Separata sobre Dogma Central

Fluxo de informao gentica numa clula (Dogma Central da biologia molecular)

Joo Richau
Professor Associado (Doutorado em Biotecnologia)

Universidade Lusfona Departamento de Psicologia Out. 2003

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Fluxo de informao gentica numa clula (Dogma Central da biologia molecular)

Nota prvia

Em cincia no existem dogmas. O dogma, uma verdade indiscutvel, frequentemente de natureza metafsica, que se estabeleceu noutras formas de cultura, nomeadamente na religio. Em cincia procura-se compreender a natureza, partindo da observao de factos, estabelecendo relaes de causa-efeito entre eles. Essas relaes hipotticas podem, muitas vezes, ser testadas em laboratrio ou na prpria natureza. Mas nenhuma experincia pode comprovar uma hiptese, to s pode conduzir sua negao. neste sentido que devem ser desenhadas as actividades de investigao cientfica. Por isso, qualquer hiptese constitui sempre uma explicao provisria. Porque novos factos relacionados foram, entretanto, observados, obrigando a uma extenso ou prpria rejeio da hiptese inicial. A cincia constroi-se, pois, de forma gradual, pelo contributo de toda a comunidade mundial de investigadores. Muitas vezes para se avanar no conhecimento tem, paradoxalmente, que se retroceder, abandonando paradigmas do passado e propondo uma nova viso explicativa dos fenmenos. Quando uma explicao resiste a sucessivas investigaes e nada se observa ao longo dos anos que a contradiga, apresentando uma explicao consistente de um fenmeno importante designa-se, normalmente, por teoria. Os cientistas devem apresentar duas caractersticas fundamentais: a curiosidade perante os fenmenos da natureza e nunca confiarem nas aparncias, sendo prudentes nas concluses. Se a formulao de hipteses constitui uma forma de fazer avanar a cincia, a descoberta de novos factos sobre a natureza tambm importante. No que respeita biologia, por exemplo, s se conhece vida no planeta Terra. No entanto, a hiptese de existncia de um conjunto de fenmenos a que chamamos vida noutros planetas no se

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pode excluir. Acresce que nada nos garante, a priori, que a existir vida extraterrestre ela tenha a mesma composio, os mesmos mecanismos e tenha produzido formas (espcies) idnticas da Terra, muito menos seres parecidos com o Homem. Enquanto tal no se descobrir limitemo-nos, pois, a estudar as caractersticas da vida terrestre.

1. Introduo

A organizao dos sistemas vivos obedece a uma srie de princpios, tanto fsicos como biolgicos: seleco natural, energia mnima, auto-regulao, construo em andares, por integraes sucessivas de subconjuntos. Jacob, F., in A lgica da vida

A vida constroi-se com tomos e molculas. A partir de pequenas molculas como a gua (H2O), o dixido de carbono (CO2), molculas de azoto, como o amonaco (NH3) e os nitratos (NO3-) e molculas de enxofre e fsforo, as plantas e as algas azuis (Cianophyta), atravs da fotossntese e certas bactrias, atravs da quimiossntese, fabricam pequenas molculas orgnicas. Entre estas a glucose, cidos gordos, aminocidos, bases azotadas, etc., ao mesmo tempo que produzem oxignio (ou enxofre). A partir destas molculas unitrias, os organismos vivos sintetizam outras molculas, como os fosfolpidos, os nucletidos e as suas macromolculas, como o DNA, o RNA, as protenas e os polissacridos. Estes constituintes agregam-se em estruturas de maior dimenso e complexidade, numa organizao hierrquica que constitui o edifcio da vida na Terra (Fig. 1). A vida da Terra depende, pois, dos organismos fotossintticos e quimiossintticos. a partir destes que se constroem as complexas teias alimentares em que se integra o Homem. Os estudos da biologia, da bioqumica e da gentica, produziram um conhecimento j extenso sobre as complexas relaes entre as biomolculas e as estruturas e funes celulares. esse o objecto deste trabalho. Essas relaes permitem compreender o que a vida na Terra, pondo a nfase dos fenmenos biolgicos na estrutura e funo das biomolculas, onde encontramos a explicao primordial para a estruturao das clulas, para a diviso celular e reproduo, para a homeostasia e para a evoluo. Para a sade e para a doena. Para o perigo, mas tambm para a esperana.

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Ecosfera Ecossistema Comunidade Populao Organismo Ex: Ser humano

Sistema

Ex:

Sistema Nervoso

Orgo

Ex:

Crebro

Tecido

Ex:

Crtex cerebral

Clula

Ex:

Neurnio

Organitos

Ex:

Mitocndrio

Estruturas supramoleculares

Exs:

Ribossoma

Membrana

Macromolculas

Exs:

DNA

Protena

Polissacrido

Molculas unitrias

Exs:

Nucletido

Aminocido

Pequenas molculas

Exs:

Dixido de carbono

gua

tomos

Exs:

Carbono

Oxignio

Figura 1 - Nveis de complexidade crescente na organizao da matria viva. Cada degrau da escada da vida apresenta propriedades novas de complexidade superior soma das propriedades do patamar inferior, designadas por propriedades emergentes.

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primeira vista mecanismos complexos como os automatismos observados nos organismos vivos parecem-nos estranhos e misteriosos. No entanto, esses processos homeostticos radicam em mecanismos moleculares muito simples que tm a sua origem no equilbrio qumico e na reversibilidade das reaces qumicas. disso exemplo o equilbrio dos sistemas tampo, em que um par cido/base conjugada em soluo aquosa capaz de manter o valor de pH dentro de intervalos muito estreitos quando se adicionam pequenas quantidades de cido ou de base soluo. O pH do sangue humano mantm-se prximo dos 7,35 sobretudo devido aco homeosttica do sistema tampo bicarbonato (CO2 + H2O H2CO3 HCO3- + H+), apesar do regime alimentar e do ritmo de vida. O CO2 resultante da actividade respiratria aerbia, realizada pelas clulas, e reage com a gua presente em grande quantidade no plasma sanguneo. Se soubermos que pequenos desvios deste valor de pH, de apenas uma ou duas dcimas de ponto, podem causar a morte do organismo por acidmia ou alcalmia percebe-se melhor que pequenos pormenores, aparentemente insignificantes, podem afinal ser muito relevantes e merecerem toda a nossa ateno. Nos organismos vivos a homeostasia depende destes equilbrios qumicos, mas fortemente reforada pela presena de inmeras enzimas (protenas) que catalisam outras tantas reaces bioqumicas. Nos organismos, ao mais alto nvel de regulao, a neurohormonal, so tambm protenas que funcionam como receptores de neurotransmissores ou de hormonas, como transportadoras de ies e como transmissores para o interior das clulas das mensagens trazidas por aquelas molculas. Alguns neurotransmissores e algumas hormonas so, eles prprios, protenas. Outra questo interessante tem a ver com a nutrio. atravs dela que o nosso organismo adquire as matrias-primas para se autoconstruir. Mais uma vez, so protenas diversas que se encarregam de digerir as complexas cadeias macromoleculares presentes em alguns alimentos e so tambm protenas que absorvem para o sangue a maioria das pequenas molculas resultantes da digesto, ou j presentes como tal nos alimentos. As molculas lipdicas so absorvidas para a linfa. Ser, por isso, muito interessante saber como decorre nas clulas a produo das suas protenas e de que modo a estrutura molecular destas determina as suas funes biolgicas. Uma vez disposio das clulas do nosso organismos, as diversas molculas so integradas nas nossas prprias molculas e estruturas celulares (assimilao), de acordo com o nosso programa gentico. Para proporcionar a multiplicao celular, de que dependem o crescimento e a reproduo, ou para permitir a necessria renovao dos tecidos e orgos. Uma alimentao equilibrada, na diversidade e quantidade adequadas, fundamental para uma vida saudvel.

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2. Fluxo de informao gentica conceitos prvios

Information cannot flow out of proteins. DNA and RNA are informationally equivalent, but the form of information in proteins is quite different. Information can be translated from the nucleic acid form to the protein form. However, we do not know (and cannot conceive ??) the reverse process. Crick, F., in Nature, 227:561-563 (1970)

Podemos considerar, para simplificar, a existncia de 5 classes de biomolculas: (1) os cidos nucleicos, DNA1 e RNA2 (deste ltimo existem 3 tipos principais: mRNA mensageiro; rRNA ribossmico; tRNA de transferncia); (2) os pptidos, os polipptidos e as protenas; (3) os glcidos (tambm designados glcidos, acares ou hidratos de carbono), que compreendem os monossacridos, os oligossacridos e os polissacridos; (4) os lpidos (tambm designados por gorduras), que incluem, entre outros, os glicridos, os fosfolpidos, os esfingolpidos, os esterides e as prostaglandinas e (5) as vitaminas (que incluem duas subclasses: as vitaminas hidrossolveis e as vitaminas lipossolveis). Os minerais, como o clcio, o ferro, o magnsio, o sdio, o potssio, o cloro, o zinco, o cobre, para alm de muitos outros, surgem normalmente associados a protenas, ou fazendo parte dos fludos biolgicos, sendo essenciais ao regular funcionamento dos organismos. A gua o constituinte mais abundante nos organismos vivos, chegando a representar mais de 95% da massa total de alguns deles e, como veremos, intervm em muitas reaces enzimticas e condiciona a organizao das biomolculas de modo determinante. tambm um veculo de transporte de nutriente, gases respiratrios, hormonas e txicos. No ser humano representa mais de 70% da massa corporal. Nesta separata vamos antever como as molculas de DNA, os genes, representam a sede da informao gentica na generalidade das clulas e ainda na grande maioria dos vrus e outras formas de vida. Como essa informao passa para outras clulas atravs da replicao das molculas de DNA e como, atravs da transcrio, se sintetizam as molculas de RNA. Vamos ainda ver como, em traos gerais, se produzem as protenas, por traduo das molculas de mRNA e como as protenas intervm no metabolismo geral do
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cido desoxirribonucleico (ADN). A sigla DNA deriva do nome ingls. cido ribonucleico (ARN).

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DNA, dos RNAs, das prprias protenas, dos glcidos, dos lpidos e de outras biomolculas, como as vitaminas (Fig. 2).

[sntese de DNA]

replicao

[sntese de RNAs]

transcrio

[sntese de PROTENAS]

traduo

DNA

RNA polimerase

DNA
informao gentica
DNA polimerase

DNA
informao gentica

mRNA
RNA polimerase

mRNA
informao gentica informao gentica

codo

base azotada

rRNA
RNA polimerase

PROTENAS
aminocidos

ribossoma

forquilha de replicao

efectuam o metabolismo de cidos nucleicos, glcidos, lpidos, vitaminas e das prprias protenas

tRNA DNA

(A)

participam na traduo, mas no so traduzidos

replicao DNA
(B)

transcrio transcrio reversa

(retrovrus, telomerases)

mRNA tRNA rRNA

traduo

PROTENA

Figura 2 Fluxo de informao gentica numa clula (dogma central da biologia molecular). Esquema baseado no modelo desenvolvido por Francis Crick (Crick F.H.C. The Central Dogma of Molecular Biology. 1970, Nature 227:561-563).

O conjunto dos genes de uma espcie, como por exemplo Homo sapiens, designa-se por genoma. O transcritoma corresponde totalidade das molculas de RNA obtidas por transcrio do genoma dessa espcie, chamando-se proteoma ao conjunto total das protenas traduzidas do mRNA. O genoma da espcie humana encontra-se j desvendado na sua totalidade, i. e., sequenciado, desde Abril de 2003, apresentando mais de 30000

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genes. Melhor dizendo, mais de 30000 tipos de gene. Porque para muitos deles conhecemse, por vezes, centenas de variantes, derivados de outros por mutao. Do conhecimento do genoma doutras espcies sabe-se que a maioria esmagadora dos genes codifica protenas, i. e., so os chamados genes estruturais. Esses genes so transcritos, deles se obtendo molculas de mRNA, os quais so traduzidos, obtendo-se protenas. De facto, s uma pequena percentagem dos genes de uma espcie codifica molculas de rRNA e tRNA, as quais no so traduzidas, embora colaborem no processo de traduo das molculas de mRNA. Neste momento conhecem-se apenas algumas centenas de protenas humanas, faltando encontrar, portanto, muitos milhares delas. Purific-las a partir de tecidos humanos, ou a partir da expresso de genes humanos clonados em bactrias, sequencilas, determinar a sua estrutura e funes biolgicas tarefa gigantesca que vai ocupar milhares de especialistas durante muitos anos. S depois disso ser possvel conhecermonos melhor, intervindo para remediar processos desregulados, dando finalmente resposta ao apelo socrtico conhece-te a ti mesmo. As molculas de DNA so replicadas por diversas enzimas, com particular realce para a enzima DNA polimerase. As molculas de DNA (genes) so transcritas pela enzima RNA polimerase (transcriptase). As molculas de mRNA, transcritas de genes estruturais, so traduzidas nos ribossomas, produzindo-se uma protena com uma determinada cadeia molecular de aminocidos e uma funo especfica a desempenhar no organismo (Fig. 2 A). O tRNA, transcrito de outras regies do genoma, transporta os aminocidos para a regio do ribossoma onde sero integrados na protena nascente. Diversos tipos de rRNA, transcritos ainda de outras regies do genoma, juntamente com diversas protenas constituem a estrutura dos ribossomas, onde so sintetizadas as protenas (Fig. 2 - A). Isto , o tRNA e o rRNA, embora participem no processo de traduo, no so traduzidos. As protenas assumem, depois, o metabolismo geral das restantes biomolculas, colaborando tambm no prprio fabrico de outras protenas. Em clulas infectadas por retrovrus, o RNA viral serve de molde enzima viral transcriptase reversa, ambos introduzidos na clula hospedeira, para se sintetizar DNA viral (transcrio reversa) essencial reproduo do vrus. Existem tambm em todas as clulas enzimas designadas por telomerases, capazes, em determinadas condies, de fazer transcrio reversa (Fig. 2 B). O ser humano dos organismos que apresenta um genoma maior, em dimenso e em nmero de genes (Tab. I) e mais complexo. No entanto, esse genoma de dimenso idntica ao de outros mamferos e apenas 7 a 8 vezes maior do que o de uma bactria.

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Tabela I Dimenso e nmero de genes do genoma de alguns organismos

Organismo Vrus da Hepatite B VIH-1 (vrus) Bacterifago (vrus) Escherichia coli (bactria) Saccharomyces cerevisiae (levedura) Caenorhabditis elegans (nemtodo) Drosophila melanogaster (mosca da fruta) Mus musculus (rato) Homo sapiens (Homem)

Dimenso do genoma (Mb) 0.0032 0.0092 0.0485 4.6392 12.155 97 137 3000 3000

Nmero de genes 4 9 80 4400 6300 19000 13600 ? 30000

O genoma humano encontra-se distribudo, na sua esmagadora maioria, por 23 pares de cromossomas localizados no ncleo de cada uma de milhares de milhes de clulas do organismo (Fig. 3). Outra parte, menor em nmero, mas no em importncia, encontra-se nas molculas de mtDNA (DNA circular) dos mitocndrios, organitos presentes em elevado nmero em cada uma das clulas e onde se realizam as reaces mais importantes do metabolismo energtico aerbio (Fig. 4). O genoma mitocondrial est tambm todo sequenciado e os seus genes codificam um proteoma importante, bem como os vrios tipos de rRNA e tRNA envolvidos na traduo. Cada mitocndrio apresenta os seus prprios ribossomas e autnomo, relativamente ao genoma cromossmico, na sntese da maioria das suas protenas Fig. 4). Cada cromossoma uma extensa molcula de DNA, albergando centenas ou mesmo mais de um milhar de genes. Estas molculas de DNA esto associadas a protenas designadas por histonas, em torno das quais se dispem de modo complexo (Fig. 3).

Para se atingir uma melhor compreenso de todos estes fenmenos necessrio conhecer-se os detalhes da composio qumica e da estrutura de todas estas molculas, com particular realce para os cidos nucleicos e as protenas. Por outro lado, estes mecanismos biolgicos acontecem dentro das clulas e em locais, organitos e estruturas, bem definidos que importa tambm conhecer.

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Figura 3 Genoma cromossmico humano. Os cromossomas encontram-se no ncleo das clulas, sob a forma de cromatina (duplas hlices de DNA associadas a diversas protenas). Durante a diviso celular, a cromatina condensa-se, formando os cromossomas. Cada cromossoma apresenta uma longa cadeia de DNA linear em dupla hlice. Nessa fase da vida celular pode-se observar que os cromossomas so em nmero de 23 pares. Estes albergam mais de 30000 genes (regies das molculas de DNA), a grande maioria dos quais codifica protenas (genes estruturais). Os cromossomas humanos distinguem-se por vrias caractersticas, entre as quais o nmero e o tipo de genes que apresentam.

cadeia L cadeia H

(A)

(B)

subunidade 8

Figura 4 Genoma mitocondrial humano. Os mitocndrios apresentam uma molcula de mtDNA (DNA circular) de cadeia dupla. (A) representao esquemtica da dupla hlice de mtDNA. (B) mapa dos genes mitocondriais presentes nessa molcula de mtDNA. Legenda: cadeia H (heavy) cadeia pesada (5168726 daltons), cadeia L (light) cadeia leve (5060609 daltons). O genoma mitocondrial humano compreende 13 genes que codificam mRNAs (e, portanto, codificam 13 tipos de protena), 22 genes que codificam outros tantos tRNAs e 2 genes codificadores dos 2 tipos de rRNA mitocondrial.

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