. Chez les espces du groupe des eucaryotes (animaux, vgtaux, et champignons entre autres), les chromosomes sont enferms dans un compartiment spcial de la cellule, que l'on nomme noyau . Chez les bactries et les arches* (nous reviendrons plus tard sur les arches), les chromosomes ne sont pas spars du reste. L'information porte par la molcule d'ADN est code dans un alphabet lettres, les bases azotes : thymine, guanine, adnine et cytosine. La suite de ces bases forme une sorte de phrase que l'on nomme squence . Les gnes sont des informations portes par des fragments d'ADN. Ils sont le plan de fabrication de protines. On dit qu'ils codent pour des protines. La cellule les fabrique en lisant l'ADN. Chaque chromosome peut contenir des centaines de gnes. On peut donc dire que l'information gntique est lue par le systme physique que constitue la cellule, l'individu.
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Cette information est porte par de longues molcules d'ADN. Une molcule d'ADN forme ce que l'on appelle un chromosome. Chez les espces du groupe des eucaryotes (animaux, vgtaux, et champignons entre autres), les chromosomes sont enferms dans un compartiment spcial de la cellule, que l'on nomme noyau . Chez les bactries et les arches* (nous reviendrons plus tard sur les arches), les chromosomes ne sont pas spars du reste. L'information porte par la molcule d'ADN est code dans un alphabet lettres, les bases azotes : thymine, guanine, adnine et cytosine. La suite de ces bases forme une sorte de phrase que l'on nomme squence . Les gnes sont des informations portes par des fragments d'ADN. Ils sont le plan de fabrication de protines. On dit qu'ils codent pour des protines. La cellule les fabrique en lisant l'ADN. Chaque chromosome peut contenir des centaines de gnes. On peut donc dire que l'information gntique est lue par le systme physique que constitue la cellule, l'individu. L'information contenue dans le systme de lecture luimme est appele information pigntique (voir encadr suivant).

L'ADN Et entre les gnes? Il y a des squences de rgulation des gnes, mais aussi des squences qui ne semblent pas avoir d'utilit particulire, comme des reliques de virus, des squences rptes etc. Les tests de paternit sont
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bass sur l'analyse de telles squences rptes que l'on nomme microsatellites , trs variables d'un individu l'autre. Dans les organismes pluricellulaires, chaque cellule porte exactement la mme information gntique ( quelques mutations prs, ventuellement, ce qui la plupart du temps n'a pas de grande consquence, sauf dans des cas particuliers, par exemple quand elles touchent des gnes susceptibles de causer des cancers). Pourquoi, ds lors, toutes nos cellules ne sontelles pas rigoureusement identiques les unes aux autres? Si nous avons des cellules sanguines, des neurones, des cellules musculaires etc., c'est parce que l'expression de l'information gntique peut tre rgule par des facteurs extrieurs. C'est une part de ce que l'on appelle la plasticit phnotypique , la capacit d'un gnome produire un phnotype (ensemble des traits observables de la cellule, l'organisme) diffrent en fonction de l'environnement. La celluleuf initiale, qui rsulte de la fusion de l'ovule et du spermatozode, contient en elle toutes les informations pour faire toutes les cellules du corps humain. partir de cellules embryonnaires totipotentes , c'est dire ayant toutes les possibilits , tous les types de cellules pourront se diffrencier, en fonction des signaux reus des autres cellules, de l'environnement, qui vont moduler l'expression des gnes. La science qui tudie ces mcanismes de diffrentiation des cellules se nomme biologie du dveloppement. Peuton prvoir les rsultats d'un croisement? Tout fait, condition bien sr que le caractre que l'on tudie soit gntiquement transmissible, et que ce dterminisme soit connu. C'est d'ailleurs une des bases de la gntique, initie par le moine Mendel. Chaque parent transmet, via ses gamtes (ovule ou spermatozode chez les animaux), un de ses allles son descendant. Chaque allle a donc une chance sur deux d'tre transmis. Si l'on sait quels allles possdent les parents, on peut prvoir ceux des descendants, en terme de probabilits. Inversement, voir les allles d'une descendance permet de dduire le gnotype des parents (quels allles ils possdent).
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Reprenons un exemple : celui de deux couleurs d'yeux, bleu et marron. Ces couleurs sont dues la mlanine, pigment marron fonc, qui, dans un cas, sera prsente dans les couches profondes de l'iris seulement (il bleu), et dans l'autre, aussi en surface (il marron).

Chez un individu aux yeux bleus, la mlanine n'est pas produite/amene dans les couches superficielles de l'iris, car une des enzymes, de synthse ou de transport du pigment, ne fonctionne pas, ou est absente. Cependant, gnralement, si un individu possde un allle efficace de cette enzyme, et aussi un allle dfectueux (htrozygote, donc), il pourra quand mme avoir des yeux marrons, puisque un allle suffit fabriquer l'enzyme. Par exemple, l'albinisme tant un dfaut de fabrication d'une enzyme servant synthtiser la mlanine, si une personne est htrozygote, on la qualifiera de porteuse , car elle aura de la mlanine mais ses enfants pourront tre albinos si l'autre parent est htrozygote pour le mme gne galement.
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Exemple simple d'un parent aux yeux bleus, et de l'autre aux yeux marrons, htrozygote (portant un allle pour le bleu, et l'autre pour le marron).

L'exemple de la figure prcdente reprsente un cas classique. Pour tre srs que le principe soit bien compris, prenons maintenant l'exemple d'un autre couple. Imaginons deux parents aux yeux marrons, htrozygotes (un allle fonctionnel, et pas l'autre). Ils auront chacun une chance sur deux de transmettre leurs enfants chacun de leurs allles (voir fig suivante). Ils auront donc une chance sur quatre d'avoir un enfant homozygote aux yeux marrons, deux chances sur quatre d'avoir un enfant htrozygote aux yeux marrons, et une chance sur quatre que l'enfant soit homozygote aux yeux bleus. Vous suivez toujours? Tableau de croisement : la couleur des yeux, version trs simple avec un gne deux allles, parents htroygotes. Les deux exemples prcdents sont simples, mais la ralit est plus complique, car ce n'est pas un seul gne, mais plusieurs qui sont impliqus dans la couleur des yeux. Pour nous donner une ide des mcanismes, intressonsnous la synthse du pigment. La mlanine est fabrique en plusieurs tapes. De manire gnrale, une chane de synthse se droule comme suit : une premire molcule est synthtise (ou absorbe par la nourriture), puis intervient dessus une autre molcule nomme enzyme, qui transformera par raction chimique notre premire molcule en une deuxime, que l'on l'appellera, aprs raction, produit . Les enzymes, souvent des protines, sont spcialises dans l'acclration des ractions chimiques, on les appelle des catalyseurs . Plusieurs autres enzymes interviennent ensuite successivement sur le produit ainsi form, le transformant, dans notre cas, en mlanine, produit final.

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La synthse de la mlanine. Les enzymes sont codes chacune par un gne prcis. Mais la mlanine n'est pas forcment produite directement l o elle est expose : elle peut aussi avoir besoin de migrer, ce qui est permis par d'autres molcules, sur lesquelles interviennent d'autres enzymes. a devient compliqu, parce que des tas d'enzymes diffrentes fonctionnent ensemble, donc il y a autant de chances que la chane soit interrompue quelque part! C'est ce type de mcanisme qui explique qu'il arrive aussi que des parents aux yeux bleus aient des enfants aux yeux marron. Avant de conclure un change de bb la maternit, ou une intervention du facteur, il convient de bien comprendre l'histoire de la mlanine. Si le pre ne peut pas fabriquer la premire enzyme, et que la mre ne peut pas fabriquer la troisime, l'enfant sera htrozygote pour chacun des gnes codant pour ces enzymes... et donc, il pourra, lui, les produire! Et ses yeux seront... marrons. Cela se nomme la complmentation .

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Tableau de croisement : la couleur des yeux, version avec deux gnes deux allles, parents homozygotes (donc un seul type de gamte pour chaque parent). Pour simplifier le dessin, nous avons plac les deux gnes sur le mme chromosome, mais ils pourraient aussi tre placs sur des chromosomes diffrents. La gntique de la couleur des yeux est donc trs complique. Rcapitulons. D'abord, il n'y a pas que deux couleurs, mais des dizaines : bleu, gris, vert (et le vert peut tre d un autre pigment que la mlanine, nomm lipofuscine), noir, brun,noisette, avec toutes les nuances possibles. Ensuite, on connat quelques gnes qui sont coup sr impliqus dans certaines de ces couleurs, mais ils n'expliquent qu'une faible part de la variabilit l'intrieur de la population humaine. l'heure actuelle, si les mcanismes gnraux sont connus, il manque encore bien des dtails. En outre, la synthse des pigments n'est pas seule en cause : ils peuvent tre synthtiss, mais pas dposs dans les diffrentes structures de l'iris, ce qui influe encore sur la couleur. Et la densit de cellules entre les couches profondes et superficielles de l'iris peut galement influer cette couleur. Enfin, si l'on prend en compte que plusieurs mcanismes (dominance, codominance, complmentation) peuvent jouer au niveau des liens entre les allles et les gnes, on comprend qu'il n'est pas rare de se retrouver dans un cas qui ne colle pas avec les exemples habituels (naissance d'enfants avec une couleur des yeux inattendue). Moralit : oui, on peut souvent prvoir les rsultats des croisements, mais il faut prendre toutes les prcautions et bien penser aux diffrents mcanismes impliqus. On aura donc un rsultat sous forme de
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probabilits : x de chances d'obtenir tel phnotype. Les leveurs et les gnticiens ont l'habitude de jongler avec de telles probabilits. Cependant, le travail est parfois trs ardu. Le hasard : un exemple pour mieux comprendre. Examinons avec un exemple concret ce que signifie tirage au hasard . Je vous donne une pice, vous la lancez en l'air. Si c'est face, vous la gardez, si c'est pile, vous me la rendez. On recommence 1000 fois. Au bout du compte, vous aurez gagn un certain nombre de pices, aux alentours de 500 si elles ne sont pas truques. Le fait que vous gagniez ou perdiez n'influe pas le fait que la pice tombe sur pile ou face : ce n'est pas parce que vous gagnez face que les pices vont se mettre miraculeusement tomber toutes sur face, ou toutes sur pile (pour vous embter). Il y a indpendance entre la face sur laquelle tombe la pice, et la face que vous devez obtenir pour gagner. Il y a des causes la chute de la pice : le mouvement que vous lui donnez, la force avec laquelle vous la lancez etc. Si on connaissait prcisment tous les paramtres physiques qui grent la pice, on pourrait prdire sur quelle face elle va tomber, mais c'est indpendant du fait que vous gagniez face. Gagner face n'influe pas le comportement de la pice. Donc, au final, estce que les pices que vous avez dans votre main la fin du jeu sont l par hasard? Non. Le hasard a jou un rle, mais la rgle du jeu stipulant que vous aviez le droit de gagner les pices tombant sur face a aussi jou. Si cette rgle avait t diffrente, vous auriez eu, pour les mmes tirages, un nombre de pices diffrent dans la main (on aurait pu dire que vous gagniez pile, ou alors que vous ne gagniez que dans le cas de deux piles conscutifs etc...) De la mme manire, en refaisant un essai de 1000 tirages, vous n'aurez probablement pas le mme nombre de pices au final, mme avec des rgles identiques. En ce qui concerne l'volution, le hasard joue un rle au niveau de la drive gntique, car il y a toujours des allles qui sont limins par hasard au cours du passage d'une gnration l'autre (vous ne passez que certains de vos caractres vos enfants, les autres sont perdus). Il joue galement au niveau des mutations, car il y a indpendance entre la nature de la mutation et son effet. Ce n'est pas parce qu'une mutation serait favorable
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qu'elle va apparatre (nous verrons ceci dans le chapitre suivant). D'un autre ct, la slection naturelle limine les mutations entranant de caractres dfavorables la reproduction de l'individu. C'est la rgle du jeu non hasardeuse. Le brassage gntique le sexe Nous avons vu que dans le cadre de la reproduction sexue, chaque parent transmet la moiti de son information gntique sa descendance, la moiti de ses chromosomes. Une partie du brassage s'effectue ce niveau l : ce ne sont pas toujours les mmes chromosomes qui se retrouvent dans tous les gamtes. Il y a autant de combinaisons que le permet le nombre de chromosomes (par exemple, si une espce a 6 chromosomes, il y a 8 gamtes possibles pour chaque individu). Une autre partie du brassage s'effectue par recombinaison, grce aux crossing overs . Ce mcanisme permet l'change de deux bouts de chromosomes au moment de la division miotique (celle qui rduit le stock de chromosomes par deux pour fabriquer les gamtes). Deux chromosomes se croisent physiquement dans la cellule et changent un bras, ou une partie de bras. Grce ces deux mcanismes, pratiquement chaque gamte produit par un individu est unique. C'est pour cela que deux parents ne peuvent pas avoir deux enfants identiques moins d'avoir des jumeaux monozygotes (une celluleuf se divise en deux cellules qui au lieu de rester ensembles, se sparent et donnent chacune un embryon, au bagage gntique strictement identique). Le brassage gntique, c'est donc la consquence principale du sexe. Il peut tre intressant, au passage, de noter que certaines espces sont divises en plus de deux sexes (un sexe tant un type d'individus n'ayant pas, biologiquement, la possibilit d'obtenir de descendance avec un autre individu du mme type et de la mme espce). En outre, d'autres espces sont divises en deux sexes, mais pas de mle ni de femelle. On ne parle de mle et femelle que quand les gamtes sont de taille diffrente (le petit est le mle, le gros la femelle). Si les deux gamtes sont de mme taille, comme chez certaines levures, on nomme les sexes diffremment (plus et
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moins, par exemple). Chez les bactries, le brassage gntique ne s'effectue pas au moment de la reproduction (division cellulaire), mais d'autres priodes. Les bactries changent entre elles du matriel gntique par divers mcanismes, dont la conjugaison (simple transmission entre individus). Comme quoi, on peut tre un organisme asexu, et pratiquer le sexe quand mme...

Pour aller plus loin


Les effets pigntiques et les effets maternels Il serait trop simple que l'information hritable d'une gnration l'autre ne soit porte que par la molcule d'ADN, l'exception de tout autre moyen. On sait maintenant que des molcules produites au cours de la vie de la cellule peuvent influencer l'expression des gnes des cellulesfilles. De l'information est porte dans le systme de lecture de l'ADN que constitue la cellule. C'est ce qui explique notamment pourquoi d'une celluleuf, on peut arriver obtenir tout un tas de cellules, qui, bien que portant la mme information gntique, sont toutes diffrentes (cellule musculaire, cellule nerveuse, etc...). Cela explique galement comment ces cellules peuvent se diviser et donner des cellulesfilles conservant leur spcialisation. Ainsi, mme si un gne est prsent et fonctionnel dans une cellule, son expression peut tre module par des molcules acquises au cours de la vie de l'individu. Certains gnes sont activs, d'autres inhibs, etc. Bien entendu, ces phnomnes pigntiques sont rversibles (au moins en thorie, mme si dans la pratique les cellules diffrencies ne reviennent parfois plus en arrire, au moins chez les animaux), puisqu'ils ne touchent pas au gnome en luimme. Examinons une des possibilits : imaginez que certaines de ces molcules soient prsentes dans l'ovule, et qu'elles puissent changer en fonction du mode de vie de la femelle qui a produit cet ovule... C'est alors l'histoire de vie de la mre qui pourra influer l'expression des gnes de son descendant. Ce sont les effets maternels. Certains croisements peuvent donc avoir des rsultats inattendus, cause de ce type de mcanisme.
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Attention toutefois, n'oublions pas que ces phnomnes sont rversibles... c'est dire que ce ne sont pas les gnes en euxmmes qui sont modifis, et que d'une gnration l'autre la situation peut potentiellement s'inverser, ventuellement en une seule gnration. Par consquent, ces phnomnes ne sont pas rapprocher de l'ide de l'hrdit des caractres acquis, notamment avance par Lamarck en son temps. Cette ide suggre que les modifications morphologiques acquises par l'individu pendant sa vie, telle par exemple une forte musculature suite un entranement prolong, se transmettraient sa descendance. Cette ide reste fausse. Une personne fortement muscle pour cause d'une pratique d'activit physique intense n'a pas plus de chances que les autres d'avoir des enfants muscls si ceuxci ne font pas particulirement de sport. La slection sexuelle La slection sexuelle est un des aspects de la slection naturelle. Avezvous remarqu que chez beaucoup d'espces, notamment les oiseaux, les mles sont trs diffrents des femelles? Ils ont des couleurs vives, ou des ornements divers. Des plumes colores, des chants, des parades. Ils prsentent tout un tas de caractristiques qui semblent en parfaite contradiction avec ce qui serait convenable pour passer inaperu des prdateurs. Chez certaines espces, ce sont les femelles qui portent ces jolis attributs voyants, chez d'autres, ce sont les deux sexes, mais de manire gnrale, le sexe qui exerce le choix le plus marqu, et donc qui est le moins color/voyant/bruyant est celui qui investit le plus d'nergie dans la production de chaque petit (par exemple, il va passer du temps les nourrir et en prendre soin). Quand on investit beaucoup d'nergie dans un seul petit, on a tendance choisir plus slectivement son partenaire que quand on investit dans un grand nombre de petits, mais peu d'nergie chaque fois. Et oui, les deux parents n'ont pas forcment le mme niveau d'investissement. Mais mme s'il l'est globalement, chacun aura quand mme intrt ce que son conjoint remplisse correctement sa part (de nourrissage des jeunes par exemple), et mme plus que correctement. Du coup, les intrts des deux sexes entrent facilement en conflit, voire
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divergent carrment, entranant des covolutions, des courses entre stratgie et contrestratgie. De ce point de vue, chaque sexe peut ainsi tre considr comme une ressource pour l'autre, en fonction de son investissement parental, de ses allles, de la disponibilit globale des partenaires. Comme ils sont plus gros, car pleins de ressources nergtiques pour le futur embryon, les ovules produits par les femelles sont moins nombreux que les spermatozodes, bien que des diffrences de sexratio (rapport entre le nombre de mles et nombre de femelles dans une population) peuvent modifier la donne en rendant les mles rares. Chacun a donc intrt choisir la meilleure ressource , ou tre choisi par elle. Mais choisir un bon partenaire est comme chacun sait un art difficile. Pourquoi le plus sduisant estil souvent le plus bizarre, ou le plus voyant? Tous ces critres, de couleur, de chant, de parade, ne sontils pas apparemment en contradiction totale avec la slection naturelle? Ces plumes, cornes, bois, sont coteux produire, ils demandent de l'nergie, nergie qui pourrait tre dpense autre chose (le systme immunitaire par exemple). Ils sont coteux maintenir aussi, parce qu'ils sont voyants et peuvent servir de point de repre aux prdateurs, comme une grosse pancarte Viande frache ici! . Parfois, ces ornements servent la comptition intrasexe, par exemple les combats entre mles. Pourtant, ils peuvent aussi ne s'adresser qu'aux partenaires potentiels, pour les sduire, ou constituer la fois un avertissement aux concurrents et un signal de sduction, comme le chant des oiseaux par exemple. Il y a deux grandes hypothses pour expliquer l'volution de tels caractres de sduction : l' emballement de Fisher, et le principe du handicap de Zahavi. Admettons que ce soit la femelle qui choisisse, ce qui est le plus souvent le cas. D'aprs Fisher, si une femelle prfre un mle qui prsente un certain caractre, ses fils le possderont galement, si le caractre est hritable. Et si la prfrence des femelles est aussi hritable, alors les filles prfreront les mmes types de mles que leurs mres, slectionnant au fur et mesure des gnrations les mles aux attributs les plus importants. Le phnomne s'entretient de luimme, s'emballant jusqu' ce que le cot de production
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du caractre devienne trop lourd. Selon le principe du handicap, c'est justement parce qu'ils sont coteux ds le dbut de processus (contrairement l'ide de Fisher), que les caractres de slection sexuelle sont maintenus. Ils servent de point de repre au sexe oppos, qui peut ainsi choisir le partenaire de meilleure qualit. cause de ce cot, la tricherie n'est pas facile. Si un individu prsente un caractre si coteux produire, et qu'il est malgr tout l, parader, c'est qu'il doit vraiment tre exceptionnel, non? Or, comment choisir son partenaire, d'un point de vue volutif? Comment choisir celui qui donnera la descendance la plus nombreuse et la plus vigoureuse? Selon la thorie des bons gnes (comprendre les bons allles ), il faut tre capable de trouver le partenaire qui a les gnes les plus favorables en fonction de l'environnement dans lequel on se trouve. Le handicap permet donc de tester le partenaire, et de trouver celui qui a de bons gnes . Ainsi, vos petits seront de meilleure qualit, survivront mieux, et vos propres gnes seront le mieux dissmins, et donc slectionns. Par consquent, on peut dire que les femelles sont slectionnes pour choisir les meilleurs mles , et vice versa. Bien sr, la triche est possible. Ainsi, un individu moyen pourrait investir toute son nergie dans la production de signaux voyants, pour tre choisi, avoir une descendance nombreuse, avant de mourir puis. Ceci a t mis en vidence chez ces petits poissons que sont les pinoches. Le partenaire croit choisir le meilleur, mais en fait il ne choisit qu'un moyen ... Il y a encore d'autres possibilits de slection : certains allles ncessitent, pour tre les plus favorables, les meilleurs, la prsence d'allles complmentaires . C'est le cas de certains gnes du systme immunitaire. Les individus ne cherchent donc pas de bons allles , mais des allles complmentaires de ceux que j'ai . Dans tous les cas, disposer de signaux fiables permet d'identifier srement les partenaires potentiels porteurs de ces allles. C'est le rle des signaux soumis la slection sexuelle : odeurs, couleurs, chants, dcorations diverses.

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Taux de fixation, taux de mutation, autre explication Imaginez une population au nombre fixe de deux individus, se reproduisant par clonage. chaque gnration, il y aura deux nouveaux individus, qui remplaceront les anciens. Voyons ce qui se passe un point prcis de leur gnome, qui est par exemple occup par une base A , pour adnine . chaque gnration, cette base a une certaine probabilit d'tre mute, c'est dire d'tre remplace par un T, un C ou un G. Appelons ce taux de mutation m. Dans la population, on aura donc 2*m chances d'observer une mutation. En outre, chaque mutation a une chance sur deux d'tre fixe par la suite (puisqu'il n'y a que deux individus en tout). Si la population tait constitue de N individus au lieu de 2, nous aurions N*m chances d'observer une mutation, et cette mutation aurait 1/N chances d'tre fixe. Le taux de fixation tant gal la probabilit d'observer une mutation multipli par le taux de fixation, cela nous donne : Taux de fixation = N*m*1/N = m = Taux de mutation L'information porte par les gnes... subtilit Voyons comment se transmet l'information porte par les gnes... Chez les bactries, l'ADN n'est pas enferm dans un noyau, et les chromosomes sont circulaires. Elles possdent en plus des fragments plus petits d'ADN, nomms plasmides, qu'elles peuvent changer. Ceci est une manire de pratiquer le sexe, c'est dire l'change d'information gntique, sans se reproduire!

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Chez les eucaryotes, c'est dire ceux dont l'ADN est enferm dans un noyau, comme les plantes, les champignons et les animaux, la situation est aussi un poil complique.

En effet, les plantes, comme les animaux, possdent dans chacune de leurs cellules des organites (les organes de la cellule) dont l'origine est parfois particulire. Ainsi que l'a dcouvert Lynn Margulis, certains sont en effet des bactries, qui vivent en symbiose avec les organismes depuis des millions d'anne, et qui leurs rendent divers services, en change du gte et du couvert. Cependant, tous les organites ne sont pas issus de bactries symbiotiques, seulement quelquesuns. Par exemple, il y a les les mitochondries, qui permettent la cellule d'utiliser l'oxygne pour fabriquer de l'nergie. Chez les plantes, on trouve aussi les chloroplastes, qui contiennent la chlorophylle et permettent de transformer l'nergie lumineuse reue par la plante en sucre.Ces organites
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particuliers ont leur propre ADN. Chez les animaux, ou les vgtaux, ces organites passent d'une gnration l'autre presque exclusivement par les ovules, qui en contiennent plein, alors que le spermatozode ne donnera que son noyau. Vous avez donc reu un petit plus d'information gntique de votre mre que de votre pre; sans parler des ventuels effets maternels les effets paternels sont beaucoup plus rares. Transmission verticale transmission horizontale, et slection Nous venons de voir que la slection s'effectue au niveau des gnes. Est ce que d'autres types d'information sont galement susceptibles d'tre slectionns, comme l'information pigntique (voir annexe)? Pour que de l'information soit slectionne, il faut qu'elle soit transmise d'une gnration l'autre, or l'information pigntique disparat potentiellement en une ou deux gnrations. Nanmoins, si un caractre d un facteur pigntique est dfavorable pour l'individu qui le porte, il nuira la reproduction de celuici en raccourcissant sa dure de vie, par exemple, ou pour une autre raison. Il nuira donc sa propre transmission. Inversement, si les mcanismes pigntiques apportent un avantage reproductif aux organismes qui les possdent par rapport aux autres, la capacit employer ces mcanismes sera slectionne. Nous restons ici au niveau des transmissions dites verticales , c'est dire au niveau des caractres transmis d'une gnration l'autre par filiation. Nanmoins, il existe un autre mode de transfert, dit horizontal , c'est dire entre deux individus potentiellement de la mme gnration, et non ncessairement apparents (fig suivante). La maladie de la vache folle donne un exemple d'information pigntique transmise horizontalement. En effet, cette maladie est de une protine nomme prion, qui existe en deux formes. Une forme dite infectieuse a la proprit de transformer la forme normale en infectieuse . Elle se propage ainsi dans la cellule (le neurone), et conduit sa mort, puis s'infiltre dans les neurones voisins. Elle peut galement passer d'un individu l'autre par consommation de tissus contamins (maladie de CreutzfelJacob, et encphalite spongiforme bovine par exemple). Ainsi la transmission horizontale permet la protine de se propager dans la population. La reproduction de la protine nuit celle de l'individu, mais
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elle se propage quand mme car la mort de l'individu n'est pas un obstacle cette propagation, si les vivants consomment les tissus nerveux des morts.

Transfert d'information horizontal (d'un individu l'autre, qui ne descendent pas l'un de l'autre) et vertical (par descendance). L'information gntique peut aussi, chez certaines espces, tre transfre horizontalement. C'est un jeu trs apprci des bactries, qui utilisent ainsi les avantages du sexe (le brassage gntique), sans passer par la case reproduction . Chez l'homme, ainsi que chez d'autres espces, notamment des grands singes, certaines espces d'oiseaux etc., il existe un autre type de caractre transmis horizontalement. Il s'agit des comportements appris par apprentissage social (imitation etc.). Ces comportements sont galement potentiellement soumis la slection naturelle. Ainsi, on peut imaginer que les diffrentes cultures culinaires humaines ont t slectionnes en fonction de leur bonne adquation avec les besoins physiologiques des humains. Ainsi, des chercheurs ont observ que les cuisines les plus pices correspondaient aux pays les plus chauds, l'effet bactricide des pices limitant la croissance des bactries sur la nourriture, et en particulier la viande. De manire gnrale, si une mode culinaire est inadapte aux besoins humains, la nourriture ne permettra un bon dveloppement des
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individus. On peut donc imaginer que l'ensemble de nos rgles de cuisine ont t construites grce la combinaison de facteurs gntiques et culturels. Gntiques car nous avons un got instinctif pour certains aliments (ce qui est bon au got est souvent comestible, mais ce critre, mme s'il nous permet d'viter certains poisons ou aliment impropres la consommation, n'est pas suffisant). Culturels car la reconnaissance et le mode de prparation des aliments est variable entre les populations et s'apprend socialement. Mais quoi qu'il en soit, au final, ce qui est slectionn est de nature informative.

Pourquoi l'intelligent design n'est pas une thorie scientifique


Ce chapitre ne figure pas dans le corps du texte pour une raison simple : mon propos n'est pas de faire de l'histoire des ides, mais de dcrire l'volution des espces telle qu'elle est comprise actuellement par les biologistes. Cette annexe ne devrait donc pas tre ncessaire, car la thorie se suffit ellemme. Si vous l'avez comprise, vous devez tre capable vousmme de comprendre les dfauts des arguments des contradicteurs. Depuis quelques annes, un courant de pense fleurit un peu partout : le crationnisme dit scientifique , dont la thorie de l'intelligent design est le cheval de bataille. Qu'est ce que le crationnisme? C'est l'ide selon laquelle le monde tel qu'il existe a t cr par intervention divine. Il ne faut pas le confondre avec le fixisme. Selon les fixistes, le monde vivant n'volue pas. Il a t cr tel quel. Cette pense drive d'une interprtation stricte des textes religieux. Nous n'en discuterons pas, car il est vident qu'une telle pense n'a absolument rien de scientifique. L'volution est visible, elle se produit sous nos yeux et de nouvelles publications scientifiques en font tat chaque jour. Le crationnisme n'est pas ncessairement associ au fixisme. Selon la thorie de l'intelligent design, l'volution serait dirige vers un but, elle aurait une finalit. Implicitement, le but de l'volution aurait t la cration de l'humain (trs flatteur pour l'go des arrogants que nous sommes), et
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peuttre quelque chose de mieux . Cette ide est en contradiction totale avec ce que la science nous enseigne du vivant. D'une part, l'volution n'a pas de but . Elle ne peut pas en avoir, car il n'existe pas de mieux . Une baleine estelle mieux qu'un brin d'herbe? Pourquoi le seraitelle? Mathmatiquement, ce qui est slectionn, c'est la capacit transmettre ses gnes. Une baleine n'est pas plus efficace qu'un brin d'herbe dans ce domaine, et l'homme non plus. Les biologistes ne voient pas le monde sous forme d'une chelle. Pas plus sous la forme du moins volu au plus volu que du moins bien au mieux . Pire, la thorie de l'intelligent design n'est pas scientifique car elle n'est pas parcimonieuse. Le principe de la parcimonie veut qu'un phnomne ne soit expliqu que par le minimum de causes. Imaginez un ascenseur. Pour expliquer son fonctionnement, vous avez besoin de vous rfrer aux cbles, l'lectricit... Vous n'avez pas besoin, une fois que vous avez dcrit tous les mcanismes, de dcrire des filins invisibles ou des mains de gants pour expliquer comment il bouge. Eh bien en volution c'est pareil. Tout s'explique bien avec le nodarwinisme. C'est une thorie robuste et complte. Pourquoi inventer d'autres mcanismes plus ou moins sotriques, si ce n'est pour satisfaire notre go en nous imaginant suprieurs aux autres tres vivants? Pour imaginer d'autres concepts, il faudrait d'abord trouver un exemple qui ne puisse pas s'expliquer avec le nodarwinisme. Un des autres grand arguments des tenants de l'intelligent design ou des crationnistes fixistes, c'est de souligner les discussions des volutionnistes. D'aprs eux, si les spcialistes continuent de discuter des modalits de l'volution, c'est la signe qu'elle n'est pas fiable, ou pire qu'elle n'existe pas. Or, imaginez deux ptissiers discutant de la tarte aux fraises. L'un soutient qu'il faut une pte sable, et l'autre une pte brise. Mais quoiqu'il en soit, le gteau s'appellera toujours tarte aux fraises ! Il ne viendrait l'ide de personne de dire que la tarte aux fraises n'existe pas... Bien sr que les spcialistes discutent en permanence des modalits de l'volution. Il reste encore des choses dcouvrir, et beaucoup d'espces tudier. Mais en plus d'un sicle de recherche, personne n'a trouv de cas
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qui ne soit pas explicable par la thorie synthtique de l'volution. Et ce n'est pas pourtant pas faute de chercher. Au final, les principaux arguments des crationnistes de tous poils contre la thorie de l'volution refltent une seule chose : ils n'ont pas pris le temps d'essayer de la comprendre avant de la critiquer, et n'expriment bien souvent qu'une navrante ignorance du sujet.

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Bibliographie

Des livres pour aller plus loin


volution, synthse des Faits et Thories, Francine Brondex (ouvrage de synthse trs complet) L'Origine des Espces, Charles Darwin Le Gne goste, Richard Dawkins Les Avatars du Gne, PierreHenri Gouyon (ouvrage de synthse sur le nodarwinisme, c'est dire les apports cumuls de la thorie de Darwin et de la gntique) Manuel universel d'ducation sexuelle : A l'usage de toutes les espces, selon Mme le Dr Tatiana , Olivia Judson La Fourmi et le Sociobiologiste, Pierre Jaisson (ouvrage traitant de l'volution des socits) L'Arbre phylogntique du Vivant, Bernard Lecointre et Herv le Guyader La Vie est Belle, Stefen J. Gould (ainsi que ses autres ouvrages)

Articles scientifiques de rfrence :


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Bibliographie

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Remerciements et crdits images

Je remercie :
Sophie Picot, Arnaud Le Rouzic, Karine Poitrineau, Adeline Loyau et Michel Mouly pour leurs prcieuses corrections et leurs conseils techniques, PierreHenri Gouyon et Tadeusz Kawecki pour leurs conseils aviss, et leurs superbes textes de prface et postface, Niki, pour son dessin, Vassilissa Dolivo, Jacques Dupasquier et Grard Grandsimon pour les photographies de leurs chiens, les membres du forum Futura Sciences Gnration, qui ont, par leurs discussions et questions, indirectement contribu cet ouvrage, les concepteurs de La Poule ou l'Oeuf , pour leur aide et leur disponibilit, Mathieu Pasquini d'InLibroVeritas pour sa confiance, Mes parents pour leur soutien... et Luc Grandsimon, bien sr, pour son soutien, sa patience, et tout le reste...

Crdits images
Illustration de couverture et dessin de chien partie 1.3.c : Luc Grandsimon, fig 1.1 : Niki Albiane Nox, fig 1.2 : Boxer et Caniche : Grard Grandsimon, Mastiff : Vassilissa Dolivo, Malamute : Jacques Dupasquier, fig 3.2 : Eric Gaba, fig 3.5 : Siamois standard actuel : JeanLuc Npoux. Toutes les autres illustrations et photos sont de l'auteur.

Remerciements et crdits images

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glossaire/lexique

Allle: Version d'un gne, ou plus gnralement d'une squence gntique. Les gnes existent gnralement en plusieurs allles, dont les effets sont diffrents. Par exemple, le principal gne qui dtermine les groupes sanguins existe en trois allles: A, B et O. Arche: Organisme ressemblant une bactrie, et longtemps class comme tel. Mais les travaux de Carl Woese ont montr qu'elles possdaient des caractristiques qui permettaient de les classer dans un groupe distinct. Certaines espces se caractrisent galement par une capacit vivre dans des environnements impropres toute autre forme de vie (trs chauds, trs acides...). Chromosome: Forme que prend un brin d'ADN au moment de la division cellulaire : il s'enroule et s'entortille sur luimme, empaquet dans des protines, ce qui lui donne une forme deX (avant la division), ou de btonnet (aprs la division). Pour illustrer des schmas de croisements, nous reprsentons les chromosomes par des btonnets, avec des points de couleur reprsentant les gnes. Diplode: Organisme dont les cellules contiennent deux lots de chromosomes (chaque gne est donc en double). Chez les humains, les cellules somatiques (cellules du corps) sont diplodes, et les cellules sexuelles (ovule, spermatozode), sont haplodes. Dominant: Se dit d'un phnotype, d'un caractre, qui apparat mme si l'individu est htrozygote pour le gne considr. Un seul allle codant pour le phnotype dominant est suffisant son expression. L'autre allle codera donc pour un phnotype rcessif par rapport notre dominant, car cette notion est relative. Pour les groupes sanguins, si l'on regarde le dernier gne de la chane de fabrication des molcules responsables des diffrents groupes, le phnotype B est dominant par rapport au phnotype O. Un individu portant le couple d'allles B/O sera de phnotype B. Eucaryote: Organisme dont le matriel gntique est contenu dans un compartiment cellulaire spcial nomm noyau.
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Gne: Information porte par un segment d'ADN, codant pour la synthse d'une protine (voire plusieurs en cas d' pissage alternatif , un procd typique des eucaryotes qui permet un seul gne de produire plusieurs protines). Htrozygote: Se dit d'un individu qui porte deux allles diffrents d'un gne (on peut tre htrozygote pour certains gnes, et homozygote pour d'autres). Homozygote: Se dit d'un individu qui porte deux allles identiques d'un gne (on peut tre htrozygote pour certains gnes, et homozygote pour d'autres). Phnotype: Ensemble des traits observables d'un organisme (morphologie, physiologie etc...). Le groupe sanguin est un de ces traits, chez l'tre humain, de mme que la couleur des yeux, de la peau, la taille etc... Quand on dfinit un phnotype, il faut faire attention l'ventuelle influence de l'environnement. Par exemple, une personne peut avoir une peau fonce cause de son background gntique, mais le bronzage peut aussi jouer un rle plus ou moins important. Polymorphe: Se dit d'un gne ou d'une squence gntique qui existe en plusieurs allles. Rcessif: Se dit d'un phnotype, d'un caractre, qui n'apparat pas dans le cas o l'individu est htrozygote pour le gne considr. Pour les groupes sanguins, si l'on regarde le dernier gne de la chane de fabrication des molcules responsables des diffrents groupes, le phnotype O est rcessif par rapport aux phnotypes A et B. Un individu portant le couple d'allles A/O sera de phnotype A, et un individu O/O de phnotype O.

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