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AFC 2013

Colloque de
lAssociation Franaise
de Cristallographie
Bordeaux 2 5 juillet


Programme et rsums
- 2 -
- 3 -
Chres et chers collgues,

Nous vous souhaitons la bienvenue au Congrs AFC2013 de l'Association
Franaise de Cristallographie, qui se tiendra dans la belle ville de
Bordeaux qui avait dj accueilli le Congrs de l'IUCr en 1990.

Le Comit Scientifique a organis un programme riche et vari de
confrences plnires, de sessions thmatiques ou interdisciplinaires et de
rencontres autour de posters. Les scientifiques de nombreuses disciplines
utilisant la cristallographie ou la cristallogense dans leurs recherches
pourront y dcouvrir les rsultats les plus rcents et partager leurs points
de vue.

L'AFC a pour tradition de mettre l'honneur les jeunes chercheurs, qu'elle
soutient par des prix et des bourses. L'AFC2013 sera l'occasion de la
remise du prix de Thse nos laurats 2012, qui y prsenteront leurs
travaux. Un jury slectionnera galement les meilleurs posters, qui
l'AFC remettra un prix. A noter cette anne une initiative indite, "Meet
the experts", o doctorants et jeunes chercheurs sont invits venir
rencontrer des chercheurs confirms et leur poser toutes les questions qui
leur tiennent cur.

Nous comptons sur votre prsence l'Assemble Gnrale, un vnement
majeur de la vie de notre Association. Le Conseil d'Administration vous y
prsentera le bilan de sa mandature qui s'achve et changera avec vous
sur les perspectives futures, en particulier les prparatifs de l'Anne
Internationale de la Cristallographie en 2014.

Le Comit d'Organisation a enfin dploy tous ses efforts pour complter
ce programme par des soires conviviales, qui devraient achever, nous
l'esprons, de faire de l'AFC2013 Bordeaux un "Grand Cru" tous les
gards.

Au plaisir de vous y retrouver en personne,

Jacqueline Cherfils, Prsidente du Comit Scientifique
Alain Dautant, Prsident du Comit d'Organisation

- 4 -

Remerciements

Le comit local dorganisation tient remercier tout spcialement toutes celles
et ceux sans qui ce congrs naurait pas t possible :

Martine Galian, Catherine Alves-Magalhaes Isabelle Nicolas, (Service de
Gestion de lIBGC),

Lydie Goutire (Services gnraux de lIBGC),

Axel Catouillart et Jean Baptiste Maurange (Service informatique de lIBGC),

Annie Nadeau et Guillaume Moissonni (Cellule Colloque la DR 15 du
CNRS),

Jean-Louis Hodeau (Grenoble) qui vous a propos lexposition dans le Hall de
lENSCBP,

Mireille Frimigacci (Responsable HSE, ENSCBP),

Marie Hnault (Responsable Cellule Congrs de lUniversit Bordeaux
Segalen),

lAFC et le conseil scientifique de lAFC 2013,

les chairs et les co-chairs pour lorganisation des sessions,

les confrenciers qui ont bien voulu accepter linvitation,

les organismes qui nous ont soutenus,

les partenaires,

et tous les participants au congrs de lAFC 2013.


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Le Comit Scientifique

Jacqueline Cherfils, prsidente (LEBS, Gif, AFC)
Ren Guinebretire, vice-prsident (SPCTS, Limoges, AFC)
Nathalie Audebrand (ESI, Rennes)
Yves Bourne (AFMB, Marseille)
Alain Dautant (IBGC, Bordeaux)
Denis Gratias (ONERA, Paris)
Ivan Huc (IECB, Bordeaux)
Jean-Paul Iti (Soleil, AFC)
Mario Maglione (ICMCB, Bordeaux)
Claudine Mayer (Pasteur, Paris, AFC)
Olivier Perez (ENSI, Caen, AFC)


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Le Comit Local dOrganisation

Alain Dautant, prsident (IBGC, CNRS)
Pierre Dechambenoit (CRPP, UB1)
Stephan Dubernet (IRAMAT-CRP2A, UB3)
Sbastien Fribourg (IECB-ARNA, INSERM)
Bernard Gallois (CBMN, CNRS)
Philippe Guionneau (ICMCB, UB1)
Elizabeth Hillard (CRPP, CNRS)
Ivan Huc (IECB-CBMN, CNRS)
Brice Kauffmann (IECB, CNRS)
Aline Lacoudre (ISM, UB1)
Eric Lebraud (ICMCB, CNRS)
Stphane Massip (Facult de Pharmacie, UBS)
Denise Mondieg (LOMA, UB1)
Stanislas Pechev (ICMCB, CNRS)
Thierry Toupance (ISM, UB1)

- 7 -
Organismes soutenant le congrs
- 8 -
LAssociation Bordelaise de Cristallographie
www.abc.u-bordeaux1.fr

La Rgion Aquitaine
region.aquitaine.fr

AVIESAN
www.aviesan.fr

LUniversit de Bordeaux 1
www.u-bordeaux1.fr

LUniversit Bordeaux Segalen
www.univ-bordeauxsegalen.fr

CNRS Dlgation rgionale Aquitaine
www.cnrs.fr

Le CROUS de Bordeaux
www.crous-bordeaux.fr

La CUB - Communaut Urbaine de Bordeaux
www.lacub.fr

Le Conseil Gnral de Gironde - CG33
www.gironde.fr

LIBGC
www.ibgc.cnrs.fr

LINSERM
www.inserm.fr

LIPB ENSCBP
www.enscbp.fr

LOffice de Tourisme de Bordeaux - OTB
www.bordeaux-tourisme.com

TransBioMed
www.transbiomed.u-bordeaux2.fr
Organismes soutenant le congrs
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Partenaires
- 10 -

www.sourcedesabatilles.com

genomics.agilent.com



www.bruker.com

www.dectris.com


www.dutscher.com

www.dunnlab.de


www.elexience.fr

www.exploranova.com


www.inel.fr

www.moleculardimensions.com
Partenaires
- 11 -

www.mitegen.com
www.natx-ray.com



www.oxcryo.com

www.panalytical.com


www.rigaku.com

www.stoe.com



www.xenocs.com

Journal des sessions
- 12 -
Mardi 2 juillet
1A Matriaux fonctionnels (1) 15h00 16h30 A
MARIO MAGLIONE et CHRISTINE MARTIN
1B Surfaces et interfaces 15h00 16h30 B
GILLES RENAUD et DAVID BABONNEAU
1C Nouvelles structures en biologie 15h00 16h30 C
MIRJAM CZJZEK et LIONEL MOUREY
2A Chimie supramolculaire et Ingnierie molculaire 17h00 18h30 A
NATHALIE GUILLOU et IVAN HUC
2B Cristallographie pour les nanosciences 17h00 18h30 B
RENE GUINEBRETIERE et VALERIE DEMANGE
2C Enzymologie et dynamique 17h00 18h30 C
HERMAN VAN TILBEURGH et GERLIND SULZENBACHER
Mercredi 3 juillet
3A Croissance cristalline (GFCC) 10h30 12h00 A
ALAIN IBANEZ et FRANOISE BONNETE
3B Cristallographie rsolue en temps 10h30 12h00 B
MARYLISE BURON et SYLVAIN RAVY
3C La cristallographie sous conditions extrmes 10h30 12h00 C
ERIC GIRARD et JEAN-PAUL ITIE
4A Matriaux fonctionnels (2) 13h30 15h00 A
MARIO MAGLIONE et CHRISTINE MARTIN
4B Apriodicit, Structure module 13h30 15h00 B
BERTRAND TOUDIC et DENIS GRATIAS
4C Biologie structurale des gnomes 13h30 14h40 C
CLAUDINE MAYEr et ANNE-CATHERINE DOCK-BREGEON
4D Formation ReNaFoBis 14h40 15h00 C
JEAN CAVARELLI
Jeudi 4 juillet
5A Approches multitechniques en cristallochimie 10h30 12h00 A
NATHALIE AUDEBRAND et PASCAL ROUSSEL
5B Densit lectronique, modlisation 10h30 12h00 B
PHILIPPE RABILLER et MARIE-BERNADETTE LEPETIT
5C Cristallographie biologique et Sant 10h30 12h00 C
YVES BOURNE et MAGALI MATHIEU
6A/B Mthodes mergentes en cristallographie 13h30 15h15 A
OLIVIER PEREZ ET DAVID LE BOLLOC'H
6C Biologie Structurale Intgrative et gros assemblages 13h30 15h15 C
DINO MORAS et JACQUELINE CHERFILS
Vendredi 5 juillet
7A Cristallographie in situ, in operando 9h00 10h30 A
ERIK ELKAM ET BEATRICE GILLON
7B Texture, Microstructure, dformation 9h00 10h30 B
ALAIN LODINI ET DANIEL CHATEIGNER
7C GI Synchrotron et plateformes en biologie structurale 9h00 10h30 C
ANDREW THOMPSONet MICHEL KOCHOYAN
8A Chiralit, polymorphisme 11h00 12h30 A
GERARD COQUEREL et CHRISTIAN JARRY
8B De l'ordre local l'ordre longue distance 11h00 12h30 B
PIERRE-ANTOINE ALBOUY; ET PAULINE MARTINETTO
8C Dfis en cristallographie biologique - Success stories. 11h00 12h30 C
PHILIPPE DUMAS ET JULIE MENETREY

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Programme


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Programme
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Mardi 2 juillet

10h00 14h00 Accueil et enregistrement des participants Hall de lENSCPB

Repas

12h00 13h30 Djeuner dans le hall de lENSCBP

13h30 14h00 Discours inauguraux et de bienvenue
ALAIN DAUTANT ; Prsident du comit local dorganisation
JACQUELINE CHERFILS ; Prsidente de lAssociation Franaise de Cristallographie

* * * * * * * * * * Confrence plnire I * * * * * * * * *
14h00 15h00 Amphi C
Chair : RENE GUINEBRETIERE, vice prsident de lAFC

IVAN HUC ; CBMN & IECB, Bordeaux
SP1 - Les foldamres : une expansion de l'espace chimique base sur l'analyse des
structures.

= = = Session 1A Matriaux fonctionnels (1)= = =
15h00 16h30 Amphi A

Chair : MARIO MAGLIONE; ICMCB, Bordeaux
Co-chair : CHRISTINE MARTIN; ENSI, Caen

15h00 CHRISTOPHE PAYEN; Institut des Matriaux Jean Rouxel, Nantes
O1 - Relations structure-magntisme dans le compos magnto-lectrique MnWO
4
.
15h30 JULIEN ROBIN; Institut des Sciences Chimiques Universit de Rennes 1
O2 - Synthse et structures cristallines de nouveaux polymres de coordination
chiraux base de fluorne pour la sparation et la catalyse nantioslective.
16h00 16h30 JEROME ROUQUETTE; CNRS Universit de Montpellier II
O3 - Origine de la fatigue ferrolectrique dans le zirconate-titanate de Plomb PZT.


= = = Session 1B Surfaces et interfaces = = =
15h00 16h30 Amphi B

Chair : GILLES RENAUD; ESRF, Grenoble
Co-Chair : DAVID BABONNEAU; Universit de Poitiers

15h00 YVONNE SOLDO-OLIVIER; LEPMI, Grenoble
O4 - SXRD in situ couple llectrochimie : tude de llectro-insertion dhydrogne
dans des nanofilms de Pd.
15h30 ALESSANDRO COATI; Synchrotron SOLEIL, Gif-sur-Yvette
O5 - Surfaces vicinales : des nano-gabarits pour croissance pitaxiale.
Programme
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16h00 GABIN GBABODE; Universit de Rouen
O6 - Mise en vidence de phases induites par le substrat pour des msognes -
conjugus.
16h15 16h30 RENE GUINEBRETIERE; ENS de Cramique Industrielle, Universit de
Limoges
O7 - Etude de surfaces vicinales ordonnes par diffusion centrale des rayons X sous
incidence rasante. Nouveaux dveloppements sur la ligne BM02 lESRF.

= = = Session 1C Nouvelles structures en biologie = = =
15h00 16h30 Amphi C

Chair : MIRJAM CZJZEK; Station Biologique, Roscoff
Co-chair : LIONEL MOUREY; IBPS, Toulouse

15h00 MARIE-CHRISTINE VANEY; Institut Pasteur, Unit de Virologie Structurale Paris
O8 - Structure de l'ectodomaine de la glycoprotine d'enveloppe E1, dans sa forme
post-fusion, du virus de la Rubole.
15h30 SEBASTIEN FRIBOURG; Institut Europen de Chimie et Biologie, Bordeaux
O9 - Bases structurales de l'initiation de la transcription de l'ARN polymerase III.
16h00 CORALIE BOMPARD; Universit Lille 1
O10 - Analyse structurale par SAXS de SopB, un effecteur de type III de Salmonella
en complexe avec sa chaperonne spcifique SigE.
16h15 16h30 PASCAL ARNOUX ; CEA Cadarache
O11 - Bases structurales et fonctionnelles de la biominralisation de la magntite :
importance des domaines magntochromes.

Tout le monde rencontre tout le monde

16h30 17h00 Pause caf sponsorise par lABC Rencontre avec les partenaires
industriels Salle ChemInnov.

= = = Session 2A Chimie supramolculaire et Ingnierie molculaire = = =
17h00 18h30 Amphi A

Chair : NATHALIE GUILLOU; Institut Lavoisier, Versailles St-Quentin-en-Yvelines
Co-chair : IVAN HUC; CBMN & IECB, Bordeaux

17h00 NICOLAS MERCIER; MOLTECH-Anjou, Universit d'Angers
O12 - Analyse structurale dhybrides organique-inorganique et relations structure-
proprits : limportance de linterface et des liaisons faibles.
17h30 JONATHAN NITSCHKE; Cambridge University
O13 - Crystallography as a critical resource in metal-organic self assembly.
18h00 MARC FOURMIGUE; Universit de Rennes 1
O14 - La liaison halogne pour l'laboration d'architectures complexes: contribution
lectrostatique et rseaux d'anions (2D, 3D).
18h15 18h30 CLEMENT FALAISE; UCCS
O15 - Les carboxylates duranium ttravalents : prcurseurs du combustible nuclaire.
Programme
- 17 -

= = = Session 2B Cristallographie pour les nanosciences = = =
17h00 18h30 Amphi B

Chair : RENE GUINEBRETIERE; Universit de Limoges
Co-chair : VALERIE DEMANGE; Institut des Sciences Chimiques de Rennes, Rennes 1

17h00 ANNICK LOISEAU; Laboratoire d'Etude des Microstructures ONERA CNRS
O16 - Structure des nanostructures de nitrure de bore: quel impact sur leurs proprits
de luminescence ?
17h30 ETIENNE SNOECK; CEMES, Toulouse
O17 - Imagerie des champs de dformations par holographie lectronique.
18h00 PASCALE LAUNOIS, CRM2, Universit Paris Sud
O18 - Structuration de leau pendant le remplissage des nanotubes de carbone.
18h15 18h30 DOMINIK SCHANIEL, CRM2, Universit Nancy 1
O19 - Structure et dynamique de molcules isoles dans des matrices poreuses.

= = = Session 2C Enzymologie et dynamique.= = =
17h00 18h30 Amphi C

Chair : HERMAN VAN TILBEURGH; IBBMC, Universit Paris-Sud, Orsay
Co-chair : GERLIND SULZENBACHER; AFMB, Marseille

17h00 AUDE ECHALIER-GLAZER; CBS, Montpellier
O20 - Activation et activit du complexe COP9 signalosome.
17h30 MURIEL GONDRY; CEA, Saclay
O21 - Les synthases de cyclodipeptides (CDPS), des homologues daminoacyl-ARNt
synthtases impliques dans la synthse peptidique non ribosomale.
18h00 JULIEN HIBLOT; Facult de Mdecine Marseille
O22 - Promiscuit enzymatique lactonase/phosphotriestrase : implications volutives
et biotechnologiques.
18h15 18h30 VALERIE CAMPANACCI; LEBS Gif-sur-Yvette
O23 - Aperu structural du mcanisme enzymatique dAnkX, une protine de
Legionella pneumophila modifiant la petite protine G Rab.

Tout le monde rencontre tout le monde

18h30 20h30 Soire daccueil dans le hall de lENSCBP
Programme
- 18 -
Programme
- 19 -
Mercredi 3 juillet


* * * * * * * * * * Confrence plnire II * * * * * * * * *
9h00-10h00 Amphi C

Chair : JACQUELINE CHERFILS, prsidente de lAFC

9h00-10h00 Amphi C - RAY STEVENS, Department of Molecular Biology, Scripps, USA
SP2 - The Amazing Diversity of the Human GPCR Superfamily.


Tout le monde rencontre tout le monde

10h00 10h30 Pause caf Rencontre avec les partenaires industriels Salle ChemInnov.


= = = Session 3A Croissance cristalline (GFCC) = = =
10h30 12h00 Amphi A

Chair : ALAIN IBANEZ; Institut Nel, Grenoble
Co-chair : FRANOISE BONNETE, Universit d'Avignon et des Pays de Vaucluse

10h30 VALENTIN GORDELIY; IBS Grenoble
O24 - Cristallisation des protines membranaires in cubo.
11h00 PASCAL LOISEAU; Chimie Paris Tech / ENSCP Paris
O25 - Croissance, Structure et Optique Non Linaire Quadratique.
11h30 MARJORIE ALBINO; ICMCB Bordeaux
O26 - Etude structurale par diffraction des rayons X sur monocristaux relaxeurs de
Ba
2
LnFeNb
4
O
15
(Ln=La, Pr, Nd, Sm et Eu).
11h45 12h00 PIERRE GRAS; ENSIACET Toulouse
O27 - Synthse, caractrisation et croissance cristalline de cristaux de pyrophosphate
de calcium dintrt biologique.

= = = Session 3B Cristallographie rsolue en temps = = =
10h30 12h00 Amphi B

Chair : MARYLISE BURON; Universit Rennes 1
Co-chair : SYLVAIN RAVY; CRISTAL, Synchrotron SOLEIL

10h30 CAROLINE CURFS; ESRF, Grenoble
O28 -Etudes par Diffraction Rsolue en Temps de Phnomnes Irrversibles:
Application aux Synthses Auto-Propages.
11h00 PAUL BEAUD; SLS (Swiss Light Source)
O29 - Ultrafast structural dynamics in charge and orbitally ordered manganites under
non-equilibrium conditions.
Programme
- 20 -
11h30 12h00 CLAIRE LAULHE; Synchrotron-soleil
O30 - Diffraction pompe-sonde rsolue en temps sur la ligne de lumire CRISTAL
SOLEIL.

= = = Session 3C La cristallographie sous conditions extrmes = = =
10h30 12h00 Amphi C

Chair : ERIC GIRARD; IBS, Grenoble
Co-chair : JEAN-PAUL ITIE; Synchrotron SOLEIL

10h30 JULIEN HAINES; Institut Charles Gerhardt, Montpellier
O31 - Diffraction des rayons X sur monocristaux sous pression : application ltude
de structures complexes.
11h00 LOUISE LASSALLE; IBS Grenoble
O32 - Molecular basis of piezophilic adaptation.
11h20 NATHALIE COLLOC'H; CNRS CEA Universit de Caen, Centre Cyceron
O33 - Structure cristallographique de la neuroglobine sous pression.
11h40 12h00 PHILIPPE GUIONNEAU; ICMCB Bordeaux
O34 - Haute pression et cristallographie des matriaux molculaires conversion de
spin.

Repas

12h00-13h30 Djeuner dans le hall de lENSCBP


= = = Session 4A Matriaux fonctionnels (2)= = =
13h30 15h00 Amphi A

Chair: MARIO MAGLIONE; ICMCB, Bordeaux
Co-chair: CHRISTINE MARTIN; ENSI Caen

13h30 MATHIEU ALLIX; CEMHTI, Orlans
O35 -Cramiques transparentes par cristallisation complte du verre.
14h00 JEAN-MICHEL RUEFF; ENSI Caen
O36 -Matriaux hybrides base dargent et dacides phosphoniques et carboxyliques :
exploration de nouvelles architectures proprits bactricides.
14h20 LIANG TAO; Universit de Picardie
O37 - Crystal and Magnetic Structure of LiMBO
3
(M=Fe, Co, Mn).
14h40 15h00 ARNAUD GROSJEAN; ICMCB Bordeaux
O38 -Matriaux polymriques conversion de spin de type [Fe(R-trz)
3
]Xn:
Comportement structural et microstructural.

Programme
- 21 -
= = = Session 4B Apriodicit, Structure module = = =
13h30 15h00 Amphi B

Chair : BERTRAND TOUDIC; GMCM, Rennes
Co-chair : DENIS GRATIAS; ONERA, Chatillon

13h30 BERTRAND DEVOUARD; Observatoire de Physique du Globe, Clermont-Ferrand
O39 -Structures naturelles apriodiques et multimacles icosadriques. (30 min)
14h00 MARIANNE QUIQUANDON; LEM CNRS/ONERA, Chatillon
O40 - Etude de la filiation structurale entre les phases icosadriques F (Faces
Centres) et P (Primitives).
14h20 SYLVAIN RAVY; Synchrotron SOLEIL
O41 - L'homomtrie la lumire des faisceaux cohrents.
14h40 15h00 WERNER PAULUS; Institut Charles Gerhard, Universit de Montpellier 2
O42 - Limpact des corrlations structurales grande chelle pour la ractivit des
solides : l'exemple des oxydes AO(ABO
3
)n Ruddlesden-Popper.

= = Session 4C Biologie structurale des gnomes (interactions protines/ADN, ARN)= =
13h30 14h30 Amphi C

Chair : CLAUDINE MAYER; Institut Pasteur, Universit Paris 7, Paris
Co-Chair : ANNE-CATHERINE DOCK-BREGEON; ENS, Paris

13h30 MARIE-HELENE LE DU; Laboratoire de Biologie Structurale et Radiologie, CEA,
CNRS, Universit Paris Sud, Gif-sur-Yvette
O43 -Vers l'architecture du tlomre de la levure bourgeonnante par biologie
structurale intgrative.
14h00 VALERIE LAMOUR; IGBMC, Illkirch
O44 - Nouvelles informations sur le mcanisme de surenroulement de l'ADN obtenues
par cryo-microscopie lectronique d'une ADN gyrase complte.
14h20 14h40 JOANNA TIMMINS; IBS, Grenoble
O45 - Etudes structurales de la recombinaison homologue chez Deinococcus
radiodurans.

= = = 4D Formation ReNaFoBis = = =
14h40 15h00 Amphi C

Chair : JEAN CAVARELLI; IGBMC, Strasbourg

14h40 15h00 CLAUDINE MAYER; Institut Pasteur, Universit Paris 7
O46 - ReNaFoBis : Rseau National de Formation Doctorale en Biologie Structurale
Intgrative
Programme
- 22 -
* * * * * * * * * * Hommage Roger Fourme * * * * * * * * *
15h00 15h30 Amphi C

15h00 15h30 ERIC GIRARD; IBS, Grenoble
SP3 - Un hommage Roger Fourme



Tout le monde rencontre tout le monde

15h30 16h00 Pause caf Rencontre avec les partenaires industriels Salle ChemInnov.

16h00 17h00 Premire sance Poster




17h00 18h00 Transfert en TRAMWAY Ligne B
(Direction Bassins flot ou Claveau Station Victoire)

= = = = = = = = = = Confrence grand public = = = = = = = = =
Amphitatre Denigs
Universit Bordeaux Segalen
Place de la Victoire Bordeaux

18h00 : Photo de groupe sur le parvis de lUniversit de Bordeaux Segalen Site Victoire

18h15 Accueil par MANUEL TUNON DE LARA ; Prsident de lUniversit Bordeaux Segalen

18h25 AN-PANG TSAI, Tohoku University, Japan
SP4 - Quasicrystals : Structures, properties and applications

19h25 20h00 Rception dans latrium de lUniversit offert par lUniversit Bordeaux
Segalen
Programme
- 23 -
Jeudi 4 juillet


* * * * * * * * * * Confrence plnire III * * * * * * * * *
9h00-10h00 Amphi C
Chair : PASCAL ROUSSEL, vice-prsident de lAFC

MARC DE BOISSIEU, SIMAP, Grenoble
SP5 - Les quasicristaux : structure atomique et dynamique.

Tout le monde rencontre tout le monde

10h00 10h30 Pause caf Rencontre avec les partenaires industriels Salle ChemInnov.


= = = Session 5A Approches multitechniques en cristallochimie = = =
10h30 12h00 Amphi A

Chair : NATHALIE AUDEBRAND; Universit Rennes 1
Co-chair : PASCAL ROUSSEL; ENSC, Lille

10h30 PHILIPPE BOULLAY; CRISMAT, Caen
O47 - Combinaison des donnes de diffraction des lectrons et de diffraction des
rayons X poudre: que peut-on en attendre?
11h00 FLORENT BOUCHER; Institut des Matriaux Jean Rouxel, Nantes
O48 - Apport des calculs ab initio la rsolution des structures cristallines : intrt de
la modlisation en spectromtrie RMN et Mssbauer.
11h30 VALERIE DEMANGE; Universit de Rennes 1
O49 - Nanorods de niobates et niobo-tantalates de potassium pitaxis sur substrats
monocristallins : tude par diffraction des rayons X, diffraction des lectrons en
prcession et tomodiffraction des lectrons.
11h45 12h00 LUCY COOPER; Institut Lavoisier, CNRS Universit de Versailles St-
Quentin-en-Yvelines
O50 - Solides hybrides base de ligands dorigine naturelle : rsolution structurale via
une approche multitechnique diffraction / RMN .

= = = Session 5B Densit lectronique, modlisation = = =
10h30 12h00 Amphi B

Chair : PHILIPPE RABILLER; Universit de Rennes 1, Rennes
Co-Chair : MARIE-BERNADETTE LEPETIT; Institut Nel, Grenoble

10h30 NOUR EDDINE GHERMANI; Laboratoire Structures, Proprits de Modlisation des
Solides, Ecole centrale de Paris
O51 - Proprits lectrostatiques de molcules d'intrt pharmaceutique.
11h00 ALESSANDRO ERBA; Dipartimento di Chimica, Universit de Turin, Italie
O52 - Ab initio description of nuclear motion and dispersion effects on the electron
density matrix of crystals.
Programme
- 24 -
11h30 ENRIQUE ESPINOSA; CRM2, Universit de Lorraine
O53 - Les liaisons halogne et chalcogne pour l'ingnierie cristalline et la chimie
supramolculaire.
11h45 12h00 SAMIR BENTATA; Facult des Sciences et de la Technologie, Mostaganem,
Algrie
O54 - Ab-initio Study of structural, Electronic and Magnetic Properties of CdTe
Doped Transition Metal Co.

= = = Session 5C Cristallographie biologique et Sant = = =
10h30 12h00 Amphi C

Chair : YVES BOURNE; AFMB, Marseille
Co-chair : MAGALI MATHIEU, Sanofi, Chilly-Mazarin

10h30 WILLIAM BOURGUET; CBS, Montpellier
O55 - Mcanismes de reconnaissance et d'activation des rcepteurs hormonaux par les
perturbateurs endocriniens environnementaux.
11h00 THOMAS BERTRAND; Sanofi, Vitry sur Seine
O56 -Une approche structurale pour linhibition slective de PI3Kbeta.
11h20 VALERIE GUILLET; IPBS, Toulouse
O57 - Structure cristallographique de la protine FadD32 de Mycobacterium marinum,
une cible potentielle pour le dveloppement de nouveaux antituberculeux.
11h40 12h00 PASCALE MARCHOT; AFMB, Marseille
O58 - Toward closing the synaptic gap: a molecular approach to explore neuronal
connectivity deficiencies associated with autism.

Repas

12h00-13h30 Djeuner dans le hall de lENSCBP

= = =Session 6A/B Mthodes mergentes en cristallographie = = =
13h30 15h15 Amphi A

Chair : OLIVIER PEREZ; ENSI Caen
Co-chair : DAVID LE BOLLOC'H; LPS, Orsay

13h30 PIERRE BORDET; Institut Nel, Grenoble
O59 - Application de la Fonction de Distribution de Paires l'tude de matriaux
nano-cristallins ou mal ordonns.
14h00 JAN LNING; Universit Pierre et Marie Curie, Paris
O60 - Nouvelles possibilits exprimentales en physique introduites par les XFELs.
14h30 BERTRAND TOUDIC; GMCM, Rennes
O61 - Mthodes rapides pour analyser les dsordres structuraux statiques et
dynamiques dans limmense espace rciproque.


Programme
- 25 -
14h55 VINCENT JACQUES; LPS Universit Paris Sud
O62 - Dfauts de phase dans les cristaux lectroniques tudis par diffraction
cohrente des rayons X.
15h15 15h30 NICOLETA GALATANU; Xenocs
O63 - La socit Xenocs

= = = Session 6C Biologie Structurale Intgrative et gros assemblages = = =
13h30 15h15 Amphi C

Chair : DINO MORAS ; IGBMC, Illkirch
Co chair : JACQUELINE CHERFILS; LEBS, Gif-sur-Yvette

13h30 YVES MECHULAM; Ecole Polytechnique Palaiseau
O64 - Dmarrage de la traduction chez les eucaryotes et les arches : le facteur e/aIF2.
14h00 NICOLAS GARREAU DE LOUBRESSE; Equipe Marat Yusupov, IGBMC Strasbourg
O65 - Crystal structure of the eukaryotic 80S ribosome.
14h30 ZEINEB FOURATI-KAMMOUN; Ecole Polytechnique, Palaiseau et IBBMC, Orsay
O66 - Etude structurale et fonctionnelle de la protine Pat1 de Saccharomyces
cerevisiae.
14h50 LUDOVIC SAUGUET; Institut Pasteur, Paris
O67 - Dtermination des bases structurales du mcanisme de permation des ions chez
les rcepteurs-canaux pentamriques de la famille Cys-loop.
15h10 15h30 MARC RUFF; IGBMC, Illkirch
O68 - Etudes structurales et fonctionnelles du complexe de pr-intgration du VIH-1.

Tout le monde rencontre tout le monde

Meet the experts
15h30 16h00 Amphis A/B

Jeunes chercheurs, venez rencontrer et poser vos questions des chercheurs et diteurs de
l'AFC:
Comment choisir le "bon" journal ?
Comment rdiger une demande de financement ?
Etc

15h30 16h00 Pause caf Rencontre avec les partenaires industriels Salle ChemInnov.
16h00 17h00 Seconde sance Poster

= = = Assemble Gnrale de lAFC = = =
17h00 18h00 Amphi C

= = = Prix de thse 2012 de lAFC = = =
18h00 19h00 Amphi C

Confrences des trois Laurats des prix de l'AFC 2012.
Chair : ENRIQUE ESPINOSA ; Nancy
Programme
- 26 -
Chair : JACQUELINE CHERFILS; Prsidente de lAFC
Co-Chair : CLAUDINE MAYER; Vice-prsidente de lAFC
Co-Chair : RENE GUINEBRETIERE ; Vice-prsident de lAFC
Co-Chair : PASCAL ROUSSEL; Vice-prsident de lAFC


18h00 (GT Bio) - TRISTAN WAGNER ; Institut Pasteur, Paris
O69 - Contrle du mtabolisme central chez les mycobactries par la rgulation
allostrique de lalpha-ktoglutarate dshydrognase.
18h20 (GT Chimie) FLORIAN MOREAU; Laboratoire des Sciences Chimiques, Rennes
O70 - Cristallochimie de nouveaux polymres de coordination noyau spirobifluorne
ou ttraphnylmthane : du design du ligand la topologie et aux proprits du solide
hybrides.
18h40 19h00 (GT Physique) ERWAN PAINEAU; Institut National Polytechnique Lorraine,
Nancy
O71 - Transitions de phases cristal-liquides et comportement sous champs de
suspensions collodales d'argile naturelle.

19h00 20h00 Transfert en TRAMWAY Ligne B (direction Bassins flot ou Claveau,
Station CAPC)



20h00 23h00
Cit Mondiale du vin
Dner de Gala
Remise des prix des posters


Programme
- 27 -
Vendredi 5 juillet


= = = Session 7A Cristallographie in situ, in operando = = =
9h00 10h20 Amphi A

Chair: ERIK ELKAM; Synchrotron SOLEIL
Co-chair: BEATRICE GILLON; Laboratoire Lon Brillouin, CEA-CNRS, Saclay

9h00 MONICA CERETTI; Institut Charles Gerhardt, Montpellier
O72 - Structural complexity in (Re)
2
NiO
4+
: electrochemically controlled oxygen
intercalation reactions, explored by neutron and synchrotron scattering methods under
operando conditions.
9h30 LAURENCE CROGUENNEC; ICMCB, Bordeaux
O73 - Apport des tudes menes operando par diffraction et absorption des rayons X
la comprhension des mcanismes mis en jeu au sein des matriaux d'lectrode pour
batteries Li-ion.
10h00 10h20 OMAR KAMMOUN; Institut des Sciences Chimiques de Rennes
O74 - Structures lamellaires supramolculaires de sulfates hybrides : du design la
stabilit thermique et aux transitions de phases.

= = = Session 7B Texture, Microstructure, dformation = = =
9h00 10h30 Amphi B

Chair : ALAIN LODINI; LACM, Reims
Co-Chair : DANIEL CHATEIGNER; ENSI Caen

9h00 CHRISTOPHE WIERZBANOWSKI; Universit de Cracovie
O75 - Study of texture development in asymmetrically rolled titanium. Experimental
study and calculations.
9h30 VINCENT KLOSEK; CEA - LLB Saclay
O76 - Evolutions microstructurales et htrognits de dformation dans les aciers
ODS Fe-14Cr1W.
10h00 10h30 HLNE ROTELLA, ENSI Caen
O77 - Rsolution et affinement de structure dun film mince pitaxi de LaVO
3
.


= = = Session 7C Grands Instruments Synchrotron et plateformes
en biologie structurale - (Dveloppements, XFEL, nouveauts) = = =
9h00 10h30 Amphi C


Chair : ANDREW THOMPSON; Synchrotron SOLEIL
Co-Chair : MICHEL KOCHOYAN; CBS, Montpellier

9h00 JEAN DAILLANT; DSM/IRAMIS/SIS2M/LIONS CEA
O78 - La cristallographie SOLEIL.
Programme
- 28 -
9h30 Marie-EMMANUELLE COUPRIE; Synchrotron SOLEIL
O79 - FELs dans le monde, leurs proprits et avantages cf synchrotrons, et l'avenir
des projets en France.
9h50 JAN LNING; Universit Pierre et Marie Curie, Paris
O80 - Nouvelles possibilits exprimentales en cristallographie introduites par les
XFELs.
10h10 10h30 HASSAN BELRHALI; EMBL Grenoble
O81 - BM14-2: une ligne MX MAD lESRF avec de nouveaux outils pour exposer
des cristaux biologiques temprature ambiante.

Tout le monde rencontre tout le monde

10h30 11h00 Pause caf Rencontre avec les partenaires industriels Salle ChemInnov.

= = = Session 8A Chiralit, polymorphisme = = =
11h00 12h30 Amphi A

Chair : GERARD COQUEREL; TSHO, Rouen
Co-Chair : CHRISTIAN JARRY; Pharmacochimie, Universit Bordeaux Segalen

11h00 PHILIPPE ESPEAU; Laboratoire de Chimie Physique, Universit Paris Descartes
O82 - Formulations Pharmaceutiques et Polymorphisme
11h30 HOWARD D. FLACK; Genve, Suisse
O83 - Configuration absolue et structure absolue: notions de base et valuation.
12h00 12h30 PATRICK ROSA; ICMCB Bordeaux
O84 - Composs multifonctionnels : transition de spin et chiralit.

= = = Session 8B De l'ordre local l'ordre longue distance = = =
11h00 12h30 Amphi B

Chair : PIERRE-ANTOINE ALBOUY; LPS, Orsay
Co-chair : PAULINE MARTINETTO; Institut Nel, Grenoble

11h00 DOMINIQUE THIAUDIERE; Synchrotron SOLEIL
O85 - Apport du synchrotron pour des expriences combines DRX et XAS.
11h30 MICHELA BRUNELLI; ILL, Grenoble
O86 - Analyse par PDF (rayons X et neutrons) l'chelle nanomtrique des
inhomognits dans des oxydes de crium dops au rhnium.
12h00 12h30 CELINE MARIETTE; Institut de Physique de Rennes
O87 - Dsordre "quasi-liquide" de chaines d'alcane sous-confinement
subnanomtrique supramolculaire.






Programme
- 29 -


= = = 8C Dfis en cristallographie biologique - Success stories.= = =
11h00 12h30 Amphi C

Chair : Philippe Dumas; IBMC, Strasbourg
Co-chair : Julie Mntrey; LEBS, Gif-sur-Yvette

11h00 ANNE HOUDUSSE; Institut Curie
O88 - La myosine VI, un nanomoteur contre-sensMyosin VI.
11h25 JEAN-BAPTISTE CHARBONNIER; IBiTec, CEA Saclay
O89 - Control of the DNA mismatch repair and the meiosis recombination by
eukaryotic MutL homologs.
11h50 MIKAEL ELIAS; Weizmann Institute of Science, Rehovot Israel
O90 - La survie en milieu riche en arsniate : le mcanisme molculaire de
discrimination du phosphate.
12h10 12h30 JACQUELINE CHERFILS; LEBS, Gif-sur-Yvette
O91 - Integrated conformational and lipid-sensing regulation of ArfGEFs.



Repas

12h30-14h00 Djeuner dans le hall de lENSCBP



Clture de lAFC 2013


Au revoir
et
bientt

Programme
- 30 -


- 31 -









Rsums des
confrences plnires
SP1-5
et orales
O1-91


- 32 -

Session plnire I Mardi 2 juillet 14h00-15h00
- 33 -
SP1 - Les foldamres: une expansion de l'espace chimique base sur
l'analyse des structures

Ivan Huc

Universit de Bordeaux CNRS IPB UMR5248 (CBMN), Institut Europen de Chimie et
Biologie, 2 rue Robert Escarpit, 33600 Pessac, France.
i.huc@iecb.u-bordeaux.fr

Nous avons entrepris un programme de recherche dans le domaine des foldamres des
architectures molculaires artificielles replies dont le succs a repos trs largement sur
l'analyse des structures cristallographiques. Spcifiquement, nous avons dvelopp des
foldamres hlicodaux drivs d'acides amins aromatiques.
[1]
Certains de ces objets replis
prsentent une stabilit conformationnelle sans prcdent,
[2]
et constituent des briques
lmentaires bien dfinies pour l'laboration de structures replies artificielles de la taille de
petites protines (Fig. 1).
[3]
Ils possdent frquemment une forte propension s'assembler en
hlices double, triple voire quadruple.
[4]
Des cavits peuvent tre conues l'intrieur de ces
hlices qui leur confrent des proprits de rcepteurs artificiels
[5]
et de moteurs
molculaires.
[6]
Des analogues solubles dans l'eau de ces foldamres se montrent prometteurs
pour la reconnaissance d'acides nucliques et de protines.
[7]


Figure 1. A gauche et au centre: structure dans le cristal d'un grand foldamre constitu de
deux hlices de sens d'hlicit opposs orientes 90. A droite: la structure cristalline d'une
petite protine est montre la mme chelle pour en comparer la taille.

[1] G. Guichard, I. Huc, Chem. Commun. 2011, 47, 5933.
[2] H. Jiang, J.-M. Lger, I. Huc, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 3448; N. Delsuc, T.
Kawanami, J. Lefeuvre, A. Shundo, H. Ihara, M. Takafuji, I. Huc ChemPhysChem 2008, 9,
1882.
[3] N. Delsuc, J.-M. Lger, S. Massip, I. Huc Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 214; N.
Delsuc, S. Massip, J.-M. Lger, B. Kauffmann, I. Huc, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 3165.
[4] Q. Gan, C. Bao, B. Kauffmann, A. Grlard, J. Xiang, S. Liu, I. Huc, H. Jiang, Angew.
Chem. Int. Ed. 2008, 47, 1715; D. Haldar, H. Jiang, J.-M. Lger, I. Huc, Angew. Chem. Int.
Ed. 2006, 45, 5483.
[5] Y. Ferrand, A. M. Kendhale, B. Kauffmann, A. Grlard, C. Marie, V. Blot, M. Pipelier, D.
Dubreuil, I. Huc, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 7858.
[6] Q. Gan, Y. Ferrand, C. Bao, B. Kauffmann, A. Grlard, H. Jiang, I. Huc, Science 2011,
331, 1172.
[7] L. Delaurire, Z. Dong, K. Laxmi-Reddy, F. Godde, J.-J. Toulm, I. Huc, Angew. Chem.
Int. Ed. 2012, 51, 473.

1a - Matriaux fonctionnels (1) Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 34 -
O1 - Relations structure-magntisme dans le compos magnto-
lectrique MnWO
4


Christophe Payen
1
, Lynda Meddar
1
, Michael Josse
2
,

Pascaline Patureau
1
, Philippe
Deniard
1
,

Mario Maglione
2
, Franoise Damay
3
, Gilles Andr
3


1
Institut des Matriaux Jean Rouxel, Universit de Nantes - CNRS,
2
CNRS, ICMCB, Bordeaux,
2
LLB, CEA,CNRS

MnWO
4
est un compos magntolectrique de type II bien tudi depuis quelques
annes [1]. Cet oxyde de Mn
2+
(spin S=5/2) prsente une structure cristalline simple
(hubnerite ou wolframite) avec des chanes zigzag issues du partage dartes doctadres
MnO
6
distordus [2]. Trois phases magntiques sont prsentes basse temprature [3]. Une de
ces phases (AF2, entre T
1
= 7.5 K et T
2
= 12.5 K) associe une structure magntique
hlicodale incommensurable et une polarisation ferrolectrique spontane dans une direction
perpendiculaire aux chanes MnO
4
(phase multiferroque ). La succession d'tats
magntiques basse temprature est la consquence d'une comptition entre interactions
magntiques et anisotropie magntique locale. Il est possible de raliser des substitutions
chimiques du Mn
2+
ou du W
6+
par dautres mtaux de transition, ce qui ouvre des possibilits
de modulation des proprits.
Nous prsenterons diffrents travaux raliss pour comprendre les proprits
magntiques du compos MnWO
4
et celles des solutions solides issues des diffrentes
substitutions chimiques. Ltat multiferroque peut tre dstabilis ou stabilis selon le
type de substitution, les substitutions impliquant des modifications des interactions
magntiques et de lanisotropie magntique qui modulent les proprits magntiques.














[1] A.H. Arkenbout, Phys. Rev. B, 74, 184431 (2006) ; K. Taniguchi et al., Phys. Rev. Lett.
97, 097203 (2006) ; O. Heyer et al., J. Phys.: Condens. Matter 18, L471 (2006).
[2] H. Weitzel, Z. Kristallogr. Kristallgeom. Kristallphys. Kristallchem., 144, 238 (1976) ; J.
Macavei, H. Schulz, H., Z. Kristallogr. 207, 193 (1993).
[3] G. Lautenschlger et al., Phys. Rev. B, 48, 6087 (1993).
1a - Matriaux fonctionnels (1) Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 35 -
O2 - Synthse et structures cristallines de nouveaux polymres de coordination chiraux
base de fluorne pour la sparation et la catalyse nantioslective

Julien Robin

1
, Nathalie Audebrand
1
, Cyril Poriel
2
, Carmelo Prestipino
1


1
Equipe Chimie du Solide et Matriaux,
2
Equipe Matire Condense et Systmes Electroactifs.
Institut des Sciences chimiques de Rennes, UMR CNRS 6226, Universit de Rennes 1.

Les recherches sur les Metal Organic Frameworks (MOFs), ou polymres de
coordination, se sont largement dveloppes ces vingt dernires annes [1] et les applications
potentielles sont nombreuses notamment dans le domaine de lenvironnement (stockage et
sparation de gaz, dpollution des eaux). Les MOFs chiraux sont de plus en plus tudis
compte tenu de leurs proprits en catalyse htrogne et sparation nantioslective [2,3].
Nous avons synthtis trois ligands originaux cur fluorne sur lesquels ont t greffes
deux chanes chirales (Figure 1).

Figure 1 : Ligands chiraux cur fluorne synthtiss
La ractivit de ces ligands avec des sels mtalliques (Zn, Cu, Cd, Y, La) a t tudie
avec diffrentes conditions de synthses solvothermales. Les structures cristallines des MOFs
synthtiss ont t dtermines par diffraction des rayons X (DRX) par le monocristal. La
variation de la taille, de la gomtrie et de la connectivit du ligand a permis de contrler
linterpntration, la topologie, la dimensionnalit et la porosit des MOFs, comme lillustre
la Figure 2.

Figure 2 : Srie de MOFs au cuivre : a) [Cu L1H
2
O] porosit potentielle de 15% ; b) [Cu
2
(L2)
2

(DMF) (H
2
O)] porosit potentielle de 35% ; c) [Cu
4
(L3)
2
DMF (H
2
O)
3
] porosit potentielle de 60%.

La ractivit de ces MOFs a t tudie en particulier par DRX par les poudres in situ
avec des diffractomtres de laboratoire et le rayonnement synchrotron.
[1] L. R. MacGillvray, Metal-Organic Frameworks: Design and applications, John Wiley &
Sons, 2010.
[2] Y. Minyoung, S. Renganathan, and K. Kimoon, Chem. Rev, 2012, 112, 1196-1231.
[3] L. Jian-Rong, J. Sculley, and H. C. Zhou, 2012, Chem. Rev, 112, 869-932.
1a - Matriaux fonctionnels (1) Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 36 -
O3 - Origine de la fatigue Ferrolectrique dans le zirconate-titanate de
Plomb PZT

J. Rouquette,
1
M. Hinterstein,
2
J. Haines,
1
Ph. Papet,
1
M. Knap,
3
J. Glaum,
4
H. Fuess
5


1
Institut Charles Gerhardt UMR CNRS 5253 Equipe C2M, Montpellier cedex 5, France.
2
Institut fr Werkstffwissenschaften, Technische Universitt Dresden, Germany
3
CELLS-ALBA, Barcelona, Spain
4
School of Materials Science and Engineering, Australian
5
Institute for Materials Science, Technische Universitt Darmstadt, Germany .
E-mail: Jerome.Rouquette@um2.fr

Les Ferrolectriques prsentent un fort potentiel pour des applications
microlectroniques. Dans les mmoires ferrolectriques non volatiles (FeRAM), linformation
est stocke et lue en renversant la direction de la polarisation lectrique. La dgradation du
basculement de polarisation, i.e. fatigue ferrolectrique, est une contrainte technique la
commercialisation des mmoires ferrolectriques ; la quantit de charges bascules sous
champs diminue lors de cycles (de lordre de 10
7
) rpts. Malgr de nombreuses tudes
thoriques et exprimentales, lorigine de la fatigue nest pas connue. Dans la littrature la
fatigue serait cause par la formation dune couche linterface entre llectrode mtallique
et le matriau ferrolectrique, des dformations rsultantes de domaines 90, de llectro-
migration de lacunes doxygne formant des dfauts tendus pouvant bloquer des domaines,
de mcanismes dinhibition de nuclation dinterface induit par injection de charge, de
fissures micro- et macro-scopiques, , mais notre connaissance lorigine structurale de la
fatigue na jamais t propose.
Dans cette tude, la fatigue ferrolectrique de cramiques commerciales de PZT est
tudie par diffraction X synchrotron en fonction du champ lectrique appliqu. Utilisant la
mthodologie rapporte rcemment [1], nous avons caractris lorigine structurale de la
fatigue par une dgradation de la transformation quadratique-monoclinique sous champ, qui
traduit la rduction de lefficacit pizolectrique. La perte de polarisation rmanente peut
aussi tre dtecte par une anomalie moins intense et plus diffuse du dplacement quadratique
moyen du plomb B
iso
(Pb) sous champ pour lchantillon fatigu (10
7
cycles) qui traduit le
basculement de polarisation. Nous avons aussi pu caractriser la cintique de la raction
induite sous champ, de lordre de la milliseconde, qui conforte sans aucun doute notre
interprtation sur lorigine structurale de la fatigue ferrolectrique.




[1] M. Hinterstein, J. Rouquette*, J. Haines, P. Papet, M. Knapp, J. Glaum, H. Fuess,
Structural Description of the Macroscopic Piezo- and Ferroelectric Properties of Lead
Zirconate Titanate, Phys. Rev. Lett., 107 (2011).

1b - Surfaces et Interfaces Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 37 -
O4 - SXRD in situ couple llectrochimie : tude de llectro-
insertion dhydrogne dans des nanofilms de Pd

Yvonne Soldo-Olivier
1
, Eric Sibert
1
, W. Liang
1
, M. De Santis
2


1
Laboratoire dElectrochimie et de Physico Chimie des Matriaux et des Interfaces, CNRS-
Grenoble INP-UJF-UdS, 1130 rue de la Piscine, 30402 St . Martin dHres, France
2 Institut Nel, CNRS-UJF, 25 av. des Martyrs, 38042 Grenoble, France

Le palladium prsente non seulement des proprits catalytiques remarquables vis--vis
de la dissociation d'hydrogne, mais il est aussi caractris par une grande cintique
dinsertion/dsinsertion de cet lment. Par rapport au Pd massif, la taille nanomtrique des
films ultra-minces est de nature induire de profondes modifications sur les proprits
thermodynamiques. C'est le cas pour les nanoparticules de Pd, qui prsentent une solubilit de
l'hydrogne rduite [1-4].
Afin d'obtenir une comprhension approfondie des mcanismes rgissant l'insertion
d'hydrogne dans les films ultra-minces de Pd, nous avons tudi l'influence de la taille
nanomtrique et du substrat monocristallin sur les isothermes dinsertion lectrochimique de
lhydrogne. Le comportement original des diffrentes paramtres thermodynamiques, tel le
taux d'insertion maximale d'hydrogne, a t observ pour les systmes Pd/Pt(111) et
Pd/Au(111).
Nous avons ralis des mesures de diffraction de surface des rayons X (SXRD) in situ
en milieu lectrochimique. Pour ceci, nous avons conu une cellule lectrochimique adapte
la diffraction de surface et venant sinsrer dans le diffractomtre de la ligne franaise CRG-
D2AM lESRF (Grenoble, France). Ces mesures nous ont permis dobtenir la structure
microscopique des films de Pd avant et aprs hydruration. Lexistence de zones au sein des
films de Pd avec des paramtres cristallographiques diffrents a t mise en vidence.
Nous avons ainsi t en mesure de donner une description dtaille de la relation forte
entre la structure des films l'chelle atomique et le comportement des isothermes dinsertion
en fonction du substrat et de lpaisseur du film [5,6].



[1] A. Pundt, M. Suleiman, C. Bhtz, M.T. Reetz, R. Kirchheim, N.M. Jisrawi, Mat. Sci. Engi.
2004, B108, 19.
[2] A. Pundt, Adv. Engi. Mat. 2004, 6, 11.
[3] C. Lebouin, Y. Soldo, S.A. Grigoriev, M. Guymont, P. Millet, Int. J. Hydrogen Energ.,
2013, 38(2), 966.
[4] C. Lebouin, Y. Soldo-Olivier, E. Sibert, P. Millet, M. Maret, R. Faure J. Electroanal.
Chem., 2009, 626, 59.
[5] C. Lebouin, Y. Soldo-Olivier, E. Sibert, M. De Santis, F. Maillard, R. Faure, Langmuir
2009, 25(8), 4251.
[6] Y. Soldo-Olivier, M. C. Lafouresse, M. De Santis, C. Lebouin, M. de Boissieu, E. Sibert,
J. Phys. Chem. C, 2011, 115(24), 12041.
1b - Surfaces et Interfaces Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 38 -
O5 - Surfaces vicinales : des nano-gabarits pour croissance pitaxiale

Alessandro Coati
1
, Yves Garreau
1,2


1
Synchrotron SOLEIL, LOrme des Merisiers, Saint Aubin, B.P. 48, 91192 Gif sur Yvette
Cedex, France,
2
Matriaux et Phnomnes Quantiques (MPQ), Btiment Condorcet, Case courrier 7021, 10
rue Alice Domon et Lonie Duquet, 75205 Paris Cedex 13

Les surfaces vicinales mtalliques sont des bons gabarits pour la croissance de
nanostructure. En effet, elles prsentent une succession rgulire de terrasses spares par des
marches et constituent elles mmes de nanostructures dont on peut contrler les dimensions
(largeur de terrasses, priode) en choisissant langle de coupe par rapport une surface
nominale. Suite un recuit thermique ou ladsorption dune espce chimique, ou encore
un dpt dun autre matriau, les surfaces vicinales peuvent se rorganiser et donner
naissance des nouvelles structures priodiques, comme par exemple des facettes, qui
peuvent tre contrles par les paramtres de recuit, dadsorption ou de dpt.
Nous nous sommes intresss lorganisation de surfaces vicinales mtalliques et la
modification de leurs morphologies suite au dpt sub-monocouche dune espce chimique en
utilisant la diffraction de rayons X en incidence rasante (GIXD) et la microscopie effet
tunnel (STM).
Pour des dpts dpassant la monocouche, nous avons pu observer des phnomnes
intressants dpitaxie sur les surfaces mtalliques vicinales tudies. Par exemple, le dpt
dAg sur une surface vicinale de Cu ou de Ni (espces prsentant une forte non miscibilit en
volume), une croissance pitaxiale lieu, avec une interface abrupte entre le substrat et la
couche dpose. Nous avons pu mettre en vidence que linterface entre les deux mtaux est
constitue de deux surfaces vicinales qui semboitent parfaitement. Nous obtenons ainsi une
croissance avec une couche bien cristalline et sans dfauts, prsentant une surface
bidimensionnelle, mme en prsence de matriaux qui prsentent au dpart des paramtres
rticulaires trs diffrents.
Laction dune surface vicinale dans lpitaxie dune couche peut avoir aussi dautres
effets tonnants : cest le cas de la croissance dune couche de Co sur une surface vicinale
dAu. Dans ce cas le Co, qui prsente naturellement une structure fcc, est contraint croitre
avec une structure fcc, hrite du substrat dAu.
Dans cet expos on pourra mettre en vidence ces phnomnes trs particuliers lis la
croissance sur substrats vicinaux.

1b - Surfaces et Interfaces Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 39 -
O6 - Mise en vidence de phases induites par le substrat pour des
msognes -conjugus

Gabin Gbabode
1,4
, Oliver Werzer
2
, Armin Moser
2
, Roland Resel
2
, Yves Geerts
3
, Johann
de Silva
4
, Michele Sferrazza
4


1
Sciences et Mthodes Sparatives, EA 3233, Universit de Rouen, 76821 Mont-Saint-
Aignan, France,
2
Institute of Solid State Physics, Graz University of Technology, Petersgasse 16, 810 Graz,
Autriche,
3
Laboratoire de Chimie des Polymres, Facult des Sciences, Universit libre de Bruxelles
(ULB), Boulevard du Triomphe, 1050, Bruxelles, Belgique,
4
Dpartement de Physique, Facult des Sciences, Universit libre de Bruxelles, Boulevard du
Triomphe, 1050 Bruxelles, Belgique.

Llectronique organique est un domaine de recherche trs attractif qui est bas sur
lutilisation de molcules semi-conductrices organiques pour la fabrication de composants
lectroniques comme les transistors effet de champ organiques (ou OFETs). Il est connu,
pour ces derniers, que le transport de charges seffectue dans les premires couches
molculaires du semi-conducteur organique (OSC) linterface entre celui-ci et le
dilectrique [1]. Il est ainsi crucial de pouvoir connatre lorganisation structurale des OSCs
proche du substrat sur lequel ils sont dposs car elle est directement relie leurs proprits
de transport de charges.
Nous prsenterons deux exemples de msognes -conjugus dposs en film minces
(paisseur infrieure 100 nm) par la mthode de spin-coating sur des wafers de silicium
conventionnels. Nous avons mis en vidence pour chacun deux la prsence dune
organisation structurale proche du substrat (phase induite par le substrat) diffrente de celle
observe dans le reste du film (phase bulk ), notamment grce des analyses structurales
combinant principalement diffraction des rayons X spculaire et en incidence rasante.
Le premier compos, le o,e-dioctylterthiophne, prsente un comportement thermotrope
assez complexe avec des transitions de phases 337 K (cristalline - smectique G), 344 K
(smectique G smectique F), 358 K (smectique F smectique C) et fond 363 K. La
prsence de deux phases cristallines en films minces temprature ambiante a pu tre prouve
dont la proportion relative dpend des conditions de fabrication du film.
Pour le deuxime, un driv de phthalocyanine, nous avons pu montrer lexistence dune
phase induite par le substrat sur une paisseur denviron 30 nm. De plus, de manire tout fait
originale, cette phase possde une organisation structurale tridimensionnelle alors que la
phase bulk est une msophase colonnaire bidimensionnelle typique [2].

[1] Dinelli et al., Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 116802.
[2] Gbabode et al., Adv. Mater. 2012, 24, 658-662.
1b - Surfaces et Interfaces Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 40 -
O7 - Etude de surfaces vicinales ordonnes par diffusion centrale des
rayons X sous incidence rasante. Nouveaux dveloppements sur la
ligne BM02 lESRF

Caroline Matringe
1
, Elsa Thune
1
, Ren Guinebretire
1
,
David Babonneau
2
, Nathalie
Boudet
3
, Nils Blanc
3
, Mireille Maret
4


1
Science des Procds Cramiques et de Traitements de Surface, SPCTS, UMR CNRS 7315,
ENSCI, Centre Europen de la Cramique (CEC), 12 rue Atlantis, 87068 Limoges Cedex
2
Institut PPRIME, UPR CNRS 3346, Universit de Poitiers, SP2MI, Tlport 2, Boulevard
Marie et Pierre Curie, BP 30179, 86962 Futuroscope Chasseneuil Cedex
3
Institut Nel, UPR CNRS 2940, 25 rue des Martyrs, BP 166, 38042 Grenoble cedex 9
4
Science et Ingnierie des Matriaux et Procds, SIMAP UMR 5266 CNRS, 1130 rue de la
Piscine, BP 75, 38402 St Martin dHres.

Les surfaces vicinales sont des substrats utiliss pour faire crotre des nanostructures
auto-organises. Dune manire gnrale, aprs dcoupe des monocristaux ces surfaces
prsentent des marches de dimension latrale et de hauteur variables. Des traitements
thermiques judicieusement choisis conduisent, par simple minimisation de lentropie, la
formation de rseaux de marches priodiques qui peuvent a priori tre mono ou
bidimensionnels. Les dimensions caractristiques des nanostructures labores sur ces
surfaces gabarits sont directement dpendantes de la priode des rseaux forms et de la
hauteur des marches qui les constituent. La mesure de lvolution de la priode ainsi que du
profil des marches constitue donc une tape clef de llaboration de ces nanostructures par
auto-organisation.

La diffusion centrale des rayons X sous incidence rasante est une mthode de choix pour
dterminer la fois le profil et les dimensions caractristiques des rseaux de marches.
Lorientation relative entre lchantillon, et plus particulirement les bords de marche, et le
faisceau incident de rayons X doit toutefois tre contrle de faon trs prcise. De cette
prcision dpendra laptitude dterminer notamment le profil des marches. Les bords de
marche tant des directions cristallographiques, lorientation azimutale de lchantillon, qui
est un monocristal, peut tre dtermine par diffraction. Nous montrerons dans cette
communication, comment lassociation du nouveau goniomtre implant sur la ligne BM02
lESRF et du banc de diffusion centrale prsent sur cette mme ligne nous a permis dtudier
de faon complte des rseaux mono ou bidimensionnel forms par traitements thermiques
trs haute temprature de surfaces de saphir. La pertinence de lapproche propose sera
illustre notamment par le trs bon accord entre des observations locales dans lespace rel
menes par microscopie force atomique et la cartographie bidimensionnelle du rseau
rciproque au voisinage du centre de ce rseau.
1c - Nouvelles structures en biologie Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 41 -
O8 - Structure de l'ectodomaine de la glycoprotine d'enveloppe E1,
dans sa forme post-fusion, du virus de la Rubole.

Marie-Christine Vaney, Rebecca Phillips, Alejandra Tortorici, Rana Al-Kurdi, Giovanna
Barba-Spaeth, Thomas Krey, Flix A. Rey

Unit de Recherche de Virologie Structurale, Dpartement de Virologie, Institut Pasteur,
CNRS UMR 3569,28 rue du Dr. Roux, 75015 Paris, France

Le virus de la rubole (RV) est lagent responsable de cette maladie gnralement
bnigne touchant les enfants, mais qui peut provoquer de graves malformations congnitales
au foetus lors d'une infection in utero. RV est le seul membre du genre des Rubivirus
appartenant la famille des Togaviridae, qui inclut aussi le genre Alphavirus dont le virus
chikungunya fait partie. Malgr son importance mdicale, l'organisation structurale de RV
reste peu connue l'heure actuelle. Les glycoprotines E1 et E2 sont les protines d'enveloppe
de RV. Nous avons dtermin la structure de la forme post-fusion de l'ectodomain de E1
(E1e) 1.8 de rsolution [1]. E1 est l'antigne principal et la seule cible des anticorps
neutralisants contre RV, et l'pitope d'un de ces anticorps neutralisants a t localis sur la
structure. E1 est aussi implique dans l'entre du virus dans les cellules cibles par sa liaison
des rcepteurs cellulaires de surface, dont l'un d'entre eux a t rcemment identifi [2], ainsi
que dans la fusion membranaire. La structure du trimre de E1e rvle deux boucles de fusion
et un site mtallique par protomre, ainsi qu'une trs large surface de fusion (~8000
2
).
Celle-ci pourrait servir induire une pression importante lors de l'insertion membranaire du
virus, de faon catalyser plus efficacement la fusion des membranes virale et cellulaire.
Nous avons aussi montr que les proprits de liaison de E1e aux lipides sont diffrentes en
fonction de la nature de l'ion (Na
+
ou Ca
2+
) et du pH. La prsence de mtal dans E1e voque
les protines cellulaires de la famille "TIM" [3], lesquelles reconnaissent spcifiquement, via
un mtal, les ttes lipidiques des phosphatidylsrines la surface plasmatique des cellules en
apoptose. Les caractristiques structurales de RV E1e et sa comparaison avec les autres
protines de fusion de classe II, qui englobe les protines d'enveloppe des alphavirus et
flavivirus, seront prsentes.






[1] DuBois RM, Vaney MC, Tortorici MA, Kurdi RA, Barba-Spaeth G, Krey T, Rey FA.
Functional and evolutionary insight from the crystal structure of rubella virus protein E1.
Nature. 2013, 493(7433):552-556.
[2] Cong H, Jiang Y, Tien P. Identification of the Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein as a
Cellular Receptor for Rubella Virus. J. Virology. 2011, 85(21):1103811047.
[3] Santiago C, Ballesteros A, Martinez-Munoz L, Mellado M, Kaplan GG, Freeman GJ,
Casasnovas JM. Structures of T cell immunoglobulin mucin receptors 1 and 2 reveal
mechanisms for regulation of immune responses by the TIM receptor family. Immunity.
2007, 26:299310.
1c - Nouvelles structures en biologie Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 42 -
O9 - Bases structurales de l'initiation de la transcription de l'ARN
polymerase III

Stphane Lefvre
1,2
, Hlne Dumay-Odelot
1,2
, Leyla El Ayoubi
1,2
, Nol Pinaud
1,2
, Martin
Teichmann
1,2
, Sbastien Fribourg
1,2


1
Univ. Bordeaux, IECB, F-33607 Pessac, France,
2
INSERM, U869, Laboratoire ARNA, F-33000, Bordeaux, France,

LARN polymrase III humaine (hPol III) transcrit les gnes codants pour les ARN de
transfert et lARN ribosomal 5S, ainsi que ceretains ARN non codants impliqus dans la
rgulation de la transcription et dans lpissage tels que 7SK, U6 snRNA. hPol III est la plus
complexe des trois ARN polymrases nuclaires avec 17 sous-units. Parmi ces 17 sous-
units seulement 5 sont spcifiques de hPol III et sont rparties en deux sous-complexes
stables de 2 (RPC4 et RPC5) et 3 sous-units (RPC62, RPC39, RPC32) respectivement.

Le complexe ternaire form par RPC62, RPC39 et RPC32 est impliqu dans
linitiation spcifique de la transcription. Par ailleurs la sous-unit RPC32 est prsente dans le
gnome sous deux isoformes codes par deux gnes distincts [1]. RPC32| est la sous-unit
constitutive prsente dans chaque type cellulaire test ce jour, alors que RPC32o, la
premire historiquement identifie, a une expression hautement rgule et nest retrouve que
dans les cellules souches embryonnaires et les cellules en cours de transformation [1].
Dans le but de comprendre les bases molculaires de la fonction de ce complexe ternaire et
limplication pour lholoenzyme de la prsence de lune ou lautre isoforme de RPC32, nous
avons dbut une tude structure-fonction de ce complexe.

En rsolvant la structure de la sous-unit humaine RPC62 nous avons identifi des
domaines classiques de liaison lADN et une homologie forte avec TFIIEo, un facteur de
transcription Pol II [2]. Ltude fonctionnelle in vitro associe a permis lidentification des
domaines ncessaires la formation du complexe et dmontre une spcificit de RPC62 et
RPC39 pour lADN simple ou double brin respectivement. Cette premire tape dans la
comprhension du rle du complexe dans linitiation de la transcription permet de proposer un
modle fonctionnel du complexe ternaire et dmontre une homologie tendue entre les
systme de transcription Pol I/II et III.






[1] Haurie et al. (2010) Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 107 (9), 4176-81.
[2] Lefvre et al. (2011) Nat. Struct. Mol. Biol., 18(3), 352-8.
1c - Nouvelles structures en biologie Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 43 -
O10 - Analyse structurale par SAXS de SopB, un effecteur de type III
de Salmonella en complexe avec sa chaperonne spcifique SigE.

Pierre Roblin
1
, Pierre Lebrun
2
, Prakash Rucktooa
3
, Frderique Dewitte
3
, Zo Lens
3
, Vincent
Villeret
3
& Coralie Bompard
3
.

1
Synchrotron SOLEIL, Lorme des merisiers, Saint Aubin, BP 48, 91192 Gif sur Yvette Cedex,
France
2
Structural Biology, Brussels , Vlaams Instituut voor Biotechnologie (VIB) Vrije Universiteit
Brussel (VUB) , Pleinlaan 2, 1050 Brussels, Belgium
3
Interdisciplinary Research Institute, CNRS -USR 3078, Universite Lille Nord de France, 50
Avenue de Halley, 59658 Villeneuve dAscq, France

SopB/SigD est une inositol phosphatase multi-domaines implique dans lentro-
pathognicit de Salmonella enterica. Ce facteur de virulence est inject dans les cellules
eucaryotes par le systme de scrtion de type III (TTSS) provoquant une rorganisation du
cytosquelette actine qui aboutit linternalisation de la bactrie. Avant sa scrtion, la
protine est maintenue dans le cytoplasme des bactries par interaction avec une chaperonne
spcifique SigE dont la structure atomique est connue. Nous avons ralis ltude du
complexe SopB/SigE par diffusion des rayons-X aux petits angles (SAXS) afin davancer
dans la connaissance des mcanismes de scrtion de type III et notamment dans la
reconnaissance des effecteurs par lappareil de scrtion lui-mme. Le SAXS combin
dautres approches biochimique, biophysiques et de modlisation molculaire sest avr tre
la technique la plus approprie pour ltude de ce complexe qui possde plusieurs rgions
dsordonnes. Linteraction entre SopB et SigE a pu tre caractrise par lanalyse structurale
de plusieurs constructions de leffecteur co-exprimes avec la chaperonne. La structure a
basse rsolution du complexe obtenue par SAXS a abouti la mise en vidence dune
structure quaternaire originale permettant de mieux comprendre les mcanismes de
reconnaissance des complexes effecteur/chaperonne de type III et les composant du TTSS et a
permis de proposer un mcanisme de scrtion pour ce facteur de virulence.


1c - Nouvelles structures en biologie Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 44 -
O11 - Bases structurales et fonctionnelles de la biominralisation de la
magntite : importance des domaines magntochromes.

Marina I Siponen
1
, Pierre Legrand
2
, Marc Widdrat
3
, Stphanie R. Jones
4
, Michelle C.Y.
Chang
4
, Damien Faivre
3
, David Pignol
1
, Pascal Arnoux
1

1
Laboratoire de Bionergtique Cellulaire, CEA/DSV/IBEB, UMR 7265 CNRS/CEA,
Universit Aix-Marseille, Saint-Paul-lez-Durance, F-13180, France
2
French National Synchrotron facility-SOLEIL, GIF-sur-Yvette, France
3
Department of Biomaterials, Max Planck Institute of Colloids and Interfaces, Science Park
Golm, 14424 Potsdam, Germany
4
Departments of Chemistry and Molecular and Cell Biology, University of California,
Berkeley, Berkeley, CA 94720-1460, United States

Les bactries magntotactiques salignent le long des lignes de champ magntique
terrestre grce la mise en place dun organite appel le magntosome : un cristal de
magntite [Fe(II)Fe(III)
2
O
4
] ou bien de greigite [Fe(II)Fe(III)
2
S
4
] entour dune vsicule
proto-lipidique. Alors que les besoins en Fer(II) et Fe(III) sont vidents, rien nest connu
concernant les mcanismes biologiques de contrle de ce ratio Fe(II)/Fe(III). Nous avons
propos lintervention dun domaine contenant un motif CXXCH (typique des cytochromes c)
qui est spcifique des MTB et qui se retrouve en tandem dans plusieurs protines associes au
magntosome (MamE, P, T et X) et nous avons propos le nom de magntochrome pour
dfinir ce domaine [1].

Ici, nous prsentons la structure de MamP qui se caractrise par lassociation dun
domaine PDZ avec deux domaines magntochrome [2]. Le domain PDZ joue un rle central
dans loligomrisation de MamP via la reconnaissance dun peptide provenant de sa propre
squence (auto-inhibition). Quant aux deux domaines magntochrome ils dfinissent une
nouvelle classe de cytochrome de type c extrmement compacte et caractrise par une forte
exposition de lhme au solvant. Larrangement relatif des domaines PDZ et magntochromes
dans le dimre de MamP contribue la cration dune poche acide que lon peut dcrire
comme un creuset entour de quatre hmes. Des expriences de cintique, de co-cristallisation
de MamP avec du Fe(II) ainsi que des expriences de production de magntite in vitro en
prsence de MamP indiquent que MamP est une fer oxidase qui contribue la formation et
la solubilisation despces de Fe(III) dans le creuset. Ces espces seraient par la suite
ncessaires la croissance des cristaux de magntites ou de greigite. Ces rsultats montrent
les mcanismes molculaires de la gestion du fer prenant place dans le magntosome et
soulignent limportance des domaines magntochromes dans ce processus.



[1] Siponen, et al., Biochem Soc Trans. 2013, 40, 1319-23
[2] Siponen, et al., Soumis
2a - Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 45 -
O12 - Analyse structurale dhybrides organique-inorganique et
relations structure-proprits : limportance de linterface et des
liaisons faibles

Nicolas Mercier

MOLTECH-Anjou UMR CNRS 6200- Universit dAngers, 2Bd Lavoisier, 49045 Angers

Dans cette prsentation, nous analyserons des structures cristallines ( retro-crystal-
engineering analysis) de composs de type hybride organique-inorganique en relation avec
leurs proprits. Beaucoup dexemples seront pris parmi des hybrides constitus danions
halognomtallate et de cations organiques [1]. On attachera une importance particulire
linterface organique-inorganique qui est le sige dinteractions faibles et on montrera
limpact de celles-ci sur les proprits des matriaux. Ainsi, nous verrons comment la
combinaison de liaisons halogne et liaisons hydrogne permet la rduction du gap BC-BV de
perovskites hybrides [2], comment un changement de liaison hydrogne avec la temprature,
corrl un changement conformationnel du cation cystaminium, a un impact drastique sur
les proprits optiques (doublage de frquence) des matriaux [3], comment le
methylviologne permet la formation ( effet template ) de chaines polaires doctadres
trans-connects dans une nouvelle famille de ferrolectriques hybrides [4], ou comment les
interactions N
+
Cl ont un effet sur les proprits de transfert de charge photo-induit de
chlorometallates de viologne [5]. Dautres exemples seront emprunts la chimie de
coordination, en particulier des complexes ou des polymres de coordination possdant des
proprits de photoluminescence [6].











[1] N. Mercier et al., CrystEngComm 2009, 11, 720-734.
[2] S. Sourisseau, N. Mercier et al., Chem. Mater. 2007, 19, 600-607.
[3] N. Mercier et al., Angew. Chemie 2006, 45, 2100-2103 ; W. Bi, N. Mercier et al., Adv.
Mater. 2008, 20, 1013-1017
[4] N. Leblanc, N. Mercier et al., J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 14924-14927.
[5] N. Mercier, Eur. J. Inorg. Chem. 2013, 19-31.
[6] O. Toma, N. Mercier et al., CrystEngComm 2012, 14, 7844-7847 ; O. Toma, N. Mercier et
al., Eur. J. Inorg. Chem. 2013, 1113-1117.
2a - Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 46 -
O13 - Crystallography as a critical resource in metal-organic self
assembly

Jonathan Nitschke

Cambridge University, United Kingdom

Designing complex materials for new devices through the art of chemical synthesis
brings challenges and opportunities; single-crystal X-ray diffraction is a key front-line
technique in the structural characteration of new, complex self-assembled materials.This talk
will focus upon the design of self-assembly processes that can bring together simple, organic
molecules and first-row transition-metal ions into complex, functional structures, and how
these structures may be characterised using state-of-the-art crystallographic techniques
developed by our partners at Global Phasing Ltd. Examples include an octa-Fe(II) cubic cage
that is capable of selectively binding to higher fullerenes,[1] a tetra-Fe(II) tetrahedral cage
that is capable of rendering air-stable white phosphorus (P4), which is ordinarily
pyrophoric,[2] and a deca-Co(II) pentagonal prism, shown at right, which forms part of a
chemical network that behaves differently under the influences of different chemical
signals.[3] This prism is formed through the action of hexafluorophosphate template ions, and
it binds tightly to chloride once formed.





















[1] W. Meng, B. Breiner, K. Rissanen, J. D. Thoburn, J. K. Clegg, J.
R. Nitschke, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 3479.
[2] P. Mal, B. Breiner, K. Rissanen, J. R. Nitschke, Science 2009, 324, 1697.
[3] I. A. Riddell, M. M. J. Smulders, J. K. Clegg, Y. R. Hristova, B.
Breiner, J. D. Thoburn, J. R. Nitschke, Nature Chem. 2012, 4, 751.
2a - Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 47 -
O14 - La liaison halogne pour l'laboration d'architectures
complexes: contribution lectrostatique et rseaux d'anions (2D, 3D)

Marc Fourmigu, Julien Lieffrig, Olivier Jeannin

Institut des Sciences Chimiques de Rennes, Universit Rennes 1, UMR CNRS 6226, Campus
de Beaulieu, 35042 Rennes (France)

La liaison halogne est base sur une distribution lectronique anisotrope autour
datomes dhalogne organiques, conduisant une dformation et une lacune de densit
lectronique le long de la liaison CHal. Cette polarisation est lorigine dinteractions
HalHal directes mais aussi dinteractions CHalNC avec des
nitriles ou tout autre base de Lewis, qui peuvent tre aussi fortes et
plus directionnelles qu'une liaison hydrogne normale [1,2].
La contribution lectrostatique cette interaction est dmontre ici dans une srie de
complexes transfert de charge formuls (EDT-TTFI
2
)
2
(TCNQF
n
) avec n = 02 dans lequel
la charge des partenaires lectro-
actifs est modulable (et module)
en fonction de n et/ou de la
temprature, dans des composs
prsentant une conversion
neutre-ionique [3,4].
Par ailleurs, la mise en uvre d'anions halognures (Cl

, Br

, I

) ou pseudo-halognures
(SCN

) [5] comme accepteurs de liaisons halogne permet la construction de structures


polymriques avec des molcules iodes ditopiques, mais aussi des structures poreuses
robustes avec des molcules iodes tritopiques, comme des structures 2D en nid d'abeille [6],
evt. interpntres, mais aussi des structures 3D cubiques de type pyrite [7]:

[1] R. Rogers, Cryst. Growth Des. 2011, 11, 4721.
[2] M. Fourmigu, Curr. Op. Solid State Mater. Sc. 2009, 13, 36.
[3] J. Lieffrig, O. Jeannin, T. Guizouarn, P. Auban, M. Fourmigu, Cryst. Growth Design
2012, 12, 4248
[4] J. Lieffrig, O. Jeannin, S. Dahaoui, E. Espinosa, P. Auban-Senzier, M. Fourmigu et al. ,
en prparation
[5] P. Cauliez, V. Polo, T. Roisnel, R. Llusar, M. Fourmigu, CrystEngComm 2010, 12, 558
[6] S. Triguero, R. Llusar, V. Polo, M. Fourmigu, Cryst Growth Design 2008, 8, 2241
[7] J. Lieffrig, O. Jeannin, M. Fourmigu, J. Am. Chem. Soc. 2013, sous presse, DOI:
10.1021/ja400740v
C Br
+o
-o
N C
-o
EDT-TTFI
2
TCNQF
n
, -1 < < 0
EDT-TTFI
2
S
S
S
S
S
S
I
I
NC
NC
CN
CN
F
F
S
S
S
S
S
S
I
I
2a - Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 48 -
O15 - Les carboxylates duranium ttravalents : prcurseurs du
combustible nuclaire

Clment Falaise
1
, Christophe Volkringer
1
, Natacha Henry
1
, Thierry Loiseau
1

1
Unit de Catalyse et Chimie du Solide (UCCS) UMR CNRS 8181, Universit de Lille,
USTL-ENSCL, BatC7, BP 90108, 59652 Villeneuve dAscq

Depuis quelques annes la chimie de luranium connait un regain dintrt, notamment
grce sa place dans lindustrie nergtique mondiale. La maitrise de la technologie nuclaire
implique une parfaite comprhension de la chimie associ luranium, que ce soit pour la
fabrication du combustible nuclaire (oxyde duranium) ou dans les mthodes de sparation.
Aujourdhui la chimie de luranium hexavalent (U
VI
) est largement tudie, celle des
degrs doxydation infrieurs (U
V
, U
IV
, U
III
) reste encore assez peu explore. Ce constat est
surprenant, si lon considre que luranium ttravalent est impliqu dans certaines tapes de
fabrication du combustible nuclaire conduisant la formation de la cramique UO
2
utilise
comme combustible dans les centrales nuclaires actuelles. Ce paradoxe sexplique
simplement par la difficult disoler et de caractriser des espces chimiques prsentant de
faibles degrs doxydation dans les conditions atmosphriques ambiantes.

Cette communication sera centre sur la cristallochimie de nouveaux composs base
duranium ttravalents (U
IV
) et leurs proprits thermiques. Des mthodes de synthses
impliquant une maitrise de la cristallisation et de lhydrolyse seront prsentes. Ces stratgies
de synthse ont donn lieu des chimies de coordination indites de luranium, associant
notamment clusters inorganiques polynuclaire et ligands organiques. La prsentation
sarticulera principalement autour des topologies associant U
IV
et de ligands carboxylates :
- dans un premier temps le systme U
IV
/dicarboxylates linaires sera expos. Ce
systme trs riche dun point de vue cristallochimique permet lobtention dune
famille de matriaux microporeux (U
6
O
4
(OH)
4
(H
2
O)
6
(OOC-X-COO)
6
) dont les
dimensions des cavits sont modulables [1].
- ltude du systme U
IV
/benzoate a galement t effectue. Ainsi nous avons russi
isoler des agrgats nanomtriques composs de 38 atomes duranium [2]. La
formation de ces assemblages polymtalliques ainsi que les difficults lies la
rsolution structurale seront abordes.

[1] Falaise et al., Chemistry- A european journal. 2013, 19, 5324533.
[2] Falaise et al., submitted to Angew. Chem. Int. Ed.
2b - Cristallographie pour les nanosciences Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 49 -
O16 - Structure of BN nanostructures: which impact on their
luminescent properties?

J. Loayza
1,2
, J. Barjon
2
, A. Pierret
1,3
, S. Moldovan
4
, O. Ersen
4
, F. Ducastelle
1
and A. Loiseau
1


1
LEM, ONERA-CNRS, 29 avenue de la Division Leclerc, Chtillon, France
2
Group Nanophysique et Semi-conducteurs, CEA/INAC CNRS-UJF, 17 rue des Martyrs,
Grenoble, France
3
GEMAC, Universit Versailles St Quentin CNRS, 45 avenue des Etats Unis, Versailles,
France
4
LPA, ENS-CNRS, 24 rue Lhomond, Paris, France
4
IPCMS, CNRS Universit de Strasbourg, 23 rue du Loess, Strasbourg, France

annick.loiseau@onera.fr


Hexagonal boron nitride (h-BN) is a wide band gap semiconductor (~ 6.5 eV), which
can be synthesized, as graphite, its carbon analog, as bulk crystallites, nanotubes and layers.
These structures meet a growing interest for deep UV LED and graphene engineering [1]. For
instance electron mobility of graphene has been shown to be preserved when graphene is
supported by a h-BN film.

Until recently, properties of h-BN materials were poorly known due to both the
scarcity of crystals and suitable investigation tools. This situation has changed thanks, first, to
the development of dedicated photoluminescence (PL) and cathodoluminescence (CL)
experiments running at 4K and adapted to the detection in the far UV range [2, 3, 4], and
second to the avaibility of high quality single crystals [5]. Thanks to these tools, h-BN has
been shown to display original optical properties, governed, in the energy range 5.5 6 eV,
by strong excitonic effects [2, 3, 6], which has been confirmed by reliable theoretical
calculations [7, 8]. Furthermore, experimental investigations combining cathodo-
luminescence measurements and transmission electron microscopy (TEM) observations have
revealed that excitonic luminescence is highly sensitive to their environment and are easily
perturbed by structural defects such as dislocations [4].


In this talk, we will examine the interplay between structure, defects and luminescence
properties of BN layers and BN nanotubes and how these properties can be further exploited
for the characterization of these nanostructures. We carry out optical and structural
characterizations of this material by combining PL, CLmeasurements at 4K in the UV range
(up to 7eV) and TEM analyses using HRTEM, diffraction contrast imaging and electron
tomography. Thin layers have been obtained by mechanically exfoliating small crystallites.
Exfoliated flakes were reported first on SiO
2
substrates for AFM thickness measurements, as
described in [9] and second on TEM grids. Nanotubes are multi wall nanotubes made of
typically 10 to 20 layers provided by the team of D. Golberg (NIMS, Japan).


2b - Cristallographie pour les nanosciences Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 50 -
O16 - Structure of BN nanostructures: which impact on their
luminescent properties?

We will show that, whatever the structure, bulk or nanoscale, excitonic luminescence
consists of two series of lines called S and D. S excitons are found to be self-trapped, due to a
Jahn-Teller effect [3]. Thanks to the imaging capability of the CL, emission, related to D
lines, is found to be localized on defects, identified by TEM as grain boundaries. In defect
free areas of thin layers, D lines completely vanish and S lines only are observed. D/S ratio
can therefore be used as a qualification parameter of the defect densities present in the layers
[10]. Concerning nanotubes, we will show that exciton trapping on structural defects gives
rise to a spectacular localization of the luminescence caused by a complex structure of these
tubes that we have analysed by combining electron diffraction, high resolution imaging and
electron tomography.

























[1] C.R. Dean et al. Nature Nanotechnology 5 (2010) 722
[2] P. Jaffrennou el al., Phys. Rev. B 77 (2008) 235422
[3] K. Watanabe et al., Phys. Rev. B 79 (2009) 193104
[4] P. Jaffrennou el al., J. Appl. Phys. 102 (2007) 116102
[5] Y. Kubota et al.. Science 317 (2007) 932
[6] L. Museur et al., Phys. Stat. Sol. rrl, 5 (2011) 414
[7] B. Arnaud, et al. Phys. Rev. Lett. 96 (2006) 026402
[8] C.-H. Park et al., Phys. Rev Lett. 96 126105 (2006)
[9] G. F. Schneider, et al, Nano. Lett. 10 (2010)1912
[10] J. Loayza et al, Nanoletters, submitted (2013)
2b - Cristallographie pour les nanosciences Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 51 -
O17 - Imagerie des champs de dformations par holographie
lectronique

Etienne Snoeck, Christophe Gatel, Florent Houdellier, Nikolay Cherkashin, Martin Hytch

CEMES-CNRS 29 rue Jeanne Marvig, 31055 Toulouse Cedex

Dans une exprience de Microscopie Electronique Transmission (MET) conventionnelle
ou de spectroscopie seules la distribution dintensit et la distribution en nergie du faisceau
dlectron sont mesures alors que linformation contenue dans la phase des faisceaux
transmis et diffracts est perdue. Le dphasage du faisceau dlectron porte des informations
rsultant de linteraction entre londe lectronique et les champs magntiques et
lectrostatiques. La mesure de ce dphasage permet dvaluer ces champs [1]. Nous avons
galement montr que la phase des faisceaux diffracts permet aussi de sonder les champs de
dformation locaux [2, 3]. Les techniques dinterfromtrie lectronique menes dans un
microscope lectronique transmission permettent de mesurer ces phases et de cartographier
ces champs avec une rsolution spatiale de lordre de celle du microscope. Je dtaillerai la
technique dholographie en champ sombre qui permet de mesurer la phase gomtrique des
faisceaux diffracts et par l, de cartographier les champs de dformation. Jillustrerai les
potentialits de cette mthode en tudiant ltat de dformation de divers systme contraints.



















[1] Electron holography of nanostructured materials R.E. Dunin-Borkowski, M.R.
McCartney and D.J. Smith.
Chapter in Volume 3 of the "Encyclopaedia of Nanoscience
[2] International patent PCT N PCT/FR2008/001302 - M.J. Htch, E. Snoeck,
F. Houdellier, F. He.
[3] Nanoscale holographic interferometry for strain measurements in electronic devices
M. Htch, F. Houdellier, F. He and E. Snoeck, Nature, 453, (June 2008)
2b - Cristallographie pour les nanosciences Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 52 -
O18 - Structuration de leau pendant le remplissage des nanotubes de
carbone

Erwan Paineau
1*
, Pierre-Antoine Albouy
1
, Stphan Rouzire
1
, Andra Orecchini
2,3
,
Stphane Rols
2
, Pascale Launois
1*


1
Laboratoire de Physique des Solides, UMR CNRS 8502, Universit Paris Sud, 91405,
Orsay, France,
2
Institut Laue Langevin, BP 156, 38042, Grenoble, France,
3
Dipartimento di Fisica, Universit di Perugia, I-06123 Perugia, Italy,
* erwan-nicolas.paineau@u-psud.fr; pascale.launois@u-psud.fr

Le comportement de leau dans les nanotubes de carbone, nanocanaux ultimes avec leur
diamtre interne de lordre du nanomtre, est surprenant. Leau entre spontanment dans ces
nanotubes dits hydrophobes et sy coule presque sans frottement. Ce phnomne pourrait
prsenter un intrt considrable en termes dapplications, par exemple pour la dsalinisation
de leau par osmose inverse.
Aprs une rapide prsentation des proprits originales de leau dans les nanotubes de
carbone, nous discuterons de la structure de leau pendant le remplissage des nanotubes,
mesure ici [1] pour la premire fois. Nous avons mis au point une exprience de diffusion
des rayons X in situ, dans une cellule humidit contrle, pour mesurer les diagrammes de
diffraction de nanotubes de diamtre 1.4 nm, pendant leur remplissage. Nous avons aussi
dvelopp une mthode danalyse systmatique des diagrammes pour dterminer la quantit
deau absorbe au fil du temps et le profil de densit radiale de leau correspondant. Leau
remplit dabord les nanocanaux de manire homogne jusque 5% en masse puis se structure
en trois couches. Le remplissage homogne na pas t discut jusqu prsent dans les
nombreux articles de simulations numriques dans la littrature. De plus, rsultats
exprimentaux et prdictions numriques diffrent sur certains aspects pour ce qui concerne le
remplissage complet. Les rsultats exprimentaux motiveront donc sans doute de nouvelles
tudes thoriques et de simulations numriques, pour mieux comprendre les proprits
particulires de leau confine dans un environnement hydrophobe.

[1] Paineau et al., Nano Letters. 2013, 13, 1751-1756.
2b - Cristallographie pour les nanosciences Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 53 -
O19 - Structure et dynamique de molcules isoles dans des matrices
poreuses

Dominik Schaniel
1
, Kuan-Ying Hsieh
1
, El-Eulmi Bendeif
1
, Axel Gansmuller
1
, Sbastien
Pillet
1
, Theo Woike
2


1
Universite de Lorraine, CRM2, UMR 7036, Vandoeuvre- les-Nancy,
2
Institut fr Strukturphysik, TU Dresden

Linclusion de molcules fonctionnelles dans des matrices nanostructures est un
domaine de recherche trs actif [1], en vertu des applications potentielles dans plusieurs
domaines, p.ex. optique, catalyse, mdecine [1-4]. Dans le cas dune fonctionnalit optique
comme la photocommutation du ligand NO dans Na
2
[Fe(CN)
5
NO]2H
2
O (SNP) leurs
confrant des proprits photorfractives intressantes [5], ces capacits devraient tre
conserves aprs encapsulation dans la matrice. Il existe donc un intrt fondamental pour
dterminer la structure de molcules encapsules dans des matrices afin de vrifier lintgrit
structurale des complexes fonctionnels et dtudier les interactions hte-matrices.

Nous avons ralis des nanohybrides contenant des molcules isoles spcifiques du
complexe SNP en imprgnant des matrices poreuses de SiO
2
(taille de pore entre 1-2 nm) par
une solution de SNP. La structure de ces nanohybrides a t tudie par diffusion totale et
lanalyse de la fonction de distribution de paires (PDF), et par rsonance magntique
nuclaire (RMN). Lanalyse de la PDF diffrentielle permet didentifier les complexes de
SNP lintrieur des pores, sous forme de molcules isoles ou de clusters molculaires, et de
dterminer larrangement anion-cation et la taille du cluster. Lanalyse RMN rvle une
certaine dynamique des molcules qui dpend du taux dhydratation de la matrice.

En conclusion, lanalyse PDF des donnes de diffusion totale combine des mesures
RMN du solide permet de dterminer la structure et la dynamique des molcules isoles dans
les pores dun matriau amorphe.







[1] Sanchez et al., Adv. Mater. 2003, 15, 1669 ; Vinu et al., J. Nanosci. Nanotec. 2005, 5,
347.
[2] Deniz et al., Chem. Eur. J. 2012, 18, 15782.
[3] Blecher et al., Nanomedicine : Nanotechnology, Biology, and Medicine 2012, 8, 1364.
[4] T.-W. Sung, Y.-L. Lo, Sensors and Actuators B : Chemical 2012, 173, 406.
[5] Schaniel et al., Adv. Mater. 2007, 19, 723.

2c - Enzymologie et dynamique Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 54 -
O20 - The COP9 signalosome: Activity and regulation

M. Birol, F. Hoh, Y. Yang, A. Padilla, C. Dumas & A. Echalier
*


Centre de Biochimie Structurale. CNRS, INSERM, UM1, UM2. 29 rue de Navacelles. 34090
Montpellier cedex

*
aude.echalier-glazer@cbs.cnrs.fr

The Cop9 (Constitutive photomorphogenesis 9) signalosome (CSN) is a large multiprotein
complex that, through its role in the ubiquitin-proteasome pathway, is implicated in various
cellular functions spanning from cell cycle to circadian rhythm and reaching the immunity of
organisms. To date the CSN complex has mostly been studied for its implication in the
regulation of the E3-cullin RING ubiquitin ligases (CRLs). The isopeptidase catalytic activity
of the CSN complex is carried by the subunit 5, CSN5 (also known as Jab1). CSN5 is
involved in the deneddylation of CRLs by performing the hydrolysis of the isopeptide bond
between an ubiquitin-like molecule, Nedd8 (cullin-neural precursor cell expressed
developmentally downregulated gene 8) and the CRL cullin scaffolding subunit. CSN5 when
incorporated within the CSN complex displays isopeptidase activity, however it is
intrinsically inactive in a stand-alone form. In light of our work, the determination of the
CSN5 crystal structure together with biochemical and in silico investigations contributed to
understand the molecular regulation of CSN5 activity as well as to identify a potential
molecular trigger that is involved in the transition of an inactive CSN5 to an active
isopeptidase enzyme. A single point mutation located in a flexible region of the active site of
CSN5, known as the Ins-1 segment, was used to obtain a constitutively active variant of
CSN5 [1]. We will present here how the activity of the CSN catalytic subunit is regulated.





















[1] Echalier et al. (2013). PNAS. 110(4), 1273-1278.
2c - Enzymologie et dynamique Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 55 -
O21 - Les synthases de cyclodipeptides, des homologues
daminoacyl-ARNt synthtases impliques dans la synthse
peptidique non ribosomale

Mireille Moutiez
1
, Jrme Seguin
1
, Pascal Belin
1
, Jean-Luc Pernodet
2
, Muriel Gondry
1


1
CEA, iBiTec-S/SIMOPRO, 91191 Gif-sur-Yvette,
2
Univ. Paris-Sud 11, CNRS, UMR8621, 91405 Orsay

Nous avons identifi une nouvelle famille denzymes, les synthases de cyclodipeptides
(CDPS), qui sont impliques dans la biosynthse dune classe de peptides non ribosomaux,
les cyclodipeptides [1,2]. Les cyclodipeptides et leurs drivs, les dictopiprazines (DKP),
sont extrmement rpandus chez les microorganismes et se caractrisent par une grande
varit de structures chimiques et une large gamme dactivits pharmacologiques.

Les CDPSs utilisent des ARNt aminoacyls (aa-ARNt) comme substrats pour
synthtiser les liaisons peptidiques de diffrents cyclodipeptides ; elles dtournent donc leur
profit des composs qui sont normalement dvolus la synthse protique ribosomale. La
rsolution des structures cristallographiques de CDPS [3-5] a permis de montrer que ces
enzymes prsentent une homologie structurale importante avec les domaines catalytiques des
aminoacyl-ARNt synthtases (aaRS), les enzymes qui catalysent lactivation et le transfert des
acides amins sur les ARNt pour former des aa-ARNt (Figure 1).


substrats
cyclodipeptides
NH
HN
O
O
aa
aa
aaRS aaRS
substrats Produit
aa
CDPS CDPS

Figure 1 : une similitude structurale entre deux familles denzymes, les aaRS et les CDPS


Les CDPS possdent une poche qui accommode la partie aminoacyle dun aa-ARNt et
contient les rsidus catalytiques. Elles utilisent un mcanisme catalytique de type ping-pong
qui transite par la formation dun intermdiaire acyl-enzyme provenant du transfert de la
partie aminoacyle dun premier aa-ARNt vers une srine catalytique [3]. Les tapes
subsquentes de la catalyse et les bases molculaires des interactions entre les CDPS et leurs
substrats sont actuellement en cours dtude au laboratoire.





2c - Enzymologie et dynamique Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 56 -
O21 - Les synthases de cyclodipeptides, des homologues
daminoacyl-ARNt synthtases impliques dans la synthse
peptidique non ribosomale

Dans les voies de biosynthse de DKP, les CDPS sont associes des enzymes de
modification des cyclodipeptides produits. Par exemple, la voie de biosynthse isole chez M.
tuberculosis est constitue dune CDPS produisant du cyclo(L-Tyr-L-Tyr) qui est utilis
comme substrat par le cytochrome P450 CYP121 pour former une DKP dont les chanes
latrales sont pontes par une liaison C-C intramolculaire [1,2].

Notre objectif est dutiliser les connaissances acquises pour effectuer une ingnierie
tant gntique que protique des voies de biosynthse des DKP [6] afin de crer de nouvelles
DKP aux proprits biologiques et pharmacologiques optimises.


























[1]

Gondry et al., Nat Chem Biol. 2009, 5, 414-420.
[2]

Belin et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 2009, 106, 7426-7431.
[3]

Sauguet et al., Nucleic Acids Res. 2011, 39, 4475-4489.
[4]

Vetting et al., Nat Chem Biol. 2010, 6, 797-799.
[5]

Bonnefond et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 2011, 108, 3912-3917.
[6] Belin et al., Nat. Prod. Rep. 2012, 29, 961-979.
2c - Enzymologie et dynamique Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 57 -
O22 - Promiscuit enzymatique lactonase/phosphotriestrase :
implications volutives et biotechnologiques.

Julien Hiblot
1
, Guillaume Gotthard
1
, Jrmy Robin
1
, Patrick Masson
2
, Mikael Elias
3
& Eric
Chabrire
1


1
Unit de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, IRD/CNRS,
Universit de la Mditerrane (Aix-Marseille II), 13 385 Marseille, France,
2
IRBA-CRSSA, Dpartement de Toxicologie. 38702 La Tronche Cedex, France,
3

Weizmann Institute of Science, Biological Chemistry, Rehovot, Israel.

La promiscuit enzymatique est la capacit fortuite dune enzyme prendre en charge
un substrat non naturel, i.e. une fonction non soumise pression de slection [1]. Il sagit de
lun des moteurs prpondrant de lvolution des fonctions enzymatiques. Rcemment, un
lien phylogntique fut mis en vidence entre les Phosphotriestrases bactriennes (PTEs) et
les Phosphotriesterases-Like Lactonase (PLLs) [2]. Les PTEs auraient diverg des PLLs
suite lutilisation massive dinsecticides organophosphors (OPs) depuis 50 ans.
En effet, les PTEs prsentent la capacit dhydrolyser trs efficacement certains OPs
neurotoxiques [3] ouvrant des perspectives dutilisation dans la bio-dcontamination de ces
composs. Les PLLs, quant elles, sont des lactonases hydrolysant les AHLs, molcules
impliques dans la communication bactrienne (ou quorum sensing ; QS) [4] et ouvrant des
perspectives dutilisation dans linhibition de la virulence bactrienne (par quorum
quenching ; QQ) [5]. La promiscuit entre ces deux activits enzymatiques proviendrait de la
ressemblance gomtrique entre ltat de transition dhydrolyse des AHLs et celle des
substrats OPs (ttradriques) [4,6].
Afin de dvelopper des produits dintrt biotechnologique, nous nous sommes inspir
de ce lien volutif afin damliorer la PLL hyperthermostable SsoPox [7-11]. Nous avons
utilis une banque de donnes de mutations lors de protocoles dvolution in vitro afin de
redessiner (in silico) le site actif de SsoPox. Suite son amlioration, lanalyse structurale de
variants slectionns a rvl, notamment, une flexibilisation locale, principalement
responsable de lamlioration. Cette observation soutient le modle de polarit/modularit
corps-site actif des topologies prsentant un haut potentiel volutif [12].

[1] Khersonsky & Tawfik, Annu Rev Biochem. 2010, 79, 471-505.
[2] Afriat-Jurnou et al., Biochemistry. 2012, 51, 6047-55; Afriat et al. Biochemistry. 2006, 45,
13677-13686; Elias & Tawfik, J Biol Chem. 2012, 287, 11-20.
[3] Raushel. Nature. 2011, 469, 310-311.
[4] Popat et al., Br Med Bull. 2008, 87, 63-75.
[5] Amara et al., Chem Rev. 2011, 111, 195-208.
[6] Ben-David et al., J Mol Biol. 2012, 418, 181-196.
[7] Gotthard et al., Acta Crystallogr Sect F. 2013, 69, 73-76.
[8] Hiblot et al., Sci Rep. 2012, 2, 779.
[9] Hiblot et al., PLoS One. 2012, 7, e47028.
[10] Del Vecchio et al., Extremophiles. 2009, 13, 461-470.
[11] Elias et al., J Mol Biol. 2008, 379, 1017-1028.
[12] Dellus-Gur et al., J Mol Biol. 2013, accepted.
2c - Enzymologie et dynamique Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 58 -
O23 - Aperu structural du mcanisme enzymatique dAnkX, une
protine de Legionella pneumophila modifiant la petite protine G
Rab

Valrie Campanacci
1
, Shaeri Mukherjee
2
, Craig R. Roy
2
, Jacqueline Cherfils
1


1
Laboratoire dEnzymologie et Biochimie Structurales, Centre de Recherche de Gif, CNRS,
Gif-sur-Yvette, France,
2
Department of Microbial Pathogenesis, Yale University School of Medicine, New Haven,
CT, USA

Legionella pneumophila est la bactrie responsable dune pneumonie svre appele
maladie du Lgionnaire. La bactrie infecte les macrophages alvolaires et se dveloppe en
crant une vacuole spcialise, la LCV (legionella-containing vacuole), similaire dun point
de vue morphologique au rticulum endoplasmique de son hte [1]. Afin dassurer la
biogense et la survie de cet organelle de rplication, L. pneumophila injecte un arsenal de
protines appeles effecteurs dans le cytosol de la cellule infecte via un systme de scrtion
de type IV (Dot/Icm). Ces effecteurs vont pirater les machineries du trafic cellulaire et ainsi
permettre au pathogne dchapper aux dfenses de lhte [2].

AnkX, un des effecteurs scrts par L. pneumophila, est une protine comprenant un
domaine FIC et des squences ankyrines rptes [3]. Les domaines FIC sont caractriss par
un motif conserv HPFx[D/E]GN[G/K]R. Alors que la plupart des domaines FIC bactriens
permettent le transfert dAMP partir dATP sur des protines cibles, AnkX utilise la cytidine
diphosphate-choline (CDP-choline) comme substrat pour attacher de manire covalente un
groupement phosphocholine sur la petite protine G Rab [4]. Cette modification de Rab altre
son interaction avec ses partenaires cellulaires.

Nous avons rsolu les structures cristallographiques de AnkX (rsidus 1 484) sous
forme apo, lie son substrat la CDP-choline (en utilisant une forme inactive de lenzyme), et
lie aux produits de la raction (CMP et phosphocholine) [5]. Ces structures rvlent pourquoi
AnkX transfre la phosphocholine et non pas le nuclotide sur Rab, et comment les squences
ankyrines rptes contraignent le domaine FIC. Nos rsultats gnralisent un mcanisme de
phosphoryl-transfrase commun toutes les enzymes domaine FIC.

[1] Tilney et al., J. Cell Sci. 2001, 114, 4637.
[2] Hubber et al., Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 2010, 26, 26183.
[3] Pan et al., Science. 2008, 320, 16511654.
[4] Mukherjee et al., Nature, 2011, 477, 103-106.
[5] Campanacci et al., EMBO J. 2013 Apr 9. doi: 10.1038/emboj.2013.82.
Remerciements : Nous remercions chaleureusement toute lquipe de la ligne Proxima-1 du
synchrotron Soleil, et tout particulirement Beatriz Guimaraes, pour leur aide, conseils et
disponibilit lors des collectes. Ce travail a bnfici des infrastructures de la plateforme de
cristallisation LEBS/IMAGIF.
Sance plnire II Mercredi 3 juillet 9h00-10h00
- 59 -
SP2 - The Amazing Diversity of the Human GPCR Superfamily

Ray Stevens

The Scripps Research Institute, La Jolla CA, USA

GPCRs constitute the largest protein families in the human genome and play essential
roles in normal cell processes, most notably in cell signaling. The human GPCR family
contains more than 800 members and recognizes thousands of different ligands and activates a
number of signaling pathways through interactions with a small number of binding partners.
GPCRs have also been implicated in numerous human diseases, and represent more than 30-
40% of drug targets. Delivering GPCR structures in close collaboration with the community
on specific receptor systems is of immense value to the basic science community interested in
cell signaling and molecular recognition, as well as the applied science community interested
in drug discovery. This work is being followed up with additional biophysical characterization
including NMR spectroscopy and community wide assessments with computational biology
groups throughout the world. Crystal structures are now available for rhodopsin, adrenergic,
and adenosine receptors in both inactive and activated forms, as well as for chemokine,
dopamine, histamine, lipid, and all four opioid receptors in inactive conformations. A review
of the common structural features seen in these receptors and the scope of structural diversity
of GPCRs at different levels of homology provides insight into our growing understanding of
the biology of GPCR action and their impact on drug discovery. Given the current set of
GPCR structural data, a distinct modularity is now being observed between the extracellular
(ligand-binding) and intracellular (signaling) regions. The rapidly expanding repertoire of
GPCR structures provides a solid framework for experimental and molecular modeling
studies, and helps to chart a roadmap for comprehensive structural coverage of the whole
superfamily and an understanding of GPCR biological and therapeutic mechanisms. With
the rapid accumulation of this data, one can now start to investigate GPCR evolution, and
expanding this understanding to human evolution and cognition.

This work was supported by NIGMS PSI:Biology for GPCR structure processing
(U54GM094618) and the NIH Roadmap Initiative (JCIMPT) for technology development
(GM073197).
3a - Croissance cristalline (GFCC) Mercredi 3 juillet 10h30-12h00
- 60 -
O24 - Membrane Protein Crystallization in Cubic Phases

Valentin Gordeliy
1,2


1
Institute of Structural Biology J.P. Ebel, CEA-CNRS-UJF UMR 5075, Grenoble F-38027,
France
2
Institute of Complex System-6, Research Centre Juelich, Juelich 52425, Germany


An overview of in meso approaches to membrane protein crystallization will be given
and new developments in the field under discussion will be described. Recent progress in the
corresponding high throughput instrumentation will also be in a focus of the presentation. In
addition, a brief overview of membrane protein crystallization platform at the Institute of
Structural Biology J.P. Ebel, Grenoble will be presented. A critical analysis of the
perspectives of this approach will be done.
3a - Croissance cristalline (GFCC) Mercredi 3 juillet 10h30-12h00
- 61 -
O25 - Croissance, Structure et Optique Non Linaire Quadratique

Pascal Loiseau
1
, Grard Aka
1
, Simon Ilas
1
, Federico Khaled
1


1
Laboratoire de Chimie de la Matire Condense de Paris ENSCP (Chimie-Paristech),
UMR CNRS 7574, 11 rue Pierre et Marie Curie, 75231 Paris Cedex 05


Parmi tous les milieux qui peuvent conduire la gnration dun rayonnement laser,
les lasers solides sont souvent privilgis pour des raisons de miniaturisation, de maintenance
et de fiabilit. Cependant, alors que les applications des lasers sont fortement conditionnes
par leurs longueurs donde dmission, toutes ces longueurs donde ne sont pas facilement
accessibles. En effet, les lasers solides les mieux matriss pour de hautes performances
mettent vers 1 m (cas du cristal de Y
3
Al
5
O
12
(YAG) dop Nd
3+
par exemple). Pour obtenir
des longueurs donde plus courtes, la solution consiste alors disposer derrire le cristal laser
des cristaux qualifis de non linaires : ils ont la particularit de pouvoir modifier la frquence
des rayonnements laser qui les traversent. Il est alors possible denvisager des dispositifs laser
solides mettant dans le visible, voire mme dans lultraviolet par des processus de somme de
frquence.
Les processus non linaire quadratique de conversion de frquence ne sont efficaces
que dans des milieux birfringents, non centrosymtriques, transparents dans le domaine
optique dintrt, et dont la polarisabilit est significative. Lensemble de ces critres peut
savrer extrmement slectif et difficile combiner, dautant plus que la longueur donde
laser vise est courte. Nanmoins, il savre que les composs base de groupements borate
prsentent les meilleures proprits pour les processus de conversion de frquence dans le
visible et lultraviolet.
Au-del des ces proprits intrinsques, le cristal optique non linaire idal doit aussi
prsenter de bonnes proprits dusage et la facult dtre labor avec la meilleure qualit
cristalline et optique possible.
Lensemble de ces aspects sera abord pendant la confrence au travers de lexprience
acquise au LCMCP dans ce domaine depuis plus de 20 ans.


3a - Croissance cristalline (GFCC) Mercredi 3 juillet 10h30-12h00
- 62 -
O26 - Etude structurale par diffraction des rayons X sur monocristaux
relaxeurs de Ba
2
LnFeNb
4
O
15
(Ln=La, Pr, Nd, Sm et Eu)

Marjorie Albino
1,2
, Philippe Veber
1,2
, Stanislav Pechev
1,2
, Matias Velzquez
1,2
, Mario
Maglione
1,2
, Michal Josse
1,2


1
CNRS, ICMCB, UPR 9048, F-33600 Pessac, France
2
Univ. Bordeaux, ICMCB, UPR 9048, F-33600 Pessac, France

Les composs de formulation Ba
2
LnFeNb
4
O
15
avec Ln=La, Pr, Nd, Sm, Eu
(BLnFNO) cristallisants dans la structure cristalline Tetragonal Tungsten Bronze (TTB) ont
fait lobjet dtudes sur cramiques au sein de lICMCB [1]. Les cations Nb
5+
positionns en
site octadrique, connus comme ions ferrolectriquement actifs, apportent cette famille de
matriaux des proprits dilectriques intressantes. La structure cristalline tudie par
diffraction des rayons X et neutronique sur poudre suggre une modulation de la structure
TTB.
Pour tudier les comportements dilectriques et structuraux intrinsques la matrice
TTB, llaboration de cristaux est indispensable. La technique de croissance cristalline par la
mthode des flux, utilisant le borate de lithium LiBO
2
en tant que solvant, a permis
lobtention de cristaux BLnFNO de taille millimtrique [2], malgr la volatilisation du
solvant. Par la suite, dautres essais ont t entrepris dans une enceinte en platine scelle sous
vide primaire afin dviter lvaporation du solvant lors de la croissance. Aprs optimisation
du procd de cristallogense [3], des cristaux de BLnFNO de taille sub-centimtrique voire
centimtrique ont ainsi t forms et utiliss pour des mesures dilectriques.
Les tudes structurales sur monocristaux par DRX ralises temprature ambiante
mettent en vidence, et ce, quelle que soit la nature de la terre rare insre en site carr, une
structure module incommensurable bidimensionnelle (3+2D) caractrise par les vecteurs de
modulation (, , ). La rsolution des structures cristallines en 3D sur les monocristaux de
BLnFNO conduit des facteurs de reliabilits satisfaisants en symtrie quadratique dans le
groupe despace P4/mbm. Le remplissage partiel du site carr par les cations Ln
3+
, avec un
taux de lacunes pouvant atteindre jusqu' ~40% dans le cas de Ln=Sm ou Eu, induit une
distorsion des octadres MO
6
(M=Fe, Nb) environnants. Lvolution des distances M-O ainsi
que des angles O-M-O ou encore M-O-M fera lobjet dune discussion dtaille lors de cette
prsentation orale, afin dvaluer les relations structure-proprits dans ces matriaux.







[1] M. Josse et al., Solid State Sci., 2009, 11(6), 1118-1123
[2] E. Castel & al., J. Cryst. Growth, 2012, 340, 156-165
[3]M. Albino et al., accepted in Eur. J. Inorg. Chem., doi: 10.1002/ejic.201300008
3a - Croissance cristalline (GFCC) Mercredi 3 juillet 10h30-12h00
- 63 -
O27 - Synthse, caractrisation et croissance cristalline de cristaux de
pyrophosphate de calcium dintrt biologique.

Pierre Gras,
1
Christian Rey,
1
Sbastien Teychen,
2
Christian Bonhomme,
3
Danielle
Laurencin,
4
Batrice Biscans,
2
Stphanie Sarda
5
et Christle Combes
1


1
CIRIMAT, ENSIACET, UMR 5085, INPT-CNRS-UPS, Universit de Toulouse, Toulouse,
France.
2
Laboratoire de Gnie Chimique, ENSIACET, INPT-CNRS-UPS, Universit de Toulouse,
Toulouse, France.
3
Laboratoire de Chimie de la Matire Condense de Paris, Collge de France, UMR 7574,
UMPC Paris 6, Paris, France.
4
Institut Charles Gerhardt de Montpellier, UMR 5253, Montpellier, France.
5
CIRIMAT, Universit Paul Sabatier, UMR 5085, INPT-CNRS-UPS, Universit de Toulouse,
Toulouse, France.

Les pyrophosphates de calcium hydrats (CPP : Ca
2
P
2
O
7
nH
2
O) sont impliqus dans
de nombreuses formes darthrite dont larthrose, la plus rpandue des maladies articulaires.
Deux types de CPP ont t identifis in vivo dans les articulations de patients arthritiques : des
cristaux de pyrophosphates de calcium dihydrat (CPPD : Ca
2
P
2
O
7
2H
2
O) monoclinique (m-
CPPD) et triclinique (t-CPPD), possdant chacun un fort potentiel inflammatoire [1]. Outre
ces deux formes, plusieurs phases de CPP ont t synthtises in vitro dont un compos
tetrahydrat monoclinique m-CPPT (CPPT: Ca
2
P
2
O
7
4H
2
O) et une phase amorphe a-CPP
identifis comme prcurseurs in vitro des phases pathologiques [2].

Lobjectif de ce travail est de mettre au point une mthode de synthse simple et
rapide de plusieurs phases de CPP pures puis de les caractriser finement. Les composs ont
t prpars par double dcomposition de sels de pyrophosphate et de calcium en milieu
aqueux tamponn diffrentes tempratures. Quatre phases pures ont t synthtises, m-
CPPD, t-CPPD, m-CPPT et a-CPP, et caractrises notamment par DRX sur poudre,
spectroscopies FTIR et Raman, et RMN du solide
31
P et
43
Ca. Dans un second temps,
plusieurs conditions de croissance cristalline en gel ont t utilises afin dobtenir des cristaux
de qualit suffisante, notamment m-CPPD dont la structure reste non rsolue.

Les outils analytiques complmentaires ont permis dtudier certaines proprits
structurales des phases de CPP ainsi que leur volution en solution. Ces rsultats ont contribu
lidentification de cristaux de CPP in situ dans le liquide synovial de patients souffrant
darthrite. Des rsultats prliminaires sur la croissance de cristaux en gel seront prsents. Le
but final de cette tude serait de relier la morphologie et la chimie de surface des cristaux de
CPP aux proprits inflammatoires observes afin daider la mise au point de nouveaux
traitements visant contrler voire inhiber leur formation in vivo.

[1] M. Roch-Arveiller, R. Legros, B. Chanaud, O. Muntaner, S. Strzalko, A. Thuret, D. A.
Willoughby et J. P. Giroud, Biomed. Pharmacother., 1990, 44, 467474.
[2] E. H. Brown, J. R. Lehr, J. P. Smith et A. W. Frazier, Agricultural and Food Chemistry,
1963, 11, 214222.
3b - Cristallographie rsolue en temps Mercredi 3 juillet 10h30-12h00
- 64 -
O28 - Etudes par Diffraction Rsolue en Temps de Phnomnes
Irrversibles: Application aux Synthses Auto-Propages.
Caroline Curfs
1


1
ESRF, 6 rue J. Horowitz, 38046 Grenoble Cx

Irreversible phenomena can be challenging to study, especially when the succession of
events is extremely fast. Thus, in order to avoid missing or overlapping information, the
phenomenon has to be probed in the most continuous and fast way. When polycrystalline
materials are involved, a possible technique is Time-Resolved X-Ray Powder Diffraction
(TRXRD).
Combustion synthesis [1] is a good example of a fast and irreversible phenomenon.
Indeed it can take only few seconds to obtain the final products and the lifetime of some
intermediate phases can be as short as a couple of hundreds of milliseconds. This synthesis is
based on the exothermic properties of the chemical reaction to synthesize a whole sample.
Two combustion modes exist depending whether the synthesis occurs in the form of a heat
wave travelling through the sample (Self-propagating High-temperature Synthesis SHS) or if
it occurs simultaneously in the whole sample (Thermal Explosion Synthesis TES). Because
these reactions can be extremely fast (less than 1 second to obtain the final products), the
composition and physico-chemical properties of the final products are difficult to predict.
Thus, in order to better control this process, it is necessary to determine the synthesis
mechanisms. The crystallographic changes occurring during the synthesis are then probed by
TRXRD without interfering with the propagation of the wave. TRXRD is also the only
technique which can be used to study the mechanisms during the TES.
In this study, several samples of the same composition (equiatomic composition of Al-
Ni-Ti-C) and density (55%) have been synthesised by Combustion Synthesis using either the
SHS or the TES modes. For both modes, TRXRD experiments have been performed to
determine the synthesis mechanisms. A comparison between the different synthesis
mechanisms involved in the SHS and TES modes will be presented.




[1] Merzhanov, in Combustion and Plasma Synthesis of High-Temperature Materials, VCH,
New York, p.1, 1990.
3b - Cristallographie rsolue en temps Mercredi 3 juillet 10h30-12h00
- 65 -
O29 - Ultrafast structural dynamics in charge and orbitally ordered
manganites under non-equilibrium conditions

Paul Beaud
1

1
Light Source, Paul Scherrer Institut, CH-5232 Villigen PSI, Switzerland

A key challenge in condensed matter is the understanding of the dynamic interplay
among valence charge distribution, orbital order, magnetism and distortions of the atomic
lattice which give rise to complex phase diagrams. Material properties such as
superconductivity, metal-insulator transitions, colossal magnetoresistance (CMR) and
multiferroicity are observed. Very short, intense pulses of light have the ability to excite
matter far from equilibrium on extremely short time scales. The ensuing real-time dynamics
have the potential to unravel the complex interplay of forces that ultimately determine the
properties of these materials. Femtosecond x-ray diffraction is the only method capable of
directly measuring the dynamics of the long range order of both, the atomic lattice and the
electronic subsystems.

In my talk I will first introduce the time-resolved x-ray diffraction techniques we
developed at the FEMTO slicing source [1] at the Swiss Light Source during its first years of
operation by addressing fundamental questions on simple solid systems [2,3]. More recently
we have shifted our research interests towards structural dynamics of strongly correlated
systems occuring under highly non-equilibrium conditions. As an example, our progressing
studies of the dynamics coupled to the melting of charge and orbital order in CMR
manganites [4,5] will be discussed in more detail.














[1] P. Beaud et al., Phys. Rev. Lett. 99 174801 (2007).
[2] S. L. Johnson et al., Phys. Rev. Lett. 100 155501 (2008).
[3] S. L. Johnson et al., Phys. Rev. Lett. 102 175503 (2009).
[4] P. Beaud et al., Phys. Rev. Lett. 103 155702 (2009).
[5] A. Caviezel et al., Phys. Rev. B 87 205104 (2013).
3b - Cristallographie rsolue en temps Mercredi 3 juillet 10h30-12h00
- 66 -
O30 - Diffraction pompe-sonde rsolue en temps sur la ligne de
lumire CRISTAL SOLEIL

C. Laulh
1,2
, S. Ravy
2
, S. Hustache
2
, Ph. Hollander
2
and J.-P. Ricaud
2


1
Universit Paris-Sud, 91405 Orsay Cedex, France,
2
Synchrotron SOLEIL, Gif-sur-Yvette, France


Le synchrotron SOLEIL dveloppe des expriences pompe-sonde sappuyant la fois
sur des lasers impulsions ultracourtes et sur le faisceau de rayons X puls produit dans
lanneau de stockage. La rsolution temporelle de ces expriences est limite en pratique par
la dure des impulsions de rayons X, typiquement 70 ps FWHM dans les modes de
fonctionnement standards de lanneau. Afin dtudier les dynamiques photoinduites
ultrarapides, un mode low- [1-2] a t mis en place, pouvant donner des impulsions X de
10 ps FWHM. Une rsolution ultime de ~ 100 fs est attendue lhorizon 2014 au synchrotron
SOLEIL, dans le cadre du projet femto-slicing [3]. CRISTAL est une ligne de diffraction sur
onduleur qui depuis avril 2012 utilise la structure temporelle du rayonnement synchrotron
pour raliser des expriences de type pompe-sonde. Lchantillon est dabord excit par une
impulsion laser infrarouge de 40 fs FWHM ( pompe ). Les changements structuraux
photoinduits sont ensuite tudis dans le domaine temporel, en mesurant la diffraction dune
impulsion de rayons X monochromatiques au temps At aprs excitation ( sonde ). Les
expriences se droulent sur le diffractomtre 6-cercles de la ligne, qui offre une grande
varit denvironnements chantillon, et une gomtrie de dtection trs souple.
Les impulsions laser et X sont produites des frquences de lordre du kHz et du
MHz, respectivement. Pour faire une exprience pompe-sonde, il faut donc slectionner le
signal de diffraction provenant dune seule impulsion X aprs chaque excitation laser. Dans
les modes dopration standards SOLEIL (hybride, 8 paquets, 1 paquet), limpulsion
slectionner est spare de ses voisines de 147 ns. Sur CRISTAL, nous slectionnons cette
impulsion via une fentre dactivation de 90 ns applique au dtecteur pixels XPAD3.2 [4],
de dimensions 7 x 12 cm (taille de pixel : 150 m).
Dans ma prsentation, je dcrirai linstallation de diffraction pompe-sonde rsolue en
temps sur la ligne CRISTAL. Je montrerai ensuite des exemples de mesure dans les modes
standard (rsolution 70 ps) et low- (rsolution 10 ps) [5-6]. Je terminerai en prsentant les
dernires avances du projet femto-slicing SOLEIL, qui vise produire des impulsions de
rayons X de 100 fs dici 2014.

[1] P. Brunelle, F. Briquez, A. Loulergue et al., Proceedings of IPAC 2011, (2011) 2124.
[2] M.-A. Tordeux, J. Barros, A. Bence et al., Proceedings of IPAC 2012, (2012) 1608.
[3] A. Nadji, F. Briquez, M.-E. Couprie et al., Proceedings of IPAC 2010 (2010) 2499.
[4] P. Pangaud, S. Basolo, N. Boudet et al., Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. A 591, 159
(2008).
[5] C. Laulh, S. Ravy, P. Fertey et al., Acta Physica Polonica A 121, 332 (2012).
[6] C. Laulh, M. Cammarata, M. Servol et al., to be published in Eur. Phys. J. Special
Topics.
3c - Cristallo sous conditions extrmes Mercredi 3 juillet 10h30-12h00
- 67 -
O31 - Diffraction des rayons X sur monocristaux sous pression :
application ltude de structures complexes

Julien Haines
1
, Jrme Rouquette
1
, Arie van der Lee
2


1
Institut Charles Gerhardt Montpellier, UMR 5253 CNRS-Universit Montpellier 2, France,
2
Institut Europen des Membranes, UMR CNRS 5635, Universit Montpellier 2, France

Grce la qualit des donnes, la diffraction de rayons X sur monocristal sous pression
permet de suivre la structure cristallographique fine de matriaux complexes. Les spcificits
de la technique de diffraction des rayons X sur monocristal en cellule enclume de diamants
seront prsentes. Des rsultats obtenus sur source de laboratoire et au synchrotron seront
compars. Nous prsenterons des exemples des tudes sous pression sur des matriaux
charpente ouverte comme les zolithes et les cyanures de mtaux de transition [1] prsentant
des structures particulirement complexes (trs grandes mailles, transitions de phases,
dsordre, insertion despces).





























[1] Cairns et al., Nature Mater. 2013, 12, 212-216.
3c - Cristallo sous conditions extrmes Mercredi 3 juillet 10h30-12h00
- 68 -
O32 - Molecular basis of piezophilic adaptation

Louise Lassalle
1
, Marie Trovaslet
2
, Anne-claire Dhaussy
3
, Dominique Madern
1
, Bruno
Franzetti
1
, Eric Girard
1


1
IBS (UMR 5075 CEA-CNRS-UJF-PSB), 41 rue Jules Horowitz, 38027 Grenoble Cedex,
France

2
Institut de Recherches Biomdicales des Armes, antenne de La Tronche, France
3
CRISMAT, ENSICAEN, 6 Boulevard du Marchal Juin, 14000 Caen, France

Notre plante vit majoritairement sous pression. En effet, plus de 60 % de la biosphre
sont caractriss par des pressions suprieures 100 bars. Ces pressions peuvent atteindre
1000 bars dans les fosses sous-marines les plus profondes. La plupart des micro-organismes y
sont toutefois reprsents. La dcouverte rcente de Pyrococcus yayanosii CH1 [1], premier
hyperthermo-piezophile strict, a relanc la question de ladaptation aux fortes pressions. En
effet, cette nouvelle arche nest capable de crotre que sous hautes pressions (optimum de
croissance : 98 C et 520 bars) et supporte des pressions pouvant atteindre 1500 bars.
Je prsenterai lapproche choisie base sur une tude comparative de deux protines
modles ainsi que les rsultats prliminaires obtenus. Leffet de la pression sur les malate
dshydrognases (MalDH) et les glyoxylate rductases (GR) est tudi aussi bien dun point
de vue structurale quenzymatique. Le suivi de lactivit enzymatique est effectu grce un
spectrophotomtre coupl une enceinte pression disponible au sein de la plateforme Haute
Pression de lIBS. Ltude structurale est effectue par cristallographie des rayons X grce
une cellule enclume diamant [2].
Les rsultats prliminaires indiquent une diffrence de comportement entre les
enzymes issues dorganismes isols la surface et celles issues dorganismes des profondeurs.
Cette diffrence suggre que les enzymes issues dorganismes des fonds marins sont adaptes
pour fonctionner de manire optimale sous hautes pressions.














[1] Xiang Zeng, et al.,. The ISME journal. 2009, 3 :873-876.
[2] Fourme et al., Curr Opin Struct Biol. 2012, 22(5):636-42
3c - Cristallo sous conditions extrmes Mercredi 3 juillet 10h30-12h00
- 69 -
O33 - Structure cristallographique de la neuroglobine sous pression

Nathalie Colloch
1
, Eric Girard
2
, Roger Fourme
3
, Anne-Claire Dhaussy
4
, Thierry Prang
5
,
Beatrice Vallone
6


1
ISICT UMR 6301 CNRS CEA Universit de Caen, centre Cyceron, Caen,,
2
IBS, UMR 5075 CEA-CNRS-UJF, Grenoble,
3
Synchrotron Soleil, Gif-sur-Yvette,
4
CRISTMAT, ENSICAEN, Caen,
5
LCRB UMR 8015 CNRS Universit Paris Descartes,
6
Department of Biochemical Sciences, University of Rome La Sapienza, Rome, Italie

La neuroglobine (Ngb) est une globine implique dans la protection des neurones contre
lhypoxie et surexprime dans les glioblastomes qui sont des tumeurs crbrales trs
agressives. La Ngb participerait aux mcanismes de dfense de ce type de cancer pour
survivre dans des environnements hypoxiques. La Ngb est galement surexprime dans le
cerveau des mammifres marins vivant en profondeur, donc dans un environnement sous
pression et hypoxique.
La structure de la Ngb murine a t dtermine dans les formes deoxy et lie au
monoxyde de carbone, rvlant la prsence dune large cavit interne implique dans la
transition structurale entre les deux formes [1,2]. La pression permettant de piger des sous-
tats conformationnels de haute nergie [3], nous avons donc dterminer la structure de la
Ngb sous haute pression hydrostatique pour esprer atteindre des sous-tats impliqus dans
son fonctionnement.
Les donnes de diffraction ont t enregistres sur la ligne CRISTAL du synchrotron
SOLIEL sur des cristaux de Ngb murine placs dans une cellule enclume diamant soumis
une pression leve. Lanalyse de la courbe de compressibilit a clairement rvl quil
existait une transition aux alentours de 300 MPa. Nous avons enregistr trois jeux complets de
diffraction, lun pression ambiante, le deuxime avant la transition (270 MPa) et le troisime
proche de la transition (310 MPa). La rsolution des diffrents jeux de donnes est de 2 , ce
qui permet danalyser les diffrences.
La diffrence la plus notable est la grande diminution du volume de la cavit interne
dans les structures sous pression, avec une rupture de la connexion entre lhme et larrire de
la cavit, qui serait un site rservoir pour loxygne. Il semble que les structures sous pression
correspondent un intermdiaire entre la structure deoxy et la structure en prsence de
monoxyde de carbone.




[1] Vallone et al., Proteins, 2004, 56, 85-92.
[2] Vallone et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004, 101, 17351-17356.
[3] Fourme et al., Ann. Rev. Biophys., 2009, 38, 53-171.
3c - Cristallo sous conditions extrmes Mercredi 3 juillet 10h30-12h00
- 70 -
O34 - Haute Pression et Cristallographie des Matriaux Molculaires
Conversion de Spin.

Philippe Guionneau
1
, Patrick Rosa
1
, Helena J. Shepherd
2
, Samir Matar
1
, Vincent
Legrand
3
, Marie-Hlne Leme-Cailleau
3
, Stanislav Pechev
1
, Alain Marbeuf
4
, P. Ngrier
4
,
Laure Vendier
2
, Gabor Molnar
2
, Jean-Franois Ltard
1


1
Univ. de Bordeaux, ICMCB
2
Univ.de Toulouse, LCC
3
ILL, Grenoble
4
Univ. de Bordeaux, LOMA

Le comportement sous haute pression des matriaux molculaires conversion de
spin apparat complexe et mme surprenant bien des gards [1]. En effet, si linfluence de
lapplication dune pression sur une conversion de spin semble bien comprise et anticipe
lchelle de la molcule, il nen est rien lchelle du cristal. Dailleurs, la plupart, voire la
totalit, des proprits de conversion de spin sous pression qui apparaissent non conformes
aux prdictions, atypiques ou indites sont gnralement attribues une origine structurale.
Encore faut-il le prouver et comprendre les phnomnes mis en jeu, afin, en retour, dutiliser
les relations structure-proprits dans le dveloppement de ces matriaux pizo-commutables.

Nous montrerons comment linvestigation cristallographique en conditions extrmes
a rcemment permis de dterminer les diagrammes de phase (pression-temprature-
lumire) de complexes molculaires conversion de spin. Laccent sera port sur la
complmentarit des approches dinvestigation structurale sous pression in situ utilises :
diffraction X sur monocristal [2, 3], diffraction des neutrons sur poudre [4] y compris avec
couplage pression-temprature [5] et approches thoriques [6].








[1] P.Guionneau and E. Collet in Spin-Crossover Materials: Properties and Applications,
John Wiley & Sons Ltd, Oxford UK, (2013), Chapter 20, pp 507 -526.
[2] H.J. Shepherd et al. Angew. Chem. Int. Ed. 51, 3910-3914 (2012).
[3] H.J. Shepherd et al. Phys. Chem. Chem. Phys., 14, 5265-5271 (2012).
[4] V. Legrand et al. J. Appl. Cryst, 47, 637-640 (2008).
[5] V. Legrand et al. soumis, (2013).
[6] A. Marbeuf et al. Chemical Physics, 420, 2534 (2013).

4a - Matriaux fonctionnels (2) Mercredi 3 juillet 13h30-15h00
- 71 -
O35 - Cramiques transparentes par cristallisation complte du verre

Mathieu Allix
1,2
, Kholoud Al Saghir, Sbastien Chenu ,Salaheddine Alahrache
1,2
, Franck
Fayon
1,2
, Matthew Suchomel
3
, Florence Porcher
4
, et Guy Matzen
1,2


1
CEMHTI, CNRS UPR 3079, 1D Avenue de la Recherche Scientifique, 45071 Orlans Cedex 2, France,
2
Universit d'Orlans, Facult des Sciences, Avenue du Parc Floral, 45067 Orlans Cedex 2, France,
3
Argonne National Laboratory, Advanced Photon Source, Argonne, USA,
4
CEA Saclay, Laboratoire Lon Brillouin F-91191 Gif Sur Yvette, France.

Les cramiques polycristallines transparentes constituent une classe mergente de
matriaux photoniques qui concurrence la technologie monocristal sur un large domaine
dapplications optiques comme les matriaux pour laser, les scintillateurs, les lentilles
optiques ou encore les armures transparentes. Ces nouvelles cramiques offrent de nombreux
avantages, notamment de mise en forme et de production grande chelle, et tolrent des taux
de dopage dions actifs plus levs que les monocristaux, ce qui permet damliorer les
performances optiques. Cependant, jusqu prsent, seul un nombre limit de ces cramiques
polycristallines et transparentes a t rapport. Ces dernires se limitent essentiellement des
composs cubiques ou nanocristallins qui requirent un mode de synthse complexe, long, et
trs haute temprature, donc extrmement coteux.





4a - Matriaux fonctionnels (2) Mercredi 3 juillet 13h30-15h00
- 72 -
O35 - Cramiques transparentes par cristallisation complte du verre

Nos rcents travaux dmontrent la possibilit dobtenir simplement des cramiques
polycristallines transparentes par cristallisation complte dun verre de mme composition,
malgr des cristaux de taille micromtrique et de symtrie non cubique (donc non isotrope).
De plus, la cristallisation partir du verre permet de synthtiser de nouveaux matriaux grce
aux tempratures de cristallisation relativement basses. Ceci est dmontr dans le cas dune
nouvelle composition, BaAl
4
O
7
, possdant deux polymorphes orthorhombiques et montrant
une haute transparence dans les domaines visible et proche infrarouge [1,2]. Les structures
cristallographiques de ces composs ont t dtermines ab initio partir de donnes de
diffraction de poudre. A partir des structures ainsi tablies, les indices de rfraction ont t
calculs, permettant de remonter la birfringence des matriaux et de discuter les proprits
de transparence en fonction des structures cristallines tablies et des microstructures
observes. Dernirement, ce mme procd de synthse a t appliqu sur de nouvelles
compositions daluminosilicates de strontium, permettant de mettre en vidence lexistence de
nouvelles solutions solides qui ont t labores sous forme de matriaux polycristallins
hautement transparents.
























[1] M. Allix, Highly Transparent BaAl
4
O
7
Polycrystalline Ceramic Obtained by Full
Crystallization from Glass, Advanced Mater., 24 5570 (2012)
[2] M. Allix, Verres, vitrocramique et cramiques transparentes daluminates, Brevet (dpt
en France n1161025 dcembre 2011 Extension internationale mars 2012).
[3] S. Alahrach, Perfectly transparent Sr
3
Al
2
O
6
polycristalline ceramic elaborated from
glass crystallization, Chemistry of Materials, submitted.
4a - Matriaux fonctionnels (2) Mercredi 3 juillet 13h30-15h00
- 73 -
O36 - Matriaux hybrides base dargent et dacides phosphoniques
et carboxyliques : exploration de nouvelles architectures proprits
bactricides.

Jean-Michel Rueff
1
, Olivier Perez
1
, Marion Galmiche
1
, Hlne Couthon-Gourvs
2
, Mathieu
Berchel
2
, Paul-Alain Jaffrs
2
, Gary Hix
3

1
CRISMAT, CNRS UMR 6508, ENSICAEN-Caen;
2
Universit de Brest, CNRS, UMR 6521, CEMCA;
3
Nottingham Trent University UK.

Les sels, mtaux ou nanoparticules base dargent prsentent des proprits
bactricides, dues aux ions argent quils librent, exploites dans le domaine mdical
(pansements, instruments chirurgicaux). Nos rcents travaux ont montr quil tait possible de
synthtiser de nouveaux matriaux hybrides base dargent capables de relarguer des ions
Ag+ en solution aqueuse conduisant alors un effet bactricide sur six souches bactriennes
et tout particulirement sur les bactries Gram ngatives (A. aeruginosa, E. coli)[1]. Or, la
dimensionnalit (1D, 2D ou 3D) et la structure dun matriau hybride, pour un mtal donn,
est aisment contrlables via la nature des briques organiques ou/et le milieu ractionnel (pH,
temprature). Ds lors notre objectif fut dexplorer linfluence de la dimensionnalit et la
structure du matriau final sur le relargage dargent. A cette fin, nous avons ralis des
hybrides largent prsentant des architectures originales partir de molcules homo[2] ou
htropolyfonctionelles [3] possdant des groupes ractifs du type acide phosphonique ou
acides phosphoniques et acides carboxyliques lis un squelette rigide ; diffrentes conditions
exprimentales furent appliques (pH, temprature). La thorie HSAB (Hard and Soft Acids
and Bases theory) a t applique afin dorienter nos synthses et obtenir des matriaux
charpentes optimises pour contrler le relargage dargent. Cette stratgie a permis dobtenir
plusieurs matriaux dont les structures ont t caractrises par diffraction de rayons-X sur
monocristal. La synthse, la structure et la stabilit de matriaux hybrides polyfonctionnels
base dargent ainsi que la quantification du relargage de sel dargent en solution aqueuse
seront prsents.







[1] Berchel, M.; Le Gall, T.; Denis, C.; Le Hir, S.; Quentel, F.; Ellouet, C.; Montier, T.;
Rueff, J.M.; Salan, J.Y.; Haelters, J.P.; Lehn, P.; Hix, G.B.; Jaffrs, P.A. New J. Chem. 35
(2011) 1000.
[2] Rueff, J.M.; Perez, O.; Pautrat, A.; Barrier, N.; Hix, G.; Hernot, S.; Couthon-Gourvs, H.;
Jaffrs, P.A. Inorg. Chem. (2012), 51, 10251-10261.
[3] A) Rueff, J.M.; Caignaert, V.; Chausson, S.; Leclaire, A.; Simon, C.; Perez, O.; le Pluart,
L.; Jaffrs, P.A. Eur. J. Inorg. Chem. (2008) 4117. b) Rueff, J.M.; Perez, O.; Simon, C;
Couthon-Gourvs, H.; Lorilleux, C.; Jaffrs, P.A. Cryst. Growth Des. 9 (2009) 4262.
4a - Matriaux fonctionnels (2) Mercredi 3 juillet 13h30-15h00
- 74 -
O37 - Crystal and Magnetic Structure of LiMBO
3
(M=Fe, Co, Mn)

Liang Tao
1
, Gwenalle Rousse
2
, Christian Masquelier
1


1
LRCS, CNRS UMR7314, Universit de Picardie Jules Verne, 33 rue Saint Leu, 80039
Amiens, France 1,
2
IMPMC UMR 7590 CNRS-Universit Pierre et Marie Curie, 4 Place Jussieu, 75252 Paris
Cedex 05, France 2

LiMBO
3
(M = Fe, Co, Mn) compositions, especially LiFeBO
3
, have been spotted as
potential interesting cathode materials for Li-ion battery [1-6] due to the light and small
triangular oxyanion (BO
3
)
3-
which would allow in theory for LiFeBO
3
to reach a capacity of
220mAh/g for the extraction of Li
+
at ~2.8 V vs. Li.

The crystallographic unit cells of LiMBO
3
(M = Fe, Mn, Co) are usually described in
monoclinic C2/c symmetry except for one polymorph of LiMnBO
3
described in the hexagonal
(P-6) space group. Up to now, three structural models have been proposed for the monoclinic
form of LiFeBO
3
. Pure LiFeBO
3
was prepared and analysed by state of the art synchrotron X-
Ray diffraction and PDF data, confronted with
57
Fe Mossbauer, Neutron Powder Diffraction
(NPD) and
6
Li-NMR. All the results [7] suggested a new model for LiFeBO
3
: Li has two
partially occupied sites and Fe atom either vibrates along the long axis of ellipsoid[001], or
randomly distribute inside the anisotropic thermal motion ellipsoid of Fe atom. Similar model
was tested against NPD data of LiCoBO
3
and LiMnBO
3
recorded at D2B ILL Grenoble.

Both temperature dependent magnetic susceptibility measurements and low
temperature NPD (D20 ILL Grenoble) experiments were carried out. The results indicate the
formation of an intermediate incommensurately ordered phase on cooling, followed by
formation of commensurate long-range antiferromagnetic order below T
N2
= 10K for
LiMnBO
3
, T
N2
= 25 K for LiFeBO
3
, and T
N2
= 11 K for LiCoBO
3
.








[1] V. Legagneur et al., Solid States Ionics, 2001, 139 (1-2), 37.
[2] Y.Z. Dong et al., Electrochimica Acta, 2008, 53 (5), 2339
[3] A. Yamada et al., Advanced Materials, 2010, 22 (32), 3583.
[4] A.Yamada et al., J. Mater. Chem., 2011, 21 (29), 10690
[5] J. C. Kim et al., J. Electrochem. Soc., 2011, 158 (3), A309
[6] Y. Janssen et al., J. Am. Chem. Soc., 2012, 134, 12516
[7] L. Tao, B. C. Melot, G. Rousse, D. Hanzel, G. Mali, J. R. Neilson, T. M. McQueen, R.
Dominko, S. Levasseur, C. Masquelier; submitted, March 2013
4a - Matriaux fonctionnels (2) Mercredi 3 juillet 13h30-15h00
- 75 -
O38 - Matriaux polymriques conversion de spin de type [Fe(R-
trz)
3
]X
n
: Comportement structural et microstructural

Arnaud Grosjean
1
, Nathalie Daro
1
, Cindy Mauriac
1
, Cline Etrillard
1
, Brice Kauffmann
2
,
Philippe Ngrier
3
, Denise Mondieig
3
, Jean-Franois Ltard
1
et Philippe Guionneau
1
.

1
CNRS, Univ. Bordeaux, ICMCB, UPR 9048, 87 avenue du Dr A. Schweitzer, F-33608
Pessac
2
European Institute of Chemistry and Biology, 2 Rue Robert Escarpit, 33607 Pessac Cedex
3
CNRS, Univ. Bordeaux, LOMA, UMR 5798, 351 cours de la libration, F-33400 Talence
E-mail: grosjean@icmcb-bordeaux.cnrs.fr ; guionneau@icmcb-bordeaux.cnrs.fr

Les mtaux de transition allant de 3d
4
3d
7
sont connus pour former des complexes
pouvant avoir deux configurations lectroniques diffrentes, appels tats Bas Spin et Haut
Spin, en fonction de leurs environnements cristallins. Dans certains cas ces composs peuvent
passer dun tat un autre en fonction de conditions extrieures comme la temprature, la
pression, une irradiation lumineuse, lapplication dun champ magntique, ou encore sous
leffet dune dsolvatation : cest le phnomne de la conversion de spin. Il a dj t
dmontr que les relations structure-proprits ont un rle crucial dans la comprhension et le
dveloppement de ce type de matriaux [1].
Parmi tous les matriaux conversion de spin, la famille des complexes
polymriques [Fe(Rtrz)
3
]X
n
possde les caractristiques au plus proche des pr-requis pour
des applications industrielles [2]. En effet, ils peuvent prsenter une transition de spin abrupte
avec large hystrse autour des conditions ambiantes de temprature et de pression.
Cependant, bien que cette famille de composs soit connue depuis plus de vingt ans son
comportement reste encore mal compris et, notamment, les proprits structurales restaient
dterminer. En effet, jusqu prsent, aucune structure cristalline navait t obtenue. Au
cours de ce travail, un premier rsultat bas sur des investigations par diffraction X sur
monocristal [3] a permis de dcrire de faon fiable les proprits structurales dun complexe
de cette famille, confirmant dailleurs lhypothse de structure polymrique 1D admise
jusquici sur la base dinvestigation sur poudre [4, 5]. Ce premier rsultat a permis douvrir la
voie de nombreuses tudes cristallographiques compltes sur les diffrents aspects du
comportement structural de ces matriaux autour de la transition de spin. A ce jour, une
vritable banque de donnes structurales sur les complexes [Fe(Rtrz)
3
]X
n
est en cours de
construction et permet dj denvisager des relations structures-proprits [6].

[1] P. Guionneau et al., Top. Curr. Chem. 234, 97-128 (2004) ; Malcolm A. Halcrow, Chem.
Soc. Rev., 2011, 40, 41194142
[2] A. Bousseksou et al., Chem. Soc. Rev., 2011, 40, 33133335 ; G. Aromi et al.,
Coordination Chemistry Reviews 255 (2011) 485546
[3] A. Grosjean et al., Chem. Commun., 2011, 47, 1238212384
[4] A. Urakawa et al., J. Phys. Chem. C 2011, 115, 13231329
[5] A. Michalowicz et al., Chem. Mater. 1995, 7, 1833-1842
[6] A. Grosjean et al., Eur. J. Inorg. Chem. 2013 DOI: 10.1002/ejic.201201121
4b - Apriodicit, structure module Mercredi 3 juillet 13h30-15h00
- 76 -
O39 - Structures naturelles apriodiques et multimacles icosadriques

Bertrand Devouard
1


1
Aix-Marseille Universit - CEREGE, BP80, 13545 Aix-en Provence Cedex 04

Cette contribution prsente un florilge de minraux ayant des structures apriodiques,
du tube l'icosadre. Les principaux exemples sont des composs lamellaires, phyllosilicates,
sulfosels ou des composs mixtes hydroxyde-sulfure (e.g., tochilinite) associant deux types de
feuillets incommensurables. Ces structures apriodiques prsentent des similarits avec les
nanostructures de carbone, mais possdent souvent un plus grnd degr d'organisation du fait
de forces de liaison inter-feuillets plus importantes.
Les serpentines, de composition idale Mg
3
Si
2
O
5
, prsentent des structures "plates"
(lizardite), tubulaires (chrysotile, e.g. [1]), cniques (certains "chrysotiles" synthtiques, e.g.
[2]), modules (antigorite), mais aussi des structures cylindriques polygonises (serpentines
polygonales [3, 4]) ou polyhdriques [5]. Les serpentines polygonales sont formes de 15 ou
30 secteurs de types lizardite et prsentent des symtries globales d'ordre 5 [3, 4].
Les serpentines polygonales ont t dcrites comme des macles multiples de
lizardite [6]. De fait, des multi-macles "parfaites" de symtrie 5 sont possibles, telle la
pentagonite [7] qui prsente des macles cycliques cinq individus. Le compos synthtique
B
6
0, quand lui, peut former de spectaculaires macles multiples symtrie icosadrique [8].
Si de telles multi-macles icosadriques ne sont pas (encore?) connues l'tat naturel, on
notera qu'un minral quasicristallin a t dcrit rcemment [9].
Dans le cas des serpentines polygonales, toutefois, il a t dmontr par diffraction
lectronique et microscopie lectronique transmission que les diffrents secteurs sont
dlimits par des jonctions courbes qui sont des murs de dislocations partielles et qui gnrent
un kalidoscope de polytypes d'un secteur l'autre [3, 4].
Certains sulfosels lamellaires synthtiques [e.g., 10] sont connus pour former des
structures enroules ou modules semblables aux serpentines. La cylindrite et la franckite
sont deux sulfosels naturels de Pb, Sb, Sn, Fe qui prsentent des structures cylindriques
(centimtriques!) et modules, respectivement [11]. Enfin, la tubulite, Ag
2
Pb
22
Sb
20
S
53
[12],
forme des tubes creux millimtriques qui sont une merveilleuse illustration de la complexit
de ces structures minrales apriodiques.

[1] Devouard & Baronnet, Eur. J. Miner, 1995, 7, 835-846.
[2] Amelinckx et al., Acta Cryst. A, 1996, 52, 850-878.
[3] Baronnet et al., Phys. Chem. Minerals, 1994, 21, 330-343.
[4] Baronnet & Devouard, Can. Mineralogist, 2005, 43, 513-542.
[5] Baronnet et al., Amer. Mineralogist, 2007, 92, 687-690.
[6] Chisholm, J. Phys. D, 1991, 24, 199-202.
[7] Evans, Amer. Mineralogist, 1973, 58, 412-424.
[8] Hubert et al., Nature, 1998, 391, 376-378.
[9] Bindi et al., Amer. Mineralogist, 2011, 96, 928931.
[10] Bernaerts, 1997, PhD thesis, Univ. Antwerpen, Belgium.
[11] Williams and Hyde, Phys. Chem. Minerals, 1988, 15, 521-544.
[12] Melo et al., Min. Mag. 2012, 76, 807-817.
4b - Apriodicit, structure module Mercredi 3 juillet 13h30-15h00
- 77 -
O40 - Etude de la filiation structurale entre les phases icosadriques F
(Faces Centres) et P (Primitives)

Marianne Quiquandon
1
et Denis Gratias
2


1,2
LEM CNRS/ONERA ; 29 avenue de la division Leclerc, 92322 CHATILLON CEDEX


Nous dcrivons comment lon peut passer dune structure atomique quasicristalline
icosadrique de type F (Faces Centres), comme celle propose par M. Quiquandon and D.
Gratias [1], vers celle de type P (Primitive), propose par C. Pay Gomez and S. Lidin [2].
Lune et lautre peuvent, en effet, tre obtenues avec des surfaces atomiques construites
partir du mme polydre lmentaire propos ds 1986 par C. L. Henley [3] et se dduisent
lune de lautre par simple mise en ordre chimique de ces surfaces de faon analogue aux
transformations ordre-dsordre quon rencontre dans les alliages ordonns simples.

Notre prcdent modle de structure atomique de type F [1] sappuie lorigine sur un
petit triacontadre avec des surfaces atomiques diffrentes entre les deux sites n et n de
lhyperespace adquatement tronqus pour viter la gnration datomes trop proche
distance pour quil ny ait pas de recrouvrement entre les deux surfaces. Dans le cas dune
structure P, les deux sites n et n doivent tre occups par une mme surface atomique
construite avec le polydre de Henley [3] qui satisfait la fois le non recouvrement des
surfaces atomiques aux courtes distances et la condition de fermeture. Reformulant en retour
notre modle de structure F en utilisant des surfaces atomiques construites partir de ce
polydre [3], nous montrons comment on peut alors passer de P F par simple dcoration
chimique des cellules engendres par la dcomposition des surfaces atomiques des atomes
proches.















[1] M. Quiquandon and D. Gratias, Phys. Rev. B 74, 214205 (2006).
[2] C. Pay Gomez and S. Lidin, Phys. Rev. B 68, 024203 (2003).
[3] C. L Henley, Phys. Rev. B 34, 797 (1986).
4b - Apriodicit, structure module Mercredi 3 juillet 13h30-15h00
- 78 -
O41 - Lhomomtrie la lumire des faisceaux cohrents

Sylvain Ravy
1
,

1
Synchrotron-SOLEIL, LOrme des merisiers, Saint Aubin BP48, 911912 Gif-sur-Yvette
Cedex, France

Introduite par Arthur L. Patterson en 1939 [1], lhomomtrie dcrit des structures
cristallines ayant les mmes distances interatomiques et donc des rflexions de Bragg de
mme intensit. tendue la diffusion diffuse, elle dcrit des systmes dsordonns qui ont
statistiquement la mme fonction de corrlation de paires. De telles structures apparaissent
donc indistinguables par diffraction.
Depuis une quinzaine danne, lutilisation de faisceaux cohrents a permis de mesurer
des diagrammes de diffraction qui prsentent des franges dinterfrence ou des tavelures
(speckles) moyennes par les techniques classiques. Nous montrerons que la diffusion
cohrente permet de rsoudre en thorie certains cas dhomomtrie de Bragg, ce qui est
connu, mais quelle ouvre des voies pour traiter les cas dhomomtrie de diffusion diffuse, ce
qui lest moins [3].
Grce suite de Rudin-Shapiro [2] :
1, 1, 1, -1, 1, 1, -1, 1, 1, 1, 1, -1, -1, -1, 1, -1, 1, 1, 1, -1, 1, 1, -
1, 1, -1, -1, -1, 1, 1, 1, -1, 1, 1, 1, 1, -1, 1, 1, -1, 1
dont la diffusion diffuse est similaire celle dun suite alatoire alors quelle est dterministe,
il est possible de manipuler indpendamment les fonctions de corrlation de quadruplets des
fonctions de corrlation de paires. On peut ainsi montrer que lanalyse statistique des
tavelures des diagrammes de diffraction cohrente permet de distinguer des ordres qui
concernent des fonctions de corrlation dordre suprieur 2.

La diffraction pourrait-elle, enfin, explorer au-del des corrlations de paires ?














[1] A.L. Patterson, Nature (London) 143, 939 (1939); Phys. Rev. 65, 195 (1944)
[2] http://oeis.org/A020985
[3] Sylvain Ravy, Submitted, (http://arxiv.org/abs/1303.3792)
4b - Apriodicit, structure module Mercredi 3 juillet 13h30-15h00
- 79 -
O42 - Limpact des corrlations structurales grande chelle pour la
ractivit des solides : lexemple des oxydes AO(ABO
3
)
n
Ruddlesden-
Popper

W. Paulus
1
, M. Ceretti
1
, O. Wahyudi
2
, A. Perrichon
1
, A. Villesuzanne
3
, D. Chernychov
4
, A.
Bosak
4

1
Universit de Montpellier 2, Institut Charles Gerhard, UMR 5253, Montpellier
2
Universit de Rennes 1, Instiut de Chimie UMR 6226, Rennes
3
ICMCB, Bordeaux
4
ESRF, Grenoble

Les oxydes des mtaux de transition du type K
2
NiF
4
montrent une haute mobilit de
lion oxygne ds la temprature ambiante. Pour cette raison ils sont actuellement considrs
comme membrane doxygne dans des futures piles combustible type SOFC. Certains
composs comme le (Pr/Nd)
2
NiO
4+
montrent des proprits de conductivit ionique de
loxygne trs prometteuses dj temprature modres et peuvent intercaler loxygne sur
des sites interstitiels qui peut aller jusqu o =0.25 pour (Pr/Nd)
2
NiO
4+
.
Par diffraction neutronique combine avec des calculs de la DFT, nous avons montr
une dlocalisation dynamique de loxygne apical faible potentiel. Cette dlocalisation est
lorigine de la formation des super-rseaux, impliquant des fortes corrlations entre ordre
structural des atomes de oxygne apicaux et interstitiels, associ des ordres de charge et/ou
orbital du mtal de transition. Lanalyse de ces interactions est importante pour mieux
comprendre leur ractivit chimique et notamment leur haute mobilit ionique de loxygne
basse temprature.
Nous allons focaliser sur le cas complexe du systme Pr
2
NiO
4+,
qui montre part
dune trs forte dlocalisation dynamique de loxygne apical, des corrlations structuraux au
del de 300 pour la phase PrNiO
4.25
.
Nous discutons lenjeu comptitif entre corrlations et instabilits structurales,
provocant une dynamique de rseau modifie via la cration des modes mous, qui in fine
peuvent promouvoir la mobilit de loxygne ds la temprature ambiante.




[1] From T to T-La
2
CuO
4
via Oxygen Vacancy Ordered La
2
CuO
3.5
,

M. Ikbel Houchati, M.
Ceretti, C. Ritter and W. Paulus, Chem. Mater. 2012, 24, 3811-3815
[2] Lattice Dynamics to Trigger Low Temperature Oxygen Mobility in Solid Oxide Ion
Conductors, W.Paulus, H. Schober, S. Eibl, M. Johnson, T. Berthier, O. Hernandez, M.
Ceretti, M. Plazanet, K. Conder, C. Lamberti, J. Am. Chem. Soc. (2008) 130 (47) 16080-85
[3] On the role of lattice dynamics on low-temperature oxygen mobility in solid oxides: a
neutron diffraction and first-principles investigation of La
2
CuO
4+
, Villesuzanne Antoine,
Paulus Werner, Cousson, Alain, Hosoya Shoichi, Le Dreau Loic, Hernandez Olivier,
Prestipino Carmelo, Houchati Mohamed Ikbel, Schefer Juerg, J Solid State Electrochemistry
Volume: 15 Issue: 2 Pages: 357-366 (2011)
4c - Biologie structurale des gnomes (interactions protines/ADN, ARN
Mercredi 3 juillet 13h30-14h40
- 80 -
O43 - Vers larchitecture du tlomre de la levure bourgeonnante par
biologie structurale intgrative.

Yann-Va Le Bihan
1
, Batrice Matot
1
, Olivier Pitrement
2
, Rachel Lescasse
3
, Javier Prez
4
,
Marie-Josphe Giraud-Panis
5
, Patrick Weber
6
, Bianca Sclavi
7
, Sophie Zinn-Justin
1
, Eric Le
Cam
4
, Eric Gilson
5
, Simona Miron
1
, and Marie-Hlne Le Du
1
.

1
Lab Biologie Structurale et Radiobiologie, CEA, CNRS et Univ Paris Sud, Gif-sur-Yvette.
2
Maintenance des Gnomes, IGR, CNRS et Univ. Paris Sud, Villejuif.
3
Lab Tlomre et Rparation du Chromosome, CEA, Fontenay-aux-roses.
4
Synchrotron SOLEIL, Gif-sur-Yvette.
5
IRCAN, Univ Nice CNRS INSERM, Nice.
6
PF6, Institut Pasteur CNRS, Paris.
7
LBPA, CNRS, ENS Cachan.
Les tlomres constituent lextrmit non codante des chromosomes linaires chez les
eucaryotes. Une multitude de donnes atteste de leur implication dans le cancer et le
vieillissement. Leur raccourcissement progressif lors de la rplication de l'ADN conduit la
snescence cellulaire, ce qui est considr comme une barrire anti-tumorale et participe au
vieillissement. Inversement, leur allongement par l'enzyme tlomrase et la voie ALT est
requis pour linitiation et le maintien des cancers. Les mcanismes biologiques de maintien
des tlomres sont bien tablis, mais manquent dramatiquement de donnes structurales.
Pratiquement rien n'est connu sur le repliement appropri et la dynamique des assemblages
macromolculaires tlomriques. Par consquent, une question cl de la biologie moderne des
tlomres est de relier les fonctions associes aux tlomres la structure des complexes
nucloprotiques qui constituent les extrmits des chromosomes.
Chez la levure, Rap1 lie troitement lADN double-brin avec une frquence moyenne de
une protine indpendante tous les 18 paires de base. Son interaction avec l'ADN induit une
hypersensibilit au permanganate de potassium que nous avons attribue un rsidu
darginine conserv, et non pas une fusion ou une altration locale de l'ADN (Le Bihan et
al., 2013). Rap1 recrute des partenaires protiques fonctionnels essentiels et spcifiques pour
la rgulation ngative de l'allongement des tlomres, pour la rpression de la transcription,
ou pour l'inhibition de la voie de rparation par jonction des extrmits non homologues
(NHEJ). Rap1 est organise en domaines globulaires connects par de longues rgions non
structures, ce qui suggre que ses fonctions multiples sont associes un comportement
dynamique favorisant la formation de structures quaternaires spcifiques. Nous avons utilis
une approche intgre de mthodes complmentaires de biologie structurale (cristallographie,
RMN, SAXS) pour construire les architectures de Rap1 et du complexe Rap1/DNA. Nos
rsultats rvlent un rarrangement structural de Rap1 lors de la fixation lADN qui
implique notamment une rorientation du domaine C-terminal par rapport au domaine Myb.
Une structure cristallographique du domaine Myb en complexe avec un ADN double-brin
permet didentifier une boucle essentielle senroulant autour de lADN, qui contraint
lorientation du domaine C-terminal et affecte laffinit de Rap1 pour lADN (Matot et al.,
2012). Enfin, la combinaison des informations structurales lanalyse de la liaison de Rap1
aux rptitions tlomriques par AFM, nous permet de proposer un modle dassemblage de
Rap1 aux tlomres.
4c - Biologie structurale des gnomes (interactions protines/ADN, ARN
Mercredi 3 juillet 13h30-14h40
- 81 -
O44 - Nouvelles informations sur le mcanisme de surenroulement de
l'ADN obtenues par cryo-microscopie lectronique d'une ADN gyrase
complte.

Julie Papillon
1
, Jean-Franois Mntret
1
, Claire Batisse
1
, Reynald Hlye
2
, Patrick Schultz
1
,
Nolle Potier
2
, Valrie Lamour
1,3


1
IGBMC, UMR7104 CNRS-UdS, U964 Inserm, Illkirch, France
2
Institut de Chimie de Strasbourg, UMR7177 CNRS-UdS, Strasbourg, France
3
Hpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France

Les ADN topoisomrases de type 2 (Topo2A) remodlent la topologie de lADN lors
de la rplication, la transcription et la sgrgation des chromosomes. Ces enzymes modulaires
catalysent le transport dun ADN double brin travers la coupure dun autre duplex par un
mcanisme douverture successive de portes le long de son interface htrodimrique.
LADN gyrase bactrienne, une cible avre pour les antibiotiques, est la seule Topo2A
capable dintroduire des supertours ngatifs dans lADN ncessitant la fixation de longs
segments contigus dADN. Les donnes structurales morceles de ces complexes multi-
conformationnels laissent aujourdhui de nombreuses questions mcanistiques en suspens et
ne permettent pas toujours didentifier les tats conformationnels viss par les antibiotiques.
Nous avons dtermin par cryo-microscopie lectronique larchitecture complte de lADN
gyrase de T. Thermophilus et son complexe avec un ADN long de 155pb bloqu par
lantibiotique ciprofloxacine, aprs caractrisation de ses complexes nucloprotiques de plus
de 320kDa par spectromtrie de masse supramolculaire. Ces premires donnes structurales
sur lADN gyrase entire rvlent lorganisation quaternaire de ses domaines et le trajet de
lADN autour de lenzyme menant la formation de surenroulement ngatif. La conformation
de lenzyme en prsence dADN et de la ciprofloxacine suggre que lantibiotique bloque le
transport de lADN dans les premires tapes du cycle catalytique. Cette tude montre
galement limplication du domaine ATPase dans la capture et la stabilisation des croisements
dADN avant translocation, un mcanisme qui peut tre tendu toutes les topoisomrases de
type 2.

4c - Biologie structurale des gnomes (interactions protines/ADN, ARN
Mercredi 3 juillet 13h30-14h40
- 82 -
O45 - tudes structurales de la recombinaison homologue chez
Deinococcus radiodurans

Simone Pellegrino
1
, Jens Radzimanowski
1
, Franois Dehez
2
, Daniele de Sanctis
1
, Sean
McSweeney
1
and Joanna Timmins
1,3


1
European Synschrotron Radiation Facility, Groupe de Biologie Structurale, Grenoble,
2
Universit de Lorraine/CNRS, Nancy,
3
Institut de Biologie Structurale, Groupe Infection
virale et Cancer, Grenoble.

Chez Deinococcus radiodurans, un organisme prsentant une trs forte rsistance aux
rayonnements ionisants, la principale voie implique dans la rparation des cassures double-
brin est la voie de recombinaison homologue faisant intervenir une srie de protine Rec
ayant pour objectif de charger la recombinase RecA sur lADN afin de catalyser lchange de
brins dADN.
Nous avons utilis des mthodes de biologie structurale et de biochimie in vitro pour
caractriser la structure et les activits de plusieurs de ces protines et notamment la protine
RecN et le complexe htro-hxamrique RecO-RecR. RecN joue un rle essentiel dans les
premires tapes de reconnaissance de cassures double-brin dans lADN, alors que le
complexe RecOR reconnat les jonctions simple brin-double brin et facilite le chargement de
RecA sur lADN. Nous avons dtermin les structures cristallines de trois fragments de RecN
et, avec laide dune enveloppe de la protine entire dtermine par SAXS (small-angle X-
ray scattering), nous avons pu reconstitue une structure quasi atomique de cette protine trs
allonge (300 de long) appartenant la famille des SMC (Structural Maintenance of
Chromosomes). Nous avons galement tudi le rle de la fixation et de lhydrolyse de lATP
dans lactivit et loligomrisation de RecN et identifi les rgions de RecN impliques dans
linteraction avec lADN. Nous avons utilis une approche similaire pour RecO-RecR : nous
avons dtermin deux structures cristallines du complexe rvlant un changement de
conformation permettant la fixation de lADN au centre de ce complexe. Cette hypothse a
t confirm par ltude du complexe par SANS (small-angle neutron scattering), et les
rsidus impliqus dans la fixation de lADN simple brin ont t identifis par lutilisation de
simulations de dynamique molculaire et de mutagnse dirige.
Ces travaux nous permettent de mieux comprendre le rle et le mcanisme daction de
ces protines dans la voie de recombinaison homologue.



4d - ReNaFoBis Mercredi 3 juillet 14h40-15h00
- 83 -
O46 - Rseau National de Formation Doctorale en Biologie
Structurale Intgrative



Claudine Mayer

Institut Pasteur, Universit Paris

Les dfis actuels de la biologie structurale ncessitent de former des tudiants ayant une
culture biologique de plus en plus vaste en complment dune formation initiale suffisante en
biologie, physique, chimie, et mathmatiques. En effet, la comprhension des systmes
biologiques impose dintgrer des mthodes et des outils aux interfaces de plusieurs
disciplines. Inclure un tel ensemble de connaissances dans un cursus Licence-Master est
incompatible avec son format actuel, et conduirait une formation probablement hors de
porte de la majorit des tudiants en biologie luniversit. Depuis de nombreuses annes, la
communaut franaise de biologie structurale a eu faire face de telles difficults, les dfis
relever ne pouvant le plus souvent pas tre abords au sein dune unique universit.

Il est aujourdhui plus que ncessaire de dvelopper des collaborations et des changes
entre les universits franaises dans le cadre de l'enseignement de la biologie structurale
intgrative afin dassurer la formation et le recrutement de futurs chercheurs dans un niveau
dexcellence international. Dans ce contexte, plusieurs reprsentants des quipes de recherche
et/ou responsables de formation de cinq universits franaises (Grenoble, Marseille,
Montpellier, Paris et Strasbourg) se sont associs pour mettre en place le Rseau National de
Formation en Biologie Structurale Intgre, RNaFoBis. Soutenue par lITMO Bases
Molculaires et Structurales du Vivant, cette initiative sappuie sur des collaborations dfinies
au sein de la recherche nationale (projet FRISBI) et europenne (projet INSTRUCT). Nous
prsenterons, au cours de cet expos, les objectifs et les actions en cours de RNaFoBiS.

Roger Fourme Mercredi 3 juillet 15h00-15h30
- 84 -
SP3 - Un hommage Roger Fourme

Eric Girard
1


1
Institut de Biologie Structurale J.-P. Ebel, UMR5075 CEA-CNRS-UJF-PSB, Grenoble,
France.

Au cours de cette prsentation, je reprendrai les grandes lignes de la carrire scientifique
de Roger Fourme (1942-2012).





En particulier, je me focaliserai sur le dernier domaine de recherche que Roger avait initi en
2000 : les tudes sur les effets des hautes pressions hydrostatiques sur les macromolcules
biologiques [1,2].


[1] R. Fourme, E. Girard, R. Kahn, A.-C. Dhaussy, I. Ascone, Annu. Rev. Biophys. 2009, 38,
153171.
[2] R. Fourme, E. Girard, K. Akasaka, Curr Opin Struct Biol 2012, 22, 636642.

Confrence Grand Public lUniversit Bordeaux Segalen
Mercredi 3 juillet 18h25-19h25
- 85 -
SP4 - Quasicrystals: Structures, properties and applications

A.P. Tsai

Institute of Multidisciplinary Research for Advanced Materials, Tohoku University, Sendai
980-8577, Japan


Quasi-crystal (Qc) is no longer a unique structure matter since it has been confirmed
as an equilibrium phase in a large number of alloys. It is clear that stability of stable Qcs can
be understood within the framework of Hume-Rothery rules. Even more interesting, it is
found that stable Qcs are a strict electron compound, which only formed for alloys with sharp
valence electron concentration (e/a: electron-atom ratio). Actually, most stable Qcs were
discovered on the basis of the e/a criterion. With these stable Qcs, structural analysis is
allowed to study on a single grain sample.

Although few structural models have been proposed, they still suffered from
considerable uncertainty due to topological and chemical disorder. Recently, understanding in
structure has been highly improved in a binary Cd-Yb Qc. Furthermore, observed surface
structures of quasicrystals by STM have been well interpreted by bulk structural model.

This talk will mainly deal with three topics; the first one is the Hume-Rothery rules for
stable Qcs, the second one is regarding the structure of a binary Cd-Yb Qc and the third one is
the surface structures in relation to bulk structural models for Qcs.
Sance plnire III Jeudi 4 juillet 9h00-10h00
- 86 -
SP5 - Les quasicristaux : structure atomique et dynamique.

Marc de Boissieu

SIMaP, CNRS, Universit de Grenoble, Saint Martin dHres, France


La dcouverte des quasicristaux par Dan Shechtman a t une rvolution en
cristallographie qui a profondment modifie notre comprhension des matriaux ordonns.
En effet les quasicristaux sont des matriaux ordonns grande distance (comme le montre
leur diagramme de diffraction avec des pics de Bragg) mais non priodiques. Aprs une
introduction sur les quasicristaux, je prsenterai les rsultats rcents obtenus dans le systme
binaire CdYb, pour lequel la structure atomique de cette phase icosadrique est maintenant
bien comprise. Est ce que lordre quasipriodique grande distance induit de nouvelles
proprits physiques ? Jaborderai cette question en prsentant des rsultats sur la dynamique
de ces matriaux : la dynamique de rseau et les phonons dune part, et les phasons dautre
part, qui sont des fluctuations caractristiques de lordre quasipriodique. Finalement
jaborderai la question des mcanismes qui peuvent stabiliser ces structures ordonnes et non
priodiques.
5a - Approches multitechniques en cristallochimie Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 87 -
O47 - Combinaison des donnes de diffraction des lectrons et de
diffraction des rayons X poudre: que peut-on en attendre?

P. Boullay
1
, N. Barrier
1
, S. Malo
1
, O.

Perez
1
and L. Palatinus
2


1
CRISMAT, CNRS UMR 6508, 6 Bd du Marchal JUIN 14050 CAEN Cedex, France
2
Institute of Physics of the AS CR, v.v.i. Na Slovance 2, 182 21 Prague, Czechia.

Dterminer la structure de matriaux complexes et/ou de taille nanomtrique est un
enjeu important en Science des Matriaux, essentiel pour dfinir une stratgie dlaboration
de matriaux et connatre linfluence des mcanismes structuraux sur les proprits.
Lheureux possesseur dun monocristal de bonne qualit naura vraisemblablement pas se
soucier dune approche multitechnique pour dterminer la structure du compos
nouvellement synthtis. De mme, un compos pulvrulent monophas de difficult
structurale moyenne ne devrait gure poser de problme aux outils de rsolution de structures
applicables aux diagrammes de diffraction de poudres. Pour certains matriaux de complexit
structurale leve (maille de trs grand volume, phases apriodiques, prsence de dsordre,
) et/ou de faible volume diffractant (films minces, nanoparticules, ), une approche
multitechnique prend, en revanche, tout son sens.
La microscopie lectronique en transmission a depuis longtemps fait ses preuves en
tant que technique complmentaire de la diffraction des rayons X sur poudre. Souvent
premire tape vers la rsolution structurale, elle permet dapporter des informations sur les
paramtres de maille, la symtrie et/ou la prsence de motifs structuraux (voir [1-3] pour
quelques exemples). Loin de se limiter un simple aspect qualitatif, lmergence de la
technique de prcession des lectrons [4] en mode dit tomographique [5] combin la
mthode de rsolution par charge-flipping [6] permet denvisager une utilisation plus
quantitative des donnes de diffraction des lectrons aboutissant un premier modle
structural pouvant tre affin laide du diagramme de diffraction de poudres. Dans le cadre
de cet expos, nous prsenterons un aperu de ce qui peut tre obtenu par prcession des
lectrons dans le cas de la rsolution de structures modules incommensurables avec
notamment lexemple des composs o-CaTe
2
O
5
[7] et Bi
5
Nb
3
O
15
[8]. Nous verrons que la
combinaison des donnes de diffraction des rayons X, des neutrons et des lectrons peut tre
ralise (JANA2006 [9]) et nous en discuterons lintrt dans le cadre dun affinement
structural.

[1] P. Boullay et al, J. Solid State Chem. 1997, 132, 239-248.
[2] M. Huv et al, Chem. Mater. 2004, 16, 26282638.
[3] L.B. McCusker et al, Z. Kristallogr. 2013, 228, 1-10.
[4] R. Vincent et al, Ultramicroscopy 1994, 53, 271-282.
[5] U. Kolb et al, Ultramicroscopy 2007, 107, 507.
[6] G. Oszlnyi et al, Acta Cryst. A 2004, 60, 134-141.
[7] N. Barrier, Habilitation Diriger des Recherches 2012, Universit de Caen-Basse
Normandie.
[8] P. Boullay et al, Inorg. Chem. 2013, 52, 61276135.
[9] V. Petricek et al, Institute of Physics, Praha, Czech Republic, 2006.
5a - Approches multitechniques en cristallochimie Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 88 -
O48 - Apport des calculs ab initio la rsolution des structures cristallines :
intrt de la modlisation en spectromtrie RMN et Mssbauer

Florent Boucher*

Institut des Matriaux Jean Rouxel (IMN), Universit de Nantes, CNRS, 2 rue de la
Houssinire, BP 32229, 44322 Nantes Cedex
*Florent.Boucher@cnrs-imn.fr

Concernant la caractrisation des matriaux par diffraction des rayons X, nous
observons depuis plusieurs annes un engouement marqu pour les tudes sur poudres
dlaissant de fait lintrt port aux approches sur mono cristaux. Cette mutation dans le
domaine des techniques de diffraction, essentiellement guide par une volution des
problmatiques matriaux : tude in situ, matriaux polycristallins ou nanostructurs,
matriaux dlectrodes, nest pas sans consquences sur la qualit des donnes que lon peut
en extraire. Bien que les diffractomtres et les dtecteurs soient de plus en plus performants,
les informations structurales issues des tudes de diffraction sur poudre sont par nature
entaches dune plus grande imprcision. Le cristallochimiste ou le chimiste des matriaux
doit en tre conscient lorsquil cherche interprter telle ou telle proprit partir de
lanalyse des longueurs de liaisons ou de ltude des environnements atomiques.

Cette difficult peut en partie tre contourne en combinant plusieurs techniques de
caractrisations telles que la diffraction lectronique ou neutronique ou des techniques de
sondes locales telles que la RMN, le Mssbauer ou la spectromtrie dabsorption des rayons
X. Dans cet expos, nous montrerons comment les calculs de structure lectronique ab initio
(bass sur la thorie de la fonctionnelle de la densit, DFT) sont galement complmentaires
de toutes ces approches. Les optimisations de gomtrie permettent par exemple damliorer
la description des distances lorsque quexistent, au sein dune mme structure, des contrastes
marqus entre atomes lourds et lgers ou que des atomes dhydrogne doivent tre
positionns. Laccs aux composantes du tenseur de gradient de champs lectrique autorise en
parallle une corrlation directe aux donnes de la RMN (C
q
) et du Mssbauer (clatement
quadripolaire). Finalement, le calcul des constantes dcran ou des densits de charge au
noyau permet la comparaison avec les valeurs de dplacement chimique (RMN) ou de
dplacement isomrique (Mssbauer). Nous illustrerons cela au travers de quelques exemples
issus dtudes rcentes.
5a - Approches multitechniques en cristallochimie Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 89 -
O49 - Nanorods de niobates et niobo-tantalates de potassium pitaxis
sur substrats monocristallins : tude par diffraction des rayons X,
diffraction des lectrons en prcession et tomodiffraction des lectrons

Valrie Demange
1
, Vincent Dorcet
1
, Lukas Palatinus
2
, Philippe Boullay
3
, Anne Waroquet
1
,
Noha Hakmeh
1
, Quentin Simon
4
, Maryline Guilloux-Viry
1

1
Institut des Sciences Chimiques de Rennes, UMR 6226 CNRS/Universit de Rennes 263,
avenue Gnral Leclerc, Campus de Beaulieu, 35042 Rennes, France,
2
Institute of Physics, Department of Structure Analysis, Cukrovarnicka 10, 16253 Praha 6,
Czech Republic,
3
Laboratoire de Cristallographie et Sciences des Matriaux, CRISMAT UMR 6508 CNRS /
ENSICAEN, 6, boulevard du Marchal Juin, 14050 Caen Cedex 4, France,
4
Institut de Chimie de la Matire Condense de Bordeaux, ICMCB UPR 9048 CNRS, 87,
Avenue du Docteur Schweitzer, 33608 PESSAC Cedex, France.

Notre tude porte sur la synthse par ablation laser puls, sur des substrats
monocristallins de (100)SrTiO
3
et de saphir R, de niobates et niobo-tantalates de potassium et
la caractrisation de leur structure et microstructure. L'augmentation du taux de potassium
relativement celui du niobium, ou niobium et tantale, permet d'obtenir successivement les
phases rfrences dans le diagramme de phases KNbO
3
-Nb
2
O
5
(i.e. K(Nb,Ta)
3
O
8
,
K
3
(Nb,Ta)
7
O
19
, K
4
(Nb,Ta)
6
O
19
, K
6
(Nb,Ta)
10
O
30
, K(Nb,Ta)O
3
) [1]. Les composs anisotropes
prsentent pour la plupart une croissance sous forme de nanorods pitaxis. Parmi eux, nous
avons tudi plus spcifiquement les composs de structure-type bronze de tungstne
quadratique dont la structure a t rsolue par diffraction lectronique en prcession et
tomodiffraction des lectrons, techniques couples la microscopie lectronique en
transmission. Les relations d'pitaxie de ces nanorods ont t dtermines par diffraction des
rayons X sur un diffractomtre 4-cercle.

Structure aprs affinement d'un nanorod K
5.96
Nb
10.56
O
29.2

partir des donnes de diffraction lectronique en prcession.

[1] A. Reisman, F. Holtzberg. J. Am. Chem. Soc. 1955, 77, 2115-1955.
5a - Approches multitechniques en cristallochimie Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 90 -
O50 - Solides hybrides base de ligands dorigine naturelle :
rsolution structurale via une approche multitechnique diffraction /
RMN

Lucy Cooper
1
,

Thomas Devic
1
, Nathalie Guillou,
1
Charlotte Martineau,
1
Christian Serre
1

1
Institut Lavoisier, UMR CNRS 8180, Universit de Versailles St-Quentin-en-Yvelines, 45
avenue des tats-Unis, 78035, Versailles, France

Les Metal Organic Frameworks (MOFs) sont des polymres hybrides cristalliss
poreux forms de ligands organiques et de briques inorganiques interagissant par liaisons
fortes [1]. Ils sont souvent obtenus partir de poly-carboxylates et de cations M(II) ; ce
systme conduit des cristaux, gnralement peu stables lhydrolyse. A linverse, les
cations plus chargs (M(III), M(IV)) et les ligands plus basiques, conduisent souvent des
matriaux plus stables, mais moins bien cristalliss. Dans cette tude, nous nous sommes
intresss la ractivit du systme Zr(IV) / acide gallique, un carboxyphnolate dorigine
naturelle. La complexit des solides obtenus (incertitude sur ltat de protonation des ligands
et diversit des polydres de coordination) rend difficile le processus de dtermination
structurale uniquement partir de la diffraction sur poudre. Nous avons donc choisi une
stratgie alternative, combinant les deux techniques complmentaires que sont la diffraction et
la Rsonance Magntique Nuclaire (RMN) ltat solide.
Les donnes RMN
1
H et
13
C, en renseignant sur la nature, les modes de coordination et
la multiplicit des ligands organiques, ont permis damorcer la rsolution structurale par
diffraction de deux des nombreuses phases pulvrulentes identifies dans ce systme. La
premire structure, obtenue en prsence dexcs dacide salicylique,
Zr[C
6
H
2
O
3
CO
2
][C
6
H
4
OCO
2
][HCON(CH
3
)
2
], peut se dcrire partir de chanes dantiprismes
base carre connects par artes. Dans le second compos synthtis plus haute
temprature, lacide gallique perd sa fonction carboxylique, pour former
Zr[C
6
H
3
O
3
]
2
.N(CH
3
).
La synthse, la structure, les caractrisations physicochimiques et lapproche conjointe
diffraction sur poudre / RMN du solide utilise seront prsentes.











Fig. 1 : Structures des deux composs obtenus avec (a) et sans acide salicylique (b).

[1] G. Frey, Chem. Soc. Rev, 2008, 37, 191.
5b - Densit lectronique, modlisation Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 91 -
O51 - Proprits lectrostatiques de molcules dintrt
pharmaceutique

Nour Eddine Ghermani,
1,2
Nouha El Hassan,
1
Aziza Ikni,
1
Xiaoxuan Shi,
1
Jean-Michel
Gillet
1
et Anne Spasojevic-de Bir
1


1
Laboratoire Structures, Proprits et Modlisation des Solides (SPMS) UMR CNRS 8580,
Ecole Centrale Paris, 1, Grande Voie des Vignes, 92295 Chtenay-Malabry, France.
2
Institut Galien Paris Sud, UMR CNRS 8612, Universit Paris Sud, Facult de Pharmacie, 5,
rue Jean-Baptiste Clment, 92296 Chtenay-Malabry, France.

Les interactions molculaires sont rgies par les proprits lectrostatiques tells que
les charges et les moments atomiques, le potentiel et le champ lectrostatique. Ces proprits
sont drives de la distribution lectronique de la molcule isole ou lintrieur dun cristal.
Deux mthodes existent pour la dtermination de la distribution lectronique : une mthode
exprimentale base sur la diffraction X haute rsolution et une mthode thorique base sur
les calculs quantiques Hartree-Fock ou DFT (fonctionnelle de densit). Ces deux mthodes
donnent des rsultats trs comparables. Depuis plus de dix ans, nous avons appliqu ces
mthodes diffrentes molcules pharmaceutiques qui ont dans le domaine de la recherche et
de la sant en gnral un intrt certains.

Dans cette prsentation orale, nous commencerons par donner les bases de calculs des
proprits lectrostatiques avant de prsenter nos rsultats sur les molcules pharmaceutiques
que nous avons tudies.
5b - Densit lectronique, modlisation Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 92 -
O52 - Ab initio Description of Nuclear Motion and Electron
Correlation Effects on the Density Matrix of Crystals

Alessandro Erba,
a,*
Cesare Pisani,
a
Matteo Ferrabone
a
and Roberto Dovesi
a


a
Dipartimento di Chimica, Universit di Torino, via Giuria 5 10125, Torino, Italy
* E-mail: alessandro.erba@unito.it

A large number of effects has to be accurately taken into account when comparing theoretical
predictions with experimental determinations of the electron charge distribution of crystals.
Within the framework of ab initio simulations, in this contribution we address two of them:
thermal nuclear motion and dynamic electron correlation.
Two schemes for the inclusion of nuclear motion effects are presented: (i) a fully ab initio
technique for the determination of atomic anisotropic displacement parameters (ADP) of
crystalline materials within the harmonic approximation to the lattice potential [1]; (ii) a
harmonic Monte Carlo ab initio approach for the description of nuclear motion effects on the
electronic density matrix of crystalline materials [2]: in the frame of the Born-Oppenheimer
approximation, nuclear motions in crystals can be simulated rather accurately using a
harmonic model. In turn, the electronic first-order density matrix can be expressed as the
statistically weighted average over all its determinations each resulting from an instantaneous
nuclear configuration.
As regards electron correlation, the CRYSCOR program implements the MP2 method for
crystals, reformulated according to the so-called local approach (namely LMP2) [3]. The
program provides both the LMP2 correction to the Hartree-Fock energy and one-electron
Density Matrix (DM) [4]. As a consequence, the correlation correction at LMP2 level to
several DM-related quantities such as electron charge and momentum densities, Compton
profiles, static structure factors, etc. can be evaluated.
Such schemes have been developed within the formalism of all-electron atom-centered basis
sets, one-electron Hamiltonians (Hartree-Fock, Density-functionaltheory, hybrids) and
periodic boundary conditions, and implemented in the CRYSTAL and CRYSCOR programs
for solid state quantum chemistry.





[1] A. Erba, M. Ferrabone, R. Orlando and R. Dovesi, J. Comput. Chem., 34, 346 (2013).
[2] C. Pisani, A. Erba, M. Ferrabone and R. Dovesi, J. Chem. Phys., 137, 044114 (2012).
[3] C. Pisani, M. Schtz, S. Casassa, D. Usvyat, L. Maschio, M. Lorenz and A. Erba, Phys.
Chem. Chem. Phys., 14, 7615 (2012)
[4] D. Usvyat and M. Schtz, J. Phys.: Conf. Ser., Honorary issue Pisani, 117, 012027
(2008).
5b - Densit lectronique, modlisation Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 93 -
O53 - Les liaisons halogne et chalcogne pour lingnierie cristalline
et la chimie supramolculaire

M. Brezgunova
1
, E. Aubert
1
, S. Dahaoui
1
, T.T.T. Bui,
1
J. Lieffrig,
2
S. Lebgue,
1
C. Jelsch,
1
P.
Fertey,
3
C. Lecomte,
1
J.G. ngyn,
1
M. Fourmigu,
2
Enrique Espinosa
1


1
Laboratoire de Cristallographie, Rsonance Magntique et Modlisations (CRM2), UMR
CNRS 7036, Universit de Lorraine, BP 70239, Bd. des Aiguillettes, 54506 Vandoeuvre-ls-
Nancy, France.
2
Institut des Sciences Chimiques de Rennes Universit Rennes 1, UMR CNRS 6226 Campus
de Beaulieu, 35042 Rennes, France.
3
Synchrotron Soleil, LOrme des Merisiers Saint-Aubin, BP 48, 91192 Gif-sur-Yvette, France.
E-mail : enrique.espinosa@crm2.uhp-nancy.fr

La liaison halogne est une interaction attractive et directionnelle. Elle se forme entre un
atome dhalogne, li un atome de carbone, et un autre atome dhalogne ou une base de
Lewis (CHalX, X = Hal, B). Lorigine de cette interaction faible a t associe
lanisotropie de la distribution lectronique autour du noyau de lhalogne. Cette anisotropie
conduit des rgions lectrophiles (
+
) selon la direction CHal et des rgions nuclophiles
(
-
) dans le plan perpendiculaire cette direction. Lintensit et les aspects directionnels de la
liaison halogne peuvent tre aussi efficaces que ceux de la liaison hydrogne pour guider
lassemblage molculaire. Malgr le fait que cette interaction puisse tre mise profit dans les
domaines de lingnierie cristalline et de la chimie supramolculaire, la caractrisation et la
modlisation exprimentale de la liaison halogne ont t trs peu explores. Notre groupe a
tudi la structure et la densit lectronique cristalline des composs hexachlorobenzne
(C
6
Cl
6
), hexabromobenzne (C
6
Br
6
), pentachlorophnol (C
6
Cl
5
OH) et pentabromophnol
(C
6
Br
5
OH), ce qui a permis de mettre en vidence les rgions lectrophile/nuclophile autour
des noyaux des atomes de chlore et de brome et les interactions que celles-ci ralisent.[1,2]
Par ailleurs, la liaison chalcogne prsente de nombreuses similitudes avec la liaison
halogne. En effet, elle est galement contrle par des interactions lectrostatiques du type
lectrophile-nuclophile entre rgions atomiques
+
et
-
. Avec ltude du compos C
8
H
4
O
2
Se
nous avons prouv le fort caractre directionnel de la liaison chalcogne ChalX (X = Chal,
Hal, B).[3]
Afin de les utiliser dans les domaines de lingnierie cristalline et de la chimie
supramolculaire, lintensit lectrostatique et lnergie des liaisons halogne et chalcogne
ont t caractrises et compares celles des liaisons hydrogne dans les mmes structures
cristallines.[2,3]
[1] (a) T. T. T. Bui, S. Dahaoui, C. Lecomte, G. R. Desiraju, E. Espinosa, Angew. Chem. Int.
Ed., 2009, 48, 3838-3841; (b) E. Aubert, S. Lebgue, M. Marsman, T.T.T. Bui, C. Jelsch, S.
Dahaoui, E. Espinosa and J.G. ngyn, J. Phys. Chem. A, 2011, 115, 14484-14494.
[2] M. E. Brezgunova, E. Aubert, S. Dahaoui, P. Fertey, S. Lebgue, C. Jelsch, J. G. ngyn,
E. Espinosa, Cryst. Growth & Des., 2012, 12, 5373-5386.
[3] M. E. Brezgunova, J. Lieffrig, E. Aubert, S. Dahaoui, P. Fertey, S. Lebgue, J. G. ngyn,
M. Fourmigu, E. Espinosa, Cryst. Growth & Des., 2013 (submitted).
5b - Densit lectronique, modlisation Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 94 -
O54 - Ab-initio Study of structural, Electronic and Magnetic
Properties of CdTe Doped Transition Metal Co

Samir Bentata*, Ali Zitouni, Bouabdellah Bouadjemi and Wissam Benstaali

Laboratoire de Technologie et des Proprits du Solide
Faculty of Sciences and Technology, BP227
Abdelhamid Ibn Badis University, Mostaganem (27000) Algeria

*E-mail: sam_bentata@yahoo.com

The full potential linear augmented plane wave (FPLAPW) based on density-
functional theory (DFT) is employed to study the structural, electronic and magnetic
properties of transition metal Co doped CdTe. The 3d transition element Co is used as a
dopant in order to induce spin polarization. We have analyzed the structural parameters,
charge and spin densities, total and partial densities of states within the generalized gradient
approximation (GGA). The results show a half-metallic ferromagnetic character with an
important magnetic moment. The results obtained, make the Co
x
Zn
1-x
Te a promising
candidate for application in spintronics.

Keywords: magnetic moment, half-metallic, spin-up/spin-down, GGA.









5c - Cristallographie biologique et sant Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 95 -
O55 - Mcanismes de reconnaissance et d'activation des rcepteurs
hormonaux par les perturbateurs endocriniens environnementaux

William Bourguet

Centre de Biochimie Structurale, Inserm U1054-CNRS U5048-UM1, 34090 Montpellier, France

Nous sommes quotidiennement exposs des milliers de polluants environnementaux
dont certains peuvent agir comme des perturbateurs endocriniens. Le terme de perturbation
endocrinienne fait rfrence la capacit de certaines substances exognes moduler le
systme hormonal de manire inapproprie et provoquer des effets dltres sur les
organismes vivants tels que des troubles de la reproduction, du comportement, du
mtabolisme ou encore des cancers. Les perturbateurs endocriniens sont le plus souvent des
composs de synthse produits par lindustrie mais on en trouve galement ltat naturel,
notamment dans les plantes et les champignons. Ils ont des structures chimiques gnralement
trs loignes de celles des hormones naturelles qui rendent la comprhension de leur liaison
aux rcepteurs nuclaires hormonaux particulirement difficile.

Dans ce contexte, nous dveloppons un projet original visant tudier de manire
systmatique les modes de reconnaissance et dactivation utiliss par les grandes familles de
polluants environnementaux (phtalates, parabnes, benzophnones, pesticides, alkylphenols,
organotains, etc.) lors de linteraction avec leurs rcepteurs hormonaux cibles. Lors de cet
expos, je prsenterai plus particulirement les cas du bisphnol A (BPA) [1], des
organotains [2] et du phtalate MEHP [3] afin dillustrer la diversit des mcanismes mis en
uvre. Jvoquerai galement le dveloppement dun outil bioinformatique qui utilise ces
structures cristallographiques exprimentales pour faciliter la modlisation de linteraction des
molcules environnementales avec les rcepteurs nuclaires et donc la prdiction de leur
activit hormonale.

Une application directe de ces rsultats dans le domaine de lenvironnement est de
pouvoir proposer des modifications chimiques des composs existants afin de dissocier leurs
proprits industrielles de leur activit hormonale rsiduelle. Ces recherches peuvent avoir
galement des retombes dans le domaine de la sant car elles permettent de rvler des
modes de liaison insouponns pouvant inspirer la conception de nouvelles molcules
thrapeutiques.






[1] Delfosse et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 2012, 109, 14930-5.
[2] le Maire et al., EMBO Rep. 2009, 10, 367-73.
[3] Rsultats non publis.
5c - Cristallographie biologique et sant Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 96 -
O56 - Une approche structurale pour linhibition slective de
PI3Kbeta

Thomas Bertrand
1
, Jean-Pierre Marquette
1
, Andreas Karlsson
1
, Nadine Michot
2
, Angela
Virone-Oddos
3
, Victor Certal
3
,

Frank Halley
3


1
Structure Design and Informatics,
2
Protein Production,
3
Oncology Drug Discovery
Sanofi, 13 Quai Jules Guesde, 94403 Vitry-sur-Seine France.

La voie de signalisation PI3K/mTOR est implique dans la prolifration, la survie des
cellules tumorales et les mtastases. Lidentification de mutations somatiques activatrices du
gne PIK3CA ainsi que la frquence trs leve de la perte du suppresseur de tumeur PTEN
(Phosphatase and TENsin homologue), activant cette voie dans les tumeurs humaines, ont
conduit au dveloppement de nouvelles thrapies anticancreuses ciblant cette voie. Dans le
cas de la perte de PTEN, lactivation anormale de cette voie de signalisation est due
lisoforme PI3Kbeta. La plupart des inhibiteurs de PI3K en dveloppement clinique tant des
molcules pan-PI3K, il serait utile de dcouvrir des inhibiteurs slectifs de lisoforme
PI3Kbeta pour le traitement des cancers humains prsentant une dficience en PTEN. Les
structures de PI3Kbeta et dautres isoformes en complexe avec diffrents inhibiteurs ont t
rsolues par cristallographie des rayons X. Elles ont permis de mieux comprendre la relation
structure-activit de la srie chimique du candidat actuellement en phase clinique ainsi que sa
slectivit
1
.




















[1] Certal et al., J. Med. Chem. 2012, 55(10), 4788-4805.
5c - Cristallographie biologique et sant Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 97 -
O57 - Structure cristallographique de la protine FadD32 de
Mycobacterium marinum, une cible potentielle pour le dveloppement
de nouveaux antituberculeux

Valrie Guillet
1
, Sgolne Galandrin
2
, Mamadou Daff
2
, Hdia Marrakchi
2
et Lionel
Mourey
1


1
Groupe de Biophysique Structurale, IPBS/CNRS,
2
Enveloppes mycobactriennes : Structure, biosynthse et fonctions, IPBS/CNRS Universit
de Toulouse, F-31077 Toulouse, France

La dcouverte de nouveaux antituberculeux est ncessaire pour permettre un traitement
efficace de la maladie quel que soit le stade de linfection. Un des axes pour la dcouverte de
nouvelles molcules est de cibler la biosynthse de composants de lenveloppe
Mycobacterium tuberculosis, parmi lesquels les acides mycoliques. Ces lipides sont des
composants majeurs et spcifiques de lenveloppe mycobactrienne et essentiels la survie.
Ltape clef de la formation des acides mycoliques est la condensation de deux chanes
dacides gras. Cette tape est contrle par lopron fadD32-pks13-accD4, essentiel la
croissance du bacille tuberculeux [1]. FadD32 est une fatty acyl-AMP ligase (FAAL) qui
active un acide gras en C50-C60 (conversion des acides gras en acyl-adnylates [2]) avant
condensation avec un acide gras en C22-C26 par lenzyme Pks13 [3]. La protine FadD32 est
conserve dans tous les gnomes des espces mycobactriennes squences et reprsentent
une cible trs prometteuse. Lactivit enzymatique in vitro de FadD32 de M. tuberculosis
tant relativement faible, nous avons largi cette tude dautres enzymes orthologues
complexes des analogues de substrats ou inhibiteurs. Des cristaux de FadD32 de M.
marinum et M. smegmatis ont t obtenus et les structures rsolues en complexe avec un
inhibiteur analogue de substrat [4].
Ces structures sont essentielles pour comprendre les disparits de spcificit de substrat
et dactivit enzymatique entre les diffrentes FadD32 et au sein de la famille des FAAL,
ouvrant ainsi de nouvelles perspectives en drug design. Outre la rsolution de la structure,
nous avons galement dvelopp un test de criblage haut-dbit (HTS). Lidentification de
ligands potentiels et la validation de ces composs a t ralise par mesure de la modulation
de la stabilit thermique. Ce criblage a permis lidentification de nouvelles classes
dinhibiteurs [5].



[1] Portevin D. et al., J. Biol. Chem. 2005, 280, 8862-8874.
[2] Lger M. et al., Chem. Biol. 2009, 16 (5): 510519.
[3] Gavalda S. et al., J. Biol. Chem. 2009, 284 (29): 1925519264.
[4] Guillet V. et al., manuscrit en prparation
[5] Galandrin S. et al., J. Biomol. Screen. 2013, 18(5):576-87.
5c - Cristallographie biologique et sant Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 98 -
O58 - Toward closing the synaptic gap: a molecular approach to
explore neuronal connectivity deficiencies associated with autism

Pascale Marchot
1,2
, Philippe Leone
1
, Igor P Fabrichny
1,2
, Davide Comoletti
3
, Meghan T
Miller
3
, Graldine Ferracci
4
, Simon U Garcia
3
, Sandrine Conrod
2
, Palmer Taylor
3
, Yves
Bourne
1


1
Architecture et Fonction des Macromolcules Biologiques (AFMB), CNRS/AMU, Marseille,
France.
2
Biochimie des

Interactions Cellulaires et Molculaires (BIMC), CNRS/AMU, and
4
Centre
dAnalyse Protomique de Marseille (CAPM), Facult de Mdecine Secteur Nord, Marseille,
France.
3
Dept. of Pharmacology, Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences (SSPPS),
UCSD, La Jolla, CA.

Neuronal circuits are maintained by homeostatic mechanisms controlling synapse
maturation and signaling. The neuroligins are postsynaptic cell adhesion proteins whose
transient associations with presynaptic alpha- and beta-neurexins participate in synaptogenesis
and may regulate the ne balance between excitation and inhibition. This heterophilic
interaction is regulated by gene selection, alternative mRNA splicing and post-translational
modifications. Mutations in the neuroligin and neurexin genes appear to be associated with
autism and mental retardation.
Structural analyses of neuroligin-4 [1] and its complex with a beta-neurexin partner [2]
led to position the neuroligin structural defects associated with autism-linked mutations and
precluding either proper folding and trafficking to the cell membrane, or recognition of the
neurexin partner. These analyses also showed that whereas neuroligin-1 (found at
glutamatergic and central cholinergic synapses) and neuroligin-2 (found at gabaergic and
glycinergic synapses) are preset conformationally to respectively bind and not bind neurexin,
conformational reshaping at the surface of neuroligin-4 (found at glycinergic synapses),
controled by environmental variations, is required for accommodating neurexin, thus adding
another mean for regulation of the neurexin-neuroligin interaction.
This work illustrates how structural biology, associated with molecular biology and
biochemistry approaches, can contribute to dissect the organization and functioning of inter-
cellular interactions crucial for neuronal activity.

[1] Fabrichny, Leone, Sulzenbacher, Comoletti, Miller, Taylor, Bourne, Marchot (2007)
Structural analysis of the synaptic protein neuroligin and its |-neurexin complex:
determinants for folding and cell adhesion. Neuron 56, 979-91.
[2] Leone, Comoletti, Ferracci, Conrod, Garcia, Taylor, Bourne, Marchot (2010) Structural
insights into the exquisite selectivity of neurexin/neuroligin synaptic interactions. EMBO J 29,
2461-71.

Work supported by the SPINE2-Complexes Consortium (to YB, PM and PL); the CNRS
Direction des Relations Internationales Sciences de la Vie (to PM and YB); the CNRS and
Fondation pour la Recherche Mdicale (to IF); the Autism Speaks and the Cure Autism Now
Pilot Study (to DC), and NIH grants (to PT and MM).

6a - Mthodes mergentes en cristallographie Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 99 -
O59 - Application de la Fonction de Distribution de Paires l'tude de
matriaux nano-cristallins ou mal ordonns

Pierre Bordet

Institut Nel, CNRS-UJF, Grenoble

Depuis quelques annes, lanalyse de la diffusion totale par la fonction de distribution
de paires (PDF) connait un renouveau important [1], motiv, dune part, par le dveloppement
de nouvelles sources de haute nergie et intensit allies des mthodes danalyse robustes et
dautre part par lmergence de thmatiques matriaux ncessitant la prise en compte de la
structure locale. Ainsi, lanalyse PDF a-t-elle t applique avec succs des problmes trs
varis allant de ltude de la transition Jahn-Teller dans les manganites magnto-rsistives [2]
celle dinclusions nanocristallines dans des minraux base de titane [3].
Cependant, lutilisation de la PDF a t jusquici cantonne pour lessentiel au domaine
des composs minraux de structures relativement simples. Nous voulons ici montrer travers
deux exemples que la PDF peut tre un outil prcieux dans le cadre dtudes structurales de
matriaux plus complexes
Le premier de ces exemples portera sur lapport de la PDF dans ltude de composs
molculaires ou pharmaceutiques. Le deuxime, sur ltude du verdissement progressif de
pigments de bleu de Prusse anciens. Dans les deux cas, on prcisera lapport de lanalyse PDF
ainsi que les difficults nouvelles qui devront tre prises en compte pour un application
optimale de la mthode ce type de composs


















[1] EGAMI T., BILLINGE S. J. L. (2003) Underneath the Bragg Peaks: Structural analysis of
complex materials, Pergamon, Oxford, England.
[2] BOZIN ET AL. (2007) Phys. Rev; Lett. 98, 137203.
[3] GREY I.E., et al. (2010) American Mineralogist, 95, 161
6a - Mthodes mergentes en cristallographie Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 100 -
O60 - Nouvelles possibilits exprimentales en physique introduites
par les XFELs

Jan Lning

Universit Pierre et Marie Curie, Paris

Le rayonnement des nouveaux lasers lectrons libres mettant des rayons X (XFEL,
pour X-ray Free Electron Laser) permet de raliser des expriences entirement nouvelles
grce aux proprits uniques de leur rayonnement : des impulsions ultra-brves (domaine de
la femtoseconde) et ultra-intenses avec un trs haut degr de cohrence. Ceci cre des
nouvelles possibilits pour l'tude exprimentale dans une grande diversit de domaines
scientifiques, aller de la physique la chimie, la biologie et autres.

Pour leur exploitation, un grand nombre de nouvelles techniques exprimentales et
d'instrumentations originaux ont t conus pendant les quelques annes depuis le XFEL
FLASH en Hambourg est devenu une source ouverte aux utilisateurs. Entre temps, il y a
quatre XFELs qui servent une communaut d'utilisateurs en pleine croissance : les XUV-
FELs FLASH et FERMI (Italie) et les XFELs LCLS (Etats-Unis) et SACLA (Japon).

Cette prsentation commencera par un rsum de ce dveloppement rcent en mettant
l'accent sur les capacits et les dfis exprimentaux qui drivent des proprits uniques de ces
sources.
Aprs une prsentation plus gnrale de l'tat de l'art des techniques de diffusion aux
XFELs, quelques exemples rcents concernant la physique de la matire condense sont
discuts en plus de dtails.
6a - Mthodes mergentes en cristallographie Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 101 -
O61 - Mthodes rapides pour analyser les dsordres structuraux
statiques et dynamiques dans limmense espace rciproque.

Laurent Gurin
1
, Bertrand Toudic
1
, Cline Mariette
1
, Philippe Rabiller
1
, Alexei Bosak
2
,
Danile de Sanctis
2
, Jacques Ollivier
3


1
Institut de Physique de Rennes,
2
ESRF, Grenoble,
3
ILL, Grenoble

Une tendance constante de la cristallographie est daller vers ltude de systmes de
plus en plus complexes. Ceci se caractrise par des mailles de plus en plus grandes, voire
infinies pour des cristaux apriodiques qui possdent un ordre grande distance mais sans la
symtrie de translation. Aux structures moyennes sont associs des dsordres, fluctuations de
diffrents types qui induisent la rduction de lintensit des pics de Bragg et simultanment
lapparition de la diffusion diffuse dans lespace rciproque. Un exemple fameux est le
Thermal Diffuse Scattering (T.D.S.), signature des branches de phonon dont lintensit crot
comme le module du vecteur rciproque au carr. Bien sr de nombreux autres sources de
dsordre existent en lien, comme le T.D.S., avec des fluctuations collectives (modes de
phason si matriaux apriodiques, phnomnes prtransitionnels critiques de type mode mou
ou ralentissement critique des fluctuations autour dinstabilits structurales) ou des
fluctuations locales darrangement structural ou de composition. Dun point de vue structural,
le challenge est videmment de rsoudre la structure en affinant simultanment la diffusion
diffuse et les pics de Bragg. Cette mthode dite 3D-PDF ne fera pas lobjet de cette
prsentation et nous nous focaliserons ici sur le caractre potentiellement dynamique du
dsordre prsent dans ces matriaux. Cette information en nergie est essentielle pour
dterminer lorigine du dsordre et le caractriser. Ltude couple de la diffraction X et des
X inlastiques permet une analyse rapide et complte grce aux dveloppements rcents de
dtecteurs trs haute rsolution bruit nul et aux spectromtres rtrodiffusion sur sources
synchrotrons. Si ncessaire, des mesures par diffusion neutronique en temps de vol peuvent
complter ces informations pour les dynamiques les plus lentes. Cette approche exprimentale
sera illustre par une tude du dsordre dans un cristal composite apriodique organique.
6a - Mthodes mergentes en cristallographie Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 102 -
O62 - Dfauts de phase dans les cristaux lectroniques tudis par
diffraction cohrente des rayons X

Vincent Jacques

LPS, Universit Paris Sud

La diffraction cohrente des rayons X est une technique trs sensible la prsence de
dfauts de phase dans les cristaux. Une dislocation de rseau est un exemple typique de
dfaut de phase cristallin qui cre un effet dinterfrence visible en diffraction cohrente. Cet
effet a t dmontr exprimentalement sur des boucles de dislocation isoles dans le silicium
[1]. Au-del des dislocations de rseau, les dfauts de phase se rencontrent dans tout type de
structure, et en particulier dans les cristaux lectroniques, qui prsentent des modulations
statiques de la densit de charge appeles Ondes de Densit de Charge (ODC). Ces structures
lectroniques sont des cristaux part entire qui se forment dans une structure atomique sous-
jacente par un mcanisme de distorsion priodique de rseau appele distorsion de Peierls.
Dans certains systmes, les ODC sont incommensurables et elles ont la possibilit de glisser
lorsquelles sont soumises laction dune force extrieure telle que celle engendre par
lapplication dun courant lectrique. Nous montrerons comment les ODC des systmes
quasi-unidimensionnels K0.3MoO3 et NbSe3 se comportent sous courant, et notamment
comment la diffraction cohrente des rayons X a permis de mettre en vidence les diffrents
rgimes de glissement de lODC dans NbSe3 [2] et un rseau de solitons dans K0.3MoO3
[3,4].

















[1] V.L.R. Jacques et al., PRL 106, 065502 (2011)
[2] E. Pinsolle et al., PRL 109, 256402 (2012)
[3] D. Le Bolloch et al., PRL 100, 096403 (2008)
[4] V.L.R. Jacques et al., PRB 85, 035113 (2012)
6b - Biologie structurale intgrative et gros assemblages
Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 103 -
O64 - Dmarrage de la traduction chez les eucaryotes et les arches: le
facteur e/aIF2

Yves Mechulam, Pierre-Damien Coureux, Etienne Dubiez, Auriane Monestier, Marie
Naveau, Christine Lazennec-Schurdevin, Michel Panvert et Emmanuelle Schmitt

Laboratoire de Biochimie, Unit mixte de Recherche 7654, Ecole Polytechnique, Centre
National de la Recherche Scientifique, F-91128 Palaiseau cedex.

Chez tous les tres vivants, le dmarrage de la traduction implique le recrutement dun
ARNt initiateur spcialis, systmatiquement aminoacyl par une mthionine. Cet ARNt joue
un rle cl dans lidentification du codon de dmarrage sur lARNm. Malgr luniversalit de
ce processus, les mcanismes de slection et dutilisation de cet ARNt diffrent suivant le
domaine, bactrien, eucaryote ou archen. Chez les eucaryotes et les arches, le facteur
htrotrimrique de dmarrage de la traduction 2 (e/aIF2) forme un complexe ternaire avec le
GTP et l'ARN de transfert initiateur, puis vient se lier la petite sous-unit du ribosome.
Lappariement entre lanticodon de lARNt et le codon de dmarrage sur lARNm engendre
une cascade dvnements qui aboutit au dpart des facteurs de dmarrage et au
positionnement correct du ribosome pour une traduction fidle.
Nous utilisons un ensemble de mthodes biochimiques et structurales pour dcrire la
formation du complexe de dmarrage archen, et le rle des facteurs dans la spcificit du
systme. Nous dcrirons plus particulirement les rsultats obtenus concernant la liaison de
lARNt initiateur au facteur aIF2, ainsi que le rle du facteur aIF1 dans la formation du
complexe de dmarrage. De manire surprenante, malgr une similitude structurale
considrable entre la sous unit centrale d'e/aIF2 et le facteur d'allongement de la traduction
EF-Tu, ces deux protines G de l'appareil de traduction utilisent des stratgies de liaison de
l'ARNt radicalement diffrentes [1]. Ces rsultats seront galement discuts dans le contexte
du dmarrage de la traduction chez les eucaryotes [2].















[1] Schmitt et al., Nat. Struct. Mol. Biol. 2012, 19, 450-454.
[2] Naveau et al., Nucleic Acids Res. 2013, 41, 1047-1057.
6b - Biologie structurale intgrative et gros assemblages
Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 104 -
O65 - Crystal structure of the eukaryotic 80S ribosome

Nicolas Garreau de Loubresse and Marat Yusupov

Institut de Gnetique et de Biologie Molculaire et Cellulaire, UMR7104 IGBMC, U964
INSERM, Dpartement de Biologie Structurale Intgrative, Illkirch, France.


Ribosomes translate genetic information encoded by messenger RNA into proteins.
Many aspects of translation and its regulation are specific to eukaryotes, whose ribosomes are
much larger and intricate than their bacterial counterparts. We report the crystal structure of
the 80S ribosome from the yeast Saccharomyces cerevisiae at a resolution of 3.0 angstroms.
This atomic model reveals the precise architecture of eukaryote-specific elements and their
interaction with the universally conserved core. Together, it forms the structural and
experimental framework to explore the eukaryotic translation apparatus as well as small
molecules of therapeutic interest against infectious diseases, genetic disorders and cancers.
Emphasis will be placed on methods development and recent advances to investigate small
molecules on the yeast ribosome.
6b - Biologie structurale intgrative et gros assemblages
Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 105 -
O66 - Etude structurale et fonctionnelle de la protine Pat1 de
Saccharomyces cerevisiae

Zeineb Fourati-Kammoun
1,2
, Olga Kolesnikova
3
, Jenny Keller
2
, Noureddine Lazar
2
,
Anthony Doizy
2
, Herman van Tilbeurgh
2
, Bertrand Sraphin
3
et Marc Graille
1,2


1
Laboratoire de Biochimie, Ecole Polytechnique, Route de Saclay, Palaiseau,
2
Institut de Biochimie et Biophysique Molculaire et Cellulaire, Universit Paris sud, Orsay
3
Equipe Labellise La Ligue, IGBMC (Institut de Gntique et de Biologie Molculaire et
Cellulaire), Illkirch F-67400, France; CNRS, UMR7104, Illkirch F-67404, France; Inserm,
U964, Illkirch F-67400, France; and Universit de Strasbourg, Strasbourg F-67000, France

La quantit dun ARNm eucaryote dans la cellule est finement rgule par lquilibre
entre son niveau de transcription et sa vitesse de dgradation. Chez la levure S. cerevisiae, la
dgradation des ARNm se fait essentiellement par la voie 5-3, tributaire dune tape de
decapping . Cette tape, catalyse par lenzyme Dcp2, vise dtruire la coiffe stabilisatrice
en 5 des ARNm pour permettre lexonuclase Xrn1 de dgrader lARNm dans le sens 5-
3. Lactivit catalytique intrinsque de Dcp2 est trs faible et requiert lintervention dun
ensemble de facteurs formant le complexe activateur du decapping . La protine Pat1
constitue un lment central de ce complexe [1]. En effet, Pat1 active directement la catalyse
par Dcp2 travers son domaine C terminal, et utilise ce domaine pour fixer Dcp2 et certains
autres activateurs du decapping [2, 3].
La structure cristallographique du domaine C terminal de Pat1 de S. cerevisiae ainsi
que la caractrisation de son interaction avec lARN seront prsents. La structure de ce
domaine rvle une particularit par rapport son orthologue humain [4]. Il sagit dune
extension C terminale caractristique des levures, dont la dltion induit un phnotype
thermosensible in vivo, suggrant quil sagit dun domaine fonctionnellement important. En
considrant quil existe deux paralogues Pat1 chez lhomme (Pat1a et Pat1b) dont un seul est
impliqu dans le decapping , ce rsultat stipule que Pat1 ait volu en sparant deux
domaines fonctionnellement importants chez les eucaryotes suprieurs.






[1] Bonnerot C, Boeck R, Lapeyre B (2000) The two proteins Pat1p (Mrt1p) and Spb8p
interact in vivo, are required for mRNA decay, and are functionally linked to Pab1p. Mol Cell
Biol 20: 5939-5946
[2] Nissan T, Rajyaguru P, She M, Song H, Parker R (2010) Decapping activators in
Saccharomyces cerevisiae act by multiple mechanisms. Mol Cell 39: 773-783
[3] Pilkington GR, Parker R (2008) Pat1 contains distinct functional domains that promote P-
body assembly and activation of decapping. Mol Cell Biol 28: 1298-1312
[4] Braun JE, Tritschler F, Haas G, Igreja C, Truffault V, Weichenrieder O, Izaurralde E
(2010) The C-terminal alpha-alpha superhelix of Pat is required for mRNA decapping in
metazoa. EMBO J 29: 2368-2380
6b - Biologie structurale intgrative et gros assemblages
Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 106 -
O67 - Dtermination des bases structurales du mcanisme de
permation des ions chez les rcepteurs-canaux pentamriques de la
famille Cys-loop

Ludovic Sauguet
1
, Samuel Murail
2
, Catherine Van Renterghem
3
, Laurie Malherbe
1
, Frdric
Poitevin
1
, Andy Thompson
4
, Pierre-Jean Corringer
3
, Marc Baaden
2
et Marc Delarue
1


1
Unit de Dynamique Structurale des Macromolcules, Institut Pasteur, Paris
2
IBPC, Paris,
3
Unit Rcepteurs-Canaux, Institut Pasteur, Paris,
4
Synchrotron SOLEIL, Gif-sur-Yvette

Chez les vertbrs, les rcepteurs-canaux de la famille Cys-loop (RCPs) assurent la
transmission chimio-lectrique du signal lectrique nerveux par lintermdiaire de transitions
allostriques qui couplent la liaison dun agoniste avec louverture ou la fermeture du canal
|1|. Chez lhomme, ces protines membranaires pentamriques comprennent les rcepteurs
nicotiniques, GABA, glycine et srotonine, qui sont la cible de nombreuses classes de
molcules thrapeutiques. Les mcanismes de permation des ions chez les RCPs demeurent
nanmoins peu documents. La dtermination de la structure de GLIC |2|, un homologue
procaryote de la famille, dans une conformation ouverte permante aux ions |3-4|, constitue
un bon modle structural permettant dtudier les mcanismes de permation chez les RCPs.

En amliorant rcemment la structure de GLIC 2.4 de rsolution, la plus haute
rsolution atteinte pour des RCPs, nous avons pu pour la premire fois dcrire
exprimentalement la gomtrie dhydratation dans le pore de ces rcepteurs et notamment la
prsence de deux pentagones deau |5|. A partir de co-cristaux obtenus en prsence de
diffuseurs anomaux (Br
-
, Cs
+
et Rb
+
), nous avons cartographi les sites de fixation des ions
monovalents positifs et ngatifs dans la structure de GLIC et notamment dans le pore
transmembranaire. Cette tude structurale a t complte par des simulations de dynamique
molculaire et des expriences dlectrophysiologie sur canal-unique qui ont permis de
proposer un mcanisme pour la permation des ions |5|.





[1] Corringer P.J., Poitevin F., Prevost M.S., Sauguet L. et al. Structure. 2012, 20 (6)
941-56
[2] Bocquet N. et al. Nature 2009, 457 (7225) 111-4
[3] Prevost M., Sauguet L. et al. Nature Struct. Mol. Biol. 2012, 19 (6) 642-9
[4] Sauguet L. et al. Nature communications. 2013, 16 (4) 1697
[5] Sauguet L. et al. EMBO J. 2013, 32 (5) 728-41
6b - Biologie structurale intgrative et gros assemblages
Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 107 -
O68 - tudes structurales et fonctionnelles du complexe de pr-
intgration du VIH-1

Nicolas Levy
1
, Sylvia Eiler
1
, Aurlie Schaetzel
1
, Corinne Crucifix
1
, Karine Pradeau-
Aubtreton
1
, Vincent Parissi
2
, Stphane Emiliani
3
, Yves Mly
4
, Patrick Schultz
1
, Marc Ruff
1


1
IGBMC, 1 rue Laurent Fries, 67404 Illkirch,
2
Laboratoire de Microbiologie Fondamentale et Pathognicit, Universit de Bordeaux 2,
Bordeaux,

3
Institut Cochin, Universit Paris Descartes, Paris,

4
Laboratoire de Biophotonique et Pharmacologie. UMR 7213 CNRS, UDS, Facult de
Pharmacie, Illkirch

Dans les tapes prcoces de la rplication du VIH-1, le gnome viral est converti en
ADN qui va interagir avec des protines cellulaires et virales pour former le complexe de pr-
intgration (PIC). Lintgrase (IN) est une protine essentielle du PIC et intervient dans
plusieurs tapes de la rplication du virus, comme la dcapsidation, la rverse transcription,
limport nuclaire, le ciblage de la chromatine et lintgration. Lintgrase va recruter des
protines de la cellule hte pour effectuer ces diverses fonctions. Les mcanismes
molculaires et la dynamique de ces processus ainsi que le rle des cofacteurs cellulaires
restent largement inconnus. Les intgrases rtrovirales sont des protines montrant une grande
flexibilit inter domaine. Comme pour dautres protines dsordonnes, cette flexibilit
intrinsque confre lintgrase la capacit dinteragir avec des partenaires multiples. Nous
assumons que les diffrentes fonctions du PIC dans linfection virale refltent les diffrentes
conformations de ses composant protiques qui peuvent varier avec les protines partenaires
et les modifications post traductionnelles. Nous avons dmontr que la faible solubilit et la
flexibilit inter domaine peuvent tre contournes par la formation de complexes stables et
spcifiques avec des substrats comme des cofacteurs protiques et par des modifications post
traductionnelles. Nous avons reconstitus in vitro des complexes solubles et stables autour de
lintgrase qui est prsente toutes les tapes de la transcription inverse lintgration. Les
structures des complexes IN/LEDGF/DNA [1] et IN/LEDGF/INI1/DNA [2] ont t rsolues
par cryo microscopie lectronique. Ces structures combines aux essais fonctionnels ont
donns des informations importantes pour les rles de LEDGF et INI1 dans linfection virale.
Un autre sous complexe du PIC a t caractris au laboratoire, le complexe IN/transportine-
SR2/VBP1 impliqu dans le transfert nuclaire du PIC. Des rsultats prliminaires sur la
structure de ce complexe seront prsents.




[1] Michel et al, EMBO J.. 2009, 28, 980-991.
[2] Maillot et al, PLoS ONE, 2013, 8(4): e60734. doi:10.1371/journal.pone.0060734

Laurats des prix de thse de lAFC 2012 Jeudi 4 juillet 18h00-19h00
- 108 -
(GT-BIO)

O69 - Contrle du mtabolisme central chez les mycobactries par la
rgulation allostrique de lalpha-ktoglutarate dshydrognase.

Tristan Wagner

Institut Pasteur, Paris

L-ktoglutarate dshydrognase (KDH) est un complexe multienzymatique
constitu de trois composants (E1o, E2o, E3) situ au nud mtabolique entre le cycle de
Krebs et lassimilation de lazote. Vu son rle clef, ce complexe ncessite une rgulation fine
pour coordonner le flux de carbone ainsi que la production dnergie par le cycle de Krebs.
Les Corynebacterineae ont une situation particulire car E2o est absent, son domaine
catalytique est fusionn E1o. Ce nouveau polypeptide (appel KGD pour E1o+E2o) possde
un systme unique de contrle par GarA, une protine domaine en tte de fourche (ce
domaine appel FHA reconnait les thronines phosphoryles). GarA est une sorte d
interrupteur molculaire qui rgule la synthse du glutamate et est contrl lui-mme par
phosphorylation. Dans ltat non phosphoryl, GarA lie E1o, le cur catalytique du complexe
KDH, en inhibant son activit.

Le but de cette thse est de dchiffrer le mcanisme catalytique de E1o, ainsi que les
bases molculaires de linhibition par GarA. Nous avons rsolu la structure cristalline de
KGD de Mycobacterium smegmatis en complexe avec son cofacteur thiamine diphosphate.
Nous montrons pour la premire fois que KGD effectue dimportants rarrangements
conformationnels pendant le cycle catalytique, le principal tant une translocation dun tour
dune hlice externe (E). GarA agit comme inhibiteur en liant cette hlice par son domaine
FHA, bloquant ainsi sa translocation. Linteraction KGD-GarA nimplique aucun rsidu
phospho-thronine mais un aspartate mimant la charge phosphate sur lhlice E, un
comportement sans prcdents pour une protine domaine FHA. Le domaine additionnel de
type E2o interagit galement avec la mme hlice E, gnrant un effet dinhibition
synergique avec GarA. Cet effet peut nanmoins tre contrecarr par laction de lactyl-CoA,
un activateur allostrique qui se lie un site distinct. Laction de lactyl-CoA, jusqu
prsent unique pour lenzyme mycobactrienne, est due des changements subtils de certains
rsidus clefs pour le rarrangement conformationnel catalytique.

Laurats des prix de thse de lAFC 2012 Jeudi 4 juillet 18h00-19h00
- 109 -

Structure de lorganisation hexamrique de KGD compos de E1o (en vert) et du domaine
E2o (en bleu). Le domaine FHA de GarA est reprsent en surface (violet) alors que
lemplacement du site actif de E1o est localis par le cofacteur thiamine pyrophosphate
(rouge).
Laurats des prix de thse de lAFC 2012 Jeudi 4 juillet 18h00-19h00
- 110 -
(GT CHIMIE)

O70 - Cristallochimie de nouveaux polymres de coordination
noyau spirobifluorne ou ttraphnylmthane : du design du ligand
la topologie et aux proprits du solide hybrides.

Florian Moreau

Laboratoire des Sciences Chimiques, Rennes

Ce travail concerne la cristallochimie de nouveaux polymres de coordination. Afin de
diriger la topologie des rseaux forms et d'obtenir des polymres de coordination poreux,
nous avons propos le design de ligands ttracarboxylates comportant deux types de noyaux
de gomtries fixes : le noyau ttraphnylmthane de symtrie Td et le noyau spirobifluorne
de symtrie D2d. des espaceurs phnyles ont t introduits dans une stratgie de chimie
d'chelle et la position de la fonction coordinante sur l'espaceur a t module afin de
permettre une flexibilit conformationnelle des ligands. La ractivit de ces ligands a t
explore vis--vis de sels de zinc, de cuivre et de lanthane. Les structures des polymres de
coordination ont t dtermines par diffraction des rayons x par le monocristal. La stabilit
thermique, la ractivit chimique et les proprits d'adsorption de gaz ont t investigues. Le
premier chapitre de ce mmoire est consacr l'tude bibliographique des polymres de
coordination poreux. Le deuxime chapitre expose la stratgie de synthse organique des
ligands viss. Les trois chapitres suivants regroupent selon leurs caractristiques structurales
les polymres de coordination synthtiss. Un clairage particulier est port sur les topologies
et le phnomne d'interpntration des rseaux ainsi que sur l'influence de la flexibilit des
ligands. Un dernier chapitre est consacr aux polymres de coordination 2D noyau
spirobifluorne. Enfin, un rcapitulatif des traits marquants des matriaux synthtiss clture
ce mmoire en abordant les perspectives offertes par ce travail.
Laurats des prix de thse de lAFC 2012 Jeudi 4 juillet 18h00-19h00
- 111 -
(GT PHYSIQUE)

O71 - Transitions de phases dans les argiles. Influence de la
minralogie et de la morphologie. Comportement sous coulement et
sous champs.

Erwan Paineau

Institut National Polytechnique Lorraine, Nancy


Lobjectif de ce travail est dtudier les transitions de phases sol-gel et isotrope-
nmatique dans des suspensions de smectites dioctadriques en fonction de la morphologie et
de la nature minralogique des argiles. Bien que tous les systmes tudis prsentent une
transition sol-gel de faibles fraction volumique, la transition cristal-liquide isotrope-
nmatique na pu tre identifie que dans le cas de suspensions de smectites ayant un dficit
de charge ttradrique. Leffet de la localisation de la charge sur le comportement collodal a
t dtermine laide de la diffusion des rayons X aux petits angles (SAXS) et par des
mesures rhologiques. La nature des interactions lectrostatiques dans ces suspensions est
purement rpulsive et rejette lide dune structure tridimensionnelle de type chteau de
carte . Cependant, les smectites ayant un dficit de charge ttradrique sont plus rpulsives et
ont des proprits viscolastiques plus faibles que celles ayant un dficit octadrique. Il a
galement t montr que la dpendance en taille de particules de la position de la transition
sol-gel tait lie une statistique de pigeage hydrodynamique des plaquettes dargile.
Finalement, lapplication de champs externes (lectrique et magntique) a permis dobtenir
lalignement de la phase nmatique tandis que dans la phase isotrope, le champ lectrique
induit un ordre antinmatique parfait. Afin de prserver lordre induit, ces suspensions ont t
polymrises sous champ permettant lobtention de nanocomposites orientes et structurs.

7a - Cristallographie in situ, in operando Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 112 -
O72 - Complexit structurale de (RE)
2
NiO
4+o
explore par diffraction in
situ des neutrons et du rayonnement synchrotron pendant une raction
d'intercalation de loxygne contrle lectrochimiquement

M Ceretti
1
,

O. Wahyudi
2,3
, J. Stern
1
,

A. Villesuzanne
3
, J.M. Bassat
3
, G. Andr
4
, F. Porcher
4
,
W. Paulus
1

1
Universit de Montpellier 2, Institut Charles Gerhardt, UMR CNRS 5253, Montpellier,
2
Universit de Rennes 1, Rennes,
3
CNRS, Universit de Bordeaux, ICMCB, 87 Av. Dr. A. Schweitzer, Pessac,

4
Laboratoire Lon Brillouin, CEA-CNRS, CE Saclay, 91191 Gif sur Yvette

Les conducteurs d'ions oxygne basse temprature sont des matriaux d'intrt majeur
pour une srie d'applications dans le domaine des conducteurs ioniques. Nd
2
NiO
4+o
et
Pr
2
NiO
4+o
appartiennent ces oxydes non stchiomtriques, avec une structure type K
2
NiF
4,

qui montrent une mobilit d'ions d'oxygne ds la temprature ambiante. Pour cette raison, ils
figurent parmi les candidats les plus prometteurs pour les membranes d'oxygne, les capteurs
ou les catalyseurs, oprant temprature modre. Une des caractristiques les plus
intressantes est la possibilit d'accueillir une quantit importante d'atomes d'oxygne
supplmentaires sur les sites interstitiels, la rgion non stchiomtrique tant 0 <o <0,26 [1].
Dans cette tude, nous avons suivi par diffraction in situ des neutrons sur poudre et par
diffraction du rayonnement synchrotron sur monocristal, lvolution structurale en fonction de
la stchiomtrie en oxygne de (Nd,Pr)
2
NiO
4+o
temprature ambiante, pendant une raction
lectrochimique. La raction a t effectue dans des cellules spcialement conues [2-3].
Nous rapportons ici le riche diagramme de phase en fonction du transfert de charge, allant
d'une phase orthorhombique incommensurable pour (Nd,Pr)
2
NiO
4.25,
passant par une phase
ordonne intermdiaire quadratique, jusqu la phase stchiomtrique AF (Nd,Pr)
2
NiO
4.0
. La
raction de Nd
2
NiO
4.0
s'est rvle tre partialement rversible en sarrtant une
stchiomtrie o=0.10. Une tude structurale de cette phase a rvl une structure P42/ncm.
Les calculs prliminaires de dynamique de rseau (algorithme DFT ab initio) indiquent que
cette rversibilit limite est li aux contraintes de structure et en particulier la valeur du
paramtre c, accompagn d'un facteur de Debye-Waller rduit pour les atomes d'oxygne
apicaux. Pr
2
NiO
4+o
prsente un mcanisme d'intercalation diffrente, et la phase rduite peut
tre charg jusqu' sa stchiomtrie initiale o=0.25. Il s'agit d'une diffrence importante qui
nous pensons tre lie au rayon ionique lgrement plus lev de Pr
3+
par rapport Nd
3+
et
associe une dynamique du rseau modifie [4-5].



[1] Y. Toyosumi et al. J. Alloys and Compounds 408412 (2006) 12001204.
[2] W. Paulus, et al, JACS (2008)
[3] R. Le Toquin, et al, J. Am. Chem. Soc. 128 (2006) 1316113174
[4] A Villesuzanne et al., J. Solid State Electrochem. 15, 2 (2012), 357
[5] O. Wayudi, PhD Thesis, University Rennes 1, dec. 2011
7a - Cristallographie in situ, in operando Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 113 -
O73 - Lapport des tudes menes operando par diffraction et
absorption des rayons X la comprhension des mcanismes mis en
jeu au sein des matriaux dlectrode pour batteries Li-ion.

Laurence Croguennec
1
, Jean-Marcel Ateba Mba
1,2
, Matteo Bianchini
1,2,3
, Hideyuki Koga
1
,
Emmanuelle Suard
3
, Stphanie Belin
4
, Claude Delmas
1
et Christian Masquelier
2


1
ICMCB-CNRS, Universit de Bordeaux, IPB-ENSCBP, 33600 Pessac, France,
2
LRCS-CNRS, Universit de Picardie Jules Vernes, 80039 Amiens Cedex 1, France,
3
Institut Laue-Langevin, 38000 Grenoble, France,
4
Synchrotron Soleil, 91192 Gif-sur-Yvette, France

Ces vingt dernires annes les efforts de recherche menes dans le domaine des
batteries Li-ion ont t largement orients vers la recherche de nouveaux matriaux
dlectrode et de nouveaux lectrolytes, avec lobjectif daccroitre la scurit, la dure de vie
et les densits dnergie et de puissance de ces systmes lectrochimiques [1]. Il sest avr
essentiel de suivre les volutions structurales et les processus redox mis en jeu au cours des
ractions de dsintercalation et de rintercalation des ions Li
+
des matriaux dlectrodes,
pour mieux prdire la rversibilit de ces batteries Li-ion. Des mthodes de caractrisation ont
t rapidement dveloppes pour suivre in situ ces ractions dynamiques au cours du
fonctionnement de la batterie, notamment par diffraction des rayons X (de laboratoire ou
Synchrotron) [2-3] ou par spectroscopie dabsorption des rayons X [3-4]. Ces tudes menes
operando apportent une information globale sur la nature des ractions mises en jeu, dans des
conditions proches des conditions relles dutilisation dune batterie. Les caractrisations
menes ex situ sur des compositions cls restent nanmoins essentielles car complmentaires :
elles permettent en effet une dtermination plus fine de leur structure atomique et
lectronique. Nous illustrerons travers quelques exemples lapport de ces caractrisations,
ralises operando, pour la comprhension de systmes de choix : ici, des matriaux
dlectrodes positives de type polyanioniques (LiFePO
4
et LiVPO
4
F) et oxydes lamellaires
surlithis (Li
1.20
Ni
0.13
Co
0.13
Mn
0.54
O
2
) [3-6]. Nous prsenterons galement pour la premire
fois la cellule lectrochimique que nous avons dveloppe pour raliser de la diffraction des
neutrons in situ, de rsolution suffisante pour raliser une dtermination structurale par la
mthode de Rietveld.

Remerciements : Les auteurs remercient lInstitut de Recherche Europen Alistore-ERI, le
Rseau Franais sur le Stockage Electrochimique de lEnergie (RS2E), lindustriel Toyota
Motor Europe, lInstitut Laue-Langevin (ILL-Grenoble), le Synchrotron SOLEIL et la Rgion
Aquitaine pour leur soutien aux recherches prsentes.

[1] Goodenough et al., Chem. Mater. 2010, 22, 587-603.
[2] Morcrette et al., Electrochimica Acta 2002, 47(19), 3137-3149.
[3] Leriche et al., J. Electrochem. Soc. 2010, 157(5), A606-A610.
[4] Ouvrard et al., J. Power Sources 2013, 229, 16-21.
[5] Ateba Mba et al., J. Electrochem. Soc. 2012, 159(8), A1171-A1175.
[6] Koga et al., J. Phys. Chem. C, soumise.
[7] Bianchini et al., J. Electrochem. Soc., soumise.
7a - Cristallographie in situ, in operando Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 114 -
O74 - Structures lamellaires supramolculaires de sulfates hybrides :
du design la stabilit thermique et aux transitions de phases

Omar Kammoun
1,2
, Thierry Bataille
1
, Walid Rekik
2
, Anita Lucas
1
, Houcine Nali
2
, Tahar
Mhiri
2


1
Institut des Sciences Chimiques de Rennes, UMR 6226 CNRS Universit de Rennes 1, UEB,
Rennes, France ;
2
Laboratoire physicochimie de lEtat Solide, Facult des Sciences de Sfax, universit de Sfax,
Tunisie.

Les composs hybrides organique-inorganique supramolculaires de classe I
reprsentent une opportunit intressante pour le dveloppement de nouveaux matriaux dans
diffrents domaines d'applications, en tant que dilectriques, semiconducteurs, ou matriaux
ONL [1,2]. Dans ce contexte, nous nous intressons des sulfates mixtes de mtaux de
transition et damines protones possdant une bonne stabilit thermique et prsentant des
transitions de phase rversibles, pour des applications potentielles comme dilectriques ou
catalyseurs [3]. Dans la continuit de notre activit, nous avons choisi dintroduire
laromaticit dans la partie organique afin daugmenter la mobilit des lectrons pour faciliter
le transfert de charge. Plusieurs familles de nouveaux composs de formule
(Amine)
2
M
II
(SO
4
)
2
(H
2
O)
x
(avec Amine = mthylbenzylamine, benzimidazole, 2-
mthylimidazole, 4-aminopyridine et M = Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn)ont t prpares et
caractrises partir des donnes de diffraction des rayons X (cristal et poudre). De manire
surprenante, elles appartiennent un type structural indit dans les sulfates, savoir un rseau
entirement supramolculaire fort caractre lamellaire. Le design des couches minrales et
lespace interfeuillets sont principalement gouverns par lamine utilise.

Ltude systmatique de leur comportement thermique par diffraction des rayons X in
situ a mis en vidence une grande disparit dans la stabilit des prcurseurs et rvl
lexistence dun nombre important de phases intermdiaires au cours du chauffage. Nous
montrerons la complexit des structures obtenues travers une discussion cristallochimique,
et nous mettrons en parallle les diffrences entre les structures et leur ractivit thermique et
les transitions de phases observes.

[1] R. Masse, J. Zyss, European Patent EP 0 488 869 B1 (1996).
[2] N. Leblanc, N. Mercier, L. Zorina, S. Simonov, P. Auban-Senzier, C. Pasquier, JACS
2011, 133, 1492414927.
[3] F. Hajlaoui, S. Yahyaoui, H. Naili, T. Mhiri, T. Bataille, Inorg. Chim. Acta 2010, 363,
691695.
7b - Texture, Microstructure, dformation Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
O75 - Study of texture development in asymmetrically rolled titanium.
Experimental study and calculations.

M. Wronski
1
, K. Wierzbanowski
1
, S. Wronski
1
, B. Bacroix
2
, A. Lodini
3
, P. Lipinski
4



1
AGH University of Science and Technology, Faculty of Physics and Applied Computer Science, al.
Mickiewicza 30, 30-059 Krakw, Poland,
2
LSPM-CNRS, Universit Paris XIII, 99, av. J.B. Clement, 93 430 Villetaneuse, France
3
LISM, UFR SEN, Universit de Reims Champagne Ardenne, Moulin de la Housse BP1039, 51687
Reims, France
4
LaBPS, ENIM, 1, Route dArs Laquenexy CS 65820, 57078 Metz Cedex 3, France


The goal of this work was to study the asymmetric rolling process using Finite
Element (FEM) method coupled with the crystallographic deformation model of
polycrystalline material. The Leffers-Wierzbanowski (LW) model was selected to be coupled
with Finite Elements Method (FEM). The implementation of LW model into FEM enabled a
study of heterogeneous plastic deformation process (with elastic interactions), like
asymmetric rolling, taking into account its crystallographic nature. The experimental textures
of asymmetrically rolled titanium were determined using Electron Back Scattering Diffraction
(EBSD) technique. The observed trends of texture formation were confirmed by our
calculations.
The studied asymmetric rolling process was realized using two identical rolls, driven
by independent motors, rotating with different angular velocities e
1
and e
2
. This ensured a
high range of rolling asymmetry. During asymmetric rolling a strong stress component is
induced in the material. Our aim was to examine the influence of this shear stress on the
microstructure and crystallographic texture.
It should be mentioned that asymmetric rolling offers numerous possibilities of
material modification, it can provide large volumes of deformed material and is easy to
implement on existing industrial rolling mills.






7b - Texture, Microstructure, dformation Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 116 -
O76 - Evolutions microstructurales et htrognits de dformation
dans les aciers ODS Fe-14Cr1W
S. Zhong
1
, V. Klosek
1
, Y. de Carlan
2
, V. Ji
3
, M.H. Mathon
1

1
CEA, IRAMIS, Laboratoire Lon Brillouin (CEA CNRS), F-91191 Gif-sur-Yvette cedex
2
CEA, DEN, SRMA, F-91191 Gif-sur-Yvette cedex
3
ICMMO / LEMHE, Univ. Paris Sud XI, F-91405 Orsay cedex

Les aciers ODS (Oxide Dispersion Strengthening) sont envisags comme matriaux de
structure pour les racteurs de future gnration neutrons rapides (RNR) ou fusion. Le
renforcement de ces matriaux par une dispersion fine doxydes de type Y
2
O
3
a ouvert de
nombreuses perspectives dapplications de ces aciers ODS. Ces systmes sont labors par
mcanosynthse (mechanical alloying). Il est acquis que ce procd permet dobtenir ces
matriaux nanostructurs avec mise en solution des atomes dyttrium et doxygne introduits
sous forme de nanocomposs durant le co-broyage, ce qui permet ensuite de contrler la
phase de prcipitation des particules durcissantes. Les proprits mcaniques tant troitement
dpendantes de la dispersion doxydes, la maitrise de la prcipitation est un enjeu important
dans le dveloppement de ces aciers.

Lobjectif de ce travail a t, dabord, de prciser les cintiques de prcipitation ainsi
que les conditions de recristallisation entre 850 et 1450C dans un matriau choisi comme
rfrence (Fe-14Cr-1W-0,3Ti-0,3Y
2
O
3
) ainsi que dans 4 nuances prsentant des teneurs en Ti,
Y et O diffrentes, afin de mettre en vidence leffet de la composition chimique sur le
comportement de ce type dalliage sous traitement thermique. La microstructure au sens large
du terme (taille des grains, dispersion des oxydes, textures cristallographiques) a t
caractrise par diffraction et diffusion des neutrons ainsi que par microscopie lectronique.

Dans un deuxime temps, limpact de ces volutions microstructurales sur les
proprits mcaniques a t tudi. Une partie du travail a notamment t focalise sur
lanalyse sous sollicitation uni-axiale des htrognits de dformation des grains en
fonction de leur orientation cristallographique. Cette tude, ralise sur plusieurs nuances
avec diffrentes distributions de tailles de nanoparticules, sest appuye sur la technique de
diffraction des neutrons pour lanalyse des dformations et des textures cristallographiques.
Les comportements observs ont t confronts une modlisation micromcanique.

7b - Texture, Microstructure, dformation Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 117 -
O77 - Rsolution et affinement de structure dun film mince pitaxi
de LaVO
3
.

Hlne Rotella
1
, Pascal Roussel
2
, Magali Morales
3
, Henni Ouerdane
1
, Philippe Boullay
1
,
Olivier Copie
1
, Adrian David
1
, Daniel Chateigner
1
, Lucas Lutterotti
4
, Wilfrid Prellier
1
.

1
Laboratoire CRISMAT, CNRS UMR 6508, ENSICAEN et Universit de Caen Basse-
Normandie, 6 bd Marchal Juin, 14050 Caen Cedex 4, France.
2
Laboratoire UCCS, CNRS UMR 8181, ENSCL, Cit Scientifique, Btiment C7 - BP 90108,
59652 Villeneuve d'Ascq Cedex, France.
3
Laboratoire CIMAP, CNRS UMR 6252, ENSICAEN et Universit de Caen Basse-
Normandie, 6 bd Marchal Juin, 14050 Caen Cedex 4, France.
4
Dipartimento di Ingegneria dei Materiali, Univ. di Trento, I-38050 Trento, Italy

E-mail: helene.rotella@ensicaen.fr

Ltude des provskites ABO
3
synthtises sous forme de films minces suscite depuis de
nombreuses annes un grand intrt tant ils prsentent un large spectre de proprits
fonctionnelles, telles que la ferrolectricit, la supraconductivit, ou encore les transitions
mtal-isolant. Ces proprits, souvent lies la structure de ces matriaux, ncessitent une
dtermination de plus en plus prcise des proprits structurales. La connaissance des angles
B-O-B permet par exemple de comprendre les recouvrements orbitalaires responsables du
type de transport des lectrons au sein du matriau ou encore interviennent dans les
interactions dchange entre les spins des lectrons.
Ce travail prsente la rsolution et laffinement de la structure dun film mince de
LaVO
3
ralise par diffraction de rayons X en haute rsolution et sinscrit dans cette optique.
Lorthovanadate de lanthane prsente, sous forme massive, une structure orthorhombique
Pnma commune dans les provskites, qui se dforme facilement sous la contrainte travers
les rotations doctadres doxygnes. Le film mince ainsi dpos sur un substrat de SrTiO
3

orient (001), sadapte pour compenser la contrainte qui lui est impose [1]. Bien que le
principe de cette tude soit de considrer le film comme un monocristal, on ne peut se
soustraire aux contraintes de mesures imposes par la gomtrie de lchantillon. Sa taille est
en effet un inconvnient majeur (lpaisseur du film tant dun peu moins dune centaine de
nanomtres) qui conduit une intensit diffracte fortement diminue. A cela, sajoute
lorientation prfrentielle du cristal induite par la croissance pitaxiale du film sur le substrat
monocristallin. En consquence, dterminer la structure prcise dun film mince devient un
challenge intressant.
Dans cet expos, je montrerai, en mappuyant sur les dveloppements rcents de la
diffraction des rayons X, quil devient possible daccder un grand nombre de rflexions et,
aprs une analyse fine, daccder la structure complte dun film mince doxyde.


[1] Rotella et al., Phys. Rev. B, 2012, 85, 184101
7c - Grands Instruments Synchrotron et plateformes en biologie structurale -
(Dveloppements, XFEL, nouveauts) Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 118 -
O78 - La cristallographie SOLEIL

Jean Daillant

DSM/IRAMIS/SIS2M/LIONS CEA

Lanne 2014 a t choisie par lUNESCO pour tre lanne internationale de la
cristallographie. Dans ce cadre, je dresserai un panorama de la cristallographie SOLEIL en
insistant sur les axes stratgiques que nous avons dfinis :

Biocristallographie,
rsolution temporelle,
utilisation de la cohrence,
conditions extrmes,
mesures in operando
et couplage de techniques.

Ces diffrents points seront illustrs par des exemples rcents.
7c - Grands Instruments Synchrotron et plateformes en biologie structurale -
(Dveloppements, XFEL, nouveauts) Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 119 -
O79 - X-ray Free Electron Laser sources

Marie-Emmanuelle Couprie

Synchrotron SOLEIL

Since the first laser discovery in 1960 and the first Free Electron Laser (FEL) in 1977,
Free Electron Lasers provide intense coherent fs pulses in the X-ray range for
multidisciplinary investigations of matter. After introducing the concepts, and the various
configurations, the panorama of the presently available facilities around the world will be
described. The different properties of these sources will be presented. New recent trends will
be givcn, such as two-color operation. Further prospects including multi- Free Electron Laser
beamlines on superconducting linear accelerators, laser wakefield accelerators based Free
Electrons Lasers will be open. Future advanced FELs will be discussed as well, in particular
with the case of the LUNEX5 (free electron Laser Using a New accelerator for the
Exploitation of X-ray radiation of 5th generation) project in France, which aims at
investigating the production of short, intense, and coherent pulses in the soft X-ray region,
with a 400 MeV superconducting linear accelerator and a laser wakefield accelerator
(LWFA), feeding a single Free Electron Laser line with seeding with High order Harmonic in
Gas and Echo Enable Harmonic Generation.

7c - Grands Instruments Synchrotron et plateformes en biologie structurale -
(Dveloppements, XFEL, nouveauts) Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 120 -
O80 - Nouvelles possibilits exprimentales en cristallographie
introduites par les XFELs

Jan Lning

Universit Pierre et Marie Curie, Paris

Le rayonnement des nouveaux lasers lectrons libres mettant des rayons X (XFEL,
pour X-ray Free Electron Laser) permet de raliser des expriences entirement nouvelles
grce aux proprits uniques de leur rayonnement : des impulsions ultra-brves (domaine de
la femtoseconde) et ultra-intenses avec un trs haut degr de cohrence. Ceci cre des
nouvelles possibilits pour l'tude exprimentale dans une grande diversit de domaines
scientifiques, aller de la physique la chimie, la biologie et autres.

Pour leur exploitation, un grand nombre de nouvelles techniques exprimentales et
d'instrumentations originaux ont t conus pendant les quelques annes depuis le XFEL
FLASH en Hambourg est devenu une source ouverte aux utilisateurs. Entre temps, il y a
quatre XFELs qui servent une communaut d'utilisateurs en pleine croissance : les XUV-
FELs FLASH et FERMI (Italie) et les XFELs LCLS (tats-Unis) et SACLA (Japon).

Cette prsentation commencera par un rsum de ce dveloppement rcent en mettant
l'accent sur les capacits et les dfis exprimentaux qui drivent des proprits uniques de ces
sources. Aprs une prsentation plus gnrale de l'tat de lart des techniques de diffusion aux
XFELs, quelques exemples rcents concernant l'tude de la structure des nano-structures
biologiques sont discuts en plus de dtails.
7c - Grands Instruments Synchrotron et plateformes en biologie structurale -
(Dveloppements, XFEL, nouveauts) Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 121 -
O81 - BM14-2: une ligne MX MAD lESRF avec de nouveaux
outils pour exposer des cristaux biologiques temprature ambiante.

Belrhali H
1
, Nanao M, Manjasetty B
1
, Zander U, Hoffmann G, Mrquez JA
1
, Felissaz F,
Gobbo A, Papp G, Cipriani F
1
, Nasri JA, Geoffroy L, Elhorga V, Lavault B, Siebrecht R
2


1
EMBL Grenoble Outstation,
2
Arina.x

BM14 est la station exprimentale situe sur laimant de courbure 14 de lESRF. Elle
est ddie aux expriences de cristallographie des macromolcules biologiques et notamment
celles qui utilisent la mthode exprimentale MAD (Multiple Anomalous Diffraction).
BM14 a bnfici en 2011 et 2012 dun renouvellement complet de ses lments
optiques, augmentant la brillance de son faisceau dun facteur 3 4 selon lnergie utilise (de
7 17 keV). Il en rsulte pour lutilisateur un temps moyen dexposition de 5 7 secondes par
image.
En collaboration avec les quipes de Florent Cipriani et de Jose-Antonio Marquez de
lEMBL, nous avons rcemment dvelopp une nouvelle tte goniomtrique pour le
microdiffractomtre de la ligne (MDII) qui permet de manipuler les plaques de cristallisation
de type Crystal Direct [2] et ainsi offrir aux utilisateurs la possibilit dexposer leur
chantillons in situ, c'est--dire encore dans leur milieu de cristallisation, aux rayons X de la
ligne de lumire. Ces plaques ont t optimises pour ne diffuser que trs faiblement sous les
rayons-X minimisant le bruit accumul sur les clichs de diffraction.
Nous prsenterons les expriences initiales de collectes de donnes et in situ ainsi que
leur traitement automatis et les perspectives quoffre ce nouvel instrument sur la ligne.
Lquipe de BM14 a galement dvelopp une collaboration avec lentreprise Arinax un
changeur de buse pour optimiser lutilisation de la dshydratation contrle des chantillons
temprature ambiante [3]. Grce ce systme, lutilisateur peut bascule dune exprience de
dshydration une exprience de collecte de donnes cristallographiques sous flux dazote
cryognique distance. Nous avons pu vrifier que le schage de cristaux tests permet leur
conglation sans ajout de cryo-protectant [4].
Nous nous proposons dexposer les principes de ces dveloppements et leur modus
operandi ainsi que les premiers rsultats enregistrs qui semblent prometteur.

[1] A. Thompson et al 1993-1994 (EMBL Report 1993-1994)
[2] CrystalDirect: a new method for automated crystal harvesting based on laser-induced
photoablation of thin films F. Cipriani, M. Rwer, C. Landret, U. Zander, F. Felisaz and J. A.
Mrquez Acta Cryst. (2012). D68, 1393-1399. [ doi:10.1107/S0907444912031459 ]
[3] Improvement of the diffraction quality of macromolecular crystals at European
synchrotrons using the HC1 dehydration control device U. Mueller, M. S. Weiss, J. Sanchez-
Weatherby, T. L.-M. Sorensen, M. Thunnissen, T. Ursby, A. Gobbo, S. R. Russi, M. W.
Bowler and F. Cipriani. Acta Cryst A. (2012). A68, s14
[4] Direct cryocooling of naked crystals: are cryoprotection agents always necessary? E.
Pellegrini, D. Piano and M. W. Bowler. Acta Cryst. (2011). D67, 902-906
8a - Chiralit, polymorphisme Vendredi 5 juillet 11h00-12h30

- 122 -
O82 - Formulations Pharmaceutiques et Polymorphisme

Philippe Espeau
1
, Yohann Corvis
1
, Philippe Ngrier
2
, Stphane Massip
3
, Jean-Michel Lger
3


1
EA 4066 Physico-Chimie Industrielle du Mdicament , Facult des Sciences
Pharmaceutiques et Biologiques, 4 avenue de lObservatoire, F-75006 Paris.
2
LOMA, UMR CNRS 5798, Universit Bordeaux, F-33400 Talence.
3
Pharmacochimie, FRE CNRS 3396, Universit Bordeaux 2, 33000 Bordeaux.


Le polymorphisme revt un grand intrt en pharmacie, et plus particulirement dans
lindustrie pharmaceutique, pour des raisons dactivit thrapeutique mais aussi de
brevetabilit. Un polymorphisme mal caractris ou mconnu peut entraner des consquences
dramatiques tant dun point de vue sanitaire (inefficacit, surdosage) que dun point de vue
financier. Cest pour la premire raison que la recherche et la caractrisation des polymorphes
pour une substance active donne sont devenues obligatoires depuis une quinzaine dannes.

En effet, pour une substance active donne, lactivit thrapeutique peut varier dun
polymorphe un autre car sa biodisponibilit nest pas la mme. La forme solide retenue
sera celle qui rpond des exigences de stabilit physique et chimique, pharmacocintiques,
et donc dactivit thrapeutique. Si gnralement, le choix se porte sur la forme solide la plus
stable dans des conditions ordinaires de temprature et de pression, dans certains cas, une
forme mtastable peut lui tre prfre pour des raisons de biodisponibilit ou de
contournement de brevet. Tout ceci ncessite de procder, en amont, un criblage des
polymorphes pour ensuite tablir leur stabilit relative. Grce la calorimtrie et la
diffraction des rayons X, des rgles simples de hirarchisation peuvent tre tablies [1].

Le polymorphisme cristallin, quil soit li la substance active [2] ou aux excipients [3],
sera donc abord sous langle thermodynamique et cristallographique. Son impact, en termes
dactivit thrapeutique, de formulation galnique, mais galement de brevet, sera discut aux
travers dexemples.












[1] H.G. Brittain, in Polymorphism in pharmaceutical solids , Ed.Informa Healthcare,
2009.
[2] P. Espeau et al., J. Pharm. Sci. 2005, 94(3), 524-39.
[3] Y. Corvis et al., CrystEngComm. 2012, 14, 7055-64.
8a - Chiralit, polymorphisme Vendredi 5 juillet 11h00-12h30

- 123 -
O83 - Configuration absolue et structure absolue: notions de base et
valuation

Howard D. Flack
1


1
Chimie minrale, analytique et applique, Universit de Genve, Suisse

On traitera les questions de symtrie dimportance dans la comprhension et la
dtermination de la configuration absolue et la structure absolue. Les dfinitions de chiralit,
nantiomorphe, nantiomre et racmate vont tre exposes. On va considrer la formation
de structures cristallines chirales et achirales partir de molcules chirales et achirales. Le
phnomne de maclage par inversion sera trait par les exemples du quartz et du
hexahelicne. Par la suite, cest la symtrie de limage de diffraction en prsence de la
diffusion resonante qui va occuper notre attention. La modlisation de tout cristal non-
centrosymtrique comme macl par inversion en suit naturellement. Pour terminer la partie
notions de base, il convient den dduire les rgles concernant la dtermination de la
configuration absolue dune molcule chirale partir des mesures de diffraction.

Les travaux exposs sous le thme valuation ont dbut en 2007. Ils concernent
uniquement les structures cristallines non-centrosymtriques. On utilise la moyenne (A) et la
diffrence (D) dintensit des opposs de Friedel i.e. A(hkl) = [|F(hkl)|
2
+ |F(hkl)|
2
], D(hkl) =
|F(hkl)|
2
- |F(hkl)|
2
. Par un calcul des valeurs attendues de A et de |D|
2
on arrive Friedif
stat

qui quantifie a priori la grandeur du signale de la diffusion resonante dun cristal partir de sa
composition chimique et la longueur donde de la radiation. On peut aussi calculer les valeurs
Friedif
obs
et Friedif
model
, et les comparer avec Friedif
stat
, ce qui donne les indications
intressantes concernant la prsence dun centre de symtrie dans le cristal. Les graphiques
de A
obs
contre A
model
et de D
obs
contre D
model
permettent de visualiser laccord entre
paramtres. On observe souvent, mme trop souvent, que les valeurs de D
obs
sont domines
par les incertitudes alatoires et les erreurs systmatiques. Lutilisation de valeurs comme R
int

ou R
merge
permet, dans les bons cas, de dterminer le groupe ponctuel du cristal.











[1] Parsons, S., Pattison, P. & Flack, H.D., Acta Cryst. A. 2012, 68, 736-749.
[2] Flack, H.D., Sadki, M., Thompson, A.L. & Watkin, D.J., Acta Cryst. A. 2011, 67, 21-34.
8a - Chiralit, polymorphisme Vendredi 5 juillet 11h00-12h30

- 124 -
O84 - Composs multifonctionnels : transition de spin et chiralit

Patrick Rosa, Ahmad Naim, Elen Duverger-Nedellec, Philippe Guionneau

CNRS, Universit de Bordeaux, ICMCB, 87 avenue du Dr. A. Schweitzer, Pessac, F-33608,
France

rosa@icmcb-bordeaux.cnrs.fr

La synthse de nouveaux composs transition de spin est intressante tant d'un point
de vue fondamental, pour la comprhension physique des transitions de phase impliques, que
pour les applications technologiques ventuelles de ces composs. L'obtention de matriaux
magntiques non-centrosymtriques constitue un objet d'tude intressant en optique non-
linaire (effet potentiel des lectrons non-apparis), en cristallographie (mise en vidence
rcente dun arrangement incommensurable dtats de spin) [1].

Pour obtenir des matriaux molculaires transition de spin non-centrosymtriques,
nous dveloppons actuellement plusieurs stratgies au sein du groupe de Sciences
Molculaires de l'ICMCB. Ces stratgies passent par l'introduction de la chiralit par les deux
composantes variables du matriau, les ligands du mtal de transition (typiquement le Fe(II)
ou le Co(II)) et les ventuels contre-anions. Nous exposerons les rsultats rcents que nous
avons obtenus avec cette dernire approche, en dtaillant l'utilisation de plusieurs familles
d'anions chiraux, utilises prcdemment principalement en HPLC chirale et/ou
diffrentiation nantioslective en RMN, rarement pour la synthse de matriaux
molculaires, mais jamais dans le contexte de la transition de spin: des tris(dioxolnes) de
phosphate(V) (famille TRISPHAT dveloppe par le Prof. Lacour de l'Universit de
Genve)[2] ou darsenic(V)[3], des adduits de (+)- ou (-)-tartrate avec As(III) ou Sb(III).[4]
Nous prsenterons les structures de nouveaux anions obtenus, ainsi que divers complexes de
Fe(II) cristalliss en prsence de ces anions. Nous montrerons que l'analyse des interactions
chirales en phase solide peut prsenter des rsultats inverss par rapport aux rsultats en
solution (RMN, dichrosme circulaire), et que celles-ci dpendent fortement, comme le
phnomne de transition de spin lui-mme, dinteractions intermolculaires non-covalentes,
en particulier les liaisons hydrogne.





[1] E. Collet et collab., Phys. Rev. Lett., 2012, 109, 257206 1-5.
[2]. J. J. Jodry et collab., Inorg. Chem., 2004, 43, 3329.
[3] T. Ito et collab. Inorg. Nucl. Chem. Lett., 1971, 7, 1097-1102. B. A. Borgias, Inorg.
Chem., 1986, 25, 1057-1060.
[4] A. Zalkin, Inorg. Chem., 1973, 12, 1641-1646.

8b - De l'ordre local l'ordre longue distance Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 125 -
O85 - Apport du synchrotron pour des expriences combines de
diffraction des rayons X et de spectroscopie dabsorption des rayons X

Dominique Thiaudire

Synchrotron SOLEIL, lorme des merisiers, Saint-Aubin. 91192 Gif sur Yvette

La diffraction des rayons X (XRD) et la spectroscopie dabsorption des rayons X (XAS)
sont deux techniques danalyse indispensables pour obtenir des informations sur la structure
de matriaux. Puisque le rayonnement synchrotron permet de choisir aisment lnergie du
faisceau de photons, il est un outil incontournable pour des mesures XAS. En ce qui concerne
la diffraction des rayons X, en plus du choix de lnergie, les flux importants de photons
permettent de rduire considrablement les temps denregistrement de diagrammes ou de
clichs de diffraction. On peut aussi envisager dtudier des matriaux dont les quantits de
matire diffractantes sont trs faibles. Enfin, les tailles de faisceau pouvant tre de plus en
plus rduites, les mesures XRD (mais aussi les mesures XAS) peuvent tre menes
localement en vue de cartographier des matriaux.
Les informations pouvant tre recueillies par ces deux techniques sont dans la plupart
des cas complmentaires, il nest donc pas rare de devoir faire des mesures combines.
Celles-ci peuvent tre dissocies ds lors que les conditions exprimentales nont pas pour
consquence une irrversibilit des proprits des matriaux tudier. Pour des tudes de
transformation in-situ, ces mesures combines en quasi-simultan deviennent importantes si
on souhaite garantir que les deux expriences sont effectues sur la mme zone de
lchantillon et dans des conditions physico-chimiques (temprature, pression, sollicitation
mcanique, processus ractionnels, etc) totalement identiques, ce qui est trs important pour
tablir des corrlations entre les informations complmentaires donnes par les deux types de
mesures.
Mon expos dbutera par un rappel des techniques danalyse couramment utilises sur
les installations synchrotrons. Jexpliquerai lintrt de combiner des mesures XRD et XAS
pour obtenir des informations courte, moyenne et grande distance. Je donnerai les conditions
exprimentales optimales pour russir de telles mesures. Enfin, je prsenterai diffrentes
tudes qui ont ncessites des mesures combines en quasi-simultan.
8b - De l'ordre local l'ordre longue distance Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 126 -
O86 - Structure d'oxydes fonctionnels: le rle de l'chelle
msoscopique

Michela Brunelli

Institut Laue-Langevin, Grenoble, France.
Les oxydes fonctionnels prsentent des proprits physiques complexes et fascinantes
lis leur structure. La prsence de fortes corrlations lectroniques et/ou dune importante
concentration en dfauts affectent leur structure diffrentes chelles. En particulier,
limportance des inhomognits une chelle nanomtrique (et parfois plus grande
chelle) devient de plus en plus vidente.
Je prsenterai dans cette contribution quelques rsultats rcents obtenus lESRF et
lILL en collaboration avec le dpartement de chimie de lUniversit de Milan I. Nous avons
effectus des mesures de diffraction X et neutronique sur des poudres doxydes fort dfaut
de concentration de type Ce
1-x
TR
x
O
2-x/2
o TR est une terre rare (ces oxydes servent
dlectrolytes dans des piles combustible). Les donnes ont t analyses par PDF afin de
remonter aux inhomognits nanomtriques. Grce lextrme souplesse de cette technique,
il est possible de se concentrer sur diffrentes chelles de longueur partir des seules donnes
de diffraction de poudre.
A partir des quelques exemples concernant ce type de matriau, je voudrais souligner
la complmentarit entre les informations obtenues en utilisant les neutrons ou les rayons X,
une analyse dans lespace direct ou rciproque.















[1] E. Dagotto, Science 309 (2005) 257-262.
[2] M. Coduri et al., Phys. Chem. Chem. Phys. 15 (2013), 8495 8505.
[3] M. Scavini et al., Chem. Mater., 24 (2012) 1338-1345.
[4] M. Coduri et al., Z. Kristallogr. 227 (2012) 272-79.
8b - De l'ordre local l'ordre longue distance Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 127 -
O87 - Dsordre "quasi-liquide" de chaines d'alcane sous-confinement
subnanomtrique supramolculaire.

Cline Mariette
1
, Bertrand Toudic
1
, Philippe Rabiller
1
, Laurent Gurin
1
, Alexei Bosak
2


1
Institut de Physique de Rennes,
2
ESRF, Grenoble

Il existe une trs vaste littrature concernant les phases uni-dimensionnelles de type
"liquide" gnralement sous confinement dans des matrices htes [1, 2]. Ce travail a t
gnralis dans le cadre du confinement de molcules linaires d'alcanes (C
n
H
2n+2
) dans une
matrice hte d'ure (CO(NH
2
)
2
). Ces composs d'inclusion sont connus pour tre une famille
prototype de matriaux apriodiques lorsque la molcule invite est suffisamment longue (n
suprieur 13) [3]. Nous montrerons ici que des signatures spcifiques existent dans le cas
des molcules invites plus courtes, le cristal tant stable au del de n=7. Le dsordre
translationnel y apparait alors important, pouvant autoriser de vritables glissements de ces
molcules confines. Cette ordre purement local dans la phase haute temprature "liquide
quasi-unidimensionnel" conduit froid un ordre longue distance soit commensurable avec
le rseau hte (n=8 et n=11) soit fabriquant un composite incommensurable intermodul (n=7
[4] ou n=12). L'ordre local dans la phase "quasi-liquide" se traduit par une image de diffusion
du sous-rseau invit particulirement structure. L'extrme richesse de ces informations en
font des matriaux adapts pour des tudes 3D-PDF.


FIGURE: Plans de diffusion associs la priodicit de la molcule confine d'alcane dans la
matrice hte d'ure, mesurs par rayonnement synchrotron sur la ligne de lumire ID23
(ESRF): gauche, dans le n-nonane/ure et droite, dans le n-dodcane/ure.





[1] Heilmann et al., Phys. Rev. B, 1979, 20, 2, 751.
[2] Albouy et al., Phys. Rev. B, 1987, 35, 173.
[3] Toudic et al., Science, 2008, 319, 69.
[4] Mariette et al., J. Chem. Phys. 2012, 136, 104507.

8c - Dfis en cristallographie biologique Success stories
Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 128 -
O88 - La myosine VI, un nanomoteur contre-sens.

Anne Houdusse
1
, Amel Bahloul
1
, Julie Mntrey
1
, Paola Llinas
1
, Tatiana Isabet
1
, Olena
Pylypenko
1
, Hannah Benisty
1
, Virginie Ropars
1
, Serena Sirigu
1
, Carlos Kikuti
1
, Helena
Sirkia
1
, H. Lee Sweeney
2
.

1
Structural Motility, Institut Curie UMR 144, Paris, France
2
University Pennsylvania, Philadelphia, USA

La myosine VI est le seul moteur de la superfamille capable de diriger la production de
force dans une direction oppose celle des autres le long des filaments dactine. De
nombreuses tudes structurales couples des expriences de molcule unique ont permis de
dterminer les lments structuraux et le mcanisme particulier de ce nanomoteur. Alors quil
ne fait plus de doute que les rarrangements du domaine moteur sont similaires ceux des
autres myosines, la procession du moteur le long du filament dactine requiert un dcouplage
de son bras de levier. Ce qui rend le mcanisme de cette myosine plus proche de celui dj
dcrit pour le mouvement de kinsines. Les dfis restant relever pour ce moteur consistent
dcrire comment il sassemble en dimre lors de la reconnaissance de partenaires et comment
cela dfinit le rle cellulaire quil peut jouer en transportant ou en ancrant ses partenaires au
cytosquelette dactine.














[1] Mntrey J*, Bahloul A*, et al. Nature (London) 435, 779-85, 2005.
[2] Mntrey J*, Llinas P*, et al. The structural basis for the large powerstroke of myosin VI.
Cell 131:300-308, 2007.
[3] Mukherjea M*, Llinas P*, et al. Myosin VI dimerization triggers an unfolding of a 3-helix
bundle in order to extend its reach. Molecular Cell, 35:305-15, 2009.
[4] Sweeney HL and Houdusse A, Myosin VI rewrites the rules for myosin motors, Cell,
141:573-82, 2010.
[5] Mntrey J*, Isabet T*, et al. Processive steps in the reverse direction require uncoupling
of the lead head lever arm of myosin VI. Mol Cell. 48,75-86, 2012.
8c - Dfis en cristallographie biologique Success stories
Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 129 -
O89 - Control of the DNA mismatch repair and the meiosis
recombination by eukaryotic MutL homologs.

JB Charbonnier
1
, E Gueneau
1
, C Tellier-Lebegue
1
, P Legrand
2
, J Marquz
3
, C Dherin
4
, S
Boiteux
4


1
UMR 8221, CEA, CNRS, Univ Paris Sud, iBiTec-S, Gif-s-Yvette
2
Synchrotron SOLEIL, Proxima 1, St Aubin
3
HTX platform, EMBL, Grenoble
4
UPR 4301, CNRS, Centre Biophysique Molculaire, Orlans

jb.charbonnier@cea.fr

The DNA mismatch-repair (MMR) system corrects replication errors and is thus
essential for maintaining genome integrity. MMR factors are also involved in other DNA-
metabolic processes including a correct meiotic recombination. These functions depend on
MutL homolog heterodimers with Mlh1 as a common subunit. In human, MLH1 mutations
underlie half of hereditary nonpolyposis colorectal cancers (HNPCC). We solved the crystal
structures of MutLa (Mlh1/Pms1 heterodimer) C-terminal domain (CTD) from S. cerevisiae,
alone and in complex with fragments derived from Mlh1 partners [1]. These structures reveal
structural rearrangements and additional domains compared to the bacterial MutL
counterparts and in particular they highlight a role of Mlh1 subunit in Pms1 endonuclease site.
We determined the structures of the ternary complexes between MutLa-CTD and Exo1 or
Ntg2 fragments reveal the binding mode of the MIP-box motif shared by several Mlh1
partners [2, 3, 4]. Finally, the structures provide a rationale for the deleterious impact of
mutations in HNPCC.

















[1] Gueneau, E et al (2013) Nat Struct Mol Biol
[2] Gellon, L et al (2002) J Biol Chem
[3] Dherin, C, et al (2009) Mol Cell Biol
[4] Zakharyevich, K et al (2010) Mol Cell
8c - Dfis en cristallographie biologique Success stories
Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 130 -
O90 - La survie en milieu riche en arsniate : le mcanisme
molculaire de discrimination du phosphate

Mikael Elias
1
, Alon Wellner
1
, Korina Goldin-Azulay
1
, Eric Chabriere
2
, Julia A. Vorholt
3
,
Tobias J. Erb
3
& Dan S. Tawfik
1


1
Department of Biological Chemistry, Weizmann Institute of Science, Rehovot 76100, Israel.
2
URMITE CNRS-Universit de la Mditerrane, Marseille, France
3
Institute of Microbiology, ETH Zurich, Switzerland


Larsniate et le phosphate sont abondants sur notre plante et sont des espces proches
sur les plans physico-chimiques : pK
a
quasi identiques, charges similaires sur les atomes
doxygne, et une taille qui ne diffre que de 4%. Le phosphate est pourtant indispensable la
vie (tant notamment un constituant essentiel de lADN) alors que larsniate est extrmement
toxique. Cette similarit a suscit lide que larsniate pourrait substituer le phosphate dans
certaines niches [1]. Mais quil soit utilis ou exclu, discriminer larsniate du phosphate est
une tche trs complexe : toutes les enzymes qui utilisent le phosphate sont incapables de
discriminer ces deux anions. Ceci constitue par ailleurs une des raisons principales de la trs
grande toxicit de larsniate. Les protines sont-elles capables de discriminer ces deux ions ?
Et si oui, par quel mcanisme ?

Nous nous sommes intresss en particulier au systme dimport cellulaire de
phosphate, qui est soumis ce challenge dans les environnements riches en arsniate. Plus
particulirement, nous avons examin les Phosphate-Binding Protein priplasmiques (PBPs)
associes au transporteur ABC qui permettent limport de phosphate. Nous avons pu montrer
que toutes ces protines sont capables de discriminer efficacement le phosphate de larsniate
(>500 fois) [2]. Nous avons rsolu la structure de lune de ces PBPs, en prsence de
phosphate et darsniate, des rsolutions sub-atomiques (0.88-0.98). Les anions sont fixs
et immobiliss par une constellation de liaisons hydrogne (12) avec la protine et des
interactions rpulsives. Ce mode de fixation provoque la distorsion dune liaison hydrogne
courte, unique (Low barrier H-bond) par lion arsniate, 4% plus gros que le phosphate [2].
Ces dterminants structuraux permettent au systme dimport de phosphate de fixer
slectivement le phosphate par rapport larsniate, et ce mme dans des environnements
riches en arsniate tels que le Lac Mono (californie, USA).





[1] Wolfe-Simon et al., Science. 2011, 332, 1163-6.
[2] Elias et al., Nature. 2012, 491, 134-7.
8c - Dfis en cristallographie biologique Success stories
Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 131 -
O91 - Integrated conformational and lipid-sensing regulation of
ArfGEFs
Jacqueline Cherfils, Kaheina Aizel, Valrie Biou, Jorge Navaza, Mahel Zeghouf
Laboratoire d'Enzymologie et Biochimie Structurales, CNRS, Gif-sur-Yvette, France
The structural and biochemical mechanisms whereby GEFs coordinate their
subcellular targeting to their nucleotide exchange activity remain poorly understood. I will
present the crystal structure of an ArfGEF in a complex that mimics a membrane-bound
intermediate combined with the analysis of its exchange activity reconstituted on membranes.
This uncovered a novel regulatory mechanism mediated by an atypical PH domain, which
restricts the activity of the GEF to specific membranes and potentiates its efficiency by about
2000-fold by concurrent optimization of membrane recruitment and nucleotide exchange.



- 132 -

- 133 -













Rsums des
POSTERS
P1-70

- 134 -

Session Posters 1a/4a Matriaux fonctionnels (1 et 2)
- 135 -
P1 - Etude de diffrentes structures des conducteurs protoniques
base de sulfate, de phosphate et de slnate avec le benzylamine

Asma BEN RACHED
1
, Zakaria ELAOUD
1
, Arnaud GROSJEAN
2
, Philippe GUIONNEAU
2
,
et Tahar MHIRI
1


1
Laboratoire de lEtat Solide, Facult des Sciences de Sfax, BP1171 Sfax Tunisie,
2
CNRS, Univ. Bordeaux, ICMCB, UPR 9048, 87 avenue du Dr A. Schweitzer, F-33608 Pessac


La recherche et la caractrisation de nouveaux matriaux hybrides de type MH
n
XO
4-n

(M= ligand organique, X=S, Se, P, As ) constituent un thme de recherche trs prometteur
en cristallochimie. Ces matriaux prsentent un intrt considrable parce quils rassemblent
les proprits physiques des lments organiques et inorganiques [1,2]. Les applications de
ces matriaux couvrent des domaines aussi varis que la biolectronique ou loptique par
exemple [3,4]. Notre dmarche est base sur une synthse systmatique de composs
cristalliss suivie de la dtermination de leurs structures cristallines et de la nature des liaisons
chimiques qui sont donc la cl de la comprhension du comportement physique de ces
matriaux.
Dans cette optique nous poursuivons nos recherches sur les synthses de benzylamine avec
diffrents acides comme les acides sulfurique, phosphorique, phosphoreux et slnique.
Ltude cristallographique par diffraction X a montr que ces matriaux ne sont pas
isotypes bien que bass sur le mme amine (M=C
7
H
9
N
1
). Le sulfate organique (X=S)
cristallise dans le systme monoclinique de groupe despace P2
1
/c alors que le slnate
(X=Se) et le phosphate (X=P) organiques cristallisent dans le systme triclinique de groupe
despace P-1 tandis que le compos base de lacide phosphoreux cristallise dans le systme
orthorhombique de groupe despace Pbca. Lexamen de ces structures montre une alternance
de plans contenant des chanes organiques [C
6
H
5
CH
2
NH
3
+
] et de plans forms de chanes de
ttradres [HSO
4
]
-
,[SeO
3
]
2-
, [HPO
3
]
-
et [PO
4
]
2-
. Les plans inorganiques et organiques sont lis
entre eux par des liaisons hydrogne du type NHO.et O
_
H

O. Les liaisons inter-chanes


sont assures par ltablissement dinteractions de type van der Waals. Toutes ces liaisons
assurent la cohsion et la stabilit de ldifice cristallin et forment ainsi un rseau
tridimensionnel.









[1] F.Z. Arrakhiz. Materials and Design.2013, 50, 376381.
[2] X. Yu. Dyes and Pigments . 2013, 98, 479-485.
[3] A.K.Tatikonda. Biosensors and Bioelectronics .2013, 45, 201205.
[4] M.H. Ibrahim. Optik .2013, 124 , 1532 1535.
Session Posters 1a/4a Matriaux fonctionnels (1 et 2)
- 136 -
P2 - Relation structure proprits dans la solution solide
(Ba
1-x
Sr
x
)
2
NdFeNb
4
O
15


Flora Molinari
1,2
, Eric Lebraud
1,2
, Rodolphe Decourt
1,2
, Dominique Michau
1,2
, Michal
Josse
1,2

1
CNRS, ICMCB, UPR 9048, F-33600 PESSAC, FRANCE
2
UNIV. BORDEAUX, ICMCB, UPR 9048, F-33600 PESSAC, FRANCE

Des tudes cramiques sur des composs Ba
2
LnFeNb
4
O
15
(Ln = La, Pr, Nd, Sm, Eu,
Gd), de structure type bronze quadratique de tungstne (TTB), ont rvles des
comportements dilectriques originaux : relaxeur pour Ln=La et Pr et ferrolectrique pour
Ln=Nd, Sm, Eu [1]. Ltude des proprits dilectriques dans la solution solide
Ba
2
Pr
x
Nd
1-x
FeNb
4
O
15
, a permis de mettre en vidence pour certaines compositions
(0,2 x 0,8) une transition relaxeur-ferrolectrique-paralectrique lors du rchauffement
[2]. Des comportements similaires (usuellement dnomms crossover ) ont t obtenus
dans d'autres solutions solides bases sur des mcanismes de substitution diffrents (par
exemple, substitution Nb-Ta).
Dans ce poster, nous discuterons des rsultats obtenus sur des cramiques au sein
dune nouvelle solution solide (Ba
1-x
Sr
x
)
2
NdFeNb
4
O
15
, base elle aussi sur le niobate
ferrolectrique Ba
2
NdFeNb
4
O
15
. Les analyses MEB et les proprits dilectriques, ainsi que
les tudes structurales sur poudre par Diffraction des Rayons X ralises lambiante dans le
groupe despace P4/mbm menes dans cette solution solide seront alors prsents.



















[1] M. Josse et al., Solid State Sci., 2009, 11(6), 1118-1123
[2] E. Castel et al., J. Phys.: Condens. Matter 21 (2009) 452201
Session Posters 1a/4a Matriaux fonctionnels (1 et 2)
- 137 -
P3 - Elaboration, structure et caractrisation spectroscopique du
phosphate Na
x
Ca
y
Al
z
Ti
t
(PO
4
)
3


A. Nazih
1
, S. Pechev
2
, S. Krimi
3
, M. Velazquez
2
, M. Couzi
4
, A. El Jazouli
1


1
LCMS, URAC17, Facult des Sciences Ben M'Sik-UH2M, Casablanca, Maroc.
2
ICMCB-CNRS, Universit de Bordeaux1, France.
3
LPCMI, Facult des Sciences Ain Chock UH2C, Casablanca, Maroc.
4
ISM-CNRS, Universit de Bordeaux1, France.

Les matriaux phosphats vitreux ou cristalliss sont trs tudis en raison de leur
importance dans divers domaines : batteries, optique non linaire, conducteurs ioniques,
biomatriaux, lasers, etc. Nous avons montr prcdemment que les phosphates cristalliss
Na
5-2x
Ca
x
Ti(PO
4
)
3
(0 < x <1) appartiennent la famille Nasicon (Na super ionic conductors)
et cristallisent dans le groupe despace non-centrosymtrique R32 [1-3]. Les essais de
substitution, dans Na
3
CaTi(PO
4
)
3
(x = 1), de l'aluminium au titane, nous a permis disoler un
nouveau phosphate de formule Na
x
Ca
y
Al
z
Ti
t
(PO
4
)
3
. Nous prsentons ici sa mthode de
prparation, sa structure cristalline et sa caractrisation par Raman, infrarouge et absorption
optique.
Le phosphate Na
x
Ca
y
Al
z
Ti
t
(PO
4
) a t prpar, sous forme de monocristaux et de
poudre polycristalline, partir de Na
2
CO
3
, CaCO
3
, Al
2
O
3
, TiO
2
et (NH
4
)
2
HPO
4
. Les
monocristaux ont t obtenus par fusion suivie dun refroidissement lent. La poudre a t
obtenue par raction ltat solide. La structure, rsolue par diffraction des rayons X sur
monocristal, appartient au type structural Nasicon, groupe despace R32. Les paramtres
cristallins de la maille hexagonale quivalente sont : a
h
= 8,9976(1) et c
h
= 21,8312(3) . La
structure est forme par un rseau 3D doctadres AO
6
(A=Na/Ca, Al/Ti) et de ttradres PO
4

lis par les sommets. Les sites interstitiels, usuellement appels M1 et M2, sont occups par le
sodium.
Ltude du phosphate Na
x
Ca
y
Al
z
Ti
t
(PO
4
) par spectroscopie vibrationnelle Raman et
infrarouge et par absorption optique sera galement prsente.



[1] S. Krimi, A. El Jazouli, L. Rabardel, M. Couzi, I. Mansouri and G. Le Flem. J. Solid State
Chem., 1993, 102, 400-407.
[2] S. Krimi, I. Mansouri, A. El Jazouli, J. P. Chaminade, P. Gravereau and G. Le Flem. J.
Solid State Chem., 1993, 105, 561-566.
[3] S. Krimi, A. El Jazouli, A. Lachgar, L. Rabardel, D. de Waal, J. R. Ramos-Barrado. Ann. Chim.
Sci. Mat., 2000, 25 Supp. 1, S75-78.

Remerciements : Nous remercions le CNRST/Maroc, le CNRS/France (Accord n 24494) et
le comit franco-marocain Volubilis (Action Intgre n MA/10/229), pour leur soutien
financier.
Session Posters 1a/4a Matriaux fonctionnels (1 et 2)
- 138 -
P4 - Diffraction X et cristaux conversion de spin : approches indites
et rsultats nouveaux.

Sabine Lakhloufi
1,2
, Philippe Guionneau
2
, Marie-Hlne Leme-Cailleau
1


1
Institut Laue-Langevin, 6 rue Jules Horowitz, BP 156, Grenoble, F-38042, France,
2
CNRS, Universit de Bordeaux, ICMCB, 87 avenue du Dr A. Schweitzer, Pessac, F-33608,
France

La diffraction des rayons X (DRX) est un outil privilgi pour ltude fine de la
matire, depuis lchelle atomique jusqu celle de larrangement complet macroscopique.
Les dveloppements techniques rcents de cette mthode, en matire de source de
rayonnement, de dtection et danalyse de donnes, nous ont permis de dvelopper deux
approches innovantes pour ltude des transitions de phase, offrant dans le cas de cristaux
conversion de spin une description du mcanisme de conversion depuis lchelle de la
premire sphre de coordination de lion mtallique jusqu celle, macroscopique, du cristal.
Une tude multi-structurale multi-temprature du complexe conversion thermique
graduelle [Fe(PM-AzA)
2
(NCS)
2
] (Fe-AzA), comprenant plus de 40 structures acquises par
DRX entre 100K et 300K a donn lieu llaboration de films de la conversion de spin,
permettant de visualiser quasiment en continu toutes les modifications structurales induites
par la commutation. Alli ltude multi-temprature du complexe isostructural base de Zn
II

qui ne transite pas, ce procd a permis de dcorrler les effets thermiques de ceux de la
conversion de spin, et didentifier et quantifier prcisment les consquences propres de cette
dernire, depuis lchelle atomique celle de la maille cristalline.
Ltude aux chelles suprieures, msoscopique et macroscopique, a ncessit un
protocole exprimental pionnier mis en uvre au laboratoire. Bas sur lvolution des forme
et taille des taches de Bragg des clichs de DRX, il a permis le suivi de lvolution de la
qualit cristalline des matriaux pendant et au fil des conversions de spin. Appliqu aux
cristaux de Fe-AzA, il a mis jour une fatigabilit initiale en lien avec le mcanisme de
conversion de spin, vieillissement inattendu dans un complexe conversion graduelle [1].

Les avances ralises laide de ces deux techniques concernent aussi bien le niveau
fondamental, apportant des informations de base sur le phnomne de conversion de spin, que
le niveau exprimental, ouvrant de nouvelles voies dinvestigation, en allant jusqu des
lments intressants le domaine de lapplication industrielle.





[1] Guionneau et al., Chem. Phys. Lett. 2012, 542, 52-55.

Session Posters 1b Surfaces et interfaces
- 139 -
P5 - Etude de la transition de phase cubique/quadratique dans des
nanofils auto-organiss de FePt

David Babonneau
1
, Mathieu Garel
1
, Frdric Pailloux
1
, Alexandre Boulle
2
, Alessandro
Coati
3
, Yves Garreau
3,4


1
Institut PPRIME, UPR CNRS 3346, Universit de Poitiers, SP2MI, 11 Bvd Marie et Pierre
Curie, BP 30179, 86962 Futuroscope Chasseneuil Cedex
2
Science des Procds Cramiques et de Traitements de Surface, SPCTS, UMR CNRS 7315,
ENSCI, Centre Europen de la Cramique (CEC), 12 rue Atlantis, 87068 Limoges Cedex
3
Synchrotron SOLEIL, L'Orme des merisiers, BP 48, 91192 Gif-sur-Yvette Cedex, France
4
Universit Paris Diderot, Sorbonne-Paris-Cit, MPQ, UMR 7162 CNRS, Btiment
Condorcet, Case 7021, 75205 Paris Cedex 13, France

Les nanofils ferromagntiques prsentent des proprits physiques originales qui
dcoulent de leurs dimensions sub-microniques et de leur gomtrie spcifique. Ils offrent des
perspectives nouvelles pour des applications, notamment dans le domaine du stockage de
linformation, de llectronique de spin et des dispositifs hyperfrquences. Dans cette tude,
nous nous intressons des nanofils dalliage FePt dont lorganisation, la morphologie, la
composition et les transitions de phases sont autant de paramtres clefs gouvernant leurs
proprits physico-chimiques.
Les nanofils sont labors sur des surfaces dalumine amorphe (Al
2
O
3
) pralablement
nanostructures par pulvrisation ionique en incidence oblique conduisant lobtention de
rides priodiques unidirectionnelles [1,2]. Un co-dpt de FePt est ensuite effectu en
incidence rasante (5) et temprature ambiante par pulvrisation ionique. Une couche
dAl
2
O
3
est finalement dpose pour recouvrir et enrober les nanofils, puis des traitements
thermiques ex situ 600C sous vide sont effectus. Lorganisation et la morphologie des
nanofils ont t analyses avant et aprs traitement par GISAXS et HAADF-STEM, et les
phases en prsence ont t identifies par diffraction des rayons X en incidence rasante et par
diffraction lectronique en aire slectionne filtre en nergie. Nos observations montrent que
la microstructure rsultant de la croissance temprature ambiante est assez bien prserve
lors des traitements thermiques, qui entranent par ailleurs une transition de phase cubique
(dsordonne)/quadratique (ordonne).
Afin de prciser la cintique de mise en ordre chimique, des traitements thermiques in
situ ont galement t raliss dans un microscope lectronique. En utilisant un dispositif de
dtection des trs faibles intensits diffractes et en procdant un post-traitement des clichs
obtenus, la dtection des premiers stades de mise en ordre a ainsi pu tre mise en vidence.



[1] Camelio et al., Phys. Rev. B 2009, 80, 155434.
[2] Babonneau et al., Phys. Rev. B 2012, 85, 235415.
Session Posters 1c Nouvelles structures en biologie
- 140 -
P6 - One protein, many assemblies. Membrane fusion by a single viral
glycoprotein involves formation of radically different pH-dependent
oligomers.

Eduard Baquero
1*
, Aurlie A. Albertini
1*
, Malika Ouldali
1
, Linda Buonocore
2
, John K. Rose
2
,
Jean Lepault
1+
, Yves Gaudin
1+
, Stphane Bressanelli
1+


1
Centre de Recherche de Gif, Laboratoire de Virologie Molculaire et Structurale, CNRS
(UPR 3296), Avenue de la Terrasse, 91198, Gif sur Yvette Cedex, France,
2
Yale University School of Medicine, 310 Cedar St., New Haven, CT 06510, USA

Enveloped viruses enter cells through a membrane fusion reaction driven by
conformational changes of viral fusion glycoproteins. For some of these fusion glycoproteins,
crystal structures have provided atomic, static pictures of pre- and post-fusion conformations,
but intermediates in the transition have remained elusive [1]. Thus, in different pH conditions
the vesiculovirus (family Rhabdoviridae) fusion protein G may form two kinds of symmetric,
trimeric spikes. Each trimer is made of a different folding state of G [2] [3].
We report here a crystal structure in which G forms a flat heterotetramer with twofold
symmetry. The tetramer is made up of two different refolding intermediates between the pre-
and post-fusion states. The tetramer interfaces feature pH-dependent molecular switches and
residues where mutants were previously reported to change the phenotype for rhabdovirus
fusion.
These results extend the noted convergence of fusion proteins of so-called class III (e.g.
Rhabdoviruses) and class II (e.g. flaviviruses) in a completely unexpected direction. In
agreement with electron microscopy and tomography results of the states of G at the viral
surface, we propose that the different assemblies of G act at different stages of fusion. This
proposed division of labor has profound consequences on virally-catalyzed membrane fusion.












[1] E. Baquero, A.A. Albertini, P. Vachette, J. Lepault, S. Bressanelli, Y. Gaudin, Curr.
Opin. Virol. 2013.
[2] S. Roche, S. Bressanelli, F.A. Rey, Y. Gaudin, Science 2006, 313, 187.
[3] S. Roche, F.A. Rey, Y. Gaudin, S. Bressanelli, Science 2007, 315, 843.
Session Posters 1c Nouvelles structures en biologie
- 141 -
P7 - La protine priplasmique AccA dAgrobacterium tumefaciens :
Etude de la relation Structure fonction

El Sahili Abbas
1
, Denis Faure
2
,
Solange Morra
1


1
LEBS UPR CNRS 3082,
2
ISV UPR CNRS 2355

Agrobacterium tumefaciens est une bactrie pathogne du sol qui cause, chez les
plantes, la maladie de la galle du collet se caractrisant par la formation de tumeurs colonises
par la bactrie. Ce mcanisme dinfection est bien connu et se compose de 4 tapes:

1- La blessure de la plante active chez A. tumefaciens le plasmide de virulence Ti (pTi)
2- Un fragment de ce pTi, le T-DNA est transfr dans le gnome de la cellule
vgtale
3- La plante scrte alors des hormones de croissances vgtales lorigine des
tumeurs et de lAgrocinopine qui sert de source dnergie la bactrie
4- LAgrocinopine active galement des mcanismes de quorum sensing chez la
bactrie qui conduisent la propagation du pTi chez des bactries non pathognes les rendant
pathognes.
LAgrocinopine est importe dans la bactrie par le systme Acc, compos dun
transporteur ABC et dune protine priplasmique AccA qui reconnait lAgrocinopine.
Cependant, des tudes ont montr quAccA tait galement la voie dentre de
lAgrocine 84, qui est un agent phytosanitaire qui tue A. tumefaciens [1].
Il sagit donc de comprendre la spcificit de linteraction dAccA avec
lAgrocinopine et lAgrocine 84 par une tude structure fonction.
Je prsenterai mes premiers rsultats de doctorat (dbut en Octobre 2012) sur cette
tude travers des structures cristallines obtenues et des mesures de microcalorimtrie.


















[1] Kim, H. & Farrand, S. K. (1997). Journal of Bacteriology. 179, 75597572.
Session Posters 1c Nouvelles structures en biologie
- 142 -
P8 - Le criblage des conditions de cristallisation des protines est
sous-chantillonn.

Fabrice Gorrec

MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge, UK

Les conditions de cristallisation qui ont permis d'obtenir les structures de cristaux de
protines au MRC Laboratory of Molecular Biology (MRC-LMB, Cambridge, Angleterre)
ont t analyses [1]. Plus un agent cristallisant est employ pour formuler les conditions de
nos kits de criblages, plus frquemment il apparait dans les formulations de conditions pour
nos structures publies. Cette analyse montre que, malgr la grande varit des agents
employs [2], ils ont tous le mme impact sur nos chances de succs d'obtenir les structures
partir de cristaux. Et surtout, l'analyse suggre que mme si nous employons de nombreux kits
de criblage, ce criblage est sous-chantillonn.





























[1] Gorrec, J. Appl. Cryst. 2013, in press.
[2] Stock et al., Prog. Biophys. Mol. Biol. 2005, 88, 311-327.

Session Posters 2a Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
- 143 -
P9 - Service de Radiocristallographie de lInstitut de Chimie de
Strasbourg

Corinne Bailly, Lydia Brelot

Service de Radiocristallographie, Institut de Chimie de Strasbourg (UMR 7177),
1 rue Blaise Pascal, B.P.296 R8, 67008 Strasbourg CEDEX, France

Nous vous prsentons ici le Service de Radiocristallographie de lInstitut de Chimie de
Strasbourg. Ce service assure la dtermination de structures molculaires et/ou
supramolculaires par diffraction des rayons X sur monocristaux de tous composs, produits
naturels ou produits de synthse.

Le service dispose de deux diffractomtres : un diffractomtre 4-cercles CCD Bruker
Kappa APEX II DUO IS quip de deux sources (tube scell au molybdne et micro-source
au cuivre) ainsi quun diffractomtre 4-cercles Nonius Kappa CCD quip dun tube scell au
molybdne. Ces deux diffractomtres sont chacun quips dun systme cryognique Oxford
Cryosystems pour les enregistrements basse temprature.
Le service dispose galement dun stromicroscope LEICA M125 lumire polarise,
quip dune camra permettant de prendre en photo les cristaux.

Le service tant ouvert toute la communaut strasbourgeoise ainsi qu tout
laboratoire extrieur, la nature des chantillons tudis est trs varie : composs
supramolculaires (grilles de mercure [1]), porphyrines [2], composs organomtalliques
(complexes de titane [3]), composs organiques [4], etc
La microsource au cuivre permet galement de dterminer la configuration absolue de la
structure dun compos nantiomriquement pur.










[1] J.Ramirez, A.-M.Stadler, Z-Anorg.Allg.Chem. 2009, 635, 1348-1351.
[2] J.Taesch, T.T.Dang, V.Heitz, Tetrahedron Lett. 2012, 53, 333-337.
[3] C.Romain, L.Brelot, S.Bellemin-Laponnaz, S.Dagorne, Organometallics. 2010, 29, 1191-
1198.
[4] B.Manteau, P.Genix, L.Brelot, J.-P.Vors, S.Pazenock, F.Giornal, C.Leuenberger,
F.R.Leroux, Eur.J.Org.Chem. 2010, 6043-6066.
Session Posters 2a Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
- 144 -
P10 - Rsolution dune macle lors de la dtermination structurale par
diffraction X dun complexe de cuivre

Carine Duhayon, Jean-Pierre Costes

CNRS, LCC (Laboratoire de Chimie de Coordination), 205 route de Narbonne, BP 44099, F-
31077 Toulouse Cedex 4.

Le ligand 2-hydroxy-N'-[(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)methylidene]benzohydrazide
possde trois fonctions dprotonables et deux sites de coordination devant permettre de ce fait
la formation de complexes htromtalliques, soit par synthse directe, soit par synthse
multi-tapes. Afin de mieux comprendre laffinit des ions mtalliques vis--vis des sites
possibles de coordination, nous avons dabord envisag la complexation dun seul centre
mtallique, en loccurrence lion cuivre(II) en prsence dun excs de pipridine qui joue le
rle dagent dprotonant mais qui peut aussi se complexer au cuivre.

Lors de la dtermination structurale par diffraction des rayons X sur les monocristaux
obtenus, nous avons t confronts la prsence dune macle par pseudo-mrihdrie. Nous
montrerons comment les outils logiciels (en particulier Crystals
[1]
, Platon
[2]
et Rotax
[3]
) mis
la disposition du cristallographe ont permis de trouver la bonne maille cristalline et la loi de
macle, le traitement final aboutissant la rsolution de cette structure.


Figure. Vue de la molcule obtenue

Le rsultat obtenu confirme la formation dun complexe mononuclaire neutre. Lion
cuivre se trouve dans un environnement plan carr, li deux atomes doxygne et un atome
dazote du ligand, la quatrime position tant occupe par latome dazote de la pipridine.
Jusqu prsent les ligands similaires celui utilis ici conduisent des complexes
ttranuclaires,
[4]
avec les quatre centres mtalliques positionns aux sommets dun carr.
Lutilisation de la pipridine permet donc dobtenir un complexe simple qui pourra servir la
formation ultrieure dentits htromtalliques.

[1] Betteridge, P.W., Carruthers, J.R., Cooper, R.I., Prout, K. & Watkin, D.J. 2003, J. Appl.
Cryst. 36, 1487.
[2] A.L.Spek, Acta Cryst. 2009, D 65, 148-155
[3] R. I. Cooper, R. O. Gould, S. Parsons and D. J. Watkin, 2002, J. Appl. Cryst., 35, 168-174
[4] Y. S. Moroz, K. Kulon, M. Haukka, E. Gumienna-Kontecka, H. Kozlowski, F. Meyer, I.
O. Fritsky, Inorg. Chem. 2008, 47, 5656.
Session Posters 2a Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
- 145 -
P11 - Structure Elucidation of Host-Guest Complexes of Tartaric and
Malic Acid by Quasi-Racemic Crystallography

Guillaume Lautrette,
1
Brice Kauffmann,
1

Yann Ferrand,
1
Christophe Aube,
2
Nagula
Chandramouli,
1
Didier Dubreuil,
2
Ivan Huc
1


1
Universit de Bordeaux, CBMN, UMR5248 Institut Europen de Chimie et Biologie 2 rue
Escarpit, 33600 Pessac, France and CNRS, CBMN, UMR5248
2
Universit de Nantes, CEISAM, UMR6230 Facult des Sciences et des Techniques 2 rue de
la Houssinire, BP 92208 44322 Nantes Cedex 3, France and CNRS, CEISAM, UMR6230

The propensity of racemic solutions of organic molecules to frequently produce
racemic crystals and to only rarely resolve into crystals containing exclusively one enantiomer
(conglomerates) has been known for long. Over a decade of foldamer chemistry has provided
strong empirical evidence that this observation also holds true in the case of helical aromatic
foldamers. Racemic crystallography has been used to solve the structure of some proteins that
can be produced by chemical synthesis and which were shown to crystallize more readily as a
racemic pair than as a single enantiomer.[1] As an extension to racemic crystallography,
quasi-racemates are sometimes found to co-crystallize, as was originally described by Pasteur
for malate and tartrate salts.[2] A quasi-racemic crystal comprise a pair of molecules the
structures of which are almost, but not exactly, mirror images.[3]



In this poster, we introduce the use of quasi-racemic crystallography as a method to
elucidate the structures of host-guest foldamers complexes of tartaric and malic acid. We took
advantage of the high propensity of enantiomeric P and M helices to co-crystallize, and
demonstrated that co-crystals still form even when the guests introduced in the cavities are not
mirror images.
[1] (a) C. Toniolo, C. Peggion, M. Crisma, F. Formaggio, X. Shui, D.S. Eggleston, Nat.
Struct. Biol. 1994, 1, 908914; (b) B. L. Pentelute, Z. P. Gates, V. Tereshko, J. L. Dashnau, J.
M. Vanderkooi, A. Kossiakoff, S. B. H. Kent, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 9695 9701.
[2] (a) L. Pasteur, Ann. Chim. Phys. 1853, 28, 437; (b) K. A. Wheeler, R. C. Grove, R. E.
Davis, W. S. Kassel, Angew. Chem. 2008, 120, 8487; Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 78
81.
[3] (a) D. E. Mortenson, K. A. Satyshur, I. A. Guzei, K. T. Forest, S. H. Gellman, J. Am.
Chem. Soc. 2012, 134, 2473; (b) K. Mandal, B. L. Pentelute, D. Bang, Z. P. Gates, V. Yu.
Torbeev, S. B. H. Kent, Angew. Chem. 2012, 124, 15101515; Angew. Chem. Int. Ed. 2012,
51, 1481.
Session Posters 2a Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
- 146 -
P12 - Synthse et caractrisation nouveaux carboxylates
htromtallique impliquant le cation uranyle

Natacha Henry, Ionut Mihalcea, Clment Falaise, Christophe Volkringer, Thierry Loiseau
Unit de Catalyse et Chimie du Solide (UCCS) UMR CNRS 8181, Universit de Lille,
USTL-ENSCL, BatC7, BP 90108, 59652 Villeneuve dAscq
La chimie des actinides a connu un net regain dintrt ces dernires annes, qui devrait
saccentuer avec le renouvellement du parc lectronuclaire et notamment vers le
dveloppement dun nuclaire durable. Dans ce cadre, la matrise des degrs doxydation des
actinides au sein de ces composs constitue un objectif important afin de mieux relier les
proprits du solide aux caractristiques redox originales de ces lments. Des systmes
comportant luranium au degr doxydation +6 et un lanthanide (permettant de simuler le
comportement du plutonium ou des actinides mineurs) ou des mtaux de transition (prsents
dans le cycle du combustible) sont donc privilgis, en leur associant diffrents anions
organiques (carboxylates).
Les synthses et les structures dhtromtallique de carboxylates forms d'uranyle
associ un lanthanide trivalent (Ce, Nd) ou un mtal de transition divalent (Cu, Zn) seront
prsentes. Dans le cas de lanthanide-uranyle mixte, nous discuterons d'une configuration
unique dinteraction cation-cation avec U
VI
=O-Ln
III
(Ln = Ce, Nd) (figure a), ainsi que de leur
dgradation thermique en oxydes mixtes (U,Ln)O
2
dans le perspective de produire de
nouveaux types de combustibles nuclaires.
[1,2]

La synthse de composs mixtes contenant cuivre ou zinc
[3,4]
mne une srie dont
certains ont un comportement de dshydratation inattendu (figure b).






[1] C. Volkringer, N. Henry, S. Grandjean, T. Loiseau, J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 1275.
[2] I. Mihalcea, C. Volkringer, N. Henry, T. Loiseau, Inorg. Chem. 2012, 51, 9610.
[3] J. Olchowka, C. Falaise, C. Volkringer, N. Henry, T. Loiseau, Chem. Eur. J. 2013, 19,
2012.
[4] J. Olchowka, C. Volkringer, N. Henry, T. Loiseau, Eur. J. Inorg. Chem. 2013 2109.
Session Posters 2a Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
- 147 -
P13 - Matriaux hybrides organiques inorganiques : synthse et
caractrisation

Insaf ABDI et Amor BENALI

Unit de Recherche synthse et structure de nanomatriaux, Universit de Carthage, Facult
des Sciences de Bizerte 7021, Jarzoune, Bizerte, Tunisie

Amor.BenAli@fsb.rnu.tn
Les matriaux hybrides organique-inorganique sont gnralement labors par voie
hydro(solvo)thermale en condition sub-critique par voie classique en utilisant des autoclave
type Parr ou par chauffage micro-ondes. Deux types de composs hybrides sont obtenus : les
composs hybrides type I o les interactions entre les deux sous-rseaux sont faibles (liaisons
hydrogne, liaison de type Van der Waals et les composs hybrides type II ou MOF (Metal
Organic Framework), o des liaisons fortes (covalentes) stablissent entre les sous-rseaux
inorganique organique. Compte tenu de leurs porosit leve, ces composs peuvent avoir des
applications dans plusieurs domaines tel que : chimie du ptrole, catalyse, stockage-sparation
de gaz (H
2
, CO
2
, CH
4
,...).

Dans la littrature peu de travaux concernent les fluorures hybrides. Lquipe
allemande, Kemnitz et al., a tudi jusqu la fin des annes 90, diffrents systmes
chimiques impliquant des cations mtalliques tels que Al
3+
, Mn
2+
ou Fe
3+
. Durant cette mme
priode, Gerasimenko et al., ont synthtis de nombreux fluorures base de zirconium en
particulier un fluorozirconate de guanidinium tridmensionnel [H
3
O][Hgua]
5
.[ZrF
5
]
6
[1]. Ce
dernier prsente des cavits de diamtre proche de 5 . Quelques annes plus tard, Lightfoot
et al. ont labor des fluorures de vanadium [2] ou dyttrium hybrides [3] prsentant des
structures tridimensionnelles.

Cest dans ce contexte que nous nous sommes intresss linvestigation des systmes
FeF
3
amine - HF thanol/H
2
O par synthse hydrothermale classique. Une nouvelle phase a
t mise en vidence de formulation [C
2
H
7
N
4
]
2
FeF
6
(F) H
2
O. Sa structure monoclinique a t
dtermine sur monocristal dans le groupe despace Pc. Elle peut tre dcrite en termes
doctadres FeF
6
isols et de cations organiques [C
3
H
7
N
4
]
2+
. La caractrisation du
fluoroferrate hybride par spectromtrie Mssbauer indique un environnement octadrique et
une valence trois pour les cations Fe
3+
.

Mots cls : hybdride, hydro(solvo)thermale, DRX


[1] A.V. Gerasimenko, B.V. Bukvetskii, V.B. Logvinova, R.L. Davidovich, Koord. Khim., 22
(1996) 584.
[2] D.W. Aldous, N.F. Stephens, P. Lightfoot, Inorg. Chem., 46 (2007) 3996.
[3] N.F. Stephens, Philip Lightfoot, J. Solid State Chem., 180 (2007) 259.
Session Posters 2a Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
- 148 -
P14 - Evidence of the unprecedented conversion of intermolecular
proton- to water-bridging two phosphoryl metal complexes

Rmy Sylvain,
1
Laure Vendier,
1
Christian Bijani,
1
Antonio Santoro,
2
Fausto Puntoriero,
2

Sebastiano Campagna,
2
Pierre Sutra
1
and Alain Igau
,1


1
Laboratoire de Chimie de Coordination, UPR-CNRS 8241, 205 Route de Narbonne, 31077
Toulouse cedex 4, France
,
2
Dipartimento di Scienze Chimishe, University of Messina, Via Sperone 31, I-98166 Vill.
S.Agata, Messina, Italy

We evidenced the conversion of an unprecedented intermolecular bridged-proton
bimetallic P-metallated phosphoryl complex [{[Ru](Ph 2 P=O)} 2 H][PF 6] 3 to its
corresponding H-bonded water complex [{[Ru](Ph 2 P=O)} 2 (H 2 O)][PF 6] 2, a rare motif.
Surprisingly and to the best of our knowledge, hydrogen-bonded dimers of P-metallated
phosphoryl complexes {[L n M](R 2 P=O) 2 }H] have not yet been described in the literature
[1-3]. Moreover, the H-bonded water bridging intermolecularly two P=O unit is a rare motif
[4-6].
Their synthesis, NMR data, X-ray crystal structures, electrochemical and photo physical
properties were performed.
We have demonstrated that the P=O group in the polypyridine ruthenium(II) complex
{[Ru](Ph 2 PO)]} 1 is a good hydrogen-bond acceptor to form quantitatively the
intermolecular proton-bridged [{[Ru](Ph 2 P=O)} 2 H]3+2 and water-bridged [{[Ru](Ph 2
P=O)} 2 -(H 2 O)]2+3 dimer complexes which have been successfully characterized in
solution and their structure determined by X-ray crystallography. We have demonstrated that
the unprecedented intermolecular H-bonded water bimetallic complex 3 is formed through the
formation of the proton-bridged complex 2. Our studies emphasize the ability of P-metallated
P=O unit to act as a proton acceptor. Hydrogen bonding belongs to the panel of the
interactions that hold groups of molecules together. Therefore, the properties of P=O unit to
form hydrogen bonding pave the way for future investigations in many areas. We are
therefore currently exploring the potential of bridged hydrogen-bonded organic entities to P-
metallated phosphoryl complexes in crystal engineering.

[1] Dupont et al., Acta Cryst. D. 2013, 04, 3-6 ; B. Kurscheid, H.-G. 30 Stammler, B.
Neumann and B. Hoge, Z. Anorg. Allg. Chem., 2012, 638, (3-4), 534.
[2] T. Achard, L. Giordano, A. Tenaglia, Y. Gimbert and G. Buono Organometallics, 2010,
29, 3936
[3] A. Christiansen, D. Selent, A. Spannenberg, W. Baumann, R. Franke and A. Brner,
Organometallics, 2010, 29, 3139.
[4] C. Givelet, B. Tinant, L. Van Meervelt, T. Buffeteau, N. Marchand-Geneste and B. Bibal,
J. Org. Chem., 2009, 74, 652
[5] G. Guerrero, P. H. Mutin, F. Dahan, and A. Vioux J. Organomet. 40 Chem., 2002, 649,
113.
[6] P. Calcagno, B. M. Kariuki, S. J. Kitchin, J. M. A. Robinson, D. Philp, and K. D. M.
Harris, Chem. Eur. J., 2000, 6, 2338.
Session Posters 2c Enzymologie et dynamique
- 149 -
P15 - Caractrisations biochimique et structurale des glutathion
transfrases du basidiomycte Phanerochaete chrysosporium

Claude Didierjean
1
, Pascalita Prosper
1
, Thomas Roret
1
, Mlanie Morel
2
, Eric Gelhaye
2
,
Frdrique Favier
1


1
CRM2 UMR UHP-CNRS 7036, facult des sciences et technologies, Universit de Lorraine,
BP 70239 54506 Vandoeuvre-ls-Nancy, France. Claude.Didierjean@univ-lorraine.fr
2
IAM, UMR UHP-INRA 1136, facult des sciences et technologies, Universit de Lorraine,
BP 70239 54506, Vandoeuvre-ls-Nancy, France.


Les interactions entre les champignons et les plantes constituent un des exemples les
plus intressants pour lcologie. Dun ct, les champignons symbiotiques (tels que les
mycorhiziens) ont la capacit damplifier la production des matires premires vgtales et
dun autre ct les pathognes peuvent engendrer des consquences dramatiques sur les
cultures. Les squenages rcents de nombreux gnomes de champignons ont lambition
dapporter de nouvelles informations pour comprendre ces interactions en identifiant de
nouvelles enzymes fongiques impliques, par exemple, dans les processus de dgradation du
bois
1
. Notre analyse sest focalise sur les glutathion transfrases (GST) qui constituent une
vaste superfamille denzymes classes comme des enzymes du mtabolisme secondaire. Dans
ce projet, nous tentons de caractriser toutes les GST prsentes dans le champignon
saprophyte de la pourriture blanche Phanerochaete chrysosporium en tudiant leurs
spcificits de substrat et leurs relations structure-fonction. Notre analyse phylogntique des
GST fongiques a permis de montrer que les champignons saprophytes possdent en gnral
un plus grand nombre de squences codantes pour les GST (>25) que les autres
champignons
2
. Par exemple, la levure Saccharomyces cerevisiae en possde 11 alors que P.
chrysosporium en possde 27. Ainsi, nous avons pu classer les GST fongiques en cinq
classes : Omega, Ure2p, GTT1, GTT2 et GSTFuA dont plusieurs sont spcifiques aux
champignons. Nos tudes biochimiques et structurales rcentes ont mis en vidence de
nouvelles classes structurales de GSTs avec des proprits parfois non catalytiques mais
plutt de transport
3
. Ces proprits seront prsentes et les structures cristallographiques
seront resitues dans la superfamille structurale des GST.









[1] Eastwood et al., Science. 2011, 333, 762-765
[2] M. Morel et al., Cell. Mol. Life Sc. 2009, 66, 3711-3725.
[3] Meux et al., J. Biol. Chem. 2011, 286, 9162-9173 ; Mathieu et al., J. Biol. Chem. 2012,
287, 39001-39011 ; Meux et al., FEBS Letters, 2012, 586, 3944-3950 ; Thuillier et al., 2013,
FEBS Letters, accept.
Session Posters 2c Enzymologie et dynamique
- 150 -
P16 - tude structurale et fonctionnelle de la pseudouridine synthase
PUS1

Tiphaine Huet
1
, Jeffrey Patton
2
et Stphane Thore
1


1
Department of Molecular Biology, University of Geneva, Sciences III, Quai Ernest
Ansermet 30, 1211 Geneva, Switzerland.
2
Department of Pathology, Microbiology, and Immunology, University of South Carolina,
School of Medicine, 6439 Garners Ferry Road, Columbia, SC 29208, United States.

Considr comme le cinquime nuclotide, la pseudouridine est le nuclotide
modifi le plus abondant. Elle rsulte de laction des enzymes pseudouridine synthases. Ces
enzymes sont responsables de la modification des ARNs non-codant, tels que les ARNt,
RNAr [1]. Rcemment, il a t montr que la pseudouridine synthase PUS1 modulait les
rponses des rcepteurs nuclaires de class I et II en impliquant lARN non-codant SRA
(Steroid receptor RNA Activator) [2]. Le SRA intervient dans la signalisation du rcepteur de
lacide rtinoque (RAR) et prsente plusieurs pseudouridines, suggrant une nouvelle classe
de substrats pour lenzyme PUS1 [3]. Ces rsultats indiquent un nouveau niveau de rgulation
de la transcription induite par les rcepteurs nuclaires.
Nous prsentons ici les modles atomiques, obtenus par cristallisation, des enzymes
PUS1 sauvage et de sa forme inactive mute D146A. Les constantes daffinit et les activits
ont t caractrises pour de ces deux formes de PUS1 en complexe avec plusieurs substrats
SRA. Ces rsultats rvlent les bases molculaires de la reconnaissance du SRA par lenzyme
PUS1.


[1] Patton, J.R. Multiple pseudouridine synthase activities for small nuclear RNAs. Biochem J
(1993) 290: 595-600.
[2] Zhao, X., Patton, J.R., Davis, S.L., Florence, B., Ames, S.J. and Spanjaard, R.A.
Regulation of nuclear receptor activity by a pseudouridine synthase through post-
transcriptional modification of steroid receptor RNA activator. Mol Cell (2004) 15: 549-558.
[3] Hao, X., Patton, J.R., Ghosh, S.K., Fischel-Ghodsian, N., Shen, L. and Spanjaard, R.A.
Pus3p- and Pus1p-dependent pseudouridylation of steroid receptor RNA activator controls a
functional switch that regulates nuclear receptor signaling. Mol Endocrinol (2007) 21: 686-
699.
Session Posters 2c Enzymologie et dynamique
- 151 -
P17 - Etudes structurales et fonctionnelles de deux laminarinases de la
bactrie marine Zobellia galactanivorans

Aurore Labourel
1,2
, Murielle Jam
1,2
, Alexandra Jeudy
1,2
, Jan-Hendrik Hehemann
1,2
,
Mirjam Czjzek
1,2
et Gurvan Michel
1,2


1
UPMC Universit Paris 6 et
2
CNRS, UMR 7139 Vgtaux Marins et Biomolcules, Station
Biologique de Roscoff, F-29682 Roscoff, Bretagne, France

Les algues brunes sont des organismes photosynthtiques marins ayant un
mtabolisme du stockage du carbone particulier. Le D-fructose-6-phosphate issue de la
photosynthse nest pas converti en saccharose et en amidon comme chez les plantes
terrestres, mais en D-mannitol et en laminarine, un beta-1,3-glucane vacuolaire portant des
branchements occasionnels en beta-1,6 [1]. La laminarine peut tre utilise comme source de
carbone par des bactries marines htrotrophes. Tel est le cas de la flavobactrie Zobellia
galactanivorans isole de lalgue rouge Delesseria sanguinea [2] et vritable modle
mergent pour la bioconversion des polysaccharides dalgues [3-6]. Lanalyse de son gnome
squenc rvle la prsence de 5 laminarinases putatives (4 GH16 et 1 GH64) prsentant des
architectures modulaires varies. Afin de confirmer les prdictions, les modules catalytiques
des laminarinases A et C (LamA_GH16 et LamC_GH16, 38% didentit de squence), ainsi
que le CBM6 de LamC (LamC_CBM6) ont t clons et surexprims dans E. coli.
LamA_GH16 et LamC_GH16 sont toutes les deux actives sur la laminarine extraite de lalgue
brune Laminaria digitata et sur le (1,3:1,4)--D-glucane de lorge. Leurs paramtres
cintiques ont ainsi t dtermins sur chacun des substrats. Nous avons galement pu
montrer par gel retard que LamC_CBM6

tait capable de lier la laminarine. Les structures
cristallographiques de LamA_GH16, LamC_GH16 et LamC_CBM6 ont t rsolues par
remplacement molculaire 1.5 , 1.6 et 1.4 de rsolution respectivement, et expliquent
la spcificit de LamA_GH16 pour la laminarine. Finalement des mutants inactifs de
LamA_GH16 et de LamC_GH16 ont t obtenus par mutagnse dirige afin dobtenir la
structure des complexes enzyme-substrat. LamA_GH16 a t cristallise avec des
ttrasaccharides purifis de laminarine et un trisaccharide de (1,3:1,4)--D-glucane dans la
gorge catalytique. LamC_GH16 a pu tre cristallise avec un hexasaccharide de synthse
contenant deux liaisons thiols. Les mcanismes molculaires de reconnaissance de la
laminarine par ces GHs et CBM marins seront finalement discuts.




[1] Michel et al., New Phytologist.2010, 188, 67-81.
[2] Barbeyron et al., Int J Syst Evol Microbiol, 2001, 51: 985-997.
[3] Michel et al., Applied Microbiology and Biotechnology, 2006, 71, 23-33.
[4] Hehemann et al., Nature, 2010, 464, 908-912.
[5] Rebuffet et al., Environmental microbiology, 2011, 13,1253-1270.
[6] Thomas et al., Journal of Microbiological Methods, 2011, 84, 61-66.
Session Posters 2c Enzymologie et dynamique
- 152 -
P18 - A quoi sert une chlorophylle qui ne capte pas la lumire ?

Audrey Le Bas
1
, Silvia Zambolin
1
, Fabrice Rappaport
2
, Daniel Picot
1
, Francesca Zito
1


1
Laboratoire de Biologie Physico-Chimique des Protines Membranaires, UMR 7099,
2
Laboratoire de Physiologie Membranaire et Molculaire du Chloroplaste, UMR 7141,
Institut de Biologie Physico-Chimique IBPC, 13 rue Pierre et Marie Curie, 75005 Paris


La structure cristallographique du complexe membranaire cytochrome b
6
f de la
photosynthse oxygnique a t rsolue en prsence [1] et en absence d'un inhibiteur (TDS).
Des changements structuraux de faible amplitude, l'exception de la rorganisation d'un
domaine, et lis au turn-over de la protine sont mis en vidence dans le b
6
f, principalement
autour de la molcule de chlorophylle. De tels mouvements sont aussi retrouvs dans
l'homologue mitochrondrial, le cytochrome bc
1
.

Le b
6
f, bien que trs similaire au bc
1
, possde des caractristiques propres comme une
molcule de chlorophylle a de fonction inconnue, tudie par une approche de mutagnse
dirige chez l'algue verte unicellulaire Chlamydomonas reinhardtii. L'alanine 140 de la sous-
unit IV, situe dans le site natif de la chlorophylle, a t mute en phnylalanine dans le but
de modifier la fixation et/ou la stabilit de ce pigment. La structure cristallographique du
mutant A140F a montr, pour la premire fois, un complexe b
6
f sans molcule de
chlorophylle. Cette perte est accompagne d'une diminution du turn-over de la protine,
suggrant un rle fonctionnel pour ce pigment.

En effet, les mmes changements structuraux observs dans la souche de rfrence sont
retrouvs dans ce mutant avec une plus forte amplitude. Le mutant A140F peut ainsi apporter
une meilleure comprhension des mcanismes de transfert d'lectrons et de leur contrle,
domaine trs controvers dans l'tude des cytochromes de type bc
1
et b
6
f.














[1] Stroebel et al., Nature. 2003, 426(6965), 413-418.
Session Posters 2c Enzymologie et dynamique
- 153 -
P19 - Etudes structurales de la Quinone Envelope Oxidoreductase
homolog d'Arabidopsis thaliana.

Sarah Mas-y-mas
1
, Ccile Giustini
2
, Lucas Moyet
2
, Daniel Salvi
2
, Jean-Luc Ferrer
2
, Norbert
Rolland
2
, Gilles Curien
2
et David Cobessi
1


1
Institut de Biologie Structurale
2
Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Vgtale, CEA, CNRS, Universit Joseph Fourier,
Grenoble

La ceQORH (Chloroplast envelope Quinone Oxidoreductase homolog) est une
enzyme chloroplastique qui participe la dtoxification des plantes en agissant sur des
longues chanes carbones toxiques issues du stress oxydatif. Cette protine est code par un
gne nuclaire et est importe dans le chloroplaste par une voie alternative au systme
d'import principal TOC et TIC [1], voie dimport qui est encore inconnue. De manire
gnrale, les protines chloroplastiques possdent un peptide signal situ l'extrmit N-
terminale qui empche leur repliement jusqu ce que ce peptide signal soit cliv au cours du
transport au travers des membranes. Cependant, pour la ceQORH, cette squence est interne
(rsidu 60 100), et n'est pas clive [2].

Nous avons clon et purifi la ceQORH d'Arabidopsis thaliana. Seuls les complexes
de la ceQORH avec le NADP et le 13-Oxo-9,11,15-octadecatrienoic (13-KOT), ou de la
ceQORH avec le NADPH cristallisent. La structure de la ceQORH en complexe avec le
NADP et le 13-KOT a t dtermine 2,8 de rsolution en utilisant le remplacement
molculaire. Lunit asymtrique est compose de deux ttramres. la diffrence des
quinones oxydo-rductases de structure connue, les monomres de la ceQORH ne s'associent
pas sous forme d'un dimre fonctionnel d l'orientation d'une hlice empchant la
dimrisation de l'enzyme. La surface enfouie de chaque monomre dans le ttramre est trs
faible. Le 13-KOT est stabilis par trois molcules de ceQORH. Le nicotinamide du NADP
est situ une distance du 13-KOT qui est compatible pour la rduction d'une de ses doubles
liaisons C-C. Le peptide signal est partiellement enfoui dans la structure. Afin de dterminer
l'tat d'oligomrisation des diffrents complexes de la ceQORH avec ses cofacteurs et ligands
en solution, des tudes d'ultracentrifugation analytique seront entreprises.








[1] Miras et al., J. Biol. Chem., 2007, 282, 29482-29492.
[2] Miras et al., J. Biol. Chem., 2002, 227, 47770-47778.
Session Posters 2c Enzymologie et dynamique
- 154 -
P20 - Bases structurales de l'activit oxydase de la flavoprotine AnaB
implique dans la biosynthse de la cyanotoxine anatoxine-a.

Karine Moncoq
1
, Leslie Regad
2
, Stphane Mann
3
, Annick Mjean
3
, Olivier Ploux
3


1
CNRS/Universit Paris-Diderot 7, UMR7099, IBPC, Paris,
2
INSERM, UMR-S973, MTi, Paris,
3
CNRS, UMR7223, Chimie ParisTech, ENSCP, Paris.

Les cyanobactries sont des procaryotes photosynthtiques qui colonisent la plus part
des environnements aquatiques ou terrestres. Ces micro-organismes produisent de nombreux
mtabolites secondaires dont des toxines pour les animaux et l'homme. Parmi ces toxines,
l'anatoxine-a est une neurotoxine extrmement puissante, agoniste du rcepteur nicotinique de
l'actylcholine. La voie de biosynthse de cette toxine a t rcemment identifie et une des
enzymes cl de cette biosynthse, AnaB, a t caractrise [1].
Cette flavoprotine catalyse l'oxydation du substrat prolyl-AnaD (proline charge sur
AnaD, protine de transport d'acyles (ACP)) en dhydroprolyl-AnaD (1-pyrroline-5-carboxyl-
AnaD, P5C) en utilisant l'oxygne comme deuxime substrat.


Voie de biosynthse de l'anatoxine-a

AnaB prsente donc une activit oxydase bien qu'elle appartienne la famille des acyl-
CoA dshydrognases (ACADs) qui, la place de l'oxygne, utilise des protines de transport
d'lectrons comme accepteur d'lectrons. Afin de comprendre la ractivit l'oxygne de cette
enzyme peu commune, sa structure cristallographique a t rsolue 2.8 . AnaB est un
homottramre qui prsente un repliement trs proche des ACADs avec une poche de fixation
au FAD similaire et la base du site actif conserve. Si la similarit d'AnaB avec les ACADs
est frappante, la structure rvle plusieurs diffrences importantes : i) une plus grande
accessibilit du FAD au solvant, ii) la prsence d'un canal d'eau proche du FAD pouvant
constituer un chemin d'entre potentiel de l'oxygne, et iii) la prsence d'une charge positive
dans l'environnement du site actif. L'ensemble de ces donnes fournissent un aperu structural
et molculaire sur le mcanisme d'action d'AnaB et en particulier sa ractivit l'oxygne.

[1] Mann et al., Biochemistry 2011, 50, 7184-7197.
Session Posters 2c Enzymologie et dynamique
- 155 -
P21 - Caractrisation structurale et fonctionnelle damylosaccharases

Frdric Gurin
1,2
, Sophie Barbe
2
, Sandra Pizzut-Serrin
2
, Gabrielle Vronse
2
, David
Guieysse
2
, Valrie Guillet
1
, Pierre Monsan
2
, Lionel Mourey
1
, Magali Remaud-Simon
2
,
Isabelle Andr
2
et Samuel Tranier
1

1
Institut de

Pharmacologie et de Biologie Structurale, CNRS-Universit de Toulouse, F-
31077 Toulouse, France,
2
Universit de Toulouse ; INSA, UPS, INP, LISBP, F-31077 Toulouse, France ; CNRS, UMR
5504, F-31400 Toulouse, France ;

INRA, UMR 792, F-31400 Toulouse, France

Les amylosaccharases sont des -transglucosidases de la famille GH13 [1] utilisant le
saccharose comme donneur dunit glucosyle pour synthtiser des produits tels que lamylose
ou des isomres du saccharose (turanose, trhalulose). Ces enzymes prsentent galement un
grand intrt pour la synthse de glucoconjugus en mettant profit leur promiscuit vis--vis
daccepteurs exognes [2]. La seule structure damylosaccharase disponible tait celle de
l'amylosaccharase de Neisseria polysaccharea (ASNp) [3]. Par comparaison avec lASNp,
lASDg, une amylosaccharase homologue de Deinococcus geothermalis, prsente des
diffrences de profil de produits et de caractristiques biochimiques [4].

Les structures de lASDg, ainsi que celles de lASDg et de lASNp en complexe avec le
turanose ont t dtermines [5]. LASDg rvle une organisation homodimrique indite
pour les amylosaccharases pouvant expliquer sa thermostabilit accrue. Les interactions
observes au sein du complexe ASNp-turanose contraignent la sous-unit fructosyle adopter
une conformation exclusivement ouverte, suggrant une orientation slective du fructose
accepteur dans le site actif et expliquant ainsi la formation prfrentielle de turanose par cette
enzyme. LASDg lie majoritairement le tautomre -furanoyl du fructose au travers dun
rseau moins dense dinteractions. Cette topologie du sous-site +1, moins contrainte que dans
lASNp, peut autoriser dautres modes de liaison du fructose conduisant la formation de
trhalulose en quantit plus importante.

Paralllement, nous avons dtermin la structure cristallographique de trois doubles
mutants prsentant une amlioration spectaculaire de spcificit la fois vis--vis du
saccharose et de laccepteur -allyl-N-acetyl-2-dsoxy--D-glucopyranoside par rapport au
type sauvage. Lanalyse des structures et des simulations de dynamique molculaire montrent
une rigidit locale du sous-site -1 couple une flexibilit des boucles impliques dans la
topologie du site actif [6].

Tout ceci montre l'importance de la conformation locale des rsidus catalytiques mais
aussi de la dynamique de ces protines au cours de la catalyse.


[1] Henrissat et al, Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 637-44.
[2] Andr et al, Top. Curr. Chem. 2010, 294, 25-48.
[3] Skov et al, J. Biol. Chem. 2001, 276, 25273-78.
[4] Emond et al, FEMS Microbiol. Lett. 2008, 285, 25-32.
[5] Gurin et al, J. Biol. Chem. 2012, 287, 6642-54.
[6] Champion et al, J Am Chem Soc. 2012, 134, 18677-88.

Session Posters 3a Croissance cristalline (GFCC)
- 156 -
P22 - PCC-oMaltoside : un nouveau tensio-actif pour la
cristallisation des protines membranaires

Laurie-Anne Barret
1,2
, Barrot-Ivolot Cherone
1
, Raynal Simon
1
, Colette Jungas
2
, Ange
Polidori
1
, Franoise Bonnet
1


1
Equipe Chimie Bioorganique et des Systmes Amphiphiles, IBMM UMR 5247, 33 rue L.
Pasteur, Universit dAvignon et des Pays de Vaucluse, 84000 Avignon, France
2
Laboratoire de Bionergtique Cellulaire, Institut de Biologie Environnementale et de
Biotechnologie, CEA Cadarache, 13108 Saint-Paul-lez-Durance, France

La cristallisation des protines membranaires (PMs) reprsente un dfi de la biologie
structurale. En effet, la rsolution structurale de ces protines l'chelle atomique se heurte
une cristallisation plus complique que celle des protines solubles du fait du caractre
amphiphile des PMs, qui ncessitent l'emploi de dtergents (molcules amphiphiles,
lipophiles) pour leur solubilisation, leur purification et leur manipulation. Nanmoins
lutilisation de ces tensio-actifs dtergents (DDM, OG) peut parfois dstabiliser la protine
membranaire et amener lobtention de cristaux de faible pouvoir diffractant.
Lutilisation de tensio-actifs chaine hydrophobe plus rigide [1] ou hmifluore
lipophobe, moins dstabilisante pour les PMs, peut tre une alternative intressante par
rapport aux dtergents classiques hydrocarbons.

PCC-o-malt FH-|-malt

Dans ce projet, nous avons tudi le rle de la nature de la chane hydrophobe (rigide
cyclique ou fluore) sur la stabilit et la cristallisation du complexe photosynthtique RC-
LH1-pufX de Rhodobacter blasticus. Nous avons abord la cristallisation par ltude des
forces d'interaction (via la mesure du second coefficient du viriel) entre micelles de tensio-
actifs en utilisant des techniques de diffusion des rayonnements. Cette approche dj utilise
avec succs [2-4], nous a permis de corrler diagrammes de phases des tensio-actifs et
diagrammes de phases des complexes membranaires [5], ncessaire au contrle de la
croissance cristalline et lamlioration des cristaux de protines.







[1] Hovers et al. Molecular Membrane Biology (2011) 28(3): 171-81
[2] Bonnet et al, J. Cryst Growth (1999) 196: 403-414.
[3] Loll et al, J. Cryst. Growth (2001) 232: 432-438
[4] Loll et al, Cryst Growth Des. (2002) 2: 533-539
[5] Barret et al, J Phys Chem B (2013) accepted
Session Posters 3a Croissance cristalline (GFCC)
- 157 -
P23 - Rseau National des Technologies et Procds de la Croissance
Cristalline

Franoise Bonnet
1
, Pascal Lejay
2,*


1
Equipe Chimie Bioorganique et des Systmes Amphiphiles, IBMM UMR 5247, 33 rue L.
Pasteur, Universit dAvignon et des Pays de Vaucluse, 84000 Avignon, France
2

Institut NEEL, 25 avenue des Martyrs, BP 166, 38042 Grenoble cedex 9

CNRS - Mission Ressources et Comptences Technologiques
http://cristech.cnrs.fr

* Responsable du Rseau Cristech

Le rseau CRISTECH, cr en 2005, est un rseau technologique issu de la Mission
Ressources et Comptences Technologiques (MRCT) du CNRS. A travers diffrents
organismes de recherche (CNRS, INSERM, Universits, Ecoles et CEA) et des Industriels, le
rseau Cristech est ouvert aux chercheurs, ingnieurs et techniciens impliqus dans
llaboration, la mise en forme et ltude de matriaux monocristallins.
Les technologies couvertes par le rseau sont varies, car elles dpendent fortement
des composs/matriaux considrs et de la thmatique scientifique : cristaux pour la biologie,
nouveaux matriaux, cristaux pour loptique, mtallurgie semi-conducteurs, etc. Les mthodes
de prparation vont de conditions douces (pression ambiante, basse temprature) des
conditions extrmes (haute temprature, haute pression). De la mme faon, les technologies
dpendent fortement de la taille recherche pour les monocristaux : dune centaine de microns
pour les nouveaux matriaux ou les cristaux de protines, plusieurs kilogrammes pour des
applications telles que le silicium photovoltaque et le saphir.

Les objectifs du Rseau Cristech pour la communaut sont multiples :
Etablir un tat des lieux et crer un rfrentiel complet et actualisable de la croissance
cristalline en France,
Reprsenter lensemble des thmes et des technologies de cristallogense,
Sauvegarder un savoir faire et le faire voluer,
Fdrer des comptences et aider aux collaborations entre les quipes et les laboratoires,
Former une entit connue et visible des autres communauts scientifiques susceptibles
dinteragir,
Mener des actions nationales de formation.

Session Posters 3a Croissance cristalline (GFCC)
- 158 -
P24 - Crystal structures of E. coli outer-membrane porin OmpF in two
different C2 space-groups, with and without tNCS.

Vincent Chaptal
1
, Arnaud Kilburg
1
, Ben Wiseman
2
, Jonathan Sarwan
2
, Gina Catalina Reyes-
Mejia
2
, Jean-Michel Jault
2
and Pierre Falson
1


1
Drug Resistance Mechanism and Modulation, CNRS UMR5086 BMSSI, Univ. Lyon-1,
IBCP, 7 passage du vercors, Lyon, 69007, France,
2
Institut de Biologie Structurale, UMR 5075, Universit Joseph Fourier/CEA/CNRS, 41 rue
jules Horowitz, Grenoble, F-38027 cedex-1, France


OmpF est la protine la plus abondante de la membrane externe de E. coli. OmpF
appartient la famille des porines gnrales qui nont pas de spcificit particulire pour leurs
substrats, mais permet la diffusion de molcules travers son pore ayant une limite de taille
de 600 Da [1]. Nous avons cristallis OmpF comme contaminant dune purification dun
transporteur ABC de B. subtilis, BmrA, exprim dans E. coli C41(DE3) [2]. OmpF a t co-
purifie sur chromatographie dchange dions, colonne daffinit au Nickel et une
chromatographie dexclusion de taille. Lidentification de OmpF dans les cristaux na t
possible quaprs une optimisation extensive de ces derniers, permettant la sparation de
plusieurs gros cristaux, leurs dpts sur gel dacrylamide en conditions dnaturantes, et
identification par spectromtrie de masse. Cette optimisation de la taille des cristaux nous a
permis de collecter de faon concomitante des donnes de diffraction jusqu 3.5 et 3.8 de
rsolution pour deux formes cristallines distinctes. Ces deux formes appartiennent au groupe
despace C2, qui na jamais t observe auparavant dans les structures de OmpF dj
dposes dans la PDB. Malgr des paramtres de maille trs similaires pour ces deux formes
cristallines, lempilement est diffrent et se traduit par une symtrie non-cristallographique
translationnelle (tNCS) pour la forme diffractant 3.8.

Cette cristallisation dun contaminant dune purification de protine membranaire nous
a amen revoir notre stratgie de purification et identifier plusieurs autres contaminants,
spcifiques de certains dtergents. Les enseignements tirs de ces expriences apportent de
nouveaux lments pour la purification des protines membranaires.





[1] Koebnik, R., K.P. Locher, and P. Van Gelder, Structure and function of bacterial outer
membrane proteins: barrels in a nutshell. Mol Microbiol, 2000. 37(2): p. 239-53.
[2] Steinfels, E., et al., Characterization of YvcC (BmrA), a multidrug ABC transporter
constitutively expressed in Bacillus subtilis. Biochemistry, 2004. 43(23): p. 7491-502.
Session Posters 3a Croissance cristalline (GFCC)
- 159 -
P25 - Des contaminants cachs dans la purification du transporteur
ABC BmrA de Bacillus subtilis

Arnaud Kilburg
1
, Vincent Chaptal
1
, Benjamin Wiseman
2
, Jonathan Sarwan
2
, Gina Catalina
Reyes-Mejia
2
, Jean-Michel Jault
2
and Pierre Falson
1
.

1
Drug Resistance Mechanism and Modulation, CNRS UMR5086 BMSSI, Univ. Lyon-1, IBCP,
7 passage du vercors, Lyon, 69007, France,
2
Institut de Biologie Structurale, UMR 5075, Universit Joseph Fourier/CEA/CNRS, 41 rue
jules Horowitz, Grenoble, F-38027 cedex-1, France

BmrA ( Bacillus Multidrug Resistance ATP ) est une pompe defflux membranaire
transporteur ABC qui utilise lnergie issue de lhydrolyse de lATP pour transporter une
grande diversit de molcules vers lextrieur des cellules. Les recherches actuelles se
concentrent sur lobtention de donnes structurales en complexe avec des substrats transports
afin de comprendre leur fonction defflux. A ce jour, la structure de trois exportateurs ABC
bactriens et celle de la P-gp de souris ont t publis [1]. Aucune na t rsolue en prsence
de substrats transports. Notre objectif est de rsoudre la structure 3D de BmrA en complexe
avec des nuclotides, des substrats et/ou des modulateurs.
BmrA a t purifie avec six dtergents diffrents sur chromatographie changeuse dions,
colonne daffinit au nickel et chromatographie dexclusion de taille. Avec 75% dextraction,
la foscholine 12 (FC12) est le dtergent le plus efficace pour solubiliser BmrA. Sa purification
a conduit la cristallisation dun contaminant, OmpF, une porine de la membrane externe
dE.coli. Nous avons rsolu sa structure 3.5 de rsolution. Cette protine possde un profil
de migration sur gel dacrylamide en conditions dnaturantes identique celui de BmrA
rendant son identification difficile. Lanalyse par spectromtrie de masse a rvl la prsence
dOmpF uniquement dans les chantillons purifis en FC12. Une autre protine, AcrB
(acriflavine resistance protein B) a t dtecte dans les chantillons purifis avec des
dtergents maltosides mais tait absente des purifications en FC12 et LDAO. OmpF et AcrB
sont deux contaminants frquemment rencontrs dans la purification des protines
membranaires et ont dj t cristalliss plusieurs reprises [2], [3]. Nous sommes parvenus
liminer OmpF en optimisant les conditions dextractions en FC12 et AcrB en centrifugeant la
fraction membranaire avant solubilisation.
Nos rsultats apportent de nouveaux lments dans la stratgie dlimination dOmpF et AcrB
pour la purification des protines membranaires.




[1] Aller SG, Yu J, Ward A, et al. Structure of P-glycoprotein reveals a molecular basis for
poly-specific drug binding. Science (2009) 323:1718-1722.
[2] Kefala G, Chihoon A, Krupa M, et al. Structures of the OmpF porin crystallized in the
presence of foscholine 12. Protein science (2010) 19 :1117-1125.
[3] Psakis G, Polaczek J et Essen L. Obstinate contaminants in a picogram scale. One more
bottleneck in the membrane protein structure pipeline. Journal of structural biology (2009)
166 :107-111.
Session Posters 3a Croissance cristalline (GFCC)
- 160 -
P26 - tude de la croissance cristalline de laragonite (CaCO
3
) en
prsence dions phosphates

S. Tadier
1
, P.G. Koutsoukos
2
, C. Rey
1
, C. Combes
1


1
Universit de Toulouse, CIRIMAT, UPS-INPT-CNRS, ENSIACET, 4, alle Emile Monso, BP
44362, 31030 Toulouse Cedex 4, France
2
Department of Chemical Engineering and FORTH-ICEHT, University of Patras, GR 26 500,
Patras, Greece

Le carbonate de calcium (CaCO
3
) est un compos abondant, notamment dans les
calcifications dorigine biologique. Ltude de sa germination et de sa croissance cristalline,
en prsence ou non dions phosphates (PO
4
3-
) qui pourraient les contrler, est donc
particulirement intressante. A notre connaissance, aucune tude na t ralise sur
laragonite, lun des quatre polymorphes non hydrats du CaCO
3
, et constituant final dun
ciment pour comblement osseux mis au point au CIRIMAT. Afin de mieux apprhender la
prise de ce ciment in-vivo (donc en prsence de PO
4
3-
), nous avons tudi leur influence sur la
cristallisation de laragonite.

La croissance cristalline daragonite partir dune solution sursature en CaCO
3
a t
mise au point par la mthode de croissance cristalline composition constante : les
mcanismes de cristallisation de laragonite partir de germes daragonite (synthtiss par
prcipitation 100C) ont t tudis en conditions contrles (pH= 7,8, T = 37C, force
ionique et sursaturation constantes), en prsence ou non dions PO
4
3-
(0,25 mol.L
-1
- 1
mmol.L
-1
).

Nous montrons quen labsence de phosphates, la croissance des germes daragonite
est contrle soit par le transport de masse au sein de la solution vers la surface du cristal, soit
par la diffusion de surface. En prsence dions PO
4
3-
, trois zones de comportements ont t
mises en vidence : partir de 0,5 mol.L
-1
, les ions PO
4
3-
diminuent la vitesse de
cristallisation de laragonite et inhibent mme toute croissance pour une concentration de 7,5
mol.L
-1
. A partir de 8 mol.L
-1
, il semblerait que les germes introduits se dissolvent en dbut
dexprience. Au-del de 1 mmole.L
-1
, le prcipit est compos de phosphate de calcium mal
cristallis et non plus de CaCO
3
. Cette tude fondamentale mene in-vitro contribue une
meilleure connaissance de la raction de prise in-vivo du ciment biomdical base de CaCO
3
.
Session Posters 3a Croissance cristalline (GFCC)
- 161 -
P27 - Croissance hydrothermale de monocristaux isotypes du quartz,
relations structure- proprits

Vincent Ranieri, Manhal Souleiman, Gopal Bhalerao, Julien Haines et Olivier Cambon

Institut Charles Gerhardt Montpellier, UMR-CNRS-UM2-ENSCM-UM1 5253, Universit
Montpellier 2, Equipe C2M, Place E. Bataillon, 34095 Montpellier, Cedex 5, France

Parmi les matriaux pizolectriques, le quartz- est encore le plus utilis. Cependant
ses proprits physiques atteignent leurs limites (transition 846 K, coefficient de
couplage lectromcanique k =8,5%) pour les applications mergentes. Des relations
structure-proprits liant la fois les proprits physiques et la stabilit thermique la
distorsion structurale ont t tablies pour les matriaux isotypes du quartz [1]. GeO
2
et
GaAsO
4
sont les matriaux les plus prometteurs de cette famille.
Nous prsenterons les travaux effectus sur la phase pure GaAsO
4
et sur une solution
solide Si
1-x
Ge
x
O
2
.
Les monocristaux de GaAsO
4
ont t obtenus par pitaxie sur des germes X (1-20) de
GaPO
4
et de GaAsO
4
en conditions hydrothermales (P2MPa). Les mesures confirment ses
remarquables performances avec une stabilit thermique atteignant 1273 K et un coefficient
de couplage le plus important des isotypes du quartz (k = 21%) [2,3]. De plus, sa structure non
centro-symtrique et sa composition chimique lui confre des proprits optiques non
linaires. Les premires mesures donnent d
11
=3.03 pm/V (
(2)
=6.06 pm/V).
Des solutions solides Si
1-x
Ge
x
O
2
(0<x<0,24) ont t obtenues par pitaxie sur germe Z
(001) de quartz par voie hydrothermale (100 MPa P 200MPa) [4]. Les mesures par DRX
et par spectroscopie Raman montrent que la distorsion structurale et la temprature de
transition augmentent avec x. De plus, ltude des modes de vibration Raman
impliqus dans la transition montre que le dsordre dynamique est rduit avec la
substitution de germanium [5]. Ce rsultat est important pour les applications car le dsordre
dynamique est responsable des pertes des proprits pizolectriques du quartz et limite son
utilisation 200C [6].



[1] Haines J., Cambon, O., Keen D. A. Physica B., 2004, 350, 1-3, E979-E981.
[2] Cambon, O., Haines, J., Fraysse, G., Dtaint, J., Capelle, B., Van der Lee, A. J. Appl.
Phys., 2005, 97, 074110.
[3] Cambon, O., Bhalerao, G. M., Bourgogne, D., Haines, J., Hermet, P., Keen, D. A., Tucker,
M. G. J. Am. Chem. Soc, 2011, 20, 133, pp 80488056.
[4] Ranieri, V., Darracq, S., Cambon, M., Haines, J., Cambon, O., Largeteau, A., Demazeau,
G. Inorganic chemistry, 2011, 50 (10), pp 46324639.
[5] Ranieri, V., Bourgogne, D., Darracq, S., Cambon, M., Haines, J., Cambon, O., Le Parc,
R., Levelut, C., Largeteau, A., Demazeau, G. Phys. Rev. B, 2009, 79, 224304.
[6] Haines J., Cambon, O., Keen D. A., Tucker M. G., and Dove M. T. Appl. Phys. Lett.,
2002, 81, 2968.
Session Posters 3a La cristallographie sous conditions extrmes (GFCC)
- 162 -
P28 - Premires expriences Hautes Pressions en presses Gros
Volumes (Paris-Edimbourg et multi-enclumes) de diffraction X en
dispersion dnergie sur la ligne PSICH de SOLEIL

Nicolas Guignot
1
, Jean-Paul Iti
1
, Pierrick Zerbino
1
, Kirill Chernidchenko
1,2
, Yann Le
Godec
2
, Alain Prat
3
, Geeth Manthilake
4
, Julien Chantel
4
, Franck Pointud
4
et Denis Andrault
4


1
Synchrotron SOLEIL,
2
IMPMC, Universit Pierre et Marie Curie,
3
Institut Nel,
4
LMV, Universit Blaise Pascal

Deux types de presses "gros volume" ont t installs et tests sur la ligne PSICH de
SOLEIL. La diffraction X in situ a permis de suivre la densit et les transformations de phases
grce la dtection combine en dispersion dnergie et dispersion angulaire (CAESAR [1])
Dans cette prsentation nous montrerons lintrt de ces systmes pour ltude des matriaux
en conditions extrmes de pression et de temprature. Dans une premire exprience ralise
en cellule Paris-Edimbourg, nous avons pu observer la croissance de nanoparticules de MoB
4

haute pression et haute temprature. Dans une seconde exprience nous avons align une
nouvelle presse quipe d'un module original de type DIA-100, et pouvant dlivrer 1200
tonnes de pousse. Nous avons mesur la compression d'un mlange de MgO et de KBr
jusqu 21.5 GPa. Quelques amliorations restent apporter ces dispositifs avant de les
mettre la disposition des utilisateurs. A terme, leur complmentarit permettra de raliser
une grande diversit d'expriences jusqu' plus de 25 GPa et 2000C.


















[1] Wang et al. (2004) Journal of Applied Crystallography, 37, 947-956.
Session Posters 4b Apriodicit, structure module
- 163 -
P29 - Structural and thermal investigations of a Tunisian natural
phosphate rock

Bchir Badraoui
1
, Hassen Bachou
1
, Masseoud Othmani
1
, Yannick Coppel
2
, Nabil Fatteh
3
,
Mongi Debbabi
1


1
Laboratoire de Physico-Chimie des Matriaux, Universit de Monastir, Facult des
Sciences, 5019 Monastir, Tunisia
2
CNRS, LCC (Laboratoire de Chimie de Coordination), 205 route de Narbonne, BP 44099,
F-31077 Toulouse Cedex 4, France
3
Centre de recherches CPG Mtlaoui 2134 Gafsa, Tunisia
E-mail : badraoui_b@yahoo.fr



Tunisian natural phosphate rock from Mdhilla deposits are characterized by different
methods. The principal constituent of the phosphate rock sample is the fluoroapatitic phase to
which other clay and siliceous mineral; sulfates, carbonates and organic matter are associated.
The crystallographic structure of natural phosphate was examined by powder X-Ray
diffraction (XRD) at different temperatures of calcinations. The XRD diagrams show a
significant structure change with increasing of the temperature to 1100C. The MAS-NMR
technique was used to study the carbon, phosphorus, silicon and fluoride environment.
The result confirms the single phosphate apatitic phase; the NMR study also indicates
the presence of a small amount of organic compounds which was detected by chemical
analysis (only 0.6%), IR spectroscopy and thermogravimetric analysis.

Session Posters 4b Apriodicit, structure module
- 164 -
P30 - Structure cristalline de composs approximants dans les
systmes (Ce, Nd, Sm, Gd)-Au-Sn

Pascal Boulet, Marie-Ccile De Weerd, Jean-Marie Dubois

Institut Jean Lamour, UMR CNRS 7198, Universit de Lorraine, Parc de Saurupt, 54011
Nancy Cedex


Depuis la dcouverte de composs quasicristallins stables dans les systmes binaires
Cd
5.7
Yb [1] et Cd
5.7
Ca [2], un intrt croissant sest port sur ces structures quasicristallines et
leurs structures approximantes. Ces diffrentes phases de type Tsai sont formes de plusieurs
enveloppes concentriques : un ttradre partiellement occup, suivi dun dodcadre, puis un
icosadre, un icosidodcadre, et enfin un triacontadre plus ou moins dficitaire. En fait,
toutes ces phases coexistent dans un domaine de composition trs restreint et valu par
exemple moins de 2% atomique dans les systmes binaires comme Cd-Yb.

Par ailleurs, des structures similaires ont t obtenues dans des systmes ternaires de
type TR-Au-Sn [5,6], avec TR = Ce, Pr, Eu, Gd, Dy et Tb. Les dterminations exprimentales
de des diagrammes ternaires base de Crium [7] ou de Prasodyme[8] ont rvl des
domaines de compositions lgrement plus levs concernant ce type de phases, d un
change sur certains sites cristallographiques dor et dtain. En fait, une tude prcise du
diagramme ternaire Ce-Au-Sn[7] a montr un domaine dhomognit donnant une formule
type Ce
3
Au
15x
Sn
3y
, avec 0<x<2 and 0<y<1.

Dans ce papier, nous dcrirons les structures obtenues partir de donnes
monocristallines de 4 structures isostructurales adoptant la structure approximante 1/1 de type
Tsai dans les systmes ternaires TR-Au-Sn avec TR= crium, nodyme, samarium et
gadolinium.






[1] A.P. Tsai, J. Q. Guo, E. Abe, H. Takakura and T.J. Sato, Nature 408 (2000) 537.
[2] J. Q. Guo, E. Abe and A.P. Tsai, Phys. Rev. B 62 (2000) R14605.
[3] A. Palenzona, J. Less Common Met. 25 (1971) 367.
[4] C.P. Gomez and S. Lidin, Angew. Chem., Int. Ed. 40 (2001) 4037.
[5] S. Kenzari, V. Demange, P. Boulet, M.C. de Weerd, J. Ledieu, J.M. Dubois and V.
Fourne, J. Phys. Condens Matter 20 (2008) 095218.
[6] Y. Morita and A.P. Tsai, Jap. J. App. Phys. 47 (2008) 7975
[7] P. Boulet, D. Mazzone, H. Noel, P. Rogl and R. Ferro, J. Alloys and Compd. 317/318
(2001) 350.
[8] D. Mazzone, R. Marazza, P. Riani, G. Zanicchi, G. Cacciamani, M.L. Fornasini and P.
Manfrinetti, Calphad 33 (2009) 31.
Session Posters 4b Apriodicit, structure module
- 165 -
P31 - Zn(O
3
P-C
3
H
5
) : O la nature est plus propre induire lordre
que le chimiste !

Marion Galmiche
1,2
, Olivier Perez
1
, Jean-Michel Rueff
1
, Bernard Nysten
2
, Paul-Alain
Jaffrs
3


1
CRISMAT, CNRS UMR 6508, ENSICAEN-Caen,
2
Universit Catholique de Louvain IMCN/BSMA - Belgique,
3
Universit de Brest, CNRS, UMR 6521, CEMCA

Dans loptique dobtenir des matriaux hybrides prsentant des proprits de
conduction lectronique, des synthses par voie hydrothermale ont t ralises partir de
lacide de 2-thiophen-2-ylphosphonic et dactate de zinc. Des mono cristaux ont t obtenus
et tudis par diffraction des rayons X sur un diffractomtre 4-cercles (Nonius) quip dune
camra CCD (APEX2) et dune source micro foyer Mo (INCOATEC). Le rseau rciproque
associ ce matriau est caractris par la prsence de rflexions intenses, sindexant dans la
maille a=4.8110(4), b=27.193(3), c=5.6571(4) et o=|==90, et de rflexions de faibles
intensit en position irrationnelle avec le rseau prcdemment dfini. Lindexation de ces
dernires ncessite lintroduction du vecteur de modulation q= -0.034 a* + 0.216 b*,
incompatible avec une symtrie orthorhombique. Le compos synthtis a donc une structure
module incommensurable de symtrie monoclinique. La rsolution structurale a t ralise
laide du formalisme des superespaces
[1,2]
dans le groupe de Xn(o
1
0o
3
)0 avec comme
vecteur de centrage X(0,,0,). La dtermination de la structure module met en vidence
que i) la molcule organique utilise lors de la synthse sest brise : le cycle aromatique
thiophne a laiss la place une chaine linaire trois atomes de carbone comportant une
double liaison C=C compatible avec lune des deux structures suivantes : Zn(O
3
P-CH=CH-
CH
3
)-H
2
O ou Zn(O
3
P-CH
2
-CH=CH
3
)-H
2
O ii) la modulation conduit la mise en ordre des
diffrents rgio-isomres au sein du matriau.

Nous avons cherch reproduire la synthse de ce matriau par voie hydrothermale
partir de la molcule organique commerciale, lacide allyl phosphonique (H
2
O
3
P-CH
2
-
CH=CH
2
), et de lactate de zinc. Les cristaux obtenus prsentent les mmes paramtres de
maille. Toutefois, aucune modulation nest observe et la rsolution structurale rvle un
important dsordre affectant les chaines carbones. Ce dsordre correspond une moyenne
des conformations des chaines rvles par ltude de la phase module.







[1] P.M. De Wolff. Acta Crystallogr. A, 30 :777, 1974.
[2] P.M. De Wolff, T. Jansen, and A. Janner. Acta Crystallogr. A, 37 :625, 1981.
Session Posters 4b Apriodicit, structure module
- 166 -
P32 - Structural studies of tetragonal tungsten bronze (TTB) crystals
and ceramics by XRD, neutron and electron diffraction

Pierre Heijboer
1
, Michal Josse
1
, Matias Velazquez
1
, Florence Porcher
2
, Franois Weill
1
,
Mario Maglione
1


1
ICMCB, Universit Bordeaux 1, CNRS, 87 Avenue du Docteur Albert Schweitzer, 33600
Pessac
2
LLB, UMR12 CEA-CNRS, Bt. 563 CEA Saclay, 91191 Gif sur Yvette

The tetragonal tungsten bronze structure (TTB) has been first reported in 1949 [1].
They observed that such materials have both ferroelectric and ferromagnetic properties at
room temperature. This recently came back through the investigation of Ba
2
LnFeNb
4
O
15

(where Ln = La, Pr, Nd, Sm, Eu, Gd) ceramics and crystals, which revealed their composite
multiferroic nature.
Following the recent studies on ceramics from this family [2, 3, 4] we investigated
their crystal growth by the optical vertical floating zone. By using this last technique, we grew
cm-sized single-crystal sections of the Ba
2
LaFeNb
4
O
15
compound, to investigate more
precisely the crystal structure by XRD, neutron and electronic diffraction. We confirmed the
existence of a modulated structure (incommensurate or not, depending on the composition)
and the average structure as tetragonal (P4/mbm).

In order to investigate the effect of substitution (lanthanum or neodymium by cerium)
on the structure and physical properties, we also synthesized new adjusted compositions TTB
in ceramics. their characterization by XRD and neutron diffraction in temperature support a
P4/mbm space group. We recently performed electron diffraction in temperature on those
ceramics, and they also exhibit this modulation. Furthermore, some XPS experiments on both
ceramics and crystals are giving us more information on the lattice disorder, including the
octahedral sites both filled by iron and niobium. We added physical properties investigations,
including dielectric measurements, that revealed particular and interesting relaxor-
ferroelectric-paraelectric transitions by increasing the temperature in some of the ceramics.

The aim of our studies is to link the composition, the structure (including the
incommensurate modulation) and the physical properties of such advanced materials.







[1] Magneli et al., Ark. Kemi 1, 1949, 213.
[2] Roulland et al., Solid State Sciences 2009, 11, 17091716.
[3] Graetsch et al., Acta Cryst. B. 2012, 68, 101-106.
[4] Albino et al., accepted in Eur. J. Inorg. Chem., doi: 10.1002/ejic.201300008
Session Posters 4b Apriodicit, structure module
- 167 -
P33 - Tetrahedron ordering in the Cd
6
Tb and Zn
6
Sc 1/1
quasicrystalline approximants: Experiment and Simulation

D. Liu
1
, G. Beutier
1
, H. Euchner
2
, T. Yamada
3
, M. Dupraz
1
, M. de Boissieu
1


1
Sciences et Ingnierie des Matriaux et Procds, INP Grenoble CNRS UJF, Grenoble,
France
2
Institutfu rTheoretische und AngewandtePhysik, Universitt Stuttgart, Pfaffenwaldring 57,
70550 Stuttgart, Germany
3
IMRAM, Tohoku University, Sendai, Japan

Dan.Liu@simap.grenoble-inp.fr

Keywords: quasicrystal approximant, phase transition, domain

The discovery of binary quasicrystal Cd
5.7
Yb and Cd
5.7
Ca breaks a path to deeply
investigate structure and physical properties of quasicrystal [1, 2]. For nowadays, the
technique determining atomic structure of binary quasicrystal has been developed maturely
[3], however, study quasicrystal directly is still a challenging work. As counterparts of
icosahedral quasicrystal, Cd
6
R (R=rare elements) as well as Zn
6
Sc 1/1 approximants, are
expected to play a key role to understand different properties of quasicrystal.
Other than quasicrystals, most of the cubic approximants have been evidenced an
order-disorder phase transition from space group Im-3 to Cc or C2/c, and the ordering of
innermost Cd4/Zn4 tetrahedron in Tsai-type cluster is indicated as the trigger factor [4, 5, 6,
7]. According to symmetric operation, 6 domains with different orientations are obtained in
the low temperature phase [8].
We will present high resolution x-ray diffraction and diffuse scattering in situ
measurements using synchrotron data. And this will be compared with atomic scale molecular
dynamic simulation. The structural phase transition is observed at ~190K and 159K for Cd
6
Tb
and Zn
6
Sc respectively. Diffuse scattering with respect of temperature is discussed both
experimentally and simulatively to Zn
6
Sc. A deep measurement is carried out with some
fundamental reflections below Tc, and the 3-D peak splitting contributed by different domains
is visualized using a new method.

[1] A.P. Tsai, J.Q. Guo, E. Abe, H. Takakura and T. J. Sato, Nature 408 (2000), 537.
[2] J.Q. Guo, E. Abe and A.P. Tsai, Phys. Rev. B 62 (2000), R14605.
[3] H. Takakura, C.P. Gmez, A. Yamamoto, M. De Boissieu and A.P. Tsai, Nature Materials 6
(2007), 58.
[4] R. Tamura, Y. Murao, S. Takeuchi, M. Ichihara, M. Isobe and Y. Ueda, J. J. Appl. Phys. 41 (2002),
L524.
[5] R. Tamura, K. Edagawa, C. Aoki, S. Takeuchi and K. Suzuki, Phys. Rev. B 68 (2003), 174105.
[6] R. Tamura, K. Edagawa, Y. Murao, S. Takeuchi, K. Suzuki, M. Ichihara, M. Isobe and Y. Ueda, J.
Non-Cryst. Solids 334-335 (2004), 173.
[7] R. Tamura, K. Nishimoto, S. Takeuchi, K. Edagawa, M. Isobe and Y. Ueda. Phys. Rev. B 71
(2005), 092203.
[8] T. Yamada, H. Euchner, C.P. Gmez, H. Takakura, R. Tamura and M. de Boissieu, J. Phys.:
Condens. Matter 25 (2013), 205405.
Session Posters 4b Apriodicit, structure module
- 168 -
P34 - Transitions de phases vers des tats ondes de densit de
charges dans les bronzes phosphates de tungsten (PO
2
)
4
(WO
3
)
2m

Olivier Prez
1
, Kamil Kolincio
1
, Laurent Gurin
2
, Pierre Fertey
3

1
Ensicaen, 6 Bd du Marchal Juin, 14050 Cedex 04, France
2
IPR, Universit de Rennes 1, Campus de Beaulieu, Btiment 11A, 35042 RENNES
3
Synchrotron SOLEIL, LOrme des Merisiers - BP 48, 91190 SAINT-AUBIN

Les bronzes phosphate de tungstne [1] tunnels pentagonaux (MPTBp), de formule
chimique (PO
2
)
4
(WO
3
)
2m
avec m variant de 4 14, peuvent tre dcrits comme
lintercroissance rgulire de tranches de ttradres PO
4
et de tranches doctadres WO
6
lis
par les sommets et dpaisseur proportionnelle m. Cette famille de composs dont la
dimensionnalit peut tre gouverne par le paramtre m, fournit un systme modle pour
ltude des conducteurs quasi 2D et des instabilits lectroniques qui les caractrisent . Les
MPTBp prsentent ainsi jusqu trois transitions de phase successives de type Peierls en
fonction de la temprature vers des tats ondes de densit de charges (ODC). Ces tats sont
associs lapparition de rflexions satellites de faible intensit et donc des modulations
structurales commensurables ou incommensurables. Ltude de la surface de Fermi permet de
dfinir trois possibles vecteurs de modulation via lhypothse de mcanisme dembotement
cach [2,3]. Notons que des comportements assez diffrents sont observs pour les MPTBp en
fonction de la parit de m (symtries diffrentes pour les termes paires ou impaires) ou de la
valeur de m, i.e. de la dimensionnalit (transition en dessous de la temprature ambiante pour
m 8 et au-dessus pour m 9).
Afin dobtenir des informations sur les mcanismes rgissant ces instabilits
lectroniques, i.e. dexpliquer les diffrentes transitions de phases observes, une analyse
prcise des proprits de transport et des diagrammes de diffraction de diffrents membres de
la famille des MPTBp au-dessus et au-dessous de la temprature de chaque transition a t
ralise. Notre choix sest orient sur des membres prsentant des diffrences de
dimensionnalit marques (P
4
W
12
O
44
(m=6) ou P
4
W
20
O
68
(m=10)), des parits diffrentes
pour m (P
4
W
18
O
62
(m=9) ou P
4
W
20
O
68
(m=10)) ou des valeurs inusuelles de m (P
4
W
23
O
77

(m=11.5)). Ltude structurale des phases modules en utilisant le formalisme des
superespaces est propose.







[1] P. Roussel, O. Prez and Ph. Labb, Acta Cryst. B57, 603-632 (2001)
[2] Foury, P. & Pouget, J. P. (1993). Int. J. Mod. Phys. B7, 3973-4003.
[3] E. Wang, M. Greenblatt, E.I. Rachidi, E. Canadell, & M.H. Whangbo, J.S.S.C. 80, 266-
275 (1989).
Session Posters 4b Apriodicit, structure module
- 169 -
P35 - Structure module commensurable dun nouveau polymorphe -
CaTeO
3
(H
2
O)
M. Poupon, O. Prez, N. Barrier, J.M. Rueff, H. Latappy
Laboratoire CRISMAT, UMR 6508 CNRS ENSICAEN, 6 bd Marchal Juin 14050 CAEN
Cedex 4 France.

Ces dernires annes, nous avons montr que la synthse de phases hydrates
ATeO
3
(H
2
O) (A = Ca, Sr, Ba) par voie hydrothermale, suivie ou non dune dshydratation,
tait une mthode de synthse originale pour obtenir de nouvelles phases polymorphes [1,2] ;
ces phases peuvent prsenter des proprits de ferrolectricit ou doptique non-linaire [3,4].
Rcemment nous avons pu obtenir, par voie hydrothermale un nouveau polymorphe -
CaTeO
3
(H
2
O). Des monocristaux de cette phase ont pu tre isols et des donnes de
diffraction ont t mesures sur un diffractomtre 4-cercles quip dune camra CCD
(Apex2) et dune source microfocus Mo (INCOATEC). -CaTeO
3
(H
2
O) prsente une
symtrie monoclinique et une maille cristalline a=13.60, b=3.74, c =9.40 et =124.53.
Une premire tude ralise dans le groupe despace C2/m, rvle lexistence dun dsordre
de position affectant une partie des atomes doxygne qui interdit toute analyse fine de
lenvironnement de latome de tellure. Les plans de diffraction reconstruits partir des images
exprimentales prsentent des rflexions supplmentaires noyes dans des lignes de diffusion
diffuse ; le prcdent rsultat daffinement ne correspondrait donc qu une structure
moyenne. Bien que ces rflexions supplmentaires soient localises en position rationnelle
dans le rseau prcdemment dfini, nous avons choisi dutiliser le formalisme des
superespaces en (3+1)d ; cette approche permet dinterprter la structure relle partir de
notre structure moyenne et dune modulation de certains paramtres atomiques tout en
rduisant les corrlations entre atomes grce aux symtries (3+1)d. Le groupe de superespace
choisi est X2/n(0)0s avec X(0,,0,) et vecteur de modulation . Lanalyse des
densits lectroniques (3+1) dimensions a rvl une mise en ordre des atomes doxygne
prcdemment trouvs dsordonns. Cette mise en ordre conduit pour les atomes de tellure
une configuration ttradrique [TeO
3
E], E dsignant la paire dlectrons libres du tellure. Une
hypothse sur lexistence de diffusion diffuse est finalement propose.








[1] Rai R., Sharma S. & Choudhary R.N.P., J. Mat. Sci. Lett., 2002, 21, 297.
[2] Yamada T & Iwasaki H., J. Appl. Phys., 1973, 44, 3934.
[3] Stger B., Weil M., Baran E.J., Gonzlez-Bar A. C., Malo S., Rueff J. M., Petit S.,
Lepetit M. B. Raveau B. & Barrier N., DaltonTrans., 2011, 40, 5538.
[4] N. Barrier, Habilitation Diriger des Recherches, Universit de Caen, 2012.
Session Posters 4b Apriodicit, structure module
- 170 -
P36 - Transitions de phase dans les composs d'inclusion
d'ure/alcane.

Philippe Rabiller
1
, Cline Mariette
1
, Bertrand Toudic
1
, Laurent Gurin
1
, Mark D.
Hollingsworth
2

1
Institut de Physique de Rennes,
2
Kansas State University, Manhattan, USA

Les cristaux apriodiques possdent la proprit davoir un ordre grande distance
mais sans la symtrie de translation. Ces cristaux se dcrivent dans des superespaces
cristallographiques de dimension suprieure trois. Dans cette affiche, nous nous intressons
plus particulirement aux brisures de symtrie prsentes dans de tels espaces
cristallographiques en considrant la famille prototype hte/invit d'ure/alcane. Des tudes
par diffraction de rayons X sur sources synchrotron rvlent de multiples solutions
structurales impliquant des changements ou non de la dimension du groupe de superespace.
Un cas particulirement intressant est illustr par les molcules invites les plus courtes.
Cette cristaux prsentent une phase de haute symtrie de dimension 3 avec confinement d'une
phase "quasi-liquide" des alcanes. A basse temprature, la mise en ordre structural conduit
la formation de composites apriodiques intermoduls. Un tel exemple monoclinique est ainsi
obtenu pour l'heptane [1].


FIG: (a) Reprsentation schmatique de la structure du n-heptane/ure. (b) Projection suivant
la direction des canaux (c) Reprsentation bidimensionnelle du compos dfinissant les
paramtres hte c
h
, invit c
g
et le dphasage entre les molcules invites de canal canal A
g
.










[1] Mariette et al., J. Chem. Phys. 2012, 136, 104507.

Session Posters 5a Approches multitechniques en cristallochimie
- 171 -
P37 - Rsolution structurale par diffraction RX dazo composs

A. Benosmane
1
, A. Mili
1
, A. Bouchoul
1
, L. Ouahab
2

1
Unit de recherche de chimie de lenvironnement et Molculaire structurale.
Facult des Sciences Exactes, Universit Mentouri, Constantine Algrie.
2
LCSIM/UMR 6511 CNRS, Universit de Rennes I. France.

E-mail : King.Ali@hotmail.fr

Les azo-composs ont t prpars sous forme de poudre de couleur rouge par la
mthode de synthse classique des colorants azoques (raction de diazotation damine
aromatique primaire suivie dune copulation sur le -naphtol).

R= H, Cl, SO
2
-NH
2
, O-CH
3
Des cristaux rouges sous forme daiguilles, stables lair, ont t obtenus par
recristallisation dans un mlange compos de deux solvants (lthanol et Actone). Les
intensits sont collectes par un diffractomtre automatique quatre cercles munis dun
dtecteur bidimensionnel Kappa CCD.
Les structures molculaires analyses correspondant au monomre ou dimre, se
prsentent sous la forme quinonehydrazone qui constitue en effet le tautomre
thermodynamiquement favoris en raison de son nergie plus basse.







Farrugia, L. J. (1997). J. Appl. Cryst. 30, 565.
Lee, S. H., Kim, J. Y., Ko, J., Lee, J. Y. & Kim, J. S. (2004). J. Org. Chem. 69, 29022905.
Sheldrick, G. M. (2008). Acta Cryst. A64, 112122.
Oueslati, F., Dumazet-Bonnamour, I. & Lamartine, R. (2004). New J. Chem.28, 15751578.
Spek, A. L. (2009). Acta Cryst. D65, 148155.
Allen, F. H., Kennard, O., Watson, D. G., Brammer, L., Orpen, A. G. & Taylor,R. (1987). J.
Chem. Soc. Perkin Trans. 2, pp. S119.
Chen, Z. H., Morimoto, H., Matsunaga, S. & Shibasaki, M. (2008). J. Am. Chem. Soc. 130,
21702171.
Dao, V.-T., Gaspard, C., Mayer, M., Werner, G. H., Nguyen, S. N. & Michelot, R. J. (2000).
Eur. J. Med. Chem. 35, 805813.
Session Posters 5b Densit lectronique, modlisation
- 172 -
P38 - Electronic and Magnetic Properties of the PrMnO3 Perovskite:
A comparative study of LSDA+U and GGA+U

Zoubir Aziz*, Bouabdellah Bouadjemi and Samir Bentata

Laboratoire de Technologie et des Proprits du Solide
Faculty of Sciences and Technology, BP227
Abdelhamid Ibn Badis University, Mostaganem (27000) Algeria
*E-mail: aziz_zdz@yahoo.fr

The electronic and magnetic properties of the cubic PrMnO3 perovskite structure are
studied using the full potential linear augmented plane wave (FPLAPW) based on density-
functional theory (DFT) in the local spin density approximation (LSDA) and the generalized
gradient approximation (GGA) with the on-site Hubbard Ueff parameter (LSDA + U and
GGA+U). We have analyzed the structural parameters, densities of states, partial densities of
states and band structures. We have shown that this component is half-metallic and
ferromagnetic with an important magnetic moment.

Keywords: magnetic moment, half-metallic, spin-up/spin-down, GGA+U.



Session Posters 5b Densit lectronique, modlisation
- 173 -
P39 - Etude de la distribution de la densit de charge dans le compos
4-Methoxy Benzene Carbothio Amide (C
8
H
9
NOS)

Younes Magrous, Abdelkader Chouiah and Fodil Hamzaoui

Laboratoire Structure et Elaboration des Matriaux Molculaires
Facult des Sciences & de la Technologie - Universit de Mostaganem - Algrie

Le prsent travail concerne la dtermination de la distribution de la densit lectronique
du compos de formule chimique C
8
H
9
NOS partir dun spectre de diffraction des rayons X
haute rsolution sur monocristal [1]. Le Compos investi est connu pour ses remarquables
applications en optiques non linaire.

Nous avons utilis le formalisme de Blessing pour la rduction et le traitement des
donnes brutes. Laffinement de la structure a t effectu en utilisant le programme XD bas
sur le model multipolaire de Hansen-Coppens [2] tenant compte lasphricit des lectrons de
valence. Les rsultats obtenus tmoignent de la qualit du spectre de diffraction dune part et
de lefficacit du model utilis. Nous avons explor systmatiquement les diffrentes sections
planes de la molcule. Les cartes de densit obtenues seront prsentes lors de la rencontre.


Carte de densit dynamique dans le plan du
cycle benznique

Carte de densit dynamique
autour de l'atome de Liaison C-S










[1] Dupont et al., Acta Cryst. D. 2013, 04, 3-6.
[2] Hansen, N. K. & Coppens, P. (1978). Acta Cryst. A34, 909.
Session Posters 5c Cristallographie biologique et Sant
- 174 -
P40 - Mcanisme dactivation de Legionella RalF : tude biochimique
et structurale

Marcia Folly-Klan
1
, Eric Alix
3
, Danile Stalder
2
, Lionel Duarte
1
, Anna Delprato
1
, Pampa
Ray
1
, Mahel Zeghouf
1
, Bruno Antonny
2
, Valrie Campanacci
1
, Craig R. Roy
3
, Jacqueline
Cherfils
1


1
Laboratoire dEnzymologie et Biochimie Structurales, Centre de Recherche de Gif, CNRS,
Gif-sur-Yvette, France,
2
Institut de Pharmacologie Molculaire et Cellulaire, Universit de Nice-Sophia Antipolis et
CNRS, 06560 Valbonne, France,
3
Department of Microbial Pathogenesis, Yale University School of Medicine, New Haven,
CT, USA

Legionella pneumophila, lagent responsable de la maladie du Lgionnaire, est un
pathogne intracellulaire capable dchapper la rponse immunitaire de lhte et ainsi viter
sa destruction par les macrophages alvolaires. Pour cela, la bactrie camoufle lidentit du
phagosome pour viter la voie lysosomale en crant une vacuole de rplication appele LCV
(Legionella-containing vacuole).

Dans ce but, L. pneumophila utilise un systme de scrtion de type IV appel Dot/Icm
pour injecter diffrents effecteurs dans le cytosol de la cellule hte. Un de ces effecteurs,
RalF, va tre responsable du recrutement de la petite protine G Arf1 la surface de la LCV
[1, 2]. En effet, RalF possde un domaine (Sec7) apparent aux facteurs dchange cellulaires
(ArfsGEFs) qui stimulent lchange GDP/GTP ncessaire lactivation de la petite protine G
Arf. La particularit de RalF rside dans la prsence dun domaine C-terminal, le capping
domain, responsable de lauto-inhibition de la protine en solution [3].

Notre objectif est de dcrypter les mcanismes fonctionnels de cette famille de protines
afin de comprendre leur rgulation et leur capacit cibler certaines membranes. Ceci passe
par une tude structurale par diffraction aux rayons X et par diffusion des rayons X aux petits
angles (SAXS) combine une tude fonctionnelle de reconstitution de lactivit dchange
en prsence ou non de membranes artificielles. Nos rsultats montrent que le capping domain
possde un cluster aromatique senseur de lenvironnement lipidique. Le capping
domain est ainsi capable dinteragir spcifiquement avec des lipides prsents la surface de la
LCV permettant le passage une conformation active de RalF dans laquelle le site actif du
domaine Sec7 est libr et catalyse la raction dchange de nuclotide de Arf1.



[1] Nagai et al., Science, 2002, 295(5555), 679-682
[2] Ninio et al., TRENDS in Microbiology. 2007, 15(8), 372-380
[3] Amor et al., J. Biol. Chem., 2005, 280(2), 1392-1400
Session Posters 5c Cristallographie biologique et Sant
- 175 -
P41 - Etude structurale et fonctionnelle de la phosphatase alcaline
LapA : un transporteur de phosphate chez Pseudomonas auruginosa
PAO1

Ahmed Djeghader
1
, Guillaume Gotthard
1
, Daniel Gonzalez
1
, Julien Hiblot
1
, Mikael Elias
2
et
Eric Chabrire
1


1
Unit de recherche sur les maladies infectieuses tropicales mergentes (URMITE), CNRS-
Universit de la Mditerrane, Marseille, France
2
Weizmann Institute of Science, Biological Chemistry, Rehovot, Israel

Le phosphore est un lment indispensable la vie mais peu rpandue dans la nature.
Son acquisition de lenvironnement sous forme de phosphate inorganique (Pi) reprsente donc
un enjeu majeur pour la survie et la croissance des microorganismes. Afin dassurer son
approvisionnement, les bactries possdent deux principaux systmes complmentaires : le
systme Pit (Phosphate inorganic transport) haute vlocit/faible affinit, et le systme Pst
(Phosphate specific transport) haute affinit/faible vlocit [1]. Tandis que le systme Pit est
rgulirement utilis par les bactries dans les conditions normales, le systme Pst est
fortement sollicit en cas de carence en phosphate. En plus de ces deux systmes, certaines
bactries possdent un troisime systme dacquisition, fortement exprim en conditions
limitantes de phosphate.
Nous nous sommes intresss ce dernier systme prsent chez le pathogne
Pseudomonas aeruginosa PAO1. Il sagit en effet de la protine LapA, une phosphatase
alcaline faible poids molculaire [2], extracellulaire, et phylogntiquement relie la
famille des phosphate binding proteins (PBP). La structure cristallographique de cette
protine fut rsolue 0.87 de rsolution. Elle prsente un repliement de type venus-flytrap,
similaire celui des PBP avec des diffrences au niveau de la longueur des boucles exposes
au solvant. Son activit phosphatase fut caractrise envers le para-Nitro-Phenyl-Phosphate
(pNPP). Nos rsultats prliminaires montre que LapA prsente une haute affinit pour ce
substrat mais une trs faible vlocit. Cela suggre un mode de fonctionnement et un rle
diffrent de celui des phosphatases alcalines classiques dans le systme dacquisition de
phosphate. Des travaux de co-cristallisation avec des analogues de substrat et de mutagnse
dirige sont actuellement en cours afin dlucider les bases structuraux de cette activit.







[1] Willsky et al., J Bacteriol. 1980, 144,356-365.
[2] Tan et al., FEMS Microbiol Lett. 1993, 106, 281-286.
Session Posters 5c Cristallographie biologique et Sant
- 176 -
P42 - Solubilisation de protines problmatiques, et si la solution
rsidait dans la phylognie ?

Daniel Gonzalez
1
, Julien Hiblot
1
, Guillaume Gotthard
1
, Ahmed Djeghader
1
, Mikael Elias
2
et
Eric Chabrire
1


1
Unit de recherche sur les maladies infectieuses tropicales mergentes (URMITE), CNRS-
Universit de la Mditerrane, Marseille, France
2
Weizmann Institute of Science, Biological Chemistry, Rehovot, Israel

Ltude structurale, biochimique et mcanistique des protines require une protine
pure et en grand quantit. Cependant, de nombreuses protines, problmatiques mais
limportant rle physiologique ne sont pas tudies faute de pouvoir les obtenir en
quantit/qualit suffisante; cest notamment le cas des protines hydrophobes. Bien que de
multiples stratgies furent dveloppes afin de surmonter ces limitations, elles savrent
souvent inefficaces et peuvent tre complexes pour les plus pointues dentre elles.
Dans le but de solubiliser une protine problmatique (HPBP), nous avons exploit
une stratgie reposant sur la phylognie: la rsurrection ancestrale. En effet, connue pour
gnrer des protines ancestrales thermostables, nous avons pos lhypothse que cette
mthode permettrait denrichir la protine en mutations cls stabilisatrices; tout en conservant
son activit physiologique. La Human Phosphate Binding Protein (HPBP) est une protine
humaine, issue du plasma humain. Cette lipoprotine est associe la paraoxonase humaine
(hPON1), prsentant toutes deux une hydrophobicit prononce et une grande instabilit [1,2].
Dailleurs, la PON fut solubilise par des approches mthodologiques lourdes en vue
dapplications biotechnologiques [3].
En vue de solubiliser HPBP, nous avons ralis un arbre phylogntique de la famille
des protines DING, laquelle appartient HPBP. Il a permis didentifier 60 positions
stabilisatrices potentielles dont 22 ont t slectionnes par analyse structurale. Le gne
codant ce variant fut synthtis et la protine exprime de faon soluble contrairement
lenzyme sauvage. Le variant conserve les multiples activits de HPBP dont celle de fixer le
phosphate et dinhiber le VIH, via ltape de la transcription, une tape non cible par les
thrapies actuelles [4,5]. Ainsi, nous proposons par cette tude une nouvelle mthodologie
qui, par tude in sillico, permettant de solubiliser rapidement et relativement facilement
certaines protines complexes tudier. Cette stratgie pourrait permettre de dverrouiller un
verrou technique dans ltude de certaines protines hydrophobes.

[1] Dupont et al., Acta Cryst. D. 2013, 04, 3-6 ; Renault F, Chabriere E, Andrieu JP, Dublet
B, Masson P, et al. (2006) J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci 836: 15-21.
[2] Rochu D, Renault F, Clery-Barraud C, Chabriere E, Masson P (2007) Biochim Biophys
Acta 1774: 874-883.
[3] Harel M, Aharoni A, Gaidukov L, Brumshtein B, Khersonsky O, et al. (2004) Nat Struct
Mol Biol 11: 412-419.
[4] Cherrier T, Elias M, Jeudy A, Gotthard G, Le Douce V, et al. Virol J 8: 352.
[5] Morales R, Berna A, Carpentier P, Contreras-Martel C, Renault F, et al. (2006) Structure
14: 601-609.
Session Posters 5c Cristallographie biologique et Sant
- 177 -
P43 - Evolution convergente et divergente entre lactonases et
phosphotriestrases

Guillaume Gotthard
1
, Julien Hiblot
1
, Mikael Elias
2
et Eric Chabrire
1


1
Unit de recherche sur les maladies infectieuses tropicales mergentes (URMITE), CNRS-
Universit de la Mditerrane, Marseille, France
2
Weizmann Institute of Science, Biological Chemistry, Rehovot, Israel

Les organophosphors (OPs) sont des composs synthtiques neurotoxiques introduits
dans la nature partir des annes 50s. Certaines enzymes ont rapidement volu (~ 30 ans)
pour dgrader efficacement ces composs, approchant la perfection catalytique (BdPTE,
k
cat
/K
M
~ 10
8
M
-1
.s
-1
). Lmergence rapide dune telle activit souleva la question de son
origine puisque ces composs ne sont pas naturels. Rcemment, la mise en vidence dune
promiscuit enzymatique phosphotriestrase chez des lactonases permit de proposer que les
lactonases puissent tre le point dmergence des phosphotriestrases [1,2]. Ainsi, il est
possible dobserver au sein de deux familles structurales distinctes (amidohydrolases et
mtallo--lactamases) des phnomnes dvolution convergente et divergente illustrant
parfaitement les relations de promiscuit entre ces deux activits.
SsoPox et SisLac sont des Phosphotriestrases-Like Lactonases (PLLs)
hyperthermostables (Tm ~ 106C) prsentant des activits de promiscuit phosphotriestrase
(k
cat
/K
M
~ 10
3
M
-1
.s
-1
, 25C) [3]. Appartenant la superfamille des amidohydrolases
(topologie (/)
8
), elles prsentent une importante homologie structurale avec la BdPTE. Cette
dernire aurait diverg dune lactonase appartenant probablement la famille des PLLs [1].
Paralllement aux PLLs, dautres OP hydrolases (MPH et OPHC2) ayant galement merg
au sein de la superfamille des mtallo--lactamases (sandwich /) sont prsumes
provenir de lactonases apparentes telles quAiiA.
Dans lobjectif de dvelopper un bio-dcontaminant efficace envers les OPs, nous
avons utilis les voies empruntes par la nature pour ingnieuriser une enzyme
hyperthermostable (SsoPox) afin de rendre son cur catalytique plus efficace envers les OPs.
En effet, bien que la promiscuit dactivit phosphotriestrase des lactonases offre des
possibilits dvolution par mutagnse alatoire, criblage et slection ; la nature offre des
modles dj optimiss pouvant tre mims au sein denzyme prexistantes permettant ainsi
de converger plus rapidement vers des catalyseurs efficaces et robustes.






[1] Afriat-Jurnou et al., Biochemistry 51, 6047-6055
[2] Elias et al., The Journal of biological chemistry 287, 11-20
[3] Elias et al., Journal of molecular biology 379, 1017-1028
Session Posters 5c Cristallographie biologique et Sant
- 178 -
P44 - Bases structurales de lantignicit des complexes peptide-CMH

Jean-Baptiste Reiser
1
, Franois Legoux
2
, Stphanie Gras
1
, Eric Trudel
1
, Anne Chouquet
1
,
Alexandra Lger
2
, Madalen Le Gorrec
1
, Paul Machillot
1
, Marc Bonneville
2
, Xavier Saulquin
2
,
Dominique Housset
1


1
Institut de Biologie Structurale, UMR 5075, CEA, CNRS, Universit J. Fourier Grenoble I,
41 rue J. Horowitz, 38027 Grenoble,
2
UMR 892 et Centre de Recherche en Cancrologie Nantes Angers, INSERM, Universit de
Nantes, 8 quai Moncousu, 44007 Nantes

Le projet que nous menons en collaboration avec lquipe de M. Bonneville, a pour but
de comprendre les bases structurales de la reconnaissance dantignes tumoraux, prsents par
les molcules CMH, par les rcepteurs du lymphocyte T (TCR). Nous cherchons tablir le
lien entre les interactions intermolculaires quun TCR peut tablir avec les complexes
peptide-CMH, observables grce aux structures cristallographiques et quantifiables par
diffrentes techniques biophysiques comme la rsonance plasmonique de surface [1], et la
capacit de ces mmes complexes peptide-CMH activer des lymphocytes T et activer une
rponse immune efficace. Cest un enjeu majeur pour le dveloppement de limmunothrapie
anti-tumorale. En combinant tudes structurales de plusieurs complexes peptide-CMH et
analyse de la frquence des lymphocytes T spcifiques de ces complexes peptide-CMH dans
le rpertoire naf de lymphocytes T [2], nous avons pu dgager un certain nombre de principes
et montrer que plusieurs paramtres doivent tre pris en compte. Lanalyse de plusieurs TCR
spcifiques dun mme antigne de mlanome, Melan-A [3], par SPR nous a montr trs
rcemment une bonne corrlation entre affinit du TCR pour le peptide-CMH et lavidit
fonctionnelle pour les lymphocytes T qui portent ces TCR. De plus, cette approche va nous
permettre de quantifier la contribution de chacune des chanes et des TCR linteraction
TCR-peptide-CMH, permettant de mieux comprendre les raisons de la prvalence dune
chane particulire, TRAV12-2, dans le rpertoire anti-Melana-A, et les bases de la
diffrence daffinit entre ces diffrents TCR. In fine, nos travaux visent mieux comprendre
toute la complexit de la rponse lymphocytaire T anti-tumorale, dans le but daider
dvelopper des stratgies dimmunothrapie plus efficaces.




[1] Gras, S. et al. Structural bases for the affinity-driven selection of a public TCR against a
dominant human cytomegalovirus epitope. J Immunol 183, 430-437 (2009).
[2] Legoux, F. et al. Impact of TCR reactivity and HLA phenotype on naive CD8 T cell
frequency in humans. J Immunol 184, 6731-6738, doi:jimmunol.1000295
[pii]10.4049/jimmunol.1000295 (2010).
[3] Trautmann, L. et al. Dominant TCR V alpha usage by virus and tumor-reactive T cells
with wide affinity ranges for their specific antigens. Eur J Immunol 32, 3181-3190 (2002).
Session Posters 5c Cristallographie biologique et Sant
- 179 -
P45 - Etude structurale de rcepteurs membranaires bactriens
impliqus dans le transport d'antibiotiques

Lucile Moynie et James H Naismith

Biomedical Sciences Research Complex, University of St Andrews, St Andrews KY16 9ST,
Scotland

L'augmentation de la rsistance aux antibiotiques des bactries Gram ngatif telle que
Pseudomonas aeruginosa est devenue un enjeu sanitaire majeur ncessitant le dveloppement
de nouveaux traitements [1]. Une des nouvelles stratgies dveloppes consiste utiliser les
voies de transport du complexe sidrophore-fer travers la paroi bactrienne afin de dlivrer
les antibiotiques de manire plus efficace. C'est le cas de BAL30072, un -lactamine
conjugu un sidrophore dvelopp par Basilea Pharmaceutica International qui possde une
forte activit contre Pseudomonas aeruginosa (concentration minimal d'inhibition 8 mg/L)
[2].
Rcemment, deux transporteurs des complexes sidrophore-fer (PiuA et PirA) ont t
identifis comme tant impliqus dans le transport travers la membrane externe de
Pseudomonas aeruginosa de ces nouveaux antibiotiques [3,4].
Nous avons dbut l'tude structurale de ces protines membranaires afin de
comprendre les mcanismes de transport de cette nouvelle classe d'antibiotiques et d'amliorer
leur efficacit.




















[1] Page and Heim, Cur Opin Pharmacol.. 2009, 09, 1-8.
[2] Page et al., Antimicrob. Agents Chemother. 2010, 6, 2291-2302.
[3] van delden et al., Antimicrob. Agents Chemother. 2013, 5, 2095-2101
[3] Mcpherson et al., Antimicrob. Agents Chemother. 2012, 12, 6334-6342
Session Posters 5c Cristallographie biologique et Sant
- 180 -
P46 - Caractrisations structurales dinhibiteurs atypiques de la
protine kinase CK2 pour la conception de nouvelles molcules anti-
cancreuses

Jean-Baptiste Reiser
1
, Benot Bestgen
2,4
, Thierry Lomberget
2
, Marc Le Borgne
2
, Mathias
Engel
3
Claude Cochet
3


1
Institut de Biologie Structurale Jean-Pierre Ebel (CEA-CNRS-UJF), 41 rue Jules Horowitz
38027 Grenoble Cedex,
2
Universit de Lyon, Universit Lyon 1, Facult de Pharmacie, ISPB, EA 4446 Biomolcules,
Cancer et Chimiorsistances, 8 avenue Rockefeller 69373 Lyon cedex 8, France,
3
Institut de Recherches en Technologie et Sciences pour le Vivant (CEA), 17 rue des Martyrs
30854 Grenoble Cedex 09
4
Pharmaceutical and Medicinal Chemistry, Saarland University, Campus C2.3, D-66123
Saarbrcken, Germany.

CK2 est une protine kinase qui fait partie dune classe denzymes multifonctionnelles,
constitutivement actives et exprimes de manire ubiquitaire. Sa surexpression et sa
drgulation ont t rvles dans de nombreux types de cellules cancreuses, notamment les
cellules leucmiques, de la prostate, du colon ou du sein. CK2 est aujourdhui considre
comme une cible prometteuse pour le dveloppement de nouvelles thrapies anticancreuses
spcifiques. Toutefois, peu des molcules inhibitrices identifies ce jour se sont avres tre
de bons candidats pour le dveloppement de molcules thrapeutiques ; essentiellement parce
que beaucoup dentre elles nont pas dmontr leur efficacit dans des modles cellulaires ou
chez lanimal. Depuis plusieurs annes, nos collaborateurs et notre quipe sintressent la
dcouverte et la caractrisation dinhibiteurs originaux de cette protine kinase en utilisant
diffrentes approches de criblage, de biochimie, de biologie cellulaire et de biologie
structurale. Ainsi, grce la stratgie employe, plusieurs nouvelles familles de molcules
possdant une action inhibitrice des degrs divers et spcifiques de CK2 ont t dcouvertes,
dont certaines ont montr une efficacit in vivo sur la rgression de xnogreffes de tumeurs
humaines chimiorsistantes.
Dans un premier temps, nous nous sommes intress plusieurs familles dinhibiteurs
ATP-comptitifs [1,2]. Les diffrentes structures de CK2 en complexe avec plusieurs
molcules ont permis de dcrire le mode dinteraction et les interactions cls ncessaires
linhibition et de rationaliser la slectivit plus ou moins restreinte de ces composs pour
CK2. Nous nous focalisons aujourdhui sur des composs non-ATP-comptitifs atypiques qui
sont capables de moduler lactivit kinase de faon allostrique. Ces nouveaux inhibiteurs ont
la particularit dtre trs spcifiques pour la kinase cible. Toutefois, le site de fixation et le
mode dinhibition restent encore peu connus. Nous prsenterons les rsultats prliminaires
obtenus par SAXS sur un complexe entre le domaine catalytique de CK2 et un de ces
nouveaux types dinhibiteurs.
[1] Prudent, R., et al., Antitumor activity of pyridocarbazole and benzopyridoindole
derivatives that inhibit protein kinase CK2. Cancer Res. 2010, 70(23), 9865-74.
[2] Lopez-Ramos, M., et al., New potent dual inhibitors of CK2 and Pim kinases: discovery
and structural insights. FASEB J. 2010, 24(9), 3171-85.
Session Posters 5c Cristallographie biologique et Sant
- 181 -
P47 - Caractrisation structurale et fonctionnelle de la voie de
conjugaison de FAT10

Prakash Rucktooa

UMR 8576 CNRS Universit des Sciences et Technologies de Lille

Les modifications post-traductionnelles modulent la fonction des protines, contribuant
la rgulation fine de processus cellulaires. La fatylation est une de ces modifications, qui
consiste en la conjugaison dune protine de type ubiquitine appele FAT10 sur une protine
cible. Cette conjugaison se fait par lintermdiaire de diffrentes enzymes agissant en cascade.
Une enzyme dactivation (Uba6) active FAT10 avant de le transfrer sur une enzyme de
conjugaison (Ube2z) qui procde la modification des protines cibles avec laction conjointe
de E3-ligases.
Uba6 et Ube2z prsentent toutefois la particularit de fonctionner la fois lors de la
fatylation et lors de lubiquitination. Cette double spcificit de substrat souligne la
complexit de mcanismes de rgulation intervenant dans la conjugaison de modificateurs de
type ubiquitine sur des protines cibles.
Nous utilisons des mthodes structurales, biophysiques et biochimiques afin de
comprendre comment survient cette double spcificit de substrat pour Uba6 et Ube2z.

Session Posters 5c Cristallographie biologique et Sant
- 182 -
P48 - Inhibiteurs de Myosine du muscle lisse : une nouvelle mthode
pour le traitement des maladies de hyper-contractilit des voies
ariennes

S. Sirigu
1
, J. Hartman
2
, G. Bergnes
2
, F. Malik
2
, A. Houdusse
1


1
Motilit Structurale, Institut Curie, UMR 144, CNRS, Paris, France,
2
Recherche Prclinique et Dveloppement, Cytokinetics, Inc., San Francisco, CA 94080,
USA.

Les myosines sont des moteurs molculaires essentiels pour de nombreuses fonctions
cellulaires. La production de force est couple lhydrolyse de lATP alors quun changement
de conformation nomm powerstroke se produit sur le complexe acto-myosine au moment du
relchement des produits. Pendant ce cycle moteur, la myosine explore diffrents tats
conformationnels en fonction du nuclotide li et de laffinit pour lactine qui en rsulte.
Plusieurs isoformes de myosines ont t impliques dans des maladies humaines svres et la
recherche de drogues allostriques capables de moduler ces moteurs constitue une nouvelle
approche thrapeutique pour ces dficits.

Notre collaborateur, Cytokinetics, Inc. (USA) a dcouvert des inhibiteurs slectifs de
la Myosine II du muscle lisse qui empchent lhydrolyse de lATP |1, 2|. Ce mcanisme
dinhibition augmente la population de moteurs molculaires faiblement lis lactine et
favorise la relaxation du muscle lisse. Le potentiel de cette drogue a t valid dans des
modles animaux de bronchoconstriction et reprsente une nouvelle voie thrapeutique pour
le traitement des maladies de hyper-contractilit des voies ariennes.
Nous avons rsolu la structure cristallographique de la Myosine II du muscle lisse lie
un de ces inhibiteurs de Cytokinetics. Notre structure dcrit une poche inattendue dans
laquelle la drogue se fixe. Cette poche se situe entre les deux connecteurs du moteur qui
contrlent llment mcanique de la myosine, le bras de levier. Cette rgion de la protine
subit des rarrangements structuraux qui dterminent la position exacte du bras de levier
pendant le cycle de la myosine et en particulier le powerstroke. Notre structure apporte des
lments nouveaux pour la comprhension des rarrangements allostriques du moteur et
reprsente un outil important pour la ralisation de nouvelles gnrations dinhibiteurs
spcifiques de myosines.






|1| Zhao et al., Pharmacol Exp Ther. 2011, 339(1):307-12
|2| Ho et al., PLoS One. 2012, 7(5):e36302
Session Posters 5c Cristallographie biologique et Sant
- 183 -
P49 - Structural and functional studies of FNE, a bacterial adhesion
protein of Streptococcus equi : a "Rebel" protein for crystallization

Mounira Tiouajni, Dominique Durand, Agathe Urvoas, Marielle Lepiniec-Valerio, Karine
Blondeau, Asma Guellouz, Marc Graille, Philippe Minard and Herman van Tilbeurgh

Institut de Biochimie et Biophysique Molculaire et Cellulaire (IBBMC), Universit Paris
Sud, UMR 8619, Orsay, France.

Streptococcus equi is a gram-positive bacteria responsible for diseases of the upper
respiratory tract in horses that can be fatal such as strangles. Exceptionally, this bacteria is
responsible for meningitis in humans. FNE is a protein involved in adhesion and virulence of
Streptococcus equi by interacting with fibronectin in the extracellular matrix of the cell.
Fibronectin is a long-glycoprotein (250 kDa) organized into functional domains that interact
with different partners such as bacterial adhesion proteins. FNE Interacts with the Gelating
Binding Domain of fibronectin (GBD), located near the N-terminus. We study the structural
and functional aspects of this interaction as a model for bacterial adhesion to the GBD. We
were unable to crystallize FNE or a truncated version lacking the disordered C-terminal
peptide. We therefore developed artificial proteins that bind to FNE with the objective to
create complexes of these proteins in complex with FNE and amenable to crystallization. We
made use of a library coding for artificial protein constructed by repetition of a pattern
designed HEAT from a thermophilic archaeal protein [1]. Three artificial proteins interacting
with the FNE have been obtained by phage-display and the corresponding complexes with
FNE were tested for crystallization. We will present this new innovative cristallogenesis
technique and the structure of the complex FNE / artificial partner obtained at 1.83 of
resolution.

























[1] Urvoas, Guellouz et al ; J Mol Biol. 2010, 404b307-27
Session Posters 6a Mthodes mergentes en cristallographie
- 184 -
P50 - Analyse structurale de noirs de carbone archologiques par
techniques combines

Sophie Cersoy
1
, Pauline Martinetto
1
, Pierre Bordet
1
, Jean-Louis Hodeau
1
, Elsa Van
Eslande
2
, Philippe Walter
2


1
Institut Nel, CNRS-UJF, Grenoble,
2
LAMS, CNRS-UMPC, Paris

Les noirs dits de carbone ont t frquemment utiliss depuis la Prhistoire en tant
que pigments, cosmtiques ou encres. Ils regroupent en fait une trs grande varit de produits
obtenus par carbonisation dun matriau dorigine animale, vgtale ou minrale quon peut
retrouver sous les termes de noir de charbon, noir de fume, noir dos. Si les recettes de
prparation sont relativement bien dcrites, en particulier dans les ouvrages anciens [1], les
diffrentes phases carbones obtenues, souvent mal cristallises, sont difficiles identifier et
caractriser.
Des micro-prlvements de cosmtiques et/ou encres noirs ont t effectus dans
diffrents objets dcouverts pendant les fouilles de Pompi. Leur composition, en lien avec
leur usages et fonction, reste dterminer [2]. Comprendre ces matriaux incite le
dveloppement de nouvelles mthodologies : combinaison diffraction des rayons X et
tomographie, qui permet la reconstruction de coupes virtuelles structurales montrant la
rpartition des phases (cristallises ou non)

[3] et caractrisation de matriaux non/mal
cristalliss par analyse de la fonction de distribution de paires (PDF) [4]. Des donnes de
diffraction des rayons X ont t enregistres sur la ligne BM2-CRG de lESRF en mode
tomographie. Elles permettent didentifier les phases cristallises et de comparer les signaux
de diffusion des diffrentes phases carbones caractristiques des chantillons. Des pigments
noirs de rfrence, achets chez diffrents fournisseurs de pigments, ont galement t
analyss pour aider linterprtation des chantillons anciens. Les rsultats de diffraction des
rayons X sont confronts ceux obtenus par dautres techniques de caractrisation structurale
comme la spectroscopie Raman, qui peut permettre de dterminer lorigine vgtale, minrale
ou animale des noirs de carbone tudis et leur degr de dsordre.
Ce projet participe une srie dtudes menes sur les cosmtiques archologiques,
connus pour rvler des pratiques et savoir-faire anciens dans le domaine de la physico-
chimie [5].

[1] DIOSCORIDE, De materia medica (I, 69); PLINE L'ANCIEN, Histoire naturelle, Livre XXXV.
[2] GAMBERINI et al., Vibrational Spectroscopy, 2008, 47, 82-90 ; CANEVALI et al., Anal.
Bioanal. Chem., 2011, 401, (6), 1801-1818.
[3] BLEUET P. et al. Nat. Mat., 2008, 7(6), 468-472 ; ALVAREZ-MURGA et al., J. Appl. Cryst.
2011, 44, 163-171 ; DE NOLF W. and JANSSENS K., Surf. Interface Anal., 2010, 42, 411-418.
[4] EGAMI T., BILLINGE S. J. L., Underneath the Bragg Peaks: Structural analysis of complex
materials, 2003, Pergamon, Oxford, England ; BORDET P., Collection de la Socit Franaise
de la Neutronique, 2008, 9, O. Isnard, Ed., EDP Sciences.
[5] WALTER P. et al., Nature, 1999, 397, 483-484.
Session Posters 6a Mthodes mergentes en cristallographie
- 185 -
P51 - Cryscal

Thierry Roisnel
1
, Juan Rodrguez-Carvajal
2
, Javier Gonzlez-Platas
3


1
Centre de Diffractomtrie X, Institut des Sciences Chimiques de Rennes, UMR6226 CNRS
Universit de Rennes 1, Avenue du Gnral Leclerc, 35042 Rennes Cedex (France)
2
Institut Lau Langevin, 6 rue Jules Horowitz, BP156, 38042 Grenoble Cedex 9 (France)
3
Departamento Fisica Fundamental II, Universidad de La Laguna, 38204 La Laguna,
Tenerife (Spain)

Bas en grande partie sur l'utilisation de la librairie cristallographique modulaire
CrysFML[1], Cryscal est une calculette cristallographique conue pour raliser de
nombreuses oprations basiques en cristallographie / diffraction:
. lecture et analyse de fichiers d'intensits intgres (.hkl); recherche de groupes d'espace
. transformations matricielles
. calculs de distances et angles interatomiques
. calcul de connectivit et de Bond Valence Sum
. calcul de facteurs de structure cristallographique (X, neutrons, e
-
)
. simulation de diagrammes de diffraction sur poudres (X, neutrons), avec prise en compte
d'un largissement des rflexions dues une taille de particules non infinie
. calcul de coefficient d'absorption (X, neutrons)
. conversion de format de fichiers (.INS, .CIF, .CEL, .FST )

et galement obtenir des informations cristallographiques (groupe d'espace, positions
atomiques, ) ou atomiques (facteurs de diffusion, rayons ioniques, masses molculaires, )
ou bien encore raliser des rapports d'exprience de rsolution structurale (.HTML, .PDF).

Les nombreuses potentialits offertes par Cryscal sont directement lies l'utilisation de
mots cls et des arguments associs, lesquels permettent de spcifier au programme les
diffrentes tches accomplir. Ces instructions excuter peuvent tre soit directement
entres au clavier (mode interactif), soit tre lues dans un fichier d'entre qui peut tre pass
comme argument l'excution du programme, ce qui permet aisment l'interfaage par
d'autres programmes (ex: WinGX, WinPLOTR ).
A noter que les informations structurales ncessaires l'excution de certaines tches
peuvent tre soit introduites manuellement, soit tre extraites directement de la lecture de
fichiers de donnes structurales (formats CIF, .INS/.RES pour SHELXL, .PCR pour
FullProf ).
Signalons enfin que Cryscal est volutif en fonction des demandes des utilisateurs et
qu'une version pour Windows est disponible et tlchargeable l'adresse :
www.cdifx.univ-rennes1.fr/cryscal.

[1] J. Rodrguez-Carvajal and J. Gonzlez-Platas
http://www.iucr.org/resources/commissions/crystallographic-
computing/newsletters/1/crysfml

Session Posters 6b Biologie Structurale Intgrative et gros assemblages
- 186 -
P52 - Rotor architecture in the F
1
c
10
sub-complex of the yeast F
1
F
0
-
ATP synthase

Marie-France Giraud
1,2
, Patrick Paumard
1,2
, Corinne Sanchez
1,2
, Isabelle Larrieu
1,2
, Daniel
Brthes
1,2
, Alain Dautant
1,2


1
Universit de Bordeaux, IBGC, UMR 5095, F-33000 Bordeaux, France
2
CNRS, IBGC, UMR 5095, F-33000 Bordeaux, France

The yeast mitochondrial F
1
F
0
-ATP synthase is a hybrid molecular nanomotor. F
1
is a
chemical motor driven by ATP hydrolysis while F
0
is an electrical motor driven by proton
flow. The two stepping motors are mechanically coupled through a common rotary shaft. Two
different crystal forms of the yeast F
1
c
10
ATP-synthase sub-complex were obtained at a
resolution of 3.43 (form I) and 6.5 (form II). Form I crystals were grown in the presence
of Mg-ADP, dicyclohexylcarbodiimide (DCCD) and azide. The structure (yF
1
c
10
(I)) displayed
new features compared with the unrefined yF
1
c
10
[1] and the first yeast F
1
structure (yF
1
)
inhibited by adenylyl imidodiphosphate (AMPPNP) [2]. An ADP molecule was bound in both
beta(DP) and beta(TP) catalytic sites. The alpha(DP)-beta(DP) pair was slightly open and
resembled the novel conformation identified in yF
1
, whereas the alpha(TP)-beta(TP) pair was
very closed and resembled more a DP pair. Hence, yF
1
c
10
(I) provided a model of a new Mg-
ADP-inhibited state of the yeast F
1
[3]. Like in the original yF
1
[2] and yF
1
c
10
[1] structures,
the foot of the central stalk was rotated by ~40 with respect to the bovine F
1
structure [4].

The form II crystal was obtained in the presence of AMPPNP, DCCD and azide.
Despite the low resolution of the dataset, the structure (yF
1
c
10
(II)) is informative on the
enzyme. In form I crystals significant interactions of the F
1
-head with the c
10
-ring of a
neighboring molecule affected the overall conformation of the rotor. This led to a tilt between
the pseudo symmetry axis of the (alpha-beta)
3
domain and the 10-fold symmetry axis of the c-
ring near the F
1
-F
0
rotor interface and resulted in an unbalanced machine. However, in the
form II crystal, the packing has a weaker influence on the conformation of the rotor. The yeast
yF
1
c
10
(II) and the bovine bF
1
c
8
[5] structures share a common rotor architecture with the
inertia center of the (alpha-beta)
3
domain close to the rotor c-ring axis, thus providing a
model of a more efficient motor.




[1] Stock, D., Leslie, A.G., and Walker, J. E. (1999) Science 286, 1700-1705.
[2] Kabaleeswaran, V., Puri, N., Walker, J. E., Leslie, A.G., and Mueller, D.M. (2006) EMBO
J. 25, 5433-5442.
[3] Dautant, A., Velours, J. and Giraud, M.-F. (2010) J. Biol. Chem. 285, 29502-29510.
[4] Gibbons, C., Montgomery, M. G., Leslie, A. G., and Walker, J. E. (2000) Nat. Struct. Biol.
7, 1055-1061.
[5] Watt, I.N., Montgomery, M.G., Runswick, M.J., Leslie, A.G., Walker J.E. (2010) Proc.
Natl. Acad. Sci. USA. 107, 16823-16827.
Session Posters 6b Biologie Structurale Intgrative et gros assemblages
- 187 -
P53 - Structural insights into DNA recognition by Retinoid X Nuclear
Receptor

Judit Osz
1
, Alastair McEwan
2
, Pierre Poussin-Courtmontagne
2
,

Catherine Birck
2
, Irwin
Davidson
3
,

Dino Moras
1
, Natacha Rochel
1


1
Department of Integrative Structural Biology,
2
Structural Biology Platform,
3
Department of Functional Genomics and Cancer, Institut de Gntique et de Biologie
Molculaire et Cellulaire (IGBMC), Institut National de Sant et de Recherche Mdicale
(INSERM) U964 / Centre National de Recherche Scientifique (CNRS) UMR 7104 / Universit
de Strasbourg, 67404 Illkirch, France.

Retinoid X receptors (RXRs) are transcription factors with important function in embryonic
development, metabolic processes, differentiation and apoptosis. A particular feature of RXRs
is their ability to act as homodimer or as obligatory heterodimerisation partner of class II
nuclear receptors. Functional RXR homodimers specifically regulate genes containing direct
repeats (DR) of the half-site (A/G)G(G/T)TCA separated by 1 nucleotide (DR1). To unravel
the mechanism of specificity of DNA binding by RXR, we have characterized the interaction
between RXR and several DR1 from regulated genes using structural and biochemical
approach. We identify the key interactions that lead to high and low affinity binding to DR1
sequence and show that the DNA sequence affects RXR homodimer structure. The solution
structures of intact homodimeric RXR/DR1 show an extended asymmetrical arrangement
with distinct hinge conformations.

Session Posters 7a Cristallographie in situ, in operando
- 188 -
P54 - Etude du photomagntisme de composs molculaires
MnCu
x
Zn
(2-x)
par diffraction de neutrons polariss sous irradiation
lumineuse in-situ.

Batrice Gillon
1
, Karl Ridier
1
, Grgory Chaboussant
1
, Nathalie Bridonneau
2
, Valrie
Marvaud
2


1
Laboratoire Lon Brillouin (LLB), UMR12 CNRS-CEA, CEA Saclay, 91191 Gif-sur-Yvette
(France),
2
Institut Parisien de Chimie Molculaire (IPCM), CNRS UMR7201, 75252 Paris (France)

La nature du processus microscopique qui pourrait expliquer les proprits
photomagntiques des composs doctacyanomolybdate de cuivre demeure en dbat bien que
les rsultats de XMCD sur le complexe trinuclaire (MoCu
2
)-Meen [1] mettent en vidence
un mcanisme de transition de spin (ST) de lion Mo
IV
(BS) (S=0) vers un tat haut spin
Mo
IV
(HS) (S=1). Toutefois, lexistence dun mcanisme concomitant de transfert de charge
mtal-mtal (MMCT) de lion MoIV vers lion Cu
II
(dj observ dans le complexe
heptanuclaire photomagntique MoCu
6
par spectroscopie dabsorption X-ray [2]) ne peut pas
tre exclu comme le suggrent les mesures SQUID effectues rcemment sur la famille de
complexes (MoCu
x
Zn
2-x
)-tren dans lesquels le Cu est substitu par le Zn non magntique
avec diffrentes concentrations 0<x<0,2.

Afin de mieux comprendre lorigine du photomagntisme dans ces matriaux, nous
utilisons la diffraction de neutrons polariss (PND) associe une irradiation in-situ par la
lumire qui permet de caractriser les tats photomagntique lchelle atomique. Cette
technique permet dtablir les cartes de densit de spin avant et aprs irradiation in-situ par
un faisceau laser (405nm) afin de discriminer le rle des atomes Mo and Cu dans le processus
de photoexcitation. Les rcentes investigations par PND sur un monocristal de (MoCu
2
)-Meen
sur le diffractomtre 6T2 au LLB ont montr que des rflexions intenses apparaissent aprs
irradiation lumineuse des positions diffrentes de celles de ltat fondamental et
disparaissent aprs relaxation thermique [3]. Ceci prouve lexistence dun tat mtastable
induit par la lumire possdant une structure diffrente du fondamental. Les rsultats obtenus
lors dexpriences similaires effectues sur monocristal de (MoCu
0,1
Zn
1,9
)-tren sont prsents.







[1] M.-A. Arrio, et al., J. Phys. Chem. C 2010, 114, 593-600
[2] J.M. Herrera, et al., Angew. Chem. Int. 2004, 43, 5468-5471
[3] A. Hammerschmied, Diplom Arbeit, TU Wien, 2010

Session Posters 7b Texture, microstructure, dformation
- 189 -
P55 - Analyse quantitative de diagrammes de diffraction
lectronique : nanoparticules et textures

P. Boullay
1
and L. Lutterotti
2


1
CRISMAT, CNRS UMR 6508, 6 Bd du Marchal JUIN 14050 CAEN Cedex, France
2
Department of Materials Engineering and Industrial Technologies, University of Trento,
38123 TRENTO, Italy

Les chantillons polycristallins composs de grains de taille nanomtrique posent des
difficults quand leur caractrisation structurale et microstructurale. Lobjet de cette
prsentation sera de montrer comment la microscopie lectronique en transmission (MET)
peut tre un outil de caractrisation permettant dobtenir des rsultats quantitatifs fiables et
complter avantageusement les informations obtenues par diffraction des rayons X. Parmi les
diffrentes techniques disponibles dans un MET, les auteurs sintresseront plus
particulirement lanalyse quantitative des diagrammes de diffraction de cercles
classiquement obtenus pour une assemble de nanoparticules. Ils montreront comment le
programme MAUD [1] peut tre utilis pour extraire des informations telles que
lidentification de la phase, les paramtres de maille, la texture, la taille et la forme des
particules.
Typiquement, les donnes de diffraction lectronique sont collectes sur un trs faible
volume diffractant en utilisant un faisceau parallle illuminant une surface de 200m
2
1m
2

contenant un nombre suffisant de particules pour obtenir un diagramme de cercles. La dure
denregistrement des donnes est de lordre de la seconde. Les intensits sont extraites en
utilisant une routine ImageJ implmente dans MAUD. Les informations structurales et
microstructurales sont ensuite obtenues par la mthode de Rietveld de faon identique ce qui
est effectue dans le cadre dune analyse dun diagramme de diffraction des rayons X sur
poudre.
Les rsultats obtenus sur quelques matriaux oxydes seront exposs et, lorsque
disponibles, compars ceux obtenus par diffraction des rayons X. Lidentification de la
phase et lanalyse de la taille moyenne des domaines diffractant seront illustres sur des
nanoparticules de TiO
2
[2] et de Mn
3
O
4
[3]. Le cas dune assemble de nanoparticules
prsentant une forte texturation sera aussi abord avec lexemple dun film de platine dpos
sur silicium. Ces premiers rsultats indiquent la pertinence de cette approche qui dun point de
vue technique est simple mettre en uvre.











[1] L. Lutterotti, Nuclear Inst. and Methods in Physics Research 2010, B268, 334-340.
[2] M.A. Reddy et al., ElectroChem. Com. 2006, 8, 1299-1303.
[3] L. Sicard et al., J. Magn. Magn. Mater. 2010, 322, 2634-2640.
Session Posters 7c Grands Instruments Synchrotron et plateformes en biologie
structurale - (Dveloppements, XFEL, nouveauts)
- 190 -
P56 - PROXIMA 2A Une nouvelle ligne de lumire micro-focus et
accordable en nergie, ddie la bio-cristallographie

Denis Duran
1
, Sebastien Le Couster
1,2
, Frederic Blache
1
, Aurlien Delmotte
1
, Roger Fourme
1
,
Gavin Fox
1
, Rob Meijers
1,3
, Thierry Moreno
1
, Sandra Pierre-Joseph
1
, Jean-Pierre Samama
1
,
Martin Savko
1
& William Shepard
1


1
Synchrotron SOLEIL, l'Orme des Merisiers, Saint Aubin, BP 48, 91192 Gif-sur-Yvette,
France
2
Adresse actuelle: THALES, Domaine Corbeville Thomson, 91400 Orsay, France
3
Adresse actuelle: EMBL c/o DESY, Building 25A, Notkestrae 85, 22603 Hamburg,
Germany

PROXIMA 2A est une nouvelle ligne de lumire Synchrotron SOLEIL, accordable
en nergie, et ddie la micro-cristallographie des macromolcules biologiques. Elle vient
douvrir aux utilisateurs en mars 2013. Sa source est un puissant onduleur U24 sous vide.
Loptique consiste en un monochromateur dit channel-cut en Si[111] refroidi avec lazote
liquide, un miroir pr-focalisant convexe et une paire de miroirs focalisants bimorphes en
configuration Kirkpatrick-Baez. Ce schma innovateur utilise un miroir convexe pour
produire une source secondaire virtuelle afin de refocaliser le faisceau-X 5 m dune large
source horizontale. Les supports des lments optiques sont tudis pour minimiser les effets
des vibrations transmis par lenvironnement. Pour les drives longues, la temprature dans les
cabanes exprimentales est contrle moins de 0.1C prs. Actuellement, en mode
Kirkpatrick-Baez seul, le faisceau-X est focalis 10 m 5 m (HV FWHM) avec un flux
de photons de 110
13
410
11


ph/s selon lnergie (7 15 keV). La station exprimentale
contient un micro-diffractomtre, un dtecteur bidimensionnel, un cryostat, un robot pour
transfrer les chantillons et un dtecteur de fluorescence-X pour les expriences MAD et
SAD. Les utilisateurs grent leurs expriences par linterface MXCuBE [1], qui permet le
centrage de lchantillon, le lancement des collectes, les enregistrements de spectres en
nergie-X et les transferts des chantillons. Les donnes de diffraction-X enregistres sont
dune excellente qualit, et les utilisateurs exploitent le micro-faisceau-X pour chercher la
meilleure zone dans leurs cristaux. Un bilan des premiers rsultats et les perspectives venir
seront prsents.













[1] Gabadinho et al., J. Synchrotron Rad. 2010, 17, 700-707.
Session Posters 7c Grands Instruments Synchrotron et plateformes en biologie
structurale - (Dveloppements, XFEL, nouveauts)
- 191 -
P57 - Etude structurale de MglA, une GTPase rgulatrice de la
polarit bactrienne

Paloma Fernndez-Varela
1
, Armelle Vigouroux
1
, Mahel Zeghouf
1
, Lionel Duarte
1
,
Mathilde Guzzo
2
, Tam Mignot
2
, Jacqueline Cherfils
1


1
Laboratoire d'Enzymologie et Biochimie Structurales (LEBS) Centre de Recherche de Gif
CNRS Btiment 34 - Avenue de la Terrasse 91190 Gif-sur-Yvette
2
Laboratoire de Chimie Bactrienne, Institut de Microbiologie de la Mditerrane, Universit
Aix-Marseille, Marseille, France.

Comment la bactrie modle Myxococcus xanthus contrle-t-elle la direction de ses
mouvements ? Lquipe de Tm Mignot, au laboratoire de Chimie Bactrienne Marseille, a
dmontr rcemment que la polarit est tablie par une protine apparente aux petites
protines G eukaryotes, MglA (1). La polarit du mouvement est dtermine par la
localisation de MglA sous sa forme active, lie au GTP, au ple avant de la bactrie,
cependant quune GTPase activating protein, (GAP), MglB, linactive au ple arrire.
Occasionnellement, la bactrie sarrte et repart en sens inverse : cette inversion est
dclenche par la relocalisation synchronise de MglA et MglB aux ples opposs. Ces
travaux suggrent pour la premire fois que la rgulation de la motilit par les petites
GTPases, bien connue chez les eucaryotes, pourrait tre bien plus largement conserve quil
navait t envisag jusqu ce jour.

Les bases structurales de ce mcanisme ont commenc tre tudies chez une
protine homologue MglA prsente chez Thermus thermophilus, dont la fonction nest pas
connue (2). La forme inactive de MglA
Tt
(MglA
Tt
-GDP) adopte une conformation jamais
encore observe chez les petites GTPases eucaryotes. Cette structure, ainsi que sa
comparaison au complexe MglA-MglB, suggre que MglA pourrait subir un changement
conformationnel de grande amplitude entre sa forme inactive (lie au GDP) et sa forme active
(lie au GTP). Identifier la nature de ces rarrangements chez MglA
Mx
est une tape
importante dans la comprhension des mcanismes molculaires de la motilit et de la polarit
bactrienne.











[1] Zhang Y et al. PLoS Genet 2012, 8(8):e1002872.
[2] Miertzschke M et al. EMBO J. 2011, 30:4185-97.

Session Posters 8a Chiralit, polymorphisme
- 192 -
P58 - Towards the rational synthesis of Chiral Spin-Crossover
compounds

Ahmad Naim,

Elen Duverger-Nedellec, Philippe Guionneau, Patrick Rosa

CNRS, Universit de Bordeaux, ICMCB, 87 Av. Doc. A. Schweitzer, 33608 Pessac, France

e-mail : naim@icmcb-bordeaux.cnrs.fr

Since the discovery of molecular chirality by Pasteur in 1849, and the helical
structure of DNA by Wilkins, Watson and Crick in 1953, chirality has become a
fundamental notion in Chemistry (e.g. enantio selective synthesis of drugs, NLO
properties of chiral materials) and Biology (chirality of DNA, RNA, proteins, the origin of
life). Chirality initially started dealing with the simple case of quaternary carbons; with
transition metals the situation got more complex due to the multiple and high valencies
available to those atoms.
We have engaged towards the rational synthesis of new chiral spin-crossover
materials starting from chiral enantiopure ligands and/or anions, or mixing with achiral
ligands. We identified two potentially useful families of chiral anions; tartaric acid based
anions ( antimonyl and arsenyl tartrate), which were widely used in the past in HPLC
chiral separations, but only sparingly in the synthesis of molecular materials ;
tris(dioxolene)-phosphate(V) and arsenate(V) anions. Lacour (U. Geneva) has synthesized
tetrachlorocatechol-based phosphate chiral anions (TRISPHAT, BINPHAT,) [1], with
great synthetic versatility, and the same helicoidal chirality than hexacoordinated metal
complexes. The more easily synthesized non-chlorinated analogue, the
tris(catecholato)phosphate(V) anion (TRISCAT) was shown to epimerize quickly in
solution [2]. Nevertheless the corresponding TRISCAS arsenate(V) was shown to be
configurationally stable.
We will present the results that we have achieved.


[1] a) J. Lacour, C. Ginglinger, F. Favarger, Tet. Lett. 1998, 39, 4825-4828. b) J. Lacour, S.
Constant, V. Hebbe, Eur. J. Org. Chem. 2002, 3580-3588. c) F. Favarger, C. Goujon-
Ginglinger, D. Monchaud, J. Lacour, J. Org. Chem. 2004, 69, 8521-8524. d) C. Prollier, G.
Bernardinelli, J. Lacour, Chirality 2008, 20, 313-324. e) S. Constant, J. Lacour, Top. Curr.
Chem. 2005, 250, 1-41.
[2] J. Cavezzan, G. Etemad-Moghadam, M. Koenig, A. Klaebe, Tet. Lett. 1979, 20, 795-798
Session Posters 8a Chiralit, polymorphisme
- 193 -
P59 - Caractrisation structurale de co-cristaux pharmaceutiques
obtenus par cristallisation dun mlange fondu.

Rachel Tabaroni
1
, Mathieu Marchivie
1
, Stphane Massip
1
, Clmence Neurohr
2
et Pascale
Subra-Paternault
2


1
Universit Bordeaux Segalen, Pharmacochimie, CNRS FRE 3396, F-33000 Bordeaux,
France
2
Universit Bordeaux, CBMN-UMR5248, Alle Geoffroy St Hilaire, F-33600 Pessac, France

Les proprits des matriaux ltat solide sont largement dpendantes de
larrangement tridimensionnel adopt par les molcules. Concernant les principes actifs (PA),
il est bien connu que les proprits comme la stabilit, la fluidit, lhygroscopie ou la
biodisponibilit, sont dpendantes de larrangement des molcules dans le solide. Ainsi,
diffrentes stratgies ont t proposes pour modifier et contrler de telles proprits
notamment par la formation de sels, de polymorphes, dhydrates, de solvates et plus
rcemment de co-cristaux. Les co-cristaux sont des complexes molculaires forms de deux
drivs diffrents (ou plus) cristallisant au sein de la mme maille cristalline. Dans le domaine
pharmaceutique, de tels systmes sont prpars partir dun PA et dune seconde molcule
favorisant la formation du co-cristal appel : co-former . Alors que le premier co-cristal fut
dcouvert en 1844,
[1]
ce nest que rcemment que les co-cristaux sont apparus comme des
composs prometteurs dans le dveloppement du mdicament afin de matriser la solubilit,
rduire lhygroscopie, contrler le polymorphisme cristallin et bien dautres paramtres.
[2]
Les
techniques de croissance cristalline les plus couramment utilises sont la recristallisation
partir de solvants, partir dun mlange fondu ou, de faon plus originale, par prcipitation en
milieu CO
2
supercritique. Dans cette communication, nous dcrivons un co-cristal form
partir dun mlange actazolamide / nicotinamide par recristallisation classique et partir
dun mlange quimolaire fondu. Si un hydrate de ce co-cristal tait dj dcrit dans la
littrature
[3]
, le driv anhydre pressenti lors de ces travaux navait pas t caractris
structuralement. La technique utilise ici pour la formation de ce compos nous a permis de
faire crotre des cristaux de taille et de qualit suffisante pour une tude par diffraction des
rayons X sur monocristaux. Les rsultats confirment la stchiomtrie propose et nous
autorisent une comparaison dtaille de larrangement cristallin des deux pseudo-
polymorphes.

[1] F. Wohler, Annalen Chem. Pharm., 1844, 51, 145-163; G. P. Stahly, Crystal Growth &
Design, 2009, 9, n 10, 4212-4229
[2] N. Rodriguez-Hornedo, Molecular Pharmaceutics, 2007, 4, n 3, 299-300; N. A.
Meanwell, Annual Reports in Medicinal Chemistry, 2008, 43, 373-404; N. Shan and M. J.
Zaworotko, Drug discovery today, 2008, 13, n 9-10, 440-446; D. J. Good and N. Rodriguez-
Hornedo, Crystal Growth & Design, 2009, 9, n 5, 2252-2264; N. Schultheiss and A.
Newman, Cryst Growth Des, 2009, 9, n 6, 2950-2967; N. Qiao, M. Li, W. Schlindwein, N.
Malek, A. Davies and G. Trappitt, Int J Pharm, 2011, 419, n 1-2, 1-11
[3] J. I. Arenas-Garcia, D. Herrera-Ruiz, K. Mondragon-Vasquez, H. Morales-Rojas and H.
Hopfl, Crystal Growth & Design, 2010, 10, n 8, 3732-3742
Session Posters 8a Chiralit, polymorphisme
- 194 -
P60 - Polymorphisme du 2-ChloroAdamantane

Philippe Negrier
1
, Maria Barrio
2
, Josep Lluis. Tamarit
2
, Denise Mondieig
1


1
Laboratoire Ondes et Matire d'Aquitaine, UMR 5798 au CNRS-Universit Bordeaux I, 351,
cours de la Libration, 33405 Talence Cedex, France.
2
Grup de Caracteritzaci de Materials, Department de Fsica I Enginyeria Nuclear, ETSEIB,
Diagonal 647, 08028 Barcelona, Universitat Politcnica de Catalunya, Catalonia

Les molcules organiques de forme pseudo-sphriques comme l'adamantane
prsentent souvent des transitions d'une phase solide ordonne une phase dsordre
orientationel dite phase "plastique"
[1-3]
. La substitution en position 2 d'un atome d'hydrogne
par le chlore rduit la symtrie (Cs) et conduit un polymorphisme diffrent.
[4-6]

Nous avons tudi le 2-ChloroAdamantane par diffraction des RX sur poudre en
fonction de la temprature et par analyse enthalpique diffrentielle pression atmosphrique.
Quatre phases solides ont t identifies dont trois phases avaient t mises en vidence par
spectroscopie Raman et IR
[7
]. Nous prsenterons les structures de ces phases rsolues partir
de mesures par diffraction sur poudre l'aide du diffractomtre CPS 120 INEL (en mode
transmission et gomtrie Debye-Scherrer et CuK
1
).


















[1] Disorder in Crystals, N. G. Parsonage and L.A.K. Staveley, Clarendon Press, Oxford,
1978.
[2] J. P. Amoureux and M. Foulon, Acta Cryst. 1970, B43, 470.
[3] J. P. Amoureux, M. Bee and J.C. Damien, Acta Cryst. 1980 ,B36, 2633
[4] T. Clark, T.M.O. Knox, H. Mackle and M.A. Mckervey, J. Chem.Soc. Faraday. Trans.,
1977, 73, 1224.
[5] A.B. Bazyleva, A.V. Blokin, G.J. Kabo, A.G. Kabo, Y.U. Paulechka, J. Chem.
Thermodynamics, 2005, 37, 643.
[6] M. Foulon and C. Gors, Acta Cryst. 1988, B44, 156.
[7] M.R. Parolin, N.T. Kawaii, I. S. Butler and D.F. R. Gilson, Can. J. Chem. 1988, 66, 1973.
Session Posters 8a Chiralit, polymorphisme
- 195 -
P61 - Conformation et polymorphisme du 1,1,2,2-tetrachlorothane
(C
2
H
2
Cl
4
)

Ph. Negrier
1
, M. Barrio
2
, M. Zuriaga
3
, S.C. Prez
3
, J.Ll. Tamarit
2
and D. Mondieig
1


1
Laboratoire Ondes et Matire d'Aquitaine, UMR 5798 au CNRS-Universit Bordeaux I, 351,
cours de la Libration, 33405 Talence Cedex, France.
2
Grup de Caracteritzaci de Materials, Department de Fsica I Enginyeria Nuclear, ETSEIB,
Diagonal 647, 08028 Barcelona, Universitat Politcnica de Catalunya, Catalonia
3
Facultad de Matemtica, Astronoma y Fsica, Universidad Nacional de Crdoba and
IFEG-CONICET, Ciudad Universitaria, X5016LAE Crdoba, Argentina

La molcule de 1,1,2,2-tetrachlorothane adopte deux types de conformations: trans
(antipriplanaire) et gauche (synclinale). La diffrence d'nergie entre les deux conformations
est faible (<1 kcal mol
-1
)
[1,2]
. Ainsi, le polymorphisme observ sous diffrentes conditions de
pression et de temprature est principalement li aux interactions intermolculaires.
Il a dj t tabli qu' pression atmosphrique, la phase stable | est orthorhombique (P2
1
2
1
2
1
,
Z=8, Z=2) et prsente uniquement des molcules en conformation gauche. A haute pression,
la structure d'une phase monoclinique (P2
1
/c, Z=2, Z=0.5) comportant deux molcules en
conformation trans a t dtermine.
[3]

Ce travail prsente une nouvelle phase solide dans laquelle 2 conformations gauche
coexistent. Cette phase mtastable o, obtenue par recristallisation de la phase liquide
surfondue, se transforme de manire irrversible en phase stable | lorsque l'on procde une
lvation de temprature . Nous prsenterons les relations thermodynamiques entre les
diffrentes phases condenses et les caractristiques structurales de la phase o.













[1].J. E. Mark and C. Sutton, J. Am. Chem. Soc. 1972, 94, 1083.
[2] (a) J. R. Thomas and W. D. Gwinn, J. Am. Chem. Soc. 1949, 71, 2785; (b) R. J. Abraham
and K. Parry, Chem. Commun. 1969, 17, 963; (c) R. J. Abraham and K. Parry, J. Chem. Soc.
B, 1970, 539.
[3] M. Bujak, D. Blser, A. Katrusiak, R. Boese, Chem. Commun. 2011, 47, 8769.
Session Posters
- 196 -
P62 - Reconnaissance de surfaces protiques par des foldamres
aromatiques.

Jrmie Buratto
1
, Batrice Langlois dEstaintot
1
, Cinzia Colombo
1,2
, Lucile Fischer
1,2
,
Bernard Gallois
1
et Ivan Huc
1,2


1
CBMN UMR 5248, Universit Bordeaux1, Bt B14, Alle Geoffroy St Hilaire, 33600 Pessac
France.
2
IECB, 2 Rue Robert Escarpit, 33607 Pessac France.

Les interactions protine - protine jouent un trs grand rle dans les processus
biologiques, et reprsentent des cibles thrapeutiques de choix pour le traitement de maladies.
Parmi les quelques 22 000 protines humaines, 80% dentre elles seraient actives sous forme
de complexes. La conception rationelle de molcules antagonistes, susceptibles de reconnatre
spcifiquement des surfaces protiques tendues, permettrait dinhiber ces interactions [1].
Les foldamres aromatiques prsentent toutes les caractristiques ncessaires pour accomplir
un tel but [2] : i) structures stables mimant celles (hlices , brins ) rencontres dans les
protines, ii) fonctionnalisation importante, iii) obtention par synthse sur support solide de
molcules de grande taille, iv) cristallisation aise.

Dans le cadre du contrat europen FOLDAPPI (FOLDamers Against Protein-Protein
Interaction, Action Marie Curie Industry-Academia Partnerships and Pathways, Programme
FP7-People-2007), loptimisation de tels foldamres sappuie sur des outils structuraux
(diffraction des rayons X et modlisation molculaire). Les foldamres tudis sont constitus
de sous-units quinolines. Ils adoptent une structure en hlice [2]. Lune des protines cibles
choisie pour dmontrer linteraction protine - foldamre est lanhydrase carbonique humaine
(HCA II). Elle a t choisie car sa structure a t trs tudie et quelle offre la possibilit
dancrer le foldamre sa surface par lintermdiaire dun inhibiteur de forte affinit
(Kd ~ 1 nM).

Nous prsentons diffrents foldamres tudis ainsi que leur facult adopter une
hlicit donne en prsence de la protine (expriences de CD induit).Aprs identification du
meilleur candidat, un premier complexe a t cristallis. Sa structure a t rsolue 3,2 .
Larrangement molculaire rvle lexistence de dimres induits essentiellement par des
interactions foldamre foldamre. De nouvelles tudes (DLS, CD) en fonction de la nature
et de la position des chanes latrales du foldamre sont en cours afin de favoriser les
interactions foldamre protine au sein dun mme complexe.




[1] Cochran et al., Chem. Biol. 2000, 7(4), R85-94.
[2] Gillies et al., J. Org. Chem. 2010, 46, 214.
Session Posters
- 197 -
P63 - Etude structurale dune flavoprotine fluorescente capable de
gnrer une espce ractive de loxygne

Cline Lafaye
1
, David Von Stetten
2
, Marjolaine Noirclerc-Savoye
1
, Xiaokun Shu
3
, Antoine
Royant
1,2

1
Institut de Biologie Structurale Jean-Pierre Ebel UMR5075
-
CNRS-CEA-UJF, 41 Rue Jules
Horowitz, 38027 Grenoble, France.
2
Structural Biology Group, European Synchrotron Radiation Facility, 6 Rue Jules Horowitz,
38043 Grenoble, France,

3
Department of Pharmaceutical Chemistry, University of California San Francisco, California.

Lutilisation de la microscopie lectronique en corrlation avec la microscopie de
fluorescence permet la localisation protique avec une trs haute rsolution spatiale. Un des
challenges majeurs de cette technique corrlative reste le marquage spcifique des protines.
Cela ncessite le dveloppement dtiquettes fluorescentes, codes gntiquement pour une
visualisation in situ au sein des cellules ou des tissus, et capables de gnrer une espce
ractive de loxygne, loxygne singulet. La flavoprotine fluorescente miniSOG se rvle
tre un excellent candidat pour rsoudre ce problme [1]. miniSOG (pour Singlet Oxygen
Generator de taille minimale), est une petite (106 rsidus) protine fluorescente capable de
gnrer efficacement de loxygne singulet aprs illumination par la lumire bleue. Dans les
tissus fixs, loxygne singulet gnr par photo illumination permet de polymriser
localement la petite molcule diaminobenzidine en un prcipit facilement visible par
microscopie lectronique [1]. Dans ce poster je prsente lavancement de nos tudes
structurales de la protine miniSOG destine comprendre ses proprits de gnration
doxygne singulet et en proposer ventuellement une version amliore.















[1] Shu X, et al. PLoS Biol 2011, 9(4.): e1001041
Session Posters
- 198 -
P64 - Protection/diversion par C1q linterface hte/pathogne

Christophe P. Moreau
1,2


1
Institut de Biologie Structurale, Grenoble
2
Universit Joseph Fourier, Grenoble

Limmunit inne constitue une premire ligne de dfense dont laction est immdiate
ds que les barrires physiques naturelles (muqueuses, pidermes) ont t franchies. Elle
comprend un systme majeur de dfense nomm complment. Nous nous intressons la
protine multi-fonctionnelle C1q. Sa fonction dite classique est lactivation de la cascade
protolytique du complment qui permet dliminer des complexes immuns, gnre des
signaux inflammatoires et instruit dautres lments de limmunit. La seconde fonction est
llimination rapide des cellules apoptotiques sans mission de signaux inflammatoires. Pour
cela, C1q reconnat diffrents ligands exposs spcifiquement en surface de ces cellules
comme la phosphatidyl-srine (PS, signal eat me ), la calrticuline [1], ou la GAPDH [2].
De manire surprenante, des signaux similaires peuvent tre retrouvs en surface de
certains pathognes. En effet, la CRT et la PS sont exprimes la surface de Trypanosoma
Cruzi, un parasite responsable de la maladie de Chagas. Ici, linteraction C1q/calrticuline
entraine une inactivation du complment et favorise la pntration du parasite, suggrant une
stratgie parasitaire de type cheval de Troie [3]. En obtenant la structure de la calrticuline
de ce parasite, seule ou en complexe avec les ttes globulaires de C1q, nous esprons
dcouvrir des particularits permettant de dvelopper des thrapies contre ces pathognes en
collaboration avec la facult de mdecine de Santiago au Chili.
Lorsque la GAPDH exprime en surface des cellules apoptotiques humaines est
reconnue par C1q ceci nactive pas le complment, tandis que son homologue la surface des
Pneumocoques conduit lactivation du complment [2]. La rsolution rcente de la structure
de la GAPDH de pneumocoque nous a donn des premiers indices pour expliquer ces
diffrences, que nous souhaitons confirmer en obtenant la structure du complexe form entre
la GAPDH et C1q.







[1] Padassi et al., J.Mol.Biol., 2011, 408(2), 277-90
[2] Terrasse et al., J.Mol.Biol., 2012, 287(51), 42620-33
[3] Ramirez et al., Mol. Immunol., 2012, 52(3-4), 133-40
Session Posters
- 199 -
P65 - Etude structurale et des proprits magntiques et lectriques
des provskites doubles couches des manganates La
2-x
Bi
x
CaMn
2
O
7

(avec x=1)

Mhamed Oubla
1
,
Mohammed Lamire
1*
, Hassan Lassri
2
, El-Kebir Hlil
3


1
Laboratoire de Physico-Chimie des Matriaux Inorganiques, Facult des Sciences
An-Chock, Universit Hassan II, B.P. 5366 Marif, Casablanca, Morocco,
2
Laboratoire de Physique des Matriaux, Micro-lectronique, Automatique et Thermique,
Facult des Sciences An-Chock, Universit Hassan II, B.P. 5366 Marif, Casablanca,
Morocco,
3
Institut Nel, CNRS - Universit J. Fourier, BP 166, 38042 Grenoble, France.
*Corresponding author email: lamiremed@gmail.com

Loxyde provskite couches LaCaBiMn
2
O
7
a t prpar par la mthode
conventionnelle de co-prcipitation dans une solution aqueuse. Les tudes de diffraction des
rayons X suggrent que cette phase cristallise dans le groupe despace I4/mmm du systme
quadratique. Les proprits magntiques montrent que les interactions ferromagntiques sont
dominantes et que lion manganse est prsent au sein de cette phase dans des tats de valence
mixtes Mn
3+
et Mn
4+
. La courbe de thermo-aimantation obtenue obit la loi de Bloch. La
constante de rigidit de spin D et la valeur approximative de linteraction dchange J
Mn-Mn

ont t estimes partir des rsultats exprimentaux. La courbe de variation de la rsistivit
lectrique en fonction de la temprature montre que le compos prsente une transition Metal-
Isolant (M-I) au voisinage sa temprature de Curie (T
c
).


Session Posters
- 200 -
P66 - Caractrisation structurale de la rgion centrale de la protine
pUL36 du virus de lHerps Simplex de type 1

Nathalie Scrima, Stphane Bressanelli et Stphane Roche

Laboratoire de Virologie Molculaire et Structurale, CNRS, Gif-sur Yvette


Les virus de la famille des herpsviridae tels que le virus de lherps simplex de type
1 (HSV1) ont une structure caractristique en quatre couches. Le gnome viral est enferm
dans une capside icosadrique elle-mme entoure dun tgument protique et enfin dune
enveloppe lipidique. Le tgument se subdivise lui-mme en deux sous-composants : le
tgument interne regroupe les protines interagissant fortement avec la capside tandis que les
protines de tgument externe se dtachent aisment de la capside.
Deux des protines du tgument interne, UL36 et UL37 forment un complexe de
stchiomtrie inconnue. Elles remplissent des rles multiples au cours du cycle viral. Elles
sont ainsi impliques dans le transport des capsides virales, dans linjection du matriel
gntique viral dans le noyau ou encore dans lassemblage de nouvelles particules virales.
Notamment, UL36 interagit avec la protine UL25 localise aux sommets de la capside ainsi
quavec la protine de tgument externe UL48, ce qui suggre quelle traverse le tgument de
part en part. UL36 est une protine de 337 kDa et lexception de son domaine N-terminal
aucune information structurale nest disponible, ce qui rend son tude dlicate. Notamment,
les domaines fonctionnels de la protine restent inconnus.
Nous sommes parvenus produire et purifier divers fragments dUL36 de HSV1
reprsentant au total un tiers de la protine. Des expriences de gel-filtration indiquent que ces
fragments sont tous trs allongs et quils sont probablement tous capables de former des
oligomres, ce qui suggre quils pourraient faire partie de la tige de la protine traversant
le tgument. Nous sommes parvenus rsoudre la structure cristallographique dun de ces
fragments. Celui-ci forme un dimre antiparallle trs allong. La prsence de contact
cristallographique trs tendu suggre quil pourrait former des oligomres plus instables
dordres suprieurs. Les consquences de ces donnes pour lassemblage des particules
virales seront discutes.

Session Posters
- 201 -


P67 - Evolution structurale en fonction de la temprature du compos
LiNbO
3

Charef TABTI, Abdelkader CHOUAIH & Fodil HAMZAOUI

Laboratoire SEA2M, Dpartement de Chimie
Facult des sciences et technologie, Universit de Mostaganem BP. 188,
Mostaganem 27000 , Algrie.

A comparative study was made by X-ray diffraction on a single crystal of lithium niobate
(LiNbO
3
) at low temperature (120K) and room temperature (293K). LiNbO
3
is a ferroelectric
compound particularly interesting for applications in nonlinear optic field. After a recording
of very good quality of X-ray diffraction spectrum, we used Blessing formalism for the
reduction and the processing raw data. Structure refinement was carried out by program
SHELXL. The results of the refinement led to a reliability factor of about 6% to T = 293K
and of 3% to T = 120K. The structure evolution study of lithium niobate according to the
temperature, made it possible to highlight the compound stability in the invested temperature
range. The found results show a light displacement (about 0,01) of oxygen atoms around
the connection Li Nb.


Une tude comparative a t faite par diffraction des rayons X sur un monocristal de niobate
de lithium (LiNbO
3
) basse temprature (120K) et temprature ambiante (293K) . Le
LiNbO
3
est un compos inorganique ferrolectrique particulirement intressant pour des
applications dans le domaine de loptique non linaire. Aprs un enregistrement de trs bonne
qualit du spectre de diffraction X, nous avons utilis le formalisme de Blessing pour la
rduction et le traitement des donnes brutes. Laffinement de la structure a t ralis par le
programme SHELXL. Les rsultats de laffinement ont conduit un facteur de reliabilit de
lordre de 6% T = 293K et de 3% T = 120K. Ltude de lvolution de la structure du
niobate de lithium en fonction de la temprature, a permis de mettre en vidence la stabilit du
compos dans le domaine de temprature investi. Les rsultats trouvs montrent un lger
dplacement (de lordre de 0,01) des atomes doxygne autour de la liaison Li Nb.




Session Posters
- 202 -
P68 - Etude structurale de deux nouveaux composs de coordination
supramolculaires base doxalate et de 2-picolylamine.

Patrice Tsobnang Kenfack
1,2
, Simon Ponou
3
, Emmanuel Wenger
2
, Claude Lecomte
2
, John.
Ngolui Lambi
3


1
Dpartement de Chimie Inorganique, Universit de Yaound I, Facult de Sciences, BP 812,
Yaound, Cameroun.;
2
CRM2, UMR 7036 CNRS, Universit de Lorraine, Facult des Sciences et Technologies, BP 70239,
54506 Vandoeuvre-ls-Nancy, France.;
3
Dpartement de Chimie, Ecole Normale Suprieure de Yaound, BP 47 Yaound, Cameroun.

Le design et la synthse des MOF Metal Organic Framework suscitent depuis
quelques annes un intrt considrable dans la chimie supramolculaire et dans lingnierie
cristalline en raison de leurs potentielles applications dans le magntisme, la catalyse,
loptique non linaire et la conductivit lectrique [1,2]. Nous sommes intresss par la
rationalisation de la synthse des composs de coordination htromtalliques
supramolculaires bases sur les interactions intermolculaires (liaisons hydrognes,
interaction ion diple, interaction - stacking etc.) [3]. Nous prsentons ainsi dans cette
communication deux nouveaux composs du genre, base des ligands oxalate et 2-
aminomthylpyridine (amp) rcemment obtenus: [Co(amp)
3
][Cr(C
2
O
4
)
3
].6H
2
O et
[Cu
2
(amp)
2
Cl][Cr(C
2
O
4
)].H
2
O (Figure 1). Les interactions intermolculaires trs
directionnelles mises en jeu dans la formation de ces composs ont t particulirement
analyses au cours des tudes structurales que nous avons ralises par diffraction de rayons
X sur monocristal. Ces complexes htromtalliques prsentent des caractristiques
intressantes pour le magntisme molculaire.


Figure 1 : Units asymtriques des composs Co(pico)
3
Cr(C
2
O
4
)
3
.6H
2
O

(gauche)

et
Cu
2
(pico)
4
Cl(Cr(C
2
O
4
)
3
.H
2
O (droite)


[1] Jean N., Corado D., Justin N., Claudio P., Eleuterio A., Simon P. Transition Met chem.
2013, 38, 21-29.
[2] Takanori O., Naoya K., Masakatsu S. Chem., Int. Ed. 2013, 52(24), 61966201.
[3] Patrice T. K., Simon P., Emmanuel W., Claude L., John. N. L. (en prparation)

Nous remercions grandement lUICr pour son Initiative Africaine et le Service de
Coopration dAction Culturelle (SCAC) de lAmbassade de France au Cameroun pour le
financement de ce travail.

- 203 -
P69 - Molecular Jewellery

Aline Lacoudre et Nol Pinaud

CESAMO, ISM, UMR5255, Universit Bordeaux1, 351 cours de la Libration, 33405 Talence
Cedex

La cristallogense est un art subtil et phmre o la patience est reine. Cet Art
prsomptueux, qui consiste assister Dame Nature dans la ralisation de structures
architecturales molculaires, nous livre parfois un spectacle oculaire en faire plir Van
Cleef & Arpels !

Quils diffractent ou non, incolores ou enlumins, macls ou sublimement sculpts,
translucides ou opaques, les cristaux nous procurent un plaisir visuel que lon transpose
aussitt en plaisir partag.

Nous proposons au CESAMO de lier cet Art celui de la photographie en ralisant
des clichs de tous les cristaux que nous mettons au monde dans le service. Nous vous
offrons ici un instant de flnerie, o formes, couleurs et lumire crent un pome graphique,
afin de vous procurer le plus simple des plaisirs : le plaisir des yeux.


- 204 -
P70 - Les quasicristaux : chronologie dune dcouverte


Marianne Quiquandon, Denis Gratias

LEM CNRS/ONERA ; 29 avenue de la division Leclerc, 92322 CHATILLON CEDEX


Suite lattribution du prix Nobel de chimie 2011 Daniel Shechtman pour la
dcouverte des quasicristaux [1-2], nous prsenterons le contexte scientifique de lpoque via
lhistorique des principaux articles sur le sujet [3-11] prcurseurs de cette dcouverte. Nous
verrons comment, malgr la tenace opposition dune majorit de cristallographes amricains,
les concepts quasicristallins se sont rapidement dvelopps pour rejoindre, en les compltant,
ceux des phases incommensurables [12-16] et ont donn corps un corpus maintenant bien
structur de la thmatique Apriodicit au coeur du dbat sur une redfinition attendue de la
notion de cristal.










[1] D. Shechtman & I. Blech, Met. Trans. 16A, 1005 (1985).
[2] D. Shechtman, I. Blech, D. Gratias & J. W. Cahn, Phys. Rev. Lett. 53 (20), 1951-1953
(1984).
[3] E. Esclangon, Thse la facult des sciences de Paris : Fonctions Quasi-Priodiques
(1904).
[4] H. Bohr, Acta Math. 45, 29 (1924); Acta Math. 46, 101 (1925); Acta Math. 47, 237 (1926).
[5] A. S. Besicovitch, Almost periodic functions, Cambridge (1932).
[6] Y. Meyer, lectures notes in mathematics n117, Springer (1970); algebraic numbers and
harmonic analysis, North Holland (1972).
[7] R. Penrose Bull Inst Maths its Appl 10 n7/8 266 (1974); ibid. Math. Intelligencer 2 32
(1979).
[8] P. M. de Wolff Acta Cryst. A30, 777 (1974); Acta Cryst. A33, 493 (1977).
[9] A. Janner & T. Janssen, Phys. Rev. B15, 643 (1977); Physica (Utrecht) 99A, 47 (1979).
[10] M. Gardner Sci. Amer. 236, n110 (1977).
[11] A. L. Mackay, Sov. Phys. Crystallogr. 26 (5), 517 sept-oct (1981); ibid. Physica 114A,
609 North-Holland Publishing Co. (1982).
[12] D. Levine & P.J. Steinhardt, Phys. Rev. Lett. 53 (26), 2477-2480 (1984).
[13] M. Duneau & A. Katz, Phys. Rev. Lett. 54, 2688 (1985).
[14] P. A. Kalugin, A. Y. Kitaev & L. S. Levitov, J. Phys. Lett. 46, L-601 (1985).
[15]

V. Elser, Phys. Rev. Lett. 54, 1730 (1985).
[16] P. Bak, Phys. Rev. Lett. 56, 861 (1986).

- 205 -
P71 - Rsolution de la structure cristalline du DL-menthol sur
monocristal et criblage du polymorphisme de lnantiomre et du
compos racmique.

Yohann Corvis
1
, Philippe Ngrier,
2
Stphane Massip,
3
Mathieu Marchivie,
3
Philippe Espeau
1


1
Laboratoire Physico-Chimie Industrielle du Mdicament, EA 4066, Universit Paris Descartes, Sorbonne Paris
Cit, Facult des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, 4 Avenue de lObservatoire, 75 006 Paris,
2
Univ. Bordeaux, LOMA, UMR 5798, 33 400 Talence, France, and CNRS, LOMA, UMR 5798, 33 400 Talence,
France,
3
Univ. Bordeaux, Pharmacochimie, FRE CNRS 3396, 33 000 Bordeaux, France, and CNRS, Pharmacochimie,
FRE CNRS 3396, 33 000 Bordeaux, France.

Nos prcdents travaux, qui ont montr quun driv amide pouvait induire un
polymorphisme de lnantiomre lvogyre du menthol [1], nous ont conduit aux constats
suivants : (i) la structure cristalline du DL-menthol, dcrit comme tant un pseudo-racmate
[2], tait non rsolue, (ii) depuis prs dun sicle, date laquelle le polymorphisme du L-
menthol a t mis en vidence [3], aucune tude quantitative des polymorphes de
lnantiomre na t ralise, alors que la structure cristalline de sa forme stable a t rsolue
(systme trigonal, P3
1
[4]). Le polymorphisme du DL-menthol est, quand lui, non lucid
jusqu ce jour.

La structure cristalline du DL-menthol nayant pu tre dtermine partir des clichs
RX de poudres, la mthode de sublimation/condensation a t adapte au laboratoire de
manire optimiser la croissance cristalline du compos racmique. Ainsi, nous avons pu
rsoudre la structure sur monocristal (systme triclinique P, Z = 3). Des expriences
danalyse thermique et de diffraction des rayons X sur poudres ont t menes dans le but de
caractriser les polymorphes du menthol, de dterminer leurs conditions de stabilit et
daccder aux cintiques de transition de phases. Les phases stables, pression et temprature
ordinaires, ont t dnommes o. Les rsultats montrent que les polymorphes mtastables |
du L- et du DL-menthol cristallisent dans une maille triclinique P1. La transition | o pour
le L-menthol implique une modification structurale de sa maille (triclinique trigonale), alors
que pour le DL-menthol, cette transition ne saccompagne daucun changement de systme
cristallin. Pour aller plus loin dans ces tudes, les interactions entre le L- et le D-menthol ont
t apprhendes par dtermination des diagrammes de phases stable et mtastables.

La complmentarit des approches thermodynamique et cristallographique permet de
dmontrer sans ambigut que le menthol racmique est un racmate alors que les
polymorphes mtastables correspondants sont des pseudo-racmates [5].

[1] Y. Corvis, P. Ngrier, M. Lazerges, S. Massip, J.-M. Leger, P. Espeau, J. Phys. Chem. B 2010, 114, 5420-5426.
[2] M. Kuhnert-Brandstaetter, R. Ulmer, L. Lanaghammer, Arch. Pharm. 1974, 307, 497-503.
[3] F. E. Wright, J. Am. Chem. Soc 1917, 39, 1515-1524.
[4] P. Bombicz, J. Buschmann, P. Luger, N. X. Dung, C. B. Nam, Z. Kristallogr. 1999, 214, 420-423.
[5] Y. Corvis, P. Ngrier, S. Massip, J.-M. Leger, P. Espeau, CrystEngComm 2012, 14, 7055-7064.

- 206 -
P72 - News in Open structure and property Databases
Daniel Chateigner
1,*
, Saulius Grazulis
2
, Justas Butkus
2
, Andrius Merkys
2
, Adriana
Dakevi
2
, Olivier Prez
1
, Giancarlo Pepponi
3
, Luca Lutterotti
1,4
, Miguel Quirs Olozbal
5
,
Armel Le Bail
6
, Robert Downs
7
, Peter Moeck
8
, Alexandre F.T. Yokochi
9


1
CRISMAT-ENSICAEN-CNRS, IUT Caen, Normandie Universits, Caen, France,
2
Inst. of Biotechnology, Vilnius, Lithuania,
3
Fundazione Bruno Kessler, Trento, Italy,
4
Dept. of Industrial Engineering, Univ. of Trento, Italy,
5
Dept de Qumica Inorgnica, Univ. de Granada, Spain,
6
Lab des Oxydes et Fluorures, CNRS and Univ. du Maine, Le Mans, France,
7
Dept of Geosciences, Univ. of Arizona, Tucson, Arizona, USA,
8
Portland State Univ., Dept of Physics, Portland, Oregon, USA,
9
School of Chemical, Biological and Environmental Engineering, Oregon State Univ.,
Corvallis, Oregon, USA

The COD project (abbreviated from the "Crystallography Open Database",
http://www.crystallography.net/) aims at collecting in a single open access database all
organic, inorganic and metal organic structures [1]. It grew to more than 235000 cif files in
the past 10 years. Since December 2007 the main database server is maintained and new
software is developed in the Vilnius University Institute of Biotechnology. Structure file
harvesting is now routinely operated and automated for a growing number of publishers'
journals [2]. Registered users can deposit new data into the database, either form the previous
publications or as personal communications. The deposition software performs rigorous
checks of syntax and semantics, thus ensuring high quality depositions. The search engine
acquired new capabilities, and COD records can be viewed on-line or downloaded. For
massive data mining, COD permits downloads and updates of the whole database using
Subversion, Rsync or HTTP protocols. The ease of access to COD data has spurred the use of
this resource for software testing [3], teaching [4], and research [5].
For the powder diffraction community, COD is recently used for open Full-Pattern
Search-Match (cod.iutcaen.unicaen.fr). It allows phase quantification from x-rays, neutron
and electron powder patterns, with high or medium resolution instruments, provided the
structures are already in COD. This tool is particularly suited for nanocrystalline powders in
which severe line broadening appears precluding phase identification from only peak maxima.
COD-derived databases are offered for software produced by many diffractometer vendors. In
addition to COD, search match can be done against its sister database, PCOD, that contains
structures predicted by the GRINSP program [6]. Recently launched the new TCOD database
collects structures optimized from COD using first-principles calculations. The open nature of
the COD permitted numerous mirrors around the globe [7] and specifically tailored COD
database variants. Meanwhile, the Material Properties Open Database [8] collects tensor
properties. This latter sister is on a demanding growth.
1. Graulis, S.; Chateigner, D.; Downs, R. T.; Yokochi, A. F. T.; Quirs, M.; Lutterotti, L.; Manakova, E.; Butkus,
J.; Moeck, P. & Le Bail, A. (2009). Crystallography Open Database -- an open-access collection of crystal
structures, Journal of Applied Crystallography 42 : 726-729.

- 207 -
2. Graulis, S.; Dakevi, A.; Merkys, A.; Chateigner, D.; Lutterotti, L.; Quirs, M.; Serebryanaya, N. R.;
Moeck, P.; Downs, R. T. & Le Bail, A. (2012). Crystallography Open Database (COD): an open-access
collection of crystal structures and platform for world-wide collaboration, Nucleic Acids Research 40 : D420-
D427.
3. Grosse-Kunstleve, R. & Gildea, R. (2011). Computational Crystallography Initiative: COD stats,
http://cci.lbl.gov/cod_stats/ (retrieved 2013.01.31).
4. Moeck, P. (2004). EDU-COD: Educational Subset of COD,
http://nanocrystallography.research.pdx.edu/search/edu/ (retrieved 2013.01.31).
5. First, E. L. & Floudas, C. A. (2013). MOFomics: Computational pore characterization of metalorganic
frameworks, Microporous and Mesoporous Materials 165 : 32-39.
9 L. Lutterotti, H. Pilliere, C. Fontugne, P. Boullay, D. Chateigner (2013), in preparation
6. Le Bail, A. (2005). Inorganic structure prediction with it GRINSP, Journal of Applied Crystallography 38 :
389-395.
7. Quirs-Olozbal, M. (2006). COD Mirror of Granada University, http://qiserver.ugr.es/cod/. Moeck, P.
(2007). Crystallography Open Database Mirror, http://nanocrystallography.research.pdx.edu/search/codmirror/.
Graulis, S. (2007). COD Mirror in Vilnius, http://cod.ibt.lt/. Chateigner, D. (2010). Crystallography Open
Database Mirror at ENSICAEN, http://cod.ensicaen.fr/.
8 G. Pepponi, S. Grazulis, D. Chateigner (2012). MPOD: a Material Property Open Database linked to structural
information. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research B 284, 2012, 10-14.
http://www.materialproperties.org/

- 208 -
P73 - Structure de FemX
wt
en complexe avec un conjugu peptidyl-
ARN.

Ins Li de la Sierra-Gallay,
2
Matthieu Fonvielle,
1
Maxime Lecerf,
1
Delphine Patin,
3
Dnia
Mellal,
4
Didier Blanot,
3
Herman van Tilbeurgh,
2
Mlanie Ethve-Quelquejeu,
4
Michel Arthur
1

1
Centre de Recherche des Cordeliers, LRMA, Equipe 12, Universit Pierre et Marie Curie
Paris 6, UMR S 872, Paris, F-75006 France ; Universit Paris Descartes, Sorbonne Paris
Cit, UMR S 872, Paris F-75006 France ; INSERM, U872, Paris, F-75006 France
2
Fonction et Architecture des Assemblages Macromolculaires, Institut de Biochimie et de
Biophysique Molculaire et Cellulaire, Universit Paris-Sud, UMR 8619, Orsay, F-91405,
France; CNRS, UMR 8619, Orsay, F-91405, France
3
Laboratoire des Enveloppes Bactriennes et Antibiotiques, Institut de Biochimie et de
Biophysique Molculaire et Cellulaire, Universit Paris-Sud, UMR 8619, Orsay, F-91405,
France; CNRS, UMR 8619, Orsay, F-91405, France
4
Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, Universit
Paris Descartes, UMR 8601, Paris, F-75005; CNRS UMR 8601, Paris, F-75005 France

Les aminoacyl transfrases de la famille Fem interviennent dans la voie de synthse
peptidique non-ribosomale du peptidoglycane parital des bactries, en utilisant des
aminoacyl-ARN
t
en tant que donneurs de rsidus dacides amins. Ces enzymes sont des
cibles attractives pour le dveloppement dantibiotiques, car elles n'ont pas dhomologue dans
les cellules de mammifres et interviennent dans des tapes essentielles de l'assemblage de la
paroi de pathognes rsistants aux antibiotiques, comme Staphylococcus aureus,
Streptococcus pneumoniae et Enterococcus faecalis.
FemX
Wv
de Weissella viridescens est une enzyme modle pour la famille Fem. Elle
intervient dans l'assemblage de la chane latrale du prcurseur du peptidoglycane, plus
particulirement dans le transfert du rsidu Ala de l'Ala-ARN
t
Ala
la chaine latrale du rsidu
Lys en troisime position du prcurseur du peptidoglycane UDP-MurNAc-pentapeptide.
La structure de FemX
Wv
a t prcdemment dtermine tant pour la forme apo que
pour des complexes contenant lUDP-MurNAc-pentapeptide [1] ou le produit de la raction
UDP-MurNAc-pentapeptide(Ala). La co-cristallisation avec l'ARN a chou,
vraisemblablement en raison de la basse affinit de FemX
Wv
pour l'ARN
t
Ala
libre, l'instabilit
de la liaison ester Ala-ARN
t
Ala
et l'ordre de fixation des substrats, c'est--dire le prcurseur
peptidoglycane suivi par Ala-ARN
t
Ala
, ce qui pourrait prvenir la formation d'un complexe
binaire Fem/Ala-ARN
t
Ala
. Nous avons synthtis un conjugu peptidyl-ARN stable qui mime
les deux substrats de FemX
Wv
. Ces molcules sont composes d'un analogue du prcurseur du
peptidoglycane li de faon covalente diffrentes portions du bras accepteur de lARN
t
Ala
.
Deux de ces bi-substrats, prsentant de trs bonnes affinits pour FemX (IC
50
de 0.05
2 nM) [2], ont t cristalliss avec FemX
Wv
. Nous prsentons ici la structure
cristallographique 1.7 de rsolution de lun de ces complexes [3].

La structure du complexe et l'analyse des mutants a rvl le mcanisme par lequel
FemXWv lie ses substrats pour la catalyse et la stabilisation de l'intermdiaire ttradrique

[1] S. Biarrotte-Sorin et al., Structure 2004, 12, 257-267
[2] Fonvielle et al., Chem. Eur. J. 2013, 19, 1357-1363.
[3] Fonvielle et al., Angew. Chem. 2013, 125, 1-5.

- 209 -
P74 - PknG mediated signalling pathways in Mycobacterium
tuberculosis

Maria Natalia Lisa
1
, Nathalie Barilone
1
, Pedro Alzari
1



1
Unit de Microbiologie Structurale, Institut Pasteur, Paris, France.

Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is the causative agent of tuberculosis and is still a
major world health problem. During its life cycle Mtb goes through distinct replicative stages
and is also capable of lying in a dormant state for several years. Then, Mtb bacilli must
possess efficient signaling systems to sense the environment and to adapt the bacterial
physiology accordingly. Structural and mechanistic information about these mechanisms will
contribute to the development of new drugs against Mtb.

Mtb possess eukaryotic-like serine/threonine protein kinases that regulate metabolic
processes and the interaction with the host [1-2]. Among them, protein kinase G (PknG) is
essential for mycobacterial survival inside macrophages [3] and also controls the glutamate
metabolism by regulating downstream partners [4]. Then, PknG is an attractive candidate for
drug target against Mtb, and we are conducting structural and kinetic studies to better
understand the molecular determinants of the enzyme activity. We will present several high
resolution X-ray crystal structures obtained for PknG. In all of the cases a tilted and/or rotated
orientation of helix alpha-C (a known hotspot for regulation) is found, which precludes the
formation of a conserved and essential Lys-Glu ionic pair at the kinase active site [6]. Thus,
we conclude that these structures represent inactive conformations of PknG. On the other
hand, it has been shown that PknG autophosphorylates its N-terminal region, outside the
catalytic core [4]. This is critical for the binding of the protein substrate GarA, which contains
a C-terminal domain capable of recognizing pThr residues. Interestingly, while we have
detected PknG activity in the presence of high concentrations of a 17mer peptide containing
the GarA phosphorylation site [4], this activity disappears when deleting PknG N-terminal
region. This indicates that phosphorylation outside PknG kinase core may be important for the
kinase activity.







[1] Cole ST et al., Nature 1998.
[2] Sassetti CM et al., Mol Microbiol 2003.
[3] Walburger A et al., Science 2004.
[4] O'Hare HM et al., Mol Microbiol 2008.
[5] Scherr N et al., PNAS 2007.
[6] Huse M and Kuriyan J, Cell 2002.

- 210 -
P75 - Implication de la structure quaternaire dans la spcificit
enzymatique dune Glycoside Hydrolase de la famille GH5

Thibaud Frey
1
, Mickael Lafond
2
, Gerlind Sulzenbacher
1
, Jean-Guy Berrin
2
, Marie-Line
Garron
1

1
Architecture et Fonction des Macromolcules Biologique, UMR 7257 CNRS, Aix Marseille Universit,
Marseille, France
2
Biotechnologie des Champignons Filamenteux, UMR1163 INRA, Aix Marseille Universit, Polytech Marseille,
Marseille, France

Les cellulases sont des CAZymes (Carbohydrate Active Enzymes) impliques dans de
nombreux processus industriels comme la conversion de la biomasse en biocarburant.
Largement tudies, elles constituent la premire famille de CAZyme dcrite en 1989 sous le
nom de cellulase family A [1]. La cellulase family A , rfrence maintenant comme
Glycoside Hydrolase famille 5 (GH5), est une large famille de GH avec plus de 3800
squences [2].
Mme si les GH5 prsentent une certaine prdisposition pour la dgradation des
polysaccharides vgtaux, il est encore complexe de prdire leur activit enzymatique puisque
20 activits ont t recenses au sein de cette famille. Afin de mieux comprendre la spcificit
et lvolution de cette grande famille, rcemment une subdivision en sous familles a t
ralise [3]. Ce travail a permis didentifier 51 sous familles dont 20 nont aucune
caractrisation enzymatique et 38 nont aucun reprsentant structural.
La famille GH5_26 est une petite sous famille regroupant 23 squences, pour laquelle
deux activits glycosidiques, endo--1,4-glucanase (EC 3.2.1.4) et -1,3/1,4-glucanase (EC
3.2.1.73), ont t reportes. Nos travaux ont ports sur la GH5_26 provenant de
Saccharophagus degradans (GH5_26Sd). La caractrisation enzymatique montre que
GH5_26Sd est une -1,3/1,4-glucanase avec une activit cellulosique minoritaire. La
GH5_26Sd adopte une structure quaternaire trimrique stable observable en solution et en
cristallisation. La particularit de cette structure est quen plus de son domaine catalytique
classique en TIM barrel, GH5_26Sd prsente une extrmit N-terminale venant partiellement
occuper le site actif du monomre contigu. Pour comprendre si cette occupation partielle du
site actif pouvait influencer lactivit nous avons ralis une caractrisation enzymatique
complte de GH5_26Sd et dun mutant tronqu. Nos rsultats montrent que lextrmit N-
terminale influe effectivement sur la spcificit de substrat puisque la dltion de 16 acides
amins en N-ter confre lenzyme une activit cellulosique significative de type endo--1,4-
glucanase.










[1] Henrissat B. et al., Gene, 1989, 81(1):83-95.
[2] www.cazy.org
[3] Aspeborg H. et al., BMC Evol. Biol., 2012;12:186.

- 211 -
P76 - PknB: une phosphorylation en trans compatible avec une
dimrisation back to back

G. Andr-Leroux
*#
, N. Barilone
*
, M.N. Lisa
*
et P. M. Alzari
*

* Institut Pasteur, Unit de Microbiologie Structurale, 25 rue du Dr Roux, 75724 Paris Cedex
15, France
# Inra, MIG, Domaine de Vilvert 78352 Jouy-en-Josas, France.

gwenaelle.andre-leroux@jouy.inra.fr

La tuberculose, maladie infectieuse cause par Mycobacterium tuberculosis (Mtb), tue
chaque anne 2 millions de personnes. Bacille intracellulaire avec une stratgie dinfection
redoutable, il alterne formes de vie rplicative et latente. Pour tre virulent, le bacille a
dvelopp une signalisation cellulaire impliquant des kinases de type eucaryotes ou STPKs.
PknB, STPK essentielle la croissance, la division cellulaires de la bactrie
[1-2]
et
linfection des macrophages
[3]
, montre un domaine kinase et une machinerie catalytique
comparables aux homologues eucaryotes
[4-5]
. Ainsi, le mcanisme fonctionnel des STPKs
suppose une activit optimale subordonne une activation de la boucle dactivation par
autophosphorylation
[5; 6]
et une homodimrisation via une interface back-to-back
extrmement conserve
[7-9].
Cette interface promeut lautophosphorylation et active le
domaine catalytique pour la phosphorylation de protines htrologues
[8-10]
; ensuite PknB
monomrique est pleinement active
[5-6; 8; 11]
. Que lautophosphorylation soit un mcanisme cis
ou trans reste claircir. Les travaux de Mieczkowski supportent un modle dassemblage
front-to-front compatible avec une transphosphorylation et montrent une seconde
interface
[11]
. Nous discuterons nos rsultats cristallographiques rcents qui appuient fortement
cette hypothse de trans-autophosphorylation.










[1] Sassetti et al., PNAS. 2003, 100, 12989-12994,
[2] Fernandez et al., J Bacteriol. 2006,188, 7778-84.
[3] Av-Gay et al., Infect Immun.1999, 67, 5676-5682.
[4] Ortiz-Lombarda et al., J Biol Chem. 2003, 278, 13094-13100.
[5] Young et al., Nat Struct Biol. 2003, 10, 168-174.
[6] Boitel et al., Mol. Microbiol. 2003, 49, 1493-508.
[7] Chenna et al., NAR. 2003, 31, 3497-3500.
[8] Greestein et al., J. Biol. Chem. 2007, 282, 11427-11435.
[9] Lombana et al., Structure. 2010, 18, 1667-1677.
[10] Alber. Curr. Opin. Struct. Biol. 2009, 19, 650-657.
[11] Mieczkowsky et al., EMBO J. 2008, 27, 3186-3197.

- 212 -
P77 - Confinement de liquides molculaires dans des gels de silice et
des verres bioactifs porosit contrle.

Rachida Dorbez-Sridi
1
, Nouha Letaief, Nizar Bchellaoui, Hassane Oudadesse
2


1
Laboratoire Physico-Chimie des Matriaux ; Facult des Sciences de Monastir ; Universit
de Monastir.
2
Unit Sciences Chimiques de Rennes ; UMR 6226 CNRS/ Universit de Rennes 1.


Les proprits des fluides molculaires au voisinage dune interface plane dpendent
presque uniquement de la nature chimique de la surface et de ses interactions avec le fluide
molculaire. linverse, leffet du confinement dun fluide dans un matriau poreux est
complexe et dpend non seulement de la nature chimique du matriau mais galement de sa
structure poreuse, caractrise par la taille des pores et leur topologie.
Deux familles de matriaux monopolisent lintrt, savoir la silice msoporeuse et
les verres bioactifs base de silice ayant des caractristiques contrles qui constituent des
matriaux htes de confinement et qui peuvent tre immergs dans des fluides complexes.
On sest intress, en premire tape, ltude, par diffusion de rayons X et de
neutrons, de la structure, la cintique ainsi que les transitions de phases de leau confine
dans deux chantillons de gels de silice ayant une porosit contrle lun, non modifi, se
comporte comme une matrice hydrophile et lautre modifi prsente une surface hydrophobe
[1, 2].
En seconde tape, nous avons labor, par la mthode sol-gel, un verre ternaire
msoporeux dont la taille des pores est comprise entre 2 et 50 nm, compos de 85% SiO
2
10% CaO et 5% P
2
O
5
. Ce verre, M85S, est synthtis en se basant sur le protocole de
synthse du MCM-41 et a une porosit contrle dans le but de lutiliser en tant que systme
de libration de principes actifs pour des applications concernent particulirement le
comblement de dfauts osseux en chirurgies orthopdique et dentaire.



[1] R. Dorbez-Sridi, R. Cortes, E. Mayer et S. PIN. J. Chem Phys, 2002, 116(16), 7269.
[2] J. Jelassi, T. Grosz, I. Bako, M.C. Bellissnt-funel, John Dore, H.L. Castricum and R. Sridi-
Dorbez. J. Chem Phys 2011, 134, 064509.

- 213 -
P78 - Molecular basis of piezophilic adaptation

Louise Lassalle
1
, Marie Trovaslet
2
, Anne-claire Dhaussy
3
, Dominique Madern
1
, Bruno
Franzetti
1
, Eric Girard
1


1
IBS (UMR 5075 CEA-CNRS-UJF-PSB), 41 rue Jules Horowitz, 38027 Grenoble Cedex,
France

2
Institut de Recherches Biomdicales des Armes, antenne de La Tronche, France
3
CRISMAT, ENSICAEN, 6 Boulevard du Marchal Juin, 14000 Caen, France

Notre plante vit majoritairement sous pression. En effet, plus de 60 % de la biosphre
sont caractriss par des pressions suprieures 100 bars. Ces pressions peuvent atteindre
1000 bars dans les fosses sous-marines les plus profondes. La plupart des micro-organismes y
sont toutefois reprsents. La dcouverte rcente de Pyrococcus yayanosii CH1 [1], premier
hyperthermo-piezophile strict, a relanc la question de ladaptation aux fortes pressions. En
effet, cette nouvelle arche nest capable de crotre que sous hautes pressions (optimum de
croissance : 98 C et 520 bars) et supporte des pressions pouvant atteindre 1500 bars.
Je prsenterai lapproche choisie base sur une tude comparative de deux protines
modles ainsi que les rsultats prliminaires obtenus. Leffet de la pression sur les malate
dshydrognases (MalDH) et les glyoxylate rductases (GR) est tudi aussi bien dun point
de vue structurale quenzymatique. Le suivi de lactivit enzymatique est effectu grce un
spectrophotomtre coupl une enceinte pression disponible au sein de la plateforme Haute
Pression de lIBS. Ltude structurale est effectue par cristallographie des rayons X grce
une cellule enclume diamant [2].
Les rsultats prliminaires indiquent une diffrence de comportement entre les
enzymes issues dorganismes isols la surface et celles issues dorganismes des profondeurs.
Cette diffrence suggre que les enzymes issues dorganismes des fonds marins sont adaptes
pour fonctionner de manire optimale sous hautes pressions.














[1] Xiang Zeng, et al.,. The ISME journal. 2009, 3 :873-876.
[2] Fourme et al., Curr Opin Struct Biol. 2012, 22(5):636-42

- 214 -
P79 - Les Congrs de Cristallographie Bordeaux

M. Hospital & J. Housty avec les souvenirs et les documents des anciens : M. Allaume, Y.
Barrans, N.B. Chanh, C. Hauw, P. Marsau, et des plus jeunes : A. Dautant, B. Gallois etc ...

Laboratoire de Cristallographie, (1954 -1994) Bordeaux

Depuis les annes 1950, l'Universit de Bordeaux a toujours t active dans le domaine de la Cristallographie
en association avec le CNRS. Le laboratoire de Cristallographie (ERA 06 puis LA 144 du CNRS) a t membre de
l'A.F.C. depuis sa cration en 1954 et a eu l'honneur et le plaisir d'organiser 3 Congrs :

En 1962 le Congrs national de l'AFC (120 participants),

En 1973 le 1er Congrs europen de I'EUC (European Union of Crystallography) avec la prsence de Dorothy
Hodgkin (prix Nobel de chimie 1964) (900 participants),

En 1990 le XV
me
Congrs International de Cristallographie et Assemble Gnrale de l'lUCr (International Union of
Crystallography) avec la prsence de Dorothy Hodgkin, Herbert A. Hauptmann (prix Nobel de chimie 1985) et
Robert Huber (prix Nobel de chimie 1988) (2400 participants).

Les Anciens se rjouissent de voir le collectif bordelais de cristallographes recevoir leurs collgues franais et
trangers et souhaitent tous un bon Congrs et un agrable sjour.








- 215 -







Liste

des

participants

- 216 -

Liste des participants
- 217 -
Abdi Insaf P13
abdi.insaf@yahoo.fr
Facult des sciences de Bizerte
Bousalem (Tunisie)

Albino Marjorie O26
albino@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)


Albouy Pierre-Antoine O18
pierre-antoine.albouy@u-psud.fr
LPS UMR 8502
Paris (France)

Allain Magali Chair
magali.allain@univ-angers.fr
Plateforme PIAM
Angers (France)

Allix Mathieu O35
mathieu.allix@cnrs-orleans.fr
CEMHTI UPR3079
Orlans (France)

Arnoux Pascal O11
pascal.arnoux@cea.fr
CEA
Cadarache (France)

Audebrand Nathalie O2
nathalie.audebrand@univ-rennes1.fr
Institut des Sciences Chimiques UMR6226
Rennes (France)

Aziz Zoubir P38
aziz_zdz@yahoo.fr
Laboratoire de Technologie et des
Proprits du solide
Mostaganem (Algrie)

Babonneau David O7, P5
david.babonneau@univ-poitiers.fr
PHYMAT CNRS
Poitiers (France)




Badraoui Bechir P29
badraoui_b@yahoo.fr
IPEIM
Monastir (Tunisie)

Bailly Corinne P9
c.bailly@unistra.fr
Institut de Chimie de Strasbourg
UMR7177
Strasbourg (France)

Baptiste Benoit
benoitb47@hotmail.fr
IMPMC UMR 7590
Paris (France)

Bataille Thierry O74
thierry.bataille@univ-rennes1.fr
Institut des Sciences Chimiques UMR6226
Rennes (France)

Beaud Paul O29
paul.beaud@psi.ch
Paul Scherrer Institut
Genve (Suisse)

Belrhali Hassan O81
belrhali@embl.fr
EMBL
Grenoble (France)

Ben Rached Asma P1
asma_benrached@hotmail.fr
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)

Benosmane Ali P37
king.ali@hotmail.fr
Universit Hassiba Benbouali
Chlef (Algrie)


Bentata Samir O54, P38
sam_bentata@yahoo.com
Universit Abdelhamid Ibn Badis
Mostaganem (Algrie)


Liste des participants
- 218 -
Berthier Eric Industriel
e.berthier@inel.fr
INEL
Artenay (France)

Bertrand Thomas O56
thomas.bertrand@sanofi.com
SANOFI R&D
Vitry-sur-Seine (France)

Birck Catherine P53
birck@igbmc.fr
IGBMC UMR7104 U964
Strasbourg (France)

Boissier Fanny
f.boissier@iecb.u-bordeaux.fr
IECB
Bordeaux (france)

Bompard Coralie O10
coralie.bompard@iri.univ-lille1.fr
IRI USR3078
Lille (France)

Bonnet Franoise P22, P23
francoise.bonnete@univ-avignon.fr
IBMM UMR5247
Avignon (France)

Bordet Pierre O59, P50
pierre.bordet@grenoble.cnrs.fr
Institut Nel UPR2940
Grenoble (France)

Bouchene Rafika
wbouchene@yahoo.fr
Universit dOum El Bouaghi
Oum El Bouaghi (Algrie)

Boucher Florent O48
Florent.Boucher@cnrs-imn.fr
IMN Jean Rouxel UMR6502
Nantes (France)

Boulet Pascal P30
pascal.boulet@ijl.nancy-universite.fr
Institut Jean Lamour UMR7198
Nancy (France)

Boullay Philippe O47, O49, P55
philippe.boullay@ensicaen.fr
CRISMAT UMR6508
Caen (France)

Bourguet William O55
bourguet@cbs.cnrs.fr
CBS UMR5048
Montpellier (France)

Bourne Yves O58
yves.bourne@afmb.univ-mrs.fr
AFMB UMR7257
Marseille (France)

Brthes Daniel P52
Daniel.Brethes@ibgc.cnrs.fr
IBGC UMR5095
Bordeaux (France)

Bressanelli Stphane P6, P66
stephane.bressanelli@vms.cnrs-gif.fr
LVMS UPR3296
Gif-sur-Yvette (France)

Brunelli Michela O86
brunelli@ill.eu
ILL
Grenoble (France)

Buratto Jrmie P62
j.buratto@cbmn.u-bordeaux.fr
CBMN UMR5248
Bordeaux (France)

Buron-Le Cointe Marylise Chair
marylise.buron@univ-rennes1.fr
Institut de Physique UMR6251
Rennes (France)

Campanacci Valrie O23, P40
campanacci@lebs.cnrs-gif.fr
LEBS UPR3082
Gif sur Yvette (France)
Liste des participants
- 219 -
Cattey Hlne
hcattey@u-bourgogne.fr
ICMUB UMR6302
Dijon (France)

Cavagnino Andrea
andrea.cavagnino@u-psud.fr
IBBMC UMR8619
Orsay (France)

Cavarelli Jean Chair
cava@igbmc.fr
IGBMC UMR7104 U964
Strasbourg (France)

Ceretti Monica O42, O72
monica.ceretti@univ-montp2.fr
Institut Charles Gerhardt UMR5253
Montpellier (France)

Chaptal Vincent P24, P25
vincent.chaptal@ibcp.fr
IBCP FR3302
Lyon (France)

Charbonnier Jean-Baptiste O89
jb.charbonnier@cea.fr
CEA
Saclay (France)

Chateigner Daniel O77, P72
daniel.chateigner@ensicaen.fr
CRISMAT UMR6508
Caen (France)

Cherfils Jacqueline O23, O91, P40, P57
cherfils@lebs.cnrs-gif.fr
LEBS UPR3082
Gif-sur-Yvette (France)

Coati Alessandro O5, P5
coati@synchrotron-soleil.fr
Synchrotron SOLEIL
Saint-Aubin (France)

Cochet Damien Industriel
damien.cochet@bruker-axs.fr
Bruker AXS SAS
Champs sur Marne (France)

Colloc'h Nathalie O33
colloch@cyceron.fr
ISTCT UMR 6301
Caen (France)

Combes Christle O27, P26
christele.combes@ensiacet.fr
CIRIMAT, UPS-INPT-CNRS, ENSIACET
Toulouse (France)

Cooper Lucy O50
lucy-jane.cooper@uvsq.fr
ILV UMR8180
Versailles (France)

Coquerel Grard Chair
gerard.coquerel@univ-rouen.fr
SMS EA3233
Rouen (France)

Corvis Yohann O82, P71
yohann.corvis@parisdescartes.fr
Facult de Pharmacie
Paris Descartes (France)

Couprie Marie-Emmanuelle O79
couprie@synchrotron-soleil.fr
Saint-Aubin
Synchrotron SOLEIL (France)

Croguennec Laurence O73
crog@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)

Curfs Caroline O28
curfs@esrf.fr
ESRF
Grenoble (France)

Czjzek Mirjam P17
czjzek@sb-roscoff.fr
Station Biologique UMR7139
Roscoff (France)

Daillant Jean O78
jean.daillant@synchrotron-soleil.fr
Synchrotron SOLEIL
Saint-Aubin (France)
Liste des participants
- 220 -
Dautant Alain P52
a.dautant@ibgc.cnrs.fr
IBGC CNRS Univ. Bdx Segalen
Bordeaux (France)

De Boissieu Marc SP5, P33
marc.de-boissieu@simap.grenoble-inp.fr
SIMAP
Grenoble (France)

Dechambenoit Pierre CLO
dechambenoit@crpp-bordeaux.cnrs.fr
CRPP UPR8641
Bordeaux (France)

Demange Valrie O49
valerie.demange@univ-rennes1.fr
Institut des Sciences Chimiques UMR6226
Rennes (France)

Descamps Marc
marc.descamps@univ-lille1.fr
UMET UMR8207
Lille (France)

Devouard Bertrand O39
devouard@cerege.fr
CEREGE UMR7330
Aix-en-Provence (France)

Didierjean Claude P15
claude.didierjean@univ-lorraine.fr
CRM2 UMR7036
Nancy (France)

Djeghader Ahmed P41
ahmed.djeghader@gmail.com
URMITE UMR6236
Marseille (France)

Dock-Bregeon Anne-Catherine Chair
dock@biologie.ens.fr
IBENS
Paris (France)

Dorbez-Sridi Rachida P77
rdorbez@gmail.com
Facult des Sciences
Monastir (Tunisie)

Dorn Andy Industriel
andy.dorn@agilent.com
Agilent Technologies XRD
Cologne (Allemagne)

Duhayon Carine P10
duhayon@lcc-toulouse.fr
LCC UPR8241
Toulouse (France)

Dumas Philippe Chair
p.dumas@ibmc-cnrs.unistra.fr
IBMC FRC1589
Strasbourg (France)

Dupin Adrien
a.dupin@iecb.u-bordeaux.fr
IECB
Bordeaux (France)

Echalier Aude O20
aude.echalier-glazer@cbs.cnrs.fr
CBS UMR5048
Montpellier (France)

El Sahili Abbas P7
abbas.el-sahili@lebs.cnrs-gif.fr
LEBS UPR3082
Gif-sur-Yvette (France)

Elias Mikael O22, O90, P41, P42, P43
mikael.elias@gmx.fr
Weizmann Institute of Science
Rehovot (Israel)

Elkaim Erik Chair
erik.elkaim@synchrotron-soleil.fr
Synchrotron SOLEIL
Saint-Aubin (France)

Erba Alessandro O52
alessandro.erba@unito.it
Universit di Torino
Torino (Italie)

Espeau Philippe O82, P71
philippe.espeau@parisdescartes.fr
Facult de Pharmacie
Paris Descartes (France)
Liste des participants
- 221 -
Espinosa Enrique O53
enrique.espinosa@crm2.uhp-nancy.fr
CRM2 UMR7036
Nancy (France)

Falaise Clment O15, P12
clement.falaise@gmail.com
UCCS UMR8181
Lille (France)

Fauvet Grard Industriel
gerard.fauvet@bruker-axs.fr
Bruker AXS SAS
Champs sur Marne (France)

Favier Frdrique P15
frederique.favier@univ-lorraine.fr
CRM2 UMR7036
Nancy (France)

Fernandez-Varela Paloma P57
fernandez-varela@lebs.cnrs-gif.fr
LEBS UPR3082
Gif-sur-Yvette (France)

Ferrand Yann P11
y.ferrand@iecb.u-bordeaux.fr
CBMN UMR5248
Bordeaux (France)

Ferrer Jean-Luc P19
jean-luc.ferrer@ibs.fr
IBS UMR5075
Grenoble (France)

Fetics Susan
susan.fetics@lebs.cnrs-gif.fr
LEBS UPR3082
Gif-sur-Yvette (France)

Flack Evelyne
Howard.Flack@unige.ch
Universit de Genve
Genve (Suisse)

Flack Howard O83
crystal@flack.ch
Universit de Genve
Genve (Suisse)

Folly-Klan Marcia P40
marcia.folly-klan@lebs.cnrs-gif.fr
LEBS UPR3082
Gif-sur-Yvette (France)

Fourati Kammoun Zeineb O66
zeineb.fourati-kammoun@u-psud.fr
Ecole Polytechnique UMR7654
Palaiseau (France)

Fourmigu Marc O14, O53
marc.fourmigue@univ-rennes1.fr
Institut des Sciences Chimiques UMR6226
Rennes (france)

Fribourg Sebastien O9
sebastien.fribourg@inserm.fr
IECB
Bordeaux (France)

Galatanu Nicoleta O63
nicoleta.galatanu@xenocs.com
Xenocs
Sassenage (France)

Gallois Bernard P62
b.gallois@cbmn.u-bordeaux.fr
CBMN UMR5248
Bordeaux (France)

Galmiche Marion O36, P31
marion.galmiche@ensicaen.fr
CRISMAT UMR6508
Caen (France)

Garreau de Loubresse Nicolas O65
ngdl@igbmc.fr
IGBMC UMR7104 U964
Strasbourg (France)

Garron Marie-Line P75
marie-line.garron@afmb.univ-mrs.fr
AFMB UMR7257
Marseille (France)

Gbabode Gabin O6
gabin.gbabode@univ-rouen.fr
SMS EA3233
Rouen (France)
Liste des participants
- 222 -
Ghermani Nour Eddine O51
noureddine.ghermani@u-psud.fr
LSPMS Ecole Centrale de Paris
Paris (France)

Gillon Batrice P54
beatrice.gillon@cea.fr
CEA
Saclay (France)

Giorgi Michel
michel.giorgi@univ-amu.fr
Fdration de Chimie FR 1739
Marseille (France)

Girard Eric SP3, O32, O33, P78
eric.girard@ibs.fr
IBS UMR5075
Grenoble (France)

Giraud Marie-France P52
marie-france.giraud@ibgc.cnrs.fr
IBGC UMR5095
Bordeaux (France)

Gondry Muriel O21
muriel.gondry@cea.fr
CEA
Saclay (France)

Gonzalez Ccile
Cecile.gonzalez@ibgc.cnrs.fr
IBGC UMR5095
Bordeaux (France)

Gonzalez Daniel P41, P42
gonzalez.daniel.mrs@gmail.com
URMITE UMR6236
Marseille (France)

Gorrec Fabrice P8
fgorrec@mrc-lmb.cam.ac.uk
MRC Laboratory of Molecular Biology,
Cambridge (UK)

Gordeliy Valentin O24
valentin.gordeliy@ibs.fr
IBS UMR5075
Grenoble (France)

Gotthard Guillaume O22, P41, P42, P43
guillaume.gotthard@gmail.com
URMITE UMR6236
Marseille (France)

Gras Pierre O27
pierre.gras@ensiacet.fr
CIRIMAT UMR5085
Toulouse (France)

Gratias Denis O40, P70
denis.gratias@onera.fr
LEM UMR104
Chatillon (France)

Grosjean Arnaud O38, P1
grosjean@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)

Gurin Laurent O87, P34, P36
laurent.guerin@univ-rennes1.fr
Institut de Physique UMR6251
Rennes (France)

Gueguen-Chaignon Virginie
virginie.gueguen-chaignon@ibcp.fr
IBPC FR3302
Lyon (France)

Guillet Valrie O57, P21
valerie.guillet@ipbs.fr
IPBS UMR5089
Toulouse (France)

Guillin Jacques Industriel
jacques.guillin@bruker-axs.fr
Bruker AXS SAS
Champs sur Marne (France)

Guillou Nathalie O50
nathalie.guillou@uvsq.fr
ILV UMR8180
Versailles (France)

Guinebretire Ren O7
rene.guinebretiere@unilim.fr
SPCTS UMR7315
Limoges (France)
Liste des participants
- 223 -
Guionneau Philippe O34, O38, O84, P1,
P4, P55
guio@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)

Haines Julien O3, O31, P27
julien.haines@univ-montp2.fr
Institut Charles Gerhardt UMR5253
Montpellier (France)

Hamzaoui Fodil P39, P67
Fodil_hamzaoui@yahoo.fr
SEA2M Universit Abdelhamid Ibn Badis
Mostaganem (Algrie)

Hartmann Thomas Industriel
hartmann@stoe.com
Stoe & Cie gmbh
Darmstadt (Allemagne)

Heijboer Pierre P32
heijboer@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)

Henry Natacha O15, P12
natacha.henry@ensc-lille.fr
UCCS UMR8181
Lille (France)

Hiblot Julien O22, P41, P42, P43
julien.hiblot@gmail.com
URMITE UMR6236
Marseille (France)

Hillard Elizabeth CLO
hillard@crpp-bordeaux.cnrs.fr
CRPP UPR8641
Bordeaux (France)

Hobbs Jeanette Industriel
jeanette@moleculardimensions.com
MolecularDimensions
Newmarket (UK)

Hodeau Jean-Louis P50
hodeau@grenoble.cnrs.fr
Institut Nel UPR2940
Grenoble (France)
Hospital Michel O79
michel.hospital@numericable.fr
Laboratoire de Cristallographie
Universit Bordeaux 1
Talence (France)

Housty Jacques O79
housty.jacques@neuf.fr
Laboratoire de Cristallographie Bdx 1
Cestas (France)

Houdusse Anne O88, P48
anne.houdusse@curie.fr
Institut Curie UMR144
Paris (France)

Housset Dominique P44
dominique.housset@ibs.fr
IBS UMR5075
Grenoble (France)

Huc Ivan SP1, P11, P62
i.huc@iecb.u-bordeaux.fr
CBMN UMR5248
Bordeaux (France)

Huet Tiphaine P16
Tiphaine.Huet@unige.ch
Department of Molecular Biology
Geneva (Switzerland)

Ibanez Alain Chair
alain.ibanez@grenoble.cnrs.fr
Institut Nel UPR2940
Voiron (France)

Iti Jean-Paul P28
jean-paul.itie@synchrotron-soleil.fr
Synchrotron SOLEIL
Saint-Aubin (France)

Jacques Vincent O62
vincent.jacques@u-psud.fr
LPS UMR8502
Orsay (France)

Jarry Christian Chair
christian.jarry@u-bordeaux2.fr
Facult de Pharmacie
Bordeaux (France)
Liste des participants
- 224 -

Josse Michael O1, O26, P2, P32
josse@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)

Kammoun Omar O74
omarkammoun1985@yahoo.fr
Institut des Sciences Chimiques UMR6226
Rennes (France)

Karmazin-Brelot Lydia
brelot@unistra.fr
Institut de Chimie de Strasbourg
UMR7177
Strasbourg (France)

Kauffmann Brice O38, P11
b.kauffmann@iecb.u-bordeaux.fr
IECB
Bordeaux (France)

Kenfack Tsobnang Patrice P68
pakenfack@gmail.com
CRM2 UMR7036
Nancy (France)

Khadri Amina
aymza.n@gmail.com
Universit dOum El Bouaghi
Oum El Bouaghi (Algrie)

Kilburg Arnaud P24, P25
arnaud.kilburg@ibcp.fr
IBCP FR3302
Lyon (France)

Klosek Vincent O76
vincent.klosek@cea.fr
CEA
Saclay (France)

Labesse Gilles
g.labesse@cbs.cnrs.fr
CBS UMR5048
Montpellier (France)





Labourel Aurore P17
aurore.labourel@sb-roscoff.fr
Station biologique UMR7139
Roscoff (France)

Lacoudre Aline P69
a.lacoudre@ism.u-bordeaux1.fr
ISM UMR5255
Bordeaux (France)

Lafaye Cline P63
celine.lafaye@ibs.fr
IBS UMR5075
Grenoble (France)


Laguerre Michel
m.laguerre@iecb.u-bordeaux.fr
CBMN UMR5248
Bordeaux (France)

Lakhloufi-Mathieu Sabine P4
lakhloufi@ill.eu
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)

Lamour Valrie O44
lamourv@igbmc.fr
IGBMC UMR7104
Strasbourg (France)

Larrieu Isabelle P52
isabelle.larrieu@ibgc.cnrs.fr
IBGC UMR5095
Bordeaux (France)

Lassalle Louise O32, P78
louise.lassalle@ibs.fr
IBS UMR5075
Grenoble (France)

Laulh Claire O30
claire.laulhe@synchrotron-soleil.fr
Synchrotron SOLEIL
Saint-Aubin (France)

Liste des participants
- 225 -
Launois Pascale O18
pascale.launois@u-psud.fr
LPS UMR8502
Orsay (France)

Le Bas Audrey P18
Audrey.Lebas@ibpc.fr
IBPC UMR7099
Paris (France)

Le Bolloc'h David Chair
lebolloch@lps.u-psud.fr
LPS UMR8502
Orsay (France)

Le Dreau Loic Industriel
loic.ledreau@bruker-axs.fr
Bruker AXS SAS
Champs sur Marne (France)

Le Du Marie-Hlne O43
marie-helene.ledu@cea.fr
CEA
Saclay (France)

Lebraud Eric P2
lebraud@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)

Leger Jean-Michel O82
jean-michel.leger@u-bordeaux2.fr
Facult de Pharmacie
Bordeaux (France)

Leme-Cailleau Marie-hlne O34, P4
lemee@ill.fr
ILL
Grenoble (France)

Leroux Gwenalle P76
gwenaelle.andre-leroux@jouy.inra.fr
MIG
Jouy en Josas (France)

Li de la Sierra-Gallay Ines P73
ines.gallay@u-psud.fr
IBBMC UMR8619
Orsay (France)

Lisa Maria Natalia P74, 76
nlisa@pasteur.fr
Institut Pasteur
Paris (France)

Lisboa Johnny
johnny.lisboa@u-psud.fr
IBBMC UMR8619
Orsay (France)

Liu Dan P33
liudan2004sdu@163.com
SIMAP UMR5266
Grenoble (France)

Lodini Alain O75
alain.lodini@univ-reims.fr
LACM
Reims (France)

Loiseau Annick O16
loiseau@onera.fr
LEM UMR104
Chatillon (France)

Loiseau Pascal O25
pascal-loiseau@chimie-paristech.fr
LCMCP-ENSCP UMR7574
Paris (France)

Lning Jan O60, O80
jan.luning@upmc.fr
LCPMR UMR7614
Paris (France)

Maglione Mario O1, O26, P32
maglione@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
ICMCB
Bordeaux (France)

Marchivie Mathieu P59, P71
mathieu.marchivie@u-bordeaux2.fr
Pharmacochimie
Bordeaux (France)

Marchot Pascale O58
pascale.marchot@univ-amu.fr
AFMB UMR7257
Marseille (France)

Liste des participants
- 226 -
Mariette Cline O61, O87, P36
celine.mariette@univ-rennes1.fr
Institut de Physique UMR6251
Rennes (France)

Martin Christine Chair
christine.martin@ensicaen.fr
CRISMAT UMR6508
Caen (France)

Martinetto Pauline P50
pauline.martinetto@grenoble.cnrs.fr
Institut Nel UPR2940
Grenoble (France)

Mas-y-mas Sarah P19
sarah.mas-y-mas@ibs.fr
IBS UMR5075
Grenoble (France)

Massip Stphane O82, P59, P71
stephane.massip@u-bordeaux2.fr
Pharmacochimie
Bordeaux (France)

Mathieu Magali Chair
magali.mathieu@sanofi.com
Sanofi
Vitry sur seine (France)

Matringe Caroline O7
caroline.matringe@etu.unilim.fr
SPCTS UMR7315
Limoges (France)

Mayer Claudine O46
claudine.mayer@pasteur.fr
Institut Pasteur
Paris (France)

Maziarz Steve Industriel
steve.maziarz@exploranova.com
EXPLORA NOVA SARL
Bordeaux (France)

Mechulam Yves O64
yves@botrytis.polytechnique.fr
Ecole Polytechnique UMR7654
Palaiseau (France)

Menetrey Julie O88
julie.menetrey@lebs.cnrs-gif.fr
LEBS UPR3082
Gif-sur-Yvette (France)

Mercier Nicolas O12
nicolas.mercier@univ-angers.fr
MOLTECH UMR6200
Angers (France)

Merzoug Meriem
myri-sam@hotmail.fr
Universit dOum El Bouaghi
Oum El Bouaghi (Algrie)

Molinari Flora P2
molinari.flora@gmail.com
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)

Moncoq Karine P20
moncoq@ibpc.fr
IBPC UMR7099
Paris (France)

Mondieig Denise O38, P60, P61
d.mondieig@loma.u-bordeaux1.fr
LOMA UMR5798
Bordeaux (France)

Moras Dino P53
moras@igbmc.fr
CERBM GIE
Strasbourg (France)

Moreau Christophe P64
Christophe-p.moreau@ibs.fr
IBS UMR5075
Grenoble (France)

Moreau Florian O70
florian.moreau.univ@gmail.com
Nottingham (UK)


Mourey Lionel O57, P21
lionel.mourey@ipbs.fr
IPBS UMR5089
Toulouse (France)

Liste des participants
- 227 -
Moynie Lucile P45
lm108@st-andrews.ac.uk
Universit de St Andrews
St Andrews (Ecosse)

Naim Ahmad O84, P58
naim@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)


Ngrier Philippe O34, O38, O82, P60, P61,
P71
ph.negrier@loma.u-bordeaux1.fr
LOMA UMR5798
Bordeaux (France)

Nitschke Jonathan O13
jrn34@cam.ac.uk
Cambridge (UK)


Oubla M'hamed P65
mh.oubla@gmail.com
Facult des Sciences Hassan II Ain Chock
Casablanca (Maroc)

Paineau Erwan O18, O70
erwan-nicolas.paineau@u-psud.fr
LPS UMR8502
Orsay (France)

Paulus Werner O42, O72
werner.paulus@univ-montp2.fr
Institut Charles Gerhard
Universit Montpellier 2
Montpellier (France)

Payen Christophe O1
christophe.payen@cnrs-imn.fr
IMN Jean Rouxel UMR6502
Nantes (France)

Pechev Stanislav O26, O34, P3
pechev@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
ICMCB UPR9048
Bordeaux cedex (France)



Pedelacq Jean-Denis
pedelacq@ipbs.fr
IPBS UMR5089
Toulouse (France)

Perez Olivier O36, O47, P31, P34, P35,
P72
olivier.perez@ensicaen.fr
CRISMAT UMR6508
Caen (France)

Perez Philippe Industriel
p.perez@elexience.fr
ELEXIENCE
Verrires-le-Buisson (France)


Petit Pierre-Emmanuel
pierre-emmanuel.petit@cnrs-imn.fr
IMN Jean Rouxel UMR6502
Nantes (France)

Poupon Morgane P35
morgane.poupon@ensicaen.fr
CRISMAT UMR6508
Caen (France)

Philouze Christian
Christian.Philouze@ujf-grenoble.fr
DCM UMR5250
Grenoble (France)

Picot Daniel P18
Daniel.Picot@ibpc.fr
LBPCPM UMR7099
Paris (France)


Pignol David O11
david.pignol@cea.fr
CEA UMR7265
Cadarache (France)

Pinaud Nol O9
noel.pinaud@u-bordeaux1.fr
ISM UMR5255
Bordeaux (France)

Liste des participants
- 228 -
Poupon Morgane P35
morgane.poupon@ensicaen.fr
CRISMAT UMR6508
Caen (France)

Prang Thierry O33
thierry.prange@parisdescartes.fr
LCRB UMR 8015
Paris (France)

Quiquandon Marianne O40, P70
marianne.quiquandon@wanadoo.fr
LEM UMR104
Chatillon (France)

Rabiller Philippe O61, O87, P36
philippe.rabiller@univ-rennes1.fr
Institut de Physique UMR6251
Rennes (France)

Ranieri Vincent P27
v.ran34@gmail.com
Institut Charles Gerhardt UMR5253
Montpellier (France)

Ravy Sylvain O30, O41
ravy@synchrotron-soleil.fr
Synchrotron SOLEIL
Saint Aubin (France)

Reiser Jean-Baptiste P44, P46
jean-baptiste.reiser@ibs.fr
IBS UMR5075
Grenoble (France)

Retailleau Pascal
pascal.retailleau@icsn.cnrs-gif.fr
ICSN UPR2301
Gif-sur-Yvette (France)

Richard Philippe
philippe.richard@u-bourgogne.fr
ICMUB UMR6302
Dijon (France)

Robin Julien O2
julien.robin@univ-rennes1.fr
Institut des Sciences Chimiques UMR6226
Rennes (France)

Rochel Natacha P53
rochel@igbmc.fr
IGBMC UMR7104
Strasbourg (France)

Rogues Pierrick Industriel
pierrick.rogues@natx-ray.com
Natx-ray
Grenoble (France)

Roisnel Thierry P51
thierry.roisnel@univ-rennes1.fr
Institut des Sciences Chimiques UMR6226
Rennes (France)

Ropars Virginie O88
virginie.ropars@curie.fr
Institut Curie UMR144
Paris (France)

Roret Thomas P15
thomas.roret@univ-lorraine.fr
CRM2 UMR7036
Nancy (France)

Rosa Patrick O34, O84, P58
rosa@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
ICMCB UPR9048
Bordeaux (France)

Rotella Hlne O77
helene.rotella@ensicaen.fr
CRISMAT UMR6508
Caen (France)

Rouquette Jrome O3, O31
Jerome.rouquette@um2.fr
Institut Charles Gerhardt UMR5253
Montpellier (France)

Roussel Pascal O77
pascal.roussel@ensc-lille.fr
UCCS UMR8181
Lille (France)

Rousselin Yoann
Yoann.Rousselin@u-bourgogne.fr
ICMUB UMR6302
Dijon (France)

Liste des participants
- 229 -
Rucktooa Prakash O10, P47
prakash.rucktooa@univ-lille1.fr
IRI UMR8576
Lille (France)

Rueff Jean-Michel O36, P31, P35
jean-michel.rueff@ensicaen.fr
CRISMAT UMR6508
Caen (France)

Ruff Marc O68
ruff@igbmc.fr
IGBMC UMR7104
Strasbourg (France)

Samama Jean-Pierre P56
samama@synchrotron-soleil.fr
Synchrotron SOLEIL
Saint Aubin (France)

Sanchez Corinne P52
corinne.sanchez@ibgc.cnrs.fr
IBGC UMR5095
Bordeaux (France)

Sangiorgio La
leasangiorgio@gmail.com
Grenoble (France)

Sauguet Ludovic O67
lsauguet@pasteur.fr
Institut Pasteur
Paris (France)

Schaniel Dominik O19
dominik.schaniel@univ-lorraine.fr
CRM2 UMR7036
Nancy (France)

Seddiki Nadir
nadir.seddiki@ibgc.cnrs.fr
IBGC UMR5095
Bordeaux (France)

Shepard William P56
william.shepard@synchrotron-soleil.fr
Synchrotron SOLEIL
Saint Aubin (France)


Sirigu Serena P48
serena.sirigu@curie.fr
Institut Curie UMR144
Paris (France)

Sleator Olivia Industriel
olivia.sleator@Rigaku.com
Rigaku Europe
Kemsing, Sevenoaks (UK)

Snoeck Etienne O17
snoeck@cemes.fr
CEMES UPR9011
Toulouse (France)

Soldo-Olivier Yvonne O4
yvonne.soldo@lepmi.grenoble-inp.fr
LEPMI UMR5279
Grenoble (France)

Specklin David
david.specklin@gmail.com
Institut de Chimie UMR 7177
Strasbourg (France)

Sridi Taha
Facult des Sciences
Monastir (Tunisie)

Stevens Ray SP2
stevens@scripps.edu
Department of Molecular Biology,
Scripps, USA La Jolla (U.S.A.)

Sulzenbacher Gerlind P75
Gerlind.Sulzenbacher@afmb.univ-mrs.fr
AFMB UMR7257
Marseille (France)

Tabti Charef P67
tabti_sea2m@yahoo.fr
Universit Abdelhamid Ibn Badis
Mostaganem (Algrie)

Tao Liang O37
tllight@hotmail.com
LRCS CNRS UMR7314 Univ de Picardie
Amiens (France)

Liste des participants
- 230 -
Thiaudire Dominique O85
thiaudiere@synchrotron-soleil.fr
Synchrotron SOLEIL
Saint Aubin (France)

Thompson Andrew O67
andrew.thompson@synchrotron-soleil.fr
Synchrotron SOLEIL
Saint Aubin (France)

Timmins Joanna O45
joanna.timmins@ibs.fr
IBS UMR5075
Grenoble (France)

Tola Fabienne
Fabienne.Tola@ujf-grenoble.fr
DCM UMR5250
Grenoble (France)

Toudic Bertrand O61, O87, P36
bertrand.toudic@univ-rennes1.fr
Institut de Physique UMR6251
Rennes (France)

Tranier Samuel P21
samuel.tranier@ipbs.fr
IPBS UMR5089
Toulouse (France)

Trapani Stefano
trapani@cbs.cnrs.fr
CBS UMR5048
Montpellier (France)

Tsai An-Pang SP4
aptsai@tagen.tohoku.ac.jp
SIMAP
Grenoble (France)

Van der Lee Arie O31
avderlee@univ-montp2.fr
IEM UMR5635
Montpellier (France)

Van Tilbeurgh Herman O66, P49, P73
herman.van-tilbeurgh@u-psud.fr
IBBMC UMR 8619
Orsay (France)

Vaney Marie-Christine O8
mcvaney@pasteur.fr
Institut Pasteur
Paris (France)

Vendier Laure O34, P14
vendier@lcc-toulouse.fr
LCC UPR8241
Aureville (France)

Wagner Tristan O69
tristan.wagner@mpi-marburg.mpg.de
Max Planck Institute
Marburg (Allemagne)

Wehenkel Annemarie
anne-marie.wehenkel@curie.fr
Institut Curie UMR3306
Paris (France)

Welter Richard
welter@unistra.fr
Institut de Chimie UMR 7177
Strasbourg (France)

Wierzbanowski Krzysztof O75
wierzbanowski@fis.agh.edu.pl
Universite de Science et Technologie AGH
Zabierzow (Pologne)

Ingrid Gautier Industriel
ingrid.gautier@panalytical.com
PANalytical
Le Plessis Robinson (France)


Liste des participants
- 231 -