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Chapitre 2 :

Composs et fonctions organiques


Marine PEUCHMAUR
Anne universitaire 2010/2011
Universit Joseph Fourier de Grenoble - Tous droits rservs.
Chimie Chimie Organique
1. Les hydrocarbures
2. Les fonctions organiques
1. Les hydrocarbures
1.1. Les alcanes
1.2. Les alcnes
1.3. Les alcynes
1.4. Les composs aromatiques
Les hydrocarbures ne sont composs que datomes de carbone et dhydrogne
1.1. Les alcanes
pentane
mthylbutane dimthylpropane
Alcane linaire Alcanes ramifis
Chanes
principales
Ramifications
Carbone quaternaire (reli 4 C)
Carbone tertiaire (reli 3 C)
Carbone secondaire (reli 2 C)
Carbone primaire (reli 1 C)
Les alcanes sont des composs saturs.
Leur formule brute est du type C
n
H
(2n+2)
.
C
sp
3
: atome de C ou H
Exemples :
A. Les alcanes acycliques
1.1. Les alcanes (suite)
C
6
H
14
C
6
H
14
C
6
H
12
C
6
H
12
C
6
H
12
5 doublets liants C-C
5 doublets liants C-C
6 doublets liants C-C
6 doublets liants C-C
6 doublets liants C-C
1 doublet liant C-C
supplmentaire
Composs
saturs
2 atomes
dhydrogne
en moins
Le nombre dinsaturation correspond au nombre de doublets ou hormis les liaisons
C-H que comporte lhydrocarbure tudi, en plus par rapport son homologue alcane. A
chaque insaturation correspond un manque de 2 atomes dhydrogne.
1 insaturation
Les cycloalcanes sont des composs insaturs.
Leur formule brute est du type C
n
H
(2n+2)
.
hexane
2-mthylpentane
alcanes
cyclohexane
mthylcyclopentane
1,2-dimthylcyclobutane
cycloalcanes
B. Les cycloalcanes
1.2. Les alcnes
(ou olfines)
sp
2
Les alcnes sont des composs insaturs (double liaison).
Leur formule brute est du type C
n
H
2n
.
L
C=C
< L
CC
et E
C=C
> E
CC
Gomtrie trigonale autour des C
hybrids sp
2
de la double liaison
Pas de rotation autour de
la double liaison C=C
Liaison C=C plus difficile casser
totalement que liaison CC
E
C=C
< E
CC
Les lectrons sont plus mobiles et
plus polarisables que les lectrons :
ce sont eux qui vont confrer ses
proprits chimiques la molcule
Remarque : les cycloalcanes possdent la mme formule brute
1.2. Les alcnes (suite)
Exemples :
propne
cyclohexne cyclopenta-1,3-dine limonne
(citron, menthe, pin)
OH
Vitamine A (rtinol)
-carotne
NO
2
Phromone de dfense des termites
H
3
C CH
3
thane
C
2
H
6
satur
H
2
C CH
2
thne (ou thylne)
C
2
H
4
1 insaturation
(2 atomes H en moins)
1.3. Les alcynes
sp
Exemples :
H
3
C CH
3
thane
C
2
H
6
satur
H
2
C CH
2
thne (ou thylne)
C
2
H
4
1 insaturation
Hex-1-yne
HC CH thyne (ou actylne) C
2
H
2
2 insaturations
(4 atomes H en moins)
Hex-2-yne
Alcyne terminal = alcyne vrai
(H li la triple liaison acide)
Alcyne interne
Les alcynes sont des composs insaturs (triple liaison).
Leur formule brute est du type C
n
H
2n-2
.
HN OH
OH
O
O OH
O
COOH
OCH
3
Dynmycine A
(fermentation Micromonospora chersina)
nediyne
1.3. Les composs aromatiques
sp
2
Les aromatiques sont des composs insaturs
(cycle + doubles liaisons).
A. Le benzne et ses drivs
Structures de Kekul du benzne
Les 6 liaisons carbone-carbone
sont identiques (l = 1,39 )
Les 6 liaisons carbone-hydrogne
sont identiques ( l = 1,09 )
Reprsentation du
benzne sous forme
dune structure unique
Exemples :
Nombre dinsaturations
Hydrocarbure satur (alcane) : C
n
H
(2n+2)
C
6
H
14
8 atomes H en moins
4 insaturations (1 cycle + 3 doublets )
C
6
H
6
Tolune
(mthylbenzne)
OH
Phnol
(benznol)
CHO
Benzaldhyde
(benzne-carbaldhyde)
NO
2
Nitrobenzne
1.3. Les composs aromatiques
B. Position des substituants sur le benzne
X
ortho
par rapport X
mta
par rapport X
para
par rapport X
mta
ortho
Exemples :
C. Autres composs aromatiques
Un compos sera aromatique si :
cycle plan avec recouvrement latral des OA voisines
4n + 2 (n entier 0) lectrons dlocaliss
Exemples :
Rgles de Hckel
14-Annulne
Cyclooctattrane
Cyclobutadine
Cation
cyclopropnyle
Cation
cycloheptatrinyle
Anion
cyclopentadinyle
OH
p-hydroxytolune
4-hydroxytoluene
1
2
3
4
Br
Br
m-dibromobenzne
1,3-dibromobenzne
1
2
3
NO
2
Cl
o-chloronitrobenzne
2-chloronitrobenzne
1
2
Aromatiques Non aromatiques
2. Les fonctions organiques
2.1. Quelques fonctions organiques en biochimie
2.2. Les fonctions organiques halognes
2.3. Les fonctions organiques oxygnes
2.4. Les fonctions organiques azotes
2.5. Autres htroatomes
2.1. Quelques fonctions organiques en biochimie
Les fonctions organiques ou groupements fonctionnels sont lis la
prsence dhtroatomes (oxygne, soufre, azote, phosphore).
palmitoyloleylphosphatidylcholine
O
P
O
O
O
N
O
O
O
O
O
OH
O
HO
Prostaglandine A1
Lipides
H
2
N
OH
O
S
H
2
N
OH
O
OH
L-mthionine
L-tyrosine
Acides amins - Peptides
O
OH
HO
N
N
NH
2
O
N
N
N
N
NH
2
O
OH OH
O P O
O
O
Dsoxyribonucloside
(dsoxycytidine)
Nuclotide
(Adnosine monophosphate - AMP)
Acides Nucliques
O
OH
O HO
OH
OH
O
HO
OH
OH
OH
Lactose
(Disaccharide)
-D-galactose
/-D-glucose
Glucides
2.2. Les fonctions organiques halognes
C X
Les halognoalcanes (ou halognures dalkyle) sont des
alcanes dont un ou plusieurs atomes H ont t remplacs
par un halogne not X (X = F, Cl, Br ou I).
A. Proprits de la liaison CX
Longueur de liaison : CF < CCl < CBr < CI
Elctrongativit : C << I < Br < Cl < F
Liaison CX polarise :
Polarisabilit : F < Cl < Br < I
Force de liaison : CF > CCl > CBr > CI
Ractivit relative : CF < CCl < CBr < CI
C X

+
Remarque : Consquences sur les proprits physiques
Halognoalcanes = composs polaires plus de forces intermolculaires (diple-diple) que dans
leurs homologues alcanes non polaires tempratures de changement dtat leves.
A temprature ambiante, CH
3
CH
3
: gaz, CH
3
CH
2
Cl : gaz, par contre CH
3
CH
2
Br et CH
3
CH
2
I : liquides.
2.2. Les fonctions organiques halognes
B. Exemples dhalognoalcanes
H
3
C I
iodomthane
CHCl
3
trichloromthane
(chloroforme)
Cl
Br Cl
Cl
Br
Halomon
F
Cl
F
F
Cl
Cl
Trichlorotrifluorothane
CFC-113
F
F
F
F
* *
n
Polyttrafluorothne (PTFE)
Tflon
Cl
*
Cl
*
n
n
Chlorure
de vinyle
PVC
2.3. Les fonctions organiques oxygnes
A. La liaison simple CO
Trois grandes classes de composs possdent des liaisons simples CO : les
alcools, les phnols et les theroxydes. Ces composs peuvent tre considrs
comme des drivs de leau dans laquelle un ou deux atomes H ont t substitus.
O
H H
O
CH
3
H
3
C
O
H H
3
C
O
H
mthoxymthane
theroxyde
phnol
phnol
mthanol
alcool
Oxygne hybrid sp
3
(gomtrie ttradrique)
A.1. Les alcools
C OH
Alcools = hydrocarbures dont un atome H a t
remplac par un groupement hydroxyle (OH).
Atome de C devant tre hybrid sp
3
2.3. Les fonctions organiques oxygnes
A.1. Les alcools (suite)
Bien que fortes, les liaisons CO et OH seront
trs ractives (polarit + doublets non liants de
loxygne).
Les liaisons CO et OH sont polarises (lectrongativit : C,H < O).
C O
H

+
'

'
+
Proprits des alcools
Les alcools jouent le rle dacides dans les couples ROH / RO
-
(RO
-
: alcoolate, R : groupement
alkyle). Ce sont des acides indiffrents dans leau (pKa > 14).
Les alcools peuvent galement agir en tant que bases dans les couples ROH
2
+
/ ROH. Ce sont
des bases indiffrentes dans leau (pKa < 0).
Classement des alcools
H
3
C
C
OH
CH
3
H
3
C
propan-2-ol
isopropanol
H
3
C
OH
H
3
C
H
2
C
OH
H
3
C
CH
OH
CH
3
mthanol
thanol
mthylpropan-2-ol
tertiobutanol
Alcool primaire
Alcool secondaire
Alcool tertiaire
2.3. Les fonctions organiques oxygnes
A.1. Les alcools (suite)
Exemples :
Production dthanol par fermentation
levure
H
3
C C
O
C
O
O
-CO
2
H
3
C C
O
H
thanal
CH
3
CH
2
OH
thanol
rduction
dcarboxylation
glucose anion 2-oxopropanoate
(pyruvate)
2
2 2
C
6
H
12
O
6
OH
menthol
HO
Vitamine D3
HO
Cholestrol
OH
prop-2-n-1-ol
OH
propn-2-ol
Attention
il ne sagit
pas dun
alcool (nol)
sp
2
2.3. Les fonctions organiques oxygnes
A.2. Les phnols
Ar O
H
Phnols = composs aromatiques (Ar) portant un groupement
hydroxyle OH (si plusieurs OH : polyphnols).
O
Les phnols sont plus acides que les alcools (stabilisation de lion phnolate
par msomrie).
OH
O
Couple acidobasique :
Formes msomres de lion phnolate
Hybride de
rsonance
Base conjugue du phnol stabilise acidit plus importante du phnol
O O
O O
2.3. Les fonctions organiques oxygnes
A.2. Les phnols (suite)
Exemples :
HO
OH
Estradiol
HO
O
H
N
O
(E)-Capsacine
(E)-8-mthyl-N-vanilly-trans-6-nonenamide
OH
HO
OH
trans-resvratrol
(raisin)
OH
NO
2
O
2
N
NO
2
Acide picrique
2,4,6-trinitrophnol
HO
HO
HN
OH
Adrnaline ou pinphrine
(R)-4-(1-hydroxy-2-(mthylamino)thylbenzne-1,2-diol)
COOH
OH
COOH
O
O
acide salicylique
acide ortho-hydroxybenzoque
Aspirine
2.3. Les fonctions organiques oxygnes
A.3. Les theroxydes
C O
C
Ethroxydes (ou thers) : proprits proches des
alcools (prsence doublets libres de latome O).
Atomes de C devant tre hybrids sp
3
Exemples :
O
oxacyclopentane
ttrahydrofurane (THF)
O
thoxythane
ther dithylique
O
O
O
O
O
O
K
thers couronnes
18C6
Charles J. Pederson, Jean-Marie Lehn,
Donald J. Cram : Prix Nobel de chimie en
1987 pour leurs travaux sur les molcules
dont la structure permet des intractions
spcifiques avec une haute slectivit
(reconnaissance molculaire).
2.3. Les fonctions organiques oxygnes
A.4. Autres fonctions comprenant une liaison simple CO
Ar O
H
C O
C
C OH
C OH
HO
C OH
O
R
C O
O
R
R'
Rappel
Hydrate Hmiactal Actal
Ne surtout pas confondre ces fonctions avec des alcools ou theroxydes!!
Exemples :
R, R = chanes carbones
hydrate
hmiactal
actal
Cl
3
C
O
H
H
2
O
Cl
3
C CH
OH
OH
Chloral
trichloroactaldhyde
Chloral hydrate
2,2,2-trichlorothane-1,1-diol
O
HO
HO
OH
HO
OH
-D-glucopyranose
O
O
O
OH
12
Aculatine
2.3. Les fonctions organiques oxygnes
B. La liaison double C=O
O
Y
X
Atomes O et C hybrids sp
2
Formule gnrale des carbonyles (C=O).
Dans cette famille, diffrentes fonctions existent
suivant la nature des groupements X et Y.
Exemples :
O
H
R
aldhyde
R = H ou chane carbone
O
R'
R
ctone
R, R = chanes carbones
O
H
OH
OH
OH
OH
OH
hexose
O H
11-cis-rtinal
H
O
benzaldhyde
O
H
H
mthanal
formaldhyde
O
camphre
O
damascnone
O
cis-jasmone
2.3. Les fonctions organiques oxygnes
B. La liaison double C=O (suite)
O
HO
R
O
Cl
R
O
R'O
R
O
O
R
R'
O
O
R'S
R
Acide
carboxylique
Ester
Chlorure dacyle
(chlorure dacide)
Anhydride
dacide
Thioester
Thio :
prsence
de soufre
O
N
R
R''
R'
Amide
Exemples :
R, R = chanes carbones
R, R = H ou chanes carbones
Lactame (amide intracyclique)
Lactone (ester intracyclique)
N
S
CO
2
H
O
H
N
O
Pnicilline G
acide
amide N
N
N
N
NH
3
O
O
P O
O
-
OH
O
P
O
O
P
O
O
N
H
OH
OH OH
OH
O
NH O
S
O
Actyl co-enzyme A
amide
amide
thioester
O
OH
Ibuprofne
acide
N
COOH
Acide nicotinique
acide
CH
3
C CH
2
COOCH
3
n
Poly(mthacrylate de mthyle)
PMMA (plexiglas)
ester
O
O
actate disopentyle
(arome de banane)
ester
Liaison
peptidique
R
3
N H O
H
2.3. Les fonctions organiques azotes
A. La liaison simple CN : la fonction amine
Amines = drivs de lammoniac dont un ou plusieurs
H sont remplacs par des chanes carbones.
Atome N devant tre hybrid sp
3
C N
R
R'
R, R = H ou chanes carbones
Les liaisons CN et NH sont polarises (lectrongativit : C,H < N) + doublet libre sur N.


+
Proprits des amines
Les amines sont basiques (doublet libre sur N).
H NR
2
O
H
H
R
3
N H OH
R
3
N H
OH
amine cation
ammonium
Basicitcroissantedesamines
NH
3
CH
3
NH
2
(CH
3
)
2
NH
N
R
R''
R'
Effets inductifs donneurs
des chanes carbones
2.3. Les fonctions organiques azotes
A. La liaison simple CN : la fonction amine (suite)
Classement des amines
Amine primaire
Amine secondaire
Amine tertiaire
N
R
H
H
N
R
R'
H
N
R
R'
R''
N
R'''
R
R'
R''
Sel dammonium
quaternaire
Remarque : ce nest pas la mme
dfinition que pour les alcools (on prenait
en compte le C portant lhydroxyle, ici cest
directement le N).
Exemples :
N
OH
choline
NH
2
amphtamine
Amine I
N
O
OH
O
HN
O
O
Quinapril
(Accupril)
Amine II
N
N
nicotine
Amine III
N
OH
N
O
quinine
Amine III
O
N
mthadone
Amine III
Amide
pyrrolidine
quinoline
pyridine
2.3. Les fonctions organiques azotes
B. La liaison double C=N : la fonction imine
C N
R''
R' R
Imines
Si R = alkyl ou aryl, on peut parler de bases de Schiff (imines stables).
Atomes de C et N devant tre hybrids sp
2
Exemples :
R, R , R = H ou chanes carbones
N
polyzonimine
O
N
H
Cl
O
N
H
Cl
N-(3-chlorophnyl)-2-hydroxy-1-naphthaldimine
nolimino ctoamino
Proprits photochromiques et thermochromiques ltat solide
Tautomrie : raction chimique rversible
faisant intervenir le dplacement concomitant
dun atome dhydrogne et dune liaison
(proportion des tautomres dpend du pH, du
solvant, de la temprature).
Tautomrie
nol- cto-
-imino
-amino
2.4. Autres htroatomes
A. Le soufre
Soufre hybrid sp
3
(gomtrie ttradrique)
S
H
R
Thiol
(mercaptan)
S
R'
R
Thiother
S
H
Ar
Thiophnol
S
R' S
R
Disulfure
Exemples :
HS OH
O
NH
2
Cystine
acide (R)-2-amino-
3-sulfanylpropanoque
S
Allylmthyl thiother
3-(mthylsulfanyl)prop-1-ne
H
N
OH
O
O
N
H
SH
O
NH
2
HO
O
glutathion
O
OH
S
S
Acide lipoque
S
S
H
2
N COOH
COOH H
2
N
Cystine
SH
3-mthylbut-2-ne-1-thiol
(jet de moufette)
O
OH
NH
2
S
mthionine
HS 2-(4-mthylcyclohex-
3-nyl)propane-2-thiol
(pamplemousse)
2.4. Autres htroatomes
B. Le phosphore
Ion phosphate : PO
4
3
H
3
PO
4
Acide phosphorique Ion dihydrognophosphate Ion hydrognophosphate Ion phosphate
H
2
PO
4

HPO
4
2
PO
4
3
+ H + H + H
proprits acido-basiques
formules msomres
pK
a1
= 2,1 pK
a2
= 7,2 pK
a3
= 12
HO
P
O
OH
OH
O
P
O
OH
OH
O
P
O
O
OH
O
P
O
O
O
O
P
O
O
O
O
P
O
O
O
O
P
O
O
O
O
P
O
O
O
2.4. Autres htroatomes
B. Le phosphore (suite)
Phosphoester
monophosphate
O
P
O
O
O
R
diphosphate
O
P
O
O
O P
O
O
O
R
triphosphate
O
P
O
O
O P
O
O
O
R
P
O
O
O
Phosphodiester
R
O
P
O
O
O R'
Phosphotriester
R
O
P
O
O
O R'
R''
Acylphosphate
O
P
O
O
O
O
R
CQFR
1. Les hydrocarbures
2. Les fonctions organiques
Savoir identifier et nommer les fonctions organiques cites dans le cours.
Savoir reconnatre un alcane, alcne, alcyne ou aromatique.
Connatre les caractristiques lies ces familles de compos (insaturations,
position particulire des substituants sur un cycle driv du benzne).
1) Parmi ces composs, lesquels sont aromatiques (pensez ventuellement prendre en compte les
doublets non liants)?
2) Dterminez le nombre dinsaturations portes par les composs suivants :
3) Soit un cycle benznique avec deux substituants CH
3
en position 1 et 3. Sagit-il du para-
dimthylbenzne, de lortho-dimthybenzne ou du mta-dimthylbenzne?
4) Donnez la formule brute des 7 molcules reprsentes ci-dessus.
Exercices dapplication
O
H
N
N
Exercices dapplication
5) Identifiez et nommez les fonctions prsentes sur les molcules ci-dessous :
H
O
O
O
O HO
O
O O
HO
OH
O
N
S
O
HO
N
H
NH
2
Srotonine
(neuromodulateur du systme nerveux central)
Cinnamaldhyde
(composant principal de lessence de cannelle)
Epothilone A
(produit bactrien naturel possdant une activit
anticancreuse plus puissante que celle du taxol)
Mvastatine
(mtabolite fongique inhibant lenzyme qui contrle
la biosynthse du cholestrol)
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