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Biochimie Structurale 2

Simone Granon James Sturgis


sturgis@ibsm.cnrs-mrs.fr

Biochimie Structurale 2.1

James Sturgis

Biochimie Structurale 2

La Biochimie Cellulaire (4+2)


Le mtabolisme Le couplage Structure et Purification Cintique

Les Protines

Les Enzymes

Biochimie Structurale 2.1

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Biochimie Structurale 2 Examen

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Biochimie Structurale 1 Rappel


Les molcules de la vie...

Les petits

Glucides Acide Amins Vitamines

- Nuclotides - Acides Gras - et autres

Les grands

Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides


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Biochimie Structurale 2.1

Biochimie Structurale 1 Rappel


Les molcules de la vie...

Les petits

Glucides Acide Amins Vitamines

- Nuclotides - Acides Gras - et autres

Les grands

Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides


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Biochimie Structurale 1 Rappel


Les molcules de la vie...

Les petits

Glucides Acide Amins Vitamines

- Nuclotides - Acides Gras - et autres

Les grands

Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides


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Biochimie Structurale 1 Rappel


Les molcules de la vie...

Les petits

Glucides Acide Amins Vitamines

- Nuclotides - Acides Gras - et autres

Les grands

Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides


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Biochimie Structurale 1 Rappel


Les molcules de la vie...

Les petits

Glucides Acide Amins Vitamines

- Nuclotides - Acides Gras - et autres Pyridoxal Vitamine B6

Les grands

Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides

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Biochimie Structurale 1 Rappel


Les molcules de la vie...

Les petits

Glucides Acide Amins Vitamines

- Nuclotides - Acides Gras - et autres

Les grands

Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides


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La dynamique des molcules de la vie....

Les conversions Les cintiques Les catalyseurs

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Les Conversions biologiques


Sucre (maltose/saccharose ou amidon) + Eau + Levure

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Les Conversions biologiques


Sucre (maltose/saccharose ou amidon) + Eau + Levure

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Les Conversions biologiques


Sucre (maltose/saccharose ou amidon) + Eau + Levure

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La chimie biologique
Sucre (maltose/saccarose ou amidon) + Eau + Levure

Maltose Saccarose Amidon Levure et eau

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... et si on regardait dans le flacon?


Une production de gas carbonique ... et d'alcool Maltose Saccarose Amidon Levure et eau

CO2 Ethanol

Danger

La chimie organique
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... et si on regardait dans le flacon?


Les cellules qui se divisent

Les levures qui croissent sur les glucides... Td environ 60 minutes.


file:///home/james/University/Teaching_2005%252f6/Biochimie_2/growthyeast-hr.qt

...mais aussi
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Philip Meaden Heriot-Watt University Edinburgh, Scotland and The MicrobeLibrary

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... et si on regardait dans le flacon?


Une tmperature qui augmente La matrise de ceci est important pour la qualit des vins et des bires...

...mais aussi
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Une reaction chimique

Glucide + levure -> CO2 + thanol + 2 x levure + chaleur


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Production de Biomasse

Glucide + levure -> CO2 + thanol + 2 x levure + chaleur


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Couplage de Ractions
D'une part: Utilisation du glucide comme fioul pour la cellule et production des dchets (Ethanol et Gas carbonique) D'autre part: Production de nouvelles cellules avec l'nergie derive de l'utilisation du fioul.

Deux processus coupls

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Couplage de Ractions
Catabolisme Utilisation de glucide comme fioul pour la cellule et production des dchets (Ethanol et Gas carbonique) Anabolisme Production de nouvelles cellules avec l'nergie derive de l'utilisation du fioul.

Deux processus coupls Mtabolisme

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... et si on tue les cellules?


Glucose + levure -> CO2 + thanol + 2 x levure + chaleur Glucose + levure (mort) -> CO2 + thanol + levure (mort) + 2 x chaleur Experience ancienne ( Hans et Eduard Buchner en 1897, pousse plus loin par Harden et Young en 1905 ) Le catabolisme est toujours possible Le mtabolisme est de-regl. Le couplage entre anabolisme et catabolisme conserve l'nergie. Les composants du suc de levure sont capable de faire la chimie.
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Catalystes Enzymes
Les composants du suc de levure capable de catalyser les ractions chimiques sont les enzymes Ce sont des protines souvent avec des cofacteurs ou co-enzymes.

Certaines protines sont des catalystes impressionants


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Liens entre Anabolisme et Catbolisme

Catabolisme Petites molcules ATP NAD(P)H Utilisation de fiouls

Anabolisme

Fabrication des molcules de la vie

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ATP l'argent comptant de la cellule


C'est quoi cette molcule? Pourquoi est-elle si utile? Comment est stocke l'nergie ?

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ATP l'argent comptant de la cellule


C'est quoi cette molcule? Pourquoi elle est si utile? Comment est stocke l'nergie ?

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ATP l'argent comptant de la cellule


C'est quoi cette molcule? Pourquoi elle est si utile? Comment est stocke l'nergie ? ADP~P

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ATP l'argent comptant de la cellule


C'est un vritable argent pour la cellule ADP + H+ + Pi ATP + H2O

G' = -29,2 kJ mol-1

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Couplage et thermodynamique
Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. A B 1er raction favorable A->B C D

2me raction favorable C->D

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Couplage et thermodynamique
Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. A B 1er raction favorable A->B D C

2me raction dfavorable D->C

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Couplage et thermodynamique
Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. A B 1er raction favorable A->B D C

2me raction dfavorable D->C A+D B+C

Les deux ractions couples


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ATP et couplage
Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. Glucide Ethanol + CO2 ATP 1er raction favorable A->B ADP + Pi

2me raction dfavorable D->C Glucide + ADP +Pi Ethanol + ATP + CO2

Les deux ractions couples


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ATP et couplage - Catabolisme


Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. Macromolcules Petites molcules 1er raction favorable A->B ADP + Pi ATP 2me raction dfavorable D->C Macromolcules + ADP + Pi Petites molcules + ATP

Les deux ractions couples


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ATP et couplage - Anabolisme


Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. Petites molcules Macromolcules 1er raction favorable A->B ADP + Pi ATP 2me raction dfavorable D->C Petites molcules + ATP Macromolcules + ADP + Pi

Les deux ractions couples


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NAD(P)H le pouvoir rducteur


C'est quoi cette molcule? Pourquoi elle est si utile?

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NAD(P)H le pouvoir rducteur


C'est quoi cette molcule? Pourquoi elle est si utile?

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