Tres principales procesos que conforman el dogma central de la biologa.

Nos dedicamos previamente al estudio de la replicacin del DNA a estudiar en detalle las caractersticas fisicoqumicas de esta molcula que es la encargada de guardar la informacin gentica. No solamente estudiamos el tipo de enlace, sino que estudiamos cada uno de los monmeros que constituyen esta molcula, de ah sacamos varios conceptos bsicos como nucletidos, nuclesidos, que tipo de enlace los une, metaestabilidad. En esas primeras dos horas hablamos que los nucletidos no son nicamente depositarios de la informacin gentica, como es en el caso que estamos estudiando, sino que participan en todas las rutas metablicas como compuestos ricos de alta energa, ellos son las monedas energticas de las clulas y bueno, vieron que cada una de las reacciones de todas las enzimas involucradas en este proceso requieren de esta energa, la cual normalmente viene en forma de ATP, que es un nucoleotido de ribosa trifosforilada, y son unas de las principales monedas energticas que hay. Otra de las funciones que puede tener un nucletido que pudieran ver ms adelante es que pueden participar en seales qumicas, capaces de responder a algunos estmulos extracelulares y bueno, estn muchas veces como cofactores de algunas enzimas. Hablamos sobre monmero, bases nitrogenadas, que las constituyen, cuales son los enlaces que los unen, todo esto lo discutimos porque debido a estos enlaces es que estn intrnsecas las caractersticas fsicoqumicas de la molcula. Bueno sabemos pirimidinas y purinas, es importante reconocerlas porque ya saben que en algunos procesos la adicin de bien sea, una purina o pirimidina es clave en el inicio del proceso. Conceptops: ARN y DNA molcula conformada por cuarto clases de monmeros, y en general estas molculas pueden considerarse como polmeros de nucletidos que suelen denominarse polinucletidos. Modelo de Watson y Crick, que para esa poca permita abarcar todo lo poquito que se saba de comodebia ser la molecula de DNA: Grande, alargada, segn la composicin de bases de las leyes de Chargaff se encontraba la misma proporcin de purinas que de pirimidinas. Ellos conocan los datos de difraccin de rayos X de Rosalynd Franklin, en el cual saban que su modelo tendra que ser una helice en la cual segn ellos, estaban orientadas las bases hacia la regin interna y el esqueleto fosforilado hacia la regin externa, y bueno, lo que ellos dedujeron fue lo principal, que les permiti establecer su modelo, fue que ellos decan que esas dos hlices podan estar estabilizadas por puentes de hidrgeno, que para esa poca fue algo bastante revolucionario, sin embargo, ya Pauling haba dicho que la estructura secundaria de las protenas se estabilizaba netamente por puentes de hidrgeno, entonces, tomando esta informacin llegaron a la conclusin de su modelo, el cual todava no ha tenido una modificacon sigtificativa. Estructura Doble hlice Apareamiento de bases: Purina - Pirimidina Ambas hebras son antiparalelas entre si

Fuerzas de enlace que mantiene las hebras son los puentes de hidrgeno

Lo ms importante que tiene su modelo es que permite indicar posibles mecanismos para su replicacin, la cual es semi conservativa, cada molcula hebra sirve como molde para la sntesis de una molcula nueva y bueno, siempre cada clula nueva va a tener molculas que van a ser producto de una hebra molde y una hebra nueva. Con respecto a las diferentes estructuras del DNA, pudimos darnos cuenta que el modelo que nos propusieron Watson y Crick en un inicio era el modelo de mxima hidratacin, sin embargo ellos se dieron cuenta de que exista la posibilidad de otras estructuras como la A, Z, la H es mas reciente, sin embargo, todas ellas han sido evidenciadas en los diferentes procesos. Es importante recordar estas molculas. Secuencia palindrmica, efecto hipercrmico y temperatura de fusin, vean que son meramente conceptos que tienen que ver con las propiedades fisicoqumicas de la molcula. Con respecto a la topologa, hablamos no solo de este modelo, sino de la estructura primaria y secundaria del DNA, que tiene que ver con las conformaciones de la doble hlice y las posibles formas en las que se puede encontrar el DNA (A, B, Z y H), hablamos de estructura 3ria y su plegamiento, ya que el DNA nunca est en su forma relajada, siempre est en condicin de sper enrollamiento. En relacin al enrollamiento, tenemos diferentes tipos: Plectnico: Donde el DNA aparte de su estructura normal se enrolla de forma senoidal en funcin de minimizar o guardar y empaquetar esa gran molcula en el menor espacio. Una de las principales protenas, en eucariotas superiores, responsables del correcto plegamiento de la molcula de ADN son las histonas, hablamos de ellas, y tambin de unas unidades de organizacin como son los nucleosomas, los cuales consisten en un grupo de histona s, las cuales van a cumplir la funcin de un carrete de hilo alrededor del cual el DNA se va a enrrollar y as permitir un correcto empaquetamiento. Replicacin Semi conservativa Sintesis de DNA en una sola direccin 5 3 Empieza en un nico punto Bidireccional

Tres fases principales Inicio: Debera cumplir funcin de apertura o acceso al DNA, el cual no se abre en cualquier sitio, sino que hay un punto muy particular dentro del cromosoma en donde se abre. En bacterias hay un nico punto en donde se abre la doble hebra, el punto de origen.

Elongacin: Holoenzima, DNA polimerasa, que se encarga de duplicar el DNA, la cual est de manera doble, ya que aunque una de las hebras se replique de forma continua y otra discontinua, ambas se replican al mismo tiempo. Terminacin: Cierre de las dos horquillas, participacion de topoisomerasa tipo 4, que es la que corta los dos cromosomas. En pasos generales lo que tiene que ocurrir en la replicacin es primero una separacin de las hebras, y las responsables de esa separacin son las helicasas, esta separacin de las hebras genera tensin, la cual es liberada por las topoisomerasas, tambin hay que estabilizar esas hebras que estn separadas, ya que el DNA no puede estar en mono hebra, por lo cual actan las SSb. Luego debe iniciarse la sntesis, pero las polimerasas solamente pueden colocar un nucletido si ya tienen puesto un grupo OH en el medio, por lo tanto primero debe sintetizarse un cebador, el cual es producto de una RNA polimerasa denominada primasa. Se inicia la polimerizacin por parte de la DNA polimerasa 3, comienza la elongacin de la nueva cadena, pero los cebadores deben eliminarse (en la cadena continua slo se origina un nico cebador, pero en la discontinua cada fragmento de Okasaki tiene un cebador, el cual se coloca cada 200 pares de bases), lo cual ocurre gracias a la actividad exonucleasa 3-5 de la DNA polimerasa 1, la cual adems de eliminar el cebador, lo sustituye por un fragmento de DNA; al hacer esto la enzima deja unas mellas, las cuales sern cerradas por una ligasa. DNA polimerasa Bacterias: Solo 3,su principal caracterstica es que corrigen sus errores, tienen actividad exonucleasa 3-5. Sus probabilidades de cometer errores es muy baja. Polimerasa 1: Caracterstica principal: No solo corrige 3-5, sino tambin 5-3, lo cual le permite eliminar el cebador a medida que va avanzando. Sitios de origen: En ese punto de origen estn las secuencias consenso, 4 secuencias con una repeticin de 9 pares de bases, que es el sitio en donde se unen ciertas protenas para que despus en esta regin con3 secuencias consecutivas de 13 pares de bases se genere la mella en donde entrara la helicasa. DNAa, trabajan en conjunto con unas protenas tipo histonas, generando una pequea tensin en la regin consenso, lo que ocasiona que una regin rica en base A, T se abre generando la pequea mella en donde estarn incorporadas la helicasa, (En E. coli, la helicasa es la DNAb) la cual es previamente activada por una DNAc, la cual entra al ADN, el cual es estabilizado por las SSB. Una vez que est la horquilla lista, se ensambla la DNA polimerasa. Elongacin: Horquilla de replicacin

 Conceptos:

Helicasa Girasa, topoisomerasa de tipo 2, DNA polimerasa, primer Sentido: 5-3 Hebra continua y hebra retrasada

Primosoma: Primasa y helicasa, conjunto que permite posicionar de manera correcta los cebadores para que se pueda sintetizar esa regin de la cadena, hay otras proteinas accesorias que participan en el Primosoma. Participacin activa en la cadena retardada.

Terminacion Se encuentran las dos horquillas y llega la topoisomerasa 4 y corta las dos hebras, y se separan los dos cromosomas. En eucariotas: No hay un nico punto de origen Velocidad de movimiento es ms lento DNA mucho ms complejas Actan otros factores de replicacin, RFa (Proteinas de fijacin al DNA de cadena sencilla, misma funcin que las SSB) y RFc (Facilita la formacin del complejo de replicacin activo), complejos proteicos.

Errores: Replicativos, mal apareamiento de bases Ausencia de bases, desaminacin espontnea Mecanismos de correccin de errores Transcripcin Se necesita tener acceso al DNA en regiones muy controladas y tratar de traducir esa molcula a una molecula adaptadora que despus pueda ser traducida a protena, RNA. Propiedades fisicoqumicas: No solo almacena informacin en forma de nucletidos, su importancia recae en tener actividades catalticas a pesar de ser una molcula no proteica. Tipos de RNA:

Mensajero: Lleva la informacin que se va a traducir para sintetizar una protena Transferencia: Funciona como una molecula adaptadora que permite leer a informacin que est en la molcula de DNA y traer un aa particular en base a esa informacin. Ribosmico: Maquinaria en donde ocurre el proceso de traduccin

Diferencias y similitudes entre replicacin y transcripcin La replicacin es una copia del cromosoma entero, dando DNA hijo idntico al parental mientras que la transcripcin es una copia selectiva, se puede transcribir en un momento dado uno o varios genes. Ambas necesitan una cadena molde, en la replicacin ambas cadenas sirven de molde, mientras que en la transcripcin una sola de las cadenas sirve como molde y es la cadena que la RNA polimerasa pueda leer, porque slo lee 3- 5 Enzima encargada de la replicacin es la DNA polimerasa, mientras que en transcripcion es la RNA polimerasa.

Diferencias en eucariotas y procariotas (?) Minuto: 32:50