OPERACIONES SENCILLA S CON SECUENCIAS

6 de diciembre de 2013

SECUENCIA ORIGINAL DE ADN

ATGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGCATCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTTAGGGCCCAGTCAGTA GTGCGGTGGGGGACCATGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTTATGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGCATCC CGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTTAGGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGACCATGCGCGAACATTGTGGTGT TGCACTTATGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGCATCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTTAGGGCCCA GTCAGTAGTGCGGTGGGGGACCATGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTTATGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATAC TGCATCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTTAGGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGACCATGCGCGAACATT GTGGTGTTGCACTT

SECUENCIA REVERSA
TTCACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAGGGGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCGACGAACTGACACGTCT AGTCTGCCCTACGTCATAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTATTCACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAGGGGG TGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCGACGAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACGTCATAAAAGTCGAACCATACCA GCGTGTATTCACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAGGGGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCGACGAACTGA CACGTCTAGTCTGCCCTACGTCATAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTATTCACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTAC CAGGGGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCGACGAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACGTCATAAAAGTCGAAC CATACCAGCGTGTA

SECUENCIA COMPLEMENTARIA
TACACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACGTAGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGAATCCCGGGTCAGTCAT CACGCCACCCCCTGGTACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAATACACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACGTAGG GCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGAATCCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCTGGTACGCGCTTGTAACACCACA ACGTGAATACACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACGTAGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGAATCCCGGGT CAGTCATCACGCCACCCCCTGGTACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAATACACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATG ACGTAGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGAATCCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCTGGTACGCGCTTGTAA CACCACAACGTGAA

TRANSCRIPCIN A ARN
AUGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGCAUCCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUUAGGGCCCAGUCAGUA GUGCGGUGGGGGACCAUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUUAUGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGCAUCC CGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUUAGGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGACCAUGCGCGAACAUUGUGGUGU UGCACUUAUGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGCAUCCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUUAGGGCCCA GUCAGUAGUGCGGUGGGGGACCAUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUUAUGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUAC UGCAUCCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUUAGGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGACCAUGCGCGAACAUU GUGGUGUUGCACUU

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PROTENA CODIFICADA (ESTRUCTURA PRIMARIA)

cuantas soluciones posibles hay para la secuencia problema? por que?
Como no sabemos si nuestras cadena original de ADN es la hebra codificante o la hebra, por tanto, ya tendremos dos cadenas de RNAm que pueden dar lugar a una protena. Pero es que adems, para cada una de las cadenas de RNA tendremos tres posibilidades, ya que la transcripcin depender de dnde est el inicio dentro del triplete (frame 1, frame 2, frame 3).

Reading Frame RF1

MCDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHLCATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTYVRPYQA ENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALMCDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLH

Reading Frame RF2

CATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTYVRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALMCDHTKL KILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHLCATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCT

Reading Frame RF3

VRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALMCDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHLCATIPS* KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTYVRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVAL

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ESTADSTICA DA SECUENCIAS
PORCENTAJE DE NUCLETIDOS
112 nucletidos de Adenina (23,52%); 120 nucletidos de Citosina (25,21%); 136 nucletidos de Guanina (28,57%) y 108 nucletidos de Timidina (22,68%).

PORCENTAJE DE DMEROS (PAREJAS DE BASES DIFERENTES)

AA 24 dmeros (5,04%);AC 28 dmeros (5,88%); AG 32 dmeros (6,72%); AT 28 dmeros (5,88%); CA 48 dmeros (10,08%); CC 28 dmeros (5,88%); CG 20 dmeros (4,2%); CT 24 dmeros (5,04%); GA 20 dmeros (4,2%); GC 44 dmeros (9,24%); GG 32 dmeros (6,72%); GT 40 dmeros (8,4%); TA 19 dmeros (3,99%); TC 20 dmeros (4,2%); TG 52 dmeros (10,92%); TT 16 dmeros (3,36%)

AAA AAT ACT AGT ATG CAC CCA

PORCENTAJE DE TRIPLETES (CODONES)

8 tripletes (1,68%); AAC 4 tripletes (0,84%); AAG 8 tripletes (1,68%); 4 tripletes (0,84%); ACA 8 tripletes (1,68%);ACC 12 tripletes (2,52%); 8 tripletes (1,68%); AGC 12 tripletes (2,52%); AGG 4 tripletes (0,84%); 16 tripletes (3,36%); ATA 8 tripletes (1,68%); ATC 8 tripletes (1,68%); 8 tripletes (1,68%); ATT 4 tripletes (0,84%); CAA 8 tripletes (1,68%); 8 tripletes (1,68%); CAG 16 tripletes (3,36%); CAT 16 tripletes (3,36%); 16 tripletes (3,36%); CCC 8 tripletes (1,68%); CCG 4 tripletes (0,84%);

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CGA CGT GAA GCA GCT GGG GTC TAC TCA TGA TGT

8 tripletes (1,68%); CGC 4 tripletes (0,84%); CGG 4 tripletes (0,84%); 4 tripletes (0,84%); CTG 16 tripletes (3,36%); CTT 8 tripletes (1,68%); 8 tripletes (1,68%); GAC 8 tripletes (1,68%); GAT 4 tripletes (0,84%); 16 tripletes (3,36%); GCC 4 tripletes (0,84%); GCG 16 tripletes (3,36%); 8 tripletes (1,68%); GGA 4 tripletes (0,84%); GGC 4 tripletes (0,84%); 16 tripletes (3,36%); GGT 8 tripletes (1,68%); GTA 4 tripletes (0,84%); 12 tripletes (2,52%); GTG 20 tripletes (4,2%); GTT 4 tripletes (0,84%); 8 tripletes (1,68%); TAG 8 tripletes (1,68%); TAT 3 tripletes (0,63%); 8 tripletes (1,68%); TCC 4 tripletes (0,84%); TCT 8 tripletes (1,68%); 8 tripletes (1,68%); TGC 24 tripletes (5,04%); TGG 8 tripletes (1,68%); 12 tripletes (2,52%); TTA 7 tripletes (1,47%); TTG 8 tripletes (1,68%)

ANEXOS - BIBLIOGRAFA
http://difusion.df.uba.ar/ConectarIgualdad/Tutorial%20CodigoGenetico.pdf http://pendientedemigracion.ucm.es/info/genetica/grupod/Transcripcion/Transcripcion.htm http://personales.upv.es/jcanizar/bioinformatica/conocimientos_previos.html http://es.wikipedia.org/wiki/Traducci%C3%B3n_(gen%C3%A9tica)

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