Tema 3.

cidos Nucleicos
ARQUITECTURA MOLECULAR DE LA MATERIA VIVA
BIOQUMICA. Curso 2013-2014. Fuencisla San Juan Serrano. rea de Bioqumica y Biologa Molecular
cidos ucleicos
1. Nau!ale"a e im#o!a$cia %iol&'ica de los AN
- !or qu" comen#amos es$udiando los %&'
elemen$os
qumicos
MOL(CULA) MACROMOL MACROMOL( (CULA) CULA)
in$eracciones (olimeri#aci)n
macromol"culas m*s im(or$an$es (ara la +ida
la +ida comen#) la a(arici)n de es$as mol"culas ca(aces de au$ore(licarse
ac$,an como de(osi$arios y $ransmisores de la in-ormaci)n gen"$ica
(rogramaci)n del desarrollo y -unciones del organismo .(lano/
0ec$uras'
- 1l descu2rimien$o
- 3%
- 4ri(le 5"lice
- %6 au$oca$al$ico
- 6i2o#imas
*cido ri2onucleico .6%/
*cido deso7iri2onucleico .8%/
- 4i(os'
cidos ucleicos
*. Com#o$e$es de los Acidos Nucleicos
- 9nidad monom"rica .NUCLE+TIDO/ -ormada (or'
- Cadenas (olim"ricas de unidades unidas co+alen$emen$e
a#,car de : C' 6i2osa .6%/ 2;deso7irri2osa .8%/
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
*cido -os-)rico unido al C
:
de la (en$osa .enlace -os-odies$er/
2ase ni$rogenada unida al C
1
de la (en$osa .enlace -glucosdico/
cidos ucleicos
Bases i$rogenadas'
- uni)n nucle)$idos' enlace -os-odi"s$er con C
3
de o$ro nucle)$ido
- los % (ueden con$ener (eque<a (ro(orci)n de 2ases modi-icadas .me$iladas/
2ases (irimdicas 2ases (,ricas
DNA, %= >= C= 4
RNA, %= >= C= 9
- uni)n a la (en$osa (or el de C
1
y del C
?
%. -os-)rico'
- es el que le con-iere el car*c$er *cido
cidos ucleicos
- % (ueden considerarse (olmeros o (olinucle)$idos de 4 nucle)$idos di-eren$es
- cada nucle)$ido' deri+ado :;-mono-os-orilado de nucle)sido'
- (olmeros (eque<os con 2a@o nA de residuos' oligonucle)$idos
cidos ucleicos
3. -!o#iedades de los $ucle&idos
*cidos rela$i+amen$e -uer$es a (B -isiol)gico'
el gru(o -os-a$o (uede ioni#arse= (erdiendo 2 B
C
consecu$i+amen$e
algunos de los gru(os de las 2ases (ueden $am2i"n ioni#arse= (erdiendo B
C
$au$omeri#aci)n de las 2ases' is)meri#aci)n en la que +ara la (osici)n del gru(o -uncional
isomeri#aci)n de las 2ases' +ariaci)n de la (osici)n de los B
a2sor2en lu# en el rango ul$ra+ioles$a .2D0 nm/' de2ido a los do2les enlacesE
en la2. (ara de$erminaci)n cuan$i$a$i+a de % es(ec$ro-o$om"$ricamen$e
cidos ucleicos
.. Esa%ilidad / 0o!maci&$ del e$lace 0os0odiese!
- Formaci)n enlace -os-odies$er' - des5idra$aci)n
- >A F C2: GJHmol sen$ido 5idr)lisis
- Bidr)lisis muy len$a'
- solo condiciones e7$remas *cidas o alcalinas
- o (or nucleasas
al$a es$a2ilidad de los %
- In +i+o= se -orma aco(lado a la 5idr)lisis del
corres(ondien$e nucle)$ido $ri-os-a$o .AT-1
2T-1 CT-1 UT-1 dAT-1 d2T-1 dCT-1 dTT-/
cidos ucleicos
3. Es!ucu!a de los AN
1s$ruc$ura (rimaria
- secuencia nucleo$dica % (resen$a 2 carac$ers$icas'
a/ direccionalidad'
enlace -os-odies$er en$re el ! y JB
-
del C
:
(en$osa .nucle)$ido/
y el JB
-
del C
3
de o$ro nucle)$ido
e7$remo cadena con ! en (osici)n :; .i#quierda/
e7$remo cadena con JB- en (osici)n 3; .derec5a/
a/ indi+idualidad' secuencia de 2ases es(ec-ica
ACGTT
5 3
- im(or$ancia de la es$ruc$ura (rimaria' almacenamien$o in-ormacion gene$ica
com2inaciones de 4 le$ras .2ases/ $omadas de 3 en 3
Ej. Tetranucletido RNA
cidos ucleicos
1s$ruc$ura $ridimensional
- K%4SJ L C6ICG .1?:3/' di*me$ro cons$an$e de la do2le 5"lice solo (osi2le si'
- 8o2le 5"lice 8%' 5i$o de la Biologa Molecular
- Conocimien$os (re+ios'
M 2ases en el in$erior de la 5"lice
M (urinas-(irimidinas en-ren$adas
.man$iene dis$ancia %-4 y C-> con los
C
1
(en$osa a 1.0N nm/
la com(lemen$ariedad de las 2ases de las 2 cadenas' 2ase de la au$orre(licaci)n de %
2. 8% siem(re' O%P F O4P y OCP F O>P .Chargaff)
3. 8ensidad 8%' sugera dos cadenas
4. (redominan -ormas $au$om"ricas amino .%=C/ y ce$o .>=4/ .Donohue)
1. di-racci)n de rayos 3 .FranQlin= KilQins= S$oQes)
es$ruc$ura 5elicoidal' 20 R di*me$ro
+uel$a de 5"lice' 3.4 nm
dis$ancia en$re nucle)$idos adyacen$es' 0.34 nm
10=: nucle)$idosH+uel$a
cidos ucleicos
- Modelo de %8 (ro(ues$o (or Ka$son y CricQ'
M do2le 5"lice con Sarma#)n 5idro-licoT .-os-a$o-
deso7irri2osa/ en el e7$erior
M orien$aci)n o(ues$a de las cadenas .an$i(aralelas/
M (ares de 2ases en el in$erior .(uen$es B y -uer#as Uan
der Kaals/
M giro 5"lice des$r)giro .sen$ido agu@as relo@/
M2 surcos de acceso a las 2ases
cidos ucleicos
1s$ruc$ura Ka$son-CricQ' .0o!ma B/
di-erecias'
do2le 5"lice de7$r)gira do2le 5"lice des$r)gira
di*me$ro' 2D R di*me$ro' 20 R
(ares nucle)$idosH+uel$a' 11 (ares nucle)$idosH+uel$a' 10=:
2. n. o2lcuas al e@e' m*s e7$ernas 2.n. (er(endiculares al e@e
M 8% acuoso .5idra$ado/
M 8% in +i+o
1s$ruc$ura cris$alina' .0o!ma A/
M 8% .des5idra$ado/
M 8%-6%
M 6% do2le cadena
(uen$es B
JB
-
ri2osa B
2
J
mol"culas menos 5idra$adas mol"culas m*s 5idra$adas
cidos ucleicos
Formas de los % in +i+o
DNA
- 2ica$enario lineal' n,cleo eucario$as
2ac$eri)-ago 42
- 2ica$enario circular' 2ac$erias
mi$ocondrias y cloro(las$os eucario$as
+irus SU40
- monoca$enario lineal' (ar+o+irus
- monoca$enario circular' +irus 1V4
RNA
- 2ica$enario' re$ro+irus
- monoca$enario' nucleolar
mensa@ero
$rans-erencia
ri2os)mico
cidos ucleicos
M -orma B .Ka$son y CricQ/' - m*s es$a2le
- orien$aci)n 2ases San$iT
M -orma %' - no es$* claro se encuen$ra en las c"lulas in +i+o
- se da en disoluciones ricas en sales
- orien$aci)n 2ases San$iT
M -orma W' - 5"lice le+)gira= con 12 (ares nucle)$idosH+uel$a
- es$ruc$ura m*s delgada y alargada
- orien$aci)n 2ases (,ricas SsinT
- (legamien$o en #ig-#ag
- regiones del %8 con es$a con-ormaci)n 44
- regulaci)n e7(resi)n algunos genes
- recom2inaci)n gen"$ica
- 8i-eren$es -ormas $ridimensionales 8% do2le cadena'
cidos ucleicos
- 8% do2le cadena su(erenrrollado .em(aque$amien$o/'
DNA ci!cula!
#!oca!ioa
DNA euca!ioa 5c!omosomas6
unidad -undamen$al de la croma$ina'
- N 5is$onas .2 7 B3= B4= B2% y B2B/ muy 2*sicas
- unidas (or in$eracci)n elec$ros$*$ica con 8%
- -ormaci)n cromosomas en la di+isi)n celular
http://www.youtube.com/watch?v=N5zFOScowqo
- $ensi)n y gas$o energ"$ico
- dirigida y ca$ali#ada (or S$o(oisomerasasT .aco(lado a la 5idr)lisis de %4!/
cidos ucleicos
- Secuencias (oco -recuen$es de 8% do2le cadena'
7o!8uilla' - duran$e la re(licaci)n
- ca$ali#ada (or 5elicasas
C!u"' - duran$e la recom2inaci)n
- secuencias (alindr)micas
ADN c!u"ado o 2
.
' - re(licaci)n= recom2inaci)n y re(araci)n
- in$ercam2io 4 mol"culas 8% do2le cadena
- $2 8% Bolliday .Bolliday= 1?D4/
ADN !i#le o 7' - una cadena (irimidinas y o$ra (urinas
- a(areamien$o Boogs$een
- duran$e la $ranscri(ci)n
- && regulaci)n $ranscri(ci)n
cidos ucleicos
- 8% y 6% monoca$enario'
do2le 5"lice % o B' regiones au$ocom(lemen$arias
a(areamien$o de 2ases .e@. 6%$/
5"lice (or a(ilamien$o 2ases' in$eracciones 5idro-)2icas
no (uen$es B
no com(lemen$ariedad 2ases a(iladas.
o+illo alea$orio' es$ruc$ura -le7i2le
ro$aci)n cons$an$e e ines(ec-ica
- 6% do2le cadena .re$or+irus/' -orma %
cidos ucleicos
1. 6% im(licados en la sn$esis de (ro$enas
4i(os y -unciones del 6%
cidos ucleicos
RNA me$sa9e!o .6%m/' - monoca$enario
- sn$esis so2re molde de 8% .$ranscri(ci)n/
- sale ci$osol $ra+"s (oros de la en+ol$ura nuclear
- (or$adores de la in-ormaci)n gen"$ica 8%
-eucario$as son monocis$r)nicos .1 (ro$ena/
- (rocario$as son (olicis$r)nicos .m*s de 1 (ro$ena/
- +ida media cor$a= se degradan r*(idamen$e
- secuencias marcadoras de inicio y $erminaci)n
cidos ucleicos
RNA !a$s0e!e$cia .6%$/
- cor$os (olmeros .N0 nucle)$idos/
- es$ruc$ura cru# .com(lemen$ariedad 2ases/
- se unen a lugares es(ec-icos del ri2osoma
- $ienen 1 si$io es(ec-ico (ara -i@aci)n aa .e7$remo 3;/
- an$icod)n' 3 nucle)$idos com(lemen$arios al cod)n .6%m/
- $rans-ieren 1 aa es(ec-ico a (ro$ena en crecimien$o
- m*s nA 6%$ que aa' redundancia c)digo gen"$ico
- (roceso' $raducci)n
cidos ucleicos
RNA !i%os&mico .6%r/'
-!oca!ioas
su2unidad (eque<a 30S' r6% 1DS y 21 (ro$enas
su2unidad grande :0S' r6% :S= 23S y 34 (ro$enas
.ri2osoma V0S/
Euca!ioas
su2unidad (eque<a 40S' r6% 1NS y 33 (ro$enas
su2unidad grande D0S' r6% 2NS= :.NS= :S y 4? (ro$enas
.ri2osoma N0S/
%6r
(ro$enas
cen$ro ac$i+o
- se -orma en el nucleolo
- +arios -ragmen$os de di-eren$es $ama<os
- asociado a (ro$enas' su2unidades ri2os)micas
- muy a2undan$e .N0X de $odo el 6%/
- ac$i+idad ca$al$ica' enlaces (e($dicos
cidos ucleicos
8ogma Cen$ral de la Biologa Molecular
UN 2EN UNA -ROTENA
cidos ucleicos
2. 6% reguladores- carac$ers$icos de eucario$as
- com(lemen$arios de regiones es(ec-icas del %6m o de genes del %8
- se -orman (or -ragmen$aci)n de mol"culas de $ranscri($os de 6% mayores
s$RNA' - 6% nuclear (eque<o .small nuclear 6%/
- (ar$ici(a en el (rocesamien$o del 6%
Mic!o RNA' - 21 nucle)$idos
- se une al 6%m in5i2iendo su $raducci)n
siRNA' - 6% (eque<os de in$er-erencia
- se unen al 6%m (romo+iendo su degradaci)n
!$RNA' - 6% (eque<o que -orma (ar$e de ri2onucleo(ro$ena
- dirige a las (ro$enas sin$e$i#adas a su des$ino en la c"lula
3. 6% con ac$i+idad ca$al$ica' 6i2o#imas
- %6 asociado a (ro$enas .ri2onucleo(ro$enas/
- la su2unidad de %6 la que lle+a a ca2o las reacciones ca$al$icas
- se conocen : $i(os' 3 lle+an a ca2o reacciones de au$omodi-icaci)n .eliminaci)n de in$rones/
ri2onucleasa !' cor$a el 6% (recursor (ara generar el 6%$
%6 ri2os)mico' reali#a el enlace (e($dico duran$e la sn$esis (ro$eica
siRNA
mRNA
cidos ucleicos
:. Esa%ilidad de AN de do%le cade$a
- es$ruc$ura es$a2le en condiciones -isiol)gicas
- es$a2ili#ada (or' (uen$es B
in$eracciones 5idro-)2icas
-uer#as Uan der Kaals
- re(licaci)n y $ranscri(ci)n 81S%496%0IW%CIY
- (roceso re+ersi2le' 5i2ridaci)n o rena$urali#aci)n
Fac$ores que -a+orecen la desna$urali#aci)n in +i+o
- re(ulsi)n elec$ros$*$ica en$re - gru(os -os-a$o
- mayor en$ro(a y menor 1 de las -ormas lineales .o+illo alea$orio/
- ca$ali#ada en#im*$icamen$e
cidos ucleicos
densidad de -lo$aci)n
+iscosidad
a2sor2ancia a 2D0 nm
8esna$urali#aci)n in +i$ro
- (or ele;ada em#e!au!a,
- a2sor2ancia .e-ec$o 5i(ercr)mico/' do2les enlaces de las 2ases es$*n m*s e7(ues$os
- la desna$urali#aci)n (uede seguirse midiendo la a2sor2ancia de lu# 9U
- cada es(ecie de % $iene una 4Z de desna$urali#aci)n
carac$ers$ica' #o de 0usi&$ .$m/
- [ con$enido > C [ ($o -usi)n
.necesi$a [ 1 (ara rom(er (uen$es B que % F 4/
- ($o -usi)n indica el con$enido y com(osici)n 2ases
cidos ucleicos
<. O!as 0u$cio$es de los $ucle&idos
4rans(or$adores de 1nerga
%dem*s de c)mo su2unidades de los %= (ueden ac$uar como'
Co-ac$ores en#im*$icos .coen#imas/
M nucle)sidos mono-= di- y $ri-os-ar$o'
- 5idr)lisis gru(os ! 1 (ara im(ulsar reacciones
- %4! .am(liamen$e u$ili#ado/
- 94!= >4! y C4! .en reacciones es(ec-icas/
- ac$,an como (recursores ac$i+ados en sn$esis %
>4!' Sn$esis de (ro$enas
C4!' Sn$esis de l(idos
94!' Me$a2olismo de car2o5idra$os
cidos ucleicos
cidos ucleicos
Mol"culas reguladoras
segundos mensa@eros en la se<ali#aci)n celular
>M! cclio .c>M!/' - (resen$e en muc5as c"lulas
- regulaci)n -unciones .+isi)n= +asodila$aci)n= $ransmisi)n ner+iosa\/
%M! cclio .c%M!/' - sin$e$i#ado (or la adenila$o ciclasa
- -unciones reguladoras .c. animales/
>uanosina $e$ra-os-a$o .((>((/'
- en 2ac$erias
- in5i2e sn$esis de r6% y $6% cuando
disminuye la necesidad de (ro$enas
cidos ucleicos
Bi2liogra-a'
- Feduc5i= ca($ulo D' (g. ?3-110
- Ma$5e]s - Uan Bolde= ca($ulo 4' (g. ?3-140
- 0e5ninger= ca($ulo 10' (g. 32:-3D1
cidos ucleicos
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